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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
Legend |
| Query |
| Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF0734_high_2 (Length: 416)
Name: NF0734_high_2
Description: NF0734
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
[»] NF0734_high_2 |
 |  |
|
[»] scaffold0150 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] chr4 (61 HSPs) |
 |  |
|
[»] chr8 (69 HSPs) |
 |  |
|
[»] chr6 (57 HSPs) |
 |  |
|
[»] chr1 (47 HSPs) |
 |  |
|
[»] chr5 (58 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0022 (6 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0162 (4 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0010 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0080 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold1272 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0521 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0025 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0032 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0031 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0480 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0120 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0028 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0077 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0589 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold1867 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0342 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0970 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0021 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0103 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0610 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0004 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0447 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0014 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0670 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0035 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0389 (1 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0190 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0598 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0456 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0383 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0338 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0151 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0193 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0165 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0148 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0016 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0554 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0387 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0253 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0075 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0020 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0409 (2 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0034 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0310 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0012 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold1164 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0138 (1 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0158 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0833 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0037 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0117 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0160 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0359 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0406 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0001 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0673 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0133 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0026 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0068 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0195 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0240 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0601 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0153 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0390 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0231 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0335 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0011 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0396 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0044 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0786 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0327 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0561 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0003 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0634 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0065 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0125 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0090 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold1311 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0017 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0083 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0183 (1 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0029 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0130 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0207 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0049 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0173 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0367 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0122 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0023 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold1542 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0266 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0615 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0091 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0686 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0772 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0465 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0118 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0420 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0215 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold1734 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0740 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0234 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0184 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0078 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0018 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0106 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0081 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: scaffold0150 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:
Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 24 - 413
Target Start/End: Original strand, 28469 - 28857
Alignment:
Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcca |
123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
28469 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaagcca |
28568 |
T |
 |
Q |
124 |
tgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagc |
223 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28569 |
tgaatcattaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacataattcttactacaattcaacaacaacataccataattcaacaatttgagc |
28668 |
T |
 |
Q |
224 |
ataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
28669 |
ataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatcataa |
28768 |
T |
 |
Q |
324 |
ttggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|| |||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
28769 |
ttagagcacgaatgataacaactttggacaattaatcatttactcaattaagaacttattcatacaa-caattgaaaatttaaactaaaa |
28857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 71
Target Start/End: Original strand, 21640 - 21687
Alignment:
Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcacc |
71 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
21640 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccacc |
21687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 52 - 413
Target Start/End: Original strand, 67952 - 68313
Alignment:
Q |
52 |
acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag |
150 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
T |
67952 |
acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag |
68051 |
T |
 |
Q |
151 |
cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcat |
250 |
Q |
|
|
|| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
68052 |
caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat |
68151 |
T |
 |
Q |
251 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga |
350 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
68152 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga |
68251 |
T |
 |
Q |
351 |
acaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
68252 |
acaattaatctattactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatttatactaaaa |
68313 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 24 - 413
Target Start/End: Original strand, 43645827 - 43646214
Alignment:
Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcca |
123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
T |
43645827 |
tcatcaaaatcaaactttttcattaccaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcaaatgacatca-caaatcatgaattatgaacacccaagtca |
43645925 |
T |
 |
Q |
124 |
tgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagc |
223 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
43645926 |
tgaatcatcgacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacagttcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagc |
43646025 |
T |
 |
Q |
224 |
ataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |
|
|
T |
43646026 |
ataattcaacatatatcactttctcatactttaaacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataa |
43646125 |
T |
 |
Q |
324 |
ttggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
43646126 |
ttagagcacgaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaaacacttattcatacaa-caattggaaatttacactaaaa |
43646214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 67 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 31146451 - 31146111
Alignment:
Q |
67 |
tcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac |
166 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || || | ||||||| | || | |||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
T |
31146451 |
tcaccaacaataactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacctaggccatgatttatcatcaacaacatcacttagcaacagtaacatcaat |
31146352 |
T |
 |
Q |
167 |
tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
31146351 |
tgaacaggaatcttattacaattcaacaaca-catagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacataaaat |
31146253 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattac |
366 |
Q |
|
|
||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
31146252 |
ttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggaacacgaattctaacaattatggacaattaatcaattac |
31146153 |
T |
 |
Q |
367 |
tcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacac |
408 |
Q |
|
|
||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
31146152 |
tcagttaagcacttattcatacaacaatttgaaaatttacac |
31146111 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 69 - 416
Target Start/End: Original strand, 25305423 - 25305755
Alignment:
Q |
69 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
168 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
T |
25305423 |
accaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttagccacaacaacatcaattg |
25305522 |
T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaa-caacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
267 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25305523 |
aacatgactcttaccacaattcaacaatcaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacacatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
25305622 |
T |
 |
Q |
268 |
tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattact |
367 |
Q |
|
|
||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
25305623 |
tcatcaa---------------caacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatcatttact |
25305707 |
T |
 |
Q |
368 |
caattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
25305708 |
caattaagcacttattcatacaa-caattgtaaaattatactaaaatga |
25305755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 49 - 390
Target Start/End: Original strand, 722353 - 722690
Alignment:
Q |
49 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
148 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||| |
|
|
T |
722353 |
tcaaccaattttacaaagtcaccaacaacaactcatatctcatcaataaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcactt |
722452 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
||||||||| || |||| |||||||| ||| | | ||||||||| ||||||| || |||| ||| || |||||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
722453 |
agcagcaactacttcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatcaacatatcacaatttgacatttagagcataa----acatatatcattttcat |
722548 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
722549 |
atactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataatatcataattggagcacgaattttaacaattat |
722648 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaa |
390 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
722649 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa |
722690 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 58 - 412
Target Start/End: Original strand, 19666495 - 19666848
Alignment:
Q |
58 |
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157 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| |
|
|
T |
19666495 |
tttacaaaaccaacaacaacaatccatttctcatcatcaaaacatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaac |
19666594 |
T |
 |
Q |
158 |
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257 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |
|
|
T |
19666595 |
aacatcaattgaacatggttctcatcataattcaataacaacatagcataattcaaccatttgagcataattcataagttaacacttatacatactttga |
19666694 |
T |
 |
Q |
258 |
acatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaatta |
357 |
Q |
|
|
||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| ||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
19666695 |
acatgcaaattcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattttaacaactatgaacaatta |
19666794 |
T |
 |
Q |
358 |
atcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
19666795 |
atcacttattcaattaagcatttattcatacaat-aattgaaaaattacactaaa |
19666848 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 57 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22580140 - 22579800
Alignment:
Q |
57 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa |
156 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | |||||||||||| || ||||| |
|
|
T |
22580140 |
ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatatcagcag |
22580041 |
T |
 |
Q |
157 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt-ctcatacttt |
255 |
Q |
|
|
||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || |
|
|
T |
22580040 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaa---agcataattcaaccaattgagcatatttcaacatataacatttttctcatacctt |
22579944 |
T |
 |
Q |
256 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
355 |
Q |
|
|
|| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22579943 |
gatcataaagtttcaccaacaacaattcaattatcat-aacttcatacatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
22579845 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
22579844 |
taatcaattacacaattaagcacttattcatacaat-aattgaaaa |
22579800 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19433646 - 19433448
Alignment:
Q |
24 |
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123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
19433646 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagcca |
19433547 |
T |
 |
Q |
124 |
tgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgag |
222 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19433546 |
tgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttacaacaattcaataacaacatagcataattcaacaatttgag |
19433448 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 3529 - 3173
Alignment:
Q |
49 |
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148 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
3529 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatctacaa-tcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactt |
3431 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| |||||||| || | | ||||||||| || || || | ||| || ||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
3430 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaacctaagcataattcaaca------tatcacaaattgacatttagagaataatatgacatatatcattttcat |
3337 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
3336 |
atactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaattctaacaatcat |
3237 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3236 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacataatcatacaa-caattgaaaatttacactaaaa |
3173 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 48 - 357
Target Start/End: Original strand, 24884643 - 24884952
Alignment:
Q |
48 |
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147 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
T |
24884643 |
atcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcctcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctat |
24884742 |
T |
 |
Q |
148 |
tagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct |
247 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||| | |||||| ||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
T |
24884743 |
tagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcataactcacaatatatcactttca |
24884842 |
T |
 |
Q |
248 |
catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatta |
347 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||| || |||||| |||| |||||| || |
|
|
T |
24884843 |
catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacaaattttaacaacta |
24884942 |
T |
 |
Q |
348 |
tgaacaatta |
357 |
Q |
|
|
|||| ||||| |
|
|
T |
24884943 |
tgaaaaatta |
24884952 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22775389 - 22775141
Alignment:
Q |
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caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
253 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
22775389 |
caacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacacaattcaacatatataactttctcatact |
22775290 |
T |
 |
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
353 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22775289 |
ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaca---------- |
22775200 |
T |
 |
Q |
354 |
attaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22775199 |
attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaa |
22775141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 154 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22780767 - 22780519
Alignment:
Q |
154 |
caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
253 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
22780767 |
caacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacacaattcaacatatataactttctcatact |
22780668 |
T |
 |
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
353 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22780667 |
ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaca---------- |
22780578 |
T |
 |
Q |
354 |
attaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22780577 |
attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaa |
22780519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 57 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24571572 - 24571231
Alignment:
Q |
57 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa |
156 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||| | || | ||||||||||||||| || ||| |
|
|
T |
24571572 |
ttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatacatagccaagc-atgagttatcatcaacaacatcacttaacaacaa |
24571474 |
T |
 |
Q |
157 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg |
256 |
Q |
|
|
||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
24571473 |
caacatcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattgagcatatttcaacatatatcattttctcataccttg |
24571374 |
T |
 |
Q |
257 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaatt |
356 |
Q |
|
|
||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || | ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
T |
24571373 |
aacatgaaatttctctaacaacaattcaagtatccacaacttcatgcattcaaacgtgtcatcaaaattagagcacgaatttcatcatctatgaacaatt |
24571274 |
T |
 |
Q |
357 |
aatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaa |
400 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
24571273 |
aatcaattacccaattaagcatttattcatacaat-aattgaaa |
24571231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 69 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 24294792 - 24294449
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Q |
69 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
168 |
Q |
|
|
|||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
T |
24294792 |
accaacaattacttatttctcatccacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattg |
24294693 |
T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
Q |
|
|
|||||| ||| | | ||||||||| ||||||| || |||| ||| || ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| |
|
|
T |
24294692 |
aacatgaatctcagcataattcaacatcaacatatcacaatttgacatttggagcataatataacatatatcattttcatatactttgatcattcaattt |
24294593 |
T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
368 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24294592 |
caccaacaacaaatcaattatcatcaatttctcacatacaattataacatcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattactc |
24294493 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24294492 |
aattaagaatttattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaa |
24294449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 71 - 416
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170 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
19669376 |
caacaacaactcatttttcatcatcagttcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa |
19669277 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||||| | || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
T |
19669276 |
catggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcatgattcacaagttaacacttacacatacttagaacatgcaatttca |
19669177 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || ||||| || |||| || ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
T |
19669176 |
ccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcaccatagttagagcatggattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaa |
19669077 |
T |
 |
Q |
371 |
ttaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
19669076 |
ttaatcacttattcatacaat-aattgaaaaattacactaaaatga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
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167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
28974026 |
caccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt |
28974125 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
28974126 |
gatcatgaaacttaccacaattcatcaacaacatagcataattcgccaa-atgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaat |
28974224 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| | ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
28974225 |
tcaattaacaacaattctattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
28974324 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
28974325 |
ccaaattaagca-cttttcatacaat-aattgaaaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 323
Target Start/End: Original strand, 9636701 - 9636977
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Q |
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atcaacccatttta-caaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
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T |
9636701 |
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9636800 |
T |
 |
Q |
147 |
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246 |
Q |
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||| || |||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |
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T |
9636801 |
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9636900 |
T |
 |
Q |
247 |
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323 |
Q |
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T |
9636901 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataa |
9636977 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
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Target Start/End: Original strand, 24277739 - 24278007
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168 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||| || || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||| | |
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|
T |
24277739 |
accaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcattta |
24277838 |
T |
 |
Q |
169 |
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268 |
Q |
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T |
24277839 |
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24277938 |
T |
 |
Q |
269 |
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337 |
Q |
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T |
24277939 |
caccaacaacaattcaattgtcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
24278007 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
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Q |
56 |
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155 |
Q |
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|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||| | || | |||||||| || ||||| || |
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T |
25601989 |
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25602088 |
T |
 |
Q |
156 |
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254 |
Q |
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T |
25602089 |
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25602187 |
T |
 |
Q |
255 |
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354 |
Q |
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T |
25602188 |
tgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatccatgaacaa |
25602287 |
T |
 |
Q |
355 |
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401 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
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T |
25602288 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttattcatacaat-aattgaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
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Target Start/End: Complemental strand, 36890952 - 36890659
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170 |
Q |
|
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||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |
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|
T |
36890952 |
caacaacaacttatttctcaacaacaaatcaagaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacaacaattgat |
36890853 |
T |
 |
Q |
171 |
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269 |
Q |
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|
T |
36890852 |
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36890754 |
T |
 |
Q |
270 |
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364 |
Q |
|
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|| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
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|
T |
36890753 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgccatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt |
36890659 |
T |
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Target Start/End: Complemental strand, 23821705 - 23821566
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371 |
Q |
|
|
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T |
23821705 |
caacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttactcaat |
23821606 |
T |
 |
Q |
372 |
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412 |
Q |
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||||||| || ||| |||| ||||||||| |||||||||| |
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T |
23821605 |
taagcacttaagcatgcaat-aattgaaaaattacactaaa |
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T |
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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 272 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 23830784 - 23830645
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Q |
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371 |
Q |
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T |
23830784 |
caacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttactcaat |
23830685 |
T |
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Q |
372 |
taagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
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T |
23830684 |
taagcacttaagcatgcaat-aattgaaaaattacactaaa |
23830645 |
T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 189 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24087537 - 24087311
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Q |
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287 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| |||||| ||||| | ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
24087537 |
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24087438 |
T |
 |
Q |
288 |
atcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcata |
387 |
Q |
|
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|||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |
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T |
24087437 |
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24087338 |
T |
 |
Q |
388 |
caatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
||| | |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
24087337 |
caa--caatgaaaaattacactaaaatga |
24087311 |
T |
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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4448402 - 4448092
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Q |
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167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
T |
4448402 |
caccaacaacatctcatttttcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
4448304 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| || ||||| | | | |||| | |||||||||||| ||| |
|
|
T |
4448303 |
gatcatgaaacttatcataattcaacaacaacaaagcatcattcaccaatt-gaacatattttcaacacaaacccatttcatacactttgaacatgtaat |
4448205 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
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| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
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T |
4448204 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
4448105 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
||||||||||||| |
|
|
T |
4448104 |
ctcaattaagcac |
4448092 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 401
Target Start/End: Original strand, 271148 - 271479
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Q |
68 |
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167 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| ||| | ||||||| |||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
T |
271148 |
caccaacaacatctcattcctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
271246 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | |||| | |||||||||||| ||| |
|
|
T |
271247 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttcatacactttgaacatgtaat |
271345 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
271346 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcttcatttatgaataattaatcaattca |
271445 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
| |||||||||| || |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
271446 |
cccaattaagca-cttttcatacaat-aattgaaaa |
271479 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Original strand, 6094672 - 6094895
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146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| | || || || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
T |
6094672 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattccacatcacaaactcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
6094771 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
||| || |||||||||||| | |||||| |||| | |||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |
|
|
T |
6094772 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc |
6094871 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
6094872 |
acatactatgaacatgcaatttca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23821892 - 23821730
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150 |
Q |
|
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||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |
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T |
23821892 |
acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
23821793 |
T |
 |
Q |
151 |
cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaa |
213 |
Q |
|
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|| |||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||| ||||||||| ||||||| |
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|
T |
23821792 |
caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataacatagcacaattcaa |
23821730 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23830971 - 23830809
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Q |
52 |
acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag |
150 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |
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|
T |
23830971 |
acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
23830872 |
T |
 |
Q |
151 |
cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaa |
213 |
Q |
|
|
|| |||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
23830871 |
caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataacatagcacaattcaa |
23830809 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 364
Target Start/End: Original strand, 32465835 - 32466130
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
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||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||||||| | |
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|
T |
32465835 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaatt |
32465934 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
267 |
Q |
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T |
32465935 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaagaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatatccatttttcatactttgaacatacaatt |
32466033 |
T |
 |
Q |
268 |
tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||| || | |||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32466034 |
caactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaatt |
32466130 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
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Target Start/End: Original strand, 25212980 - 25213176
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24 |
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121 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| |
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|
T |
25212980 |
tcatcaaaatcaaatttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagc |
25213078 |
T |
 |
Q |
122 |
catgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
||| | |||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
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T |
25213079 |
cataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
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Q |
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Q |
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T |
27261783 |
caccaacaacatctcatttcttaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaatatcaatt |
27261882 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
27261883 |
gatcatgaaacttat--caatttctcatactttgagcataattcaccaat--gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaat |
27261978 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| || |||||||||||||||||| | ||||| || ||| || |||| |||||||||| | |||| |||| | || |||||||||||||||||| | |
|
|
T |
27261979 |
tgaactaacaacaattcaattatccataactttatacatccaaacatgtcatcataattagggcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaattca |
27262078 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
27262079 |
tccaattaagcacttattcatacaat-aattgaaaa |
27262113 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 323
Target Start/End: Original strand, 25594980 - 25595252
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || | |
|
|
T |
25594980 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctatgaatcat---caacaatctctc |
25595075 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
||| || |||||||||||| | |||||| ||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||| || |||| |
|
|
T |
25595076 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaaaaacaacatagcacaattcaacaattagagtacaattcacaatataccattttc |
25595175 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
|
|
|||| | || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
25595176 |
acatattatggacatgcaatttcatcaacaacaattcatttatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataa |
25595252 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16292985 - 16292816
Alignment:
Q |
154 |
caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
253 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||| ||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| | ||||| || |||| |||||| |
|
|
T |
16292985 |
caacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagtacaattcaacaattaaagcacaattgacaatataccattttcgcatact |
16292886 |
T |
 |
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
16292885 |
atgaacatgcaatttcaccaacaacagttcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa |
16292816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Original strand, 22138140 - 22138295
Alignment:
Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |
|
|
T |
22138140 |
caacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaa |
22138239 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata |
226 |
Q |
|
|
|||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
22138240 |
catggttctcttcataattcaaaaacatcatagcataattcaaccaattgagcata |
22138295 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25265695 - 25265407
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccattttaca-aaatcaccaacaacaactcat-ttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca |
145 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| |||||| || ||| |||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
T |
25265695 |
atcaacccattt-acataaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatca |
25265598 |
T |
 |
Q |
146 |
cttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataa--ttcaacatatatcact |
243 |
Q |
|
|
||| || |||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||| | | || | |
|
|
T |
25265597 |
attaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaa-ttgagcacaattttcacaacttcacatt |
25265499 |
T |
 |
Q |
244 |
ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|| |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
T |
25265498 |
tttacata-attgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatt |
25265407 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 412
Target Start/End: Original strand, 19660032 - 19660200
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Q |
243 |
tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaac |
342 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |
|
|
T |
19660032 |
tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtatacgaacatatcatcataattagagcacgaaattcaac |
19660131 |
T |
 |
Q |
343 |
aattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
| || |||||| |||||| ||| || ||||| ||| || |||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
T |
19660132 |
atctaagaacaaataatcacttattccattaaacacttaatcatacaa-caaatgaaaaattacactaaa |
19660200 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24827041 - 24826846
Alignment:
Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcc |
122 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| |||| | |||||||| |
|
|
T |
24827041 |
tcatcaatatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacagctcattttctcaacaac-aatcatgataaatgagcacccaagcc |
24826943 |
T |
 |
Q |
123 |
atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
|| | |||| | ||||||| | || |||| |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
T |
24826942 |
ataattcataatcaacaacgtatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
24826846 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28031516 - 28031366
Alignment:
Q |
69 |
accaacaacaactcattt-ctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || | || |||||||||||| | |
|
|
T |
28031516 |
accaacaacatctcattttctcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcaacaacaacaacatcaatt |
28031418 |
T |
 |
Q |
168 |
g-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
| ||| || |||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
28031417 |
gaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatatcataattcatcaatt |
28031366 |
T |
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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
Target Start/End: Original strand, 15633193 - 15633341
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Q |
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accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
168 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| |||||||||||| || |
|
|
T |
15633193 |
accaacaacatcttatttctcactaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcat-agcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg |
15633290 |
T |
 |
Q |
169 |
aa-catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
|| | ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
15633291 |
aaacttgtttctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
15633341 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23836975 - 23836679
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| || | |||||| || ||| | || |||||||| ||| | |
|
|
T |
23836975 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaaaatgactaaacaacaacaacaacaatt |
23836876 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaa |
265 |
Q |
|
|
|| |||| | || |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || ||| ||| || |||| | |||||||||||| || |
|
|
T |
23836875 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatatttttcacacatacccattttcatacactttgaacatgtaa |
23836777 |
T |
 |
Q |
266 |
tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
|| ||| ||| |||||||||| || | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23836776 |
ttccactaac-acaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaatt |
23836679 |
T |
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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
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Target Start/End: Original strand, 33128045 - 33128172
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190 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||| | |||||| |||| | ||||||| |
|
|
T |
33128045 |
acaaatcatgagttatgaacaccacccaagccatgaatcattaacaacaatatctcttaaccacaacaatatcaattaaacatgattctcatcacaattc |
33128144 |
T |
 |
Q |
191 |
aacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
T |
33128145 |
aacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
33128172 |
T |
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Target: chr2; HSP #42
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154 |
caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatac |
252 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||| ||| || ||| ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||| | ||||| || |||| |||| |
|
|
T |
18536818 |
caacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacataacacaatttaacaattagagcacaatttacaatatacccattttcacatat |
18536917 |
T |
 |
Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
| |||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
18536918 |
tatgaacatgcaatttcatctacagcaatttaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
18537002 |
T |
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attatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacata |
202 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | || || |||||||||||| | |||||| ||| || ||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
24560964 |
attatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacata |
24560867 |
T |
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337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||| |
|
|
T |
43643057 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatt |
43642974 |
T |
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||| | ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
19794804 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
19794721 |
T |
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tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcat |
301 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
T |
20279575 |
tgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcat |
20279621 |
T |
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Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || ||||||| || ||| |
|
|
T |
25876186 |
caacaacaacttatttcacaataacaagccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaataacaacaacatttgat |
25876087 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
|
|
|||| | || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||| | | |||| | |||||||||||| |||| |
|
|
T |
25876086 |
catgaagcatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattca |
25875988 |
T |
 |
Q |
270 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
|| |||| ||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25875987 |
actaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaatt |
25875894 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #48
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56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||| || |||| || |
|
|
T |
12636157 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaatccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca |
12636059 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
12636058 |
acaacatcaa |
12636049 |
T |
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| || | ||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
462901 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatt |
462984 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
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Query Start/End: Original strand, 253 - 337
Target Start/End: Original strand, 8891405 - 8891488
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
8891405 |
tttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatt |
8891488 |
T |
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Target: chr2; HSP #51
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Q |
257 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
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T |
17396748 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaa-ttcatgcataca-acatatcatcaaagttggagcacgaatt |
17396670 |
T |
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Target: chr2; HSP #52
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
20627413 |
tttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
20627330 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
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Target Start/End: Original strand, 22283921 - 22284004
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaa |
140 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| | |||||| |
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T |
22283921 |
atttcacaaaaccaccaacaacaattcatttctcaacagcaattcatgaatcatgca-acccaagccatgtatcatcatcaacaa |
22284004 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
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Target Start/End: Original strand, 15044784 - 15045152
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Q |
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146 |
Q |
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||||||||||||| || ||| || ||||||||| | |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |
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T |
15044784 |
atcaacccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcac |
15044883 |
T |
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Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15044884 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
15044983 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15044984 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
15045083 |
T |
 |
Q |
347 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |
|
|
T |
15045084 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa-caattgagaatttaaactaaaatga |
15045152 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
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Target Start/End: Complemental strand, 15109640 - 15109272
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| || ||| || ||||||||| | |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |
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|
T |
15109640 |
atcaacccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattac |
15109541 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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T |
15109540 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttatcaatttgagtataattcaacatatatcactttc |
15109441 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
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|
T |
15109440 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaactatt |
15109341 |
T |
 |
Q |
347 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |
|
|
T |
15109340 |
atgaataattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa-caattgagaatttaaactaaaatga |
15109272 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 56 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 41166228 - 41165882
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
41166228 |
atttcacaaaaccacccacaacaactcatttctcatcaacaaatcataagttatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaaca |
41166129 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
255 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41166128 |
acaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
41166029 |
T |
 |
Q |
256 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
355 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| || |
|
|
T |
41166028 |
gaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaatatattatcataattggagcacaaattctaaca----------at |
41165939 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41165938 |
taatcaattactcaattaagcacttattcatacca-caattgaaaatttacactaaaa |
41165882 |
T |
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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 72 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13809776 - 13809448
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171 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| || | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |
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T |
13809776 |
aacaacatctcatttctcaacaaccaatcatgaatcatgcatatccaagccatgaattatcatcaacaacatcaattagcaacaacaacatcaattgatc |
13809677 |
T |
 |
Q |
172 |
atgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcac |
271 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
13809676 |
atgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaactaattgagcatatttcaacatataccattttctcatactttgaacatgaaatctcac |
13809577 |
T |
 |
Q |
272 |
caacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaat |
371 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13809576 |
caacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaat |
13809477 |
T |
 |
Q |
372 |
taagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
13809476 |
taagcacttattcatacaat-aattgaaaa |
13809448 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 71 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 52265775 - 52265446
Alignment:
Q |
71 |
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170 |
Q |
|
|
||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
52265775 |
caacatcaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa |
52265676 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
52265675 |
catgaatcttatcacaattcaacaacaacattgcataattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacataaaatttct |
52265576 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
52265575 |
ctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaattacccaa |
52265476 |
T |
 |
Q |
371 |
ttaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
|||| ||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
52265475 |
ttaaacacttattcatacaat-aattgaaaa |
52265446 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
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Target Start/End: Original strand, 14901197 - 14901555
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Q |
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attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| || |||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |
|
|
T |
14901197 |
attttacaaaaccaccaacaacaacccatttctcatcatcaattcatgaattatgcacacccatgtcatgaatcatcaacaacagcatcacttagcaaca |
14901296 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
255 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14901297 |
acaacatcaattgaatatgattcttaccacaattcaataataacatatcataattcaacattttgagcatatttaaacatatatcactttctcatacttc |
14901396 |
T |
 |
Q |
256 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
355 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
T |
14901397 |
aaacatgaaatttcaccaacaacaa-tcaattttcaacaatttcatacattcaaacatattgtcataattagagcacgaattataacaaatatgaacaat |
14901495 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || || |||||||| |
|
|
T |
14901496 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaat-aattgaaaaattgcaataaaatga |
14901555 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
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Query Start/End: Original strand, 49 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 7965000 - 7964639
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Q |
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tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
148 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
7965000 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
7964901 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||| | |||||| |||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
T |
7964900 |
agcaacaacaaaatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac |
7964801 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
|||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |
|
|
T |
7964800 |
atac-ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattttaacaactat |
7964702 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
T |
7964701 |
gaacaattactcacttactcaattaagcacttaatcatacaa-caaatgaaaaattacactaaa |
7964639 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 49 - 401
Target Start/End: Original strand, 18276392 - 18276743
Alignment:
Q |
49 |
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148 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
18276392 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaatactcatcgtcaaatcatgatttatgaacacccaagccatcaatcatcaacaacaatatcactt |
18276491 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| | |
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|
T |
18276492 |
tgcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac |
18276591 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||| |
|
|
T |
18276592 |
atgctttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaactat |
18276691 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
18276692 |
gaacaattaatcacatactcaattaagcacttaatcatacaat-aattgaaaa |
18276743 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 7186156 - 7185771
Alignment:
Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcc |
122 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||| |||| ||| |||||||| |
|
|
T |
7186156 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaaca---acaacaactcatatctcatcatcaaatcatgatttataaacacccaagcc |
7186060 |
T |
 |
Q |
123 |
atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgag |
222 |
Q |
|
|
||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |
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|
T |
7186059 |
atgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcatcatttagtg |
7185960 |
T |
 |
Q |
223 |
cataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcata |
322 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| |
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|
T |
7185959 |
cacaattcaacatatatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcata |
7185860 |
T |
 |
Q |
323 |
attggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
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||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||| |
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|
T |
7185859 |
attagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaa-caaatgaaaaattacactaaa |
7185771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 48 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41256660 - 41256330
Alignment:
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146 |
Q |
|
|
||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |
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|
T |
41256660 |
atcaacccatttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatctc |
41256561 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
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||| || |||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |
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|
T |
41256560 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatggttctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttc |
41256461 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
|
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|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | |
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|
T |
41256460 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattca-acatttcatcataattagagcacgaatttcaacaact |
41256362 |
T |
 |
Q |
347 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
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|
T |
41256361 |
atgaacaattaatcacttattcaattaagcac |
41256330 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 71 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15013549 - 15013243
Alignment:
Q |
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170 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||| ||||| | || |
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T |
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caacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaatatcaattaaa |
15013450 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
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|||| |||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |
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|
T |
15013449 |
catgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatgtcattttcacatactatgaacatgcaatttca |
15013350 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
|
|
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|
T |
15013349 |
ccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattca-acatatcatcataattagagcacgaatttaaacaactatgaacaattaatcacttattcaa |
15013251 |
T |
 |
Q |
371 |
ttaagcac |
378 |
Q |
|
|
|||||||| |
|
|
T |
15013250 |
ttaagcac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 411
Target Start/End: Original strand, 27960950 - 27961289
Alignment:
Q |
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168 |
Q |
|
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|||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| | ||||| |||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||| || |
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|
T |
27960950 |
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T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
Q |
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| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
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|
T |
27961049 |
atcatgaatcttataacaattcaacaacaatataacataattcaaccaatttagcatatttcaacatataccacttcttcatactttgaacatgaaattc |
27961148 |
T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
368 |
Q |
|
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|
T |
27961149 |
cactaacaacaattcaattattcataacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacggattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
27961248 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaa |
411 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
27961249 |
aattaagcacttattcatacaa-caattg-aaatttacactaa |
27961289 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 56 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 47535328 - 47535042
Alignment:
Q |
56 |
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155 |
Q |
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|
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T |
47535328 |
attttacaaaaccatcaacaacaactcatttctcattaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacgtcaatt------- |
47535236 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
255 |
Q |
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|
T |
47535235 |
------------gaacatgattcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatacttt |
47535148 |
T |
 |
Q |
256 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
355 |
Q |
|
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T |
47535147 |
gaacttgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat |
47535048 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18494598 - 18494264
Alignment:
Q |
68 |
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167 |
Q |
|
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|
T |
18494598 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccatgagttaccatcaacaacatcacttaacaacaacagcaacaatt |
18494499 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt-ctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
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|| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| | |
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|
T |
18494498 |
gatcatgaatcttaacacaattcaacaacaacatagcatcatccaaccaattgagcacatttcaacatataccatttttctcatactttgatcatgaagt |
18494399 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattac |
366 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
18494398 |
ttcaccaacaacaattcaattatcat-aacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattgatcaattac |
18494300 |
T |
 |
Q |
367 |
tcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
18494299 |
acaattaagcacctattcataccat-aattgaaaatt |
18494264 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 37957314 - 37956951
Alignment:
Q |
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148 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| |
|
|
T |
37957314 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccgtgaattatcaataacaacatcactt |
37957215 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||| | | ||||||||| ||||||| || | ||| || ||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
37957214 |
agcagcaaccacatcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatcaacatattccaaattgacatttagagcataatatgacatatatcattttcat |
37957115 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| || ||| ||| | ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |
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|
T |
37957114 |
atactttgatcattcaatttcaccaacaactaatcaattaccaccaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaattccaacaatcat |
37957015 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37957014 |
gaacaattaatcaattactcaattaaacaaataatcatacaa-caattgaaaatttacactaaaa |
37956951 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19822065 - 19821703
Alignment:
Q |
49 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
148 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
T |
19822065 |
tcaactcattttacaaagtcaccaaaaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacat |
19821966 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||||| |||||| || |||| | || || ||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
19821965 |
agcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaataacatatcacaatt-atcatttagagcataatatgacatatatcattttcat |
19821867 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
| ||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || |
|
|
T |
19821866 |
acactttgatcactcaatttctccaacaaccaaccaattatcaccaatttctcacatacaaacataacatcataataggagcacgaactctaataatcat |
19821767 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
19821766 |
gatcaattaatcaattactcaattaagcacttattcata-aaacaattgaaaattgacactaaaa |
19821703 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 57 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40905214 - 40904893
Alignment:
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ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa |
156 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||| ||||||| ||| |
|
|
T |
40905214 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccacgagtcatcaacaacaatatctcttagcaacaa |
40905115 |
T |
 |
Q |
157 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg |
256 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| || |||| |||| |||||| || |
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T |
40905114 |
caacatcaatt-aacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattggagtacaattcacaatgcatcattttcacatactatg |
40905016 |
T |
 |
Q |
257 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aat |
355 |
Q |
|
|
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|
T |
40905015 |
aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcagcaatttcatgtattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttcaacaactatgaacaaag |
40904916 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
|||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
40904915 |
taatcatttattcaattaagcac |
40904893 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 71 - 378
Target Start/End: Original strand, 38764689 - 38764995
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|
|
||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||| || |||||||||||| | || |
|
|
T |
38764689 |
caacaacaacttatttctcatcttcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaattaaa |
38764788 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| |||| | | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||| |
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T |
38764789 |
catgattctcatcataattgaacaacaacatcgcataattcaacaatttgagcacaattcacaatataacattttcacatactatgaacatgtaatttca |
38764888 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||| || |||||||||| |||| |
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|
T |
38764889 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcattcattcaaacatatccccataattaaagcacgaatttcaacaactatgaa-aaataatcaattattcaa |
38764987 |
T |
 |
Q |
371 |
ttaagcac |
378 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
38764988 |
ctaagcac |
38764995 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 71 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 30232763 - 30232435
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Q |
|
|
||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |
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30232763 |
caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaataatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgat |
30232664 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt-ctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
|
|
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T |
30232663 |
catgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcacataacccacttttcacatactttgatcatgaagtttc |
30232565 |
T |
 |
Q |
270 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactca |
369 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
30232564 |
accaacaacaattcaattatcat-aacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattacaca |
30232466 |
T |
 |
Q |
370 |
attaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| || ||||||||| |
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|
T |
30232465 |
attaagcacttattcataccat-aattgaaaa |
30232435 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 71 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18238424 - 18238158
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|
|
||||||||||| ||||| || || || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | || |
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|
T |
18238424 |
caacaacaacttatttcacatcactaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
18238325 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
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Q |
|
|
|||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |
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|
T |
18238324 |
catgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca |
18238225 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
18238224 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
18238158 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 68 - 378
Target Start/End: Original strand, 16732146 - 16732457
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||| ||||||| | |
|
|
T |
16732146 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacgacatcaatt |
16732245 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
16732246 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
16732344 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
16732345 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
16732444 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
| ||||||||||| |
|
|
T |
16732445 |
cccaattaagcac |
16732457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 71 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13442946 - 13442635
Alignment:
Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca---tcaact |
167 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || ||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||| |||| | |
|
|
T |
13442946 |
caacaacaactcatttctcatcatcaattcataatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaaaatctcttaacaacaacaacaacatcaatt |
13442847 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
267 |
Q |
|
|
|||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||| |
|
|
T |
13442846 |
aaacatgattctcatcacaattcaacaataacataacacaattcaacatttagagcataattcacaatataacattttcacatactatgaacatgcaatt |
13442747 |
T |
 |
Q |
268 |
tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaattac |
366 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | || |||||| |||| |
|
|
T |
13442746 |
tcacaaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttac |
13442647 |
T |
 |
Q |
367 |
tcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
|||||||||||| |
|
|
T |
13442646 |
tcaattaagcac |
13442635 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12837468 - 12837159
Alignment:
Q |
69 |
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168 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | || |
|
|
T |
12837468 |
accaacaacaacttatttctcac-aacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattg |
12837370 |
T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
267 |
Q |
|
|
| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
12837369 |
accatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaatt |
12837271 |
T |
 |
Q |
268 |
tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-ac |
366 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |
|
|
T |
12837270 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatatcatcatttatggacaattaatcaattcac |
12837171 |
T |
 |
Q |
367 |
tcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
||||||||||| |
|
|
T |
12837170 |
ccaattaagcac |
12837159 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 41917017 - 41916741
Alignment:
Q |
48 |
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146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
T |
41917017 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttttgaacactcaagcaatgaatcatcaacaacaatatctc |
41916918 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
||| || ||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||| |||||||| ||| |
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|
T |
41916917 |
ttaacaacaacaacatcagttaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaactcacaatatatcatcttc |
41916818 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
41916817 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattatattatcaccaattttatgtattcaaacatatcatcataa |
41916741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 71 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 50220207 - 50219987
Alignment:
Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| || || || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | || |
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|
T |
50220207 |
caacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
50220108 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| |||| | |||| |||||||||||| | || ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |
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|
T |
50220107 |
catgattctcatcacaaatcaacaacaacacaacacaattcaacatttagagcacaattcaaaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca |
50220008 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatca |
291 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
50220007 |
ccaacaacaattcaattatca |
50219987 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 337
Target Start/End: Original strand, 54398391 - 54398629
Alignment:
Q |
99 |
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198 |
Q |
|
|
|||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | |||||| |||| | |||| |||||||||| |
|
|
T |
54398391 |
tcatgatttataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaa |
54398490 |
T |
 |
Q |
199 |
catagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaactt |
298 |
Q |
|
|
|||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
T |
54398491 |
cataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatattattttcatatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattt |
54398590 |
T |
 |
Q |
299 |
catgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
54398591 |
catgtactcaaacatatcaacataacaagagcacgaatt |
54398629 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13590313 - 13590065
Alignment:
Q |
99 |
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198 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||| |||| || |||||||||||| | |||||| ||| | |||| |||||||||| |
|
|
T |
13590313 |
tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaa |
13590214 |
T |
 |
Q |
199 |
catagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaactt |
298 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||| | |||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| || |
|
|
T |
13590213 |
catagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatattatgaacatgcagtttcatcaacatcaattgaattatcaccaattt |
13590114 |
T |
 |
Q |
299 |
catgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatta |
347 |
Q |
|
|
|||| | || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
13590113 |
catgtacccaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaatta |
13590065 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 47468532 - 47468349
Alignment:
Q |
154 |
caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
253 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |
|
|
T |
47468532 |
caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacactatatcattttcacatact |
47468433 |
T |
 |
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
47468432 |
atgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
47468349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Original strand, 16522751 - 16522946
Alignment:
Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcc |
122 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
16522751 |
tcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagcc |
16522849 |
T |
 |
Q |
123 |
atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
|| | |||| | ||||||||| || |||| |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
T |
16522850 |
ataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
16522946 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23270204 - 23269908
Alignment:
Q |
68 |
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167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||||||| | |
|
|
T |
23270204 |
caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt |
23270105 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaa |
265 |
Q |
|
|
|| |||| | |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||| || |||| | |||||||||||| || |
|
|
T |
23270104 |
gatcatgatacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcatcaa-ttgagtatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaa |
23270006 |
T |
 |
Q |
266 |
tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
|| || ||| ||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23270005 |
ttcaactaac-acaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaatt |
23269908 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 364
Target Start/End: Original strand, 30457880 - 30458176
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac |
166 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||| | |||||||||||||| || | |||| |||| ||||| || |||||||| ||| |
|
|
T |
30457880 |
caccaacaacatctcatttctctataacaaaataatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaat |
30457978 |
T |
 |
Q |
167 |
tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaa |
265 |
Q |
|
|
||| |||| |||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | ||| ||||||||||||||| || |
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|
T |
30457979 |
tgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcgtaattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttacatactttgaacatgtaa |
30458077 |
T |
 |
Q |
266 |
tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30458078 |
ttcaaccaacaacaatttaattatccataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt |
30458176 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 403
Target Start/End: Original strand, 34395222 - 34395569
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| || | ||||||||| || ||||| || |
|
|
T |
34395222 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatagcaaca |
34395321 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatata-tcactttctcatact |
253 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| || |||| | ||| |
|
|
T |
34395322 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccattttcatacact |
34395420 |
T |
 |
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
353 |
Q |
|
|
||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| | ||||||| ||| | |||| |||||||||| ||| ||||||| | || ||||||||| |
|
|
T |
34395421 |
ttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcattacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaaca |
34395519 |
T |
 |
Q |
354 |
attaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||| || || |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
34395520 |
attaatcagttcacccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
34395569 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Original strand, 44055892 - 44056226
Alignment:
Q |
68 |
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167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || | | |||||||||||| | |
|
|
T |
44055892 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatggctaaaccacaacaacatcaatt |
44055991 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
44055992 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatattcatttttcatactttgaacatgtaat |
44056090 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| || ||||||||||||| || | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
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|
T |
44056091 |
tcaactaacaacaattcaa-aattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
44056189 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
44056190 |
tccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
44056226 |
T |
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Target: chr4; HSP #34
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122 |
Q |
|
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||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| |
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T |
9295627 |
tcatcaaaatcaaacttcttctttatcaactcattttacataaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagcc |
9295725 |
T |
 |
Q |
123 |
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218 |
Q |
|
|
|| | |||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
T |
9295726 |
ataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
9295822 |
T |
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Target: chr4; HSP #35
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Target Start/End: Complemental strand, 55376893 - 55376532
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43 |
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141 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||| |
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|
T |
55376893 |
tcataatcaacccattttcatcaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
55376794 |
T |
 |
Q |
142 |
atcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatca |
241 |
Q |
|
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|| | ||| || |||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||| |||||||| | |||||||| ||||| ||| ||| || ||| ||| | |
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T |
55376793 |
ataatttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaatt-gagtatattttcacacataccc |
55376695 |
T |
 |
Q |
242 |
ctttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaa |
341 |
Q |
|
|
||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | |
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|
T |
55376694 |
atttttcatacttagaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcat |
55376595 |
T |
 |
Q |
342 |
caattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaattt |
404 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
55376594 |
cacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattt |
55376532 |
T |
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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21959733 - 21959399
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167 |
Q |
|
|
||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||||||| | |
|
|
T |
21959733 |
caccaacaacatttaatttctcaaccacaaactatgaatcatgcaagcccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaatt |
21959634 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||| | ||| ||| |
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|
T |
21959633 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttg-agatgtaat |
21959536 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| | |||||||||||||| |||| | |||||||| |||| | |||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||| ||| |||| | |
|
|
T |
21959535 |
tcaatcaacaacaattcaaatatccataacttcatacatttaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatcaattaattca |
21959436 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
| ||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
21959435 |
cccaaataagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
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T |
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Target: chr4; HSP #37
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Q |
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167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| | |
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|
T |
53705003 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
53704904 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
267 |
Q |
|
|
|| |||| | || |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || ||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| |
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|
T |
53704903 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatacccatttttcatactttgaacatacaatt |
53704805 |
T |
 |
Q |
268 |
tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-ac |
366 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||| || | |||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |
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|
T |
53704804 |
caactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcat |
53704705 |
T |
 |
Q |
367 |
tcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||| ||||||||| |
|
|
T |
53704704 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa |
53704671 |
T |
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Target: chr4; HSP #38
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Target Start/End: Complemental strand, 20813638 - 20813507
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Q |
247 |
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346 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || || |
|
|
T |
20813638 |
tcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcattt |
20813539 |
T |
 |
Q |
347 |
atgaacaattaatcaatt-actcaattaagca |
377 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
T |
20813538 |
atgaacaattaatcaattcacccaattaagca |
20813507 |
T |
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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
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Target Start/End: Complemental strand, 40885659 - 40885505
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Q |
248 |
catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatta |
347 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| || || | |||||| ||||||| || ||| | |
|
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T |
40885659 |
catactttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaa-ttcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattttagcaaaca |
40885561 |
T |
 |
Q |
348 |
tgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
40885560 |
tgaacaattatccaattattcaattaatcacttattcatacaagaaatagaaaatt |
40885505 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
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Target Start/End: Complemental strand, 45459099 - 45458790
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193 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||| | ||||||||||| || || ||||||||| || || || |||||||||||| || |||| |||| |||||||||| |
|
|
T |
45459099 |
acaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcttcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcaac |
45459000 |
T |
 |
Q |
194 |
aacaacatagcataattcaacaatttgagcataa-ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaa |
292 |
Q |
|
|
|||| || ||||||||||| ||||| || |||| || |||||||| | |||||||| ||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| | |
|
|
T |
45458999 |
aacagcaaagcataattcaccaatt-gaacatatctttaacatatacaaacttctcatattttgagcatgtaattcaactaacaacaattcaattatcta |
45458901 |
T |
 |
Q |
293 |
caacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||| |||| | || |||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||| |
|
|
T |
45458900 |
tcacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagca-cttttcatacaaa |
45458802 |
T |
 |
Q |
392 |
gaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||||| |
|
|
T |
45458801 |
taattgaaaatt |
45458790 |
T |
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Target: chr4; HSP #41
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167 |
Q |
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|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| | |
|
|
T |
14996107 |
accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaatta |
14996204 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
14996205 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
14996255 |
T |
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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
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167 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| | |
|
|
T |
19697648 |
accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaatta |
19697551 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
19697550 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
19697500 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
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Q |
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167 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| | |
|
|
T |
19708233 |
accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaatta |
19708136 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
19708135 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
19708085 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
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Q |
|
|
||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | |||| |||||||| | || |||||||| || ||| |||| | |
|
|
T |
44346816 |
ctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacgacatcactaaacaacaacaacaacatttgatcatgaaaca |
44346915 |
T |
 |
Q |
180 |
tactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaac |
278 |
Q |
|
|
|| |||||||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||||| || ||| ||| | | ||||| | |||||||||||| |||| || |||| | |
|
|
T |
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tatcacaattcatgaacaacaatgtataattcaccaatt-gagcatattttcacacatacccattttcttacactttgaacatgtaattcaactaaca-c |
44347013 |
T |
 |
Q |
279 |
aattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagca |
377 |
Q |
|
|
||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
T |
44347014 |
aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagca |
44347113 |
T |
 |
Q |
378 |
cctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
44347114 |
ctta-tcatacaaataattgaaaatt |
44347138 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
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165 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
T |
8044920 |
accaacaacatcttatttctcatcaacaattcatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcagcaacaacatcaa |
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283 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |
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|
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8872625 |
acaattcatcaacaacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcacacatacccatttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacacttc |
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T |
 |
Q |
284 |
aattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctat |
382 |
Q |
|
|
||| || | | |||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |
|
|
T |
8872526 |
aatcattcatagcttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta- |
8872428 |
T |
 |
Q |
383 |
tcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
8872427 |
tcatacaaataattgaaaatt |
8872407 |
T |
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Target: chr4; HSP #47
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|
|
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|
|
T |
54118344 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatt |
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|
|
||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| || ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
T |
819997 |
caacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaa |
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T |
 |
Q |
371 |
ttaagca |
377 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
819897 |
ttaagca |
819891 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15675327 - 15675106
Alignment:
Q |
115 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
214 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||| |||||| | |
|
|
T |
15675327 |
cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcacc |
15675228 |
T |
 |
Q |
215 |
aatttgagcataatt--caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcataca |
312 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||| || | | || ||| |||| || ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||| |
|
|
T |
15675227 |
aatt-gagcacaattttcacaacttcacatttttacataatt-gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaaca |
15675131 |
T |
 |
Q |
313 |
taacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
15675130 |
tatcatcacagttggagcacgaatt |
15675106 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
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Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 53907966 - 53907873
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca |
161 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| |
|
|
T |
53907966 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaatcaacaacaaca |
53907873 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 124
Target Start/End: Original strand, 14951713 - 14951795
Alignment:
Q |
43 |
tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccat |
124 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
T |
14951713 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccat |
14951795 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 31115654 - 31115767
Alignment:
Q |
115 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
214 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||| | |||||| | |
|
|
T |
31115654 |
cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcacc |
31115753 |
T |
 |
Q |
215 |
aatttgagcataatt |
229 |
Q |
|
|
|| |||||||||||| |
|
|
T |
31115754 |
aa-ttgagcataatt |
31115767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47468610 - 47468536
Alignment:
Q |
57 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcat |
131 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
T |
47468610 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcat |
47468536 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 255 - 300
Target Start/End: Original strand, 21417471 - 21417516
Alignment:
Q |
255 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttca |
300 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
21417471 |
tgaacatgaaatttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattca |
21417516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 32460953 - 32460878
Alignment:
Q |
69 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca |
145 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| || |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
32460953 |
accaacaacatctcaattctcaccaacaa-tcatgatatatgcacacccaagtcataaatcataaacaacaacatca |
32460878 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 10104349 - 10104271
Alignment:
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacg |
333 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||| |
|
|
T |
10104349 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacg |
10104271 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 5682817 - 5682767
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaat |
106 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
5682817 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaat |
5682767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25119498 - 25119392
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaac-aaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagc |
154 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| || ||| | || | |
|
|
T |
25119498 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcattatcaacaatatgactaaacaac |
25119399 |
T |
 |
Q |
155 |
aacaaca |
161 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
25119398 |
aacaaca |
25119392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7132342 - 7132246
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
T |
7132342 |
caccaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaa |
7132246 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 337
Target Start/End: Original strand, 122052 - 122135
Alignment:
Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||| |||| |
|
|
T |
122052 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatt |
122135 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 337
Target Start/End: Original strand, 13246593 - 13246676
Alignment:
Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||||| |
|
|
T |
13246593 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatt |
13246676 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 69)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 56 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 21198434 - 21198075
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
T |
21198434 |
attttaccaaaccaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacagcaacatcacttagcaaca |
21198335 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
255 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21198334 |
acaacatcaattgaacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
21198235 |
T |
 |
Q |
256 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
355 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||| |
|
|
T |
21198234 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaat |
21198135 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
21198134 |
taatcaattactcaattaagcacttaatcatacaat-aattgaaaaattacactaaaatga |
21198075 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 56 - 416
Target Start/End: Original strand, 23837163 - 23837522
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
23837163 |
atttcacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca |
23837262 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
255 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23837263 |
acaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatagttcaacatatatcactttctcatacttt |
23837362 |
T |
 |
Q |
256 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
355 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |
|
|
T |
23837363 |
gaacatgaaatttcaataacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaat |
23837462 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || | |||||||| |
|
|
T |
23837463 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatctatattaaaatga |
23837522 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 49 - 391
Target Start/End: Original strand, 38533607 - 38533949
Alignment:
Q |
49 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
148 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||||||| | |
|
|
T |
38533607 |
tcaacccattttacaaagtctccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacct |
38533706 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |
|
|
T |
38533707 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaataatttgagcatatttcaacatataccattttctc |
38533806 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
38533807 |
atactttgaacatgagatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaattctaacaattat |
38533906 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
38533907 |
gaacaattagtcaattacttaattaagcacttattcatacaat |
38533949 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 49 - 412
Target Start/End: Original strand, 26011452 - 26011814
Alignment:
Q |
49 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
148 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
26011452 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
26011551 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
T |
26011552 |
agcaacaacaacatcaattcaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac |
26011651 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |
|
|
T |
26011652 |
atactttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat |
26011751 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
26011752 |
gaacaattaatcacttactcaattaaacacttaatcatacaat-aattgaaaaattacactaaa |
26011814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 49 - 412
Target Start/End: Original strand, 5854572 - 5854934
Alignment:
Q |
49 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
148 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
5854572 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
5854671 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
5854672 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaacatttagagcataattcaacatataacactttcat |
5854771 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |
|
|
T |
5854772 |
atactttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat |
5854871 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
5854872 |
gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaat-aattgaaaaattacactaaa |
5854934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 49 - 412
Target Start/End: Original strand, 15933256 - 15933618
Alignment:
Q |
49 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
148 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
15933256 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcttcaaatcatgatttacaaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
15933355 |
T |
 |
Q |
149 |
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248 |
Q |
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T |
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15933455 |
T |
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Q |
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348 |
Q |
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T |
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15933555 |
T |
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Q |
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412 |
Q |
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T |
15933556 |
gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaat-aattgaaaaattacactaaa |
15933618 |
T |
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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
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Target Start/End: Complemental strand, 39447034 - 39446693
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T |
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T |
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Q |
169 |
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268 |
Q |
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T |
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T |
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Q |
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368 |
Q |
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T |
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413 |
Q |
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T |
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T |
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Target: chr8; HSP #8
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Target Start/End: Complemental strand, 22736127 - 22735774
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148 |
Q |
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T |
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T |
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Q |
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247 |
Q |
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T |
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22735928 |
T |
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Q |
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347 |
Q |
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T |
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22735837 |
T |
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Q |
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Q |
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T |
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T |
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Target: chr8; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 17285323 - 17285525
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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aaaa |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 33528383 - 33528745
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T |
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Q |
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247 |
Q |
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T |
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33528581 |
T |
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Q |
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346 |
Q |
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T |
33528582 |
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33528680 |
T |
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Q |
347 |
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412 |
Q |
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T |
33528681 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
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Target Start/End: Original strand, 23149736 - 23150078
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Q |
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T |
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T |
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Q |
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245 |
Q |
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T |
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Q |
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344 |
Q |
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T |
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Target: chr8; HSP #12
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Target Start/End: Complemental strand, 33611334 - 33610980
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T |
 |
Q |
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256 |
Q |
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T |
33611234 |
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T |
 |
Q |
257 |
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356 |
Q |
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T |
33611134 |
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33611035 |
T |
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Q |
357 |
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412 |
Q |
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T |
33611034 |
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T |
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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
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Target Start/End: Original strand, 23158118 - 23158460
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Q |
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|
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T |
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T |
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Q |
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245 |
Q |
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T |
23158215 |
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23158314 |
T |
 |
Q |
246 |
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344 |
Q |
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T |
23158315 |
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T |
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Q |
345 |
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390 |
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T |
23158415 |
ttatgaacaattaatcatttactcaaataagcacttattcatacaa |
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T |
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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
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Target Start/End: Original strand, 22981366 - 22981570
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T |
22981366 |
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T |
 |
Q |
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383 |
Q |
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T |
22981466 |
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22981563 |
T |
 |
Q |
384 |
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390 |
Q |
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T |
22981564 |
catacaa |
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Target: chr8; HSP #15
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|
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||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
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T |
18261762 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
18261663 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
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T |
18261662 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc |
18261563 |
T |
 |
Q |
247 |
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346 |
Q |
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T |
18261562 |
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18261463 |
T |
 |
Q |
347 |
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391 |
Q |
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T |
18261462 |
atgaacaaagaatcacttattcaattaaacacttaatcatgcaat |
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Target: chr8; HSP #16
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T |
 |
Q |
224 |
ataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
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T |
29306550 |
ataattcaacatatatcattttcacaaactttgaacatacaaattcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattagaacatatcatcatag |
29306649 |
T |
 |
Q |
324 |
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416 |
Q |
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T |
29306650 |
ttagagcacgaatattaacatctatgaacaatcaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaa-caaatgaaaaattacactaaaatga |
29306741 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 71 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23152100 - 23151781
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T |
23152100 |
caacaacttctcatttatcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacatagcaacaacagcatcaattgaa |
23152001 |
T |
 |
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catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
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T |
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cacggttctcatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattgggcaaaattcacttcataccactttcatacaatttgaacatgaaatttca |
23151901 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
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T |
23151900 |
ccaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaatatatcatcataattggaacacgaattttaacaaatatgaacaattaatcatttactgaa |
23151801 |
T |
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Q |
371 |
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390 |
Q |
|
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|||||||| |||||| |||| |
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|
T |
23151800 |
ttaagcacttattcacacaa |
23151781 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
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Target Start/End: Complemental strand, 23226368 - 23226002
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145 |
Q |
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T |
23226368 |
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23226269 |
T |
 |
Q |
146 |
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245 |
Q |
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T |
23226268 |
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23226169 |
T |
 |
Q |
246 |
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345 |
Q |
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T |
23226168 |
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23226069 |
T |
 |
Q |
346 |
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416 |
Q |
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T |
23226068 |
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23226002 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
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Target Start/End: Complemental strand, 38635915 - 38635595
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170 |
Q |
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T |
38635915 |
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38635816 |
T |
 |
Q |
171 |
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270 |
Q |
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T |
38635815 |
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38635716 |
T |
 |
Q |
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370 |
Q |
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T |
38635715 |
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38635616 |
T |
 |
Q |
371 |
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391 |
Q |
|
|
|||||||| || |||| |||| |
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|
T |
38635615 |
ttaagcacttaatcatgcaat |
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Target: chr8; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 48 - 391
Target Start/End: Original strand, 22742717 - 22743064
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146 |
Q |
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||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || | |
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T |
22742717 |
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T |
 |
Q |
147 |
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243 |
Q |
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| | || |||| |||||||| | |||||| |||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||| | |
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T |
22742817 |
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22742916 |
T |
 |
Q |
244 |
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343 |
Q |
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T |
22742917 |
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22743016 |
T |
 |
Q |
344 |
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391 |
Q |
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|
T |
22743017 |
actatgaacaaataatcaattattcaactaagcacttaatcatgcaat |
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Target: chr8; HSP #21
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Target Start/End: Complemental strand, 45465393 - 45465088
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Q |
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T |
45465393 |
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T |
 |
Q |
171 |
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270 |
Q |
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T |
45465293 |
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45465194 |
T |
 |
Q |
271 |
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370 |
Q |
|
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T |
45465193 |
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45465095 |
T |
 |
Q |
371 |
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377 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
45465094 |
ttaagca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 323
Target Start/End: Original strand, 33172184 - 33172460
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146 |
Q |
|
|
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T |
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T |
 |
Q |
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246 |
Q |
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|| | |||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |
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T |
33172284 |
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33172383 |
T |
 |
Q |
247 |
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323 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
33172384 |
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33172460 |
T |
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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 45559228 - 45558952
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Q |
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146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || |||||| |||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
T |
45559228 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgatttatgaccacccaagctatgaatcatcaacaacaatatccc |
45559129 |
T |
 |
Q |
147 |
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246 |
Q |
|
|
||| || |||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |
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T |
45559128 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc |
45559029 |
T |
 |
Q |
247 |
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323 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||| ||||| |||||||| |
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|
T |
45559028 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtactcaaacatatcatcataa |
45558952 |
T |
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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
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Target Start/End: Original strand, 15969794 - 15970141
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| || |||||||||||||| || || | |||||||||||| || |||| ||| ||| |
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|
T |
15969794 |
atcaccaacaacaactcatttctcctctacaa-tcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaatagcaacatcacttaacaacaactacaccaa |
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T |
 |
Q |
166 |
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262 |
Q |
|
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|||||||| ||| | | |||||||| || |||| || || | ||| || ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||| |
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|
T |
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15969992 |
T |
 |
Q |
263 |
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362 |
Q |
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|
|
T |
15969993 |
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15970092 |
T |
 |
Q |
363 |
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412 |
Q |
|
|
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|
|
T |
15970093 |
ttactcaattaagcatttattcatacaat-aattgaaaaattgcactaaa |
15970141 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
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Target Start/End: Complemental strand, 31194606 - 31194250
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Q |
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|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| || |
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T |
31194606 |
attttacaaagtcaccaacaacaactcatttttcaccaacaaatcatgaatcatgtgcacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaaca |
31194507 |
T |
 |
Q |
156 |
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255 |
Q |
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T |
31194506 |
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T |
 |
Q |
256 |
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354 |
Q |
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T |
31194406 |
gatgcattcaattttacccacaacaa-ccaattatcaccaatttcttacatacaaacagaacatcgtaattagagcacgaattctaacaatcatgaacaa |
31194308 |
T |
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Q |
355 |
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413 |
Q |
|
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|
T |
31194307 |
ttaatcaattactcaattaagcaattattcatacaa-caattgaaaatttgcactaaaa |
31194250 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
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|||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || | |
|
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T |
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25296364 |
T |
 |
Q |
298 |
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397 |
Q |
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|
||||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |
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T |
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tcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattttaacatgtatgaacaattaattacttactcaattaaacacttattcatacaa-caatca |
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T |
 |
Q |
398 |
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413 |
Q |
|
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|
|
T |
25296464 |
aaaatttacactaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
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Q |
|
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|
T |
25758285 |
acatagaacaattcaacaatttgagcataattcaacatatatcattttcaaaagctttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatt |
25758384 |
T |
 |
Q |
298 |
tcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattg |
397 |
Q |
|
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T |
25758385 |
tcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattttaacatgtatgaacaattaattacttactcaattaaacacttattcatacaa-caatca |
25758483 |
T |
 |
Q |
398 |
aaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |
|
|
T |
25758484 |
aaaatttacactaaaa |
25758499 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 48 - 337
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Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||| || | |
|
|
T |
18041823 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcataaactcatgatttatgaacacctaagctatgaatcatcaacaacaatatatc |
18041724 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
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||| || |||||||||||| | |||||| |||| | |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||| |
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T |
18041723 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagtacaattcacaatatatcattttc |
18041624 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
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T |
18041623 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgtactcaaacatatcgtcataacaagagcacgaatt |
18041533 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 20573461 - 20573129
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|
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|
T |
20573461 |
caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
20573363 |
T |
 |
Q |
168 |
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266 |
Q |
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T |
20573362 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccttttcatacactttgaacatgtaat |
20573264 |
T |
 |
Q |
267 |
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365 |
Q |
|
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| || |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
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|
T |
20573263 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
20573164 |
T |
 |
Q |
366 |
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401 |
Q |
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|
| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| |
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|
T |
20573163 |
cccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa |
20573129 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22497500 - 22497210
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Q |
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146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || |||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | | | |
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|
T |
22497500 |
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T |
 |
Q |
147 |
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246 |
Q |
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||| || |||||||||||| | |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |
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T |
22497400 |
ttatcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc |
22497301 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
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T |
22497300 |
acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatctactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
22497210 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
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Target Start/End: Original strand, 20481585 - 20481916
Alignment:
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170 |
Q |
|
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||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | ||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |
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T |
20481585 |
caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgat |
20481684 |
T |
 |
Q |
171 |
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269 |
Q |
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T |
20481685 |
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20481783 |
T |
 |
Q |
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369 |
Q |
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T |
20481784 |
actaacaacaattcaattattcataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaaataatcaattatcca |
20481883 |
T |
 |
Q |
370 |
attaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |
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T |
20481884 |
attaagcacttattcatac-attaattgaaaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 57 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 37653895 - 37653617
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156 |
Q |
|
|
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T |
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ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttttcatcatcaaatcatga--tatgaacacccaagccataaatcatcaacaacaatattccttaacaacaa |
37653798 |
T |
 |
Q |
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256 |
Q |
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T |
37653797 |
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37653698 |
T |
 |
Q |
257 |
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337 |
Q |
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|||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||| | || ||||||| |||||||||| |
|
|
T |
37653697 |
aacatgcaatttcagcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgcatacaaacacatcaccataattaaagcacgaatt |
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T |
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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 401
Target Start/End: Original strand, 21680980 - 21681313
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Q |
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168 |
Q |
|
|
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|
T |
21680980 |
accaacaacatcttatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaacatcaattg |
21681079 |
T |
 |
Q |
169 |
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267 |
Q |
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| |||| || | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||| |
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T |
21681080 |
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21681179 |
T |
 |
Q |
268 |
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366 |
Q |
|
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|
T |
21681180 |
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21681279 |
T |
 |
Q |
367 |
tcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
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|
T |
21681280 |
caaattaagcacttattcatacaat-aattgaaaa |
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T |
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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27233348 - 27233159
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Q |
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156 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||| |
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|
T |
27233348 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcattatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaa |
27233249 |
T |
 |
Q |
157 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
T |
27233248 |
caacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacattttgagcataattcacaatatatcattttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24552851 - 24552571
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Q |
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156 |
Q |
|
|
|||||||||| || | ||||||||| ||||| || || ||| |||||| | || ||| | ||||| | |||||| |||||| | ||| |||| || ||| |
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|
T |
24552851 |
ttttacaaaaccaacgacaacaacttatttcacatcaccaactcatgattcattaacactcaagctctaaatcatcaacaaccatatctcttaacaacaa |
24552752 |
T |
 |
Q |
157 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg |
256 |
Q |
|
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||||||||| | |||||| |||| | |||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| || |
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|
T |
24552751 |
caacatcaattaaacatgattctcatcacaaattaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatg |
24552652 |
T |
 |
Q |
257 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
24552651 |
aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
24552571 |
T |
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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Original strand, 41246635 - 41246969
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Q |
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167 |
Q |
|
|
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|
T |
41246635 |
caccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt |
41246734 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
267 |
Q |
|
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|| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | ||| || |||||| |||||| |||| |
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|
T |
41246735 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttaagcatatttcatcatatacccatttttcctacttttaacatgtaatt |
41246833 |
T |
 |
Q |
268 |
tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-ac |
366 |
Q |
|
|
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|
T |
41246834 |
caaccaacaacaatttaattattcataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaattaatcaattcat |
41246933 |
T |
 |
Q |
367 |
tcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
41246934 |
ccaattaagca-cttttcatacaactaattgaaaatt |
41246969 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19331606 - 19331341
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145 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || |||||| | |||||| || |||| ||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
T |
19331606 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgattcatgaacacctaagctatgaatcatcaacaaacaatatct |
19331507 |
T |
 |
Q |
146 |
cttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt |
245 |
Q |
|
|
|| | | |||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |
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|
T |
19331506 |
ctcaataacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaacaatttgagcataattcacaatatatcatttt |
19331407 |
T |
 |
Q |
246 |
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314 |
Q |
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| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |
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|
T |
19331406 |
cacatactatgaacatgcaatttcacca---acaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacata |
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T |
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Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
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|
T |
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acaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaa-cataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatt |
20561687 |
T |
 |
Q |
283 |
caattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaccta |
381 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||| |||| | || |||||||||||||||||||| || |||||||||| || |
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|
T |
20561686 |
caattatctataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagca-ctt |
20561588 |
T |
 |
Q |
382 |
ttcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
20561587 |
ttcatacaaataattgaaaa |
20561568 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || | | ||||||||| || ||||| |||| ||||||| | |
|
|
T |
20648099 |
caccaacaaaatctcacttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaatt |
20648000 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataa-ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |
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T |
20647999 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaat |
20647901 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaa |
285 |
Q |
|
|
| || ||||||||||||| |
|
|
T |
20647900 |
tcaactaacaacaattcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20654175 - 20653944
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167 |
Q |
|
|
||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| | | ||||||||| || ||||| |||| ||||||| | |
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T |
20654175 |
caccaacaaaatctcacttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagcaatgaattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaatt |
20654076 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
20654075 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgtaat |
20653977 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttc |
299 |
Q |
|
|
| || |||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
T |
20653976 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
20653944 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
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Q |
266 |
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365 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | |||||| ||| |
|
|
T |
27233162 |
tttcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaactaataatcactta |
27233063 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
|||||||||||| |
|
|
T |
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ttcaattaagcac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
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|
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|
|
T |
17285232 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
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Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Original strand, 37611645 - 37611980
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac |
166 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || | |||| |||| ||||| || |||||||| ||| |
|
|
T |
37611645 |
caccaacaacatttcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaat |
37611743 |
T |
 |
Q |
167 |
tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaa |
264 |
Q |
|
|
||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||| | |
|
|
T |
37611744 |
tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgta |
37611842 |
T |
 |
Q |
265 |
atttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
||| || |||| |||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37611843 |
attcaactaaca-caattcaattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaatt |
37611941 |
T |
 |
Q |
365 |
actc-aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
37611942 |
catctaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
37611980 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
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Target Start/End: Original strand, 16002013 - 16002230
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Q |
106 |
ttatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagca |
205 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| | || || |||||||||||| | |||||| || || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
16002013 |
ttatgaacacccaagatgtgaataatcaacaacaacatctcataacaacaacaacatcaattaaacatggatcc-accacaaatcaacaacaacatagca |
16002111 |
T |
 |
Q |
206 |
taattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgca |
304 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||| |||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| | |
|
|
T |
16002112 |
caattcaacaattagagcacaatttacaatatactcattttcacatatcatgaacatacaatttcatcaacaacaattaaattatcatcaaattcatata |
16002211 |
T |
 |
Q |
305 |
ttcatacataacatcataa |
323 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
16002212 |
ctcaaacatatcatcataa |
16002230 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3431570 - 3431462
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| || |
|
|
T |
3431570 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaaca |
3431472 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
3431471 |
acaacatcaa |
3431462 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
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Target Start/End: Complemental strand, 18118437 - 18118336
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Q |
191 |
aacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct-catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattat |
289 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| |||||| || ||| | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
18118437 |
aacaacaacatagcacaattcatcaatttaagcacaattcaccatataccaatttatgcatatcatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattat |
18118338 |
T |
 |
Q |
290 |
ca |
291 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
18118337 |
ca |
18118336 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
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Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
|||||||| |||| | |||| ||||||| || |||||||| | ||||| |||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| ||| |
|
|
T |
22235070 |
caacaacatctcaatcctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaatccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgat |
22234971 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
|
|
|||| | || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||| | | |||| | ||||||| |||| |||| |
|
|
T |
22234970 |
catgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcacacatacccattttcatacactttgagcatgtaattca |
22234872 |
T |
 |
Q |
270 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
368 |
Q |
|
|
|| |||| ||||| |||||| | |||||||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | || |
|
|
T |
22234871 |
actaaca-caattaaattattcataacttcatacatctaaacacgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcattc |
22234773 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
22234772 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
22234739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| |
|
|
T |
20567427 |
caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaa |
20567331 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
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Query Start/End: Original strand, 68 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20573620 - 20573524
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| |
|
|
T |
20573620 |
caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaa |
20573524 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Original strand, 25122626 - 25122754
Alignment:
Q |
275 |
caacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaatta |
373 |
Q |
|
|
||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
T |
25122626 |
caacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattggagcacgaatttgatcatttatgaacaattaatcaattcatccaatta |
25122725 |
T |
 |
Q |
374 |
agcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
25122726 |
agca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
25122754 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #51
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
16193816 |
tttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
16193733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 337
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Alignment:
Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
16405075 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
16404992 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
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Alignment:
Q |
69 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
T |
18612386 |
accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacactcaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaa |
18612480 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 165
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Q |
69 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
T |
18619291 |
accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacactcaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaa |
18619385 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #55
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||| | |||||| || ||| | || || |
|
|
T |
24717152 |
attttacaaaaccaccaacaacaatccatttatcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatca |
24717053 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatg |
174 |
Q |
|
|
|||||| | | |||||||| |
|
|
T |
24717052 |
acaacaaccattgaacatg |
24717034 |
T |
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| || |
|
|
T |
13721217 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca |
13721119 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
13721118 |
acaacatcaa |
13721109 |
T |
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Q |
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accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
168 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| || |||||| || |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| || |
|
|
T |
21494725 |
accaacaacatctcaattctcaccaacaa-tcatgatatatgcacacccaagttataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg |
21494627 |
T |
 |
Q |
169 |
aa |
170 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
21494626 |
aa |
21494625 |
T |
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca |
161 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | |||||| || ||| | || |||||||| |
|
|
T |
41507087 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaaca |
41506994 |
T |
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253 |
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337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
24928891 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatt |
24928808 |
T |
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tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatca |
320 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
6774346 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
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T |
 |
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacat |
143 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| |
|
|
T |
20567268 |
caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat |
20567194 |
T |
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83 |
atttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
22886320 |
atttctcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa |
22886406 |
T |
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatca |
320 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
24549145 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
24549211 |
T |
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| | ||| |||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| | |
|
|
T |
19993324 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaaccctagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
19993225 |
T |
 |
Q |
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gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
|| ||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
19993224 |
gatgatgaaatttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24929087 - 24929037
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaat |
106 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
24929087 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaat |
24929037 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 124
Target Start/End: Original strand, 29759893 - 29759975
Alignment:
Q |
43 |
tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccat |
124 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
T |
29759893 |
tcataatcaacccatttacaccaaaacaccaacaacaaaccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccat |
29759975 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 139
Target Start/End: Original strand, 25296137 - 25296229
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaaca |
139 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||| ||| || | |||||||| ||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
25296137 |
atcaaccaattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttttcatcatctaatcatgatatatgaacacctaagtcatgaatcatcaacaaca |
25296229 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 139
Target Start/End: Original strand, 25758157 - 25758249
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaaca |
139 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||| ||| || | |||||||| ||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
25758157 |
atcaaccaattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttttcatcatctaatcatgatatatgaacacctaagtcatgaatcatcaacaaca |
25758249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 43373568 - 43373485
Alignment:
Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| || || || ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
43373568 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaa-ttcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatt |
43373485 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 56 - 416
Target Start/End: Original strand, 21623133 - 21623492
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
T |
21623133 |
attttaccaaactaccaacaacaactcatttttcatccacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatcacttagcaaca |
21623232 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
255 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21623233 |
acaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
21623332 |
T |
 |
Q |
256 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
355 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
21623333 |
gaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaattctaacatttatgaacaat |
21623432 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
T |
21623433 |
taatcaattactcaattaagcacttattcatacaa-caattgagaaattacactaaaatga |
21623492 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 43 - 416
Target Start/End: Original strand, 18398890 - 18399261
Alignment:
Q |
43 |
tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaac |
141 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||| |
|
|
T |
18398890 |
tcataatcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcttatca-caattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaac |
18398988 |
T |
 |
Q |
142 |
atcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatca |
241 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
T |
18398989 |
atcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatacta |
18399088 |
T |
 |
Q |
242 |
ctttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaa |
341 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18399089 |
ttttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaa |
18399188 |
T |
 |
Q |
342 |
caattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
18399189 |
caattatgaacaattagtcaattactcaattaagcacttattcatacaat-aattg-aaatttacactaaaatga |
18399261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 72 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 25367503 - 25367159
Alignment:
Q |
72 |
aacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaac |
171 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
T |
25367503 |
aacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaac |
25367404 |
T |
 |
Q |
172 |
atgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcac |
271 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
25367403 |
atgaatcttatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagcatatttcaacataaaccactttctcatactttgaacatgaaatttctc |
25367304 |
T |
 |
Q |
272 |
caacaacaattcaattatc-aacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
25367303 |
taacaacaattccattatcaaaaaacttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattgctcaa |
25367204 |
T |
 |
Q |
371 |
ttaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25367203 |
ttaagcacttattcatacaat-aattgaaaatttacactaaaatga |
25367159 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 56 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18381965 - 18381649
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
18381965 |
atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca |
18381866 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
255 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18381865 |
acaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatttaagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
18381766 |
T |
 |
Q |
256 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
355 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||| |
|
|
T |
18381765 |
gaacatgaaatttcaccaacaaccattcaattatcaacaacttcatgtattcaaaaatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat |
18381666 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaattactcaatt |
372 |
Q |
|
|
|||||| |||| ||||| |
|
|
T |
18381665 |
taatcatttacacaatt |
18381649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 49 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22362054 - 22361713
Alignment:
Q |
49 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
148 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
22362054 |
tcaacccattttacaaaactaacaacaacaactcaattctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
22361955 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
22361954 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacttatgtcactttctc |
22361855 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| || || ||| |
|
|
T |
22361854 |
atactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatcatctat |
22361755 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaa |
390 |
Q |
|
|
||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
22361754 |
gaacaattaatcatttgctcaattaagcacttattcatacaa |
22361713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 33538647 - 33538297
Alignment:
Q |
60 |
tacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaa |
159 |
Q |
|
|
||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
T |
33538647 |
tacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaataacaa |
33538548 |
T |
 |
Q |
160 |
catcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaac |
259 |
Q |
|
|
|||||| | |||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
33538547 |
catcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacctttagagcataattcacaacatatcactttcacatactttgaac |
33538448 |
T |
 |
Q |
260 |
atgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaat |
359 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||| || |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
33538447 |
atgcaatttcaccaacaacaattcaatt-tcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagttagagcacgaattttaacaactatgaacaattaat |
33538349 |
T |
 |
Q |
360 |
caattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
T |
33538348 |
cacttactcaattaagcacttaatcatacaa-caaatgaaaaattacactaaa |
33538297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 57 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18629892 - 18629556
Alignment:
Q |
57 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa |
156 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |
|
|
T |
18629892 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaa |
18629793 |
T |
 |
Q |
157 |
caaca---tcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
253 |
Q |
|
|
||||| |||| | |||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
18629792 |
caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacattcagagcataattcacaatataccactttcacatact |
18629693 |
T |
 |
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
353 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
T |
18629692 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaaca |
18629593 |
T |
 |
Q |
354 |
attaatcaattactcaattaagcacctattcatacaa |
390 |
Q |
|
|
|||||||| ||| |||||||| ||| || |||||||| |
|
|
T |
18629592 |
attaatcacttattcaattaaacacttaatcatacaa |
18629556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 117 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 21411270 - 21410973
Alignment:
Q |
117 |
caagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa |
216 |
Q |
|
|
|||||||||||| || || |||| ||||| ||| || || | ||||||| || ||||| ||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
21411270 |
caagccatgaattataaataacatcatcatttaacaacatctacatcaattgcacatgaatctcagcataatccaacatcaacatagcataattca-caa |
21411172 |
T |
 |
Q |
217 |
tttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataac |
316 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21411171 |
tttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttatttaacaaccattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataac |
21411072 |
T |
 |
Q |
317 |
atcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21411071 |
atcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaattagtcaattcctcaattaagcacttattcatacaat-aattgaaaatttacactaaaatga |
21410973 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 17083493 - 17083125
Alignment:
Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcc |
122 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
T |
17083493 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaacaacaacaacaactcatttctaatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagcc |
17083394 |
T |
 |
Q |
123 |
atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgag |
222 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |
|
|
T |
17083393 |
atgaatcatcaacaacaacatcaatta-------------------aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagag |
17083313 |
T |
 |
Q |
223 |
cataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcata |
322 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
17083312 |
cacaattcaacatatatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa-ttcatgcattcaaacatatcatcata |
17083214 |
T |
 |
Q |
323 |
attggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
T |
17083213 |
attagagcacgaatattaacaactatgaacaattaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaa-caaatgaaaaattacactaaa |
17083125 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 314
Target Start/End: Original strand, 25651197 - 25651460
Alignment:
Q |
52 |
acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag |
150 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
T |
25651197 |
acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatccaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
25651296 |
T |
 |
Q |
151 |
cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcat |
250 |
Q |
|
|
|| |||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
T |
25651297 |
caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcacat |
25651396 |
T |
 |
Q |
251 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacata |
314 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |
|
|
T |
25651397 |
actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacata |
25651460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 416
Target Start/End: Original strand, 33324673 - 33325017
Alignment:
Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
T |
33324673 |
caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaa |
33324772 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| |||| | | |||||||| |||| ||||||||||||| | | |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| || |||| |
|
|
T |
33324773 |
catggttctcatcataattcaaccacaatatagcataattcatccaattgagcataattcataagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattca |
33324872 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
33324873 |
-caacaacaattcaattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaattatccaa |
33324971 |
T |
 |
Q |
371 |
ttaagcacctattcatacaatgaattgaaa-atttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
33324972 |
ttaatcacttattcatac-attaattgaaataattacactaaaatga |
33325017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 71 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 35136279 - 35135935
Alignment:
Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
T |
35136279 |
caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaa |
35136180 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| |||| | | |||||||| |||| ||||||||||||| | | |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| || |||| |
|
|
T |
35136179 |
catggttctcatcataattcaaccacaatatagcataattcatccaattgagcataattcacaagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattca |
35136080 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
35136079 |
-caacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaattatctaa |
35135981 |
T |
 |
Q |
371 |
ttaagcacctattcatacaatgaattg-aaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
T |
35135980 |
ttaatcacttattcatacaat-aattgaaaaaattacactaaaatga |
35135935 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 71 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16888059 - 16887718
Alignment:
Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||| |
|
|
T |
16888059 |
caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgtatacccaagccatgaatcattaacaataacatcacatagtgacaacaaaatcaattgaa |
16887960 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| || |||| |
|
|
T |
16887959 |
catggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcacccaattgagcataattcacaagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattca |
16887860 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
T |
16887859 |
ccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttattcaa |
16887760 |
T |
 |
Q |
371 |
ttaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
16887759 |
ttaatcacttattcatacaat-aattgaaaaattatactaaaa |
16887718 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17557258 - 17556979
Alignment:
Q |
96 |
aaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaa |
195 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||| || || | |||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||| | || ||| || | | |||||||||||| |
|
|
T |
17557258 |
aaatcatgatttatgaacacctaaactatgaatgattaacaacaatattagttagcaacaacaacatcaattaaatatgattataatcacaattcaacaa |
17557159 |
T |
 |
Q |
196 |
caacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaa |
295 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
17557158 |
caacatagca-aattcaacatctatagcataattcaacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa |
17557060 |
T |
 |
Q |
296 |
cttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
|||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
17557059 |
tttcatgca-tcaaacatatcatcataattagagcacgaatt-taacaactatgaacaaataatcaattattcaattaagcac |
17556979 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 48 - 378
Target Start/End: Original strand, 29605406 - 29605736
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || | |
|
|
T |
29605406 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaagaacaacttatttctcattatcaattcatgatttatgcacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatttc |
29605505 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||| | | |||| ||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||| |||| |
|
|
T |
29605506 |
ttagcaacaacaacatcaattaagcatgattcacatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacattttgagcacaattcacaatatttcattttc |
29605605 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| | |
|
|
T |
29605606 |
acatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatc-actaattcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaact |
29605704 |
T |
 |
Q |
347 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
29605705 |
atgaacaaataatcacttattcaattaagcac |
29605736 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 69 - 413
Target Start/End: Original strand, 15740207 - 15740550
Alignment:
Q |
69 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
168 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||| || || | ||||||| || |
|
|
T |
15740207 |
accaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaaaccatgaattattaataacatcatcatttaacaacatctacatcaattg |
15740306 |
T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
Q |
|
|
|||||| ||| | || ||||||||| ||||||| || || | ||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |
|
|
T |
15740307 |
aacatgaatctcagtataattcaacatcaacatatcacaaattgacatatagagcataatatgacatatatcatttttatatactttgatcattcaattt |
15740406 |
T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
368 |
Q |
|
|
|||||||||| | |||||||||| ||| ||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15740407 |
caccaacaaccaatcaattatcaccaatttcttacatacaaacatagcatcataattggagcacgaaatctaacaatcatgaacaattaatcaattactc |
15740506 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15740507 |
aattaagtacttattcatacaa-aaattgaaaatttacactaaaa |
15740550 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 413
Target Start/End: Original strand, 25919571 - 25919934
Alignment:
Q |
49 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
148 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
25919571 |
tcaactcattttacaaagtcaccaacaataactcatttttcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcatat |
25919670 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| || || | | || || ||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
25919671 |
agcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatatcacaaattatcatttagagtataatatgacatatatcattttcat |
25919770 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
| |||| || || |||||| |||||||| | ||||||||| ||| ||| | | || | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |
|
|
T |
25919771 |
acacttggatcactcaatttctccaacaaccaaccaattatcaccaatttctcacgtacaaatataacatcataataggagcacgaattctaataatcat |
25919870 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |
|
|
T |
25919871 |
gaccaattaatcaattactcaattaagcacttattcattcaa-caaatgaaaattgacactaaaa |
25919934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 391
Target Start/End: Original strand, 34966823 - 34967168
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
T |
34966823 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacgaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
34966922 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
||| || |||||||||||| | |||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
34966923 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcataattcaacaattagagtacaattcacaatatatctttttc |
34967022 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |
|
|
T |
34967023 |
acatactatgaacatgcaatttcacgaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact |
34967122 |
T |
 |
Q |
347 |
atga-acaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
| || | || |||||| ||| |||||||||||| || |||||||| |
|
|
T |
34967123 |
aagagaaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaat |
34967168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 71 - 378
Target Start/End: Original strand, 19854135 - 19854443
Alignment:
Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | || |
|
|
T |
19854135 |
caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattaaa |
19854234 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| | || ||||| || ||| ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||| |
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|
T |
19854235 |
catgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcattatttagagcacaactcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttca |
19854334 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaattactca |
369 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| || || | || |||||| ||||||| |
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|
T |
19854335 |
ccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttcaacagctaagagcaaaataatcacttactca |
19854434 |
T |
 |
Q |
370 |
attaagcac |
378 |
Q |
|
|
||||||||| |
|
|
T |
19854435 |
attaagcac |
19854443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 15079944 - 15079634
Alignment:
Q |
102 |
tgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacat |
201 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||| || |
|
|
T |
15079944 |
tgaattatgaatacccaaaccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaatatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaatat |
15079845 |
T |
 |
Q |
202 |
agcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcat |
301 |
Q |
|
|
||||||||||| | | |||||||||||||| | || |||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
15079844 |
agcataattcacccaattgagcataattcacaagttagcactcatacacactttgaacatgcaatttcac-aacaacaattcaattatcctcaacttcat |
15079746 |
T |
 |
Q |
302 |
gcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
|||| || ||||| |||| || || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||||| |
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|
T |
15079745 |
gcataca-acatatcatcctagttagagcacgaatt-taacatctatgaataattaatcaattatccaattaatcccttattcataaaat-aattgaaaa |
15079649 |
T |
 |
Q |
402 |
tttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |
|
|
T |
15079648 |
attacactaaaatga |
15079634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28195362 - 28195101
Alignment:
Q |
69 |
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168 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | | |||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| ||| ||| || |
|
|
T |
28195362 |
accaacaacatctcatttctcaacaataaatcat-aattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaaccacaacaattg |
28195264 |
T |
 |
Q |
169 |
aacatgtt-tcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
267 |
Q |
|
|
| ||| ||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
28195263 |
atcataaaatctcatcacaattcaacaacatcatggcataattcaactaattgagcacatttcatcatataccattttctcatactatgaacatgaaatt |
28195164 |
T |
 |
Q |
268 |
tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagc |
330 |
Q |
|
|
| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
28195163 |
ttactaacaacaattcaattatcaacaacttcatacattcaaacatatcatcataattggagc |
28195101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 186 - 378
Target Start/End: Original strand, 22848110 - 22848301
Alignment:
Q |
186 |
aattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaa |
285 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22848110 |
aattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcacaattcacaatataacattttcacatactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaa |
22848209 |
T |
 |
Q |
286 |
ttatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
22848210 |
ttatcaccaatttcttgcatttaaacatatcatcataattaatgcacgaatttcaacaactatgaacaa-taatcaattattcaactaagcac |
22848301 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 364
Target Start/End: Original strand, 31628245 - 31628541
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
T |
31628245 |
caccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
31628344 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
31628345 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
31628443 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||| || ||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31628444 |
tcaactaacaacaattcaattatcaataacttcatacatctaaacatgtaatcataattcgaatacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt |
31628541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 29160594 - 29160350
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||| || || || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
T |
29160594 |
atcaacccattttcacaaaaccaataacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
29160495 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
||| || |||||||||||| | |||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |||| |
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|
T |
29160494 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcgcaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaactcacaatatatcattttc |
29160395 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatca |
291 |
Q |
|
|
||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29160394 |
acataccatgaacatgcaatttcactaacaacaattcaattatca |
29160350 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22462386 - 22462112
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||| || ||||||| ||| | |||||| || || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
T |
22462386 |
atcaacctattttcacaaaaccaacaacaactacttaattctcatcacaaactcatga-ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
22462288 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
||| || ||||||||||| | |||||| ||| | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
22462287 |
ttaacaacaacaacatcatttaaacatgaatctcatcacaac-caacaacatcatagcacaattcaacaattagagcaaaattcacaatataccactttc |
22462189 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
|
|
|||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
22462188 |
acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa |
22462112 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 337
Target Start/End: Original strand, 23222703 - 23222997
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaaca--acatc |
144 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| | ||| |
|
|
T |
23222703 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttagttcacatcagaaactcatgatttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacatgatatc |
23222802 |
T |
 |
Q |
145 |
acttag--cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcac |
242 |
Q |
|
|
|||| || |||||||||||| | |||||| ||| | |||| | ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |
|
|
T |
23222803 |
tcttataacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaataaacaacaacatagtacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcat |
23222902 |
T |
 |
Q |
243 |
tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||| |||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
23222903 |
tttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataaaaagagcacgaatt |
23222997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Original strand, 18583267 - 18583384
Alignment:
Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcca |
123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
T |
18583267 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagcca |
18583365 |
T |
 |
Q |
124 |
tgaatcattaacaacaaca |
142 |
Q |
|
|
||||| || | |||||||| |
|
|
T |
18583366 |
tgaattatcatcaacaaca |
18583384 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 364
Target Start/End: Original strand, 32898767 - 32899063
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
|||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||| ||| || | ||||||||| ||| | || ||||||| |||| | |
|
|
T |
32898767 |
caccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacttcaatt |
32898866 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
32898867 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaat |
32898965 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32898966 |
tcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt |
32899063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17013793 - 17013598
Alignment:
Q |
184 |
acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattc |
283 |
Q |
|
|
|||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17013793 |
acaaatcaacaagaacatagcacaattcaacaattaaagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacaggcaatttcaccaacaacaattc |
17013694 |
T |
 |
Q |
284 |
aattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
|||| ||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || | || |||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
17013693 |
aattttcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttactcaattaagcac |
17013598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 323
Target Start/End: Original strand, 23221870 - 23222148
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
T |
23221870 |
atcaatccattttcacaaaaccaacaacaacaacttagttcacatcagaaactcatgatttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacaatatctc |
23221969 |
T |
 |
Q |
147 |
ttag--cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactt |
244 |
Q |
|
|
||| || |||||| ||||| | |||||| ||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||| || || |
|
|
T |
23221970 |
ttataacaacaacaatatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacataatacaattcaacaattagagcataattcacaatataccattt |
23222069 |
T |
 |
Q |
245 |
tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
|
|
|| |||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | || ||||| |||||||| |
|
|
T |
23222070 |
tcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactctaacatatcatcataa |
23222148 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 403
Target Start/End: Original strand, 16086022 - 16086329
Alignment:
Q |
96 |
aaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaa |
195 |
Q |
|
|
||||||||||| ||| | |||||| ||||||| || | |||||||| || || || |||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||| |
|
|
T |
16086022 |
aaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcataattcaacaa |
16086121 |
T |
 |
Q |
196 |
caacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaaca |
294 |
Q |
|
|
||||| | |||||||| ||||| |||||| || ||||| ||| | ||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | | |
|
|
T |
16086122 |
caacaaggtataattcaccaatta-agcatattttcaacacatacccatttttcgtactttgaacatgtaattcaacaaacaacaattcaattatccata |
16086220 |
T |
 |
Q |
295 |
acttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatga |
393 |
Q |
|
|
||||||| ||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| || |||||||||| || |||||||||| | |
|
|
T |
16086221 |
acttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagca-cttttcatacaatta |
16086319 |
T |
 |
Q |
394 |
attgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
16086320 |
attgaaaatt |
16086329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Original strand, 4991005 - 4991200
Alignment:
Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcc |
122 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
4991005 |
tcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagcc |
4991103 |
T |
 |
Q |
123 |
atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
| | |||| | ||||||||| || |||| |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
T |
4991104 |
aaaattcatgatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacaccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
4991200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 403
Target Start/End: Original strand, 16106561 - 16106828
Alignment:
Q |
136 |
aacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caaca |
234 |
Q |
|
|
|||||||| || || || |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| || ||||| |
|
|
T |
16106561 |
aacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaggtataattcaccaatta-agcatattttcaaca |
16106659 |
T |
 |
Q |
235 |
tata-tcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacg |
333 |
Q |
|
|
||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||| |
|
|
T |
16106660 |
catactcatttt-tcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcaca |
16106758 |
T |
 |
Q |
334 |
aattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||| | || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
16106759 |
aatttcatcatttacgaacaattaattaattcactcaattaagca-cttttcatacaattaattgaaaatt |
16106828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 403
Target Start/End: Original strand, 18570372 - 18570591
Alignment:
Q |
184 |
acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatt |
282 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||||| || || ||||||| |
|
|
T |
18570372 |
acaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaatttaactaataacaatt |
18570470 |
T |
 |
Q |
283 |
caattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaccta |
381 |
Q |
|
|
|||||||| | ||| |||| ||| | |||| |||||||||| |||||| |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |
|
|
T |
18570471 |
caattatccataacatcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta |
18570570 |
T |
 |
Q |
382 |
ttcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
18570571 |
-tcatacaaataattgaaaatt |
18570591 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 378
Target Start/End: Original strand, 32352110 - 32352335
Alignment:
Q |
154 |
caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
253 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||| |||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||| || || || |||||| |||||||| |||| |||||| |
|
|
T |
32352110 |
caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacataattcaacatttagaacacaattcacaatatatcattttcacatact |
32352209 |
T |
 |
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac- |
352 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |
|
|
T |
32352210 |
atgaacatacaatttcaccataaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaatataccatcatagaaagagcatgaatttcaacaactatgagca |
32352309 |
T |
 |
Q |
353 |
aattaatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
|| |||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
32352310 |
aaataatcacttattcaattaagcac |
32352335 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 358
Target Start/End: Original strand, 18777126 - 18777413
Alignment:
Q |
71 |
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170 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || ||||||||| | ||| |
|
|
T |
18777126 |
caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacattcattgat |
18777225 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
18777226 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt-gaacatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca |
18777324 |
T |
 |
Q |
270 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaa |
358 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| || |||||||| | | |||||||||||||| |
|
|
T |
18777325 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcttttatgaacaattaa |
18777413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 324
Target Start/End: Original strand, 19672275 - 19672519
Alignment:
Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| || ||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| | || |
|
|
T |
19672275 |
caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgatttatgaacaccgaagttatgaatcatcaacaacaatatctct--------acaacatcaattaaa |
19672366 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| | || | ||||||||||| || |||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |
|
|
T |
19672367 |
catgat-ctcatcgcaattcaacaataagatagcacaattcaacatttggagcacaattcacaatatatcattttcacatattatgaacatgcaatttca |
19672465 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataat |
324 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
19672466 |
ttaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataat |
19672519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18823709 - 18823515
Alignment:
Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcca |
123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
T |
18823709 |
tcatcaaaatcaaacttcttctttatcaagccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagcca |
18823611 |
T |
 |
Q |
124 |
tgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
|| || || | ||||||||| || || || |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
T |
18823610 |
tggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccgcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
18823515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 404
Target Start/End: Original strand, 18432626 - 18432955
Alignment:
Q |
74 |
caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacat |
173 |
Q |
|
|
||||| ||||||| ||| ||| ||| ||| ||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || ||||| |||||| ||| ||| |
|
|
T |
18432626 |
caacatctcatttttcaacaataaaccattaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataacatatcaacaacatcatcaattgatcat |
18432725 |
T |
 |
Q |
174 |
gtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacc |
272 |
Q |
|
|
| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| | | ||| ||||||||| |||||| |||| | | |
|
|
T |
18432726 |
gaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatacacccatttttcatacttttaacatgtaattcaatc |
18432824 |
T |
 |
Q |
273 |
aacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaat |
371 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||| || |||| |
|
|
T |
18432825 |
aacaacaattcaagtattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaaataatcaattcacccaat |
18432924 |
T |
 |
Q |
372 |
taagcacctattcatacaatgaattgaaaattt |
404 |
Q |
|
|
||||| || |||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
18432925 |
taagc-tcttttcatacaat-aattgaaaattt |
18432955 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18839564 - 18839419
Alignment:
Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcca |
123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
T |
18839564 |
tcatcaaaatcaaacttcttctttttcaactcattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagcca |
18839466 |
T |
 |
Q |
124 |
tgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
|| || || | ||||||||| || || || |||||||||||| |||| |
|
|
T |
18839465 |
tggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa |
18839419 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
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Q |
317 |
atcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
25654350 |
atcataattagagcacgaattttaacaactctgaacaattaatcacctactcaattaagcacttaatcatacaat-aattgaaaaattacactaaa |
25654444 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
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Target Start/End: Complemental strand, 35009677 - 35009456
Alignment:
Q |
115 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
214 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
T |
35009677 |
cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcacc |
35009578 |
T |
 |
Q |
215 |
aatttgagcataa--ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcataca |
312 |
Q |
|
|
|| ||||||| || ||||| | | || ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || || |
|
|
T |
35009577 |
aa-ttgagcacaattttcaaaacttcacatttttacata-attgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaact |
35009481 |
T |
 |
Q |
313 |
taacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||| | || ||||||||||| |
|
|
T |
35009480 |
taacatcacagttagagcacgaatt |
35009456 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
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Target Start/End: Original strand, 19629314 - 19629458
Alignment:
Q |
73 |
acaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa-c |
171 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| | || | |
|
|
T |
19629314 |
acaacaactcatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaatc |
19629411 |
T |
 |
Q |
172 |
atgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
|| |||| || ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
T |
19629412 |
ttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt |
19629458 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac |
166 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||| ||| |
|
|
T |
22440911 |
caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaat |
22441009 |
T |
 |
Q |
167 |
tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaa |
265 |
Q |
|
|
||| |||| |||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||| | ||| ||||||||| |||||| || |
|
|
T |
22441010 |
tgatcatgaaacttatcacaaatcatgaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaactcatacccatttttcatacttttaacatgtaa |
22441108 |
T |
 |
Q |
266 |
tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt- |
364 |
Q |
|
|
|| || | ||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||| ||||||| | || ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22441109 |
ttcaccccatcacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattc |
22441208 |
T |
 |
Q |
365 |
actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
22441209 |
actcaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
22441246 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #45
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Q |
69 |
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168 |
Q |
|
|
||||||| || || ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| || |
|
|
T |
32277039 |
accaacagcatcttatttctcaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg |
32276942 |
T |
 |
Q |
169 |
-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
||| || |||| || ||||||||||| ||||| || |||||| ||||| |
|
|
T |
32276941 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaataacatgtcacaattcatcaatt |
32276891 |
T |
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255 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-a |
353 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | | |
|
|
T |
31467680 |
tgaacatgcaatttcattaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataataagagcatgaatttcaacaactaagagcaa |
31467581 |
T |
 |
Q |
354 |
attaatcaattactcaattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
| |||||| ||| |||||||||||| || |||||||| |
|
|
T |
31467580 |
aataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaat |
31467543 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| | |||||| || ||| | || || |
|
|
T |
35015447 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
35015348 |
T |
 |
Q |
156 |
acaaca |
161 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
35015347 |
acaaca |
35015342 |
T |
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282 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||| | |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
21931296 |
acaaatcaacaacaacataacacaactcatcaatttaagcataattcacaatatacccatttatacatatcatgaacatgcaatttcatcaacaacaatt |
21931395 |
T |
 |
Q |
283 |
caattatcaacaacttcatgcattcatacataacatc |
319 |
Q |
|
|
||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||| |
|
|
T |
21931396 |
caattatcatcaatttcatatattcaaacatatcatc |
21931432 |
T |
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Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
23153610 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
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T |
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Q |
|
|
|||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| || |
|
|
T |
16231859 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca |
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T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
16231958 |
acaacatcaa |
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T |
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Q |
|
|
|||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| || |
|
|
T |
18087112 |
atttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaatt-atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca |
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T |
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Q |
156 |
acaacatcaa |
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Q |
|
|
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|
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19983581 - 19983476
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||| | |||||| || ||| | || || |
|
|
T |
19983581 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
19983482 |
T |
 |
Q |
156 |
acaaca |
161 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
19983481 |
acaaca |
19983476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25744483 - 25744390
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca |
161 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| |
|
|
T |
25744483 |
caccaacaacatctcatttctctacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca |
25744390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1657847 - 1657765
Alignment:
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
T |
1657847 |
ttgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatt |
1657765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 253 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14626218 - 14626152
Alignment:
Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatca |
320 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
14626218 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
14626152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 337
Target Start/End: Original strand, 15862635 - 15862717
Alignment:
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
T |
15862635 |
ttgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatt |
15862717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16300230 - 16300116
Alignment:
Q |
97 |
aatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaa |
195 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| || ||| || |||| || ||||||||| | |
|
|
T |
16300230 |
aatcatgatatatgaacacccaagccataaatcatatacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacca |
16300131 |
T |
 |
Q |
196 |
caacatagcataatt |
210 |
Q |
|
|
|||||| ||||||| |
|
|
T |
16300130 |
caacatgtcataatt |
16300116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 56 - 416
Target Start/End: Original strand, 20177140 - 20177499
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |
|
|
T |
20177140 |
atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca |
20177239 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
255 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20177240 |
acaacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
20177339 |
T |
 |
Q |
256 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
355 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20177340 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
20177439 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
20177440 |
taatcaattactcaattaagcacttaaacatacaat-aattgaaaaattacactaaaatga |
20177499 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 154 - 413
Target Start/End: Original strand, 16645975 - 16646233
Alignment:
Q |
154 |
caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
253 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16645975 |
caacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagaataattcaacatatatcactttctcatact |
16646074 |
T |
 |
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
353 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16646075 |
ttgaacatgaaattttaccaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
16646174 |
T |
 |
Q |
354 |
attaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16646175 |
attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaa |
16646233 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 154 - 413
Target Start/End: Original strand, 16656701 - 16656959
Alignment:
Q |
154 |
caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
253 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16656701 |
caacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
16656800 |
T |
 |
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
353 |
Q |
|
|
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16656801 |
ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
16656900 |
T |
 |
Q |
354 |
attaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
16656901 |
attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaattaacactaaaa |
16656959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 49 - 412
Target Start/End: Original strand, 17608886 - 17609248
Alignment:
Q |
49 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
148 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
17608886 |
tcaacccattttccaaaaccaacaacaacaactcaattctcataatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
17608985 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
| || |||||||| ||| |||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
17608986 |
aacaacaacaacaacaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcat |
17609085 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
17609086 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaactat |
17609185 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
|| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
17609186 |
gatcaactaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaat-aattgaaaaattacactaaa |
17609248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 49 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 37234149 - 37233787
Alignment:
Q |
49 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
148 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || | |||| |||||| || ||| || |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
37234149 |
tcaacccattttacaaaaccaaccacaaaaactcaattttcatcatcaaatcatgatttatggacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcactt |
37234050 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37234049 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaaccacaacatagcataattcaacatttagagcataattcaacatatatcactttcat |
37233950 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
37233949 |
atactttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactaaagcacgaattctaacaactat |
37233850 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
|||||||| ||| |||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
37233849 |
taacaattactcacttactcaattaagcacttaataatacaat-aattgaaaaattacactaaa |
37233787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 57 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 51627945 - 51627591
Alignment:
Q |
57 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa |
156 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| ||| |
|
|
T |
51627945 |
ttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacagcaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacatcatcacttagcaacaa |
51627846 |
T |
 |
Q |
157 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg |
256 |
Q |
|
|
||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
T |
51627845 |
caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaccatatcataattcaaccaattgaacatatttcaacatataccattttctcatactttg |
51627746 |
T |
 |
Q |
257 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaatt |
356 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |
|
|
T |
51627745 |
aacatgaagtttcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcatcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaaat |
51627646 |
T |
 |
Q |
357 |
aatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
51627645 |
aatcaattactcaattaagcacttattcatgcaa-caattg-aaatttacactaaaa |
51627591 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 49 - 412
Target Start/End: Original strand, 19603055 - 19603417
Alignment:
Q |
49 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
148 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||| || || ||| ||||||||| |
|
|
T |
19603055 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattattcacacccaagtcatgaattatcaataaccacatcactt |
19603154 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| |||||||| | | | | ||||||||| ||||||| || || ||| || ||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
19603155 |
agcagcaactacatcaattgaacatgaatttcagcataattcaacatcaacatatcacaagatgacatttagagcataatatgacatatatcattttcat |
19603254 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
19603255 |
atactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattat |
19603354 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
19603355 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaat-aattgaaaatttgcactaaa |
19603417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 57 - 378
Target Start/End: Original strand, 21194980 - 21195301
Alignment:
Q |
57 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa |
156 |
Q |
|
|
||||| |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||| |
|
|
T |
21194980 |
ttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaa |
21195079 |
T |
 |
Q |
157 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg |
256 |
Q |
|
|
|||||| || | |||||| |||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || |
|
|
T |
21195080 |
caacattaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttcacatactatg |
21195179 |
T |
 |
Q |
257 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaatt |
356 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
21195180 |
aacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattttaacaactatgaacaatt |
21195279 |
T |
 |
Q |
357 |
aatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
21195280 |
aatcacttattcaattaagcac |
21195301 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 83 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 22143616 - 22143284
Alignment:
Q |
83 |
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182 |
Q |
|
|
|||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |
|
|
T |
22143616 |
atttctcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattgagcatggttctcat |
22143517 |
T |
 |
Q |
183 |
tacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatt |
282 |
Q |
|
|
| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || || || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
T |
22143516 |
cataattcaacaacaacatagcataattcaaccatttgagcataattcataagttaacatttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaatt |
22143417 |
T |
 |
Q |
283 |
caattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctat |
382 |
Q |
|
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|
T |
22143416 |
caattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaagcacttat |
22143317 |
T |
 |
Q |
383 |
tcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
22143316 |
tcatacaat-aattgaaaaattacactaaaatga |
22143284 |
T |
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Target: chr1; HSP #10
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Target Start/End: Complemental strand, 36356557 - 36356219
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T |
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caacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccataaatcatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgaacat |
36356458 |
T |
 |
Q |
174 |
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273 |
Q |
|
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| ||| | | || |||||| ||||||| || |||| ||| || ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||| |
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|
T |
36356457 |
gaatctcagcataaatcaacatcaacatatcacaatttgacatttagagcataatatgacatatatcattttcatatactttgatccttcaatttcacca |
36356358 |
T |
 |
Q |
274 |
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373 |
Q |
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|
T |
36356357 |
acaacatttcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattactcaatta |
36356258 |
T |
 |
Q |
374 |
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413 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
36356257 |
agcacttattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaa |
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T |
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148 |
Q |
|
|
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|
|
T |
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tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaacttatttctcatcaacaa-tcgtgaactatgcacacccaagccatgaattaacaacagcaacatcactt |
38033864 |
T |
 |
Q |
149 |
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248 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||| |||||||| ||| | | ||||||||| ||| ||| || || | ||| || ||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
T |
38033863 |
agcagcaatcacatcaattgaacatgaatctcaacataattcaacatcaatatatcacaacttgacatttagagcataatataacatatatcattttcat |
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T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
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T |
38033763 |
atactttgatcattcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaattctaataatcat |
38033664 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
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||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38033663 |
taacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaa |
38033600 |
T |
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Target: chr1; HSP #12
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Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||| |
|
|
T |
27674755 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaa-aaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcactt |
27674853 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
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| || |||| ||| ||| |||||||| ||| | | |||||||| ||||||| || || | ||| || |||||| || |||||||||| || | |
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|
T |
27674854 |
aacaacaactacaccaattgaacatgaatctcagcataattcaacctcaacatatcacaaattgacatttagagcatgatatgacatatatcatttccat |
27674953 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |
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|
T |
27674954 |
atactttgatcattcaatttcaccaataacaaatcaattatcaccaatttcttacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacagtcat |
27675053 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27675054 |
gaacaaataatcaattactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaa |
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T |
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148 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||| |
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|
T |
20955728 |
tcaaccccttttacaaagtcacccacaacaactcatttcacaccaacaattcacgaattattcacaccgaagccatgaattatcaataacaacatcactt |
20955629 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| |||||||| | | | | ||||||||| ||||||| || || ||| || ||||||||| |||||||||| | || |
|
|
T |
20955628 |
agcagcaactacatcaattgaacatgaatttcagcataattcaacatcaacatatcacaagatgacatttagagcataatatgacatatatcattctcat |
20955529 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
T |
20955528 |
atactttgatcattcaatttcaccaacaacagatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataacatcataattggagcacaaattctaacaattat |
20955429 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
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|
|
T |
20955428 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatttgcactaaa |
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T |
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Target: chr1; HSP #14
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|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || | || |||||||| |
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T |
22829712 |
caacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaatagaaaaatcactta |
22829613 |
T |
 |
Q |
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249 |
Q |
|
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|
T |
22829612 |
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22829514 |
T |
 |
Q |
250 |
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349 |
Q |
|
|
| |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22829513 |
tgctttgaccattcaatttcactaacaacaaatcaattatcaccagtttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatg |
22829414 |
T |
 |
Q |
350 |
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412 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| |
|
|
T |
22829413 |
aataattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaaattgcactaaa |
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Target: chr1; HSP #15
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|
|||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |
|
|
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atttcacaaaaccgccaacaacaattcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcaacatcaacaacatcacttagcaaca |
13377023 |
T |
 |
Q |
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255 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| |||| | | || | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
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acaacatcaattgagcatgactttcaccataattcaacaacaacataacataatt-------------------caacatataccacttcttcatacttt |
13376942 |
T |
 |
Q |
256 |
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354 |
Q |
|
|
||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| | || ||||||||| |
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T |
13376941 |
gaacatgaaatttcaacgacaacaatttaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacga-ttctcatcatctatgaacaa |
13376843 |
T |
 |
Q |
355 |
ttaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
13376842 |
ttaatcaattactaaattaagcacttaatcatacaat-aattgaaaaattacactaaaatga |
13376782 |
T |
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Target: chr1; HSP #16
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|
||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |
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T |
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T |
 |
Q |
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tagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct |
247 |
Q |
|
|
|| || |||||||||||| | |||||| |||| | | ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||| |
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|
T |
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taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataagacatttcaacaatttaagcacaattcacaatataacattttca |
8538001 |
T |
 |
Q |
248 |
catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatta |
347 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |
|
|
T |
8538000 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaacca |
8537901 |
T |
 |
Q |
348 |
tgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
||||| | |||||||||| |||| ||||||| || |||| |||| |
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|
T |
8537900 |
tgaacgaataatcaattattcaactaagcacttaatcatgcaat |
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|
|
||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |
|
|
T |
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atcaacccatttttacaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattcct |
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T |
 |
Q |
148 |
tagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct |
247 |
Q |
|
|
|| || |||||||||||| | |||||| |||| | | ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||| |
|
|
T |
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taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataagacatttcaacaatttaagcacaattcacaatataacattttca |
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T |
 |
Q |
248 |
catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatta |
347 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |
|
|
T |
8603239 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaacca |
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T |
 |
Q |
348 |
tgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
||||| | |||||||||| |||| ||||||| || |||| |||| |
|
|
T |
8603139 |
tgaacgaataatcaattattcaactaagcacttaatcatgcaat |
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|
|
||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| || || ||| |||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||||| || || |
|
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acccattttcacaaaatcaaccacaacaacttatttcacatcaccaactcatgatttatgaacatttacgctatgaatcatcaacaacaacatctctcag |
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T |
 |
Q |
151 |
cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcat |
250 |
Q |
|
|
|| ||||||| |||| | |||||| |||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| |||||||| |||| ||| |
|
|
T |
52400691 |
caacaacaacgtcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttatagcacaattcacaatatatcattttcacat |
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T |
 |
Q |
251 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga |
350 |
Q |
|
|
||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |
|
|
T |
52400791 |
actatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaactatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaaagtcaacaactatga |
52400890 |
T |
 |
Q |
351 |
acaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||| |||||||||||| || |||| |||| |
|
|
T |
52400891 |
acaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaat |
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|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
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T |
 |
Q |
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ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
||| | |||||||||||| | ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |
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T |
40436460 |
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40436361 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
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|
T |
40436360 |
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|
T |
49997548 |
caacaacaacttatttctcatcaacaac-catgatttatgaacaccaaatccatgaatgatcaacaacaatatctcttaagcaacaacaacatcagttaa |
49997450 |
T |
 |
Q |
170 |
acatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
|
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||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| | |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| |
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|
T |
49997449 |
acatgattctcaccttaattcaacaacaacatagcacaattcaaaatttagagtacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttc |
49997350 |
T |
 |
Q |
270 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactca |
369 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | | |||| |||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||| |
|
|
T |
49997349 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcaccataactagggcacaaatttcaacaatcatgaacaaataatcacttattca |
49997250 |
T |
 |
Q |
370 |
attaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
||||||||| || |||| |||| |
|
|
T |
49997249 |
attaagcacttaatcatgcaat |
49997228 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5768436 - 5768128
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170 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| || || || |||| | |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | || |
|
|
T |
5768436 |
caacaacaacttatttcacatcacaaactcataatttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
5768337 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| |||| | |||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| |
|
|
T |
5768336 |
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5768237 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaattactca |
369 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || | || |||||| ||| ||| |
|
|
T |
5768236 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattca |
5768137 |
T |
 |
Q |
370 |
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378 |
Q |
|
|
||||||||| |
|
|
T |
5768136 |
attaagcac |
5768128 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
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Target Start/End: Original strand, 33397308 - 33397598
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Q |
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146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || |||| |||||| ||||| || || || |||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
T |
33397308 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaaccacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacacaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
33397407 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
||| || |||||| ||||| | |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||| |
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|
T |
33397408 |
ttaacaacaacaagatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatattattttc |
33397507 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||| | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
33397508 |
acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaactcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
33397598 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41229221 - 41229096
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
41229221 |
attttaccaaactaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaaca |
41229122 |
T |
 |
Q |
156 |
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181 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
T |
41229121 |
acaacatcaattgaacatgattctta |
41229096 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 401
Target Start/End: Original strand, 21718206 - 21718537
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
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|
T |
21718206 |
caccaacaacatctcatttctcaagaacaac-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
21718304 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattc-aacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
21718305 |
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21718403 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| | |
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|
T |
21718404 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaattaatcaattca |
21718503 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
| |||||||||| || |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
21718504 |
cccaattaagca-cttttcatacaat-aattgaaaa |
21718537 |
T |
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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
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Target Start/End: Complemental strand, 27330001 - 27329747
Alignment:
Q |
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191 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |||| |||| |||||| | |
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|
T |
27330001 |
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27329902 |
T |
 |
Q |
192 |
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290 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27329901 |
acaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcacataacccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatc |
27329803 |
T |
 |
Q |
291 |
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347 |
Q |
|
|
| |||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27329802 |
-ataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaatta |
27329747 |
T |
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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 402
Target Start/End: Original strand, 35054736 - 35055067
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Q |
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
||||||||||| ||| | || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |
|
|
T |
35054736 |
caacaacaacttattccacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgat |
35054835 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
|
|
|||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
35054836 |
catgaaacttatcacagttcatcaactacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca |
35054934 |
T |
 |
Q |
270 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
368 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || | |
|
|
T |
35054935 |
actaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaattaaatcatttatgaacaattaaccaattcaccc |
35055034 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaat |
402 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
35055035 |
aattaagca-cttttcatacaaataattgaaaat |
35055067 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 25093922 - 25094105
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Q |
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253 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||| ||| | |||| |||||||||||||| || |||||||||||| || || |||||| |||||||| ||||||||| | |
|
|
T |
25093922 |
caacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaattagaacacaattcacaatatatcattttctcatatt |
25094021 |
T |
 |
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
25094022 |
atggacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
25094105 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 9784245 - 9783999
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Q |
154 |
caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatac |
252 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||| |
|
|
T |
9784245 |
caacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaa---agcataattcaccaatta-agcatattttcaacatataccaacttctcatac |
9784150 |
T |
 |
Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac |
352 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
T |
9784149 |
tttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatgaac |
9784050 |
T |
 |
Q |
353 |
aattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||| ||||||| || |||||||||| || ||||||| | ||||||||||| |
|
|
T |
9784049 |
aatttatcaattcacccaattaagca-cttttcataccaataattgaaaatt |
9783999 |
T |
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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35522588 - 35522439
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Q |
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
T |
35522588 |
caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacgtatcaacaacaacatcaatt |
35522490 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
|| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
T |
35522489 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatt |
35522439 |
T |
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Q |
69 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||| || | |
|
|
T |
22403379 |
accaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgaaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacagtt |
22403281 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaa |
265 |
Q |
|
|
| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||| || |
|
|
T |
22403280 |
aatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaa |
22403182 |
T |
 |
Q |
266 |
tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt- |
364 |
Q |
|
|
|| || |||| ||||| |||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22403181 |
ttcaactaaca-caatttaattattcataacttcatacatctagacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattc |
22403083 |
T |
 |
Q |
365 |
actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
22403082 |
acccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
22403045 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
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Query Start/End: Original strand, 273 - 401
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aacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaat |
371 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || |||| |
|
|
T |
35522417 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaat |
35522318 |
T |
 |
Q |
372 |
taagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
||||| ||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
35522317 |
taagc-ccttttcatacaaataattgaaaa |
35522289 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
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Target Start/End: Original strand, 41212046 - 41212344
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Q |
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac- |
166 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| |||| |
|
|
T |
41212046 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaaca |
41212145 |
T |
 |
Q |
167 |
--tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaa |
264 |
Q |
|
|
||| |||| | || |||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||||||| || ||| ||| | ||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
41212146 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacagtgcataattc-actaattgagcatatttttacacatacccatttttcatactttgaacataca |
41212244 |
T |
 |
Q |
265 |
atttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
|| || ||||||||||||||||| | |||||||| | | | ||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41212245 |
gttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacctctaaacaggtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt |
41212344 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
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cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
214 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| | |||||||| ||| || | || || |||||||||||||||| ||||| |||||| | |
|
|
T |
20445704 |
cccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcacc |
20445803 |
T |
 |
Q |
215 |
aatttgagcataatt--caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcataca |
312 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||| |
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|
T |
20445804 |
aatt-gagcacaattttcaccacttatcatttgttcctactt-gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaaca |
20445900 |
T |
 |
Q |
313 |
taacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
20445901 |
tatcatcacaattggagcacgaatt |
20445925 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 364
Target Start/End: Original strand, 49967628 - 49967923
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||| | || |||| |||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||||||| | |
|
|
T |
49967628 |
caccaacaacatctcattcctcaacaacaac-catgaatcatgcaaaccgaagcaatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt |
49967726 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| | || |||||||| |||||||| | |||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | ||| | ||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
49967727 |
gatcatgaaacgtatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttttataatttgaacatgtaat |
49967825 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||||||| |
|
|
T |
49967826 |
tcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatgatttttgaacaattaatcaatt |
49967923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21650329 - 21650167
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || | || || |
|
|
T |
21650329 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcaacaaca |
21650231 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaa-catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| | || |||| || |||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
T |
21650230 |
acaacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
21650167 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 76606 - 76480
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Q |
105 |
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204 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | || | |||||| ||||| | |||||| ||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
T |
76606 |
attatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcataataacaacaatatcaattaaacatgaatctcaccgcatttcaacaacaacatagc |
76507 |
T |
 |
Q |
205 |
ataattcaacaatttgagcataattca |
231 |
Q |
|
|
| |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
76506 |
acaattcaacaattagagcacaattca |
76480 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
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Query Start/End: Original strand, 62 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9784377 - 9784237
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Q |
62 |
caaaatcaccaacaacaactcattt-ctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaac |
160 |
Q |
|
|
||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || ||||||| |
|
|
T |
9784377 |
caaaaacatcaacaacaactcattttctcaccttcaaatcatgaatcatgcaagcccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaac |
9784278 |
T |
 |
Q |
161 |
atcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacat |
201 |
Q |
|
|
||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
9784277 |
atcaattgatcttgaaacttatcacaattcaacaacaacat |
9784237 |
T |
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Target: chr1; HSP #38
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Q |
115 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
214 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| | |||||||| ||| || | || || |||||||||||||||| ||||| |||||| | |
|
|
T |
20531469 |
cccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcacc |
20531568 |
T |
 |
Q |
215 |
aatttgagcataatt--caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcataca |
312 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||| |
|
|
T |
20531569 |
aatt-gagcacaattttcaccacttatcatttgttcctactt-gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaaca |
20531665 |
T |
 |
Q |
313 |
taacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|| |||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
20531666 |
tattatcacatttggagcacgaatt |
20531690 |
T |
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Target: chr1; HSP #39
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Q |
43 |
tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaac |
141 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||| | |||||| |
|
|
T |
22366970 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaat |
22367069 |
T |
 |
Q |
142 |
atcacttagcagcaacaaca |
161 |
Q |
|
|
|| ||| | || |||||||| |
|
|
T |
22367070 |
atgactaaacaacaacaaca |
22367089 |
T |
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Target: chr1; HSP #40
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Target Start/End: Complemental strand, 37844549 - 37844467
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Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
T |
37844549 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatt |
37844467 |
T |
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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
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Target Start/End: Complemental strand, 15861728 - 15861630
Alignment:
Q |
43 |
tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaa |
140 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||| | |||||| |
|
|
T |
15861728 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgcatcatcatcaacaa |
15861630 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 165
Target Start/End: Original strand, 17148534 - 17148642
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| || |
|
|
T |
17148534 |
atttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaatt-atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca |
17148632 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
17148633 |
acaacatcaa |
17148642 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 337
Target Start/End: Original strand, 41394385 - 41394468
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||| || |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
41394385 |
tttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaattt-atgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
41394468 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatca |
320 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
2116418 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
2116484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
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Q |
207 |
aattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactt-tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcat |
301 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||| |||||| ||||| | || || |||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
T |
20194140 |
aattcaacaattagagcacaattcacaatatacccattatcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcat |
20194235 |
T |
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Target: chr1; HSP #46
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Target Start/End: Original strand, 20913195 - 20913276
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Q |
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tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
20913195 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
20913276 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
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Query Start/End: Original strand, 255 - 337
Target Start/End: Original strand, 20931510 - 20931591
Alignment:
Q |
255 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
20931510 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
20931591 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
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Target Start/End: Original strand, 13377485 - 13377850
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |
|
|
T |
13377485 |
atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattac |
13377584 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13377585 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagtataattcaacatatatcactttc |
13377684 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13377685 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
13377784 |
T |
 |
Q |
347 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13377785 |
atgaacaattaatcgattactcaatgaatcacttattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaa |
13377850 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 56 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 17224220 - 17223864
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |
|
|
T |
17224220 |
attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcacttagcaaca |
17224121 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
255 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17224120 |
acaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagtataattcaacatatatcactttctcatacttt |
17224021 |
T |
 |
Q |
256 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
355 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| |
|
|
T |
17224020 |
gaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaat |
17223921 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|||| | |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
17223920 |
taattatttactcaattaagcacttaatcataaaat-aattgaaaaattacactaaaa |
17223864 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 49 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 16915217 - 16914855
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Q |
49 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
148 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |
|
|
T |
16915217 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcttcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatgactt |
16915118 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
T |
16915117 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacgtttagagcataattcaacatataacactttcac |
16915018 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |
|
|
T |
16915017 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat |
16914918 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
16914917 |
gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaat-aattgaaaagttacactaaa |
16914855 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 49 - 412
Target Start/End: Original strand, 48356602 - 48356964
Alignment:
Q |
49 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
148 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
48356602 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
48356701 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| |||||||| ||| | | ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
T |
48356702 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac |
48356801 |
T |
 |
Q |
249 |
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348 |
Q |
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T |
48356802 |
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48356901 |
T |
 |
Q |
349 |
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412 |
Q |
|
|
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|
|
T |
48356902 |
gaacaattaatcacttactcaattaagcatttaatcatacaacgaa-tgaaaaattacactaaa |
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T |
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T |
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268 |
Q |
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| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
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T |
49047843 |
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T |
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Q |
269 |
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368 |
Q |
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T |
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T |
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Q |
369 |
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387 |
Q |
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|||||||||| |||||||| |
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T |
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T |
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Target: chr7; HSP #6
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T |
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T |
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Q |
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223 |
Q |
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T |
14272100 |
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T |
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Q |
224 |
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323 |
Q |
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||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |
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T |
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T |
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Q |
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416 |
Q |
|
|
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T |
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T |
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Target: chr7; HSP #7
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T |
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T |
 |
Q |
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248 |
Q |
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T |
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T |
 |
Q |
249 |
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348 |
Q |
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T |
9839037 |
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9839136 |
T |
 |
Q |
349 |
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412 |
Q |
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9839137 |
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T |
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T |
 |
Q |
149 |
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247 |
Q |
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T |
9611365 |
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T |
 |
Q |
248 |
catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatta |
347 |
Q |
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T |
9611465 |
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9611564 |
T |
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Q |
348 |
tgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
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|
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T |
9611565 |
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Target: chr7; HSP #9
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T |
13274765 |
accaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg |
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T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
Q |
|
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| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13274865 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata----------taccactttctcatactttgaacatgaaattt |
13274954 |
T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
368 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13274955 |
tactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
13275054 |
T |
 |
Q |
369 |
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390 |
Q |
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|
|||||||||| ||||||||||| |
|
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T |
13275055 |
aattaagcacttattcatacaa |
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T |
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Q |
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270 |
Q |
|
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T |
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T |
 |
Q |
271 |
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370 |
Q |
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T |
20583621 |
tcaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcttcataattagggcaaaaatttcaacaactatgaacaaataatcacttattcaa |
20583522 |
T |
 |
Q |
371 |
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391 |
Q |
|
|
||| |||| || |||| |||| |
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|
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T |
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246 |
Q |
|
|
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|
T |
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T |
 |
Q |
247 |
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346 |
Q |
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T |
38424375 |
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38424474 |
T |
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Q |
347 |
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391 |
Q |
|
|
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|
T |
38424475 |
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|
|
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|
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T |
 |
Q |
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246 |
Q |
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|
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T |
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T |
 |
Q |
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tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
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Q |
|
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T |
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acatacaatgaacatgcaatttctccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcatattagga-cacgaatttcaacaact |
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T |
 |
Q |
347 |
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|
|
|||||||| |||||| ||| |||||||||||| |
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|
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4484982 |
atgaacaaataatcacttattcaattaagcac |
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|
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
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 |
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catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |
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|
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T |
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|
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T |
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actaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattacaca |
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Q |
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401 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| || ||||||||| |
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|
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catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
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|
|
|||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |
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T |
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|
|
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|
T |
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 |
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attaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
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|
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Q |
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T |
12248391 |
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12248292 |
T |
 |
Q |
168 |
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266 |
Q |
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T |
12248291 |
gatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatatactattttctcatactttaaacatgaaat |
12248192 |
T |
 |
Q |
267 |
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366 |
Q |
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T |
12248191 |
tcaactaataacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaagtaatcaattat |
12248092 |
T |
 |
Q |
367 |
tcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
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T |
12248091 |
ccaattaagcacttattcatacaat-aattgaaaa |
12248058 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
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Target Start/End: Original strand, 31501126 - 31501473
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143 |
Q |
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T |
31501126 |
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31501225 |
T |
 |
Q |
144 |
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243 |
Q |
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T |
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ctcataacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcattattcacaatatatcatt |
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T |
 |
Q |
244 |
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343 |
Q |
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T |
31501326 |
ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaatttcatgtatttaaacatatcttcataattagatcactaatttcatca |
31501425 |
T |
 |
Q |
344 |
attatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
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T |
31501426 |
actatgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 391
Target Start/End: Original strand, 14935319 - 14935660
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Q |
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146 |
Q |
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T |
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14935418 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
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T |
14935419 |
ttaaca---acaacatcatttaaaaatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttc |
14935515 |
T |
 |
Q |
247 |
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346 |
Q |
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T |
14935516 |
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14935615 |
T |
 |
Q |
347 |
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391 |
Q |
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T |
14935616 |
gtgaccaaagattcacttattcaattaagcacttaatcatgcaat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 391
Target Start/End: Original strand, 15362912 - 15363253
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Q |
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146 |
Q |
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T |
15362912 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactgatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcttcaacaacaatatctc |
15363011 |
T |
 |
Q |
147 |
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246 |
Q |
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T |
15363012 |
ttaaca---acaacatcatttaaaaatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttc |
15363108 |
T |
 |
Q |
247 |
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346 |
Q |
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T |
15363109 |
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15363208 |
T |
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Q |
347 |
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391 |
Q |
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|
T |
15363209 |
gtgaccaaagattcacttattcaattaagcacttaatcatgcaat |
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T |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
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Target Start/End: Complemental strand, 16570287 - 16569943
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Q |
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156 |
Q |
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T |
16570287 |
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16570188 |
T |
 |
Q |
157 |
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255 |
Q |
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T |
16570187 |
caacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctcatacttt |
16570088 |
T |
 |
Q |
256 |
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355 |
Q |
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T |
16570087 |
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16569988 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
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T |
16569987 |
taatcaattatccaattaagcacttattcatacaat-aattgaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
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Target Start/End: Original strand, 16595375 - 16595719
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Q |
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156 |
Q |
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T |
16595375 |
ttttaccaaaacacccacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaa |
16595474 |
T |
 |
Q |
157 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatacttt |
255 |
Q |
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T |
16595475 |
caacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctcatacttt |
16595574 |
T |
 |
Q |
256 |
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355 |
Q |
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T |
16595575 |
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16595674 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
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|||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
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T |
16595675 |
taatcaattatccaattaagcacttattcatacaat-aattgaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
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Target Start/End: Complemental strand, 34241477 - 34241134
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148 |
Q |
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|
||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||| |
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T |
34241477 |
tcaaccctttttacaaaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatgtcactt |
34241378 |
T |
 |
Q |
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248 |
Q |
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| || |||||||||||| | |||||| |||| | | ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||| | |
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T |
34241377 |
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34241297 |
T |
 |
Q |
249 |
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348 |
Q |
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T |
34241296 |
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34241197 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
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T |
34241196 |
gaacaattaatcacttactcaattaatcacttaatcatacaa-caaatgaaaaattacactaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
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Target Start/End: Original strand, 16919601 - 16919776
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Q |
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|||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
T |
16919601 |
aacaacaatattacttagcaacaacaacatcaattaaacacgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaa |
16919700 |
T |
 |
Q |
233 |
catatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattca |
308 |
Q |
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|
T |
16919701 |
catatatcactttctcatattttgaacatgaaatttcaccaataacaattcgattatcaacaatttcatgcattca |
16919776 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 333
Target Start/End: Original strand, 4446168 - 4446454
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Q |
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Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| || || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||| |
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T |
4446168 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcacatcatcaattcatgatttatgaacacccaagccatgaatcattcaacatcagcatct |
4446267 |
T |
 |
Q |
146 |
cttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt |
245 |
Q |
|
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T |
4446268 |
cttatcaacaacaacatcaatt-aacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattggagcacaatacataatatatcatttt |
4446366 |
T |
 |
Q |
246 |
ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacg |
333 |
Q |
|
|
| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | || ||||| |||||||| | ||||||| |
|
|
T |
4446367 |
cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtgtgcaaacatatcatcataactagagcacg |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 71 - 378
Target Start/End: Original strand, 28390292 - 28390600
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170 |
Q |
|
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T |
28390292 |
caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
28390391 |
T |
 |
Q |
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catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
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|
T |
28390392 |
catgattatcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttca |
28390491 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaattactca |
369 |
Q |
|
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T |
28390492 |
ccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttgaacaactaagagcaaaataatcacttactca |
28390591 |
T |
 |
Q |
370 |
attaagcac |
378 |
Q |
|
|
||||||||| |
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|
T |
28390592 |
attaagcac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 401
Target Start/End: Original strand, 11287394 - 11287726
Alignment:
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Q |
|
|
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|
T |
11287394 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaact |
11287493 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
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T |
11287494 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
11287592 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
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T |
11287593 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaacataatcagagcactaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
11287692 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
| ||||||| || || |||||||||| ||||||||| |
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|
T |
11287693 |
cccaattaaaca-cttttcatacaat-aattgaaaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 71 - 412
Target Start/End: Original strand, 15358777 - 15359117
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Q |
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|
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|
T |
15358777 |
caacaacaacttatttttcatcatcaaatcttgatatatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaattaaa |
15358876 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
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|||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |
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T |
15358877 |
catgattcccatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca |
15358976 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
|
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||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| |||| |
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|
T |
15358977 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattaaaacacgaatttcaacaactatgaacaa-taatcagttattcaa |
15359075 |
T |
 |
Q |
371 |
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412 |
Q |
|
|
|||| || || |||| |||| ||| |||||| ||||||| |
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|
T |
15359076 |
ctaagtacttaatcatgcaattaatgaaaaattaccactaaa |
15359117 |
T |
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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
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Target Start/End: Original strand, 28722203 - 28722396
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Q |
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|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28722203 |
acaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattc |
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T |
 |
Q |
284 |
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377 |
Q |
|
|
|||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |
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|
T |
28722303 |
aattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttcaacaactatgaacaaagattcacttattcaattaagca |
28722396 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 354
Target Start/End: Original strand, 14940709 - 14941015
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144 |
Q |
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T |
14940709 |
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14940808 |
T |
 |
Q |
145 |
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244 |
Q |
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T |
14940809 |
tcttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattt |
14940908 |
T |
 |
Q |
245 |
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344 |
Q |
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T |
14940909 |
tcacatactatgaacatgcaatttcac---caacaatttaattatcacaaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaa |
14941005 |
T |
 |
Q |
345 |
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354 |
Q |
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T |
14941006 |
ctatgaacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
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Target Start/End: Complemental strand, 13863197 - 13862890
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Q |
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T |
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caacaacaacttatttcacattatcaaatcattgattatgaacacccaagccatgcatcattaacaacaatatcacttagcaacaacaacaacaattgaa |
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T |
 |
Q |
171 |
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269 |
Q |
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T |
13863097 |
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13862998 |
T |
 |
Q |
270 |
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368 |
Q |
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T |
13862997 |
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13862898 |
T |
 |
Q |
369 |
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376 |
Q |
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|
|||||||| |
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T |
13862897 |
aattaagc |
13862890 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 71 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13449094 - 13448842
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170 |
Q |
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T |
13449094 |
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13448995 |
T |
 |
Q |
171 |
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270 |
Q |
|
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T |
13448994 |
catgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca |
13448895 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
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T |
13448894 |
ccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatgataa |
13448842 |
T |
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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7284370 - 7284034
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Q |
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126 |
Q |
|
|
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|
T |
7284370 |
tcaaaatcaaacttctccattatcaacccatttaacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaactcaagccatga |
7284272 |
T |
 |
Q |
127 |
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226 |
Q |
|
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|
T |
7284271 |
attattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaa-ttaagcata |
7284173 |
T |
 |
Q |
227 |
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325 |
Q |
|
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T |
7284172 |
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7284073 |
T |
 |
Q |
326 |
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364 |
Q |
|
|
||| ||||||| | || |||||||||||||||||||| |
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|
T |
7284072 |
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7284034 |
T |
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Target: chr7; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 48 - 354
Target Start/End: Original strand, 15368302 - 15368608
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Q |
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144 |
Q |
|
|
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|
T |
15368302 |
atcaacccatttttacaaaactaacaacaacaacttatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaattctaaaaactc |
15368401 |
T |
 |
Q |
145 |
acttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactt |
244 |
Q |
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|
T |
15368402 |
tcttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcattaatttgagcataattcacaatatatcattt |
15368501 |
T |
 |
Q |
245 |
tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaa |
344 |
Q |
|
|
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|
T |
15368502 |
tcacatactatgaacatgcaatttcac---caacaatttaattatcacaaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaa |
15368598 |
T |
 |
Q |
345 |
ttatgaacaa |
354 |
Q |
|
|
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|
|
T |
15368599 |
ctatgaacaa |
15368608 |
T |
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Target: chr7; HSP #33
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Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15822701 - 15822367
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167 |
Q |
|
|
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|
T |
15822701 |
caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
15822602 |
T |
 |
Q |
168 |
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266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||| | | |||||||||| ||| |
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|
T |
15822601 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattc-accatttgagcatattttcaacatataccattttcatacattttgaacatgtaat |
15822503 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
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|
T |
15822502 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatcca-acatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
15822404 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
| |||||||||| || ||||||||| || |||||||| |
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|
T |
15822403 |
cccaattaagca-cttttcatacaaataactgaaaatt |
15822367 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
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Q |
|
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|
T |
17947831 |
tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaa |
17947732 |
T |
 |
Q |
199 |
catagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaactt |
298 |
Q |
|
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T |
17947731 |
catagcacaattcaacaattagagcacaatttacaatatatcattttcacatactatgcacattcagtttaaccaacaacaattcaattatcaccaattt |
17947632 |
T |
 |
Q |
299 |
catgcattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||| |||||||| |
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|
T |
17947631 |
catgcactcaaacatatcatcataa |
17947607 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 401
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||| || | |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||| ||| | |
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T |
12758965 |
caccaacaacatctcatttctccaca-caaatcataaatcctgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacttaacaacaacaacaacaatt |
12759063 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
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|| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | |||| ||| | |||||||||| ||| |
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T |
12759064 |
gatcatgaaacttatcataattcaccaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccctttttcacattttgaacatgtaat |
12759162 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| | |
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|
T |
12759163 |
tcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattggagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
12759262 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
| ||||||| || || ||||||||| ||||||||| |
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|
T |
12759263 |
cccaattaaaca-cttttcatacaaataattgaaaa |
12759297 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12370107 - 12369775
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Q |
|
|
|||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | || ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| | | |
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|
T |
12370107 |
caactacaacttatttctcaataacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaataattatgcacaacatcacttagcaacaacaacatcaattaat |
12370008 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
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T |
12370007 |
catgaaagttatcacaattcaacaacaacaaggcataattcaccaatt-gagcatattttcaacagatacccatttttcatactttgaacatgtaattca |
12369909 |
T |
 |
Q |
270 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
368 |
Q |
|
|
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|
T |
12369908 |
accaacaacaattcaattatccgtaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttaatcatttatgaacaattaattaattcaccc |
12369809 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
12369808 |
aattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Original strand, 3895005 - 3895337
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71 |
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170 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |
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|
T |
3895005 |
caacaacaacttattttacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat |
3895104 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |
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|
T |
3895105 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgcaattca |
3895203 |
T |
 |
Q |
270 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
368 |
Q |
|
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|| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | | |
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T |
3895204 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatttcatcagaattagagcatgaatttcatcaattatgaacaattaatcaattcatcc |
3895303 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
3895304 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
3895337 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9724046 - 9723798
Alignment:
Q |
99 |
tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaa |
198 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||| |||| || |||||||||||| | |||||| ||| | |||| |||||||||| |
|
|
T |
9724046 |
tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaa |
9723947 |
T |
 |
Q |
199 |
catagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaactt |
298 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||| | |||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| || |
|
|
T |
9723946 |
catagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatattatgaacatgcagtttcatcaacatcaattgaattatcaccaattt |
9723847 |
T |
 |
Q |
299 |
catgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatta |
347 |
Q |
|
|
|||| | || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
9723846 |
catgtacccaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaatta |
9723798 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8267882 - 8267743
Alignment:
Q |
184 |
acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattc |
283 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
8267882 |
acaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattc |
8267783 |
T |
 |
Q |
284 |
aattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
|
|
|||||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
8267782 |
aattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa |
8267743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 378
Target Start/End: Original strand, 33559710 - 33559935
Alignment:
Q |
154 |
caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
253 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||| |||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
33559710 |
caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcccaattcacaatatatcattttctcatact |
33559809 |
T |
 |
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac- |
352 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
33559810 |
atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattttaacatatcatcatagcaagaggacgaatttcaacagctatgaaca |
33559909 |
T |
 |
Q |
353 |
aattaatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
|| |||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
33559910 |
aaataatcacttattcaattaagcac |
33559935 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 337
Target Start/End: Original strand, 46473971 - 46474248
Alignment:
Q |
61 |
acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaac |
160 |
Q |
|
|
|||||| || ||||||||||| | ||| || || || |||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||| |
|
|
T |
46473971 |
acaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaac |
46474070 |
T |
 |
Q |
161 |
atcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaac |
259 |
Q |
|
|
||||| | |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | ||||| || || | |||| | ||||| |
|
|
T |
46474071 |
atcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattaacaatatacacatttccacatattatgaac |
46474170 |
T |
 |
Q |
260 |
atgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
46474171 |
atgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactctaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
46474248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 45452435 - 45452103
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||| || || || ||||||| ||| | |
|
|
T |
45452435 |
caccaacaacatctcatttctccaca-caaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacgacaatt |
45452337 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
45452336 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcatg--tca-caaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaat |
45452240 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| || ||||||||| |||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
45452239 |
tcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
45452140 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
45452139 |
cccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
45452103 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Original strand, 4438881 - 4438994
Alignment:
Q |
189 |
tcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaatta |
288 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
4438881 |
tcaacaacaacatagcacaattcaacaattggagcacaattcacaatatatcattttaacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaatta |
4438980 |
T |
 |
Q |
289 |
tcaacaacttcatg |
302 |
Q |
|
|
||| ||| |||||| |
|
|
T |
4438981 |
tcaccaatttcatg |
4438994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9319667 - 9319578
Alignment:
Q |
234 |
atatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
|
|
|||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
9319667 |
atatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgtattcaaacatatcatcataa |
9319578 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 403
Target Start/End: Original strand, 44865391 - 44865543
Alignment:
Q |
251 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga |
350 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||| |
|
|
T |
44865391 |
actttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga |
44865490 |
T |
 |
Q |
351 |
acaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
44865491 |
acaattaatcaattcatccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
44865543 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Original strand, 3049564 - 3049720
Alignment:
Q |
72 |
aacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaac |
171 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| | |
|
|
T |
3049564 |
aacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatc |
3049663 |
T |
 |
Q |
172 |
atgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt |
229 |
Q |
|
|
||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
3049664 |
atgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcataatt |
3049720 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 162
Target Start/End: Original strand, 4438777 - 4438893
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcatt-aacaacaacatca |
145 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||| || || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||| |
|
|
T |
4438777 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaagtcatttcacatcatcaattcatgatttatgaacacccaagccatgaatcattcaacatcagcatct |
4438876 |
T |
 |
Q |
146 |
cttagcagcaacaacat |
162 |
Q |
|
|
|||| || ||||||||| |
|
|
T |
4438877 |
cttatcaacaacaacat |
4438893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39046893 - 39046743
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| | |
|
|
T |
39046893 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacagatcaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
39046794 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
|| |||| | || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
39046793 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt |
39046743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||| || |
|
|
T |
371055 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcggcaaca |
371153 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
371154 |
acaacatcaa |
371163 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
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Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
T |
45149559 |
atcaacccattttcacaaaatcaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgg-ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
45149657 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattca |
212 |
Q |
|
|
||| || |||||||||||| | |||||| ||| | |||| |||||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
45149658 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaaccaacaacatcatagcacaattca |
45149723 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
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Q |
184 |
acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaat |
281 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||| |||| || |||| |||| |
|
|
T |
143732 |
acaattcatcaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caat |
143829 |
T |
 |
Q |
282 |
tcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
143830 |
tcaattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt |
143912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
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Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca |
145 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||| |
|
|
T |
8268003 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaaatcatgatttatgaacatccaagctatgaatcctcaacaacaacatca |
8267905 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #53
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Q |
104 |
aattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatag |
203 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| | ||||| | | | |||| ||||||||||| || |
|
|
T |
8563582 |
aattatgaacacccaaggtgtgaatcatcaacaacaacatctcataacaacaacaacatcaattaaacatatattcaatcacaaatcaacaacaacctaa |
8563483 |
T |
 |
Q |
204 |
cataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatg |
302 |
Q |
|
|
|| |||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||| || ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
T |
8563482 |
cacaattcatccatttgagcataactcacaatatactcatttatatatatcatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcata |
8563383 |
T |
 |
Q |
303 |
cattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
|
|
| ||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
8563382 |
tactcaaacatatcatcataa |
8563362 |
T |
 |
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Q |
81 |
tcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
|||| ||||| || |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |
|
|
T |
25124120 |
tcatatctcatcatcaaatcatgatttgtgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaacatctcatatcaacaacaacatcaa |
25124204 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacat |
143 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| | || | ||||||||| |
|
|
T |
35094794 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacat |
35094869 |
T |
 |
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Q |
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catactttgaa-catgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
T |
13321173 |
catactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatt |
13321262 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #57
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Target Start/End: Original strand, 45149748 - 45149830
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Q |
255 |
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337 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
T |
45149748 |
tgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcattataacaagagcacgaatt |
45149830 |
T |
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43 |
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131 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |
|
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T |
126366 |
tcataatcaacccattttctccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcat |
126455 |
T |
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Q |
49 |
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147 |
Q |
|
|
|||| ||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| | |
|
|
T |
9321326 |
tcaatccattttcacaaaaccaacaacaacaacttacttcacatcacaaactcatgatttgtgaacacccaagctatgaatcattaacaacaatatctat |
9321227 |
T |
 |
Q |
148 |
tagcagcaacaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
|| || |||||||||||| |
|
|
T |
9321226 |
tatcaacaacaacatcaa |
9321209 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
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Target Start/End: Complemental strand, 18980310 - 18980202
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| || |
|
|
T |
18980310 |
atttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaatt-atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca |
18980212 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
18980211 |
acaacatcaa |
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T |
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Target: chr7; HSP #61
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Q |
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Q |
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|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||||| |
|
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T |
11580839 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatt |
11580756 |
T |
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Q |
253 |
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337 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
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T |
13037114 |
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13037031 |
T |
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Q |
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337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||| | | |||||||||||||| |
|
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T |
18253935 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatt |
18253852 |
T |
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Target: chr7; HSP #64
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
T |
47481131 |
tttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatt |
47481048 |
T |
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Target: chr7; HSP #65
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Q |
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tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatc |
319 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||| |
|
|
T |
16479050 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatc |
16478985 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 337
Target Start/End: Original strand, 16211929 - 16212012
Alignment:
Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
16211929 |
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16212012 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 92)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
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Target Start/End: Complemental strand, 47785061 - 47784688
Alignment:
Q |
24 |
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123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
47785061 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacagaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaagcca |
47784962 |
T |
 |
Q |
124 |
tgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagc |
223 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
47784961 |
tgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattc------------ |
47784874 |
T |
 |
Q |
224 |
ataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
47784873 |
-------aacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataa |
47784781 |
T |
 |
Q |
324 |
ttggagcacgaattctaacaa----ttatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
47784780 |
ttagagcacgaattataacaacttcctttgaacaataaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaa |
47784688 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 57 - 412
Target Start/End: Original strand, 39656492 - 39656846
Alignment:
Q |
57 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa |
156 |
Q |
|
|
|||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
T |
39656492 |
tttttcaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacccctaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaa |
39656591 |
T |
 |
Q |
157 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg |
256 |
Q |
|
|
| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39656592 |
ccacatcaattgaacatgaatcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttg |
39656691 |
T |
 |
Q |
257 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaatt |
356 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
39656692 |
aacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaccaatttcataaattcaaacataacatcataattggagcacggattttaacaattatgaacaatt |
39656791 |
T |
 |
Q |
357 |
aatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| |
|
|
T |
39656792 |
aatcatttactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaaattgcactaaa |
39656846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 69 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 11329230 - 11328892
Alignment:
Q |
69 |
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168 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
T |
11329230 |
accaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg |
11329131 |
T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
Q |
|
|
| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11329130 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatgaaattt |
11329031 |
T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
368 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11329030 |
cactaacaacaattcaattattaacaactttatgca-----acatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
11328936 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11328935 |
aattaagcacttattcatacaat-aattgaaaatttacactaaaa |
11328892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 71 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3576705 - 3576361
Alignment:
Q |
71 |
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170 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||| || |
|
|
T |
3576705 |
caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatcaatcaaa |
3576606 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
3576605 |
catgactcttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatttgagcataattcaatatatatcactttctcatacattgaacatgaaatttca |
3576506 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
3576505 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
3576406 |
T |
 |
Q |
371 |
ttaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
3576405 |
ttaagcacttattcgtacaa-caattgaaaaattacactaaaatga |
3576361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 48 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12489017 - 12488659
Alignment:
Q |
48 |
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146 |
Q |
|
|
||||||||||||| || ||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| |
|
|
T |
12489017 |
atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcccatcattaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcac |
12488918 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12488917 |
ttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
12488818 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
12488817 |
tcatactttgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatccaaacacaatatcataattagagcatgaattctaacaatt |
12488718 |
T |
 |
Q |
347 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttac |
406 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
12488717 |
atgaacaattaattaatgactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatttac |
12488659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 69 - 416
Target Start/End: Original strand, 17191519 - 17191865
Alignment:
Q |
69 |
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168 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| | |
|
|
T |
17191519 |
accaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacattacttagcaacagcaacatcaatta |
17191618 |
T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17191619 |
aacatgattcttatcacaattcagcaacaacataacataattcatcaatttgagcataattcaacataaatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
17191718 |
T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
368 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
17191719 |
caccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaattaatcatttactc |
17191818 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
17191819 |
aattaagcaattgttcatacaa-caattgaaaaattacactaaaatga |
17191865 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 69 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 14059482 - 14059137
Alignment:
Q |
69 |
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168 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||| |||||||| || |
|
|
T |
14059482 |
accaacaacatctcatttctcatcaacagatcatgaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatagcaacaataacatcaattg |
14059383 |
T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
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|
|
|||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14059382 |
aacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaaattgagcatatttcaacatatgtcattttctcatactttgaacatgaaattt |
14059283 |
T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
368 |
Q |
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T |
14059282 |
ctctaaaaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattagtcaattagtc |
14059183 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
14059182 |
aattaagcacttattcatacaat-aattgaaaa-ttgcactaaaatga |
14059137 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 69 - 411
Target Start/End: Original strand, 17139486 - 17139826
Alignment:
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168 |
Q |
|
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|||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| || |
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T |
17139486 |
accaacaacatctcatttcgcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg |
17139585 |
T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
Q |
|
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T |
17139586 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatatttcaacatataccattttctcatagtttgaacatgaaattt |
17139685 |
T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
368 |
Q |
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T |
17139686 |
caccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacacttaatcaattactc |
17139785 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaa |
411 |
Q |
|
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T |
17139786 |
aattaagcacttattcatacaa-caattg-aaatttacactaa |
17139826 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
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Target Start/End: Original strand, 16880111 - 16880444
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Q |
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178 |
Q |
|
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T |
16880111 |
actcatttatcaccaataattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatccacaacatcacttagcaacaataacatcaattgaacatgaatc |
16880210 |
T |
 |
Q |
179 |
ttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaac |
278 |
Q |
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T |
16880211 |
ttatcacaattcaacaacaacatagcataatttcacaaattgagcatattctaacatataccactttctcatactttgaacatgaaattttactaacaac |
16880310 |
T |
 |
Q |
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aattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
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T |
16880311 |
aattcaattatcaacaacttcttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaattcaaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaaacac |
16880410 |
T |
 |
Q |
379 |
ctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
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|
T |
16880411 |
ttgttcatacaa-caattgaaaatttacactaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
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Target Start/End: Original strand, 12952915 - 12953285
Alignment:
Q |
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Q |
|
|
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|
T |
12952915 |
tcataatcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaat |
12953014 |
T |
 |
Q |
142 |
atcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatca |
241 |
Q |
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T |
12953015 |
atctcttagcaacaacaacatcaattaaacataaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataaca |
12953114 |
T |
 |
Q |
242 |
ctttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaa |
341 |
Q |
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T |
12953115 |
ctttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagaacacgaattctaa |
12953214 |
T |
 |
Q |
342 |
caa-ttatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
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T |
12953215 |
caactaatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacagt-aattgaaaaattacactaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
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Target Start/End: Original strand, 30207279 - 30207537
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Q |
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253 |
Q |
|
|
||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
30207279 |
caacaacttcaattgaacttgaatcttatcacaattgaacaacaacatagcacaattcatcaatttaagcataattcaacatatatcactttctcatact |
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T |
 |
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
353 |
Q |
|
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|
T |
30207379 |
ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaccagtatgaata |
30207478 |
T |
 |
Q |
354 |
attaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
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T |
30207479 |
attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaa |
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T |
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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 57 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 9591035 - 9590680
Alignment:
Q |
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156 |
Q |
|
|
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|
T |
9591035 |
ttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaactatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaa |
9590936 |
T |
 |
Q |
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caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg |
256 |
Q |
|
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|
T |
9590935 |
caacatcaattgaacatggttctcatcagaactcaacaacaacatagcataattcaacaaattgagcataattcatatcataccactttcacatactttg |
9590836 |
T |
 |
Q |
257 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaatt |
356 |
Q |
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T |
9590835 |
aacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttaatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacggattttaacaactatgaacaatt |
9590736 |
T |
 |
Q |
357 |
aatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
|| || ||| |||||||||||| || |||||||| | ||||||| |||||||||| |
|
|
T |
9590735 |
aaccacttattcaattaagcacttaatcatacaacaatttgaaaaattacactaaa |
9590680 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 69 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12560505 - 12560174
Alignment:
Q |
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Q |
|
|
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|
T |
12560505 |
accaacaacatctcatttctcaacatcaaatcatgaatcatgcatacccaagccaggaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatccattg |
12560406 |
T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
Q |
|
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| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12560405 |
atcatgaatcatatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccagttgggcatattttcacatataccactttctcatactttgaacatgaaattt |
12560306 |
T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
368 |
Q |
|
|
| | ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12560305 |
ctctaacaaaaattcaagtatcaataacttcaagcattcaatcataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
12560206 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
12560205 |
aattaagcacttattcatacaat-aattgaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
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Target Start/End: Original strand, 17204667 - 17205005
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Q |
|
|
||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |
|
|
T |
17204667 |
tttacaaaaccactaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattacttagcaacaac |
17204766 |
T |
 |
Q |
158 |
aacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttga |
257 |
Q |
|
|
|||||| | | |||||| ||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17204767 |
aacatccattaaacatgattcctatcacaattcaacaacaatatagca-------------------taattcaacatatatcactttctcatactttga |
17204847 |
T |
 |
Q |
258 |
acatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaatta |
357 |
Q |
|
|
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|
T |
17204848 |
acatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaatta |
17204947 |
T |
 |
Q |
358 |
atcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
17204948 |
atcatttactcaattaagcacttgttcgtacca-caattgaaaaattacactaaaatga |
17205005 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 413
Target Start/End: Original strand, 15876046 - 15876381
Alignment:
Q |
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accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
168 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||| || |
|
|
T |
15876046 |
accaacaccaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaatacctaagccatgaatcatcattaacaacatcacttaccaacaacaacatcaattg |
15876145 |
T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
Q |
|
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T |
15876146 |
aacatgaatcttatcacaattcaacaacaacttatgataatccaacaatttgagtatcattcaagatatatcactttctcatacttggaacataaaattt |
15876245 |
T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
368 |
Q |
|
|
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|
T |
15876246 |
catcaacaacaattcagttatcaacaacatcatgcatttaaacatattatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaa--------tc |
15876337 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15876338 |
aattaagcacttattcatacaat-aattgaaaatttacactaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 68 - 391
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|
|
||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
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caccaacaacatctcatttctcaacaaaaaatcatgaattatgcatacccaagtcatgaattatcatcaacaacatcacttagcatcaacaacatcaatt |
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T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
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|
T |
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gatcatgaaacttatcacaattcaaccacaacatagtataattcaaccagttgagcatattttcatcatatatcattttctcatactttgaacatgaaat |
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T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
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| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
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T |
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tccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
55440820 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
| ||||||||||| |||||||||||| |
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|
T |
55440819 |
cccaattaagcacttattcatacaat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 68 - 364
Target Start/End: Original strand, 14295415 - 14295712
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Q |
|
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T |
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caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaatt |
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T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
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T |
14295515 |
gatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgaatt |
14295614 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
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| || |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
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T |
14295615 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 49 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 17960602 - 17960239
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T |
17960602 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagtcatgaattattaataacaacatcactt |
17960503 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
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T |
17960502 |
agcagcaaacacatcaattgaatatgaatctcagcataattcaacatcaacataacacaaattgtcatttagagcataatatgacatatatcattttcat |
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T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
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T |
17960402 |
atactttgatcattcaatttcacccacaaaaaatcaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacgaattctaaccatcat |
17960303 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17960302 |
gaacaattaattaattactcaattaagcaattattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaa |
17960239 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 71 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14815032 - 14814712
Alignment:
Q |
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170 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||| || ||||| |||| | |||||| | || |||||||| ||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | || |
|
|
T |
14815032 |
caacaacaacttatttctcatcatcaaattatgattcatgaacacgcaggccatgaaacatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
14814933 |
T |
 |
Q |
171 |
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270 |
Q |
|
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|||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |
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T |
14814932 |
catgattcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca |
14814833 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||| |||| |
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T |
14814832 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaactatgagcaaataatcacttattcaa |
14814733 |
T |
 |
Q |
371 |
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391 |
Q |
|
|
|||||||| || |||| |||| |
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|
T |
14814732 |
ttaagcacttaatcatgcaat |
14814712 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 68 - 364
Target Start/End: Original strand, 14301042 - 14301339
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
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||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | || ||| ||||||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||| | |
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|
T |
14301042 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcaaaccaaagacatgaataatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaatt |
14301141 |
T |
 |
Q |
168 |
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266 |
Q |
|
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|
|
T |
14301142 |
gatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgaatt |
14301241 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
| || |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14301242 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt |
14301339 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 49 - 325
Target Start/End: Original strand, 34559857 - 34560133
Alignment:
Q |
49 |
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148 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
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|
T |
34559857 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaattatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
34559956 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| ||||||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| || ||| ||| | |
|
|
T |
34559957 |
agcaacaacaacatcaatcgaacatgaatctcatcataattcaacaactacataacataattcaaaatttagagcataattcaacatgtaacacattcac |
34560056 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataatt |
325 |
Q |
|
|
||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
T |
34560057 |
atattttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattataatt |
34560133 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 71 - 413
Target Start/End: Original strand, 14080489 - 14080830
Alignment:
Q |
71 |
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170 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |
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|
T |
14080489 |
caacaacaactcatttctcatcaccaaatcatgaattatgaatacccaagccgtaaatcatcaacaacaacattacttcgcaataacaacatcaattgaa |
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T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
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T |
14080589 |
catggttctcatcataattcaacaacaatatagcacaattcacccaattgagcataattcataagttagcacttatacatactttgaacatgcaaattca |
14080688 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
|
|
| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |
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T |
14080689 |
ctaaccacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattttaacatctatgcacaattaatcatttatccaa |
14080788 |
T |
 |
Q |
371 |
ttaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| |
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|
T |
14080789 |
ttaaacacttattcataccat-agttgaaaatttacactaaaa |
14080830 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38811297 - 38810981
Alignment:
Q |
49 |
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148 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
38811297 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctgatcatcaaaacatgaattatgcacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactt |
38811198 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| |||||||| ||| | | ||||||||| ||||||| || |||| ||| || ||||||||| |||||||||| |||| |
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|
T |
38811197 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatcaacatatcacaatttgacatttagagcataatatgacatatatcattttcat |
38811098 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
|| ||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||| | | | ||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |
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|
T |
38811097 |
gtattttgatcattcaatttcaccaacaacaaattaattatcatcaattccttacatacaaaaagaacatcataattggagcacgaattctaacaatcat |
38810998 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaatta |
365 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |
|
|
T |
38810997 |
gaacaattaatcaatta |
38810981 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 11061293 - 11060944
Alignment:
Q |
52 |
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150 |
Q |
|
|
||||||||| || |||||| |||||| |||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
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T |
11061293 |
acccattttcaccaaatcaacaacaataacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
11061194 |
T |
 |
Q |
151 |
cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctca |
249 |
Q |
|
|
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|
T |
11061193 |
caccaacaacatcaattgaacatgactattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctca |
11061094 |
T |
 |
Q |
250 |
tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatg |
349 |
Q |
|
|
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|
T |
11061093 |
tactttgaacctgaaattcaactaacaacaatccaattattcataacttcatacatttaaaaat-tgatcataattagagcacgaatttcatcatccatt |
11060995 |
T |
 |
Q |
350 |
aacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
11060994 |
aacaaataattaattatccaattaagcacttattcatacaat-aattgaaaa |
11060944 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 48 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6228916 - 6228626
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Q |
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146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | |
|
|
T |
6228916 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatttc |
6228817 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||| | |||||| | | | | ||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |
|
|
T |
6228816 |
ttagcaacaacaacatcaattaaacatgatccacatcataattcgacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttc |
6228717 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
6228716 |
acatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaatt |
6228626 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 69 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4162474 - 4162165
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Q |
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168 |
Q |
|
|
||||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
4162474 |
accaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatagttcttagcaacaacaacatcaatta |
4162375 |
T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
Q |
|
|
|||||| ||| | |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||||| || ||||| |
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|
T |
4162374 |
aacatgattcacgtcatcattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacttgtaattt |
4162275 |
T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
368 |
Q |
|
|
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|
T |
4162274 |
caccaacagcaattcaattatcaccaattttatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaatttcaacaactatgaacaaataatcacttattc |
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T |
 |
Q |
369 |
aattaagcac |
378 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
4162174 |
aattaagcac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Original strand, 54423993 - 54424324
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Q |
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||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |
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|
T |
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caacaacaacttatttctcat-aacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacgtcacttagcaataacaacatcaattgat |
54424091 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
54424092 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatatcaatttctcatactttgaacatgtaattca |
54424190 |
T |
 |
Q |
270 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
368 |
Q |
|
|
|| ||| |||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || | |
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|
T |
54424191 |
actaaccacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccc |
54424290 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
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aattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
54424324 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 48 - 289
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Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
T |
1990759 |
atcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacaaaccaagccatgaatcatcaacaacaatatctc |
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T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
||| || ||||||||||| | |||||| |||| | ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |
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|
T |
1990859 |
ttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcacagttcaacaacaacataacacaattc-acaatttgagcataattcacaatatatcattttc |
1990957 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattat |
289 |
Q |
|
|
|||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
1990958 |
atctactatgaacatgcaatttcacaaacaataattcaattat |
1991000 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
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Target Start/End: Complemental strand, 31412610 - 31412292
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Q |
|
|
|||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||| |
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|
T |
31412610 |
acaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaac |
31412511 |
T |
 |
Q |
161 |
atcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaaca |
260 |
Q |
|
|
||||| | ||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |
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|
T |
31412510 |
atcaattaaacctaattctcatcacaattcaacaacaacatatcacaattcaacaattaaagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaaca |
31412411 |
T |
 |
Q |
261 |
tgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaat |
359 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || | || |||| |
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|
T |
31412410 |
tgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataat |
31412311 |
T |
 |
Q |
360 |
caattactcaattaagcac |
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Q |
|
|
|| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
31412310 |
cacttattcaattaagcac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
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Target Start/End: Original strand, 50313144 - 50313475
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|
||||||| ||||||||||| || | || |||||| |||||||| | |||||||| | ||||||| | ||| | ||||||||| |||||||| ||| || |
|
|
T |
50313144 |
atcaacctattttacaaaaccaaccacgacaacttatttctcatcgtcaaatcataatttatgaatactcaaactatgaatcatcaacaacaatatctct |
50313243 |
T |
 |
Q |
148 |
tagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct |
247 |
Q |
|
|
|| || |||||||||||| | |||||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |
|
|
T |
50313244 |
taacaacaacaacatcaattaaacatgattcccatcacaattcaacaacaacatatcacaatccaacatttagagcacaattcacaatatatcattttca |
50313343 |
T |
 |
Q |
248 |
catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatta |
347 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| || |
|
|
T |
50313344 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcactcaaacatatcattataacaagagcacgaatttcaacaacta |
50313443 |
T |
 |
Q |
348 |
tgaac-aattaatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
||| | || |||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
50313444 |
tgagcaaaataatcacttactcaattaagcac |
50313475 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 71 - 344
Target Start/End: Original strand, 41661545 - 41661818
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170 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| ||| || ||| |||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| || | || |||||||||||| | || |
|
|
T |
41661545 |
caacaacaacttatttatcatcatcaattcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctctcaacaacaacaacatcaattaaa |
41661644 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| |||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
41661645 |
catgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca |
41661744 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaa |
344 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| || | |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
T |
41661745 |
ccaacaacaattcaattatcatcatttccatgtattcaaacatatcatcatagcaagagcacgaattttaacaa |
41661818 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 378
Target Start/End: Original strand, 15517728 - 15517918
Alignment:
Q |
189 |
tcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct-catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaatt |
287 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| |||||| ||||| | ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15517728 |
tcaacaacaacttagcacaattcatcaatttaagcacaattcacaatatacccatttatacataccatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatt |
15517827 |
T |
 |
Q |
288 |
atcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
|||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
15517828 |
atcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatttatgaacaattaatcacttactcaattaagcac |
15517918 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 403
Target Start/End: Original strand, 3578057 - 3578400
Alignment:
Q |
57 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaa-caacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| | || |||||| || |||| ||||||||| |||||||| || |
|
|
T |
3578057 |
ttttaccaaaacaccaacaacctctcattcctccacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagcca---atttttaatcaacaacatgacttagcaaca |
3578153 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactt |
254 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| |
|
|
T |
3578154 |
acaa-atcaattgatcatgaaacttatcgcaattcaaccacaacatagcgtaattcaaccagttgagcatattttcaacatatactattttctcatactt |
3578252 |
T |
 |
Q |
255 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaa |
354 |
Q |
|
|
||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| | |||| | || |||||||||| |
|
|
T |
3578253 |
tgaacatgaaattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacattca-acatgtcatcataattagagaatgaatatcatcatttatgaacaa |
3578351 |
T |
 |
Q |
355 |
ttaatcaa-ttactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
3578352 |
ttaatcaatttacccaattaagcacttattcctacaat-aattgaaaatt |
3578400 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 43427805 - 43427459
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Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||| | || || |||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
T |
43427805 |
atcaacccattttcacaaaaccaacatcaacaacttatttcatatcacaaactcatgatttatgaacaccaaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
43427706 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
| || |||||||||||| | | |||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||| |
|
|
T |
43427705 |
--aacaacaacaacatcaattaatcatgattctcatcacaactcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatttacaatatatcattttc |
43427608 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcat---acataacatcataattggagcacgaattctaaca |
343 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||| |
|
|
T |
43427607 |
acatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcatcaaacatatcaccataacaagagcacgaatttcaaca |
43427508 |
T |
 |
Q |
344 |
attatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
| || || | || |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
43427507 |
actaagagcaaaataatcacttattcaattaagcacttatgcatacaat |
43427459 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14528282 - 14528124
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
14528282 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcattcatacccaagccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt |
14528183 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata |
226 |
Q |
|
|
|| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
14528182 |
gatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcata |
14528124 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 378
Target Start/End: Original strand, 17100636 - 17100941
Alignment:
Q |
74 |
caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacat |
173 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||| |
|
|
T |
17100636 |
caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcat |
17100735 |
T |
 |
Q |
174 |
gtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacc |
272 |
Q |
|
|
| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | | |||||||||||||||| |||| || |
|
|
T |
17100736 |
gaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttgaacatgtaattcaact |
17100834 |
T |
 |
Q |
273 |
aacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaat |
371 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||| |
|
|
T |
17100835 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacccaat |
17100934 |
T |
 |
Q |
372 |
taagcac |
378 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
17100935 |
taagcac |
17100941 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 378
Target Start/End: Original strand, 17101321 - 17101626
Alignment:
Q |
74 |
caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacat |
173 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||| |
|
|
T |
17101321 |
caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcat |
17101420 |
T |
 |
Q |
174 |
gtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacc |
272 |
Q |
|
|
| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | | |||||||||||||||| |||| || |
|
|
T |
17101421 |
gaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttgaacatgtaattcaact |
17101519 |
T |
 |
Q |
273 |
aacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaat |
371 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||| |
|
|
T |
17101520 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacccaat |
17101619 |
T |
 |
Q |
372 |
taagcac |
378 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
17101620 |
taagcac |
17101626 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
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Target Start/End: Complemental strand, 50112309 - 50111986
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Q |
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ctcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttct |
179 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||| ||| | | |||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||||||| ||| |||| || |
|
|
T |
50112309 |
ctcatttctcaaaaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaact |
50112210 |
T |
 |
Q |
180 |
tactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaac |
278 |
Q |
|
|
|| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
T |
50112209 |
tatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaac |
50112111 |
T |
 |
Q |
279 |
aattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagca |
377 |
Q |
|
|
||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
T |
50112110 |
aattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagca |
50112011 |
T |
 |
Q |
378 |
cctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
50112010 |
-cttttcatacaaataattgaaaatt |
50111986 |
T |
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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17523176 - 17522863
Alignment:
Q |
52 |
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149 |
Q |
|
|
||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||| | |||||||||||||| || | |||||| || ||||| |
|
|
T |
17523176 |
acccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcataaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaaattgactta |
17523078 |
T |
 |
Q |
150 |
gcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
||| |||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||| | |
|
|
T |
17523077 |
gcaacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcatcaataacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccattttgtt |
17522979 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || | | |||||||||| ||||||||| | | || |||| |
|
|
T |
17522978 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccacatcttcatacatccaaaactgtcatcataattagagcacgaagttcatcatttat |
17522879 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||| |
|
|
T |
17522878 |
gaacaaataatcaatt |
17522863 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 33369199 - 33368874
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | |||||||| || | |
|
|
T |
33369199 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcgtcaacaacaatattcc |
33369100 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
||| || ||| |||||||| | |||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||| || |||| || |||| |
|
|
T |
33369099 |
ttaacaacaaaaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcac-------agtataa------------cattttc |
33369019 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| || || |||| |||||||||| ||||| | |
|
|
T |
33369018 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaaccacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccacaattaaagcacgaatttcaacaact |
33368919 |
T |
 |
Q |
347 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
|||||||| |||| ||||| |||| ||||||| || |||| |||| |
|
|
T |
33368918 |
atgaacaaataattaattattcaaataagcacttaatcatgcaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 197 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4145954 - 4145791
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197 |
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296 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| || ||||| | |||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
4145954 |
aacatagcacaattcaacatttagagcacagttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaa- |
4145856 |
T |
 |
Q |
297 |
ttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatca |
361 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
T |
4145855 |
ttcatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaatttcaacaactatgaacaaataatca |
4145791 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 401
Target Start/End: Original strand, 14298399 - 14298731
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Q |
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Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || | ||||||||||| | |
|
|
T |
14298399 |
caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaataacaacatcaatt |
14298497 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| || | | || | |||||||||||| ||| |
|
|
T |
14298498 |
gatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactttgaacatgtaat |
14298596 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| || ||| |||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||| |||| | || |||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
14298597 |
tcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
14298696 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
| |||||||||| || ||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
14298697 |
cccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaa |
14298731 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 401
Target Start/End: Original strand, 14304026 - 14304358
Alignment:
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68 |
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167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || | ||||||||||| | |
|
|
T |
14304026 |
caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaataacaacatcaatt |
14304124 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| || | | || | |||||||||||| ||| |
|
|
T |
14304125 |
gatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactttgaacatgtaat |
14304223 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| || ||| |||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||| |||| | || |||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
14304224 |
tcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
14304323 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
| |||||||||| || ||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
14304324 |
cccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaa |
14304358 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Original strand, 19946632 - 19946826
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Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcca |
123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
T |
19946632 |
tcatcaaaatcaaacttctatattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagcca |
19946730 |
T |
 |
Q |
124 |
tgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
|| || || | ||||||||| || || || |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
T |
19946731 |
tggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataaatcatcaatt |
19946826 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Original strand, 33341817 - 33341918
Alignment:
Q |
26 |
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125 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
T |
33341817 |
atcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatg |
33341915 |
T |
 |
Q |
126 |
aat |
128 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
33341916 |
aat |
33341918 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 116 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12349761 - 12349474
Alignment:
Q |
116 |
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215 |
Q |
|
|
||||||||||| | || | | ||||||| || || || |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
T |
12349761 |
ccaagccatgatttatcatctacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcacca |
12349662 |
T |
 |
Q |
216 |
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314 |
Q |
|
|
||| ||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | || || || ||| | |||| |
|
|
T |
12349661 |
att-gagcatattttcaacatataacaacttctcacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataaatttatacatctaaacatg |
12349563 |
T |
 |
Q |
315 |
acatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||| || |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
12349562 |
tcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaattaattcacccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
12349474 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 128
Target Start/End: Original strand, 7853916 - 7854019
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Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcca |
123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| | ||||||||| |
|
|
T |
7853916 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgattcatgcaaacccaagcca |
7854014 |
T |
 |
Q |
124 |
tgaat |
128 |
Q |
|
|
||||| |
|
|
T |
7854015 |
tgaat |
7854019 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 337
Target Start/End: Original strand, 10912842 - 10913132
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||| | |
|
|
T |
10912842 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctgtgaatcatcaacatcaatatctc |
10912940 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcacttt |
245 |
Q |
|
|
| || |||||||||||| | |||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||| |
|
|
T |
10912941 |
atgacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaaccacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatacccatttt |
10913040 |
T |
 |
Q |
246 |
ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
| |||| | || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
10913041 |
cacatattatggacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
10913132 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 401
Target Start/End: Original strand, 35123674 - 35124005
Alignment:
Q |
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||| |||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
T |
35123674 |
caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
35123772 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | |||| | ||||| |||||| ||| |
|
|
T |
35123773 |
gatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccttttcatacacttt-aacatgtaat |
35123870 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| || |||||||||||||||||| | || ||||| ||| || ||| |||||||||| || ||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
35123871 |
tcgactaacaacaattcaattatccataatttcatacatccaaacacgtcatcataattaaagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
35123970 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
| |||||||||| || ||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
35123971 |
cccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaa |
35124005 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
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Target Start/End: Original strand, 11638337 - 11638554
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| | || ||| |||||| |||| | || | || ||||||||| |||| ||| ||| || | | |||||||||||| | || |
|
|
T |
11638337 |
caacaacaactcatttcttatcatcaattcatgatttatacatacctaggctatgaatcatcaacaccaatatctctgaataacaacaacatcaattaaa |
11638436 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| ||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
11638437 |
catgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattaaagcacaattcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttca |
11638536 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaatta |
288 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |
|
|
T |
11638537 |
ccaacaacaattcaatta |
11638554 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13301564 - 13301417
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Q |
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tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaac |
342 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |
|
|
T |
13301564 |
tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattcaac |
13301465 |
T |
 |
Q |
343 |
aattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaa |
390 |
Q |
|
|
| || |||| | |||||| ||| |||||||||||| || |||||||| |
|
|
T |
13301464 |
atctaagaaccaataatcacttattcaattaagcacttaatcatacaa |
13301417 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13312220 - 13312073
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Q |
243 |
tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaac |
342 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |
|
|
T |
13312220 |
tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattcaac |
13312121 |
T |
 |
Q |
343 |
aattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaa |
390 |
Q |
|
|
| || |||| | |||||| ||| |||||||||||| || |||||||| |
|
|
T |
13312120 |
atctaagaaccaataatcacttattcaattaagcacttaatcatacaa |
13312073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11882313 - 11882145
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Q |
243 |
tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaac |
342 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| | ||| |
|
|
T |
11882313 |
tttcacatactatgaacattcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcatgaaattcaac |
11882214 |
T |
 |
Q |
343 |
aattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
| || |||||| |||||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
T |
11882213 |
atctaagaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatt-aaaagttacactaaa |
11882145 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 283
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Q |
52 |
acccattttacaaaatcaccaacaacaactcat-ttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag |
150 |
Q |
|
|
||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||| | ||| |||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| || || |
|
|
T |
17938535 |
acccatttt-caaaaacaacaacaacaactcatcttttcatctccaattcatgaatcatgtaaacccaagccatgaatgattatcaacaacatgacatat |
17938633 |
T |
 |
Q |
151 |
cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctca |
249 |
Q |
|
|
|| |||||||||||| ||| |||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||| |||||| |
|
|
T |
17938634 |
caacaacaacatcaattgatcatgaaaataaccacaatccaacaacaacaaagcataattcatcaatta-agcatattttcaacatatatcaacttctca |
17938732 |
T |
 |
Q |
250 |
tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattc |
283 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||| || ||||||||||| |
|
|
T |
17938733 |
tactttgaacatgcaattcaactaacaacaattc |
17938766 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 317778 - 317444
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| | | |||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| | |
|
|
T |
317778 |
caccaacaacatctcatttctccacaacaaaccaagaattatacaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
317679 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
267 |
Q |
|
|
|| |||| | || |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||| || ||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
317678 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattt-agcatattttcacacatacccatttttcatactttgaacatacaatt |
317580 |
T |
 |
Q |
268 |
tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-ac |
366 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||| || | |||||||| ||| | |||| ||||||| || ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
317579 |
caactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcatacttagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcat |
317480 |
T |
 |
Q |
367 |
tcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
317479 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
317444 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
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Query Start/End: Original strand, 24 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 54685622 - 54685519
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24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcca |
123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
T |
54685622 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaacagcaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaatccaagcca |
54685524 |
T |
 |
Q |
124 |
tgaat |
128 |
Q |
|
|
||||| |
|
|
T |
54685523 |
tgaat |
54685519 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9303422 - 9303276
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Q |
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tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcc |
122 |
Q |
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T |
9303422 |
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9303324 |
T |
 |
Q |
123 |
atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
|| | |||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
9303323 |
ataattcatagtcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa |
9303276 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19261105 - 19260840
Alignment:
Q |
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171 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | ||||||| ||| || |||||||||| | ||| | |
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|
T |
19261105 |
aacaacaacttatttcataacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacattcataacatcatttaacaacaacaacatctattgatc |
19261006 |
T |
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Q |
172 |
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270 |
Q |
|
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||| |||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| | |
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T |
19261005 |
atgaaacttatcacaattcatcaacaacttagtataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaa |
19260907 |
T |
 |
Q |
271 |
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337 |
Q |
|
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| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| |
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|
T |
19260906 |
ctaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
19260840 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16996321 - 16995995
Alignment:
Q |
76 |
acaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgt |
175 |
Q |
|
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|
T |
16996321 |
acaactcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatga |
16996222 |
T |
 |
Q |
176 |
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275 |
Q |
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T |
16996221 |
aacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatacccatttttcatactttgaacatacaattcaagtaac |
16996123 |
T |
 |
Q |
276 |
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374 |
Q |
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T |
16996122 |
aacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcaccacttatgaataattaatcaattcatccaattaa |
16996023 |
T |
 |
Q |
375 |
gcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||| || |||||||| ||||||||||| |
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T |
16996022 |
gcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
16995995 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Original strand, 8631769 - 8632102
Alignment:
Q |
71 |
caacaacaactcattt-ctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactga |
169 |
Q |
|
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T |
8631769 |
caacaacaactcattttctcatcttcaattcgtgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatttg |
8631868 |
T |
 |
Q |
170 |
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268 |
Q |
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T |
8631869 |
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8631967 |
T |
 |
Q |
269 |
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367 |
Q |
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T |
8631968 |
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8632067 |
T |
 |
Q |
368 |
caattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
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T |
8632068 |
caattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
8632102 |
T |
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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22144542 - 22144207
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
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|
T |
22144542 |
caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtattatcatcaacaacatggcttaacaacaacaacaacaatt |
22144443 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaa |
265 |
Q |
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|
|| |||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||| || |||| | |||||||||||| || |
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T |
22144442 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatacttcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaa |
22144344 |
T |
 |
Q |
266 |
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364 |
Q |
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T |
22144343 |
ttcaactaac-acaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcagttatgaacagttaatcaattc |
22144245 |
T |
 |
Q |
365 |
actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
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|
T |
22144244 |
acccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
22144207 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 38167894 - 38168051
Alignment:
Q |
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |
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|
T |
38167894 |
caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat |
38167993 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt |
229 |
Q |
|
|
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|
T |
38167994 |
catgaaacttattacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcataatt |
38168051 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16182215 - 16181881
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | | |||||||| ||| | |
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|
T |
16182215 |
caccaccaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaaaacaacaacaacaatt |
16182116 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| ||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||| | | |||| | |||||||||||| ||| |
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|
T |
16182115 |
gatcattaaacttatcacaattcatcaacgacaatgcataattcaccaatttg-gcatattttcacacatacccattttcatacactttgaacatgtaat |
16182017 |
T |
 |
Q |
267 |
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365 |
Q |
|
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T |
16182016 |
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16181918 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
16181917 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
16181881 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 19570957 - 19570624
Alignment:
Q |
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| | | |||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| | |
|
|
T |
19570957 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaac-caagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
19570859 |
T |
 |
Q |
168 |
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266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||| |
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|
T |
19570858 |
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19570760 |
T |
 |
Q |
267 |
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365 |
Q |
|
|
| || ||| ||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||| |||| |||||| |||| | || |||||| |||||||||||| | |
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|
T |
19570759 |
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19570661 |
T |
 |
Q |
366 |
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403 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
19570660 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
19570624 |
T |
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Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Original strand, 13817492 - 13817823
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Q |
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||| | |
|
|
T |
13817492 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgact---aaacaacaacaacaatt |
13817588 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||||||| ||| |
|
|
T |
13817589 |
gatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatatttccacatatacccattttcatacactttgaacatgtaat |
13817687 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| || ||| | ||||||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||| |||||||||||||| | |
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|
T |
13817688 |
tcaactaac-ataattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgtacaattaatcaattca |
13817786 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
13817787 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
13817823 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16934263 - 16934101
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attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| || |
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|
T |
16934263 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatttatgaatacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaaca |
16934165 |
T |
 |
Q |
156 |
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218 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| | || |||| || |||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
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|
T |
16934164 |
acaacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
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Q |
|
|
|||||||||| || |||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |
|
|
T |
11477467 |
accaacaacatcttatttttcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcagcagcaacaacatcaattg |
11477369 |
T |
 |
Q |
169 |
-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
||| || |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |
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|
T |
11477368 |
aaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataattcatcaatt |
11477318 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
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Q |
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aacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||| || |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |
|
|
T |
51961403 |
aacaacaactcatatctcatcatcaaatcatgatttgtgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaacatctcatatcaacaacaacatcaa |
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345 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| | | |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | || | |
|
|
T |
34439433 |
catactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcatttatccataacttcatacct-cataaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcact |
34439335 |
T |
 |
Q |
346 |
tatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |
|
|
T |
34439334 |
tatgaacaattaatcaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
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167 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| | |
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T |
 |
Q |
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gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
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aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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|
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T |
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T |
 |
Q |
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gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
8276022 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
8275972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
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Target Start/End: Original strand, 14284940 - 14285089
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Q |
69 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
168 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| || |
|
|
T |
14284940 |
accaacaacatctcaattcacaccaacat-tcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctgagcaacaacaacatcaattg |
14285038 |
T |
 |
Q |
169 |
-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
14285039 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
14285089 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #73
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Q |
115 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
214 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||| | || || ||||||||||||||| ||||| |||||| | |
|
|
T |
15859262 |
cccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcacc |
15859163 |
T |
 |
Q |
215 |
aatttgagcataatt--caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcataca |
312 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||| || | ||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||| |
|
|
T |
15859162 |
aatt-gagcacaattttcacaacttatcatttgttcata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaaca |
15859066 |
T |
 |
Q |
313 |
taacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
15859065 |
tatcatcacagttggagcacgaatt |
15859041 |
T |
 |
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Q |
104 |
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203 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | || || |||||||||||| | ||||||| | | |||| ||||||||||| || |
|
|
T |
11402602 |
aattatgaacatccaaggtatgaatcatcaacaacaacatatcataacaacaacaacatcaattaaacatgtattcaatcacaaatcaacaacaacctaa |
11402701 |
T |
 |
Q |
204 |
cataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct-catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatg |
302 |
Q |
|
|
|| |||||| | ||||||||| |||||| ||||| | ||| | || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
T |
11402702 |
cacaattcatccatttgagcacaattcacaatatacctatttatacaccccatgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcata |
11402801 |
T |
 |
Q |
303 |
cattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatta |
347 |
Q |
|
|
| ||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
11402802 |
tactcaaacatatcactataatatgagcacgaatttcaacaatta |
11402846 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #75
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| | |||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| |
|
|
T |
13838861 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaa-tatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcc |
13838959 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataa--ttcaacatatatcactttctcatact |
253 |
Q |
|
|
| |||||||| |||||| | || || |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||| || |||| | ||||| || || || | |
|
|
T |
13838960 |
ataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaa-ttgagcacaattttcacaacttatcatttgttccta-t |
13839057 |
T |
 |
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
13839058 |
ttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
13839140 |
T |
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Q |
243 |
tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
8604977 |
tttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattattaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
8605071 |
T |
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Q |
255 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatta |
347 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
38375779 |
tgaacatgcaatttcatctacaacaattcaattatcatcaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaatta |
38375687 |
T |
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
51158118 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
51158035 |
T |
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Q |
273 |
aacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||| | || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
11196384 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatatcatcattattagagcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaatt |
11196293 |
T |
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Q |
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tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaac |
141 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| | |||||| |
|
|
T |
30152893 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat |
30152992 |
T |
 |
Q |
142 |
atcacttagcagcaacaaca |
161 |
Q |
|
|
|| ||| | || |||||||| |
|
|
T |
30152993 |
atgactaaacaacaacaaca |
30153012 |
T |
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Q |
353 |
aattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
34560130 |
aattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaat-aattgaaaaattacactaaa |
34560188 |
T |
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Target: chr3; HSP #82
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Q |
105 |
attatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagc |
204 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | | || |||||||||||| | |||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
38375911 |
attatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacagtatctcatgacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacatagc |
38375812 |
T |
 |
Q |
205 |
ataattca |
212 |
Q |
|
|
| |||||| |
|
|
T |
38375811 |
acaattca |
38375804 |
T |
 |
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| || ||| | |
|
|
T |
6147015 |
caccaacaacatctcatttctccatacaaaatcatgaatcatgaaa-cccaagccatgaattattatcaacaacatgacttaacaacaacagcaacaatt |
6146917 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |
|
|
T |
6146916 |
gaccatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatgattcaccaatt |
6146866 |
T |
 |
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||| | |||||| || ||| | || || |
|
|
T |
17956274 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
17956175 |
T |
 |
Q |
156 |
acaaca |
161 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
17956174 |
acaaca |
17956169 |
T |
 |
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| || |
|
|
T |
18910960 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca |
18911058 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
18911059 |
acaacatcaa |
18911068 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #86
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
12030247 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
12030164 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
14842661 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
14842578 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||| | | |||||||||||||| |
|
|
T |
15936727 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatt |
15936644 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || ||||||||| || ||| |
|
|
T |
53898721 |
caacaacatctcatttctcaacat-aaatcatgaatcttgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacatatcaacaacaacattaattgat |
53898623 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
|||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
53898622 |
catgaaacttatcacaatgcaacaacaacaatgcataattcaccaatt |
53898575 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
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Q |
316 |
catcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
14528102 |
catcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacctaattaagca-cttttcatacaat-aattgaaaa |
14528018 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #91
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Q |
255 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttca |
300 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
12539152 |
tgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattca |
12539107 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #92
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Q |
257 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
17912578 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatt |
17912500 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
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Target Start/End: Original strand, 19862186 - 19862533
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
19862186 |
caccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaatt |
19862285 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
267 |
Q |
|
|
| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19862286 |
gcacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
19862385 |
T |
 |
Q |
268 |
tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattact |
367 |
Q |
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|
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T |
19862386 |
tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcacttact |
19862485 |
T |
 |
Q |
368 |
caattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
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caattaagcacttattcatacaa-caaatgaaaaattacactaaaatga |
19862533 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 48 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 5451134 - 5450769
Alignment:
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146 |
Q |
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||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||| |
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T |
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T |
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Q |
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246 |
Q |
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T |
5451034 |
ttagcaacaacaacatcagttgaacatgaattttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
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T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
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T |
5450934 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaacaatt |
5450835 |
T |
 |
Q |
347 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
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|
T |
5450834 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcatttatttatgcaa-caattgaaaatttacactaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
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Target Start/End: Original strand, 7728378 - 7728741
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Q |
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148 |
Q |
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T |
7728378 |
tcaacccatttttcaaagtcaccaacaacacctcatctctcaccaacaattcatgaattatgcacacccaagcgataaattatcatcaacaacatcactt |
7728477 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
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|||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
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|
T |
7728478 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctc |
7728577 |
T |
 |
Q |
249 |
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348 |
Q |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
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T |
7728578 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatccattcaaatataacttcataattggagtacgaattctaacaattat |
7728677 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
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|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||| |
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|
T |
7728678 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa-caaatgaaaatttacaccaaaa |
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T |
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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
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Target Start/End: Original strand, 3673818 - 3674182
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Q |
|
|
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T |
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atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcgtgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaaccacctcgc |
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T |
 |
Q |
147 |
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246 |
Q |
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|
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T |
3673918 |
ttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttc |
3674017 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
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T |
3674018 |
tcatactttgatcatgaaatttccctaacaacaattcaattatcaacaacttaatgtattcaaacatatcatcataatttgagcacgaattctaacaatt |
3674117 |
T |
 |
Q |
347 |
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413 |
Q |
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T |
3674118 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaa-ttacactaaaa |
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T |
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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
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Target Start/End: Original strand, 432419 - 432758
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Q |
|
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||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
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T |
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432518 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
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T |
432519 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcattttc |
432618 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
|
|
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T |
432619 |
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T |
 |
Q |
347 |
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386 |
Q |
|
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
432719 |
atgatcaattaatcatttactcaattaagcacttattcat |
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T |
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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
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Target Start/End: Original strand, 16595486 - 16595831
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Q |
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|
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|
T |
16595486 |
accaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagtcatgaattatcaataacatcatcatttaacaacatctacatcaattg |
16595585 |
T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
Q |
|
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|||||| ||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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T |
16595586 |
aacatgaatctcaacataattcaacatcaacataacataattca-caatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatgaaattt |
16595684 |
T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
368 |
Q |
|
|
| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
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|
T |
16595685 |
ctctatcaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattagtcaattactc |
16595784 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
16595785 |
aattaagcacttattcatacaat-aattgaaaatttacactaaaatga |
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T |
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|
||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
Q |
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ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
353 |
Q |
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|
T |
28902354 |
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T |
 |
Q |
354 |
attaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacacta |
410 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
T |
28902454 |
attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaattaacacta |
28902509 |
T |
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Q |
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253 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28938649 |
caacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
28938748 |
T |
 |
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
353 |
Q |
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|
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
T |
28938749 |
ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
28938848 |
T |
 |
Q |
354 |
attaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacacta |
410 |
Q |
|
|
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|
|
T |
28938849 |
attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaattaacacta |
28938904 |
T |
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Target: chr5; HSP #9
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Q |
|
|
|||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
21616974 |
tcaacccattttacaaaaccaaccacaacagctcacttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcaacaacaacaatatcactt |
21617073 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |
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|
T |
21617074 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagaacaattcaacatttagagcatagttcaacatataacactttcat |
21617173 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaa-tta |
347 |
Q |
|
|
|||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | | |
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|
T |
21617174 |
atacttggaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactaa |
21617273 |
T |
 |
Q |
348 |
tgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
21617274 |
tgaacaattaatcccttactcaattaagcacttaatcatacaat-aattgaaaaattacactaaa |
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T |
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Target: chr5; HSP #10
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148 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||| || |||||||||| | |||||| || ||| |||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |
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|
T |
21222897 |
tcaacccttttcacaaaaccaataacaacaactgaattctcatcatcaagtcatgatttatgaacactcaatccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
21222798 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
21222797 |
agcaacaacaacattaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattaaacatttagagcataattcaacatataacactttcat |
21222698 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
21222697 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactat |
21222598 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
21222597 |
gaacaattaatcaa-tactcaattaagcacttaatcatacaat-aattgaaaaattacactaaa |
21222536 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
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170 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
23493899 |
caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa |
23493998 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| || |
|
|
T |
23493999 |
catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttcgcatatctcaacatatacctattcttcatactttgaacataaaattcca |
23494098 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
|
|
| || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
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ctaataacaattcaattttccacaacttcatgcattcgaacatgtcatcatagttggagcacgaattctaacaattatgaacaattaattgattactcaa |
23494198 |
T |
 |
Q |
371 |
ttaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
23494199 |
ttaagcacttattcatacaa-caattg-aaatttacactaaaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 49 - 412
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|
|
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|
|
T |
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tcaacccattttacaaaa---ccaacaacaactcatttttcatcatcaaatcctgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcactt |
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T |
 |
Q |
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agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
| || |||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
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aacaacaacaacatcaattaaacatgattctcattacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcataattcacaatatatcactttcac |
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T |
 |
Q |
249 |
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348 |
Q |
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T |
37983522 |
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37983621 |
T |
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Q |
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412 |
Q |
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T |
37983622 |
gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaa-caaatgaaaaattacactaaa |
37983684 |
T |
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Target: chr5; HSP #13
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146 |
Q |
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||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||||| || || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
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T |
23981806 |
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23981708 |
T |
 |
Q |
147 |
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246 |
Q |
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T |
23981707 |
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23981608 |
T |
 |
Q |
247 |
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346 |
Q |
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T |
23981607 |
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23981508 |
T |
 |
Q |
347 |
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403 |
Q |
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T |
23981507 |
atgaacaattaatcaatgcactaaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
23981451 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
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Q |
49 |
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148 |
Q |
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T |
32966436 |
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32966337 |
T |
 |
Q |
149 |
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248 |
Q |
|
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T |
32966336 |
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32966239 |
T |
 |
Q |
249 |
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348 |
Q |
|
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T |
32966238 |
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32966139 |
T |
 |
Q |
349 |
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413 |
Q |
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T |
32966138 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttatttatacaa-caattgaaaattcacactaaaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
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Target Start/End: Original strand, 29917931 - 29918251
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T |
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29918030 |
T |
 |
Q |
157 |
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256 |
Q |
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T |
29918031 |
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29918130 |
T |
 |
Q |
257 |
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356 |
Q |
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T |
29918131 |
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29918230 |
T |
 |
Q |
357 |
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377 |
Q |
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||||| ||| ||||||||||| |
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T |
29918231 |
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Target Start/End: Original strand, 6456580 - 6456921
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Q |
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146 |
Q |
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T |
6456580 |
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6456679 |
T |
 |
Q |
147 |
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246 |
Q |
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T |
6456680 |
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6456779 |
T |
 |
Q |
247 |
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346 |
Q |
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T |
6456780 |
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T |
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Q |
347 |
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391 |
Q |
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T |
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Target Start/End: Complemental strand, 21310854 - 21310632
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T |
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Q |
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392 |
Q |
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T |
21310754 |
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21310656 |
T |
 |
Q |
393 |
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416 |
Q |
|
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|| |||||| |||||||||||||| |
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T |
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216 |
Q |
|
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T |
22885668 |
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22885767 |
T |
 |
Q |
217 |
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316 |
Q |
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T |
22885768 |
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22885867 |
T |
 |
Q |
317 |
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378 |
Q |
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|
T |
22885868 |
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T |
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Target Start/End: Complemental strand, 1168500 - 1168178
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Q |
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|||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||| |
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T |
1168500 |
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1168401 |
T |
 |
Q |
142 |
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240 |
Q |
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T |
1168400 |
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1168302 |
T |
 |
Q |
241 |
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340 |
Q |
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T |
1168301 |
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1168202 |
T |
 |
Q |
341 |
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364 |
Q |
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|
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T |
1168201 |
tcatttatgaacaattaatcaatt |
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T |
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Target: chr5; HSP #20
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Q |
|
|
||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21297322 |
aacaacaacttagcacaattcaacaattttgacataattcaacatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
21297223 |
T |
 |
Q |
291 |
aacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaa |
390 |
Q |
|
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| ||| ||||||| |||| ||||| ||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |
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T |
21297222 |
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21297123 |
T |
 |
Q |
391 |
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414 |
Q |
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T |
21297122 |
-caaatgaaaaattacactaaaat |
21297100 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #21
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156 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | |||||||||||| || ||| || |
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|
T |
19405503 |
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19405602 |
T |
 |
Q |
157 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatacttt |
255 |
Q |
|
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||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |
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T |
19405603 |
caatatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacgaatcataattcaactaattgagcatattttcaacatatacccttttctcatacttt |
19405702 |
T |
 |
Q |
256 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
355 |
Q |
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|||||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| | || |||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||| |
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T |
19405703 |
gaacatgaaattcaactaacaataattcaattatccataacttcatacattcaaatatgtcatcataattagagcataaatttcatcatttatgaacaat |
19405802 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
19405803 |
taatcaattcacccaattaagcacttattcatacaat-aattgaaaa |
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T |
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Q |
|
|
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|
T |
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T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |
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T |
24084133 |
ttagcaacaacaacatcaattaaacatgattcacatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttc |
24084232 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
|
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|||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||| | |||||||| | ||||| |
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|
T |
24084233 |
acatactatgaacatgtaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagggcacgaatgtcaccaatt |
24084332 |
T |
 |
Q |
347 |
-atgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| ||| |||||||||||| || |||| |||| |
|
|
T |
24084333 |
aatgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
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Target Start/End: Complemental strand, 11337455 - 11337121
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|
|
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T |
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T |
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Q |
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gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
11337356 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaaat-gagcatattttcaacatttaccatattctcatactttgaacatgtaat |
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T |
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Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
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Q |
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|
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T |
11337257 |
tcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaaccaattca |
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T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
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|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
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|
T |
11337157 |
tccaattaagcacttattcatacaat-aattgaaaatt |
11337121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26560096 - 26559774
Alignment:
Q |
57 |
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156 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||| ||||| || || || ||| || |||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||| ||||||| ||| |
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|
T |
26560096 |
ttttacaaaaccaataacaacaacttatttcacatcacaaattcacgatttatgaacacccaagccaagaatcatcaccaacaatatctcttagcaacaa |
26559997 |
T |
 |
Q |
157 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg |
256 |
Q |
|
|
||||||||| | ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| || |
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|
T |
26559996 |
caacatcaattaaacataattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatg |
26559897 |
T |
 |
Q |
257 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga-acaat |
355 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |
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|
T |
26559896 |
aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatataatcatagcaagagcacgaatttcaacaactatgattaaaa |
26559797 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
|||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
26559796 |
taatcatttattcaattaagcac |
26559774 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Original strand, 20712056 - 20712387
Alignment:
Q |
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170 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | ||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |
|
|
T |
20712056 |
caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgat |
20712155 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataat-tcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |
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|
T |
20712156 |
catgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattatcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca |
20712254 |
T |
 |
Q |
270 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
368 |
Q |
|
|
| ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||| |
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|
T |
20712255 |
atcaacaacaattcagttatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatt-tcatcattatgaacaattaatcaattcactc |
20712353 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
20712354 |
aattaagca-cttttcatacaagtaattgaaaatt |
20712387 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 337
Target Start/End: Original strand, 21109758 - 21109996
Alignment:
Q |
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198 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||||||||| | |||||| |||| | |||| |||||||||| |
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|
T |
21109758 |
tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaataacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaa |
21109857 |
T |
 |
Q |
199 |
catagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaactt |
298 |
Q |
|
|
|||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || |
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|
T |
21109858 |
cataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattattaccaattt |
21109957 |
T |
 |
Q |
299 |
catgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| |
|
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T |
21109958 |
catgtactcaaacatatcatcagaacaagagcacgaatt |
21109996 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 403
Target Start/End: Original strand, 23466552 - 23466747
Alignment:
Q |
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305 |
Q |
|
|
|||||||| | ||||||||| ||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |
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|
T |
23466552 |
aattcaaccaattgagcatatttcaacatacaccatttttctcatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcat-aacttcttacat |
23466650 |
T |
 |
Q |
306 |
tcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
23466651 |
acaaacatgttgccataattggagcacgaattctaataattatgaacaattaatcaattacacaattaatcacttattcatacaat-aattgaaaatt |
23466747 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23234776 - 23234486
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Q |
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146 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | ||||| || || || |||||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
T |
23234776 |
atcaacctattttcacaaaaccaacaacaacaatttatttcacatcacaaactcatgatttatgaaaactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
23234677 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
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||| || ||||||||||| | |||||| |||| | || | |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||| |
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T |
23234676 |
ttaacaataacaacatcaattaaacatgattctcatcactaatcaacaacaaaatagcacaattcaataattagagcacaattcacaatatatcattttc |
23234577 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
23234576 |
acatactataaacatgcaattacaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtacttaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
23234486 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16835590 - 16835314
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Q |
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atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || |||||||| || | ||| || || || |||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
16835590 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacagcttaattcacatcacaaactcatgatttatgaacatccaagctatgaatcatcaacaacaacatctc |
16835491 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
||| || ||||||||| || | |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| ||||| | |||| |
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|
T |
16835490 |
ttaacaacaacaacattaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcgacaattagagcacaattcacaatatactattttc |
16835391 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
|
|
|||| | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| | || ||||| |||||||| |
|
|
T |
16835390 |
acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaaatcaattatcaccaatttcatgtacccaaacatatcatcataa |
16835314 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 403
Target Start/End: Original strand, 11583984 - 11584366
Alignment:
Q |
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122 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||| |
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|
T |
11583984 |
tcatcaaaaacaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccacgaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaaacccaagcc |
11584082 |
T |
 |
Q |
123 |
atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaatt---caacaacaacatagcataattcaacaattt |
219 |
Q |
|
|
|||||| || | |||| | || ||| | || |||||||| | | ||| |||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || |
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T |
11584083 |
atgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcaacaacaacaacaaagcataattcaccaa-tt |
11584181 |
T |
 |
Q |
220 |
gagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacat |
318 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| | |||| | |||| |||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| || | || ||| |
|
|
T |
11584182 |
gagcatattttcaacatatacccttttcatacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaatatgtcat |
11584281 |
T |
 |
Q |
319 |
cataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||| | ||||||||||| | || | ||||||||||||| |||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
11584282 |
cataaatagagcacgaatttcaccactcatgaacaattaattaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
11584366 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24183286 - 24183069
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Q |
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282 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| | |||| | |||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
T |
24183286 |
acaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatacccttttcatacactttgaacatgtaattcgactaacaacaatt |
24183188 |
T |
 |
Q |
283 |
caattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaccta |
381 |
Q |
|
|
|||||||| | ||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || |||||||||| || |
|
|
T |
24183187 |
caattatccatgacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagca-ctt |
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T |
 |
Q |
382 |
ttcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
24183088 |
ttcatacaaataattgaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 347
Target Start/End: Original strand, 23417198 - 23417498
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Q |
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146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | | | |
|
|
T |
23417198 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatacctc |
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T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-acttt |
245 |
Q |
|
|
|| || |||||||||||| | |||||| | | || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||| | | ||| |
|
|
T |
23417297 |
ataacaacaacaacatcaattaaacatgaatgtcaccacaaatcaacaacaacatagcacaattcagcaattagagcacaattcacaatataccaatttt |
23417396 |
T |
 |
Q |
246 |
ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaat |
345 |
Q |
|
|
| |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
T |
23417397 |
cacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaatcatcaccaaattcatgtactcaaacaaatcatcataacaagagcacgaatttcaacaat |
23417496 |
T |
 |
Q |
346 |
ta |
347 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
23417497 |
ta |
23417498 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 109155 - 108960
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122 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
109155 |
tcatcaaaatcaaacttcttctctatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagcc |
109057 |
T |
 |
Q |
123 |
atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
|| | |||| | ||||||||| || |||| |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
T |
109056 |
ataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Original strand, 16105576 - 16105771
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Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcc |
122 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| || ||||| |
|
|
T |
16105576 |
tcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacctaagcc |
16105674 |
T |
 |
Q |
123 |
atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
|| | |||| | ||||||||| || |||| |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
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|
T |
16105675 |
ataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Original strand, 21397066 - 21397404
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Q |
68 |
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166 |
Q |
|
|
|||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || ||| |||| |||| |
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T |
21397066 |
caccaagaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaataacaacaaca |
21397165 |
T |
 |
Q |
167 |
--tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatg |
262 |
Q |
|
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||| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||| |
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|
T |
21397166 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatg |
21397264 |
T |
 |
Q |
263 |
aaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaa |
362 |
Q |
|
|
|||| || |||| |||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| |
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T |
21397265 |
taattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaa |
21397363 |
T |
 |
Q |
363 |
tt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
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T |
21397364 |
ttcatccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Original strand, 28261498 - 28261828
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Q |
68 |
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167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | || |||||| ||| | || |||||||| ||| | |
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T |
28261498 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcagcaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
28261597 |
T |
 |
Q |
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gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
267 |
Q |
|
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T |
28261598 |
gatcataaaacatatcacaatttatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcacacatat----ttttcatactttgaacatacaatt |
28261692 |
T |
 |
Q |
268 |
tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-ac |
366 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||| || | |||||||| ||| | |||| |||||||| | ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
28261693 |
caactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataactagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcat |
28261792 |
T |
 |
Q |
367 |
tcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
28261793 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
28261828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
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Target Start/End: Original strand, 7528879 - 7529028
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Q |
69 |
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168 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| || |
|
|
T |
7528879 |
accaacaacatctcaattcacaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg |
7528977 |
T |
 |
Q |
169 |
-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
7528978 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
7529028 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Original strand, 21906697 - 21907011
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| |||| | |||||||||||| | |
|
|
T |
21906697 |
caccaacaacatttcatttctcagccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactt---aacaacaacatcaatt |
21906793 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
267 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||| || |||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
21906794 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcatcaa-ttgaacata-----------------ttttcatactttgaacatgtaatt |
21906875 |
T |
 |
Q |
268 |
tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-ac |
366 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||| | |||||||| | | |||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| || |
|
|
T |
21906876 |
caaccaacatcaattcaattatccataacttcatatgtctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcac |
21906975 |
T |
 |
Q |
367 |
tcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
21906976 |
ccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
21907011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
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Target Start/End: Complemental strand, 24225632 - 24225431
Alignment:
Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccatttt-ac-aaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaat-catgaattatgaactcccaag |
120 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||| | || || | |||||| |||| ||||||||| |||||| |
|
|
T |
24225632 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaatcctcaacaacaacttaaatcacatc-acaaatccatg-attatgaacacccaag |
24225535 |
T |
 |
Q |
121 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg |
220 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||| ||| | || || ||| |||||||| | |||||| | || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
24225534 |
ttatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaataacatcaattaaacatgaattccaccacaaatcaacaacaaaatagcacaattcaacaattag |
24225435 |
T |
 |
Q |
221 |
agca |
224 |
Q |
|
|
|||| |
|
|
T |
24225434 |
agca |
24225431 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #40
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Query Start/End: Original strand, 68 - 174
Target Start/End: Original strand, 23466434 - 23466540
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
23466434 |
caccaacaacatatcattcctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaactatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaatt |
23466533 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatg |
174 |
Q |
|
|
|| |||| |
|
|
T |
23466534 |
gatcatg |
23466540 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #41
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Target Start/End: Original strand, 4865418 - 4865574
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Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || || |
|
|
T |
4865418 |
tcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccattt |
4865517 |
T |
 |
Q |
347 |
atgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
4865518 |
atgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
4865574 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #42
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || || |||| || |
|
|
T |
9730672 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaatatgtctcagcaaca |
9730574 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
9730573 |
acaacatcaa |
9730564 |
T |
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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
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Target Start/End: Original strand, 24475560 - 24475850
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||| | |
|
|
T |
24475560 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgact---aaacaacaacaacaatt |
24475656 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| | || |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || ||| ||| || |||| | |||||||||||| ||| |
|
|
T |
24475657 |
gatcatgaaacata--acaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatacccattttcatacactttgaacatgtaat |
24475753 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
| || ||| ||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24475754 |
tcaactaac-acaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaatt |
24475850 |
T |
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Target: chr5; HSP #44
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Q |
115 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
214 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||| |||||| | |
|
|
T |
22054071 |
cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcacc |
22053972 |
T |
 |
Q |
215 |
aatt |
218 |
Q |
|
|
|||| |
|
|
T |
22053971 |
aatt |
22053968 |
T |
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Target: chr5; HSP #45
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
T |
23507128 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatt |
23507211 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #46
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Target Start/End: Complemental strand, 18531166 - 18531084
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Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
18531166 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
18531084 |
T |
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Target: chr5; HSP #47
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Query Start/End: Original strand, 123 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18531297 - 18531202
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Q |
123 |
atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
|||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
18531297 |
atgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt |
18531202 |
T |
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Target: chr5; HSP #48
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Target Start/End: Original strand, 19873824 - 19873927
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Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
||||||||||| | ||| || || || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | || |
|
|
T |
19873824 |
caacaacaacttaattcacatcacaaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
19873923 |
T |
 |
Q |
171 |
catg |
174 |
Q |
|
|
|||| |
|
|
T |
19873924 |
catg |
19873927 |
T |
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Target: chr5; HSP #49
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Q |
69 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact- |
167 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| | |
|
|
T |
17909485 |
accaacaacatcttatttctcacc-accaatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtcgcatcagcaacaacatcaatta |
17909582 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
T |
17909583 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt |
17909633 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr5; HSP #50
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Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 2031787 - 2031880
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca |
161 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | |||||| || ||| | || |||||||| |
|
|
T |
2031787 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaaca |
2031880 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #51
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Q |
264 |
aatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
19873934 |
aatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
19874007 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #52
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Query Start/End: Original strand, 184 - 301
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Q |
184 |
acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactt--tgaacatgaaatttcaccaacaacaat |
281 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| | ||| | | || | |||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
T |
11763659 |
acaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatacccatttat-acacctcatgaacatgaaatttcatcaacatcaac |
11763561 |
T |
 |
Q |
282 |
tcaattatcaacaacttcat |
301 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| ||||| |
|
|
T |
11763560 |
tcaattatcatcaaattcat |
11763541 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #53
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Q |
57 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagc |
121 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
22882391 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcaacatcaattcatgatttatgaacacccaagc |
22882455 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatca |
320 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
29188372 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
29188306 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #55
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Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
T |
34939441 |
ttgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatt |
34939523 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #56
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Q |
43 |
tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccat |
124 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
T |
11342635 |
tcataatcaacccattttcaccaagacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccat |
11342717 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| || |
|
|
T |
10778259 |
atttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca |
10778161 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
10778160 |
acaacatcaa |
10778151 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 172
Target Start/End: Original strand, 34939303 - 34939360
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Q |
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172 |
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|
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T |
34939303 |
cccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaaca |
34939360 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:
Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
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Target Start/End: Original strand, 35444 - 35802
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Q |
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attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
35444 |
attttacaaaaccaccaaca-caactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca |
35542 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
255 |
Q |
|
|
| |||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35543 |
aaaacatcaattgaacatgactcttaccacatttcaacaacaacatagcataaatcaacaatttgagtataattcaacatatatcactttctcatacttt |
35642 |
T |
 |
Q |
256 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
355 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || | |||||||| |
|
|
T |
35643 |
gaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaattataagaactttgaacaat |
35742 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
35743 |
taatcttttactcaattaagcacctattcatacaa-caattgaaaaattacactaaaatga |
35802 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0243 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:
Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 48 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2264
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
T |
2607 |
atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaaacatgaattatgaacgcccaagccatgaatcatcatcaacaacatcac |
2508 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
|||| | |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
2507 |
ttaggaacaacaacatcaattgaacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacatatgtcactttc |
2408 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
2407 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaataatt |
2308 |
T |
 |
Q |
347 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaa |
390 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
2307 |
atgattaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa |
2264 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:
Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 52 - 413
Target Start/End: Original strand, 6622 - 6981
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Q |
52 |
acccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagc |
151 |
Q |
|
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
6622 |
acccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaaaacatcacttagg |
6721 |
T |
 |
Q |
152 |
agcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcata |
251 |
Q |
|
|
|| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6722 |
agtaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatagcatagcataattcaacaatttgagcaaaattcaacatatatcactttctcata |
6821 |
T |
 |
Q |
252 |
ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaa |
351 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| | |||| |
|
|
T |
6822 |
ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaattataacaact-tgaa |
6920 |
T |
 |
Q |
352 |
caattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6921 |
caattaatcatttacacatttaagcatttattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaa |
6981 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0053 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:
Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 56 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 77129 - 76770
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |
|
|
T |
77129 |
atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcacttagcaaca |
77030 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
255 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
77029 |
acaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgaacataattcaacatatatcactttctcatacttt |
76930 |
T |
 |
Q |
256 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
355 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||| |
|
|
T |
76929 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaatttcatcatctatgaacaat |
76830 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
76829 |
tactcaattactcaattaagtacttaatcatacaat-aattgaaaaattacactaaaatga |
76770 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 49 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 103211 - 102848
Alignment:
Q |
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148 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| || | |||||||||||||| |
|
|
T |
103211 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcactt |
103112 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|| | ||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||| ||||||||| |
|
|
T |
103111 |
agaaacaataacatcaattgaacatgaatgttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaaatttagcatattccaccatataccactttctc |
103012 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
103011 |
atactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattat |
102912 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
102911 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatttacacaaaaa |
102848 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 69 - 365
Target Start/End: Original strand, 109568 - 109864
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Q |
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168 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
109568 |
accaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcgtgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaactg |
109667 |
T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
Q |
|
|
| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
109668 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcaaaattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttaaacatgaaattt |
109767 |
T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatta |
365 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
109768 |
cattaacaacaattcaattatcaacaacttcatggattcaaacatatcatcatacttggatcacgaattctaacaattatcatcaattaatcaatta |
109864 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 112812 - 112519
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || | |
|
|
T |
112812 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatga---attatcaacaacatgacttaacaacaacaacataaatt |
112716 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
112715 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataattc-actaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaat |
112617 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
| || ||||||||||||||| | | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
112616 |
tcaactaacaacaattcaattgttcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt |
112519 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 378
Target Start/End: Original strand, 131931 - 132101
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Q |
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306 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | |
|
|
T |
131931 |
aattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactacgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtact |
132030 |
T |
 |
Q |
307 |
catacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || || || |||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
132031 |
caaacatatcatcataacaagagcacgaattttaacaacta-gagaaaataatcacttactcaattaagcac |
132101 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 68248 - 67972
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Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||| |||||| ||||||||| || ||||| ||| | |
|
|
T |
68248 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacaaccaagctatgaatcatcaaaaacaatatctc |
68150 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcacttt |
245 |
Q |
|
|
| || |||||||||||| | |||||| ||| || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||| |
|
|
T |
68149 |
atgacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatacccatttt |
68050 |
T |
 |
Q |
246 |
ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
|
|
| |||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| | | | ||||| |||||||| |
|
|
T |
68049 |
cacatattatgaacatgcaatttcatctacaacaattcaattatcaccaaattcatgtacttaaacatatcatcataa |
67972 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 194
Target Start/End: Original strand, 131816 - 131939
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Q |
71 |
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170 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || || |||| || |||||||| ||| | | |
|
|
T |
131816 |
caacaagaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaaaaatatttcttaacaacaacaacaacaattaag |
131915 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaaca |
194 |
Q |
|
|
|||| |||| | ||||||||||| |
|
|
T |
131916 |
catgattctcatcacaattcaaca |
131939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 4)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 56 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 7307 - 6948
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
7307 |
attttacaaaaccatcattcacaactcatttctcatcaacaattcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagca |
7208 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
255 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
7207 |
acaacatcaattgaacatgattcttatcacaatccaataacaacataacataattaaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
7108 |
T |
 |
Q |
256 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
355 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
7107 |
gaacattaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttgacaattatgaacaac |
7008 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
7007 |
aaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacg-attgaaaaattacattaaaatga |
6948 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8415 - 8333
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Q |
115 |
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197 |
Q |
|
|
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|
|
T |
8415 |
cccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaaca |
8333 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
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74 |
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170 |
Q |
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T |
11730 |
caacatcttatttctcaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcat-aacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattgaa |
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T |
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8197 |
T |
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T |
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T |
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agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
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T |
69515 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac |
69614 |
T |
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Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
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T |
69615 |
atactttaaacatgcaatttcacctacaacaattcaattataaccaatttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat |
69714 |
T |
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Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
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T |
69715 |
gaacaattaatcactttctcaattaagcacttaatcatacaat-aattgaaaaattacactaaa |
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T |
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Target: scaffold0010; HSP #1
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|
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T |
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T |
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Q |
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agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
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|||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| | |
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T |
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agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaagaacatagcacaattcaacatttaaagcataattcaacatataacactttcac |
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T |
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Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
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||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |
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T |
31178 |
atactatgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaactat |
31277 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
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|
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||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |
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T |
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gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaat-aattgaaaaattacactaaa |
31340 |
T |
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Target: scaffold0080; HSP #1
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Q |
|
|
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T |
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tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
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T |
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Q |
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agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
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|||| |||||||||||| | |||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||| ||| || || | ||||||||||||||||||||| |
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T |
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agcaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaatttgacatttagaacccaattcaacatatatcactttcat |
43888 |
T |
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Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
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T |
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atcctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattagagcattaattttaacaactat |
43788 |
T |
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Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
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||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |
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T |
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gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaa-caattgaaaaattacactaaa |
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T |
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T |
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246 |
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||| || ||||||| |||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |
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T |
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23764 |
T |
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Q |
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T |
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T |
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atgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaat |
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|
|||||||| |||||||||| |||| ||||||| || |||| |||| |
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Target: scaffold1272; HSP #1
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|
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|
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T |
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acccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcacttagc |
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T |
 |
Q |
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251 |
Q |
|
|
| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
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T |
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aacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatttgagcaaaattcaa---------------cata |
454 |
T |
 |
Q |
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ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaa |
351 |
Q |
|
|
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|
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T |
455 |
ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaatataattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattataggacgaattataacaact-tgaa |
553 |
T |
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Q |
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caattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
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caattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaa |
614 |
T |
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Target: scaffold0700; HSP #1
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Q |
|
|
||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
2483 |
tcaacccattttagaaaaccaacaacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
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T |
 |
Q |
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agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
2583 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcat |
2682 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |
|
|
T |
2683 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat |
2782 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||| |||||| || ||| || ||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
T |
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gaacaattaatcacttactgaattaatcatctaatcttacaa-caaatgaaaaattacactaaa |
2845 |
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Target: scaffold0521; HSP #1
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Q |
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|
||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
11074 |
caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatctatgaacacctaagccatgaatcataaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaa |
11173 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| |||| | | ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11174 |
catggttctcatcataattcaacaacaagatagcatatttcaactatttgagcataattcaacatatatcactttcacacactttgaacatgaaatttca |
11273 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaa-ttctaacaattatgaacaattaatcaattactca |
369 |
Q |
|
|
| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
11274 |
caaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggaacatgaatttttaacaattatgaacaattaatcatctactca |
11373 |
T |
 |
Q |
370 |
attaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
11374 |
attaagcacttattcatacaat-aattgaaaaattacactaaa |
11415 |
T |
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Target: scaffold0095; HSP #1
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Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
T |
33996 |
accaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg |
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T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
Q |
|
|
| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
33897 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcatatttcaacatataacacttcttcatactttaaacatgaaattc |
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T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
368 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
33797 |
cactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
33698 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
33697 |
aattaagcatttattcatacaa-caattg-aaatttacactaaaa |
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Target: scaffold0025 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 5)
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Target: scaffold0025; HSP #1
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Q |
|
|
|||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
53305 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacacgtcaattctcatcatcaaatcatgattaatga-ctcccaagccatgaatcattaacaacaatgtcactt |
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T |
 |
Q |
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agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
|
|
|||| |||||||||| | |||||||| ||| | |||||||| |||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| ||| | |
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|
T |
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agcaacaacaacatccattgaacatgaatctcatcacaattcatcaacaaaatagcataattgaacatttagagcataattcaacatataacaccttcac |
53503 |
T |
 |
Q |
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atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
|
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T |
53504 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcattattagagcatgaattctaacaactat |
53603 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
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Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
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Target: scaffold0025; HSP #2
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|
|
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T |
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T |
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tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
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|
|
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atgaacaattaatcaattactcaattaagca |
377 |
Q |
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|
||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
85788 |
atgaacaattaatcacttattcaattaagca |
85818 |
T |
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Q |
|
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||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |
|
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T |
146581 |
caacaacaacttatttcacaaaaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatgcataacatcacttaacaacaacaacatctattgat |
146680 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
|
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|||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |
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|
T |
146681 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca |
146779 |
T |
 |
Q |
270 |
accaacaacaattcaattat |
289 |
Q |
|
|
|| ||||||| ||||||||| |
|
|
T |
146780 |
actaacaacagttcaattat |
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T |
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Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
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T |
9013 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatt |
9095 |
T |
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Target: scaffold0025; HSP #5
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Q |
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337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||| |||| |
|
|
T |
148884 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatt |
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T |
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Target: scaffold0092 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
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Target: scaffold0092; HSP #1
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168 |
Q |
|
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|||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| | | | |||||||||||||||| || ||||||||| || |
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|
T |
3297 |
accaactacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacatcaacatcaattg |
3396 |
T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
Q |
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| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
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T |
3397 |
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3496 |
T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
368 |
Q |
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| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3497 |
ctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
3596 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
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|||||||||| |||||||||||| |
|
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T |
3597 |
aattaagcacttattcatacaat |
3619 |
T |
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Target: scaffold0032 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
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148 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| || | |||||||||||||| |
|
|
T |
94061 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacatctcatttctcaccaacaaatcatgaattatgttcacccaaatcatgaattatcatcaacaacatcactt |
93962 |
T |
 |
Q |
149 |
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248 |
Q |
|
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| | ||||||||||| |||||||| | | | |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || |||||| |
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T |
93961 |
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93863 |
T |
 |
Q |
249 |
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347 |
Q |
|
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T |
93862 |
atactttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattatcaaaaacttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaatttctaacagtta |
93763 |
T |
 |
Q |
348 |
tgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattc |
384 |
Q |
|
|
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|
|
T |
93762 |
tgaacaattaataatttacccaattaagcacttattc |
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T |
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Target: scaffold0032; HSP #2
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170 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |
|
|
T |
104889 |
caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt-aa |
104791 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
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|||| || | | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | || || || |||||||||||| || || |||| |
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T |
104790 |
catggttatcatcataattcaacaacaacataacataattcaaccatttgagcataattcataagttagcatttatacatactttgaacctgcaaattca |
104691 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
|
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T |
104690 |
ccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttagagcatgaattttaacatctatgaacaattaatcacttactcaa |
104591 |
T |
 |
Q |
371 |
ttaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
104590 |
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104550 |
T |
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Name: scaffold0031
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Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
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Target Start/End: Complemental strand, 97487 - 97125
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148 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||| || |
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T |
97487 |
tcaacccattttacaaaaccaataacaacaactcaattcttatcatcaaatcatgatttatgaaaacccaaggcatgaatcatcaacaataatatcaatt |
97388 |
T |
 |
Q |
149 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
248 |
Q |
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|| | |||||| ||||| |||||||| ||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| | |
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T |
97387 |
agtaacaacaatatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaccaacatagcataattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac |
97288 |
T |
 |
Q |
249 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattat |
348 |
Q |
|
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T |
97287 |
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97188 |
T |
 |
Q |
349 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
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|
T |
97187 |
gaacaattaatcactcactcaattaaacactaaatcatacaat-aattgaaaaattacactaaa |
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T |
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Target: scaffold0031; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 31010 - 31352
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Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||| || | ||| ||| |||| || |||||| |
|
|
T |
31010 |
ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccataaattatcatcaaaaacctcacatatcagcaa |
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T |
 |
Q |
157 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatacttt |
255 |
Q |
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|
|
T |
31110 |
caacatcaattaatcatgaaacttatcacaattcaacaactaca-aacataacttaacaaattgagcatattttcaacatataccattttcttatacttt |
31208 |
T |
 |
Q |
256 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
355 |
Q |
|
|
||||||| |||| || ||| |||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |
|
|
T |
31209 |
gaacatg-aattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaaa |
31307 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
||||||||| || |||||||||| || |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
31308 |
taatcaattcacccaattaagca-cttttcatacaat-aattgaaaa |
31352 |
T |
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Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 391
Target Start/End: Original strand, 70657 - 70913
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Q |
|
|
||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| || |||| |
|
|
T |
70657 |
caacaacatcatatatcagcaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaaccaattaagcatattttcaac |
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T |
 |
Q |
234 |
atatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacg |
333 |
Q |
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|
|||| || |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
70757 |
atattccattttctcatactttgaacatgaa-ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgacatcataattagagcacg |
70855 |
T |
 |
Q |
334 |
aattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
|||| | || |||| ||| |||||| |||| || |||||||||| || |||||||||| |
|
|
T |
70856 |
aatttcatcatttataaactattaattaattcacccaattaagca-cttttcatacaat |
70913 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
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Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
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Q |
|
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |
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|
T |
197545 |
tcaacccattttacaaaactaacaacaacaacaactcaattctcatcatcaaagcatgatttatgaagacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatca |
197446 |
T |
 |
Q |
146 |
cttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt |
245 |
Q |
|
|
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|
|
T |
197445 |
cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacataggacaattcaacatttagagcataattcaacttataacacttt |
197346 |
T |
 |
Q |
246 |
ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaat |
345 |
Q |
|
|
| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| | |||| |
|
|
T |
197345 |
cacatactttgaacttgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatacattcaaacatatcatcataattagagcccgaaattcaacatc |
197246 |
T |
 |
Q |
346 |
tatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
T |
197245 |
taagaacaattaatcacttatccaattaagcacttaatcatacaa-caaatgaaaaattacactaaa |
197180 |
T |
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Target: scaffold0480 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:
Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
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Target Start/End: Complemental strand, 9152 - 8820
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
9152 |
caccgacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt |
9053 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
267 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
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T |
9052 |
gatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatatatcaacatatatcattttctcatactttgaacatgaaatt |
8953 |
T |
 |
Q |
268 |
tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaa-ttac |
366 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| || | |
|
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T |
8952 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattttc |
8853 |
T |
 |
Q |
367 |
tcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaa |
400 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
8852 |
ccaattaagcacttattcatacaat-aattgaaa |
8820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5516 - 5182
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167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
5516 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt |
5417 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| | || |||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||| || || ||| | | |||| | |||||||||||| ||| |
|
|
T |
5416 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcctaattcaccaa-ttgagcatattttcgcacatacctattttcatacactttgaacatgtaat |
5318 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| || ||| ||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
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|
T |
5317 |
tcaactaac-acaattcaattattcataacttcatacatctaaacatctcatcataataagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
5219 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
5218 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
5182 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:
Target: scaffold0123; HSP #1
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Q |
|
|
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|
T |
7994 |
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8093 |
T |
 |
Q |
175 |
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274 |
Q |
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T |
8094 |
gttctcatcataattccacaacaacatagcataattcacccaattgagcataaatcataagttagcacttatacatactttgaacatgcaaattcaccaa |
8193 |
T |
 |
Q |
275 |
caacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaa |
374 |
Q |
|
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T |
8194 |
caacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaa |
8293 |
T |
 |
Q |
375 |
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416 |
Q |
|
|
||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
8294 |
tcacttattcatacaat-aattgaaaaattacattaaaatga |
8334 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 364
Target Start/End: Original strand, 21445 - 21784
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123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
T |
21445 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagcca |
21544 |
T |
 |
Q |
124 |
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223 |
Q |
|
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||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| | | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |
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|
T |
21545 |
tgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaaataatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagc |
21643 |
T |
 |
Q |
224 |
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322 |
Q |
|
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||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||| ||||||| |
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T |
21644 |
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21742 |
T |
 |
Q |
323 |
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364 |
Q |
|
|
||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21743 |
attagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt |
21784 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 401
Target Start/End: Original strand, 31144 - 31519
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Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcca |
123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
T |
31144 |
tcatcaaaatcaaactttttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagcca |
31243 |
T |
 |
Q |
124 |
tgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagc |
223 |
Q |
|
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||||| || | ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| |
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T |
31244 |
tgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaaaaacatcaattgataatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagtataatttaccaa-ttgagc |
31342 |
T |
 |
Q |
224 |
ata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcata |
322 |
Q |
|
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||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||| ||||||| |
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T |
31343 |
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31441 |
T |
 |
Q |
323 |
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401 |
Q |
|
|
||| || || ||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
31442 |
attagatcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagca-cttttcatacaat-aattgaaaa |
31519 |
T |
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Target: scaffold0028 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
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Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 71 - 414
Target Start/End: Original strand, 79519 - 79861
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Q |
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170 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
79519 |
caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa |
79618 |
T |
 |
Q |
171 |
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270 |
Q |
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T |
79619 |
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79718 |
T |
 |
Q |
271 |
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370 |
Q |
|
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||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||| || | ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||| |
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T |
79719 |
ccaccaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattttagcatctatgaacaattaatcatttatccaa |
79818 |
T |
 |
Q |
371 |
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414 |
Q |
|
|
|||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
79819 |
ttaatcacttattcatacaat-aattgaaaaattacactaaaat |
79861 |
T |
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Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Original strand, 130489 - 130684
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Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcc |
122 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
130489 |
tcatcaaaatcaaacttcttctttattaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagcc |
130587 |
T |
 |
Q |
123 |
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218 |
Q |
|
|
|| | |||| | ||||||||| || | || |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
T |
130588 |
ataattcataatcaacaacatatctcaacaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
130684 |
T |
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Target: scaffold0028; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 253 - 337
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Q |
253 |
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337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || | ||| ||||| | |||||||||||||| |
|
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T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatt |
89471 |
T |
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Target: scaffold0077 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
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Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
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Target Start/End: Original strand, 6500 - 6860
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146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
T |
6500 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacctaagccatgaatcatcaacaacaatatctc |
6599 |
T |
 |
Q |
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246 |
Q |
|
|
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T |
6600 |
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6699 |
T |
 |
Q |
247 |
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346 |
Q |
|
|
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|
T |
6700 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaattccatgtatttaaacatatcaccataattagaacacaaatttcatcaact |
6799 |
T |
 |
Q |
347 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacac |
408 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| ||| |||||||||||| || |||| |||| || |||||| |||||| |
|
|
T |
6800 |
atgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaa-tgaaaaattacac |
6860 |
T |
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Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
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Target Start/End: Complemental strand, 15625 - 15445
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282 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||| | | ||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
T |
15625 |
acaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcacacatacccatttttttatactttgaacatacaattcaactaacaacaatt |
15527 |
T |
 |
Q |
283 |
caattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
||||| || | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15526 |
caattgtccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaatt |
15445 |
T |
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Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 37013 - 36930
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Q |
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Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
37013 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
36930 |
T |
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Target: scaffold0589 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 2)
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Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
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300 |
Q |
|
|
|||||||||| || | ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
T |
7915 |
tagcataattggaccaattgagcatattttcacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttca |
8014 |
T |
 |
Q |
301 |
tgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
8015 |
tgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaaatatgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaat |
8105 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 69 - 165
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Q |
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accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| | | | |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
7812 |
accaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaa |
7908 |
T |
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Target: scaffold1867 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
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Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
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tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcca |
123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
T |
78 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcagcaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagcca |
176 |
T |
 |
Q |
124 |
tgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagc |
223 |
Q |
|
|
||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |
|
|
T |
177 |
tgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttgagc |
275 |
T |
 |
Q |
224 |
ata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcata |
322 |
Q |
|
|
||| ||||||||||| | |||| | |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| ||||||| |
|
|
T |
276 |
atattttcaacatatacccttttcatacacttgaaacatgaatttcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcata |
375 |
T |
 |
Q |
323 |
attggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
376 |
attagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
456 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
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Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 71 - 401
Target Start/End: Original strand, 5920 - 6251
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Q |
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
5920 |
caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa |
6019 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatca-ctttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
Q |
|
|
|||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6020 |
catgaatattatcacaattcaacaaccacatagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatataccatttttctcatactttgaacatgaaattc |
6119 |
T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-act |
367 |
Q |
|
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|||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| |||| | |||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || |
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|
T |
6120 |
taccaacaacaatccaattatccataacttcatacattcaaacatgtcgtcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
6219 |
T |
 |
Q |
368 |
caattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
||||||||| || |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
6220 |
aaattaagca-cttttcatacaat-aattgaaaa |
6251 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0970 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
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Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 390
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atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
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Q |
|
|
||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
2411 |
atcaacctattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaataaggaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcac |
2510 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||||| | | || || ||||||||| ||||||||||| |||| |
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T |
2511 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatatcataaattatcatttagagcataatataacatatatcattttc |
2610 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
|
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T |
2611 |
atacactttgatcattcaatttctccaacaaccaaccaattatcaccaatttctcacatacaaacataccatcataataggagcacgaattctaataatc |
2710 |
T |
 |
Q |
347 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaa |
390 |
Q |
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|
T |
2711 |
atgaccaattaatcaattactcaataaagcacttactcatacaa |
2754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 68 - 400
Target Start/End: Original strand, 11664 - 11997
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167 |
Q |
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T |
11664 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataaccaagccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacatcaatt |
11763 |
T |
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Q |
168 |
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266 |
Q |
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T |
11764 |
gatcatgaaacttatcacaattctacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatgttttcaactcatatctttttctcatactttgaacatgaaat |
11863 |
T |
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Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
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T |
11864 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattgaaacatgtcatcataattagagcacgaaattcatcatttatgaacaattaatcaattga |
11963 |
T |
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Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaa |
400 |
Q |
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T |
11964 |
cccaattaagcacttattcatacaat-aattgaaa |
11997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 132520 - 132209
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
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T |
132520 |
caccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt |
132421 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
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T |
132420 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacgatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatataat |
132322 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
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| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
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T |
132321 |
tcaacaaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
132222 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcac |
378 |
Q |
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|
| ||||||||||| |
|
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T |
132221 |
cccaattaagcac |
132209 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 236 - 400
Target Start/End: Original strand, 16044 - 16209
Alignment:
Q |
236 |
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335 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| | |
|
|
T |
16044 |
atatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgga |
16143 |
T |
 |
Q |
336 |
ttctaacaattatgaac-aattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaa |
400 |
Q |
|
|
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T |
16144 |
tttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatacaat-aattgaaa |
16209 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 236 - 400
Target Start/End: Original strand, 25575 - 25740
Alignment:
Q |
236 |
atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaa |
335 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| |||||||||| ||||||| | |
|
|
T |
25575 |
atatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattaaaacatgtcatcataattagagcacgga |
25674 |
T |
 |
Q |
336 |
ttctaacaattatgaac-aattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaa |
400 |
Q |
|
|
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|
|
T |
25675 |
tttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatacaat-aattgaaa |
25740 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 402
Target Start/End: Original strand, 88323 - 88586
Alignment:
Q |
139 |
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237 |
Q |
|
|
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T |
88323 |
aacatcacttaacaacagcaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt-gatcatattttcaacacat |
88421 |
T |
 |
Q |
238 |
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337 |
Q |
|
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| | ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||| || |||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||| |
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T |
88422 |
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88521 |
T |
 |
Q |
338 |
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402 |
Q |
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| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| || || ||||||||| |||||||||| |
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T |
88522 |
tcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaaaca-cttttcatacaaataattgaaaat |
88586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0103 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:
Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 69 - 403
Target Start/End: Original strand, 33640 - 33974
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Q |
69 |
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168 |
Q |
|
|
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|
|
T |
33640 |
accaacaacaacttatttcacattatcaaatcatgaattatgaacaccctagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg |
33739 |
T |
 |
Q |
169 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
267 |
Q |
|
|
| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |
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T |
33740 |
atcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaa-cataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaatt |
33838 |
T |
 |
Q |
268 |
tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-ac |
366 |
Q |
|
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|
|
T |
33839 |
caactaacaacaattcaattatctataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttacgaacaattaatcaattcat |
33938 |
T |
 |
Q |
367 |
tcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| |
|
|
T |
33939 |
ccaattaagcacttaatcatacagt-aattgaaaatt |
33974 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0610 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:
Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 68 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 846 - 513
Alignment:
Q |
68 |
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167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
846 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt |
747 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |
|
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T |
746 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaat-gagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaat |
648 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| | ||||||||||| |||||| | || ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
647 |
tcaattaacaacaattctattatccataatttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
548 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
547 |
cccaattaagcacttattcatacaat-aattgaaaa |
513 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:
Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 378
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27785
Alignment:
Q |
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146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
T |
27453 |
atcaacccatttttacaaaaccgacaacaacaactcatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
27552 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
||| || ||||| |||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||| |||||| |||||||| |||| |
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|
T |
27553 |
ttaacaacaacatcatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacatttagggcacaattcacaatatatcattttc |
27652 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
|
|
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|
|
T |
27653 |
acatactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaact |
27752 |
T |
 |
Q |
347 |
atgaac-aattaatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
|||| | || |||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
27753 |
atgagcaaaataatcatttattcaattaagcac |
27785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 291
Target Start/End: Original strand, 86313 - 86557
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Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
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|
|
T |
86313 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttacttcacatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
86412 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
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T |
86413 |
ttaacaacaaaaacatcaattaaacatgattatcatcacaattgaactataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatataacattttc |
86512 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatca |
291 |
Q |
|
|
|||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
86513 |
acatactatgaacatccaatttcaccaacaaaaattcaattatca |
86557 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:
Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Original strand, 4543 - 4876
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Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
4543 |
caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa |
4642 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
|
|
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T |
4643 |
aatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca |
4742 |
T |
 |
Q |
270 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
368 |
Q |
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|
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T |
4743 |
accaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatcc |
4842 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
4843 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
4876 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Original strand, 9157 - 9490
Alignment:
Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
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T |
9157 |
caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa |
9256 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
|
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T |
9257 |
aatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca |
9356 |
T |
 |
Q |
270 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
368 |
Q |
|
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T |
9357 |
accaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatcc |
9456 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
9457 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
9490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 68 - 378
Target Start/End: Original strand, 159279 - 159588
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
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|
T |
159279 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccaaaaattat---catcaacatcacttagcaacaacaacatcaatt |
159375 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
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T |
159376 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcataatttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaat |
159475 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
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T |
159476 |
tcaactaacaacaatgccattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
159575 |
T |
 |
Q |
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ctcaattaagcac |
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Q |
|
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T |
159576 |
cccaattaagcac |
159588 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 68 - 401
Target Start/End: Original strand, 85309 - 85641
Alignment:
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167 |
Q |
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T |
85309 |
caccaacaacgtctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt |
85408 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
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|
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|
|
T |
85409 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgtaat |
85507 |
T |
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Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
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T |
85508 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttataaacaattaatcaattca |
85607 |
T |
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Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
| |||||||||| || |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
85608 |
cccaattaagca-cttttcatacaat-aattgaaaa |
85641 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0670 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:
Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
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Target Start/End: Complemental strand, 7966 - 7621
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146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
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T |
7966 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
7867 |
T |
 |
Q |
147 |
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246 |
Q |
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T |
7866 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc |
7767 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
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T |
7766 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtagtcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaact |
7667 |
T |
 |
Q |
347 |
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391 |
Q |
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| |||| || |||||| ||| |||| ||||||| || |||||||| |
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|
T |
7666 |
aagaacaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaat |
7621 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:
Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 118233 - 117901
Alignment:
Q |
68 |
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167 |
Q |
|
|
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T |
118233 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaccccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaact |
118134 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
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T |
118133 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgaacatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
118035 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
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T |
118034 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
117935 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||| ||||||||| |
|
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T |
117934 |
gccaattaagca-cttttcatacaat-aattgaaaa |
117901 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 109732 - 109400
Alignment:
Q |
68 |
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167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| | |
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|
T |
109732 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaatcccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt |
109633 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
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T |
109632 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaattt-atcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgtaat |
109534 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
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T |
109533 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
109434 |
T |
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Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||| ||||||||| |
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|
T |
109433 |
gccaattaagca-cttttcatacaat-aattgaaaa |
109400 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0389 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:
Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 71 - 416
Target Start/End: Original strand, 10642 - 10985
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Q |
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170 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
T |
10642 |
caacaacaattcatttttcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatgatcaacaacaacatcacttagcaaaaacaacatcaattgaa |
10741 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
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|||| |||| | | ||||| |||||||| || |||||| |||| | || ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| || ||| |
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T |
10742 |
catggttctcatcataattcgacaacaacgtatcataatccaaccaattaagcataattcacaagttaacacttatacatactttgaacatgcaaattct |
10841 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
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T |
10842 |
ccgacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaattataacatctatgaacaattaattatttatccaa |
10941 |
T |
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Q |
371 |
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416 |
Q |
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|||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |
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T |
10942 |
ttaatcacttattcatacaat-aattgaaaa-ttatactaaaatga |
10985 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0190 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:
Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 404
Target Start/End: Original strand, 9903 - 10250
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Q |
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156 |
Q |
|
|
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|
|
T |
9903 |
ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaataatcatcaacaacatgacatatcaacaa |
10002 |
T |
 |
Q |
157 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatacttt |
255 |
Q |
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||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | |||| | |||| |
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|
T |
10003 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatatacccttttcatactcttt |
10101 |
T |
 |
Q |
256 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
355 |
Q |
|
|
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|
|
T |
10102 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat |
10201 |
T |
 |
Q |
356 |
taatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaattt |
404 |
Q |
|
|
||||||||| || |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
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|
T |
10202 |
taatcaattcacccaattaagca-cttttcatacaaagaattgaaaattt |
10250 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0598 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:
Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 71 - 378
Target Start/End: Original strand, 3232 - 3539
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Q |
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170 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| || || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | || |
|
|
T |
3232 |
caacaacaacttatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
3331 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| || | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |
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|
T |
3332 |
catgatt-tcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcccaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca |
3430 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaattactca |
369 |
Q |
|
|
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|
T |
3431 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagcgcacgaatttcaacaactatgagcaaaataatcacttattca |
3530 |
T |
 |
Q |
370 |
attaagcac |
378 |
Q |
|
|
||||||||| |
|
|
T |
3531 |
attaagcac |
3539 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:
Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
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Target Start/End: Complemental strand, 1790 - 1471
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Q |
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193 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || | || ||||||| |||| ||| |||| |||| | | |||||||| |
|
|
T |
1790 |
caaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatatctaattcaacaacaacttcaattgagcatggttctcatcataattcaac |
1691 |
T |
 |
Q |
194 |
aacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaac |
293 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| | || || || |||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1690 |
aacaacatagcataattcacccatttgaacataattcataaattagcatttatacatacttttaacaagcaaattcaccaacaacaattcaattatcact |
1591 |
T |
 |
Q |
294 |
aacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatga |
393 |
Q |
|
|
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|
|
T |
1590 |
aatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaagcacttattcatacaat-a |
1492 |
T |
 |
Q |
394 |
attgaaaatttacactaaaat |
414 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1491 |
attgaaaatttacactaaaat |
1471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 95 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 8935 - 8616
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Q |
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193 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || | || ||||||| |||| ||| |||| |||| | | |||||||| |
|
|
T |
8935 |
caaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatatctaattcaacaacaacttcaattgagcatggttctcatcataattcaac |
8836 |
T |
 |
Q |
194 |
aacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaac |
293 |
Q |
|
|
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|
|
T |
8835 |
aacaacatagcataattcacccatttgaacataattcataaattagcatttatacatacttttaacaagcaaattcaccaacaacaattcaattatcact |
8736 |
T |
 |
Q |
294 |
aacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatga |
393 |
Q |
|
|
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|
T |
8735 |
aatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaagcacttattcatacaat-a |
8637 |
T |
 |
Q |
394 |
attgaaaatttacactaaaat |
414 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8636 |
attgaaaatttacactaaaat |
8616 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:
Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Original strand, 7151 - 7485
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Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacat-caactga |
169 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |
|
|
T |
7151 |
caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccaattga |
7250 |
T |
 |
Q |
170 |
acatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
268 |
Q |
|
|
| ||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |
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|
T |
7251 |
aaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
7350 |
T |
 |
Q |
269 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-act |
367 |
Q |
|
|
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|
|
T |
7351 |
aaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatc |
7450 |
T |
 |
Q |
368 |
caattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
7451 |
caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
7485 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0338 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:
Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 401
Target Start/End: Original strand, 8964 - 9296
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | | |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| | |
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|
T |
8964 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcaagcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaagt |
9063 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| | || |||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |
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|
T |
9064 |
gatcttgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
9162 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
9163 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaattaatcaattca |
9262 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
|||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
9263 |
ctcaattaagca-cttttcatacaat-aattgaaaa |
9296 |
T |
 |
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Target Start/End: Complemental strand, 22713 - 22370
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146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||| | | |||||| ||||| | ||||||| | |||||||| |||| |
|
|
T |
22713 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcataattcatgaacacccaaactatgaatcttcaacaacaatatcaa |
22614 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
||| || |||||||||||| | |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | || || || |
|
|
T |
22613 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattcacatctcaattcaacaacaacatagcacaattcaataatttgagcataattcataagttagcatttat |
22514 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
346 |
Q |
|
|
|||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| | |
|
|
T |
22513 |
acatattttgaacatgcaaattcaccaacaacaattaaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaact |
22414 |
T |
 |
Q |
347 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaa |
390 |
Q |
|
|
||||||||||| ||| ||| || |||||||| |||| |||||| |
|
|
T |
22413 |
atgaacaattattcacttattctattaagcatttattaatacaa |
22370 |
T |
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Target: scaffold0193; HSP #1
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170 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| ||| || |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||| | || |
|
|
T |
4585 |
caacaacaacttatttttcatcatcaaatcttgatatatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaattaaa |
4684 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
4685 |
catgattcccatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca |
4784 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| |||| |
|
|
T |
4785 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattaaaacacgaatttcaacaactatgaacaa-taatcagttattcaa |
4883 |
T |
 |
Q |
371 |
ttaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaa |
412 |
Q |
|
|
|||| || || |||| |||| ||| |||||| ||||||| |
|
|
T |
4884 |
ctaagtacttaatcatgcaattaatgaaaaattaccactaaa |
4925 |
T |
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Target: scaffold0165 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
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Target: scaffold0165; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 71 - 378
Target Start/End: Original strand, 29944 - 30251
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170 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | || |
|
|
T |
29944 |
caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatacgtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcgcttaacaacaacaacatcaattaaa |
30043 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
30044 |
catgattctcatcacaattcaacaaaaacatagcacaattcaacaattagagcaaaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca |
30143 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaattactca |
369 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||| | || || | || |||||| ||||||| |
|
|
T |
30144 |
cctacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcatagtaagagcacgaattttaactacta-gagcaaaataatcacttactca |
30242 |
T |
 |
Q |
370 |
attaagcac |
378 |
Q |
|
|
||||||||| |
|
|
T |
30243 |
attaagcac |
30251 |
T |
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170 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | || |
|
|
T |
21979 |
caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatacatacccaagctgtgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
22078 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
22079 |
catgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcccaattcaacatttagagcacaattcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttca |
22178 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga-acaattaatcaattactca |
369 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | || |||||| ||| ||| |
|
|
T |
22179 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatatactcaaacataacatcatagcaagagcacgaatttcaacaactatgagaaaaataatcacttattca |
22278 |
T |
 |
Q |
370 |
attaagcac |
378 |
Q |
|
|
||||||||| |
|
|
T |
22279 |
attaagcac |
22287 |
T |
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Target: scaffold0148; HSP #1
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170 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | || |
|
|
T |
37538 |
caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
37637 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
37638 |
catgattctcgtctcaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttca |
37737 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaattactca |
369 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || || | || |||||| ||||||| |
|
|
T |
37738 |
ccaacaacaattcaattttcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattttaacaacta-gagcaaaataatcacttactca |
37836 |
T |
 |
Q |
370 |
attaagcac |
378 |
Q |
|
|
||||||||| |
|
|
T |
37837 |
attaagcac |
37845 |
T |
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Q |
|
|
|||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
116700 |
caacaacaacat--cataaatcatccatttgagcaatatttcaacatatatcattttctcatactttgaacatgaaa----acccaca-caattcaatta |
116608 |
T |
 |
Q |
289 |
tcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctattcatac |
388 |
Q |
|
|
||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
116607 |
tcaacaatttcatgccttcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgagcaattaataatttactcaattaagcacttattcatac |
116508 |
T |
 |
Q |
389 |
aatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
|| ||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
116507 |
aa-ccattcaaaatttacactaaaa |
116484 |
T |
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155 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |
|
|
T |
116795 |
attttacaaaaccaccaacaacaatccatttttcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaaca |
116696 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatca |
164 |
Q |
|
|
||||||||| |
|
|
T |
116695 |
acaacatca |
116687 |
T |
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Target: scaffold0016; HSP #3
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167 |
Q |
|
|
|||||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| | | ||||||||| ||| | || |||||||| || | |
|
|
T |
164192 |
caccaacaccatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattaccatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacattt |
164291 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| | || |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||| || |||| | |||||||||||| ||| |
|
|
T |
164292 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatatcttcacacatacccattttcatacactttgaacatgtaat |
164390 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| || ||| ||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||| ||||| | || ||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
164391 |
tcaactaac-acaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatgaaaaattaatcaattca |
164489 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
164490 |
tccaattaagcactta-ccatacaattaattgaaaatt |
164526 |
T |
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Q |
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124 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
T |
162469 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccat |
162401 |
T |
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Target: scaffold0016; HSP #5
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Q |
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attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaa |
140 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| | |||||| |
|
|
T |
166547 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttttcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaa |
166463 |
T |
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Target: scaffold0554; HSP #1
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171 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||| ||| | |
|
|
T |
1897 |
aacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatactcaagccaagaattatcatcatcaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatc |
1996 |
T |
 |
Q |
172 |
atgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| || || |||||| || |||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
1997 |
atgaatcttataacaaatcaacaaca-catagcataattcaaccaattgagcatattttcatcatataccattttcgcatactttgaacatgaaattcaa |
2095 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actca |
369 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| |||| | || |||||| ||||||||||||| || || |
|
|
T |
2096 |
ctaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgagcaattaatcaattcaccca |
2195 |
T |
 |
Q |
370 |
attaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
|||||||| || |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
2196 |
attaagca-cttttcatacaat-aattgaaaa |
2225 |
T |
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Target: scaffold0387 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
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Target: scaffold0387; HSP #1
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71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| | || |
|
|
T |
1213 |
caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttagcaacaacaacatcaattaaa |
1114 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
270 |
Q |
|
|
|||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
1113 |
catgatt----------------aacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcccaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca |
1030 |
T |
 |
Q |
271 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaa |
370 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | || |
|
|
T |
1029 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagaacacgaattttaacaactatgaacaaataatcacttatttaa |
930 |
T |
 |
Q |
371 |
ttaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
|||||||| || |||| |||| |
|
|
T |
929 |
ttaagcacttaatcatgcaat |
909 |
T |
 |
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Target: scaffold0253 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)
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Q |
|
|
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|
|
T |
7358 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatctc |
7457 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
|||||| || ||||||||| | |||||| |||| | | |||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||| |||||||| |||| |
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|
T |
7458 |
ttagcaacaccaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacagcatagcacaattcaacatttatagcacaattcacaatatatcattttc |
7557 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagca |
331 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
7558 |
acatactatgagaatgcaatttcaccaacaataattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagca |
7642 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 331
Target Start/End: Original strand, 16783 - 17067
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Q |
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atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| | |
|
|
T |
16783 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatctc |
16882 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
|||||| || ||||||||| | |||||| |||| | | |||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||| |||||||| |||| |
|
|
T |
16883 |
ttagcaacaccaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacagcatagcacaattcaacatttatagcacaattcacaatatatcattttc |
16982 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagca |
331 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
16983 |
acatactatgagaatgcaatttcaccaacaataattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagca |
17067 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0075 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:
Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 378
Target Start/End: Original strand, 4906 - 5229
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |
|
|
T |
4906 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcagcaaatcatgaattatgaacaaccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaaca |
5005 |
T |
 |
Q |
156 |
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254 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || |||||||||| |
|
|
T |
5006 |
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5104 |
T |
 |
Q |
255 |
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354 |
Q |
|
|
|||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||| |||| | || |||||||||| |
|
|
T |
5105 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaa |
5204 |
T |
 |
Q |
355 |
ttaatcaatt-actcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
||||| |||| || ||||||||||| |
|
|
T |
5205 |
ttaattaattcacccaattaagcac |
5229 |
T |
 |
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Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
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Target Start/End: Complemental strand, 34559 - 34477
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Q |
254 |
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337 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
T |
34559 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatt |
34477 |
T |
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Target: scaffold0058 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:
Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
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Target Start/End: Complemental strand, 70569 - 70241
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Q |
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174 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
70569 |
aacaacccatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccaagaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatg |
70470 |
T |
 |
Q |
175 |
tttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaa |
274 |
Q |
|
|
| || | | ||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||| | || |||| || |||||||||||| || |||| ||| |
|
|
T |
70469 |
gtcctcatcataattcaacaacaatataacataattcacccaattgagcataattcacaagttagcactcatacacactttgaacatgcaaattca-caa |
70371 |
T |
 |
Q |
275 |
caacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaa-ttctaacaattatgaacaattaatcaattactcaatta |
373 |
Q |
|
|
||| |||| |||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||| |
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|
T |
70370 |
caataattgaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaatttttaacatctatgaacaattaatcaattatacattta |
70271 |
T |
 |
Q |
374 |
agcacctattcatacaatgaattgaaaattt |
404 |
Q |
|
|
| ||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
70270 |
atcacttattcatacaat-aattgaaaattt |
70241 |
T |
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Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
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Target Start/End: Original strand, 107967 - 108255
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Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || | |
|
|
T |
107967 |
atcaacccatttttaaaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcaa-aattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatatc |
108065 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
246 |
Q |
|
|
||| || |||||||||||| | |||||| | | | |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
T |
108066 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgatcttcatcacaattcaacaataaca-agcataattcaacatttagagcataattcataatataccattttc |
108164 |
T |
 |
Q |
247 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
108165 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatt |
108255 |
T |
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Target: scaffold0409 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
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Target: scaffold0409; HSP #1
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Q |
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acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattc |
283 |
Q |
|
|
||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |
|
|
T |
1502 |
acaatccaacagtaacatagcacaatacaacatttagagcatgattcatcatatatcattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatcc |
1403 |
T |
 |
Q |
284 |
aattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctatt |
383 |
Q |
|
|
|||||||| ||| || |||||| || ||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |
|
|
T |
1402 |
aattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaagcacttatt |
1303 |
T |
 |
Q |
384 |
catacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
1302 |
catacaat-aattgaaaaattacactaatatga |
1271 |
T |
 |
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Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
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Target Start/End: Complemental strand, 9757 - 9526
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Q |
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acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattc |
283 |
Q |
|
|
||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |
|
|
T |
9757 |
acaatccaacagtaacatagcacaatacaacatttagagcatgattcatcatatatcattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatcc |
9658 |
T |
 |
Q |
284 |
aattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaagcacctatt |
383 |
Q |
|
|
|||||||| ||| || |||||| || ||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |
|
|
T |
9657 |
aattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaagcacttatt |
9558 |
T |
 |
Q |
384 |
catacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
9557 |
catacaat-aattgaaaaattacactaatatga |
9526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 391
Target Start/End: Original strand, 40662 - 40959
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Q |
95 |
caaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaaca |
194 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| |||| |||| ||||| |||| |
|
|
T |
40662 |
caaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatgtaaca |
40761 |
T |
 |
Q |
195 |
acaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcac-tttctcatactttgaacatgaaatttc-accaacaacaattcaattatcaa |
292 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||| | |
|
|
T |
40762 |
acaatatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcacataacccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatcca |
40860 |
T |
 |
Q |
293 |
caacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
|||||||| ||| | |||| |||||||||| ||| ||||||| | || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
40861 |
taacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagca-ctattcatacaat |
40959 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 391
Target Start/End: Original strand, 46145 - 46466
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Q |
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||| |
|
|
T |
46145 |
caacaacaacttatttcacattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagaaacaacaacatccattgat |
46244 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcac-tttctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||| |
|
|
T |
46245 |
catgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcacataacccacttttcacatactttgatcatgaagtttc |
46343 |
T |
 |
Q |
270 |
-accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-act |
367 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||| ||||||| | || |||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
46344 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
46443 |
T |
 |
Q |
368 |
caattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||| |
|
|
T |
46444 |
caattaagca-cttttcatacaat |
46466 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0310
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Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 427 - 49
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Q |
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tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcca |
123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||| | |
|
|
T |
427 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaaaagctcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagcta |
329 |
T |
 |
Q |
124 |
tgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagc |
223 |
Q |
|
|
||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| || | || ||| |
|
|
T |
328 |
tgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattc-acgaattaagc |
230 |
T |
 |
Q |
224 |
ata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcata |
322 |
Q |
|
|
||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || || ||||||||| |||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||||| |
|
|
T |
229 |
atattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcata |
130 |
T |
 |
Q |
323 |
attggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
| | |||||||||| | || |||| |||| |||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
129 |
aatatagcacgaatttcatcatttattaacatttaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
49 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 6676 - 6603
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Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaa |
97 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| |
|
|
T |
6676 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaagaacaactcaattctcaacaacaa |
6603 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 6562 - 6343
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Q |
184 |
acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatt |
282 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| | || || ||||||||| |
|
|
T |
6562 |
acaattcaacaacaacaaaacataattcacgaatta-agcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatc |
6464 |
T |
 |
Q |
283 |
caattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaccta |
381 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||| | |||||||||| | || ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| || |
|
|
T |
6463 |
caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatcatttatgaacagttaatcaattcatccaattaagcactta |
6364 |
T |
 |
Q |
382 |
ttcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
6363 |
-tcatacaaataattgaaaatt |
6343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 253271 - 252924
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||| || | ||||||||| ||||| || | |
|
|
T |
253271 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcaagaaatcatgaatcatgcaaacccaagccttgaattatcatcaacaacatgacttaacaaaa |
253172 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactt |
254 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |
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|
T |
253171 |
acaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcatgattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaatttctcatactt |
253073 |
T |
 |
Q |
255 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaa |
354 |
Q |
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T |
253072 |
tgaaaatgtaattcaactaacaacaattcaattatccctaacttcatacatccaaacatgtcatcataatcaaagcacgaattttatcatttatgcacaa |
252973 |
T |
 |
Q |
355 |
ttaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
252972 |
ttaatcaattcacccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
252924 |
T |
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Target: scaffold0012; HSP #2
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Target Start/End: Complemental strand, 247542 - 247459
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Q |
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|
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|||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||| | | |||||||||||||| |
|
|
T |
247542 |
tttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatt |
247459 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1164 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
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Target: scaffold1164; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 1332 - 1693
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tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaac |
141 |
Q |
|
|
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|
T |
1332 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaac |
1431 |
T |
 |
Q |
142 |
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240 |
Q |
|
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T |
1432 |
atgacatagcaacagcaacatttattgatcatgaaacttatcacaattcatcaatcacataacataattcaacaatt-gagcatattttcaacatatacc |
1530 |
T |
 |
Q |
241 |
actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattcta |
340 |
Q |
|
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| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | |
|
|
T |
1531 |
aatttctcatactttgaacatataattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttca |
1630 |
T |
 |
Q |
341 |
acaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|| || |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
1631 |
tcacataggaacaattaatcaattcacccaattaagcactta-tcatccaaataattgaaaatt |
1693 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:
Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 22681 - 22352
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Q |
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aacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatg |
174 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| | |
|
|
T |
22681 |
aacaactcatttttcatcgccaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaacatcacttagcaacaaaaacat-----------g |
22593 |
T |
 |
Q |
175 |
tttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaa |
274 |
Q |
|
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|||| | | |||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| || |||||||| |
|
|
T |
22592 |
gttctcatcataattcaacaacaacttagcataattcacccaattgagcataattcacaagttaacacttatacacactttgaacatgcaaattcaccaa |
22493 |
T |
 |
Q |
275 |
caacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaa |
374 |
Q |
|
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|
T |
22492 |
caacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaatcaatcaatcatccaattaa |
22393 |
T |
 |
Q |
375 |
gcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaatga |
416 |
Q |
|
|
||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |
|
|
T |
22392 |
tcacttattcatacaat-aattaaaaaataacactaaaatga |
22352 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:
Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 337
Target Start/End: Original strand, 24893 - 25204
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Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcca |
123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
T |
24893 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgca-acccaagcca |
24990 |
T |
 |
Q |
124 |
tgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagc |
223 |
Q |
|
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||||| || | ||||||||| | || || |||||||| ||| ||| | || |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |
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|
T |
24991 |
tgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaa-ttgagc |
25089 |
T |
 |
Q |
224 |
ata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcata |
322 |
Q |
|
|
||| ||||||||||| | |||| | |||| |||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| ||||||| |
|
|
T |
25090 |
atattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcata |
25189 |
T |
 |
Q |
323 |
attggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
| | |||||| |||| |
|
|
T |
25190 |
aatagagcacaaatt |
25204 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 25235 - 25523
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Q |
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214 |
Q |
|
|
|||||||||||||| || | ||||||||| | || || |||||||| ||| ||| | || |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| | |
|
|
T |
25235 |
cccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacc |
25334 |
T |
 |
Q |
215 |
aatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacat |
313 |
Q |
|
|
|||| ||||||| || ||||||||| | |||| | |||| |||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| |
|
|
T |
25335 |
aatt-gagcatattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacat |
25433 |
T |
 |
Q |
314 |
aacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||| |||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
25434 |
gtcatcataaatagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
25523 |
T |
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Target: scaffold0833; HSP #1
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Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcca |
123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
T |
3233 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagcca |
3331 |
T |
 |
Q |
124 |
tgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaac |
199 |
Q |
|
|
||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
3332 |
tgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac |
3407 |
T |
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Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
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Q |
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |
|
|
T |
24995 |
caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgaatacccaagccaagaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat |
24896 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataa-ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
24895 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatatgttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca |
24797 |
T |
 |
Q |
270 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
368 |
Q |
|
|
|| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||| |||| | || ||||| |||||||||||||| || |
|
|
T |
24796 |
actaacaacaatttaattatcaataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacct |
24697 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaattt |
404 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
24696 |
aattaagca-cttttcatacaaataattgaaaattt |
24662 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0117 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
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Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11837 - 11542
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||||| || | ||||||||| || || || ||||||||| || | |
|
|
T |
11837 |
caccaacaacatctcatttctccaca-caaatcatgaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacataaatt |
11739 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
11738 |
gatcatgaaactgatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatta-agcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaat |
11640 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
| | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11639 |
tcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt |
11542 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Original strand, 1 - 330
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Q |
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| || | |||||| || || ||||| |||||||||||| ||| |
|
|
T |
1 |
caacaacaatccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaattgat |
100 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
269 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||||| |||| || |||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
101 |
catgaaacttatcacaattcatcaaccacgtagcataattcacgaatt-gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgcaattca |
199 |
T |
 |
Q |
270 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
368 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||| ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| || | |
|
|
T |
200 |
accaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacat---gtcatcattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcaccc |
296 |
T |
 |
Q |
369 |
aattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
297 |
aattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
330 |
T |
 |
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
165 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| || | |||||| || || ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
3496 |
caccaacaacattccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaa |
3593 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
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Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 364
Target Start/End: Original strand, 1300 - 1590
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Q |
74 |
caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacat |
173 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| ||| ||| |
|
|
T |
1300 |
caacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcat |
1399 |
T |
 |
Q |
174 |
gtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacc |
272 |
Q |
|
|
| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||| || ||| | ||| |||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
T |
1400 |
gaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttaagcatattttcatcacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaacc |
1498 |
T |
 |
Q |
273 |
aacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||| ||| ||||||||||| | || |||| |||||||||||||| |
|
|
T |
1499 |
accaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcatgattagagcacgaatttcatcatttatacacaattaatcaatt |
1590 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 251 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11740 - 11588
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Q |
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Q |
|
|
|||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||| |
|
|
T |
11740 |
actttgaacatgtaattcaaccaagaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatga |
11641 |
T |
 |
Q |
351 |
acaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
11640 |
acaattaatcaattcatccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
11588 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0406 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
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Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 154 - 378
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Q |
|
|
|||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| || |||| |||||| |
|
|
T |
14099 |
caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacgtagtataattcaacatttagagcacaattcacaatataccattttcacatact |
14198 |
T |
 |
Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac- |
352 |
Q |
|
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|||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || || | |
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|
T |
14199 |
atgaacatgcaatttcaccagcaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattttaacaacta-gagca |
14297 |
T |
 |
Q |
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aattaatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
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|
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T |
14298 |
aaataatcacttactcaattaagcac |
14323 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0008 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 2)
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Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 364
Target Start/End: Original strand, 22668 - 22964
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || | || |||||||||||| | |
|
|
T |
22668 |
caccaacaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacaaaacaacaacaacatcaatt |
22767 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
22768 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaat |
22866 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22867 |
tcaactaacaacaattcaattattcaaaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt |
22964 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 128269 - 128186
Alignment:
Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||||| |
|
|
T |
128269 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatt |
128186 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 401
Target Start/End: Original strand, 60784 - 61116
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
T |
60784 |
caccaacaacatctcatttctccaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
60882 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || ||| || |||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
60883 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttaagtatatttttaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaat |
60981 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
60982 |
tcaaccaacaacaattcaattattcataacatcatacatctaaacatgttatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
61081 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaa |
401 |
Q |
|
|
| |||||||||| || ||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
61082 |
cccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaa |
61116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 70892 - 70597
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||||| | | |
|
|
T |
70892 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatccaat |
70793 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaa |
265 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| || |
|
|
T |
70792 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacctacttt-tcatactttgaacatgtaa |
70695 |
T |
 |
Q |
266 |
tttcaccaacaacaattcaatta-tcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaa |
362 |
Q |
|
|
|| || ||||| || ||||||| ||| |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
70694 |
ttcaactaacaataaatcaattattcattaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaa |
70597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 171872 - 172034
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| | || |||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| |
|
|
T |
171872 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttcttaacaacaaatcatgaa-tatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcc |
171970 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaattt |
219 |
Q |
|
|
| |||||||| |||||| | || || ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |
|
|
T |
171971 |
ataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaattt |
172034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 177575 - 177737
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| | || |||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| |
|
|
T |
177575 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttcttaacaacaaatcatgaa-tatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcc |
177673 |
T |
 |
Q |
156 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaattt |
219 |
Q |
|
|
| |||||||| |||||| | || || ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |
|
|
T |
177674 |
ataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaattt |
177737 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 79912 - 79825
Alignment:
Q |
316 |
catcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
79912 |
catcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
79825 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:
Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 1096 - 757
Alignment:
Q |
64 |
aaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatc |
163 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||| | |
|
|
T |
1096 |
aaatcaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacaac |
997 |
T |
 |
Q |
164 |
aactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatg |
262 |
Q |
|
|
|| ||| |||| |||| |||| ||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
996 |
aattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaataacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaactcatacccatttttcatactttgaacatg |
898 |
T |
 |
Q |
263 |
aaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaa |
362 |
Q |
|
|
|||| | ||||||||| ||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||| |||||| |
|
|
T |
897 |
taattcatctaacaacaatccaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatcaatcaa |
798 |
T |
 |
Q |
363 |
tt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
797 |
ttcactcaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
757 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7118 - 6780
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac- |
166 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| |||| |
|
|
T |
7118 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaaca |
7019 |
T |
 |
Q |
167 |
--tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatga |
263 |
Q |
|
|
||| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || ||| ||| || |||| | ||| |||||||| |
|
|
T |
7018 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatacccattttcatacactctgaacatgt |
6920 |
T |
 |
Q |
264 |
aatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaat |
363 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| | |||| | || ||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
6919 |
aattcaaccaacaacaattcaactattcataacttcatacatctaaacatgtcctcgtaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaat |
6820 |
T |
 |
Q |
364 |
t-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
| || |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
6819 |
tcacccaattaagca-ctgatcatacaaataattgaaaatt |
6780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0133 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:
Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 378
Target Start/End: Original strand, 25439 - 25634
Alignment:
Q |
184 |
acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattc |
283 |
Q |
|
|
|||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25439 |
acaaatcaacaagaacatagcacaattcaacaattaaagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacaggcaatttcaccaacaacaattc |
25538 |
T |
 |
Q |
284 |
aattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaattactcaattaagcac |
378 |
Q |
|
|
|||| ||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || | || |||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
25539 |
aattttcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttactcaattaagcac |
25634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 89950 - 89792
Alignment:
Q |
251 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga |
350 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
T |
89950 |
actttgaacatacaaattcac-aacaacaattcaagtatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt-taacatctatga |
89853 |
T |
 |
Q |
351 |
acaattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatttacactaaaa |
413 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
89852 |
acaattaatcaattatccaattaatcacttattcatacaat-aattgaaaa-ttacactaaaa |
89792 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 90135 - 90037
Alignment:
Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca |
145 |
Q |
|
|
||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
90135 |
atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaacatca |
90037 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 337
Target Start/End: Original strand, 107910 - 107993
Alignment:
Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||| | | |||||||||||||| |
|
|
T |
107910 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatt |
107993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:
Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Original strand, 48124 - 48458
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac |
166 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| |||| || ||| || | ||| |
|
|
T |
48124 |
caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaat |
48222 |
T |
 |
Q |
167 |
tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
||| |||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
48223 |
tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaatt-gagcatattttaacacatacccatttttcatactttgaacataaaat |
48321 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| || |||||||||||||| || | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
48322 |
tcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
48421 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
48422 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
48458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 403
Target Start/End: Original strand, 61572 - 61906
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac |
166 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| |||| || ||| || | ||| |
|
|
T |
61572 |
caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaat |
61670 |
T |
 |
Q |
167 |
tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
||| |||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
61671 |
tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaatt-gagcatattttaacacatacccatttttcatactttgaacataaaat |
61769 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| || |||||||||||||| || | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
61770 |
tcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
61869 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
61870 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
61906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 788 - 644
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
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Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||| | |||||||||||| | |
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T |
788 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagtaacaacaacatcaatt |
689 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattca |
212 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
688 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattca |
644 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 115 - 337
Target Start/End: Original strand, 19231 - 19452
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Q |
115 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
214 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| | || || ||||||||||||||| ||||| |||||| | |
|
|
T |
19231 |
cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcacc |
19330 |
T |
 |
Q |
215 |
aatttgagcataatt--caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcataca |
312 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||| || | ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| || ||| |
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T |
19331 |
aatt-gagcacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaaca |
19427 |
T |
 |
Q |
313 |
taacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
19428 |
tatcatcacagttggagcacgaatt |
19452 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 115 - 337
Target Start/End: Original strand, 21315 - 21536
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Q |
115 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
214 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| | || || ||||||||||||||| ||||| |||||| | |
|
|
T |
21315 |
cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcacc |
21414 |
T |
 |
Q |
215 |
aatttgagcataatt--caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcataca |
312 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||| || | ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| || ||| |
|
|
T |
21415 |
aatt-gagcacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaaca |
21511 |
T |
 |
Q |
313 |
taacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
21512 |
tatcatcacagttggagcacgaatt |
21536 |
T |
 |
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Target: scaffold0240 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 403
Target Start/End: Original strand, 7593 - 7882
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Q |
115 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
214 |
Q |
|
|
|||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||| |||| | |||| | |||||||| |||||||||| | |
|
|
T |
7593 |
cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataatttatcaacaacaatgcataattcacc |
7692 |
T |
 |
Q |
215 |
aatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacat |
313 |
Q |
|
|
|||| ||||||| || || |||||| | ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |
|
|
T |
7693 |
aatt-gagcatattttcatcatatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatttataacttcatacatctaaacat |
7791 |
T |
 |
Q |
314 |
a-acatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
| |||||||||| || || ||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
7792 |
aggcatcataattagatcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
7882 |
T |
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Name: scaffold0601
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Target: scaffold0601; HSP #1
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105 |
attatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagc |
204 |
Q |
|
|
||||||||| | ||||| |||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||| | |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
1107 |
attatgaacacacaagctatgaatcattaacaacgatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgaatctccccacatttcaacaacaacatagc |
1008 |
T |
 |
Q |
205 |
ataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgca |
304 |
Q |
|
|
| |||||||||||| ||||| ||| || | || |||| |||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| | |
|
|
T |
1007 |
acaattcaacaattagagcacaatacacc------cattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcattta |
914 |
T |
 |
Q |
305 |
ttcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
913 |
ctcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
881 |
T |
 |
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Target: scaffold0153 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0153
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Target: scaffold0153; HSP #1
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Q |
207 |
aattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatt |
306 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | | |
|
|
T |
8606 |
aattcaacaattagagcacaattcataatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtact |
8705 |
T |
 |
Q |
307 |
catacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac-aattaatcaattactcaattaagcacctattcatacaat |
391 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || |||| || |||||| ||| |||||||||||| || |||||||| |
|
|
T |
8706 |
caaacatatcatcacaacaagagcacgaatttcaataactaagaacaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaat |
8791 |
T |
 |
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Target: scaffold0153; HSP #2
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Q |
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atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| || || ||| |||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
T |
1791 |
atcaacccatttttacaaaactaacaacaacaacttatttcacatcatcaattcatgatttatg-acacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctc |
1889 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacata |
202 |
Q |
|
|
||| || || ||||||||| | |||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
1890 |
ttaacaacatcaacatcaattaaacatgattctcatcacaattc-acaacaacata |
1944 |
T |
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Target: scaffold0390 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0390
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Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |
|
|
T |
16108 |
caacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaa |
16009 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata |
226 |
Q |
|
|
|||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
16008 |
catggttctcttcataattcaaaaacatcatagcataattcaaccaattgagcata |
15953 |
T |
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Q |
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |
|
|
T |
3124 |
caacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccatgtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaa |
3025 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata |
226 |
Q |
|
|
|||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
3024 |
catggttctcttcataattcaaaaacatcatagcataattcaaccaattgagcata |
2969 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 160
Target Start/End: Original strand, 5162 - 5251
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Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaac |
160 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
5162 |
caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcaccaacaacaatatcacatagcaacaacaac |
5251 |
T |
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Target: scaffold0231 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:
Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
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Target Start/End: Complemental strand, 13048 - 12782
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Q |
24 |
tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcc |
122 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | | || || || |||| ||||||||| |||||| |
|
|
T |
13048 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaccatcaacaacaacttaaattacatcataaatccatg-attatgaacacccaagtt |
12950 |
T |
 |
Q |
123 |
atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgag |
222 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||| ||| | || || ||||||||||| | |||||| | || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
T |
12949 |
atgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcatttaaacatgaattccaccacacatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagag |
12850 |
T |
 |
Q |
223 |
cataattcaacatatat-cactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattat |
289 |
Q |
|
|
|| |||||| | |||| || ||| |||| | |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
T |
12849 |
cacaattcacaacatatccattttaacatattatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattat |
12782 |
T |
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Back To:
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Target: scaffold0335 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
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Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
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Q |
52 |
acccattt-tacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag |
150 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| || || |
|
|
T |
5875 |
acccatttatacaaaacaaccaacaacatctcatttctcaccaacaa-tcatgacatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatttctcag |
5777 |
T |
 |
Q |
151 |
cagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattca |
212 |
Q |
|
|
|| |||||||||||| || ||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
5776 |
caacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattca |
5714 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
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Target: scaffold0011; HSP #1
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | | |||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
T |
255084 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
254985 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaa |
265 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| || |||| | |||||||||||| || |
|
|
T |
254984 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaa |
254886 |
T |
 |
Q |
266 |
tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
|||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||| | ||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
254885 |
-ttcaactacaacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaatt |
254788 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 68 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 261690 - 261394
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | | |||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
T |
261690 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
261591 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaa |
265 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| || |||| | |||||||||||| || |
|
|
T |
261590 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaa |
261492 |
T |
 |
Q |
266 |
tttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
|||| | || ||||||||||||| | |||||||| ||| | ||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
261491 |
-ttcaactactacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaatt |
261394 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 253 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 123264 - 123181
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
123264 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatt |
123181 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:
Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
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Target Start/End: Complemental strand, 11977 - 11643
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
|||||| |||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||| | | |||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
11977 |
caccaaaaacatctcatttctcaacaccaa-tcatgaaccatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt |
11879 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| | |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
11878 |
gatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaactaatacccatttttcatactttgaacatgtaat |
11780 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||| || |||| | || ||||||||||||||||||| | |
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|
T |
11779 |
tcatccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacaaatttcatcacatatgaacaattaatcaattca |
11680 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
11679 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
11643 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 38275 - 38610
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68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
|||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||| || | ||||||||| ||| | || ||||||| |||| | |
|
|
T |
38275 |
caccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagttatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacgtcaatt |
38374 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||| |
|
|
T |
38375 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcgccaa-ttgagcatattttcaacatatacccatttctcttcctttgaacatgtaat |
38473 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
365 |
Q |
|
|
| |||||||| ||||||||||| | || ||||| || | |||| |||||||||| |||| || ||| | || ||||||||||||||| |||| | |
|
|
T |
38474 |
tcaaccaacaaaaattcaattattcataaattcataaatctaaacatgtcatcataattagagcgcgtatttcatcatttatgaacaattaattaattca |
38573 |
T |
 |
Q |
366 |
ctcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
38574 |
cccaattaagca-cttttcatacaaataattgaaaatt |
38610 |
T |
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Target: scaffold0786; HSP #1
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170 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |
|
|
T |
4591 |
caacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaaatcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaa |
4492 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata |
226 |
Q |
|
|
|||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
4491 |
catggttctcttcataattcaaaaacatcatagcataattcaaccaattgagcata |
4436 |
T |
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Q |
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaac |
160 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
1574 |
caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac |
1663 |
T |
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Target: scaffold0327; HSP #1
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Q |
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacat |
162 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
T |
5937 |
caacaacaactcatttttcatcgccaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaacatcacttagcaacaaaaacat |
6028 |
T |
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Target: scaffold0561; HSP #1
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195 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| || |||||||| || | | |||||| ||| | |||| ||||||| |
|
|
T |
3014 |
tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcttttaacaacaacaacaacataaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaa |
2915 |
T |
 |
Q |
196 |
caacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaa |
295 |
Q |
|
|
||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| |||| | |||| ||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
T |
2914 |
caacataatacaattcaacaattagagcacaattcacaatataccattttcacatattatgaaaatgcaattttatcaacaacgattcaattatcaccaa |
2815 |
T |
 |
Q |
296 |
cttcatgcattcatacataacatcataa |
323 |
Q |
|
|
|||||| | ||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
2814 |
tttcatgtactcaaacatatcatcataa |
2787 |
T |
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214 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||| | |
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|
T |
13531 |
cccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcatc |
13630 |
T |
 |
Q |
215 |
aatttgagcataa--ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcataca |
312 |
Q |
|
|
|| ||||||| || |||| | | || ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||| |
|
|
T |
13631 |
aa-ttgagcacaattttcacaacttcacatttttacata-attgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaaca |
13727 |
T |
 |
Q |
313 |
taacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||| | || ||||||||||| |
|
|
T |
13728 |
taacatcaaagttagagcacgaatt |
13752 |
T |
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Target: scaffold0003; HSP #1
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Q |
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150 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
T |
147531 |
accaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
147612 |
T |
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Target: scaffold0634; HSP #1
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373 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
5595 |
acaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaaaaatgatgaacaaataatcacttattcaatta |
5694 |
T |
 |
Q |
374 |
agcac |
378 |
Q |
|
|
||||| |
|
|
T |
5695 |
agcac |
5699 |
T |
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Target: scaffold0065; HSP #1
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320 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | | ||| ||||| ||||| |
|
|
T |
68014 |
agcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcacgtactcaaacatatcatca |
67915 |
T |
 |
Q |
321 |
taattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
||| ||||||||||| |
|
|
T |
67914 |
taacaagagcacgaatt |
67898 |
T |
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Target: scaffold0125 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
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Target: scaffold0125; HSP #1
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cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
214 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
T |
41673 |
cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcacc |
41772 |
T |
 |
Q |
215 |
aatt |
218 |
Q |
|
|
|||| |
|
|
T |
41773 |
aatt |
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T |
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Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
T |
41812 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatt |
41894 |
T |
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Target: scaffold0090; HSP #1
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caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatc |
144 |
Q |
|
|
|||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
3387 |
caacaactcatttcacaataaaaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaacatc |
3317 |
T |
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Q |
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tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaaccca |
56 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
3424 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaccca |
3392 |
T |
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaa |
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Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
1655 |
caacaacatctcatttctcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcataaacaacaa |
1724 |
T |
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tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccatttta-caaaatcac-caacaacaactcatttctcaccaacaaatc-atgaattatgaactcccaag |
120 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| | || || || |||||| |||| |||||||| |||||| |
|
|
T |
12697 |
tcatcaaaatcaaacttcttcactatcaacccattttaacaaaaaccctcaacaacaacttaaatcacatca-caaatccatga-ttatgaacacccaag |
12794 |
T |
 |
Q |
121 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg |
220 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||| ||| | || || |||||||||||| | |||||| | || |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | |
|
|
T |
12795 |
ttatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgaattccaccacaaatcaacaacaacatagcacaattaaacaattag |
12894 |
T |
 |
Q |
221 |
agcataattcaacatata |
238 |
Q |
|
|
|||| || |||| ||||| |
|
|
T |
12895 |
agcacaaatcaaaatata |
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T |
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Target: scaffold0083 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
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68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||| | |
|
|
T |
14854 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgact---aaacaacaacaacaatt |
14950 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaat |
266 |
Q |
|
|
|| |||| | || |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || ||| ||| || |||| | |||||||||||| ||| |
|
|
T |
14951 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatacccattttcatacactttgaacatgtaat |
15049 |
T |
 |
Q |
267 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt |
364 |
Q |
|
|
| || ||| ||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15050 |
ctaactaac-acaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaatt |
15146 |
T |
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Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| |
|
|
T |
14194 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca |
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T |
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346 |
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416 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
5670 |
tatgaacaattaatcacttattcaattaagcacttattcatataat-aattgaaaaattacactaaaatga |
5601 |
T |
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Back To:
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Q |
|
|
|||||||||| || |||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| || |
|
|
T |
50124 |
accaacaacatcttatttttcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg |
50026 |
T |
 |
Q |
169 |
-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
||| || |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
50025 |
aaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataattcatcaatt |
49975 |
T |
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Q |
|
|
||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||| || |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
27051 |
acaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattatagcacgattttcaacaatgatgaacaaataatcacttattcaattaagc |
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T |
 |
Q |
377 |
ac |
378 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
26951 |
ac |
26950 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0207 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
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Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
Target Start/End: Original strand, 17680 - 17826
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Q |
69 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
168 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| || |
|
|
T |
17680 |
accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgagcacccaagccataaatcataaacaacaacttgtct---cagcaacaacatcaattg |
17775 |
T |
 |
Q |
169 |
-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
17776 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
17826 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33704 - 33414
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Q |
48 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
146 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||||||| || |||||| ||||| || ||| | |
|
|
T |
33704 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctataaatcatcaacaataatatctc |
33606 |
T |
 |
Q |
147 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-acttt |
245 |
Q |
|
|
| || |||||||||||| | || || ||| || ||| ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||| | ||||| | | ||| |
|
|
T |
33605 |
atgacaacaacaacatcaattaaatgtgaatctcaccacatttcaacaacaacataacacaatttaacaattagagcacaatttataatatacctatttt |
33506 |
T |
 |
Q |
246 |
ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||| | ||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
33505 |
ctcatattatgaacattcaatttcatctacatcaatttaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
33414 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 193 - 403
Target Start/End: Original strand, 20274 - 20485
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Q |
193 |
caacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatc |
290 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |
|
|
T |
20274 |
caacaacaaagcataattaaccaatt-gagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattatt |
20372 |
T |
 |
Q |
291 |
aacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcataca |
389 |
Q |
|
|
| |||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| |
|
|
T |
20373 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcataca |
20471 |
T |
 |
Q |
390 |
atgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
| ||||||||||| |
|
|
T |
20472 |
aataattgaaaatt |
20485 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 253 - 337
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||| | | |||||||||||||| |
|
|
T |
48350 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatt |
48433 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0173 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:
Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
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Target Start/End: Original strand, 5201 - 5349
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Q |
69 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
168 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| | |
|
|
T |
5201 |
accaacaacatcttatttcttaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaatta |
5298 |
T |
 |
Q |
169 |
aa-catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
|| | || |||| || ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
T |
5299 |
aatcttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt |
5349 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0367 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:
Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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Alignment:
Q |
117 |
caagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa |
216 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
T |
17542 |
caagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaccacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaa |
17443 |
T |
 |
Q |
217 |
tt |
218 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
17442 |
tt |
17441 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:
Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24467 - 24374
Alignment:
Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca |
161 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||||| |
|
|
T |
24467 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaacaaca |
24374 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24371 - 24193
Alignment:
Q |
226 |
aattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataat |
324 |
Q |
|
|
||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||| ||| |
|
|
T |
24371 |
aattcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaat |
24272 |
T |
 |
Q |
325 |
tggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
24271 |
tagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
24193 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20041 - 19889
Alignment:
Q |
251 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga |
350 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||| |
|
|
T |
20041 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
19942 |
T |
 |
Q |
351 |
acaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
19941 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
19889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 161
Target Start/End: Original strand, 30056 - 30161
Alignment:
Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | |||||| || ||| | || || |
|
|
T |
30056 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaaca |
30155 |
T |
 |
Q |
156 |
acaaca |
161 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
30156 |
acaaca |
30161 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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Target Start/End: Complemental strand, 61455 - 61354
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Q |
117 |
caagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa |
216 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
T |
61455 |
caagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaccacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaa |
61356 |
T |
 |
Q |
217 |
tt |
218 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
61355 |
tt |
61354 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 337
Target Start/End: Original strand, 48761 - 48844
Alignment:
Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
48761 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
48844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1542 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:
Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
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Target Start/End: Complemental strand, 634 - 551
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
634 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:
Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
6164 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
6081 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:
Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
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Target Start/End: Complemental strand, 3682 - 3599
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
3682 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
3599 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266; HSP #2
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||| | ||| ||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
1287 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaa-ttcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatt |
1370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0175 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:
Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
1056 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
973 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0615 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:
Target: scaffold0615; HSP #1
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Q |
69 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
168 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| |||||||||||| || |
|
|
T |
6492 |
accaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcatcaacaacatcaattg |
6394 |
T |
 |
Q |
169 |
-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
218 |
Q |
|
|
||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
T |
6393 |
aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
6343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0091 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:
Target: scaffold0091; HSP #1
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| | |
|
|
T |
32180 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
32279 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatg |
174 |
Q |
|
|
|| |||| |
|
|
T |
32280 |
gatcatg |
32286 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
167 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| | |
|
|
T |
42123 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
42024 |
T |
 |
Q |
168 |
gaacatg |
174 |
Q |
|
|
|| |||| |
|
|
T |
42023 |
gatcatg |
42017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0686 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:
Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
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Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||| | |||||| || ||| | || || |
|
|
T |
6373 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatattactaaacaaca |
6274 |
T |
 |
Q |
156 |
acaaca |
161 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
6273 |
acaaca |
6268 |
T |
 |
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Target: scaffold0772; HSP #1
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Q |
257 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
5696 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcaaagttggagcacgaatt |
5775 |
T |
 |
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Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
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Target: scaffold0465; HSP #1
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Q |
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |
|
|
T |
10241 |
caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgat |
10142 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattc |
211 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
T |
10141 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaaccaagcataattc |
10101 |
T |
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Q |
69 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca |
145 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
34670 |
accaacaacatctcaattctcaccaacaa-tcatgttatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatca |
34595 |
T |
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Target: scaffold0498; HSP #1
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Q |
254 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
T |
9042 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcga-ttcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatt |
9124 |
T |
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Target: scaffold0420; HSP #1
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatca |
320 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
13413 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
13347 |
T |
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Target: scaffold0215 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatca |
320 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
9437 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
9371 |
T |
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Target: scaffold0215; HSP #2
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatca |
320 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
16335 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
16269 |
T |
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaat |
106 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
1364 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaat |
1414 |
T |
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Target: scaffold0740 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
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Target: scaffold0740; HSP #1
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Q |
68 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaaca |
142 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| | ||||| |||||||| || | |||||||| |
|
|
T |
4284 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaaca |
4358 |
T |
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Target: scaffold0740; HSP #2
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Q |
320 |
ataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacctattcatacaatgaattgaaaatt |
403 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
4513 |
ataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
4596 |
T |
 |
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Target: scaffold0234 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
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Target: scaffold0234; HSP #1
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Q |
71 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
170 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |
|
|
T |
17679 |
caacaacaacttatttcacaacaacatattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat |
17580 |
T |
 |
Q |
171 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt |
229 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
17579 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatt |
17522 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
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Target: scaffold0184; HSP #1
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| | || |||||||| ||||| | |||||| || ||| | || || |
|
|
T |
31570 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
31471 |
T |
 |
Q |
156 |
acaaca |
161 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
31470 |
acaaca |
31465 |
T |
 |
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Target: scaffold0078 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
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Target: scaffold0078; HSP #1
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Q |
56 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
155 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| | || |||||||| ||||| | |||||| || ||| | || || |
|
|
T |
41274 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
41373 |
T |
 |
Q |
156 |
acaaca |
161 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
41374 |
acaaca |
41379 |
T |
 |
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Target: scaffold0018; HSP #1
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Q |
94 |
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131 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
51430 |
acaaatcatgagttatgaacacccaagccatgaatcat |
51393 |
T |
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Target: scaffold0018; HSP #2
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253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| || | ||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
51282 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatt |
51199 |
T |
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Q |
253 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacgaatt |
337 |
Q |
|
|
||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
41892 |
tttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
41975 |
T |
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Q |
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ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaa |
105 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
1304 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaa |
1352 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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