View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0755_high_45 (Length: 277)

Name: NF0755_high_45
Description: NF0755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0755_high_45
NF0755_high_45
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (1-257)||(5866139-5866395)
chr8 (1-257)||(17140916-17141172)
chr8 (1-257)||(21490995-21491251)
chr8 (1-257)||(21249384-21249640)
chr8 (1-257)||(21255222-21255478)
chr8 (1-253)||(26355562-26355815)
chr8 (1-257)||(6520368-6520626)
chr8 (1-257)||(38855114-38855372)
chr8 (1-257)||(23760703-23760962)
chr8 (1-241)||(21285613-21285856)
chr8 (1-238)||(20498581-20498822)
chr8 (1-241)||(21673720-21673962)
chr8 (181-257)||(21396025-21396101)
chr8 (181-257)||(21790518-21790594)
chr8 (181-257)||(21389495-21389571)
chr8 (181-257)||(21778821-21778897)
chr8 (4-241)||(983267-983511)
chr8 (89-257)||(17612059-17612231)
chr8 (159-257)||(31971257-31971354)
chr8 (144-257)||(22626736-22626848)
chr8 (181-257)||(21919046-21919121)
chr8 (134-260)||(6759255-6759381)
chr8 (181-257)||(7372778-7372853)
chr8 (185-257)||(16199693-16199765)
chr8 (181-257)||(18818455-18818530)
chr8 (181-257)||(18879277-18879352)
chr8 (181-257)||(23406379-23406454)
chr8 (73-238)||(17439439-17439609)
chr8 (183-256)||(28649092-28649164)
chr8 (25-238)||(37116366-37116584)
chr8 (181-257)||(16092388-16092463)
chr8 (181-257)||(20536208-20536283)
chr8 (181-257)||(21923974-21924049)
chr8 (181-257)||(45131042-45131117)
chr8 (82-250)||(13508027-13508199)
chr8 (156-250)||(13597637-13597731)
chr8 (144-238)||(17267000-17267096)
chr8 (144-257)||(22875065-22875177)
chr8 (144-238)||(24353039-24353134)
chr8 (204-254)||(1484402-1484452)
chr8 (204-254)||(4542485-4542535)
chr8 (204-254)||(5853404-5853454)
chr8 (204-254)||(14409556-14409606)
chr8 (204-254)||(19896265-19896315)
chr8 (204-254)||(20046307-20046357)
chr8 (204-254)||(20403227-20403277)
chr8 (204-254)||(22001753-22001803)
chr8 (204-254)||(26225359-26225409)
chr8 (204-260)||(19937118-19937174)
chr8 (204-254)||(15203343-15203393)
chr8 (204-250)||(16413428-16413474)
chr8 (184-238)||(19154935-19154989)
chr8 (204-254)||(26219717-26219767)
chr8 (204-254)||(41598188-41598238)
chr8 (204-250)||(45290807-45290853)
chr8 (204-241)||(15070571-15070608)
chr8 (211-254)||(4483281-4483324)
chr8 (204-254)||(25484380-25484430)
chr8 (204-255)||(18678170-18678221)
chr8 (204-238)||(19801493-19801527)
chr8 (186-236)||(22525579-22525628)
chr8 (89-150)||(18862427-18862488)
chr8 (89-150)||(21383920-21383981)
chr8 (89-150)||(21387340-21387401)
chr8 (89-150)||(21411213-21411274)
chr8 (89-150)||(21805705-21805766)
chr8 (89-150)||(21827796-21827857)
chr8 (204-256)||(26223917-26223969)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (1-257)||(34200786-34201042)
chr7 (1-257)||(11995892-11996148)
chr7 (1-257)||(28505163-28505419)
chr7 (1-257)||(15754751-15755008)
chr7 (89-257)||(16495402-16495570)
chr7 (1-257)||(67745-68003)
chr7 (1-253)||(44014182-44014431)
chr7 (1-257)||(16219579-16219835)
chr7 (4-253)||(18005650-18005902)
chr7 (1-257)||(47831807-47832066)
chr7 (1-253)||(810993-811248)
chr7 (1-241)||(16056344-16056586)
chr7 (1-257)||(22072913-22073174)
chr7 (25-238)||(20220075-20220290)
chr7 (181-257)||(16386293-16386369)
chr7 (25-241)||(12901339-12901559)
chr7 (144-257)||(2280127-2280238)
chr7 (181-257)||(12698831-12698906)
chr7 (1-172)||(15113028-15113202)
chr7 (144-254)||(3564372-3564482)
chr7 (1-119)||(15116621-15116739)
chr7 (180-257)||(9509189-9509265)
chr7 (144-257)||(38227481-38227593)
chr7 (181-257)||(27847875-27847951)
chr7 (82-241)||(1867937-1868100)
chr7 (181-255)||(40443393-40443467)
chr7 (181-257)||(10589039-10589114)
chr7 (185-257)||(13647325-13647396)
chr7 (144-254)||(18456421-18456530)
chr7 (82-257)||(19486686-19486865)
chr7 (181-257)||(26211995-26212071)
chr7 (154-235)||(12255809-12255892)
chr7 (73-241)||(14044762-14044935)
chr7 (73-241)||(14354792-14354965)
chr7 (82-234)||(15008441-15008597)
chr7 (156-257)||(10063838-10063939)
chr7 (204-257)||(18430709-18430762)
chr7 (181-254)||(48273392-48273464)
chr7 (204-254)||(456321-456371)
chr7 (204-254)||(3386333-3386383)
chr7 (204-254)||(11972496-11972546)
chr7 (204-254)||(13869346-13869396)
chr7 (204-254)||(14949234-14949284)
chr7 (204-254)||(15376825-15376875)
chr7 (204-254)||(16213684-16213734)
chr7 (204-254)||(16232520-16232570)
chr7 (204-254)||(16410059-16410109)
chr7 (204-254)||(17062027-17062077)
chr7 (204-254)||(18640272-18640322)
chr7 (204-254)||(20110556-20110606)
chr7 (204-254)||(20385235-20385285)
chr7 (204-254)||(21189707-21189757)
chr7 (204-254)||(24702238-24702288)
chr7 (204-254)||(24704688-24704738)
chr7 (204-254)||(32125491-32125541)
chr7 (204-254)||(41522917-41522967)
chr7 (204-254)||(41525379-41525429)
chr7 (204-253)||(11393399-11393448)
chr7 (195-254)||(13831373-13831431)
chr7 (1-68)||(16324197-16324264)
chr7 (184-231)||(48991206-48991253)
chr7 (204-250)||(24275175-24275221)
chr7 (204-254)||(27216860-27216910)
chr7 (204-254)||(44116509-44116559)
chr7 (204-241)||(15144105-15144142)
chr7 (204-250)||(38898489-38898535)
chr7 (159-229)||(14036282-14036354)
chr7 (159-229)||(14346312-14346384)
chr7 (188-236)||(9177718-9177766)
chr7 (204-239)||(18154909-18154944)
chr7 (204-253)||(14932802-14932851)
chr7 (204-253)||(15356237-15356286)
chr7 (204-253)||(15360351-15360400)
chr7 (186-238)||(18203831-18203882)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (1-257)||(34123-34379)
scaffold0175 (204-257)||(273-326)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (1-257)||(19660700-19660956)
chr5 (1-253)||(22959397-22959649)
chr5 (1-257)||(19668898-19669156)
chr5 (1-253)||(21565546-21565801)
chr5 (1-257)||(21329359-21329618)
chr5 (1-257)||(21502016-21502277)
chr5 (1-257)||(26011897-26012154)
chr5 (1-238)||(20026802-20027043)
chr5 (156-257)||(36314577-36314678)
chr5 (181-257)||(21729110-21729185)
chr5 (181-257)||(21808435-21808510)
chr5 (181-257)||(25421532-25421607)
chr5 (181-254)||(24529223-24529295)
chr5 (181-257)||(8286889-8286964)
chr5 (181-257)||(21997580-21997655)
chr5 (181-257)||(23390542-23390617)
chr5 (144-238)||(22144068-22144162)
chr5 (144-257)||(24493569-24493681)
chr5 (181-250)||(37723910-37723979)
chr5 (181-257)||(13025311-13025386)
chr5 (181-257)||(13095495-13095570)
chr5 (181-257)||(21293015-21293090)
chr5 (82-238)||(22178162-22178323)
chr5 (183-257)||(9077952-9078025)
chr5 (144-254)||(22412187-22412296)
chr5 (181-257)||(22075018-22075094)
chr5 (82-257)||(40725853-40726032)
chr5 (204-257)||(1096467-1096520)
chr5 (181-257)||(25431395-25431469)
chr5 (203-254)||(20909012-20909063)
chr5 (89-136)||(36314672-36314719)
chr5 (204-254)||(264880-264930)
chr5 (204-254)||(2154726-2154776)
chr5 (204-254)||(10733052-10733102)
chr5 (204-254)||(11581311-11581361)
chr5 (204-254)||(20918060-20918110)
chr5 (204-254)||(29329934-29329984)
chr5 (204-254)||(36154892-36154942)
chr5 (204-254)||(38619434-38619484)
chr5 (204-254)||(39245136-39245186)
chr5 (204-254)||(39363384-39363434)
chr5 (204-253)||(23064512-23064561)
chr5 (206-254)||(10775790-10775838)
chr5 (204-254)||(29345980-29346030)
chr5 (204-254)||(31061068-31061118)
chr5 (204-254)||(42245477-42245527)
chr5 (204-241)||(20902121-20902158)
chr5 (204-251)||(18319146-18319193)
chr5 (207-254)||(29348453-29348500)
chr5 (207-254)||(29350926-29350973)
chr5 (195-254)||(32027393-32027451)
chr5 (204-254)||(20806854-20806904)
chr5 (204-253)||(26704075-26704124)
chr5 (204-253)||(26973808-26973857)
chr5 (187-241)||(26732884-26732937)
chr5 (89-150)||(10753627-10753688)
chr5 (181-241)||(18418596-18418656)
chr5 (89-150)||(22120146-22120207)
chr5 (1-49)||(21741407-21741455)
chr5 (92-148)||(21741486-21741541)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (1-257)||(11292-11548)
scaffold0046 (25-257)||(1997-2229)
scaffold0046 (181-257)||(28414-28489)
scaffold0046 (201-257)||(4552-4608)
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (1-257)||(15551817-15552072)
chr4 (1-219)||(16596686-16596904)
chr4 (1-253)||(12774011-12774256)
chr4 (1-238)||(13712-13953)
chr4 (1-253)||(8846360-8846631)
chr4 (1-241)||(12288071-12288315)
chr4 (1-257)||(39706151-39706409)
chr4 (15-241)||(43198428-43198660)
chr4 (181-257)||(3096293-3096368)
chr4 (181-257)||(12902757-12902832)
chr4 (184-257)||(17046487-17046560)
chr4 (181-257)||(7088877-7088952)
chr4 (181-257)||(7798774-7798849)
chr4 (144-241)||(52243202-52243301)
chr4 (181-257)||(52873413-52873488)
chr4 (181-257)||(14053346-14053422)
chr4 (144-254)||(16377531-16377639)
chr4 (181-255)||(22636437-22636510)
chr4 (181-250)||(23374405-23374473)
chr4 (181-257)||(6899891-6899966)
chr4 (181-257)||(7893703-7893778)
chr4 (181-257)||(44052829-44052904)
chr4 (154-257)||(16270254-16270356)
chr4 (1-238)||(53082012-53082254)
chr4 (25-238)||(46640341-46640558)
chr4 (144-257)||(16239978-16240090)
chr4 (181-254)||(44928970-44929042)
chr4 (204-260)||(19242693-19242749)
chr4 (181-252)||(14038653-14038723)
chr4 (204-254)||(12419-12469)
chr4 (204-254)||(1837621-1837671)
chr4 (204-254)||(7641294-7641344)
chr4 (204-254)||(12610950-12611000)
chr4 (204-254)||(14280316-14280366)
chr4 (204-254)||(15118464-15118514)
chr4 (204-254)||(18215386-18215436)
chr4 (204-254)||(18239531-18239581)
chr4 (204-254)||(23803377-23803427)
chr4 (204-254)||(44102214-44102264)
chr4 (204-254)||(44615288-44615338)
chr4 (204-254)||(44773199-44773249)
chr4 (204-254)||(50222451-50222501)
chr4 (204-254)||(51463980-51464030)
chr4 (204-254)||(52312510-52312560)
chr4 (204-257)||(15367690-15367743)
chr4 (204-257)||(15370018-15370071)
chr4 (204-257)||(15371202-15371255)
chr4 (204-257)||(15373483-15373536)
chr4 (204-257)||(15402703-15402756)
chr4 (204-257)||(16223532-16223585)
chr4 (144-256)||(19618225-19618336)
chr4 (181-254)||(54798800-54798872)
chr4 (1-148)||(15099461-15099607)
chr4 (204-255)||(22353835-22353886)
chr4 (204-254)||(3515007-3515057)
chr4 (188-238)||(6190481-6190531)
chr4 (204-254)||(8574935-8574985)
chr4 (204-250)||(15355437-15355483)
chr4 (1-148)||(15190428-15190574)
chr4 (204-241)||(14970819-14970856)
chr4 (89-150)||(630725-630786)
chr4 (89-150)||(3331994-3332055)
chr4 (89-150)||(13812760-13812821)
chr4 (89-150)||(14953912-14953973)
chr4 (89-150)||(25690170-25690231)
chr4 (206-238)||(21815699-21815731)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (1-254)||(15664-15917)
[»] chr6 (72 HSPs)
chr6 (1-257)||(28496336-28496592)
chr6 (1-257)||(29808747-29809003)
chr6 (1-257)||(1561303-1561560)
chr6 (1-253)||(19652199-19652452)
chr6 (1-241)||(19668387-19668631)
chr6 (1-257)||(20109140-20109400)
chr6 (1-238)||(23019425-23019665)
chr6 (156-257)||(27333238-27333339)
chr6 (156-257)||(27393978-27394079)
chr6 (92-241)||(9098466-9098619)
chr6 (144-257)||(20076700-20076812)
chr6 (181-257)||(16496244-16496319)
chr6 (181-257)||(35245586-35245662)
chr6 (181-257)||(16920675-16920751)
chr6 (181-257)||(20638329-20638404)
chr6 (144-257)||(19303549-19303661)
chr6 (181-257)||(29060540-29060615)
chr6 (154-241)||(4185839-4185926)
chr6 (82-257)||(8227453-8227632)
chr6 (181-257)||(17287842-17287917)
chr6 (181-257)||(22780273-22780348)
chr6 (189-257)||(22831503-22831571)
chr6 (151-241)||(25644336-25644427)
chr6 (183-256)||(18409875-18409947)
chr6 (181-245)||(11185517-11185581)
chr6 (181-257)||(20361006-20361081)
chr6 (154-241)||(4186383-4186470)
chr6 (144-257)||(25629363-25629476)
chr6 (72-254)||(22782227-22782411)
chr6 (181-254)||(25656629-25656700)
chr6 (204-257)||(25714417-25714470)
chr6 (1-238)||(35008167-35008409)
chr6 (186-238)||(23076749-23076801)
chr6 (204-254)||(2291292-2291342)
chr6 (204-254)||(8055029-8055079)
chr6 (204-254)||(12742317-12742367)
chr6 (204-254)||(18334704-18334754)
chr6 (204-254)||(19005046-19005096)
chr6 (204-254)||(19859031-19859081)
chr6 (183-257)||(20593773-20593846)
chr6 (204-254)||(24422547-24422597)
chr6 (204-254)||(25754809-25754859)
chr6 (204-254)||(26924752-26924802)
chr6 (204-254)||(33861794-33861844)
chr6 (204-254)||(33864278-33864328)
chr6 (144-256)||(30676763-30676874)
chr6 (1-257)||(22080601-22080846)
chr6 (204-254)||(1541023-1541073)
chr6 (204-254)||(1595549-1595599)
chr6 (204-254)||(3852129-3852179)
chr6 (204-254)||(20557004-20557054)
chr6 (204-256)||(34963371-34963423)
chr6 (1-68)||(9098387-9098454)
chr6 (204-251)||(16448639-16448686)
chr6 (1-68)||(27333147-27333214)
chr6 (1-68)||(27393887-27393954)
chr6 (204-238)||(18456735-18456769)
chr6 (204-238)||(18461895-18461929)
chr6 (204-238)||(18821912-18821946)
chr6 (204-254)||(25688502-25688552)
chr6 (154-199)||(4668229-4668274)
chr6 (154-199)||(4675076-4675121)
chr6 (154-253)||(31155415-31155514)
chr6 (184-236)||(33443068-33443119)
chr6 (204-255)||(19848063-19848114)
chr6 (2-60)||(4668077-4668135)
chr6 (2-60)||(4674924-4674982)
chr6 (89-150)||(22949408-22949469)
chr6 (89-150)||(22953364-22953425)
chr6 (89-150)||(23871852-23871913)
chr6 (89-150)||(23875808-23875869)
chr6 (89-150)||(27325385-27325446)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (1-241)||(20918620-20918860)
chr1 (1-257)||(33681010-33681266)
chr1 (8-253)||(20248283-20248527)
chr1 (1-241)||(52927844-52928075)
chr1 (89-257)||(14295504-14295672)
chr1 (1-257)||(22237630-22237887)
chr1 (1-250)||(21754052-21754294)
chr1 (1-253)||(22921731-22921986)
chr1 (72-204)||(22130843-22130975)
chr1 (1-238)||(21896120-21896358)
chr1 (1-238)||(21861431-21861672)
chr1 (89-189)||(51130632-51130732)
chr1 (82-238)||(35261023-35261180)
chr1 (181-257)||(20847200-20847275)
chr1 (181-257)||(27250775-27250850)
chr1 (181-256)||(50210259-50210333)
chr1 (159-241)||(16758665-16758749)
chr1 (181-254)||(34509783-34509855)
chr1 (181-257)||(21026680-21026755)
chr1 (187-257)||(38801439-38801508)
chr1 (185-257)||(45574937-45575008)
chr1 (1-238)||(16368148-16368388)
chr1 (144-238)||(50614123-50614219)
chr1 (144-238)||(50621951-50622047)
chr1 (1-133)||(20636975-20637107)
chr1 (181-257)||(22532269-22532344)
chr1 (204-257)||(13212974-13213027)
chr1 (1-119)||(12271695-12271806)
chr1 (188-256)||(20454606-20454673)
chr1 (204-260)||(21342090-21342146)
chr1 (81-238)||(16093825-16093987)
chr1 (195-254)||(21707167-21707225)
chr1 (195-254)||(21711709-21711767)
chr1 (204-254)||(13988866-13988916)
chr1 (204-254)||(21346961-21347011)
chr1 (204-254)||(21923403-21923453)
chr1 (204-254)||(23593847-23593897)
chr1 (204-254)||(29298137-29298187)
chr1 (204-254)||(29776688-29776738)
chr1 (204-254)||(31612313-31612363)
chr1 (144-238)||(41050042-41050138)
chr1 (206-254)||(433012-433060)
chr1 (204-260)||(15860121-15860177)
chr1 (144-255)||(21840766-21840876)
chr1 (82-238)||(50686630-50686791)
chr1 (154-253)||(21161720-21161818)
chr1 (195-254)||(22123171-22123230)
chr1 (206-256)||(16361915-16361965)
chr1 (204-254)||(21475199-21475249)
chr1 (181-254)||(16275455-16275526)
chr1 (204-253)||(21714546-21714595)
chr1 (1-118)||(49261481-49261598)
chr1 (204-256)||(22468764-22468816)
chr1 (144-236)||(26064959-26065052)
chr1 (1-148)||(35981550-35981696)
chr1 (89-150)||(1924911-1924972)
chr1 (89-150)||(20923925-20923986)
chr1 (186-238)||(21533923-21533974)
[»] chr2 (64 HSPs)
chr2 (36-257)||(23071849-23072070)
chr2 (1-253)||(25175854-25176109)
chr2 (1-252)||(28405981-28406236)
chr2 (1-256)||(22134079-22134326)
chr2 (94-253)||(7679589-7679750)
chr2 (1-241)||(18786764-18787008)
chr2 (159-257)||(38138-38235)
chr2 (89-257)||(19671830-19672001)
chr2 (181-257)||(20309108-20309184)
chr2 (1-238)||(7594-7835)
chr2 (159-257)||(23654409-23654507)
chr2 (1-119)||(22459423-22459541)
chr2 (1-238)||(23207296-23207537)
chr2 (74-257)||(23708553-23708738)
chr2 (181-254)||(298860-298933)
chr2 (181-257)||(23060513-23060588)
chr2 (181-257)||(23103441-23103516)
chr2 (181-257)||(23285865-23285940)
chr2 (1-238)||(23791292-23791534)
chr2 (181-257)||(23076442-23076517)
chr2 (181-257)||(8946657-8946732)
chr2 (181-257)||(22731280-22731355)
chr2 (185-254)||(22105412-22105480)
chr2 (204-257)||(22337115-22337168)
chr2 (204-257)||(23040257-23040310)
chr2 (144-257)||(23660023-23660135)
chr2 (160-238)||(22413160-22413240)
chr2 (204-257)||(22738247-22738300)
chr2 (25-238)||(25108906-25109124)
chr2 (181-256)||(32215012-32215085)
chr2 (195-254)||(45029958-45030016)
chr2 (204-254)||(571397-571447)
chr2 (204-254)||(6725995-6726045)
chr2 (204-254)||(18808943-18808993)
chr2 (204-254)||(23130862-23130912)
chr2 (204-254)||(23133329-23133379)
chr2 (204-254)||(23135590-23135640)
chr2 (204-254)||(23709644-23709694)
chr2 (204-254)||(23712125-23712175)
chr2 (204-254)||(26505379-26505429)
chr2 (204-254)||(26507857-26507907)
chr2 (204-254)||(28577099-28577149)
chr2 (204-254)||(34402634-34402684)
chr2 (204-254)||(38967374-38967424)
chr2 (204-254)||(39682313-39682363)
chr2 (144-238)||(20520200-20520295)
chr2 (204-252)||(43137301-43137349)
chr2 (204-251)||(21155172-21155219)
chr2 (195-254)||(24529633-24529691)
chr2 (204-251)||(24643062-24643109)
chr2 (204-254)||(24367774-24367824)
chr2 (204-254)||(32039610-32039660)
chr2 (204-254)||(24898307-24898358)
chr2 (204-254)||(24900790-24900841)
chr2 (204-254)||(24903267-24903318)
chr2 (204-254)||(24905744-24905795)
chr2 (204-254)||(24908219-24908270)
chr2 (188-238)||(32451981-32452031)
chr2 (144-238)||(23004767-23004863)
chr2 (144-238)||(24697613-24697709)
chr2 (186-236)||(23287384-23287433)
chr2 (89-150)||(1283690-1283751)
chr2 (187-236)||(26392403-26392451)
chr2 (89-150)||(30344773-30344834)
[»] chr3 (82 HSPs)
chr3 (1-257)||(13210191-13210448)
chr3 (1-253)||(16097332-16097587)
chr3 (29-253)||(12174152-12174376)
chr3 (1-253)||(16103784-16104038)
chr3 (1-250)||(32307684-32307926)
chr3 (1-253)||(9512924-9513166)
chr3 (1-253)||(9520899-9521141)
chr3 (9-257)||(15470927-15471174)
chr3 (1-253)||(49667947-49668193)
chr3 (1-250)||(1644546-1644787)
chr3 (1-148)||(49389492-49389639)
chr3 (92-257)||(14234487-14234655)
chr3 (1-238)||(37251029-37251270)
chr3 (144-238)||(52523735-52523831)
chr3 (134-257)||(11424758-11424880)
chr3 (1-95)||(12934174-12934268)
chr3 (181-257)||(12399209-12399284)
chr3 (181-257)||(20698481-20698556)
chr3 (181-257)||(26686887-26686962)
chr3 (144-257)||(14972854-14972967)
chr3 (144-257)||(18438534-18438647)
chr3 (82-257)||(24340665-24340844)
chr3 (181-257)||(13442274-13442349)
chr3 (181-257)||(23083407-23083482)
chr3 (154-254)||(27165250-27165350)
chr3 (154-254)||(53301569-53301669)
chr3 (82-257)||(37642207-37642386)
chr3 (181-257)||(17487856-17487931)
chr3 (181-257)||(17499338-17499413)
chr3 (181-257)||(43840932-43841007)
chr3 (144-254)||(17672626-17672735)
chr3 (192-254)||(28194693-28194755)
chr3 (144-238)||(22110358-22110454)
chr3 (156-257)||(23274687-23274788)
chr3 (144-238)||(43925977-43926073)
chr3 (159-241)||(14572605-14572686)
chr3 (144-254)||(24153217-24153326)
chr3 (181-257)||(25476431-25476506)
chr3 (144-239)||(42386428-42386523)
chr3 (72-257)||(43550456-43550644)
chr3 (204-254)||(6469246-6469296)
chr3 (204-254)||(7781459-7781509)
chr3 (204-254)||(8499518-8499568)
chr3 (204-254)||(9707719-9707769)
chr3 (204-254)||(10556985-10557035)
chr3 (204-254)||(15412429-15412479)
chr3 (204-254)||(15977515-15977565)
chr3 (204-254)||(17463178-17463228)
chr3 (204-254)||(17737236-17737286)
chr3 (204-254)||(28848723-28848773)
chr3 (204-254)||(29172695-29172745)
chr3 (204-254)||(34159326-34159376)
chr3 (144-254)||(36166598-36166706)
chr3 (204-254)||(45577950-45578000)
chr3 (204-254)||(45607019-45607069)
chr3 (204-254)||(55476491-55476541)
chr3 (204-254)||(55500942-55500992)
chr3 (144-238)||(12377940-12378036)
chr3 (82-257)||(22147467-22147646)
chr3 (204-252)||(16282923-16282971)
chr3 (204-252)||(41123892-41123940)
chr3 (204-255)||(13544024-13544075)
chr3 (144-254)||(40213729-40213838)
chr3 (204-254)||(8899094-8899144)
chr3 (204-254)||(10247835-10247885)
chr3 (204-254)||(12119837-12119887)
chr3 (204-250)||(12567564-12567610)
chr3 (204-254)||(16454393-16454443)
chr3 (204-254)||(38962003-38962053)
chr3 (204-254)||(44494809-44494859)
chr3 (204-254)||(50242822-50242872)
chr3 (204-241)||(21618462-21618499)
chr3 (1-148)||(1465273-1465419)
chr3 (204-254)||(13151902-13151953)
chr3 (204-254)||(13154367-13154418)
chr3 (188-238)||(606378-606428)
chr3 (204-254)||(17446767-17446816)
chr3 (204-238)||(53070765-53070799)
chr3 (184-241)||(14576881-14576937)
chr3 (204-255)||(46822267-46822318)
chr3 (89-150)||(19776031-19776092)
chr3 (89-150)||(37439418-37439479)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-238)||(6831-7068)
scaffold0556 (1-175)||(8097-8274)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-253)||(45654-45909)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (1-210)||(29142-29354)
scaffold0218 (1-241)||(7938-8179)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (1-241)||(10403-10646)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (1-202)||(2307-2508)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-241)||(129921-130164)
scaffold0010 (144-238)||(60723-60818)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (89-257)||(1022-1190)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-253)||(160688-160942)
scaffold0001 (204-254)||(85692-85742)
scaffold0001 (204-250)||(501088-501134)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (1-253)||(133-387)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-241)||(22536-22775)
scaffold0037 (204-254)||(82072-82122)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-257)||(12766-13025)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-257)||(6535-6793)
scaffold0621 (1-241)||(8482-8728)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (1-241)||(1098-1341)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-257)||(5985-6244)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-253)||(19268-19523)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-241)||(10543-10786)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (6-253)||(32102-32345)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-238)||(53410-53651)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-239)||(62216-62454)
scaffold0028 (1-253)||(132662-132910)
scaffold0028 (204-254)||(136680-136730)
scaffold0028 (204-254)||(139149-139199)
scaffold0028 (204-254)||(144087-144137)
scaffold0028 (204-254)||(134211-134261)
scaffold0028 (204-254)||(141618-141668)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (1-253)||(40036-40291)
scaffold0023 (1-253)||(100378-100633)
scaffold0023 (185-257)||(119875-119947)
scaffold0023 (176-253)||(101503-101580)
scaffold0023 (204-254)||(44454-44504)
scaffold0023 (204-254)||(94411-94461)
scaffold0023 (204-250)||(17552-17598)
scaffold0023 (1-37)||(101616-101652)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-241)||(5659-5901)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-253)||(2507-2762)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-257)||(6611-6870)
scaffold0333 (1-257)||(13991-14250)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-257)||(32538-32794)
scaffold0034 (188-238)||(51936-51985)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (1-257)||(897-1155)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-257)||(12942-13198)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-253)||(14559-14814)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-238)||(12587-12827)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (154-257)||(15795-15898)
scaffold0020 (1-68)||(15694-15761)
scaffold0020 (204-253)||(178898-178947)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-253)||(2666-2923)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (1-103)||(28673-28775)
scaffold0211 (185-253)||(28818-28887)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (181-257)||(7266-7342)
scaffold0106 (181-257)||(1289-1365)
scaffold0106 (204-254)||(15306-15356)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (1-238)||(136229-136471)
scaffold0021 (1-238)||(144937-145179)
scaffold0021 (181-256)||(174767-174842)
scaffold0021 (187-257)||(121766-121835)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (154-257)||(23901-24001)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (181-257)||(1094-1169)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (181-257)||(4712-4787)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (181-257)||(168024-168099)
scaffold0011 (181-257)||(51913-51988)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (144-256)||(3194-3306)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (144-257)||(3159-3271)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-236)||(7920-8161)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (144-241)||(16108-16205)
scaffold0357 (144-238)||(13147-13241)
scaffold0357 (186-238)||(2680-2732)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (144-241)||(27757-27854)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (181-257)||(10468-10544)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (181-257)||(16282-16358)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (181-257)||(16113-16188)
scaffold0120 (159-257)||(32980-33077)
scaffold0120 (159-257)||(45928-46025)
scaffold0120 (204-257)||(17397-17450)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (181-257)||(51582-51658)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (144-255)||(39479-39589)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (182-257)||(46995-47070)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (144-255)||(75223-75333)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (1-201)||(2080-2283)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (82-257)||(11464-11643)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (82-257)||(38198-38377)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (181-257)||(1094-1170)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (181-257)||(13497-13572)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (181-257)||(4849-4924)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (181-257)||(32067-32142)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-241)||(103500-103736)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (159-238)||(1051-1130)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (181-257)||(6167-6245)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (181-256)||(17263-17337)
scaffold0056 (204-238)||(79396-79430)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (159-257)||(15487-15584)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (181-254)||(5173-5246)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (25-238)||(128855-129072)
scaffold0022 (204-254)||(116430-116480)
scaffold0022 (144-234)||(78345-78436)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (181-257)||(11489-11564)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (181-257)||(13211-13286)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (154-254)||(38720-38820)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (181-257)||(1851-1926)
scaffold0016 (89-150)||(207470-207531)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (159-254)||(339972-340065)
scaffold0003 (204-254)||(158562-158612)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (144-250)||(26073-26179)
scaffold0122 (181-254)||(44753-44825)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (91-241)||(25122-25276)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (82-257)||(17969-18148)
scaffold0247 (204-254)||(2241-2291)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (144-257)||(38761-38873)
scaffold0145 (154-257)||(32942-33044)
scaffold0145 (204-259)||(9744-9799)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (181-257)||(1952-2027)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (181-257)||(343-418)
scaffold0292 (181-257)||(3470-3545)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (154-257)||(39913-40015)
scaffold0080 (4-238)||(19749-19987)
scaffold0080 (89-150)||(48936-48997)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (154-257)||(25896-25998)
scaffold0026 (154-257)||(39858-39960)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (1-103)||(2165-2267)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (181-257)||(8479-8554)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (205-257)||(8598-8650)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (92-238)||(6235-6386)
scaffold0420 (191-238)||(13793-13840)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (183-257)||(16648-16721)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (181-239)||(24349-24406)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (144-238)||(569-664)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (25-238)||(97024-97242)
scaffold0006 (25-238)||(106302-106520)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (144-238)||(267679-267775)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (190-257)||(4888-4954)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (204-254)||(13392-13442)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (204-254)||(20747-20797)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (204-254)||(22886-22936)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (204-254)||(16784-16834)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (204-254)||(37821-37871)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (144-234)||(38339-38431)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (144-255)||(10772-10882)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (189-257)||(20910-20978)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (204-251)||(4300-4347)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (204-255)||(9241-9292)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (154-238)||(2694-2780)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (204-254)||(106-156)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (204-254)||(4694-4744)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (204-254)||(13947-13997)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (204-254)||(40400-40450)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (208-254)||(161206-161252)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (204-253)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (204-253)||(36454-36503)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (206-254)||(4214-4262)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (204-256)||(12361-12413)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (210-254)||(12064-12108)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (204-240)||(29946-29982)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (204-251)||(1393-1440)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (185-236)||(4545-4595)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (89-238)||(20373-20524)
scaffold0031 (203-257)||(128751-128805)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (204-238)||(11982-12016)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (154-199)||(9136-9181)
scaffold0475 (2-60)||(9275-9333)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (204-257)||(4508-4560)
scaffold0228 (204-257)||(12090-12142)
scaffold0228 (204-257)||(22042-22094)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (204-256)||(11286-11338)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (89-150)||(30-91)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 5866139 - 5866395
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866139 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 5866238  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  5866239 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 5866338  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5866339 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17141172 - 17140916
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17141172 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 17141073  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17141072 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgc 17140973  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17140972 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21491251 - 21490995
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491251 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcctatgaattaatgttgcttataatgttat 21491152  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  21491151 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 21491052  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491051 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21249640 - 21249384
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249640 atgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgtt-accctgctgttaatgtctcactaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 21249542  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttg- 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||     
T  21249541 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgc 21249442  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249441 tatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21255478 - 21255222
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255478 atgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgtt-accctgctgttaatgtctcactaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 21255380  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttg- 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||     
T  21255379 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgc 21255280  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255279 tatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 26355562 - 26355815
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26355562 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatctttttgttattgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 26355661  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||| |||   || | |||||   |||| ||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  26355662 ataattgtatatacattaaatggaatatg-ttgatggctgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcgtgatgatttgcatactgcctatgtt 26355760  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26355761 gttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6520626 - 6520368
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||    
T  6520626 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttat 6520527  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||  | |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  6520526 ataattgtatatacattacatgaattatgtt-gatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 6520428  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6520427 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 38855114 - 38855372
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    |||||| |||||||| ||  |||  |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||    
T  38855114 atgtgaattgatcttggacattaggaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttat 38855213  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  38855214 ataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 38855312  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  38855313 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 23760703 - 23760962
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttc---cagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatg 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  |||||    
T  23760703 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgttgttgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgttaatg 23760802  T
Q  97 ttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcct 193  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   ||||  |||| |||||||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  23760803 gtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttacatactgcct 23760901  T
Q  194 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760902 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21285856 - 21285613
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||| ||| |  ||||| |||    
T  21285856 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagtgctttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatattgttgttaatgatat 21285757  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||    
T  21285756 ataattgtatatacattacatgaactatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgt 21285657  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21285656 tgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttg 21285613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20498822 - 20498581
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||  ||||| || |||||| ||||||||| ||    
T  20498822 atgtgagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgat 20498723  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||  ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| |   ||  ||||||||||||    
T  20498722 ataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatg 20498623  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498622 ttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21673962 - 21673720
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||  ||| |   |||||  |||||||| |  ||||| ||    
T  21673962 atgtgagttgatattagaggttaaaaactaagttgtt-atcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggta 21673864  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||  || |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  21673863 tataattgtatatacattaaataaattatatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatg 21673765  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21673764 ttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttg 21673720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 21396025 - 21396101
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21396025 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 21790518 - 21790594
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21790518 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 21389495 - 21389571
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21389495 ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 21778821 - 21778897
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21778821 ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 983267 - 983511
Alignment:
Q  4 tgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttacc---ttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |   ||| ||||  |||| ||||||| ||||    ||||| | ||||||| | ||||||||||    
T  983267 tgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgttgtttcagtaagtctgaattatatgattgaatgttgttgataatgttat 983366  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tgaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatg 196  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||    
T  983367 atagctgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatg 983466  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983467 ttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 983511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612231
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgatggattgt 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| ||| ||| ||||| ||   ||| | ||||||| |||||||||||||  |||     
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 17612158  T
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  17612159 atactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31971354 - 31971257
Alignment:
Q  159 gatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971354 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22626848 - 22626736
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    |||||||||  ||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22626848 tgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22626750  T
Q  244 gaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||    
T  22626749 gaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 21919046 - 21919121
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919046 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6759381 - 6759255
Alignment:
Q  134 ataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 232  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6759381 ataattgagatgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 6759283  T
Q  233 tctaagttgttgaagatgatgatgtcca 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6759282 tctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7372853 - 7372778
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7372853 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 16199693 - 16199765
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16199693 atactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 18818455 - 18818530
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18818455 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 18879277 - 18879352
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18879277 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23406454 - 23406379
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23406454 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 17439439 - 17439609
Alignment:
Q  73 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttat 169  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| |||||||||||    
T  17439439 tatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 17439538  T
Q  170 atcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||  ||  || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439539 atcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 256
Target Start/End: Original strand, 28649092 - 28649164
Alignment:
Q  183 gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28649092 gtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37116584 - 37116366
Alignment:
Q  25 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 124  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| |||||    |||| || |||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  37116584 aaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaa 37116485  T
Q  125 ttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 219  Q
    |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  37116484 ttatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaag 37116385  T
Q  220 ctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37116384 ctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 16092388 - 16092463
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16092388 ttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20536283 - 20536208
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20536283 ttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 21923974 - 21924049
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21923974 ttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 45131042 - 45131117
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45131042 ttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 250
Target Start/End: Original strand, 13508027 - 13508199
Alignment:
Q  82 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 177  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| || ||||| ||||| ||   | | ||||||||| ||||||||||||    
T  13508027 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 13508126  T
Q  178 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    |   || ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13508127 gttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Original strand, 13597637 - 13597731
Alignment:
Q  156 ttcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| || |||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13597637 ttcgatattattatatcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 17267000 - 17267096
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtat--actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    || |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267000 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22875177 - 22875065
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22875177 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgat 22875079  T
Q  244 gaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||    
T  22875078 gaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24353134 - 24353039
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353134 tgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1484452 - 1484402
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1484452 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 4542485 - 4542535
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4542485 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 5853404 - 5853454
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5853404 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 14409556 - 14409606
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14409556 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19896315 - 19896265
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19896315 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 20046307 - 20046357
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20046307 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20403277 - 20403227
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20403277 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22001803 - 22001753
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22001803 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225409
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 260
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 15203343 - 15203393
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  15203343 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Original strand, 16413428 - 16413474
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16413428 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 238
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154989
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26219767 - 26219717
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  26219767 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41598238 - 41598188
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41598238 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290853
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070571
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4483324 - 4483281
Alignment:
Q  211 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4483324 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484430
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Original strand, 18678170 - 18678221
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  18678170 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 19801493 - 19801527
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801493 ttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525579
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 18862427 - 18862488
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  18862427 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 18862488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21383981 - 21383920
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  21383981 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatatttgagatgttgat 21383920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21387401 - 21387340
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21387401 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 21387340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21411274 - 21411213
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21411274 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 21411213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21805766 - 21805705
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21805766 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 21805705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 21827796 - 21827857
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21827796 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 21827857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26223969 - 26223917
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||| |||||    
T  26223969 ttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34201042 - 34200786
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34201042 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 34200943  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  34200942 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 34200843  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200842 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 11995892 - 11996148
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995892 atgtgagtttatcttagaggttagaaactaatttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 11995991  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11995992 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgatatttgagttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgt 11996091  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11996092 tgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 28505163 - 28505419
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505163 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgtcaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 28505262  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  28505263 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgctgatttatatccgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 28505362  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28505363 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 15754751 - 15755008
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaatt-aatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15754751 atgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgcttataatgtta 15754850  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||    
T  15754851 tataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattg 15754950  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15754951 ttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16495570 - 16495402
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  16495570 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 16495471  T
Q  189 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16495470 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 68003 - 67745
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| || |||| |   |||||  |||||||| |  ||||||||    
T  68003 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgtta 67904  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  67903 tataattgtatatacattatatgaattatg-ttgat-attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 67806  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  67805 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44014431 - 44014182
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||| |||| |   |||||  |||||||| || ||||| ||    
T  44014431 atgtgagttgatc--agaggttaaaaactaagttgtt-atcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatggta 44014335  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  44014334 tataactgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 44014236  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  44014235 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 16219579 - 16219835
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||    
T  16219579 atgttagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttat 16219678  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || || |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  16219679 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 16219778  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  16219779 tgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18005902 - 18005650
Alignment:
Q  4 tgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataatgttatat 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||    |||||  |||||||| |  ||||| |||||    
T  18005902 tgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatat 18005803  T
Q  103 aattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttg 199  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||    
T  18005802 aattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttccatactgcttatgttg 18005704  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18005703 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 47832066 - 47831807
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  ||||||||    |||||||||    
T  47832066 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgtcgctaatgttat 47831967  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||  | |||||||   || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||    
T  47831966 ataattgtatatacattatatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatatgcatactgtctatgt 47831867  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  47831866 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 810993 - 811248
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||| |||||||||   ||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||    
T  810993 atgtgagttgaccttggaagttagaaactaagttatttatcttgctgttgtagtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttat 811092  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||| ||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  811093 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 811192  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  811193 tgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16056586 - 16056344
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||  |||| | ||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||    
T  16056586 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatgatataatctaatgttgttgttaatgttat 16056487  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||| || ||||||    
T  16056486 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgt-ttgcataatgtctatgt 16056388  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16056387 tgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttg 16056344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22073174 - 22072913
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    |||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||  |||| ||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||    
T  22073174 atgtgagttgatcttacaggtaaggaactaagttgtttgtcttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttat 22073075  T
Q  101 ataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatgg-attgtatactgcctat 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||    
T  22073074 ataattgcatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctat 22072975  T
Q  196 gttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  22072974 gttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Original strand, 20220075 - 20220290
Alignment:
Q  25 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 124  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||| |||||    |||| || |||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  20220075 aaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaa 20220174  T
Q  125 ttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 222  Q
    |||  | ||||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20220175 ttatatatgatgtttgagatgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctg 20220274  T
Q  223 catgagtcggtctaag 238  Q
     |||||||||||||||    
T  20220275 tatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 16386293 - 16386369
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386293 ttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12901559 - 12901339
Alignment:
Q  25 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 124  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||  |||    ||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  12901559 aaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaa 12901460  T
Q  125 ttaagtttgataat-tgaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagc 220  Q
    ||| || ||||  | ||| || | || ||| |||| ||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12901459 ttatgtatgatgttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagc 12901360  T
Q  221 tgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  12901359 tgcatgagtcggtttaagttg 12901339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Original strand, 2280127 - 2280238
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2280127 tgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-- 2280224  T
Q  244 gaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||||    
T  2280225 aaagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12698906 - 12698831
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12698906 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15113202 - 15113028
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||   ||||| || |||||  ||||||||| ||    
T  15113202 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactgatttatatgagttgatgttaattataatgtgat 15113103  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatc 172  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||  | |||  |||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||    
T  15113102 ataattgtatatatattacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 15113028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 3564372 - 3564482
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 242  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3564372 tgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 3564470  T
Q  243 tgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||    
T  3564471 tgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15116739 - 15116621
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||||||||||||  ||||| || |||||  ||||||||| ||    
T  15116739 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctactgttattgtttcagtaagactgatgtatatgagttgatgttatttataatgtgat 15116640  T
Q  101 ataattgtatatacattac 119  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  15116639 ataattgtatatatattac 15116621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9509265 - 9509189
Alignment:
Q  180 attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9509265 attgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 38227593 - 38227481
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  38227593 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagat 38227495  T
Q  244 gaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||    
T  38227494 gaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 27847875 - 27847951
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27847875 ttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 241
Target Start/End: Original strand, 1867937 - 1868100
Alignment:
Q  82 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga-- 176  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||      
T  1867937 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatcatgagc 1868035  T
Q  177 tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868036 tgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1868100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40443467 - 40443393
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40443467 ttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10589114 - 10589039
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  10589114 ttgtatactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13647396 - 13647325
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13647396 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 18456421 - 18456530
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18456421 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18456519  T
Q  244 gaagatgatga 254  Q
     ||||||||||    
T  18456520 taagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Original strand, 19486686 - 19486865
Alignment:
Q  82 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 177  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||  | |||| ||| ||| ||||| ||   ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  19486686 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 19486785  T
Q  178 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |  ||| ||||||||||||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  19486786 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26212071 - 26211995
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag-atgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26212071 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 235
Target Start/End: Original strand, 12255809 - 12255892
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255809 catttgatattgttatatcatgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14044935 - 14044762
Alignment:
Q  73 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacat---tcgatattgttat 169  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||||| |  |   | |||||||||||    
T  14044935 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtattgatattgttat 14044836  T
Q  170 atcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    |||| ||  ||  || | |||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044835 atcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14044762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14354965 - 14354792
Alignment:
Q  73 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacat---tcgatattgttat 169  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||||| |  |   | |||||||||||    
T  14354965 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtattgatattgttat 14354866  T
Q  170 atcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    |||| ||  ||  || | |||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354865 atcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14354792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 234
Target Start/End: Original strand, 15008441 - 15008597
Alignment:
Q  82 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga-- 176  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||  | ||||  |||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||      
T  15008441 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaac 15008539  T
Q  177 tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 234  Q
    ||  || |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15008540 tgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Original strand, 10063838 - 10063939
Alignment:
Q  156 ttcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||   || |||| |||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||    
T  10063838 ttcgatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgat 10063937  T
Q  256 gt 257  Q
    ||    
T  10063938 gt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18430762 - 18430709
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18430762 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 48273464 - 48273392
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  48273464 ttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 456371 - 456321
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  456371 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3386383 - 3386333
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3386383 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11972546 - 11972496
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11972546 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869346
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 14949234 - 14949284
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14949234 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 15376825 - 15376875
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15376825 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16213734 - 16213684
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16213734 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16232570 - 16232520
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16232570 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16410109 - 16410059
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16410109 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 17062027 - 17062077
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17062027 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18640322 - 18640272
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18640322 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 20385235 - 20385285
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20385235 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 21189707 - 21189757
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21189707 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24702288 - 24702238
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24702288 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24704738 - 24704688
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24704738 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32125541 - 32125491
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32125541 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41522967 - 41522917
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41522967 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41525429 - 41525379
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41525429 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Original strand, 11393399 - 11393448
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  11393399 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13831431 - 13831373
Alignment:
Q  195 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  13831431 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16324264 - 16324197
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga 68  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  16324264 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgttgatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 16324197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991206
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24275221 - 24275175
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24275221 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27216910 - 27216860
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  27216910 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44116559 - 44116509
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44116559 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Original strand, 15144105 - 15144142
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144105 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15144142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Original strand, 38898489 - 38898535
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  38898489 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14036354 - 14036282
Alignment:
Q  159 gatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036354 gatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14346384 - 14346312
Alignment:
Q  159 gatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346384 gatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 236
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177766
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtcta 9177766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 239
Target Start/End: Original strand, 18154909 - 18154944
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18154909 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 18154944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Original strand, 14932802 - 14932851
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  14932802 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Original strand, 15356237 - 15356286
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  15356237 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Original strand, 15360351 - 15360400
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  15360351 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203831
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34379 - 34123
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34379 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaattttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 34280  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34279 ataattgtatatatattacttgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgt 34180  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34179 tgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 19660700 - 19660956
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660700 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 19660799  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  19660800 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttatattcgatatcattatatcaagatggtttgcatactgcctatgttgc 19660899  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660900 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 22959397 - 22959649
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  22959397 atgtgagttgatcttagaggttaaaaaccaagttgtttatcttgttgtttttgttccagtaagactgatgcatatgaatcaatgttggttaaaatgttat 22959496  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||     
T  22959497 ataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 22959596  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22959597 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19669156 - 19668898
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaat--taatgttgcttataatgtt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||    
T  19669156 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatattgatgttgtttataatgtt 19669057  T
Q  99 atataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||    
T  19669056 atataattgtatatacattacaggacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgtctatgtt 19668957  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19668956 gttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21565801 - 21565546
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21565801 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 21565702  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||  |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  21565701 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgt 21565602  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21565601 tgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 21329359 - 21329618
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||    
T  21329359 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttat 21329458  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   ||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||    
T  21329459 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgt 21329558  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21329559 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 21502016 - 21502277
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggtta-aaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgtt 98  Q
    |||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  |||||||    
T  21502016 atgttagttgatcttggaagttagaaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgtt 21502115  T
Q  99 atataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctat 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || || || ||||   || |||||||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||    
T  21502116 atataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctat 21502215  T
Q  196 gttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21502216 gttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 26011897 - 26012154
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||  |||| ||||||| ||||    ||| |  | |||||| |  | |||||||    
T  26011897 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttattgttgtttcagtaagcctgaactatataatctgatgttgttgttgatgttat 26011996  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||    
T  26011997 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgt 26012096  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  26012097 tgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg--aaagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 20026802 - 20027043
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||   |||| ||||||| ||||    ||||  ||||||||| | |||||| |||    
T  20026802 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaattatatgttttaatgttgttgataatgctat 20026901  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tgaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| || ||||| || |||| |||||| |||||||||||  ||  ||| ||||||||||||    
T  20026902 atagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatg 20027001  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20027002 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314577
Alignment:
Q  156 ttcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 36314579  T
Q  256 gt 257  Q
    ||    
T  36314578 gt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 21729110 - 21729185
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729110 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 21808435 - 21808510
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808435 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25421607 - 25421532
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25421607 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24529295 - 24529223
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24529295 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 8286889 - 8286964
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8286889 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 21997580 - 21997655
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21997580 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 23390542 - 23390617
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23390542 ttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22144162 - 22144068
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144162 tgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24493681 - 24493569
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  24493681 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24493583  T
Q  244 gaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||    
T  24493582 gaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37723979 - 37723910
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37723979 ttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13025386 - 13025311
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13025386 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13095570 - 13095495
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13095570 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 21293015 - 21293090
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21293015 ttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 238
Target Start/End: Original strand, 22178162 - 22178323
Alignment:
Q  82 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga-- 176  Q
    |||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| |||||||| |||||||||      
T  22178162 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagc 22178261  T
Q  177 tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178262 tgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9078025 - 9077952
Alignment:
Q  183 gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9078025 gtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22412296 - 22412187
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22412296 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 22412198  T
Q  244 gaagatgatga 254  Q
     ||||||||||    
T  22412197 taagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22075094 - 22075018
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag-atgatgatgt 257  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22075094 ttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40726032 - 40725853
Alignment:
Q  82 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 177  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| ||| ||| ||||| ||   ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  40726032 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 40725933  T
Q  178 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |  ||| |||||||||| |||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  40725932 gctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1096520 - 1096467
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1096520 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25431469 - 25431395
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  25431469 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20909063 - 20909012
Alignment:
Q  203 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20909063 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 36314719 - 36314672
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgata 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36314719 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagttcgata 36314672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 264880 - 264930
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  264880 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154776
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 10733052 - 10733102
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10733052 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 11581311 - 11581361
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11581311 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 20918060 - 20918110
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20918060 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29329984 - 29329934
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29329984 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 36154892 - 36154942
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36154892 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39245186 - 39245136
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39245186 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39363434 - 39363384
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39363434 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 254
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775838
Alignment:
Q  206 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29346030 - 29345980
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29346030 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31061118 - 31061068
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31061118 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 42245477 - 42245527
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42245477 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Original strand, 20902121 - 20902158
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20902158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Original strand, 18319146 - 18319193
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  18319146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29348500 - 29348453
Alignment:
Q  207 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29348500 ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29350973 - 29350926
Alignment:
Q  207 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29350973 ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32027451 - 32027393
Alignment:
Q  195 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32027451 tgttgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704075
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973808
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 241
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10753688 - 10753627
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  10753688 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 10753627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18418656 - 18418596
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  18418656 ttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttg 18418596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 22120146 - 22120207
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  22120146 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 22120207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 21741407 - 21741455
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgtt 49  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  21741407 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttaattaccttgatgtt 21741455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 148
Target Start/End: Original strand, 21741486 - 21741541
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  21741486 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 21741541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11548 - 11292
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11548 atgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttggtgttaatgttcaagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 11449  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  11448 ataatagtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 11349  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2229 - 1997
Alignment:
Q  25 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2229 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagtctgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 2130  T
Q  125 ttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgca 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2129 ttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgca 2030  T
Q  225 tgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029 tgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28489 - 28414
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28489 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 201 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15552072 - 15551817
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15552072 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtt-accctgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaatcaatgttgcttataatgttat 15551974  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15551973 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggattgcatactgcctatgttgc 15551874  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551873 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16596904 - 16596686
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16596904 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttcaagtaagactgatgcttataaattaatgttgcttataatgttat 16596805  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||     
T  16596804 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgatgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgc 16596705  T
Q  201 tgtttgttatttaactaag 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16596704 tgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12774256 - 12774011
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||      
T  12774256 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtt-- 12774159  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgtt 198  Q
          |||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||| ||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  12774158 ------gtatatacattaaatggattatgtt-gataattgagatgttgttgattgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 12774066  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12774065 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 13712 - 13953
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||    
T  13712 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgat 13811  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||| ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||    
T  13812 ataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatg 13911  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13912 ttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8846631 - 8846360
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8846631 atgtgagttgaacttagagattagaaactaagttgtttatcttgtagttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 8846532  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat------------------tta-cattcgatattgttatatcatgatggat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||                  ||| |||||||||||||||| ||||||||  |    
T  8846531 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgatattgttatctcatgatgatt 8846432  T
Q  182 tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8846431 tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 12288071 - 12288315
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  12288071 atgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttggtaatgttat 12288170  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tgaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  12288171 atagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatg 12288270  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288271 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12288315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 39706151 - 39706409
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||| |||||||||  ||||  |||||| ||||    |||||  |||||||| |  |||||||||    
T  39706151 atgtgagttgatcttggagattaggaattaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttgctaatgttat 39706250  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||  | |||| ||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  39706251 ataattgtatatacattacatgaattatgtt-gatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 39706349  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  39706350 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 43198428 - 43198660
Alignment:
Q  15 tagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatac 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  43198428 tagaggtaaaaaactaagttgtttatcttgttgttgatgttccagtaagactaatgcatatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatac 43198527  T
Q  115 attacatgacttaagtttg-ataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgtt 208  Q
    ||||| ||| |||  | || ||| ||||| | |||||   || |||| ||||| ||||||||||||  ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  43198528 attacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgtt 43198627  T
Q  209 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198628 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 43198660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3096368 - 3096293
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096368 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12902832 - 12902757
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902832 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 184 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17046560 - 17046487
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17046560 tatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7088952 - 7088877
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7088952 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7798849 - 7798774
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7798849 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 241
Target Start/End: Original strand, 52243202 - 52243301
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243202 tgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 52243301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 52873413 - 52873488
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52873413 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 14053346 - 14053422
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14053346 ttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 16377531 - 16377639
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16377531 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16377628  T
Q  244 gaagatgatga 254  Q
    |||||| ||||    
T  16377629 gaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22636510 - 22636437
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22636510 ttgtaaactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 250
Target Start/End: Original strand, 23374405 - 23374473
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23374405 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6899966 - 6899891
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6899966 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7893778 - 7893703
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7893778 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44052904 - 44052829
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44052904 ttgtatactgcctatgttgatgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Original strand, 16270254 - 16270356
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16270254 catttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatg 16270352  T
Q  254 atgt 257  Q
    ||||    
T  16270353 atgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 53082012 - 53082254
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaa-aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| | ||||||| |    
T  53082012 atgtgagttgatcttggggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtga 53082111  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgtt---gatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgccta 194  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| ||||   ||||| | || ||||||||||||||||||  ||  || | |||||| ||    
T  53082112 tataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcttt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgctta 53082210  T
Q  195 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082211 tgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Original strand, 46640341 - 46640558
Alignment:
Q  25 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 124  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||||  ||||    ||||| || |||||| | || |||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  46640341 aaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaaacctgaattatatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaa 46640440  T
Q  125 ttaagtttgataattgaggtgtt---gatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 219  Q
    |||  | ||||  ||||| ||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  46640441 ttatatatgatg-ttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaag 46640539  T
Q  220 ctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||    
T  46640540 ctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Original strand, 16239978 - 16240090
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||| | || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  16239978 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctatt-gttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgat 16240076  T
Q  244 gaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||    
T  16240077 gaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Original strand, 44928970 - 44929042
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44928970 ttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19242749 - 19242693
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  19242749 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14038723 - 14038653
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 252  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14038723 ttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 12419 - 12469
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12419 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 1837621 - 1837671
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1837621 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 7641294 - 7641344
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7641294 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12611000 - 12610950
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12611000 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14280366 - 14280316
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14280366 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 15118464 - 15118514
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15118464 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 18215386 - 18215436
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18215386 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 18239531 - 18239581
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18239531 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 23803377 - 23803427
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23803377 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44615338 - 44615288
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44615338 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 44773199 - 44773249
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44773199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 50222451 - 50222501
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  50222451 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 51463980 - 51464030
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  51463980 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 52312560 - 52312510
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  52312560 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15367743 - 15367690
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15367743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15370071 - 15370018
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15370071 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15371255 - 15371202
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15371255 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15373536 - 15373483
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15373536 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15402756 - 15402703
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15402756 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 256
Target Start/End: Original strand, 19618225 - 19618336
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 242  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||||||  || ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19618225 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19618322  T
Q  243 tgaagatgatgatg 256  Q
    | |||||| |||||    
T  19618323 ttaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Original strand, 54798800 - 54798872
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  54798800 ttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15099607 - 15099461
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||| |||     |||    |||||||| | ||||||||||    
T  15099607 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttat 15099508  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg 148  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  15099507 ataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 15099461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22353886 - 22353835
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22353886 ttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3515057 - 3515007
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3515057 ttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190481
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 8574935 - 8574985
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  8574935 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Original strand, 15355437 - 15355483
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15355437 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15190574 - 15190428
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||| |||     |||    |||||||| | ||||||||||    
T  15190574 atgtgagttgatcttgggggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttat 15190475  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg 148  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  15190474 ataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 15190428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Original strand, 14970819 - 14970856
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14970819 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 14970856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 630725 - 630786
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  630725 ttataatgttatataattggatatatattgcatgcattatgtttgatgattgagatgttgat 630786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3332055 - 3331994
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  3332055 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 3331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 13812760 - 13812821
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  13812760 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 13812821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 14953912 - 14953973
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  14953912 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 14953973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25690231 - 25690170
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  25690231 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 25690170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 238
Target Start/End: Original strand, 21815699 - 21815731
Alignment:
Q  206 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15917 - 15664
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15917 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgatccagtaagactgattcttatgaaataatgttgcttataatgttat 15818  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15817 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgc 15718  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15717 tgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 72)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 28496336 - 28496592
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496336 atgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatgttat 28496435  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  28496436 ataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 28496535  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28496536 taattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 29808747 - 29809003
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808747 atgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatgttat 29808846  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  29808847 ataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 29808946  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29808947 taattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1561560 - 1561303
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaatt-aatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1561560 atgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgcttataatgtta 1561461  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||    
T  1561460 tataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattg 1561361  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1561360 ttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19652452 - 19652199
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19652452 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 19652353  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgtt 198  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||| | |||||  ||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  19652352 ataattgtatatactttaaatggattatg-ttgatgtttgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 19652254  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19652253 gttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19668631 - 19668387
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||  |||||  || ||||| | ||||||||||    
T  19668631 atgtgagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtatatgatgtagtgttgttgataatgttat 19668532  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||  | ||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  ||| |||||  |||||    
T  19668531 atagttgtatatacattacatgaattacgtatgatgttgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatg 19668432  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668431 ttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19668387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20109400 - 20109140
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |    ||| |||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||| ||    
T  20109400 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgtctttctagtaagactgatgtatatcaattgatgttgtttataatgtgat 20109301  T
Q  101 ataat--tgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgccta 194  Q
    |||||  |||||||||||||| ||| |||  | ||| || ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||    
T  20109300 ataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgccta 20109201  T
Q  195 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  20109200 tgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg--aaagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23019665 - 23019425
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||| | |  |||||||||    
T  23019665 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaactatataatctaatgtcgttgttaatgttat 23019566  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||| |   || |||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||    
T  23019565 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgt 23019466  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23019465 tgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333339
Alignment:
Q  156 ttcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 27333337  T
Q  256 gt 257  Q
    ||    
T  27333338 gt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394079
Alignment:
Q  156 ttcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 27394077  T
Q  256 gt 257  Q
    ||    
T  27394078 gt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Original strand, 9098466 - 9098619
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tgaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtata 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| || |||||  | |||| ||||||||||||||||||  ||  ||| |||    
T  9098466 taatgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcata 9098565  T
Q  188 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098566 ctgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 9098619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076700
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  244 gaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||    
T  20076713 gaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16496319 - 16496244
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496319 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 35245662 - 35245586
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35245662 ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 16920675 - 16920751
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16920675 ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 20638329 - 20638404
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20638329 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Original strand, 19303549 - 19303661
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  19303549 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 19303647  T
Q  244 gaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||    
T  19303648 gaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29060615 - 29060540
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29060615 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Original strand, 4185839 - 4185926
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4185839 cattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4185926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Original strand, 8227453 - 8227632
Alignment:
Q  82 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 177  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| ||| ||| ||||| ||   ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  8227453 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 8227552  T
Q  178 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |  ||| |||||||||| |||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8227553 gttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 17287842 - 17287917
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17287842 ttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 22780273 - 22780348
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22780273 ttgtatattgcctatgtttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22831571 - 22831503
Alignment:
Q  189 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  22831571 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25644427 - 25644336
Alignment:
Q  151 ttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||  || | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644427 ttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 25644336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 256
Target Start/End: Original strand, 18409875 - 18409947
Alignment:
Q  183 gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18409875 gtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11185581 - 11185517
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttga 245  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11185581 ttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 20361006 - 20361081
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  20361006 ttgtatgctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4186470 - 4186383
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4186470 cattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4186383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Original strand, 25629363 - 25629476
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 242  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || ||||||||| | ||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25629363 tgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25629461  T
Q  243 tgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||    
T  25629462 tgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22782411 - 22782227
Alignment:
Q  72 ttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---ggtgttgatttacattcgatattgtt 167  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| || || ||||||||   | |||||| || |||| |||||| ||    
T  22782411 ttatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 22782313  T
Q  168 atatcatgatg-gattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    || ||||| ||   |||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22782312 atgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25656700 - 25656629
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  25656700 ttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25714470 - 25714417
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  25714470 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35008409 - 35008167
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||| | | ||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||||| |||||    |||| || |||||| | ||||||| ||    
T  35008409 atgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgat 35008310  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgtt---gatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtat--actgcctat 195  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  || || ||||   ||||  || | |||||| |||||||  |||   || |||  |||||||||    
T  35008309 atatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctat 35008210  T
Q  196 gttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008209 gttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076749
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 2291292 - 2291342
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2291292 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8055079 - 8055029
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8055079 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12742367 - 12742317
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12742367 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 18334704 - 18334754
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18334704 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19005096 - 19005046
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19005096 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 19859031 - 19859081
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19859031 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20593846 - 20593773
Alignment:
Q  183 gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20593846 gtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24422597 - 24422547
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24422597 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25754859 - 25754809
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  25754859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 26924752 - 26924802
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26924752 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33861844 - 33861794
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  33861844 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33864328 - 33864278
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  33864328 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 256
Target Start/End: Original strand, 30676763 - 30676874
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 242  Q
    |||||| || |||| |||||| |||||||||| ||  || ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30676763 tgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 30676860  T
Q  243 tgaagatgatgatg 256  Q
    | |||||| |||||    
T  30676861 ttaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 22080601 - 22080846
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||  |||| ||||||| || | |   |||||  ||||| || |  ||||||||    
T  22080601 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgcttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgttgttaatgtta 22080700  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgattta--cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||| || | ||| |   |||  ||||| ||||| | |   |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22080701 tataaatgtatatacattatattaattatgac-gatgtttgagatgttgttctgtgcattcgatattgttatatcatgatgttttgcatactgcctatgt 22080799  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |             ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  22080800 t-------------taactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 1541023 - 1541073
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  1541023 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1595599 - 1595549
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  1595599 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 3852129 - 3852179
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3852129 ttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 20557004 - 20557054
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  20557004 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34963423 - 34963371
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  34963423 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 9098387 - 9098454
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga 68  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||    
T  9098387 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaatttgtttatcttgcagttattgtttcagtaagcctga 9098454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Original strand, 16448639 - 16448686
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  16448639 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 27333147 - 27333214
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga 68  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||    
T  27333147 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctga 27333214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 27393887 - 27393954
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga 68  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||    
T  27393887 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctga 27393954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18456769 - 18456735
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456769 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18461929 - 18461895
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461929 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 18821912 - 18821946
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25688552 - 25688502
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  25688552 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 199
Target Start/End: Original strand, 4668229 - 4668274
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  4668229 cattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttg 4668274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 199
Target Start/End: Original strand, 4675076 - 4675121
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  4675076 cattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttg 4675121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 253
Target Start/End: Original strand, 31155415 - 31155514
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgttt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||  || |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||||| ||| ||||||    
T  31155415 cattcgatattgttatatcacgatgacttgcatactgttta-gttgctgttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgat 31155513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443068
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Original strand, 19848063 - 19848114
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  19848063 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 4668077 - 4668135
Alignment:
Q  2 tgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagt 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||| ||||||||||    
T  4668077 tgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagt 4668135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 4674924 - 4674982
Alignment:
Q  2 tgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagt 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||| ||||||||||    
T  4674924 tgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagt 4674982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22949469 - 22949408
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  22949469 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 22949408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22953425 - 22953364
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  22953425 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 22953364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23871913 - 23871852
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  23871913 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 23871852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23875869 - 23875808
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  23875869 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 23875808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 27325385 - 27325446
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  27325385 ttataatgttatataattatatatatattgcattaattatgtttgatgattgagatgttgat 27325446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20918860 - 20918620
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20918860 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttaccttgttgttaatgttccagtaagactcatgcttatgaattgatgttgcttataatgttat 20918761  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  20918760 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 20918661  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918660 agtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33681266 - 33681010
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  33681266 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 33681167  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgtt---gatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||   || || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  33681166 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 33681067  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681066 tgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20248527 - 20248283
Alignment:
Q  8 ttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattg 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||||||    
T  20248527 ttgatcttagaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgttgt-ccagtaagactgatgcatatgaatccatgttgtttataatgatatataattg 20248429  T
Q  108 tatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgt 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20248428 tatatacattacatgacttatgtttgatatttaagttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgt 20248329  T
Q  208 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20248328 tttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 52927844 - 52928075
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  52927844 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 52927943  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||         ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  52927944 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg---------attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgt 52928034  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928035 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 52928075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 14295504 - 14295672
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  14295504 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 14295603  T
Q  189 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14295604 tacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22237887 - 22237630
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctg-ttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||  |||||||| | |||||||| |||||| || ||| ||||    
T  22237887 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgattgttgttccagcgagactgatacatatgaattgatgttgtttctaaagtta 22237788  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  22237787 tataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatg 22237688  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22237687 tcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21754294 - 21754052
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||      
T  21754294 atgtgagttgatctcagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtt-- 21754197  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgtt 198  Q
          |||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||| ||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  21754196 ------gtatatacattaaatggattatgtt-gataattgagatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 21754104  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21754103 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 22921731 - 22921986
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||||||    
T  22921731 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgtta 22921830  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||| ||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  22921831 tataattgtatatacattatatgaattttg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 22921929  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22921930 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 204
Target Start/End: Original strand, 22130843 - 22130975
Alignment:
Q  72 ttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatat 171  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22130843 ttatgatttgatgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatat 22130942  T
Q  172 catgatggattgtatactgcctatgttgttgtt 204  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  22130943 catgatggtttggatactgcctatgttgctgtt 22130975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 21896120 - 21896358
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||   ||| ||||||| ||||   |||||| || |||||| ||||||||| ||    
T  21896120 atgtgagttgatcttagatgtaagaaactaagttgtttatcttgttgtt---gtttcagtaagcctgaatattatgatttgatgttgtttataatgtgat 21896216  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  | || ||  ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  21896217 ataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatg 21896316  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896317 ttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 21861431 - 21861672
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||| ||||   ||||||  | |||||| ||||||||| ||    
T  21861431 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctattgttgtttcagtaagcctgaatattatgatatgatgttgtttataatgtgat 21861530  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||  ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||    
T  21861531 ataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatg 21861630  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861631 ttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 51130732 - 51130632
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  51130732 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 51130633  T
Q  189 t 189  Q
    |    
T  51130632 t 51130632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 238
Target Start/End: Original strand, 35261023 - 35261180
Alignment:
Q  82 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatgga 180  Q
    |||||| | ||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||| || ||| |  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||      
T  35261023 atgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgtt 35261122  T
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261123 ttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 20847200 - 20847275
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20847200 ttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 27250775 - 27250850
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250775 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 256
Target Start/End: Original strand, 50210259 - 50210333
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50210259 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16758749 - 16758665
Alignment:
Q  159 gatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16758749 gatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 16758665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34509855 - 34509783
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34509855 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21026755 - 21026680
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21026755 ttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 257
Target Start/End: Original strand, 38801439 - 38801508
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38801439 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 45574937 - 45575008
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45574937 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 16368148 - 16368388
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| | ||||||| ||    
T  16368148 atgtgagttgatcataggggtaagaaattaagttgtttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgat 16368247  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctat 195  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||     |||  ||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || ||| ||||||||    
T  16368248 ataaatgtatatgcattacatgaattataaacgatg-ttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctat 16368345  T
Q  196 gttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368346 gttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 50614123 - 50614219
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614123 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 50621951 - 50622047
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621951 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20637107 - 20636975
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||| ||||    |||   ||||||||| | ||||||||||    
T  20637107 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctgaattgtattttttaatgttgatgataatgttat 20637008  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttg 133  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  20637007 ataattgtatatacattatatgaattatgtttg 20636975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22532344 - 22532269
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22532344 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213027
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12271806 - 12271695
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||       ||| || |||||  ||||||||| ||    
T  12271806 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactg-------tgagttgatgttatttataatgtgat 12271714  T
Q  101 ataattgtatatacattac 119  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  12271713 ataattgtatatatattac 12271695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 256
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342090
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 238
Target Start/End: Original strand, 16093825 - 16093987
Alignment:
Q  81 aatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg----atttacattcgatattgttatatcatga 176  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16093825 aatgttgattttaatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatga 16093923  T
Q  177 --tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
      ||  || |||||||||||||||| | ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16093924 gctgttttctatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21707225 - 21707167
Alignment:
Q  195 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21707225 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21711767 - 21711709
Alignment:
Q  195 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21711767 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13988916 - 13988866
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13988916 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346961
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 21923403 - 21923453
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21923403 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 23593847 - 23593897
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23593847 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29298187 - 29298137
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29298187 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29776738 - 29776688
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29776738 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31612363 - 31612313
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31612363 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 41050042 - 41050138
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |   || |||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050042 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 433060 - 433012
Alignment:
Q  206 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  433060 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 260
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860177
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21840876 - 21840766
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 242  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||||||  || ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21840876 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 21840779  T
Q  243 tgaagatgatgat 255  Q
    | |||||| ||||    
T  21840778 ttaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50686791 - 50686630
Alignment:
Q  82 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatg 178  Q
    |||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| || |||||||||||||||      
T  50686791 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaac 50686692  T
Q  179 gattgtat--actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
     ||| |||  |||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  50686691 tattttatgaactgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21161818 - 21161720
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||  | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| |||||||    
T  21161818 cattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgttt-tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 22123171 - 22123230
Alignment:
Q  195 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  22123171 tgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361915
Alignment:
Q  206 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 21475199 - 21475249
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  21475199 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Original strand, 16275455 - 16275526
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16275455 ttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714546
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 49261598 - 49261481
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||| | ||    |||    |||||||| | ||||||||||    
T  49261598 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtccttccagtaagccggaattgtatattctaatgttgatgataatgttat 49261499  T
Q  101 ataattgtatatacatta 118  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49261498 ataattgtatatacatta 49261481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Original strand, 22468764 - 22468816
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  22468764 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26065052 - 26064959
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgta--tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||    
T  26065052 tgttgatttgcattgg-tattgttatatcatgaattattttatgtactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 35981550 - 35981696
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    |||||||||| |||     |||    |||||||| | ||||||||||    
T  35981550 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttat 35981649  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg 148  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  35981650 ataattgcatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 35981696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 1924911 - 1924972
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  1924911 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 1924972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 20923925 - 20923986
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  20923925 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 20923986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533974
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgttgtttagt-aactaagctgcatgagtcggtctaag 21533974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 64)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 257
Target Start/End: Original strand, 23071849 - 23072070
Alignment:
Q  36 tttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgat 135  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23071849 tttaccttgttgctaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgat 23071948  T
Q  136 aattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 235  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23071949 aattgagttgctgatttatattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggact 23072048  T
Q  236 aagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23072049 aagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25176109 - 25175854
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||||||    
T  25176109 atgtaagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgtta 25176010  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  25176009 tataattatatatacgttatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 25175911  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  25175910 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28406236 - 28405981
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||| || ||    |||||  || ||||| |  ||||| ||    
T  28406236 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggta 28406137  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctat 195  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||    
T  28406136 tataattgtatatacattttatgaattaagtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctat 28406038  T
Q  196 gttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 252  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28406037 gttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 22134079 - 22134326
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||        
T  22134079 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcatttttccagtaagactgatgcatatgaattggtgttgtttataatg---- 22134174  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgtt 198  Q
        |||||||||||||| |||  ||| | ||||||| |||| ||||  |  || |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  22134175 ----ttgtatatacattaaatggattatg-ttgataaatgagatgttattgattgcattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgtt 22134269  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||    
T  22134270 gctg-ttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7679750 - 7679589
Alignment:
Q  94 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactg 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  7679750 atgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactg 7679652  T
Q  191 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  7679651 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 18786764 - 18787008
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||| || |    ||||| | ||||||  | ||||||||||    
T  18786764 atgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaattatatgattgaatgttattgataatgttat 18786863  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tgaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||    
T  18786864 atagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggtttgcatactacctatg 18786963  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786964 ttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18787008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38235
Alignment:
Q  159 gatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38138 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19672001 - 19671830
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgatggattgta 185  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||  |||||| ||||| ||   | | ||||||||| |||||||||||||  ||| |    
T  19672001 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgca 19671902  T
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  19671901 tactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20309184 - 20309108
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20309184 ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 7594 - 7835
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| | || ||||  |||| ||||||| ||||    ||||| ||||||||| |  |||||| ||    
T  7594 atgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgtgat 7693  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | ||| |  ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||    
T  7694 ataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatg 7793  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7794 ttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Original strand, 23654409 - 23654507
Alignment:
Q  159 gatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654409 gatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 22459423 - 22459541
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  || || || |||||  ||||||||| ||    
T  22459423 atgtgagttgaccttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttattgtttcagtaagactgatgtatacgagttgatgttatttataatgtgat 22459522  T
Q  101 ataattgtatatacattac 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22459523 ataattgtatatacattac 22459541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23207537 - 23207296
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||| ||| |||||  ||||| |||||| ||||    ||||| || |||||| | ||||||| ||    
T  23207537 atgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgat 23207438  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat--tgaggtgt---tgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcct 193  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||   || |||||  |||| |||   |||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || ||||||||||    
T  23207437 ataaatgtatatgcattacatgaatta---tttataatgttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcct 23207341  T
Q  194 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207340 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 257
Target Start/End: Original strand, 23708553 - 23708738
Alignment:
Q  74 atgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgaggtgt---tgatttacattcgatattgttat 169  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||| |  ||||| |||   |||||| || | |||||||||||    
T  23708553 atgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttat 23708652  T
Q  170 atcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| ||  ||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23708653 atcatgttgttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttg--aaagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Original strand, 298860 - 298933
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  298860 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23060588 - 23060513
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23060588 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 23103441 - 23103516
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23103441 ttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23285940 - 23285865
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23285940 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23791534 - 23791292
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| | ||||||| ||    
T  23791534 atgtgagttgatcttgggggttggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgat 23791435  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctat 195  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||  | | ||  ||||   | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||  || | ||||||||||    
T  23791434 ataaatgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgttttatgtactgcctat 23791335  T
Q  196 gttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23791334 gttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23076517 - 23076442
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23076517 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946657
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 22731280 - 22731355
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22731280 ttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22105480 - 22105412
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22105480 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22337168 - 22337115
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22337168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Original strand, 23040257 - 23040310
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23040257 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23660135 - 23660023
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| ||||  ||  | ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  23660135 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgat 23660037  T
Q  244 gaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||    
T  23660036 gaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 238
Target Start/End: Original strand, 22413160 - 22413240
Alignment:
Q  160 atattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22413160 atattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Original strand, 22738247 - 22738300
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22738247 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25109124 - 25108906
Alignment:
Q  25 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 124  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| | ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||     
T  25109124 aaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaa 25109025  T
Q  125 ttaagtttgataattgaggt---gttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgta--tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 219  Q
    |||  | ||||  ||||| |   ||||||||   || ||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25109024 ttatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttgatattgttatatcatgaactattttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaag 25108925  T
Q  220 ctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    || ||||||||||||||||    
T  25108924 ctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 256
Target Start/End: Original strand, 32215012 - 32215085
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  32215012 ttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 45029958 - 45030016
Alignment:
Q  195 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45029958 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 571447 - 571397
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  571447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6726045 - 6725995
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6726045 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18808993 - 18808943
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18808993 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23130912 - 23130862
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23130912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23133379 - 23133329
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23133379 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23135640 - 23135590
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23135640 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 23709644 - 23709694
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23709644 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 23712125 - 23712175
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23712125 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26505429 - 26505379
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26505429 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26507907 - 26507857
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26507907 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 34402634 - 34402684
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34402634 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39682363 - 39682313
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39682363 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 20520200 - 20520295
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520200 tgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 43137349 - 43137301
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43137349 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Original strand, 21155172 - 21155219
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21155172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 24529633 - 24529691
Alignment:
Q  195 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24529633 tgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Original strand, 24643062 - 24643109
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24643062 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24367824 - 24367774
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  24367824 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 32039610 - 32039660
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  32039610 ttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 24898307 - 24898358
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24898307 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 24900790 - 24900841
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24900790 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 24903267 - 24903318
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24903267 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 24905744 - 24905795
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24905744 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 24908219 - 24908270
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24908219 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452031
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23004863 - 23004767
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtat--actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||   ||| |||  ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23004863 tgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 24697613 - 24697709
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||  |  | ||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24697613 tgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttgatgtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 24697709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 1283751 - 1283690
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  1283751 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 1283690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 30344773 - 30344834
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  30344773 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 30344834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 82)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 13210191 - 13210448
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaatt-aatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13210191 atgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttaacattccagtaaggctgatgcatatgaattcaatgttgcttataatgtta 13210290  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13210291 tataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaagttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg 13210390  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210391 ctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16097587 - 16097332
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16097587 atgtgagttgatcttagagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 16097488  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||    
T  16097487 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgatttgcatattgcctatgt 16097388  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16097387 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 253
Target Start/End: Original strand, 12174152 - 12174376
Alignment:
Q  29 taagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaa 128  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12174152 taagttgtttagcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatcaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttat 12174251  T
Q  129 gtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 228  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174252 gtttgatatttgagttgttgttttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 12174351  T
Q  229 tcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||    
T  12174352 tcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16104038 - 16103784
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16104038 atgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactaatccatatgaattgatgttgtttataatgttat 16103939  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgtt 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  16103938 ataattttatatacattaaatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 16103839  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16103838 gctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32307926 - 32307684
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  32307926 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttctagtaagactgatgcttatgaattaatgttgtttataatgtt-- 32307829  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgtt 198  Q
          |||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  32307828 ------gtatatacattaaatggattatgtt-gataattgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 32307736  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  32307735 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9513166 - 9512924
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |    
T  9513166 atgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtttt 9513067  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||        ||||||| |||  ||| ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||     
T  9513066 ata--------tacattaaatggattatgtt-gataaatgagatgttgattg-cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 9512977  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  9512976 tgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9521141 - 9520899
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  |    
T  9521141 atgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtgtt 9521042  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||        ||||||| |||  ||| ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||     
T  9521041 ata--------tacattaaatggattatgtt-gataaatgagatgttgattg-cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 9520952  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  9520951 tgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15471174 - 15470927
Alignment:
Q  9 tgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgt 108  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||    |||||  ||| |||| |  |||||||||||||||||    
T  15471174 tgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatctaa-gttgttgttaatgttatataattgt 15471076  T
Q  109 atatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgttt 205  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |    
T  15471075 atatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtct 15470976  T
Q  206 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  15470975 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 49667947 - 49668193
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||||| |      
T  49667947 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgagttgatgttgtatataatgct-- 49668044  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgattta---cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
          |||||||| ||| |||  ||| ||| ||||| |||| ||||  || |   |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  49668045 ------gtatatactttaaatggattatgtt-gataaatgagatgtttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 49668137  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  49668138 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 1644546 - 1644787
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||        
T  1644546 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatg---- 1644641  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgtt 198  Q
        |||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||| | ||| |  ||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  1644642 ----ttgtatatacattaaatggattatg-ttgataattgagatattgttgattgtattcgatattgttatataatgatgatttgcatactgcctatgtt 1644736  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  1644737 gttg-ttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 49389492 - 49389639
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  49389492 atgtgtgttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 49389591  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg 148  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  49389592 ataattgtatatacattaaatgaattatgtttgatagttgagatgttg 49389639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14234655 - 14234487
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  14234655 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 14234556  T
Q  189 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||    
T  14234555 tgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 37251029 - 37251270
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||    ||||| || |||||| | ||||||| ||    
T  37251029 atgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgat 37251128  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctat 195  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || ||||||||||||    
T  37251129 ataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctat 37251227  T
Q  196 gttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37251228 gttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 52523735 - 52523831
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523735 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 257
Target Start/End: Original strand, 11424758 - 11424880
Alignment:
Q  134 ataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 233  Q
    ||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11424758 ataattgagatgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 11424856  T
Q  234 ctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  11424857 ctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 12934174 - 12934268
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataat 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  12934174 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 12934268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12399284 - 12399209
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399284 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 20698481 - 20698556
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20698481 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26686962 - 26686887
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26686962 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14972967 - 14972854
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 242  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14972967 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14972869  T
Q  243 tgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||    
T  14972868 tgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18438647 - 18438534
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 242  Q
    |||||| || |||| |||||| |||||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  18438647 tgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 18438549  T
Q  243 tgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||    
T  18438548 tgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Original strand, 24340665 - 24340844
Alignment:
Q  82 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 177  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| || ||||| ||||| ||   | | ||||||||| ||||||||||||    
T  24340665 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 24340764  T
Q  178 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |   || ||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  24340765 gttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13442349 - 13442274
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13442349 ttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 23083407 - 23083482
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23083407 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27165350 - 27165250
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||  ||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27165350 catttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27165251  T
Q  254 a 254  Q
    |    
T  27165250 a 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 254
Target Start/End: Original strand, 53301569 - 53301669
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  53301569 catttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 53301668  T
Q  254 a 254  Q
    |    
T  53301669 a 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Original strand, 37642207 - 37642386
Alignment:
Q  82 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 177  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| ||| ||| ||||| ||   ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  37642207 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 37642306  T
Q  178 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |  ||| ||||||||||||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  37642307 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17487931 - 17487856
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17487931 ttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17499413 - 17499338
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17499413 ttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 43841007 - 43840932
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  43841007 ttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17672735 - 17672626
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 242  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||  || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17672735 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 17672638  T
Q  243 tgaagatgatga 254  Q
    | ||||||||||    
T  17672637 ttaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  192 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 22110358 - 22110454
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110358 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23274788 - 23274687
Alignment:
Q  156 ttcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||    
T  23274788 ttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcatcgaagatgttgat 23274689  T
Q  256 gt 257  Q
    ||    
T  23274688 gt 23274687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43926073 - 43925977
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926073 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14572686 - 14572605
Alignment:
Q  159 gatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    |||||| |||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572686 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14572605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 24153217 - 24153326
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24153217 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24153315  T
Q  244 gaagatgatga 254  Q
     ||||||||||    
T  24153316 taagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 25476431 - 25476506
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25476431 ttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42386523 - 42386428
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 239  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386523 tgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 257
Target Start/End: Original strand, 43550456 - 43550644
Alignment:
Q  72 ttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagg---tgttgatttacattcgatattgtt 167  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||| ||||||||    |||||| || |||| |||||| ||    
T  43550456 ttatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 43550554  T
Q  168 atatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || ||||| ||  || | ||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43550555 atgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 6469246 - 6469296
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6469246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 7781459 - 7781509
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7781459 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499518
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 9707719 - 9707769
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9707719 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412429
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15977565 - 15977515
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15977565 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17463228 - 17463178
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17463228 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17737286 - 17737236
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17737286 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 28848723 - 28848773
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28848723 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 29172695 - 29172745
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29172695 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34159376 - 34159326
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34159376 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36166706 - 36166598
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  |||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36166706 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36166609  T
Q  244 gaagatgatga 254  Q
     ||||||||||    
T  36166608 taagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 45607019 - 45607069
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45607019 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 55476541 - 55476491
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  55476541 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 55500992 - 55500942
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  55500992 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12378036 - 12377940
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |   || |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12378036 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147646
Alignment:
Q  82 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 177  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| ||| ||| ||||| ||   ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  178 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |  ||| |||| ||||| |||| || |  |||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  22147567 gttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 252
Target Start/End: Original strand, 16282923 - 16282971
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16282923 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13544075 - 13544024
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  13544075 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Original strand, 40213729 - 40213838
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggat-tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 242  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||||||  | |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  40213729 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 40213826  T
Q  243 tgaagatgatga 254  Q
    | ||||||||||    
T  40213827 ttaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8899144 - 8899094
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  8899144 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 10247835 - 10247885
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10247835 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 12119837 - 12119887
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12119837 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12567610 - 12567564
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12567610 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 16454393 - 16454443
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16454393 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 38962003 - 38962053
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  38962003 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494809
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 50242872 - 50242822
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  50242872 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21618499 - 21618462
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618499 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21618462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 1465273 - 1465419
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga--tgcttatgaattaatgttgcttataatgtt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| || |    |||||||||| |||   || ||||    |||||||| | ||||||||    
T  1465273 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgctgtcattccagtaagcctggattgtttattc--taatgttgatgataatgtt 1465370  T
Q  99 atataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg 148  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  1465371 atacaattgtatatacattacatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 1465419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 13151902 - 13151953
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13151902 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 13154367 - 13154418
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13154367 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606428
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 17446767 - 17446816
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  17446767 ttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 53070765 - 53070799
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070765 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 14576881 - 14576937
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14576881 tatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttg 14576937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 46822318 - 46822267
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  46822318 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19776092 - 19776031
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  19776092 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 19776031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 37439418 - 37439479
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  37439418 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 37439479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7068 - 6831
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7068 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgtttataatgttat 6969  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||     
T  6968 ataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 6869  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6868 tgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaag 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 8274 - 8097
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||    
T  8274 atgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttat 8175  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||   | |||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  8174 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 45654 - 45909
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  45654 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatattgctgtaattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 45753  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |    
T  45754 ataattgtatatacatcacatgaattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctattt 45853  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  45854 ttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 29142 - 29354
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata---atgt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  29142 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataattatgt 29241  T
Q  98 tatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  29242 tatataattgtatatacagtacatgacttaagtttgataattgagttgctgatttacattcgatattattatatcatgatagtttgaatactacctatgt 29341  T
Q  198 tgttgtttgttat 210  Q
    || ||||||||||    
T  29342 tgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 7938 - 8179
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||||| ||||    ||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  7938 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgtt---gtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgataatgttat 8034  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tgaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  | ||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  8035 atagttgtatatacattacatgaattatatatgatgttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatg 8134  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8135 ttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 8179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 10403 - 10646
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10403 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 10502  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  10503 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 10602  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10603 tgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttg 10646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 2307 - 2508
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2307 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttttttaccttgctattaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 2406  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||    
T  2407 ataattgtatatacattaaatgacttaagtttgataattgagttgctgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatacggtctaagttgt 2506  T
Q  201 tg 202  Q
    ||    
T  2507 tg 2508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 130164 - 129921
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  130164 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttacaatgttat 130065  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  130064 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 129965  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  129964 tgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttg 129921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 60723 - 60818
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60723 tgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 1022 - 1190
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  1022 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 1121  T
Q  189 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1122 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 160942 - 160688
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||| | ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  160942 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 160843  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  160842 ataattgtatatatattacatgacttatgtttgatatttgacatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 160743  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  160742 gctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85742
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 501134 - 501088
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  501134 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 387 - 133
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||  ||||| ||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  387 atgtgagttgatcttagaggttagaaactgagttgtt-atcttgctgttgttgttctagtgagactgatacatatgaattgatgttgtttataatattat 289  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  288 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 189  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  188 tgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 22536 - 22775
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||    | |||||| ||||||||||||    
T  22536 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttgtcttgatgttgctgttccagtaagactgatgcatat----tgatgttgtttataatgttat 22631  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||    
T  22632 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgt 22731  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22732 cgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 22775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 82122 - 82072
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  82122 ttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13025 - 12766
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||    |||||  |||||||| |  |||||||||    
T  13025 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtggtttatcttgctgttgttgttccagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttattaatgttat 12926  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||    
T  12925 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgt 12826  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  12825 tgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6793 - 6535
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| ||    
T  6793 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtt-atcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggta 6695  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  6694 tataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 6596  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6595 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8728 - 8482
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  8728 atgtgaattgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgtatatgaattgatgttgtttataatgtgat 8629  T
Q  101 ataat--tgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgccta 194  Q
    |||||  |||||||||||||| ||| |||  | ||| || ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  8628 ataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgccta 8529  T
Q  195 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8528 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 8482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1341 - 1098
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |  |||||||||    
T  1341 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttttttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgtatatgatttgatgttgttgttaatgttat 1242  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttac---attcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||  |||||||   |   ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  1241 atagttgtatatacattccatgaattatgtttgatgtttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 1142  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1141 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 5985 - 6244
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||    
T  5985 atgttagttgatcttggaggttaaaaactaagttatttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttat 6084  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||| ||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  6085 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 6184  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6185 tactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19523 - 19268
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||  |||||    |||||  |||||||| |  ||||| ||    
T  19523 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggta 19424  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  19423 tataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 19325  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19324 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10786 - 10543
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||| ||    
T  10786 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgtcat 10687  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  10686 ataattgtatatacattacatgaattatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 10587  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  10586 tgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttg 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32345 - 32102
Alignment:
Q  6 agttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataat 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||      
T  32345 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata-- 32248  T
Q  106 tgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttg 202  Q
        ||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||| | ||||||||||    
T  32247 ----tatacattaaatggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttg 32153  T
Q  203 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  32152 tttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 53410 - 53651
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||    
T  53410 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgat 53509  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||| ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||    
T  53510 ataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatg 53609  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53610 ttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 62454 - 62216
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||| |  ||||||| ||||| || |  ||||||||    
T  62454 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgtta 62355  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| ||||| | | ||||||||||| ||||| |||||||  ||  |||||||||||||||    
T  62354 tataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgtgcattcgatattattataccatgatgtttttcatactgcctatgttg 62256  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 239  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62255 ctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 132910 - 132662
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |    
T  132910 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgt 132811  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatg-gattgtatactgcctatgt 197  Q
    |      ||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||| | |||||    
T  132810 a------tatatacattaaatggattatg-ttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgt 132718  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  132717 tgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 136730 - 136680
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  136730 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 139199 - 139149
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  139199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 144137 - 144087
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  144137 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 134261 - 134211
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  134261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 141668 - 141618
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  141668 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 40036 - 40291
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||| |   |||||  | |||||| |  ||||| ||    
T  40036 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggta 40135  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  40136 tataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctactgcctatg 40234  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  40235 ttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 100633 - 100378
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||| || | |   |||||  |||||||| |  ||||||||    
T  100633 atgtgacttgctcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgttaatgtta 100534  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| ||||   | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  100533 tataattgtatatacattatatgaattatg-ttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatg 100435  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  100434 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 101580 - 101503
Alignment:
Q  176 atggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  101580 atggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44504 - 44454
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44504 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 94461 - 94411
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  94461 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Original strand, 17552 - 17598
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17552 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 101652 - 101616
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  101652 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtt 101616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5901 - 5659
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  |||| ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| ||    
T  5901 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagtt-tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggta 5803  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  5802 tataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatactgcctatg 5704  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5703 ttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttg 5659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 2507 - 2762
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| ||    
T  2507 atgtgagttgatcttagaggttagaaattaagttgtttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggta 2606  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||    
T  2607 tataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttacatactgcctatg 2705  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2706 ttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6870 - 6611
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||  |||    |||||  |||||||| |  |||||||||    
T  6870 atgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttat 6771  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||    || ||||   || ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  6770 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgt 6671  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6670 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14250 - 13991
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||  |||    |||||  |||||||| |  |||||||||    
T  14250 atgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttat 14151  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||    || ||||   || ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  14150 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgt 14051  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14050 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 32794 - 32538
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||  |  |||||||||    
T  32794 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgtttttgttaatgttat 32695  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat--ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgtt 198  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  32694 atagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgtt 32595  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  32594 gctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg--aaagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 51936 - 51985
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51936 ctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 897 - 1155
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaat-taatgttgcttataatgtta 99  Q
    |||| |||||||||| || |||| |||||||||| |||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||   || | ||| |||||||| |  ||||||||    
T  897 atgttagttgatcttggaagttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaa--ttgtaaatctaatgttgttgctaatgtta 994  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   || |||||||| ||||||||||||||||   || ||||| ||||||    
T  995 tataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatactacctatg 1094  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1095 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13198 - 12942
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||| ||||     || |  |||||||| |  |||||||||    
T  13198 atgtgagttgatcatggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattggataatctaatgttgttgctaatgttat 13099  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  | |||||||   || |||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||    
T  13098 ataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgt 12999  T
Q  198 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  12998 tgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 14559 - 14814
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||  |||| ||||||| |||||    |||||  |||||||  |  ||||| ||    
T  14559 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtatatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggta 14658  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||   |||| |||||||||||  ||||||||||||  ||   |||||||||||    
T  14659 tataatagtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttactgcctatg 14757  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14758 ttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12827 - 12587
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| || |||  ||| | || |||||| ||||||||| ||    
T  12827 atgtgagttgatcttagaggtaataaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctaatgtgtattatttgatgttgtttataatgtgat 12728  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgaggtgttgat---ttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | | | || ||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||    
T  12727 ataattgtatatacattac-tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatg 12629  T
Q  197 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12628 ttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Original strand, 15795 - 15898
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15795 cattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15894  T
Q  254 atgt 257  Q
    ||||    
T  15895 atgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 15694 - 15761
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga 68  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  15694 atgtgagttgatcttggagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 15761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178898
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 2666 - 2923
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||    |||||  || ||||| |  ||||| ||    
T  2666 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctattgttgttgttaatggta 2765  T
Q  100 tataattgtatata----cattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcc 192  Q
    ||  ||||||||||    ||||  |||| ||||| | |||| ||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  2766 ta--attgtatatatatacattttatgaattaagct-gatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcc 2862  T
Q  193 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2863 tatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 28673 - 28775
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  28673 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 28772  T
Q  101 ata 103  Q
    |||    
T  28773 ata 28775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7342 - 7266
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7342 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1365 - 1289
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1365 ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 15306 - 15356
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  15306 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 136229 - 136471
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaatt-aatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || ||||||| |  ||||||||    
T  136229 atgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgtta 136328  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tgaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctat 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||  ||| || ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||    
T  136329 tatagttgtatatacattacatgaattatgtacgatgatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctat 136428  T
Q  196 gttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    || | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  136429 gtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 144937 - 145179
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaatt-aatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || ||||||| |  ||||||||    
T  144937 atgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgtta 145036  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tgaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctat 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||  ||| || ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||    
T  145037 tatagttgtatatacattacatgaattatgtacgatgatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctat 145136  T
Q  196 gttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    || | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  145137 gtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 174842 - 174767
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  174842 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Original strand, 23901 - 24001
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23901 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatg 23997  T
Q  254 atgt 257  Q
    ||||    
T  23998 atgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 1094 - 1169
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1094 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4787 - 4712
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4787 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 168024 - 168099
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168024 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 51988 - 51913
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51988 ttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 256
Target Start/End: Original strand, 3194 - 3306
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 242  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3194 tgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 3292  T
Q  243 tgaagatgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||    
T  3293 tgaagatgatgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Original strand, 3159 - 3271
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3159 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3257  T
Q  244 gaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||    
T  3258 gaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 7920 - 8161
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| ||||||||| ||    
T  7920 atgtgagttgatcttagaggtatgaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgat 8019  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga----ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgccta 194  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||  | |||   || |    | |||||| || |||| |||||| |||||||||||  ||  ||| ||||||||||    
T  8020 ataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgccta 8119  T
Q  195 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    || || | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8120 tgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 241
Target Start/End: Original strand, 16108 - 16205
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108 tgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13241 - 13147
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13241 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 241
Target Start/End: Original strand, 27757 - 27854
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27757 tgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 27854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 10468 - 10544
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10468 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16358 - 16282
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16358 ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16188 - 16113
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16188 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Original strand, 32980 - 33077
Alignment:
Q  159 gatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32980 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 46025 - 45928
Alignment:
Q  159 gatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46025 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Original strand, 17397 - 17450
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17397 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 51658 - 51582
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  51658 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39589 - 39479
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39589 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39491  T
Q  244 gaagatgatgat 255  Q
    ||||| ||||||    
T  39490 gaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 47070 - 46995
Alignment:
Q  182 tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47070 tgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 255
Target Start/End: Original strand, 75223 - 75333
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  75223 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 75321  T
Q  244 gaagatgatgat 255  Q
    ||||| ||||||    
T  75322 gaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 2080 - 2283
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||    |||||   ||||||| |  ||||| ||    
T  2080 atgtgagttgatcttagaggttagaaaataagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggta 2179  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---ggtgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||| ||||   | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  2180 tataattgtatatacattatatgaattatg-ctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 2278  T
Q  197 ttgtt 201  Q
    |||||    
T  2279 ttgtt 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11643 - 11464
Alignment:
Q  82 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 177  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| ||| ||| ||||| ||   ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  11643 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 11544  T
Q  178 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |  ||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  11543 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Original strand, 38198 - 38377
Alignment:
Q  82 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 177  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| ||| ||| ||||| ||   ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  38198 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 38297  T
Q  178 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |  ||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  38298 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 1094 - 1170
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1094 ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13572 - 13497
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13572 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4924 - 4849
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4924 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 32142 - 32067
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32142 ttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 103500 - 103736
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||   |||||||||| |||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    ||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  103500 atgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttctttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttat 103599  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgtt 198  Q
     || ||||||||||||||||||| ||| || ||||      | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || |||||| ||||||||    
T  103600 gtagttgtatatacattacatgaattatgtatgat------gttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgtt 103693  T
Q  199 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    | ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  103694 gctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttg 103736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1130 - 1051
Alignment:
Q  159 gatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1130 gatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 6167 - 6245
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6167 ttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 256
Target Start/End: Original strand, 17263 - 17337
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17263 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 79396 - 79430
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Original strand, 15487 - 15584
Alignment:
Q  159 gatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15487 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctctt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Original strand, 5173 - 5246
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5173 ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Original strand, 128855 - 129072
Alignment:
Q  25 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 124  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| |||||    |||| || |||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  128855 aaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaa 128954  T
Q  125 ttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 219  Q
    |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  128955 ttatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaag 129053  T
Q  220 ctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||    
T  129054 ctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 116480 - 116430
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  116480 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 78436 - 78345
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 234  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  78436 tgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 11489 - 11564
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11489 ttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13286 - 13211
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13286 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 254
Target Start/End: Original strand, 38720 - 38820
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  38720 catttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatg 38819  T
Q  254 a 254  Q
    |    
T  38820 a 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1926 - 1851
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1926 ttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 207470 - 207531
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||  |||||||    
T  207470 ttataatgttatataattatatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgat 207531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 254
Target Start/End: Original strand, 339972 - 340065
Alignment:
Q  159 gatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  339972 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 158562 - 158612
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  158562 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 250
Target Start/End: Original strand, 26073 - 26179
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 242  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26073 tgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26171  T
Q  243 tgaagatg 250  Q
    ||||||||    
T  26172 tgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Original strand, 44753 - 44825
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  44753 ttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25276 - 25122
Alignment:
Q  91 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga--tggattgta 185  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| ||||| ||||||||||||  ||  || ||    
T  25276 ataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgttttata 25178  T
Q  186 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25177 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 25122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Original strand, 17969 - 18148
Alignment:
Q  82 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgaggtgttgatt---tacattcgatattgttatatcatgat 177  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| || ||||| ||||| ||   | | ||||||||| ||||||||||||    
T  17969 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 18068  T
Q  178 ggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |   || ||| ||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  18069 gttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2291
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 38873 - 38761
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 243  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  38873 tgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgat 38775  T
Q  244 gaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||    
T  38774 gaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33044 - 32942
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33044 catttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatg 32946  T
Q  254 atgt 257  Q
    ||||    
T  32945 atgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9799 - 9744
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtcc 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  9799 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2027 - 1952
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2027 ttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 418 - 343
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  418 ttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3545 - 3470
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3545 ttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40015 - 39913
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40015 catttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 39917  T
Q  254 atgt 257  Q
    ||||    
T  39916 atgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 238
Target Start/End: Original strand, 19749 - 19987
Alignment:
Q  4 tgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatata 103  Q
    |||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||  |||    ||||| || |||||  | ||||||| |||||    
T  19749 tgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaattatatgatttgatgttattaataatgtgatata 19848  T
Q  104 attgtatatacattacatgacttaagtttgataatt-gaggt-gttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttg 199  Q
    | ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |  || || ||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||    
T  19849 aatgtatatgcattacatgagttatttatgatgctgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttg 19948  T
Q  200 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
     ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19949 ctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 48936 - 48997
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  48936 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 48997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25998 - 25896
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| |||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25998 catttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatg 25900  T
Q  254 atgt 257  Q
    ||||    
T  25899 atgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 39960 - 39858
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| |||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39960 catttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 39862  T
Q  254 atgt 257  Q
    ||||    
T  39861 atgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 2165 - 2267
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |  | | |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |    
T  2165 atgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgatcttatcccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgt 2264  T
Q  101 ata 103  Q
    |||    
T  2265 ata 2267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8554 - 8479
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8554 ttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Original strand, 8598 - 8650
Alignment:
Q  205 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8598 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Original strand, 6235 - 6386
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtat 186  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| |||||||| |||||||||  ||  || |||    
T  6235 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatat 6334  T
Q  187 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6335 actgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 238
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13840
Alignment:
Q  191 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 257
Target Start/End: Original strand, 16648 - 16721
Alignment:
Q  183 gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16648 gtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 239
Target Start/End: Original strand, 24349 - 24406
Alignment:
Q  181 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 239  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24349 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 664 - 569
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  664 tgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 97242 - 97024
Alignment:
Q  25 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 124  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||  |||| ||||||| |||||    |||| || |||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  97242 aaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaa 97143  T
Q  125 ttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 219  Q
    |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  97142 ttatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaag 97043  T
Q  220 ctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  97042 ctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 106520 - 106302
Alignment:
Q  25 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 124  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||  |||| ||||||| |||||    |||| || |||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  106520 aaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaa 106421  T
Q  125 ttaagtttgataattgaggtgttg---atttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 219  Q
    |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || | |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  106420 ttatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaag 106321  T
Q  220 ctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  106320 ctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 267775 - 267679
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  || |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  267775 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 257
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  190 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13442 - 13392
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13442 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20797 - 20747
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20797 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22936 - 22886
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22936 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16834 - 16784
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16834 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37871 - 37821
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37871 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38431 - 38339
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 234  Q
    |||||| || |||| |||||||| |||||||||  ||  || |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38431 tgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10882 - 10772
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 242  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||||||  || ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10882 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 10785  T
Q  243 tgaagatgatgat 255  Q
    | |||||| ||||    
T  10784 ttaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20978 - 20910
Alignment:
Q  189 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20978 tgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4347 - 4300
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4347 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9292 - 9241
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  9292 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2780 - 2694
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatga--tggattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||    
T  2780 catttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 106
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  156 ttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4744 - 4694
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  4744 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13997 - 13947
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13997 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40450 - 40400
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  40450 ttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 254
Target Start/End: Original strand, 161206 - 161252
Alignment:
Q  208 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  161206 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23843
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4262 - 4214
Alignment:
Q  206 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4262 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Original strand, 12361 - 12413
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  12361 ttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12108 - 12064
Alignment:
Q  210 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12108 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29982 - 29946
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29982 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4595 - 4545
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 236  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4595 atactgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 238
Target Start/End: Original strand, 20373 - 20524
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagg---tgttgatttacattcgatattgttatatcatgatggattgt 184  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  ||||    
T  20373 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgt 20472  T
Q  185 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20473 atactga-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 128805 - 128751
Alignment:
Q  203 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||    
T  128805 tttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12016 - 11982
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12016 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9181 - 9136
Alignment:
Q  154 cattcgatattgttatatcatgatggattgtatactgcctatgttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  9181 cattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttg 9136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 9333 - 9275
Alignment:
Q  2 tgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagt 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||| ||||||||||    
T  9333 tgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagt 9275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4560 - 4508
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  4560 ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12142 - 12090
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  12142 ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22094 - 22042
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  22094 ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11338 - 11286
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||    
T  11338 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 91 - 30
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgaggtgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  91 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 6018 times since January 2019
Visitors: 4867