View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0754_low_40 (Length: 273)

Name: NF0754_low_40
Description: NF0754
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0754_low_40
NF0754_low_40
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (1-226)||(17206709-17206934)
chr3 (94-234)||(17206792-17206941)
chr3 (1-136)||(24545318-24545450)
chr3 (94-226)||(24545319-24545457)
chr3 (1-136)||(24556982-24557114)
chr3 (100-225)||(54331647-54331772)
chr3 (94-219)||(24553925-24554047)
chr3 (94-226)||(24556975-24557113)
chr3 (18-136)||(24549311-24549429)
chr3 (34-136)||(17206708-17206810)
chr3 (126-226)||(24549328-24549428)
chr3 (1-105)||(12860445-12860549)
chr3 (77-226)||(12860421-12860580)
chr3 (34-124)||(24553953-24554043)
chr3 (37-134)||(54331675-54331772)
chr3 (1-68)||(17206676-17206743)
chr3 (131-196)||(11191224-11191289)
chr3 (40-105)||(11191224-11191289)
chr3 (40-105)||(16180651-16180716)
chr3 (131-196)||(16180651-16180716)
chr3 (185-225)||(17668990-17669030)
chr3 (191-250)||(54331647-54331706)
chr3 (94-134)||(17668990-17669030)
chr3 (1-38)||(24545316-24545353)
chr3 (1-38)||(24557079-24557116)
chr3 (188-226)||(17259404-17259442)
chr3 (1-34)||(17668990-17669023)
chr3 (1-38)||(24549394-24549431)
chr3 (7-48)||(54331745-54331786)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (1-226)||(9744324-9744549)
chr7 (93-250)||(9744316-9744482)
chr7 (1-136)||(15577226-15577362)
chr7 (1-136)||(20253913-20254049)
chr7 (34-136)||(9744448-9744550)
chr7 (79-226)||(15577202-15577361)
chr7 (94-226)||(20253906-20254048)
chr7 (1-67)||(9744515-9744581)
chr7 (185-226)||(15138868-15138909)
chr7 (42-105)||(13134264-13134327)
chr7 (133-196)||(13134264-13134327)
chr7 (94-136)||(15138867-15138909)
chr7 (185-226)||(8136321-8136362)
chr7 (185-226)||(22001478-22001519)
chr7 (1-40)||(15138863-15138902)
chr7 (94-136)||(8136321-8136363)
chr7 (94-136)||(22001478-22001520)
chr7 (216-260)||(48217917-48217961)
chr7 (1-40)||(8136328-8136367)
chr7 (1-40)||(22001485-22001524)
chr7 (1-68)||(48217884-48217951)
chr7 (1-40)||(48809704-48809743)
chr7 (192-226)||(48809704-48809738)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-263)||(39422-39702)
scaffold0011 (94-226)||(39568-39709)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (1-196)||(44891226-44891421)
chr1 (1-136)||(17904324-17904459)
chr1 (94-250)||(44891263-44891428)
chr1 (93-263)||(17904316-17904504)
chr1 (1-136)||(24721088-24721224)
chr1 (79-226)||(24721066-24721223)
chr1 (1-136)||(45473819-45473955)
chr1 (86-226)||(45473820-45473970)
chr1 (1-68)||(17904424-17904491)
chr1 (135-195)||(6832986-6833047)
chr1 (57-104)||(6832986-6833033)
chr1 (184-226)||(7322183-7322225)
chr1 (184-226)||(51323123-51323165)
chr1 (145-177)||(14239064-14239096)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (1-226)||(18820286-18820520)
chr8 (1-226)||(22473078-22473313)
chr8 (94-227)||(18820279-18820421)
chr8 (1-136)||(2718035-2718171)
chr8 (79-226)||(22473179-22473335)
chr8 (79-196)||(36406252-36406369)
chr8 (1-136)||(36733839-36733975)
chr8 (79-226)||(36733817-36733974)
chr8 (1-136)||(22473077-22473213)
chr8 (94-226)||(2718028-2718170)
chr8 (170-250)||(36406252-36406332)
chr8 (131-226)||(6574350-6574446)
chr8 (34-105)||(36406298-36406369)
chr8 (40-136)||(6574350-6574447)
chr8 (10-63)||(4382052-4382105)
chr8 (185-226)||(20025484-20025525)
chr8 (94-136)||(20025484-20025526)
chr8 (1-40)||(20025491-20025530)
chr8 (1-47)||(18820486-18820532)
chr8 (184-226)||(22319186-22319228)
chr8 (131-196)||(12800274-12800339)
chr8 (40-105)||(12800274-12800339)
chr8 (222-263)||(22343799-22343840)
chr8 (222-263)||(22355459-22355500)
chr8 (145-177)||(16414120-16414152)
chr8 (145-177)||(32121123-32121155)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (94-263)||(26444516-26444685)
chr4 (1-256)||(35659300-35659558)
chr4 (94-263)||(46739803-46739972)
chr4 (1-226)||(12622034-12622268)
chr4 (79-226)||(12622135-12622290)
chr4 (34-159)||(26444529-26444654)
chr4 (34-159)||(46739816-46739941)
chr4 (79-226)||(19567190-19567336)
chr4 (94-226)||(35659424-35659565)
chr4 (1-136)||(12622033-12622169)
chr4 (1-136)||(16027339-16027475)
chr4 (79-226)||(16027317-16027474)
chr4 (35-136)||(19567235-19567337)
chr4 (170-250)||(19567190-19567268)
chr4 (184-227)||(14629511-14629554)
chr4 (54-105)||(44024856-44024907)
chr4 (145-196)||(44024856-44024907)
chr4 (79-136)||(46225736-46225794)
chr4 (170-226)||(46225736-46225793)
chr4 (131-196)||(14629058-14629124)
chr4 (40-105)||(14629058-14629124)
chr4 (93-135)||(14629512-14629554)
chr4 (145-177)||(3484485-3484517)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (94-263)||(6551873-6552054)
chr5 (1-159)||(6551880-6552041)
chr5 (94-211)||(6551756-6551873)
chr5 (1-132)||(26646342-26646473)
chr5 (34-120)||(6551787-6551873)
chr5 (127-223)||(26646342-26646438)
chr5 (1-136)||(12354819-12354958)
chr5 (1-105)||(14027116-14027219)
chr5 (79-226)||(12354820-12354980)
chr5 (79-196)||(14027094-14027219)
chr5 (131-226)||(8834459-8834555)
chr5 (185-250)||(6551756-6551821)
chr5 (170-226)||(14027094-14027150)
chr5 (40-136)||(8834459-8834556)
chr5 (131-226)||(8505011-8505107)
chr5 (40-136)||(8505011-8505108)
chr5 (97-136)||(29914068-29914107)
chr5 (188-226)||(29914069-29914107)
chr5 (188-225)||(26646440-26646477)
chr5 (1-44)||(26646330-26646373)
chr5 (1-40)||(29914064-29914103)
chr5 (184-226)||(12354144-12354186)
[»] scaffold1256 (5 HSPs)
scaffold1256 (34-225)||(581-781)
scaffold1256 (97-226)||(553-682)
scaffold1256 (1-134)||(648-781)
scaffold1256 (188-250)||(553-615)
scaffold1256 (7-68)||(754-815)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (34-226)||(1385017-1385218)
chr2 (99-263)||(21336977-21337150)
chr2 (94-226)||(1384986-1385118)
chr2 (7-136)||(1385090-1385219)
chr2 (99-263)||(21316987-21317160)
chr2 (34-136)||(21337003-21337105)
chr2 (34-136)||(21317013-21317115)
chr2 (1-89)||(21367509-21367598)
chr2 (1-68)||(1385184-1385251)
chr2 (185-250)||(1384986-1385051)
chr2 (1-69)||(21337070-21337138)
chr2 (1-68)||(21317080-21317147)
chr2 (130-178)||(21367511-21367559)
chr2 (54-105)||(10744580-10744631)
chr2 (145-196)||(10744580-10744631)
chr2 (185-226)||(21367563-21367605)
chr2 (184-226)||(25140684-25140726)
chr2 (133-174)||(25140044-25140085)
chr2 (184-220)||(10744191-10744227)
chr2 (145-177)||(32215770-32215802)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (54-226)||(23498332-23498516)
chr6 (54-212)||(23492734-23492904)
chr6 (94-226)||(22555844-22555976)
chr6 (94-226)||(19958167-19958308)
chr6 (1-136)||(23498379-23498517)
chr6 (1-136)||(19958174-19958309)
chr6 (1-121)||(23492781-23492904)
chr6 (34-136)||(22555843-22555945)
chr6 (145-222)||(23492734-23492811)
chr6 (185-250)||(22555911-22555976)
chr6 (15-67)||(18400984-18401036)
chr6 (1-48)||(19958274-19958321)
chr6 (1-49)||(23498482-23498530)
chr6 (1-68)||(22555811-22555878)
chr6 (185-226)||(23500515-23500556)
chr6 (1-40)||(23500510-23500549)
chr6 (94-136)||(23500514-23500556)
chr6 (145-177)||(23991898-23991930)
chr6 (145-177)||(34962761-34962793)
[»] scaffold0063 (4 HSPs)
scaffold0063 (94-259)||(61374-61548)
scaffold0063 (34-136)||(61415-61517)
scaffold0063 (1-68)||(61383-61450)
scaffold0063 (184-226)||(72865-72907)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (94-258)||(19099-19263)
scaffold0231 (34-158)||(19130-19254)
[»] scaffold0108 (3 HSPs)
scaffold0108 (1-136)||(8188-8323)
scaffold0108 (94-226)||(8181-8322)
scaffold0108 (1-68)||(8288-8355)
[»] scaffold0628 (3 HSPs)
scaffold0628 (1-136)||(4814-4950)
scaffold0628 (94-263)||(4807-4995)
scaffold0628 (1-68)||(4915-4982)
[»] scaffold0453 (3 HSPs)
scaffold0453 (149-263)||(6012-6135)
scaffold0453 (58-136)||(6012-6090)
scaffold0453 (1-68)||(6055-6122)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (1-136)||(17821-17957)
scaffold0213 (79-226)||(17822-17979)
[»] scaffold0121 (2 HSPs)
scaffold0121 (79-136)||(18942-19000)
scaffold0121 (170-226)||(18943-19000)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (146-226)||(3103-3184)
scaffold0439 (55-136)||(3102-3184)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (131-226)||(25240-25336)
scaffold0017 (40-136)||(25239-25336)
[»] scaffold1186 (2 HSPs)
scaffold1186 (184-227)||(396-439)
scaffold1186 (93-135)||(397-439)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (184-227)||(187829-187872)
scaffold0005 (93-135)||(187829-187871)
scaffold0005 (40-105)||(188259-188325)
scaffold0005 (131-196)||(188259-188325)
[»] scaffold0113 (3 HSPs)
scaffold0113 (131-195)||(33544-33608)
scaffold0113 (40-104)||(33544-33608)
scaffold0113 (184-226)||(33933-33975)
[»] scaffold1223 (1 HSPs)
scaffold1223 (184-227)||(405-448)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (184-226)||(66298-66340)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (185-226)||(3470-3511)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (145-177)||(4090-4122)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (145-177)||(18433-18465)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17206934 - 17206709
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17206934 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatg 17206835  T
Q  101 tgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagtatc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17206834 tgaagtatcaatattattaattgttgttgtttatgtgaagcatggtgaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggagctatgtgaagtatc 17206735  T
Q  201 aatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17206734 aatattatttattgttgttgtttatg 17206709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17206941 - 17206792
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt---------gaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttgg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17206941 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttgg 17206842  T
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgagaagcat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17206841 aactatgtgaagtatcaatattattaattgttgttgtttatgtgaagcat 17206792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24545450 - 24545318
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24545450 tgaagtatcaatattatttattg---ttgtttatgttgtttatatgaagcattgttaatgatgatttgaagttgatttatgatttatagttggaactatg 24545354  T
Q  101 tgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24545353 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgt 24545318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24545457 - 24545319
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgtt------gtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaac 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24545457 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgtttatgttgtttatatgaagcattgttaatgatgatttgaagttgatttatgatttatagttggaac 24545358  T
Q  188 tatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24545357 tatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 24545319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 24556982 - 24557114
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24556982 tgaagtatcaatattatttactg---ttgtttatgttgtttatatgaagcattgttaatgacgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatg 24557078  T
Q  101 tgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24557079 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgt 24557114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 54331647 - 54331772
Alignment:
Q  100 gtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagtat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  ||    
T  54331647 gtgaagtatcaatattatttattgttgctgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgaatgatgatttatagttggaactatgcgaatgat 54331746  T
Q  200 caatattatttattgttgttgtttat 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  54331747 caatattatttatcgttgttgtttat 54331772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 94 - 219
Target Start/End: Original strand, 24553925 - 24554047
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24553925 aactatgtgaagtatcaatattatttactgt---tgtttatatgaagcattgttaatgacgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatgtg 24554021  T
Q  194 aagtatcaatattatttattgttgtt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24554022 aagtatcaatattatttattgttgtt 24554047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 94 - 226
Target Start/End: Original strand, 24556975 - 24557113
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgtt------gtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaac 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||      |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24556975 aactatgtgaagtatcaatattatttactgttgtttatgttgtttatatgaagcattgttaatgacgatttgaagttgattgatgatttatagttggaac 24557074  T
Q  188 tatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24557075 tatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 24557113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 136
Target Start/End: Original strand, 24549311 - 24549429
Alignment:
Q  18 ttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattat 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24549311 ttattgttgttgtttatgttgtttatatgaagcattgttaatgacgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatgtgaattatcaatattat 24549410  T
Q  118 ttattgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  24549411 ttattgttgttgtttatgt 24549429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17206810 - 17206708
Alignment:
Q  34 tgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgttta 133  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17206810 tgttgtttatgtgaagcatggtgaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggagctatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgttta 17206711  T
Q  134 tgt 136  Q
    |||    
T  17206710 tgt 17206708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 126 - 226
Target Start/End: Original strand, 24549328 - 24549428
Alignment:
Q  126 gttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttat 225  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24549328 gttgtttatatgaagcattgttaatgacgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatgtgaattatcaatattatttattgttgttgtttat 24549427  T
Q  226 g 226  Q
    |    
T  24549428 g 24549428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 12860445 - 12860549
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12860445 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttatttatgcgaaacattgttgatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttgaaattatg 12860544  T
Q  101 tgaag 105  Q
    |||||    
T  12860545 tgaag 12860549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 226
Target Start/End: Original strand, 12860421 - 12860580
Alignment:
Q  77 tgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt---------gaagcatggttaatgatgatttgaagttgat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         ||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12860421 tgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttatttatgcgaaacattgttgatgatgatttgaagttgat 12860520  T
Q  168 tgatgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattatt-tattgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||||    
T  12860521 tgatgatttatagttgaaattatgtgaagcattaacattgttaaattgttgttgtttatg 12860580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 24553953 - 24554043
Alignment:
Q  34 tgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgt 124  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24553953 tgttgtttatatgaagcattgttaatgacgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgt 24554043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 134
Target Start/End: Original strand, 54331675 - 54331772
Alignment:
Q  37 tgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttat 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||||||||    
T  54331675 tgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgaatgatgatttatagttggaactatgcgaatgatcaatattatttatcgttgttgtttat 54331772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 17206743 - 17206676
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttg 68  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  17206743 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttgatgttgatttg 17206676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11191289 - 11191224
Alignment:
Q  131 ttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaag 196  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  11191289 ttatgtgaaccattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtatagttggaattatgtgaag 11191224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11191289 - 11191224
Alignment:
Q  40 ttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaag 105  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11191289 ttatgtgaaccattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtatagttggaattatgtgaag 11191224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 105
Target Start/End: Original strand, 16180651 - 16180716
Alignment:
Q  40 ttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaag 105  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16180651 ttatgtgaaccattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtatagttggaattatgtgaag 16180716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 196
Target Start/End: Original strand, 16180651 - 16180716
Alignment:
Q  131 ttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaag 196  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  16180651 ttatgtgaaccattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtatagttggaattatgtgaag 16180716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17669030 - 17668990
Alignment:
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17669030 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttat 17668990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 250
Target Start/End: Original strand, 54331647 - 54331706
Alignment:
Q  191 gtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  54331647 gtgaagtatcaatattatttattgttgctgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttg 54331706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17669030 - 17668990
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17669030 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttat 17668990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 24545353 - 24545316
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttg 38  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24545353 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttg 24545316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 24557079 - 24557116
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttg 38  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24557079 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttg 24557116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 226
Target Start/End: Original strand, 17259404 - 17259442
Alignment:
Q  188 tatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17259404 tatgtgaagtatcaatattatttaatgttgttttttatg 17259442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 17669023 - 17668990
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttat 34  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17669023 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttat 17668990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 24549394 - 24549431
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttg 38  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24549394 tgaattatcaatattatttattgttgttgtttatgttg 24549431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 48
Target Start/End: Original strand, 54331745 - 54331786
Alignment:
Q  7 atcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaa 48  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  54331745 atcaatattatttatcgttgttgtttatattgtttatgtgaa 54331786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 9744324 - 9744549
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9744324 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcatgactaatgatgatttgaagttgattaatgatttatagttggaactatg 9744423  T
Q  101 tgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagtatc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  9744424 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgtgaagcattgctaatgatgatttgaagttaaatgatgatttatagttggaactatgtgaaggatc 9744523  T
Q  201 aatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  9744524 aatattatttatcgttgttgtttatg 9744549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 250
Target Start/End: Original strand, 9744316 - 9744482
Alignment:
Q  93 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttg---------tttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9744316 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcatgactaatgatgatttgaagttgattaatgatttatagttg 9744415  T
Q  184 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||    
T  9744416 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgtgaagcattgctaatgatgatttg 9744482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 15577226 - 15577362
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| || ||||    
T  15577226 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttaaagttaattgatgatttatagttgaaattatg 15577325  T
Q  101 tgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  15577326 tgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatgt 15577362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 20253913 - 20254049
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20253913 tgaattatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttacgtgaatcattgttgatgatgatttgaagttgattgatgatttatagtttgaattatg 20254012  T
Q  101 tgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||| | || || ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  20254013 tgaggcattaacattgtttaattgttgttgtttatgt 20254049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 136
Target Start/End: Original strand, 9744448 - 9744550
Alignment:
Q  34 tgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgttta 133  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  9744448 tgttgtttatgtgaagcattgctaatgatgatttgaagttaaatgatgatttatagttggaactatgtgaaggatcaatattatttatcgttgttgttta 9744547  T
Q  134 tgt 136  Q
    |||    
T  9744548 tgt 9744550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 15577202 - 15577361
Alignment:
Q  79 atgatttatagttggaactatgtg--aagtatcaatattatttattgtcgttg---------tttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgat 167  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  15577202 atgatttctagttggaattatgtgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttaaagttaat 15577301  T
Q  168 tgatgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  15577302 tgatgatttatagttgaaattatgtgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatg 15577361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 226
Target Start/End: Original strand, 20253906 - 20254048
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt---------gaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttgg 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||         ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20253906 aactatgtgaattatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttacgtgaatcattgttgatgatgatttgaagttgattgatgatttatagtttg 20254005  T
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    || ||||||| | || || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  20254006 aattatgtgaggcattaacattgtttaattgttgttgtttatg 20254048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 9744515 - 9744581
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgattt 67  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  9744515 tgaaggatcaatattatttatcgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttgatgatgattt 9744581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15138909 - 15138868
Alignment:
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15138909 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 15138868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 105
Target Start/End: Original strand, 13134264 - 13134327
Alignment:
Q  42 atgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaag 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13134264 atgtgaaccattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtatagttggaattatgtgaag 13134327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 196
Target Start/End: Original strand, 13134264 - 13134327
Alignment:
Q  133 atgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaag 196  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  13134264 atgtgaaccattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtatagttggaattatgtgaag 13134327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15138909 - 15138867
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15138909 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgt 15138867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 226
Target Start/End: Original strand, 8136321 - 8136362
Alignment:
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8136321 aactatgtgaagtattaatattatttattgttgttgtttatg 8136362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 226
Target Start/End: Original strand, 22001478 - 22001519
Alignment:
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22001478 aactatgtgaagtataaatattatttattgttgttgtttatg 22001519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 15138902 - 15138863
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15138902 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtt 15138863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 136
Target Start/End: Original strand, 8136321 - 8136363
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8136321 aactatgtgaagtattaatattatttattgttgttgtttatgt 8136363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 136
Target Start/End: Original strand, 22001478 - 22001520
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22001478 aactatgtgaagtataaatattatttattgttgttgtttatgt 22001520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 48217917 - 48217961
Alignment:
Q  216 tgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttgttgttgttct 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  48217917 tgttgtttatgtgaagcattgttgttgatgatttgttgttgttct 48217961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 8136328 - 8136367
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtt 40  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8136328 tgaagtattaatattatttattgttgttgtttatgttgtt 8136367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 22001485 - 22001524
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtt 40  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22001485 tgaagtataaatattatttattgttgttgtttatgttgtt 22001524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 48217884 - 48217951
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttg 68  Q
    ||||| || ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  48217884 tgaaggataaatattatttatcattgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttgttgatgatttg 48217951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 48809704 - 48809743
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtt 40  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  48809704 tgaagtatcaatattatttaatgttgttgtttatgttgtt 48809743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 226
Target Start/End: Original strand, 48809704 - 48809738
Alignment:
Q  192 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48809704 tgaagtatcaatattatttaatgttgttgtttatg 48809738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39702 - 39422
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39702 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattggtaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatg 39603  T
Q  101 tgaagtatcaatattatttattgtcgttgttt---------atgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||         ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  39602 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgaagatttgaagttgattgatgatttatagttggaactata 39503  T
Q  192 tgaagtatcaatattatttattgt---------tgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttgttgttgttctgtg 263  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||         ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  39502 tgaaggatcaatattatttatcgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttgatgatgatttgttgttgttttgtg 39422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39709 - 39568
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgttt---------atgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttgg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||         ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39709 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattggtaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttgg 39610  T
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39609 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 39568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 44891421 - 44891226
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44891421 tgaagcatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatg 44891322  T
Q  101 tgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  44891321 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgtggaccattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtatagttggaattatgtgaag 44891226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 17904324 - 17904459
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17904324 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgttaatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagtcgattgatgatttatagttggaactatg 17904423  T
Q  101 tgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17904424 tgaagtttcaatattatttattgttggtgtttatgt 17904459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 44891428 - 44891263
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt---------gaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttgg 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||         ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44891428 aactatgtgaagcatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttgg 44891329  T
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||||    
T  44891328 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgtggaccattgttaatgatgatttg 44891263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Original strand, 17904316 - 17904504
Alignment:
Q  93 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt---------gaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17904316 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgttaatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagtcgattgatgatttatagttg 17904415  T
Q  184 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgt---------tgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttgttgttgttctgtg 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||         ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17904416 gaactatgtgaagtttcaatattatttattgttggtgtttatgttgtttatgtgaagcattgttgatgatgatttgttgatgttctgtg 17904504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 24721088 - 24721224
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24721088 tgaagtatcaatattatttattgttgttatttatgttgtttatgtgaagcattattaatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttagaattatg 24721187  T
Q  101 tgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  24721188 tgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatgt 24721224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 24721066 - 24721223
Alignment:
Q  79 atgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgtt---------gtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattg 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||         |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  24721066 atgatttatagttggaattatgtgaagtatcaatattatttattgttgttatttatgttgtttatgtgaagcattattaatgatgatttgaagttaattg 24721165  T
Q  170 atgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  24721166 atgatttatagttagaattatgtgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatg 24721223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 45473955 - 45473819
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45473955 tgaaatatcaatattatttattgttgttgattatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgattcaaagttaattgatgatttatagttggaattatg 45473856  T
Q  101 tgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  45473855 tgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatgt 45473819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 45473970 - 45473820
Alignment:
Q  86 atagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttg---------tttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgattt 176  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  45473970 atagttggaattatgtgaaatatcaatattatttattgttgttgattatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgattcaaagttaattgatgattt 45473871  T
Q  177 attgttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    || ||||||| ||||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  45473870 atagttggaattatgtgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatg 45473820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 17904424 - 17904491
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttg 68  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  17904424 tgaagtttcaatattatttattgttggtgtttatgttgtttatgtgaagcattgttgatgatgatttg 17904491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6833047 - 6832986
Alignment:
Q  135 gtgaagcatggttaa-tgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaa 195  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6833047 gtgaagcattgttaaatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttggaattatgtgaa 6832986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 6833033 - 6832986
Alignment:
Q  57 aatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaa 104  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6833033 aatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttggaattatgtgaa 6832986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Original strand, 7322183 - 7322225
Alignment:
Q  184 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  7322183 gaactatgtgaagtattaatattattaattgttgtggtttatg 7322225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 51323165 - 51323123
Alignment:
Q  184 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  51323165 gaactatgtgaagtattaatgttattaattgttgttgtttatg 51323123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 177
Target Start/End: Original strand, 14239064 - 14239096
Alignment:
Q  145 gttaatgatgatttgaagttgattgatgattta 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14239064 gttaatgatgattagaagttgattgatgattta 14239096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 18820286 - 18820520
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18820286 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatacgaagcatggttaatgatgatttaaagttgattgatgaattatagttggaactatg 18820385  T
Q  101 tgaagtatcaatattatttattgtcgt---------tgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||         |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  18820386 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgatgtttatgtgaagcattgttaatgatgattttaagttgattgatgatttacagttggaacaatg 18820485  T
Q  192 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18820486 tgaaggatcaatattatttatcgttgttgtttatg 18820520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22473313 - 22473078
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22473313 tgaagtatcaatattttttatttttgttgtttatgttgttcatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttggaattatg 22473214  T
Q  101 tgaagtatcaatattatttattgtcgttgttt---------atgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatg 191  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||         ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22473213 tgaagtatcaatattttttatttttgttgtttatgttgttcatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttggaattatg 22473114  T
Q  192 tgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    ||||  || || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  22473113 tgaaacattaacattgtttaattgttgttgtttatg 22473078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 227
Target Start/End: Original strand, 18820279 - 18820421
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt---------gaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttgg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  18820279 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatacgaagcatggttaatgatgatttaaagttgattgatgaattatagttgg 18820378  T
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18820379 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatga 18820421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 2718035 - 2718171
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2718035 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttggaattatg 2718134  T
Q  101 tgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  2718135 tgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatgt 2718171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22473335 - 22473179
Alignment:
Q  79 atgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgttt---------atgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattg 169  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||         ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22473335 atgatttatagttggaattatgtgaagtatcaatattttttatttttgttgtttatgttgttcatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttaattg 22473236  T
Q  170 atgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22473235 atgatttatagttggaattatgtgaagtatcaatattttttatttttgttgtttatg 22473179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 36406252 - 36406369
Alignment:
Q  79 atgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttat 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  36406252 atgatttatagttggaattatgtgaagtatcaatagtatttattgttgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaaattaattgatgatttat 36406351  T
Q  179 tgttggaactatgtgaag 196  Q
     | ||||| |||||||||    
T  36406352 agatggaattatgtgaag 36406369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 36733839 - 36733975
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36733839 tgaaatatcaatattatttattgttgatgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttggaattatg 36733938  T
Q  101 tgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  36733939 tgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatgt 36733975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 36733817 - 36733974
Alignment:
Q  79 atgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcg---------ttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattg 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  36733817 atgatttatagttggaattatgtgaaatatcaatattatttattgttgatgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttaattg 36733916  T
Q  170 atgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  36733917 atgatttatagttggaattatgtgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatg 36733974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22473213 - 22473077
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22473213 tgaagtatcaatattttttatttttgttgtttatgttgttcatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttggaattatg 22473114  T
Q  101 tgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||  || || ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  22473113 tgaaacattaacattgtttaattgttgttgtttatgt 22473077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 226
Target Start/End: Original strand, 2718028 - 2718170
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttg---------tttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttgg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  2718028 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttgg 2718127  T
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    || ||||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  2718128 aattatgtgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatg 2718170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 250
Target Start/End: Original strand, 36406252 - 36406332
Alignment:
Q  170 atgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttg 250  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  36406252 atgatttatagttggaattatgtgaagtatcaatagtatttattgttgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttg 36406332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Original strand, 6574350 - 6574446
Alignment:
Q  131 ttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  6574350 ttatgtaaagcattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtatagttggaattatgtgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatg 6574446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 105
Target Start/End: Original strand, 36406298 - 36406369
Alignment:
Q  34 tgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaag 105  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36406298 tgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaaattaattgatgatttatagatggaattatgtgaag 36406369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 136
Target Start/End: Original strand, 6574350 - 6574447
Alignment:
Q  40 ttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  6574350 ttatgtaaagcattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtatagttggaattatgtgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatgt 6574447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Original strand, 4382052 - 4382105
Alignment:
Q  10 aatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatg 63  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4382052 aatattatttattgttgttgtttacgttgtttatgtgaagcattgttaatgatg 4382105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 226
Target Start/End: Original strand, 20025484 - 20025525
Alignment:
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20025484 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtttttgtttatg 20025525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 136
Target Start/End: Original strand, 20025484 - 20025526
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20025484 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtttttgtttatgt 20025526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 20025491 - 20025530
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20025491 tgaagtatcaatattatttattgtttttgtttatgttgtt 20025530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 18820486 - 18820532
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtga 47  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  18820486 tgaaggatcaatattatttatcgttgttgtttatgctgtttatgtga 18820532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Original strand, 22319186 - 22319228
Alignment:
Q  184 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22319186 gaactatgtgaagtattaatgttattaattgttgttgtttatg 22319228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12800339 - 12800274
Alignment:
Q  131 ttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaag 196  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||| |||||||||    
T  12800339 ttatgtgcaccattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtacagttcgaattatgtgaag 12800274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12800339 - 12800274
Alignment:
Q  40 ttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaag 105  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  12800339 ttatgtgcaccattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtacagttcgaattatgtgaag 12800274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22343840 - 22343799
Alignment:
Q  222 ttatgagaagcattgttgaggatgatttgttgttgttctgtg 263  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22343840 ttatgtgaagcattgttgatgatgatttgttgttgttttgtg 22343799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22355500 - 22355459
Alignment:
Q  222 ttatgagaagcattgttgaggatgatttgttgttgttctgtg 263  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22355500 ttatgtgaagcattgttgatgatgatttgttgttgttttgtg 22355459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 177
Target Start/End: Original strand, 16414120 - 16414152
Alignment:
Q  145 gttaatgatgatttgaagttgattgatgattta 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16414120 gttaatgatgattagaagttgattgatgattta 16414152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32121155 - 32121123
Alignment:
Q  145 gttaatgatgatttgaagttgattgatgattta 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32121155 gttaatgatgattagaagttgattgatgattta 32121123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26444685 - 26444516
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26444685 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgattgatgatttataattggaactatgtg 26444586  T
Q  194 aagtatcaatattatttattgttgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttgttgttgttctgtg 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26444585 aaggatcaatattatttattgttgttgtttatgtgaagcattgttgatgatgatttgttgttgttctgtg 26444516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 35659558 - 35659300
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  35659558 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgaatgatgatttatagttggaagtatg 35659459  T
Q  101 tgaagtatcaatattatttattgtcgttgttt---------atgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatg 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||         ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| || | |||||||    
T  35659458 tgaaggatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgtaaatgatgatttgaagttgaataatgatttatagtcgaaactatg 35659359  T
Q  192 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttgttgttg 256  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||      |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35659358 tgaaggatcaatattatttatcgttgttgt------gaagcattcttgatgatgatttgttgttg 35659300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 46739972 - 46739803
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46739972 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgtgaaacattggtaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatgtg 46739873  T
Q  194 aagtatcaatattatttattgttgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttgttgttgttctgtg 263  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  46739872 aaggatcaatattatttatcgttgttgtttatgtgaagcattgttgatgatgatttgttgttgttttgtg 46739803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12622268 - 12622034
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12622268 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttttgtgag-cattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttggaattatg 12622170  T
Q  101 tgaagtatcaatattatttattgtcgttgttt---------atgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||         ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12622169 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttggaattatg 12622070  T
Q  192 tgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    | ||| || || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  12622069 taaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatg 12622034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12622290 - 12622135
Alignment:
Q  79 atgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt--------gaagcatggttaatgatgatttgaagttgattga 170  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||          ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12622290 atgatttatagttggaattatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttttgtgagcattgttaatgatgatttgaagttaattga 12622191  T
Q  171 tgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12622190 tgatttatagttggaattatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 12622135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26444654 - 26444529
Alignment:
Q  34 tgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgttta 133  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26444654 tgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgattgatgatttataattggaactatgtgaaggatcaatattatttattgttgttgttta 26444555  T
Q  134 tgtgaagcatggttaatgatgatttg 159  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||    
T  26444554 tgtgaagcattgttgatgatgatttg 26444529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 46739941 - 46739816
Alignment:
Q  34 tgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgttta 133  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  46739941 tgttgtttatgtgaaacattggtaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatgtgaaggatcaatattatttatcgttgttgttta 46739842  T
Q  134 tgtgaagcatggttaatgatgatttg 159  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||    
T  46739841 tgtgaagcattgttgatgatgatttg 46739816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 19567190 - 19567336
Alignment:
Q  79 atgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttat 178  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19567190 atgatttatagttggaattatgtgaagtgtcaatattatttatta--gttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatttat 19567287  T
Q  179 tgttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
     ||||||| ||||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  19567288 agttggaattatgtgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatg 19567336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35659565 - 35659424
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgttt---------atgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttgg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||         ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  35659565 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgaatgatgatttatagttgg 35659466  T
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35659465 aagtatgtgaaggatcaatattatttattgttgttgtttatg 35659424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12622169 - 12622033
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12622169 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttggaattatg 12622070  T
Q  101 tgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    | ||| || || ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  12622069 taaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatgt 12622033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 16027339 - 16027475
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  16027339 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcaatgttaatgatgatttgaagttagctgatgatttatagttggaattatg 16027438  T
Q  101 tgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  16027439 tgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatgt 16027475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 16027317 - 16027474
Alignment:
Q  79 atgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgt---------cgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattg 169  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||    
T  16027317 atgatttatagttggaattatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcaatgttaatgatgatttgaagttagctg 16027416  T
Q  170 atgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  16027417 atgatttatagttggaattatgtgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatg 16027474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Original strand, 19567235 - 19567337
Alignment:
Q  35 gttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgtcgttgttta 133  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||| ||||| ||||||||    
T  19567235 gttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttggaattatgtgaagcattaacattgtttaattgttgttgttta 19567334  T
Q  134 tgt 136  Q
    |||    
T  19567335 tgt 19567337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 250
Target Start/End: Original strand, 19567190 - 19567268
Alignment:
Q  170 atgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttg 250  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  19567190 atgatttatagttggaattatgtgaagtgtcaatattatttatta--gttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttg 19567268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14629554 - 14629511
Alignment:
Q  184 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatga 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14629554 gaactatgtgaagtattaatattattaattgttgttgtttatga 14629511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 105
Target Start/End: Original strand, 44024856 - 44024907
Alignment:
Q  54 gttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaag 105  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44024856 gttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtatagttggaattatgtgaag 44024907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 196
Target Start/End: Original strand, 44024856 - 44024907
Alignment:
Q  145 gttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaag 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  44024856 gttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtatagttggaattatgtgaag 44024907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 136
Target Start/End: Original strand, 46225736 - 46225794
Alignment:
Q  79 atgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  46225736 atgatttatatttggaattatgtgaagtatcaatattgtttaattgttgttgtttatgt 46225794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 46225736 - 46225793
Alignment:
Q  170 atgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  46225736 atgatttatatttggaattatgtgaagtatcaatattgtttaattgttgttgtttatg 46225793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14629124 - 14629058
Alignment:
Q  131 ttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaag-ttgattgatgatttattgttggaactatgtgaag 196  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  14629124 ttatgtgcaccattgttaatgatgatttgaagattaattgatgatgtatagttggaattatgtgaag 14629058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 14629124 - 14629058
Alignment:
Q  40 ttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaac-ttgattgatgatttatagttggaactatgtgaag 105  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14629124 ttatgtgcaccattgttaatgatgatttgaagattaattgatgatgtatagttggaattatgtgaag 14629058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 14629554 - 14629512
Alignment:
Q  93 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatg 135  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14629554 gaactatgtgaagtattaatattattaattgttgttgtttatg 14629512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3484517 - 3484485
Alignment:
Q  145 gttaatgatgatttgaagttgattgatgattta 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3484517 gttaatgatgattagaagttgattgatgattta 3484485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 263
Target Start/End: Original strand, 6551873 - 6552054
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtt---------tatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttgg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6551873 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgctgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttgg 6551972  T
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattattta---ttgttgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttgttgttgttctgtg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6551973 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgttgtttatgagaagcattgttgatgatgatttgttgttgttctgtg 6552054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 6551880 - 6552041
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6551880 tgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgctgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatg 6551979  T
Q  101 tgaagtatcaatattattta---ttgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  6551980 tgaagtatcaatattatttattgttgttgttgtttatgagaagcattgttgatgatgatttg 6552041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 211
Target Start/End: Original strand, 6551756 - 6551873
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6551756 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatgtg 6551855  T
Q  194 aagtatcaatattattta 211  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6551856 aagtatcaatattattta 6551873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26646473 - 26646342
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26646473 tgaagtatcaatattacttattgttgttgtttattttgtttatgtgaagcattgttgatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatg 26646374  T
Q  101 tgaagtatcaatattatttattgtcgttgttt 132  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26646373 tgaaatatcaatattatttattgttgttgttt 26646342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 120
Target Start/End: Original strand, 6551787 - 6551873
Alignment:
Q  34 tgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattattta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6551787 tgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattattta 6551873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26646438 - 26646342
Alignment:
Q  127 ttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgttt 223  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26646438 ttgtttatgtgaagcattgttgatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatgtgaaatatcaatattatttattgttgttgttt 26646342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12354958 - 12354819
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatg---ttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaact 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  12354958 tgaagtatcaatattatttattgttggtgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttattgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaatt 12354859  T
Q  98 atgtgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    |||||||  || || ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  12354858 atgtgaaacattaacattgtttaattgttgttgtttatgt 12354819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 14027116 - 14027219
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14027116 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttttgtgag-cattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttggaattatg 14027214  T
Q  101 tgaag 105  Q
    |||||    
T  14027215 tgaag 14027219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12354980 - 12354820
Alignment:
Q  79 atgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcg------------ttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttga 166  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |            ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12354980 atgatttatagttggaattatgtgaagtatcaatattatttattgttggtgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttattgatgatttgaagttga 12354881  T
Q  167 ttgatgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||  || || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  12354880 ttgatgatttatagttggaattatgtgaaacattaacattgtttaattgttgttgtttatg 12354820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 14027094 - 14027219
Alignment:
Q  79 atgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt--------gaagcatggttaatgatgatttgaagttgattga 170  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||          ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14027094 atgatttatagttagaattatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttttgtgagcattgttaatgatgatttgaagttaattga 14027193  T
Q  171 tgatttattgttggaactatgtgaag 196  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||    
T  14027194 tgatttatagttggaattatgtgaag 14027219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Original strand, 8834459 - 8834555
Alignment:
Q  131 ttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | | ||||| || || ||||||| ||||||||||||||||    
T  8834459 ttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtatagttggaattttttgaagcattaacattatttaattgttgttgtttatg 8834555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 250
Target Start/End: Original strand, 6551756 - 6551821
Alignment:
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| | |||||||||    
T  6551756 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttg 6551821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 14027094 - 14027150
Alignment:
Q  170 atgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14027094 atgatttatagttagaattatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 14027150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 136
Target Start/End: Original strand, 8834459 - 8834556
Alignment:
Q  40 ttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | ||||| || || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  8834459 ttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtatagttggaattttttgaagcattaacattatttaattgttgttgtttatgt 8834556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Original strand, 8505011 - 8505107
Alignment:
Q  131 ttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  8505011 ttatgtgcatcattgttaatgatgattcgaagttaattgatgatgtatagttgaaactatgtgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatg 8505107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 136
Target Start/End: Original strand, 8505011 - 8505108
Alignment:
Q  40 ttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  8505011 ttatgtgcatcattgttaatgatgattcgaagttaattgatgatgtatagttgaaactatgtgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatgt 8505108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29914107 - 29914068
Alignment:
Q  97 tatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29914107 tatgtgaagtatcaatattatttattgtggttgtttatgt 29914068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29914107 - 29914069
Alignment:
Q  188 tatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29914107 tatgtgaagtatcaatattatttattgtggttgtttatg 29914069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26646477 - 26646440
Alignment:
Q  188 tatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttat 225  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26646477 tatgtgaagtatcaatattacttattgttgttgtttat 26646440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 26646373 - 26646330
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatg 44  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26646373 tgaaatatcaatattatttattgttgttgtttgtgttgtttatg 26646330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 29914103 - 29914064
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtt 40  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29914103 tgaagtatcaatattatttattgtggttgtttatgttgtt 29914064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12354186 - 12354144
Alignment:
Q  184 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12354186 gaactatgtgaattattaatattattaattgttgttgtttatg 12354144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1256 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 5)
Name: scaffold1256
Description:

Target: scaffold1256; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 225
Target Start/End: Original strand, 581 - 781
Alignment:
Q  34 tgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgt--------- 124  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             
T  581 tgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtattaatattatttattgttgttgttta 680  T
Q  125 cgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgttta 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  681 tgttgtttatgtgaagcattgttaattatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaattatgtgaatgatcaatattatttatcgttgttgttta 780  T
Q  225 t 225  Q
    |    
T  781 t 781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1256; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Original strand, 553 - 682
Alignment:
Q  97 tatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  553 tatgtgaagtatcaatattatttattattgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatgtgaag 652  T
Q  197 tatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  653 tattaatattatttattgttgttgtttatg 682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1256; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 648 - 781
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  648 tgaagtattaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaattatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaattatg 747  T
Q  101 tgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttat 134  Q
    ||||  ||||||||||||||| || |||||||||    
T  748 tgaatgatcaatattatttatcgttgttgtttat 781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1256; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 250
Target Start/End: Original strand, 553 - 615
Alignment:
Q  188 tatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  553 tatgtgaagtatcaatattatttattattgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttg 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1256; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 68
Target Start/End: Original strand, 754 - 815
Alignment:
Q  7 atcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttg 68  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  754 atcaatattatttatcgttgttgtttataatgtttatgtgaagcattgttgatgatgatttg 815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 226
Target Start/End: Original strand, 1385017 - 1385218
Alignment:
Q  34 tgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttg---- 129  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||        
T  1385017 tgttgtttatgtgaagcatcgttaatgatgatttgaagttgattgataatttatagttgaaactatgtgaatgatcaatattatttattgttgttgttta 1385116  T
Q  130 -----tttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgttta 224  Q
         |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1385117 tgttgtttatgtgaagcatcgttaatgatgatttgaagttaattgataatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttatcgttgttgttta 1385216  T
Q  225 tg 226  Q
    ||    
T  1385217 tg 1385218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Original strand, 21336977 - 21337150
Alignment:
Q  99 tgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagta 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21336977 tgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgtgaagcattgttgatgatgatttgaagttgattgatgatttataattggaactatgtgaagta 21337076  T
Q  199 tcaatattatttattgt---------tgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttgttgttgttctgtg 263  Q
    ||||||||| |||||||         ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21337077 tcaatattacttattgttgttgtttatgttgtttatgagaagcatcgttgatgatgatttgatgttgttctgtg 21337150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 226
Target Start/End: Original strand, 1384986 - 1385118
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  1384986 aactatgtgaagtatcaatattaattattgttgttgtttatgtgaagcatcgttaatgatgatttgaagttgattgataatttatagttgaaactatgtg 1385085  T
Q  194 aagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1385086 aatgatcaatattatttattgttgttgtttatg 1385118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 1385090 - 1385219
Alignment:
Q  7 atcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagt 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1385090 atcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcatcgttaatgatgatttgaagttaattgataatttatagttggaactatgtgaagt 1385189  T
Q  107 atcaatattatttattgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1385190 atcaatattatttatcgttgttgtttatgt 1385219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Original strand, 21316987 - 21317160
Alignment:
Q  99 tgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagta 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21316987 tgtgaagtatcattattatttattattgttgtttatgtgaagcattgttgatgatgatttgaagttgattgatgatttataattggaactatgtgaagta 21317086  T
Q  199 tcaatattatttattg---------ttgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttgttgttgttctgtg 263  Q
    ||||||||| ||||||          ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21317087 tcaatattacttattgctgttgtttatgttgtttatgagaagcatcgttgatgatgatttgctgttgttctgtg 21317160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 136
Target Start/End: Original strand, 21337003 - 21337105
Alignment:
Q  34 tgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgttta 133  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21337003 tgttgtttatgtgaagcattgttgatgatgatttgaagttgattgatgatttataattggaactatgtgaagtatcaatattacttattgttgttgttta 21337102  T
Q  134 tgt 136  Q
    |||    
T  21337103 tgt 21337105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 136
Target Start/End: Original strand, 21317013 - 21317115
Alignment:
Q  34 tgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgttta 133  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  21317013 tgttgtttatgtgaagcattgttgatgatgatttgaagttgattgatgatttataattggaactatgtgaagtatcaatattacttattgctgttgttta 21317112  T
Q  134 tgt 136  Q
    |||    
T  21317113 tgt 21317115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21367598 - 21367509
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgat-gttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatag 89  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21367598 tgaaatatcaatattatttattgattgttgtttatgttatttatgtgaagcattgttgatgatgatttgaagttgattgatgatttatag 21367509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 1385184 - 1385251
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttg 68  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  1385184 tgaagtatcaatattatttatcgttgttgtttatgttgtttatgtgagacattgttgatgatgatttg 1385251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 250
Target Start/End: Original strand, 1384986 - 1385051
Alignment:
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  1384986 aactatgtgaagtatcaatattaattattgttgttgtttatgtgaagcatcgttaatgatgatttg 1385051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 21337070 - 21337138
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttga 69  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  21337070 tgaagtatcaatattacttattgttgttgtttatgttgtttatgagaagcatcgttgatgatgatttga 21337138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 21317080 - 21317147
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttg 68  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||    
T  21317080 tgaagtatcaatattacttattgctgttgtttatgttgtttatgagaagcatcgttgatgatgatttg 21317147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21367559 - 21367511
Alignment:
Q  130 tttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttat 178  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21367559 tttatgtgaagcattgttgatgatgatttgaagttgattgatgatttat 21367511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 105
Target Start/End: Original strand, 10744580 - 10744631
Alignment:
Q  54 gttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaag 105  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10744580 gttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtatagttggaattatgtgaag 10744631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 196
Target Start/End: Original strand, 10744580 - 10744631
Alignment:
Q  145 gttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaag 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  10744580 gttaatgatgatttgaagttaattgatgatgtatagttggaattatgtgaag 10744631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21367605 - 21367563
Alignment:
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattg-ttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21367605 aactatgtgaaatatcaatattatttattgattgttgtttatg 21367563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25140726 - 25140684
Alignment:
Q  184 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  25140726 gaactatgtgaagtattaatattattaatcgttgttgtttatg 25140684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25140085 - 25140044
Alignment:
Q  133 atgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgat 174  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25140085 atgtgaaccattgttaatgatgatttgaagttaattgatgat 25140044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 220
Target Start/End: Original strand, 10744191 - 10744227
Alignment:
Q  184 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttg 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10744191 gaactatgtgaagtattaatattattaattgttgttg 10744227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 177
Target Start/End: Original strand, 32215770 - 32215802
Alignment:
Q  145 gttaatgatgatttgaagttgattgatgattta 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32215770 gttaatgatgattagaagttgattgatgattta 32215802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 226
Target Start/End: Original strand, 23498332 - 23498516
Alignment:
Q  54 gttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttg------------tttatgtgaagc 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||            ||||||||||||    
T  23498332 gttaatgatgatttgaagttgattgatgatttagagttggaactatgtgaaggatcaatattatttattgttgttgttgtttatgttgtttatgtgaagc 23498431  T
Q  142 atggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23498432 attgttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttatcgttgttgtttatg 23498516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 212
Target Start/End: Original strand, 23492734 - 23492904
Alignment:
Q  54 gttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttg------------tttatgtgaagc 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||            ||||||||||||    
T  23492734 gttaatgatgatttgaagttgattgatgatttagagttggaactatgtgaaggatcaatattatttattgttgttgttgtttatgttgtttatgtgaagc 23492833  T
Q  142 atggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattatttat 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492834 attgttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttat 23492904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 94 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22555976 - 22555844
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtg 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22555976 aactatgtgaactatcaatattatttattgttgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgattgattatttatagttggaactatgtg 22555877  T
Q  194 aagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22555876 aaggatcaatattatttatcgttgttgtttatg 22555844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 226
Target Start/End: Original strand, 19958167 - 19958308
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtc---------gttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttgg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19958167 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcaatgtttacgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatatttgg 19958266  T
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19958267 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 19958308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 23498379 - 23498517
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgtt---gtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaact 97  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23498379 tgaaggatcaatattatttattgttgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaact 23498478  T
Q  98 atgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23498479 atgtgaagtatcaatattatttatcgttgttgtttatgt 23498517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 19958174 - 19958309
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19958174 tgaagtatcaatattatttattgtcaatgtttacgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatatttggaactatg 19958273  T
Q  101 tgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19958274 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgt 19958309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 23492781 - 23492904
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgtt---gtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaact 97  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23492781 tgaaggatcaatattatttattgttgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaact 23492880  T
Q  98 atgtgaagtatcaatattatttat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23492881 atgtgaagtatcaatattatttat 23492904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22555945 - 22555843
Alignment:
Q  34 tgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgttta 133  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  22555945 tgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgattgattatttatagttggaactatgtgaaggatcaatattatttatcgttgttgttta 22555846  T
Q  134 tgt 136  Q
    |||    
T  22555845 tgt 22555843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Original strand, 23492734 - 23492811
Alignment:
Q  145 gttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23492734 gttaatgatgatttgaagttgattgatgatttagagttggaactatgtgaaggatcaatattatttattgttgttgtt 23492811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22555976 - 22555911
Alignment:
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttg 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  22555976 aactatgtgaactatcaatattatttattgttgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttg 22555911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 18401036 - 18400984
Alignment:
Q  15 tatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgattt 67  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18401036 tatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaaacattgttaatgatgattt 18400984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 19958274 - 19958321
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19958274 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaa 19958321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 23498482 - 23498530
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaa 49  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23498482 tgaagtatcaatattatttatcgttgttgtttatgttgtttatgtgaaa 23498530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 22555878 - 22555811
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttg 68  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  22555878 tgaaggatcaatattatttatcgttgttgtttatgttgtttatatgaagcattgttgatgatgatttg 22555811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23500556 - 23500515
Alignment:
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23500556 aactatgtgaagtatcaatattatttattgctgttgtttatg 23500515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 23500549 - 23500510
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtt 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23500549 tgaagtatcaatattatttattgctgttgtttatgttgtt 23500510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23500556 - 23500514
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23500556 aactatgtgaagtatcaatattatttattgctgttgtttatgt 23500514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23991930 - 23991898
Alignment:
Q  145 gttaatgatgatttgaagttgattgatgattta 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23991930 gttaatgatgattagaagttgattgatgattta 23991898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 34962793 - 34962761
Alignment:
Q  145 gttaatgatgatttgaagttgattgatgattta 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34962793 gttaatgatgattagaagttgattgatgattta 34962761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 61548 - 61374
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  61548 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttggaactatgtg 61449  T
Q  194 aagtatcaatattatttattgt---------tgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttgttgttgttc 259  Q
    ||| ||||||||||||||| ||         ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  61448 aaggatcaatattatttatcgttgttgtatatgttgtttatgtgaagcattgttgatgatgatttgttgttgttc 61374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 61517 - 61415
Alignment:
Q  34 tgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgttta 133  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||    
T  61517 tgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttggaactatgtgaaggatcaatattatttatcgttgttgtata 61418  T
Q  134 tgt 136  Q
    |||    
T  61417 tgt 61415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 61450 - 61383
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttg 68  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  61450 tgaaggatcaatattatttatcgttgttgtatatgttgtttatgtgaagcattgttgatgatgatttg 61383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 72907 - 72865
Alignment:
Q  184 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  72907 gaactatgtgaagaattaatattattaattgttgttgtttatg 72865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Original strand, 19099 - 19263
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtg 193  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19099 aactatgggaaatatcaatattatttattgttgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactaagtg 19198  T
Q  194 aagtatcaatattatttattgttgttgtttatgagaagcattgttgaggatgatttgttgttgtt 258  Q
    ||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||||||    
T  19199 aagaataaatataatttatcgttgttgtttatgtgaagcattgttgatgataatttactgttgtt 19263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 158
Target Start/End: Original strand, 19130 - 19254
Alignment:
Q  34 tgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgttta 133  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| || ||||||||    
T  19130 tgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactaagtgaagaataaatataatttatcgttgttgttta 19229  T
Q  134 tgtgaagcatggttaatgatgattt 158  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  19230 tgtgaagcattgttgatgataattt 19254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 8188 - 8323
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8188 tgaaatatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgtttgaactatg 8287  T
Q  101 tgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  8288 tgaaggatcaatattatttatcgttgttatttatgt 8323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 226
Target Start/End: Original strand, 8181 - 8322
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttg---------tttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttgg 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8181 aactatgtgaaatatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgtttg 8280  T
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8281 aactatgtgaaggatcaatattatttatcgttgttatttatg 8322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 8288 - 8355
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttg 68  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8288 tgaaggatcaatattatttatcgttgttatttatgttgtttatgtgaaacattgttgatgatgatttg 8355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 4814 - 4950
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttg-attgatgatttatagttggaactat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  4814 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgatgtttatgtgaagcattgttaatgaagatttgaagttgaattgatgatttatagttggaacttt 4913  T
Q  100 gtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt 136  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4914 gtgaaggatcaatattatttatagttgttgtttatgt 4950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 263
Target Start/End: Original strand, 4807 - 4995
Alignment:
Q  94 aactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatg---------tgaagcatggttaatgatgatttgaagttga-ttgatgatttattgttg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4807 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgatgtttatgtgaagcattgttaatgaagatttgaagttgaattgatgatttatagttg 4906  T
Q  184 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg---------agaagcattgttgaggatgatttgttgttgttctgtg 263  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4907 gaactttgtgaaggatcaatattatttatagttgttgtttatgttgtttatttgaagcattgttgatgatgatttgttgttgttctgtg 4995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 4915 - 4982
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttg 68  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  4915 tgaaggatcaatattatttatagttgttgtttatgttgtttatttgaagcattgttgatgatgatttg 4982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 263
Target Start/End: Original strand, 6012 - 6135
Alignment:
Q  149 atgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgt---------tgttgtttatgagaagcattgttg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||| ||||||||||||    
T  6012 atgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttg 6111  T
Q  240 aggatgatttgttgttgttctgtg 263  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  6112 atgatgatttgttgttgttctgtg 6135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 58 - 136
Target Start/End: Original strand, 6012 - 6090
Alignment:
Q  58 atgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6012 atgatgatttgaagttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgt 6090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 6055 - 6122
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttg 68  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  6055 tgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatgttgtttatgtgaagcattgttgatgatgatttg 6122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17957 - 17821
Alignment:
Q  1 tgaagtatcaatattatttattgatgttgtttatgttgtttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17957 tgaagtatcaatattatttattgttgttttttatgttgtttatgtgaagctttgttaatgatgatttgaagttaattgatgatttatagttggaattatg 17858  T
Q  101 tgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  17857 tgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatgt 17821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17979 - 17822
Alignment:
Q  79 atgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgtt---------gtttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattg 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  17979 atgatttatagttggaattatgtgaagtatcaatattatttattgttgttttttatgttgtttatgtgaagctttgttaatgatgatttgaagttaattg 17880  T
Q  170 atgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  17879 atgatttatagttggaattatgtgaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatg 17822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19000 - 18942
Alignment:
Q  79 atgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  19000 atgatttatagttggaattatgtgaagtatcaatattgtttaattgttgttgtttatgt 18942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19000 - 18943
Alignment:
Q  170 atgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19000 atgatttatagttggaattatgtgaagtatcaatattgtttaattgttgttgtttatg 18943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3184 - 3103
Alignment:
Q  146 ttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  3184 ttaatgatgattcgaagttaattgatgatgtatagttggaattatgtgaagtattaacattgtttaattattgttgtttatg 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3184 - 3102
Alignment:
Q  55 ttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||| ||| ||| | |||||||||||    
T  3184 ttaatgatgattcgaagttaattgatgatgtatagttggaattatgtgaagtattaacattgtttaattattgttgtttatgt 3102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25336 - 25240
Alignment:
Q  131 ttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| || || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  25336 ttatgtgcatcattgttaatgatgatttgaagttaattaatgatgtatagttggaattatgtaaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatg 25240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25336 - 25239
Alignment:
Q  40 ttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaagtatcaatattattt-attgtcgttgtttatgt 136  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| || || ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  25336 ttatgtgcatcattgttaatgatgatttgaagttaattaatgatgtatagttggaattatgtaaagcattaacattgtttaattgttgttgtttatgt 25239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 396
Alignment:
Q  184 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatga 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  439 gaactatgtgaagtattaatattattaattgttgttgtttatga 396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 397
Alignment:
Q  93 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatg 135  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  439 gaactatgtgaagtattaatattattaattgttgttgtttatg 397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 187829 - 187872
Alignment:
Q  184 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatga 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  187829 gaactatgtgaagtattaatattattaattgttgttgtttatga 187872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 135
Target Start/End: Original strand, 187829 - 187871
Alignment:
Q  93 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgtcgttgtttatg 135  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  187829 gaactatgtgaagtattaatattattaattgttgttgtttatg 187871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 105
Target Start/End: Original strand, 188259 - 188325
Alignment:
Q  40 ttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaac-ttgattgatgatttatagttggaactatgtgaag 105  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  188259 ttatgtgcaccattgttaatgatgatttgaagattaattgatgatgtatagttggaattatgtgaag 188325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 196
Target Start/End: Original strand, 188259 - 188325
Alignment:
Q  131 ttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaag-ttgattgatgatttattgttggaactatgtgaag 196  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  188259 ttatgtgcaccattgttaatgatgatttgaagattaattgatgatgtatagttggaattatgtgaag 188325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33608 - 33544
Alignment:
Q  131 ttatgtgaagcatggttaatgatgatttgaagttgattgatgatttattgttggaactatgtgaa 195  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  33608 ttatgtgcaccattgttaatgatgatttgaagttaaatgatgatgtatagttggaattatgtgaa 33544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 33608 - 33544
Alignment:
Q  40 ttatgtgaaacatggttaatgatgatttgaacttgattgatgatttatagttggaactatgtgaa 104  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33608 ttatgtgcaccattgttaatgatgatttgaagttaaatgatgatgtatagttggaattatgtgaa 33544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33975 - 33933
Alignment:
Q  184 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33975 gaactatgtgaactattaatattattaattgttgttgtttatg 33933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1223 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1223
Description:

Target: scaffold1223; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 405 - 448
Alignment:
Q  184 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatga 227  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  405 gaactatgtgaagtattaacattattaattgttgttgtttatga 448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Original strand, 66298 - 66340
Alignment:
Q  184 gaactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  66298 gaactatgtgaaatattaatattattaattgttgttgtttatg 66340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3511 - 3470
Alignment:
Q  185 aactatgtgaagtatcaatattatttattgttgttgtttatg 226  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3511 aactatgagaagtattaatattgtttattgttgttgtttatg 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4122 - 4090
Alignment:
Q  145 gttaatgatgatttgaagttgattgatgattta 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4122 gttaatgatgattagaagttgattgatgattta 4090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 177
Target Start/End: Original strand, 18433 - 18465
Alignment:
Q  145 gttaatgatgatttgaagttgattgatgattta 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18433 gttaatgatgattagaagttgattgatgattta 18465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 4552 times since January 2019
Visitors: 4836