View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0734_low_13 (Length: 322)

Name: NF0734_low_13
Description: NF0734
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0734_low_13
NF0734_low_13
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (73-322)||(43700-43946)
scaffold0116 (73-291)||(47620-47836)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (73-322)||(25956537-25956783)
chr6 (73-316)||(27851133-27851373)
chr6 (73-251)||(20734128-20734304)
chr6 (95-231)||(22420982-22421117)
chr6 (85-231)||(2201134-2201278)
chr6 (76-246)||(34296953-34297121)
chr6 (108-201)||(19399803-19399895)
chr6 (223-268)||(19399883-19399928)
chr6 (225-268)||(16624504-16624547)
chr6 (95-169)||(18927900-18927973)
chr6 (239-268)||(16760469-16760498)
chr6 (220-269)||(27325487-27325536)
chr6 (239-268)||(31477713-31477742)
chr6 (240-268)||(16624306-16624334)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (73-322)||(13844498-13844744)
chr4 (73-273)||(46642840-46643038)
chr4 (153-322)||(15099307-15099463)
chr4 (73-251)||(33186097-33186273)
chr4 (153-224)||(15190360-15190430)
chr4 (73-247)||(35812171-35812342)
chr4 (97-226)||(15880717-15880845)
chr4 (223-273)||(15868765-15868815)
chr4 (95-169)||(9923373-9923446)
chr4 (95-169)||(11479413-11479486)
chr4 (223-273)||(13812865-13812915)
chr4 (239-268)||(10713027-10713056)
chr4 (239-268)||(10926797-10926826)
chr4 (239-268)||(12487885-12487914)
chr4 (250-322)||(52873249-52873319)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (73-322)||(28194365-28194611)
chr1 (73-322)||(43697332-43697578)
chr1 (153-322)||(35981694-35981850)
chr1 (153-268)||(49261340-49261454)
chr1 (153-268)||(20636849-20636963)
chr1 (95-251)||(51274290-51274445)
chr1 (75-209)||(12328538-12328670)
chr1 (85-165)||(8885477-8885556)
chr1 (225-268)||(39244030-39244073)
chr1 (225-268)||(39247585-39247628)
chr1 (225-268)||(41388135-41388178)
chr1 (239-268)||(1925032-1925061)
chr1 (239-268)||(20924046-20924075)
chr1 (250-322)||(43543069-43543139)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (73-322)||(5889092-5889337)
chr5 (73-251)||(12122202-12122378)
chr5 (73-251)||(21555060-21555236)
chr5 (73-251)||(21557726-21557902)
chr5 (75-250)||(31455686-31455862)
chr5 (153-322)||(21741539-21741695)
chr5 (75-250)||(31455073-31455249)
chr5 (85-231)||(24212383-24212527)
chr5 (73-251)||(30615751-30615926)
chr5 (155-251)||(17875209-17875304)
chr5 (85-231)||(35852638-35852782)
chr5 (73-246)||(36460170-36460341)
chr5 (235-322)||(29915150-29915235)
chr5 (223-265)||(21871627-21871669)
chr5 (223-265)||(21875907-21875949)
chr5 (239-268)||(10753538-10753567)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (89-229)||(39833889-39834029)
chr8 (73-251)||(21579887-21580063)
chr8 (73-251)||(29763549-29763724)
chr8 (121-251)||(41680850-41680979)
chr8 (73-246)||(42560208-42560379)
chr8 (73-201)||(18760580-18760706)
chr8 (121-231)||(32807280-32807389)
chr8 (188-251)||(22965744-22965807)
chr8 (239-268)||(18862548-18862577)
chr8 (239-268)||(21383831-21383860)
chr8 (239-268)||(21411124-21411153)
chr8 (239-268)||(21805616-21805645)
chr8 (239-268)||(21827917-21827946)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (155-322)||(18439845-18440009)
chr3 (73-251)||(31224635-31224811)
chr3 (73-169)||(1988912-1989008)
chr3 (73-273)||(12269576-12269773)
chr3 (73-251)||(15447681-15447854)
chr3 (153-322)||(1465417-1465573)
chr3 (106-251)||(31415399-31415543)
chr3 (208-322)||(20630147-20630259)
chr3 (153-257)||(49389637-49389740)
chr3 (73-246)||(11912921-11913092)
chr3 (95-208)||(6808175-6808287)
chr3 (223-268)||(49969934-49969979)
chr3 (105-201)||(49969964-49970059)
chr3 (225-268)||(4107286-4107329)
chr3 (225-268)||(4111138-4111181)
chr3 (225-268)||(16750477-16750520)
chr3 (239-268)||(12852440-12852469)
chr3 (239-268)||(15965146-15965175)
chr3 (239-268)||(15969070-15969099)
chr3 (239-268)||(15972994-15973023)
chr3 (239-268)||(19775942-19775971)
chr3 (239-268)||(37439539-37439568)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (153-322)||(85207-85373)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (73-213)||(15439318-15439457)
chr7 (153-304)||(17232598-17232746)
chr7 (153-322)||(8468386-8468545)
chr7 (73-251)||(30820937-30821113)
chr7 (73-214)||(37727607-37727747)
chr7 (153-322)||(9389703-9389859)
chr7 (76-251)||(36685934-36686107)
chr7 (106-251)||(38480232-38480376)
chr7 (73-231)||(11092752-11092908)
chr7 (84-231)||(9320421-9320566)
chr7 (73-231)||(11085014-11085170)
chr7 (74-246)||(15213699-15213869)
chr7 (239-268)||(18302178-18302207)
chr7 (239-268)||(45169909-45169938)
chr7 (250-322)||(14270136-14270206)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (73-251)||(14335-14511)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (74-251)||(24865452-24865627)
chr2 (86-251)||(22500984-22501147)
chr2 (86-251)||(22508918-22509081)
chr2 (74-251)||(7672240-7672409)
chr2 (75-201)||(6576419-6576543)
chr2 (73-151)||(2524410-2524487)
chr2 (239-268)||(1283563-1283592)
chr2 (239-268)||(1283601-1283630)
chr2 (239-268)||(30344894-30344923)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (74-251)||(1561-1736)
[»] scaffold1137 (2 HSPs)
scaffold1137 (154-268)||(2299-2412)
scaffold1137 (275-322)||(2407-2454)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (73-251)||(6359-6535)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (73-144)||(3065-3136)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (84-251)||(10890-11055)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (121-251)||(479-608)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (86-170)||(15421-15504)
scaffold0061 (86-170)||(24479-24562)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (73-246)||(4615-4786)
scaffold0599 (73-246)||(197-368)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (73-169)||(3140-3234)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (81-247)||(59295-59458)
scaffold0080 (239-268)||(49057-49086)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (95-169)||(5459-5532)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (239-273)||(9874-9908)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (223-273)||(8350-8400)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (239-268)||(571-600)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (239-268)||(11404-11433)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (239-268)||(32563-32592)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (239-268)||(7720-7749)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (239-268)||(13990-14019)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (239-268)||(24726-24755)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (239-268)||(35989-36018)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (239-268)||(189280-189309)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (250-322)||(36140-36210)


Alignment Details
Target: scaffold0116 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 73 - 322
Target Start/End: Original strand, 43700 - 43946
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43700 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 43799  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgactaa 272  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43800 at-gttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgattaa 43898  T
Q  273 tatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    | ||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  43899 tgtga-gaatatttatat-attgtgaaagatgctgatatgaagttgtaat 43946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 73 - 291
Target Start/End: Original strand, 47620 - 47836
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47620 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 47719  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgactaa 272  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47720 at-gttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgattaa 47818  T
Q  273 tatgatgaatatttatata 291  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  47819 tgtga-gaatatttatata 47836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 73 - 322
Target Start/End: Original strand, 25956537 - 25956783
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25956537 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 25956636  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgactaa 272  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25956637 at-gttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgattaa 25956735  T
Q  273 tatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    | ||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  25956736 tgtga-gaatatttatat-attgtgaaagatgctgatatgaagttgtaat 25956783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 73 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27851373 - 27851133
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| ||| ||    
T  27851373 cagagaggatgaataagatgattta-tattgatgatttaccttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa 27851275  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgactaa 272  Q
     | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  27851274 tttgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtgtatgtttaaatgatgttgtcttgttgttgtgctgaatatgatttactttgatgcttaa 27851175  T
Q  273 tatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagt 316  Q
    | ||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||    
T  27851174 tgtga-gaatatttatat-attgtgaaagatgctgatatgaagt 27851133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 251
Target Start/End: Original strand, 20734128 - 20734304
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| ||| ||    
T  20734128 cagagaggatgaataaaatgattta-tattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa 20734226  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
     || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20734227 ttg-ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctgttgtgatgaat 20734304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22421117 - 22420982
Alignment:
Q  95 ttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattatt 194  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||    
T  22421117 ttaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattg-taattgttatatatgatgattatt 22421019  T
Q  195 attgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgtt 231  Q
    |||||| || |||||||| |||||| |||||| ||||    
T  22421018 attgatagtgacttgttgcatatgtctaaatggtgtt 22420982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2201278 - 2201134
Alignment:
Q  85 ttaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatat 184  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||| |||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| ||| || || ||| ||||    
T  2201278 ttaagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatatgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattg-ttatatat 2201181  T
Q  185 gaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgtt 231  Q
    || |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||| ||||    
T  2201180 gatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtctaaatggtgtt 2201134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 246
Target Start/End: Original strand, 34296953 - 34297121
Alignment:
Q  76 agaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatg 175  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||| ||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| |||  |||     
T  34296953 agaggatgaataagatgatt-aataatgatgatttactttgatgattagatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattg-taatt 34297050  T
Q  176 gttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtga 246  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||  || |||| ||||| ||||| |||||||    
T  34297051 gttatatatgatgattattattaatgttgacttgctgcatattatttaatggtgtttccttgcggttgtga 34297121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19399895 - 19399803
Alignment:
Q  108 tttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatg 201  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  19399895 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttg-taatggttatatttgatgattattgttgatg 19399803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19399928 - 19399883
Alignment:
Q  223 aatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19399928 aatgatgttgtcttactgttgtgatgaatatggtttactttgatga 19399883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16624547 - 16624504
Alignment:
Q  225 tgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16624547 tgatgttattttgttgttgtgatgaatatgatttactttgatga 16624504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18927973 - 18927900
Alignment:
Q  95 ttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttg 169  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18927973 ttaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaa-gatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttg 18927900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16760498 - 16760469
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16760498 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 16760469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Original strand, 27325487 - 27325536
Alignment:
Q  220 ttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgac 269  Q
    |||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27325487 ttaaatgatgctattttgttgttgtgataaatatgatttactttgatgac 27325536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 31477713 - 31477742
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31477713 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 31477742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16624334 - 16624306
Alignment:
Q  240 gttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16624334 gttgtgatgaatatgatttactttgatga 16624306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 73 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13844744 - 13844498
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13844744 cagagaggatgattaagatgatttaatattattgatttacgttgatgattaaatgtgaaaatatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 13844645  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgactaa 272  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13844644 atg-ttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttactgttgtgatgaatatgatttactttgattattaa 13844546  T
Q  273 tatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    | ||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  13844545 tgtga-gaatatttatat-attgtgaaagatgctgatatgaagttgtaat 13844498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 46643038 - 46642840
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| | |||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  46643038 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgtttaaagttgatgattaa-tgcgaaaagatttatatattgtgaaagttgttaatatgaagttgtaa 46642940  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgactaa 272  Q
     || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  46642939 ttg-ttacatatgaagaatattattggtggttacttgttgtatatgtttaaatgatgctgccttgctgttgtgatgaatatgatttaatttgatgattaa 46642841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15099463 - 15099307
Alignment:
Q  153 ttgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaata 252  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||    
T  15099463 ttgttgatatgaagttg-aaattgttatacataaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaaagatgttgtcttgctgtcgtaatgaata 15099365  T
Q  253 tgatttactttgatgactaatatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    ||||| ||||            ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15099364 tgattgactt------------tgatgaatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaat 15099307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33186273 - 33186097
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| | |||||   ||||||||||||||| ||    
T  33186273 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattatgaaagacgttgatatgaagttgtaa 33186175  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
     || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  33186174 ttg-ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatttgtttaaatgatgatgtcttgttgttgtgatgaat 33186097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15190430 - 15190360
Alignment:
Q  153 ttgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaa 224  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15190430 ttgttgatatgaagttg-aaattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaa 15190360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 247
Target Start/End: Original strand, 35812171 - 35812342
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | ||||||||| || ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||  |    
T  35812171 cagagagtataaataagatgatt-aatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtggaa-gatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttg-ta 35812267  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgat 247  Q
    ||||||| ||  || ||||||| |||||| | ||||| || ||||  |  ||||||||| |||||||||||||||    
T  35812268 atggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatctaatgatgttgtcttgctgttgtgat 35812342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15880845 - 15880717
Alignment:
Q  97 aatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattat 196  Q
    ||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||||    
T  15880845 aatattgatgatttactttgattattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattg-taattgttatatatgatgattattat 15880747  T
Q  197 tgatggttacttgttgtatatgtttaaatg 226  Q
    ||||||| ||||| |  |||||| ||||||    
T  15880746 tgatggtgacttgctacatatgtctaaatg 15880717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 273
Target Start/End: Original strand, 15868765 - 15868815
Alignment:
Q  223 aatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgactaat 273  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15868765 aatgatgttgttttgttgttgtgatgaatatgatttactttgatgattaat 15868815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9923446 - 9923373
Alignment:
Q  95 ttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttg 169  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  9923446 ttaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaa-gatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttg 9923373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 11479413 - 11479486
Alignment:
Q  95 ttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttg 169  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  11479413 ttaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaa-gatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttg 11479486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 273
Target Start/End: Original strand, 13812865 - 13812915
Alignment:
Q  223 aatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgactaat 273  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13812865 aatgatgttgttttgttgttgtgatgaatatgatttacttagatgattaat 13812915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10713056 - 10713027
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10713056 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 10713027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10926826 - 10926797
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10926826 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 10926797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12487914 - 12487885
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12487914 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 12487885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 322
Target Start/End: Original strand, 52873249 - 52873319
Alignment:
Q  250 atatgatttactttgatgactaatatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| |||||    
T  52873249 atatgatttactttgatgattaatgtga-gaatatttatat-attgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 52873319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 73 - 322
Target Start/End: Original strand, 28194365 - 28194611
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28194365 cagagaagatgattaggatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaaaatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 28194464  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgactaa 272  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28194465 atg-ttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgattaa 28194563  T
Q  273 tatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    | ||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| |||||    
T  28194564 tgtga-gaatatttatat-attgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 28194611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 73 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 43697578 - 43697332
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43697578 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaagatctatatagtgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 43697479  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgactaa 272  Q
    || |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  43697478 at-gttatatatgaagattattattgttggttacttgctgtatatgtttatatgatgctgtcttgctgttgtgataaatatgatttactttgatgattaa 43697380  T
Q  273 tatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    | ||| || |||| |||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  43697379 tgtga-gattattgatat-attgtgaaagatgctgatatgaagttgtaat 43697332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 322
Target Start/End: Original strand, 35981694 - 35981850
Alignment:
Q  153 ttgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaata 252  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35981694 ttgttgatatgaagttg-aaattgttgcacatgaagattactaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaata 35981792  T
Q  253 tgatttactttgatgactaatatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    ||||| ||||            ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35981793 tgattgactt------------tgatgaatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaat 35981850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 49261454 - 49261340
Alignment:
Q  153 ttgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaata 252  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  49261454 ttgttgatatgaagttgtaattg-ttatacatgaagattattattgatggttacttgttatatatgtttaaatgatactgtcttgctgtcgtgatgaata 49261356  T
Q  253 tgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||    
T  49261355 tgatttactttgatga 49261340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20636963 - 20636849
Alignment:
Q  153 ttgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaata 252  Q
    ||||||| ||||||||| || || ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20636963 ttgttgacatgaagttgtaattg-ttatacatgaatattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaata 20636865  T
Q  253 tgatttactttgatga 268  Q
    |||||| |||||||||    
T  20636864 tgattttctttgatga 20636849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Original strand, 51274290 - 51274445
Alignment:
Q  95 ttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattatt 194  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||  ||||||||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||    
T  51274290 ttaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttg-taattgttatataagatgattatt 51274388  T
Q  195 attgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||| | || | ||| |||||||||||||    
T  51274389 attgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgtttttgttttgttgttgtgatgaat 51274445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 12328538 - 12328670
Alignment:
Q  75 gagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaat 174  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||| |||||| || |||||| |||||||   |||||||||||| ||  |||    
T  12328538 gagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatttgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagatg-taat 12328635  T
Q  175 ggttacatatgaagattattattgatggttacttg 209  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12328636 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttg 12328670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8885556 - 8885477
Alignment:
Q  85 ttaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaa 165  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   |||||||||||    
T  8885556 ttaagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaa 8885477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 268
Target Start/End: Original strand, 39244030 - 39244073
Alignment:
Q  225 tgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244030 tgatgttattttgttgttgtgatgaatatgatttactttgatga 39244073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 268
Target Start/End: Original strand, 39247585 - 39247628
Alignment:
Q  225 tgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39247585 tgatgttattttgttgttgtgatgaatatgatttactttgatga 39247628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 268
Target Start/End: Original strand, 41388135 - 41388178
Alignment:
Q  225 tgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41388135 tgatgttattttgttgttgtgatgaatatgatttactttgatga 41388178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 1925032 - 1925061
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1925032 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 1925061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 20924046 - 20924075
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20924046 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 20924075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 43543139 - 43543069
Alignment:
Q  250 atatgatttactttgatgactaatatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| |||||    
T  43543139 atatgatttactttgatgattaatgtga-gaatatttatat-attgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 43543069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 73 - 322
Target Start/End: Original strand, 5889092 - 5889337
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  5889092 cagagaggatgattatgatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgc-a 5889190  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgactaa 272  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5889191 attgttatacatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtctt-ctgtcgtgatgaatatgatttactttgatgattaa 5889289  T
Q  273 tatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    | ||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  5889290 tgtga-gaatatttatat-attgtgaaagatgctgatatgaagttgtaat 5889337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 251
Target Start/End: Original strand, 12122202 - 12122378
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||||||| ||    
T  12122202 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 12122300  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
     || ||| |||||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12122301 ttg-ttatatatgatgattattattgatggtgacttgcggcatatgtttaaatgatgatgtcttgctgttgtgatgaat 12122378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 251
Target Start/End: Original strand, 21555060 - 21555236
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||  |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||| || |||||| ||    
T  21555060 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttagtttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgacataaagttgtaa 21555158  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
     || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21555159 ttg-ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 21555236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 251
Target Start/End: Original strand, 21557726 - 21557902
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||  |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||||||| ||    
T  21557726 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttagtttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 21557824  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
     || ||| |||||| ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21557825 ttg-ttatatatgatgattattattgatagtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttatgatgaat 21557902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31455862 - 31455686
Alignment:
Q  75 gagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaat 174  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||||||||| || |    
T  31455862 gagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaacgttgatatgaagttgtaa-t 31455765  T
Q  175 ggttacatatgaa---gattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaa 250  Q
     |||| | ||||    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31455764 cgttataaatgatattgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaa 31455686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 322
Target Start/End: Original strand, 21741539 - 21741695
Alignment:
Q  153 ttgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaata 252  Q
    ||||||||| ||||||  |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  21741539 ttgttgataagaagttt-aaattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgtata 21741637  T
Q  253 tgatttactttgatgactaatatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    |||||             ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  21741638 tgatt------------gaatttgatgaatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaaatcgtaat 21741695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31455249 - 31455073
Alignment:
Q  75 gagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaat 174  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||| |||||| || |    
T  31455249 gagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaacgttgatattaagttgtaa-t 31455152  T
Q  175 ggttacatatgaa---gattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaa 250  Q
     |||| | ||||    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31455151 cgttataaatgatattgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaa 31455073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24212527 - 24212383
Alignment:
Q  85 ttaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatat 184  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   |||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  24212527 ttaagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttg-taattgttatatat 24212430  T
Q  185 gaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgtt 231  Q
    || ||||| |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||    
T  24212429 gatgattaatattgatggtgacttgctgcatatgtctaaatgatgtt 24212383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30615926 - 30615751
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| || | | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||||||| ||    
T  30615926 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgataatttacttttatgattaaatgtgaaaatat-tatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 30615829  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
     || ||| |  ||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||    
T  30615828 ttg-ttataattgatgattattaatgatggtgacttgctgcatatgtttaaacgatgatgtcttgctgttgcgatgaat 30615751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17875304 - 17875209
Alignment:
Q  155 gttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  17875304 gttgatatgaagtt-ctaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatattatcttgctgttgtgaagaat 17875209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35852782 - 35852638
Alignment:
Q  85 ttaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatat 184  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| |||  ||| |||| |||     
T  35852782 ttaagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattg-taattgttatatac 35852685  T
Q  185 gaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgtt 231  Q
    || ||||||||||||||||  |||| || |||||| |||||| ||||    
T  35852684 gatgattattattgatggtggcttgctgcatatgtctaaatggtgtt 35852638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36460341 - 36460170
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| |||  |    
T  36460341 cagagaggatgaacaagatgatt-aataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattg-ta 36460244  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtga 246  Q
    || |||| |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||  || |||| |||| |||||| |||||||    
T  36460243 attgttatatatgatgattattattaatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgtcttgcggttgtga 36460170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 322
Target Start/End: Original strand, 29915150 - 29915235
Alignment:
Q  235 ttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgactaatatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| |||||    
T  29915150 ttgctgttgtgatgaatatgatctactttgatgattaatgtga-gaatatttatat-attgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 29915235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 265
Target Start/End: Original strand, 21871627 - 21871669
Alignment:
Q  223 aatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttga 265  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21871627 aatgatgctgtcttgttgttgtgatgaatatgatttactttga 21871669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 265
Target Start/End: Original strand, 21875907 - 21875949
Alignment:
Q  223 aatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttga 265  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21875907 aatgatgctgtcttgttgttgtgatgaatatgatttactttga 21875949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10753567 - 10753538
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10753567 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 10753538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39834029 - 39833889
Alignment:
Q  89 gatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaag 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39834029 gatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataacgtgaatgttgttgatatgaagttgcaaatggttatatatgaag 39833930  T
Q  189 attattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39833929 attattattgatggttactcgctgtatatgtttaaatgatg 39833889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 251
Target Start/End: Original strand, 21579887 - 21580063
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||||||| ||    
T  21579887 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 21579985  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
     || ||| ||||||  ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21579986 ttg-ttatatatgataattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 21580063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 251
Target Start/End: Original strand, 29763549 - 29763724
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   |||||||||||||||  |    
T  29763549 cagagaggatgaataagatgatt-aatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttg-ta 29763646  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
    || |||| |||||| ||||||||| |||||| | ||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  29763647 attgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtcttgctgttgtgatgaat 29763724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 251
Target Start/End: Original strand, 41680850 - 41680979
Alignment:
Q  121 ttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtt 220  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||  | ||||||| || ||| || || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  41680850 ttaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatattgatatcaaattgtaattg-ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtt 41680948  T
Q  221 taaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
    |||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  41680949 taaatggtgatgtcttgttgttgtgatgaat 41680979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 246
Target Start/End: Original strand, 42560208 - 42560379
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| |||  |    
T  42560208 cagagaggatgaataagatgatt-aataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaatacgttgatatgaaattg-ta 42560305  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtga 246  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||| | ||||| || ||||  || |||| ||||  ||||| |||||||    
T  42560306 attgttatatatgatgattattattgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttaccttgcggttgtga 42560379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18760706 - 18760580
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| | |||| || || | |||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||   |    
T  18760706 cagagagtatgaataagatgatt-aatattgtgggtttaagtagatgattaaatgtgaaaagatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagtt-ata 18760609  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatg 201  Q
    ||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  18760608 atggttatatttgatgattattgttgatg 18760580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32807389 - 32807280
Alignment:
Q  121 ttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtt 220  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| ||| || || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||     
T  32807389 ttaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattg-ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtc 32807291  T
Q  221 taaatgatgtt 231  Q
    |||||| ||||    
T  32807290 taaatggtgtt 32807280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22965807 - 22965744
Alignment:
Q  188 gattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
    |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  22965807 gattattattgatggtgatttgatgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctgttatgatgaat 22965744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 18862548 - 18862577
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18862548 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 18862577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21383860 - 21383831
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21383860 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 21383831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21411153 - 21411124
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21411153 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 21411124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21805645 - 21805616
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21805645 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 21805616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 21827917 - 21827946
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21827917 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 21827946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 155 - 322
Target Start/End: Original strand, 18439845 - 18440009
Alignment:
Q  155 gttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatg 254  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18439845 gttgatatgtagttgcaaatg-ttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaatatg 18439943  T
Q  255 atttactttgatgactaatatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||| | |||| |||| |||||    
T  18439944 atttactttgatgattaatgtga-gaatatctatat-attgtgaaagatgatgatatgaagttgtaat 18440009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 251
Target Start/End: Original strand, 31224635 - 31224811
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||    
T  31224635 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 31224733  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
     || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31224734 ttg-ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 31224811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 73 - 169
Target Start/End: Original strand, 1988912 - 1989008
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1988912 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgattcacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgaagttg 1989008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 73 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12269773 - 12269576
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| | |||| ||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |     
T  12269773 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgtttaaagttgatgattaa-tga-aaaagatttatatattgtgaaagttgttgatatgaagttgtat 12269676  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgactaa 272  Q
     |  ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||    
T  12269675 ttt-ttacatatgaagaatattatcggtggttacttgttgtatatgtttaaatgatgctgccttgctgttgtcatgaatatgatttaagttgatgattaa 12269577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 251
Target Start/End: Original strand, 15447681 - 15447854
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| ||  |||||||||||||   |||||||||||||||  |    
T  15447681 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatattcatataatgtgaaagacgttgatatgaagttg-ta 15447778  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
    || |||| ||||   |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15447779 attgttatatat---gattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 15447854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 153 - 322
Target Start/End: Original strand, 1465417 - 1465573
Alignment:
Q  153 ttgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaata 252  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  1465417 ttgttgatatgaagttg-aaattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgctctatatgtttaaatgatgttgtcttgctgccgtgatgaata 1465515  T
Q  253 tgatttactttgatgactaatatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    ||||| ||||            ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1465516 tgattgactt------------tgatgaatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaat 1465573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31415543 - 31415399
Alignment:
Q  106 gatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggtta 205  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||||||| || || ||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  31415543 gatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattg-ttatatatgatgattattattgatggtga 31415445  T
Q  206 cttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
    |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31415444 cttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 31415399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 322
Target Start/End: Original strand, 20630147 - 20630259
Alignment:
Q  208 tgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgactaatatgatgaatatttatataattgagaaagatgctt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||| |     
T  20630147 tgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtaatgaatatgatttactttgacgattaatgtga-gaatatttatat-attgtgaaagatgttg 20630244  T
Q  308 atataaagtcgtaat 322  Q
    |||| |||| |||||    
T  20630245 atatgaagttgtaat 20630259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 257
Target Start/End: Original strand, 49389637 - 49389740
Alignment:
Q  153 ttgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaata 252  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  49389637 ttgttggtatgaagttg-aaattgttatacatgaagatcattattaatgggtacttattgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaata 49389735  T
Q  253 tgatt 257  Q
    |||||    
T  49389736 tgatt 49389740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11913092 - 11912921
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| |||  |    
T  11913092 cagagaggatgaataagatgatt-aataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattg-ta 11912995  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtga 246  Q
    || |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| || ||||  || |||| ||||  ||||| |||||||    
T  11912994 attgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatattatttaatggtgttgccttgcggttgtga 11912921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6808287 - 6808175
Alignment:
Q  95 ttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattatt 194  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| |||  ||| |||| |||| | |||||||    
T  6808287 ttaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattg-taattgttatatataatgattatt 6808189  T
Q  195 attgatggttactt 208  Q
    ||||||||| ||||    
T  6808188 attgatggtgactt 6808175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 268
Target Start/End: Original strand, 49969934 - 49969979
Alignment:
Q  223 aatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49969934 aatgatgttgtcttcctgttgtgatgaatatgatttactttgatga 49969979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 201
Target Start/End: Original strand, 49969964 - 49970059
Alignment:
Q  105 tgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatg 201  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  49969964 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttg-taatggttatatttgatgattattgttgatg 49970059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 268
Target Start/End: Original strand, 4107286 - 4107329
Alignment:
Q  225 tgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4107286 tgatgttattttgttgttgtgatgaatatgatttactttgatga 4107329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 268
Target Start/End: Original strand, 4111138 - 4111181
Alignment:
Q  225 tgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4111138 tgatgttattttgttgttgtgatgaatatgatttactttgatga 4111181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 268
Target Start/End: Original strand, 16750477 - 16750520
Alignment:
Q  225 tgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750477 tgatgttattttgttgttgtgatgaatatgatttactttgatga 16750520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 12852440 - 12852469
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12852440 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 12852469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15965175 - 15965146
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15965175 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 15965146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15969099 - 15969070
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15969099 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 15969070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15973023 - 15972994
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15973023 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 15972994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19775971 - 19775942
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775971 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 19775942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 37439539 - 37439568
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37439539 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 37439568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 153 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 85373 - 85207
Alignment:
Q  153 ttgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaata 252  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  85373 ttgttgatatggagttgcaaatg-ttatatatgaagattattattgatggttacttgatgtatatgtttaaatgaagttgtcttgctgttgtgatgaata 85275  T
Q  253 tgatttactttgatgactaatatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| |||||    
T  85274 tgatttactttgatgattaatgtga-gaatatttatat-attgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 85207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15439457 - 15439318
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  |    
T  15439457 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttg-ta 15439359  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgt 213  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15439358 attgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgt 15439318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 17232746 - 17232598
Alignment:
Q  153 ttgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaata 252  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  17232746 ttgttgatatggagttgcaaatg-ttacatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgatgtcatgctgttgtgatgaata 17232648  T
Q  253 tgatttactttgatgactaatatgatgaatatttatataattgagaaagatg 304  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  17232647 tgatttactttgatgattaatgtga-gaatatttatat-attgtgaaagatg 17232598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 8468545 - 8468386
Alignment:
Q  153 ttgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaata 252  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||    
T  8468545 ttgttgatatggagttgcagatg-ttacatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatga-------ttgctgttgtgatgaata 8468454  T
Q  253 tgatttactttgatgactaatatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| |||||    
T  8468453 tgatttactttgatgattaatgtgat-aatatttatat-attgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 8468386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 251
Target Start/End: Original strand, 30820937 - 30821113
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||||||| ||    
T  30820937 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaatacgttgatatgaagttgtaa 30821035  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
     || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30821036 ttg-ttatatatgatgattattattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgttgttgtgatgaat 30821113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Original strand, 37727607 - 37727747
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |    
T  37727607 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgctttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgtagatatgaagttg-ta 37727705  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgta 214  Q
    ||||||  || ||| ||||||| |||||| | ||||| ||||    
T  37727706 atggttgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctgta 37727747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 153 - 322
Target Start/End: Original strand, 9389703 - 9389859
Alignment:
Q  153 ttgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaata 252  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9389703 ttgttgatatgaagttg-aaattgatatacatgaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaata 9389801  T
Q  253 tgatttactttgatgactaatatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    ||||| ||||            |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9389802 tgattgactt------------tgatgaatctttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaat 9389859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 251
Target Start/End: Original strand, 36685934 - 36686107
Alignment:
Q  76 agaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatg 175  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   | ||||||||||||  || ||    
T  36685934 agaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgctgatatgaagttttaattg 36686032  T
Q  176 gttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36686033 -ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 36686107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38480376 - 38480232
Alignment:
Q  106 gatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggtta 205  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||||||| || || ||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  38480376 gatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattg-ttatatatgatgattattattgatggtga 38480278  T
Q  206 cttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
    |||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38480277 cttgctgcatatatttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 38480232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11092908 - 11092752
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||| |||  |    
T  11092908 cagagagtgtgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaaattg-ta 11092811  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgtt 231  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  11092810 attgttatatatgatgattattattgatggtgacttgttgcatacgtttaaatggtgtt 11092752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Original strand, 9320421 - 9320566
Alignment:
Q  84 attaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacata 183  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||  |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| ||| || || ||| |||    
T  9320421 attaagatgatt-aatattgatgatttattttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattg-ttatata 9320518  T
Q  184 tgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgtt 231  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||    
T  9320519 tgatgattattattgatggtgacttgttgcatatgtctaaatggtgtt 9320566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11085170 - 11085014
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||  || |||||| |||||||   ||||||||||| |||  |    
T  11085170 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaactatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattg-ta 11085073  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgtt 231  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| ||||    
T  11085072 attgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatacgattaaatggtgtt 11085014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15213869 - 15213699
Alignment:
Q  74 agagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaa 173  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||    |||||||||| |||  ||    
T  15213869 agagaggatgaataagatgatt-aataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacattgatatgaaattg-taa 15213772  T
Q  174 tggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtga 246  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||| | ||||| || ||||  || |||| ||||  ||||| |||||||    
T  15213771 ttgttatatatgatgattattattgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgttgccttgcggttgtga 15213699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18302207 - 18302178
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18302207 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 18302178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 45169909 - 45169938
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45169909 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 45169938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 322
Target Start/End: Original strand, 14270136 - 14270206
Alignment:
Q  250 atatgatttactttgatgactaatatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| |||||    
T  14270136 atatgatttactttgatgattaatgtga-gaatatttatat-attgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 14270206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14511 - 14335
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| ||  |||||||||||||   ||||||||||||||| ||    
T  14511 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatattcatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaa 14413  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
     || ||| ||| || |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14412 ttg-ttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 14335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 251
Target Start/End: Original strand, 24865452 - 24865627
Alignment:
Q  74 agagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaa 173  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||     
T  24865452 agagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 24865550  T
Q  174 tggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
    || ||| ||| || |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24865551 tg-ttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctattgtgatgaat 24865627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22501147 - 22500984
Alignment:
Q  86 taagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatatg 185  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||  ||| |||| ||| |    
T  22501147 taagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttg-taattgttatataag 22501050  T
Q  186 aagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  22501049 atgattaatattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtcttgctattgtgatgaat 22500984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22509081 - 22508918
Alignment:
Q  86 taagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatatg 185  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||  ||| |||| ||| |    
T  22509081 taagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttg-taattgttatataag 22508984  T
Q  186 aagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  22508983 atgattaatattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtcttgctattgtgatgaat 22508918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 251
Target Start/End: Original strand, 7672240 - 7672409
Alignment:
Q  74 agagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaa 173  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||||||         
T  7672240 agagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagtt----- 7672333  T
Q  174 tggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
      |||| ||| || |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7672334 --gttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatacgtttaaatgatgctgtcttgctgttgtgatgaat 7672409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6576543 - 6576419
Alignment:
Q  75 gagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaat 174  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | ||||| ||||||| || |||||| |||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  6576543 gagagtatgaataagatgatt-aatgttgtggatttaagttgatgattaaaagtgaaaaaatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttg-taat 6576446  T
Q  175 ggttacatatgaagattattattgatg 201  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  6576445 ggttatatttgatgattattgttgatg 6576419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 151
Target Start/End: Original strand, 2524410 - 2524487
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaa 151  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  2524410 cagagagtatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaa 2524487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1283592 - 1283563
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1283592 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 1283563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1283630 - 1283601
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1283630 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 1283601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 30344894 - 30344923
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30344894 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 30344923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1736 - 1561
Alignment:
Q  74 agagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaa 173  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||||||| ||     
T  1736 agagaggattaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 1638  T
Q  174 tggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
    || ||| ||| || |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1637 tg-ttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgttgttgtgatgaat 1561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 154 - 268
Target Start/End: Original strand, 2299 - 2412
Alignment:
Q  154 tgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaatat 253  Q
    |||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  2299 tgttgatatgaagttg-aaattgttgtacatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgctgtcttgctgtcgtgatgaatat 2397  T
Q  254 gatttactttgatga 268  Q
    |||| ||||||||||    
T  2398 gattgactttgatga 2412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 322
Target Start/End: Original strand, 2407 - 2454
Alignment:
Q  275 tgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  2407 tgatgaatacttatataattgtgaaagatgtttatatgaagtcgtaat 2454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 251
Target Start/End: Original strand, 6359 - 6535
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |  |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| ||| ||    
T  6359 cagagaggatgaataagatgatt-aataataatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaa 6457  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
     || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  6458 ttg-ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctattgtgatgaat 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3065
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataa 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3136 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataa 3065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11055 - 10890
Alignment:
Q  84 attaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacata 183  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| ||  || || ||| |||    
T  11055 attaagatgatt-aatgttgatgatttactatgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaatttttaattg-ttatata 10958  T
Q  184 tgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10957 tgatgattattattgattgtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttttgatgaat 10890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 608 - 479
Alignment:
Q  121 ttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtt 220  Q
    ||||||| ||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| ||  || || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  608 ttaaatgagaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattataattg-ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtt 510  T
Q  221 taaatgatgttttcttgctgttgtgatgaat 251  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  509 aaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 170
Target Start/End: Original strand, 15421 - 15504
Alignment:
Q  86 taagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgc 170  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15421 taagatgatt-aatgttgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaatgttgatatgaagttgc 15504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 170
Target Start/End: Original strand, 24479 - 24562
Alignment:
Q  86 taagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgc 170  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24479 taagatgatt-aatgttgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaatgttgatatgaagttgc 24562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4786 - 4615
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| |||  |    
T  4786 cagagaggatgaataagatgatt-aataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattg-ta 4689  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtga 246  Q
    || |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| || ||||  || |||| ||||  ||||| |||||||    
T  4688 attgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatattatttaatggtgttgccttgcggttgtga 4615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 368 - 197
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||| ||||||||| || |||||| |||||||   ||||||||||| |||  |    
T  368 cagagaggatgaataagatgatt-aataatgatgatttactttgatgattatatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattg-ta 271  T
Q  173 atggttacatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtga 246  Q
    || |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| || ||||  || |||| ||||  ||||| |||||||    
T  270 attgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatattatttaatggtgttgccttgcggttgtga 197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3234 - 3140
Alignment:
Q  73 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttg 169  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  3234 cagagagtatgaataagatgatt-aatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaa-gatttatatatcgtgaaaaatgttgatatgaagttg 3140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 247
Target Start/End: Original strand, 59295 - 59458
Alignment:
Q  81 atgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttgcaaatggttac 180  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||     
T  59295 atgaataagatgatt-aatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaa-gatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttg-taattgttat 59391  T
Q  181 atatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttttcttgctgttgtgat 247  Q
    ||  || ||||||| |||||| | ||||| || |||| ||| |||| ||||  |||||||| |||||    
T  59392 attggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattttttaatggtgttgccttgctgtcgtgat 59458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 49057 - 49086
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49057 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 49086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 5459 - 5532
Alignment:
Q  95 ttaatattgttgatttacgttgacgtttaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaaattgttgatatgaagttg 169  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  5459 ttaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaa-gatttatatattgtgaaaggtgttgatatgaagttg 5532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9908 - 9874
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatgactaat 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9908 tgttgtgatgaatatgatttactttgatgattaat 9874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 273
Target Start/End: Original strand, 8350 - 8400
Alignment:
Q  223 aatgatgttttcttgctgttgtgatgaatatgatttactttgatgactaat 273  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8350 aatgatgctgtcttgttgtcgtgatgaatatgatttactttgatgattaat 8400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 600 - 571
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  600 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 11404 - 11433
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11404 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 11433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 32563 - 32592
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32563 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 32592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 7720 - 7749
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7720 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 7749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 13990 - 14019
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13990 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 14019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 24726 - 24755
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24726 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 24755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 35989 - 36018
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35989 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 36018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 268
Target Start/End: Original strand, 189280 - 189309
Alignment:
Q  239 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189280 tgttgtgatgaatatgatttactttgatga 189309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 322
Target Start/End: Original strand, 36140 - 36210
Alignment:
Q  250 atatgatttactttgatgactaatatgatgaatatttatataattgagaaagatgcttatataaagtcgtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| |||||    
T  36140 atatgatttactttgatgattaatgtga-gaatatttatat-attgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 36210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5226 times since January 2019
Visitors: 4847