View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0755_high_8 (Length: 468)

Name: NF0755_high_8
Description: NF0755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0755_high_8
NF0755_high_8
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (5-442)||(12374-12811)
chr5 (5-442)||(21073410-21073847)
chr5 (12-442)||(18777814-18778244)
chr5 (12-442)||(22366302-22366733)
chr5 (12-442)||(19499899-19500328)
chr5 (12-442)||(25426628-25427058)
chr5 (12-442)||(4199807-4200237)
chr5 (12-442)||(43443220-43443647)
chr5 (38-442)||(27009841-27010244)
chr5 (12-390)||(29188107-29188483)
chr5 (12-274)||(10777793-10778058)
chr5 (210-442)||(23506965-23507196)
chr5 (12-274)||(21932204-21932469)
chr5 (12-274)||(21938374-21938639)
chr5 (209-442)||(27182578-27182810)
chr5 (12-274)||(35582204-35582469)
chr5 (12-241)||(22882907-22883139)
chr5 (38-274)||(7425492-7425729)
chr5 (62-274)||(11211940-11212153)
chr5 (12-274)||(36989593-36989858)
chr5 (190-442)||(22053845-22054096)
chr5 (190-442)||(18531079-18531330)
chr5 (63-374)||(35790974-35791287)
chr5 (12-274)||(17471411-17471676)
chr5 (190-431)||(34939289-34939528)
chr5 (63-274)||(23514729-23514941)
chr5 (100-274)||(1219433-1219608)
chr5 (12-136)||(11343008-11343134)
chr5 (100-208)||(23328791-23328900)
chr5 (100-208)||(24616395-24616504)
chr5 (100-208)||(24712771-24712880)
chr5 (100-208)||(24745789-24745898)
chr5 (190-325)||(20623085-20623220)
chr5 (190-325)||(21233540-21233675)
chr5 (190-324)||(25900418-25900552)
chr5 (190-325)||(16536313-16536448)
chr5 (190-325)||(37052860-37052995)
chr5 (12-136)||(16105967-16106093)
chr5 (398-438)||(29190482-29190522)
chr5 (401-442)||(17471803-17471844)
chr5 (193-274)||(32950862-32950943)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (12-442)||(19886483-19886913)
chr2 (190-442)||(17396665-17396916)
chr2 (190-437)||(462743-462989)
chr2 (209-442)||(19794735-19794967)
chr2 (12-274)||(11231161-11231426)
chr2 (12-274)||(22513008-22513273)
chr2 (12-274)||(28775630-28775895)
chr2 (190-442)||(8891242-8891493)
chr2 (12-274)||(24685604-24685869)
chr2 (190-442)||(36982453-36982704)
chr2 (190-442)||(43642969-43643220)
chr2 (190-442)||(7507856-7508107)
chr2 (209-442)||(20627344-20627576)
chr2 (209-442)||(24341420-24341652)
chr2 (100-274)||(8944014-8944189)
chr2 (100-274)||(12728560-12728735)
chr2 (100-274)||(3798516-3798691)
chr2 (100-274)||(34824643-34824818)
chr2 (105-274)||(23777963-23778133)
chr2 (12-136)||(24826522-24826646)
chr2 (190-442)||(25265402-25265653)
chr2 (63-274)||(16935761-16935973)
chr2 (63-274)||(17006421-17006633)
chr2 (63-274)||(42177845-42178057)
chr2 (100-274)||(12635781-12635956)
chr2 (105-274)||(12641560-12641730)
chr2 (100-208)||(23774370-23774479)
chr2 (190-325)||(19689413-19689548)
chr2 (190-325)||(23820187-23820322)
chr2 (105-208)||(5888548-5888652)
chr2 (190-325)||(14906452-14906587)
chr2 (151-239)||(21142098-21142187)
chr2 (190-325)||(20015127-20015262)
chr2 (63-136)||(25213372-25213446)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (12-442)||(27653805-27654235)
chr6 (38-442)||(25175563-25175968)
chr6 (116-442)||(16825678-16826006)
chr6 (12-438)||(14625952-14626377)
chr6 (105-438)||(1650022-1650352)
chr6 (12-274)||(16376196-16376461)
chr6 (12-274)||(16383520-16383785)
chr6 (12-274)||(10488867-10489132)
chr6 (12-241)||(22251389-22251621)
chr6 (38-274)||(16232060-16232297)
chr6 (12-274)||(22225561-22225826)
chr6 (192-431)||(23153458-23153696)
chr6 (12-212)||(19299467-19299670)
chr6 (23-274)||(16555973-16556227)
chr6 (23-274)||(16632529-16632783)
chr6 (38-274)||(18086674-18086911)
chr6 (190-442)||(35009451-35009702)
chr6 (190-431)||(1657760-1657999)
chr6 (100-274)||(1556173-1556348)
chr6 (63-274)||(19610186-19610398)
chr6 (100-274)||(23977937-23978112)
chr6 (38-208)||(29869627-29869798)
chr6 (192-431)||(15862484-15862720)
chr6 (109-374)||(29665941-29666208)
chr6 (105-274)||(13620712-13620882)
chr6 (12-121)||(16814820-16814930)
chr6 (191-263)||(27751603-27751675)
chr6 (293-442)||(27740838-27740985)
chr6 (63-136)||(4991396-4991470)
chr6 (194-278)||(19854317-19854402)
chr6 (218-278)||(29605612-29605672)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (12-442)||(36093-36523)
scaffold0023 (16-229)||(169736-169951)
scaffold0023 (190-442)||(48598-48849)
scaffold0023 (100-274)||(153920-154095)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (12-442)||(30120722-30121153)
chr8 (12-442)||(21851786-21852217)
chr8 (12-442)||(21844393-21844824)
chr8 (41-442)||(16674245-16674644)
chr8 (12-438)||(24548986-24549410)
chr8 (12-438)||(6774082-6774505)
chr8 (252-442)||(222753-222943)
chr8 (252-442)||(736376-736566)
chr8 (252-442)||(860271-860461)
chr8 (184-442)||(43373474-43373731)
chr8 (12-274)||(271183-271448)
chr8 (12-274)||(644472-644737)
chr8 (12-274)||(830207-830472)
chr8 (190-443)||(16193728-16193980)
chr8 (12-215)||(15318982-15319188)
chr8 (12-215)||(15499351-15499557)
chr8 (12-274)||(22088617-22088882)
chr8 (190-431)||(24928803-24929043)
chr8 (100-274)||(22006171-22006346)
chr8 (190-442)||(16404987-16405235)
chr8 (63-274)||(13720804-13721016)
chr8 (93-274)||(16195399-16195581)
chr8 (100-274)||(16872964-16873139)
chr8 (63-274)||(13662141-13662353)
chr8 (194-431)||(17345581-17345816)
chr8 (190-442)||(22907226-22907476)
chr8 (252-314)||(691908-691970)
chr8 (190-325)||(5238203-5238338)
chr8 (190-325)||(24661260-24661395)
chr8 (190-325)||(43685662-43685797)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (12-442)||(13910846-13911277)
chr7 (12-442)||(10989410-10989841)
chr7 (12-442)||(2437457-2437889)
chr7 (38-442)||(13572676-13573079)
chr7 (12-442)||(16478785-16479213)
chr7 (105-442)||(18253761-18254098)
chr7 (190-436)||(25292350-25292595)
chr7 (190-442)||(47481043-47481294)
chr7 (12-274)||(7822896-7823161)
chr7 (12-274)||(7830207-7830472)
chr7 (12-274)||(27176601-27176866)
chr7 (190-442)||(13037026-13037277)
chr7 (190-437)||(11580751-11580997)
chr7 (12-274)||(27101460-27101725)
chr7 (12-274)||(27108808-27109073)
chr7 (12-274)||(38783552-38783817)
chr7 (38-274)||(18979872-18980109)
chr7 (190-440)||(16211768-16212017)
chr7 (209-442)||(36052667-36052896)
chr7 (190-442)||(3059966-3060217)
chr7 (38-274)||(15927736-15927973)
chr7 (12-274)||(15950613-15950879)
chr7 (190-442)||(13321014-13321267)
chr7 (100-274)||(13758538-13758713)
chr7 (100-274)||(15760027-15760202)
chr7 (190-442)||(7293017-7293267)
chr7 (105-187)||(15862174-15862257)
chr7 (105-276)||(48622584-48622756)
chr7 (100-274)||(14250811-14250986)
chr7 (190-325)||(11516343-11516478)
chr7 (190-325)||(15441576-15441711)
chr7 (190-325)||(30262141-30262276)
chr7 (105-208)||(16418731-16418835)
chr7 (105-208)||(10000288-10000392)
chr7 (215-439)||(296003-296224)
chr7 (62-136)||(15516719-15516793)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (12-442)||(31497-31928)
scaffold0008 (209-442)||(128200-128431)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (12-442)||(10644219-10644648)
chr4 (100-442)||(47357654-47357994)
chr4 (218-434)||(13048261-13048477)
chr4 (209-442)||(13246430-13246662)
chr4 (210-442)||(54118276-54118507)
chr4 (190-442)||(15675101-15675352)
chr4 (38-274)||(15287096-15287333)
chr4 (209-442)||(31115629-31115861)
chr4 (12-274)||(18169138-18169403)
chr4 (38-274)||(15294205-15294442)
chr4 (190-348)||(121983-122140)
chr4 (100-274)||(7131978-7132153)
chr4 (105-274)||(19020654-19020824)
chr4 (209-374)||(10104281-10104445)
chr4 (63-274)||(17145533-17145745)
chr4 (100-274)||(20000891-20001066)
chr4 (38-208)||(22351915-22352086)
chr4 (190-442)||(26680201-26680451)
chr4 (105-239)||(18248421-18248556)
chr4 (114-216)||(8378377-8378480)
chr4 (100-208)||(26339253-26339362)
chr4 (143-274)||(22738437-22738568)
chr4 (344-442)||(111395-111493)
chr4 (190-325)||(10488678-10488813)
chr4 (190-325)||(16327938-16328073)
chr4 (209-374)||(40885585-40885749)
chr4 (38-136)||(14952085-14952183)
chr4 (105-179)||(9795490-9795564)
chr4 (398-442)||(10104450-10104494)
chr4 (105-137)||(14996444-14996476)
chr4 (190-241)||(33240900-33240951)
chr4 (105-138)||(8378491-8378524)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (38-442)||(55316219-55316622)
chr3 (38-442)||(41270075-41270478)
chr3 (100-442)||(16821139-16821479)
chr3 (105-438)||(15614838-15615168)
chr3 (105-442)||(15936553-15936890)
chr3 (105-439)||(15938395-15938729)
chr3 (63-442)||(14842446-14842824)
chr3 (190-443)||(51158030-51158282)
chr3 (190-442)||(15859036-15859287)
chr3 (190-442)||(13975734-13975985)
chr3 (190-442)||(45860805-45861056)
chr3 (12-274)||(49232604-49232869)
chr3 (190-442)||(13954902-13955153)
chr3 (12-374)||(12264614-12264981)
chr3 (12-274)||(1467562-1467827)
chr3 (190-442)||(12030159-12030410)
chr3 (190-431)||(13838905-13839145)
chr3 (190-442)||(2049810-2050061)
chr3 (12-241)||(12812042-12812274)
chr3 (12-274)||(22275377-22275642)
chr3 (63-274)||(15468216-15468428)
chr3 (63-274)||(25058907-25059119)
chr3 (63-274)||(18911161-18911373)
chr3 (212-442)||(17912516-17912744)
chr3 (105-274)||(12902008-12902178)
chr3 (63-241)||(18896920-18897099)
chr3 (100-274)||(5228481-5228655)
chr3 (105-325)||(54651573-54651795)
chr3 (212-442)||(16744149-16744377)
chr3 (190-325)||(2449250-2449385)
chr3 (105-274)||(44229153-44229323)
chr3 (329-442)||(47984650-47984763)
chr3 (329-442)||(47993937-47994050)
chr3 (329-442)||(48003224-48003337)
chr3 (329-442)||(48012510-48012623)
chr3 (100-137)||(8268646-8268683)
chr3 (100-137)||(8275746-8275783)
chr3 (401-442)||(15468555-15468596)
chr3 (193-274)||(11986181-11986262)
chr3 (401-442)||(22275209-22275250)
chr3 (194-278)||(41661727-41661812)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (12-442)||(42997-43427)
scaffold0076 (12-274)||(39271-39536)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (38-442)||(5072237-5072640)
chr1 (143-442)||(18601071-18601370)
chr1 (66-442)||(22227809-22228185)
chr1 (66-442)||(22232506-22232882)
chr1 (105-438)||(2116258-2116589)
chr1 (105-376)||(45051489-45051757)
chr1 (190-442)||(20931345-20931596)
chr1 (12-274)||(18059581-18059846)
chr1 (12-274)||(17148735-17149001)
chr1 (190-442)||(20913037-20913281)
chr1 (12-274)||(17004806-17005071)
chr1 (209-442)||(20893657-20893889)
chr1 (12-274)||(38054914-38055179)
chr1 (210-442)||(20445679-20445910)
chr1 (190-442)||(41394222-41394473)
chr1 (12-212)||(19962322-19962525)
chr1 (218-442)||(20531444-20531667)
chr1 (212-442)||(37844484-37844714)
chr1 (100-274)||(46523557-46523731)
chr1 (63-208)||(22035681-22035827)
chr1 (100-208)||(7640847-7640956)
chr1 (212-325)||(51452608-51452721)
chr1 (62-136)||(15861284-15861358)
chr1 (398-438)||(45051446-45051486)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (12-442)||(20936-21367)
scaffold0139 (12-442)||(13882-14312)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (38-442)||(64372-64780)
scaffold0026 (105-442)||(107747-108084)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (100-442)||(35-374)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (38-336)||(1153-1450)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (63-442)||(5088-5466)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (63-442)||(3722-4102)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (34-343)||(13171-13477)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (105-438)||(9266-9596)
scaffold0215 (105-438)||(16164-16494)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (63-438)||(2966-3341)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (190-418)||(5552-5780)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (105-442)||(12115-12449)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (190-440)||(3594-3843)
scaffold0266 (190-442)||(1124-1375)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (190-442)||(6076-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (190-442)||(968-1218)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (190-442)||(48187-48438)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (210-442)||(8878-9109)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (47-216)||(29388-29558)
scaffold0213 (12-73)||(29565-29627)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (193-442)||(148721-148969)
scaffold0025 (190-442)||(8849-9100)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (190-442)||(19206-19457)
scaffold0195 (190-442)||(21290-21541)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (210-442)||(123196-123427)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (12-274)||(31477-31742)
scaffold0107 (153-274)||(39814-39935)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (209-442)||(36944-37176)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (209-442)||(5092-5324)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (190-431)||(247454-247694)
scaffold0012 (105-274)||(34076-34246)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (190-442)||(26427-26678)
scaffold0162 (190-325)||(8192-8327)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (209-431)||(171916-172137)
scaffold0001 (209-431)||(177619-177840)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (190-438)||(41733-41980)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (105-442)||(34374-34724)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (190-442)||(546-797)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (209-436)||(272031-272257)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (63-216)||(10624-10778)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (63-274)||(1451-1663)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (12-239)||(7278-7509)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (12-274)||(2560-2826)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (193-442)||(41648-41896)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (63-274)||(1390-1602)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (38-208)||(6831-7002)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (105-442)||(13506-13855)
scaffold0132 (104-136)||(42677-42709)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (336-442)||(9-115)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (105-274)||(10257-10427)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (336-442)||(48514-48620)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (190-324)||(51194-51328)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (143-276)||(3579-3712)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (38-206)||(23600-23769)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (190-442)||(37078-37328)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (105-374)||(45098-45369)
scaffold0066 (105-374)||(54484-54755)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (105-276)||(54040-54212)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (190-324)||(89466-89600)
scaffold0028 (12-136)||(130880-131006)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (344-442)||(9382-9480)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (184-271)||(3360-3447)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (105-208)||(12045-12149)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (105-208)||(7443-7547)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (190-325)||(22656-22791)
scaffold0141 (190-325)||(26911-27046)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (190-325)||(1594-1729)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (105-179)||(13268-13342)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (38-129)||(154282-154373)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (12-136)||(17115-17241)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (193-374)||(56114-56295)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (194-278)||(27659-27744)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 414; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12811 - 12374
Alignment:
Q  5 gaggagcagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttca 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12811 gaggagaagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttca 12712  T
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12711 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 12612  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12611 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 12512  T
Q  305 ttgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 404  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12511 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 12412  T
Q  405 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12411 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 442
Target Start/End: Original strand, 21073410 - 21073847
Alignment:
Q  5 gaggagcagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttca 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21073410 gaggagaagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttca 21073509  T
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21073510 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgct 21073609  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073610 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 21073709  T
Q  305 ttgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 404  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21073710 ttgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttgatattatgattgatga 21073809  T
Q  405 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073810 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Original strand, 18777814 - 18778244
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  18777814 agagaagaacaagagggttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataattaacttcaaaggtaa 18777913  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18777914 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctg 18778013  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778014 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 18778113  T
Q  312 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778114 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattg 18778213  T
Q  412 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778214 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Original strand, 22366302 - 22366733
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  22366302 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttagcaatcaagtggggtgacctaggagttgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 22366401  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22366402 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttgct 22366501  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366502 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 22366601  T
Q  311 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366602 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 22366701  T
Q  411 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366702 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19500328 - 19499899
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  19500328 agagaagaacaagagagttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 19500230  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19500229 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttgctg 19500130  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500129 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 19500030  T
Q  312 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19500029 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgattaataattg 19499930  T
Q  412 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19499929 ctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25427058 - 25426628
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaag-gataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||  | || ||||||||||||||||||||    
T  25427058 agagaagagcaagagggttgaagggaagcttaaagaatcaagtgggtaac-taggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggta 25426960  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25426959 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 25426860  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426859 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 25426760  T
Q  311 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426759 taaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 25426660  T
Q  411 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426659 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Original strand, 4199807 - 4200237
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  4199807 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 4199906  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4199907 gggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttg 4200006  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4200007 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 4200106  T
Q  312 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4200107 aaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattg 4200206  T
Q  412 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4200207 cttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Original strand, 43443220 - 43443647
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  43443220 agagaagagcatgagggttgaagggaagctt-aggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 43443318  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43443319 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaatt--gcatattctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctg 43443416  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43443417 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 43443516  T
Q  312 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443517 caattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 43443616  T
Q  412 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43443617 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 38 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 27010244 - 27009841
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27010244 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 27010145  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27010144 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 27010046  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 337  Q
    |||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27010045 gatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgt 27009946  T
Q  338 tgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 437  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27009945 tgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgt 27009846  T
Q  438 tgatg 442  Q
    |||||    
T  27009845 tgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 390
Target Start/End: Original strand, 29188107 - 29188483
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  29188107 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 29188206  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  29188207 agggggttagtgattattataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 29188304  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||    
T  29188305 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T
Q  311 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgat 390  Q
    | ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  29188405 tcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 29188483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 10777793 - 10778058
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10777793 agagaagaacaagagagttgaaggggaagcttgaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaaggataatcatcttcaaaggt 10777892  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  10777893 aaggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 10777992  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10777993 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10778058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 210 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23507196 - 23506965
Alignment:
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  23507196 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 23507097  T
Q  310 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  23507096 ctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataat 23506998  T
Q  410 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23506997 tgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 21932204 - 21932469
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21932204 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 21932303  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  21932304 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 21932403  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  21932404 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 21932469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 21938374 - 21938639
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21938374 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 21938473  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  21938474 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 21938573  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  21938574 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 21938639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 209 - 442
Target Start/End: Original strand, 27182578 - 27182810
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  27182578 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 27182677  T
Q  309 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 408  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  27182678 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 27182776  T
Q  409 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27182777 ttgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35582469 - 35582204
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  35582469 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 35582370  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  35582369 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 35582270  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  35582269 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 35582204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 22882907 - 22883139
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  22882907 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgggaaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaagat 22883006  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  22883007 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttg 22883106  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||    
T  22883107 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatg 22883139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7425729 - 7425492
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425729 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 7425630  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  7425629 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaat 7425530  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  7425529 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 7425492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 274
Target Start/End: Original strand, 11211940 - 11212153
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgt 160  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  11211940 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 11212039  T
Q  161 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttgg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||    
T  11212040 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 11212139  T
Q  261 tgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||    
T  11212140 tgaaattacatgtt 11212153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 36989593 - 36989858
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  36989593 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 36989692  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||| |    
T  36989693 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctctag 36989792  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  36989793 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 36989858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 22053845 - 22054096
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  22053845 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 22053944  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  22053945 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattga 22054043  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054044 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 18531079 - 18531330
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  18531079 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 18531178  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |  ||||| |||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  18531179 gtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattga 18531277  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18531278 tgttgttgttgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 374
Target Start/End: Original strand, 35790974 - 35791287
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  35790974 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 35791073  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  ||    
T  35791074 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagt 35791173  T
Q  262 gaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattct 359  Q
    ||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||| ||||| | || ||||| |||| || |  || ||||||||| || |||| ||||||||     
T  35791174 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-agattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattca 35791272  T
Q  360 tgttcaaatgatgtt 374  Q
    ||||| | |||||||    
T  35791273 tgttccattgatgtt 35791287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 17471411 - 17471676
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||  ||  ||   | |||||| |||||||||    
T  17471411 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcatcttcaaagg 17471509  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  17471510 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctctt 17471609  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17471610 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 190 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 34939528 - 34939289
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  34939528 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 34939429  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |  |||||||||| |||||||| ||||| || |||| | ||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||| ||||    
T  34939428 gtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgctgttaattga 34939331  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 431  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34939330 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23514941 - 23514729
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  23514941 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 23514842  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  23514841 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 23514742  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  23514741 gaaattacatgtt 23514729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 1219433 - 1219608
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1219433 cttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 1219532  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||  | ||||| |||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  1219533 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1219608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11343134 - 11343008
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    | ||| || |||||  ||||||||||    
T  11343134 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcagaggttagggttaatcttcttcaaaggt 11343035  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11343034 aagggggttagtttttatcataatcat 11343008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23328900 - 23328791
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23328900 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 23328801  T
Q  199 tgtgctcttg 208  Q
     |||||||||    
T  23328800 cgtgctcttg 23328791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24616504 - 24616395
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  24616504 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 24616405  T
Q  199 tgtgctcttg 208  Q
     |||||||||    
T  24616404 cgtgctcttg 24616395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24712880 - 24712771
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  24712880 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 24712781  T
Q  199 tgtgctcttg 208  Q
     |||||||||    
T  24712780 cgtgctcttg 24712771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24745898 - 24745789
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  24745898 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 24745799  T
Q  199 tgtgctcttg 208  Q
     |||||||||    
T  24745798 cgtgctcttg 24745789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20623220 - 20623085
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  20623220 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 20623121  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  20623120 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 21233540 - 21233675
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  21233540 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 21233639  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  21233640 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 324
Target Start/End: Original strand, 25900418 - 25900552
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   |||||  |||||    
T  25900418 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaaaat 25900517  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatt 324  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | ||||||    
T  25900518 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt 25900552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16536448 - 16536313
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  16536448 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 16536349  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  16536348 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16536313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37052995 - 37052860
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||   ||||    
T  37052995 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtggaaat 37052896  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  37052895 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 37052860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16106093 - 16105967
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||  ||  || ||| |||||  |||| |||||    
T  16106093 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggt 16105994  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16105993 aagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 438
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  398 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 442
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471844
Alignment:
Q  401 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatg 17471844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32950943 - 32950862
Alignment:
Q  193 taaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| || || || |||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  32950943 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Original strand, 19886483 - 19886913
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886483 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 19886582  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19886583 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 19886682  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19886683 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 19886782  T
Q  312 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886783 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 19886882  T
Q  412 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886883 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 17396665 - 17396916
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||    
T  17396665 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaat 17396763  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17396764 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 17396863  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17396864 tattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 190 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 462989 - 462743
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  462989 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 462890  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  462889 gataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 462791  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 437  Q
    | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  462790 tgtcgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 442
Target Start/End: Original strand, 19794735 - 19794967
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  19794735 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 19794834  T
Q  309 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 408  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| ||||  ||||||||| |    
T  19794835 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatca 19794933  T
Q  409 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794934 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 11231161 - 11231426
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  11231161 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 11231260  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  11231261 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 11231360  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  11231361 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 11231426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 22513008 - 22513273
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  22513008 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 22513107  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  22513108 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22513207  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22513208 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 22513273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 28775630 - 28775895
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  28775630 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 28775729  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  28775730 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 28775829  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  28775830 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 28775895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8891493 - 8891242
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  8891493 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaat 8891394  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||    
T  8891393 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattga 8891295  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8891294 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 24685604 - 24685869
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  24685604 agagaagaacaaaagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 24685703  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  24685704 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 24685803  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  24685804 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 24685869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 36982453 - 36982704
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  36982453 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 36982552  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  36982553 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattga 36982651  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982652 tgttgttgttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 43642969 - 43643220
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  43642969 tgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 43643068  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | || ||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||    
T  43643069 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattga 43643167  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43643168 tgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 7507856 - 7508107
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7507856 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 7507955  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttg 388  Q
     |||||||||||| |||||| | |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| | |||||| || || || |||||||||   |||||||||    
T  7507956 aataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-ggctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 7508053  T
Q  389 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    || || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508054 atgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 209 - 442
Target Start/End: Original strand, 20627344 - 20627576
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||| |||||    
T  20627344 ctgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgt 20627443  T
Q  309 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 408  Q
    ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||| | || || ||||||||| |    
T  20627444 gctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatca 20627542  T
Q  409 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20627543 ttgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 209 - 442
Target Start/End: Original strand, 24341420 - 24341652
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||    
T  24341420 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgt 24341519  T
Q  309 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 408  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||    ||||||||| |    
T  24341520 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgttgatgaatca 24341618  T
Q  409 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24341619 ttgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8944189 - 8944014
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8944189 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 8944090  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8944089 cgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtt 8944014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12728735 - 12728560
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12728735 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 12728636  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12728635 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12728560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 3798516 - 3798691
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  3798516 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 3798615  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  3798616 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 3798691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34824818 - 34824643
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  34824818 cttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 34824719  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  34824718 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 34824643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 23777963 - 23778133
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23777963 aaggtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 23778062  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |  | ||||  |||| | ||||||||||||||    
T  23778063 tcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtt 23778133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 24826522 - 24826646
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  24826522 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 24826621  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcat 136  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  24826622 aggggttagtcatcatcataatcat 24826646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 25265402 - 25265653
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  25265402 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 25265501  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| ||||    
T  25265502 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattga 25265600  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  || |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25265601 tgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16935973 - 16935761
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16935973 taggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 16935874  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  ||    
T  16935873 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgt 16935774  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  16935773 gaaattacatgtt 16935761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17006633 - 17006421
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17006633 taggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 17006534  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  ||    
T  17006533 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgt 17006434  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  17006433 gaaattacatgtt 17006421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 42177845 - 42178057
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||| ||||||||||||  ||  || ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  42177845 taggggctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 42177944  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  42177945 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggt 42178044  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  42178045 gaaattacatgtt 42178057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 12635781 - 12635956
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  12635781 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgttgtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaatt 12635880  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12635881 cgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12635956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 12641560 - 12641730
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  12641560 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 12641659  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| | ||||||||||||||    
T  12641660 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtt 12641730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23774479 - 23774370
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23774479 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 23774380  T
Q  199 tgtgctcttg 208  Q
     |||||||||    
T  23774379 cgtgctcttg 23774370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 19689413 - 19689548
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  19689413 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 19689512  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  19689513 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 19689548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23820322 - 23820187
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  23820322 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 23820223  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  23820222 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 23820187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 5888548 - 5888652
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  5888548 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 5888647  T
Q  204 tcttg 208  Q
    |||||    
T  5888648 tcttg 5888652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 14906452 - 14906587
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  14906452 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 14906551  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  14906552 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 14906587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21142187 - 21142098
Alignment:
Q  151 tttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  21142187 tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 21142098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20015262 - 20015127
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  20015262 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 20015163  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  20015162 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20015127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25213446 - 25213372
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaagga-taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||||||||||||||  ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25213446 taggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Original strand, 27653805 - 27654235
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||| |    
T  27653805 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtga 27653904  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27653905 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctg 27654004  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654005 tgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 27654104  T
Q  312 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654105 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 27654204  T
Q  412 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27654205 cttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25175968 - 25175563
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaag-gataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25175968 agctttcggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattaccataatcat 25175870  T
Q  137 gtgtaattttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa 235  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25175869 gtataattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaa 25175770  T
Q  236 ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175769 ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagtt 25175670  T
Q  336 gttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 435  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175669 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 25175570  T
Q  436 gatgatg 442  Q
    |||||||    
T  25175569 gatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 116 - 442
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16826006
Alignment:
Q  116 gttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgat 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16825678 gttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 16825777  T
Q  216 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825778 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaa 16825877  T
Q  314 attggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 413  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16825878 attggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatctgatattatgattgatgaataattgct 16825977  T
Q  414 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  16825978 ttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 438
Target Start/End: Original strand, 14625952 - 14626377
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  14625952 agagaagaacaagagggttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 14626051  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | | | ||| ||  ||||||  |||||| ||||  || | | ||| | ||||  ||||||||| ||||||||||    
T  14626052 gggggttagttattatcacaatcatct-tcactttacaaattctcaaatgttgtttgaat-tgtgattatggataattattgctaaattcgtgctcttgc 14626149  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626150 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 14626249  T
Q  310 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
       |||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||    
T  14626250 tgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcat 14626348  T
Q  410 tgcttgggtatgcatattcatggattgat 438  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626349 tgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 105 - 438
Target Start/End: Original strand, 1650022 - 1650352
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgct 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1650022 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgct 1650119  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 304  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |    
T  1650120 cttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaa 1650219  T
Q  305 ttgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 404  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  |||||||    
T  1650220 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatga 1650318  T
Q  405 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 438  Q
    || | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1650319 atcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 16376196 - 16376461
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16376196 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 16376295  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  16376296 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 16376395  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16376396 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16376461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 16383520 - 16383785
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16383520 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 16383619  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  16383620 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 16383719  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16383720 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16383785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10489132 - 10488867
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  10489132 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 10489033  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  10489032 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 10488933  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  10488932 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 10488867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 22251389 - 22251621
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  22251389 agagaagaacaagagtgttgaatggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 22251488  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  22251489 atgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22251588  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  22251589 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 22251621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16232297 - 16232060
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232297 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 16232198  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  16232197 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 16232098  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16232097 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16232060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 22225561 - 22225826
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  22225561 agagaagaacaagagtgttgaatggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 22225660  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||     
T  22225661 atgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttt 22225760  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22225761 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 22225826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 192 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23153696 - 23153458
Alignment:
Q  192 ctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 291  Q
    ||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||    
T  23153696 ctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatga 23153597  T
Q  292 taagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgata 391  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||     
T  23153596 taagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatg 23153498  T
Q  392 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 431  Q
    || || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23153497 ttgtggttgatgaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19299670 - 19299467
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19299670 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggattcaatttgggcgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 19299571  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||    
T  19299570 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 19299471  T
Q  209 ctgt 212  Q
    ||||    
T  19299470 ctgt 19299467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 274
Target Start/End: Original strand, 16555973 - 16556227
Alignment:
Q  23 agagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttag 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555973 agagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttag 16556072  T
Q  121 ttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgtta 219  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||| |||||||||| ||    
T  16556073 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgcta 16556172  T
Q  220 tgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16556173 ttttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16556227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 274
Target Start/End: Original strand, 16632529 - 16632783
Alignment:
Q  23 agagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttag 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632529 agagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttag 16632628  T
Q  121 ttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgtta 219  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||| |||||||||| ||    
T  16632629 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgcta 16632728  T
Q  220 tgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16632729 ttttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16632783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 18086674 - 18086911
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18086674 agctttagaaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattagtataatcatg 18086773  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  18086774 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaat 18086873  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18086874 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18086911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 35009451 - 35009702
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  35009451 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 35009550  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| ||||    
T  35009551 gtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattga 35009649  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35009650 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 190 - 431
Target Start/End: Original strand, 1657760 - 1657999
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  1657760 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 1657859  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |  |||||||||| |||||||| ||||| || |||| | ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||| ||||    
T  1657860 gtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgttgttaattga 1657957  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 431  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1657958 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1556348 - 1556173
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1556348 cttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 1556249  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  1556248 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1556173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19610398 - 19610186
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  19610398 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgtt 19610299  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||  |||| |||    
T  19610298 gtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggt 19610199  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  19610198 gaaattacatgtt 19610186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23978112 - 23977937
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  23978112 cttctaaggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 23978013  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  23978012 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 23977937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 208
Target Start/End: Original strand, 29869627 - 29869798
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  || | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29869627 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttgatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 29869726  T
Q  137 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
     |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  29869727 ttaaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 29869798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15862720 - 15862484
Alignment:
Q  192 ctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 291  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| | |||||     
T  15862720 ctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgt 15862621  T
Q  292 taagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgata 391  Q
     |||||||||| |||||||| ||||| || |||| | ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| | | |||||||   || || |||||     
T  15862620 gaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattgctgataattgatg 15862524  T
Q  392 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 431  Q
    || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15862523 ttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 109 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 29666208 - 29665941
Alignment:
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctct 206  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||  || |||||| |||||||    
T  29666208 taagtgggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctct 29666109  T
Q  207 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaaga 304  Q
     ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||| |||||  |||||||||| |    
T  29666108 agctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaa-a 29666010  T
Q  305 ttgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 374  Q
    |||| || ||||||||||||| | ||||||||||||| || |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29666009 ttgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 13620712 - 13620882
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  13620712 aaggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 13620811  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  13620812 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtt 13620882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 16814820 - 16814930
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  16814820 agagaagagcaagaggtttgaagggaagctttagcaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 16814919  T
Q  111 agggggttagt 121  Q
    || ||||||||    
T  16814920 agagggttagt 16814930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27751675 - 27751603
Alignment:
Q  191 gctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 263  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751675 gctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 27740985 - 27740838
Alignment:
Q  293 aagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 392  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||  |   | |||| |||| |    
T  27740985 aagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagtcgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgt 27740888  T
Q  393 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | |  | ||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27740887 tgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 27740838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4991470 - 4991396
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaagga-taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||||||||||||||  ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4991470 taggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19854402 - 19854317
Alignment:
Q  194 aaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 278  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||  | |||||| |||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  19854402 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 19854317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29605672 - 29605612
Alignment:
Q  218 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 278  Q
    |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605672 tatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 36523 - 36093
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  36523 agagaagagcaagagggttgaaggaaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggtaa 36424  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  36423 gggggttaatgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtag 36324  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 36224  T
Q  312 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36223 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattg 36124  T
Q  412 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36123 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 169736 - 169951
Alignment:
Q  16 aagaacaagagggttgaagg-gaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagg 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  ||| |||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  169736 aagaacaagagagttgaaggcgaagcttgaggaatcaagtggggtgacataagagctgaattgaagcaagggttagtgataatcatcttcaaaagtaagg 169835  T
Q  114 gggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtg 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  169836 gggttagtgattatcataatcatgtataattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 169935  T
Q  214 atgttatgtttgtatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  169936 atgttatgtttgtatg 169951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 48849 - 48598
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  48849 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaat 48750  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||    
T  48749 gataagttgtgaaaattgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattga 48651  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48650 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 153920 - 154095
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  153920 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 154019  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||||| |||||||||    
T  154020 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtt 154095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 30121153 - 30120722
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  30121153 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagtaagggttagagataatcatcttcaaaggtaa 30121054  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgct 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30121053 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 30120954  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30120953 gtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 30120854  T
Q  311 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120853 tcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 30120754  T
Q  411 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30120753 gcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Original strand, 21851786 - 21852217
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg--aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21851786 agagaagaacaagagtgttggagggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctagaagctgaagtggagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 21851885  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  21851886 aagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 21851984  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21851985 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtg 21852084  T
Q  310 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852085 ctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 21852184  T
Q  410 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21852185 tgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Original strand, 21844393 - 21844824
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg--aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21844393 agagaagaacaagagtgttggagggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctagaagctgaagtggagctaggattaaggataatcaacttcaacggt 21844492  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  21844493 aagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 21844591  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21844592 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtg 21844691  T
Q  310 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844692 ctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 21844791  T
Q  410 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21844792 tgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 41 - 442
Target Start/End: Original strand, 16674245 - 16674644
Alignment:
Q  41 tttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  || ||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  16674245 tttaggaatcaagtgggtgacttatgagctgaattgaagcaagagttgagt-taatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta- 16674342  T
Q  141 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgat 240  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  16674343 atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttat 16674442  T
Q  241 gttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgt 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674443 gttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgt 16674542  T
Q  341 taaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 440  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16674543 taagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatga 16674642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24549410 - 24548986
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24549410 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttctaaggta 24549311  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  24549310 agggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 24549213  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||    
T  24549212 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 24549113  T
Q  311 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
    | ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||    
T  24549112 tcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcatt 24549014  T
Q  411 gcttgggtatgcatattcatggattgat 438  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24549013 gcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 438
Target Start/End: Original strand, 6774082 - 6774505
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  6774082 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 6774180  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  6774181 agggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 6774278  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  6774279 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 6774378  T
Q  311 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
    | ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |    
T  6774379 tcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcact 6774477  T
Q  411 gcttgggtatgcatattcatggattgat 438  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6774478 gcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 252 - 442
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222943
Alignment:
Q  252 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagtt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  352 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 252 - 442
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736566
Alignment:
Q  252 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagtt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  352 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 252 - 442
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860461
Alignment:
Q  252 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagtt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  352 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 184 - 442
Target Start/End: Original strand, 43373474 - 43373731
Alignment:
Q  184 aattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgc 283  Q
    |||| |||||||||| ||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43373474 aattaatgctaaattcgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 43373573  T
Q  284 aaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 383  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||    
T  43373574 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgtt 43373672  T
Q  384 atttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43373673 aattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 271183 - 271448
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  271183 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 271282  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  271283 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 271382  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  271383 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 271448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 644737 - 644472
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  644737 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 644638  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  644637 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 644538  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  644537 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 644472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 830472 - 830207
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  830472 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 830373  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  830372 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 830273  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  830272 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 830207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 190 - 443
Target Start/End: Original strand, 16193728 - 16193980
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16193728 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 16193827  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | | || |||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  16193828 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 16193926  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 443  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16193927 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 15318982 - 15319188
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15318982 agagaagaacaagagtgttgaaggaaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 15319081  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  15319082 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 15319181  T
Q  209 ctgtgat 215  Q
    |||||||    
T  15319182 ctgtgat 15319188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 15499351 - 15499557
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15499351 agagaagaacaagagtgttgaaggaaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 15499450  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  15499451 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 15499550  T
Q  209 ctgtgat 215  Q
    |||||||    
T  15499551 ctgtgat 15499557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 22088617 - 22088882
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  22088617 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 22088716  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  22088717 aagggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22088816  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22088817 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtt 22088882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 190 - 431
Target Start/End: Original strand, 24928803 - 24929043
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  24928803 tgctaaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 24928902  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||  |||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||    
T  24928903 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattga 24929001  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 431  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24929002 tgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 22006171 - 22006346
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22006171 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 22006270  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22006271 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22006346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 16404987 - 16405235
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  16404987 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 16405086  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  16405087 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattga 16405182  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16405183 tgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 13720804 - 13721016
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13720804 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13720903  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  13720904 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 13721003  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  13721004 gaaattacatgtt 13721016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 93 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16195581 - 16195399
Alignment:
Q  93 taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatg 191  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16195581 taatcatcttctaaggtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttg 16195482  T
Q  192 ctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||| || ||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16195481 ctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16195399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 16872964 - 16873139
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  16872964 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 16873063  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16873064 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16873139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 13662141 - 13662353
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13662141 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13662240  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||  ||| |  | ||||  |||| |||    
T  13662241 gtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggt 13662340  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  13662341 gaaattacatgtt 13662353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 194 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17345816 - 17345581
Alignment:
Q  194 aaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 293  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  |    
T  17345816 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtga 17345717  T
Q  294 agttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 393  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || |||| | ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||  |||| ||||   ||||| ||||| ||    
T  17345716 agttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatattattgttgttaattgatgtt 17345619  T
Q  394 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 431  Q
     |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17345618 gttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 22907226 - 22907476
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  22907226 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 22907325  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  22907326 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 22907423  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907424 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 252 - 314
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691970
Alignment:
Q  252 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5238338 - 5238203
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  5238338 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 5238239  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  5238238 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 24661260 - 24661395
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  24661260 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 24661359  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  24661360 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 43685797 - 43685662
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  43685797 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 43685698  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  43685697 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Original strand, 13910846 - 13911277
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  13910846 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 13910945  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  13910946 gggggttattgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttg 13911045  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13911046 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 13911145  T
Q  312 aaattggtgaatttctcct-aagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911146 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 13911245  T
Q  411 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13911246 tcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 10989841 - 10989410
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggtt-gaagggaagctttaggaatcaagtg-ggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10989841 agagaagatcaagagtgttagaaggggagcttgaggaatcaagtgaggtgacataggagcttaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggt 10989742  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgc 209  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10989741 atgggggttagtgattatcataatcatgtataattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgc 10989642  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10989641 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtg 10989542  T
Q  310 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989541 ctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 10989443  T
Q  410 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989442 tgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 2437889 - 2437457
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  2437889 agagaagaacaggagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 2437790  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  2437789 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgt 2437690  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437689 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 2437590  T
Q  310 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437589 ttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 2437490  T
Q  410 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2437489 tgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 38 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13573079 - 13572676
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13573079 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 13572980  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13572979 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 13572881  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 337  Q
    |||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13572880 gatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 13572781  T
Q  338 tgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 437  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13572780 tgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgt 13572681  T
Q  438 tgatg 442  Q
    |||||    
T  13572680 tgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Original strand, 16478785 - 16479213
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16478785 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggta 16478884  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||    
T  16478885 agggggttagtgattatcataatcattt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctcttact 16478982  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  16478983 gcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 16479082  T
Q  311 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
    | ||||||||||||| |  |||||| || |||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |    
T  16479083 tcaattggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcact 16479181  T
Q  411 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479182 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 105 - 442
Target Start/End: Original strand, 18253761 - 18254098
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||    
T  18253761 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 18253860  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 303  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||     
T  18253861 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 18253960  T
Q  304 attgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 403  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  18253961 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 18254059  T
Q  404 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18254060 aataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 190 - 436
Target Start/End: Original strand, 25292350 - 25292595
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  25292350 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaag 25292449  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25292450 gataagctatgaatattgtgctcaattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25292548  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 436  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25292549 tattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 47481043 - 47481294
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  47481043 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 47481142  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||   | ||| ||||    
T  47481143 gataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcgctcttaattga 47481241  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47481242 tgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7823161 - 7822896
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7823161 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 7823062  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  7823061 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 7822962  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  7822961 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 7822896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7830472 - 7830207
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7830472 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 7830373  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  7830372 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 7830273  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  7830272 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 7830207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27176866 - 27176601
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27176866 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27176767  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  27176766 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27176667  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27176666 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27176601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 13037026 - 13037277
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | | ||||    
T  13037026 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaat 13037125  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||    
T  13037126 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattga 13037224  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13037225 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 437
Target Start/End: Original strand, 11580751 - 11580997
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  11580751 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 11580850  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  11580851 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 11580949  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 437  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11580950 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 27101460 - 27101725
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27101460 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27101559  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  27101560 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27101659  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27101660 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27101725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 27108808 - 27109073
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27108808 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27108907  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  27108908 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27109007  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27109008 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27109073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 38783552 - 38783817
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  38783552 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 38783651  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  38783652 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 38783751  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  38783752 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 38783817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 18979872 - 18980109
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18979872 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 18979971  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  18979972 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 18980071  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18980072 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18980109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 190 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16212017 - 16211768
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  16212017 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaat 16211918  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||    
T  16211917 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattga 16211819  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 440  Q
    | || || ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16211818 tgttgtggttgatgattcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 209 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 36052896 - 36052667
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  36052896 ctgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 36052797  T
Q  309 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 408  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||   |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  36052796 gctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgatgaataa 36052701  T
Q  409 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36052700 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3060217 - 3059966
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3060217 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 3060118  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    ||||| || |||| ||| |||| || |||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  3060117 gataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattga 3060019  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3060018 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15927973 - 15927736
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927973 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15927874  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15927873 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15927774  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15927773 tgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtt 15927736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 15950613 - 15950879
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||||||||    
T  15950613 agagaagaacaagggttttgaaggaaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttcaaagg 15950712  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  15950713 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 15950812  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15950813 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15950879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13321267 - 13321014
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt-cata-tatgcaaaa 287  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || | |||| | ||    
T  13321267 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 13321168  T
Q  288 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttg-ttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 386  Q
    |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| |    
T  13321167 atgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaat 13321070  T
Q  387 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13321069 tgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13758713 - 13758538
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  13758713 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 13758614  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  13758613 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 13758538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 15760027 - 15760202
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15760027 cttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaatt 15760126  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  |  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  15760127 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15760202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7293267 - 7293017
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  7293267 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 7293168  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  7293167 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 7293070  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7293069 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15862257 - 15862174
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862257 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 276
Target Start/End: Original strand, 48622584 - 48622756
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48622584 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgc 48622683  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 276  Q
    |||| |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  48622684 tcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttca 48622756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 14250811 - 14250986
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  14250811 cttctaaggtaagggggttagttatcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaatt 14250910  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  14250911 cgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtt 14250986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11516478 - 11516343
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  11516478 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 11516379  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  11516378 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 11516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 15441576 - 15441711
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  15441576 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 15441675  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  15441676 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 30262141 - 30262276
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||    
T  30262141 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 30262240  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  30262241 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16418835 - 16418731
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  16418835 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 16418736  T
Q  204 tcttg 208  Q
    |||||    
T  16418735 tcttg 16418731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 10000288 - 10000392
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||    
T  10000288 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaaattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgc 10000387  T
Q  204 tcttg 208  Q
    |||||    
T  10000388 tcttg 10000392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 439
Target Start/End: Original strand, 296003 - 296224
Alignment:
Q  215 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 314  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||| ||||||| || ||| |    ||    
T  296003 tgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaattatatccaa 296102  T
Q  315 ttggtgaatttctcctaagttgttg-ttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 413  Q
     |||||||||| | |||| ||| || || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |   | ||| ||||| ||    ||||||||| | || |    
T  296103 atggtgaattt-tgctaaattgatgtttgaattgtgttgtgattcatgttcaattgatgttgttgctattaattgatgtt---gttgatgaattactgat 296198  T
Q  414 tgggtatgcatattcatggattgatg 439  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  296199 tgggtatgcttattcatggattgatg 296224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 15516719 - 15516793
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15516719 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaatgtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Original strand, 31497 - 31928
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  31497 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaatgtaa 31596  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  31597 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtgg 31696  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 31796  T
Q  312 aaattggtgaatttctcct-aagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31797 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataatt 31896  T
Q  411 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31897 gcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 209 - 442
Target Start/End: Original strand, 128200 - 128431
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| || || |||  || |||||| |||| |||||    
T  128200 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaattgt 128299  T
Q  309 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 408  Q
    ||| |||||| |||||| |  || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  128300 gctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatgaataa 128397  T
Q  409 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  128398 ttgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 10644648 - 10644219
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644648 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgatctaggagctgaagtgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggta 10644549  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  10644548 agggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 10644451  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||    
T  10644450 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 10644351  T
Q  311 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644350 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 10644251  T
Q  411 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10644250 gcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 100 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 47357994 - 47357654
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47357994 cttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttcctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattc 47357897  T
Q  200 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357896 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 47357797  T
Q  300 gaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357796 gaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 47357697  T
Q  400 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47357696 gatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 218 - 434
Target Start/End: Original strand, 13048261 - 13048477
Alignment:
Q  218 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13048261 tatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattg 13048360  T
Q  318 gtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 417  Q
     ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13048361 atgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttattagataatatgattaatgaataattgcttggg 13048460  T
Q  418 tatgcatattcatggat 434  Q
    | |||||||||||||||    
T  13048461 tttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13246662 - 13246430
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  13246662 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 13246563  T
Q  309 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 408  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  13246562 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 13246464  T
Q  409 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13246463 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 210 - 442
Target Start/End: Original strand, 54118276 - 54118507
Alignment:
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| ||||||    
T  54118276 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtg 54118375  T
Q  310 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    || ||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| || || ||||||||| ||    
T  54118376 ctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcat 54118474  T
Q  410 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54118475 tgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 15675101 - 15675352
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  15675101 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 15675200  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  15675201 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattga 15675299  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15675300 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 15287096 - 15287333
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15287096 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15287195  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15287196 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15287295  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15287296 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15287333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 209 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 31115861 - 31115629
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||| |||| ||| |    
T  31115861 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattat 31115762  T
Q  309 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 408  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |    
T  31115761 gctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatca 31115663  T
Q  409 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31115662 ttgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18169403 - 18169138
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||  || |||| || |||||  |||||| ||    
T  18169403 agagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaa-gg 18169305  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  18169304 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 18169205  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18169204 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18169138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 15294205 - 15294442
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294205 agctttaggaatgaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15294304  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15294305 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15294404  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15294405 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15294442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 122140 - 121983
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  122140 tgctaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 122041  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattga 348  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  122040 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattga 121983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 7131978 - 7132153
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7131978 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 7132077  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  7132078 cgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 7132153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19020824 - 19020654
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19020824 aaggtaagggggttagttaccatcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 19020725  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19020724 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 19020654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 10104281 - 10104445
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||    
T  10104281 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgt 10104380  T
Q  309 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 374  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  10104381 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 17145533 - 17145745
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17145533 taggagctgaattgaagtaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 17145632  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||| ||  | | |||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  17145633 gtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 17145732  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  17145733 gaaattacatgtt 17145745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20001066 - 20000891
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  20001066 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 20000967  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  20000966 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtt 20000891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 208
Target Start/End: Original strand, 22351915 - 22352086
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22351915 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 22352014  T
Q  137 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
     |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  22352015 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttg 22352086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26680451 - 26680201
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  26680451 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 26680352  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  26680351 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 26680254  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680253 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18248556 - 18248421
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttg-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  18248556 aaggtaagggggttagttattatcataatcttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgc 18248457  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 239  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  18248456 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 18248421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8378480 - 8378377
Alignment:
Q  114 gggttagttattatcataatcatgtgtaattttg-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  8378480 gggttagttattatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 8378381  T
Q  213 gatg 216  Q
    ||||    
T  8378380 gatg 8378377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26339362 - 26339253
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26339362 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 26339263  T
Q  199 tgtgctcttg 208  Q
     |||||||||    
T  26339262 cgtgctcttg 26339253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22738568 - 22738437
Alignment:
Q  143 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||     
T  22738568 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 22738469  T
Q  243 tagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22738468 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22738437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 344 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111395
Alignment:
Q  344 attgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10488813 - 10488678
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  10488813 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 10488714  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  10488713 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 10488678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 16327938 - 16328073
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  16327938 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 16328037  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  16328038 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 40885585 - 40885749
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaagattg 307  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||  |||||||||| |||     
T  40885585 ctgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaa-atta 40885683  T
Q  308 tgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 374  Q
    |||| |||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  40885684 tgctcaattggtgaactt-tgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14952183 - 14952085
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14952183 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9795564 - 9795490
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9795564 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaattttttcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 9795490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 442
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  398 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14996476 - 14996444
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996476 aaggtaagggggttagttattatcataatcatg 14996444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33240951 - 33240900
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33240951 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8378524 - 8378491
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgt 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8378524 aaggtaaggggattagttattatcataatcatgt 8378491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 38 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 55316622 - 55316219
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  55316622 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaaaggggttagttattatcacaatcatg 55316523  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316522 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 55316424  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 337  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55316423 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 55316324  T
Q  338 tgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 437  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55316323 tgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattga 55316224  T
Q  438 tgatg 442  Q
    |||||    
T  55316223 tgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 38 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 41270478 - 41270075
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41270478 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 41270379  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270378 ta-atttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 41270280  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 337  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41270279 gatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 41270180  T
Q  338 tgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 437  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41270179 tgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattga 41270080  T
Q  438 tgatg 442  Q
    |||||    
T  41270079 tgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 100 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16821479 - 16821139
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||      
T  16821479 cttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatcc 16821382  T
Q  200 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||    
T  16821381 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctat 16821282  T
Q  300 gaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 399  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821281 gagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 16821182  T
Q  400 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16821181 gatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 105 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15615168 - 15614838
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgct 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15615168 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgct 15615071  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 304  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  15615070 cttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaata 15614971  T
Q  305 ttgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 404  Q
    | ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||    
T  15614970 tggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 15614872  T
Q  405 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 438  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15614871 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 105 - 442
Target Start/End: Original strand, 15936553 - 15936890
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||    
T  15936553 aaggtatgggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 15936652  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 303  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||     
T  15936653 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 15936752  T
Q  304 attgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 403  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  15936753 attgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 15936851  T
Q  404 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15936852 aataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 105 - 439
Target Start/End: Original strand, 15938395 - 15938729
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||    
T  15938395 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgc 15938494  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 303  Q
    ||   |||| ||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||     
T  15938495 tccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 15938594  T
Q  304 attgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 403  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  15938595 attgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 15938693  T
Q  404 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 439  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15938694 aataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 442
Target Start/End: Original strand, 14842446 - 14842824
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctca--tgt 160  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||| || |||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | | | ||||||  ||||||  |||    
T  14842446 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatct-tcactttgcaaattctcaaatgt 14842544  T
Q  161 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttgg 260  Q
    ||||||||  || | | ||| | ||||  ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  14842545 tgtatgaat-tgtgattatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttgg 14842643  T
Q  261 tgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattctt 360  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  14842644 tgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattctt 14842742  T
Q  361 gttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842743 gttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 190 - 443
Target Start/End: Original strand, 51158030 - 51158282
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  51158030 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 51158129  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  51158130 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 51158228  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 443  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51158229 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 15859036 - 15859287
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  15859036 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaat 15859135  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  15859136 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 15859234  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15859235 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 13975734 - 13975985
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  13975734 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 13975832  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13975833 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 13975932  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13975933 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 45861056 - 45860805
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  45861056 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 45860958  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45860957 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 45860858  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45860857 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49232869 - 49232604
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  49232869 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctatgagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 49232770  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  49232769 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 49232670  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  49232669 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 49232604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 13954902 - 13955153
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  13954902 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 13955000  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13955001 gatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 13955100  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13955101 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 12264614 - 12264981
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt--gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  | | ||  |  |||||| |||||||||    
T  12264614 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttggggtgacctaggagctgaattgaagcaaaggttgggattaatcatcttcaaagg 12264713  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  12264714 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 12264813  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaagat 305  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  12264814 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-agat 12264912  T
Q  306 tgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 374  Q
    | | || ||||| |||| || |  || ||||||||| || |||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  12264913 tatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 12264981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 1467562 - 1467827
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  1467562 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 1467661  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  1467662 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 1467761  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  1467762 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 1467827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 12030159 - 12030410
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  12030159 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagt 12030258  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  12030259 gataagttgtgaaagttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattga 12030357  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12030358 tgttatggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 190 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13839145 - 13838905
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  13839145 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 13839046  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  13839045 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 13838947  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 431  Q
    | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13838946 tgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 2050061 - 2049810
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  2050061 tgctaaattcgtgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacat 2049962  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  2049961 gataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattga 2049863  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2049862 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12812274 - 12812042
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  12812274 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaactttaaaggt 12812175  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||    
T  12812174 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 12812075  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    |||| ||| ||| ||  | ||| ||||||||||    
T  12812074 ctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatg 12812042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22275642 - 22275377
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||  |   |||||| |||||| |||||||||    
T  22275642 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaaaagttaaggttaatcatcttcaaagg 22275544  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  22275543 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 22275444  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||  || ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22275443 gctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22275377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 15468216 - 15468428
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  || |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  15468216 taggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgtt 15468315  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  15468316 gtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 15468415  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  15468416 gaaattacatgtt 15468428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25059119 - 25058907
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  |  |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  25059119 taggagctgaattgaagcaaaaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgtt 25059020  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  25059019 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 25058920  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  25058919 gaaattacatgtt 25058907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18911373 - 18911161
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  18911373 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 18911274  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  18911273 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 18911174  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  18911173 gaaattacatgtt 18911161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Original strand, 17912516 - 17912744
Alignment:
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||     
T  17912516 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 17912615  T
Q  312 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    |||||| |||||||    || ||||| ||| ||||||| | |||||| |||||||  ||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||    
T  17912616 aaattgatgaatttga--tatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactg 17912713  T
Q  412 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17912714 cttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 12902008 - 12902178
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  12902008 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgc 12902107  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12902108 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12902178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Original strand, 18896920 - 18897099
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||    
T  18896920 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttccaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgtt 18897019  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  18897020 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 18897099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5228655 - 5228481
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  5228655 cttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtgttatgaaaatgggttgatgaac-attgttgctaaatt 5228557  T
Q  199 tgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  5228556 cgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 5228481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 54651795 - 54651573
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  54651795 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 54651696  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt-cata-tatgcaaaaatgataagttatga 301  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| |||||| || | |||| | ||||| ||||||||||    
T  54651695 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatga 54651596  T
Q  302 agattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    | ||| | || |||||||||||||    
T  54651595 a-attatactcaattggtgaattt 54651573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Original strand, 16744149 - 16744377
Alignment:
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||     
T  16744149 tgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 16744248  T
Q  312 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    |||| | |||||||  |  | ||| | ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || |  || || |  ||||||||| ||||    
T  16744249 aaatggatgaatttgac--atgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattg 16744346  T
Q  412 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16744347 cttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 2449250 - 2449385
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  2449250 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 2449349  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  2449350 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 2449385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44229323 - 44229153
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  ||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||    
T  44229323 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaattttttcatttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgc 44229224  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| | ||||||||||||||    
T  44229223 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtt 44229153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984650
Alignment:
Q  329 ctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 428  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  429 atggattgatgatg 442  Q
    ||| ||||||||||    
T  47984663 atgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993937
Alignment:
Q  329 ctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 428  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  429 atggattgatgatg 442  Q
    ||| ||||||||||    
T  47993950 atgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003224
Alignment:
Q  329 ctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 428  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  429 atggattgatgatg 442  Q
    ||| ||||||||||    
T  48003237 atgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012510
Alignment:
Q  329 ctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 428  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  429 atggattgatgatg 442  Q
    ||| ||||||||||    
T  48012523 atgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 137
Target Start/End: Original strand, 8268646 - 8268683
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268646 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8268683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 137
Target Start/End: Original strand, 8275746 - 8275783
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8275746 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8275783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 401 - 442
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468596
Alignment:
Q  401 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 274
Target Start/End: Original strand, 11986181 - 11986262
Alignment:
Q  193 taaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| || || ||||||| || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11986181 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275209
Alignment:
Q  401 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatg 22275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41661812 - 41661727
Alignment:
Q  194 aaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 278  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||| || ||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  41661812 aaattcgtgctcttgctatgatgatatgtttgaatacatggaaatgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 41661727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 43427 - 42997
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43427 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgatctaggagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 43328  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgc 209  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    
T  43327 agggggttagttactatcacaaacatgt--aattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 43230  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 309  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43229 tgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtg 43130  T
Q  310 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43129 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 43030  T
Q  410 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43029 tgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39536 - 39271
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  39536 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 39437  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  39436 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 39337  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  39336 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 39271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 38 - 442
Target Start/End: Original strand, 5072237 - 5072640
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5072237 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaagattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 5072336  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5072337 ta-atttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaatt 5072435  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 337  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5072436 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 5072535  T
Q  338 tgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 437  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5072536 tgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattga 5072635  T
Q  438 tgatg 442  Q
    |||||    
T  5072636 tgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 143 - 442
Target Start/End: Original strand, 18601071 - 18601370
Alignment:
Q  143 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601071 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 18601170  T
Q  243 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgtta 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601171 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgtta 18601270  T
Q  343 aattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601271 agttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 66 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22228185 - 22227809
Alignment:
Q  66 gagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgta 164  Q
    ||||||||||||||  ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22228185 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22228086  T
Q  165 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  22228085 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22227986  T
Q  265 attacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttc 364  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22227985 attacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttc 22227887  T
Q  365 aaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22227886 aattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 66 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22232882 - 22232506
Alignment:
Q  66 gagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgta 164  Q
    ||||||||||||||  ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22232882 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22232783  T
Q  165 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  22232782 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22232683  T
Q  265 attacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttc 364  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22232682 attacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttc 22232584  T
Q  365 aaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22232583 aattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 105 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2116589 - 2116258
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgct 204  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2116589 aaggtaaaggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgct 2116492  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 304  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  2116491 tttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 2116392  T
Q  305 ttgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattga-gttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 403  Q
    | ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||    
T  2116391 tggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatg 2116293  T
Q  404 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 438  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2116292 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 105 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45051757 - 45051489
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgct 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  45051757 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtg--attttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgtt 45051660  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 304  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  45051659 cttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 45051560  T
Q  305 ttgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 376  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051559 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20931596 - 20931345
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20931596 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaat 20931497  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  20931496 gataagttatgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 20931398  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931397 tgttgtggttgatgaataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 18059581 - 18059846
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  18059581 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 18059680  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  18059681 aagggggttagttattatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 18059780  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  18059781 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 18059846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17149001 - 17148735
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  17149001 agagaagaacaagagggttgaagggaaagcttgaggaatcaagtggggtgacataggagctgaattgaagcaagggttggggataatcaacttcaaaggt 17148902  T
Q  110 aaggggg-ttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctctt 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  17148901 aaggggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctctt 17148802  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17148801 gttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17148735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20913281 - 20913037
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20913281 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaat 20913182  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||       | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  20913181 gataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaa-------tttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 20913090  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913089 tcttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17005071 - 17004806
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  17005071 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 17004972  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  17004971 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 17004872  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  17004871 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 17004806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 209 - 442
Target Start/End: Original strand, 20893657 - 20893889
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  20893657 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 20893756  T
Q  309 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 408  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  20893757 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatca 20893855  T
Q  409 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20893856 ttgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 38054914 - 38055179
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  38054914 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 38055013  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||| ||     
T  38055014 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctttta 38055113  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  38055114 ctgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 38055179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 210 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20445910 - 20445679
Alignment:
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  |||| ||||||    
T  20445910 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtg 20445811  T
Q  310 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||    
T  20445810 ctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcat 20445712  T
Q  410 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20445711 tgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 41394473 - 41394222
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  41394473 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaat 41394374  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  41394373 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 41394275  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394274 tgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Original strand, 19962322 - 19962525
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19962322 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggattcaatttgggcgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 19962421  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||    
T  19962422 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 19962521  T
Q  209 ctgt 212  Q
    ||||    
T  19962522 ctgt 19962525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 218 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20531667 - 20531444
Alignment:
Q  218 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  20531667 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattg 20531568  T
Q  318 gtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 417  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||    
T  20531567 gtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 20531469  T
Q  418 tatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  20531468 tatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Original strand, 37844484 - 37844714
Alignment:
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta-tgaagattgtgc 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||  || |||| |||||||    
T  37844484 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtgaaaattgtgc 37844583  T
Q  311 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
    | ||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||| | |||    
T  37844584 tcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgagtcatt 37844682  T
Q  411 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37844683 gcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 46523731 - 46523557
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  46523731 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattc 46523632  T
Q  200 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||  |  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  46523631 gtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtt 46523557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22035827 - 22035681
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||    
T  22035827 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgtt 22035728  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  22035727 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 22035681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Original strand, 7640847 - 7640956
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  7640847 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 7640946  T
Q  199 tgtgctcttg 208  Q
     |||||||||    
T  7640947 cgtgctcttg 7640956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 51452721 - 51452608
Alignment:
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||     
T  51452721 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 51452622  T
Q  312 aaattggtgaattt 325  Q
    |||| | |||||||    
T  51452621 aaatggatgaattt 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 15861284 - 15861358
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15861284 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 398 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 45051486 - 45051446
Alignment:
Q  398 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 438  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45051486 ttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 45051446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Original strand, 20936 - 21367
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||  ||| ||| |  |||||| ||||||||||    
T  20936 agagaagaacaagagttttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggt 21035  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  21036 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgt 21135  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  21136 tgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgag 21235  T
Q  310 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21236 ctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaataat 21334  T
Q  410 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  21335 tgcttgagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 442
Target Start/End: Original strand, 13882 - 14312
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||  ||| ||| |  |||||| ||||||||||    
T  13882 agagaagaacaagagttttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggt 13981  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  13982 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaa-tcgtgctcttgc 14080  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14081 tgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtg 14180  T
Q  310 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14181 ctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataat 14279  T
Q  410 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14280 tgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 38 - 442
Target Start/End: Original strand, 64372 - 64780
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  64372 agcttaaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 64471  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  64472 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaatt 64570  T
Q  238 -----gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaa 332  Q
         |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  64571 atattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaa 64670  T
Q  333 gttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgg 432  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  64671 gttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgg 64770  T
Q  433 attgatgatg 442  Q
    |||| |||||    
T  64771 attgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 105 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 108084 - 107747
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||    
T  108084 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 107985  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 303  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||     
T  107984 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaa 107885  T
Q  304 attgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 403  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  107884 attgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 107786  T
Q  404 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107785 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 100 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 374 - 35
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  374 cttctaaggtaagggggttagttattatcaaaatcatgt--aattttgcattg-ctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattc 278  T
Q  200 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  277 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttat 178  T
Q  300 gaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 399  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177 gtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 78  T
Q  400 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  77 aatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 38 - 336
Target Start/End: Original strand, 1153 - 1450
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1153 agctttaggaatcaagttggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaggggggttagttattatcacaatcatg 1252  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1253 ta-atttttgcatttactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 1351  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttg 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1352 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 63 - 442
Target Start/End: Original strand, 5088 - 5466
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||    
T  5088 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggagttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgtt 5187  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  5188 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 5287  T
Q  262 gaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttg 361  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  5288 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctgagttgttgttaatttgagatttgattcttg 5386  T
Q  362 ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5387 ttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatattcatggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 63 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 4102 - 3722
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  4102 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttctaaggtaaggggtttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 4003  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  4002 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 3903  T
Q  262 gaaattacatgttcatatatg-caaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattctt 360  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  3902 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattctt 3804  T
Q  361 gttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3803 gttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatattcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 34 - 343
Target Start/End: Original strand, 13171 - 13477
Alignment:
Q  34 gggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataat 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13171 gggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggaactgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataat 13270  T
Q  134 catgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg 233  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13271 catgt--aatttttcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatg 13368  T
Q  234 aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaag 333  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| | |||||    
T  13369 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaag 13467  T
Q  334 ttgttgttaa 343  Q
    || |||||||    
T  13468 ttattgttaa 13477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 105 - 438
Target Start/End: Original strand, 9266 - 9596
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  9266 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 9363  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  9364 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 9463  T
Q  305 ttgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 404  Q
    | ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||    
T  9464 tggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 9562  T
Q  405 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 438  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9563 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 105 - 438
Target Start/End: Original strand, 16164 - 16494
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  16164 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 16261  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  16262 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16361  T
Q  305 ttgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 404  Q
    | ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||    
T  16362 tggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 16460  T
Q  405 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 438  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16461 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 63 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 3341 - 2966
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttg 162  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3341 taggagctgaattgaagcaagagtttcggttaatcttcttctaaggtaagggggttaattattatcataattatgtacaattttgcattttctcatgttg 3242  T
Q  163 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  3241 tatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtg 3142  T
Q  263 aaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttg- 361  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||| ||     
T  3141 aaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgt 3043  T
Q  362 ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 438  Q
    || || |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3042 tttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 190 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 5780 - 5552
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  5780 tgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 5681  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5680 gataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5581  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggt 418  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5580 taatatgattaatgaataattgcttgggt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 105 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12449 - 12115
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcat-tttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |  ||||  ||| ||||||||| |  | | ||| | ||||  ||||||||| ||||    
T  12449 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatct-taattttgtaactttcaaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtgc 12351  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 303  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||||||| ||||     
T  12350 tctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 12251  T
Q  304 attgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 403  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  12250 attgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatg 12154  T
Q  404 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12153 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 440
Target Start/End: Original strand, 3594 - 3843
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3594 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 3693  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  3694 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattga 3792  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 440  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3793 tgttgtgattgaggaataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1375 - 1124
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1375 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 1276  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  1275 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 1177  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1176 tattgtggttgatgaataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6326
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6076 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6175  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
     ||||||| | || |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||      
T  6176 aataagttgtaaaaattgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttt 6273  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6274 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 968 - 1218
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  968 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 1067  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
     ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  1068 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 1165  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1166 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 48438 - 48187
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  48438 tgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaat 48339  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  48338 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaattga 48240  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48239 tgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 210 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 9109 - 8878
Alignment:
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| |||| ||||||    
T  9109 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaaattgtg 9010  T
Q  310 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    || ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  9009 ctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataat 8911  T
Q  410 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8910 tgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29558 - 29388
Alignment:
Q  47 aatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  29558 aatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctt 29459  T
Q  146 tgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||    
T  29458 tgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatg 29388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 29627 - 29565
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaa 73  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29627 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaa 29565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 193 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 148969 - 148721
Alignment:
Q  193 taaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 292  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  148969 taaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgat 148870  T
Q  293 aagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 392  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  |    
T  148869 aagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagt 148771  T
Q  393 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  148770 tgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 9100 - 8849
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  9100 tgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 9001  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||||| |||||||||   | ||| ||||    
T  9000 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattga 8902  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8901 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19457 - 19206
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19457 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 19358  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  19357 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattga 19259  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19258 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21541 - 21290
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21541 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 21442  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  21441 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattga 21343  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21342 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 210 - 442
Target Start/End: Original strand, 123196 - 123427
Alignment:
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| ||||||    
T  123196 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtg 123295  T
Q  310 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    || ||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  123296 ctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataat 123394  T
Q  410 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  123395 ggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31742 - 31477
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  31742 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 31643  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  31642 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 31543  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  31542 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 31477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39814
Alignment:
Q  153 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtata 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  253 attgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgtt 39814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 209 - 442
Target Start/End: Original strand, 36944 - 37176
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  36944 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 37043  T
Q  309 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 408  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  37044 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 37142  T
Q  409 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37143 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 442
Target Start/End: Original strand, 5092 - 5324
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  5092 ctgtgacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 5191  T
Q  309 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 408  Q
    ||| ||||||||||||| | | |||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| |    
T  5192 gctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatca 5290  T
Q  409 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5291 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 190 - 431
Target Start/End: Original strand, 247454 - 247694
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | | ||||    
T  247454 tgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaat 247553  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  247554 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattga 247652  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 431  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  247653 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 34076 - 34246
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtg 202  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||    
T  34076 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtg 34174  T
Q  203 ctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||| | ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  34175 ctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 34246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 26427 - 26678
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  26427 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaat 26526  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  26527 gataagttgtgaaaattgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 26625  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26626 tgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 8192 - 8327
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  8192 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaat 8291  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    |  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  8292 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 209 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 172137 - 171916
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  172137 ctgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 172038  T
Q  309 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 408  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  172037 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 171939  T
Q  409 ttgcttgggtatgcatattcatg 431  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  171938 ttgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 209 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 177840 - 177619
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  177840 ctgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 177741  T
Q  309 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 408  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  177740 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 177642  T
Q  409 ttgcttgggtatgcatattcatg 431  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  177641 ttgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 190 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 41980 - 41733
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  41980 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaat 41881  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||     
T  41880 gataatttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgt 41782  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 438  Q
    | || |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41781 tgttgtagatgatgaatcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 442
Target Start/End: Original strand, 34374 - 34724
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattcatg 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | ||||  ||    
T  34374 aaggtaagagggttagttattatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaatgaatggataattattg 34473  T
Q  192 ctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 291  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||      
T  34474 ctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaatat 34573  T
Q  292 taagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgat 390  Q
     ||||| |||| ||||| || ||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||| || || || |||||||||   |||||||||||    
T  34574 gaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgat 34672  T
Q  391 attatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
     || |  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34673 gttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 546 - 797
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  546 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 645  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    ||| |||| |||| ||||| || ||||||||||||| | |||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||  || || ||||    
T  646 gatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggctgctaattga 744  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  745 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 209 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 272257 - 272031
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  272257 ctgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 272158  T
Q  309 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 408  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  272157 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 272059  T
Q  409 ttgcttgggtatgcatattcatggattg 436  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  272058 ttgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 216
Target Start/End: Original strand, 10624 - 10778
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10624 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 10723  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10724 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 1451 - 1663
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1451 taggagctgaattgaagcaagggtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 1550  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  1551 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1650  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  1651 gaaattacatgtt 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Original strand, 7278 - 7509
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||  || |||| || |||||  |||||||||    
T  7278 agagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaagg 7377  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  7378 taagggggttagttattatcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctctt 7477  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 239  Q
    | ||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  7478 gttgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 7509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2826 - 2560
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||    
T  2826 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagg 2728  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaa--ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  2727 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctct 2628  T
Q  207 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||| |||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  2627 tgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 193 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 41896 - 41648
Alignment:
Q  193 taaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 292  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||      
T  41896 taaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtg 41797  T
Q  293 aagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 392  Q
    ||||| |||| |||||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   |||||  |||| |    
T  41796 aagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgatgt 41698  T
Q  393 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41697 tgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 1390 - 1602
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  || ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1390 taggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 1489  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  1490 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggt 1589  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  1590 gaaattacatgtt 1602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7002 - 6831
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7002 agctttacgaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 6903  T
Q  137 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttg 208  Q
     |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  6902 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13855 - 13506
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttg----------atgaacaattcatg 191  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| || || ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||          ||| | ||||  ||    
T  13855 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgtttatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttg 13756  T
Q  192 ctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 291  Q
    ||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||     
T  13755 ctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgt 13656  T
Q  292 taagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgata 391  Q
     ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| ||||||||| ||||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| |||||     
T  13655 gaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatg 13557  T
Q  392 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13556 ttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 42709 - 42677
Alignment:
Q  104 aaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42709 aaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 336 - 442
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  336 gttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 435  Q
    |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  436 gatgatg 442  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 10257 - 10427
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  10257 aaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 10356  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10357 tcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 336 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  336 gttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 435  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  436 gatgatg 442  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 324
Target Start/End: Original strand, 51194 - 51328
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  51194 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaat 51293  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatt 324  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  51294 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3712 - 3579
Alignment:
Q  143 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | ||  | | ||||||||||||     
T  3712 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatga 3613  T
Q  243 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 276  Q
    |  | |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3612 ttatggtatgattgtgggtgaaattacatgttca 3579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 23600 - 23769
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23600 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggaactgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagttaagggggttagttattatcatattcaat 23699  T
Q  137 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgctct 206  Q
     |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  23700 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctct 23769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 442
Target Start/End: Original strand, 37078 - 37328
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  37078 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 37177  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| |||  |||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  37178 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 37275  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37276 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45369 - 45098
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtg 202  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||| |||    
T  45369 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 45270  T
Q  203 ctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatg 300  Q
    | |||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||| | |||||  ||||| ||    
T  45269 cccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttg 45170  T
Q  301 aagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 374  Q
    || ||||| || ||||||||||||| |  || ||||||||| || |||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  45169 aa-attgtactcaattggtgaattt-tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 45098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 54755 - 54484
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtg 202  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||| |||    
T  54755 aaggtaaggtggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 54656  T
Q  203 ctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatg 300  Q
      |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| |||| | |||| | |||||  ||||||||    
T  54655 tccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg 54556  T
Q  301 aagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 374  Q
    || ||||| || ||||||||||||| |  || ||||||||| || |||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  54555 aa-attgtactcaattggtgaattt-tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 54484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 54212 - 54040
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  54212 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgc 54113  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 276  Q
    |||| |||||||| | | ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  54112 tcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttca 54040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 324
Target Start/End: Original strand, 89466 - 89600
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  89466 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 89565  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatt 324  Q
     ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  89566 tataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 131006 - 130880
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  131006 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggcataatcatcttcaaaggt 130907  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||    
T  130906 aagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 344 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9382
Alignment:
Q  344 attgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 442  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3447 - 3360
Alignment:
Q  184 aattcatgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 271  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3447 aattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 12045 - 12149
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  12045 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaatttttcattt-ctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtg 12143  T
Q  203 ctcttg 208  Q
    ||||||    
T  12144 ctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7547 - 7443
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatttgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  7547 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 7448  T
Q  204 tcttg 208  Q
    |||||    
T  7447 tcttg 7443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22791 - 22656
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  22791 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 22692  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  22691 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 22656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27046 - 26911
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  27046 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 26947  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  26946 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 1594 - 1729
Alignment:
Q  190 tgctaaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  |||||    
T  1594 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 1693  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 325  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  1694 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Original strand, 13268 - 13342
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13268 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 13342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Original strand, 154282 - 154373
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  154282 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatca 154373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 17115 - 17241
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||| | |||| |||||    
T  17115 agagaagcacaggagtgttgaaaggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataataatcttctaaggt 17214  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||    
T  17215 aagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 374
Target Start/End: Original strand, 56114 - 56295
Alignment:
Q  193 taaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg--ttcatatatgcaaaaatg 290  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||  || |  |||| | |||||    
T  56114 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatgtataaatg 56213  T
Q  291 ataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaaattgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 374  Q
      |||||||||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| ||  ||  |||||||| ||||| | |||||||    
T  56214 tcaagttatgaa-attgtgctcaaatggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgtt 56295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27744 - 27659
Alignment:
Q  194 aaatttgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 278  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  27744 aaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcata 27659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 3160 times since January 2019
Visitors: 4805