View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0737_low_16 (Length: 319)

Name: NF0737_low_16
Description: NF0737
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0737_low_16
NF0737_low_16
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (1-290)||(44903186-44903475)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (56-277)||(26223481-26223702)
chr7 (56-277)||(26203843-26204064)
chr7 (32-275)||(26250796-26251039)
chr7 (41-271)||(26297400-26297630)
chr7 (49-277)||(26242346-26242574)
chr7 (45-287)||(26191204-26191446)
chr7 (41-277)||(26128516-26128752)
chr7 (41-277)||(26155152-26155388)
chr7 (56-277)||(26179032-26179253)
chr7 (41-277)||(19103509-19103745)
chr7 (56-254)||(26087753-26087951)
chr7 (56-254)||(26111541-26111739)
chr7 (150-269)||(26226927-26227046)
chr7 (151-277)||(26301760-26301886)
chr7 (150-269)||(26207392-26207511)
chr7 (56-120)||(26301902-26301966)
chr7 (163-277)||(26259848-26259962)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44903475 - 44903186
Alignment:
Q  1 aaataggctgtggcagcatttgtagtcctcacccaatcgcgaagctgcagacggctcatctcaatggtatgaggcaaacaaggaatagtaaacttctgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44903475 aaataggctgtggcagcatttgtagtcctcacccaatcgcgaagctgcagacggctcatctcaatggtatgaggcaaacaaggaatagtaaacttctgtg 44903376  T
Q  101 tatcagaaactaaatgatcatgaggtctatactttctaacaaaataacatgcacaattggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44903375 tatcagaaactaaatgatcatgaggtctatactttctaacaaaataacatgcacaattggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgct 44903276  T
Q  201 tagttttgcagctgattgcacagtccaaggaatcatcatatcagttactatacaatctggttgaagatcttgaaacattacctcaatagg 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44903275 tagttttgcagctgattccacagtccaaggaatcatcatatcagttactatacaatctggttgaagatcttgaaacattacctcaatagg 44903186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26223702 - 26223481
Alignment:
Q  56 tcatctcaatggtatgaggcaaacaaggaatagtaaacttctgtgtatcagaaactaaatgatcatgaggtctatactttctaacaaaataacatgcaca 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26223702 tcatctcaattgtatgaggcaaacaaggaacagtaaatttctgtgtatcagaaactaaattatcatgaggtctatactttctaacaaaatagcttgcaca 26223603  T
Q  156 attggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattgcacagtccaaggaatcatcatatcagttactatacaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||    ||||||| |||| |||||||    
T  26223602 attggagaagtagcttgagctgtaaaagtaaatccttggaatgtttagttttgcagctgattcaactgtccaaggataagtcatatccgttattatacaa 26223503  T
Q  256 tctggttgaagatcttgaaaca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26223502 tctggttgaagatcttgaaaca 26223481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 56 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26204064 - 26203843
Alignment:
Q  56 tcatctcaatggtatgaggcaaacaaggaatagtaaacttctgtgtatcagaaactaaatgatcatgaggtctatactttctaacaaaataacatgcaca 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  26204064 tcatctcaattgtatgaggcaaacaaggaacggtaaatttctgtgtatcagaaactaaattatcatgaggtctatactttctaacaaaatagctcgcaca 26203965  T
Q  156 attggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattgcacagtccaaggaatcatcatatcagttactatacaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||    |||||||||||| |||||||    
T  26203964 attggagaagtagcttgagctgtaaaagtaaatccttggaatgtttagttttgcagctgattcaactgtccaaggataagtcatatcagttattatacaa 26203865  T
Q  256 tctggttgaagatcttgaaaca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26203864 tctggttgaagatcttgaaaca 26203843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 32 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26251039 - 26250796
Alignment:
Q  32 cccaatcgcgaagctgcagacggctcatctcaatggtatgaggcaaacaaggaatagtaaacttctgtgtatcagaaactaaatgatcatgaggtctata 131  Q
    ||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||    
T  26251039 cccaatcacaaagttgctgacgggtcatctcaattgtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtatcagaaactaaattataatggggtttata 26250940  T
Q  132 ctttctaacaaaataacatgcacaattggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattgcacagtccaagga 231  Q
     |||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| || | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26250939 ttttctaacaaaataaattgcacattcggagaagtagcttgagctgcaaaagtaaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaagga 26250840  T
Q  232 atcatcatatcagttactatacaatctggttgaagatcttgaaa 275  Q
      | ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26250839 tacttcatatctgtcactatacaatctggttgaagttcttgaaa 26250796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26297630 - 26297400
Alignment:
Q  41 gaagctgcagacggctcatctcaatggtatgaggcaaacaaggaatagtaaacttctgtgtatcagaaactaaatgatcatgaggtctatactttctaac 140  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| ||| |||| ||||||||    
T  26297630 gaagctgcagacgtgtcatctcaatggtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtttcagaaactaaattataatggggtttatattttctaac 26297531  T
Q  141 aaaataacatgcacaattggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattgcacagtccaaggaatcatcata 240  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| | | || ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     |||||    
T  26297530 aaaataaattgcacaataggagaagtagcttgagctgtaaaagtcaatccttggaatgtttagttttgcagctgattccacagtccaagggtatttcata 26297431  T
Q  241 tcagttactatacaatctggttgaagatctt 271  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  26297430 tctgtcactatacaatctggttgaagttctt 26297400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26242574 - 26242346
Alignment:
Q  49 agacggctcatctcaatggtatgaggcaaacaaggaatagtaaacttctgtgtatcagaaactaaatgatcatgaggtctatactttctaacaaaataac 148  Q
    |||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||||||||||||||     
T  26242574 agacgggtcatctcaactgtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtatcagaaactaaattataatggggtttatattttctaacaaaataaa 26242475  T
Q  149 atgcacaattggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattgcacagtccaaggaatcatcatatcagttac 248  Q
     | |||| | ||||||||||||||||||| || | | || ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  26242474 ttccacagtcggagaagtagcttgagctgcaaaagtgaatccttggaatatttagttttgcagctgattccacagtccaaggatacatcatatcagtgac 26242375  T
Q  249 tatacaatctggttgaagatcttgaaaca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26242374 tatacaatctggttgaagatctttaaaca 26242346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26191446 - 26191204
Alignment:
Q  45 ctgcagacggctcatctcaatggtatgaggcaaacaaggaatagtaaacttctgtgtatcagaaactaaatgatcatgaggtctatactttctaacaaaa 144  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  | | ||||    
T  26191446 ctgcagaggggtcatctcaatggtatgaggaaaactaggaatagtaaatttctgtgtatcagaaactaaattatcatgaggcctatatttcatgataaaa 26191347  T
Q  145 taacatgcacaattggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattgcacagtccaaggaatcatcatatcag 244  Q
    | | | |||||  |||||||||| |||||||| ||| | | || ||| |||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||||||||||    
T  26191346 tgaaaggcacagctggagaagtaacttgagctataaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgcttccactgtccaaggatacatcatatcag 26191247  T
Q  245 ttactatacaatctggttgaagatcttgaaacattacctcaat 287  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  26191246 tgactatacaatctggttgaagatctttaaacagaacctcaat 26191204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26128752 - 26128516
Alignment:
Q  41 gaagctgcagacggctcatctcaatggtatgaggcaaacaaggaatagtaaacttctgtgtatcagaaactaaatgatcatgaggtctatactttctaac 140  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | |     
T  26128752 gaagctgcagaggagtcatctcaattgtatgaggcaaaccaggaattgtaaatttctgtgtatcagaaactaaattatcatttggtctatacttcatgat 26128653  T
Q  141 aaaataacatgcacaattggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattgcacagtccaaggaatcatcata 240  Q
    |||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||| | |||||||||||||| ||  || |||||||||| |||||||    
T  26128652 aaaatgttctgcacagttggagaagtagcttgagctgttataatgaattcttggaatacctagttttgcagctgcttcgaccgtccaaggaagcatcata 26128553  T
Q  241 tcagttactatacaatctggttgaagatcttgaaaca 277  Q
    || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26128552 tctgtcactatacaatcaggttgaaggtcttgaaaca 26128516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26155388 - 26155152
Alignment:
Q  41 gaagctgcagacggctcatctcaatggtatgaggcaaacaaggaatagtaaacttctgtgtatcagaaactaaatgatcatgaggtctatactttctaac 140  Q
    ||||||||||| |  |||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |     
T  26155388 gaagctgcagaggagtcatttcaattgtatgaggcaaaccaggaattgtaaatttgtgtgtatcagaaactaaattatcatgaggtctatacttcatgat 26155289  T
Q  141 aaaataacatgcacaattggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattgcacagtccaaggaatcatcata 240  Q
     |||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | |||| ||||||||| ||  || |||||||||| |||||||    
T  26155288 caaatgagcagcacaattggagaagtagcttgagctgtaataatgaattcttggaatacctagtcttgcagctgcttcgaccgtccaaggaaacatcata 26155189  T
Q  241 tcagttactatacaatctggttgaagatcttgaaaca 277  Q
    || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26155188 tctgtcactatacaatcaggttgaaggtcttgaaaca 26155152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26179253 - 26179032
Alignment:
Q  56 tcatctcaatggtatgaggcaaacaaggaatagtaaacttctgtgtatcagaaactaaatgatcatgaggtctatactttctaacaaaataacatgcaca 155  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | |  |||| |    ||||    
T  26179253 tcatctcaattgtatgaggaaaacaaggaattgtaaatttctgtgtatcagaaactaaattatcatttggtctatacttcatgatcaaatgagcaacaca 26179154  T
Q  156 attggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattgcacagtccaaggaatcatcatatcagttactatacaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | |||||||||||||| || ||| ||||| |||  |  ||||||||| || ||||||    
T  26179153 attggagaagtagcttgagctgtaataatgaattcttggaatacctagttttgcagctgcttccactgtccacggatacgacatatcagtgacaatacaa 26179054  T
Q  256 tctggttgaagatcttgaaaca 277  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  26179053 tcaggttgaagatcttgaaaca 26179032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 277
Target Start/End: Original strand, 19103509 - 19103745
Alignment:
Q  41 gaagctgcagacggctcatctcaatggtatgaggcaaacaaggaatagtaaacttctgtgtatcagaaactaaatgatcatgaggtctatactttctaac 140  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||  | |     
T  19103509 gaagctgcagaggagtcatctcaatggtatgaggcaaaccaggaaccgtaaatttctgcgtatcagaaactaaattattatgaggtctatacttcatgat 19103608  T
Q  141 aaaataacatgcacaattggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattgcacagtccaaggaatcatcata 240  Q
    |||||   |  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||| | |||||||||||||| ||  || ||||||| |  ||||  |    
T  19103609 aaaatggaaaacacagttggagaagtagcttgagctgtaatagtgaattcttggaatacctagttttgcagctgcttcgacggtccaagcatacatctga 19103708  T
Q  241 tcagttactatacaatctggttgaagatcttgaaaca 277  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19103709 tcagtaactatacaatctggtcgaagatcgtgaaaca 19103745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26087951 - 26087753
Alignment:
Q  56 tcatctcaatggtatgaggcaaacaaggaatagtaaacttctgtgtatcagaaactaaatgatcatgaggtctatactttctaacaaaataacatgcaca 155  Q
    |||||||||| | |||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | | |||||    ||||||    
T  26087951 tcatctcaattgaatgagggaatccaggaacagtaaatttctgtgtatcagaaaccaaattatcatgaggtctatacttcatgataaaatgttctgcaca 26087852  T
Q  156 attggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattgcacagtccaaggaatcatcatatcagttactataca 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||| | |||||||||||||| ||  || |||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  26087851 gttggagaagtagcttgagctgtaatagtgaattcttggaatacctagttttgcagctgcttcgaccgtccaaggaaacatcatatttgtcactataca 26087753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26111739 - 26111541
Alignment:
Q  56 tcatctcaatggtatgaggcaaacaaggaatagtaaacttctgtgtatcagaaactaaatgatcatgaggtctatactttctaacaaaataacatgcaca 155  Q
    |||||||||| | |||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | | |||||    ||||||    
T  26111739 tcatctcaattgaatgagggaatccaggaacagtaaatttctgtgtatcagaaaccaaattatcatgaggtctatacttcatgataaaatgttctgcaca 26111640  T
Q  156 attggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattgcacagtccaaggaatcatcatatcagttactataca 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||| | |||||||||||||| ||  || |||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  26111639 gttggagaagtagcttgagctgtaatagtgaattcttggaatacctagttttgcagctgcttcgaccgtccaaggaaacatcatatttgtcactataca 26111541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26227046 - 26226927
Alignment:
Q  150 tgcacaattggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattgcacagtccaaggaatcatcatatcagttact 249  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| |  |||    
T  26227046 tgcacaacttgagaagtagcttgagctgtaatagtaaagcctaggaatgccgcgttttgcagctgattgcactgtccaaggaaataacatatctgagact 26226947  T
Q  250 atacaatctggttgaagatc 269  Q
    ||||||||| |||| |||||    
T  26226946 atacaatcttgttggagatc 26226927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26301886 - 26301760
Alignment:
Q  151 gcacaattggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattgcacagtccaaggaatcatcatatcagttacta 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | || | ||| |||||| | ||||||| ||||||||  || |||||||||  || |||||| || ||||    
T  26301886 gcacagttggagaagtagcttgagctgtaaaagtacatcctcggaatgttcagttttgaagctgattcaactgtccaaggatacagcatatcggtgacta 26301787  T
Q  251 tacaatctggttgaagatcttgaaaca 277  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26301786 tacaatctggttgaagttcttgaaaca 26301760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26207511 - 26207392
Alignment:
Q  150 tgcacaattggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattgcacagtccaaggaatcatcatatcagttact 249  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||   | |||||| |  |||    
T  26207511 tgcacaacttgagaagtagcttgagctgtaatagtaaagccttggaatgccgagttttgcagctgattccactgtccatggatataacatatctgagact 26207412  T
Q  250 atacaatctggttgaagatc 269  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  26207411 atacaatctggttggagatc 26207392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 26301966 - 26301902
Alignment:
Q  56 tcatctcaatggtatgaggcaaacaaggaatagtaaacttctgtgtatcagaaactaaatgatca 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26301966 tcatctcaattgtatgaggcaaaccagcaatagtaaatttctgtgtatcagaaaccaaattatca 26301902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26259962 - 26259848
Alignment:
Q  163 aagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattgcacagtccaaggaatcatcatatcagttactatacaatctggtt 262  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||| ||||  |  ||||| || |||||||  || |||||||||   | ||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  26259962 aagtagcttgagctgtaatagtagatccttggaacaccgagtttcgctgctgattcaactgtccaaggatagaacatatcagagactatgcaatcaggtt 26259863  T
Q  263 gaagatcttgaaaca 277  Q
    |||||||||||||||    
T  26259862 gaagatcttgaaaca 26259848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 4712 times since January 2019
Visitors: 4838