View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0748_low_27 (Length: 311)

Name: NF0748_low_27
Description: NF0748
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0748_low_27
NF0748_low_27
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (12-254)||(13211-13453)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (12-256)||(18818286-18818530)
chr8 (12-247)||(21923814-21924049)
chr8 (12-247)||(20536208-20536443)
chr8 (12-243)||(7372778-7373001)
chr8 (12-242)||(23406379-23406611)
chr8 (12-243)||(22626736-22626966)
chr8 (13-243)||(28648934-28649164)
chr8 (12-247)||(21918886-21919121)
chr8 (12-254)||(18879116-18879352)
chr8 (12-243)||(16092231-16092463)
chr8 (9-243)||(6759255-6759487)
chr8 (13-247)||(23648554-23648788)
chr8 (12-238)||(22875065-22875291)
chr8 (12-247)||(31971257-31971490)
chr8 (12-247)||(45130884-45131117)
chr8 (12-247)||(16199532-16199765)
chr8 (15-178)||(14409444-14409606)
chr8 (15-178)||(1484402-1484564)
chr8 (15-178)||(5853292-5853454)
chr8 (19-178)||(16413316-16413474)
chr8 (15-178)||(20403227-20403389)
chr8 (15-178)||(22001753-22001915)
chr8 (15-227)||(41598188-41598399)
chr8 (15-178)||(4483281-4483442)
chr8 (15-178)||(4542373-4542535)
chr8 (15-178)||(15203231-15203393)
chr8 (15-178)||(20046195-20046357)
chr8 (12-233)||(21389353-21389571)
chr8 (12-228)||(21395888-21396101)
chr8 (12-228)||(21790381-21790594)
chr8 (14-166)||(18678069-18678221)
chr8 (15-178)||(19896265-19896430)
chr8 (12-215)||(21778697-21778897)
chr8 (14-166)||(32121734-32121886)
chr8 (15-178)||(14823774-14823935)
chr8 (150-247)||(25363026-25363123)
chr8 (15-227)||(26219717-26219918)
chr8 (13-178)||(26223917-26224081)
chr8 (15-178)||(25484275-25484430)
chr8 (31-227)||(19801333-19801527)
chr8 (19-194)||(13508024-13508199)
chr8 (19-178)||(45290694-45290853)
chr8 (15-158)||(26225268-26225409)
chr8 (9-123)||(19937061-19937174)
chr8 (19-194)||(13597556-13597731)
chr8 (28-123)||(15070571-15070665)
chr8 (12-138)||(38855246-38855372)
chr8 (39-196)||(23776772-23776929)
chr8 (12-135)||(6520368-6520491)
chr8 (31-194)||(20498581-20498744)
chr8 (12-227)||(17612018-17612231)
chr8 (12-110)||(17140916-17141014)
chr8 (12-81)||(21490995-21491065)
chr8 (12-127)||(5866280-5866395)
chr8 (16-131)||(21285601-21285716)
chr8 (16-81)||(23760895-23760961)
chr8 (27-130)||(983407-983512)
chr8 (31-194)||(37116366-37116530)
chr8 (39-189)||(20465982-20466132)
chr8 (12-62)||(21249384-21249434)
chr8 (12-62)||(21255222-21255272)
chr8 (16-81)||(26355749-26355815)
chr8 (31-215)||(17439423-17439609)
chr8 (24-138)||(21673716-21673830)
chr8 (39-179)||(16410207-16410347)
chr8 (176-227)||(26222987-26223039)
chr8 (39-189)||(30643235-30643385)
chr8 (16-228)||(17353843-17354060)
chr8 (31-131)||(24353039-24353140)
chr8 (39-179)||(17926659-17926799)
chr8 (31-80)||(20502154-20502203)
chr8 (33-81)||(22525579-22525627)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (12-247)||(51913-52148)
scaffold0011 (12-251)||(167861-168099)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (12-251)||(25421532-25421771)
chr5 (12-251)||(25431395-25431633)
chr5 (12-254)||(23390375-23390617)
chr5 (12-247)||(24493569-24493803)
chr5 (12-247)||(8286728-8286964)
chr5 (12-243)||(9077952-9078183)
chr5 (12-247)||(13025311-13025545)
chr5 (12-247)||(13095495-13095729)
chr5 (15-241)||(24529223-24529449)
chr5 (12-251)||(22075018-22075258)
chr5 (12-243)||(1096467-1096698)
chr5 (12-179)||(21808343-21808510)
chr5 (12-247)||(21292856-21293090)
chr5 (12-179)||(21729018-21729185)
chr5 (15-227)||(22412187-22412388)
chr5 (15-178)||(264768-264930)
chr5 (15-178)||(39363384-39363546)
chr5 (15-177)||(10732941-10733102)
chr5 (15-178)||(20909012-20909174)
chr5 (15-178)||(29329934-29330096)
chr5 (15-178)||(42245365-42245527)
chr5 (26-227)||(18418594-18418793)
chr5 (12-120)||(21997547-21997655)
chr5 (15-178)||(29345980-29346142)
chr5 (15-227)||(11581151-11581361)
chr5 (15-178)||(36154783-36154942)
chr5 (15-178)||(29348453-29348615)
chr5 (15-178)||(29350926-29351088)
chr5 (15-178)||(39245136-39245298)
chr5 (15-178)||(20902008-20902172)
chr5 (15-178)||(2154613-2154776)
chr5 (15-178)||(32027393-32027555)
chr5 (18-178)||(18319033-18319193)
chr5 (15-178)||(10775675-10775838)
chr5 (14-166)||(17517168-17517320)
chr5 (31-233)||(22144068-22144271)
chr5 (15-178)||(31061068-31061231)
chr5 (15-178)||(20917952-20918110)
chr5 (149-247)||(22107259-22107357)
chr5 (15-123)||(38619434-38619541)
chr5 (116-243)||(21986037-21986164)
chr5 (61-187)||(18356364-18356488)
chr5 (16-123)||(23064512-23064618)
chr5 (18-178)||(24067110-24067270)
chr5 (19-219)||(37723910-37724108)
chr5 (16-194)||(21565546-21565723)
chr5 (61-187)||(20910745-20910869)
chr5 (12-81)||(19660886-19660956)
chr5 (12-81)||(21329548-21329618)
chr5 (39-219)||(21873277-21873453)
chr5 (12-227)||(40725853-40726069)
chr5 (12-135)||(21502154-21502277)
chr5 (31-130)||(20026942-20027043)
chr5 (16-81)||(22959583-22959649)
chr5 (87-227)||(20766035-20766166)
chr5 (16-101)||(26704075-26704160)
chr5 (16-101)||(26973808-26973893)
chr5 (12-110)||(36314577-36314675)
chr5 (16-190)||(22032323-22032492)
chr5 (12-181)||(26011988-26012154)
chr5 (16-190)||(18769947-18770118)
chr5 (12-81)||(19668898-19668968)
chr5 (15-69)||(20806850-20806904)
chr5 (28-81)||(26732884-26732937)
chr5 (16-189)||(23572084-23572254)
chr5 (31-81)||(26740697-26740747)
chr5 (31-192)||(22178161-22178323)
chr5 (16-101)||(23201360-23201445)
chr5 (31-80)||(23469822-23469871)
chr5 (61-131)||(29448052-29448123)
chr5 (39-75)||(22757148-22757184)
[»] chr3 (91 HSPs)
chr3 (12-254)||(17487856-17488098)
chr3 (12-248)||(13442274-13442510)
chr3 (12-254)||(17499338-17499580)
chr3 (12-247)||(23083247-23083482)
chr3 (12-242)||(26686887-26687117)
chr3 (12-254)||(20698315-20698556)
chr3 (12-242)||(43840932-43841162)
chr3 (16-247)||(14576719-14576949)
chr3 (12-243)||(14972854-14973085)
chr3 (12-243)||(18438534-18438765)
chr3 (15-227)||(24153115-24153326)
chr3 (12-251)||(12399209-12399448)
chr3 (12-243)||(25476275-25476506)
chr3 (25-247)||(14572602-14572823)
chr3 (15-243)||(40213611-40213838)
chr3 (30-233)||(42386428-42386632)
chr3 (12-243)||(11424653-11424880)
chr3 (27-251)||(30029855-30030078)
chr3 (15-194)||(29172567-29172745)
chr3 (15-178)||(9707607-9707769)
chr3 (15-178)||(17463178-17463340)
chr3 (15-178)||(34159326-34159488)
chr3 (15-178)||(45606907-45607069)
chr3 (15-178)||(55476491-55476653)
chr3 (15-178)||(7781347-7781509)
chr3 (15-178)||(8899094-8899256)
chr3 (15-178)||(16454281-16454443)
chr3 (15-178)||(17672626-17672788)
chr3 (15-178)||(28848611-28848773)
chr3 (15-178)||(38961891-38962053)
chr3 (15-178)||(13151790-13151953)
chr3 (15-178)||(13154255-13154418)
chr3 (14-178)||(13544024-13544187)
chr3 (15-178)||(6469134-6469296)
chr3 (15-178)||(10247723-10247885)
chr3 (19-178)||(12567564-12567722)
chr3 (17-178)||(16282811-16282971)
chr3 (15-178)||(17446655-17446816)
chr3 (15-178)||(50242822-50242984)
chr3 (12-178)||(43550478-43550644)
chr3 (17-178)||(41123892-41124049)
chr3 (15-158)||(36166598-36166739)
chr3 (31-178)||(53070653-53070799)
chr3 (15-129)||(55500942-55501055)
chr3 (14-166)||(46822267-46822419)
chr3 (15-218)||(12119684-12119887)
chr3 (12-227)||(24340628-24340844)
chr3 (15-141)||(15977515-15977640)
chr3 (26-227)||(21618460-21618650)
chr3 (14-190)||(12511059-12511236)
chr3 (15-123)||(15412429-15412536)
chr3 (150-228)||(14179570-14179648)
chr3 (150-251)||(16796685-16796786)
chr3 (31-227)||(52523633-52523831)
chr3 (15-123)||(8499518-8499625)
chr3 (15-194)||(27165250-27165429)
chr3 (15-131)||(10556985-10557101)
chr3 (12-227)||(37642170-37642386)
chr3 (15-112)||(44494809-44494905)
chr3 (16-194)||(16103784-16103960)
chr3 (30-227)||(23274705-23274903)
chr3 (12-127)||(13210333-13210448)
chr3 (15-112)||(17737236-17737335)
chr3 (16-194)||(16097332-16097509)
chr3 (15-191)||(53301492-53301669)
chr3 (12-135)||(14234487-14234610)
chr3 (16-131)||(15470928-15471043)
chr3 (16-81)||(12174310-12174376)
chr3 (19-131)||(32307684-32307795)
chr3 (94-194)||(2051138-2051238)
chr3 (15-76)||(28194693-28194755)
chr3 (16-81)||(49668127-49668193)
chr3 (16-183)||(856140-856304)
chr3 (15-68)||(45577947-45578000)
chr3 (19-81)||(1644725-1644787)
chr3 (16-81)||(9512924-9512990)
chr3 (16-81)||(9520899-9520965)
chr3 (39-179)||(11298481-11298621)
chr3 (12-227)||(22147431-22147646)
chr3 (31-131)||(43925977-43926079)
chr3 (13-162)||(14665398-14665546)
chr3 (13-162)||(14668554-14668702)
chr3 (16-101)||(15878083-15878168)
chr3 (31-131)||(37251168-37251270)
chr3 (31-131)||(22110352-22110454)
chr3 (39-187)||(19725857-19726004)
chr3 (16-101)||(23077509-23077594)
chr3 (33-77)||(13919350-13919394)
chr3 (176-227)||(36166747-36166799)
chr3 (31-135)||(12377940-12378046)
chr3 (39-179)||(12496280-12496421)
[»] chr2 (71 HSPs)
chr2 (12-242)||(23060513-23060742)
chr2 (12-236)||(23076442-23076666)
chr2 (12-247)||(22731120-22731355)
chr2 (12-247)||(22738066-22738300)
chr2 (12-247)||(23285865-23286096)
chr2 (12-247)||(22337115-22337350)
chr2 (12-243)||(23660023-23660253)
chr2 (12-251)||(23654268-23654507)
chr2 (15-251)||(298696-298933)
chr2 (12-247)||(38002-38235)
chr2 (15-178)||(22105412-22105575)
chr2 (12-247)||(20309108-20309340)
chr2 (18-178)||(21155060-21155219)
chr2 (15-178)||(18808943-18809105)
chr2 (15-178)||(23130862-23131024)
chr2 (15-178)||(23133329-23133491)
chr2 (15-178)||(23709532-23709694)
chr2 (15-178)||(23712013-23712175)
chr2 (15-178)||(26505379-26505541)
chr2 (15-178)||(26507857-26508019)
chr2 (15-178)||(34402522-34402684)
chr2 (15-178)||(39682313-39682475)
chr2 (13-178)||(32214921-32215085)
chr2 (15-178)||(571397-571559)
chr2 (15-178)||(6725995-6726157)
chr2 (15-178)||(23135590-23135752)
chr2 (15-178)||(24367774-24367936)
chr2 (12-233)||(23708518-23708738)
chr2 (15-178)||(24898195-24898358)
chr2 (15-178)||(24900678-24900841)
chr2 (15-178)||(24903155-24903318)
chr2 (15-178)||(24905632-24905795)
chr2 (15-178)||(24908107-24908270)
chr2 (15-178)||(32039498-32039660)
chr2 (15-178)||(28577099-28577261)
chr2 (17-178)||(43137301-43137461)
chr2 (15-178)||(45029854-45030016)
chr2 (19-166)||(25616192-25616339)
chr2 (167-254)||(27753730-27753817)
chr2 (15-178)||(24529528-24529691)
chr2 (15-178)||(38967374-38967537)
chr2 (12-181)||(23103348-23103516)
chr2 (12-227)||(19671830-19672043)
chr2 (31-251)||(32451811-32452031)
chr2 (39-196)||(22799063-22799220)
chr2 (16-196)||(23019643-23019823)
chr2 (17-138)||(28405981-28406103)
chr2 (12-89)||(8946657-8946734)
chr2 (12-75)||(23040247-23040310)
chr2 (31-179)||(7687-7835)
chr2 (16-138)||(25175854-25175976)
chr2 (16-180)||(7679589-7679751)
chr2 (31-233)||(20520092-20520295)
chr2 (13-81)||(22134258-22134326)
chr2 (18-94)||(24643034-24643109)
chr2 (12-110)||(23071972-23072070)
chr2 (31-194)||(23791292-23791456)
chr2 (101-178)||(24642856-24642933)
chr2 (39-179)||(25963669-25963809)
chr2 (33-101)||(23038048-23038116)
chr2 (31-131)||(23207296-23207398)
chr2 (33-81)||(23287384-23287432)
chr2 (33-81)||(26392403-26392451)
chr2 (27-77)||(18786958-18787009)
chr2 (16-196)||(22740897-22741081)
chr2 (16-219)||(40622123-40622327)
chr2 (31-233)||(22413035-22413240)
chr2 (108-195)||(22459500-22459587)
chr2 (31-81)||(25108906-25108957)
chr2 (39-161)||(21916071-21916192)
chr2 (94-227)||(24697512-24697644)
[»] chr7 (78 HSPs)
chr7 (12-254)||(9509189-9509431)
chr7 (12-247)||(12698831-12699067)
chr7 (15-227)||(18456319-18456530)
chr7 (12-247)||(38227481-38227715)
chr7 (15-243)||(3564254-3564482)
chr7 (12-251)||(26211995-26212235)
chr7 (12-247)||(10589039-10589273)
chr7 (12-248)||(16386132-16386369)
chr7 (14-247)||(40443393-40443624)
chr7 (12-178)||(13647325-13647491)
chr7 (15-194)||(16213684-16213861)
chr7 (15-227)||(48273392-48273594)
chr7 (15-178)||(456321-456483)
chr7 (15-178)||(11972496-11972658)
chr7 (15-178)||(14949122-14949284)
chr7 (27-245)||(15143925-15144143)
chr7 (15-178)||(15376713-15376875)
chr7 (15-178)||(16232520-16232682)
chr7 (15-178)||(18640272-18640434)
chr7 (15-178)||(20385123-20385285)
chr7 (15-178)||(21189595-21189757)
chr7 (15-178)||(32125491-32125653)
chr7 (15-178)||(41522917-41523079)
chr7 (15-178)||(41525379-41525541)
chr7 (16-178)||(11393287-11393448)
chr7 (12-178)||(18430709-18430874)
chr7 (15-178)||(24702238-24702400)
chr7 (15-178)||(27216860-27217022)
chr7 (19-165)||(24275175-24275320)
chr7 (12-247)||(27847719-27847951)
chr7 (12-218)||(2280033-2280238)
chr7 (15-176)||(16410059-16410219)
chr7 (15-178)||(44116509-44116671)
chr7 (15-178)||(3386333-3386495)
chr7 (16-181)||(14932685-14932851)
chr7 (16-181)||(15356120-15356286)
chr7 (16-181)||(15360234-15360400)
chr7 (15-178)||(24704688-24704847)
chr7 (15-227)||(17061866-17062077)
chr7 (15-195)||(20110556-20110724)
chr7 (15-123)||(13869346-13869453)
chr7 (19-178)||(38898376-38898535)
chr7 (15-141)||(13831373-13831498)
chr7 (31-227)||(12756622-12756817)
chr7 (12-131)||(67745-67864)
chr7 (12-131)||(22072913-22073033)
chr7 (12-227)||(19486649-19486865)
chr7 (16-135)||(16219715-16219834)
chr7 (78-178)||(26355983-26356083)
chr7 (78-178)||(26358435-26358535)
chr7 (12-127)||(34200786-34200901)
chr7 (12-110)||(28505321-28505419)
chr7 (27-233)||(1867895-1868101)
chr7 (16-138)||(18005650-18005772)
chr7 (18-101)||(18154873-18154956)
chr7 (39-188)||(15211484-15211633)
chr7 (16-135)||(811129-811248)
chr7 (12-127)||(16495402-16495517)
chr7 (12-135)||(47831807-47831930)
chr7 (35-233)||(15008398-15008597)
chr7 (16-81)||(44014182-44014248)
chr7 (16-190)||(17138006-17138177)
chr7 (61-142)||(2530129-2530208)
chr7 (12-81)||(11996078-11996148)
chr7 (34-194)||(12255730-12255892)
chr7 (12-65)||(15754955-15755008)
chr7 (16-189)||(12187019-12187189)
chr7 (27-131)||(16056343-16056446)
chr7 (12-215)||(10063740-10063939)
chr7 (39-189)||(12321685-12321835)
chr7 (16-101)||(19649521-19649606)
chr7 (27-89)||(12901338-12901401)
chr7 (27-81)||(14044761-14044816)
chr7 (27-81)||(14354791-14354846)
chr7 (100-195)||(15113031-15113125)
chr7 (100-195)||(15116568-15116662)
chr7 (15-73)||(26356098-26356156)
chr7 (15-73)||(26358550-26358608)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (12-247)||(3470-3705)
scaffold0292 (12-243)||(343-573)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (12-254)||(1851-2093)
[»] chr4 (71 HSPs)
chr4 (12-254)||(44052829-44053071)
chr4 (14-247)||(22636437-22636669)
chr4 (12-247)||(12902757-12902992)
chr4 (12-247)||(7893703-7893935)
chr4 (12-251)||(7088877-7089116)
chr4 (12-247)||(16239856-16240090)
chr4 (12-229)||(16270140-16270356)
chr4 (15-243)||(16377413-16377639)
chr4 (12-196)||(7798774-7798958)
chr4 (17-243)||(14038653-14038879)
chr4 (19-251)||(23374241-23374473)
chr4 (12-184)||(6899891-6900062)
chr4 (12-137)||(52873363-52873488)
chr4 (15-227)||(44928829-44929042)
chr4 (15-227)||(54798669-54798872)
chr4 (15-178)||(18215274-18215436)
chr4 (12-247)||(14053188-14053422)
chr4 (15-178)||(12307-12469)
chr4 (15-194)||(1837494-1837671)
chr4 (15-178)||(15118352-15118514)
chr4 (15-178)||(52312510-52312672)
chr4 (15-227)||(14280316-14280518)
chr4 (9-178)||(19242693-19242861)
chr4 (13-178)||(19618172-19618336)
chr4 (15-178)||(3515007-3515169)
chr4 (15-178)||(23803265-23803427)
chr4 (15-178)||(44615288-44615450)
chr4 (15-178)||(44773087-44773249)
chr4 (15-178)||(50222339-50222501)
chr4 (12-247)||(17046487-17046719)
chr4 (15-178)||(18239419-18239581)
chr4 (15-178)||(51463868-51464030)
chr4 (15-227)||(44102214-44102425)
chr4 (19-178)||(15355324-15355483)
chr4 (15-178)||(12610950-12611105)
chr4 (13-178)||(14970707-14970871)
chr4 (12-227)||(15367690-15367905)
chr4 (12-227)||(15402703-15402918)
chr4 (27-227)||(52243099-52243302)
chr4 (12-98)||(3096293-3096379)
chr4 (15-178)||(7641192-7641344)
chr4 (12-227)||(15371202-15371417)
chr4 (12-227)||(15373483-15373698)
chr4 (31-194)||(13790-13953)
chr4 (14-178)||(22353835-22353999)
chr4 (127-241)||(3096759-3096872)
chr4 (12-227)||(15370018-15370232)
chr4 (31-176)||(21815587-21815731)
chr4 (12-227)||(16223532-16223747)
chr4 (150-247)||(17047958-17048055)
chr4 (31-251)||(6190481-6190701)
chr4 (15-158)||(8574844-8574985)
chr4 (27-194)||(43198492-43198661)
chr4 (18-178)||(20149832-20149992)
chr4 (61-187)||(43256106-43256230)
chr4 (12-81)||(15551817-15551887)
chr4 (39-196)||(15093798-15093955)
chr4 (12-135)||(39706286-39706409)
chr4 (16-81)||(12774011-12774077)
chr4 (27-130)||(12288211-12288316)
chr4 (16-81)||(8846360-8846426)
chr4 (39-179)||(16356905-16357045)
chr4 (39-187)||(16488023-16488171)
chr4 (16-189)||(15121747-15121917)
chr4 (87-176)||(15464888-15464977)
chr4 (39-179)||(16348617-16348757)
chr4 (176-227)||(8574784-8574836)
chr4 (31-194)||(46640395-46640558)
chr4 (209-243)||(15091093-15091127)
chr4 (31-79)||(15791793-15791841)
chr4 (33-81)||(17333298-17333346)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (12-247)||(38761-38995)
scaffold0145 (12-229)||(32942-33158)
scaffold0145 (10-178)||(9744-9912)
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (12-247)||(20360846-20361081)
chr6 (12-251)||(17287678-17287917)
chr6 (12-254)||(20638162-20638404)
chr6 (12-244)||(22780116-22780348)
chr6 (12-243)||(29060540-29060771)
chr6 (13-256)||(18409704-18409947)
chr6 (12-243)||(25629245-25629476)
chr6 (12-243)||(20593773-20594004)
chr6 (12-239)||(19303435-19303661)
chr6 (12-179)||(16496244-16496411)
chr6 (12-179)||(20076700-20076863)
chr6 (15-178)||(12742317-12742479)
chr6 (15-178)||(18334592-18334754)
chr6 (15-178)||(19005046-19005208)
chr6 (15-178)||(19858919-19859081)
chr6 (15-178)||(22782227-22782389)
chr6 (15-178)||(24422547-24422709)
chr6 (15-178)||(33861794-33861956)
chr6 (15-178)||(33864278-33864440)
chr6 (13-178)||(30676710-30676874)
chr6 (15-178)||(2291180-2291342)
chr6 (15-178)||(8055029-8055191)
chr6 (15-178)||(25754809-25754971)
chr6 (15-178)||(26924640-26924802)
chr6 (13-178)||(34963371-34963535)
chr6 (15-178)||(25656629-25656791)
chr6 (31-227)||(18456735-18456930)
chr6 (27-233)||(25644335-25644543)
chr6 (15-178)||(1540911-1541073)
chr6 (15-178)||(1595549-1595711)
chr6 (15-178)||(25688502-25688664)
chr6 (12-247)||(16920519-16920751)
chr6 (15-178)||(3852017-3852179)
chr6 (12-187)||(35245586-35245758)
chr6 (18-178)||(16448526-16448686)
chr6 (50-251)||(25603267-25603467)
chr6 (39-243)||(15041441-15041644)
chr6 (15-178)||(20556894-20557054)
chr6 (31-165)||(18461895-18462028)
chr6 (12-247)||(22831503-22831737)
chr6 (14-178)||(19847949-19848114)
chr6 (31-196)||(18821782-18821946)
chr6 (12-194)||(20109140-20109322)
chr6 (50-251)||(25611605-25611805)
chr6 (14-166)||(23992429-23992578)
chr6 (12-227)||(8227416-8227632)
chr6 (12-81)||(27333269-27333339)
chr6 (12-81)||(27394009-27394079)
chr6 (12-73)||(25714417-25714478)
chr6 (61-187)||(27415887-27416011)
chr6 (31-247)||(11185524-11185737)
chr6 (12-127)||(28496477-28496592)
chr6 (12-127)||(29808888-29809003)
chr6 (12-131)||(23019408-23019525)
chr6 (16-131)||(19652199-19652313)
chr6 (39-185)||(18907134-18907280)
chr6 (39-161)||(21766718-21766839)
chr6 (12-65)||(1561303-1561356)
chr6 (16-101)||(19873120-19873205)
chr6 (16-101)||(22432249-22432334)
chr6 (16-101)||(22438799-22438884)
chr6 (27-81)||(9098565-9098620)
chr6 (27-130)||(19668386-19668491)
chr6 (16-101)||(19862978-19863063)
chr6 (33-81)||(33443068-33443116)
chr6 (12-59)||(22080799-22080846)
chr6 (16-196)||(25642120-25642304)
chr6 (24-81)||(4185872-4185930)
chr6 (194-242)||(5834388-5834436)
chr6 (102-234)||(16965210-16965341)
chr6 (194-242)||(20177096-20177144)
chr6 (194-242)||(22158847-22158895)
chr6 (120-179)||(18180596-18180656)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (15-243)||(22886-23113)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (12-242)||(8424-8650)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (12-254)||(6000-6245)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (13-243)||(50210103-50210333)
chr1 (12-251)||(27250611-27250850)
chr1 (15-243)||(34509783-34510011)
chr1 (12-243)||(22532269-22532500)
chr1 (12-251)||(21026680-21026919)
chr1 (13-245)||(20135188-20135420)
chr1 (13-226)||(22468604-22468816)
chr1 (89-247)||(22354458-22354616)
chr1 (15-194)||(23593719-23593897)
chr1 (15-178)||(13988866-13989028)
chr1 (15-178)||(21923291-21923453)
chr1 (124-254)||(22356053-22356184)
chr1 (124-254)||(22357739-22357870)
chr1 (12-178)||(45574842-45575008)
chr1 (15-227)||(433012-433222)
chr1 (15-178)||(21475087-21475249)
chr1 (15-178)||(31612313-31612475)
chr1 (12-247)||(38801277-38801508)
chr1 (14-178)||(21840766-21840929)
chr1 (15-178)||(29298137-29298298)
chr1 (15-178)||(29776688-29776850)
chr1 (13-194)||(16361915-16362095)
chr1 (15-178)||(16275363-16275526)
chr1 (12-218)||(13212821-13213027)
chr1 (15-215)||(21346961-21347161)
chr1 (12-112)||(20847175-20847275)
chr1 (9-215)||(21342090-21342296)
chr1 (15-178)||(22123067-22123230)
chr1 (15-178)||(21707167-21707329)
chr1 (15-178)||(21711709-21711871)
chr1 (150-228)||(48603652-48603730)
chr1 (39-196)||(21787979-21788136)
chr1 (31-194)||(21896195-21896358)
chr1 (31-193)||(21861510-21861672)
chr1 (9-123)||(15860064-15860177)
chr1 (18-178)||(40389157-40389317)
chr1 (61-187)||(33797570-33797694)
chr1 (27-233)||(16758664-16758872)
chr1 (13-80)||(20454606-20454673)
chr1 (16-194)||(33681011-33681188)
chr1 (31-221)||(35260992-35261180)
chr1 (16-101)||(21714546-21714631)
chr1 (16-138)||(22921864-22921986)
chr1 (19-131)||(21754052-21754163)
chr1 (16-138)||(22237631-22237753)
chr1 (31-194)||(50614055-50614219)
chr1 (31-194)||(50621883-50622047)
chr1 (12-127)||(14295557-14295672)
chr1 (16-127)||(20248283-20248394)
chr1 (28-127)||(20918620-20918719)
chr1 (31-179)||(41049990-41050138)
chr1 (27-81)||(52928021-52928076)
chr1 (39-161)||(18182093-18182214)
chr1 (16-101)||(42865245-42865330)
chr1 (192-251)||(20847101-20847161)
chr1 (149-227)||(21477653-21477732)
chr1 (31-80)||(16368338-16368388)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (12-243)||(3041-3271)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (12-251)||(25896-26134)
scaffold0026 (12-251)||(39858-40096)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (12-247)||(8479-8710)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (14-243)||(39479-39707)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (14-243)||(75105-75333)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (12-251)||(931-1169)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (12-243)||(4508-4738)
scaffold0228 (12-243)||(12090-12320)
scaffold0228 (12-243)||(22042-22272)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (12-243)||(39913-40143)
scaffold0080 (39-191)||(18597-18749)
scaffold0080 (31-131)||(19885-19987)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (30-254)||(24180-24406)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (13-243)||(17105-17337)
scaffold0056 (31-227)||(79235-79430)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (19-243)||(25955-26179)
scaffold0122 (15-158)||(44682-44825)
scaffold0122 (149-243)||(33385-33479)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (12-243)||(16490-16721)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (12-251)||(4849-5088)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (64-242)||(13144-13322)
scaffold0175 (12-87)||(34123-34199)
scaffold0175 (12-68)||(273-329)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (12-247)||(20910-21146)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (13-216)||(3103-3306)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (15-243)||(339840-340065)
scaffold0003 (15-178)||(158450-158612)
scaffold0003 (61-187)||(71350-71474)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (12-247)||(32067-32299)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (12-229)||(32863-33077)
scaffold0120 (12-229)||(45928-46142)
scaffold0120 (12-223)||(16113-16323)
scaffold0120 (12-73)||(17389-17450)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (12-247)||(1952-2187)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (12-247)||(4712-4946)
scaffold0358 (77-247)||(1-170)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (12-247)||(13497-13730)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (12-247)||(15351-15584)
scaffold0114 (16-189)||(7295-7465)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (12-247)||(10312-10544)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (102-254)||(124675-124827)
scaffold0021 (13-190)||(174767-174943)
scaffold0021 (12-81)||(121766-121835)
scaffold0021 (31-130)||(136370-136471)
scaffold0021 (31-130)||(145078-145179)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (75-238)||(3424-3588)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (93-243)||(27911-28061)
scaffold0130 (13-46)||(27878-27911)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (12-222)||(46995-47202)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (12-247)||(16282-16514)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (12-142)||(28414-28544)
scaffold0046 (12-127)||(11292-11407)
scaffold0046 (12-127)||(1997-2112)
scaffold0046 (12-65)||(4552-4605)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (33-243)||(4545-4754)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (15-178)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (15-178)||(37821-37983)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (15-178)||(141618-141780)
scaffold0028 (15-178)||(136680-136842)
scaffold0028 (15-178)||(139149-139311)
scaffold0028 (15-178)||(144087-144249)
scaffold0028 (15-178)||(134211-134373)
scaffold0028 (14-138)||(62200-62321)
scaffold0028 (16-75)||(132662-132722)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (15-178)||(94411-94573)
scaffold0023 (19-178)||(17440-17598)
scaffold0023 (15-175)||(44454-44614)
scaffold0023 (16-139)||(100378-100501)
scaffold0023 (16-219)||(38394-38596)
scaffold0023 (12-81)||(119875-119945)
scaffold0023 (16-138)||(40169-40291)
scaffold0023 (104-219)||(23581-23695)
scaffold0023 (16-81)||(101503-101569)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (12-247)||(938-1170)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (12-247)||(1289-1521)
scaffold0106 (12-247)||(7266-7498)
scaffold0106 (15-80)||(15291-15356)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (15-178)||(4694-4856)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (15-178)||(13392-13554)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (15-178)||(13947-14109)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (15-178)||(82072-82234)
scaffold0037 (27-194)||(22610-22776)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (89-243)||(853-1006)
scaffold0395 (12-78)||(4888-4954)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (15-227)||(16784-16995)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (14-178)||(10772-10935)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (71-247)||(6669-6845)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (12-179)||(128751-128917)
scaffold0031 (31-230)||(20328-20524)
scaffold0031 (16-101)||(65830-65915)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (19-178)||(501088-501246)
scaffold0001 (15-218)||(85539-85742)
scaffold0001 (16-138)||(160688-160809)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (13-178)||(11286-11450)
scaffold0029 (16-189)||(12763-12933)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (18-178)||(4300-4459)
scaffold0761 (39-161)||(6281-6402)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (15-178)||(40400-40562)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (12-247)||(51582-51814)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (13-178)||(12249-12413)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (14-178)||(9241-9404)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (15-178)||(106-268)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (27-194)||(8481-8650)
scaffold0621 (12-138)||(6535-6661)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (16-177)||(29558-29720)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (29-178)||(29946-30094)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (15-178)||(4214-4377)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (15-178)||(12064-12220)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (15-158)||(116430-116571)
scaffold0022 (31-194)||(128909-129072)
scaffold0022 (176-227)||(116579-116631)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (31-218)||(13147-13336)
scaffold0357 (27-218)||(16014-16206)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (12-134)||(11442-11564)
scaffold0235 (196-247)||(11399-11450)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (150-247)||(1052-1149)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (12-227)||(17932-18148)
scaffold0247 (15-218)||(2088-2291)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (27-218)||(27663-27855)
scaffold0165 (171-247)||(3640-3716)
scaffold0165 (171-247)||(7704-7780)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (15-218)||(161049-161252)
scaffold0007 (95-218)||(164550-164674)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (15-247)||(5017-5246)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (18-178)||(1280-1440)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (31-251)||(51766-51985)
scaffold0034 (12-131)||(32538-32654)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (31-194)||(12587-12749)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (31-194)||(53488-53651)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (15-194)||(38641-38820)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (12-194)||(11464-11646)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (12-194)||(38195-38377)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (172-243)||(10323-10394)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (31-233)||(60614-60818)
scaffold0010 (24-194)||(129917-130086)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (16-219)||(23843-24048)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (61-187)||(15362-15486)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (39-219)||(16264-16442)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (16-138)||(19268-19390)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (39-181)||(29117-29262)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (33-194)||(7998-8161)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (27-194)||(10481-10647)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (16-196)||(4741-4921)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (16-138)||(2801-2923)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (16-138)||(14692-14814)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (15-127)||(15664-15776)
scaffold0261 (16-101)||(1339-1424)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (191-247)||(17873-17929)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (12-135)||(6121-6244)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (16-194)||(133-310)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (24-138)||(5655-5769)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (87-194)||(225482-225588)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (12-81)||(6611-6681)
scaffold0333 (12-81)||(13991-14061)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (16-219)||(26828-27027)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (16-81)||(23934-24000)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (12-81)||(15828-15898)
scaffold0020 (16-79)||(178898-178961)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (31-138)||(1051-1158)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (12-127)||(1075-1190)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (16-194)||(45732-45909)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (12-77)||(1089-1155)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (16-219)||(21721-21920)
scaffold0210 (16-219)||(29613-29812)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (16-81)||(2696-2762)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (16-183)||(1881-2045)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (12-135)||(12766-12889)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (204-252)||(20595-20643)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (16-81)||(28820-28887)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (16-135)||(12943-13062)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (39-188)||(192920-193070)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (16-81)||(1086-1152)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (16-101)||(36454-36539)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (27-227)||(25121-25321)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (39-179)||(1853-1993)
scaffold0104 (39-179)||(9536-9675)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (16-101)||(69794-69879)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (103-191)||(1169-1257)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (39-162)||(920-1042)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (27-130)||(8075-8180)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (39-189)||(46670-46820)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (24-81)||(6824-6882)
scaffold0556 (87-131)||(8090-8134)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (31-73)||(11982-12024)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (16-101)||(19980-20065)
scaffold0139 (35-165)||(38339-38470)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (39-179)||(44104-44244)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (27-131)||(10542-10646)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (31-194)||(97024-97188)
scaffold0006 (31-194)||(106302-106466)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (31-179)||(6237-6386)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (16-88)||(10567-10639)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (39-189)||(17054-17205)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (16-110)||(32102-32197)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (39-187)||(416-564)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (100-165)||(13092-13157)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (33-81)||(206576-206624)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (31-130)||(569-669)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (40-189)||(15111-15259)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (39-179)||(6368-6508)


Alignment Details
Target: scaffold0193 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13453
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 13310  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13311 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 13410  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13411 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 13453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818286
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 18818431  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
18818430 attgtaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 18818331  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatccta 256  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
18818330 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactacccta 18818286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923814
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatca 21923950  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
21923949 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataaccttattttgcatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 21923850  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21923849 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 21923814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536443
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 20536307  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
20536308 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatcttaaacaactt 20536407  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
20536408 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 20536443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7373001
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7372877  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
7372878 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc--------ttatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 7372969  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
7372970 cacagattataattaacatcctcattaagtct 7373001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406611
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23406478  T
112 attgcaagtcaac--aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 209  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
23406479 attgcaagtcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacatagtcaacatcaacacatcttaaacaac 23406578  T
210 ttcacagattataattaacatcatcattaagtc 242  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
23406579 ttcacatattataattaacatcctcattaagtc 23406611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22626966
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 22626834  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
22626835 aatacaaatcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagctt 22626934  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
22626935 cacagattataattaacatcctcattaagtct 22626966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28648934
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaa 28649065  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 212  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28649064 atgcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 28648965  T
213 acagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
28648964 acatattataattaacatcatcattaagtct 28648934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21918886
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 21919022  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
21919021 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcagcagcaacacatcttaaacagct 21918923  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||    
21918922 tcacagatcgtaattaacctcatcgttaagtcttaat 21918886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18879116
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||    
18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acataataatatca 18879258  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
18879257 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatctt-atcagctt 18879159  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
18879158 cacagattatagttaacatcatcattaagtcttgatgctatcc 18879116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16092231
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 16092364  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 210  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
16092363 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataatttaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacaact 16092264  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||||||    
16092263 tcgcatattataattaacatcatccttaagtct 16092231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759487
Alignment:
9 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataata 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataata 6759354  T
109 tcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaaca 207  Q
    |||| |||||||   |||||||| || ||| || | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
6759355 tcaaatgcaagt---caacatctcaattatacactcataattcaattaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaaca 6759451  T
208 gcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6759452 gcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 6759487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648788
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||     
23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatcat 23648653  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 212  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
23648654 ttgcaatacaacaacatcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctta 23648753  T
213 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
23648754 acagattataattaacatcatcattaggtcttaat 23648788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 238
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875291
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 22875163  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 210  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22875164 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagct 22875263  T
211 tcacagattataattaacatcatcatta 238  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
22875264 tcacagattataattaacatcaccatta 22875291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971490
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 31971355  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
31971356 attccaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacatctt 31971454  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
31971455 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 31971490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45130884
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||    
45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatca 45131020  T
112 attgcaagt-caacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    ||| ||| | || ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
45131019 atttcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcatcaacaacaaatcttatacagct 45130921  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
45130920 tcacagattataattaacctcattattaagtcttaat 45130884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199532
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||  || |||||||||||||||||    
16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa--caacatgacataataatatc 16199668  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
16199667 aatttcaattcatctacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatattacatcataatcaacaacaacatatcttatacagct 16199569  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
16199568 tcacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 16199532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409444
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14409508  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
14409507 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14409444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484564
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 1484500  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
1484501 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 1484564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853292
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 5853356  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
5853355 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 5853292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413316
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 16413376  T
119 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
16413375 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 16413316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403389
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20403325  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
20403326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20403389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001915
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22001851  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
22001852 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22001915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598399
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41598286  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 213  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||| ||||    
41598287 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagtttca 41598385  T
214 cagattataattaa 227  Q
    ||||| || |||||    
41598386 cagatcatcattaa 41598399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483442
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4483378  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
4483379 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4483442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542373
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   || | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacaagat-acaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4542437  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
4542436 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4542373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203231
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15203295  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | ||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
15203294 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15203231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046195
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 20046259  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
20046258 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20046195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389353
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||   |||||||||||||||| |||||    
21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatc 21389475  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
21389474 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21389376  T
211 tcacagattataattaacatcat 233  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||    
21389375 tcacatattacaattaacttcat 21389353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395888
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||||    
21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatc 21396005  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||  |||||    
21396004 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagct 21395906  T
211 tcacagattataattaac 228  Q
    |||||||||| |||||||    
21395905 tcacagattacaattaac 21395888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790381
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||||    
21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatc 21790498  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||  |||||    
21790497 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagct 21790399  T
211 tcacagattataattaac 228  Q
    |||||||||| |||||||    
21790398 tcacagattacaattaac 21790381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678069
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 18678122  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
18678121 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 18678069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896430
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgac---ataataatatca 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||||||||   ||||||||||||    
19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatca 19896363  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
19896364 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19896430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778697
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||   |||||||||||||||| |||||    
21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatc 21778801  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
21778800 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21778702  T
211 tcaca 215  Q
    |||||    
21778701 tcaca 21778697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121886
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 32121833  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
32121834 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 32121886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823935
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14823871  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
14823872 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14823935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25363123 - 25363026
Alignment:
150 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
25363123 tcaagtaatgcataaaacattataccacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 25363026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219918
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| |    
26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatac-aaaatagtatgacataataatatcaaat 26219814  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttca 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||      ||||     ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
26219815 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttca 26219904  T
214 cagattataattaa 227  Q
     ||||||| |||||    
26219905 tagattatcattaa 26219918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224081
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| | || || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaataaag-caatatacaaaaatagcatgacataataatatcaa 26224015  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||  |||| || || |||||||||||  |||||||||||    
26224016 atgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataatttaattaatgcatatacaattatatcaca 26224081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484275
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |        || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagcta--------gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25484339  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
25484338 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 25484275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801333
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 130  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
131 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 227  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataa-caacatcaagtcatcgtaaatcagcttcacagatcatcattaa 19801333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13508199 - 13508024
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | || || || ||||| ||||||||||| |  |||    
13508199 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgca 13508101  T
118 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    ||| |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
13508100 agtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13508024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290694
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 45290755  T
119 gtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | ||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||||| |||  |||||||||||    
45290754 gccaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcagatacaattatatcaca 45290694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225268
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  || | ||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acaatatac-aaaacagtatgacataataatatcaaat 26225312  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 158  Q
     |||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
26225311 acaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26225268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937061
Alignment:
9 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataata 108  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |    
19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataaga 19937076  T
109 tcaattgcaagtcaa 123  Q
    |||| ||||||||||    
19937075 tcaaatgcaagtcaa 19937061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13597731 - 13597556
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  | ||||| || ||||| ||||||||||| |  |||    
13597731 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgca 13597633  T
118 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    ||| |||||||||  |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
13597632 agtaaacaacatcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13597556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 123
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070665
Alignment:
28 caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15070665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855246
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||||||    
38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 38855274  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
38855273 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 38855246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23776929 - 23776772
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | |||| ||||||||| | |||| | ||||||||| |  ||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||    
23776929 gactcatgcaacttagttaaataactatagcagcataggcagatcacaacatcagcatgacttcttaatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcat 23776830  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 196  Q
    ||||| |||  | |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
23776829 tcaataatatcttaagtaatgcacataacattatataacatcatattcaacatcaaca 23776772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520491
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||||||    
6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6520466  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
6520467 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 6520491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498744
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    || ||| |||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
20498680 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 20498744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17612018
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||    
17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 17612133  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 209  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||   ||||||||  |||| |||| ||||    
17612132 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattata---aacatcaaatcatcataaatcagc 17612036  T
210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
17612035 ttcacagatcatcattaa 17612018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 110
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17141014
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||  || |||||||||||||||||    
17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aatccatcatgacataataatatc 17141014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491065
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 21491065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866280
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||||||||||    
5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 5866297  T
111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
5866296 gaatgtaaatcaacaac 5866280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285716
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| | | |||||| ||||| |||| |||||||| |    
21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaat 21285699  T
115 gcaagtcaacaacatct 131  Q
    |||| ||||||||||||    
21285700 gcaaatcaacaacatct 21285716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23760961 - 23760895
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
23760961 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 23760895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983407
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 124  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||   ||||| |||| ||| |||| ||||| |||||    
983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
125 aacatc 130  Q
    ||||||    
983412 aacatc 983407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116530
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttaca-aaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcag--tacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 37116463  T
127 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    ||||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||  | |||||||||| || | |||||||||    
37116464 catctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 37116530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20466132 - 20465982
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||||| | |||| |||| ||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
20466132 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagtataggcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 20466034  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaac 189  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||    
20466033 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaac 20465982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249434
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataa 62  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21249434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255272
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataa 62  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21255272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355749
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagt 26355749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439423
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttaca-aaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||||  ||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagt--acataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 17439512  T
127 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcaca 215  Q
    ||||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||  | |||||||||| || |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||    
17439511 catctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatattataacagcttcaca 17439423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 138
Target Start/End: Original strand, 21673716 - 21673830
Alignment:
24 tcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| ||||||||||| | | | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||    
21673716 tcatcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca 21673814  T
123 acaacatcttaaatat 138  Q
    ||||||||| ||||||    
21673815 acaacatctcaaatat 21673830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16410347 - 16410207
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||| |  | |||||| ||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
16410347 gactcatgcaacttagtgaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataataccaatt-catttcaacaacatcttgatcat 16410249  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
16410248 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 16410207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26223039 - 26222987
Alignment:
176 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
26223039 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 26222987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30643385 - 30643235
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||  ||| | |||| |||| ||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
30643385 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 30643287  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaac 189  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| || |||||||||    
30643286 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcatattataatcaac 30643235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17354060 - 17353843
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataata-----atatc 110  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||     |||||    
17354060 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacattatgacatcatataacgatatc 17353961  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatg-catataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 209  Q
    || | ||||  | || ||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||  ||  ||||| || |||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||    
17353960 aaatacaagcaagcatcatctcaatcattcattcataattcaagtaatgaaatcaaacatcatctcacatcatattcaacataaacatttcat-aacagc 17353862  T
210 ttcacagattataattaac 228  Q
    ||||||||||| |||||||    
17353861 ttcacagattacaattaac 17353843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353140
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttaca-aaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcag--tacataaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaa 24353135  T
127 catct 131  Q
    |||||    
24353136 catct 24353140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17926799 - 17926659
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| || | ||||||||| | | || |||||||| |  | | |||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
17926799 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcaaaacaacagcataatttcacaatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 17926701  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
17926700 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 17926659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20502203 - 20502154
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||||    
20502203 cttagaccgactcatgcagcttaattaacatacaacagcaacataggcag 20502154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 81
Target Start/End: Original strand, 22525579 - 22525627
Alignment:
33 tagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 81  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||    
22525579 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacaacaacttaggcagt 22525627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52148
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatca 52012  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
52013 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatctacatcaacacatcttaaacagctt 52112  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52113 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 52148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167861
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatca 168000  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
167999 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagctt 167901  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
167900 caaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 167861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25421771
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 25421631  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
25421632 attgcaagtcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 25421731  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
25421732 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatgcta 25421771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431633
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 25431493  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
25431494 attgcaagtcaacaacatcttaaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 25431593  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
25431594 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatgcta 25431633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390375
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23390518  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
23390517 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagctt 23390418  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
23390417 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcc 23390375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24493803
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 24493667  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
24493668 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaatagctt 24493767  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
24493768 cacagattataattaacatcattattaagtcttaat 24493803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286728
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaa-cagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatc 8286865  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8286864 aattgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 8286765  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
8286764 tcacataatataattaacatcttcattaagtcttaat 8286728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078183
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 9078051  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9078052 agtgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 9078151  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
9078152 cacagattataattaacatcatcattaagtct 9078183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025545
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||    
13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatca 13025409  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
13025410 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaactt 13025509  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
13025510 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaat 13025545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095729
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||    
13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatca 13095593  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
13095594 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaactt 13095693  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
13095694 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaat 13095729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529449
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaat 24529322  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
24529323 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24529422  T
215 agattataattaacatcatcattaagt 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
24529423 agattatagttaacatcatcattaagt 24529449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075258
Alignment:
12 acatcatcat-cttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||    
22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatc 22075117  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
22075118 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 22075217  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
22075218 tcacatattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 22075258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096698
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||    
1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatca 1096566  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | ||||| |||||||||||| | |||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
1096567 aatgcaaatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 1096666  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    || || |||||||||||||| |||||||||||    
1096667 cataggttataattaacatcctcattaagtct 1096698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808343
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21808411  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||    
21808410 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacat 21808343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21292856
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||    
21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaacaaa--cagtatgacataataatatca 21292993  T
112 at--tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 209  Q
    ||  |  || ||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| |    
21292992 atattcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacaac 21292894  T
210 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
21292893 ttcacagattataattaacctcattattaagtcttaat 21292856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729018
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21729086  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||||||||    
21729085 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcacat 21729018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412388
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 22412285  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||      ||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22412286 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22412375  T
215 agattataattaa 227  Q
    |||||||||||||    
22412376 agattataattaa 22412388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264768
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 264832  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
264831 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 264768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363546
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39363482  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
39363483 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39363546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732941
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10733004  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcac 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
10733003 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 10732941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909174
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20909110  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
20909111 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330096
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 29330032  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
29330033 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29330096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245365
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 42245429  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
42245428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 42245365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Original strand, 18418594 - 18418793
Alignment:
26 atcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaa-taacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 124  Q
    |||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
18418594 atcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcatttgcaattca-c 18418690  T
125 aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataa 223  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
18418691 aacatcttaa-tattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttcacaggttataa 18418789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997547
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 21997556  T
112 attgcaagt 120  Q
    | |||||||    
21997555 aatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346142
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29346078  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
29346079 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29346142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581151
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 11581263  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 213  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| || |||||    
11581262 gcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataa-caacatcaa-tcatcataaatcaacttca 11581165  T
214 cagattataattaa 227  Q
    |||||||| |||||    
11581164 cagattatcattaa 11581151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154783
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaca-ca---gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 36154847  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
36154846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 36154783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348615
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| || |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29348551  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
29348552 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29348615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351088
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| || |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29351024  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
29351025 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29351088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245298
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39245234  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| ||| ||  || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
39245235 gcaagtcaataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 39245298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20902008
Alignment:
15 tcatcatcttcat-caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaag 20902074  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaata-ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || || ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
20902073 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 20902008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154613
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 2154678  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaata-ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
2154677 gcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 2154613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027555
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32027491  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
32027492 ccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32027555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319033
Alignment:
18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 18319095  T
118 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
18319094 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 18319033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775675
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |    
10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaat 10775740  T
115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
10775739 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 10775675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517168
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 17517221  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 166  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
17517220 cgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 17517168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144271
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaac 228  Q
    || ||| |||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||| | || |||||     
22144167 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaattcatcttataacaacttcacaggtcatcattaat 22144266  T
229 atcat 233  Q
    |||||    
22144267 atcat 22144271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061231
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31061166  T
115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| |||| | | || ||||||   ||| || || |||||||||||| |||||||||||    
31061167 gcaagtcaatcaacgtatcaattattcacaaataatttaattaatgcatataaaattatatcaca 31061231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20917952
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||      
20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacaaaataatataaa-- 20918014  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
      ||||||||||| ||| || ||||||  | || ||||||||| |||||||  |||||||||||    
20918013 --aagtcaacaacgtctcaattattcacatctaattcaagtaaagcatatataattatatcaca 20917952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22107357 - 22107259
Alignment:
149 ttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
22107357 ttcaagtaatgcataatatattatatcacatcataatcaacaacaacacaccttaaacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaat 22107259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619541
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38619532  T
115 gcaagtcaa 123  Q
    |||||||||    
38619533 gcaagtcaa 38619541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21986164 - 21986037
Alignment:
116 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 215  Q
    ||||||||||||||||| | |||  | | |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
21986164 caagtcaacaacatcttcattataaattcatatctcaagtaatgcatataacattttatcacctcatattcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 21986065  T
216 gattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||    
21986064 aattatagttaacatcatcatcaagtct 21986037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 18356364 - 18356488
Alignment:
61 aacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc 160  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||   | |||||||||    
18356364 aacaacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaatatttcttaagtaatgc 18356461  T
161 atataacattatatcacatcataatca 187  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||    
18356462 ataaaacattatatcacattataatca 18356488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064618
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatg 23064610  T
116 caagtcaa 123  Q
    ||||||||    
23064611 caagtcaa 23064618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067270
Alignment:
18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 24067208  T
118 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| || | ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
24067209 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 24067270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Original strand, 37723910 - 37724108
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| || ||||||| |  |    
37723910 catcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatcaaattaa 37724006  T
118 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc-atataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 216  Q
    | ||| |||||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||  ||||||||||||||    
37724007 attcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaaacattatatcacatcatattcaacactaacatctc-aaaacagcttcacag 37724105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565723
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21565644  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
21565645 gcaagtcatcaacatttcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 21565723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20910869 - 20910745
Alignment:
61 aacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 159  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||| ||||||||    
20910869 aacaacagcaacatagacagcatacaaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaacattcaaataattctt-aagtaatg 20910773  T
160 catataacattatatcacatcataatca 187  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||    
20910772 cataaaacattatatcacattataatca 20910745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660886
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 19660886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329548
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 21329548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Original strand, 21873277 - 21873453
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| | ||||||||| | |||||||||||  ||  |||||   |||||||  ||    
21873277 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataggcaggatacaacatcagcatgacttcataatatcaatctcatttcaac---atcttaaccat 21873373  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagatt 219  Q
    ||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||||||    
21873374 tcaataatatcttaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcacagatt 21873453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40726069
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||  |||  | ||||||| |||||||| | ||||  || ||||| |||||||||||    
40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaag-catcatgatataataatatc 40725951  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 209  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
40725952 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 40726051  T
210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
40726052 ttcacagatcatcattaa 40726069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21502154
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |   ||| |||||||| |||| ||||||    
21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat-gtaaatcagcatgatataacaatatc 21502179  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
     | ||||||||| || |||||||||    
21502178 gaatgcaagtcatcatcatcttaaa 21502154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026942
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-ccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T
128 atc 130  Q
    |||    
20026944 atc 20026942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959583
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 22959583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20766166 - 20766035
Alignment:
87 aaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||      ||||     ||  |||||||||||    
20766166 aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtacgacatcataatc 20766077  T
187 aacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
20766076 aacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 20766035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704160
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||    
26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 26704160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973893
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||    
26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 26973893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 110
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314675
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||| || ||||| |||||||||||    
36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032492
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||  ||||| ||| |||||     
22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaaaca-atcatg--ataattataccaatt- 22032418  T
116 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaaca 190  Q
    ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||    
22032419 caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 22032492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26011988
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||||||    
26012154 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaagcaacatgatataacaatatc 26012058  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatca 181  Q
    || ||  | |||||||||||| ||| | ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| ||||||    
26012057 aaatgtgaatcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatca 26011988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18770118 - 18769947
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||| ||  |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
18770118 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggtcgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 18770021  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaaca 190  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||    
18770020 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 18769947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19668968
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagt 19668968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806850
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagc 69  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaacagc 20806850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
28 caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 81  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 189
Target Start/End: Original strand, 23572084 - 23572254
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacag-catgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||| | ||||||| |||||||| | || ||||||||| | |||| ||||  |||||  |||| ||| |||||    
23572084 catcatcttaatcatcttatatggactcatgcaacttagttcaataacaataacagcataggcagatcacaacaacaatcatga--taattataccaatt 23572181  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaac 189  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
23572182 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaac 23572254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 81  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
26740747 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178161
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||  ||||| || | |||||||| ||||| ||||||||    
22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtata-taaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatc 192  Q
    |||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| || | |||||||    
22178224 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 22178161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 23201360 - 23201445
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||  |||||||    
23201360 catcatcttgttcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacattatgacat 23201445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 23469822 - 23469871
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||||    
23469822 cttagaccgactcatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggcag 23469871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 131
Target Start/End: Original strand, 29448052 - 29448123
Alignment:
61 aacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagc--atgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||  |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
29448052 aacaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatct 29448123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Original strand, 22757148 - 22757184
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
22757148 gactcatgtaacttagttaaataacagcagcaacata 22757184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 91)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17488098
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 17487955  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
17487956 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagatt 17488055  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17488056 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 17488098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 248
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442510
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 13442373  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13442374 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 13442473  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13442474 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 13442510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499580
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 17499437  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
17499438 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagatt 17499537  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17499538 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 17499580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23083247
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatca 23083383  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
23083382 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatatcaacacatcttaaacagctt 23083283  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
23083282 cacagattgtaattaacatcatcactaagtcttaat 23083247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687117
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 26686986  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
26686987 attgcaagtcaacatcatcttaaatattccattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 26687086  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtc 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
26687087 cacagattataattaacatcctcattaagtc 26687117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698315
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatca 20698457  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
20698456 attgcaattcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacttcaacacatcttgaacagctt 20698358  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20698357 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaattctatcc 20698315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841162
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 43841031  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
43841032 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 43841131  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtc 242  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||    
43841132 cacagattataattaacatcctcgttaagtc 43841162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14576949 - 14576719
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
14576949 catcatcaacatcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtata-aacaacagcatgacataataatatcaattg 14576851  T
116 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
14576850 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 14576751  T
216 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
14576750 gattataattaacatcatcattaaatcttaat 14576719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14973085
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 14972953  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | ||||| |||||||||||| | |||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14972954 aatgcaaatcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 14973053  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
14973054 catagattataattaacatcatcattaagtct 14973085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18438765
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 18438633  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||||||||||||||||||   ||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
18438634 aatgcaagtcaacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagctt 18438733  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
18438734 cacagattatagttaacatcatcattaagtct 18438765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153115
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 24153228  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24153227 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24153128  T
215 agattataattaa 227  Q
    |||||||||||||    
24153127 agattataattaa 24153115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399448
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 12399308  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
12399309 aatgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataagacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaatagctt 12399408  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||    
12399409 cacagattatagttaacctcttcattatgtcttaatgcta 12399448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476275
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 25476407  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
25476406 aatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagctt 25476307  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
25476306 cacagattgtaattaacatcctcattaagtct 25476275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 14572602 - 14572823
Alignment:
25 catcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
14572602 catcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgagagtcaac 14572700  T
125 aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
14572701 aacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgaaaaaaacattatatcacatcataaacaacataaacaaatcttaaacaacttcacaaattataat 14572800  T
225 taacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||    
14572801 taacatcatcattaagtcttaat 14572823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213611
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaat 40213740  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 214  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || | ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
40213739 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctttac 40213640  T
215 agattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
40213639 agattataattaacatcatcattaagtct 40213611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 233
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386632
Alignment:
30 acttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaac 228  Q
    || ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaaacagcttcacagattatcattaac 42386627  T
229 atcat 233  Q
    |||||    
42386628 atcat 42386632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424653
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataacaatatca 11424782  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    || |||| ||||||   ||| || ||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
11424781 atagcaaatcaaca---tctcaattatgcattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataaacaacttcaacacatcttaaacagctt 11424685  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
11424684 cacagattaaaattaacatcaacattaagtct 11424653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 251
Target Start/End: Original strand, 30029855 - 30030078
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||| |||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||    
30029855 tcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaatatcatttgcaattca-caa 30029953  T
127 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 226  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |    
30029954 cgtcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaacagcttcacatattatattaa 30030053  T
227 acatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
30030054 acatcatcattaagtcttaaagcta 30030078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172567
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29172647  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |  |||||||||||    
29172646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatactatcaacatcaa 29172567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707607
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 9707671  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
9707670 acaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 9707607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463340
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17463276  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
17463277 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17463340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159488
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34159424  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
34159425 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34159488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606907
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 45606971  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
45606970 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45606907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476653
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55476589  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
55476590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 55476653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781347
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 7781411  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
7781410 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7781347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899256
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8899192  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
8899193 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8899256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454281
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16454345  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
16454344 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16454281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672788
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17672724  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
17672725 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 17672788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848611
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 28848675  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
28848674 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 28848611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961891
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38961955  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
38961954 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 38961891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151790
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13151855  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
13151854 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13151790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154255
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13154320  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
13154319 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13154255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544187
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||||||     
13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 13544122  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
13544123 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 13544187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469134
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6469198  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || || |||  |||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
6469197 gcaagtcaacaacgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcaca 6469134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247723
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10247787  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
10247786 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 10247723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567722
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 12567662  T
119 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
12567663 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12567722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282811
Alignment:
17 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||    
16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgc 16282873  T
117 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
16282872 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16282811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446655
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
17446816 tcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17446719  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
17446718 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17446655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242984
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 50242920  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
50242921 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 50242984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550478
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatca 43550545  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||    
43550544 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcaca 43550478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124049
Alignment:
17 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacacaa----cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 41123987  T
117 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
41123988 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41124049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166739
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 36166695  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
36166696 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 36166739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070653
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 53070701  T
131 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
53070700 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 53070653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55501040  T
115 gcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||    
55501041 gcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822419
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  |||| || ||||||| |||||||||    
46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaat 46822366  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
46822367 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 46822419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119684
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12119789  T
115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 212  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||   ||| |  || |||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
12119788 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 12119690  T
213 acagat 218  Q
    ||||||    
12119689 acagat 12119684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340628
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| | || || || ||||| |||||||||||    
24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatc 24340746  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 209  Q
     |  |||||| |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
24340745 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 24340646  T
210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
24340645 ttcacagatcatcattaa 24340628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977640
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 15977613  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattca 141  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||    
15977614 gcaagtcaacaacgtctcaattattca 15977640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Original strand, 21618460 - 21618650
Alignment:
26 atcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
21618460 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 21618557  T
126 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataat 224  Q
    |||||| |||||| || | ||| ||||||||      ||||     ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||    
21618558 acatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcat 21618647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511236
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  |||| || ||||||| |||||||||    
12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaat 12511158  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatat-aacattatatcacatcataatcaaca 190  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| || |||| | ||||||||| || ||||||    
12511159 tgcaattcaacaacatcttcaatattcaataatatctcaagtaatgcacataaacaatgtatcacatcttattcaaca 12511236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412536
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15412527  T
115 gcaagtcaa 123  Q
    |||||||||    
15412528 gcaagtcaa 15412536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 14179570 - 14179648
Alignment:
150 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14179570 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 14179648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 150 - 251
Target Start/End: Original strand, 16796685 - 16796786
Alignment:
150 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgc 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||    
16796685 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaaaaacaacacatcttaaacaacttcacatattataattagcctcttcattaagtcttaatgc 16796784  T
250 ta 251  Q
    ||    
16796785 ta 16796786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523633
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||  ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||    
52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataatta 226  Q
    |||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| || ||||    
52523732 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa-tcatcttataacagcttctcagatcatcatta 52523634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499625
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 8499616  T
115 gcaagtcaa 123  Q
    |||||||||    
8499617 gcaagtcaa 8499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165429
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||| | | |||||| ||||| |||  ||||||||     
27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgc-aaaacaacatgatataccaatatcaaa 27165348  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||  |||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
27165349 tgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 27165429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557101
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |    
10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-tcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaat 10557083  T
115 gcaagtcaa-caacatct 131  Q
    ||||| ||| ||||||||    
10557084 gcaagccaatcaacatct 10557101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642170
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||  |||  | |||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||    
37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 37642288  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 209  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
37642287 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 37642188  T
210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
37642187 ttcacagatcatcattaa 37642170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 112
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494905
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaa 44494905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16103960
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16103882  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
16103883 gcaa-tcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaa 16103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 227
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274903
Alignment:
30 acttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 128  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||| |  |||||| |||||||    
23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
129 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaa-acagcttcacagattataattaa 227  Q
    ||| |||||||||  |||| ||||||||| | |||||  |||| ||||||| |||| |||||||||  |||| |||  ||||||||||||| || |||||    
23274804 tctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcagcttcacagatcatcattaa 23274903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210333
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||||||||||    
13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 13210350  T
111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | ||||| ||||||||    
13210349 gaatgcaaatcaacaac 13210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 112
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737335
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtt--tacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatactacaacaacagcatgacataataatatcaa 17737335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097509
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | | ||| || ||| | |||| |||||| | |    
16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaat 16097430  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
16097431 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 16097509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301492
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||| ||||| |||| ||||||||     
53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaa 53301571  T
114 tgcaagtca-acaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacat 191  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||  |||| |||||||| | | ||||  |||||||||||  |||| ||||||    
53301570 tgcaagtcattcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattacgtatacaattatatcacaatataaacaacat 53301492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234610
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||||||    
14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 14234585  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
14234586 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 14234610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Original strand, 15470928 - 15471043
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
15470928 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 15471026  T
115 gcaagtcaacaacatct 131  Q
    |||||||| ||||||||    
15471027 gcaagtcatcaacatct 15471043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174310
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 12174310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Original strand, 32307684 - 32307795
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
32307684 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 32307782  T
118 agtcaacaacatct 131  Q
    | ||||||||||||    
32307783 a-tcaacaacatct 32307795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2051238 - 2051138
Alignment:
94 catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 193  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
2051238 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatca 2051139  T
194 a 194  Q
    |    
2051138 a 2051138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 76
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacatag 76  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49668127
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 49668127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856304
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 856237  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcata 183  Q
     ||| ||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
856238 -caattcaacaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatacata-aacattataatacatcata 856304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577947
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacag 68  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 45577947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 1644787 - 1644725
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 81  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
1644787 catcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaacaacaacataggcagt 1644725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9512990
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagt 9512990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9520965
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagt 9520965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11298621 - 11298481
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||| ||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
11298621 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 11298523  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
11298522 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 11298481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147431
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||  |||  | ||||||| ||||| || | ||||| || ||||| |||||||||||    
22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 22147548  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 209  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| ||  |||| |||| ||||    
22147547 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat-aaatcatcataaatcagc 22147449  T
210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
22147448 ttcacagatcatcattaa 22147431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926079
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttaca-aaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcag--tacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 43926074  T
127 catct 131  Q
    |||||    
43926075 catct 43926079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665546
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    |||||||||||| |||| |||| |  |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||| | |||  ||||| || || | | ||||||||    
14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataatcagatcacatcaacagtataactttaaaatatcaa 14665497  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcat 162  Q
    || ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||    
14665498 tt-catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcat 14665546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668702
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    |||||||||||| |||| |||| |  |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||  ||| | |||  ||||| || || | ||||||||||    
14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagtataactttataatatcaa 14668653  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcat 162  Q
    || ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||    
14668654 tt-catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcat 14668702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878083
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||  |||||||    
15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatatgacat 15878083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251168
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37251172  T
128 atct 131  Q
    ||||    
37251171 atct 37251168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110352
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttaca-aaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||     
22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcag--tacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacag 22110357  T
127 catct 131  Q
    |||||    
22110356 catct 22110352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19726004 - 19725857
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||  ||| | |||  ||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
19726004 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcatgac-tcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 19725907  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatca 187  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |  ||| ||||| ||||||| |||||||    
19725906 tcaataatatttcaagtaatgtaattaatcattaaatcacattataatca 19725857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077509
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||||||    
23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaacataggcagatcacaacaacattatgacat 23077509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919394
Alignment:
33 tagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacatagg 77  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
13919350 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagg 13919394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 227
Target Start/End: Original strand, 36166747 - 36166799
Alignment:
176 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
36166747 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 36166799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 135
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378046
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaa-ataacaacagcaacataggcagtttacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 128  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| | |  |||||||||||||||||| || |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 12378039  T
129 tcttaaa 135  Q
     ||||||    
12378040 acttaaa 12378046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Original strand, 12496280 - 12496421
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataa-tatcaattgcaagtcaacaacatcttaaata 137  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||  ||| | |||| |||||||| || | |||| |||||||| ||  || |||||||||| |  |    
12496280 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataattatcaatt-catttctacaacatcttgatca 12496378  T
138 ttcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
12496379 ttcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 12496421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 71)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060742
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23060612  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23060613 attgcaagtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 23060712  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtc 242  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
23060713 caca-attataattaacatcatcattaagtc 23060742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076666
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 23076541  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
23076542 attgcaagtcaacaatatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacagcttaaacagctt 23076641  T
212 cacagattataattaacatcatcat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
23076642 cacagattataattaacatcatcat 23076666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22731120
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 22731256  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22731255 attgcaattcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22731156  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
22731155 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22731120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22738066
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 22738202  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22738201 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22738102  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
22738101 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22738066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23286096
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||    
23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag----acataataatatca 23285960  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
23285961 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 23286060  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
23286061 cacagattataattaacatcttcattaagtcttaat 23286096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337350
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatca 22337214  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
22337215 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaacaactt 22337314  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
22337315 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaat 22337350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660253
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||    
23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatca 23660121  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23660122 aatgcaaatcaacaacatcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 23660221  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
23660222 tacaaattataattaacatcatcaataagtct 23660253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654268
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatca 23654408  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
23654407 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaacaacaacacatcttaaacagctt 23654308  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
23654307 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 23654268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298696
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||    
298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
298833 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaataacaacacatcttatacagcttca 298734  T
214 cagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    || |||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
298733 catattatagttaacctcttcattaagtcttaatgcta 298696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 38002
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 38137  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||| | | ||| || |||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
38136 atttcgattcatcatcatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatgtcttatacagctt 38038  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
38037 cagagattataattaacctcattgttaagtcttaat 38002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105575
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |    
22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22105511  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
22105512 gcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22105575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309340
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||    
20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 20309204  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
20309205 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 20309303  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
20309304 tcacagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 20309340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155060
Alignment:
18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 21155121  T
118 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
21155120 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21155060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809105
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18809041  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
18809042 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18809105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23131024
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23130960  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
23130961 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23131024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133491
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23133427  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
23133428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23133491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709532
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23709596  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
23709595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23709532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712013
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23712077  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
23712076 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23712013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505541
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26505477  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
26505478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26505541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26508019
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26507955  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
26507956 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26508019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402522
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34402586  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
34402585 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34402522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682475
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39682411  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
39682412 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39682475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214921
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 32214987  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
32214986 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 32214921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571559
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 571495  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || | ||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
571496 gcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 571559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726157
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6726093  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | ||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
6726094 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 6726157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135752
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23135688  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
23135689 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 23135752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367936
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24367872  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
24367873 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24367936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708518
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||| ||||||    
23708738 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatc 23708642  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagc 209  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||    
23708641 aattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatcttataacagc 23708542  T
210 ttcacagattataattaacatcat 233  Q
    ||||||||| || ||||| |||||    
23708541 ttcacagatcatcattaatatcat 23708518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898195
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24898260  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
24898259 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24898195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900678
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24900743  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
24900742 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24900678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903155
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24903220  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
24903219 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24903155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905632
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24905697  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
24905696 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24905632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908107
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24908172  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
24908171 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24908107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039498
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32039562  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
32039561 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32039498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577261
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgcaa-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 28577197  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
28577198 gcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 28577261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137461
Alignment:
17 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtaa-tatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 43137399  T
117 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
43137400 aagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 43137461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029854
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  || | |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 45029918  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
45029917 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatatcaca 45029854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 166
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616339
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaa 25616291  T
119 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 166  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
25616292 ttcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 25616339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 167 - 254
Target Start/End: Original strand, 27753730 - 27753817
Alignment:
167 cattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27753730 cattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacatattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 27753817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529528
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagt 24529593  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaata-ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| |||||| ||| || || ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
24529592 gcaagttaacaacgtctcaattatttcatatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 24529528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967537
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |  || | |||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacaca-acaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaat 38967472  T
115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
38967473 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 38967537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103348
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||    
23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacatgattatatca 23103419  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc-atataacattatatcacatca 181  Q
    | | ||| ||| |||||||| ||  ||||| | ||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
23103418 aattcaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtcatgcaattaaacattatatcacatca 23103348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19672043
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | |||||| ||||| |||||||||||    
19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 19671928  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagc 209  Q
     |  |||||| ||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| || | ||||    
19671929 gaacgcaagtaaacaacatc-tcaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa-caacatcaa-tcatcatagatcagc 19672025  T
210 ttcacagattataattaa 227  Q
    |||||||||||| |||||    
19672026 ttcacagattatcattaa 19672043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451811
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa-ca 128  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||    
32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa-tgcaagccaacaatca 32451933  T
129 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcat-aatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 227  Q
    ||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||   | | |||||||||||| ||| |||||||    
32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acataatatcacatcataaatcaacattaacatcccat-aacagcttcacaaattgtaattaa 32451835  T
228 catcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
     |||||  | ||||||||||||||    
32451834 tatcatattcaagtcttaatgcta 32451811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22799220 - 22799063
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||| |||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||    
22799220 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacatcatgacttcataatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcat 22799121  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 196  Q
    ||||| |||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
22799120 tcaataatatcttaagtaaggcacataacattatatcacatcatattcaacattaaca 22799063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23019823 - 23019643
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||| |||||| | ||||||||||||     
23019823 catcatcttaatcatcttatattgactcataaaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacatgacttcataatatcaattt 23019724  T
116 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 196  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
23019723 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaaca 23019643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 138
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406103
Alignment:
17 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||| |||||| | ||    
28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
116 caagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
28406081 caaatcaacaacatctcaaatat 28406103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946734
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaa 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaacataggcagtatacaaaa 8946734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040247
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7687
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 7737  T
130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    || ||| |||||  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
7736 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacat 7687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25175976
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 25175952  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
25175953 gcaaatcaacaacatctcaaatat 25175976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679751
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||||| |    
7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaa-t 7679686  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatc 180  Q
    | |||||| ||||||| |||| | ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||||    
7679687 gtaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatataattatataacatc 7679751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520092
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttaca-aaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcag--tacataaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaa 20520199  T
127 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataatt 225  Q
    ||||| ||| | |||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||| || | | |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||    
20520198 catctcaaaca-tcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaatcatcttataacaacttcacagattatcatt 20520100  T
226 aacatcat 233  Q
    || |||||    
20520099 aatatcat 20520092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134258
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 81  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcaacataggcagt 22134258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643034
Alignment:
18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagc 94  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||    
24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-tcagtatacaaaaacagc 24643034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071972
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||||||||||    
23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 23071972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791456
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttaca-aaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcag--tacataaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaa 23791389  T
127 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    ||||| ||| ||| |  |||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| || | |||||||||    
23791390 catctcaaacatt-atatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaa 23791456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24642933 - 24642856
Alignment:
101 taataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
24642933 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24642856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25963809 - 25963669
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
25963809 gactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 25963711  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
25963710 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 25963669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 101
Target Start/End: Original strand, 23038048 - 23038116
Alignment:
33 tagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||    
23038048 tagacggactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 23038116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207398
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||    
23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgac 23207394  T
128 atct 131  Q
    ||||    
23207395 atct 23207398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 81
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287432
Alignment:
33 tagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 81  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
23287384 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 23287432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 81
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
33 tagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 81  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
26392403 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786958
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacatagg 77  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacatagg 18786958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22741081 - 22740897
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataata-----atatc 110  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||  |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||| | |     |||||    
22741081 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagtatgacatcacataacgatatc 22740982  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaacatcaaca 196  Q
    |||   ||  ||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
22740981 aataaaaa--caacaacatcttaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacattaaca 22740897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40622327 - 40622123
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacag-catgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||| ||| |||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||  |||||  |||| |||||||||    
40622327 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatga--taattatatcaatt 40622230  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaat-----tatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacag 208  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| || |     ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||    
40622229 -caattcatcaacatcttatgtatacagtacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaaca-caa-acatctcataacag 40622134  T
209 cttcacagatt 219  Q
    |||||||||||    
40622133 cttcacagatt 40622123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413035
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagc--atgacataataatat--caattgcaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  ||||| || ||||||||||||| || |||| ||||  |||| |||| |||||  ||| ||||| ||||||    
22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaaca 22413142  T
126 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataat 224  Q
    |||||| ||    |||   ||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||    
22413141 acatctcaaca--tcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagattaacat 22413044  T
225 taacatcat 233  Q
    ||| |||||    
22413043 taatatcat 22413035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22459587 - 22459500
Alignment:
108 atcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaac 195  Q
    ||||| || |||||| |||||||| |||||||||  ||||  |||||||||| |||||  |||||||||||| ||||  |||||||||    
22459587 atcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaac 22459500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 81
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25108957
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||    
25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagt 25108957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21916192 - 21916071
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| | |||||||  ||| | |||| || ||||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
21916192 gactcatgcaacttagttaaataacaaaaacaacataatcagatcacaacaaaagcataaattcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 21916094  T
139 tcaattatacttcaagtaatgca 161  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
21916093 tcaataatatttcaagtaatgca 21916071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24697644 - 24697512
Alignment:
94 catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 193  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||  ||||  || | |||| ||||||||||||   ||||||||||| || | |||||| |    
24697644 catgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaac-ttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataa 24697546  T
194 acacatcttaaacagcttcacagattataattaa 227  Q
    |  ||| ||| |||||||||||||| || |||||    
24697545 aatcatattatacagcttcacagatcatcattaa 24697512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 78)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509431
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatca 9509288  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9509289 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 9509388  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
9509389 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgctatcc 9509431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12699067
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaa-acagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatc 12698930  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12698931 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 12699030  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
12699031 tcacagattataattaacatcctcattaactcttaat 12699067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456319
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |    
18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaat 18456432  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18456431 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 18456332  T
215 agattataattaa 227  Q
    |||||||||||||    
18456331 agattataattaa 18456319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227715
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 38227579  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||    
38227580 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatatcacatcttaatcaacatcaacatatcttaaatatctt 38227679  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
38227680 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaat 38227715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564254
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 3564383  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 214  Q
    | ||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
3564382 gtaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcat 3564283  T
215 agattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
3564282 aggttataattaacatcatcattaagtct 3564254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212235
Alignment:
12 acatcatcat-cttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 26212094  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
26212095 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataatcaacaacaacacatcttaaacagct 26212194  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
26212195 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 26212235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589273
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatca 10589138  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
10589139 attgcaattcaacaacatcttcaatgttcaaatattcttcaagcaatgcata-aacattatatcacatcataatcagcaacaacacatcttaaatagctt 10589237  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
10589238 cacagattataattaacctcatcattaagtcttaat 10589273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16386132
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||    
16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    ||||| |  ||| |||||||||||||||||||  |    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
16386269 aattgtatttcatcaacatcttaaatattcaaacaattctcaagtaatgcataaaacattatattacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 16386170  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 248  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
16386169 tcacagattatagttaacctcttcattaagtcttaatg 16386132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443624
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaa 40443490  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 212  Q
    || ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||    
40443491 tttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagcttc 40443589  T
213 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
40443590 acagattataattaacctcattgttaagtcttaat 40443624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647491
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatca 13647424  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
13647425 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13647491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213861
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16213782  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
16213783 ccaagtcaacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaacataa-caacatcaa 16213861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273594
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 48273491  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 213  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || | ||| ||||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
48273492 gcaagtcaacaacatc-tcaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 48273580  T
214 cagattataattaa 227  Q
    |||||||| |||||    
48273581 cagattatcattaa 48273594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456483
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 456419  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
456420 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 456483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972658
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11972594  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
11972595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11972658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949122
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14949186  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
14949185 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14949122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15143925
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| | ||| ||||||| || || |||||||||| |||||| ||||||    
15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatct-cagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaa 15144045  T
127 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataatt 225  Q
    ||||| || ||| || | ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |     
15144044 catctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttgacagattatatta 15143945  T
226 aacatcatcattaagtctta 245  Q
    ||||||||||||||||||||    
15143944 aacatcatcattaagtctta 15143925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376713
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15376777  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
15376776 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15376713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232682
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16232618  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
16232619 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16232682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640434
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18640370  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
18640371 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18640434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385123
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20385187  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
20385186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20385123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189595
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21189659  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
21189658 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21189595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125653
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32125589  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
32125590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32125653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523079
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41523015  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
41523016 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41523079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525541
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41525477  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
41525478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41525541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393287
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 11393350  T
116 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
11393349 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11393287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430874
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatataaaaacatcatgacataataatatca 18430807  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
18430808 aatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18430874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702400
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 24702336  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
24702337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24702400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27217022
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 27216958  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
27216959 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 27217022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275320
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 24275273  T
119 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatata 165  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||    
24275274 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 24275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847719
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||| |||||    
27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtgtacaa---cagtatgacataattatatc 27847855  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
27847854 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatcacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 27847756  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||    
27847755 tcacagattatagttaatctcattattaagtcttaat 27847719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280033
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
2280238 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatc 2280142  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagc 209  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||  |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||    
2280141 aaatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagc 2280042  T
210 ttcacagat 218  Q
    |||||||||    
2280041 ttcacagat 2280033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 176
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410219
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16410157  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatca 176  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
16410158 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatca 16410219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116671
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 44116607  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||    
44116608 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcaca 44116671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386495
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaat 3386431  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||    
3386432 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcaca 3386495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932685
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || | |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 14932752  T
116 caa-gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatca 181  Q
    |||  |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
14932751 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 14932685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356120
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || | |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15356187  T
116 caa-gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatca 181  Q
    |||  |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
15356186 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 15356120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360234
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || | |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15360301  T
116 caa-gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatca 181  Q
    |||  |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
15360300 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 15360234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704847
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||   || |||||||||||||||| |    
24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaa---caagacataataatatcaaat 24704783  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
24704784 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24704847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061866
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  || |||| |||||||  |||||||||||||||||||||     
17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactcag-cagtatacaaaat-agcatgacataataatatcaaa 17061980  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 212  Q
    ||||||||| |||| ||| || |||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
17061979 tgcaagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 17061881  T
213 acagattataattaa 227  Q
    |||||| || |||||    
17061880 acagatcattattaa 17061866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110724
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |           |||||||||||||||||||||||||||||| |    
20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcta-----------tacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20110644  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaac 195  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||    
20110645 gcaagtcaataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaac 20110724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869453
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13869444  T
115 gcaagtcaa 123  Q
    |||||||||    
13869445 gcaagtcaa 13869453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898376
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 38898437  T
119 gtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||| |||||||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
38898436 gtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 38898376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831498
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||| |||||||||||||||| || |    
13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca-cggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaat 13831471  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattca 141  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||    
13831472 gcaagtcaacaacgtctcaattattca 13831498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756622
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 130  Q
    |||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |  || | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataacaacagcaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtc 12756719  T
131 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 227  Q
    | || ||||||  || | |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||| |||||||| || |||||    
12756718 tcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcatcacagatcatcattaa 12756622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Original strand, 67745 - 67864
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||||||    
67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 67843  T
111 aattgcaagtcaacaacatct 131  Q
     | ||||| ||||||||||||    
67844 gaatgcaaatcaacaacatct 67864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073033
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | ||||| |||||||| |||| ||||||    
22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
111 aattgcaagtcaacaacatct 131  Q
    || || |||||||||||||||    
22073013 aaatgtaagtcaacaacatct 22073033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486649
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||  |||  | |||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||    
19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 19486767  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 209  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
19486766 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 19486667  T
210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
19486666 ttcacagatcatcattaa 19486649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16219834 - 16219715
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
16219834 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16219736  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||    
16219735 gcaagtcatcaacatcttaaa 16219715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26356083 - 26355983
Alignment:
78 cagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcac 177  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
26356083 cagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 26355984  T
178 a 178  Q
    |    
26355983 a 26355983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26358535 - 26358435
Alignment:
78 cagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcac 177  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
26358535 cagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 26358436  T
178 a 178  Q
    |    
26358435 a 26358435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34200901
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||||||||||    
34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 34200884  T
111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
34200885 gaatgtaaatcaacaac 34200901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505321
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||||||||||    
28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867895
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagc--atgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||  |||| |||| ||||||||| |||| | ||    
1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatcaat-gcaaatgaa 1868004  T
124 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataa 223  Q
    |||||||| ||| || ||  |||| |||| ||||||||||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||||||||| |||||||||||| || |    
1868003 caacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaaaaagcttcacagatcatca 1867905  T
224 ttaacatcat 233  Q
    |||| |||||    
1867904 ttaatatcat 1867895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005772
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |   ||| || ||||| |||| |||||| | |    
18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtat-ggaaatcatcatgatataacaatatcgaat 18005748  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
18005749 gcaaatcaacaacatctcaaatat 18005772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154873
Alignment:
18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagtatgacat 18154873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Original strand, 15211484 - 15211633
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagttt-acaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaata 137  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||||| ||  || ||| |||||||| || ||    
15211484 gactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattca-caacatctcaatta 15211582  T
138 ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaa 188  Q
    |||||| | ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
15211583 ttcaataaaacttcaagcgatgtatacaacattatatcacatcataatcaa 15211633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811129
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 811150  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
    ||||||||  |||||| ||||    
811149 gcaagtcattaacatcataaa 811129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495517
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||||||||||    
16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 16495500  T
111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
16495501 gaatgtaaatcaacaac 16495517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47831930
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | | | | || ||||| |||| ||||||    
47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-atatcatcatgatataacaatatc 47831905  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
47831906 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 47831930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008398
Alignment:
35 gaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||||||||| ||| || |||| |||  ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaat-gcaaatcaacaacacct 15008500  T
132 taaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaacat 230  Q
     ||| || ||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
15008499 caaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagattatcattaatat 15008401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014248
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 44014248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138006
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 17138080  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaaca 190  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||    
17138079 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 17138006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2530208 - 2530129
Alignment:
61 aacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaa 142  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
2530208 aacaacagcaacataggcaacatacaaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaa 2530129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11996078
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagt 11996078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255730
Alignment:
34 agaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacag-catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 131  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||| | ||||   |  ||||| |||| |||||||| || || || |||||||||    
12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
132 taaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
     ||| |||||  |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
12255792 caaacattcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 12255730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754955
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15754955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 189
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187189
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  || | ||||  ||||| ||| |||||    
12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaattacaatcatg--ataattataccaatt 12187116  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaac 189  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||    
12187117 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaac 12187189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056446
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||   ||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    
16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagaca--ttatgcaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 16056440  T
126 acatct 131  Q
    ||||||    
16056441 acatct 16056446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10063939 - 10063740
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| || ||||| | |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||| || | || || || ||||| |||||||||||    
10063939 acatcaacaccttcaacgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaa-catcatgatataataatatc 10063841  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 209  Q
     |   ||||| |||||||||| |||||||||  |||| |||||      ||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
10063840 gaacacaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaa-----acatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 10063746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12321835 - 12321685
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | | |||||||||||||| |||| ||||  ||| | |||| |||||||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
12321835 gactcatgcaacgtagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 12321737  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaac 189  Q
    || || ||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||    
12321736 tccataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaac 12321685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649521
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||| ||||  |||||||    
19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacaatatgacat 19649521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 89
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901401
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaa 89  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||    
12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 12901401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 81
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044816
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagt 14044816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 81
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354846
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagt 14354846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Original strand, 15113031 - 15113125
Alignment:
100 ataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaac 195  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||  ||||  |||||||||  |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
15113031 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa-tattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaac 15113125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Original strand, 15116568 - 15116662
Alignment:
100 ataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaac 195  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||  |||||||||  |||||  |||||||||||| ||||  |||||||||    
15116568 ataacaatatcaattgcaagtcatcaacatc-tcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaac 15116662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26356156 - 26356098
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||||||||| |||||    
26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaaca 26356098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26358608 - 26358550
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||||||||| |||||    
26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaaca 26358550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3705
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 3569  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3570 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 3669  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
3670 catagattataattaacatcctcattaagtcttaat 3705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 343 - 573
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||    
343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatacaaaat-agcatgacgtaataatatca 441  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
442 attggaagtcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 541  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||    
542 catatattataattaacatcctcattaagtct 573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Original strand, 1851 - 2093
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 1950  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
1951 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagctt 2050  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
2051 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcc 2093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 71)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44053071
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 44052928  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
44052929 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatcttaaacagctt 44053028  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44053029 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 44053071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636669
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 22636536  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 213  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
22636537 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatctt-aacagcttca 22636635  T
214 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
22636636 cagattataattaacatcctcgttaagtcttaat 22636669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12902992
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 12902856  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
12902857 attgtaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 12902956  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
12902957 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaat 12902992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7893935
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7893802  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||    
7893803 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcacatcataat---cagcaacacatcttaaacagctt 7893899  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
7893900 cacagattataattaacatcatcgttaagtcttaat 7893935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7089116
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7088976  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||    
7088977 attgcaattcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattagcaacaacacatcttaaacaactt 7089076  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
7089077 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 7089116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239856
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 16239992  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16239991 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatcatatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16239892  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16239891 cgcagattataattaacatcatcattaagtcttaat 16239856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270140
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 16270258  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16270257 aatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16270158  T
212 cacagattataattaaca 229  Q
    ||||||||||||| ||||    
16270157 cacagattataatcaaca 16270140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377413
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |    
16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaat 16377542  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 214  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
16377541 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctccac 16377442  T
215 agattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
16377441 agattataattaacatcatcattaagtct 16377413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 196
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798958
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7798873  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
7798874 attgcaagtcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaaca 7798958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038879
Alignment:
17 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgc 14038752  T
117 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 216  Q
    ||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
14038753 aagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatgttaaacagcttcacag 14038852  T
217 attataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
14038853 attataattaatatcatcattaagtct 14038879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374241
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaa 23374374  T
119 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 218  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
23374373 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacagatcttaaaaagcttcagagat 23374274  T
219 tataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||    
23374273 tatagttaacctcttcattaagtcttaatgcta 23374241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900062
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||  |||||||||||||    
6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatagcataataatatca 6899989  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataa 184  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
6899990 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataa 6900062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873363
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 52873389  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaata 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
52873388 attgcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928829
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaat 44928943  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 213  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| |||| ||||||||    
44928942 gcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacataaaatcatcataaatcagcttca 44928843  T
214 cagattataattaa 227  Q
    ||||| || |||||    
44928842 cagatcatcattaa 44928829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798669
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 54798773  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
54798772 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 54798683  T
214 cagattataattaa 227  Q
    |||||||| |||||    
54798682 cagattatcattaa 54798669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215274
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18215338  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
18215337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18215274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14053188
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || || ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa--cagcatgacataataatatc 14053325  T
111 aattgcaagtcaacaacat-cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 209  Q
    |||| ||| ||| |||||| ||||   || ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||    
14053324 aatttcaattcatcaacattcttatgcatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacggc 14053226  T
210 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
14053225 ttcacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 14053188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12307
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12371  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
12370 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837494
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaat 1837573  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
1837572 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattataa-caacatcaa 1837494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118352
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15118416  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
15118415 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15118352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312672
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 52312608  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
52312609 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 52312672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280518
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 14280414  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | | ||| ||||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
14280415 gcaagtcaacaacatctcaaatatagattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 14280504  T
214 cagattataattaa 227  Q
    |||||||| |||||    
14280505 cagattatcattaa 14280518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 178
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242861
Alignment:
9 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataata 108  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataata 19242791  T
109 tcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
19242792 tcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19242861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618172
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 19618238  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
19618237 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19618172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515169
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaat 3515105  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
3515106 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 3515169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803265
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23803329  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
23803328 gcaaatcaacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 23803265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615450
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 44615386  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
44615387 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44615450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773087
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44773151  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||   ||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
44773150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44773087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222339
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 50222403  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
50222402 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 50222339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046719
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||||   ||||||||| |||||    
17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatagaacaaca---tgacataattatatc 17046583  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||    
17046584 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaacatatcttattcagct 17046682  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
17046683 tcacagattataattaaccttattattaagtcttaat 17046719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239419
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18239483  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
18239482 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 18239419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463868
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 51463932  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
51463931 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 51463868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102425
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44102312  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 213  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| || ||||||  |||| |||| ||||||||    
44102313 gcaagtaaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttca 44102411  T
214 cagattataattaa 227  Q
    ||||| || |||||    
44102412 cagatcatcattaa 44102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355324
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15355385  T
119 gtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
15355384 gtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 15355324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611105
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||| |    
12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca--------acaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12611041  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
12611042 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12611105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970707
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaacag-caatatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 14970773  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||    
14970772 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataattatatcaca 14970707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367905
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15367788  T
112 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 209  Q
    | |||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
15367789 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15367887  T
210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
15367888 ttcacagatcatcattaa 15367905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402918
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15402801  T
112 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 209  Q
    | |||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
15402802 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15402900  T
210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
15402901 ttcacagatcatcattaa 15402918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243099
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |||  ||||| |||| |||||||| || || ||||    
52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-cagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaa 52243204  T
124 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattata 222  Q
    |||||||| ||| |||||  |||| | |||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||     
52243203 caacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcatc 52243104  T
223 attaa 227  Q
    |||||    
52243103 attaa 52243099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 98
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096379
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatga 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641192
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||           |||||||| ||||||||||||||||||| |    
7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca-----------caaaaacaacatgacataataatatcaaat 7641256  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
7641255 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7641192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371417
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15371300  T
112 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 209  Q
    | |||||||||| |||  ||| || ||||||  |||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
15371301 aatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15371399  T
210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
15371400 ttcacagatcatcattaa 15371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373698
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15373581  T
112 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 209  Q
    | |||||||||| |||  ||| || ||||||  |||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
15373582 aatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15373680  T
210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
15373681 ttcacagatcatcattaa 15373698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13790
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    || |||||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
13854 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353999
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  |  |||| |||||||||| |||||||||    
22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaat 22353934  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | ||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
22353935 tacaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22353999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 241
Target Start/End: Original strand, 3096759 - 3096872
Alignment:
127 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 226  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
3096759 catcataaatattcaaatattcttcaagtaatgcata-aacattgtatctcatcataatcagcaacaacacatcttaaacagcttcacatattataatta 3096857  T
227 acatcatcattaagt 241  Q
    || ||||||||||||    
3096858 acctcatcattaagt 3096872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370232
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15370116  T
112 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 209  Q
    | |||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| | | |||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
15370117 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaact-acgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15370214  T
210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
15370215 ttcacagatcatcattaa 15370232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815587
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 130  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |  | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-ctgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtc 21815633  T
131 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatca 176  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
21815632 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatca 21815587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223747
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatct 16223630  T
112 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 209  Q
    | |||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||  ||||||  |||||||||||  |||| ||||||||   |||| |||| ||||    
16223631 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacccatatacaattatatcacaatataa-caacatcacatcatcataaatcagc 16223729  T
210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
16223730 ttcacagatcatcattaa 16223747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 150 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17048055 - 17047958
Alignment:
150 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   || |||||||||||||||    
17048055 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacaggttgtaattagtctcttcattaagtcttaat 17047958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 251
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190701
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa-ca 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| |||||||| || |||  ||||| ||    
6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa-tgtaagcgaacaatca 6190579  T
129 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcata-atcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 227  Q
    ||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||  || | |||||||||||  ||| |||||||    
6190580 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattagatcacatcatacatcaacattaacatctcat-aacagcttcacgaattgtaattaa 6190677  T
228 catcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
     |||||  | ||||||||||||||    
6190678 tatcatattcaagtcttaatgcta 6190701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574844
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 8574888  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 158  Q
    | || |||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
8574887 gtaattcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 8574844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198492
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacag-catgacataataatatcaattgcaagtcaac 124  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | | |||||  |  ||||| ||||  ||||||| ||||||||| |    
43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
125 aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    || |||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 43198492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 20149832 - 20149992
Alignment:
18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||  | ||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 20149930  T
118 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| || | ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
20149931 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 20149992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43256230 - 43256106
Alignment:
61 aacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 159  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||    
43256230 aacaacagcaacataggcagcataccaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatg 43256134  T
160 catataacattatatcacatcataatca 187  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||    
43256133 catataatattatatcacattataatca 43256106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15551887
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 15551887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 196
Target Start/End: Original strand, 15093798 - 15093955
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||| |||| |||||  || | |||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  || ||||||| ||||  ||    
15093798 gactcatgcaacttagttaaagaacaatagcagcatagaaagatcacaacaacagcatgacttcataatatcaatttcatttctacaacatattaatcat 15093897  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 196  Q
    ||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
15093898 tcaataatatattaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaaca 15093955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706286
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||||||    
39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 39706311  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
     | |||||||||  |||||| ||||    
39706310 gaatgcaagtcatgaacatcataaa 39706286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774077
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 12774077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288211
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaa 12288218  T
124 caacatc 130  Q
    |||||||    
12288217 caacatc 12288211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846426
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 8846426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16357045 - 16356905
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||    
16357045 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttccacaacatcttgatcat 16356947  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
16356946 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 16356905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16488171 - 16488023
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||  ||| | |||||| |||||| || | |||||||||||| |   ||||||||||||| |  ||    
16488171 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaaaagcagcataacttcataatatcaatt-cttttcaacaacatcttgatcat 16488073  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatca 187  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||    
16488072 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattataatca 16488023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15121917 - 15121747
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacag-catgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||| ||| |||||||| | || ||||||||| |||||| || |  |||||  |||| |||||||||    
15121917 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatatcagcataggcagattacaacaataatcatga--taattatatcaatt 15121820  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaac 189  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
15121819 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaac 15121747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15464977 - 15464888
Alignment:
87 aaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatca 176  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||| ||||||||  |||||||||    
15464977 aaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattatatca 15464888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16348757 - 16348617
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||    
16348757 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttccacaacatcttgataat 16348659  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
16348658 tcaataatattttaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 16348617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8574836 - 8574784
Alignment:
176 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
8574836 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 8574784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640395
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||  ||||| |||| |||||||| || || |||| |||    
46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataac 46640460  T
128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    |||| ||    |||  |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||    
46640459 atctcaa--catcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaa 46640395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 243
Target Start/End: Original strand, 15091093 - 15091127
Alignment:
209 cttcacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
15091093 cttcacagattataattaacatcttcattaagtct 15091127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Original strand, 15791793 - 15791841
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggca 79  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||    
15791793 cttagaccgactcatgtagtttaattaaaagacaacaacaacataggca 15791841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 81
Target Start/End: Original strand, 17333298 - 17333346
Alignment:
33 tagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
17333298 tagactgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagacagt 17333346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 38761 - 38995
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 38859  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38860 aatgcaaataaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 38959  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38960 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 38995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33158
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 33040  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33041 aatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 33140  T
212 cacagattataattaaca 229  Q
    ||||||||||||| ||||    
33141 cacagattataatcaaca 33158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9912
Alignment:
10 ggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatat 109  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataatat 9842  T
110 caattgcaagtcaacaacatcttaaata-ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||| |||||||||||||| ||| || || ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
9843 caagtgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 9912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360846
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatca 20360982  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
20360981 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 20360882  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
20360881 cacatattataattaacctcatcattaagtcttaat 20360846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287678
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatca 17287818  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
17287817 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatgtcataacataatcaacctcaacacatcttaaacagctt 17287718  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
17287717 cacaggttataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 17287678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20638162
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 20638305  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| | | ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20638304 attgcaatttatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcataaaacgttatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 20638205  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
20638204 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgttatcc 20638162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22780116
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatca 22780249  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
22780248 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22780149  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtctt 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
22780148 cacagattatgattaacatcatcattaagtctt 22780116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29060771
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 29060639  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29060640 aatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatctcatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 29060739  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
29060740 cacagattataattaatatcatcattaagtct 29060771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409704
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaa 18409848  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 212  Q
     |||||||||||||||||| ||  || || | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18409847 atgcaagtcaacaacatctcaatcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 18409748  T
213 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatccta 256  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
18409747 acatattataattaacatcatcattaagtctcaatactacccta 18409704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25629245
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatca 25629377  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25629376 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 25629277  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
25629276 cacagattataattaacaacatcattaagtct 25629245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20594004
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 20593872  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| |||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20593873 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataaatcaagtaatgcgtataacaatatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 20593972  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
20593973 cacagattataattatcattatcattaagtct 20594004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303435
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaggaagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 19303563  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
19303562 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttcaacagctt 19303463  T
212 cacagattataattaacatcatcattaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
19303462 cacagattataattaacatcatcattaa 19303435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496411
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 16496343  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||||||||    
16496344 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcacat 16496411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076863
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac-aaaacagcatgacataataatatca 20076798  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    | |||||   | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
20076799 aatgcaa---atcaacatcttaaaaattcaattatacttcaagtaatgcgtataacattatatcacat 20076863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742479
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12742415  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
12742416 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12742479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334592
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18334656  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
18334655 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18334592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005208
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19005144  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
19005145 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19005208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858919
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19858983  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
19858982 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19858919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782389
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22782325  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||   ||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
22782326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22782389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422709
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24422645  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
24422646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24422709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861956
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33861892  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
33861893 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33861956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864440
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33864376  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
33864377 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33864440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676710
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 30676776  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
30676775 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 30676710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291180
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2291244  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
2291243 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 2291180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055191
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaaa-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8055127  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
8055128 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8055191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754971
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25754907  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
25754908 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 25754971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924640
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 26924704  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
26924703 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26924640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963535
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 34963469  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
34963470 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 34963535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656791
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25656727  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| || ||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||    
25656728 gcaagttaataacgtctcaattattcacatataattcaactaatacatatataattatatcaca 25656791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456930
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18456833  T
131 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 227  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
18456834 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 18456930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 233
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644543
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| |||||||| || |||||| ||    
25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
126 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataat 224  Q
    |||||| ||| |||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||  |||| || | ||||||||||||| || ||    
25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacatcaaatcatcatatatcagcttcacagatcatcat 25644534  T
225 taacatcat 233  Q
    ||| |||||    
25644535 taatatcat 25644543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540911
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaat 1540975  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
1540974 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 1540911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595711
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 1595647  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||    
1595648 gcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcaca 1595711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688664
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 25688600  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||| ||||||  || ||||||||    
25688601 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataatcatatcaca 25688664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920519
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||   || ||||||||||  |||||    
16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatacaa---catcatgacataagtatatc 16920655  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    || | | | ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||    
16920654 aaattccattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataccacatcataatcaacaacaacttatcttattcagct 16920556  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
16920555 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 16920519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852017
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |    
3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaat 3852081  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
3852080 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 3852017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245758
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||    
35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaacaaca---tgacataataatatc 35245682  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatca 187  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
35245683 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatca 35245758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448526
Alignment:
18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16448588  T
118 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
16448587 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 16448526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25603467 - 25603267
Alignment:
50 cttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatact 149  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||  || || || |||||| || |||||||| | |||    
25603467 cttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattc-actacatctcaattattcaataaaact 25603369  T
150 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgc 249  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||| ||    
25603368 tcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttcacagattctattaaacatcgtcattaagtcttaaagc 25603269  T
250 ta 251  Q
    ||    
25603268 ta 25603267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15041644 - 15041441
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| || | ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||    
15041644 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatcttaagtat 15041545  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcatta 238  Q
    ||||| | |  |||||||||||| || |||||| | || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
15041544 tcaataaaatctcaagtaatgcacat-acattaaaccaaatcttaattatcatcaacacatcttaaacagctttacagattgtatctaacatcatcatta 15041446  T
239 agtct 243  Q
     ||||    
15041445 ggtct 15041441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556894
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaat 20556956  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| ||   ||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
20556955 gcaagtcaacaacgtctcaa--tttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20556894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 165
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462028
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18461993  T
131 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatata 165  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||    
18461994 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 18462028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831737
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||  |||   ||||||||| |||||    
22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcactgttcaacgaca---tgacataatcatatc 22831599  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaat--attcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 208  Q
    || | ||| ||| |||||||||| ||  || |||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||    
22831600 aaattcaattcatcaacatcttagatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcag 22831698  T
209 cttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||    
22831699 cttcacagattatagttaacctcattctcaagtcttaat 22831737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19847949
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  |||||||  |||||| |||||||||    
19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaat 19848015  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaata-ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
19848014 tgcaattcaacaatatcttaaatatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 19847949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821782
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa-cat 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||| |||    
18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatcaa-cgcaagccaacaatcat 18821849  T
130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcat-aatcaacatcaaca 196  Q
    || || |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
18821848 ctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataaatcaacattaaca 18821782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109322
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||| | |||| ||||||    
20109140 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatc 20109236  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatat--aacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||| |||||||||    
20109237 aaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 20109322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25611805 - 25611605
Alignment:
50 cttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatact 149  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||  || || || |||||| || |||||||| | |||    
25611805 cttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattc-actacatctcaattattcaataaaact 25611707  T
150 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgc 249  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| |||||||||| ||| ||    
25611706 tcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttcatagattctgttaaacatcgtcattaagtcctaaagc 25611607  T
250 ta 251  Q
    ||    
25611606 ta 25611605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992578
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 23992528  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 166  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
23992529 tgcaatt---caacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 23992578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227416
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||  |||  | ||||||| |||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||    
8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 8227534  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 209  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
8227533 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 8227434  T
210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
8227433 ttcacagatcatcattaa 8227416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333269
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 27333269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27394009
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 27394009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714478
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27416011 - 27415887
Alignment:
61 aacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaatta-tacttcaagtaatg 159  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||| || | ||| | ||||||    
27416011 aacaacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatcttgagtattcaaataattctt-aggtaatg 27415915  T
160 catataacattatatcacatcataatca 187  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||    
27415914 cataaaacattatatcacattataatca 27415887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 247
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185737
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||   |||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||| || |||    
11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatgtgcagtgtac---aacaacatgacataattatatcaaattcaattcatcagcat 11185620  T
130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaaca 229  Q
    |||   ||| |||  || |||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||  || ||||||||||||   |||||     
11185621 cttttgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aactttataacacttcataatcagcaacaacatatcttattcatcttcacagattacggttaacc 11185719  T
230 tcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||  |||||||||||||    
11185720 tcactattaagtcttaat 11185737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496477
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||||||||||    
28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28496494  T
111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
28496493 gaatgtaaatcaacaac 28496477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808888
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||||||||||    
29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 29808905  T
111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
29808904 gaatgtaaatcaacaac 29808888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019525
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||| | ||||| || ||||| |||| ||||||    
23019408 acatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatc 23019504  T
111 aattgcaagtcaacaacatct 131  Q
    || ||||||||||||||||||    
23019505 aaatgcaagtcaacaacatct 23019525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652313
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19652297  T
115 gcaagtcaacaacatct 131  Q
    |||| ||||||||||||    
19652298 gcaa-tcaacaacatct 19652313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 185
Target Start/End: Original strand, 18907134 - 18907280
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||  ||| | |||| |||||||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
18907134 gactcatgcagcttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 18907232  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataat 185  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||    
18907233 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataat 18907280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 161
Target Start/End: Original strand, 21766718 - 21766839
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| ||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
21766718 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagatcacaacaacaacataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 21766816  T
139 tcaattatacttcaagtaatgca 161  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
21766817 tcaataatatttcaagtaatgca 21766839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561356
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 1561356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873205
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||    
19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 19873205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 22432249 - 22432334
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
22432249 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcataggcagtttacaacaacagtatgacat 22432334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 22438799 - 22438884
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
22438799 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcataggcagtttacaacaacagtatgacat 22438884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098565
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagt 9098565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668491
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| | | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgc-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 19668484  T
124 caacatc 130  Q
    |||||||    
19668485 caacatc 19668491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863063
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||| || |||||| ||||| |||||||    
19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggaagattacaacaacagtatgacat 19863063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 81
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443116
Alignment:
33 tagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 81  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
33443068 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 33443116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080799
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaa 59  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25642304 - 25642120
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataata-----atatc 110  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||  |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||| | |     |||||    
25642304 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagtatgacatcacataacgatatc 25642205  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaacatcaaca 196  Q
    |||   ||  ||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
25642204 aataaaaa--caacaacatcttaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacattaaca 25642120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 4185930 - 4185872
Alignment:
24 tcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagt 81  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
4185930 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagt 4185872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5834436 - 5834388
Alignment:
194 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
5834436 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtc 5834388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16965341 - 16965210
Alignment:
102 aataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatct 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||  |||||  |||  |||  |||||||||  ||||||  |||| || |||| ||||||||||  |||    
16965341 aataatatcaattacaattcaatagcatcttaaaccttcaacaatatctcacataatgcataatacattaattcacttcttaataaacatcaacatgtct 16965242  T
202 taaacagcttcacagattataattaacatcatc 234  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||    
16965241 taaacagctt-acagattgtatttaacatcatc 16965210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 242
Target Start/End: Original strand, 20177096 - 20177144
Alignment:
194 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
20177096 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtc 20177144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22158895 - 22158847
Alignment:
194 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
22158895 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtc 22158847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 179
Target Start/End: Original strand, 18180596 - 18180656
Alignment:
120 tcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
18180596 tcaacaacatcttaatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 18180656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23113
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacac-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22984  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
22985 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 23084  T
215 agattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
23085 agattataaataacatcatcattaagtct 23113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8424
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca---gcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatca 8555  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
8554 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 8455  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtc 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
8454 cacagattataattaacatcctcattaagtc 8424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 6000
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaaca---taggcagtttacaaaaacagcatgacataataata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
109 tcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 208  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6145 tcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 6046  T
209 cttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6045 cttcacattttataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 6000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50210103
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 50210234  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 212  Q
     |||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50210233 atgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 50210134  T
213 acagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
50210133 acagattataattaacatcatcattaagtct 50210103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250611
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 27250751  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
27250750 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 27250651  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||    
27250650 cacagattataattaacctcttcattaagtatcaatgcta 27250611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34510011
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaat 34509882  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
34509883 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcaa 34509982  T
215 agattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
34509983 agattataattaacatcatcattaagtct 34510011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532500
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcc 22532368  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22532369 attgcaattcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22532468  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||    
22532469 cacagttcataaataacatcatcattaagtct 22532500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21026919
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||  ||||||    
21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatca 21026779  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
21026780 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacagcaacacatcttaaacagctt 21026879  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
21026880 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 21026919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135420
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||     
20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatcat 20135287  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 212  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
20135288 gtgcaattcaacaacatcttaagtattcaataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatcatatcataatgaacatcaacacatcttaaacagcttc 20135387  T
213 acagattataattaacatcatcattaagtctta 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
20135388 acagattataattaacaacatcattaggtctta 20135420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468604
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaa 22468717  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 212  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
22468716 ttgcaattcaacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcacatcataat-tacatcagcacatcttaaacagcttc 22468618  T
213 acagattataatta 226  Q
    ||||||||||||||    
22468617 acagattataatta 22468604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 89 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354458
Alignment:
89 aacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaa 188  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 22354517  T
189 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
22354516 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22354458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593719
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23593799  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
23593798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 23593719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13989028
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13988964  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
13988965 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13989028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923291
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21923355  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
21923354 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21923291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 124 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22356184 - 22356053
Alignment:
124 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaa-catcaacacatcttaaacagcttcacagattata 222  Q
    ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
22356184 caacatcataaatattcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattata 22356085  T
223 attaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
22356084 attaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 22356053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 124 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22357870 - 22357739
Alignment:
124 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaa-catcaacacatcttaaacagcttcacagattata 222  Q
    ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
22357870 caacatcataaatattcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattata 22357771  T
223 attaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
22357770 attaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 22357739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574842
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacca 45574909  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||||||||| ||| || |||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
45574908 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45574842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433222
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |    
433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg---gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaat 433108  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 213  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||| |    
433109 gcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttta 433208  T
214 cagattataattaa 227  Q
    ||||| || |||||    
433209 cagatcatcattaa 433222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475087
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21475151  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
21475150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21475087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612475
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31612411  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
31612412 gcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 31612475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801277
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||   ||||| |||||||| |||||    
38801508 acatcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa---cagcaagacataattatatc 38801413  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    || | ||| ||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||    
38801412 aaattcaattcatcaacatattatatatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcgtaatcaacaacaacatatcttattcagct 38801314  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||    
38801313 tcacaaattatagttaatctcattattaagtcttaat 38801277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840929
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 21840864  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
21840865 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 21840929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298298
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaat 29298234  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
29298235 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29298298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776850
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |    
29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaat 29776786  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
29776787 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29776850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362095
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  |||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-cagtatataaaaacaacatgacataataatatcaa 16362013  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||   ||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
16362014 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 16362095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275363
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 16275428  T
115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||  || | ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
16275427 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacataaaattcaattaatgcatataccattatatcaca 16275363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212821
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 13212929  T
112 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 209  Q
    | |||||||||| |||| ||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| || |    
13212928 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcaac 13212830  T
210 ttcacagat 218  Q
    |||||||||    
13212829 ttcacagat 13212821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 215
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347161
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21347059  T
115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 212  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
21347060 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 21347158  T
213 aca 215  Q
    |||    
21347159 aca 21347161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847175
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||    
20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatca 20847176  T
112 a 112  Q
    |    
20847175 a 20847175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 215
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342296
Alignment:
9 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataata 108  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataata 21342188  T
109 tcaattgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-c 206  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |    
21342189 tcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattacatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatc 21342287  T
207 agcttcaca 215  Q
    |||||||||    
21342288 agcttcaca 21342296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123067
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||     
22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacacaa-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||  | || |||||||||||||||||  |||||||||||    
22123131 tgcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22123067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707329
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |   ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21707265  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  ||||  ||| ||||||| ||||  |||||||||||    
21707266 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcaca 21707329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711871
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |   ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21711807  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  ||||  ||| ||||||| ||||  |||||||||||    
21711808 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcaca 21711871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 48603652 - 48603730
Alignment:
150 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48603652 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 48603730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21788136 - 21787979
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | |||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||    
21788136 gactcatgcaacttagttaaataaccatagcagcataggcagatcacaacaacagcatgacttcgtaatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcat 21788037  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 196  Q
    ||||| |||  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
21788036 tcaataatatcttaagtaatgcacataacattatataacatcataatcaacatcaaca 21787979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896195
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    || ||| |||||  |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
21896259 ctcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 21896195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861510
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 193  Q
    || ||| |||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
21861573 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860064
Alignment:
9 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataata 108  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataata 15860079  T
109 tcaattgcaagtcaa 123  Q
    | || ||||||||||    
15860078 ttaaatgcaagtcaa 15860064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389317
Alignment:
18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 40389255  T
118 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| || | ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
40389256 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 40389317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 33797570 - 33797694
Alignment:
61 aacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 159  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||    
33797570 aacaacagcaacatatgcagcatacaaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatg 33797666  T
160 catataacattatatcacatcataatca 187  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||    
33797667 cataaaacattatatcacattataatca 33797694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 233
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758872
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| |||  ||||| |||| |||||||| | |||  |||    
16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaa 16758762  T
124 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattata 222  Q
    |||||||   || |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||| ||     
16758763 caacatc-acaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatattataacagcttcacagatcatc 16758861  T
223 attaacatcat 233  Q
    ||||| |||||    
16758862 attaatatcat 16758872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454606
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Original strand, 33681011 - 33681188
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
33681011 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 33681109  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
33681110 gcaagtcgtcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 33681188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35260992
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||   |    
35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca---t 35261085  T
130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattat 221  Q
    || ||| |||||   ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||| || | |||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||    
35261084 ctcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacaacttcacatattat 35260992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714631
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||    
21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 21714631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921864
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22921888  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
22921887 gcaaatcaacaacatctcaaatat 22921864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Original strand, 21754052 - 21754163
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||||| ||||    
21754052 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgca 21754150  T
118 agtcaacaacatct 131  Q
    | ||||||||||||    
21754151 a-tcaacaacatct 21754163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Original strand, 22237631 - 22237753
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
22237631 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22237729  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
22237730 gcaagtcatcaacatctcaaatat 22237753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50614055
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttaca-aaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcag--tacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 50614122  T
127 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    ||||| ||| | ||  ||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||    
50614121 catctcaaaca-tcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaa 50614055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621883
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttaca-aaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcag--tacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 50621950  T
127 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    ||||| ||| | ||  ||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||    
50621949 catctcaaaca-tcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaa 50621883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295557
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||| || ||||| |||||||||||    
14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 14295574  T
111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
14295573 gaatgtaaatcaacaac 14295557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248394
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 20248381  T
115 gcaagtcaacaac 127  Q
    |||| ||||||||    
20248382 gcaaatcaacaac 20248394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918719
Alignment:
28 caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | | ||| || ||||| ||||||||||| | || || |||||||    
20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 20918718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049990
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||| || |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
129 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    ||| ||    |||  |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||    
41050038 tctcaa--catcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacat 41049990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52928021
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagt 52928021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18182214 - 18182093
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||  ||| | |||| |||||||| || | ||||||||||||  |  ||||||||||||| |  ||    
18182214 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaatt-tatttcaacaacatcttgatcat 18182116  T
139 tcaattatacttcaagtaatgca 161  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
18182115 tcaataatatttcaagtaatgca 18182093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 42865330 - 42865245
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||| |||||||    
42865330 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcaacatatgcagattgcaacaacagtatgacat 42865245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20847161 - 20847101
Alignment:
192 caacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||    
20847161 caacacatctttaaacagcttcatagattatggttaacctcttcattaagtcttaatgcta 20847101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Original strand, 21477653 - 21477732
Alignment:
149 ttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 227  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
21477653 ttcaagtaatgcgtatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 21477732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368338
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcag 16368338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 3041
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 3173  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
3172 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 3073  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
3072 cacaggttataattaacatcatcattaagtct 3041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26134
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||    
25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatca 25994  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
25995 aatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 26094  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
26095 cacagattataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 26134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 39858 - 40096
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||    
39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatca 39956  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
39957 aatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 40056  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
40057 cacaaattataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 40096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8710
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatca 8578  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
8579 attgcaagtcaacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgcacataacatta----acatcataatcaacatcaacacatcctaaacagctt 8674  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
8675 cacagattgtaattaacatcatcattaagtcttaat 8710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39707
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||     
39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 39577  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39578 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 39677  T
214 cagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||    
39678 tagattataattaacatcattattaagtct 39707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 75105
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||     
75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 75235  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
75234 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 75135  T
214 cagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||    
75134 tagattataattaacatcattattaagtct 75105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 931
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatca 1070  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
1069 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagctt 971  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
970 caaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 4508 - 4738
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 4606  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4607 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 4706  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
4707 cacagattataattaacatcatcattaagtct 4738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12320
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 12188  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12189 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 12288  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
12289 cacagattataattaacatcatcattaagtct 12320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22272
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 22140  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22141 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22240  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
22241 cacagattataattaacatcatcattaagtct 22272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40143
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 40011  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
40012 aatgcatgtcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcataaagagctt 40111  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
40112 cacagattataattaacatcatcattaagtct 40143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18749 - 18597
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||||| || || | |||||||||||| |   ||||||||||||| |  ||    
18749 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagaataacttcataatatcaatt-cgtttcaacaacatcttgatcat 18651  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaacat 191  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |  ||| ||||| ||||||| |||||||||||    
18650 tcaataatatttcaagtaatggaattaatcattaaatcacattataatcaacat 18597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19885
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| || |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 19889  T
128 atct 131  Q
    ||||    
19888 atct 19885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24180
Alignment:
30 acttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
129 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataa-tcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataattcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 24207  T
228 catcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||    
24206 catcctcaataagtcttaatactatcc 24180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 17105
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaa--cagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatc 17238  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    || |||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
17237 aaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacgtcttaaacagct 17138  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
17137 ttacagattataattaacatcatgattaagtct 17105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79235
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-gacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtc 79332  T
131 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 227  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||| ||| || |||||    
79331 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcactgatcatcattaa 79235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 25955
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 26080  T
119 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 218  Q
     |||||||| ||| || ||| || | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
26079 ttcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagat 25980  T
219 tataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
25979 tataattaacatcatcattaagtct 25955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44682
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44726  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
44725 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 44682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33479 - 33385
Alignment:
149 ttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
33479 ttcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcataggttataattaacatcatcattaagtct 33385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16490
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 16622  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | || ||||||||| ||||| || ||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
16621 aatggaagtcaacagcatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16522  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
16521 cacagactataattaacatcatcattaagtct 16490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 4849 - 5088
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 4948  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
4949 aatgcaattcaacaacatcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 5048  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    |||||||||||  ||||  | ||||||||||||| |||||    
5049 cacagattatagctaaccccttcattaagtcttattgcta 5088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 64 - 242
Target Start/End: Original strand, 13144 - 13322
Alignment:
64 aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcata 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
13144 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcaca 13243  T
164 taacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
13244 taacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacagattataattaacatcttcattaagtc 13322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34199
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaa 87  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa 34199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Original strand, 273 - 329
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacag 68  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacag 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21146
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||    
20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
21010 aattgcaattcaacaacatcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcagcatcaacacatcttaaacagct 21109  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
21110 tcacaggttataattaacatcttcattaagtcttaat 21146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3103
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 3207  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 212  Q
     || || |||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3206 atgtaattcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 3107  T
213 acag 216  Q
    ||||    
3106 acag 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339840
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |    
340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-caacaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaat 339968  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 214  Q
     |||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
339967 -caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 339869  T
215 agattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
339868 agattataattaacgtcatcattaagtct 339840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158450
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 158514  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
158513 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 158450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 71350 - 71474
Alignment:
61 aacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaatta-tacttcaagtaatg 159  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||| || | ||| | ||||||    
71350 aacaacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatcttgagtattcaaataattctt-aggtaatg 71446  T
160 catataacattatatcacatcataatca 187  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||    
71447 cataaaacattatatcacattataatca 71474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32299
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||||||||||    
32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag--taaacaaacaacatgacataataatatca 32164  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||    
32165 atttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 32263  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
32264 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 32299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32863
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 32979  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca-catcttaaacagct 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  | ||| ||||    
32978 attgcaattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatcagcatca--taaaatagct 32882  T
211 tcacagattataattaaca 229  Q
    ||||||||||||| |||||    
32881 tcacagattataactaaca 32863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46142
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 46026  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca-catcttaaacagct 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  | ||| ||||    
46027 attgcaattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatcagcatca--taaaatagct 46123  T
211 tcacagattataattaaca 229  Q
    ||||||||||||| |||||    
46124 tcacagattataactaaca 46142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16323
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||    
16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatca 16212  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 210  Q
    | |||||| ||||| ||||| || ||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||    
16213 aatgcaagccaacatcatctcaagtatacattcataactcaagtaatgcatataacattatatcacgtcatgatcaacatca--acatcttaaaacagct 16310  T
211 tcacagattataa 223  Q
    |||||||||||||    
16311 tcacagattataa 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17389
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2187
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||    
1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatca 2051  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||    
2052 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacattatatctcatcataatcaacaacaacatatcatatacagctt 2151  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
     ||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||    
2152 tacatattattaataaccttatcattaagtcttaat 2187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4946
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||    
4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatca 4811  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||  ||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
4812 attgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacaactt 4910  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
4911 cacagattatacttaacctcattgttaagtcttaat 4946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 247
Target Start/End: Original strand, 1 - 170
Alignment:
77 gcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatca 176  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||| ||||||  ||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
1 gcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatcaattgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcata-aacattatatca 99  T
177 catcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
100 catcataatcaacaacaacatatcttatacaacttcacagattatacttaacctcattgttaagtcttaat 170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13730
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||    
13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacatgataatatca 13595  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||| | | ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||    
13596 atttcgattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 13694  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
13695 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 13730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15351
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 15486  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||  |||  || ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
15485 atttcaattcatcaacatcttatgtataaaaatattcttcaagtaatgcata-aatattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 15387  T
212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
15386 cacagattataattaaccttattattaagtcttaat 15351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 189
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7465
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| | ||||  ||||| ||| ||| |    
7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattata-caaat 7391  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaac 189  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||    
7392 tcaattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaac 7465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10312
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||    
10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatc 10448  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||    
10447 aatttcaattcaacaacatcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacgacatatcttatacagct 10349  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
10348 tcacagattataattaaccttattattaagtcttaat 10312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 254
Target Start/End: Original strand, 124675 - 124827
Alignment:
102 aataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatct 201  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
124675 aataatatcaattgcaattcatcaacgttttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatct 124774  T
202 taaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
124775 taaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgctatcc 124827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174943
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| || ||||||    
174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatca 174863  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatat-aacattatatcacatcataatcaaca 190  Q
    | | ||| |||||||||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| ||||||    
174864 aattcaattcaacaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaactaaacattatatcacgtcatattcaaca 174943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136370
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||| |||||||||||  |||||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 136373  T
128 atc 130  Q
    |||    
136372 atc 136370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 145078
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||| |||||||||||  |||||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 145081  T
128 atc 130  Q
    |||    
145080 atc 145078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3424
Alignment:
75 aggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatat 174  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacattatat 3489  T
175 cacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatcatcatta 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
3488 cacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcatagattataattaacatcatcatta 3424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 93 - 243
Target Start/End: Original strand, 27911 - 28061
Alignment:
93 gcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatc 192  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatc 28010  T
193 aacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
28011 aacaaatcttaaacaacttcacaggttataattaacatcatcattaagtct 28061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 46
Target Start/End: Original strand, 27878 - 27911
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatg 46  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
27878 catcatcatcttcataaacttagaccgactcatg 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47202
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||    
46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtttac---agcagcatgacataataatatc 47091  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||    
47092 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattctccaagtaatgcata-aacattatatcacatcataaacatcaacaacatatcttatacagct 47190  T
211 tcacagattata 222  Q
    ||||||||||||    
47191 tcacagattata 47202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16514
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||    
16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 16378  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    || | ||| ||| |||||| |||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
16379 aaattcaattcatcaacatattatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 16477  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
16478 tcacagattatagttaacctcattattaagtcttaat 16514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 142
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28544
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 28513  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaa 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
28514 attgcaattcaacaacatcttatatattcaa 28544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11407
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||||||||||    
11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 11390  T
111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
11391 gaatgtaaatcaacaac 11407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2112
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | | ||| || ||||| |||||||||||    
1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 2095  T
111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
2096 gaatgtaaatcaacaac 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4605
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 243
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4754
Alignment:
33 tagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatctt 132  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| | ||||| || || |||||||||| |  || |||||||||||||    
4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatctt 4644  T
133 aaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatc 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
4645 aaatattcatttatacttcaagtaatgcataatacattatatcacatcatgatcaacatca--acatcttaaaacagcctcacaaattataattaacatc 4742  T
232 atcattaagtct 243  Q
     ||| |||||||    
4743 ttcaataagtct 4754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20909
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20845  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
20846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37983
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 37919  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
37920 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 37983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141780
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 141716  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
141717 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 141780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136842
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 136778  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
136779 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 136842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139311
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 139247  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
139248 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 139311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144249
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 144185  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
144186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 144249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134373
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 134309  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
134310 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 134373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 138
Target Start/End: Original strand, 62200 - 62321
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||  ||||||||||| |    
62200 atcatcatcatcttcgacttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat-gaaaaacatcatggtataataatatcga 62298  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
     ||||   ||||||||||| ||||||    
62299 atgca---caacaacatctcaaatat 62321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 75
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132722
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacata 75  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacata 132722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94573
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 94509  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
94510 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 94573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17440
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 17500  T
119 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
17499 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 17440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44614
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaa-acagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44552  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatc 175  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
44553 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatatc 44614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100501
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| ||||||||||| | |    
100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaat 100476  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatatt 139  Q
    |||| |||||||||||| |||||||    
100477 gcaaatcaacaacatctcaaatatt 100501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38394
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||| ||| | |||| |||| |||||| |  |||||||||||     
38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcatagacagatcacaacaacaacatgacttcttaatatcaattt 38497  T
116 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 215  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||    
38496 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcaca 38398  T
216 gatt 219  Q
    ||||    
38397 gatt 38394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119945
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 119945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40169
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||   | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 40193  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
40192 gcaaatcaacaacatctcaaatat 40169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23695 - 23581
Alignment:
104 taatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta 203  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |     
23695 taatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaacatttcat- 23597  T
204 aacagcttcacagatt 219  Q
    ||||||||||||||||    
23596 aacagcttcacagatt 23581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101569
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagt 101569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 938
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||| |||||   || ||||||||||| |||||    
1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatacaa---catcatgacataattatatc 1074  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||    
1073 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatattttatacagct 975  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||    
974 tcacagattatagttaacctcattcttaagacttaat 938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1521
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||| |||||    
1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtac---aacatcatgacataattatatc 1385  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
1386 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 1484  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
1485 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7498
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||   |||| ||||| ||||| |||||    
7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacaacatgaaataattatatc 7362  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
7363 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 7461  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
7462 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4856
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 4792  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
4793 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13554
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13490  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
13491 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 13554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14109
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14045  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
14046 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82234
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 82170  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
82171 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 82234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22610
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||    
22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22678  T
126 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    |||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
22677 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 22610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1006 - 853
Alignment:
89 aacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaa 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |    
1006 aacagcatggcataataatatcaat-gcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcga 908  T
189 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||    
907 catcaacacatcttaaacagcttcacatatcataaatagcatcaccattaagtct 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4888
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggc 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16995
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16882  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 213  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| || ||||||  |||| |||| ||||||||    
16883 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttca 16981  T
214 cagattataattaa 227  Q
    ||||| || |||||    
16982 cagatcatcattaa 16995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10935
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 10870  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
10871 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 10935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Original strand, 6669 - 6845
Alignment:
71 acataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacatt 170  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||| ||    
6669 acataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacgtt 6768  T
171 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||    
6769 atatcacatcataatcaacaacaacatatcatatacagctttacagattataaataaccttatcattaaatcttaat 6845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128917
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |   |    | ||||||||||||||||||||||||||    
128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaacaaaaaaaaaaaa-aaaaacagcatgacataataatatca 128849  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
128850 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacat 128917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20328
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacat-cagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 20427  T
131 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaaca 229  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||  ||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||||    
20426 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa--aacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaaca 20329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 65915 - 65830
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||  ||| ||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||    
65915 catcatcttgatcatcttttacctactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 65830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501246
Alignment:
19 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 501186  T
119 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
501187 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 501246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85539
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 85644  T
115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 212  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
85643 gcaagtcaatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 85545  T
213 acagat 218  Q
    ||||||    
85544 acagat 85539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160809
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||||| |    
160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 160786  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||| |||||||||| | ||||||    
160787 gcaa-tcaacaacatgtcaaatat 160809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11450
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 11384  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
11385 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 189
Target Start/End: Original strand, 12763 - 12933
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacag-catgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||| | ||||||| |||||||| | || ||||||||| | |||| ||||  |||||  |||| ||| |||||    
12763 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttcaataacaataacagcataggcagatcacaacaacaatcatga--taattataccaatt 12860  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaac 189  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
12861 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaac 12933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4459
Alignment:
18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 4398  T
118 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||| ||| || || |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
4399 aatcaacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 6402 - 6281
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||  ||| | |||| |||| ||| || | |||||||||||| ||  |||||||| |||| |  ||    
6402 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacatcataacttcataatatcaatt-catttcaacaacttcttgatcat 6304  T
139 tcaattatacttcaagtaatgca 161  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
6303 tcaataatatttcaagtaatgca 6281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40562
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaat 40498  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  || | |||||||||||||||||  |||||||||||    
40499 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 40562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 51582 - 51814
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||| ||| |    
51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattataac 51678  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||  |||||    
51679 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatatccttcaagaaatgcata-aacattataacacttcatattcaacaacaacatatcttattcagct 51777  T
211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||| ||||| |||   ||||||||||||    
51778 tcacagattatagttaacctcactcttaagtcttaat 51814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12249
Alignment:
13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaa 12315  T
113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  | || |||||||||||||||||  |||||||||||    
12314 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9404
Alignment:
14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||| |||||||||||||||||||     
9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaa 9339  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
9340 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 9404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 106 - 268
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 204  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
205 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8650
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||    
8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 8579  T
126 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatat--aacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    |||||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||| |||||||||    
8580 acatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6661
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||||||    
6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6633  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
6634 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 6661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 177
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29720
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaataatagcatgacataataatatcaattg 29657  T
116 caa-gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcac 177  Q
    |||  ||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||    
29658 caatttcaacaagactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcac 29720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30094
Alignment:
29 aacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacg 30044  T
129 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||| || ||||||  |||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||    
30045 tctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatatcaca 30094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4377
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaat 4312  T
115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
4313 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 4377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12220
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||      |||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa------cagcaacacag-cagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaat 12156  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
12157 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116571
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatac-aaaacagcatgacataatcatatcaaat 116527  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
116528 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128909
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
129 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    ||| ||| | |||  |||| |||| |||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||    
128973 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 128909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 227
Target Start/End: Original strand, 116579 - 116631
Alignment:
176 acatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 227  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||    
116579 acatcataatcaacattaacatatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 116631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 218
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13336
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
130 cttaaat-attcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagat 218  Q
    || |||  |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
13246 ctgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 13336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16014
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||| |||||||| || || ||||||    
16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 16108  T
126 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagat 218  Q
    |||||| ||| ||||   |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
16107 acatctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 16014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11442
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 11465  T
112 attgcaagtcaacaacatcttaa 134  Q
    ||| ||| ||| |||||| ||||    
11464 atttcaattcatcaacatgttaa 11442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11399
Alignment:
196 acatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
11450 acatgttaatcagcttcacagattataattaacctcatcattaagtcttaat 11399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 247
Target Start/End: Original strand, 1052 - 1149
Alignment:
150 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
1052 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacatcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17932
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | | || || || ||||| |||||||||||    
18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaa-catcatgatataataatatc 18050  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 209  Q
     |  |||||| |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
18049 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 17950  T
210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
17949 ttcacagatcatcattaa 17932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2088
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2193  T
115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 212  Q
    |||||||||  ||| ||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
2192 gcaagtcaattaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 2094  T
213 acagat 218  Q
    ||||||    
2093 acagat 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27663
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||||||||| ||| | ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||||||    
27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 27757  T
126 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagat 218  Q
    |||||| ||| |||||  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
27756 acatctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 27663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 171 - 247
Target Start/End: Original strand, 3640 - 3716
Alignment:
171 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
3640 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 3716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 171 - 247
Target Start/End: Original strand, 7704 - 7780
Alignment:
171 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
7704 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 7780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161049
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |    
161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaat 161154  T
115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 212  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||  |||| ||| |||||  |||| |||| |||||||    
161153 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caatatcaaatcatcataaatcagcttc 161055  T
213 acagat 218  Q
    ||||||    
161054 acagat 161049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164550
Alignment:
95 atgacataataatatcaattgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 193  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||    
164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatca 164576  T
194 acacatcttaaa-cagcttcacagat 218  Q
    |  |||| |||| |||||||||||||    
164575 aatcatcataaatcagcttcacagat 164550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 5017
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| | | |||   |||| ||||||||||| |||||||     
5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatac---aacatcatgacataattatatcaaa 5150  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 213  Q
    | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || |||  ||| ||||    
5149 ttcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaacatattttattcagtttca 5051  T
214 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    || |||||||||||| | || ||||| |||||||    
5050 catattataattaaccttattattaaatcttaat 5017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1280
Alignment:
18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 1342  T
118 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| || | ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
1341 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 1280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51766
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa-ca 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatcaa-tgcaagccaacaatca 51888  T
129 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcat-aatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 227  Q
    ||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |  || | |||||||||||| ||| |||||||    
51887 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataaatcaacattaatatctcat-aacagcttcacaaattgtaattaa 51790  T
228 catcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
     |||||  | ||||||||||||||    
51789 tatcatattcaagtcttaatgcta 51766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32654
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||||| |||| ||||||    
32538 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatc 32634  T
111 aattgcaagtcaacaacatct 131  Q
    || ||||| ||||||||||||    
32635 aaatgcaa-tcaacaacatct 32654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12749
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    || ||||| | |  |||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
12686 ctcaaatacttatatataattc-agtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 12749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53488
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 53553  T
130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    || |||||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
53552 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 53488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38641
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| || ||||| |||| ||||||||     
38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 38722  T
114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||| |  |||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
38721 tgcaagtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 38641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11646
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||    
11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 11562  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
11563 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 11646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38195
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||    
38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 38279  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
38278 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 38195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 243
Target Start/End: Original strand, 10323 - 10394
Alignment:
172 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
10323 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattattattaacatcattattaagtct 10394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60614
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagc--atgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| |||  ||||||||| |||| ||||||||    
60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagctcatgatataccaatatcaat-gcaaatcaacaac 60721  T
128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataatta 226  Q
    |||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
60720 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaatcattttataacagcttcacagattatcatta 60621  T
227 acatcat 233  Q
    | |||||    
60620 atatcat 60614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Original strand, 129917 - 130086
Alignment:
24 tcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |||||||||    
129917 tcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 130015  T
123 acaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
     |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| ||||  ||| |||||||||    
130016 tcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaa 130086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 23843 - 24048
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| || ||| ||||      
23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaccataggcagattacaacaacagtatgacatcat-ataacaatat 23941  T
116 caagt----caacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 211  Q
    ||| |    || |||||||| ||  ||||| | ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||| ||||||||    
23942 caaataaaacagcaacatctcaatcattcattcatagttcaagtaatgaaattaacattatatcacatcatattcaacactaacatctctt-aacagctt 24040  T
212 cacagatt 219  Q
    ||||||||    
24041 cacagatt 24048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15486 - 15362
Alignment:
61 aacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 159  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||    
15486 aacaacatcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatg 15390  T
160 catataacattatatcacatcataatca 187  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||    
15389 cataaaacattatatcacattataatca 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16442 - 16264
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||  | |||| |||| |||||| | ||||||||||||  |  |||||||||||||||  ||    
16442 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcatatcacaacaacatcatgacttcataatatcaatta-atttcaacaacatcttaatcat 16344  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagatt 219  Q
    ||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||||||    
16343 tcaataatatcttaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcacagatt 16264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19390
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19366  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
19367 gcaaatcaacaacatctcaaatat 19390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 181
Target Start/End: Original strand, 29117 - 29262
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa-gtcaacaacatcttaa--a 135  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| || | |||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||  |    
29117 gactcatgcatcttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattgcaattttaacaacaccttaaata 29216  T
136 tattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatca 181  Q
    |||||||| | |||||||||||| || | |||||||||||||||||    
29217 tattcaataaaacttcaagtaatacacacaacattatatcacatca 29262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7998
Alignment:
33 tagaccgactcatgtagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtttacaaaaacagc--atgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||||| | ||||  ||||  |||| ||||||||||||| || || ||||||||||    
8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaat-cagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacat 8063  T
130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
8062 cttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaa 7998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10481
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||    
10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10549  T
126 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    |||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
10548 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 10481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4921 - 4741
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||| | ||||||||||||| || |||| ||||||||| | |||| |||||| |||| | ||||||||||||     
4921 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataataatagcagcataggcagatcacaacaacagcttgacttcataatatcaattt 4822  T
116 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 196  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
4821 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatatacataacgttatatcacatcatattcaacattaaca 4741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2801
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||||| |    
2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 2825  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
2824 gcaaatcaacaacatctcaaatat 2801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14692
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||| ||| ||||||| | |    
14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcag-taagaaaatcatcatgatatagtaatatcgaat 14716  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
14715 gcaaatcaacaacatctcaaatat 14692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 127
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15776
Alignment:
15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||| |     
15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccatcatgatataataatatcgaa 15762  T
114 tgcaagtcaacaac 127  Q
    || || ||||||||    
15763 tgtaaatcaacaac 15776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 1339 - 1424
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | |||  |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||    
1339 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttgtttaagtaacaatagcaacataggcagattacaacaacattatgacat 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17929 - 17873
Alignment:
191 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
17929 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 17873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6121
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||||||    
6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6146  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
     | |||||||||  |||||| ||||    
6145 gaatgcaagtcattaacatcataaa 6121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Original strand, 133 - 310
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 231  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| | || |||| |||||||||    
232 gcaaatcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaa 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 138
Target Start/End: Original strand, 5655 - 5769
Alignment:
24 tcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  |||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||    
5655 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtat-gaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca 5753  T
123 acaacatcttaaatat 138  Q
    ||||||||| ||||||    
5754 acaacatctcaaatat 5769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 194
Target Start/End: Original strand, 225482 - 225588
Alignment:
87 aaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatc 186  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |    
225482 aaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaac 225580  T
187 aacatcaa 194  Q
    ||||||||    
225581 aacatcaa 225588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6681
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 6681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14061
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 14061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 26828 - 27027
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||| || |||| |||| | ||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| | ||||  ||||| |||||||||    
26828 catcattttaatcatcttatatcgactcatgcatcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattatatcaatt 26925  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttca 213  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
26926 -caattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaaca-caa-acatctcataacagcttca 27021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 24000 - 23934
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
24000 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 23934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15828
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 15828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 79
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178961
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggca 79  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggca 178961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 138
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1158
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||||| | | | ||| ||||||    
1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacat 1149  T
130 cttaaatat 138  Q
    || ||||||    
1150 ctcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1075
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||||||||||    
1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1092  T
111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
1091 gaatgtaaatcaacaac 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45732
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 45811  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    | |||||| |||||||| || || ||||  ||| |||| || ||| |||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
45810 gtaagtcatcaacatctcaatta-tcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 45732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 1089
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacatagg 77  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagg 1089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21721
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 21823  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttca 213  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
21822 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcttaatcaaca-caa-acatctcataacagcttca 21727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29613
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 29715  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttca 213  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
29714 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcttaatcaaca-caa-acatctcataacagcttca 29619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2696
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagt 2696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Original strand, 1881 - 2045
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 1978  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcata 183  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
1979 -caattcatcaacatcttatgtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcata 2045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Original strand, 12766 - 12889
Alignment:
12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | | | ||| || ||||| |||| ||||||    
12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 12864  T
111 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
12865 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 12889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 252
Target Start/End: Original strand, 20595 - 20643
Alignment:
204 aacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
20595 aacagcttcacagattatagttaacatcatcattaagtcttaatgctat 20643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28820
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataaca--acagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagt 28820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 135
Target Start/End: Original strand, 12943 - 13062
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||||| |||| |||||| | |    
12943 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcagcatgatataacaatatcgaat 13041  T
115 gcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
    |||||||| ||||||| ||||    
13042 gcaagtcatcaacatcataaa 13062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 193070 - 192920
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcag-tttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaata 137  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||||| ||  || || ||||||||| || ||    
193070 gactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattc-acaacatctcaatta 192972  T
138 ttcaattatacttcaagtaatgca-tataacattatatcacatcataatcaa 188  Q
    |||||| | ||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||||||    
192971 ttcaataaaacttcaagtgatgtattacaacattatatcacaccataatcaa 192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1152
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 1152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36539
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || | ||||||||  |||||| ||||  |||||||    
36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagtagcataggcaaattacaacaacaatatgacat 36539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25321
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||    
25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacgatatcaa-tgcaaatcaa 25218  T
124 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattata 222  Q
    |||||||| ||| | |||  |||| |||| |||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||     
25219 caacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattatta-caacatcaaatcgtcttataacagcttcacagatcatc 25316  T
223 attaa 227  Q
    |||||    
25317 attaa 25321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Original strand, 1853 - 1993
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
1853 gactcatgcaacttagttaaataacaatggcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 1951  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
1952 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 1993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Original strand, 9536 - 9675
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| | |||||||  ||| | |||  |||||||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
9536 gactcatgcaacttagttaaataacaataacaacataatcagatcacatcaacagcataac-tcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 9633  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
9634 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 9675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69879
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||    
69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 69879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1257 - 1169
Alignment:
103 ataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacat 191  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
1257 ataatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaaataatgcacataacattatatcacatcatattcaacat 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 162
Target Start/End: Original strand, 920 - 1042
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
920 gactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 1018  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcat 162  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||    
1019 tcaataatatttcaagtaatgcat 1042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 8075
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||  ||||| |||| |||||||| | ||| ||||    
8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaac-cagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaa 8082  T
124 caacatc 130  Q
    |||||||    
8081 caacatc 8075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 46820 - 46670
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||| |||| ||||||||| | |||| || ||||| || | |||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||    
46820 gactcatgcaacttagttacataacaatagcagcataggcagatcacaacaatagcataacttcataatatcaatt-catttccacaacatcttgatcat 46722  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaac 189  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||    
46721 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaac 46670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 81
Target Start/End: Original strand, 6824 - 6882
Alignment:
24 tcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagt 81  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
6824 tcatcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagt 6882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 131
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8134
Alignment:
87 aaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 131  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
8090 aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatct 8134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20065
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||| || | ||||||||| |||||| ||||| |||||||    
19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaatagtagcataggcagattacaacaacagtatgacat 20065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 165
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38470
Alignment:
35 gaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| || | |||||||| ||||| ||||||||||||    
38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatct 38437  T
132 taaatattcaattatacttcaagtaatgcatata 165  Q
     ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||    
38438 caaaca-tcatatataattcatgtaatgcatata 38470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Original strand, 44104 - 44244
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||    
44104 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttccacaacatcttgataat 44202  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
44203 tcaataatattttaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 44244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10646
Alignment:
27 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||    
10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10640  T
126 acatct 131  Q
    ||||||    
10641 acatct 10646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97188
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttaca-aaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagt--acataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 97121  T
127 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    ||||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||  | |||||||||| || | |||||||||    
97122 catctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 97188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106466
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttaca-aaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagt--acataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 106399  T
127 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 194  Q
    ||||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||  | |||||||||| || | |||||||||    
106400 catctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 106466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6237
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| || | |||||||| ||||| ||||||||    
6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    |||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||    
6287 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacat 6237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10567
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaa 88  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcaacataggcagattacaaa 10567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17205 - 17054
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtc-aacaacatcttaaata 137  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||  ||| | |||  |||||||| || | |||||||||||| ||  || ||||||||||| || |    
17205 gactcatggaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcataacttcataatatcaatt-catttccaacaacatcttgaaca 17107  T
138 ttcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaac 189  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||    
17106 ttcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaac 17054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32197
Alignment:
16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||| | ||||| || ||||| |||| ||||||    
32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatc 32197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 187
Target Start/End: Original strand, 416 - 564
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||  ||| | |||| | |||||| || | |||||||||||| |   ||||| ||||||| |  ||    
416 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacagcagcataacttcataatatcaatt-cttttcaacgacatcttgatcat 514  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatca 187  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||    
515 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattataatca 564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 13092 - 13157
Alignment:
100 ataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatata 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || ||||||||||||||    
13092 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattgaagtaatgcatata 13157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206576
Alignment:
33 tagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 81  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
206624 tagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 206576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 130
Target Start/End: Original strand, 569 - 669
Alignment:
31 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcata-taaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaac 666  T
128 atc 130  Q
    |||    
667 atc 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Original strand, 15111 - 15259
Alignment:
40 actcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatatt 139  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | || ||||  ||| | || || ||||||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  |||    
15111 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcac-aacacagcataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcatt 15208  T
140 caattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaac 189  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||    
15209 caataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaac 15259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6508 - 6368
Alignment:
39 gactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||| | | |||||||||||||| |||| |||||| || | |||| || ||||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
6508 gactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcataggaagatcacaacaatagcataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 6410  T
139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||| ||| ||||| |||||||    
6409 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacat 6368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University