View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0740_high_21 (Length: 459)

Name: NF0740_high_21
Description: NF0740
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0740_high_21
NF0740_high_21
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (1-431)||(15648-16078)
scaffold0390 (1-432)||(2663-3094)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (1-431)||(22138170-22138600)
chr2 (127-336)||(32296025-32296227)
chr2 (127-356)||(24428859-24429077)
chr2 (132-296)||(32240500-32240661)
chr2 (1-114)||(9636755-9636868)
chr2 (1-114)||(6094726-6094839)
chr2 (1-114)||(24277771-24277884)
chr2 (1-126)||(19666538-19666663)
chr2 (1-114)||(24884696-24884809)
chr2 (1-114)||(19433456-19433569)
chr2 (127-216)||(32303738-32303827)
chr2 (1-126)||(43645903-43646028)
chr2 (1-125)||(19669222-19669346)
chr2 (1-113)||(23821730-23821842)
chr2 (1-113)||(23830809-23830921)
chr2 (6-102)||(24560867-24560963)
chr2 (6-114)||(25595038-25595143)
chr2 (1-126)||(68002-68127)
chr2 (13-97)||(33128067-33128151)
chr2 (14-124)||(25265520-25265629)
chr2 (35-126)||(24571404-24571495)
chr2 (1-126)||(25305455-25305581)
chr2 (6-102)||(18536771-18536866)
chr2 (1-112)||(28031372-28031484)
chr2 (1-75)||(3404-3478)
chr2 (40-114)||(16292925-16292999)
chr2 (1-94)||(24294667-24294760)
chr2 (14-126)||(271193-271304)
chr2 (1-94)||(722405-722498)
chr2 (51-112)||(22775331-22775392)
chr2 (51-112)||(22780709-22780770)
chr2 (269-298)||(32303694-32303723)
chr2 (14-126)||(4448246-4448357)
chr2 (1-112)||(15633224-15633335)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (1-432)||(4130-4561)
scaffold0786 (1-60)||(1604-1663)
[»] scaffold1678 (1 HSPs)
scaffold1678 (127-304)||(103-280)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (1-114)||(18261595-18261708)
chr8 (1-114)||(27233191-27233304)
chr8 (1-114)||(38635772-38635885)
chr8 (1-114)||(45559061-45559174)
chr8 (1-114)||(45465250-45465363)
chr8 (1-114)||(18041656-18041769)
chr8 (1-126)||(23226188-23226313)
chr8 (1-114)||(33172238-33172351)
chr8 (1-114)||(26011504-26011617)
chr8 (1-114)||(33528436-33528548)
chr8 (1-113)||(33611178-33611290)
chr8 (1-126)||(19331426-19331552)
chr8 (1-114)||(5854624-5854737)
chr8 (1-114)||(22497333-22497446)
chr8 (1-120)||(23151951-23152070)
chr8 (1-114)||(15933308-15933421)
chr8 (3-114)||(22742773-22742887)
chr8 (24-126)||(29306450-29306552)
chr8 (1-126)||(23837208-23837333)
chr8 (1-113)||(20709703-20709814)
chr8 (1-126)||(23158173-23158295)
chr8 (7-97)||(37653757-37653847)
chr8 (1-126)||(21198264-21198389)
chr8 (1-114)||(24552694-24552807)
chr8 (1-126)||(23149791-23149913)
chr8 (1-126)||(38533659-38533784)
chr8 (14-126)||(39446878-39446990)
chr8 (4-74)||(16002011-16002081)
chr8 (13-74)||(31194488-31194549)
chr8 (54-126)||(25296222-25296293)
chr8 (54-126)||(25758242-25758313)
chr8 (1-112)||(22735964-22736075)
chr8 (1-97)||(3431429-3431526)
chr8 (1-102)||(15969828-15969929)
chr8 (14-126)||(21681025-21681137)
chr8 (46-126)||(37611723-37611802)
chr8 (14-126)||(20573305-20573416)
chr8 (1-80)||(21494614-21494694)
chr8 (1-80)||(22886337-22886417)
chr8 (86-126)||(22981368-22981408)
chr8 (14-126)||(41246681-41246792)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (1-126)||(20583666-20583791)
chr7 (1-114)||(17947716-17947829)
chr7 (1-126)||(4484737-4484862)
chr7 (1-114)||(9723931-9724044)
chr7 (1-114)||(13448951-13449064)
chr7 (1-114)||(28390322-28390435)
chr7 (8-125)||(31501190-31501307)
chr7 (1-126)||(38424229-38424354)
chr7 (1-114)||(46474011-46474124)
chr7 (6-112)||(45149617-45149723)
chr7 (1-114)||(16915052-16915165)
chr7 (1-114)||(34241312-34241425)
chr7 (1-114)||(48356654-48356767)
chr7 (1-114)||(9611318-9611430)
chr7 (1-114)||(9838890-9839002)
chr7 (6-126)||(13863042-13863162)
chr7 (1-126)||(14940763-14940890)
chr7 (2-114)||(15358808-15358920)
chr7 (1-126)||(14935373-14935495)
chr7 (1-126)||(15362966-15363088)
chr7 (1-114)||(4446222-4446335)
chr7 (1-110)||(13377539-13377648)
chr7 (1-93)||(9321181-9321273)
chr7 (18-126)||(13274814-13274922)
chr7 (1-112)||(15368356-15368469)
chr7 (38-114)||(33559694-33559770)
chr7 (14-126)||(49047786-49047898)
chr7 (29-126)||(16919597-16919694)
chr7 (6-73)||(8563513-8563580)
chr7 (1-79)||(14272045-14272123)
chr7 (37-126)||(12248233-12248322)
chr7 (1-114)||(17224062-17224175)
chr7 (1-75)||(25124140-25124214)
chr7 (14-126)||(12759010-12759121)
chr7 (46-126)||(16570118-16570198)
chr7 (46-126)||(16595464-16595544)
chr7 (49-114)||(8267852-8267917)
chr7 (51-126)||(28722169-28722245)
chr7 (46-126)||(3049638-3049717)
chr7 (46-126)||(3895080-3895159)
chr7 (14-126)||(11287440-11287551)
chr7 (1-62)||(4438831-4438893)
chr7 (1-97)||(371099-371196)
chr7 (37-126)||(12369953-12370041)
chr7 (14-126)||(15822544-15822655)
chr7 (1-77)||(18980190-18980266)
chr7 (14-126)||(26070377-26070488)
chr7 (14-126)||(26094164-26094275)
[»] chr6 (34 HSPs)
chr6 (1-114)||(34966877-34966990)
chr6 (1-112)||(19854165-19854276)
chr6 (1-114)||(29160427-29160540)
chr6 (1-114)||(25651247-25651360)
chr6 (6-114)||(22462221-22462328)
chr6 (1-115)||(33538492-33538606)
chr6 (1-126)||(22361877-22362002)
chr6 (1-114)||(29605460-29605573)
chr6 (1-114)||(18629732-18629848)
chr6 (1-126)||(33324703-33324828)
chr6 (1-126)||(35136124-35136249)
chr6 (1-126)||(18398948-18399073)
chr6 (6-126)||(15079820-15079940)
chr6 (1-102)||(23221924-23222027)
chr6 (14-124)||(35009569-35009678)
chr6 (1-114)||(18381807-18381920)
chr6 (1-114)||(23222757-23222874)
chr6 (12-126)||(25367349-25367463)
chr6 (1-126)||(21623178-21623303)
chr6 (1-102)||(25919623-25919724)
chr6 (20-114)||(17013763-17013858)
chr6 (53-126)||(16887904-16887977)
chr6 (1-114)||(17557141-17557253)
chr6 (49-114)||(32352105-32352170)
chr6 (51-114)||(17083321-17083384)
chr6 (54-124)||(22848078-22848148)
chr6 (1-114)||(19672305-19672409)
chr6 (1-80)||(16300146-16300226)
chr6 (17-124)||(28195207-28195315)
chr6 (1-40)||(17083376-17083415)
chr6 (1-70)||(19629341-19629409)
chr6 (1-77)||(18086992-18087068)
chr6 (14-126)||(31628291-31628402)
chr6 (1-80)||(32276929-32277008)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (1-114)||(18238281-18238394)
chr4 (1-126)||(15013394-15013519)
chr4 (1-124)||(38764719-38764842)
chr4 (1-114)||(13590198-13590311)
chr4 (1-126)||(41256481-41256606)
chr4 (1-114)||(7964835-7964948)
chr4 (1-114)||(41916850-41916963)
chr4 (1-114)||(50220064-50220177)
chr4 (1-114)||(54398393-54398506)
chr4 (1-112)||(7185970-7186081)
chr4 (1-114)||(40905058-40905170)
chr4 (4-114)||(13442800-13442913)
chr4 (1-126)||(15044838-15044963)
chr4 (1-126)||(52265620-52265745)
chr4 (1-114)||(18276444-18276557)
chr4 (1-110)||(15109477-15109586)
chr4 (6-126)||(41166058-41166178)
chr4 (1-95)||(19821919-19822013)
chr4 (16-126)||(13809622-13809732)
chr4 (51-114)||(47468472-47468535)
chr4 (51-126)||(47535177-47535252)
chr4 (14-126)||(27960994-27961106)
chr4 (15-126)||(21959576-21959686)
chr4 (1-40)||(47468527-47468566)
chr4 (1-114)||(14901242-14901355)
chr4 (35-124)||(18494442-18494531)
chr4 (46-126)||(12837313-12837392)
chr4 (1-112)||(14996138-14996249)
chr4 (14-126)||(16732192-16732303)
chr4 (1-112)||(19697506-19697617)
chr4 (1-112)||(19708091-19708202)
chr4 (46-126)||(30232609-30232688)
chr4 (14-112)||(23270060-23270158)
chr4 (1-94)||(37957169-37957262)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (1-114)||(7799-7912)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-114)||(3262-3374)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (1-114)||(37568-37681)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-114)||(27507-27620)
scaffold0004 (1-114)||(86367-86480)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (1-126)||(21195024-21195149)
chr1 (1-114)||(33397362-33397475)
chr1 (1-114)||(17608938-17609051)
chr1 (1-114)||(40436393-40436506)
chr1 (4-114)||(5768293-5768403)
chr1 (4-102)||(8538046-8538144)
chr1 (4-102)||(8603285-8603383)
chr1 (1-126)||(22143473-22143598)
chr1 (1-114)||(37233984-37234097)
chr1 (1-114)||(52400641-52400754)
chr1 (1-113)||(49997406-49997519)
chr1 (6-114)||(76497-76605)
chr1 (6-75)||(20194059-20194128)
chr1 (1-126)||(20177185-20177310)
chr1 (6-114)||(25093880-25093982)
chr1 (14-126)||(51627776-51627888)
chr1 (1-79)||(41229098-41229176)
chr1 (1-114)||(13376964-13377077)
chr1 (1-97)||(21650188-21650285)
chr1 (1-94)||(36356437-36356530)
chr1 (1-93)||(27674806-27674898)
chr1 (14-128)||(35522430-35522543)
chr1 (54-110)||(16645975-16646031)
chr1 (46-126)||(27329868-27329947)
chr1 (52-110)||(16656699-16656757)
chr1 (1-77)||(17148578-17148654)
chr1 (14-126)||(21718251-21718362)
chr1 (14-126)||(22403223-22403334)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (1-110)||(43926-44035)
scaffold0080 (1-114)||(23796-23909)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-114)||(6554-6667)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (1-126)||(6456634-6456759)
chr5 (1-114)||(21109760-21109873)
chr5 (1-126)||(23981628-23981753)
chr5 (1-114)||(29917975-29918088)
chr5 (2-114)||(37983375-37983487)
chr5 (1-80)||(19873854-19873933)
chr5 (1-111)||(16835426-16835536)
chr5 (17-113)||(22885668-22885764)
chr5 (1-113)||(23234610-23234722)
chr5 (3-114)||(26559939-26560050)
chr5 (1-119)||(23493929-23494047)
chr5 (1-126)||(19862219-19862344)
chr5 (1-114)||(24084087-24084200)
chr5 (6-112)||(23417256-23417362)
chr5 (1-114)||(21617026-21617139)
chr5 (1-126)||(7728430-7728555)
chr5 (1-110)||(21222736-21222845)
chr5 (6-75)||(24225480-24225549)
chr5 (2-126)||(3673873-3673997)
chr5 (6-126)||(432478-432598)
chr5 (1-126)||(5450955-5451080)
chr5 (1-97)||(9730531-9730628)
chr5 (6-114)||(11763629-11763740)
chr5 (14-126)||(1168317-1168428)
chr5 (1-112)||(7528910-7529022)
chr5 (51-126)||(24183245-24183319)
chr5 (7-77)||(23514578-23514648)
chr5 (52-110)||(28902252-28902310)
chr5 (52-110)||(28938647-28938705)
chr5 (47-112)||(16595564-16595629)
chr5 (46-126)||(20712131-20712210)
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (1-114)||(41661575-41661688)
chr3 (1-114)||(12952974-12953087)
chr3 (1-114)||(31412457-31412570)
chr3 (7-126)||(9590866-9590985)
chr3 (1-114)||(6228749-6228862)
chr3 (1-126)||(11061118-11061243)
chr3 (1-124)||(14814879-14815002)
chr3 (1-112)||(33369034-33369145)
chr3 (1-114)||(43427640-43427751)
chr3 (1-114)||(4162329-4162442)
chr3 (4-102)||(50313200-50313298)
chr3 (1-112)||(1990812-1990924)
chr3 (1-113)||(34559909-34560021)
chr3 (6-112)||(38375804-38375910)
chr3 (1-126)||(3576550-3576675)
chr3 (1-114)||(17204710-17204823)
chr3 (6-114)||(10912900-10913008)
chr3 (20-114)||(11638386-11638480)
chr3 (1-126)||(17191551-17191676)
chr3 (1-114)||(47784871-47784984)
chr3 (14-126)||(14295461-14295573)
chr3 (14-126)||(17139531-17139643)
chr3 (1-126)||(12488838-12488963)
chr3 (1-126)||(14080519-14080644)
chr3 (1-126)||(39656536-39656661)
chr3 (14-126)||(11329073-11329185)
chr3 (14-126)||(14528124-14528236)
chr3 (35-126)||(14301109-14301200)
chr3 (1-126)||(16880133-16880258)
chr3 (1-94)||(38811152-38811245)
chr3 (6-74)||(11402604-11402672)
chr3 (1-75)||(51961300-51961374)
chr3 (1-126)||(14059325-14059450)
chr3 (1-97)||(16934122-16934219)
chr3 (1-97)||(15876078-15876174)
chr3 (6-74)||(12539234-12539305)
chr3 (37-126)||(12560348-12560437)
chr3 (1-126)||(55440961-55441086)
chr3 (1-112)||(14284971-14285083)
chr3 (46-126)||(17100708-17100787)
chr3 (46-126)||(17101393-17101472)
chr3 (51-126)||(12349652-12349726)
chr3 (1-112)||(8268878-8268989)
chr3 (1-112)||(8275978-8276089)
chr3 (1-80)||(11477356-11477436)
chr3 (46-126)||(38167969-38168048)
chr3 (46-126)||(54424067-54424146)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (1-114)||(2535-2648)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (1-126)||(8020-8145)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (1-114)||(108020-108132)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-114)||(69467-69580)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (14-114)||(29987-30087)
scaffold0165 (1-114)||(22009-22122)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (1-112)||(85543-85654)
scaffold0025 (15-110)||(53370-53465)
scaffold0025 (46-126)||(146656-146735)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (1-114)||(7412-7525)
scaffold0253 (1-114)||(16837-16950)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-126)||(104735-104859)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-126)||(79549-79674)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (6-126)||(4578-4698)
scaffold0447 (6-126)||(9192-9312)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (1-94)||(131846-131939)
scaffold0022 (6-114)||(68082-68190)
scaffold0022 (1-126)||(103034-103159)
scaffold0022 (14-126)||(109613-109725)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (6-126)||(5955-6075)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (2-114)||(4616-4728)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (1-91)||(1845-1934)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (8-126)||(22534-22652)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (11-97)||(61375-61461)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (6-126)||(7186-7307)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-114)||(76971-77084)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-114)||(197377-197490)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (6-114)||(998-1106)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (17-97)||(17462-17542)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (2-114)||(31031-31143)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (6-108)||(2470-2572)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (1-102)||(2908-3012)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (1-126)||(11104-11229)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (1-126)||(10672-10797)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-126)||(2428-2553)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (1-126)||(70418-70543)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (6-75)||(12780-12849)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (1-77)||(1107-1183)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (14-121)||(41672-41778)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (1-126)||(1658-1784)
scaffold0456 (1-126)||(8803-8929)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (1-112)||(68004-68119)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (6-75)||(12897-12966)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (1-126)||(7137-7262)
scaffold0162 (14-98)||(8332-8416)
scaffold0162 (1-80)||(11756-11835)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (1-126)||(28546-28671)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-126)||(46175-46299)
scaffold0034 (1-126)||(40668-40792)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (1-114)||(97322-97435)
scaffold0031 (54-126)||(70676-70748)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (1-112)||(33672-33783)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (14-112)||(13530-13628)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (14-126)||(33840-33952)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (20-114)||(25374-25469)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (18-126)||(8994-9102)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (6-70)||(33582-33646)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (1-124)||(319-442)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (45-124)||(51312-51390)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-64)||(116687-116750)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (16-125)||(11712-11821)
scaffold0021 (14-126)||(132363-132474)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (50-114)||(14095-14159)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (46-126)||(159354-159434)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-124)||(6671-6794)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (6-64)||(1411-1469)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (68-126)||(22541-22599)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (46-126)||(1971-2050)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (14-126)||(21535-21646)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (37-126)||(3365-3454)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-126)||(4951-5075)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (14-126)||(167-278)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (14-126)||(689-800)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (14-126)||(7592-7703)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (14-126)||(9960-10071)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (46-126)||(24841-24920)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-80)||(50013-50093)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (51-126)||(89975-90050)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (6-49)||(147568-147611)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (7-112)||(5714-5820)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (1-70)||(5232-5300)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (14-126)||(1340-1451)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (14-126)||(631-742)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (1-45)||(3316-3360)


Alignment Details
Target: scaffold0390 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16078 - 15648
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||  || ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16078 atgaattatgaatacccaagtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaacatggttctcttcataattcaaaaacatca 15979  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcatacaatgaacatgagtttgtatagttacacataataaccaacaacacatttttgcagagaaataataatttaaaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15978 tagcataattcaaccaattgagcatacaatgaacatgagtttgtatagttacacataataaccaacaacacatttttgcagagaaataataatttaaaca 15879  T
Q  201 tatacatgtcaattgtgccaatagaattttcacaacattaagtggcttttattttatttttcatttacgattaatgaataagttgaatgattgtttaaac 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15878 tatacaggtcaattgtgccaatagaattttcacaacattaagtggcttttattttatttttcgtttacgattaatgaataagttgaatgattgtttaaac 15779  T
Q  301 aatcaattatcatcaatcttgtccaaacccaactcattcgcaagcttgtaacattcctcatcaattgtcttggtcctgaatgcaaggggtttaacaacac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15778 aatcaattatcatcaatcttgtccaaacccaactcattggcaagcttgtaacattcctcatcaattgtcttggtcctgaatgcaaggggtttaacaacac 15679  T
Q  401 gaaccacgcgaacgacaccctccatcttggt 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15678 gaaccacgcgaacgacaccctccatcttggt 15648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3094 - 2663
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| ||||| |  || ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3094 atgaattatgaatacccatgtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaacatggttctcttcataattcaaaaacatca 2995  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcatacaatgaacatgagtttgtatagttacacataataaccaacaacacatttttgcagagaaataataatttaaaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2994 tagcataattcaaccaattgagcatacaatgaacatgagtttgtatagttacacataataaccaacaacacatttttgcagagaaataataatttaaaca 2895  T
Q  201 tatacatgtcaattgtgccaatagaattttcacaacattaagtggcttttattttatttttcatttacgattaatgaataagttgaatgattgtttaaac 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2894 tatacaggtcaattgtgccaatagaattttcacaacattaagtggcttttattttatttttcgtttacgattaatgaataagttgaatgattgtttaaac 2795  T
Q  301 aatcaattatcatcaatcttgtccaaacccaactcattcgcaagcttgtaacattcctcatcaattgtcttggtcctgaatgcaaggggtttaacaacac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2794 aatcaattatcatcaatcttgtccaaacccaactcattggcaagcttgtaacattcctcatcaattgtcttggtcctgaatgcaaggggtttaacaacac 2695  T
Q  401 gaaccacgcgaacgacaccctccatcttggtg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2694 gaaccacgcgaacgacaccctccatcttggtg 2663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 22138170 - 22138600
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||  || ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22138170 atgaattatgaatacccaagtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaacatggttctcttcataattcaaaaacatca 22138269  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcatacaatgaacatgagtttgtatagttacacataataaccaacaacacatttttgcagagaaataataatttaaaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22138270 tagcataattcaaccaattgagcatacaatgaacatgagtttgtatagttacacataataaccaacaacacatttttgcagagaaataataatttaaaca 22138369  T
Q  201 tatacatgtcaattgtgccaatagaattttcacaacattaagtggcttttattttatttttcatttacgattaatgaataagttgaatgattgtttaaac 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22138370 tatacaggtcaattgtgccaatagaattttcacaacattaagtggcttttattttatttttcgtttacgattaatgaataagttgaatgattgtttaaac 22138469  T
Q  301 aatcaattatcatcaatcttgtccaaacccaactcattcgcaagcttgtaacattcctcatcaattgtcttggtcctgaatgcaaggggtttaacaacac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22138470 aatcaattatcatcaatcttgtccaaacccaactcattggcaagcttgtaacattcctcatcaattgtcttggtcctgaatgcaaggggtttaacaacac 22138569  T
Q  401 gaaccacgcgaacgacaccctccatcttggt 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22138570 gaaccacgcgaacgacaccctccatcttggt 22138600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 127 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 32296227 - 32296025
Alignment:
Q  127 caatgaacatgagtttgtatagttacacataataaccaacaacacatttttgcagagaaataataatttaaacatatacatgtcaattgtgccaatagaa 226  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  32296227 caataaacatgattttgtatagttacacataataaccaacaacacatttttgcagagaaataataatttaaacagatacaggtcaattgtgccaatataa 32296128  T
Q  227 ttttcacaacattaagtggcttttattttatttttcatttacgattaatgaataagttgaatgattgtttaaacaatcaattatcatcaatcttgtccaa 326  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||||||    
T  32296127 atttcacaacattaagtggcttttattttattttttgattaggtttaatgaataagttgaatgattgtttaatca-------atcatcaagcttgtccaa 32296035  T
Q  327 acccaactca 336  Q
    ||||||||||    
T  32296034 acccaactca 32296025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 356
Target Start/End: Original strand, 24428859 - 24429077
Alignment:
Q  127 caatgaacatgagtttgtatagttacacataataaccaacaacacatttttgcagagaaataataatttaaacatatacatgtcaattgtgccaatagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    |||||||||||||    
T  24428859 caatgaacatgagtttgtatagttaggcataataaccaacaaaacatttttgcagagaaataataatttaaacagatacaggt----tgtgccaatagaa 24428954  T
Q  227 ttttcacaacattaagtggcttttattttatttttcatttacgattaatgaataagttgaatgattgtttaaacaatcaattatcatcaatcttgtccaa 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||| |||||||||    
T  24428955 ttttcacaacattaagtgacttttattttatttttcgtttaggattaatgaataagttgaatgattatttaatca-------atcatcaagcttgtccaa 24429047  T
Q  327 acccaactcattcgcaagcttgtaacattc 356  Q
    ||||||||| ||  ||||||| | ||||||    
T  24429048 acccaactcttttacaagcttttcacattc 24429077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 132 - 296
Target Start/End: Original strand, 32240500 - 32240661
Alignment:
Q  132 aacatgagtttgtatagttacacataataaccaacaacacatttttgcagagaaataa-taatttaaacatatacatgtcaattgtgccaatagaatttt 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    ||| |||||||||||||    
T  32240500 aacaagagtttgtatagttacacataataaccaataacacatttttgcagagaaataaataatttaaacagatacaggt----tgtaccaatagaatttt 32240595  T
Q  231 cacaacattaagtggcttttattttatttttcatttacgattaatgaataagttgaatgattgttt 296  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32240596 cacaacattaagtggcctttattttatttttcgtttaggattaacgaataagttgaatgattgttt 32240661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 9636755 - 9636868
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  9636755 atgatttatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaaca 9636854  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  9636855 tagcacaattcaac 9636868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 6094726 - 6094839
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  6094726 atgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaaca 6094825  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || || ||||||||    
T  6094826 taacacaattcaac 6094839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 24277771 - 24277884
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  24277771 atgatttatgagtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcacaattcaacaacaaca 24277870  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || || ||||||||    
T  24277871 taacacaattcaac 24277884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 19666538 - 19666663
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||    
T  19666538 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaataacaaca 19666637  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  19666638 tagcataattcaaccatttgagcata 19666663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 24884696 - 24884809
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||    
T  24884696 atgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctattagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaataaca 24884795  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  24884796 tagcacaattcaac 24884809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 19433569 - 19433456
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    | ||||||| |||| ||    
T  19433569 atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttacaacaattcaataacaaca 19433470  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||||||||||||    
T  19433469 tagcataattcaac 19433456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 127 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32303827 - 32303738
Alignment:
Q  127 caatgaacatgagtttgtatagttacacataataaccaacaacacatttttgcagagaaataataatttaaacatatacatgtcaattgt 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||    
T  32303827 caatgaacatgagtttttatagttacatataataaccaacaacacatttttgcagagaaataatggtttaaacagttacatgtcaattgt 32303738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 43645903 - 43646028
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||   || | |||||||||| ||    
T  43645903 atgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcgacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacagttcaacaacaaca 43646002  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  43646003 tagcataattcaacaatttgagcata 43646028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19669346 - 19669222
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||| ||    
T  19669346 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatggttcacatcataattcaacaacaaca 19669247  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcat 125  Q
    || |||||||||||||||| |||||    
T  19669246 tatcataattcaaccaattaagcat 19669222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23821842 - 23821730
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||    
T  23821842 atgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataaca 23821743  T
Q  101 tagcataattcaa 113  Q
    ||||| |||||||    
T  23821742 tagcacaattcaa 23821730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23830921 - 23830809
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||    
T  23830921 atgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataaca 23830822  T
Q  101 tagcataattcaa 113  Q
    ||||| |||||||    
T  23830821 tagcacaattcaa 23830809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 24560963 - 24560867
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcata 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||| ||||    
T  24560963 ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacata 24560867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 114
Target Start/End: Original strand, 25595038 - 25595143
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||| |||||||    
T  25595038 ttatgaacacccaagctatgaatcatc---aacaatctctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaaaaacaacatagca 25595134  T
Q  106 taattcaac 114  Q
     ||||||||    
T  25595135 caattcaac 25595143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 68002 - 68127
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||   || |||||||||||| ||    
T  68002 atgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaaca 68101  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  68102 tagcataattcaacaatttgagcata 68127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Original strand, 33128067 - 33128151
Alignment:
Q  13 cacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaaca 97  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33128067 cacccaagccatgaatcattaacaacaatatctcttaaccacaacaatatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaaca 33128151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 25265629 - 25265520
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  25265629 acccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattc-a 25265531  T
Q  114 ccaattgagca 124  Q
    |||||||||||    
T  25265530 ccaattgagca 25265520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 24571495 - 24571404
Alignment:
Q  35 caacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||   || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24571495 caacaacatcacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattgagcata 24571404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 25305455 - 25305581
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaa-catc 99  Q
    |||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| |||   || |||||||||| || |    
T  25305455 atgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttagccacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatcaac 25305554  T
Q  100 atagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||    
T  25305555 atagcataattcaacaatttgagcata 25305581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 102
Target Start/End: Original strand, 18536771 - 18536866
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||| ||||    
T  18536771 ttatgaacacc-aagctatgaatcatcaacaacagtatctcatgacgacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacata 18536866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28031484 - 28031372
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcttcataattcaacaacatc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |  |||||||||||| |    
T  28031484 atgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcaacaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaac 28031385  T
Q  100 atagcataattca 112  Q
    ||| |||||||||    
T  28031384 atatcataattca 28031372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 3478 - 3404
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatga 75  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3478 atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatga 3404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16292999 - 16292925
Alignment:
Q  40 atatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaac 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  16292999 atatctcttaataacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagtacaattcaac 16292925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24294760 - 24294667
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaaca 94  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||||||||  |||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  24294760 atgaattatgaatactcaagccatgaatcatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcagcataattcaaca 24294667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 271193 - 271304
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||| ||  | || ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||||||||| || | |||||||| |    
T  271193 acccaagctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattc-a 271291  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  271292 ccaattgagcata 271304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 722405 - 722498
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaaca 94  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||| ||| |||| || |||| || |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  722405 atgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcacttagcagcaactacttcaattgaacatgaatctcagcataattcaaca 722498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22775392 - 22775331
Alignment:
Q  51 caacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattca 112  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||  ||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22775392 caacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattca 22775331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22780770 - 22780709
Alignment:
Q  51 caacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattca 112  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||  ||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22780770 caacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattca 22780709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 32303723 - 32303694
Alignment:
Q  269 gattaatgaataagttgaatgattgtttaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32303723 gattaatgaataagttgaatgattgtttaa 32303694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 4448357 - 4448246
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  | || ||||||||||||||||| | |||||  ||  |||||||||||||||| || ||||| |||| |    
T  4448357 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataattcaacaacaacaaagcatcattc-a 4448259  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||| ||||    
T  4448258 ccaattgaacata 4448246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 15633224 - 15633335
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcttcataattcaacaacatc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| || |||||  |  |||||||||||| |    
T  15633224 atgatatatgaacacccaagccataaatcatag-caacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgtttctcacctcaattcaacaacaac 15633322  T
Q  100 atagcataattca 112  Q
    ||  |||||||||    
T  15633323 atgtcataattca 15633335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4561 - 4130
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| ||||||   || ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4561 atgaattatgaatacccaaatcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaacatggttctcttcataattcaaaaacatca 4462  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcatacaatgaacatgagtttgtatagttacacataataaccaacaacacatttttgcagagaaataataatttaaaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4461 tagcataattcaaccaattgagcatacaatgaacatgagtttgtatagttacacataataaccaacaacacatttttgcagagaaataataatttaaaca 4362  T
Q  201 tatacatgtcaattgtgccaatagaattttcacaacattaagtggcttttattttatttttcatttacgattaatgaataagttgaatgattgtttaaac 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4361 tatacaggtcaattgtgccaatagaattttcacaacattaagtagcttttattttattttttgtttacgattaatgaataagttgaatgattgtttaaac 4262  T
Q  301 aatcaattatcatcaatcttgtccaaacccaactcattcgcaagcttgtaacattcctcatcaattgtcttggtcctgaatgcaaggggtttaacaacac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4261 aatcaattatcatcaatcttgtccaaacccaactcattggcaagcttgtaacattcctcatcaattgtcttggtcccgaatgcaaggggtttaacaacac 4162  T
Q  401 gaaccacgcgaacgacaccctccatcttggtg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4161 gaaccacgcgaacgacaccctccatcttggtg 4130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 1604 - 1663
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaac 60  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1604 atgaattatgaatacccaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1678 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1678
Description:

Target: scaffold1678; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 127 - 304
Target Start/End: Original strand, 103 - 280
Alignment:
Q  127 caatgaacatgagtttgtatagttacacataataaccaacaacacatttttgcagagaaataataatttaaacatatacatgtcaattgtgccaatagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  103 caatgaacatgagtttgtatagttacacataataaccaacaacacatttttgcagagaaataataatttaaacagatccaggtcaattgtgccaatagaa 202  T
Q  227 ttttcacaacattaagtggcttttattttatttttcatttacgattaatgaataagttgaatgattgtttaaacaatc 304  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  203 ttttcgcaacattaaatgacttttattttatttttggtttaggattaataaataagttgaatgattgtttaatcaatc 280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18261708 - 18261595
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  18261708 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaaca 18261609  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  18261608 tagcacaattcaac 18261595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 27233304 - 27233191
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  27233304 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaaca 27233205  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || || ||||||||    
T  27233204 taacacaattcaac 27233191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 38635885 - 38635772
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  38635885 atgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaaca 38635786  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || || ||||||||    
T  38635785 taacacaattcaac 38635772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 45559174 - 45559061
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  45559174 atgatttatgaccacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaaca 45559075  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  45559074 tagcacaattcaac 45559061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 45465363 - 45465250
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||    
T  45465363 atgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataaca 45465264  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||  ||||||||    
T  45465263 tagctcaattcaac 45465250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18041769 - 18041656
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  18041769 atgatttatgaacacctaagctatgaatcatcaacaacaatatatcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaaca 18041670  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || || ||||||||    
T  18041669 taacacaattcaac 18041656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23226313 - 23226188
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  23226313 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca 23226214  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    || |||||||||| || |||||||||    
T  23226213 taacataattcaatcatttgagcata 23226188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 33172238 - 33172351
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  33172238 atgatttatgaacacgcaagctatgaatcatcaacaaccatatctctttataacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaaca 33172337  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  33172338 tagcacaattcaac 33172351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 26011504 - 26011617
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||    
T  26011504 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattcaacatgaatctcatcacaattcaacaacaaca 26011603  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  26011604 tagcacaattcaac 26011617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 33528436 - 33528548
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||    
T  33528436 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaa-aatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaaca 33528534  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  33528535 tagcacaattcaac 33528548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33611290 - 33611178
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||| ||    
T  33611290 atgatttatgaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaacatggttctcaacacaattcaacaacaaca 33611191  T
Q  101 tagcataattcaa 113  Q
    |||||||||||||    
T  33611190 tagcataattcaa 33611178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19331552 - 19331426
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaa-caatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatc 99  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  19331552 atgattcatgaacacctaagctatgaatcatcaacaaacaatatctctcaataacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaac 19331453  T
Q  100 atagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||    
T  19331452 atagcacaactcaacaatttgagcata 19331426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 5854624 - 5854737
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||    
T  5854624 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaaca 5854723  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| || |||||    
T  5854724 tagcacaactcaac 5854737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22497446 - 22497333
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||    
T  22497446 atgatttatgaacacccaaactatgaatcattaacaacaatacctcttatcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaaca 22497347  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  22497346 tagcacaattcaac 22497333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23152070 - 23151951
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| ||    
T  23152070 atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacatagcaacaacagcatcaattgaacacggttctcatcataattcaacaacaaca 23151971  T
Q  101 tagcataattcaaccaattg 120  Q
    || |||||||||||||||||    
T  23151970 tatcataattcaaccaattg 23151951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 15933308 - 15933421
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  15933308 atgatttacaaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaaca 15933407  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || || ||||||||    
T  15933408 taacacaattcaac 15933421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 114
Target Start/End: Original strand, 22742773 - 22742887
Alignment:
Q  3 gatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctct---taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatc 99  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  22742773 gatttatgaacacccaagccacgaatcatcaacaacaatattcctcaacaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaac 22742872  T
Q  100 atagcataattcaac 114  Q
    |||||| ||||||||    
T  22742873 atagcacaattcaac 22742887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 126
Target Start/End: Original strand, 29306450 - 29306552
Alignment:
Q  24 tgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagc 123  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||    
T  29306450 tgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagc 29306549  T
Q  124 ata 126  Q
    |||    
T  29306550 ata 29306552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 23837208 - 23837333
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||   || |||||||||||| ||    
T  23837208 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaaca 23837307  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  23837308 tagcataattcaacaatttgagcata 23837333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 20709703 - 20709814
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  |    
T  20709703 atgatttatgaacacctaagttatga-tcatctacaacaatatctctcaacatcaacaacatcaattaaacatgattctcatcaaaactcaacaacaaaa 20709801  T
Q  101 tagcataattcaa 113  Q
    ||||| |||||||    
T  20709802 tagcacaattcaa 20709814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 23158173 - 23158295
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||   || ||||  |||||||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  23158173 atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaaca---tcacttaggaacaacaacaactattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca 23158269  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  23158270 taacataattcaaccaattgagcata 23158295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 37653847 - 37653757
Alignment:
Q  7 tatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaaca 97  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  37653847 tatgaacacccaagccataaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcaacagaattcaacaaca 37653757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21198389 - 21198264
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||| ||    
T  21198389 atgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacagcaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacaattcaacaacaaca 21198290  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    || ||||||||||| | |||||||||    
T  21198289 taacataattcaacaatttgagcata 21198264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24552807 - 24552694
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||| || ||||| |||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| ||    
T  24552807 atgattcattaacactcaagctctaaatcatcaacaaccatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaattaacaacaaca 24552708  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || || ||||||||    
T  24552707 taacacaattcaac 24552694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 23149791 - 23149913
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||   |     
T  23149791 atgaattatgaatactcaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaaaaacaactattgaacatgattctcatcataattcaacaa---ct 23149887  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23149888 tagcataattcaaccaattgagcata 23149913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 38533659 - 38533784
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| |||  |||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||    
T  38533659 atgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacctagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaaca 38533758  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||  | |||||||||    
T  38533759 tagcataattcaataatttgagcata 38533784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 39446990 - 39446878
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| ||   |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39446990 acccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaa 39446891  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||| ||||||    
T  39446890 ccaatttagcata 39446878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 16002011 - 16002081
Alignment:
Q  4 atttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatg 74  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16002011 atttatgaacacccaagatgtgaataatcaacaacaacatctcataacaacaacaacatcaattaaacatg 16002081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 31194549 - 31194488
Alignment:
Q  13 cacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatg 74  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31194549 cacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaacaacaacatcaattgaacatg 31194488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 126
Target Start/End: Original strand, 25296222 - 25296293
Alignment:
Q  54 caacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||    
T  25296222 caacaacatcaattaaacataattctcatcataattgaacaaca-catagaacaattcaacaatttgagcata 25296293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 126
Target Start/End: Original strand, 25758242 - 25758313
Alignment:
Q  54 caacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||    
T  25758242 caacaacatcaattaaacataattctcatcataattgaacaaca-catagaacaattcaacaatttgagcata 25758313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22736075 - 22735964
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| | | ||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||| |||||||| ||    
T  22736075 atgaattatgcacacccaagccatgaattaacaacaacaacatcagttagcaagaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaatccaacaacaaca 22735976  T
Q  101 tagcataattca 112  Q
    ||| ||||||||    
T  22735975 tagtataattca 22735964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 3431526 - 3431429
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaat-taaacatgattctcttcataattcaacaaca 97  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||| ||||||||  | |||||||||||||    
T  3431526 atgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaaca 3431429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 15969828 - 15969929
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| ||| | | ||| ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||  |||||||||||  |||||    
T  15969828 atgaattatgcacacccaagccatgaattatcaatagcaacatcacttaacaacaactacaccaattgaacatgaatctcagcataattcaacctcatca 15969927  T
Q  101 ta 102  Q
    ||    
T  15969928 ta 15969929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 21681025 - 21681137
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||| | || ||  ||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||||||||| || ||||||||| ||    
T  21681025 acccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaacatcaattgatcatgaaactaatcacaattcaacaacaacaaagcataatttaa 21681124  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  21681125 ccaattgagcata 21681137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Original strand, 37611723 - 37611802
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||  || |||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  37611723 cttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattc-accaattgagcata 37611802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20573416 - 20573305
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  | || ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||||||||| || || ||||||| |    
T  20573416 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattc-a 20573318  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  20573317 ccaattgagcata 20573305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21494694 - 21494614
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctc 80  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21494694 atgatatatgcacacccaagttataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctc 21494614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 22886337 - 22886417
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctc 80  Q
    ||||| ||||||||||||||  || ||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22886337 atgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctc 22886417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 126
Target Start/End: Original strand, 22981368 - 22981408
Alignment:
Q  86 aattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  22981368 aattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata 22981408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 41246681 - 41246792
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| ||  ||||||||| |    
T  41246681 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattc-a 41246779  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||| ||||||    
T  41246780 ccaattaagcata 41246792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20583791 - 20583666
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  20583791 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaaca 20583692  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||    
T  20583691 tagcacaattcaacaatttgagcata 20583666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 17947829 - 17947716
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  17947829 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaaca 17947730  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  17947729 tagcacaattcaac 17947716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 4484737 - 4484862
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |    
T  4484737 atgattcatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaata 4484836  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||    
T  4484837 tagcacaattcaacaatttgagcata 4484862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 9724044 - 9723931
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||    
T  9724044 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaaca 9723945  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  9723944 tagcacaattcaac 9723931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 13449064 - 13448951
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||    
T  13449064 atgatttatcaacacccaagctacgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataaca 13448965  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  13448964 tagcacaattcaac 13448951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 28390322 - 28390435
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | ||    
T  28390322 atgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattatcatcacaattcaacaataaca 28390421  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  28390422 tagcacaattcaac 28390435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 125
Target Start/End: Original strand, 31501190 - 31501307
Alignment:
Q  8 atgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcata 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |    
T  31501190 atgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcaca 31501289  T
Q  108 attcaaccaattgagcat 125  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  31501290 attcaacaatttgagcat 31501307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 38424229 - 38424354
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||    
T  38424229 atgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcacttaaacataattctcatcataattcaacaacaaca 38424328  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||| | |||||||| | |||||||||    
T  38424329 tagaacaattcaacaatttgagcata 38424354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 46474011 - 46474124
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||    
T  46474011 atgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaaca 46474110  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  46474111 tagcacaattcaac 46474124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 112
Target Start/End: Original strand, 45149617 - 45149723
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  45149617 ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaaccaacaacatcatagca 45149716  T
Q  106 taattca 112  Q
     ||||||    
T  45149717 caattca 45149723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16915165 - 16915052
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  16915165 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatgacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaaca 16915066  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  16915065 tagcacaattcaac 16915052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 34241425 - 34241312
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  34241425 atgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatgtcacttatcaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaaca 34241326  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || || ||||||||    
T  34241325 taacacaattcaac 34241312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 48356654 - 48356767
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  48356654 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaaca 48356753  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || || ||||||||    
T  48356754 taacacaattcaac 48356767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 9611318 - 9611430
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  9611318 atgatttatgaacacc-aagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaaca 9611416  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  9611417 tagcacaattcaac 9611430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 9838890 - 9839002
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  9838890 atgatttatgaacacc-aagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaaca 9838988  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  9838989 tagcacaattcaac 9839002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 13863162 - 13863042
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| | |  ||| |||||||||||| |||||||    
T  13863162 ttatgaacacccaagccatgcatcattaacaacaatatcacttagcaacaacaacaacaattgaacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagca 13863063  T
Q  106 taattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13863062 taattcaaccaattgagcata 13863042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 14940763 - 14940890
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcga--caacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacat 98  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |  | | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  14940763 atgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaattctaaaaactctcttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcataattcaacaacaa 14940862  T
Q  99 catagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||    
T  14940863 catagcacaattcaacaatttgagcata 14940890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 114
Target Start/End: Original strand, 15358808 - 15358920
Alignment:
Q  2 tgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcat 101  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||    
T  15358808 tgatatatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattcccatcacaattcaacaacaacat 15358907  T
Q  102 agcataattcaac 114  Q
    | || ||||||||    
T  15358908 aacacaattcaac 15358920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 14935373 - 14935495
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  14935373 atgatttatgaacacccaaaccatgaatcttcaacaacaatatctcttaaca---acaacatcatttaaaaatgattctcatcataattcaacaacaaca 14935469  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    || || |||||||| | |||||||||    
T  14935470 tatcacaattcaacaatttgagcata 14935495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 15362966 - 15363088
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15362966 atgatttatgaacacccaaaccatgaatcttcaacaacaatatctcttaaca---acaacatcatttaaaaatgattctcatcataattcaacaacaaca 15363062  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    || || |||||||| | |||||||||    
T  15363063 tatcacaattcaacaatttgagcata 15363088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 4446222 - 4446335
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcat-cgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  4446222 atgatttatgaacacccaagccatgaatcattcaacatcagcatctcttatcaacaacaacatcaattaa-catgattctcatcacaattcaacaacaac 4446320  T
Q  100 atagcataattcaac 114  Q
    |||||| ||||||||    
T  4446321 atagcacaattcaac 4446335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 13377539 - 13377648
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||| ||    
T  13377539 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaaca 13377638  T
Q  101 tagcataatt 110  Q
    ||||||||||    
T  13377639 tagcataatt 13377648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 9321273 - 9321181
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaac 93  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||    
T  9321273 atgatttgtgaacacccaagctatgaatcattaacaacaatatctattatcaacaacaacatcaattaaatataattctcatcacaattcaac 9321181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 126
Target Start/End: Original strand, 13274814 - 13274922
Alignment:
Q  18 aagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaa 117  Q
    |||| ||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13274814 aagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaa 13274913  T
Q  118 ttgagcata 126  Q
    |||||||||    
T  13274914 ttgagcata 13274922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 15368356 - 15368469
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcga--caacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacat 98  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |  | | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15368356 atgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaattctaaaaactctcttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcataattcaacaacaa 15368455  T
Q  99 catagcataattca 112  Q
    |||| || ||||||    
T  15368456 catatcacaattca 15368469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 114
Target Start/End: Original strand, 33559694 - 33559770
Alignment:
Q  38 caatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| || ||||||||    
T  33559694 caatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaac 33559770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 49047898 - 49047786
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||  ||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  49047898 acccaagccatgaattatcagcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcaa 49047799  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  49047798 ccaattgagcata 49047786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 126
Target Start/End: Original strand, 16919597 - 16919694
Alignment:
Q  29 catcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||    
T  16919597 catcaacaacaatattacttagcaacaacaacatcaattaaacacgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata 16919694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 8563580 - 8563513
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacat 73  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8563580 ttatgaacacccaaggtgtgaatcatcaacaacaacatctcataacaacaacaacatcaattaaacat 8563513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 14272123 - 14272045
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattct 79  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14272123 atgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaacaacaacatcaattgaacatgattct 14272045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12248322 - 12248233
Alignment:
Q  37 acaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12248322 acaacatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 12248233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 17224175 - 17224062
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||   ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    | |||||||||||| ||    
T  17224175 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaaca 17224076  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||||||||||||    
T  17224075 tagcataattcaac 17224062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 25124140 - 25124214
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatga 75  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  25124140 atgatttgtgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaacatctcatatcaacaacaacatcaattaagcatga 25124214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 12759010 - 12759121
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | |||||  ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  12759010 acccaagccatgaattatcaccaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcataattcaccaacaacatagcataattc-a 12759108  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  12759109 ccaattgagcata 12759121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16570198 - 16570118
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16570198 cttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 16570118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Original strand, 16595464 - 16595544
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16595464 cttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 16595544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 8267917 - 8267852
Alignment:
Q  49 aacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaac 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8267917 aacaacaacatcatcaattaaacataattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaac 8267852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Original strand, 28722169 - 28722245
Alignment:
Q  51 caacaacaacatcaattaaacatga-ttctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||    
T  28722169 caacaacaacttcatttaaacatgaattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcata 28722245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Original strand, 3049638 - 3049717
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3049638 cttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattc-accaattgagcata 3049717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Original strand, 3895080 - 3895159
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3895080 cttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattc-accaattgagcata 3895159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 11287440 - 11287551
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  |||| ||||||||||||||| | | |||||  ||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  11287440 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattc-a 11287538  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  11287539 ccaattgagcata 11287551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 4438831 - 4438893
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatca-tcgacaacaatatctcttaacaacaacaacat 62  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||| ||||||||||||    
T  4438831 atgatttatgaacacccaagccatgaatcattcaacatcagcatctcttatcaacaacaacat 4438893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 371099 - 371196
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaat-taaacatgattctcttcataattcaacaaca 97  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || |||   ||||||||||||||||  |||| ||||||||  | |||||||||||||    
T  371099 atgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcggcaacaacaacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaaca 371196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12370041 - 12369953
Alignment:
Q  37 acaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||   |  ||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  12370041 acaacatcacttagcaacaacaacatcaattaatcatgaaagttatcacaattcaacaacaacaaggcataattc-accaattgagcata 12369953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15822655 - 15822544
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  | || ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||||||||| || |||||||||| |    
T  15822655 acccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattc-a 15822557  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    ||| |||||||||    
T  15822556 ccatttgagcata 15822544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18980266 - 18980190
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgatt 77  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||   |||||| || ||| | |||||||||||||||||| | ||||||    
T  18980266 atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattacatatgatt 18980190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 26070488 - 26070377
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  | |||| ||| |||| ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  26070488 acccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattc-a 26070390  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||| ||||||    
T  26070389 ccaattaagcata 26070377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 26094275 - 26094164
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  | |||| ||| |||| ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  26094275 acccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattc-a 26094177  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||| ||||||    
T  26094176 ccaattaagcata 26094164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 34966877 - 34966990
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  34966877 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaaca 34966976  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||||||||||||    
T  34966977 tagcataattcaac 34966990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 19854165 - 19854276
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||    
T  19854165 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataaca 19854264  T
Q  101 tagcataattca 112  Q
    ||||| ||||||    
T  19854265 tagcacaattca 19854276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 29160540 - 29160427
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| ||    
T  29160540 atgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcgcaaatcaacaacaaca 29160441  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  29160440 tagcacaattcaac 29160427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 25651247 - 25651360
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  25651247 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaaca 25651346  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  25651347 tagcacaattcaac 25651360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22462328 - 22462221
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  22462328 ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcatttaaacatgaatctcatcacaa-ccaacaacatcatagca 22462230  T
Q  106 taattcaac 114  Q
     ||||||||    
T  22462229 caattcaac 22462221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 33538606 - 33538492
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||    
T  33538606 atgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaataacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataaca 33538507  T
Q  101 tagcataattcaacc 115  Q
    ||||| |||||||||    
T  33538506 tagcacaattcaacc 33538492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22362002 - 22361877
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | || ||| |||||||||||| ||    
T  22362002 atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaaca 22361903  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||| | | |||||||||    
T  22361902 tagcataattcatcaatttgagcata 22361877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 29605460 - 29605573
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  29605460 atgatttatgcacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatttcttagcaacaacaacatcaattaagcatgattcacatcataattcaacaacaaca 29605559  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  29605560 tagcacaattcaac 29605573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18629848 - 18629732
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaaca---tcaattaaacatgattctcttcataattcaacaaca 97  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  18629848 atgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaata 18629749  T
Q  98 tcatagcataattcaac 114  Q
     ||||||| ||||||||    
T  18629748 acatagcacaattcaac 18629732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 33324703 - 33324828
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||  |    
T  33324703 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaaccacaata 33324802  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  33324803 tagcataattcatccaattgagcata 33324828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 35136249 - 35136124
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||  |    
T  35136249 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaaccacaata 35136150  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  35136149 tagcataattcatccaattgagcata 35136124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 18398948 - 18399073
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| |||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||    
T  18398948 atgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaaca 18399047  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  18399048 tagcataattcaacaatttgagcata 18399073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15079940 - 15079820
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  15079940 ttatgaatacccaaaccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaatatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaatatagca 15079841  T
Q  106 taattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  15079840 taattcacccaattgagcata 15079820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 23221924 - 23222027
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctct--taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacat 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||     
T  23221924 atgatttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacaatatctcttataacaacaacaatatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaa 23222023  T
Q  99 cata 102  Q
    ||||    
T  23222024 cata 23222027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 35009678 - 35009569
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  35009678 acccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattc-a 35009580  T
Q  114 ccaattgagca 124  Q
    |||||||||||    
T  35009579 ccaattgagca 35009569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18381920 - 18381807
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||| ||    
T  18381920 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaaca 18381821  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
     |||||||||||||    
T  18381820 aagcataattcaac 18381807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 23222757 - 23222874
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaaca--atatctctta--acaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaac 96  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || | ||||||    
T  23222757 atgatttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacatgatatctcttataacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaataaacaac 23222856  T
Q  97 atcatagcataattcaac 114  Q
    | ||||| | ||||||||    
T  23222857 aacatagtacaattcaac 23222874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25367463 - 25367349
Alignment:
Q  12 acacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattc 111  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  25367463 acacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacacaattc 25367364  T
Q  112 aaccaattgagcata 126  Q
    ||| | |||||||||    
T  25367363 aacaatttgagcata 25367349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 21623178 - 21623303
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||| ||||  ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||   || |||||||||||| ||    
T  21623178 atgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatcacttagcaacaacaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaacaacaaca 21623277  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  21623278 tagcataattcaacaatttgagcata 21623303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 25919623 - 25919724
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||   || ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  25919623 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcatatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca 25919722  T
Q  101 ta 102  Q
    ||    
T  25919723 ta 25919724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 17013858 - 17013763
Alignment:
Q  20 gctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaa-catcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaac 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  17013858 gctatgaatcatcaacaacaatatttcttaataacaacaatcatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaagaacatagcacaattcaac 17013763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16887977 - 16887904
Alignment:
Q  53 acaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16887977 acaacaaaatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcacccaattgagcata 16887904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 17557253 - 17557141
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||| ||    
T  17557253 atgatttatgaacacctaaactatgaatgattaacaacaatattagttagcaacaacaacatcaattaaatatgattataatcacaattcaacaacaaca 17557154  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  17557153 tagca-aattcaac 17557141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 114
Target Start/End: Original strand, 32352105 - 32352170
Alignment:
Q  49 aacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  32352105 aacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacataattcaac 32352170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 17083384 - 17083321
Alignment:
Q  51 caacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17083384 caacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaac 17083321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Original strand, 22848078 - 22848148
Alignment:
Q  54 caacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagca 124  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||    
T  22848078 caacaacatcaattaagcattattcccatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagca 22848148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 19672305 - 19672409
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| |  |    
T  19672305 atgatttatgaacaccgaagttatgaatcatcaacaacaatatctct--------acaacatcaattaaacatga-tctcatcgcaattcaacaataaga 19672395  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  19672396 tagcacaattcaac 19672409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 16300226 - 16300146
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctc 80  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16300226 atgatatatgaacacccaagccataaatcatatacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctc 16300146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28195315 - 28195207
Alignment:
Q  17 caagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgat-tctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaacc 115  Q
    ||||| |||||| |||  |||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||| | ||| |  |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  28195315 caagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaaccacaacaattgatcataaaatctcatcacaattcaacaacatcatggcataattcaact 28195216  T
Q  116 aattgagca 124  Q
    |||||||||    
T  28195215 aattgagca 28195207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 17083415 - 17083376
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaa 40  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17083415 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaa 17083376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 19629341 - 19629409
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 70  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  19629341 atgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaa 19629409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18087068 - 18086992
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgatt 77  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||   |||||| || ||| | |||||||||||||||||| | ||||||    
T  18087068 atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattacatatgatt 18086992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 31628291 - 31628402
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  | || ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||||||||| || |||||||||| |    
T  31628291 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattc-a 31628389  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||| ||||||    
T  31628390 ccaattaagcata 31628402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 32277008 - 32276929
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctc 80  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32277008 atgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctc 32276929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18238394 - 18238281
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  18238394 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaaca 18238295  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  18238294 tagcacaattcaac 18238281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15013519 - 15013394
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |     
T  15013519 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaatatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacc 15013420  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||    
T  15013419 tagcacaattcaacaatttgagcata 15013394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 38764719 - 38764842
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  38764719 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattgaacaacaaca 38764818  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagca 124  Q
    | |||||||||||| | |||||||    
T  38764819 tcgcataattcaacaatttgagca 38764842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 13590311 - 13590198
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||    
T  13590311 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaaca 13590212  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  13590211 tagcacaattcaac 13590198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 41256606 - 41256481
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |     
T  41256606 atgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatggttctcatcacaattcaacaacaacc 41256507  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||    
T  41256506 tagcacaattcaacaatttgagcata 41256481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 7964948 - 7964835
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  7964948 atgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaaaatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaaca 7964849  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  7964848 tagcacaattcaac 7964835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 41916963 - 41916850
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  41916963 atgatttttgaacactcaagcaatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcagttaaacatgattctcatcacaattcaacaacaaca 41916864  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  41916863 tagcacaattcaac 41916850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 50220177 - 50220064
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  50220177 atgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaaca 50220078  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
     | || ||||||||    
T  50220077 caacacaattcaac 50220064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 54398393 - 54398506
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  54398393 atgatttataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaaca 54398492  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || || ||||||||    
T  54398493 taacacaattcaac 54398506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 7186081 - 7185970
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||    
T  7186081 atgatttataaacacccaagccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaaca 7185982  T
Q  101 tagcataattca 112  Q
    ||||| ||||||    
T  7185981 tagcacaattca 7185970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 40905170 - 40905058
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  40905170 atgatttatgaacacccaagccacgagtcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaatt-aacatgattctcatcacaattcaacaacaaca 40905072  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  40905071 tagcacaattcaac 40905058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 13442913 - 13442800
Alignment:
Q  4 atttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaac---aacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||    
T  13442913 atttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaaaatctcttaacaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataaca 13442814  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || || ||||||||    
T  13442813 taacacaattcaac 13442800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 15044838 - 15044963
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||| ||    
T  15044838 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaaca 15044937  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||| | | |||||||||    
T  15044938 tagcataattcatcaatttgagcata 15044963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 52265745 - 52265620
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||| ||    
T  52265745 atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaaca 52265646  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    | |||||||||||| | |||||||||    
T  52265645 ttgcataattcaacaatttgagcata 52265620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 18276444 - 18276557
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||  |    
T  18276444 atgatttatgaacacccaagccatcaatcatcaacaacaatatcactttgcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaata 18276543  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  18276544 tagcacaattcaac 18276557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 15109586 - 15109477
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||| ||    
T  15109586 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaaca 15109487  T
Q  101 tagcataatt 110  Q
    ||||||||||    
T  15109486 tagcataatt 15109477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 41166178 - 41166058
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||   || |||||||||||| |||||||    
T  41166178 ttatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacatagca 41166079  T
Q  106 taattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  41166078 taattcaacaatttgagcata 41166058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 19822013 - 19821919
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaa 95  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19822013 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaa 19821919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 13809732 - 13809622
Alignment:
Q  16 ccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaacc 115  Q
    |||||| |||||| |||  |||||| |||  ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  13809732 ccaagccatgaattatcatcaacaacatcaattagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaact 13809633  T
Q  116 aattgagcata 126  Q
    |||||||||||    
T  13809632 aattgagcata 13809622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 47468535 - 47468472
Alignment:
Q  51 caacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| || ||||||||    
T  47468535 caacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaac 47468472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 47535252 - 47535177
Alignment:
Q  51 caacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||    
T  47535252 caacaacaacgtcaattgaacatgattcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata 47535177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 27960994 - 27961106
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||| | |||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||  | | ||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  27960994 acccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaatcttataacaattcaacaacaatataacataattcaa 27961093  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||| ||||||    
T  27961094 ccaatttagcata 27961106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21959686 - 21959576
Alignment:
Q  15 cccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaac 114  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||| ||  || ||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  21959686 cccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattc-ac 21959588  T
Q  115 caattgagcata 126  Q
    ||||||||||||    
T  21959587 caattgagcata 21959576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 47468566 - 47468527
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaa 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47468566 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaa 47468527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 14901242 - 14901355
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||   || ||||||| || | ||    
T  14901242 atgaattatgcacacccatgtcatgaatcatcaacaacagcatcacttagcaacaacaacatcaattgaatatgattcttaccacaattcaataataaca 14901341  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || |||||||||||    
T  14901342 tatcataattcaac 14901355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18494531 - 18494442
Alignment:
Q  35 caacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagca 124  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | ||||| |||   || |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  18494531 caacaacatcacttaacaacaacagcaacaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaacaacatagcatcatccaaccaattgagca 18494442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12837392 - 12837313
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||  ||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12837392 cttaacaacaacaacatccattgaccatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattc-accaattgagcata 12837313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 14996138 - 14996249
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcttcataattcaacaacatc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||  |  |||||||||||| |    
T  14996138 atgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaac 14996236  T
Q  100 atagcataattca 112  Q
    ||  |||||||||    
T  14996237 atgtcataattca 14996249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 16732192 - 16732303
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  |||| ||||||| ||||||||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  16732192 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattc-a 16732290  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  16732291 ccaattgagcata 16732303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19697617 - 19697506
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcttcataattcaacaacatc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||  |  |||||||||||| |    
T  19697617 atgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaac 19697519  T
Q  100 atagcataattca 112  Q
    ||  |||||||||    
T  19697518 atgtcataattca 19697506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19708202 - 19708091
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcttcataattcaacaacatc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||  |  |||||||||||| |    
T  19708202 atgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaac 19708104  T
Q  100 atagcataattca 112  Q
    ||  |||||||||    
T  19708103 atgtcataattca 19708091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 30232688 - 30232609
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||  ||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30232688 cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattc-accaattgagcata 30232609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23270158 - 23270060
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattca 112  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||| |||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  23270158 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgatacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattca 23270060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 37957262 - 37957169
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaaca 94  Q
    |||| ||||| ||||||||||  ||||| ||| | ||||| ||| |||| || |||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  37957262 atgaattatgcacacccaagccgtgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaccacatcaattgaacatgaatctcagcataattcaaca 37957169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 7912 - 7799
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  7912 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaaca 7813  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  7812 tagcacaattcaac 7799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 3262 - 3374
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||    
T  3262 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgatt-tcatcacaattcaacaacaaca 3360  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  3361 tagcacaattcaac 3374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 37568 - 37681
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||    
T  37568 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcgtctcaattcaacaataaca 37667  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  37668 tagcacaattcaac 37681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 27507 - 27620
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |    
T  27507 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacatcatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaata 27606  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  27607 tagcacaattcaac 27620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 86367 - 86480
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||| | | ||    
T  86367 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaaaaacatcaattaaacatgattatcatcacaattgaactataaca 86466  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  86467 tagcacaattcaac 86480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 21195024 - 21195149
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |     
T  21195024 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacattaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacc 21195123  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||    
T  21195124 tagcacaattcaacaatttgagcata 21195149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 33397362 - 33397475
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  33397362 atgatttatgaacacacaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaagatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaaca 33397461  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  33397462 tagcacaattcaac 33397475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 17608938 - 17609051
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  17608938 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacaacaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaaca 17609037  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  17609038 tagcacaattcaac 17609051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 40436506 - 40436393
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||    
T  40436506 atgatttgtgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaaaaacaacaacatcaattaaacataattctcatcacaaatcaacaacaaca 40436407  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  40436406 tagcacaattcaac 40436393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5768403 - 5768293
Alignment:
Q  4 atttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatag 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||     
T  5768403 atttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaattaacaacaacataa 5768304  T
Q  104 cataattcaac 114  Q
    || ||||||||    
T  5768303 cacaattcaac 5768293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 8538144 - 8538046
Alignment:
Q  4 atttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcata 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8538144 atttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacata 8538046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 8603383 - 8603285
Alignment:
Q  4 atttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcata 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8603383 atttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacata 8603285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22143598 - 22143473
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  22143598 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattgagcatggttctcatcataattcaacaacaaca 22143499  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  22143498 tagcataattcaaccatttgagcata 22143473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 37234097 - 37233984
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||    
T  37234097 atgatttatggacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaaccacaaca 37233998  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||||||||||||    
T  37233997 tagcataattcaac 37233984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 52400641 - 52400754
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  52400641 atgatttatgaacatttacgctatgaatcatcaacaacaacatctctcagcaacaacaacgtcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaaca 52400740  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  52400741 tagcacaattcaac 52400754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 49997519 - 49997406
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaa-caacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatc 99  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  49997519 atgatttatgaacaccaaatccatgaatgatcaacaacaatatctcttaagcaacaacaacatcagttaaacatgattctcaccttaattcaacaacaac 49997420  T
Q  100 atagcataattcaa 113  Q
    |||||| |||||||    
T  49997419 atagcacaattcaa 49997406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 76605 - 76497
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  |  | |||||||||| |||||||    
T  76605 ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcataataacaacaatatcaattaaacatgaatctcaccgcatttcaacaacaacatagca 76506  T
Q  106 taattcaac 114  Q
     ||||||||    
T  76505 caattcaac 76497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 75
Target Start/End: Original strand, 20194059 - 20194128
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatga 75  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20194059 ttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcatgacaacaacaacatcaattaaacatga 20194128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 20177185 - 20177310
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| | |||||| ||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| | |   || |||||||||||| ||    
T  20177185 atgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaaca 20177284  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  20177285 tagcataattcaacaatttgagcata 20177310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 114
Target Start/End: Original strand, 25093880 - 25093982
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| |||| ||    
T  25093880 ttatgaacacccaagctataaatcatc---aacaatatcttttaaca---acaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacataaca 25093973  T
Q  106 taattcaac 114  Q
     ||||||||    
T  25093974 caattcaac 25093982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 51627888 - 51627776
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||  ||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||  ||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51627888 acccaagccatgaattatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaccatatcataattcaa 51627789  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||| ||||    
T  51627788 ccaattgaacata 51627776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 41229176 - 41229098
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattct 79  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41229176 atgaattatgaacactcaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgattct 41229098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 13377077 - 13376964
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| || ||||| |||||||| |  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| | ||  ||||||||||||||| ||    
T  13377077 atgaattatgaatactcaagccatgaatcaacatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgagcatgactttcaccataattcaacaacaaca 13376978  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || |||||||||||    
T  13376977 taacataattcaac 13376964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 21650285 - 21650188
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcttcataattcaacaaca 97  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||    
T  21650285 atgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcaacaacaacaacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaaca 21650188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 36356530 - 36356437
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaaca 94  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||    
T  36356530 atgaattatgaacacccaagccataaatcatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgaacatgaatctcagcataaatcaaca 36356437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 27674806 - 27674898
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaac 93  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||  |||||||||||    
T  27674806 atgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcacttaacaacaactacaccaattgaacatgaatctcagcataattcaac 27674898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 35522543 - 35522430
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  | || ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||||||||| || |||||||||| |    
T  35522543 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacgtatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattc-a 35522445  T
Q  114 ccaattgagcataca 128  Q
    |||||||||||||||    
T  35522444 ccaattgagcataca 35522430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 110
Target Start/End: Original strand, 16645975 - 16646031
Alignment:
Q  54 caacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataatt 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16645975 caacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatt 16646031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 27329947 - 27329868
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||  ||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27329947 cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattc-accaattgagcata 27329868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 110
Target Start/End: Original strand, 16656699 - 16656757
Alignment:
Q  52 aacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataatt 110  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16656699 aacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatt 16656757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 17148578 - 17148654
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgatt 77  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||   |||||| || ||| | |||||||||||||||||| | ||||||    
T  17148578 atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattacatatgatt 17148654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 21718251 - 21718362
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  | || ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| || ||| ||||| ||||||||||||| |    
T  21718251 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattc-a 21718349  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  21718350 ccaattgagcata 21718362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22403334 - 22403223
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |||||  ||  ||| |||||| ||||| ||  ||||||||| |    
T  22403334 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacagttaatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattc-a 22403236  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  22403235 ccaattgagcata 22403223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 44035 - 43926
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  44035 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaaca 43936  T
Q  101 tagcataatt 110  Q
    ||||| ||||    
T  43935 tagcacaatt 43926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23909 - 23796
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  23909 atgatatacgaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacgtcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaaca 23810  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  23809 tagcacaattcaac 23796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 6554 - 6667
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  6554 atgatttatgaacacctaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacatcatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaaca 6653  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  6654 tagcacaattcaac 6667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 6456634 - 6456759
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  6456634 atgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacgatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaaca 6456733  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    || || |||||||| | |||||||||    
T  6456734 taacacaattcaacaatttgagcata 6456759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 21109760 - 21109873
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  21109760 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaataacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaaca 21109859  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || || ||||||||    
T  21109860 taacacaattcaac 21109873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23981753 - 23981628
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  23981753 atgagttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca 23981654  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    || ||||||||||||| |||||||||    
T  23981653 tatcataattcaaccatttgagcata 23981628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 29917975 - 29918088
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  29917975 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcagttaaacatgattctcatcataattcaacaacaaca 29918074  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || || ||||||||    
T  29918075 taacacaattcaac 29918088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 114
Target Start/End: Original strand, 37983375 - 37983487
Alignment:
Q  2 tgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||    
T  37983375 tgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcattacaattcaacaataacat 37983474  T
Q  102 agcataattcaac 114  Q
    |||| ||||||||    
T  37983475 agcacaattcaac 37983487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 19873854 - 19873933
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctc 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19873854 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctc 19873933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16835536 - 16835426
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||    
T  16835536 atgatttatgaacatccaagctatgaatcatcaacaacaacatctcttaacaacaacaacattaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaaca 16835437  T
Q  101 tagcataattc 111  Q
    ||||| |||||    
T  16835436 tagcacaattc 16835426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 113
Target Start/End: Original strand, 22885668 - 22885764
Alignment:
Q  17 caagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  22885668 caagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcaacataattcaacaacaacataacacaattcaa 22885764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23234722 - 23234610
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||  |    
T  23234722 atgatttatgaaaactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaataacaacatcaattaaacatgattctcatcactaatcaacaacaaaa 23234623  T
Q  101 tagcataattcaa 113  Q
    ||||| |||||||    
T  23234622 tagcacaattcaa 23234610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 26560050 - 26559939
Alignment:
Q  3 gatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcata 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  26560050 gatttatgaacacccaagccaagaatcatcaccaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacataattctcatcacaaatcaacaacaacata 26559951  T
Q  103 gcataattcaac 114  Q
    ||| ||||||||    
T  26559950 gcacaattcaac 26559939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 23493929 - 23494047
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||| ||    
T  23493929 atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaaca 23494028  T
Q  101 tagcataattcaaccaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23494029 tagcataattcaaccaatt 23494047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 19862219 - 19862344
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||| ||    
T  19862219 atgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgcacatgattcttatcacaattcaacaacaaca 19862318  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  19862319 tagcataattcaacaatttgagcata 19862344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 24084087 - 24084200
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||    
T  24084087 atgatttactaacacccaagccatgaatcttcaacaacaatatttcttagcaacaacaacatcaattaaacatgattcacatcacaattcaacaacaaca 24084186  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  24084187 tagcacaattcaac 24084200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 112
Target Start/End: Original strand, 23417256 - 23417362
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  || || ||||||||| |||||||    
T  23417256 ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatacctcataacaacaacaacatcaattaaacatgaatgtcaccacaaatcaacaacaacatagca 23417355  T
Q  106 taattca 112  Q
     ||||||    
T  23417356 caattca 23417362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 21617026 - 21617139
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||    
T  21617026 atgaattatgaacacccaagccatgaatcaacaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaaca 21617125  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||| | ||||||||    
T  21617126 tagaacaattcaac 21617139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 7728430 - 7728555
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||| |||||||||| || ||| |||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||| ||    
T  7728430 atgaattatgcacacccaagcgataaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaaca 7728529  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  7728530 tagcataattcaacaatttgagcata 7728555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 21222845 - 21222736
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||| |||  ||| |||||||||||| ||    
T  21222845 atgatttatgaacactcaatccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacattaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaaca 21222746  T
Q  101 tagcataatt 110  Q
    ||||| ||||    
T  21222745 tagcacaatt 21222736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24225549 - 24225480
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatga 75  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24225549 ttatgaacacccaagttatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaataacatcaattaaacatga 24225480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Original strand, 3673873 - 3673997
Alignment:
Q  2 tgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcat 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |  || |||| ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||||||||| |||    
T  3673873 tgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaaccacctcgcttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacat 3673972  T
Q  102 agcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||||||||| | |||||||||    
T  3673973 agcataattcaacaatttgagcata 3673997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Original strand, 432478 - 432598
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||| |||||||| ||||| |    
T  432478 ttatgaatacccaagccaggaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaatccaacaacaacatagta 432577  T
Q  106 taattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||| | | |||||||||    
T  432578 taattcatcaatttgagcata 432598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 5451080 - 5450955
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||| || |||||| | ||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||||| | |  ||| |||||||||||| ||    
T  5451080 atgatttatgatcatccaagccaagaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcagttgaacatgaattttatcacaattcaacaacaaca 5450981  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||| | | |||||||||    
T  5450980 tagcataattcatcaatttgagcata 5450955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 9730628 - 9730531
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaat-taaacatgattctcttcataattcaacaaca 97  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||| ||||||||  | |||||||||||||    
T  9730628 atgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaatatgtctcagcaacaacaacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaaca 9730531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11763740 - 11763629
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatc---tcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcata 102  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||       ||||||||||||| ||||||||||||| || | ||| || ||||||||| ||||    
T  11763740 ttatgagcacccaagttatgaatcatcaacaaaaatatccaacaacaacaacaacaacaacaattaaacatgaatcccatcacaaatcaacaacaacata 11763641  T
Q  103 gcataattcaac 114  Q
    ||| ||||||||    
T  11763640 gcacaattcaac 11763629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1168428 - 1168317
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  |||| ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  1168428 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattc-a 1168330  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  1168329 ccaattgagcata 1168317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 7528910 - 7529022
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcttcataattcaacaacatc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||  || ||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||  |  |||||||||||| |    
T  7528910 atgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaac 7529009  T
Q  100 atagcataattca 112  Q
    ||  |||||||||    
T  7529010 atgtcataattca 7529022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 24183319 - 24183245
Alignment:
Q  51 caacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||| |||||||| | |||||  ||| ||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  24183319 caacaacaccatcaattgatcatgaaactcatcacaattcaacaacaacaaagcataattc-accaattgagcata 24183245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 23514578 - 23514648
Alignment:
Q  7 tatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgatt 77  Q
    ||||||||||||||| || ||||||   |||||| |||||| || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  23514578 tatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatctctcaagaacaacaacatcaattacatatgatt 23514648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 110
Target Start/End: Original strand, 28902252 - 28902310
Alignment:
Q  52 aacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataatt 110  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  28902252 aacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatt 28902310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 110
Target Start/End: Original strand, 28938647 - 28938705
Alignment:
Q  52 aacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataatt 110  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  28938647 aacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatt 28938705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 112
Target Start/End: Original strand, 16595564 - 16595629
Alignment:
Q  47 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattca 112  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||| || |||| |||||||||    
T  16595564 ttaacaacatctacatcaattgaacatgaatctcaacataattcaacatcaacataacataattca 16595629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Original strand, 20712131 - 20712210
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||   ||  ||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  20712131 cttaacaacaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagcataattc-accaattgagcata 20712210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 41661575 - 41661688
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||    
T  41661575 atgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctctcaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataaca 41661674  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  41661675 tagcacaattcaac 41661688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 12952974 - 12953087
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||| ||    
T  12952974 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacataaatctcatcacaattcaacaacaaca 12953073  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  12953074 tagcacaattcaac 12953087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 31412570 - 31412457
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| ||    
T  31412570 atgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacctaattctcatcacaattcaacaacaaca 31412471  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || || ||||||||    
T  31412470 tatcacaattcaac 31412457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9590985 - 9590866
Alignment:
Q  7 tatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcat 106  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||||||    
T  9590985 tatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcagaactcaacaacaacatagcat 9590886  T
Q  107 aattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  9590885 aattcaacaaattgagcata 9590866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6228862 - 6228749
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| ||    
T  6228862 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatttcttagcaacaacaacatcaattaaacatgatccacatcataattcgacaacaaca 6228763  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  6228762 tagcacaattcaac 6228749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11061243 - 11061118
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| | |  ||| |||||||||||| ||    
T  11061243 atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaccaacaacatcaattgaacatgactattatcacaattcaacaacaaca 11061144  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11061143 tagcataattcaaccaattgagcata 11061118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14815002 - 14814879
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||| |||||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||    
T  14815002 atgattcatgaacacgcaggccatgaaacatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattcttatcacaattcaacaacaaca 14814903  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagca 124  Q
    ||||| |||||||| | |||||||    
T  14814902 tagcacaattcaacaatttgagca 14814879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 33369145 - 33369034
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  33369145 atgatttatgaacacccaagtcatgaatcgtcaacaacaatattccttaacaacaaaaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaaca 33369046  T
Q  101 tagcataattca 112  Q
    ||||| ||||||    
T  33369045 tagcacaattca 33369034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 43427751 - 43427640
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  43427751 atgatttatgaacaccaaagctatgaatcatcaacaacaatatctc--aacaacaacaacatcaattaatcatgattctcatcacaactcaacaacaaca 43427654  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  43427653 tagcacaattcaac 43427640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 4162442 - 4162329
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||    
T  4162442 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatagttcttagcaacaacaacatcaattaaacatgattcacgtcatcattcaacaacaaca 4162343  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    || || ||||||||    
T  4162342 taacacaattcaac 4162329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Original strand, 50313200 - 50313298
Alignment:
Q  4 atttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcata 102  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  50313200 atttatgaatactcaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattcccatcacaattcaacaacaacata 50313298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 1990812 - 1990924
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacac-ccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatc 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |    
T  1990812 atgatttatgaacaaaccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcacagttcaacaacaac 1990911  T
Q  100 atagcataattca 112  Q
    ||| || ||||||    
T  1990912 ataacacaattca 1990924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 34559909 - 34560021
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||  ||    
T  34559909 atgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatcgaacatgaatctcatcataattcaacaactaca 34560008  T
Q  101 tagcataattcaa 113  Q
    || ||||||||||    
T  34560009 taacataattcaa 34560021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 38375910 - 38375804
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||| |||||||    
T  38375910 ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacagtatctcatgacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacatagca 38375811  T
Q  106 taattca 112  Q
     ||||||    
T  38375810 caattca 38375804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3576675 - 3576550
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||||||||| ||    
T  3576675 atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatcaatcaaacatgactcttatcacaattcaacaacaaca 3576576  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||||| || | | |||||||||    
T  3576575 tagcataatccatcaatttgagcata 3576550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 17204710 - 17204823
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||||  |    
T  17204710 atgaattataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattacttagcaacaacaacatccattaaacatgattcctatcacaattcaacaacaata 17204809  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||||||||||||    
T  17204810 tagcataattcaac 17204823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 114
Target Start/End: Original strand, 10912900 - 10913008
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||| ||| |||||||    
T  10912900 ttatgaacacccaagctgtgaatcatcaacatcaatatctcatgacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaaccacaacatagca 10912999  T
Q  106 taattcaac 114  Q
     ||||||||    
T  10913000 caattcaac 10913008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Original strand, 11638386 - 11638480
Alignment:
Q  20 gctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaac 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11638386 gctatgaatcatcaacaccaatatctctgaataacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaac 11638480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 17191551 - 17191676
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||    
T  17191551 atgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacattacttagcaacagcaacatcaattaaacatgattcttatcacaattcagcaacaaca 17191650  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    || ||||||||| | | |||||||||    
T  17191651 taacataattcatcaatttgagcata 17191676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 47784984 - 47784871
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    | |||||||||||| ||    
T  47784984 atgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaaca 47784885  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||||||||||||    
T  47784884 tagcataattcaac 47784871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 14295461 - 14295573
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||| | ||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14295461 acccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaa 14295560  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  14295561 ccaattgagcata 14295573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 17139531 - 17139643
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17139531 acccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaa 17139630  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  17139631 ccaattgagcata 17139643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12488963 - 12488838
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||  ||| |||||||||||| ||    
T  12488963 atgaattatgaacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaaca 12488864  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    || ||||||||| | | |||||||||    
T  12488863 taacataattcatcaatttgagcata 12488838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 14080519 - 14080644
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||| ||  |||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  |    
T  14080519 atgaattatgaatacccaagccgtaaatcatcaacaacaacattacttcgcaataacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaata 14080618  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||    
T  14080619 tagcacaattcacccaattgagcata 14080644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 39656536 - 39656661
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||| || || | |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||    | |||||||||||| ||    
T  39656536 atgaattatgaacccctaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaaccacatcaattgaacatgaatcttacaacaattcaacaacaaca 39656635  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  39656636 tagcataattcaacaatttgagcata 39656661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11329185 - 11329073
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11329185 acccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaa 11329086  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    | | |||||||||    
T  11329085 caatttgagcata 11329073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14528236 - 14528124
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| | |  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14528236 acccaagccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaa 14528137  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  14528136 ccaattgagcata 14528124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 126
Target Start/End: Original strand, 14301109 - 14301200
Alignment:
Q  35 caacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||| ||| ||||  |||||||||||||||| | ||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301109 caacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata 14301200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 16880133 - 16880258
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| |||  | |||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||| ||    
T  16880133 atgaattatgcacacccaagccatgaattatcatccacaacatcacttagcaacaataacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaaca 16880232  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||||||  || |||||||||||    
T  16880233 tagcataatttcacaaattgagcata 16880258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 38811245 - 38811152
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaaca 94  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  38811245 atgaattatgcacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcagcataattcaaca 38811152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 74
Target Start/End: Original strand, 11402604 - 11402672
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatg 74  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11402604 ttatgaacatccaaggtatgaatcatcaacaacaacatatcataacaacaacaacatcaattaaacatg 11402672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 51961374 - 51961300
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatga 75  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  51961374 atgatttgtgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaacatctcatatcaacaacaacatcaattaagcatga 51961300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14059450 - 14059325
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||| | |||||||| |||||| |||  |||||| ||| | || |||||| |||||||||| ||||||| | |  ||| |||||||||||| ||    
T  14059450 atgaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatagcaacaataacatcaattgaacatgaatattatcacaattcaacaacaaca 14059351  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||| | |||||||||||    
T  14059350 tagcataattcatcaaattgagcata 14059325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16934219 - 16934122
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcttcataattcaacaaca 97  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||    
T  16934219 atgatttatgaatacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaaca 16934122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 15876078 - 15876174
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaaca 97  Q
    |||| ||||||| ||| |||| ||||||||||   ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||    
T  15876078 atgaattatgaatacctaagccatgaatcatcattaacaacatcacttaccaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaaca 15876174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12539305 - 12539234
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaac---aacatcaattaaacatg 74  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  12539305 ttatggacacccaatgtatgaatcatcaacaacaacatctcataacaacaacaacaacatcaattaaacatg 12539234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12560437 - 12560348
Alignment:
Q  37 acaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||   ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12560437 acaacatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaatcatatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccagttgggcata 12560348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 55441086 - 55440961
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||| | |||||||  |||||| |||  |||||| ||| |||| || |||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||||| ||| ||    
T  55441086 atgaattatgcatacccaagtcatgaattatcatcaacaacatcacttagcatcaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaaccacaaca 55440987  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||    
T  55440986 tagtataattcaaccagttgagcata 55440961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 14284971 - 14285083
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcttcataattcaacaacatc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||  || ||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||  |  |||||||||||| |    
T  14284971 atgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctgagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaac 14285070  T
Q  100 atagcataattca 112  Q
    ||  |||||||||    
T  14285071 atgtcataattca 14285083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Original strand, 17100708 - 17100787
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17100708 cttaacaacaataacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattc-accaattgagcata 17100787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Original strand, 17101393 - 17101472
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17101393 cttaacaacaataacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattc-accaattgagcata 17101472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12349726 - 12349652
Alignment:
Q  51 caacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  12349726 caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattc-accaattgagcata 12349652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 8268989 - 8268878
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcttcataattcaacaacatc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||||  |  |||||||||||| |    
T  8268989 atgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaataacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaac 8268891  T
Q  100 atagcataattca 112  Q
    ||  |||||||||    
T  8268890 atgtcataattca 8268878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 8276089 - 8275978
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcttcataattcaacaacatc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||||  |  |||||||||||| |    
T  8276089 atgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaataacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaac 8275991  T
Q  100 atagcataattca 112  Q
    ||  |||||||||    
T  8275990 atgtcataattca 8275978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 11477436 - 11477356
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctc 80  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || ||| | || |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11477436 atgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcagcagcaacaacatcaattgaaacttgattctc 11477356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Original strand, 38167969 - 38168048
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||  ||  | | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38167969 cttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttattacaattcatcaacaacatagcataattc-accaattgagcata 38168048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Original strand, 54424067 - 54424146
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||| ||| ||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54424067 cttagcaataacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattc-accaattgagcata 54424146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 2535 - 2648
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  2535 atgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaaca 2634  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||||||||||||    
T  2635 tagcataattcaac 2648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 8020 - 8145
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||    
T  8020 atgaattatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattccacaacaaca 8119  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  8120 tagcataattcacccaattgagcata 8145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 108020 - 108132
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||| | ||    
T  108020 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatatcttaacaacaacaacatcaattaaacatgatcttcatcacaattcaacaataaca 108119  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
     |||||||||||||    
T  108120 -agcataattcaac 108132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 69467 - 69580
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||    
T  69467 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaaca 69566  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  69567 tagcacaattcaac 69580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 29987 - 30087
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| |||||||    
T  29987 acccaagctatgaatcatcaacaacaatatcgcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaaaaacatagcacaattcaa 30086  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  30087 c 30087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 22009 - 22122
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||    
T  22009 atgatttatacatacccaagctgtgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaaca 22108  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||  ||||||||    
T  22109 tagcccaattcaac 22122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 85543 - 85654
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  85543 atgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaatatcacttaaacatgattctcatcataattcaacaacaaca 85642  T
Q  101 tagcataattca 112  Q
    || || ||||||    
T  85643 taacacaattca 85654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 110
Target Start/End: Original strand, 53370 - 53465
Alignment:
Q  15 cccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataatt 110  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| || |||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  53370 cccaagccatgaatcattaacaacaatgtcacttagcaacaacaacatccattgaacatgaatctcatcacaattcatcaacaaaatagcataatt 53465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Original strand, 146656 - 146735
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  146656 cttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattc-accaattgagcata 146735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 7412 - 7525
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  7412 atgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatctcttagcaacaccaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacagca 7511  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  7512 tagcacaattcaac 7525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 16837 - 16950
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16837 atgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatctcttagcaacaccaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacagca 16936  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  16937 tagcacaattcaac 16950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 104859 - 104735
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||| ||    
T  104859 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt-aacatggttatcatcataattcaacaacaaca 104761  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    || ||||||||||||| |||||||||    
T  104760 taacataattcaaccatttgagcata 104735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 79549 - 79674
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||| ||    
T  79549 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatggttcacatcataattcaacaacaaca 79648  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    || |||||||||||||||| ||||||    
T  79649 tatcataattcaaccaattaagcata 79674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Original strand, 4578 - 4698
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||| | |  ||| |||| ||||||| |||||||    
T  4578 ttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagca 4677  T
Q  106 taattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4678 taattcaaccaattgagcata 4698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Original strand, 9192 - 9312
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||| | |  ||| |||| ||||||| |||||||    
T  9192 ttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagca 9291  T
Q  106 taattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9292 taattcaaccaattgagcata 9312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 131846 - 131939
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaaca 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  131846 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaaaaatatttcttaacaacaacaacaacaattaagcatgattctcatcacaattcaaca 131939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 68190 - 68082
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||| |||| ||    
T  68190 ttatgaacaaccaagctatgaatcatcaaaaacaatatctcatgacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacataaca 68091  T
Q  106 taattcaac 114  Q
     ||||||||    
T  68090 caattcaac 68082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 103159 - 103034
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||| |||  |||||| ||| ||||  ||||| |||||||||| ||||||| | |  ||| |||||||||||| ||    
T  103159 atgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaataacatcaattgaacatgaatgttatcacaattcaacaacaaca 103060  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||    
T  103059 tagcataattcaacaaatttagcata 103034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 109613 - 109725
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||| | | ||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  109613 acccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaactgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcaaaattcaa 109712  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    | | |||||||||    
T  109713 caatttgagcata 109725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Original strand, 5955 - 6075
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | |  ||| |||||||||||  |||||||    
T  5955 ttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatattatcacaattcaacaaccacatagca 6054  T
Q  106 taattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  6055 taatttaaccaattgagcata 6075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 114
Target Start/End: Original strand, 4616 - 4728
Alignment:
Q  2 tgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcat 101  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||    
T  4616 tgatatatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattcccatcacaattcaacaacaacat 4715  T
Q  102 agcataattcaac 114  Q
    | || ||||||||    
T  4716 aacacaattcaac 4728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 1845 - 1934
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattca 91  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1845 atgatttatga-cacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacatcaacatcaattaaacatgattctcatcacaattca 1934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22652 - 22534
Alignment:
Q  8 atgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcata 107  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||||||| |    
T  22652 atgaacacccaaactatgaatcttcaacaacaatatcaattaacaacaacaacatcaattaaacatgattcacatctcaattcaacaacaacatagcaca 22553  T
Q  108 attcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||  | |||||||||    
T  22552 attcaataatttgagcata 22534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 61461 - 61375
Alignment:
Q  11 aacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaaca 97  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  61461 aacacacaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaccacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaaca 61375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Original strand, 7186 - 7307
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacat-caattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagc 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||| | |  ||| |||| ||||||| ||||||    
T  7186 ttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagc 7285  T
Q  105 ataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7286 ataattcaaccaattgagcata 7307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 77084 - 76971
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||| ||    
T  77084 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaaca 76985  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||||||||||||    
T  76984 tagcataattcaac 76971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 197490 - 197377
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||    
T  197490 atgatttatgaagacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaaca 197391  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||| | ||||||||    
T  197390 taggacaattcaac 197377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 1106 - 998
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||| |||||||    
T  1106 ttatgaacacacaagctatgaatcattaacaacgatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgaatctccccacatttcaacaacaacatagca 1007  T
Q  106 taattcaac 114  Q
     ||||||||    
T  1006 caattcaac 998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 17542 - 17462
Alignment:
Q  17 caagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaaca 97  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17542 caagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaccacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaaca 17462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 114
Target Start/End: Original strand, 31031 - 31143
Alignment:
Q  2 tgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcat 101  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| | |||    
T  31031 tgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacagtatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaagaacat 31130  T
Q  102 agcataattcaac 114  Q
    |||| ||||||||    
T  31131 agcacaattcaac 31143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 108
Target Start/End: Original strand, 2470 - 2572
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  2470 ttatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatatca 2569  T
Q  106 taa 108  Q
    |||    
T  2570 taa 2572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 3012 - 2908
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaac---aacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaaca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  3012 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcttttaacaacaacaacaacataaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaaca 2913  T
Q  98 tcata 102  Q
     ||||    
T  2912 acata 2908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 11104 - 11229
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  |    
T  11104 atgatctatgaacacctaagccatgaatcataaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaga 11203  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||    
T  11204 tagcatatttcaactatttgagcata 11229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 10672 - 10797
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| |     
T  10672 atgaattatgaacacccaagccatgaatgatcaacaacaacatcacttagcaaaaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcgacaacaacg 10771  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||    
T  10772 tatcataatccaaccaattaagcata 10797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 2553 - 2428
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||    
T  2553 atgaattatgaacgcccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttaggaacaacaacatcaattgaacatgagtcttatcataattcaacaacaaca 2454  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||| | | |||||||||    
T  2453 tagcataattcatcaatttgagcata 2428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 70543 - 70418
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||  |    
T  70543 atgaattatgaatacccaagccaagaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatggtcctcatcataattcaacaacaata 70444  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    || ||||||||| |||||||||||||    
T  70443 taacataattcacccaattgagcata 70418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 75
Target Start/End: Original strand, 12780 - 12849
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatga 75  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12780 ttatgaacacccaagttatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatga 12849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 1183 - 1107
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgatt 77  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1183 atgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttagcaacaacaacatcaattaaacatgatt 1107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Original strand, 41672 - 41778
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  41672 acccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattc-a 41770  T
Q  114 ccaattga 121  Q
    ||||||||    
T  41771 ccaattga 41778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1784 - 1658
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaa-caacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatc 99  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |  |||||||||| |||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  1784 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatatctaattcaacaacaacttcaattgagcatggttctcatcataattcaacaacaac 1685  T
Q  100 atagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  1684 atagcataattcacccatttgaacata 1658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 8929 - 8803
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaa-caacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatc 99  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |  |||||||||| |||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  8929 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatatctaattcaacaacaacttcaattgagcatggttctcatcataattcaacaacaac 8830  T
Q  100 atagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  8829 atagcataattcacccatttgaacata 8803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 68119 - 68004
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaaca----acatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaac 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    |||||||||||| || |||||| ||| || ||||||||    
T  68119 atgatttatgaacacccaagctataaatcatcaacaacaatgtatcttaacaacaacaacatacatcaattaaatataattctcatcacaaatcaacaac 68020  T
Q  97 atcatagcataattca 112  Q
    | ||||||| ||||||    
T  68019 aacatagcacaattca 68004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 12966 - 12897
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatga 75  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12966 ttatgaacacccaagttatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcatttaaacatga 12897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 7262 - 7137
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||    
T  7262 atgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattgaacatgattcttatcacaatccaataacaaca 7163  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||    
T  7162 taacataattaaacaatttgagcata 7137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 8416 - 8332
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacat 98  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8416 acccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacat 8332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 11756 - 11835
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctc 80  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11756 atgatatatgaacacccaagccataaatcat-aacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctc 11835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 28546 - 28671
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    | |||||||||||| ||    
T  28546 atgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacataattcttactacaattcaacaacaaca 28645  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    || ||||||||||| | |||||||||    
T  28646 taccataattcaacaatttgagcata 28671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 46175 - 46299
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| | |||||  ||  ||| |||| ||||||| ||    
T  46175 atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagaaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaaca 46274  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  46275 tagcataattc-accaattgagcata 46299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 40668 - 40792
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | |||||  ||  ||| |||  |||||||  |    
T  40668 atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatgtaacaacaata 40767  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40768 tagcataattc-accaattgagcata 40792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 97435 - 97322
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||  |||  |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||    
T  97435 atgatttatgaaaacccaaggcatgaatcatcaacaataatatcaattagtaacaacaatatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaccaaca 97336  T
Q  101 tagcataattcaac 114  Q
    ||||||||||||||    
T  97335 tagcataattcaac 97322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 126
Target Start/End: Original strand, 70676 - 70748
Alignment:
Q  54 caacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  70676 caacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaaccaattaagcata 70748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 33672 - 33783
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| ||    
T  33672 atgaattatgaacaccctagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaaca 33771  T
Q  101 tagcataattca 112  Q
    ||||||||||||    
T  33772 tagcataattca 33783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Original strand, 13530 - 13628
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattca 112  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13530 acccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattca 13628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 33952 - 33840
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| ||   |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33952 acccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaa 33853  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||| ||||||    
T  33852 ccaatttagcata 33840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Original strand, 25374 - 25469
Alignment:
Q  20 gctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaa-catcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaac 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  25374 gctatgaatcatcaacaacaatatttcttaataacaacaatcatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaagaacatagcacaattcaac 25469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9102 - 8994
Alignment:
Q  18 aagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaa 117  Q
    |||| |||||| |||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9102 aagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaaccaa 9003  T
Q  118 ttgagcata 126  Q
    |||||||||    
T  9002 ttgagcata 8994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 33646 - 33582
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 70  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  33646 ttatgaacacccaagctataaatcatcaacaataatatctcatgacaacaacaacatcaattaaa 33582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 319 - 442
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||||| ||| |||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||   || |||||||||| | ||    
T  319 atgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaataaca 418  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagca 124  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  419 tagcataattcaacaatttgagca 442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 51390 - 51312
Alignment:
Q  45 tcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagca 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  51390 tcttaaccacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcatcaaccacataacataattc-accaattgagca 51312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 116750 - 116687
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatca 64  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  116750 atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatca 116687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 11712 - 11821
Alignment:
Q  16 ccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaacc 115  Q
    |||||| |||||| |||  ||||||  || |||| ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11712 ccaagccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattctacaacaacatagcataattcaacc 11811  T
Q  116 aattgagcat 125  Q
    ||||||||||    
T  11812 aattgagcat 11821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 132474 - 132363
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| |   ||||||||| |    
T  132474 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacgatgcataattc-a 132376  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  132375 ccaattgagcata 132363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 114
Target Start/End: Original strand, 14095 - 14159
Alignment:
Q  50 acaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  14095 acaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacgtagtataattcaac 14159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Original strand, 159354 - 159434
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  159354 cttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcata 159434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 6671 - 6794
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| || ||| ||||  |  ||||||||||||| ||||||| |||   || |||||||||| | ||    
T  6671 atgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaaaacatcacttaggagtaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatagca 6770  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagca 124  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  6771 tagcataattcaacaatttgagca 6794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 64
Target Start/End: Original strand, 1411 - 1469
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatca 64  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  1411 ttatgaacacccaaggtatgaatcatcaacaacaacctctcctaacaacaacaacatca 1469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 68 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22599 - 22541
Alignment:
Q  68 aaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  22599 aaacatggttctcatcataattcaacaacaacttagcataattcacccaattgagcata 22541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Original strand, 1971 - 2050
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||  | | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1971 cttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttataacaaatcaacaaca-catagcataattcaaccaattgagcata 2050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 21535 - 21646
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  21535 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaaataatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattc-a 21633  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  21634 ccaattgagcata 21646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 126
Target Start/End: Original strand, 3365 - 3454
Alignment:
Q  37 acaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||| ||| |||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||  ||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3365 acaacatcacttagcaacatcaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattggaccaattgagcata 3454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 4951 - 5075
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatca 100  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||| |||  |||||| ||  |||| ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||||||||| ||    
T  4951 atgaattatgaacaaccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaca 5050  T
Q  101 tagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
     | |||||||| ||||||| ||||||    
T  5051 aatcataattc-accaattaagcata 5075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 167 - 278
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  | || ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||||||||| || |||||||||| |    
T  167 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattc-a 265  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  266 ccaattgagcata 278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 800 - 689
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  |||| ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  800 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattc-a 702  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||| ||||||||    
T  701 ccaaatgagcata 689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 7592 - 7703
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||||  ||  |||||||| | ||||| ||  ||||||||| |    
T  7592 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataatttatcaacaacaatgcataattc-a 7690  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  7691 ccaattgagcata 7703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 9960 - 10071
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  | || ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||||||||| || |||||||||| |    
T  9960 acccaagccatgaataatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattc-a 10058  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||    
T  10059 ccaattgagcata 10071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 24920 - 24841
Alignment:
Q  46 cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24920 cttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattc-accaattgagcata 24841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 50093 - 50013
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctc 80  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  50093 atgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctc 50013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 90050 - 89975
Alignment:
Q  51 caacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||| |  |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  90050 caacaacaacatcaattgaacatggtcttcatcataattcaacaataatatagcataatccactcaattgagcata 89975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 49
Target Start/End: Original strand, 147568 - 147611
Alignment:
Q  6 ttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctctta 49  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  147568 ttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactta 147611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 5820 - 5714
Alignment:
Q  7 tatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagca 105  Q
    ||||||||||||||  || ||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||  |  |||||||||||| |||  ||    
T  5820 tatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatttctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtca 5721  T
Q  106 taattca 112  Q
    |||||||    
T  5720 taattca 5714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 5232 - 5300
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 70  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5232 atgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaa 5300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 1340 - 1451
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  | || ||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||||||||| || |||||||||| |    
T  1340 acccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattc-a 1438  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||||| ||||||    
T  1439 ccaattaagcata 1451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 742 - 631
Alignment:
Q  14 acccaagctatgaatcatcgacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcttcataattcaacaacatcatagcataattcaa 113  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| ||  ||||  |||||||||||||||| | |||||  ||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  742 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagtaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattc-a 644  T
Q  114 ccaattgagcata 126  Q
    |||| ||||||||    
T  643 ccaaatgagcata 631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 3360 - 3316
Alignment:
Q  1 atgatttatgaacacccaagctatgaatcatcgacaacaatatct 45  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  3360 atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaacatct 3316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5214 times since January 2019
Visitors: 4845