View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0755_high_22 (Length: 357)

Name: NF0755_high_22
Description: NF0755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0755_high_22
NF0755_high_22
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (1-336)||(25426628-25426963)
chr5 (1-336)||(12374-12709)
chr5 (1-336)||(18777909-18778244)
chr5 (1-336)||(19499899-19500234)
chr5 (1-336)||(21073512-21073847)
chr5 (1-336)||(22366398-22366733)
chr5 (1-336)||(43443314-43443647)
chr5 (1-336)||(4199902-4200237)
chr5 (1-336)||(27009841-27010175)
chr5 (1-284)||(29188203-29188483)
chr5 (104-336)||(23506965-23507196)
chr5 (103-336)||(27182578-27182810)
chr5 (1-168)||(11211985-11212153)
chr5 (1-168)||(7425492-7425660)
chr5 (84-336)||(22053845-22054096)
chr5 (1-168)||(35791018-35791186)
chr5 (84-336)||(18531079-18531330)
chr5 (1-168)||(23514729-23514897)
chr5 (1-168)||(1219440-1219608)
chr5 (1-168)||(10777890-10778058)
chr5 (1-168)||(17471508-17471676)
chr5 (84-325)||(34939289-34939528)
chr5 (1-168)||(21932301-21932469)
chr5 (1-168)||(21938471-21938639)
chr5 (1-168)||(35582204-35582372)
chr5 (3-135)||(22883006-22883139)
chr5 (1-168)||(36989690-36989858)
chr5 (1-98)||(23328795-23328893)
chr5 (1-98)||(24616399-24616497)
chr5 (1-98)||(24712775-24712873)
chr5 (1-98)||(24745793-24745891)
chr5 (84-204)||(20623100-20623220)
chr5 (84-204)||(21233540-21233660)
chr5 (84-204)||(25900418-25900538)
chr5 (84-204)||(16536328-16536448)
chr5 (84-204)||(37052875-37052995)
chr5 (87-168)||(32950862-32950943)
chr5 (292-332)||(29190482-29190522)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (1-336)||(19886578-19886913)
chr2 (84-336)||(17396665-17396916)
chr2 (84-331)||(462743-462989)
chr2 (103-336)||(19794735-19794967)
chr2 (84-336)||(8891242-8891493)
chr2 (84-336)||(36982453-36982704)
chr2 (103-336)||(20627344-20627576)
chr2 (1-168)||(8944014-8944182)
chr2 (1-168)||(12728560-12728728)
chr2 (104-336)||(43642989-43643220)
chr2 (84-336)||(7507856-7508107)
chr2 (1-168)||(3798523-3798691)
chr2 (1-168)||(23777965-23778133)
chr2 (84-336)||(24341401-24341652)
chr2 (1-168)||(34824643-34824811)
chr2 (1-168)||(12635788-12635956)
chr2 (1-168)||(12641562-12641730)
chr2 (1-168)||(16935761-16935929)
chr2 (1-168)||(17006421-17006589)
chr2 (1-168)||(42177889-42178057)
chr2 (1-168)||(11231258-11231426)
chr2 (1-168)||(22513105-22513273)
chr2 (1-168)||(24685701-24685869)
chr2 (1-168)||(28775727-28775895)
chr2 (84-336)||(25265402-25265653)
chr2 (1-98)||(23774374-23774472)
chr2 (84-204)||(19689413-19689533)
chr2 (84-204)||(23820202-23820322)
chr2 (1-98)||(5888550-5888648)
chr2 (84-204)||(14906452-14906572)
chr2 (45-133)||(21142098-21142187)
chr2 (84-204)||(20015142-20015262)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (1-336)||(25175563-25175899)
chr6 (5-336)||(27653904-27654235)
chr6 (10-336)||(16825678-16826006)
chr6 (1-332)||(1650024-1650352)
chr6 (84-332)||(14626130-14626377)
chr6 (86-325)||(23153458-23153696)
chr6 (1-168)||(16232060-16232228)
chr6 (1-168)||(1556173-1556341)
chr6 (1-168)||(19610186-19610354)
chr6 (84-325)||(1657760-1657999)
chr6 (1-168)||(18086743-18086911)
chr6 (1-168)||(23977937-23978105)
chr6 (84-336)||(35009451-35009702)
chr6 (1-135)||(22251486-22251621)
chr6 (1-168)||(10488867-10489035)
chr6 (1-168)||(16376293-16376461)
chr6 (1-168)||(16383617-16383785)
chr6 (1-168)||(22225658-22225826)
chr6 (1-168)||(16556059-16556227)
chr6 (1-168)||(16632615-16632783)
chr6 (1-106)||(19299467-19299573)
chr6 (86-325)||(15862484-15862720)
chr6 (3-268)||(29665941-29666208)
chr6 (1-168)||(13620714-13620882)
chr6 (1-98)||(29869696-29869794)
chr6 (85-157)||(27751603-27751675)
chr6 (88-172)||(19854317-19854402)
chr6 (112-172)||(29605612-29605672)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (1-336)||(47357654-47357987)
chr4 (1-336)||(10644219-10644552)
chr4 (112-328)||(13048261-13048477)
chr4 (103-336)||(13246430-13246662)
chr4 (104-336)||(54118276-54118507)
chr4 (84-336)||(15675101-15675352)
chr4 (1-168)||(18169138-18169306)
chr4 (103-336)||(31115629-31115861)
chr4 (1-168)||(7131985-7132153)
chr4 (1-168)||(19020654-19020822)
chr4 (1-168)||(15287165-15287333)
chr4 (1-168)||(15294274-15294442)
chr4 (1-168)||(17145577-17145745)
chr4 (1-168)||(20000891-20001059)
chr4 (1-133)||(18248421-18248554)
chr4 (103-236)||(121989-122121)
chr4 (103-268)||(10104281-10104445)
chr4 (8-110)||(8378377-8378480)
chr4 (84-336)||(26680201-26680451)
chr4 (37-168)||(22738437-22738568)
chr4 (1-98)||(22351984-22352082)
chr4 (1-98)||(26339257-26339355)
chr4 (239-336)||(111395-111492)
chr4 (84-204)||(10488693-10488813)
chr4 (84-204)||(16327938-16328058)
chr4 (1-73)||(9795490-9795562)
chr4 (103-268)||(40885585-40885749)
chr4 (84-135)||(33240900-33240951)
chr4 (1-31)||(14996444-14996474)
chr4 (292-336)||(10104450-10104494)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (1-336)||(10989410-10989744)
chr7 (1-336)||(2437457-2437792)
chr7 (1-336)||(13910941-13911277)
chr7 (1-336)||(13572676-13573010)
chr7 (1-336)||(18253763-18254098)
chr7 (1-336)||(16478881-16479213)
chr7 (106-330)||(25292372-25292595)
chr7 (84-336)||(47481043-47481294)
chr7 (84-336)||(13037026-13037277)
chr7 (84-331)||(11580751-11580997)
chr7 (84-334)||(16211768-16212017)
chr7 (103-336)||(36052667-36052896)
chr7 (84-336)||(3059966-3060217)
chr7 (1-168)||(15950711-15950879)
chr7 (1-168)||(18979941-18980109)
chr7 (1-168)||(13758538-13758706)
chr7 (1-168)||(15760034-15760202)
chr7 (1-168)||(15927736-15927904)
chr7 (1-168)||(7822896-7823064)
chr7 (1-168)||(7830207-7830375)
chr7 (1-168)||(27101557-27101725)
chr7 (1-168)||(27108905-27109073)
chr7 (1-168)||(27176601-27176769)
chr7 (1-168)||(38783649-38783817)
chr7 (84-336)||(13321014-13321267)
chr7 (1-81)||(15862174-15862255)
chr7 (1-170)||(48622586-48622756)
chr7 (1-168)||(14250818-14250986)
chr7 (84-336)||(7293017-7293267)
chr7 (84-204)||(11516358-11516478)
chr7 (84-204)||(15441576-15441696)
chr7 (84-204)||(30262141-30262261)
chr7 (1-98)||(16418735-16418833)
chr7 (35-98)||(10000325-10000388)
chr7 (109-193)||(296003-296087)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (1-336)||(36093-36428)
scaffold0023 (84-336)||(48598-48849)
scaffold0023 (2-123)||(169830-169951)
scaffold0023 (1-168)||(153927-154095)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (1-336)||(30120722-30121058)
chr8 (1-336)||(16674310-16674644)
chr8 (1-336)||(21844490-21844824)
chr8 (1-336)||(21851883-21852217)
chr8 (1-332)||(6774177-6774505)
chr8 (1-332)||(24548986-24549314)
chr8 (146-336)||(222753-222943)
chr8 (146-336)||(736376-736566)
chr8 (146-336)||(860271-860461)
chr8 (78-336)||(43373474-43373731)
chr8 (84-337)||(16193728-16193980)
chr8 (84-325)||(24928803-24929043)
chr8 (1-168)||(22006178-22006346)
chr8 (1-168)||(13720848-13721016)
chr8 (1-168)||(16195399-16195567)
chr8 (1-168)||(16872971-16873139)
chr8 (84-336)||(16404987-16405235)
chr8 (1-168)||(13662185-13662353)
chr8 (1-168)||(271280-271448)
chr8 (1-168)||(644472-644640)
chr8 (1-168)||(830207-830375)
chr8 (1-109)||(15319079-15319188)
chr8 (1-109)||(15499448-15499557)
chr8 (88-325)||(17345581-17345816)
chr8 (1-168)||(22088714-22088882)
chr8 (146-207)||(691908-691969)
chr8 (84-336)||(22907226-22907476)
chr8 (84-204)||(5238218-5238338)
chr8 (84-204)||(24661260-24661380)
chr8 (84-204)||(43685677-43685797)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (1-336)||(55316219-55316553)
chr3 (1-336)||(41270075-41270409)
chr3 (1-336)||(16821139-16821472)
chr3 (1-336)||(15936555-15936890)
chr3 (1-332)||(15614838-15615166)
chr3 (1-333)||(15938397-15938729)
chr3 (84-336)||(14842573-14842824)
chr3 (84-336)||(13975734-13975985)
chr3 (84-336)||(45860805-45861056)
chr3 (84-337)||(51158030-51158282)
chr3 (84-336)||(15859036-15859287)
chr3 (84-336)||(13954902-13955153)
chr3 (84-336)||(12030159-12030410)
chr3 (84-336)||(2049810-2050061)
chr3 (84-325)||(13838905-13839145)
chr3 (1-168)||(12264712-12264880)
chr3 (1-168)||(49232604-49232772)
chr3 (1-168)||(12902010-12902178)
chr3 (1-168)||(18911161-18911329)
chr3 (1-168)||(22275377-22275545)
chr3 (1-168)||(25058907-25059075)
chr3 (1-168)||(15468260-15468428)
chr3 (1-135)||(18896964-18897099)
chr3 (1-168)||(1467659-1467827)
chr3 (106-336)||(17912516-17912744)
chr3 (1-168)||(5228481-5228648)
chr3 (1-168)||(54651625-54651793)
chr3 (1-135)||(12812042-12812177)
chr3 (84-204)||(2449250-2449370)
chr3 (45-168)||(44229153-44229277)
chr3 (106-204)||(16744149-16744247)
chr3 (223-336)||(47984650-47984763)
chr3 (223-336)||(47993937-47994050)
chr3 (223-336)||(48003224-48003337)
chr3 (223-336)||(48012510-48012623)
chr3 (1-31)||(8268653-8268683)
chr3 (1-31)||(8275753-8275783)
chr3 (87-168)||(11986181-11986262)
chr3 (295-336)||(15468555-15468596)
chr3 (88-172)||(41661727-41661812)
chr3 (292-336)||(16744333-16744377)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (1-336)||(5072306-5072640)
chr1 (37-336)||(18601071-18601370)
chr1 (1-336)||(22227809-22228144)
chr1 (1-336)||(22232506-22232841)
chr1 (1-332)||(2116258-2116587)
chr1 (1-270)||(45051489-45051755)
chr1 (84-336)||(20931345-20931596)
chr1 (84-336)||(20913037-20913281)
chr1 (103-336)||(20893657-20893889)
chr1 (84-336)||(41394222-41394473)
chr1 (104-336)||(20445679-20445910)
chr1 (1-168)||(46523557-46523724)
chr1 (1-168)||(18059678-18059846)
chr1 (112-336)||(20531444-20531667)
chr1 (106-336)||(37844484-37844714)
chr1 (6-168)||(17148735-17148898)
chr1 (1-168)||(17004806-17004974)
chr1 (1-168)||(38055011-38055179)
chr1 (1-106)||(19962419-19962525)
chr1 (1-98)||(22035685-22035783)
chr1 (1-98)||(7640854-7640952)
chr1 (84-204)||(51452623-51452743)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (2-336)||(31593-31928)
scaffold0008 (84-336)||(128181-128431)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-336)||(42997-43331)
scaffold0076 (1-168)||(39271-39439)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-336)||(21033-21367)
scaffold0139 (1-336)||(13979-14312)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-336)||(35-367)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-336)||(64441-64780)
scaffold0026 (1-336)||(107747-108082)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (1-332)||(9268-9596)
scaffold0215 (1-332)||(16166-16494)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (1-336)||(3722-4058)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-336)||(5132-5466)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (1-230)||(1222-1450)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-332)||(2966-3297)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (84-321)||(5544-5780)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-240)||(13244-13480)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (84-334)||(3594-3843)
scaffold0266 (84-336)||(1124-1375)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (84-336)||(12115-12364)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (84-336)||(6076-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (84-336)||(968-1218)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (84-336)||(48187-48438)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (104-336)||(8878-9109)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (103-336)||(148721-148953)
scaffold0025 (84-336)||(8849-9100)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (84-336)||(19206-19457)
scaffold0195 (84-336)||(21290-21541)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (104-336)||(123196-123427)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (103-336)||(36944-37176)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (103-336)||(5092-5324)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (84-325)||(247454-247694)
scaffold0012 (1-168)||(34078-34246)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (84-336)||(26427-26678)
scaffold0162 (84-219)||(8192-8327)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (103-325)||(171916-172137)
scaffold0001 (103-325)||(177619-177840)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (84-332)||(41733-41980)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (84-336)||(546-797)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-168)||(1495-1663)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-336)||(34376-34724)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (103-330)||(272031-272257)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (1-168)||(2560-2729)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (1-168)||(1434-1602)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-110)||(29388-29498)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (1-110)||(10668-10778)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (1-168)||(31477-31645)
scaffold0107 (47-168)||(39814-39935)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (230-336)||(9-115)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (1-133)||(7376-7509)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (87-336)||(41648-41896)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (230-336)||(48514-48620)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (21-168)||(10279-10427)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-170)||(54040-54210)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (37-170)||(3579-3712)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (84-205)||(13636-13757)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (1-168)||(45198-45367)
scaffold0066 (1-168)||(54584-54753)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (1-98)||(6835-6933)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (84-218)||(51194-51328)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (84-218)||(89466-89600)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (78-165)||(3360-3447)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (239-336)||(9382-9479)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (84-336)||(37078-37328)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (3-98)||(23671-23767)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (1-98)||(12047-12145)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-98)||(7447-7545)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (84-204)||(22671-22791)
scaffold0141 (84-204)||(26926-27046)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (84-204)||(1594-1714)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-73)||(13270-13342)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (87-168)||(56114-56195)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25426963 - 25426628
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25426963 ggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 25426864  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426863 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 25426764  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426763 gtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 25426664  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25426663 aattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12709 - 12374
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12709 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 12610  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12609 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagatt 12510  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12509 gtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 12410  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12409 aattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 18777909 - 18778244
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  18777909 ggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctct 18778008  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778009 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 18778108  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18778109 gtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaat 18778208  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18778209 aattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19500234 - 19499899
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19500234 ggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctct 19500135  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500134 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 19500035  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19500034 gtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgattaat 19499935  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19499934 aattgctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 21073512 - 21073847
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21073512 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 21073611  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073612 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 21073711  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073712 gtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttgatattatgattgatgaat 21073811  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21073812 aattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 22366398 - 22366733
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22366398 ggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctct 22366497  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366498 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 22366597  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366598 gtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 22366697  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22366698 aattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 43443314 - 43443647
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43443314 ggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatt--gcatattctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctct 43443411  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43443412 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatatt 43443511  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443512 gtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 43443611  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43443612 aattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 4199902 - 4200237
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4199902 ggtaagggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctct 4200001  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4200002 tgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatatt 4200101  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
     ||||||  ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200102 atgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 4200201  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
     ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  4200202 gattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27010175 - 27009841
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  27010175 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 27010077  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  27010076 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatatt 27009977  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    || || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27009976 gtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaat 27009877  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  27009876 aattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 29188203 - 29188483
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  29188203 ggtaagggggttagtgattattataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctct 29188300  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||     
T  29188301 tactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatg 29188400  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgat 284  Q
    ||||| |  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  29188401 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 29188483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 104 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23507196 - 23506965
Alignment:
Q  104 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  23507196 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 23507097  T
Q  204 ctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 303  Q
    || |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  23507096 ctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataat 23506998  T
Q  304 tgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23506997 tgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Original strand, 27182578 - 27182810
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  27182578 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 27182677  T
Q  203 gctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
    ||| |  |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  27182678 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 27182776  T
Q  303 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27182777 ttgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 11211985 - 11212153
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  11211985 ggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctc 11212084  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  11212085 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 11212153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7425660 - 7425492
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  7425660 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctc 7425561  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  7425560 ttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 7425492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 22053845 - 22054096
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  22053845 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 22053944  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |  ||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  22053945 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattga 22054043  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  22054044 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 35791018 - 35791186
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  35791018 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 35791117  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  |||||||||||||||    
T  35791118 ttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtt 35791186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 18531079 - 18531330
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  18531079 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 18531178  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |  ||||| |||| |||||| | |  |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  18531179 gtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattga 18531277  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |  ||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  18531278 tgttgttgttgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23514897 - 23514729
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  23514897 ggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 23514798  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  23514797 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 23514729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 1219440 - 1219608
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  1219440 ggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 1219539  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||||| |||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  1219540 ttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1219608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 10777890 - 10778058
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  10777890 ggtaaggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 10777989  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10777990 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10778058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 17471508 - 17471676
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||     
T  17471508 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctc 17471607  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17471608 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34939528 - 34939289
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  34939528 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 34939429  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |  |||||||||| |||||||| |  || || |||| | ||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||| ||||    
T  34939428 gtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttattgctgttaattga 34939331  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatg 325  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  34939330 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 21932301 - 21932469
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  21932301 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 21932400  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  21932401 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 21932469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 21938471 - 21938639
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  21938471 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 21938570  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  21938571 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 21938639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35582372 - 35582204
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  35582372 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 35582273  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  35582272 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 35582204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 135
Target Start/End: Original strand, 22883006 - 22883139
Alignment:
Q  3 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctttt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||| ||    
T  22883006 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctctt 22883105  T
Q  102 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 135  Q
    ||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||    
T  22883106 gctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatg 22883139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 36989690 - 36989858
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  36989690 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 36989789  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    | ||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  36989790 tagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 36989858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23328893 - 23328795
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23328893 ggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 23328795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24616497 - 24616399
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24616497 ggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 24616399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24712873 - 24712775
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24712873 ggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 24712775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24745891 - 24745793
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24745891 ggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 24745793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20623220 - 20623100
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  20623220 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 20623121  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  20623120 gaaaagttatgaaaattgtgc 20623100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Original strand, 21233540 - 21233660
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  21233540 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 21233639  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  21233640 gaaaagttatgaaaattgtgc 21233660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Original strand, 25900418 - 25900538
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   |||||  |||||    
T  25900418 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaaaat 25900517  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  25900518 gaaaagttatgaaaattgtgc 25900538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16536448 - 16536328
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  16536448 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 16536349  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  16536348 gaaaagttatgaaaattgtgc 16536328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37052995 - 37052875
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||   ||||    
T  37052995 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtggaaat 37052896  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  37052895 gaaaagttatgaaaattgtgc 37052875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32950943 - 32950862
Alignment:
Q  87 taaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||| || || || |||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  32950943 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 332
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  292 ttgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgat 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 19886578 - 19886913
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19886578 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 19886677  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19886678 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagatt 19886777  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886778 gtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 19886877  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19886878 aattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 17396665 - 17396916
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||    
T  17396665 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaat 17396763  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17396764 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 17396863  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  17396864 tattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 84 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 462989 - 462743
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  462989 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 462890  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||| | |  |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  462889 gataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 462791  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattga 331  Q
    | |  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  462790 tgtcgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Original strand, 19794735 - 19794967
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  19794735 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 19794834  T
Q  203 gctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
    ||| |  |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| ||||  ||||||||| |    
T  19794835 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatca 19794933  T
Q  303 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19794934 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8891493 - 8891242
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  8891493 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaat 8891394  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||    
T  8891393 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattga 8891295  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  8891294 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 36982453 - 36982704
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  36982453 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 36982552  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | | ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  36982553 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattga 36982651  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |  ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36982652 tgttgttgttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Original strand, 20627344 - 20627576
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||| |||||    
T  20627344 ctgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgt 20627443  T
Q  203 gctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
    ||| |  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||| | || || ||||||||| |    
T  20627444 gctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatca 20627542  T
Q  303 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  20627543 ttgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8944182 - 8944014
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  8944182 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 8944083  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8944082 ttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtt 8944014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12728728 - 12728560
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  12728728 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 12728629  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12728628 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12728560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 336
Target Start/End: Original strand, 43642989 - 43643220
Alignment:
Q  104 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||| |||| ||||||    
T  43642989 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtg 43643088  T
Q  204 ctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 303  Q
    || |  |||||||||| | || ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |     
T  43643089 ctcaattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcac 43643187  T
Q  304 tgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43643188 tgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 7507856 - 7508107
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7507856 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 7507955  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttg 282  Q
     |||||||||||| |||||| | |  ||||||||||   ||||||||||||||| ||||| | |||||| || || || |||||||||   |||||||||    
T  7507956 aataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-ggctaagttgttgttaa-ttgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 7508053  T
Q  283 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    || || |  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7508054 atgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 3798523 - 3798691
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  3798523 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctc 3798622  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  3798623 ttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 3798691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 23777965 - 23778133
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  23777965 ggtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctc 23778064  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |  | ||||  |||| | ||||||||||||||    
T  23778065 ttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtt 23778133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 24341401 - 24341652
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||    
T  24341401 tgctaaattcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaat 24341500  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |  ||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  24341501 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattga 24341599  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | ||    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  24341600 tgttcctgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34824811 - 34824643
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  34824811 ggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 34824712  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  34824711 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 34824643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 12635788 - 12635956
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  12635788 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgttgtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 12635887  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12635888 ttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12635956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 12641562 - 12641730
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  12641562 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctc 12641661  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| | ||||||||||||||    
T  12641662 ttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtt 12641730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16935929 - 16935761
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||     
T  16935929 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctc 16935830  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  |||||||||||||||    
T  16935829 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtt 16935761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17006589 - 17006421
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||     
T  17006589 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctc 17006490  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  |||||||||||||||    
T  17006489 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtt 17006421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 42177889 - 42178057
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  42177889 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 42177988  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  42177989 ttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtt 42178057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 11231258 - 11231426
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  11231258 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 11231357  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  11231358 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 11231426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 22513105 - 22513273
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  22513105 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 22513204  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22513205 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 22513273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 24685701 - 24685869
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  24685701 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 24685800  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  24685801 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 24685869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 28775727 - 28775895
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  28775727 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 28775826  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  28775827 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 28775895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 25265402 - 25265653
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  25265402 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 25265501  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |  ||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| ||||    
T  25265502 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattga 25265600  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |  || |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25265601 tgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23774472 - 23774374
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23774472 ggtaagggggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 23774374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Original strand, 19689413 - 19689533
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  19689413 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 19689512  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  19689513 gaaaagttatgaaaattgtgc 19689533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23820322 - 23820202
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  23820322 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 23820223  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  23820222 gaaaagttatgaaaattgtgc 23820202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 5888550 - 5888648
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5888550 ggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 5888648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Original strand, 14906452 - 14906572
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  14906452 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 14906551  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  14906552 gaaaagttatgaaaattgtgc 14906572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21142187 - 21142098
Alignment:
Q  45 tttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  21142187 tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 21142098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20015262 - 20015142
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  20015262 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 20015163  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  20015162 gaaaagttatgaaaattgtgc 20015142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25175899 - 25175563
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25175899 ggtaagggggttagtgattaccataatcatgtataattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctc 25175800  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175799 ttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 25175700  T
Q  200 tgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175699 tgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 25175600  T
Q  300 taattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25175599 taattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 27653904 - 27654235
Alignment:
Q  5 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttttgct 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27653904 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgct 27654003  T
Q  105 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654004 gtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 27654103  T
Q  205 taaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 304  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654104 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 27654203  T
Q  305 gcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27654204 gcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 336
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16826006
Alignment:
Q  10 gttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttttgctgtgat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16825678 gttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 16825777  T
Q  110 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825778 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaa 16825877  T
Q  208 ggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 307  Q
      ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16825878 attggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatctgatattatgattgatgaataattgct 16825977  T
Q  308 tgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  16825978 ttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 1650024 - 1650352
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1650024 ggtaagggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctct 1650121  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||    
T  1650122 tactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaatt 1650221  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  |||||||||    
T  1650222 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaat 1650320  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgat 332  Q
     | |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1650321 cactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 84 - 332
Target Start/End: Original strand, 14626130 - 14626377
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14626130 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 14626229  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    ||||||||||||| ||||||   |  ||||||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  14626230 gataagttatgaaaattgtgtgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 14626328  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgat 332  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14626329 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23153696 - 23153458
Alignment:
Q  86 ctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 185  Q
    |||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||    
T  23153696 ctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatga 23153597  T
Q  186 taagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgata 285  Q
    |||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||     
T  23153596 taagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatg 23153498  T
Q  286 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatg 325  Q
    || || ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||    
T  23153497 ttgtggttgatgaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16232228 - 16232060
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  16232228 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 16232129  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16232128 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16232060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1556341 - 1556173
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  1556341 ggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 1556242  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  1556241 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1556173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19610354 - 19610186
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  19610354 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctc 19610255  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19610254 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 19610186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 325
Target Start/End: Original strand, 1657760 - 1657999
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  1657760 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 1657859  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |  |||||||||| |||||||| |  || || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||| ||||    
T  1657860 gtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttattgttgttaattga 1657957  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatg 325  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  1657958 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 18086743 - 18086911
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  18086743 ggtaagggggttagttattagtataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 18086842  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18086843 ttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18086911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23978105 - 23977937
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  23978105 ggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctc 23978006  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  23978005 ttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 23977937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 35009451 - 35009702
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  35009451 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 35009550  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |  ||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| ||||    
T  35009551 gtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattga 35009649  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35009650 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 22251486 - 22251621
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||     
T  22251486 ggtatgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctc 22251585  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 135  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  22251586 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 22251621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10489035 - 10488867
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  10489035 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 10488936  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  10488935 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 10488867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 16376293 - 16376461
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  16376293 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 16376392  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16376393 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16376461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 16383617 - 16383785
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  16383617 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 16383716  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16383717 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16383785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 22225658 - 22225826
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||     
T  22225658 ggtatgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctc 22225757  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    || |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22225758 tttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 22225826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 16556059 - 16556227
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  16556059 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 16556158  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
     |||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16556159 ctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16556227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 16632615 - 16632783
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  16632615 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 16632714  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
     |||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16632715 ctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16632783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 19299573 - 19299467
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||     
T  19299573 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctc 19299474  T
Q  100 ttgctgt 106  Q
    |||||||    
T  19299473 ttgctgt 19299467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15862720 - 15862484
Alignment:
Q  86 ctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 185  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| | |||||     
T  15862720 ctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgt 15862621  T
Q  186 taagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgata 285  Q
     |||||||||| |||||||| |  || || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| | | |||||||   || || |||||     
T  15862620 gaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttc-atttatgttattgctgataattgatg 15862524  T
Q  286 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatg 325  Q
    || |  ||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  15862523 ttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29666208 - 29665941
Alignment:
Q  3 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||  || |||||||||||| |    
T  29666208 taagtgggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctct 29666109  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaaga 198  Q
     ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||| |||||  |||||||||| |    
T  29666108 agctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaa-a 29666010  T
Q  199 ttgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 268  Q
    |||| || |  |||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29666009 ttgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 13620714 - 13620882
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  13620714 ggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 13620813  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  13620814 ttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtt 13620882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 29869696 - 29869794
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29869696 ggtaagggggttagttattatcataatcaatttaaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 29869794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 27751675 - 27751603
Alignment:
Q  85 gctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 157  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751675 gctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19854402 - 19854317
Alignment:
Q  88 aaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 172  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||  | |||||| |||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  19854402 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 19854317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 29605672 - 29605612
Alignment:
Q  112 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 172  Q
    |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605672 tatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 47357987 - 47357654
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47357987 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttcctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 47357890  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357889 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 47357790  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357789 gtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 47357690  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47357689 aattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10644552 - 10644219
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  10644552 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 10644455  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||    
T  10644454 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 10644355  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644354 gtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 10644255  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10644254 aattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 112 - 328
Target Start/End: Original strand, 13048261 - 13048477
Alignment:
Q  112 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaggtg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  13048261 tatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattg 13048360  T
Q  212 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 311  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13048361 atgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttattagataatatgattaatgaataattgcttggg 13048460  T
Q  312 tatgcataatcatggat 328  Q
    | |||||| ||||||||    
T  13048461 tttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13246662 - 13246430
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  13246662 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 13246563  T
Q  203 gctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
    ||| |  |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  13246562 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 13246464  T
Q  303 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  13246463 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 336
Target Start/End: Original strand, 54118276 - 54118507
Alignment:
Q  104 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| ||||||    
T  54118276 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtg 54118375  T
Q  204 ctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 303  Q
    || |  |||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| || || ||||||||| ||    
T  54118376 ctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcat 54118474  T
Q  304 tgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  54118475 tgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 15675101 - 15675352
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  15675101 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 15675200  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |  ||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  15675201 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattga 15675299  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  15675300 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18169306 - 18169138
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  18169306 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 18169207  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18169206 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18169138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 31115861 - 31115629
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||| |||| ||| |    
T  31115861 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattat 31115762  T
Q  203 gctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
    ||| |  |||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |    
T  31115761 gctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatca 31115663  T
Q  303 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  31115662 ttgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 7131985 - 7132153
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  7131985 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 7132084  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  7132085 ttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 7132153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19020822 - 19020654
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19020822 ggtaagggggttagttaccatcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctc 19020723  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19020722 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 19020654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 15287165 - 15287333
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||     
T  15287165 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctc 15287264  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15287265 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15287333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 15294274 - 15294442
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||     
T  15294274 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctc 15294373  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15294374 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15294442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 17145577 - 17145745
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  17145577 ggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctc 17145676  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    || |||||||| ||| ||  | | |||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17145677 ttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17145745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20001059 - 20000891
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  20001059 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctc 20000960  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  20000959 ttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtt 20000891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18248554 - 18248421
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttg-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  18248554 ggtaagggggttagttattatcataatcttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctc 18248455  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 133  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  18248454 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 18248421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 122121 - 121989
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  122121 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 122022  T
Q  203 gctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgtta 236  Q
    ||| |  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  122021 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Original strand, 10104281 - 10104445
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||    
T  10104281 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgt 10104380  T
Q  203 gctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 268  Q
    ||| |  |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  10104381 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 8378480 - 8378377
Alignment:
Q  8 gggttagttattatcataatcatgtgtaattttg-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttttgctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  8378480 gggttagttattatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 8378381  T
Q  107 gatg 110  Q
    ||||    
T  8378380 gatg 8378377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26680451 - 26680201
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  26680451 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 26680352  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    || |||||||||| ||||||| ||   | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  26680351 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 26680254  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26680253 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22738568 - 22738437
Alignment:
Q  37 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||     
T  22738568 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 22738469  T
Q  137 tagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22738468 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22738437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 22351984 - 22352082
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  22351984 ggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgct 22352082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26339355 - 26339257
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26339355 ggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 26339257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 111492 - 111395
Alignment:
Q  239 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  111492 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10488813 - 10488693
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  10488813 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 10488714  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  10488713 gaaaagttatgaaaattgtgc 10488693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Original strand, 16327938 - 16328058
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  16327938 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 16328037  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  16328038 gaaaagttatgaaaattgtgc 16328058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 9795562 - 9795490
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 73  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9795562 ggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaattttttcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 9795490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Original strand, 40885585 - 40885749
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaagattg 201  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||  |||||||||| |||     
T  40885585 ctgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaa-atta 40885683  T
Q  202 tgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 268  Q
    |||| |  ||||||| || | ||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  40885684 tgctcaattggtgaactt-tgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33240951 - 33240900
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 135  Q
    |||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33240951 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 14996474 - 14996444
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996474 ggtaagggggttagttattatcataatcatg 14996444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 336
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  292 ttgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10989744 - 10989410
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  10989744 ggtatgggggttagtgattatcataatcatgtataattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctct 10989645  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10989644 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatatt 10989545  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989544 gtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 10989446  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10989445 aattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2437792 - 2437457
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  2437792 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctct 2437693  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437692 tgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 2437593  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437592 gtgttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 2437493  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  2437492 aattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 13910941 - 13911277
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13910941 ggtaagggggttattgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 13911040  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13911041 tgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatatt 13911140  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
     |||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911141 atgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 13911240  T
Q  300 taattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13911241 taatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13573010 - 13572676
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  13573010 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 13572912  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  13572911 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatatt 13572812  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13572811 gtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaat 13572712  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  13572711 aattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 18253763 - 18254098
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||     
T  18253763 ggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctc 18253862  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 199  Q
       |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||    
T  18253863 caactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaat 18253962  T
Q  200 tgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    |||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  18253963 tgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaa 18254061  T
Q  300 taattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18254062 taattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 16478881 - 16479213
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  16478881 ggtaagggggttagtgattatcataatcattt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctct 16478978  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  16478979 tactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 16479078  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||| |  |||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  |||||||||    
T  16479079 gtgctcaattggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaat 16479177  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
     | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16479178 cactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 106 - 330
Target Start/End: Original strand, 25292372 - 25292595
Alignment:
Q  106 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 205  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  25292372 tgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgct 25292471  T
Q  206 aaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 305  Q
     |  ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25292472 caattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgactaatgaataattg 25292570  T
Q  306 cttgggtatgcataatcatggattg 330  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||    
T  25292571 cttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 47481043 - 47481294
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  47481043 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 47481142  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||| | |  |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||   | ||| ||||    
T  47481143 gataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcgctcttaattga 47481241  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47481242 tgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 13037026 - 13037277
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | | ||||    
T  13037026 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaat 13037125  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||    
T  13037126 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattga 13037224  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  13037225 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 84 - 331
Target Start/End: Original strand, 11580751 - 11580997
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  11580751 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 11580850  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  11580851 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 11580949  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattga 331  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  11580950 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 84 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16212017 - 16211768
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  16212017 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaat 16211918  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||    
T  16211917 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattga 16211819  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatga 334  Q
    | || || ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  16211818 tgttgtggttgatgattcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36052896 - 36052667
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 202  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  36052896 ctgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 36052797  T
Q  203 gctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
    ||| |  |||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  36052796 gctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgatgaataa 36052701  T
Q  303 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36052700 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 3060217 - 3059966
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3060217 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 3060118  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    ||||| || |||| ||| |||| |  |||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  3060117 gataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattga 3060019  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  3060018 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 15950711 - 15950879
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  15950711 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 15950810  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15950811 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15950879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 18979941 - 18980109
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  18979941 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 18980040  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18980041 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18980109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13758706 - 13758538
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  13758706 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctc 13758607  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  13758606 ttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 13758538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 15760034 - 15760202
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  15760034 ggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctc 15760133  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  |  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  15760134 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15760202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15927904 - 15927736
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||     
T  15927904 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctc 15927805  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15927804 ttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtt 15927736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7823064 - 7822896
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  7823064 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 7822965  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  7822964 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 7822896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7830375 - 7830207
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  7830375 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 7830276  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  7830275 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 7830207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 27101557 - 27101725
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  27101557 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 27101656  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27101657 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27101725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 27108905 - 27109073
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  27108905 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 27109004  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27109005 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27109073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27176769 - 27176601
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  27176769 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 27176670  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27176669 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27176601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 38783649 - 38783817
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  38783649 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 38783748  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  38783749 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 38783817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13321267 - 13321014
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaa 181  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||| | ||    
T  13321267 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 13321168  T
Q  182 atgataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttg-ttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 280  Q
    |||  |||||||||| |||||||| |  |||||||||| | |||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| |    
T  13321167 atgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaat 13321070  T
Q  281 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||| | ||||| ||||||||||    
T  13321069 tgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15862255 - 15862174
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862255 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 48622586 - 48622756
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||  |  || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  48622586 ggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctc 48622685  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 170  Q
    || |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  48622686 ttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttca 48622756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 14250818 - 14250986
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||     
T  14250818 ggtaagggggttagttatcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctc 14250917  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  14250918 ttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtt 14250986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7293267 - 7293017
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  7293267 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 7293168  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    || |||||||||| ||||||| ||   | |||||||  |  | ||||||||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  7293167 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 7293070  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7293069 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11516478 - 11516358
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  11516478 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 11516379  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  11516378 gaaaagttatgaaaattgtgc 11516358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Original strand, 15441576 - 15441696
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  15441576 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 15441675  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  15441676 gaaaagttatgaaaattgtgc 15441696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Original strand, 30262141 - 30262261
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  30262141 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 30262240  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  30262241 gaaaagttatgaaaattgtgc 30262261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16418833 - 16418735
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16418833 ggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 16418735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Original strand, 10000325 - 10000388
Alignment:
Q  35 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  10000325 aattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgct 10000388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Original strand, 296003 - 296087
Alignment:
Q  109 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 193  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||| |||||||    
T  296003 tgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36428 - 36093
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36428 ggtaagggggttaatgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 36329  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36328 tgtagtgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 36229  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36228 gtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaat 36129  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36128 aattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48849 - 48598
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  48849 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaat 48750  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||    
T  48749 gataagttgtgaaaattgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattga 48651  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  48650 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Original strand, 169830 - 169951
Alignment:
Q  2 gtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctttt 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  169830 gtaagggggttagtgattatcataatcatgtataattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 169929  T
Q  102 gctgtgatgttatgtttgtatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  169930 gctgtgatgttatgtttgtatg 169951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 153927 - 154095
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  153927 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 154026  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||||| |||||||||    
T  154027 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtt 154095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30121058 - 30120722
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30121058 ggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctc 30120959  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30120958 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatat 30120859  T
Q  200 tgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120858 tgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 30120759  T
Q  300 taattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  30120758 taattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 16674310 - 16674644
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16674310 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctct 16674408  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16674409 ttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatatt 16674508  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16674509 gtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaat 16674608  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  16674609 aattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 21844490 - 21844824
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  21844490 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 21844588  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  21844589 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatatt 21844688  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844689 gtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 21844788  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  21844789 aattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 21851883 - 21852217
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  21851883 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 21851981  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  21851982 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatatt 21852081  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852082 gtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 21852181  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  21852182 aattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 6774177 - 6774505
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6774177 ggtaagggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctct 6774274  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  6774275 tactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 6774374  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  |||||||||    
T  6774375 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaat 6774473  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgat 332  Q
     | |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6774474 cactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24549314 - 24548986
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24549314 ggtaagggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctct 24549217  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||     
T  24549216 tactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatg 24549117  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||||    
T  24549116 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaat 24549018  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgat 332  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24549017 cattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 146 - 336
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222943
Alignment:
Q  146 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  246 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 146 - 336
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736566
Alignment:
Q  146 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  246 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 146 - 336
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860461
Alignment:
Q  146 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  246 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 78 - 336
Target Start/End: Original strand, 43373474 - 43373731
Alignment:
Q  78 aattcatgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgc 177  Q
    |||| ||||||||||||||||    |||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43373474 aattaatgctaaattcgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 43373573  T
Q  178 aaaaatgataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 277  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||    
T  43373574 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgtt 43373672  T
Q  278 atttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43373673 aattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 84 - 337
Target Start/End: Original strand, 16193728 - 16193980
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16193728 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 16193827  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | | || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  16193828 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 16193926  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatgt 337  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16193927 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 325
Target Start/End: Original strand, 24928803 - 24929043
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  24928803 tgctaaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 24928902  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||  ||||||||| |||   ||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||    
T  24928903 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattga 24929001  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatg 325  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24929002 tgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 22006178 - 22006346
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  22006178 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 22006277  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22006278 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22006346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 13720848 - 13721016
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  13720848 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 13720947  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  13720948 ttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 13721016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16195567 - 16195399
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||     
T  16195567 ggtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttctc 16195468  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
     |||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16195467 gtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16195399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 16872971 - 16873139
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  16872971 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctc 16873070  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16873071 ttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16873139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 16404987 - 16405235
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  16404987 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 16405086  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    | |||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||   |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  16405087 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattga 16405182  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  16405183 tgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 13662185 - 13662353
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||     
T  13662185 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctc 13662284  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||  ||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  13662285 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 13662353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 271280 - 271448
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  271280 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 271379  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  271380 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 271448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 644640 - 644472
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  644640 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 644541  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  644540 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 644472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 830375 - 830207
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  830375 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 830276  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  830275 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 830207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 15319079 - 15319188
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  15319079 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 15319178  T
Q  100 ttgctgtgat 109  Q
    ||||||||||    
T  15319179 ttgctgtgat 15319188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 15499448 - 15499557
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  15499448 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 15499547  T
Q  100 ttgctgtgat 109  Q
    ||||||||||    
T  15499548 ttgctgtgat 15499557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17345816 - 17345581
Alignment:
Q  88 aaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 187  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  |    
T  17345816 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtga 17345717  T
Q  188 agttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    ||||||||| |||||||| |  || || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||| ||||   ||||| ||||| ||    
T  17345716 agttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatattattgttgttaattgatgtt 17345619  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatg 325  Q
     |  ||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  17345618 gttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 22088714 - 22088882
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  22088714 ggtaagggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 22088813  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22088814 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtt 22088882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 207
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691969
Alignment:
Q  146 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaa 691969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 22907226 - 22907476
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  22907226 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 22907325  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    || |||||||||| ||||||| ||   | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  22907326 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 22907423  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22907424 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5238338 - 5238218
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  5238338 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 5238239  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  5238238 gaaaagttatgaaaattgtgc 5238218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Original strand, 24661260 - 24661380
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  24661260 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 24661359  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  24661360 gaaaagttatgaaaattgtgc 24661380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43685797 - 43685677
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  43685797 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 43685698  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  43685697 gaaaagttatgaaaattgtgc 43685677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 55316553 - 55316219
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55316553 ggtaaaggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 55316455  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55316454 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatatt 55316355  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  55316354 gtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaat 55316255  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  55316254 aattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 41270409 - 41270075
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41270409 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 41270311  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41270310 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatatt 41270211  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41270210 gtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaat 41270111  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41270110 aattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16821472 - 16821139
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||| |    
T  16821472 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgctct 16821375  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||  |||    
T  16821374 tgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtatt 16821275  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821274 gtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 16821175  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  16821174 aattgcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 15936555 - 15936890
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||     
T  15936555 ggtatgggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctc 15936654  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 199  Q
       |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||    
T  15936655 caactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaat 15936754  T
Q  200 tgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    |||||| |  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  15936755 tgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaa 15936853  T
Q  300 taattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15936854 taattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15615166 - 15614838
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  15615166 ggtaagggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgctct 15615069  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||     
T  15615068 tactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatg 15614969  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||||    
T  15614968 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaat 15614870  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgat 332  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15614869 cattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 15938397 - 15938729
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||     
T  15938397 ggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgctc 15938496  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 199  Q
       |||| ||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||    
T  15938497 caactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaat 15938596  T
Q  200 tgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    |||||| |  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  15938597 tgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaa 15938695  T
Q  300 taattgcttgggtatgcataatcatggattgatg 333  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  15938696 taattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 14842573 - 14842824
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  14842573 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaat 14842672  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  14842673 gataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattga 14842771  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14842772 tgttatgattgatgaataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 13975734 - 13975985
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  13975734 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 13975832  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13975833 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 13975932  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  13975933 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 45861056 - 45860805
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  45861056 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 45860958  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45860957 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 45860858  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  45860857 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 84 - 337
Target Start/End: Original strand, 51158030 - 51158282
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  51158030 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 51158129  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  51158130 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 51158228  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatgt 337  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  51158229 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 15859036 - 15859287
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  15859036 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaat 15859135  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  15859136 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 15859234  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15859235 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 13954902 - 13955153
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  13954902 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 13955000  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13955001 gatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 13955100  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  13955101 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 12030159 - 12030410
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  12030159 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagt 12030258  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| ||||  ||||||| |  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  12030259 gataagttgtgaaagttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattga 12030357  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12030358 tgttatggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2050061 - 2049810
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  2050061 tgctaaattcgtgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacat 2049962  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    ||||| || |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  2049961 gataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattga 2049863  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2049862 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13839145 - 13838905
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  13839145 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 13839046  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  13839045 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 13838947  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatg 325  Q
    | || || ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  13838946 tgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 12264712 - 12264880
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  12264712 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 12264811  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12264812 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12264880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 49232772 - 49232604
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  49232772 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 49232673  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  49232672 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 49232604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 12902010 - 12902178
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||     
T  12902010 ggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgctc 12902109  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12902110 ttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12902178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18911329 - 18911161
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  18911329 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 18911230  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18911229 ttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18911161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22275545 - 22275377
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  22275545 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 22275446  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    |||||||||||  || ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22275445 ttgctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22275377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25059075 - 25058907
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  25059075 ggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 25058976  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25058975 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 25058907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 15468260 - 15468428
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||     
T  15468260 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctc 15468359  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15468360 ttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15468428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 18896964 - 18897099
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||     
T  18896964 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctc 18897063  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 135  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  18897064 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 18897099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 1467659 - 1467827
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  1467659 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 1467758  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  1467759 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 1467827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 336
Target Start/End: Original strand, 17912516 - 17912744
Alignment:
Q  106 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||     
T  17912516 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 17912615  T
Q  206 aaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 305  Q
    ||  || ||||||  |  || ||||| ||| | ||||| | |||||| |||||||  ||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||    
T  17912616 aaattgatgaatt--tgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactg 17912713  T
Q  306 cttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17912714 cttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5228648 - 5228481
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||     
T  5228648 ggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtgttatgaaaatgggttgatgaac-attgttgctaaattcgtgctc 5228550  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||||||| |   | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  5228549 ttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 5228481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 54651793 - 54651625
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||     
T  54651793 ggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctc 54651694  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  54651693 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgtt 54651625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 12812177 - 12812042
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||     
T  12812177 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctc 12812078  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 135  Q
    ||||||| ||| ||| ||  | ||| ||||||||||    
T  12812077 ttgctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatg 12812042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Original strand, 2449250 - 2449370
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  2449250 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 2449349  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  2449350 gaaaagttatgaaaattgtgc 2449370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44229277 - 44229153
Alignment:
Q  45 tttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgt 143  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||    
T  44229277 tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggt 44229178  T
Q  144 ataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||  |||| | ||||||||||||||    
T  44229177 atgtttgtggatgaaattacatgtt 44229153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Original strand, 16744149 - 16744247
Alignment:
Q  106 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 204  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  16744149 tgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16744247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984650
Alignment:
Q  223 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatc 322  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  323 atggattgatgatg 336  Q
    ||| ||||||||||    
T  47984663 atgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993937
Alignment:
Q  223 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatc 322  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  323 atggattgatgatg 336  Q
    ||| ||||||||||    
T  47993950 atgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003224
Alignment:
Q  223 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatc 322  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  323 atggattgatgatg 336  Q
    ||| ||||||||||    
T  48003237 atgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012510
Alignment:
Q  223 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatc 322  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  323 atggattgatgatg 336  Q
    ||| ||||||||||    
T  48012523 atgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 8268653 - 8268683
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268653 ggtaagggggttagttattatcataatcatg 8268683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 8275753 - 8275783
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8275753 ggtaagggggttagttattatcataatcatg 8275783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 168
Target Start/End: Original strand, 11986181 - 11986262
Alignment:
Q  87 taaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||| || || ||||||| || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11986181 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 336
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468596
Alignment:
Q  295 atgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 41661812 - 41661727
Alignment:
Q  88 aaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 172  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||| || ||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  41661812 aaattcgtgctcttgctatgatgatatgtttgaatacatggaaatgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 41661727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 336
Target Start/End: Original strand, 16744333 - 16744377
Alignment:
Q  292 ttgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  16744333 ttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 5072306 - 5072640
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5072306 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 5072404  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5072405 tgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatatt 5072504  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5072505 gtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaat 5072604  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5072605 aattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 37 - 336
Target Start/End: Original strand, 18601071 - 18601370
Alignment:
Q  37 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601071 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 18601170  T
Q  137 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgtta 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18601171 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgtta 18601270  T
Q  237 atttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18601271 agttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22228144 - 22227809
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22228144 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctc 22228045  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 199  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22228044 ttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaat 22227945  T
Q  200 tgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    ||||   |  || ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22227944 tgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaa 22227846  T
Q  300 taattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22227845 taattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22232841 - 22232506
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22232841 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctc 22232742  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 199  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22232741 ttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaat 22232642  T
Q  200 tgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    ||||   |  || ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22232641 tgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaa 22232543  T
Q  300 taattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22232542 taattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2116587 - 2116258
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2116587 ggtaaaggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgcttt 2116490  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||     
T  2116489 tactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatg 2116390  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttga-gttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    ||||| |  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||    
T  2116389 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaa 2116291  T
Q  300 taattgcttgggtatgcataatcatggattgat 332  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2116290 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 45051755 - 45051489
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  45051755 ggtaagggggttagtctttatcataatcatgtg--attttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgttct 45051658  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  45051657 tactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 45051558  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 270  Q
    ||||| |  |||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051557 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20931596 - 20931345
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20931596 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaat 20931497  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  20931496 gataagttatgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 20931398  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20931397 tgttgtggttgatgaataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20913281 - 20913037
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20913281 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaat 20913182  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| | | |||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  20913181 gataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaatt-------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 20913090  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20913089 tcttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Original strand, 20893657 - 20893889
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  20893657 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 20893756  T
Q  203 gctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
    ||| |  |||||||||| | ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  20893757 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatca 20893855  T
Q  303 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  20893856 ttgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 41394473 - 41394222
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  41394473 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaat 41394374  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  41394373 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 41394275  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |  ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41394274 tgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20445910 - 20445679
Alignment:
Q  104 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  |||| ||||||    
T  20445910 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtg 20445811  T
Q  204 ctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 303  Q
    || |  |||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||    
T  20445810 ctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcat 20445712  T
Q  304 tgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20445711 tgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 46523724 - 46523557
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  46523724 ggtaagggggttagttattatcataatcatgttccattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctct 46523625  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    || ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||  |  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  46523624 tgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtt 46523557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 18059678 - 18059846
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||     
T  18059678 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctc 18059777  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  18059778 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 18059846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 112 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20531667 - 20531444
Alignment:
Q  112 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaggtg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  |||| |||||||| |  ||    
T  20531667 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattg 20531568  T
Q  212 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 311  Q
    |||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||    
T  20531567 gtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 20531469  T
Q  312 tatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20531468 tatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 336
Target Start/End: Original strand, 37844484 - 37844714
Alignment:
Q  106 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta-tgaagattgtgc 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||  || |||| |||||||    
T  37844484 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtgaaaattgtgc 37844583  T
Q  205 taaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 304  Q
    | |  |  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||| | |||    
T  37844584 tcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgagtcatt 37844682  T
Q  305 gcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  37844683 gcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17148898 - 17148735
Alignment:
Q  6 gggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttttgct 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |    
T  17148898 gggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgtt 17148799  T
Q  105 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    || ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17148798 gtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17148735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17004974 - 17004806
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  17004974 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 17004875  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  17004874 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 17004806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 38055011 - 38055179
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||    
T  38055011 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctt 38055110  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    || |||||||||||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  38055111 ttactgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 38055179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 19962419 - 19962525
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||     
T  19962419 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctc 19962518  T
Q  100 ttgctgt 106  Q
    |||||||    
T  19962519 ttgctgt 19962525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 22035783 - 22035685
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22035783 ggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 22035685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 7640854 - 7640952
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7640854 ggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 7640952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 51452743 - 51452623
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  51452743 tgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 51452644  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  51452643 gaaaagttatgaaaattgtgc 51452623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 336
Target Start/End: Original strand, 31593 - 31928
Alignment:
Q  2 gtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctttt 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31593 gtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 31692  T
Q  102 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattg 201  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31693 gtggtgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatatta 31792  T
Q  202 tgctaaggtggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    |||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31793 tgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaat 31892  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  31893 aattgcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 128181 - 128431
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| || || |||  |    
T  128181 tgctaaattcgtgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggt 128280  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    | |||||| |||| |||||||| |  ||| |||||| |  || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  128281 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatgga 128378  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  128379 tgttgtgattgatgaataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 43331 - 42997
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||     
T  43331 ggtaagggggttagttactatcacaaacatgt--aattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctc 43234  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 199  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  43233 ttgctgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagat 43134  T
Q  200 tgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43133 tgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 43034  T
Q  300 taattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43033 taattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39439 - 39271
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  39439 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 39340  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  39339 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 39271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 21033 - 21367
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21033 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctct 21132  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21133 tgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagatt 21232  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    | ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21233 gagctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaat 21331  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||    
T  21332 aattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 13979 - 14312
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |    
T  13979 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaat-cgtgctct 14077  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14078 tgctgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagatt 14177  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14178 gtgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaat 14276  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  14277 aattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 367 - 35
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  367 ggtaagggggttagttattatcaaaatcatgt--aattttgcattg-ctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 271  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  270 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatatt 171  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  170 gtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaat 71  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||    
T  70 aattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 64441 - 64780
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  64441 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 64539  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt-----gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 195  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||     |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  64540 tgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatga 64639  T
Q  196 agattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 295  Q
    | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  64640 atattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaa 64739  T
Q  296 tgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  64740 tgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 108082 - 107747
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||     
T  108082 ggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctc 107983  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 199  Q
       |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | || ||    
T  107982 caactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaaat 107883  T
Q  200 tgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    |||||| |  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  107882 tgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaa 107784  T
Q  300 taattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  107783 taattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 9268 - 9596
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9268 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttt 9365  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||     
T  9366 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatg 9465  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||||    
T  9466 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaat 9564  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgat 332  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9565 cattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 16166 - 16494
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16166 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttt 16263  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||     
T  16264 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatg 16363  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    ||||| |  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||||    
T  16364 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaat 16462  T
Q  301 aattgcttgggtatgcataatcatggattgat 332  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16463 cattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4058 - 3722
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  4058 ggtaaggggtttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctc 3959  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatg-caaaaatgataagttatgaaga 198  Q
    ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | |    
T  3958 ttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaa 3859  T
Q  199 ttgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 298  Q
    |||||   |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3858 ttgtgtccaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatga 3760  T
Q  299 ataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3759 ataattacttgggtttgcatattcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 5132 - 5466
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  5132 ggtaagggagttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctc 5231  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 199  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5232 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaat 5331  T
Q  200 tgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    |||| | |  |||||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  5332 tgtgttcaattggtgaattt-tgctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaa 5430  T
Q  300 taattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5431 taattgcttgggt-tgcatattcatggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 1222 - 1450
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1222 ggtaggggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 1320  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1321 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatatt 1420  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttg 230  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  1421 gtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3297 - 2966
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3297 ggtaagggggttaattattatcataattatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctct 3198  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||    
T  3197 tgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaatt 3098  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||    
T  3097 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaa 2999  T
Q  300 taattgcttgggtatgcataatcatggattgat 332  Q
    | | |||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  2998 tcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 84 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5780 - 5544
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  5780 tgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 5681  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5680 gataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5581  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataat 321  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5580 taatatgattaatgaataattgcttgggt-tgcataat 5544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 13244 - 13480
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13244 ggtaagggggttagtgattatcataatcatgt--aatttttcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctct 13341  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 200  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||     
T  13342 tagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatg 13441  T
Q  201 gtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaattt 240  Q
    ||||| |  |||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  13442 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaattt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 84 - 334
Target Start/End: Original strand, 3594 - 3843
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3594 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 3693  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  3694 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattga 3792  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatga 334  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3793 tgttgtgattgaggaataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1375 - 1124
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1375 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 1276  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  1275 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 1177  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  1176 tattgtggttgatgaataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12364 - 12115
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || ||||||    
T  12364 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaat 12265  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||  | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12264 gataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattga 12168  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12167 tgttatgattcatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6326
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6076 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6175  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
     ||||||| | || |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||      
T  6176 aataagttgtaaaaattgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttt 6273  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6274 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 968 - 1218
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  968 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 1067  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
     ||||||| |||| |||||||| |  || ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  1068 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 1165  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1166 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48438 - 48187
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  48438 tgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaat 48339  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  48338 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaattga 48240  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48239 tgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 104 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9109 - 8878
Alignment:
Q  104 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| |||| ||||||    
T  9109 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaaattgtg 9010  T
Q  204 ctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 303  Q
    || |  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  9009 ctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataat 8911  T
Q  304 tgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8910 tgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 148953 - 148721
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  148953 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 148854  T
Q  203 gctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
    ||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || || ||||||||| |    
T  148853 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatca 148755  T
Q  303 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  148754 ttgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9100 - 8849
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  9100 tgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 9001  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |  ||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||  ||||||| |||||||||   | ||| ||||    
T  9000 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattga 8902  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  8901 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19457 - 19206
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19457 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 19358  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  19357 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattga 19259  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19258 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 21541 - 21290
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21541 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 21442  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  21441 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattga 21343  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21342 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 104 - 336
Target Start/End: Original strand, 123196 - 123427
Alignment:
Q  104 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| ||||||    
T  123196 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtg 123295  T
Q  204 ctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 303  Q
    || |  |||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  123296 ctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataat 123394  T
Q  304 tgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  123395 ggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Original strand, 36944 - 37176
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  36944 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 37043  T
Q  203 gctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  37044 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 37142  T
Q  303 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37143 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Original strand, 5092 - 5324
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  5092 ctgtgacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 5191  T
Q  203 gctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
    ||| |  |||||||||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| |    
T  5192 gctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatca 5290  T
Q  303 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5291 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 325
Target Start/End: Original strand, 247454 - 247694
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | | ||||    
T  247454 tgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaat 247553  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  247554 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattga 247652  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatg 325  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  247653 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 34078 - 34246
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  34078 ggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtgct 34176  T
Q  99 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
     ||||||||| | ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  34177 cttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 34246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 26427 - 26678
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  26427 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaat 26526  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    |||||||| |||| ||||| || |  |||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  26527 gataagttgtgaaaattgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 26625  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  26626 tgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 219
Target Start/End: Original strand, 8192 - 8327
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  8192 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaat 8291  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaattt 219  Q
    |  ||||| |||| |||||||| |  ||||||||||    
T  8292 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 172137 - 171916
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  172137 ctgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 172038  T
Q  203 gctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  172037 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 171939  T
Q  303 ttgcttgggtatgcataatcatg 325  Q
    |||||| |||||||||| |||||    
T  171938 ttgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 177840 - 177619
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  177840 ctgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 177741  T
Q  203 gctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  177740 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 177642  T
Q  303 ttgcttgggtatgcataatcatg 325  Q
    |||||| |||||||||| |||||    
T  177641 ttgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41980 - 41733
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  41980 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaat 41881  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    ||||| || |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||     
T  41880 gataatttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgt 41782  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgat 332  Q
    | || |   |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41781 tgttgtagatgatgaatcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 546 - 797
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  546 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 645  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    ||| |||| |||| ||||| || |  |||||||||| | |||||||  |||||  || |||| ||||||||||| || ||||||||||  || || ||||    
T  646 gatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggctgctaattga 744  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||    
T  745 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 1495 - 1663
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||      
T  1495 ggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcac 1594  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  1595 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 34376 - 34724
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattcatgct 87  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | ||||  ||||    
T  34376 ggtaagagggttagttattatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaatgaatggataattattgct 34475  T
Q  88 aaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 187  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||   |    
T  34476 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaatatga 34575  T
Q  188 agttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 286  Q
    |||| |||| ||||| || |   ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||||| |    
T  34576 agttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgt 34674  T
Q  287 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | |  ||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34675 tgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 272257 - 272031
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 202  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  272257 ctgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 272158  T
Q  203 gctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  272157 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 272059  T
Q  303 ttgcttgggtatgcataatcatggattg 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  272058 ttgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2729 - 2560
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa--ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  2729 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgct 2630  T
Q  99 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
     |||| |||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  2629 cttgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 1434 - 1602
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  1434 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 1533  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  1534 ttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 1602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 29498 - 29388
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||     
T  29498 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctc 29399  T
Q  100 ttgctgtgatg 110  Q
    |||||||||||    
T  29398 ttgctgtgatg 29388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 10668 - 10778
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  10668 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 10767  T
Q  100 ttgctgtgatg 110  Q
    ||| |||||||    
T  10768 ttgttgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31645 - 31477
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  31645 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctc 31546  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  31545 ttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 31477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39814
Alignment:
Q  47 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtata 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  147 attgttggtgaaattacatgtt 168  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgtt 39814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 230 - 336
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  230 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggatt 329  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  330 gatgatg 336  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 7376 - 7509
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||     
T  7376 ggtaagggggttagttattatcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctc 7475  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 133  Q
    ||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  7476 ttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 7509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 41896 - 41648
Alignment:
Q  87 taaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 186  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||      
T  41896 taaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtg 41797  T
Q  187 aagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 286  Q
    ||||| |||| |||||| | |  |||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   |||||  |||| |    
T  41796 aagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgatgt 41698  T
Q  287 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41697 tgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  230 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggatt 329  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  330 gatgatg 336  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Original strand, 10279 - 10427
Alignment:
Q  21 tcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttg 119  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||      
T  10279 tcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttct 10378  T
Q  120 tatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10379 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 54210 - 54040
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctt 99  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||  |  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  54210 ggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctc 54111  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 170  Q
    || |||||||| | | ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  54110 ttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttca 54040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3712 - 3579
Alignment:
Q  37 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| | ||  | | ||||||||||||     
T  3712 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatga 3613  T
Q  137 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 170  Q
    |  | |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3612 ttatggtatgattgtgggtgaaattacatgttca 3579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13757 - 13636
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  13757 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 13658  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgct 205  Q
    |  ||||| |||| ||||||||    
T  13657 gtgaagttgtgaaaattgtgct 13636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 45367 - 45198
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||     
T  45367 ggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgcc 45268  T
Q  99 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
     ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45267 cttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 54753 - 54584
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    ||||||| |||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||      
T  54753 ggtaaggtggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgtc 54654  T
Q  99 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
     ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  54653 cttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtt 54584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 6933 - 6835
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6933 ggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 6835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Original strand, 51194 - 51328
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  51194 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaat 51293  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatt 218  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||    
T  51294 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Original strand, 89466 - 89600
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  89466 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 89565  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatt 218  Q
     ||||||| |||| |||||||| |  |||||||||    
T  89566 tataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3447 - 3360
Alignment:
Q  78 aattcatgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 165  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3447 aattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 239 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9479 - 9382
Alignment:
Q  239 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9479 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 336
Target Start/End: Original strand, 37078 - 37328
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  37078 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 37177  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgctaaggtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 283  Q
    || |||||||||| ||||||| ||   | |||||||  |  | ||||| |||   ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  37178 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 37275  T
Q  284 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 336  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37276 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 98
Target Start/End: Original strand, 23671 - 23767
Alignment:
Q  3 taagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  23671 taagggggttagttattatcatattcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgct 23767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 12047 - 12145
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12047 ggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaatttttcattt-ctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgct 12145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 7545 - 7447
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 98  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7545 ggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 7447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22791 - 22671
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  22791 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 22692  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  22691 gaaaagttatgaaaattgtgc 22671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27046 - 26926
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  27046 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 26947  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  26946 gaaaagttatgaaaattgtgc 26926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Original strand, 1594 - 1714
Alignment:
Q  84 tgctaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 183  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  1594 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 1693  T
Q  184 gataagttatgaagattgtgc 204  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  1694 gaaaagttatgaaaattgtgc 1714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 13270 - 13342
Alignment:
Q  1 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 73  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13270 ggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 13342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 168
Target Start/End: Original strand, 56114 - 56195
Alignment:
Q  87 taaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 168  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  56114 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgtt 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5920 times since January 2019
Visitors: 4860