View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0727_low_35 (Length: 296)

Name: NF0727_low_35
Description: NF0727
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0727_low_35
NF0727_low_35
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-239)||(13214-13453)
[»] chr3 (96 HSPs)
chr3 (1-239)||(17487859-17488098)
chr3 (1-233)||(13442277-13442510)
chr3 (1-239)||(17499341-17499580)
chr3 (1-239)||(20698315-20698553)
chr3 (2-232)||(14576719-14576949)
chr3 (1-232)||(23083247-23083479)
chr3 (1-227)||(26686890-26687117)
chr3 (1-236)||(12399212-12399448)
chr3 (1-228)||(14972857-14973085)
chr3 (1-227)||(43840935-43841162)
chr3 (1-212)||(24153115-24153326)
chr3 (11-232)||(14572602-14572823)
chr3 (1-228)||(11424653-11424877)
chr3 (1-228)||(18438537-18438765)
chr3 (1-228)||(25476275-25476503)
chr3 (1-228)||(40213611-40213838)
chr3 (16-218)||(42386428-42386632)
chr3 (13-236)||(30029855-30030078)
chr3 (1-163)||(29172583-29172745)
chr3 (1-163)||(7781347-7781509)
chr3 (1-163)||(9707607-9707769)
chr3 (1-163)||(17463178-17463340)
chr3 (1-163)||(17672626-17672788)
chr3 (1-163)||(34159326-34159488)
chr3 (1-163)||(45606907-45607069)
chr3 (1-163)||(55476491-55476653)
chr3 (1-123)||(36166598-36166719)
chr3 (5-212)||(24340628-24340837)
chr3 (1-163)||(8899094-8899256)
chr3 (1-163)||(16454281-16454443)
chr3 (1-163)||(17446655-17446816)
chr3 (1-163)||(28848611-28848773)
chr3 (1-163)||(38961891-38962053)
chr3 (1-163)||(13151790-13151953)
chr3 (1-163)||(13154255-13154418)
chr3 (1-163)||(6469134-6469296)
chr3 (1-163)||(10247723-10247885)
chr3 (5-163)||(12567564-12567722)
chr3 (5-163)||(13544029-13544187)
chr3 (1-163)||(43550478-43550641)
chr3 (1-163)||(50242822-50242984)
chr3 (3-163)||(16282811-16282971)
chr3 (1-164)||(14234490-14234653)
chr3 (17-212)||(52523633-52523831)
chr3 (12-123)||(21618460-21618570)
chr3 (1-179)||(27165250-27165429)
chr3 (5-127)||(46822272-46822395)
chr3 (2-179)||(16097332-16097509)
chr3 (2-179)||(16103784-16103960)
chr3 (16-212)||(23274705-23274903)
chr3 (1-114)||(55500942-55501055)
chr3 (120-213)||(14179555-14179648)
chr3 (120-236)||(16796670-16796786)
chr3 (3-163)||(41123892-41124049)
chr3 (2-164)||(15470928-15471090)
chr3 (17-163)||(53070653-53070799)
chr3 (1-176)||(13210273-13210445)
chr3 (1-203)||(12119684-12119887)
chr3 (5-127)||(12511064-12511187)
chr3 (1-103)||(15412429-15412531)
chr3 (1-131)||(15977515-15977645)
chr3 (1-141)||(53301527-53301669)
chr3 (1-103)||(8499518-8499620)
chr3 (2-95)||(12174282-12174376)
chr3 (5-212)||(37642170-37642379)
chr3 (1-97)||(44494809-44494905)
chr3 (5-104)||(32307684-32307784)
chr3 (1-103)||(10556985-10557087)
chr3 (1-97)||(17737236-17737335)
chr3 (2-104)||(49668090-49668193)
chr3 (2-104)||(9512924-9513027)
chr3 (2-104)||(9520899-9521002)
chr3 (59-179)||(2051138-2051260)
chr3 (1-62)||(28194693-28194755)
chr3 (1-54)||(45577947-45578000)
chr3 (17-116)||(37251168-37251270)
chr3 (17-116)||(43925977-43926079)
chr3 (17-116)||(22110352-22110454)
chr3 (5-95)||(1644697-1644787)
chr3 (5-212)||(22147431-22147639)
chr3 (2-66)||(23077530-23077594)
chr3 (17-120)||(12377940-12378046)
chr3 (2-168)||(856140-856304)
chr3 (19-68)||(13919350-13919399)
chr3 (2-86)||(23408428-23408513)
chr3 (2-66)||(11298580-11298644)
chr3 (1-61)||(14665400-14665460)
chr3 (2-66)||(14878569-14878633)
chr3 (2-66)||(15878104-15878168)
chr3 (157-212)||(21618594-21618650)
chr3 (161-212)||(36166747-36166799)
chr3 (25-116)||(606327-606420)
chr3 (24-61)||(3389994-3390031)
chr3 (2-67)||(15060284-15060349)
chr3 (1-61)||(14668556-14668616)
chr3 (3-67)||(15051509-15051573)
[»] chr7 (83 HSPs)
chr7 (1-239)||(9509192-9509431)
chr7 (1-232)||(12698834-12699067)
chr7 (1-232)||(38227484-38227715)
chr7 (7-236)||(26212005-26212235)
chr7 (1-212)||(18456319-18456530)
chr7 (1-232)||(10589042-10589273)
chr7 (1-233)||(16386132-16386366)
chr7 (1-228)||(3564254-3564482)
chr7 (1-232)||(40443394-40443624)
chr7 (1-232)||(27847719-27847948)
chr7 (1-203)||(2280033-2280235)
chr7 (1-163)||(13647328-13647491)
chr7 (1-179)||(16213684-16213861)
chr7 (1-163)||(456321-456483)
chr7 (1-163)||(11972496-11972658)
chr7 (1-163)||(14949122-14949284)
chr7 (1-163)||(15376713-15376875)
chr7 (1-163)||(16232520-16232682)
chr7 (1-163)||(18640272-18640434)
chr7 (1-163)||(20385123-20385285)
chr7 (1-163)||(21189595-21189757)
chr7 (1-163)||(32125491-32125653)
chr7 (1-163)||(41522917-41523079)
chr7 (1-163)||(41525379-41525541)
chr7 (2-163)||(11393287-11393448)
chr7 (1-212)||(17061866-17062077)
chr7 (1-212)||(48273392-48273594)
chr7 (13-230)||(15143925-15144143)
chr7 (1-163)||(18430712-18430874)
chr7 (1-163)||(24702238-24702400)
chr7 (1-163)||(27216860-27217022)
chr7 (5-150)||(24275175-24275320)
chr7 (1-161)||(16410059-16410219)
chr7 (1-163)||(44116509-44116671)
chr7 (1-163)||(3386333-3386495)
chr7 (1-163)||(24704688-24704847)
chr7 (2-166)||(14932685-14932851)
chr7 (2-166)||(15356120-15356286)
chr7 (2-166)||(15360234-15360400)
chr7 (1-128)||(13869346-13869474)
chr7 (1-116)||(67748-67864)
chr7 (2-164)||(811086-811248)
chr7 (2-164)||(16219672-16219834)
chr7 (1-95)||(28505321-28505416)
chr7 (1-95)||(34200789-34200884)
chr7 (5-163)||(38898376-38898535)
chr7 (21-173)||(15211480-15211633)
chr7 (2-123)||(18005650-18005772)
chr7 (1-180)||(20110556-20110724)
chr7 (13-218)||(1867895-1868101)
chr7 (1-116)||(22072916-22073033)
chr7 (2-123)||(44014182-44014301)
chr7 (1-120)||(47831810-47831930)
chr7 (1-95)||(16495405-16495500)
chr7 (1-126)||(13831373-13831498)
chr7 (1-176)||(15754833-15755005)
chr7 (5-212)||(19486649-19486858)
chr7 (47-130)||(2530126-2530208)
chr7 (20-179)||(12255730-12255892)
chr7 (1-94)||(11996051-11996145)
chr7 (25-218)||(15008398-15008593)
chr7 (1-163)||(26355983-26356156)
chr7 (1-163)||(26358435-26358608)
chr7 (17-212)||(12756622-12756817)
chr7 (16-95)||(10063841-10063921)
chr7 (13-164)||(16056343-16056493)
chr7 (4-86)||(18154873-18154956)
chr7 (2-175)||(17138006-17138177)
chr7 (2-174)||(12187019-12187189)
chr7 (17-179)||(20220129-20220290)
chr7 (13-75)||(12901338-12901401)
chr7 (13-79)||(14044761-14044828)
chr7 (13-79)||(14354791-14354858)
chr7 (85-180)||(15113031-15113125)
chr7 (85-180)||(15116568-15116662)
chr7 (26-98)||(14036282-14036357)
chr7 (26-98)||(14346312-14346387)
chr7 (24-61)||(20569654-20569691)
chr7 (25-77)||(48991207-48991260)
chr7 (1-61)||(2832499-2832559)
chr7 (25-61)||(9446216-9446252)
chr7 (25-77)||(18203839-18203891)
chr7 (2-62)||(19649546-19649606)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-239)||(1854-2093)
[»] chr5 (75 HSPs)
chr5 (1-239)||(23390375-23390614)
chr5 (1-232)||(8286728-8286961)
chr5 (1-236)||(25421535-25421771)
chr5 (1-232)||(24493572-24493803)
chr5 (1-236)||(25431398-25431633)
chr5 (1-232)||(13025314-13025545)
chr5 (1-232)||(13095498-13095729)
chr5 (7-236)||(22075028-22075258)
chr5 (1-228)||(9077955-9078183)
chr5 (1-226)||(24529223-24529449)
chr5 (5-228)||(1096474-1096698)
chr5 (1-232)||(21292856-21293087)
chr5 (1-164)||(21808343-21808507)
chr5 (1-164)||(21729018-21729182)
chr5 (12-212)||(18418594-18418793)
chr5 (1-212)||(22412187-22412388)
chr5 (1-163)||(264768-264930)
chr5 (1-103)||(21997549-21997652)
chr5 (1-163)||(39363384-39363546)
chr5 (1-162)||(10732941-10733102)
chr5 (1-163)||(20909012-20909174)
chr5 (17-218)||(22144068-22144271)
chr5 (1-163)||(29329934-29330096)
chr5 (1-163)||(42245365-42245527)
chr5 (1-212)||(11581151-11581361)
chr5 (1-163)||(29345980-29346142)
chr5 (2-179)||(21565546-21565723)
chr5 (47-172)||(18356364-18356488)
chr5 (1-163)||(36154783-36154942)
chr5 (1-163)||(29348453-29348615)
chr5 (1-163)||(29350926-29351088)
chr5 (1-163)||(39245136-39245298)
chr5 (5-204)||(37723910-37724108)
chr5 (4-163)||(18319033-18319193)
chr5 (1-163)||(20902008-20902172)
chr5 (1-163)||(2154613-2154776)
chr5 (1-163)||(10775675-10775838)
chr5 (5-127)||(17517192-17517315)
chr5 (1-163)||(32027393-32027555)
chr5 (47-172)||(20910745-20910869)
chr5 (134-232)||(22107259-22107357)
chr5 (1-164)||(21329452-21329615)
chr5 (1-164)||(21502111-21502274)
chr5 (17-115)||(20026942-20027043)
chr5 (135-228)||(21986037-21986130)
chr5 (1-163)||(31061068-31061231)
chr5 (1-103)||(38619434-38619536)
chr5 (1-94)||(20918017-20918110)
chr5 (2-94)||(22959556-22959649)
chr5 (1-95)||(19660858-19660953)
chr5 (1-95)||(36314580-36314675)
chr5 (2-204)||(21873254-21873453)
chr5 (2-103)||(23064512-23064613)
chr5 (1-166)||(26011988-26012151)
chr5 (4-163)||(24067110-24067270)
chr5 (5-212)||(40725860-40726069)
chr5 (2-175)||(22032323-22032492)
chr5 (64-123)||(20766115-20766174)
chr5 (1-179)||(19668901-19669076)
chr5 (2-86)||(26704075-26704160)
chr5 (2-86)||(26973808-26973893)
chr5 (1-55)||(20806850-20806904)
chr5 (14-67)||(26732884-26732937)
chr5 (2-175)||(18769947-18770118)
chr5 (161-212)||(20766035-20766087)
chr5 (17-177)||(22178161-22178323)
chr5 (47-116)||(29448052-29448123)
chr5 (2-174)||(23572084-23572254)
chr5 (17-67)||(26740697-26740747)
chr5 (2-66)||(20805552-20805616)
chr5 (2-65)||(20766974-20767037)
chr5 (17-66)||(23469822-23469871)
chr5 (2-66)||(23512098-23512162)
chr5 (25-61)||(26680605-26680641)
chr5 (25-61)||(26952212-26952248)
[»] chr4 (73 HSPs)
chr4 (1-239)||(44052832-44053071)
chr4 (1-232)||(12902760-12902992)
chr4 (1-236)||(7088880-7089116)
chr4 (1-232)||(22636438-22636669)
chr4 (1-232)||(16239856-16240087)
chr4 (1-214)||(16270140-16270353)
chr4 (1-232)||(7893706-7893935)
chr4 (5-236)||(23374241-23374473)
chr4 (1-228)||(16377413-16377639)
chr4 (3-228)||(14038653-14038879)
chr4 (1-181)||(7798777-7798958)
chr4 (1-169)||(6899894-6900062)
chr4 (1-232)||(14053188-14053419)
chr4 (1-232)||(17046490-17046719)
chr4 (1-122)||(52873363-52873485)
chr4 (1-212)||(44928829-44929042)
chr4 (17-179)||(13790-13953)
chr4 (1-163)||(18215274-18215436)
chr4 (1-212)||(54798669-54798872)
chr4 (13-212)||(52243099-52243302)
chr4 (1-163)||(12307-12469)
chr4 (1-179)||(1837494-1837671)
chr4 (1-163)||(15118352-15118514)
chr4 (1-163)||(23803265-23803427)
chr4 (1-163)||(44615288-44615450)
chr4 (1-163)||(52312510-52312672)
chr4 (1-163)||(3515007-3515169)
chr4 (1-163)||(19242699-19242861)
chr4 (1-163)||(44773087-44773249)
chr4 (1-163)||(50222339-50222501)
chr4 (1-163)||(51463868-51464030)
chr4 (1-212)||(14280316-14280518)
chr4 (1-163)||(18239419-18239581)
chr4 (5-163)||(19618172-19618330)
chr4 (112-226)||(3096759-3096872)
chr4 (13-179)||(43198492-43198661)
chr4 (1-212)||(44102214-44102425)
chr4 (5-163)||(15355324-15355483)
chr4 (1-123)||(8574864-8574985)
chr4 (5-212)||(15367697-15367905)
chr4 (5-212)||(15402710-15402918)
chr4 (1-83)||(3096296-3096379)
chr4 (1-163)||(12610950-12611105)
chr4 (5-212)||(15371209-15371417)
chr4 (5-212)||(15373490-15373698)
chr4 (47-172)||(43256106-43256230)
chr4 (12-163)||(14970707-14970858)
chr4 (120-232)||(17047958-17048070)
chr4 (5-212)||(15370025-15370232)
chr4 (1-120)||(39706286-39706406)
chr4 (1-163)||(7641192-7641344)
chr4 (1-95)||(15551820-15551915)
chr4 (1-163)||(22353836-22353999)
chr4 (13-115)||(12288211-12288316)
chr4 (2-95)||(12774011-12774105)
chr4 (5-212)||(16223539-16223747)
chr4 (4-163)||(20149832-20149992)
chr4 (17-161)||(21815587-21815731)
chr4 (2-95)||(8846360-8846454)
chr4 (2-181)||(15093775-15093955)
chr4 (17-98)||(6190481-6190564)
chr4 (19-77)||(17333298-17333356)
chr4 (85-174)||(15121747-15121834)
chr4 (17-97)||(46640475-46640558)
chr4 (36-112)||(16596686-16596763)
chr4 (161-212)||(8574784-8574836)
chr4 (2-66)||(16348716-16348780)
chr4 (2-66)||(16357004-16357068)
chr4 (17-97)||(53082171-53082254)
chr4 (194-228)||(15091093-15091127)
chr4 (24-61)||(11250619-11250656)
chr4 (99-179)||(8846474-8846553)
chr4 (25-61)||(15353365-15353401)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (1-232)||(20536211-20536443)
chr8 (1-241)||(18818286-18818527)
chr8 (1-228)||(22626739-22626966)
chr8 (1-239)||(18879116-18879349)
chr8 (1-232)||(21918886-21919118)
chr8 (1-232)||(21923814-21924046)
chr8 (1-228)||(28648934-28649162)
chr8 (1-232)||(31971260-31971490)
chr8 (1-228)||(7372781-7373001)
chr8 (1-227)||(23406382-23406611)
chr8 (5-232)||(23648560-23648788)
chr8 (1-232)||(45130884-45131114)
chr8 (1-223)||(22875068-22875291)
chr8 (1-228)||(16092231-16092460)
chr8 (1-228)||(6759261-6759487)
chr8 (1-232)||(16199532-16199762)
chr8 (1-218)||(21389353-21389568)
chr8 (1-213)||(21395888-21396098)
chr8 (1-213)||(21790381-21790591)
chr8 (1-200)||(21778697-21778894)
chr8 (1-163)||(14409444-14409606)
chr8 (1-163)||(1484402-1484564)
chr8 (1-163)||(5853292-5853454)
chr8 (5-163)||(16413316-16413474)
chr8 (1-163)||(20403227-20403389)
chr8 (1-163)||(22001753-22001915)
chr8 (1-212)||(41598188-41598399)
chr8 (1-163)||(4483281-4483442)
chr8 (1-163)||(4542373-4542535)
chr8 (5-179)||(13508024-13508199)
chr8 (1-163)||(15203231-15203393)
chr8 (5-127)||(18678093-18678216)
chr8 (1-163)||(20046195-20046357)
chr8 (17-179)||(20498581-20498744)
chr8 (120-232)||(25363026-25363138)
chr8 (5-179)||(13597556-13597731)
chr8 (5-127)||(32121739-32121862)
chr8 (1-123)||(26219717-26219838)
chr8 (1-120)||(6520371-6520491)
chr8 (17-212)||(19801333-19801527)
chr8 (1-163)||(19896265-19896430)
chr8 (1-123)||(38855246-38855369)
chr8 (1-123)||(26225288-26225409)
chr8 (1-112)||(17140919-17141031)
chr8 (5-212)||(17612018-17612224)
chr8 (2-159)||(21285601-21285758)
chr8 (1-94)||(21490998-21491092)
chr8 (1-95)||(5866297-5866392)
chr8 (1-163)||(14823774-14823935)
chr8 (1-163)||(25484275-25484430)
chr8 (5-97)||(45290761-45290853)
chr8 (1-103)||(19937066-19937168)
chr8 (5-163)||(26223923-26224081)
chr8 (14-103)||(15070571-15070660)
chr8 (13-115)||(983407-983512)
chr8 (2-123)||(23760839-23760961)
chr8 (2-181)||(23776772-23776952)
chr8 (2-104)||(26355712-26355815)
chr8 (10-123)||(21673716-21673830)
chr8 (17-179)||(37116366-37116530)
chr8 (1-95)||(21249387-21249483)
chr8 (1-95)||(21255225-21255321)
chr8 (25-200)||(17439423-17439601)
chr8 (17-116)||(24353039-24353140)
chr8 (161-212)||(26222987-26223039)
chr8 (17-116)||(17266994-17267096)
chr8 (25-77)||(19154928-19154981)
chr8 (157-212)||(26219862-26219918)
chr8 (22-61)||(20533467-20533506)
chr8 (19-77)||(22525579-22525637)
chr8 (17-66)||(20502154-20502203)
chr8 (2-66)||(17353996-17354060)
chr8 (2-66)||(17926758-17926822)
[»] chr2 (72 HSPs)
chr2 (1-232)||(22731120-22731352)
chr2 (1-232)||(22738066-22738297)
chr2 (1-232)||(23285868-23286096)
chr2 (1-227)||(23060516-23060742)
chr2 (1-221)||(23076445-23076666)
chr2 (1-236)||(23654268-23654504)
chr2 (1-232)||(38002-38232)
chr2 (1-228)||(23660026-23660253)
chr2 (1-236)||(298696-298933)
chr2 (1-232)||(22337118-22337350)
chr2 (1-232)||(20309111-20309340)
chr2 (1-218)||(23708518-23708735)
chr2 (1-163)||(22105412-22105575)
chr2 (4-163)||(21155060-21155219)
chr2 (1-163)||(18808943-18809105)
chr2 (1-163)||(23130862-23131024)
chr2 (1-163)||(23133329-23133491)
chr2 (1-163)||(23709532-23709694)
chr2 (1-163)||(23712013-23712175)
chr2 (1-163)||(26505379-26505541)
chr2 (1-163)||(26507857-26508019)
chr2 (1-163)||(34402522-34402684)
chr2 (1-163)||(39682313-39682475)
chr2 (1-163)||(571397-571559)
chr2 (1-163)||(6725995-6726157)
chr2 (1-163)||(23135590-23135752)
chr2 (1-163)||(24367774-24367936)
chr2 (152-239)||(27753730-27753817)
chr2 (5-163)||(32214921-32215079)
chr2 (17-164)||(7687-7835)
chr2 (1-163)||(24898195-24898358)
chr2 (1-163)||(24900678-24900841)
chr2 (1-163)||(24903155-24903318)
chr2 (1-163)||(24905632-24905795)
chr2 (1-163)||(24908107-24908270)
chr2 (1-116)||(23103399-23103513)
chr2 (1-163)||(32039498-32039660)
chr2 (5-212)||(19671837-19672043)
chr2 (2-165)||(7679589-7679751)
chr2 (5-127)||(25616192-25616315)
chr2 (1-163)||(28577099-28577261)
chr2 (3-163)||(43137301-43137461)
chr2 (1-163)||(45029854-45030016)
chr2 (1-78)||(8946660-8946737)
chr2 (2-123)||(25175854-25175976)
chr2 (1-163)||(24529528-24529691)
chr2 (1-163)||(38967374-38967537)
chr2 (3-123)||(28405981-28406103)
chr2 (1-61)||(23040247-23040307)
chr2 (1-95)||(23071972-23072067)
chr2 (2-181)||(22799063-22799243)
chr2 (1-104)||(22134221-22134324)
chr2 (17-218)||(20520092-20520295)
chr2 (2-181)||(23019643-23019823)
chr2 (4-59)||(24643054-24643109)
chr2 (13-112)||(18786907-18787009)
chr2 (17-116)||(23207296-23207398)
chr2 (17-236)||(32451811-32452031)
chr2 (2-204)||(40622123-40622327)
chr2 (19-77)||(23287384-23287442)
chr2 (19-67)||(26392403-26392451)
chr2 (105-180)||(22459500-22459575)
chr2 (17-218)||(22413035-22413240)
chr2 (17-179)||(23791292-23791456)
chr2 (19-86)||(23038048-23038116)
chr2 (25-116)||(23004775-23004869)
chr2 (17-212)||(24697512-24697709)
chr2 (86-163)||(24642856-24642933)
chr2 (24-61)||(25961592-25961629)
chr2 (25-61)||(24655396-24655432)
chr2 (25-61)||(24869903-24869939)
chr2 (2-66)||(25963768-25963832)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-232)||(3473-3705)
scaffold0292 (1-228)||(346-573)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (1-232)||(20360846-20361078)
chr6 (1-239)||(20638162-20638401)
chr6 (1-229)||(22780116-22780345)
chr6 (1-236)||(17287678-17287914)
chr6 (1-228)||(29060543-29060771)
chr6 (1-224)||(19303435-19303658)
chr6 (1-241)||(18409704-18409945)
chr6 (1-228)||(25629245-25629473)
chr6 (1-228)||(20593776-20594004)
chr6 (1-164)||(16496247-16496411)
chr6 (1-164)||(20076703-20076863)
chr6 (1-232)||(16920519-16920748)
chr6 (1-172)||(35245589-35245758)
chr6 (1-163)||(1595549-1595711)
chr6 (1-232)||(22831506-22831737)
chr6 (1-163)||(12742317-12742479)
chr6 (1-163)||(18334592-18334754)
chr6 (1-163)||(19005046-19005208)
chr6 (1-163)||(19858919-19859081)
chr6 (1-179)||(20109143-20109322)
chr6 (1-163)||(22782227-22782389)
chr6 (1-163)||(24422547-24422709)
chr6 (1-163)||(25754809-25754971)
chr6 (1-163)||(33861794-33861956)
chr6 (1-163)||(33864278-33864440)
chr6 (21-236)||(25603267-25603482)
chr6 (13-218)||(25644335-25644543)
chr6 (1-163)||(2291180-2291342)
chr6 (1-163)||(8055029-8055191)
chr6 (1-163)||(26924640-26924802)
chr6 (5-163)||(30676710-30676868)
chr6 (1-163)||(25656629-25656791)
chr6 (5-163)||(34963377-34963535)
chr6 (17-212)||(18456735-18456930)
chr6 (1-163)||(1540911-1541073)
chr6 (1-143)||(25688502-25688644)
chr6 (4-163)||(16448526-16448686)
chr6 (5-163)||(19847949-19848109)
chr6 (21-236)||(25611605-25611820)
chr6 (1-163)||(3852017-3852179)
chr6 (17-232)||(11185524-11185737)
chr6 (25-228)||(15041441-15041644)
chr6 (1-163)||(20556894-20557054)
chr6 (17-150)||(18461895-18462028)
chr6 (47-172)||(27415887-27416011)
chr6 (5-127)||(23992434-23992554)
chr6 (1-95)||(27333241-27333336)
chr6 (1-95)||(27393981-27394076)
chr6 (5-212)||(8227416-8227625)
chr6 (1-95)||(28496494-28496589)
chr6 (1-95)||(29808905-29809000)
chr6 (1-176)||(1561306-1561478)
chr6 (2-104)||(19652199-19652302)
chr6 (1-59)||(25714420-25714478)
chr6 (1-164)||(23019411-23019572)
chr6 (10-112)||(4185827-4185930)
chr6 (13-112)||(9098518-9098620)
chr6 (17-181)||(18821782-18821946)
chr6 (13-115)||(19668386-19668491)
chr6 (19-77)||(33443068-33443126)
chr6 (10-112)||(4186379-4186482)
chr6 (2-66)||(21766695-21766759)
chr6 (2-86)||(19873120-19873205)
chr6 (2-51)||(31155465-31155514)
chr6 (179-227)||(5834388-5834436)
chr6 (179-227)||(20177096-20177144)
chr6 (1-45)||(22080799-22080843)
chr6 (179-227)||(22158847-22158895)
chr6 (25-117)||(18907134-18907226)
chr6 (24-61)||(19790837-19790874)
chr6 (2-63)||(19862978-19863039)
chr6 (17-77)||(23076749-23076810)
chr6 (17-77)||(35008167-35008228)
chr6 (52-112)||(4668217-4668277)
chr6 (52-112)||(4675064-4675124)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-239)||(6000-6242)
[»] chr1 (59 HSPs)
chr1 (1-236)||(27250611-27250847)
chr1 (1-236)||(21026683-21026919)
chr1 (1-228)||(22532272-22532500)
chr1 (1-228)||(50210103-50210331)
chr1 (1-228)||(34509783-34510011)
chr1 (74-232)||(22354458-22354616)
chr1 (5-230)||(20135194-20135420)
chr1 (5-211)||(22468604-22468810)
chr1 (108-239)||(22356053-22356185)
chr1 (108-239)||(22357739-22357871)
chr1 (1-232)||(38801277-38801505)
chr1 (1-179)||(23593719-23593897)
chr1 (1-163)||(13988866-13989028)
chr1 (17-179)||(21896195-21896358)
chr1 (1-163)||(21923291-21923453)
chr1 (17-178)||(21861510-21861672)
chr1 (1-212)||(433012-433222)
chr1 (1-163)||(21475087-21475249)
chr1 (1-163)||(31612313-31612475)
chr1 (1-163)||(45574842-45575005)
chr1 (5-163)||(21840771-21840929)
chr1 (1-163)||(29298137-29298298)
chr1 (1-163)||(29776688-29776850)
chr1 (1-163)||(16275363-16275526)
chr1 (2-179)||(33681011-33681188)
chr1 (1-97)||(20847175-20847272)
chr1 (120-213)||(48603637-48603730)
chr1 (5-179)||(16361921-16362095)
chr1 (47-172)||(33797570-33797694)
chr1 (17-206)||(35260992-35261180)
chr1 (13-218)||(16758664-16758872)
chr1 (1-200)||(21346961-21347161)
chr1 (1-203)||(13212821-13213024)
chr1 (1-200)||(21342096-21342296)
chr1 (2-159)||(22237631-22237788)
chr1 (2-123)||(22921864-22921986)
chr1 (2-181)||(21787979-21788159)
chr1 (4-163)||(40389157-40389317)
chr1 (1-119)||(15860052-15860171)
chr1 (5-104)||(21754052-21754152)
chr1 (1-163)||(22123067-22123230)
chr1 (1-163)||(21707167-21707329)
chr1 (1-163)||(21711709-21711871)
chr1 (5-79)||(20454593-20454667)
chr1 (1-95)||(14295574-14295669)
chr1 (14-95)||(20918620-20918702)
chr1 (2-176)||(20248283-20248454)
chr1 (2-86)||(21714546-21714631)
chr1 (17-116)||(50614117-50614219)
chr1 (17-116)||(50621945-50622047)
chr1 (13-95)||(52927993-52928076)
chr1 (17-116)||(41050036-41050138)
chr1 (17-116)||(16368287-16368388)
chr1 (177-236)||(20847101-20847161)
chr1 (47-95)||(22130930-22130978)
chr1 (2-112)||(21161720-21161830)
chr1 (17-98)||(16093903-16093987)
chr1 (1-61)||(24783150-24783210)
chr1 (2-66)||(42865266-42865330)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-232)||(38764-38995)
scaffold0145 (1-214)||(32945-33158)
scaffold0145 (1-163)||(9749-9912)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-232)||(51916-52148)
scaffold0011 (1-236)||(167861-168096)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (16-239)||(24180-24406)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-236)||(931-1166)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-228)||(3041-3268)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-227)||(8424-8647)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-236)||(25899-26134)
scaffold0026 (1-236)||(39861-40096)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-228)||(22886-23113)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-228)||(39480-39707)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-228)||(75105-75332)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-236)||(4852-5088)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-232)||(15351-15581)
scaffold0114 (2-174)||(7295-7465)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (1-228)||(39916-40143)
scaffold0080 (17-116)||(19885-19987)
scaffold0080 (25-66)||(18708-18749)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-232)||(32070-32299)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (5-228)||(25955-26179)
scaffold0122 (1-123)||(44702-44825)
scaffold0122 (134-228)||(33385-33479)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-232)||(8482-8710)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-232)||(13500-13730)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (1-228)||(17105-17335)
scaffold0056 (17-212)||(79235-79430)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (1-228)||(339840-340065)
scaffold0003 (1-163)||(158450-158612)
scaffold0003 (47-172)||(71350-71474)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (3-228)||(4513-4738)
scaffold0228 (3-228)||(12095-12320)
scaffold0228 (3-228)||(22047-22272)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (5-232)||(20917-21146)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-232)||(4715-4946)
scaffold0358 (63-232)||(1-170)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-228)||(16490-16718)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (87-239)||(124675-124827)
scaffold0021 (1-116)||(174769-174883)
scaffold0021 (1-67)||(121769-121835)
scaffold0021 (17-115)||(136370-136471)
scaffold0021 (17-115)||(145078-145179)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-232)||(10312-10541)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-232)||(1955-2187)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (1-214)||(32863-33074)
scaffold0120 (1-214)||(45931-46142)
scaffold0120 (1-208)||(16116-16323)
scaffold0120 (1-59)||(17389-17447)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (50-227)||(13144-13322)
scaffold0175 (1-95)||(34126-34221)
scaffold0175 (1-54)||(276-329)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (1-201)||(3103-3304)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-232)||(16285-16514)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-232)||(938-1167)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-232)||(1292-1521)
scaffold0106 (1-232)||(7269-7498)
scaffold0106 (1-66)||(15291-15356)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-207)||(46998-47202)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (1-135)||(28417-28552)
scaffold0046 (1-95)||(11295-11390)
scaffold0046 (1-95)||(2000-2095)
scaffold0046 (1-51)||(4555-4605)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-232)||(5017-5246)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-232)||(51585-51814)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (57-232)||(6669-6845)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (13-179)||(8481-8650)
scaffold0621 (1-123)||(6538-6661)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (78-228)||(27911-28061)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (61-223)||(3424-3588)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (19-228)||(4545-4754)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (17-179)||(53488-53651)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-163)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-163)||(37821-37983)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (1-164)||(128754-128917)
scaffold0031 (17-215)||(20328-20524)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-163)||(136680-136842)
scaffold0028 (1-163)||(139149-139311)
scaffold0028 (1-163)||(144087-144249)
scaffold0028 (1-163)||(134211-134373)
scaffold0028 (1-163)||(141618-141780)
scaffold0028 (1-95)||(62201-62296)
scaffold0028 (2-75)||(132662-132736)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (1-163)||(94411-94573)
scaffold0023 (1-160)||(44454-44614)
scaffold0023 (5-163)||(17440-17598)
scaffold0023 (2-124)||(100378-100501)
scaffold0023 (2-123)||(40169-40291)
scaffold0023 (1-69)||(119878-119947)
scaffold0023 (2-204)||(38394-38596)
scaffold0023 (2-74)||(101503-101576)
scaffold0023 (89-204)||(23581-23695)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (57-228)||(853-1021)
scaffold0395 (1-64)||(4888-4951)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (1-163)||(4694-4856)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-163)||(13392-13554)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (1-163)||(13947-14109)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-163)||(82072-82234)
scaffold0037 (13-179)||(22610-22776)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (17-203)||(13147-13336)
scaffold0357 (13-203)||(16014-16206)
scaffold0357 (17-77)||(2680-2741)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (5-212)||(17932-18141)
scaffold0247 (1-203)||(2088-2291)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (1-212)||(16784-16995)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (4-163)||(4300-4459)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (4-119)||(11442-11558)
scaffold0235 (181-232)||(11399-11450)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (13-203)||(27663-27855)
scaffold0165 (156-232)||(3640-3716)
scaffold0165 (156-232)||(7704-7780)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (5-163)||(10777-10935)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (5-163)||(11292-11450)
scaffold0029 (2-174)||(12763-12933)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (5-163)||(501088-501246)
scaffold0001 (1-203)||(85539-85742)
scaffold0001 (2-179)||(160688-160864)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (1-123)||(116430-116551)
scaffold0022 (17-179)||(128909-129072)
scaffold0022 (5-116)||(78328-78442)
scaffold0022 (161-212)||(116579-116631)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (19-179)||(7998-8161)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (120-232)||(1037-1149)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (1-163)||(106-268)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (13-179)||(10481-10647)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (17-179)||(12587-12749)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-179)||(38641-38820)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-163)||(40400-40562)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (47-172)||(15362-15486)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (10-179)||(129917-130086)
scaffold0010 (25-218)||(60614-60810)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (1-163)||(4214-4377)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (5-163)||(12249-12407)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (5-179)||(11471-11646)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (5-163)||(9246-9404)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (5-179)||(38195-38370)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (2-123)||(19268-19390)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (1-163)||(12064-12220)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-164)||(6078-6241)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (17-123)||(1051-1158)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (1-95)||(15664-15759)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (157-228)||(10323-10394)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (2-179)||(133-310)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (2-123)||(2801-2923)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (2-179)||(45732-45909)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (15-163)||(29946-30094)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (1-203)||(161049-161252)
scaffold0007 (80-203)||(164550-164674)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (2-162)||(29558-29720)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (4-163)||(1280-1440)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (1-164)||(989-1152)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-164)||(12769-12932)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (25-204)||(26851-27027)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (1-95)||(1092-1187)
scaffold0184 (24-61)||(4284-4321)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (2-120)||(12943-13062)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-150)||(32541-32687)
scaffold0034 (17-236)||(51766-51985)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-115)||(15780-15895)
scaffold0020 (2-65)||(178898-178961)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (10-123)||(5655-5769)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (2-123)||(14692-14814)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (2-181)||(4741-4921)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (176-232)||(17873-17929)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-164)||(6614-6777)
scaffold0333 (1-164)||(13994-14157)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (13-212)||(25121-25321)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (55-179)||(225465-225588)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (2-104)||(23897-24000)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (21-173)||(192920-193074)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (2-95)||(1086-1180)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (2-123)||(2640-2762)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (13-116)||(10542-10646)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (2-74)||(28813-28887)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (24-204)||(16264-16443)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (13-115)||(8075-8180)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (2-204)||(23843-24048)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (10-94)||(6824-6909)
scaffold0556 (70-164)||(8088-8181)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (189-237)||(20595-20643)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (25-116)||(38343-38437)
scaffold0139 (2-86)||(19980-20065)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (2-204)||(21721-21920)
scaffold0210 (2-204)||(29613-29812)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (25-166)||(29117-29262)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (2-168)||(1881-2045)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (17-116)||(6284-6386)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (2-65)||(36454-36517)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (17-115)||(569-669)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (17-59)||(11982-12024)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (17-179)||(97024-97188)
scaffold0006 (17-179)||(106302-106466)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (25-77)||(206566-206618)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (2-95)||(32102-32197)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (17-104)||(2694-2784)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (2-86)||(69794-69879)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (55-123)||(2213-2281)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (2-66)||(6095-6159)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (2-66)||(10575-10639)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (2-66)||(44081-44145)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (24-63)||(4999-5038)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (13-103)||(103644-103737)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (88-176)||(1169-1257)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (24-61)||(7328-7365)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (52-112)||(9133-9193)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (2-66)||(897-961)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (2-66)||(1830-1894)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (2-66)||(14664-14728)
scaffold0081 (2-66)||(23679-23743)
scaffold0081 (2-66)||(39103-39167)


Alignment Details
Target: scaffold0193 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 13214 - 13453
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13214 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 13313  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13314 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 13413  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 239  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13414 aaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 13453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 96)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 17487859 - 17488098
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17487859 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 17487958  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17487959 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagattcac 17488058  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488059 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 17488098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 13442277 - 13442510
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13442277 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 13442376  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442377 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 13442476  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442477 agattataattaacatcatcattaagtcttaatg 13442510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 17499341 - 17499580
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17499341 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 17499440  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17499441 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagattcac 17499540  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 239  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499541 aaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 17499580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20698553 - 20698315
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20698553 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaatt 20698454  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20698453 gcaattcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacttcaacacatcttgaacagcttcac 20698355  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20698354 agattataattaacatcatcattaagtcttaattctatcc 20698315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14576949 - 14576719
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgc 101  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14576949 catcatcaacatcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtataaacaacagcatgacataataatatcaattgc 14576850  T
Q  102 aattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 201  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14576849 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcacag 14576750  T
Q  202 attataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14576749 attataattaacatcatcattaaatcttaat 14576719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23083479 - 23083247
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23083479 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaatt 23083380  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23083379 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatatcaacacatcttaaacagcttcac 23083280  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23083279 agattgtaattaacatcatcactaagtcttaat 23083247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 26686890 - 26687117
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26686890 tcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 26686989  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686990 gcaagtcaacatcatcttaaatattccattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 26687089  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtc 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26687090 agattataattaacatcctcattaagtc 26687117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 12399212 - 12399448
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  12399212 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaat 12399311  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12399312 gcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataagacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaatagcttcac 12399411  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||    
T  12399412 agattatagttaacctcttcattatgtcttaatgcta 12399448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 14972857 - 14973085
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  14972857 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14972956  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| |||||||| | |||| ||   ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14972957 gcaaatcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcat 14973056  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973057 agattataattaacatcatcattaagtct 14973085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 43840935 - 43841162
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43840935 tcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 43841034  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841035 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 43841134  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtc 227  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||    
T  43841135 agattataattaacatcctcgttaagtc 43841162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153115
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 24153227  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153226 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 24153127  T
Q  201 gattataattaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  24153126 gattataattaa 24153115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 14572602 - 14572823
Alignment:
Q  11 catcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||    
T  14572602 catcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaaca 14572701  T
Q  111 acatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataatt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14572702 acatcttaaatattcaattatacttcaaataatgaaaaaaacattatatcacatcataaacaacataaacaaatcttaaacaacttcacaaattataatt 14572801  T
Q  211 aacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14572802 aacatcatcattaagtcttaat 14572823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11424877 - 11424653
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  11424877 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataacaatatcaatag 11424778  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    |||   |||||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11424777 caa---atcaacatctcaattatgcattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataaacaacttcaacacatcttaaacagcttcaca 11424681  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11424680 gattaaaattaacatcaacattaagtct 11424653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18438537 - 18438765
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18438537 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 18438636  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| |||||||||   ||| ||   ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438637 gcaagtcaacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 18438736  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18438737 agattatagttaacatcatcattaagtct 18438765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25476503 - 25476275
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25476503 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25476404  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25476403 gcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagcttcac 25476304  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25476303 agattgtaattaacatcctcattaagtct 25476275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213611
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaat 40213740  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40213739 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctttac 40213640  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213639 agattataattaacatcatcattaagtct 40213611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386632
Alignment:
Q  16 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 114  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
Q  115 cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaac 213  Q
    || |||||||||   ||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaaacagcttcacagattatcattaac 42386627  T
Q  214 atcat 218  Q
    |||||    
T  42386628 atcat 42386632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 30029855 - 30030078
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  30029855 tcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaatatcatttgcaattca-caa 30029953  T
Q  112 catcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 211  Q
    | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  30029954 cgtcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaacagcttcacatattatattaa 30030053  T
Q  212 acatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  30030054 acatcatcattaagtcttaaagcta 30030078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172583
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29172647  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  29172646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29172583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781347
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 7781411  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  7781410 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7781347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707607
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 9707671  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  9707670 acaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 9707607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463340
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17463276  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  17463277 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17463340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672788
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17672724  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  17672725 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 17672788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159488
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34159424  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  34159425 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34159488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606907
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 45606971  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  45606970 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45606907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476653
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55476589  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  55476590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 55476653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166719
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 36166696  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  36166697 caagtcaacaacatctcaaatat 36166719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24340837 - 24340628
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  24340837 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaa 24340738  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacaga 202  Q
     | | |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  24340737 gtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacaga 24340638  T
Q  203 ttataattaa 212  Q
    | || |||||    
T  24340637 tcatcattaa 24340628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899256
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8899192  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  8899193 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8899256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454281
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16454345  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  16454344 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16454281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446655
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17446719  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  17446718 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17446655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848611
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 28848675  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  28848674 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 28848611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961891
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38961955  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  38961954 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 38961891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151790
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaat 98  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13151855  T
Q  99 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  13151854 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13151790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154255
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaat 98  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13154320  T
Q  99 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  13154319 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13154255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469134
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6469198  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || || ||| ||||  || |||||||| |||||  |||||||||||    
T  6469197 gcaagtcaacaacgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcaca 6469134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247723
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10247787  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  10247786 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 10247723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567722
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 12567662  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  12567663 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12567722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 13544029 - 13544187
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13544029 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 13544127  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  13544128 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 13544187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43550641 - 43550478
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  43550641 tcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaaat 43550542  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43550541 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcaca 43550478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242984
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 50242920  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  50242921 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 50242984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282811
Alignment:
Q  3 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgc 101  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgc 16282873  T
Q  102 aattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    || ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  16282872 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16282811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 14234490 - 14234653
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  14234490 tcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 14234589  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  14234590 gcaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 14234653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523633
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaaca 52523732  T
Q  114 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaa 212  Q
    ||| ||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| || |||||    
T  52523731 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa-tcatcttataacagcttctcagatcatcattaa 52523633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 123
Target Start/End: Original strand, 21618460 - 21618570
Alignment:
Q  12 atcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  21618460 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 21618558  T
Q  112 catcttaaatat 123  Q
    ||||| ||||||    
T  21618559 catctcaaatat 21618570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165429
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||  |||||||| |    
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaacaacatgatataccaatatcaaat 27165349  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  || ||||| ||  ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  27165350 gcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 27165429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Original strand, 46822272 - 46822395
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  46822272 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaattgcaa 46822371  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaa 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  46822372 ttcaacaacatcttaaatattcaa 46822395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097509
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| || ||| | |||| |||||| | ||    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatcatataacaatatcgaatg 16097431  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  16097432 caagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 16097509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16103960
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 16103883  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  16103884 caa-tcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaa 16103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274903
Alignment:
Q  16 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |  |||| | | ||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 23274804  T
Q  115 cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaa-acagcttcacagattataattaa 212  Q
    || ||||||||| ||||  ||||||||| | |||||  |||| ||||||| |||| |||||||||  |||| |||  ||||||||||||| || |||||    
T  23274805 ctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcagcttcacagatcatcattaa 23274903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55501040  T
Q  100 gcaattcatcaacat 114  Q
    |||| ||| ||||||    
T  55501041 gcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 213
Target Start/End: Original strand, 14179555 - 14179648
Alignment:
Q  120 atattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 213  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14179555 atattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 14179648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 236
Target Start/End: Original strand, 16796670 - 16796786
Alignment:
Q  120 atattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 219  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || ||    
T  16796670 atattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaaaaacaacacatcttaaacaacttcacatattataattagcctcttc 16796769  T
Q  220 attaagtcttaatgcta 236  Q
    |||||||||||||||||    
T  16796770 attaagtcttaatgcta 16796786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124049
Alignment:
Q  3 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgc 101  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacacaa----cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 41123987  T
Q  102 aattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    || ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  41123988 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41124049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 164
Target Start/End: Original strand, 15470928 - 15471090
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  15470928 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 15471027  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    ||| |||||||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  15471028 caagtcatcaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 15471090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070653
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 53070701  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    | || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  53070700 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 53070653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13210445 - 13210273
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| | |    
T  13210445 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaat 13210346  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacat 176  Q
    ||||   ||||||| |||||||| ||||| ||   ||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||    
T  13210345 gcaa---atcaacaacttaaata-tcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacat 13210273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119684
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12119789  T
Q  100 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 197  Q
    |||| || |||||| ||| || |||||| | ||  |  || ||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  12119788 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 12119690  T
Q  198 acagat 203  Q
    ||||||    
T  12119689 acagat 12119684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Original strand, 12511064 - 12511187
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  12511064 catcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaattgcaa 12511163  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaa 127  Q
    |||| ||||||||| |||||||||    
T  12511164 ttcaacaacatcttcaatattcaa 12511187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412531
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15412527  T
Q  100 gcaa 103  Q
    ||||    
T  15412528 gcaa 15412531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977645
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 15977613  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatat 131  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||    
T  15977614 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatat 15977645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301527
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 53301570  T
Q  100 gcaattca-tcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagta 141  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||  ||||||||    
T  53301569 gcaagtcattcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 53301527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499620
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 8499616  T
Q  100 gcaa 103  Q
    ||||    
T  8499617 gcaa 8499620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174282
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 12174282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37642379 - 37642170
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    | ||    
T  37642379 catcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaa 37642280  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacaga 202  Q
     | | |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  37642279 gtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacaga 37642180  T
Q  203 ttataattaa 212  Q
    | || |||||    
T  37642179 tcatcattaa 37642170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494905
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 97  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaa 44494905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Original strand, 32307684 - 32307784
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |||||    
T  32307684 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 32307783  T
Q  104 t 104  Q
    |    
T  32307784 t 32307784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557087
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-tcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaat 10557083  T
Q  100 gcaa 103  Q
    ||||    
T  10557084 gcaa 10557087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737335
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac----aaaacagcatgacataataatatca 96  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    | |||||||||||||||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcaatatactacaacaacagcatgacataataatatca 17737334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49668090
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 49668094  T
Q  101 caat 104  Q
    ||||    
T  49668093 caat 49668090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9513027
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 9513023  T
Q  101 caat 104  Q
    ||||    
T  9513024 caat 9513027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9521002
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 9520998  T
Q  101 caat 104  Q
    ||||    
T  9520999 caat 9521002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051138
Alignment:
Q  59 ataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacatta 156  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||  ||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaatta 2051161  T
Q  157 tatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    |||||||| |||| |||||||||    
T  2051160 tatcacattataaacaacatcaa 2051138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatag 62  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577947
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacag 54  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 45577947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251168
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37251171  T
Q  114 tct 116  Q
    |||    
T  37251170 tct 37251168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926079
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 43926076  T
Q  114 tct 116  Q
    |||    
T  43926077 tct 43926079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110352
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| || ||    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagca 22110355  T
Q  114 tct 116  Q
    |||    
T  22110354 tct 22110352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 1644787 - 1644697
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| | |||| ||||||    
T  1644787 catcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcattatataacaatatc 1644697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22147639 - 22147431
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | |||| ||| || ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||    | ||    
T  22147639 catcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaa 22147540  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacaga 202  Q
     | | |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||| ||  |||| |||| ||||||||||||    
T  22147539 gtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat-aaatcatcataaatcagcttcacaga 22147441  T
Q  203 ttataattaa 212  Q
    | || |||||    
T  22147440 tcatcattaa 22147431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077530
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378046
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 12378039  T
Q  114 tcttaaa 120  Q
     ||||||    
T  12378040 acttaaa 12378046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856304
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aac-agcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 856237  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcata 168  Q
     ||||||| ||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||    
T  856238 -caattcaacaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatacata-aacattataatacatcata 856304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  19 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 68  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 86
Target Start/End: Original strand, 23408428 - 23408513
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacat 86  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||    
T  23408428 catcatcttgatcatcttatactgactcatgcaacttggttaattaacaatagcaacatagacagattacaacaacagcgtgacat 23408513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 11298644 - 11298580
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11298644 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 11298580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 14665400 - 14665460
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    |||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14665400 tcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacata 14665460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 14878633 - 14878569
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14878633 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 14878569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878104
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 15878104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 212
Target Start/End: Original strand, 21618594 - 21618650
Alignment:
Q  157 tatcacatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  21618594 tatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 21618650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Original strand, 36166747 - 36166799
Alignment:
Q  161 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  36166747 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 36166799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 606420 - 606327
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| | | ||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  606420 gactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcacataaatcagttcatgatataacaatatcaa-tgcaattcaacaacatct 606327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 3390031 - 3389994
Alignment:
Q  24 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3390031 tgactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 3389994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 15060284 - 15060349
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 67  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15060284 catcatcttattcatcttacaatgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagt 15060349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 14668556 - 14668616
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    |||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  14668556 tcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 14668616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 67
Target Start/End: Original strand, 15051509 - 15051573
Alignment:
Q  3 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 67  Q
    ||||||||  ||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15051509 atcatcttattcatcttacaatgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagt 15051573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 83)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 9509192 - 9509431
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9509192 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaatt 9509291  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509292 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 9509391  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9509392 agattataattaacatcctcattaagtcttaatgctatcc 9509431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12698834 - 12699067
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaca--gcatgacataataatatcaat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12698834 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaat 12698933  T
Q  99 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698934 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 12699033  T
Q  199 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12699034 cagattataattaacatcctcattaactcttaat 12699067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 38227484 - 38227715
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38227484 tcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 38227583  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  38227584 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatatcacatcttaatcaacatcaacatatcttaaatatcttcaca 38227683  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227684 tattataattaacatcatcattaagtcttaat 38227715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 26212005 - 26212235
Alignment:
Q  7 tcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaatt 105  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26212005 tcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaatt 26212104  T
Q  106 catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagatta 205  Q
    || |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26212105 caacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagatta 26212204  T
Q  206 taattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26212205 taattaacctcttcattaagtcttaatgcta 26212235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456319
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 18456431  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456430 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 18456331  T
Q  201 gattataattaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  18456330 gattataattaa 18456319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 10589042 - 10589273
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  10589042 tcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatcaatt 10589141  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  10589142 gcaattcaacaacatcttcaatgttcaaatattcttcaagcaatgcata-aacattatatcacatcataatcagcaacaacacatcttaaatagcttcac 10589240  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10589241 agattataattaacctcatcattaagtcttaat 10589273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16386366 - 16386132
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaat 98  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  16386366 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 16386267  T
Q  99 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 198  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16386266 tgtatttcatcaacatcttaaatattcaaacaattctcaagtaatgcataaaacattatattacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttca 16386167  T
Q  199 cagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 233  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16386166 cagattatagttaacctcttcattaagtcttaatg 16386132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564254
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 3564383  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    | || ||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  3564382 gtaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcat 3564283  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3564282 aggttataattaacatcatcattaagtct 3564254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 40443394 - 40443624
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40443394 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa-cagcatgacataataatatcaatt 40443492  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  40443493 tcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagcttcac 40443591  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  40443592 agattataattaacctcattgttaagtcttaat 40443624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27847948 - 27847719
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||| |    
T  27847948 tcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtgtacaa--cagtatgacataattatatcaaat 27847851  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  27847850 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatcacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcac 27847752  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||| ||||  |||| |||||||||||||    
T  27847751 agattatagttaatctcattattaagtcttaat 27847719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2280235 - 2280033
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  2280235 tcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataataatatcaaat 2280138  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttca 198  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  2280137 gcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagcttca 2280038  T
Q  199 cagat 203  Q
    |||||    
T  2280037 cagat 2280033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 13647328 - 13647491
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13647328 tcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13647427  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  13647428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13647491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213861
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16213782  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
     ||| ||| |||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16213783 ccaagtcaacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaacataa-caacatcaa 16213861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456483
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 456419  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  456420 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 456483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972658
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11972594  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  11972595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11972658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949122
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14949186  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  14949185 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14949122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376713
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15376777  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  15376776 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15376713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232682
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16232618  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  16232619 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16232682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640434
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18640370  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18640371 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18640434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385123
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20385187  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  20385186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20385123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189595
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21189659  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  21189658 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21189595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125653
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32125589  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  32125590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32125653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523079
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41523015  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  41523016 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41523079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525541
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41525477  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  41525478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41525541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393287
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 11393350  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    ||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  11393349 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11393287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061866
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactcag-cagtatacaaaatagcatgacataataatatcaaat 17061979  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 198  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||| | ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  17061978 gcaagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttca 17061880  T
Q  199 cagattataattaa 212  Q
    ||||| || |||||    
T  17061879 cagatcattattaa 17061866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273594
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 48273491  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 198  Q
    |||| ||| ||||||| | ||||| ||   ||  ||||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48273492 gcaagtcaacaacatc-tcaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 48273580  T
Q  199 cagattataattaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  48273581 cagattatcattaa 48273594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15143925
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||| || || |||||||||| |||||  || |||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatct-cagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaa 15144045  T
Q  112 catcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataatt 210  Q
    ||||| || ||| ||   ||  || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |     
T  15144044 catctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttgacagattatatta 15143945  T
Q  211 aacatcatcattaagtctta 230  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15143944 aacatcatcattaagtctta 15143925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 18430712 - 18430874
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtata-caaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18430712 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaat 18430810  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18430811 gcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18430874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702400
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 24702336  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24702337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24702400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27217022
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 27216958  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  27216959 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 27217022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 150
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275320
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 24275273  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatata 150  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  24275274 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 24275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410219
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16410157  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatca 161  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||  |||||  |||||||||    
T  16410158 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatca 16410219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116671
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 44116607  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  44116608 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcaca 44116671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386495
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaat 3386431  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  3386432 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcaca 3386495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704847
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | || |||||||||||||||| ||    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaa--aacaagacataataatatcaaatg 24704784  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    ||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24704785 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24704847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932685
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 14932752  T
Q  101 caa-ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatca 166  Q
    ||| |||| |||||  ||||||||||||  |  |||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  14932751 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 14932685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356120
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15356187  T
Q  101 caa-ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatca 166  Q
    ||| |||| |||||  ||||||||||||  |  |||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15356186 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 15356120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360234
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15360301  T
Q  101 caa-ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatca 166  Q
    ||| |||| |||||  ||||||||||||  |  |||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15360300 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 15360234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869474
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13869444  T
Q  100 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaa 128  Q
    |||| || |||||| ||| || ||||||||    
T  13869445 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcaaa 13869474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 67748 - 67864
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  67748 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 67847  T
Q  100 gcaattcatcaacatct 116  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  67848 gcaaatcaacaacatct 67864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811086
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 811149  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    ||| |||| |||||| |||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  811148 caagtcattaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 811086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16219834 - 16219672
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  16219834 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 16219735  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  16219734 caagtcatcaacatcttaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 16219672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 28505416 - 28505321
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  28505416 tcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatc 28505321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 34200789 - 34200884
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  34200789 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatc 34200884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898376
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtata-caaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 38898437  T
Q  104 ttc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     || |||||||||| || |||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  38898436 gtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 38898376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 15211480 - 15211633
Alignment:
Q  21 gactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatctta 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||| |    
T  15211480 gactgactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattca-caacatctca 15211578  T
Q  119 aatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 173  Q
    | |||||||  |  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15211579 attattcaataaaacttcaagcgatgtatacaacattatatcacatcataatcaa 15211633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005772
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatggaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 18005749  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  18005750 caaatcaacaacatctcaaatat 18005772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110724
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc-----------tatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20110644  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaac 180  Q
    |||| |||  ||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  20110645 gcaagtcaataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaac 20110724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867895
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagc--atgacataataatatcaattgcaattcatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||| |||| | | |    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaat-gcaaatgaac 1868003  T
Q  110 aacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataat 209  Q
    ||||||| ||| || || ||||  |||| |||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||    
T  1868002 aacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaaaaagcttcacagatcatcat 1867904  T
Q  210 taacatcat 218  Q
    ||| |||||    
T  1867903 taatatcat 1867895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 22072916 - 22073033
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaat 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  22072916 tcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 22073015  T
Q  99 tgcaattcatcaacatct 116  Q
    || || ||| ||||||||    
T  22073016 tgtaagtcaacaacatct 22073033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014301
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 44014281  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    |||   |||||||||| ||||||    
T  44014282 caa---atcaacatctcaaatat 44014301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 47831810 - 47831930
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| || | || ||||| |||| |||||| | |    
T  47831810 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatcatcatgatataacaatatcgaat 47831909  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  47831910 gcaagtcatcaacatcataaa 47831930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 16495405 - 16495500
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  16495405 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatc 16495500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831498
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||||| || |    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca-cggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaat 13831471  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattca 126  Q
    |||| ||| |||| ||| || ||||||    
T  13831472 gcaagtcaacaacgtctcaattattca 13831498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15755005 - 15754833
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| | |    
T  15755005 tcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaat 15754906  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacat 176  Q
    ||||   ||||||| || |||||| |||| ||   ||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||    
T  15754905 gcaa---atcaacaactcaaatat-caaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacat 15754833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19486858 - 19486649
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    | ||    
T  19486858 catcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaa 19486759  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacaga 202  Q
     | | |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  19486758 gtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacaga 19486659  T
Q  203 ttataattaa 212  Q
    | || |||||    
T  19486658 tcatcattaa 19486649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 2530208 - 2530126
Alignment:
Q  47 aacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaata 130  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2530208 aacaacagcaacataggcaacatacaaa-caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaata 2530126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255730
Alignment:
Q  20 agactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||   ||||| |||| |||||||| || |||||  ||||||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  117 taaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
     ||| ||||| ||||  ||||||||||  |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  12255792 caaacattcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 12255730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11996145 - 11996051
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatat 94  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  11996145 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatat 11996051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15008593 - 15008398
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaat 121  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || |||     
T  15008593 gactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaat-gcaaatcaacaacacctcaaac 15008495  T
Q  122 attcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaacatcat 218  Q
    || || ||||  ||||||||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15008494 at-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagattatcattaatatcat 15008398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26356156 - 26355983
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagg----------cagtatacaaaa-cagcatgacataat 89  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |            |||||||||||| |||||| |||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataat 26356057  T
Q  90 aatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  26356056 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26355983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26358608 - 26358435
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagg----------cagtatacaaaa-cagcatgacataat 89  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |            |||||||||||| |||||| |||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataat 26358509  T
Q  90 aatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  26358508 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26358435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756622
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | | |||| ||    
T  12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataacaacagcaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtc 12756719  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 212  Q
    | || |||||| |||   ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||| |||||||| || |||||    
T  12756718 tcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcatcacagatcatcattaa 12756622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10063921 - 10063841
Alignment:
Q  16 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||    
T  10063921 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaacatcatgatataataatatc 10063841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056493
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 111  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgc-aaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 16056441  T
Q  112 catcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    ||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  16056442 catctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 16056493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154873
Alignment:
Q  4 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacat 86  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagtatgacat 18154873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138006
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacag-catgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  |||||  |||| ||| |||||    
T  17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatga--taattataccaatt 17138080  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaaca 175  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  17138079 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 17138006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187189
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa--aacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||  |  | |||||  |||| ||| |||||    
T  12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaattacaatcatga--taattataccaatt 12187116  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaac 174  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||    
T  12187117 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaac 12187189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220129
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| |||||   |||||||    
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaaca 20220194  T
Q  114 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||| ||| | ||| ||||  |||| |||||| |||||  |||||||||||| || | |||||||||    
T  20220193 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaa 20220129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901401
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 75  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 12901401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044828
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagc 79  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| | ||||||||    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagc 14044828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354858
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagc 79  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| | ||||||||    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagc 14354858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 180
Target Start/End: Original strand, 15113031 - 15113125
Alignment:
Q  85 ataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaac 180  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||| ||||   ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15113031 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa-tattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaac 15113125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 180
Target Start/End: Original strand, 15116568 - 15116662
Alignment:
Q  85 ataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaac 180  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||   ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||    
T  15116568 ataacaatatcaattgcaagtcatcaacatc-tcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaac 15116662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 98
Target Start/End: Original strand, 14036282 - 14036357
Alignment:
Q  26 actcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaat 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||    
T  14036282 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaat 14036357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 98
Target Start/End: Original strand, 14346312 - 14346387
Alignment:
Q  26 actcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaat 98  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||    
T  14346312 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaat 14346387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 20569691 - 20569654
Alignment:
Q  24 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20569691 tgactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 20569654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 48991207 - 48991260
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaca 77  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  48991207 gactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaaca 48991260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 2832559 - 2832499
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    |||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  2832559 tcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 2832499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 9446252 - 9446216
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446252 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 9446216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Original strand, 18203839 - 18203891
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaca 77  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  18203839 gactcatgcagcttagttaataaacaacaacaacatagacagtacataaaaca 18203891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649546
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatag 62  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatag 19649546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 1854 - 2093
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1854 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 1953  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1954 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagcttcac 2053  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2054 agattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcc 2093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 75)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23390614 - 23390375
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23390614 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 23390515  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23390514 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagcttcac 23390415  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23390414 agattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcc 23390375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8286961 - 8286728
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa--cagcatgacataataatatcaat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8286961 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaat 8286862  T
Q  99 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286861 tgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 8286762  T
Q  199 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8286761 cataatataattaacatcttcattaagtcttaat 8286728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 25421535 - 25421771
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  25421535 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 25421634  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25421635 gcaagtcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcac 25421734  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25421735 agattataattaacatcatcattaagtctcaatgcta 25421771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 24493572 - 24493803
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24493572 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 24493671  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24493672 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaatagcttcaca 24493771  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24493772 gattataattaacatcattattaagtcttaat 24493803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 25431398 - 25431633
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  25431398 tcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 25431496  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25431497 gcaagtcaacaacatcttaaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcac 25431596  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25431597 agattataattaacatcatcattaagtctcaatgcta 25431633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 13025314 - 13025545
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  13025314 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatg 13025413  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13025414 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaacttcaca 13025513  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025514 tattataattaacatcatcattaagtcttaat 13025545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 13095498 - 13095729
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  13095498 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatg 13095597  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13095598 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaacttcaca 13095697  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095698 tattataattaacatcatcattaagtcttaat 13095729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 22075028 - 22075258
Alignment:
Q  7 tcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaatt 105  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22075028 tcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatcaattgcaatt 22075127  T
Q  106 catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagatta 205  Q
    || |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22075128 caacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacatatta 22075227  T
Q  206 taattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22075228 taattaacctcttcattaagtcttaatgcta 22075258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 9077955 - 9078183
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9077955 tcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagt 9078054  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| |||||||| || ||| ||   ||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078055 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 9078154  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078155 agattataattaacatcatcattaagtct 9078183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529449
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaat 24529322  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| ||   ||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529323 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24529422  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagt 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24529423 agattatagttaacatcatcattaagt 24529449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 1096474 - 1096698
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  1096474 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaatgcaa 1096573  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 203  Q
     ||| |||||||| | |||| ||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  1096574 atcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcataggt 1096673  T
Q  204 tataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  1096674 tataattaacatcctcattaagtct 1096698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21293087 - 21292856
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaat-- 98  Q
    |||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  21293087 tcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaacaaa-cagtatgacataataatatcaatat 21292989  T
Q  99 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 198  Q
    |  |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| |||||    
T  21292988 tcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacaacttca 21292890  T
Q  199 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21292889 cagattataattaacctcattattaagtcttaat 21292856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21808507 - 21808343
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21808507 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaatt 21808408  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21808407 gcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacat 21808343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21729182 - 21729018
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21729182 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaatt 21729083  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  21729082 gcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcacat 21729018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Original strand, 18418594 - 18418793
Alignment:
Q  12 atcaacttagactgactcatgcagcttagttaaa-taacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 110  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  18418594 atcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcatttgcaattca-ca 18418691  T
Q  111 acatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataat 209  Q
    ||||||||| |||||||  |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18418692 acatcttaa-tattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttcacaggttataat 18418790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412388
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 22412286  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412287 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 22412376  T
Q  201 gattataattaa 212  Q
    ||||||||||||    
T  22412377 gattataattaa 22412388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264768
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 264832  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  264831 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 264768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21997652 - 21997549
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21997652 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21997553  T
Q  100 gcaa 103  Q
    ||||    
T  21997552 gcaa 21997549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363546
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39363482  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  39363483 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39363546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732941
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10733004  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcac 162  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  10733003 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 10732941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909174
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20909110  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  20909111 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144271
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacatc 22144167  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaaca 214  Q
    | ||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||| | || ||||| |    
T  22144168 tcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaattcatcttataacaacttcacaggtcatcattaata 22144267  T
Q  215 tcat 218  Q
    ||||    
T  22144268 tcat 22144271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330096
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 29330032  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  29330033 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29330096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245365
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 42245429  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  42245428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 42245365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581151
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 11581263  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 198  Q
    |||| |||  ||| ||| || ||||||  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| || |||||    
T  11581262 gcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataa-caacatcaa-tcatcataaatcaacttca 11581165  T
Q  199 cagattataattaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  11581164 cagattatcattaa 11581151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346142
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29346078  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  29346079 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29346142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565723
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatccaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 21565645  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||| |||||||||| | ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  21565646 caagtcatcaacatttcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 21565723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Original strand, 18356364 - 18356488
Alignment:
Q  47 aacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgta 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |    
T  18356364 aacaacagcaacataggcagcatacaaa-cagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaatatttcttaagtaatgca 18356462  T
Q  147 tataacattatatcacatcataatca 172  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  18356463 taaaacattatatcacattataatca 18356488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154783
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaca-ca---gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 36154847  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  36154846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 36154783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348615
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29348551  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  29348552 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29348615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351088
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29351024  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  29351025 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29351088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245298
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39245234  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| |||  ||| ||  || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  39245235 gcaagtcaataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 39245298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Original strand, 37723910 - 37724108
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| |  ||    
T  37723910 catcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatac--aacagcatgacatgattatatcaaattaaa 37724007  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatg-tatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacaga 202  Q
    ||||||||||||| ||  |||||   ||  |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||  |||||||||||||||    
T  37724008 ttcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaaacattatatcacatcatattcaacactaacatctc-aaaacagcttcacaga 37724106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319033
Alignment:
Q  4 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgca 102  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 18319095  T
Q  103 attc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    | || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  18319094 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 18319033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20902008
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcat-caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaat 98  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaag 20902074  T
Q  99 tgcaattcatcaacatcttaaata-ttcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    ||||| ||| |||| ||| || || |||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  20902073 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 20902008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154613
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 2154678  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaata-ttcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || || |||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  2154677 gcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 2154613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775675
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaat 10775740  T
Q  100 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  10775739 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 10775675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 17517315 - 17517192
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  17517315 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaatcgcaa 17517216  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaa 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  17517215 ttcaacaacatcttaaatattcaa 17517192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027555
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32027491  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  32027492 ccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32027555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 20910869 - 20910745
Alignment:
Q  47 aacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaata-ttcttcaagtaatgt 145  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||     
T  20910869 aacaacagcaacatagacagcatacaaa-cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaacattcaaataattctt-aagtaatgc 20910772  T
Q  146 atataacattatatcacatcataatca 172  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20910771 ataaaacattatatcacattataatca 20910745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22107357 - 22107259
Alignment:
Q  134 ttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22107357 ttcaagtaatgcataatatattatatcacatcataatcaacaacaacacaccttaaacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaat 22107259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21329615 - 21329452
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||| | |    
T  21329615 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaat 21329516  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
     ||| ||||||||||| |||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  21329515 tcaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 21329452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21502274 - 21502111
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| |||||| | |    
T  21502274 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcagcatgatataacaatatcgaat 21502175  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    |||| |||||| ||||||||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  21502174 gcaagtcatcatcatcttaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 21502111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026942
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaaca 20026944  T
Q  114 tc 115  Q
    ||    
T  20026943 tc 20026942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21986130 - 21986037
Alignment:
Q  135 tcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21986130 tcaagtaatgcatataacattttatcacctcatattcaacatcaacacatcttaaacaacttcacaaattatagttaacatcatcatcaagtct 21986037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061231
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31061166  T
Q  100 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| || |||||| | | || |||||| | ||  || || ||||| |||||| |||||||||||    
T  31061167 gcaagtcaatcaacgtatcaattattcacaaataatttaattaatgcatataaaattatatcaca 31061231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619536
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38619532  T
Q  100 gcaa 103  Q
    ||||    
T  38619533 gcaa 38619536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20918017
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatat 94  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacaaaataatat 20918017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959556
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatat 94  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatat 22959556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 19660953 - 19660858
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||| |||||    
T  19660953 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcttgatataatgatatc 19660858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 36314580 - 36314675
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  36314580 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 21873254 - 21873453
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||      
T  21873254 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataggcaggatacaacatcagcatgacttcataatatcaatct 21873353  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    || |   ||||||||||||  ||||||  || |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || | |||||||||||    
T  21873354 catt---tcaacatcttaaccattcaataatatctt-aagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcac 21873448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 103
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064613
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatg 23064610  T
Q  101 caa 103  Q
    |||    
T  23064611 caa 23064613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26012151 - 26011988
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||| |    
T  26012151 tcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaacatgatataacaatatcaaat 26012054  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatca 166  Q
    |  | ||| |||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  26012053 gtgaatcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatca 26011988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067270
Alignment:
Q  4 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgca 102  Q
    ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 24067208  T
Q  103 attc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    | || |||| | ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  24067209 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 24067270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 40725860 - 40726069
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    | ||    
T  40725860 catcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaagcatcatgatataataatatcgcacgtaa 40725959  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacaga 202  Q
     | | |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  40725960 gtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacaga 40726059  T
Q  203 ttataattaa 212  Q
    | || |||||    
T  40726060 tcatcattaa 40726069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032492
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgc 101  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||  | ||||  ||||| ||| ||||| |    
T  22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaaacaatcatg--ataattataccaatt-c 22032419  T
Q  102 aattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaaca 175  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  22032420 aattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 22032492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766115
Alignment:
Q  64 cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  20766174 cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 20766115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 19668901 - 19669076
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || | ||| |||| |||||| | |    
T  19668901 tcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaat 19669000  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||||   ||||||| || ||||| ||||| ||   ||  ||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19669001 gcaa---atcaacaactcaaata-tcaaacataagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 19669076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 86
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704160
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacat 86  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 26704160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 86
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973893
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacat 86  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 26973893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806850
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagc 55  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaacagc 20806850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  14 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 67  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18770118 - 18769947
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacag-catgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  |||||  |||| ||| |||||    
T  18770118 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggtcgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatga--taattataccaatt 18770021  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaaca 175  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  18770020 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 18769947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20766087 - 20766035
Alignment:
Q  161 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  20766087 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 20766035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178161
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||  ||||| || | |||||||| ||||| ||| |||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 22178224  T
Q  114 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatc 177  Q
    ||| ||| | ||| ||||  |||| |||||| |||||   ||||||||||| || | |||||||    
T  22178223 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 22178161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 116
Target Start/End: Original strand, 29448052 - 29448123
Alignment:
Q  47 aacaacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  29448052 aacaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatct 29448123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Original strand, 23572084 - 23572254
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacag-catgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||   |||| ||||  |||||  |||| ||| |||||    
T  23572084 catcatcttaatcatcttatatggactcatgcaacttagttcaataacaataacagcataggcagatcacaacaacaatcatga--taattataccaatt 23572181  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaac 174  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  23572182 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaac 23572254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 67  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 20805552 - 20805616
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20805552 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 20805616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 20766974 - 20767037
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 65  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20766974 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggca 20767037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Original strand, 23469822 - 23469871
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  23469822 cttagaccgactcatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggcag 23469871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 23512098 - 23512162
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    |||||||||  ||| |||| | |||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23512098 catcatcttattcatcttataatgactcatgcactttagttaaataacaatagcagcataggcag 23512162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 61
Target Start/End: Original strand, 26680605 - 26680641
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26680605 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 26680641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 61
Target Start/End: Original strand, 26952212 - 26952248
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26952212 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 26952248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 73)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 44052832 - 44053071
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44052832 tcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 44052931  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44052932 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatcttaaacagcttcac 44053031  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44053032 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 44053071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12902760 - 12902992
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12902760 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 12902859  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12902860 gtaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcac 12902959  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12902960 agattataattaacctcttcattaagtcttaat 12902992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 7088880 - 7089116
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7088880 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7088979  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||    
T  7088980 gcaattcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattagcaacaacacatcttaaacaacttcac 7089079  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7089080 agattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 7089116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 22636438 - 22636669
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22636438 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 22636537  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22636538 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatctt-aacagcttcac 22636636  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22636637 agattataattaacatcctcgttaagtcttaat 22636669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16240087 - 16239856
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16240087 tcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 16239988  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16239987 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatcatatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcgca 16239888  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16239887 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 16239856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16270353 - 16270140
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16270353 tcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 16270254  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270253 caagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 16270154  T
Q  201 gattataattaaca 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  16270153 gattataatcaaca 16270140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 7893706 - 7893935
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7893706 tcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7893805  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  7893806 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcacatcataat---cagcaacacatcttaaacagcttcac 7893902  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7893903 agattataattaacatcatcgttaagtcttaat 7893935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374241
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaa 23374374  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  23374373 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacagatcttaaaaagcttcagagat 23374274  T
Q  204 tataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  23374273 tatagttaacctcttcattaagtcttaatgcta 23374241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377413
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaaatg 16377541  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16377540 caagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctccaca 16377441  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377440 gattataattaacatcatcattaagtct 16377413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038879
Alignment:
Q  3 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgc 14038752  T
Q  102 aattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 201  Q
    || ||| |||||||| || ||| ||   ||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14038753 aagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatgttaaacagcttcacag 14038852  T
Q  202 attataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14038853 attataattaatatcatcattaagtct 14038879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 7798777 - 7798958
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7798777 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7798876  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 181  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7798877 gcaagtcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaaca 7798958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 6899894 - 6900062
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||    
T  6899894 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaacaacatagcataataatatcaaatg 6899993  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataa 169  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6899994 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataa 6900062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14053419 - 14053188
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14053419 tcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaatt 14053321  T
Q  100 gcaattcatcaacat-cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 198  Q
     |||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  14053320 tcaattcatcaacattcttatgcatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacggcttca 14053222  T
Q  199 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  14053221 cagattataattaacctcattgttaagtcttaat 14053188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 17046490 - 17046719
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||  || ||||||||||| ||||||| |    
T  17046490 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatagaa--caacatgacataattatatcaaat 17046587  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  17046588 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaacatatcttattcagcttcac 17046686  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  17046687 agattataattaaccttattattaagtcttaat 17046719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 52873485 - 52873363
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873485 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 52873386  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaata 122  Q
    |||| ||| || |||||||||||    
T  52873385 gcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928829
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaat 44928943  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 198  Q
    |||| |||  ||||||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| |||| ||||||||    
T  44928942 gcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacataaaatcatcataaatcagcttca 44928843  T
Q  199 cagattataattaa 212  Q
    ||||| || |||||    
T  44928842 cagatcatcattaa 44928829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13790
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 13854  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    | ||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  13853 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215274
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18215338  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18215337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18215274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798669
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 54798773  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 198  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54798772 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 54798683  T
Q  199 cagattataattaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  54798682 cagattatcattaa 54798669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243099
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||| || |||||| |    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaac 52243203  T
Q  110 aacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataa 208  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||  | ||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || |    
T  52243202 aacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcatca 52243103  T
Q  209 ttaa 212  Q
    ||||    
T  52243102 ttaa 52243099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12307
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12371  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  12370 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837494
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaat 1837573  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  1837572 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattataa-caacatcaa 1837494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118352
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15118416  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  15118415 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15118352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803265
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23803329  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  23803328 gcaaatcaacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 23803265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615450
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa-acagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 44615386  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  44615387 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44615450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312672
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 52312608  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  52312609 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 52312672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515169
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaat 3515105  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  3515106 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 3515169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 19242699 - 19242861
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19242699 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19242797  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  19242798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19242861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773087
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44773151  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| | ||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  44773150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44773087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222339
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 50222403  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  50222402 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 50222339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463868
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 51463932  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  51463931 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 51463868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280518
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 14280414  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 198  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||  |   ||  ||||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14280415 gcaagtcaacaacatctcaaatatagattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 14280504  T
Q  199 cagattataattaa 212  Q
    |||||||| |||||    
T  14280505 cagattatcattaa 14280518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239419
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18239483  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  18239482 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 18239419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19618330 - 19618172
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19618330 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 19618232  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| |||| ||| || ||||||  |||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  19618231 gtcaacaacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19618172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 226
Target Start/End: Original strand, 3096759 - 3096872
Alignment:
Q  112 catcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3096759 catcataaatattcaaatattcttcaagtaatgcata-aacattgtatctcatcataatcagcaacaacacatcttaaacagcttcacatattataatta 3096857  T
Q  212 acatcatcattaagt 226  Q
    || ||||||||||||    
T  3096858 acctcatcattaagt 3096872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198492
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||   ||||| ||||  ||||||| ||||| |||||    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  110 aacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    || |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 43198492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102425
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44102312  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 198  Q
    |||| | | |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| || ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  44102313 gcaagtaaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttca 44102411  T
Q  199 cagattataattaa 212  Q
    ||||| || |||||    
T  44102412 cagatcatcattaa 44102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355324
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15355385  T
Q  104 ttc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  15355384 gtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 15355324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574864
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 8574887  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatat 123  Q
     |||||| |||||||| ||||||    
T  8574886 taattcaacaacatctcaaatat 8574864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 15367697 - 15367905
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15367697 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15367795  T
Q  104 ttc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacag 201  Q
     || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||| | |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  15367796 gtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcacag 15367894  T
Q  202 attataattaa 212  Q
    || || |||||    
T  15367895 atcatcattaa 15367905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 15402710 - 15402918
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15402710 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15402808  T
Q  104 ttc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacag 201  Q
     || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||| | |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  15402809 gtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcacag 15402907  T
Q  202 attataattaa 212  Q
    || || |||||    
T  15402908 atcatcattaa 15402918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 3096296 - 3096379
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatga 83  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3096296 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611105
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||      |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-aca------aaaacagcatgacataataatatcaaatg 12611042  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    ||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  12611043 caaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12611105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 15371209 - 15371417
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15371209 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15371307  T
Q  104 ttc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacag 201  Q
     || |||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||| | |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  15371308 gtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcacag 15371406  T
Q  202 attataattaa 212  Q
    || || |||||    
T  15371407 atcatcattaa 15371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 15373490 - 15373698
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15373490 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15373588  T
Q  104 ttc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacag 201  Q
     || |||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||| | |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  15373589 gtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcacag 15373687  T
Q  202 attataattaa 212  Q
    || || |||||    
T  15373688 atcatcattaa 15373698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 43256230 - 43256106
Alignment:
Q  47 aacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaata-ttcttcaagtaatgt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||     
T  43256230 aacaacagcaacataggcagcataccaa-caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatgc 43256133  T
Q  146 atataacattatatcacatcataatca 172  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||    
T  43256132 atataatattatatcacattataatca 43256106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14970858 - 14970707
Alignment:
Q  12 atcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 110  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  14970858 atcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaacag-caatatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 14970760  T
Q  111 acatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    || ||| || |||||| ||||  ||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  14970759 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataattatatcaca 14970707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17048070 - 17047958
Alignment:
Q  120 atattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 219  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   || ||    
T  17048070 atattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacaggttgtaattagtctcttc 17047971  T
Q  220 attaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||    
T  17047970 attaagtcttaat 17047958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 15370025 - 15370232
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15370025 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15370123  T
Q  104 ttc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacag 201  Q
     || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| | | | |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  15370124 gtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaact-acgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcacag 15370221  T
Q  202 attataattaa 212  Q
    || || |||||    
T  15370222 atcatcattaa 15370232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 39706406 - 39706286
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  39706406 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 39706307  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaa 120  Q
    |||| |||| |||||| ||||    
T  39706306 gcaagtcatgaacatcataaa 39706286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641192
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca----------aaaacaacatgacataataatatcaaatg 7641255  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    ||| ||| |||| ||| || |||| | ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  7641254 caagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7641192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 15551820 - 15551915
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||||||||||    
T  15551820 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgatataataatatc 15551915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 22353836 - 22353999
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  |  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  22353836 tcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaatt 22353935  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||||||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  22353936 acaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22353999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288211
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||||||| |    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaac 12288217  T
Q  110 aacatc 115  Q
    ||||||    
T  12288216 aacatc 12288211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 95
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774105
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 12774105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 16223539 - 16223747
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  16223539 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatctaatgcaa 16223637  T
Q  104 ttc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacag 201  Q
     || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| |||   |||||  |||||||||||  |||| ||||||||   |||| |||| |||||||||||    
T  16223638 gtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacccatatacaattatatcacaatataa-caacatcacatcatcataaatcagcttcacag 16223736  T
Q  202 attataattaa 212  Q
    || || |||||    
T  16223737 atcatcattaa 16223747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Original strand, 20149832 - 20149992
Alignment:
Q  4 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgca 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 20149930  T
Q  103 attc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    | || |||| | ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  20149931 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 20149992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815587
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-ctgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtc 21815633  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatca 161  Q
    | || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  21815632 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatca 21815587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 95
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846454
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgagataacaatatc 8846454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Original strand, 15093775 - 15093955
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||  ||   |||| ||||||||||| | ||||||||||||     
T  15093775 catcatcttaatcatcttgtattgactcatgcaacttagttaaagaacaatagcagcatagaaagatcacaacaacagcatgacttcataatatcaattt 15093874  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 181  Q
    || |||  |||||| ||||  ||||||  ||   | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15093875 catttctacaacatattaatcattcaataatatattaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaaca 15093955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190564
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaat 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||| |||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaat 6190564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Original strand, 17333298 - 17333356
Alignment:
Q  19 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  17333298 tagactgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagacagtacataaaaca 17333356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15121834 - 15121747
Alignment:
Q  85 ataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaac 174  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  15121834 ataattatatcaatt-caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaac 15121747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640475
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaa 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaa 46640475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 112
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596763
Alignment:
Q  36 cttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaac 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| | || || ||||||||    
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaac 16596763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8574836 - 8574784
Alignment:
Q  161 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  8574836 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 8574784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 16348780 - 16348716
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16348780 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 16348716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 16357068 - 16357004
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16357068 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 16357004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082171
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaa 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| | |||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaa 53082171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 228
Target Start/End: Original strand, 15091093 - 15091127
Alignment:
Q  194 cttcacagattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15091093 cttcacagattataattaacatcttcattaagtct 15091127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 11250656 - 11250619
Alignment:
Q  24 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11250656 tgactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 11250619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 179
Target Start/End: Original strand, 8846474 - 8846553
Alignment:
Q  99 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  8846474 tgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 8846553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15353401 - 15353365
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353401 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 15353365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 20536211 - 20536443
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20536211 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 20536310  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20536311 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatcttaaacaacttcac 20536410  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20536411 agattataattaacatcctcattaagtcttaat 20536443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18818527 - 18818286
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18818527 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 18818428  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    | || ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818427 gtaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 18818328  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatccta 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18818327 agattataattaacatcctcattaagtcttaatactacccta 18818286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22626739 - 22626966
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  22626739 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaata 22626838  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22626839 caaatcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagcttcaca 22626938  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22626939 gattataattaacatcctcattaagtct 22626966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18879349 - 18879116
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |  ||||||||||||||||||    
T  18879349 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa----acaacataataatatcaattg 18879254  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  18879253 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatctt-atcagcttcaca 18879155  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18879154 gattatagttaacatcatcattaagtcttgatgctatcc 18879116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21919118 - 21918886
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919118 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 21919019  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaat-attcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21919018 gcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcagcagcaacacatcttaaacagcttca 21918920  T
Q  199 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21918919 cagatcgtaattaacctcatcgttaagtcttaat 21918886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21924046 - 21923814
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  21924046 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaatt 21923947  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21923946 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataaccttattttgcatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcac 21923847  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923846 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 21923814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28649162 - 28648934
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  28649162 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaat 28649063  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| ||   ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649062 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 28648963  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28648962 atattataattaacatcatcattaagtct 28648934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 31971260 - 31971490
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  31971260 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaattc 31971359  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||    
T  31971360 caattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacatcttcaca 31971458  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  31971459 gattataattaacctcattgttaagtcttaat 31971490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 7372781 - 7373001
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372781 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7372880  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||         |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372881 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatg--------cttatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 7372972  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7372973 agattataattaacatcctcattaagtct 7373001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 23406382 - 23406611
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23406382 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 23406481  T
Q  100 gcaattcatcaa--catcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 197  Q
    |||| ||| ||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23406482 gcaagtcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacatagtcaacatcaacacatcttaaacaacttc 23406581  T
Q  198 acagattataattaacatcatcattaagtc 227  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23406582 acatattataattaacatcctcattaagtc 23406611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 23648560 - 23648788
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  23648560 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatcatttgcaa 23648659  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 203  Q
    | || |||||||||||||||||||  |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23648660 tacaacaacatcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttaacagat 23648759  T
Q  204 tataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23648760 tataattaacatcatcattaggtcttaat 23648788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45131114 - 45130884
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  45131114 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaacaaa-cagcatgacataataatatcaattt 45131016  T
Q  101 caa-ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||    
T  45131015 caaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcatcaacaacaaatcttatacagcttcac 45130917  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45130916 agattataattaacctcattattaagtcttaat 45130884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 22875068 - 22875291
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22875068 tcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 22875167  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcac 199  Q
    ||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22875168 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcac 22875267  T
Q  200 agattataattaacatcatcatta 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  22875268 agattataattaacatcaccatta 22875291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16092460 - 16092231
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16092460 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16092361  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 198  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  16092360 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataatttaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacaacttcg 16092261  T
Q  199 cagattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16092260 catattataattaacatcatccttaagtct 16092231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 6759261 - 6759487
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  6759261 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 6759360  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 198  Q
    ||||    ||||||||| || ||| ||   ||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6759361 gcaa---gtcaacatctcaattatacactcataattcaattaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 6759457  T
Q  199 cagattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759458 cagattataattaacatcatcattaagtct 6759487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16199762 - 16199532
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  16199762 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa-caacatgacataataatatcaatt 16199664  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     ||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  16199663 tcaattcatctacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatattacatcataatcaacaacaacatatcttatacagcttcac 16199565  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  16199564 agattataattaacctcattgttaagtcttaat 16199532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21389568 - 21389353
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||| |    
T  21389568 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaat 21389471  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  21389470 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcac 21389372  T
Q  200 agattataattaacatcat 218  Q
    | |||| ||||||| ||||    
T  21389371 atattacaattaacttcat 21389353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21396098 - 21395888
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| |    
T  21396098 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatcaaat 21396001  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||  |||||||||    
T  21396000 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagcttcac 21395902  T
Q  200 agattataattaac 213  Q
    |||||| |||||||    
T  21395901 agattacaattaac 21395888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21790591 - 21790381
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| |    
T  21790591 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatcaaat 21790494  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||  |||||||||    
T  21790493 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagcttcac 21790395  T
Q  200 agattataattaac 213  Q
    |||||| |||||||    
T  21790394 agattacaattaac 21790381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21778894 - 21778697
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||| |    
T  21778894 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaat 21778797  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  21778796 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcac 21778698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409444
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14409508  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  14409507 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14409444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484564
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 1484500  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  1484501 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 1484564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853292
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 5853356  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  5853355 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 5853292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413316
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 16413376  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  16413375 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 16413316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403389
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20403325  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  20403326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20403389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001915
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22001851  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  22001852 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22001915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598399
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41598286  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 198  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||| ||||    
T  41598287 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagtttca 41598385  T
Q  199 cagattataattaa 212  Q
    ||||| || |||||    
T  41598386 cagatcatcattaa 41598399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483442
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4483378  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  4483379 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4483442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542373
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4542437  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  4542436 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4542373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13508199 - 13508024
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  13508199 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaa 13508100  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
     | | |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  13508099 gtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13508024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203231
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15203295  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    | || ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  15203294 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15203231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18678216 - 18678093
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18678216 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaa 18678117  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaa 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  18678116 ttcaacaacatcttaaatattcaa 18678093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046195
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 20046259  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||| | ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  20046258 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20046195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498744
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 20498680  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    | ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  20498681 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 20498744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25363138 - 25363026
Alignment:
Q  120 atattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 219  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  25363138 atattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattataccacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttc 25363039  T
Q  220 attaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||    
T  25363038 attaagtcttaat 25363026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13597731 - 13597556
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  13597731 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaa 13597632  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
     | | |||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  13597631 gtaaacaacatcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13597556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Original strand, 32121739 - 32121862
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32121739 catcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaa 32121838  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaa 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  32121839 ttcaacaacatcttaaatattcaa 32121862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219838
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaatagtatgacataataatatcaaatg 26219815  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  26219816 caagtcaacaacatctcaaatat 26219838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 6520371 - 6520491
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  6520371 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 6520470  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  6520471 gcaagtcatcaacatcataaa 6520491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801333
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtct 19801429  T
Q  117 taaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 212  Q
     || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||| ||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  19801428 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataa-caacatcaagtcatcgtaaatcagcttcacagatcatcattaa 19801333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896430
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgac---ataataatatca 96  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatca 19896363  T
Q  97 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    | ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  19896364 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19896430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 38855369 - 38855246
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  38855369 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 38855270  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  38855269 gcaaatcaacaacatctcaaatat 38855246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225288
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acaatatacaaaacagtatgacataataatatcaaata 26225311  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  26225310 caagtcaacaacatctcaaatat 26225288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 17140919 - 17141031
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||| | |    
T  17140919 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgacataataatatcgaat 17141018  T
Q  100 gcaattcatcaac 112  Q
    | || ||||||||    
T  17141019 gtaaatcatcaac 17141031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17612224 - 17612018
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    | ||    
T  17612224 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaa 17612125  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacaga 202  Q
     | | |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||   ||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  17612124 gtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattata---aacatcaaatcatcataaatcagcttcacaga 17612028  T
Q  203 ttataattaa 212  Q
    | || |||||    
T  17612027 tcatcattaa 17612018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285758
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 21285700  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatat 159  Q
    ||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  |||||||    
T  21285701 caaatcaacaacatctcaaaca-tcaaacatagttcatgtaatgtatatacaattatat 21285758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 21490998 - 21491092
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatat 94  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  21490998 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatat 21491092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 5866392 - 5866297
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  5866392 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatc 5866297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823935
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14823871  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  14823872 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14823935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484275
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagcta--------gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25484339  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  25484338 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 25484275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290761
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 97  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 45290761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 19937168 - 19937066
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19937168 tcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataagatcaaat 19937070  T
Q  100 gcaa 103  Q
    ||||    
T  19937069 gcaa 19937066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 26223923 - 26224081
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | || || |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26223923 catcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaataaag-caatatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaa 26224021  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| |||||||| || |||||| ||||  || || ||||| |||||  |||||||||||    
T  26224022 gtcaacaacatctcaattattcacatataatttaattaatgcatatacaattatatcaca 26224081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070660
Alignment:
Q  14 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15070660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983407
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||  ||||| |||| ||| |||| ||||||||| |    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  110 aacatc 115  Q
    ||||||    
T  983412 aacatc 983407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23760961 - 23760839
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| |||||  | |     
T  23760961 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcatcatgatataacaatattgaatt 23760862  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  23760861 caaatcaacaacatctcaaatat 23760839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23776952 - 23776772
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||   |||| | ||||||||| |  |||||||||||     
T  23776952 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataactatagcagcataggcagatcacaacatcagcatgacttcttaatatcaattt 23776853  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 181  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||  || |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23776852 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatctt-aagtaatgcacataacattatataacatcatattcaacatcaaca 23776772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355712
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| || || || |||| |||||| | ||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcacgatataacaatatcgaatg 26355716  T
Q  101 caat 104  Q
    ||||    
T  26355715 caat 26355712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 21673716 - 21673830
Alignment:
Q  10 tcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||     
T  21673716 tcatcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa 21673815  T
Q  109 caacatcttaaatat 123  Q
    |||||||| ||||||    
T  21673816 caacatctcaaatat 21673830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116530
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37116465  T
Q  114 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||| ||| | ||| ||||  |||| |||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||    
T  37116466 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 37116530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 21249387 - 21249483
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaat--aacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||| |||  || ||||| |||||||||||    
T  21249387 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatc 21249483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 21255225 - 21255321
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaat--aacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||| |||  || ||||| |||||||||||    
T  21255225 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatc 21255321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17439601 - 17439423
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaat 121  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||     
T  17439601 gactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaac 17439502  T
Q  122 attcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcaca 200  Q
    | ||| ||||  |||| |||||| |||||  | |||||||||| || |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||    
T  17439501 a-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatattataacagcttcaca 17439423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353140
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaaca 24353137  T
Q  114 tct 116  Q
    |||    
T  24353138 tct 24353140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26223039 - 26222987
Alignment:
Q  161 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  26223039 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 26222987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266994
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| | ||||| |  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
Q  114 tct 116  Q
    |||    
T  17266996 tct 17266994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 19154981 - 19154928
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaca 77  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19154981 gactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaaca 19154928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 212
Target Start/End: Original strand, 26219862 - 26219918
Alignment:
Q  157 tatcacatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  26219862 tatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 26219918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 20533506 - 20533467
Alignment:
Q  22 actgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20533506 actgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacata 20533467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Original strand, 22525579 - 22525637
Alignment:
Q  19 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaca 77  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| | ||||||    
T  22525579 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacaacaacttaggcagtacataaaaca 22525637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 20502203 - 20502154
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  20502203 cttagaccgactcatgcagcttaattaacatacaacagcaacataggcag 20502154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 17354060 - 17353996
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  17354060 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 17353996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 17926822 - 17926758
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||    
T  17926822 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcag 17926758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 72)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22731352 - 22731120
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22731352 tcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 22731253  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731252 gcaattcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22731153  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22731152 agattataattaacatcctcattaagtcttaat 22731120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22738297 - 22738066
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22738297 tcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 22738199  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738198 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22738099  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22738098 agattataattaacatcctcattaagtcttaat 22738066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 23285868 - 23286096
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  23285868 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaa--ca-gacataataatatcaattg 23285964  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23285965 caattcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcaca 23286064  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23286065 gattataattaacatcttcattaagtcttaat 23286096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 23060516 - 23060742
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23060516 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 23060615  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060616 gcaagtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 23060715  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtc 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23060716 a-attataattaacatcatcattaagtc 23060742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23076445 - 23076666
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23076445 tcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 23076544  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23076545 gcaagtcaacaatatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacagcttaaacagcttcac 23076644  T
Q  200 agattataattaacatcatcat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23076645 agattataattaacatcatcat 23076666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23654504 - 23654268
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa-acagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23654504 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaatt 23654405  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23654404 gcaattcatcaacatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaacaacaacacatcttaaacagcttcac 23654305  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23654304 agattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 23654268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38232 - 38002
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38232 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattt 38133  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    | |||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| |    
T  38132 cgattcatcatcatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatgtcttatacagcttcaga 38034  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  38033 gattataattaacctcattgttaagtcttaat 38002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 23660026 - 23660253
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  23660026 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatacgaaacaggatgacataataatatcaaatg 23660125  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||  ||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23660126 caaatcaacaacatcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctttaca 23660225  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23660226 aattataattaacatcatcaataagtct 23660253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298696
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaat 98  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  99 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaataacaacacatcttatacagcttca 298734  T
Q  199 cagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    || |||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  298733 catattatagttaacctcttcattaagtcttaatgcta 298696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 22337118 - 22337350
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22337118 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaaat 22337217  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22337218 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaacaacttcac 22337317  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337318 aaattataattaacatcatcattaagtcttaat 22337350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 20309111 - 20309340
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |    
T  20309111 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaat 20309208  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  20309209 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcac 20309307  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  20309308 agattatagttaacctcattcttaagtcttaat 20309340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23708735 - 23708518
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  23708735 tcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaatt 23708638  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttca 198  Q
    |||| ||||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  23708637 gcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatcttataacagcttca 23708538  T
Q  199 cagattataattaacatcat 218  Q
    ||||| || ||||| |||||    
T  23708537 cagatcatcattaatatcat 23708518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105575
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22105511  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  22105512 gcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22105575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155060
Alignment:
Q  4 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgca 102  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 21155121  T
Q  103 attcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    | ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  21155120 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21155060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809105
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18809041  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18809042 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18809105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23131024
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23130960  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  23130961 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23131024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133491
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23133427  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  23133428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23133491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709532
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23709596  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  23709595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23709532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712013
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23712077  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  23712076 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23712013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505541
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26505477  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  26505478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26505541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26508019
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26507955  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  26507956 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26508019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402522
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34402586  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  34402585 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34402522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682475
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39682411  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  39682412 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39682475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571559
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 571495  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || | |||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  571496 gcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 571559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726157
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6726093  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    | || ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  6726094 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 6726157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135752
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23135688  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  23135689 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 23135752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367936
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24367872  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24367873 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24367936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 239
Target Start/End: Original strand, 27753730 - 27753817
Alignment:
Q  152 cattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27753730 cattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacatattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 27753817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32215079 - 32214921
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32215079 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 32214981  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  32214980 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 32214921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7687
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 7736  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    | ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7735 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacat 7687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898195
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaat 98  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24898260  T
Q  99 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24898259 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24898195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900678
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaat 98  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24900743  T
Q  99 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24900742 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24900678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903155
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaat 98  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24903220  T
Q  99 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24903219 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24903155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905632
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaat 98  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24905697  T
Q  99 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24905696 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24905632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908107
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaat 98  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24908172  T
Q  99 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24908171 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24908107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 23103513 - 23103399
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |     
T  23103513 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac-aaacagcatgacatgattatatcaaatt 23103415  T
Q  101 caattcatcaacatct 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  23103414 caattcatcaacatct 23103399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039498
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32039562  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  32039561 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32039498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 19671837 - 19672043
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  19671837 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaa 19671936  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacaga 202  Q
     | | ||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| || | ||||||||||||    
T  19671937 gtaaacaacatc-tcaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa-caacatcaa-tcatcatagatcagcttcacaga 19672033  T
Q  203 ttataattaa 212  Q
    |||| |||||    
T  19672034 ttatcattaa 19672043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679751
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||| ||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaa-tg 7679687  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatc 165  Q
     || ||||||||||| |||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  7679688 taagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatataattatataacatc 7679751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616315
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaa 25616291  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaa 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  25616292 ttcaacaacatcttaaatattcaa 25616315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577261
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 28577197  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    ||||  || |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  28577198 gcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 28577261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137461
Alignment:
Q  3 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgc 101  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 43137399  T
Q  102 aattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    || ||| |||| ||| || | |||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  43137400 aagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 43137461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029854
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-acaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 45029918  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||   ||||||||||    
T  45029917 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatatcaca 45029854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 8946660 - 8946737
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacag 78  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8946660 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaacataggcagtatacaaaacag 8946737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25175976
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 25175953  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  25175954 caaatcaacaacatctcaaatat 25175976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529528
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagt 24529593  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaata-ttcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| | | |||| ||| || || |||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  24529592 gcaagttaacaacgtctcaattatttcatatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 24529528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967537
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacaca-acaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaat 38967472  T
Q  100 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| || |||||||||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  38967473 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 38967537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406103
Alignment:
Q  3 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatat 28406103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 23040307 - 23040247
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040307 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 23072067 - 23071972
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  23072067 tcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatc 23071972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22799243 - 22799063
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||| |||||| | ||||||||||||     
T  22799243 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacatcatgacttcataatatcaattt 22799144  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 181  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||  || |||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22799143 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatctt-aagtaaggcacataacattatatcacatcatattcaacattaaca 22799063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22134324 - 22134221
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||| | ||    
T  22134324 tcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaatg 22134225  T
Q  101 caat 104  Q
    ||||    
T  22134224 caat 22134221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520092
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaaca 20520197  T
Q  114 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaa 212  Q
    ||| ||| | ||| ||||  ||||||||||| |||||  | |||||||||| || | | |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  20520196 tctcaaaca-tcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaatcatcttataacaacttcacagattatcattaa 20520098  T
Q  213 catcat 218  Q
     |||||    
T  20520097 tatcat 20520092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23019823 - 23019643
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||| |||||| | ||||||||||||     
T  23019823 catcatcttaatcatcttatattgactcataaaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacatgacttcataatatcaattt 23019724  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 181  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||  || |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23019723 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatctt-aagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaaca 23019643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643054
Alignment:
Q  4 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 59  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786907
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||  ||||| |||| ||| |||| ||||||||| |    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 18786910  T
Q  110 aac 112  Q
    |||    
T  18786909 aac 18786907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207398
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| | |||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgaca 23207395  T
Q  114 tct 116  Q
    |||    
T  23207396 tct 23207398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451811
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa-ca 113  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||| |||||||| |||||  || ||| ||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa-tgcaagccaacaatca 32451933  T
Q  114 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcat-aatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 212  Q
    ||| || ||||||  ||  ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||   | | |||||||||||| ||| |||||||    
T  32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acataatatcacatcataaatcaacattaacatcccat-aacagcttcacaaattgtaattaa 32451835  T
Q  213 catcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
     |||||  | ||||||||||||||    
T  32451834 tatcatattcaagtcttaatgcta 32451811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40622327 - 40622123
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacag-catgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||  |||| |||||||||    
T  40622327 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatga--taattatatcaatt 40622230  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattca-----aatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacag 193  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||     |||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||    
T  40622229 -caattcatcaacatcttatgtatacagtacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaaca-caa-acatctcataacag 40622134  T
Q  194 cttcacagatt 204  Q
    |||||||||||    
T  40622133 cttcacagatt 40622123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287442
Alignment:
Q  19 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaca 77  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagtacataaaaca 23287442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 67
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  19 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 67  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22459575 - 22459500
Alignment:
Q  105 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaac 180  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||    
T  22459575 tcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaac 22459500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413035
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataata--atatcaattgcaattcatcaa 111  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |  ||||||| ||||| ||| |||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaa 22413141  T
Q  112 catcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataatt 210  Q
    ||||| ||    ||| | ||  |||| |||||| |||||   ||||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  22413140 catctcaa--catcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagattaacatt 22413043  T
Q  211 aacatcat 218  Q
    || |||||    
T  22413042 aatatcat 22413035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791456
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||  | | |||| |||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaaca 23791391  T
Q  114 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||| ||| ||| | ||||  |||| |||||| |||||   ||||||||||| || | |||||||||    
T  23791392 tctcaaacatt-atatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaa 23791456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 23038048 - 23038116
Alignment:
Q  19 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacat 86  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  23038048 tagacggactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 23038116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 116
Target Start/End: Original strand, 23004775 - 23004869
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| | |||| ||  || || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  23004775 gactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaacatct 23004869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24697709 - 24697512
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||  ||||| || |||| ||||||||| |  ||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  24697709 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaacaacaacgtaggcagtacatcaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 24697610  T
Q  114 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 212  Q
    ||| |||  |||| |||   |||| |||||| |||||   ||||||||||| || | |||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| || |||||    
T  24697609 tctcaaac-ttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataaaatcatattatacagcttcacagatcatcattaa 24697512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24642933 - 24642856
Alignment:
Q  86 taataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24642933 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24642856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 25961629 - 25961592
Alignment:
Q  24 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25961629 tgactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 25961592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 24655432 - 24655396
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655432 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 24655396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 61
Target Start/End: Original strand, 24869903 - 24869939
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24869903 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 24869939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 25963832 - 25963768
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25963832 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcag 25963768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 3473 - 3705
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3473 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 3572  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3573 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcat 3672  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3673 agattataattaacatcctcattaagtcttaat 3705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 346 - 573
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  346 tcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatacaaaatagcatgacgtaataatatcaattg 445  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
     || ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  446 gaagtcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcata 545  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||    
T  546 tattataattaacatcctcattaagtct 573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20361078 - 20360846
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20361078 tcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 20360979  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20360978 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcac 20360879  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20360878 atattataattaacctcatcattaagtcttaat 20360846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20638401 - 20638162
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20638401 tcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 20638302  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638301 gcaatttatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcataaaacgttatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 20638202  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20638201 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgttatcc 20638162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22780345 - 22780116
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  22780345 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatcaatt 22780246  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780245 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22780146  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtctt 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22780145 agattatgattaacatcatcattaagtctt 22780116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17287914 - 17287678
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa-acagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17287914 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaatt 17287815  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17287814 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatgtcataacataatcaacctcaacacatcttaaacagcttcac 17287715  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17287714 aggttataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 17287678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 29060543 - 29060771
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  29060543 tcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 29060642  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060643 gcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatctcatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 29060742  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29060743 agattataattaatatcatcattaagtct 29060771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19303658 - 19303435
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  19303658 tcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaggaagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 19303559  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19303558 caagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttcaacagcttcaca 19303459  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19303458 gattataattaacatcatcattaa 19303435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18409945 - 18409704
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18409945 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaat 18409846  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| |||||||| ||  || ||   ||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409845 gcaagtcaacaacatctcaatcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 18409746  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatccta 241  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  18409745 atattataattaacatcatcattaagtctcaatactacccta 18409704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25629473 - 25629245
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25629473 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaat 25629374  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629373 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 25629274  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25629273 agattataattaacaacatcattaagtct 25629245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20593776 - 20594004
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20593776 tcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaat 20593875  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593876 gcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataaatcaagtaatgcgtataacaatatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 20593975  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20593976 agattataattatcattatcattaagtct 20594004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 16496247 - 16496411
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16496247 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaatt 16496346  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  16496347 gcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcacat 16496411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 20076703 - 20076863
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20076703 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 20076802  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    |||   |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20076803 caa---atcaacatcttaaaaattcaattatacttcaagtaatgcgtataacattatatcacat 20076863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16920748 - 16920519
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||| |    
T  16920748 tcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatacaa--catcatgacataagtatatcaaat 16920651  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     | ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||     
T  16920650 tccattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataccacatcataatcaacaacaacttatcttattcagcttcat 16920552  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16920551 agattatagttaacctcattcttaagtcttaat 16920519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 35245589 - 35245758
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  35245589 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaa--caacatgacataataatatcaatt 35245686  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatca 172  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  35245687 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatca 35245758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595711
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 1595647  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||||||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  1595648 gcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcaca 1595711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 22831506 - 22831737
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||  |  ||||||||||| ||||||| |    
T  22831506 tcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcactgttcaa--cgacatgacataatcatatcaaat 22831603  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaat--attcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 197  Q
     |||||||||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||    
T  22831604 tcaattcatcaacatcttagatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagcttc 22831702  T
Q  198 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||    
T  22831703 acagattatagttaacctcattctcaagtcttaat 22831737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742479
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12742415  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  12742416 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12742479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334592
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18334656  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18334655 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18334592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005208
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19005144  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  19005145 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19005208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858919
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19858983  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  19858982 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19858919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 20109143 - 20109322
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||| |    
T  20109143 tcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacataatataacaatatcaaat 20109240  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatat--aacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  20109241 gcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 20109322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782389
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22782325  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| | ||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  22782326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22782389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422709
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24422645  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24422646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24422709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754971
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25754907  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  25754908 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 25754971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861956
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33861892  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  33861893 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33861956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864440
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33864376  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  33864377 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33864440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25603482 - 25603267
Alignment:
Q  21 gactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaa 119  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||  |||||| | |||||| ||    
T  25603482 gactgactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattca-ctacatctcaa 25603384  T
Q  120 atattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 219  Q
     |||||||  |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||    
T  25603383 ttattcaataaaacttcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttcacagattctattaaacatcgtc 25603284  T
Q  220 attaagtcttaatgcta 236  Q
    |||||||||||| ||||    
T  25603283 attaagtcttaaagcta 25603267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644543
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| || || ||||||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  111 acatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataat 209  Q
    |||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||  ||||  |||||||||||||| || |||||||||  |||| || | ||||||||||||| || ||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacatcaaatcatcatatatcagcttcacagatcatcat 25644534  T
Q  210 taacatcat 218  Q
    ||| |||||    
T  25644535 taatatcat 25644543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291180
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2291244  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  2291243 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 2291180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055191
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-aaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8055127  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  8055128 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8055191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924640
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 26924704  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  26924703 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26924640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30676868 - 30676710
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30676868 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaa 30676770  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  30676769 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 30676710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656791
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25656727  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| | |  ||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||||  |||||  |||||||||||    
T  25656728 gcaagttaataacgtctcaattattcacatataattcaactaatacatatataattatatcaca 25656791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 34963377 - 34963535
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  34963377 catcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 34963475  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  34963476 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 34963535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456930
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18456833  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 212  Q
    | || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  18456834 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 18456930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540911
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaat 1540975  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  1540974 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 1540911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688644
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 25688600  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaat 143  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||    
T  25688601 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 25688644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448526
Alignment:
Q  4 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgca 102  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16448588  T
Q  103 attc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    | || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  16448587 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 16448526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19848109 - 19847949
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  19848109 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaattgcaa 19848010  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaata-ttcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||||||||| |||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  19848009 ttcaacaatatcttaaatatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 19847949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25611820 - 25611605
Alignment:
Q  21 gactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaa 119  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||  |||||| | |||||| ||    
T  25611820 gactgactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattca-ctacatctcaa 25611722  T
Q  120 atattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 219  Q
     |||||||  |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| ||    
T  25611721 ttattcaataaaacttcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttcatagattctgttaaacatcgtc 25611622  T
Q  220 attaagtcttaatgcta 236  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  25611621 attaagtcctaaagcta 25611605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852017
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaat 3852081  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  3852080 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 3852017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 232
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185737
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||  |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatgtgcagtgtac--aacaacatgacataattatatcaaattcaattcatcagcatc 11185621  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacat 215  Q
    ||   ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||  || ||||||||||||   ||||| |    
T  11185622 ttttgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aactttataacacttcataatcagcaacaacatatcttattcatcttcacagattacggttaacct 11185720  T
Q  216 catcattaagtcttaat 232  Q
    ||  |||||||||||||    
T  11185721 cactattaagtcttaat 11185737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15041644 - 15041441
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| |||    
T  15041644 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatcttaagtat 15041545  T
Q  124 tcaa-atattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcatt 222  Q
    |||| | | || |||||||||| | || |||||| | || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||    
T  15041544 tcaataaaatc-tcaagtaatgcacat-acattaaaccaaatcttaattatcatcaacacatcttaaacagctttacagattgtatctaacatcatcatt 15041447  T
Q  223 aagtct 228  Q
    | ||||    
T  15041446 aggtct 15041441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556894
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaat 20556956  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| ||   |||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  20556955 gcaagtcaacaacgtctcaa--tttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20556894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462028
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18461993  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatata 150  Q
    | || |||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  18461994 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 18462028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27416011 - 27415887
Alignment:
Q  47 aacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaat-attcttcaagtaatgt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||     
T  27416011 aacaacagcaacataggcagcatacaaa-cagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatcttgagtattcaaataattctt-aggtaatgc 27415914  T
Q  146 atataacattatatcacatcataatca 172  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27415913 ataaaacattatatcacattataatca 27415887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Original strand, 23992434 - 23992554
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23992434 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaa 23992533  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaa 127  Q
    |   ||||||||||||||||||||    
T  23992534 t---tcaacatcttaaatattcaa 23992554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 27333336 - 27333241
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  27333336 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 27333241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 27394076 - 27393981
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  27394076 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 27393981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8227625 - 8227416
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    | ||    
T  8227625 catcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaa 8227526  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacaga 202  Q
     | | |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  8227525 gtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacaga 8227426  T
Q  203 ttataattaa 212  Q
    | || |||||    
T  8227425 tcatcattaa 8227416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 28496589 - 28496494
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  28496589 tcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatc 28496494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 29809000 - 29808905
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  29809000 tcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatc 29808905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 1561306 - 1561478
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| | |    
T  1561306 tcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaat 1561405  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacat 176  Q
    ||||   ||||||| || |||||| |||| ||   ||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||    
T  1561406 gcaa---atcaacaactcaaatat-caaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacat 1561478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652302
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 19652298  T
Q  101 caat 104  Q
    ||||    
T  19652299 caat 19652302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 25714420 - 25714478
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 59  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714420 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 23019411 - 23019572
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  23019411 tcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 23019508  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    |||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  23019509 gcaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 23019572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 4185930 - 4185827
Alignment:
Q  10 tcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcat 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||| |||||| | ||||||||||    
T  4185930 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcat 4185831  T
Q  109 caac 112  Q
    ||||    
T  4185830 caac 4185827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098518
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaca--gcatgacataataatatcaattgcaattcatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||| |||| |    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaac 9098521  T
Q  110 aac 112  Q
    |||    
T  9098520 aac 9098518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821782
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa-cat 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||  || ||| |||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatcaa-cgcaagccaacaatcat 18821849  T
Q  115 cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcat-aatcaacatcaaca 181  Q
    || || ||||||  ||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18821848 ctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataaatcaacattaaca 18821782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668491
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaac 19668485  T
Q  110 aacatc 115  Q
    ||||||    
T  19668486 aacatc 19668491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443126
Alignment:
Q  19 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaca 77  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagtatataaaaca 33443126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 112
Target Start/End: Original strand, 4186379 - 4186482
Alignment:
Q  10 tcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcat 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||  || ||||| |||| |||||| | ||||||||||    
T  4186379 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcat 4186478  T
Q  109 caac 112  Q
    ||||    
T  4186479 caac 4186482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 21766695 - 21766759
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21766695 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcag 21766759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 86
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873205
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacat 86  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 19873205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 31155514 - 31155465
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 51  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31155514 catcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaa 31155465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5834436 - 5834388
Alignment:
Q  179 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 227  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  5834436 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtc 5834388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 20177096 - 20177144
Alignment:
Q  179 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 227  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  20177096 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtc 20177144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 22080843 - 22080799
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaa 45  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22080843 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22158895 - 22158847
Alignment:
Q  179 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 227  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  22158895 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtc 22158847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 18907134 - 18907226
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||||||| || | |||||||||||| || |||| |||||||||    
T  18907134 gactcatgcagcttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatctt 18907226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 19790874 - 19790837
Alignment:
Q  24 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19790874 tgactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 19790837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 63
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863039
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagg 63  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatagg 19863039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 77
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076810
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaca 77  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaaca 23076810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 77
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008228
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaca 77  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaaca 35008228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 4668277 - 4668217
Alignment:
Q  52 cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaac 112  Q
    |||||||||||||||||| |||  || ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  4668277 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4668217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 4675124 - 4675064
Alignment:
Q  52 cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaac 112  Q
    |||||||||||||||||| |||  || ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  4675124 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4675064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6242 - 6000
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca---taggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6242 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatatca 6143  T
Q  97 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6142 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 6043  T
Q  197 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 239  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6042 cacattttataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 6000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 59)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27250847 - 27250611
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27250847 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 27250748  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27250747 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcac 27250648  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||    
T  27250647 agattataattaacctcttcattaagtatcaatgcta 27250611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 21026683 - 21026919
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  21026683 tcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatcaatt 21026782  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21026783 gcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacagcaacacatcttaaacagcttcac 21026882  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21026883 agattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 21026919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22532272 - 22532500
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22532272 tcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccatt 22532371  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532372 gcaattcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22532471  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||    
T  22532472 agttcataaataacatcatcattaagtct 22532500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 50210331 - 50210103
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  50210331 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 50210232  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210231 gcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 50210132  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210131 agattataattaacatcatcattaagtct 50210103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34510011
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaat 34509882  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| ||   ||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  34509883 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcaa 34509982  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509983 agattataattaacatcatcattaagtct 34510011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 74 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354458
Alignment:
Q  74 aacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 173  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 22354517  T
Q  174 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22354516 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22354458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 20135194 - 20135420
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  20135194 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatcatgtgcaa 20135293  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20135294 ttcaacaacatcttaagtattcaataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatcatatcataatgaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 20135393  T
Q  204 tataattaacatcatcattaagtctta 230  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20135394 tataattaacaacatcattaggtctta 20135420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22468810 - 22468604
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22468810 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaattgcaa 22468711  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||   |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22468710 ttcaacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcacatcataat-tacatcagcacatcttaaacagcttcacagat 22468612  T
Q  204 tataatta 211  Q
    ||||||||    
T  22468611 tataatta 22468604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22356185 - 22356053
Alignment:
Q  108 tcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa-catcaacacatcttaaacagcttcacagattat 206  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22356185 tcaacatcataaatattcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattat 22356086  T
Q  207 aattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22356085 aattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 22356053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22357871 - 22357739
Alignment:
Q  108 tcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa-catcaacacatcttaaacagcttcacagattat 206  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22357871 tcaacatcataaatattcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattat 22357772  T
Q  207 aattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22357771 aattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 22357739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38801505 - 38801277
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||| ||||||| |    
T  38801505 tcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa--cagcaagacataattatatcaaat 38801409  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  38801408 tcaattcatcaacatattatatatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcgtaatcaacaacaacatatcttattcagcttcac 38801310  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    | |||||| ||||  |||| |||||||||||||    
T  38801309 aaattatagttaatctcattattaagtcttaat 38801277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593719
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23593799  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  23593798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 23593719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13989028
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13988964  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  13988965 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13989028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896195
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21896259  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    | ||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  21896258 tcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 21896195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923291
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21923355  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  21923354 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21923291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861510
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21861573  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatca 178  Q
    | ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  21861572 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433222
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg---gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaat 433108  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 198  Q
    |||| ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||| |    
T  433109 gcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttta 433208  T
Q  199 cagattataattaa 212  Q
    ||||| || |||||    
T  433209 cagatcatcattaa 433222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475087
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21475151  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  21475150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21475087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612475
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31612411  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||||||| |  |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  31612412 gcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 31612475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45575005 - 45574842
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  45575005 tcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaaat 45574906  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||| | ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  45574905 gcaagtcaacaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45574842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 21840771 - 21840929
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21840771 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 21840869  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  || |||||||| |||||  |||||||||||    
T  21840870 gtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 21840929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298298
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaat 29298234  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  29298235 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29298298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776850
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaat 29776786  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  29776787 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29776850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275363
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 16275428  T
Q  100 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| || |||||| ||| || |||||| |||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16275427 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacataaaattcaattaatgcatataccattatatcaca 16275363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 33681011 - 33681188
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  33681011 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 33681110  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||| || ||||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  33681111 caagtcgtcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 33681188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 20847272 - 20847175
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 97  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  20847272 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 20847175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 213
Target Start/End: Original strand, 48603637 - 48603730
Alignment:
Q  120 atattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 213  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603637 atattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 48603730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 16361921 - 16362095
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtata-caaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16361921 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 16362019  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
     ||| |||| ||| || |||||| | ||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  16362020 gtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 16362095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Original strand, 33797570 - 33797694
Alignment:
Q  47 aacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaat-attcttcaagtaatgt 145  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||     
T  33797570 aacaacagcaacatatgcagcatacaaa-caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatgc 33797667  T
Q  146 atataacattatatcacatcataatca 172  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33797668 ataaaacattatatcacattataatca 33797694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35260992
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||   |||||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacatc 35261084  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattat 206  Q
    | ||| ||||| | ||  ||||||||||| |||||  |||| ||||||| || | |||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||    
T  35261083 tcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacaacttcacatattat 35260992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758872
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||| | |||| || |    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaac 16758763  T
Q  110 aacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataa 208  Q
    ||||||   || ||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||| || |    
T  16758764 aacatc-acaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatattataacagcttcacagatcatca 16758862  T
Q  209 ttaacatcat 218  Q
    |||| |||||    
T  16758863 ttaatatcat 16758872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347161
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21347059  T
Q  100 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 197  Q
    |||| || |||||| ||| || |||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  21347060 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 21347158  T
Q  198 aca 200  Q
    |||    
T  21347159 aca 21347161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13213024 - 13212821
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  13213024 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 13212926  T
Q  100 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 197  Q
    |||| || |||||| ||| || |||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| || ||||    
T  13212925 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcaacttc 13212827  T
Q  198 acagat 203  Q
    ||||||    
T  13212826 acagat 13212821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 21342096 - 21342296
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21342096 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21342194  T
Q  100 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 197  Q
    |||| || |||||| ||| || |||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||| ||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  21342195 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattacatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 21342293  T
Q  198 aca 200  Q
    |||    
T  21342294 aca 21342296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 22237631 - 22237788
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  22237631 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 22237730  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatat 159  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  |||||||    
T  22237731 caagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 22237788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921864
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 22921887  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  22921886 caaatcaacaacatctcaaatat 22921864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21788159 - 21787979
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||   |||| ||||||||||| |  |||||||||||     
T  21788159 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataaccatagcagcataggcagatcacaacaacagcatgacttcgtaatatcaattt 21788060  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 181  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||  || |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21788059 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatctt-aagtaatgcacataacattatataacatcataatcaacatcaaca 21787979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389317
Alignment:
Q  4 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgca 102  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 40389255  T
Q  103 attc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    | || |||| | ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  40389256 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 40389317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15860171 - 15860052
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |    
T  15860171 tcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatattaaat 15860073  T
Q  100 gcaattc-atcaacatcttaa 119  Q
    |||| || |||||| ||||||    
T  15860072 gcaagtcaatcaacgtcttaa 15860052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Original strand, 21754052 - 21754152
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||| |||||    
T  21754052 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa 21754151  T
Q  104 t 104  Q
    |    
T  21754152 t 21754152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123067
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaat 98  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  99 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    ||||| ||| |||  ||| || |||||| || |  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22123067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707329
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaca-gcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaat-agtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21707265  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||   ||| ||||||  ||||  |||||||||||    
T  21707266 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcaca 21707329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711871
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaca-gcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaat-agtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21711807  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||   ||| ||||||  ||||  |||||||||||    
T  21711808 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcaca 21711871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 20454667 - 20454593
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagc 79  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  20454667 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagcacataaaacagc 20454593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 14295669 - 14295574
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  14295669 tcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatc 14295574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 95
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918702
Alignment:
Q  14 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatc 20918702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248454
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 20248382  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacat 176  Q
    |||   ||||||| |||||||| ||||| ||   ||| ||||||||||||  |||||||  ||| |||| ||||||    
T  20248383 caa---atcaacaacttaaata-tcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacat 20248454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 86
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714631
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 21714631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50614117
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50614120  T
Q  114 tct 116  Q
    |||    
T  50614119 tct 50614117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621945
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50621948  T
Q  114 tct 116  Q
    |||    
T  50621947 tct 50621945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52927993
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 52927993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41050036
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  114 tct 116  Q
    |||    
T  41050038 tct 41050036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368287
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaca--gcatgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaaca 16368290  T
Q  114 tct 116  Q
    |||    
T  16368289 tct 16368287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20847161 - 20847101
Alignment:
Q  177 caacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||    
T  20847161 caacacatctttaaacagcttcatagattatggttaacctcttcattaagtcttaatgcta 20847101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22130978 - 22130930
Alignment:
Q  47 aacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  22130978 aacaacagcaacataggcagtatccaaaccatcatgatataataatatc 22130930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 112
Target Start/End: Original strand, 21161720 - 21161830
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |  |||||| |||| || | ||| |||| |||||| | ||    
T  21161720 catcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaacaaaa-cagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatg 21161818  T
Q  101 caattcatcaac 112  Q
    ||||||||||||    
T  21161819 caattcatcaac 21161830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093903
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaat 98  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||    
T  16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaacagctcatgatataacaatatcaat 16093903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 24783210 - 24783150
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    |||||||||| |||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  24783210 tcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 24783150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 42865330 - 42865266
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42865330 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcaacatatgcag 42865266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 38764 - 38995
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38764 tcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 38863  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38864 caaataaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 38963  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38964 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 38995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 32945 - 33158
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32945 tcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 33044  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33045 caagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 33144  T
Q  201 gattataattaaca 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  33145 gattataatcaaca 33158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 9749 - 9912
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9749 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaagt 9847  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaata-ttcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || || |||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  9848 gcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 9912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 51916 - 52148
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51916 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 52015  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52016 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatctacatcaacacatcttaaacagcttcac 52115  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52116 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 52148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 168096 - 167861
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  168096 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaatt 167997  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  167996 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagcttcaa 167898  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  167897 agattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 167861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24180
Alignment:
Q  16 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaca--gcatgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
Q  114 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataa-tcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataattcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 24207  T
Q  213 catcatcattaagtcttaatgctatcc 239  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  24206 catcctcaataagtcttaatactatcc 24180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1166 - 931
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1166 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaatt 1067  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  1066 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagcttcaa 968  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  967 agattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3268 - 3041
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  3268 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 3169  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3168 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcaca 3069  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3068 ggttataattaacatcatcattaagtct 3041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8647 - 8424
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8647 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca---gcaacataggcagtatcaaaaacagcatgacataataatatcaattg 8551  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8550 caagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 8451  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtc 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8450 gattataattaacatcctcattaagtc 8424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 25899 - 26134
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  25899 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatg 25998  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| | | |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25999 caagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcaca 26098  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26099 gattataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 26134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 39861 - 40096
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  39861 tcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatg 39960  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| | | |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39961 caagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcaca 40060  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40061 aattataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 40096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23113
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacac-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22984  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22985 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 23084  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23085 agattataaataacatcatcattaagtct 23113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 39480 - 39707
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39480 tcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 39579  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39580 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcata 39679  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  39680 gattataattaacatcattattaagtct 39707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 75332 - 75105
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  75332 tcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 75233  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  75232 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcata 75133  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  75132 gattataattaacatcattattaagtct 75105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 4852 - 5088
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  4852 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaat 4951  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4952 gcaattcaacaacatcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcac 5051  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
    ||||||||  ||||  | ||||||||||||| |||||    
T  5052 agattatagctaaccccttcattaagtcttattgcta 5088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15581 - 15351
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  15581 tcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaattt 15482  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||    
T  15481 caattcatcaacatcttatgtataaaaatattcttcaagtaatgcata-aatattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcaca 15383  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  15382 gattataattaaccttattattaagtcttaat 15351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7465
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacag-catgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  |||||  |||| |||  ||||    
T  7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatga--taattatacaaatt 7392  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaac 174  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||    
T  7393 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaac 7465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 39916 - 40143
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  39916 tcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 40015  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||  |||  |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40016 catgtcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcataaagagcttcaca 40115  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40116 gattataattaacatcatcattaagtct 40143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19885
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 19888  T
Q  114 tct 116  Q
    |||    
T  19887 tct 19885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18749 - 18708
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18749 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 18708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 32070 - 32299
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||     
T  32070 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac-aaacaacatgacataataatatcaattt 32168  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||    
T  32169 caattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagcttcaca 32267  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  32268 gattataattaacctcattgttaagtcttaat 32299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 25955
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 26080  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 203  Q
    |||| |||| ||| || ||| ||   ||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26079 ttcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagat 25980  T
Q  204 tataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  25979 tataattaacatcatcattaagtct 25955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44702
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44726  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  44725 gcaagtcaacaacatctcaaatat 44702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33479 - 33385
Alignment:
Q  134 ttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33479 ttcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcataggttataattaacatcatcattaagtct 33385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 8482 - 8710
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  8482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaatt 8581  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||| | | |||||||||||| | |||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8582 gcaagtcaacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgcacataacatta----acatcataatcaacatcaacacatcctaaacagcttcac 8677  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8678 agattgtaattaacatcatcattaagtcttaat 8710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 13500 - 13730
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  13500 tcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacatgataatatcaattt 13599  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    | ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||    
T  13600 cgattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagcttcaca 13698  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  13699 gattataattaacctcattgttaagtcttaat 13730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17335 - 17105
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa---cagcatgacataataatatcaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17335 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatcaa 17236  T
Q  98 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 197  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  17235 atgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacgtcttaaacagcttt 17136  T
Q  198 acagattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17135 acagattataattaacatcatgattaagtct 17105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79235
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtata-caaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca-cgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtc 79332  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 212  Q
    | || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||| ||| || |||||    
T  79331 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcactgatcatcattaa 79235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339840
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-caacaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat- 339968  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 200  Q
    ||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339967 caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 339868  T
Q  201 gattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  339867 gattataattaacgtcatcattaagtct 339840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158450
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 158514  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  158513 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 158450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Original strand, 71350 - 71474
Alignment:
Q  47 aacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaat-attcttcaagtaatgt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||     
T  71350 aacaacagcaacataggcagcatacaaa-cagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatcttgagtattcaaataattctt-aggtaatgc 71447  T
Q  146 atataacattatatcacatcataatca 172  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  71448 ataaaacattatatcacattataatca 71474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 4513 - 4738
Alignment:
Q  3 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgc 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  4513 atcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 4611  T
Q  102 aattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 201  Q
    || ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4612 aagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 4711  T
Q  202 attataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4712 attataattaacatcatcattaagtct 4738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 12095 - 12320
Alignment:
Q  3 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgc 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  12095 atcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 12193  T
Q  102 aattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 201  Q
    || ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12194 aagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 12293  T
Q  202 attataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12294 attataattaacatcatcattaagtct 12320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 22047 - 22272
Alignment:
Q  3 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgc 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  22047 atcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 22145  T
Q  102 aattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 201  Q
    || ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22146 aagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 22245  T
Q  202 attataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22246 attataattaacatcatcattaagtct 22272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 20917 - 21146
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgca 102  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20917 catcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 21016  T
Q  103 attcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacaga 202  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21017 attcaacaacatcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcagcatcaacacatcttaaacagcttcacagg 21116  T
Q  203 ttataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21117 ttataattaacatcttcattaagtcttaat 21146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 4715 - 4946
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||    
T  4715 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatcaatt 4814  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||    
T  4815 gcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacaacttcac 4913  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4914 agattatacttaacctcattgttaagtcttaat 4946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 232
Target Start/End: Original strand, 1 - 170
Alignment:
Q  63 gcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatca 161  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  1 gcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatcaattgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcata-aacattatatca 99  T
Q  162 catcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  100 catcataatcaacaacaacatatcttatacaacttcacagattatacttaacctcattgttaagtcttaat 170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16718 - 16490
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16718 tcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaat 16619  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    | || ||| || ||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618 ggaagtcaacagcatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 16519  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16518 agactataattaacatcatcattaagtct 16490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 124675 - 124827
Alignment:
Q  87 aataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatct 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124675 aataatatcaattgcaattcatcaacgttttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatct 124774  T
Q  187 taaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  124775 taaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgctatcc 124827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 174769 - 174883
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| |    
T  174769 tcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac--aacagcatgacatgattatatcaaat 174866  T
Q  100 gcaattcatcaacatct 116  Q
     ||||||| ||||||||    
T  174867 tcaattcaacaacatct 174883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 121769 - 121835
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 67  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  121769 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136370
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 136372  T
Q  114 tc 115  Q
    ||    
T  136371 tc 136370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 145078
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 145080  T
Q  114 tc 115  Q
    ||    
T  145079 tc 145078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10541 - 10312
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10541 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataataatatcaatt 10444  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||||    
T  10443 tcaattcaacaacatcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacgacatatcttatacagcttcac 10345  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  10344 agattataattaaccttattattaagtcttaat 10312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 1955 - 2187
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  1955 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatt 2054  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||    
T  2055 gcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacattatatctcatcataatcaacaacaacatatcatatacagctttac 2154  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    | ||||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  2155 atattattaataaccttatcattaagtcttaat 2187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33074 - 32863
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33074 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 32975  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca-catcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  | ||| ||||||||    
T  32974 caattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatcagcatca--taaaatagcttcac 32878  T
Q  200 agattataattaaca 214  Q
    ||||||||| |||||    
T  32877 agattataactaaca 32863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 45931 - 46142
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45931 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 46030  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca-catcttaaacagcttcac 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  | ||| ||||||||    
T  46031 caattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatcagcatca--taaaatagcttcac 46127  T
Q  200 agattataattaaca 214  Q
    ||||||||| |||||    
T  46128 agattataactaaca 46142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 16116 - 16323
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| |    
T  16116 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaaat 16215  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 198  Q
    ||||  || || ||||| || ||| ||   ||   |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  16216 gcaagccaacatcatctcaagtatacattcataactcaagtaatgcatataacattatatcacgtcatgatcaacatca--acatcttaaaacagcttca 16313  T
Q  199 cagattataa 208  Q
    ||||||||||    
T  16314 cagattataa 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 17447 - 17389
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 59  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17447 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 227
Target Start/End: Original strand, 13144 - 13322
Alignment:
Q  50 aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtata 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |    
T  13144 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcaca 13243  T
Q  149 taacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13244 taacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacagattataattaacatcttcattaagtc 13322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 34126 - 34221
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  34126 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacccatcatgatataataatatc 34221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 276 - 329
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacag 54  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  276 tcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacag 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3304 - 3103
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  3304 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 3205  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    | |||||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3204 gtaattcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 3105  T
Q  200 ag 201  Q
    ||    
T  3104 ag 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 16285 - 16514
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |    
T  16285 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaat 16382  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     |||||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  16383 tcaattcatcaacatattatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcac 16481  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  16482 agattatagttaacctcattattaagtcttaat 16514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1167 - 938
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||    
T  1167 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattatatcaatt 1070  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  1069 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatattttatacagcttcac 971  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||    
T  970 agattatagttaacctcattcttaagacttaat 938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 1292 - 1521
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||| ||||||| |    
T  1292 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtac--aacatcatgacataattatatcaaat 1389  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||     
T  1390 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcat 1488  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  1489 agattatagttaacctcattcttaagtcttaat 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 7269 - 7498
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||| |    
T  7269 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac--aacaacatgaaataattatatcaaat 7366  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||     
T  7367 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcat 7465  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  7466 agattatagttaacctcattcttaagtcttaat 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 46998 - 47202
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  46998 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtttacag--cagcatgacataataatatcaatt 47095  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||||||    
T  47096 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattctccaagtaatgcata-aacattatatcacatcataaacatcaacaacatatcttatacagcttcac 47194  T
Q  200 agattata 207  Q
    ||||||||    
T  47195 agattata 47202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 28417 - 28552
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28417 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 28516  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattctt 135  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  28517 gcaattcaacaacatcttatatattcaaatgttctt 28552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 11295 - 11390
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  11295 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatc 11390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 2000 - 2095
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  2000 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatc 2095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 4555 - 4605
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 51  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4555 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 5017
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||  || ||||||||||| ||||||| |    
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatacaa--catcatgacataattatatcaaat 5149  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || |||  ||| |||||    
T  5148 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaacatattttattcagtttcac 5050  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||    
T  5049 atattataattaaccttattattaaatcttaat 5017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 51585 - 51814
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||| |    
T  51585 tcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac--aacatcatgacataattataacaaat 51682  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  51683 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaatatccttcaagaaatgcata-aacattataacacttcatattcaacaacaacatatcttattcagcttcac 51781  T
Q  200 agattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||| ||||| |||   ||||||||||||    
T  51782 agattatagttaacctcactcttaagtcttaat 51814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Original strand, 6669 - 6845
Alignment:
Q  57 acataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacatt 155  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||    
T  6669 acataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacgtt 6768  T
Q  156 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||    
T  6769 atatcacatcataatcaacaacaacatatcatatacagctttacagattataaataaccttatcattaaatcttaat 6845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8650
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 8580  T
Q  112 catcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatat--aacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  8581 catctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 6538 - 6661
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  6538 tcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 6637  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  6638 gcaaatcaacaacatctcaaatat 6661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 27911 - 28061
Alignment:
Q  78 gcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatc 177  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatc 28010  T
Q  178 aacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28011 aacaaatcttaaacaacttcacaggttataattaacatcatcattaagtct 28061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3424
Alignment:
Q  61 aggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatat 159  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacattatat 3489  T
Q  160 cacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatcatcatta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3488 cacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcatagattataattaacatcatcatta 3424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4754
Alignment:
Q  19 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatctt 117  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||| || || |||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatctt 4644  T
Q  118 aaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatc 216  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4645 aaatattcatttatacttcaagtaatgcataatacattatatcacatcatgatcaacatca--acatcttaaaacagcctcacaaattataattaacatc 4742  T
Q  217 atcattaagtct 228  Q
     ||| |||||||    
T  4743 ttcaataagtct 4754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53488
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 53552  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    | ||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  53551 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 53488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20909
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20845  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  20846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37983
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 37919  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  37920 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 37983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 128754 - 128917
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |   |  | | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  128754 tcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaacaaaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 128853  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  128854 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacat 128917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20328
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacat-cagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 20426  T
Q  117 taaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaacat 215  Q
     || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||  ||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  20425 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa--aacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaacat 20328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136842
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa-acagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 136778  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  136779 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 136842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139311
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa-acagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 139247  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  139248 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 139311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144249
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa-acagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 144185  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  144186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 144249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134373
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa-acagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 134309  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  134310 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 134373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141780
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa-acagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 141716  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  141717 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 141780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 62201 - 62296
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||    
T  62201 tcatcatcatcttcgacttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaacatcatggtataataatatc 62296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 75
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132736
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 75  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| |||||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaa 132736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94573
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 94509  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  94510 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 94573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44614
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac--aaaacagcatgacataataatatcaat 98  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44552  T
Q  99 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatc 160  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  ||||||||    
T  44553 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatatc 44614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17440
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 17500  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  17499 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 17440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 124
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100501
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| | ||    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataataatatcgaatg 100477  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatatt 124  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||    
T  100478 caaatcaacaacatctcaaatatt 100501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40169
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 40192  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  40191 caaatcaacaacatctcaaatat 40169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 119878 - 119947
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 69  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  119878 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 119947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38394
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||   |||| |||| |||||| |  |||||||||||     
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcatagacagatcacaacaacaacatgacttcttaatatcaattt 38497  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 199  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||  || |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  || | |||||||||||    
T  38496 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatctt-aagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcac 38399  T
Q  200 agatt 204  Q
    |||||    
T  38398 agatt 38394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 74  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23695 - 23581
Alignment:
Q  89 taatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt 187  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||  ||||||  || |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |    
T  23695 taatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcattcaataatatctt-aagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaacatttcat 23597  T
Q  188 aaacagcttcacagatt 204  Q
     ||||||||||||||||    
T  23596 -aacagcttcacagatt 23581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1021 - 853
Alignment:
Q  57 acataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacatta 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||  ||  ||||||||||| | |||||||||    
T  1021 acataggcagtatacaa--cagcatggcataataatatcaat-gcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacatta 925  T
Q  157 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||    
T  924 tatcacatcgtaatcgacatcaacacatcttaaacagcttcacatatcataaatagcatcaccattaagtct 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 4951 - 4888
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggc 64  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4951 tcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4856
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 4792  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  4793 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13554
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13490  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  13491 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 13554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14109
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14045  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  14046 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82234
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 82170  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  82171 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 82234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22610
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 22677  T
Q  112 catcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22676 catctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 22610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 203
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13336
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatc 13246  T
Q  116 ttaaa-tattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagat 203  Q
    | |||  ||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  13247 tgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 13336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16014
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 16107  T
Q  112 catcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagat 203  Q
    ||||| ||| ||||  ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  16106 catctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 16014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 77
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2741
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaca 77  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| | ||||||    
T  2680 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagtacataaaaca 2741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18141 - 17932
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| || |||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  18141 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaa 18042  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacaga 202  Q
     | | |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  18041 gtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacaga 17942  T
Q  203 ttataattaa 212  Q
    | || |||||    
T  17941 tcatcattaa 17932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2088
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2193  T
Q  100 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 197  Q
    |||| || || ||| ||| || |||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  2192 gcaagtcaattaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 2094  T
Q  198 acagat 203  Q
    ||||||    
T  2093 acagat 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16995
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16882  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 198  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||| | ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| || ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  16883 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttca 16981  T
Q  199 cagattataattaa 212  Q
    ||||| || |||||    
T  16982 cagatcatcattaa 16995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4459
Alignment:
Q  4 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgca 102  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 4398  T
Q  103 attcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    | ||| |||| ||| || || ||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  4399 aatcaacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 11558 - 11442
Alignment:
Q  4 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgca 102  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  11558 tcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatttca 11459  T
Q  103 attcatcaacatcttaa 119  Q
    |||||||||||| ||||    
T  11458 attcatcaacatgttaa 11442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11399
Alignment:
Q  181 acatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11450 acatgttaatcagcttcacagattataattaacctcatcattaagtcttaat 11399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27663
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 27756  T
Q  112 catcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagat 203  Q
    ||||| ||| ||||| ||||  ||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  27755 catctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 27663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 232
Target Start/End: Original strand, 3640 - 3716
Alignment:
Q  156 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  3640 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 3716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 232
Target Start/End: Original strand, 7704 - 7780
Alignment:
Q  156 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  7704 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 7780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 10777 - 10935
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10777 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 10875  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  || |||||||| |||||  |||||||||||    
T  10876 gtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 10935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11450
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11292 catcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 11390  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  11391 gtcaacaacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Original strand, 12763 - 12933
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacag-catgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||   |||| ||||  |||||  |||| ||| |||||    
T  12763 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttcaataacaataacagcataggcagatcacaacaacaatcatga--taattataccaatt 12860  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaac 174  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  12861 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaac 12933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501246
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 501186  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  501187 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 501246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85539
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 85644  T
Q  100 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 197  Q
    |||| || |||||| ||| || |||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  85643 gcaagtcaatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 85545  T
Q  198 acagat 203  Q
    ||||||    
T  85544 acagat 85539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160864
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||| ||    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatg 160787  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||   ||| ||||| ||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  160788 caa-tcaacaacatgtcaaata-tcaaacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaa 160864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116551
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataatcatatcaaatg 116528  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  116529 caagtcaacaacatctcaaatat 116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128909
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaca--gcatgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||   ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  114 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||| ||| | ||| ||||  |||| |||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||    
T  128973 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 128909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 78328 - 78442
Alignment:
Q  5 catcttcat-caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||    
T  78328 catcttcattcatcttggaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatcaa-tg 78426  T
Q  101 caattcatcaacatct 116  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  78427 caaatcaacaacatct 78442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Original strand, 116579 - 116631
Alignment:
Q  161 acatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  116579 acatcataatcaacattaacatatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 116631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7998
Alignment:
Q  19 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacaaaacagc--atgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatc 8062  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  8061 ttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaa 7998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 232
Target Start/End: Original strand, 1037 - 1149
Alignment:
Q  120 atattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 219  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||    
T  1037 atattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacatcttcacagattataattagcctcttc 1136  T
Q  220 attaagtcttaat 232  Q
    |||||||||||||    
T  1137 attaagtcttaat 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 106 - 268
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 204  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  205 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10481
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 111  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10548  T
Q  112 catcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  10547 catctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 10481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12749
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 12686  T
Q  116 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    | ||||| | | ||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  12687 tcaaatacttatatataattc-agtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 12749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38641
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 38721  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||| | ||||  |||||||| ||  ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  38720 gcaagtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 38641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40562
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaat 40498  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| |||   ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  40499 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 40562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15486 - 15362
Alignment:
Q  47 aacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaata-ttcttcaagtaatgt 145  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||     
T  15486 aacaacatcaacataggcagcatacaaa-cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatgc 15389  T
Q  146 atataacattatatcacatcataatca 172  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15388 ataaaacattatatcacattataatca 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 129917 - 130086
Alignment:
Q  10 tcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||    
T  129917 tcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 130016  T
Q  109 caacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  130017 caacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaa 130086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 60810 - 60614
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaat 121  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||| ||||| ||| |||||||| |||     
T  60810 gactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagctcatgatataccaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaaac 60712  T
Q  122 attcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaacatcat 218  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  60711 attcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaatcattttataacagcttcacagattatcattaatatcat 60614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4377
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaat 4312  T
Q  100 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  4313 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 4377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12407 - 12249
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12407 catcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaaatgcaa 12309  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| |||| ||| || |||||| || |  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  12308 gtcaacaacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 11471 - 11646
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    | ||    
T  11471 catcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaa 11570  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
     | | |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  11571 gtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 11646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 9246 - 9404
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtata-caaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9246 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 9344  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  || |||||||| |||||  |||||||||||    
T  9345 gtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 9404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38370 - 38195
Alignment:
Q  5 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    | ||    
T  38370 catcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaa 38271  T
Q  104 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
     | | |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  38270 gtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 38195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19390
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 19367  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  19368 caaatcaacaacatctcaaatat 19390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12220
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||      |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa------cagcaacacag-cagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaat 12156  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  12157 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6241 - 6078
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  6241 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 6142  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    |||| |||| |||||| |||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  6141 gcaagtcattaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 6078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1158
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | | | |||||||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacatc 1150  T
Q  116 ttaaatat 123  Q
    | ||||||    
T  1151 tcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15759
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaccatcatgatataataatatc 15759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 228
Target Start/End: Original strand, 10323 - 10394
Alignment:
Q  157 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10323 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattattattaacatcattattaagtct 10394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 133 - 310
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 232  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| | || |||| |||||||||    
T  233 caaatcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaa 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2801
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||| ||    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatg 2824  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  2823 caaatcaacaacatctcaaatat 2801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45732
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 45810  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
     || |||||||||||| || || ||||| ||  |||| || |||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  45809 taagtcatcaacatctcaatta-tcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 45732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 163
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30094
Alignment:
Q  15 aacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||     
T  29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacg 30044  T
Q  114 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    ||| || |||||| ||||  ||||| ||||  |||||  |||||||||||    
T  30045 tctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatatcaca 30094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161049
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaat 161154  T
Q  100 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 197  Q
    |||| || |||||||||| || |||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||| ||| |||||  |||| |||| |||||||    
T  161153 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caatatcaaatcatcataaatcagcttc 161055  T
Q  198 acagat 203  Q
    ||||||    
T  161054 acagat 161049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164550
Alignment:
Q  80 atgacataataatatcaattgcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatca 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||| ||||||||    
T  164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatca 164576  T
Q  179 acacatcttaaa-cagcttcacagat 203  Q
    |  |||| |||| |||||||||||||    
T  164575 aatcatcataaatcagcttcacagat 164550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29720
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaataatagcatgacataataatatcaattg 29657  T
Q  101 caa-ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcac 162  Q
    ||| |||| ||| |  ||||||||||||  |  |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  29658 caatttcaacaagactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcac 29720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1280
Alignment:
Q  4 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgca 102  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 1342  T
Q  103 attc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 163  Q
    | || |||| | ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  1341 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 1280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 1152 - 989
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || | || ||||| |||| || ||| | |    
T  1152 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatcatcatgatataacaacatcgaat 1053  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  1052 gcaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 12769 - 12932
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  12769 tcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 12868  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  12869 gcaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 12932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Original strand, 26851 - 27027
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacag-catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaata 122  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  26851 gactcatgcatcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatga--taattatatcaatt-caattcatcaacatcttatgta 26947  T
Q  123 ttcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagatt 204  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  26948 tacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaaca-caa-acatctcataacagcttcacagatt 27027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 1187 - 1092
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  1187 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatc 1092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 4321 - 4284
Alignment:
Q  24 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4321 tgactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 120
Target Start/End: Original strand, 12943 - 13062
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| | ||    
T  12943 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcagcatgatataacaatatcgaatg 13042  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaa 120  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  13043 caagtcatcaacatcataaa 13062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 32541 - 32687
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  32541 tcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 32638  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatata 150  Q
    |||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  32639 gcaa-tcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatata 32687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51766
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa-ca 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || | |||| |||| |||||||||||||||| |||||  || ||| ||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatcaa-tgcaagccaacaatca 51888  T
Q  114 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcat-aatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 212  Q
    ||| || ||||||  ||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |  || | |||||||||||| ||| |||||||    
T  51887 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataaatcaacattaatatctcat-aacagcttcacaaattgtaattaa 51790  T
Q  213 catcatcattaagtcttaatgcta 236  Q
     |||||  | ||||||||||||||    
T  51789 tatcatattcaagtcttaatgcta 51766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 15895 - 15780
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||  |||| |||| |||||| | |    
T  15895 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaat 15796  T
Q  100 gcaattcatcaacatc 115  Q
    |||| |||||| ||||    
T  15795 gcaagtcatcatcatc 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178961
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 65  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggca 178961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 5655 - 5769
Alignment:
Q  10 tcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcat 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||     
T  5655 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatgaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa 5754  T
Q  109 caacatcttaaatat 123  Q
    |||||||| ||||||    
T  5755 caacatctcaaatat 5769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14692
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||| || ||||| ||| ||||||| | ||    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaagaaaatcatcatgatatagtaatatcgaatg 14715  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  14714 caaatcaacaacatctcaaatat 14692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4921 - 4741
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||   |||| |||||| |||| | ||||||||||||     
T  4921 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataataatagcagcataggcagatcacaacaacagcttgacttcataatatcaattt 4822  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 181  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||  || |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4821 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatctt-aagtaatatacataacgttatatcacatcatattcaacattaaca 4741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17929 - 17873
Alignment:
Q  176 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17929 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 17873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 6614 - 6777
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||  |||| |||| |||||| | |    
T  6614 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaat 6713  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    |||| | |||| |||  |||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  6714 gcaagttatcatcattataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 6777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 13994 - 14157
Alignment:
Q  1 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||  |||| |||| |||||| | |    
T  13994 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaat 14093  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    |||| | |||| |||  |||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  14094 gcaagttatcatcattataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 14157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25321
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||| |    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacgatatcaa-tgcaaatcaac 25219  T
Q  110 aacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataa 208  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||  |||| ||||||||||||  | |||||||||| || | |||||||||  | ||||| ||||||||||||||| || |    
T  25220 aacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattatta-caacatcaaatcgtcttataacagcttcacagatcatca 25317  T
Q  209 ttaa 212  Q
    ||||    
T  25318 ttaa 25321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 179
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225588
Alignment:
Q  55 caacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacat 154  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||  ||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaat-caacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaat 225563  T
Q  155 tatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  225564 tatatcacattataaacaacatcaa 225588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 24000 - 23897
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  24000 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 23901  T
Q  101 caat 104  Q
    ||||    
T  23900 caat 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 193074 - 192920
Alignment:
Q  21 gactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatctta 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||| |    
T  193074 gactgactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattca-caacatctca 192976  T
Q  119 aatattcaaatattcttcaagtaatgta-tataacattatatcacatcataatcaa 173  Q
    | |||||||  |  |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  192975 attattcaataaaacttcaagtgatgtattacaacattatatcacaccataatcaa 192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 95
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1180
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 95  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 1180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2640
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| || ||||  |||| |||||  | ||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatcatcatgttataacaatattgaatg 2663  T
Q  101 caattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  2662 caaatcaacaacatctcaaatat 2640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10646
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10641  T
Q  112 catct 116  Q
    |||||    
T  10642 catct 10646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28813
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataaca--acagcaacataggcagtatacaaa 74  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16443 - 16264
Alignment:
Q  24 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaat 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||  | |||| |||||||||||      
T  16443 tgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggca-tatcacaacaacatcatgacttcataatatcaatt-aatttcaacaacatcttaatc 16346  T
Q  122 attcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagatt 204  Q
    ||||||  || |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16345 attcaataatatctt-aagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcacagatt 16264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 8075
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||||| | ||| ||| |    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaac 8081  T
Q  110 aacatc 115  Q
    ||||||    
T  8080 aacatc 8075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 23843 - 24048
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||| || ||| ||||      
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaccataggcagattacaacaacagtatgacatcat-ataacaatat 23941  T
Q  101 caatt----catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 196  Q
    ||| |    || |||||||| ||  |||||   ||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||| ||||||||    
T  23942 caaataaaacagcaacatctcaatcattcattcatagttcaagtaatgaaattaacattatatcacatcatattcaacactaacatctctt-aacagctt 24040  T
Q  197 cacagatt 204  Q
    ||||||||    
T  24041 cacagatt 24048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 94
Target Start/End: Original strand, 6824 - 6909
Alignment:
Q  10 tcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatat 94  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||    
T  6824 tcatcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatat 6909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 164
Target Start/End: Original strand, 8088 - 8181
Alignment:
Q  70 acaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 164  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  8088 acaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 8181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 237
Target Start/End: Original strand, 20595 - 20643
Alignment:
Q  189 aacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595 aacagcttcacagattatagttaacatcatcattaagtcttaatgctat 20643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 116
Target Start/End: Original strand, 38343 - 38437
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38343 gactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatct 38437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 86
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20065
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacat 86  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaatagtagcataggcagattacaacaacagtatgacat 20065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21721
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacag-catgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||  |||| ||| |||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatga--taattataccaatt 21823  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttca 198  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  21822 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcttaatcaaca-caa-acatctcataacagcttca 21727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29613
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacag-catgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||  |||| ||| |||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatga--taattataccaatt 29715  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttca 198  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  29714 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcttaatcaaca-caa-acatctcataacagcttca 29619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 166
Target Start/End: Original strand, 29117 - 29262
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaattc-atcaacatcttaaata 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  29117 gactcatgcatcttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattgcaattttaacaacaccttaaata 29216  T
Q  123 t--tcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatca 166  Q
    |  ||||  |  |||||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  29217 tattcaataaaacttcaagtaatacacacaacattatatcacatca 29262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 1881 - 2045
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacag-catgacataataatatcaatt 99  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  |||||  |||| ||| |||||    
T  1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatga--taattataccaatt 1978  T
Q  100 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcata 168  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||    
T  1979 -caattcatcaacatcttatgtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcata 2045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6284
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || | |||||||| ||||| ||| |||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 6287  T
Q  114 tct 116  Q
    |||    
T  6286 tct 6284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36517
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 65  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagtagcataggca 36517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 115
Target Start/End: Original strand, 569 - 669
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaaca 667  T
Q  114 tc 115  Q
    ||    
T  668 tc 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 59  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97188
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 97123  T
Q  114 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||| ||| | ||| ||||  |||| |||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||    
T  97124 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 97188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106466
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 113  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 106401  T
Q  114 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 179  Q
    ||| ||| | ||| ||||  |||| |||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||    
T  106402 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 106466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 206618 - 206566
Alignment:
Q  25 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaca 77  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  206618 gactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagtacataaaaca 206566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 95
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32197
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 95  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatc 32197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2784
Alignment:
Q  17 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaattgcaat 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaat 2784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 86
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69879
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aacagcatgacat 86  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 69879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2213
Alignment:
Q  55 caacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 123  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 6095 - 6159
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  6095 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 6159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10575
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcaacataggcag 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 44081 - 44145
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44081 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 44145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 5038 - 4999
Alignment:
Q  24 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagg 63  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5038 tgactcatgcaacttggttaaataacaacagcaacatagg 4999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103644
Alignment:
Q  13 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaa-ataacaacagcaacataggcagtatacaaaaca--gcatgacataataatatcaattgcaa 103  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||| ||||||   ||||| |||| |||||||| |||||    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaa 103644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1257 - 1169
Alignment:
Q  88 ataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacat 176  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||  ||||||  || |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1257 ataatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaaa-taatgcacataacattatatcacatcatattcaacat 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 7365 - 7328
Alignment:
Q  24 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 61  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7365 tgactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 7328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9193
Alignment:
Q  52 cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaac 112  Q
    |||||||||||||||||| |||  || ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  9133 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 9193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 897 - 961
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  897 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcag 961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 1830 - 1894
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  1830 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatggcagcataggcag 1894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 14664 - 14728
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  14664 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 14728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 23679 - 23743
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  23679 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 23743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 39103 - 39167
Alignment:
Q  2 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 66  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  39103 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 39167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University