View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0755_low_110 (Length: 275)

Name: NF0755_low_110
Description: NF0755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0755_low_110
NF0755_low_110
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (12-275)||(19886483-19886746)
chr2 (12-274)||(11231161-11231426)
chr2 (12-274)||(22513008-22513273)
chr2 (12-274)||(28775630-28775895)
chr2 (12-274)||(24685604-24685869)
chr2 (63-274)||(8944014-8944226)
chr2 (63-274)||(12728560-12728772)
chr2 (63-274)||(34824643-34824855)
chr2 (66-274)||(3798482-3798691)
chr2 (105-274)||(23777963-23778133)
chr2 (63-274)||(12635744-12635956)
chr2 (63-274)||(12641518-12641730)
chr2 (12-136)||(24826522-24826646)
chr2 (63-274)||(42177845-42178057)
chr2 (100-274)||(16935761-16935936)
chr2 (100-274)||(17006421-17006596)
chr2 (63-208)||(23774370-23774516)
chr2 (190-275)||(25265402-25265487)
chr2 (105-208)||(5888548-5888652)
chr2 (193-275)||(19794719-19794801)
chr2 (190-275)||(462904-462989)
chr2 (190-275)||(7507856-7507941)
chr2 (190-275)||(8891408-8891493)
chr2 (151-239)||(21142098-21142187)
chr2 (210-275)||(43642989-43643054)
chr2 (193-273)||(20627328-20627408)
chr2 (209-275)||(24341420-24341486)
chr2 (190-275)||(36982453-36982538)
chr2 (190-274)||(14906452-14906536)
chr2 (190-274)||(19689413-19689497)
chr2 (190-274)||(23820238-23820322)
chr2 (190-274)||(17396665-17396748)
chr2 (190-274)||(20015178-20015262)
chr2 (63-136)||(25213372-25213446)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (5-275)||(12541-12811)
chr5 (5-275)||(21073410-21073680)
chr5 (12-275)||(18777814-18778077)
chr5 (12-275)||(19500066-19500328)
chr5 (12-275)||(22366302-22366566)
chr5 (12-275)||(4199807-4200070)
chr5 (12-275)||(25426795-25427058)
chr5 (12-275)||(43443220-43443480)
chr5 (12-275)||(29188107-29188369)
chr5 (12-274)||(10777793-10778058)
chr5 (38-274)||(27010009-27010244)
chr5 (12-274)||(21932204-21932469)
chr5 (12-274)||(21938374-21938639)
chr5 (12-274)||(35582204-35582469)
chr5 (38-274)||(7425492-7425729)
chr5 (62-274)||(11211940-11212153)
chr5 (12-274)||(36989593-36989858)
chr5 (12-241)||(22882907-22883139)
chr5 (63-274)||(35790974-35791186)
chr5 (12-274)||(17471411-17471676)
chr5 (63-274)||(1219396-1219608)
chr5 (63-274)||(23514729-23514941)
chr5 (63-208)||(23328791-23328937)
chr5 (63-208)||(24616395-24616541)
chr5 (63-208)||(24712771-24712917)
chr5 (63-208)||(24745789-24745935)
chr5 (12-136)||(11343008-11343134)
chr5 (190-275)||(34939443-34939528)
chr5 (190-275)||(18531079-18531164)
chr5 (190-275)||(22053845-22053930)
chr5 (190-275)||(23507131-23507216)
chr5 (12-136)||(16105967-16106093)
chr5 (190-275)||(27182559-27182644)
chr5 (190-274)||(20623136-20623220)
chr5 (190-274)||(21233540-21233624)
chr5 (190-274)||(25900418-25900502)
chr5 (190-274)||(37052911-37052995)
chr5 (190-274)||(16536364-16536448)
chr5 (193-274)||(32950862-32950943)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (12-275)||(27653805-27654068)
chr6 (38-275)||(25175730-25175968)
chr6 (116-275)||(16825678-16825839)
chr6 (12-275)||(14625952-14626215)
chr6 (12-274)||(16376196-16376461)
chr6 (12-274)||(16383520-16383785)
chr6 (105-275)||(1650022-1650190)
chr6 (12-274)||(10488867-10489132)
chr6 (12-241)||(22251389-22251621)
chr6 (38-274)||(16232060-16232297)
chr6 (12-274)||(22225561-22225826)
chr6 (12-212)||(19299467-19299670)
chr6 (23-274)||(16555973-16556227)
chr6 (23-274)||(16632529-16632783)
chr6 (38-274)||(18086674-18086911)
chr6 (100-274)||(1556173-1556348)
chr6 (63-274)||(19610186-19610398)
chr6 (63-274)||(23977937-23978149)
chr6 (38-208)||(29869627-29869798)
chr6 (105-274)||(13620712-13620882)
chr6 (12-121)||(16814820-16814930)
chr6 (109-274)||(29666041-29666208)
chr6 (190-275)||(35009451-35009536)
chr6 (192-275)||(15862637-15862720)
chr6 (190-275)||(1657760-1657845)
chr6 (192-275)||(23153613-23153696)
chr6 (191-263)||(27751603-27751675)
chr6 (63-136)||(4991396-4991470)
chr6 (194-275)||(19854320-19854402)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (12-275)||(13910846-13911109)
chr7 (12-275)||(10989576-10989841)
chr7 (12-275)||(16478785-16479047)
chr7 (12-275)||(2437624-2437889)
chr7 (38-274)||(13572844-13573079)
chr7 (12-274)||(7822896-7823161)
chr7 (12-274)||(7830207-7830472)
chr7 (12-274)||(27176601-27176866)
chr7 (12-274)||(27101460-27101725)
chr7 (12-274)||(27108808-27109073)
chr7 (12-274)||(38783552-38783817)
chr7 (38-274)||(18979872-18980109)
chr7 (38-274)||(15927736-15927973)
chr7 (12-274)||(15950613-15950879)
chr7 (105-275)||(18253761-18253932)
chr7 (63-274)||(13758538-13758750)
chr7 (100-274)||(15760027-15760202)
chr7 (100-274)||(14250811-14250986)
chr7 (105-187)||(15862174-15862257)
chr7 (105-275)||(48622584-48622755)
chr7 (190-274)||(13321183-13321267)
chr7 (190-275)||(47481043-47481128)
chr7 (105-208)||(16418731-16418835)
chr7 (190-275)||(11580751-11580836)
chr7 (190-275)||(13037026-13037111)
chr7 (105-208)||(10000288-10000392)
chr7 (190-275)||(16211932-16212017)
chr7 (190-274)||(11516394-11516478)
chr7 (190-274)||(15441576-15441660)
chr7 (190-274)||(30262141-30262225)
chr7 (190-274)||(7293183-7293267)
chr7 (209-275)||(36052830-36052896)
chr7 (190-275)||(3060132-3060217)
chr7 (190-274)||(25292350-25292434)
chr7 (62-136)||(15516719-15516793)
chr7 (190-274)||(295978-296062)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (12-271)||(36264-36523)
scaffold0023 (16-229)||(169736-169951)
scaffold0023 (100-274)||(153920-154095)
scaffold0023 (190-275)||(48764-48849)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (12-271)||(31497-31756)
scaffold0008 (190-275)||(128181-128266)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (12-275)||(30120889-30121153)
chr8 (12-275)||(24549148-24549410)
chr8 (12-275)||(6774082-6774343)
chr8 (12-274)||(21844393-21844656)
chr8 (12-274)||(21851786-21852049)
chr8 (41-275)||(16674245-16674477)
chr8 (12-274)||(271183-271448)
chr8 (12-274)||(644472-644737)
chr8 (12-274)||(830207-830472)
chr8 (12-215)||(15318982-15319188)
chr8 (12-215)||(15499351-15499557)
chr8 (12-274)||(22088617-22088882)
chr8 (100-274)||(22006171-22006346)
chr8 (63-274)||(13720804-13721016)
chr8 (93-274)||(16195399-16195581)
chr8 (63-274)||(16872927-16873139)
chr8 (63-274)||(13662141-13662353)
chr8 (190-275)||(16404987-16405072)
chr8 (194-275)||(17345735-17345816)
chr8 (190-275)||(24928803-24928888)
chr8 (184-275)||(43373474-43373565)
chr8 (190-275)||(16193728-16193813)
chr8 (190-274)||(5238254-5238338)
chr8 (190-274)||(22907226-22907310)
chr8 (190-274)||(24661260-24661344)
chr8 (190-274)||(43685713-43685797)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (12-275)||(10644386-10644648)
chr4 (100-275)||(47357821-47357994)
chr4 (38-274)||(15287096-15287333)
chr4 (12-274)||(18169138-18169403)
chr4 (38-274)||(15294205-15294442)
chr4 (63-274)||(20000891-20001103)
chr4 (100-274)||(7131978-7132153)
chr4 (105-274)||(19020654-19020824)
chr4 (100-274)||(17145570-17145745)
chr4 (38-208)||(22351915-22352086)
chr4 (105-239)||(18248421-18248556)
chr4 (114-216)||(8378377-8378480)
chr4 (63-208)||(26339253-26339399)
chr4 (143-274)||(22738437-22738568)
chr4 (190-275)||(15675101-15675186)
chr4 (190-275)||(10104262-10104347)
chr4 (190-275)||(54118256-54118341)
chr4 (209-275)||(31115795-31115861)
chr4 (190-275)||(122055-122140)
chr4 (209-275)||(13246596-13246662)
chr4 (38-136)||(14952085-14952183)
chr4 (190-274)||(10488729-10488813)
chr4 (190-274)||(16327938-16328022)
chr4 (190-274)||(26680367-26680451)
chr4 (105-179)||(9795490-9795564)
chr4 (218-274)||(13048261-13048317)
chr4 (190-241)||(33240900-33240951)
chr4 (209-275)||(40885585-40885651)
chr4 (105-137)||(14996444-14996476)
chr4 (105-138)||(8378491-8378524)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (34-275)||(13171-13410)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (38-275)||(55316386-55316622)
chr3 (38-275)||(41270242-41270478)
chr3 (12-274)||(49232604-49232869)
chr3 (12-274)||(12264614-12264880)
chr3 (12-274)||(1467562-1467827)
chr3 (100-275)||(16821306-16821479)
chr3 (105-275)||(15615000-15615168)
chr3 (12-241)||(12812042-12812274)
chr3 (12-274)||(22275377-22275642)
chr3 (63-274)||(15468216-15468428)
chr3 (63-274)||(25058907-25059119)
chr3 (105-275)||(15936553-15936724)
chr3 (63-274)||(18911161-18911373)
chr3 (105-274)||(12902008-12902178)
chr3 (105-275)||(15938395-15938566)
chr3 (63-241)||(18896920-18897099)
chr3 (100-274)||(5228481-5228655)
chr3 (105-274)||(54651625-54651795)
chr3 (190-275)||(15859036-15859121)
chr3 (190-275)||(51158030-51158115)
chr3 (63-275)||(14842446-14842658)
chr3 (190-275)||(12030159-12030244)
chr3 (190-275)||(13839060-13839145)
chr3 (105-274)||(44229153-44229323)
chr3 (190-274)||(17912495-17912578)
chr3 (190-275)||(2049976-2050061)
chr3 (190-274)||(2449250-2449334)
chr3 (63-137)||(8268609-8268683)
chr3 (63-137)||(8275709-8275783)
chr3 (193-274)||(11986181-11986262)
chr3 (190-274)||(13954902-13954985)
chr3 (190-274)||(13975734-13975817)
chr3 (190-274)||(45860973-45861056)
chr3 (193-271)||(16744130-16744208)
chr3 (194-275)||(41661730-41661812)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (38-275)||(1153-1389)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (12-275)||(43164-43427)
scaffold0076 (12-274)||(39271-39536)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (38-275)||(5072237-5072473)
chr1 (12-274)||(18059581-18059846)
chr1 (12-274)||(17148735-17149001)
chr1 (66-275)||(22227975-22228185)
chr1 (66-275)||(22232672-22232882)
chr1 (12-274)||(17004806-17005071)
chr1 (105-275)||(2116421-2116589)
chr1 (105-275)||(45051589-45051757)
chr1 (143-275)||(18601071-18601203)
chr1 (12-274)||(38054914-38055179)
chr1 (12-212)||(19962322-19962525)
chr1 (100-274)||(46523557-46523731)
chr1 (63-208)||(7640810-7640956)
chr1 (63-208)||(22035681-22035827)
chr1 (190-275)||(20445845-20445930)
chr1 (190-275)||(20913196-20913281)
chr1 (190-275)||(20931511-20931596)
chr1 (190-275)||(20531610-20531695)
chr1 (190-275)||(20893638-20893723)
chr1 (190-275)||(37844462-37844547)
chr1 (190-275)||(41394388-41394473)
chr1 (190-274)||(51452659-51452743)
chr1 (62-136)||(15861284-15861358)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (12-275)||(20936-21201)
scaffold0139 (12-274)||(13882-14145)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (63-275)||(3129-3341)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (47-216)||(29388-29558)
scaffold0213 (12-70)||(29568-29627)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (105-275)||(9266-9434)
scaffold0215 (105-275)||(16164-16332)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (12-274)||(31477-31742)
scaffold0107 (153-274)||(39814-39935)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (63-275)||(3889-4102)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (38-274)||(64372-64612)
scaffold0026 (105-275)||(107913-108084)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (63-275)||(5088-5301)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (100-274)||(203-374)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (63-216)||(10624-10778)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (63-274)||(1451-1663)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (12-239)||(7278-7509)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (12-274)||(2560-2826)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (63-274)||(1390-1602)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (38-208)||(6831-7002)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (105-274)||(10257-10427)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (38-206)||(23600-23769)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (105-274)||(45198-45369)
scaffold0066 (105-274)||(54584-54755)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (105-275)||(54041-54212)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (105-275)||(34374-34557)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (143-275)||(3580-3712)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (12-136)||(130880-131006)
scaffold0028 (190-275)||(89466-89551)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (63-274)||(34034-34246)
scaffold0012 (190-275)||(247454-247539)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (193-275)||(41814-41896)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (105-275)||(13672-13855)
scaffold0132 (104-136)||(42677-42709)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (184-271)||(3360-3447)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (105-274)||(12280-12449)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (190-275)||(546-631)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (105-208)||(12045-12149)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (190-275)||(6076-6161)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (190-275)||(3594-3679)
scaffold0266 (190-275)||(1290-1375)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (190-275)||(968-1053)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (190-275)||(8192-8277)
scaffold0162 (190-275)||(26427-26512)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (190-275)||(9015-9100)
scaffold0025 (209-275)||(148887-148953)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (105-208)||(7443-7547)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (190-275)||(19372-19457)
scaffold0195 (190-275)||(21456-21541)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (190-275)||(48353-48438)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (190-275)||(123176-123261)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (190-274)||(5696-5780)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (190-275)||(9044-9129)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (190-275)||(51194-51279)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (105-179)||(13268-13342)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (38-129)||(154282-154373)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (190-272)||(41898-41980)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (193-275)||(36928-37010)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (190-275)||(172071-172156)
scaffold0001 (190-275)||(177774-177859)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (190-274)||(22707-22791)
scaffold0141 (190-274)||(26962-27046)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (190-274)||(1594-1678)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (190-274)||(37078-37162)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (12-136)||(17115-17241)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (190-275)||(5073-5158)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (193-274)||(56114-56195)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (209-275)||(272191-272257)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (191-274)||(1-84)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (194-275)||(8175-8257)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 19886483 - 19886746
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886483 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 19886582  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886583 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 19886682  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886683 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 19886746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 11231161 - 11231426
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  11231161 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 11231260  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  11231261 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 11231360  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  11231361 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 11231426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 22513008 - 22513273
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  22513008 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 22513107  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  22513108 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22513207  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22513208 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 22513273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 28775630 - 28775895
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  28775630 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 28775729  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  28775730 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 28775829  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  28775830 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 28775895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 24685604 - 24685869
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  24685604 agagaagaacaaaagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 24685703  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  24685704 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 24685803  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  24685804 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 24685869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8944226 - 8944014
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8944226 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 8944127  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||    
T  8944126 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggt 8944027  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  8944026 gaaattacatgtt 8944014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12728772 - 12728560
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  12728772 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 12728673  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  12728672 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 12728573  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  12728572 gaaattacatgtt 12728560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34824855 - 34824643
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  34824855 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 34824756  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  34824755 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 34824656  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  34824655 gaaattacatgtt 34824643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Original strand, 3798482 - 3798691
Alignment:
Q  66 gagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgta 164  Q
    ||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3798482 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgta 3798581  T
Q  165 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||    
T  3798582 tgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 3798681  T
Q  265 attacatgtt 274  Q
    ||||||||||    
T  3798682 attacatgtt 3798691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 23777963 - 23778133
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23777963 aaggtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 23778062  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |  | ||||  |||| | ||||||||||||||    
T  23778063 tcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtt 23778133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 12635744 - 12635956
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  12635744 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgtt 12635843  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  12635844 gtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 12635943  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  12635944 gaaattacatgtt 12635956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 12641518 - 12641730
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  12641518 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 12641617  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| | |    
T  12641618 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggct 12641717  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  12641718 gaaattacatgtt 12641730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 24826522 - 24826646
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  24826522 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 24826621  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcat 136  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  24826622 aggggttagtcatcatcataatcat 24826646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 42177845 - 42178057
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||| ||| ||||||||| ||  || ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  42177845 taggggctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 42177944  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  42177945 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggt 42178044  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  42178045 gaaattacatgtt 42178057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16935936 - 16935761
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  16935936 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaatt 16935837  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  |||||||||||||||    
T  16935836 catgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtt 16935761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17006596 - 17006421
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  17006596 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaatt 17006497  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  |||||||||||||||    
T  17006496 catgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtt 17006421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23774516 - 23774370
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||| || |||||||    
T  23774516 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgtt 23774417  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23774416 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 23774370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 25265402 - 25265487
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25265402 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 25265487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 5888548 - 5888652
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5888548 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 5888647  T
Q  204 tcttg 208  Q
    |||||    
T  5888648 tcttg 5888652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 275
Target Start/End: Original strand, 19794719 - 19794801
Alignment:
Q  193 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19794719 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 19794801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 462989 - 462904
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  462989 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 462904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 7507856 - 7507941
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7507856 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 7507941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8891493 - 8891408
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8891493 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttc 8891408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21142187 - 21142098
Alignment:
Q  151 tttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  21142187 tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 21142098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 275
Target Start/End: Original strand, 43642989 - 43643054
Alignment:
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43642989 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 43643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 273
Target Start/End: Original strand, 20627328 - 20627408
Alignment:
Q  193 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgt 273  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20627328 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgt 20627408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Original strand, 24341420 - 24341486
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24341420 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttc 24341486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 36982453 - 36982538
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  36982453 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttc 36982538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 14906452 - 14906536
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14906452 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 14906536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 19689413 - 19689497
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19689413 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 19689497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23820322 - 23820238
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23820322 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 23820238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 17396665 - 17396748
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17396665 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 17396748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20015262 - 20015178
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  20015262 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtt 20015178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25213446 - 25213372
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaagga-taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||||| ||||||||| ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25213446 taggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12811 - 12541
Alignment:
Q  5 gaggagcagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttca 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12811 gaggagaagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttca 12712  T
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12711 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 12612  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 12541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 275
Target Start/End: Original strand, 21073410 - 21073680
Alignment:
Q  5 gaggagcagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttca 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073410 gaggagaagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttca 21073509  T
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21073510 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgct 21073609  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073610 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 21073680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 18777814 - 18778077
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  18777814 agagaagaacaagagggttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataattaacttcaaaggtaa 18777913  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18777914 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctg 18778013  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778014 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 18778077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19500328 - 19500066
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  19500328 agagaagaacaagagagttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 19500230  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19500229 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttgctg 19500130  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500129 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 19500066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 22366302 - 22366566
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  22366302 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttagcaatcaagtggggtgacctaggagttgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 22366401  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366402 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttgct 22366501  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366502 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 22366566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 4199807 - 4200070
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  4199807 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 4199906  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4199907 gggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttg 4200006  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4200007 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttc 4200070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25427058 - 25426795
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaag-gataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||    
T  25427058 agagaagagcaagagggttgaagggaagcttaaagaatcaagtgggtaac-taggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggta 25426960  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426959 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 25426860  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426859 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 25426795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 43443220 - 43443480
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  43443220 agagaagagcatgagggttgaagggaagctt-aggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 43443318  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43443319 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaatt--gcatattctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctg 43443416  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43443417 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttc 43443480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 29188107 - 29188369
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  29188107 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 29188206  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  29188207 agggggttagtgattattataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 29188304  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29188305 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 29188369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 10777793 - 10778058
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10777793 agagaagaacaagagagttgaaggggaagcttgaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaaggataatcatcttcaaaggt 10777892  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10777893 aaggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 10777992  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10777993 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10778058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27010244 - 27010009
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27010244 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 27010145  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27010144 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 27010046  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27010045 gatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtt 27010009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 21932204 - 21932469
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21932204 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 21932303  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  21932304 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 21932403  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  21932404 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 21932469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 21938374 - 21938639
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21938374 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 21938473  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  21938474 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 21938573  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  21938574 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 21938639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35582469 - 35582204
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  35582469 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 35582370  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  35582369 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 35582270  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  35582269 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 35582204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7425729 - 7425492
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425729 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 7425630  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  7425629 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaat 7425530  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  7425529 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 7425492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 62 - 274
Target Start/End: Original strand, 11211940 - 11212153
Alignment:
Q  62 ctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgt 160  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  11211940 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 11212039  T
Q  161 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttgg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||    
T  11212040 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 11212139  T
Q  261 tgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||    
T  11212140 tgaaattacatgtt 11212153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 36989593 - 36989858
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  36989593 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 36989692  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||| |    
T  36989693 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctctag 36989792  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  36989793 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 36989858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 22882907 - 22883139
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  22882907 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgggaaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaagat 22883006  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  22883007 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttg 22883106  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||    
T  22883107 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatg 22883139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 35790974 - 35791186
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  35790974 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 35791073  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  ||    
T  35791074 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagt 35791173  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  35791174 gaaattacatgtt 35791186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 17471411 - 17471676
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||| ||  ||   | |||||| |||||||||    
T  17471411 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcatcttcaaagg 17471509  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  17471510 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctctt 17471609  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17471610 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 1219396 - 1219608
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1219396 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 1219495  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||| |||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  1219496 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1219595  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  1219596 gaaattacatgtt 1219608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23514941 - 23514729
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  23514941 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 23514842  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  23514841 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 23514742  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  23514741 gaaattacatgtt 23514729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23328937 - 23328791
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  23328937 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 23328838  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23328837 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 23328791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24616541 - 24616395
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  24616541 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24616442  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24616441 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 24616395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24712917 - 24712771
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  24712917 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24712818  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24712817 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 24712771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24745935 - 24745789
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  24745935 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24745836  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24745835 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 24745789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11343134 - 11343008
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   | ||| || |||||  ||||||||||    
T  11343134 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcagaggttagggttaatcttcttcaaaggt 11343035  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11343034 aagggggttagtttttatcataatcat 11343008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34939528 - 34939443
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34939528 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttc 34939443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 18531079 - 18531164
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18531079 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 18531164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 22053845 - 22053930
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22053845 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttc 22053930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23507216 - 23507131
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23507216 tgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 23507131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16106093 - 16105967
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||| ||  || ||| |||||  |||| |||||    
T  16106093 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggt 16105994  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16105993 aagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 27182559 - 27182644
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27182559 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttc 27182644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20623220 - 20623136
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20623220 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 20623136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 21233540 - 21233624
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21233540 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 21233624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 25900418 - 25900502
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  25900418 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtt 25900502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37052995 - 37052911
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  37052995 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 37052911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16536448 - 16536364
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16536448 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 16536364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32950943 - 32950862
Alignment:
Q  193 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || || || |||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  32950943 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 27653805 - 27654068
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| |    
T  27653805 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtga 27653904  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27653905 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctg 27654004  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654005 tgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 27654068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 38 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25175968 - 25175730
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaag-gataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25175968 agctttcggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattaccataatcat 25175870  T
Q  137 gtgtaattttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa 235  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25175869 gtataattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaa 25175770  T
Q  236 ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175769 ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 25175730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 116 - 275
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16825839
Alignment:
Q  116 gttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825678 gttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 16825777  T
Q  216 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16825778 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttc 16825839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 14625952 - 14626215
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  14625952 agagaagaacaagagggttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 14626051  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctc--atgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | | | ||| ||  |||||  ||||||| || || || | | ||| | ||||  ||||||||||||||||||||    
T  14626052 gggggttagttattatcacaatcatct-tcactttacaaattctcaaatgttgtttg-aattgtgattatggataattattgctaaattcgtgctcttgc 14626149  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14626150 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 14626215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 16376196 - 16376461
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16376196 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 16376295  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  16376296 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 16376395  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16376396 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16376461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 16383520 - 16383785
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16383520 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 16383619  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  16383620 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 16383719  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16383720 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16383785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 1650022 - 1650190
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1650022 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgct 1650119  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1650120 cttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 1650190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10489132 - 10488867
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  10489132 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 10489033  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  10489032 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 10488933  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  10488932 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 10488867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 22251389 - 22251621
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  22251389 agagaagaacaagagtgttgaatggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 22251488  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  22251489 atgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22251588  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  22251589 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 22251621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16232297 - 16232060
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232297 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 16232198  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  16232197 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 16232098  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16232097 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16232060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 22225561 - 22225826
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  22225561 agagaagaacaagagtgttgaatggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 22225660  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||     
T  22225661 atgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttt 22225760  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22225761 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 22225826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19299670 - 19299467
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19299670 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggattcaatttgggcgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 19299571  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  19299570 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 19299471  T
Q  209 ctgt 212  Q
    ||||    
T  19299470 ctgt 19299467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 274
Target Start/End: Original strand, 16555973 - 16556227
Alignment:
Q  23 agagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttag 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555973 agagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttag 16556072  T
Q  121 ttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgtta 219  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  16556073 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgcta 16556172  T
Q  220 tgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16556173 ttttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16556227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 274
Target Start/End: Original strand, 16632529 - 16632783
Alignment:
Q  23 agagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttag 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632529 agagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttag 16632628  T
Q  121 ttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgtta 219  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  16632629 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgcta 16632728  T
Q  220 tgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16632729 ttttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16632783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 18086674 - 18086911
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18086674 agctttagaaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattagtataatcatg 18086773  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  18086774 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaat 18086873  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18086874 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18086911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1556348 - 1556173
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1556348 cttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 1556249  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  1556248 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1556173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19610398 - 19610186
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  19610398 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgtt 19610299  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||  |||| |||    
T  19610298 gtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggt 19610199  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  19610198 gaaattacatgtt 19610186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23978149 - 23977937
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  23978149 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 23978050  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  23978049 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 23977950  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  23977949 gaaattacatgtt 23977937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 208
Target Start/End: Original strand, 29869627 - 29869798
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  || | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29869627 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttgatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 29869726  T
Q  137 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
     |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29869727 ttaaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 29869798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 13620712 - 13620882
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13620712 aaggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 13620811  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  13620812 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtt 13620882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 16814820 - 16814930
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  16814820 agagaagagcaagaggtttgaagggaagctttagcaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 16814919  T
Q  111 agggggttagt 121  Q
    || ||||||||    
T  16814920 agagggttagt 16814930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29666208 - 29666041
Alignment:
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 206  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||  || ||||||||||||||    
T  29666208 taagtgggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctct 29666109  T
Q  207 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29666108 agctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 29666041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 35009451 - 35009536
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35009451 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 35009536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15862720 - 15862637
Alignment:
Q  192 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15862720 ctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttc 15862637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 1657760 - 1657845
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1657760 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttc 1657845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23153696 - 23153613
Alignment:
Q  192 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23153696 ctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 23153613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27751675 - 27751603
Alignment:
Q  191 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 263  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751675 gctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4991470 - 4991396
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaagga-taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||||| ||||||||| ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4991470 taggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19854402 - 19854320
Alignment:
Q  194 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| |||||||    
T  19854402 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttc 19854320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 13910846 - 13911109
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  13910846 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 13910945  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13910946 gggggttattgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttg 13911045  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13911046 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 13911109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10989841 - 10989576
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggtt-gaagggaagctttaggaatcaagtg-ggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10989841 agagaagatcaagagtgttagaaggggagcttgaggaatcaagtgaggtgacataggagcttaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggt 10989742  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 209  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989741 atgggggttagtgattatcataatcatgtataattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgc 10989642  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989641 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttc 10989576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 16478785 - 16479047
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16478785 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggta 16478884  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  16478885 agggggttagtgattatcataatcattt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctcttact 16478982  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16478983 gcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 16479047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2437889 - 2437624
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  2437889 agagaagaacaggagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 2437790  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  2437789 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgt 2437690  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2437689 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttc 2437624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13573079 - 13572844
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13573079 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 13572980  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13572979 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 13572881  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||| |  |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13572880 gatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtt 13572844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7823161 - 7822896
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7823161 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 7823062  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  7823061 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 7822962  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  7822961 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 7822896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7830472 - 7830207
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7830472 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 7830373  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  7830372 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 7830273  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  7830272 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 7830207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27176866 - 27176601
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27176866 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27176767  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  27176766 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27176667  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27176666 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27176601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 27101460 - 27101725
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27101460 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27101559  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  27101560 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27101659  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27101660 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27101725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 27108808 - 27109073
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27108808 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27108907  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  27108908 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27109007  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27109008 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27109073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 38783552 - 38783817
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  38783552 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 38783651  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  38783652 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 38783751  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  38783752 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 38783817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 18979872 - 18980109
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18979872 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 18979971  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  18979972 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 18980071  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18980072 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18980109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15927973 - 15927736
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927973 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15927874  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15927873 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15927774  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15927773 tgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtt 15927736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 15950613 - 15950879
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||||||||    
T  15950613 agagaagaacaagggttttgaaggaaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttcaaagg 15950712  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15950713 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 15950812  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15950813 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15950879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 18253761 - 18253932
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  18253761 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 18253860  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18253861 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 18253932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13758750 - 13758538
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13758750 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13758651  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  13758650 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 13758551  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  13758550 gaaattacatgtt 13758538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 15760027 - 15760202
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15760027 cttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaatt 15760126  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  |  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  15760127 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15760202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 14250811 - 14250986
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  14250811 cttctaaggtaagggggttagttatcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaatt 14250910  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  14250911 cgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtt 14250986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15862257 - 15862174
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862257 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 48622584 - 48622755
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48622584 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgc 48622683  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||| |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  48622684 tcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttc 48622755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13321267 - 13321183
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13321267 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 13321183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 47481043 - 47481128
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47481043 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttc 47481128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16418835 - 16418731
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16418835 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 16418736  T
Q  204 tcttg 208  Q
    |||||    
T  16418735 tcttg 16418731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 11580751 - 11580836
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11580751 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 11580836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 13037026 - 13037111
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  13037026 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttc 13037111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 10000288 - 10000392
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  10000288 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaaattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgc 10000387  T
Q  204 tcttg 208  Q
    |||||    
T  10000388 tcttg 10000392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16212017 - 16211932
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  16212017 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttc 16211932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11516478 - 11516394
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11516478 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 11516394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 15441576 - 15441660
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15441576 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 15441660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 30262141 - 30262225
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30262141 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 30262225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7293267 - 7293183
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7293267 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 7293183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36052896 - 36052830
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36052896 ctgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttc 36052830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3060217 - 3060132
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||    
T  3060217 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttc 3060132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 25292350 - 25292434
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||| |||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25292350 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 25292434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 15516719 - 15516793
Alignment:
Q  62 ctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15516719 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaatgtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 295978 - 296062
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||| |||   || | |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  295978 tgctaaattcgtgttctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgtt 296062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36523 - 36264
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  36523 agagaagagcaagagggttgaaggaaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggtaa 36424  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  36423 gggggttaatgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtag 36324  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 271  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacat 36264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 169736 - 169951
Alignment:
Q  16 aagaacaagagggttgaagg-gaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagg 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  169736 aagaacaagagagttgaaggcgaagcttgaggaatcaagtggggtgacataagagctgaattgaagcaagggttagtgataatcatcttcaaaagtaagg 169835  T
Q  114 gggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169836 gggttagtgattatcataatcatgtataattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 169935  T
Q  214 atgttatgtttgtatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  169936 atgttatgtttgtatg 169951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 153920 - 154095
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  153920 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 154019  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||||| |||||||||    
T  154020 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtt 154095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 48849 - 48764
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48849 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 48764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 271
Target Start/End: Original strand, 31497 - 31756
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  31497 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaatgtaa 31596  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31597 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtgg 31696  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 271  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacat 31756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 128181 - 128266
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  128181 tgctaaattcgtgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 128266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30121153 - 30120889
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  30121153 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagtaagggttagagataatcatcttcaaaggtaa 30121054  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30121053 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 30120954  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30120953 gtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttc 30120889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24549410 - 24549148
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24549410 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttctaaggta 24549311  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24549310 agggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 24549213  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24549212 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 24549148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 6774082 - 6774343
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  6774082 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 6774180  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6774181 agggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 6774278  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6774279 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 6774343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 21844393 - 21844656
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg--aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21844393 agagaagaacaagagtgttggagggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctagaagctgaagtggagctaggattaaggataatcaacttcaacggt 21844492  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21844493 aagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 21844591  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21844592 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 21844656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 21851786 - 21852049
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg--aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21851786 agagaagaacaagagtgttggagggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctagaagctgaagtggagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 21851885  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21851886 aagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 21851984  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21851985 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtt 21852049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 275
Target Start/End: Original strand, 16674245 - 16674477
Alignment:
Q  41 tttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  || ||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  16674245 tttaggaatcaagtgggtgacttatgagctgaattgaagcaagagttgagt-taatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta- 16674342  T
Q  141 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgat 240  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  16674343 atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttat 16674442  T
Q  241 gttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16674443 gttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttc 16674477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 271183 - 271448
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  271183 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 271282  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  271283 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 271382  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  271383 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 271448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 644737 - 644472
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  644737 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 644638  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  644637 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 644538  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  644537 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 644472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 830472 - 830207
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  830472 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 830373  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  830372 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 830273  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  830272 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 830207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 15318982 - 15319188
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15318982 agagaagaacaagagtgttgaaggaaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 15319081  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  15319082 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 15319181  T
Q  209 ctgtgat 215  Q
    |||||||    
T  15319182 ctgtgat 15319188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 15499351 - 15499557
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15499351 agagaagaacaagagtgttgaaggaaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 15499450  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  15499451 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 15499550  T
Q  209 ctgtgat 215  Q
    |||||||    
T  15499551 ctgtgat 15499557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 22088617 - 22088882
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  22088617 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 22088716  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  22088717 aagggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22088816  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22088817 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtt 22088882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 22006171 - 22006346
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22006171 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 22006270  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22006271 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22006346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 13720804 - 13721016
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13720804 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13720903  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  13720904 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 13721003  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  13721004 gaaattacatgtt 13721016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16195581 - 16195399
Alignment:
Q  93 taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatg 191  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16195581 taatcatcttctaaggtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttg 16195482  T
Q  192 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16195481 ctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16195399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 16872927 - 16873139
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16872927 taggagctaaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 16873026  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  16873027 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 16873126  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  16873127 gaaattacatgtt 16873139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 13662141 - 13662353
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13662141 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13662240  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||  ||| |  | ||||  |||| |||    
T  13662241 gtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggt 13662340  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  13662341 gaaattacatgtt 13662353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 16404987 - 16405072
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16404987 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 16405072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17345816 - 17345735
Alignment:
Q  194 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17345816 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttc 17345735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 24928803 - 24928888
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24928803 tgctaaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 24928888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 275
Target Start/End: Original strand, 43373474 - 43373565
Alignment:
Q  184 aattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43373474 aattaatgctaaattcgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttc 43373565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 16193728 - 16193813
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16193728 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttc 16193813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5238338 - 5238254
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5238338 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 5238254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 22907226 - 22907310
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22907226 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 22907310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 24661260 - 24661344
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24661260 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 24661344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43685797 - 43685713
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43685797 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 43685713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10644648 - 10644386
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644648 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgatctaggagctgaagtgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggta 10644549  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10644548 agggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 10644451  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10644450 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttc 10644386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 100 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 47357994 - 47357821
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattc 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357994 cttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttcctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattc 47357897  T
Q  200 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357896 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 47357821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 15287096 - 15287333
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15287096 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15287195  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15287196 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15287295  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15287296 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15287333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18169403 - 18169138
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||| || |||| || |||||  |||||| ||    
T  18169403 agagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaa-gg 18169305  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18169304 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 18169205  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18169204 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18169138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 15294205 - 15294442
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294205 agctttaggaatgaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15294304  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15294305 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15294404  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15294405 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15294442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20001103 - 20000891
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  20001103 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 20001004  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  20001003 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggt 20000904  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  20000903 gaaattacatgtt 20000891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 7131978 - 7132153
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7131978 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 7132077  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  7132078 cgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 7132153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19020824 - 19020654
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19020824 aaggtaagggggttagttaccatcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 19020725  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19020724 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 19020654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 17145570 - 17145745
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  17145570 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaatt 17145669  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||  | | |||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17145670 cgtgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17145745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 208
Target Start/End: Original strand, 22351915 - 22352086
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22351915 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 22352014  T
Q  137 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
     |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  22352015 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttg 22352086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18248556 - 18248421
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttg-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18248556 aaggtaagggggttagttattatcataatcttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgc 18248457  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 239  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  18248456 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 18248421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8378480 - 8378377
Alignment:
Q  114 gggttagttattatcataatcatgtgtaattttg-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8378480 gggttagttattatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 8378381  T
Q  213 gatg 216  Q
    ||||    
T  8378380 gatg 8378377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26339399 - 26339253
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  26339399 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 26339300  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26339299 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 26339253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22738568 - 22738437
Alignment:
Q  143 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||     
T  22738568 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 22738469  T
Q  243 tagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22738468 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22738437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 15675101 - 15675186
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15675101 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 15675186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 10104262 - 10104347
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10104262 tgctaaatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 10104347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 54118256 - 54118341
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54118256 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 54118341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31115861 - 31115795
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31115861 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 31115795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 122140 - 122055
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  122140 tgctaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 122055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13246662 - 13246596
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13246662 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 13246596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14952183 - 14952085
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14952183 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10488813 - 10488729
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10488813 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 10488729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 16327938 - 16328022
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16327938 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 16328022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26680451 - 26680367
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26680451 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 26680367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9795564 - 9795490
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9795564 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaattttttcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 9795490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 274
Target Start/End: Original strand, 13048261 - 13048317
Alignment:
Q  218 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13048261 tatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 13048317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33240951 - 33240900
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33240951 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Original strand, 40885585 - 40885651
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  40885585 ctgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttc 40885651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14996476 - 14996444
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996476 aaggtaagggggttagttattatcataatcatg 14996444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8378524 - 8378491
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgt 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8378524 aaggtaaggggattagttattatcataatcatgt 8378491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Original strand, 13171 - 13410
Alignment:
Q  34 gggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataat 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13171 gggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggaactgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataat 13270  T
Q  134 catgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg 233  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13271 catgt--aatttttcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatg 13368  T
Q  234 aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13369 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 13410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 38 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 55316622 - 55316386
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  55316622 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaaaggggttagttattatcacaatcatg 55316523  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316522 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 55316424  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55316423 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttc 55316386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 38 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41270478 - 41270242
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41270478 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 41270379  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270378 ta-atttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 41270280  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41270279 gatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttc 41270242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49232869 - 49232604
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  49232869 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctatgagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 49232770  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  49232769 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 49232670  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  49232669 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 49232604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 12264614 - 12264880
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt--gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||| | | ||  |  |||||| |||||||||    
T  12264614 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttggggtgacctaggagctgaattgaagcaaaggttgggattaatcatcttcaaagg 12264713  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12264714 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 12264813  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12264814 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12264880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 1467562 - 1467827
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  1467562 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 1467661  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  1467662 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 1467761  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  1467762 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 1467827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16821479 - 16821306
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |    
T  16821479 cttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatcc 16821382  T
Q  200 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16821381 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 16821306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15615168 - 15615000
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15615168 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgct 15615071  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15615070 cttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttc 15615000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12812274 - 12812042
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  12812274 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaactttaaaggt 12812175  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  12812174 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 12812075  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    |||| ||| ||| ||  | ||| ||||||||||    
T  12812074 ctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatg 12812042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22275642 - 22275377
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||| |   |||||| |||||| |||||||||    
T  22275642 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaaaagttaaggttaatcatcttcaaagg 22275544  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22275543 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 22275444  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||  || ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22275443 gctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22275377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 15468216 - 15468428
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  15468216 taggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgtt 15468315  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  15468316 gtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 15468415  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  15468416 gaaattacatgtt 15468428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25059119 - 25058907
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  25059119 taggagctgaattgaagcaaaaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgtt 25059020  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  25059019 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 25058920  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  25058919 gaaattacatgtt 25058907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 15936553 - 15936724
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15936553 aaggtatgggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 15936652  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15936653 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 15936724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18911373 - 18911161
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  18911373 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 18911274  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  18911273 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 18911174  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  18911173 gaaattacatgtt 18911161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 12902008 - 12902178
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  12902008 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgc 12902107  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12902108 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12902178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 15938395 - 15938566
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  15938395 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgc 15938494  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||   |||| ||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15938495 tccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 15938566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Original strand, 18896920 - 18897099
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||    
T  18896920 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttccaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgtt 18897019  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  18897020 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 18897099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5228655 - 5228481
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  5228655 cttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtgttatgaaaatgggttgatgaac-attgttgctaaatt 5228557  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  5228556 cgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 5228481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 54651795 - 54651625
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  54651795 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 54651696  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  54651695 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgtt 54651625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 15859036 - 15859121
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15859036 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 15859121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 51158030 - 51158115
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51158030 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 51158115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 14842446 - 14842658
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctca--tgt 160  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||| || |||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | | | ||||||  ||||||  |||    
T  14842446 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatct-tcactttgcaaattctcaaatgt 14842544  T
Q  161 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttgg 260  Q
    ||||||||  || | | ||| | ||||  ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  14842545 tgtatgaat-tgtgattatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttgg 14842643  T
Q  261 tgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||| |||||||    
T  14842644 tgaaattgcatgttc 14842658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 12030159 - 12030244
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12030159 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 12030244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13839145 - 13839060
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13839145 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttc 13839060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44229323 - 44229153
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  ||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  44229323 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaattttttcatttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgc 44229224  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| | ||||||||||||||    
T  44229223 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtt 44229153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 17912495 - 17912578
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17912495 tgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 17912578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2050061 - 2049976
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2050061 tgctaaattcgtgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 2049976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 2449250 - 2449334
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2449250 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 2449334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 8268609 - 8268683
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268609 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8268683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 8275709 - 8275783
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8275709 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8275783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 274
Target Start/End: Original strand, 11986181 - 11986262
Alignment:
Q  193 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||| || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11986181 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 13954902 - 13954985
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13954902 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtt 13954985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 13975734 - 13975817
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13975734 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtt 13975817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 45861056 - 45860973
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  45861056 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtt 45860973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 271
Target Start/End: Original strand, 16744130 - 16744208
Alignment:
Q  193 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 271  Q
    |||||||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  16744130 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacat 16744208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41661812 - 41661730
Alignment:
Q  194 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcat-gaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||| ||  |||||||||||||| |||||||    
T  41661812 aaattcgtgctcttgctatgatgatatgtttgaatacatggaaatgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttc 41661730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 38 - 275
Target Start/End: Original strand, 1153 - 1389
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1153 agctttaggaatcaagttggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaggggggttagttattatcacaatcatg 1252  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1253 ta-atttttgcatttactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 1351  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1352 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttc 1389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43427 - 43164
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43427 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgatctaggagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 43328  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 209  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  43327 agggggttagttactatcacaaacatgt--aattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 43230  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43229 tgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 43164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39536 - 39271
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  39536 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 39437  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  39436 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 39337  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  39336 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 39271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 38 - 275
Target Start/End: Original strand, 5072237 - 5072473
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5072237 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaagattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 5072336  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5072337 ta-atttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaatt 5072435  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5072436 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttc 5072473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 18059581 - 18059846
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  18059581 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 18059680  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  18059681 aagggggttagttattatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 18059780  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  18059781 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 18059846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17149001 - 17148735
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  17149001 agagaagaacaagagggttgaagggaaagcttgaggaatcaagtggggtgacataggagctgaattgaagcaagggttggggataatcaacttcaaaggt 17148902  T
Q  110 aaggggg-ttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  17148901 aaggggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctctt 17148802  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17148801 gttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17148735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22228185 - 22227975
Alignment:
Q  66 gagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgta 164  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22228185 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22228086  T
Q  165 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  22228085 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22227986  T
Q  265 attacatgttc 275  Q
    |||||||||||    
T  22227985 attacatgttc 22227975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22232882 - 22232672
Alignment:
Q  66 gagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgta 164  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22232882 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22232783  T
Q  165 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  22232782 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22232683  T
Q  265 attacatgttc 275  Q
    |||||||||||    
T  22232682 attacatgttc 22232672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17005071 - 17004806
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  17005071 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 17004972  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  17004971 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 17004872  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  17004871 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 17004806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2116589 - 2116421
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 204  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2116589 aaggtaaaggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgct 2116492  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2116491 tttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 2116421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 45051757 - 45051589
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  45051757 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtg--attttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgtt 45051660  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45051659 cttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 45051589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 275
Target Start/End: Original strand, 18601071 - 18601203
Alignment:
Q  143 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601071 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 18601170  T
Q  243 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601171 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttc 18601203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 38054914 - 38055179
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  38054914 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 38055013  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||     
T  38055014 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctttta 38055113  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  38055114 ctgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 38055179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Original strand, 19962322 - 19962525
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19962322 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggattcaatttgggcgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 19962421  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  19962422 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 19962521  T
Q  209 ctgt 212  Q
    ||||    
T  19962522 ctgt 19962525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 46523731 - 46523557
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattc 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  46523731 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattc 46523632  T
Q  200 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||  |  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  46523631 gtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtt 46523557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 208
Target Start/End: Original strand, 7640810 - 7640956
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  7640810 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 7640909  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7640910 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 7640956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22035827 - 22035681
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||    
T  22035827 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgtt 22035728  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22035727 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 22035681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20445930 - 20445845
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20445930 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 20445845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20913281 - 20913196
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20913281 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 20913196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20931596 - 20931511
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20931596 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 20931511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20531695 - 20531610
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||    ||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20531695 tgctaaattcgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 20531610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 20893638 - 20893723
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20893638 tgctaaattcttgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttc 20893723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 37844462 - 37844547
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37844462 tgctaaattcatgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 37844547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41394473 - 41394388
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41394473 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttc 41394388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 51452743 - 51452659
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  51452743 tgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 51452659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 15861284 - 15861358
Alignment:
Q  62 ctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15861284 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 20936 - 21201
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||| ||| ||| |  |||||| ||||||||||    
T  20936 agagaagaacaagagttttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggt 21035  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21036 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgt 21135  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21136 tgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttc 21201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 13882 - 14145
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||| ||| ||| |  |||||| ||||||||||    
T  13882 agagaagaacaagagttttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggt 13981  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13982 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaa-tcgtgctcttgc 14080  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||| |||||||||||||||    
T  14081 tgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgtt 14145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3341 - 3129
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttg 162  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3341 taggagctgaattgaagcaagagtttcggttaatcttcttctaaggtaagggggttaattattatcataattatgtacaattttgcattttctcatgttg 3242  T
Q  163 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  3241 tatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtg 3142  T
Q  263 aaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||    
T  3141 aaattacatgttc 3129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29558 - 29388
Alignment:
Q  47 aatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  29558 aatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctt 29459  T
Q  146 tgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  29458 tgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatg 29388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 29627 - 29568
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagct 70  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29627 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagct 29568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 9266 - 9434
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9266 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 9363  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9364 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 9434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 16164 - 16332
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16164 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 16261  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16262 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 16332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31742 - 31477
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  31742 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 31643  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  31642 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 31543  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  31542 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 31477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 153 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39814
Alignment:
Q  153 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtata 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  253 attgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgtt 39814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4102 - 3889
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  4102 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttctaaggtaaggggtttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 4003  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  4002 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 3903  T
Q  262 gaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  3902 gaaattacatgttc 3889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 64372 - 64612
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  64372 agcttaaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 64471  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatga--- 234  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       
T  64472 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaatt 64570  T
Q  235 --attgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
      ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  64571 atattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 64612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 108084 - 107913
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  108084 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 107985  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107984 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 107913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 5088 - 5301
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||    
T  5088 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggagttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgtt 5187  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  5188 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 5287  T
Q  262 gaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  5288 gaaattacatgttc 5301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 374 - 203
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattc 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  374 cttctaaggtaagggggttagttattatcaaaatcatgt--aattttgcattg-ctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattc 278  T
Q  200 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  277 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 216
Target Start/End: Original strand, 10624 - 10778
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10624 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 10723  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10724 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 1451 - 1663
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1451 taggagctgaattgaagcaagggtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 1550  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  1551 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1650  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  1651 gaaattacatgtt 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Original strand, 7278 - 7509
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||| || |||| || |||||  |||||||||    
T  7278 agagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaagg 7377  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  7378 taagggggttagttattatcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctctt 7477  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 239  Q
    | ||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  7478 gttgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 7509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2826 - 2560
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||    
T  2826 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagg 2728  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaa--ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  2727 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctct 2628  T
Q  207 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||| |||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  2627 tgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 1390 - 1602
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  || ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1390 taggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 1489  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  1490 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggt 1589  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  1590 gaaattacatgtt 1602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7002 - 6831
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7002 agctttacgaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 6903  T
Q  137 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
     |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6902 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 10257 - 10427
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  10257 aaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 10356  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10357 tcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 23600 - 23769
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23600 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggaactgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagttaagggggttagttattatcatattcaat 23699  T
Q  137 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 206  Q
     |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  23700 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctct 23769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 45369 - 45198
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtg 202  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  45369 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 45270  T
Q  203 ctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | |||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45269 cccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 54755 - 54584
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtg 202  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  54755 aaggtaaggtggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 54656  T
Q  203 ctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
      |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  54655 tccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtt 54584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 54212 - 54041
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54212 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgc 54113  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||| |||||||| | | ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  54112 tcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttc 54041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 34374 - 34557
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattcatg 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | ||||  ||    
T  34374 aaggtaagagggttagttattatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaatgaatggataattattg 34473  T
Q  192 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34474 ctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 34557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3712 - 3580
Alignment:
Q  143 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | ||  | | ||||||||||||     
T  3712 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatga 3613  T
Q  243 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |  | |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3612 ttatggtatgattgtgggtgaaattacatgttc 3580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 131006 - 130880
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  131006 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggcataatcatcttcaaaggt 130907  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||    
T  130906 aagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 89466 - 89551
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  89466 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 89551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 34034 - 34246
Alignment:
Q  63 taggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcat-gt 160  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||    
T  34034 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgt 34133  T
Q  161 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttgg 260  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||    
T  34134 tgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 34232  T
Q  261 tgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||    
T  34233 tgaaattacatgtt 34246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 247454 - 247539
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  247454 tgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttc 247539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41896 - 41814
Alignment:
Q  193 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41896 taaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 41814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13855 - 13672
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttg----------atgaacaattcatg 191  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| || || ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||          ||| | ||||  ||    
T  13855 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgtttatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttg 13756  T
Q  192 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13755 ctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 13672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 42709 - 42677
Alignment:
Q  104 aaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42709 aaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3447 - 3360
Alignment:
Q  184 aattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 271  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3447 aattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12449 - 12280
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcat-tttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |  ||||  ||| ||||||||| |  | | ||| | ||||  ||||||||||||||    
T  12449 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatct-taattttgtaactttcaaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtgc 12351  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12350 tctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtt 12280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 546 - 631
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  546 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 12045 - 12149
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12045 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaatttttcattt-ctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtg 12143  T
Q  203 ctcttg 208  Q
    ||||||    
T  12144 ctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6161
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6076 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 6161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 3594 - 3679
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3594 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 3679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1375 - 1290
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1375 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 1290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 968 - 1053
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  968 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 8192 - 8277
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8192 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttc 8277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 26427 - 26512
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  26427 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttc 26512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9100 - 9015
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9100 tgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 9015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 148953 - 148887
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  148953 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 148887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7547 - 7443
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7547 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 7448  T
Q  204 tcttg 208  Q
    |||||    
T  7447 tcttg 7443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19457 - 19372
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19457 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 19372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21541 - 21456
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21541 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 21456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 48438 - 48353
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48438 tgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 48353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 123176 - 123261
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  123176 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 123261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5780 - 5696
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5780 tgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 5696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9129 - 9044
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9129 tgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 9044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 51194 - 51279
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  51194 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 51279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Original strand, 13268 - 13342
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13268 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 13342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Original strand, 154282 - 154373
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  154282 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatca 154373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41980 - 41898
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg 272  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||    
T  41980 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatg 41898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 275
Target Start/End: Original strand, 36928 - 37010
Alignment:
Q  193 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  36928 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttc 37010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 172156 - 172071
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  172156 tgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttc 172071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 177859 - 177774
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  177859 tgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttc 177774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22791 - 22707
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22791 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 22707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27046 - 26962
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27046 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 26962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 1594 - 1678
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1594 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 1678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 37078 - 37162
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  37078 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 37162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 17115 - 17241
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctaaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||| | |||| |||||    
T  17115 agagaagcacaggagtgttgaaaggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataataatcttctaaggt 17214  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||    
T  17215 aagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 5073 - 5158
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||| |||   |||||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  5073 tgctaaattcgtactccaactgtgacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttc 5158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 274
Target Start/End: Original strand, 56114 - 56195
Alignment:
Q  193 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  56114 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgtt 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 272257 - 272191
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  272257 ctgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttc 272191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 274
Target Start/End: Original strand, 1 - 84
Alignment:
Q  191 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  1 gctaaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 84  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8175
Alignment:
Q  194 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||||| || |||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttc 8175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5758 times since January 2019
Visitors: 4859