View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0755_low_123 (Length: 266)

Name: NF0755_low_123
Description: NF0755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0755_low_123
NF0755_low_123
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (36-266)||(10417-10647)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (35-266)||(129919-130150)
scaffold0010 (40-207)||(60649-60818)
[»] chr3 (106 HSPs)
chr3 (25-266)||(16097332-16097573)
chr3 (25-266)||(16103784-16104024)
chr3 (25-252)||(12174152-12174376)
chr3 (21-264)||(15470927-15471166)
chr3 (21-266)||(13210205-13210448)
chr3 (35-266)||(32307691-32307912)
chr3 (21-199)||(14234487-14234665)
chr3 (25-266)||(9512924-9513152)
chr3 (25-266)||(9520899-9521127)
chr3 (25-266)||(49667961-49668193)
chr3 (35-266)||(1644560-1644780)
chr3 (40-258)||(37251051-37251270)
chr3 (133-266)||(49389506-49389639)
chr3 (24-202)||(27165250-27165429)
chr3 (40-203)||(52523665-52523831)
chr3 (21-207)||(24340657-24340844)
chr3 (24-199)||(53301492-53301669)
chr3 (39-207)||(23274705-23274874)
chr3 (40-258)||(22110235-22110454)
chr3 (21-207)||(37642199-37642386)
chr3 (21-140)||(18438534-18438653)
chr3 (21-147)||(12399209-12399335)
chr3 (21-202)||(14972854-14973036)
chr3 (24-147)||(24153204-24153326)
chr3 (24-147)||(36166598-36166719)
chr3 (186-266)||(12934188-12934268)
chr3 (21-147)||(13442274-13442400)
chr3 (21-119)||(11424783-11424880)
chr3 (40-175)||(43925977-43926114)
chr3 (39-147)||(42386428-42386536)
chr3 (21-208)||(43550457-43550644)
chr3 (24-202)||(9707592-9707769)
chr3 (24-202)||(17463178-17463355)
chr3 (21-140)||(20698437-20698556)
chr3 (24-182)||(29172587-29172745)
chr3 (24-202)||(34159326-34159503)
chr3 (24-202)||(45606892-45607069)
chr3 (24-202)||(55476491-55476668)
chr3 (21-147)||(17487856-17487982)
chr3 (21-147)||(17499338-17499464)
chr3 (21-199)||(22147467-22147646)
chr3 (21-147)||(23083356-23083482)
chr3 (24-208)||(8899094-8899277)
chr3 (26-202)||(16282796-16282971)
chr3 (24-86)||(28194693-28194755)
chr3 (23-202)||(13544024-13544202)
chr3 (24-202)||(6469119-6469296)
chr3 (24-202)||(7781332-7781509)
chr3 (28-202)||(12567564-12567737)
chr3 (24-202)||(16454266-16454443)
chr3 (24-202)||(28848596-28848773)
chr3 (24-202)||(38961876-38962053)
chr3 (24-143)||(40213720-40213838)
chr3 (24-147)||(21618449-21618570)
chr3 (21-143)||(25476384-25476506)
chr3 (21-147)||(26686887-26687013)
chr3 (24-202)||(13151775-13151953)
chr3 (24-202)||(13154240-13154418)
chr3 (83-203)||(2051137-2051260)
chr3 (24-202)||(10247708-10247885)
chr3 (35-147)||(14572603-14572714)
chr3 (24-143)||(17672626-17672744)
chr3 (24-138)||(55500942-55501055)
chr3 (24-208)||(50242822-50243005)
chr3 (26-202)||(41123892-41124064)
chr3 (24-143)||(15977515-15977633)
chr3 (24-202)||(17446640-17446816)
chr3 (24-83)||(17737236-17737294)
chr3 (21-147)||(43840932-43841058)
chr3 (40-143)||(606324-606428)
chr3 (24-74)||(8499518-8499568)
chr3 (24-74)||(10556985-10557035)
chr3 (24-74)||(15412429-15412479)
chr3 (24-74)||(45577950-45578000)
chr3 (24-143)||(12119768-12119887)
chr3 (35-147)||(14576828-14576939)
chr3 (24-74)||(44494809-44494859)
chr3 (40-207)||(53070633-53070799)
chr3 (40-137)||(12377940-12378039)
chr3 (179-258)||(43927291-43927370)
chr3 (97-207)||(19775998-19776107)
chr3 (97-207)||(37439403-37439512)
chr3 (122-207)||(23413186-23413271)
chr3 (23-74)||(46822267-46822318)
chr3 (133-199)||(1465354-1465419)
chr3 (97-207)||(4107164-4107273)
chr3 (97-207)||(4111016-4111125)
chr3 (97-207)||(8489232-8489341)
chr3 (97-207)||(15965202-15965311)
chr3 (97-207)||(15969126-15969235)
chr3 (97-207)||(15973050-15973159)
chr3 (97-207)||(16749761-16749870)
chr3 (23-74)||(12511059-12511110)
chr3 (97-172)||(16750390-16750464)
chr3 (25-90)||(856140-856204)
chr3 (97-207)||(12852300-12852413)
chr3 (25-90)||(23077530-23077594)
chr3 (22-74)||(14665398-14665450)
chr3 (22-74)||(14668554-14668606)
chr3 (97-192)||(45797242-45797337)
chr3 (97-172)||(16749994-16750068)
chr3 (42-92)||(13919350-13919399)
chr3 (25-74)||(15878119-15878168)
chr3 (97-192)||(14501198-14501293)
chr3 (25-73)||(26196500-26196548)
chr3 (22-74)||(30029841-30029893)
[»] chr1 (64 HSPs)
chr1 (21-266)||(33681010-33681252)
chr1 (21-266)||(22237630-22237873)
chr1 (36-266)||(52927858-52928076)
chr1 (25-266)||(20248283-20248520)
chr1 (25-266)||(22921745-22921986)
chr1 (35-265)||(21754059-21754279)
chr1 (37-266)||(20918620-20918846)
chr1 (40-266)||(21861445-21861672)
chr1 (40-258)||(21896142-21896358)
chr1 (21-202)||(14295495-14295672)
chr1 (40-258)||(16368170-16368388)
chr1 (40-207)||(35261015-35261180)
chr1 (36-209)||(16758664-16758839)
chr1 (40-258)||(50613999-50614219)
chr1 (40-258)||(50621827-50622047)
chr1 (40-258)||(50686630-50686850)
chr1 (40-244)||(41049933-41050138)
chr1 (24-207)||(433012-433193)
chr1 (22-143)||(50210212-50210333)
chr1 (74-208)||(22130844-22130975)
chr1 (24-202)||(23593719-23593897)
chr1 (24-140)||(34509783-34509899)
chr1 (21-192)||(45574836-45575008)
chr1 (24-202)||(13988866-13989043)
chr1 (24-202)||(21923276-21923453)
chr1 (25-136)||(21161720-21161830)
chr1 (21-147)||(27250724-27250850)
chr1 (23-143)||(21840766-21840885)
chr1 (24-202)||(21475072-21475249)
chr1 (24-202)||(29776688-29776865)
chr1 (24-202)||(31612313-31612490)
chr1 (40-199)||(16093826-16093987)
chr1 (22-202)||(16361915-16362095)
chr1 (24-192)||(29298137-29298304)
chr1 (22-90)||(20454606-20454673)
chr1 (21-92)||(20847205-20847275)
chr1 (21-147)||(22532269-22532395)
chr1 (21-74)||(13212974-13213027)
chr1 (18-74)||(21342090-21342146)
chr1 (24-202)||(22123052-22123230)
chr1 (21-97)||(38801433-38801508)
chr1 (21-147)||(21026680-21026806)
chr1 (89-202)||(51130632-51130741)
chr1 (24-74)||(21346961-21347011)
chr1 (24-74)||(21707167-21707217)
chr1 (24-74)||(21711709-21711759)
chr1 (18-74)||(15860121-15860177)
chr1 (42-190)||(26064959-26065108)
chr1 (106-266)||(12271639-12271792)
chr1 (22-90)||(22468749-22468816)
chr1 (97-207)||(1924896-1925005)
chr1 (24-74)||(16275476-16275526)
chr1 (97-207)||(20923910-20924019)
chr1 (25-74)||(21714546-21714595)
chr1 (128-264)||(20636956-20637091)
chr1 (97-207)||(41387815-41387924)
chr1 (22-74)||(20135188-20135240)
chr1 (133-264)||(35981566-35981696)
chr1 (133-199)||(49261452-49261517)
chr1 (22-74)||(24783160-24783212)
chr1 (27-74)||(40389157-40389204)
chr1 (97-172)||(41388048-41388122)
chr1 (107-172)||(39243943-39244008)
chr1 (107-172)||(39247498-39247563)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (25-266)||(21565546-21565787)
chr5 (21-266)||(19668898-19669142)
chr5 (25-266)||(22959411-22959649)
chr5 (21-266)||(21329373-21329618)
chr5 (21-256)||(21502041-21502277)
chr5 (21-266)||(19660714-19660956)
chr5 (21-264)||(26011913-26012154)
chr5 (40-266)||(20026816-20027043)
chr5 (40-258)||(22178103-22178323)
chr5 (40-207)||(22144068-22144236)
chr5 (21-122)||(36314577-36314678)
chr5 (21-207)||(40725853-40726040)
chr5 (24-147)||(22412187-22412309)
chr5 (21-147)||(24493569-24493694)
chr5 (21-154)||(8286829-8286964)
chr5 (21-147)||(21729059-21729185)
chr5 (21-147)||(21808384-21808510)
chr5 (21-147)||(23390491-23390617)
chr5 (21-147)||(13025311-13025436)
chr5 (21-147)||(13095495-13095620)
chr5 (21-129)||(21997547-21997655)
chr5 (24-202)||(264753-264930)
chr5 (24-202)||(20909012-20909189)
chr5 (24-202)||(29329934-29330111)
chr5 (24-202)||(39363384-39363561)
chr5 (21-202)||(1096467-1096649)
chr5 (21-143)||(9077952-9078074)
chr5 (21-147)||(25421532-25421658)
chr5 (24-203)||(11581183-11581361)
chr5 (24-140)||(24529223-24529339)
chr5 (24-182)||(10732944-10733102)
chr5 (24-202)||(42245350-42245527)
chr5 (24-192)||(36154777-36154942)
chr5 (24-202)||(29345980-29346157)
chr5 (74-209)||(29448055-29448192)
chr5 (21-145)||(25431395-25431518)
chr5 (24-207)||(20901988-20902172)
chr5 (21-147)||(22075018-22075145)
chr5 (24-202)||(29348453-29348630)
chr5 (24-202)||(29350926-29351103)
chr5 (24-131)||(39245136-39245242)
chr5 (24-207)||(2154593-2154776)
chr5 (24-83)||(20918052-20918110)
chr5 (24-74)||(38619434-38619484)
chr5 (25-74)||(23064512-23064561)
chr5 (24-72)||(10775790-10775838)
chr5 (27-192)||(18319027-18319193)
chr5 (24-202)||(32027393-32027570)
chr5 (21-92)||(21293020-21293090)
chr5 (97-207)||(21871507-21871616)
chr5 (97-207)||(21875787-21875896)
chr5 (24-74)||(31061068-31061118)
chr5 (40-93)||(37723922-37723975)
chr5 (97-207)||(10753594-10753703)
chr5 (24-74)||(20806854-20806904)
chr5 (97-207)||(22120131-22120240)
chr5 (25-74)||(26704075-26704124)
chr5 (25-74)||(26973808-26973857)
chr5 (133-189)||(21741486-21741541)
chr5 (23-74)||(17517269-17517320)
chr5 (27-74)||(24067110-24067157)
chr5 (37-91)||(26732884-26732937)
chr5 (31-119)||(18418590-18418677)
chr5 (121-193)||(24767287-24767359)
chr5 (40-251)||(15796438-15796651)
chr5 (88-147)||(20766115-20766174)
chr5 (40-91)||(26740697-26740747)
chr5 (143-202)||(36314670-36314728)
chr5 (25-90)||(21873254-21873318)
chr5 (25-90)||(22032323-22032387)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (25-266)||(45668-45909)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (35-266)||(6826-7054)
scaffold0556 (103-266)||(8097-8260)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (36-266)||(22550-22776)
scaffold0037 (24-208)||(82072-82255)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (25-266)||(1086-1327)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (25-266)||(160688-160928)
scaffold0001 (28-202)||(501088-501261)
scaffold0001 (24-74)||(85692-85742)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (25-266)||(133-373)
[»] chr6 (86 HSPs)
chr6 (25-266)||(19652199-19652438)
chr6 (21-266)||(28496350-28496592)
chr6 (21-266)||(29808761-29809003)
chr6 (21-266)||(1561303-1561546)
chr6 (21-266)||(20109140-20109386)
chr6 (21-264)||(23019408-23019649)
chr6 (36-264)||(19668386-19668615)
chr6 (21-122)||(27333238-27333339)
chr6 (21-122)||(27393978-27394079)
chr6 (36-189)||(9098466-9098620)
chr6 (36-207)||(25644335-25644508)
chr6 (21-207)||(8227445-8227632)
chr6 (35-136)||(4185827-4185928)
chr6 (24-208)||(22782227-22782410)
chr6 (40-258)||(23076749-23076969)
chr6 (21-143)||(29060540-29060662)
chr6 (35-136)||(4186381-4186482)
chr6 (40-258)||(35008167-35008387)
chr6 (21-266)||(22080615-22080846)
chr6 (21-147)||(16496244-16496370)
chr6 (21-147)||(17287791-17287917)
chr6 (22-143)||(18409826-18409947)
chr6 (21-143)||(19303540-19303661)
chr6 (21-127)||(20076700-20076805)
chr6 (22-202)||(30676695-30676874)
chr6 (24-202)||(2291165-2291342)
chr6 (24-202)||(12742317-12742494)
chr6 (24-202)||(18334577-18334754)
chr6 (24-202)||(19005046-19005223)
chr6 (24-202)||(19858904-19859081)
chr6 (24-202)||(24422547-24422724)
chr6 (24-202)||(33861794-33861971)
chr6 (24-202)||(33864278-33864455)
chr6 (21-143)||(25629354-25629476)
chr6 (24-202)||(1595549-1595726)
chr6 (24-202)||(8055029-8055206)
chr6 (24-202)||(26924625-26924802)
chr6 (21-147)||(20360955-20361081)
chr6 (21-143)||(20593773-20593895)
chr6 (24-129)||(25656629-25656733)
chr6 (24-208)||(25754809-25754992)
chr6 (24-208)||(20556873-20557054)
chr6 (21-140)||(16920634-16920751)
chr6 (21-140)||(20638285-20638404)
chr6 (21-140)||(35245586-35245703)
chr6 (21-83)||(25714417-25714478)
chr6 (22-202)||(34963371-34963550)
chr6 (24-202)||(1540896-1541073)
chr6 (76-136)||(4668217-4668277)
chr6 (76-136)||(4675064-4675124)
chr6 (25-136)||(31155403-31155514)
chr6 (27-192)||(16448520-16448686)
chr6 (21-89)||(22831503-22831571)
chr6 (24-143)||(25688502-25688620)
chr6 (24-83)||(3852121-3852179)
chr6 (21-147)||(22780222-22780348)
chr6 (40-207)||(18456735-18456901)
chr6 (73-209)||(18706356-18706493)
chr6 (97-207)||(22949375-22949484)
chr6 (97-207)||(22953331-22953440)
chr6 (97-207)||(23871819-23871928)
chr6 (97-207)||(23875775-23875884)
chr6 (97-207)||(27325370-27325479)
chr6 (40-84)||(11185524-11185568)
chr6 (40-236)||(18199321-18199519)
chr6 (40-236)||(18204096-18204294)
chr6 (23-74)||(19848063-19848114)
chr6 (97-207)||(16760525-16760634)
chr6 (40-176)||(18461895-18462031)
chr6 (163-244)||(28103796-28103877)
chr6 (40-236)||(18177577-18177775)
chr6 (102-210)||(18696569-18696676)
chr6 (42-119)||(33443068-33443146)
chr6 (40-83)||(18821904-18821946)
chr6 (23-74)||(23992429-23992480)
chr6 (121-207)||(16624583-16624669)
chr6 (97-207)||(31477577-31477686)
chr6 (18-62)||(19008799-19008843)
chr6 (107-172)||(16624371-16624436)
chr6 (25-74)||(18907111-18907160)
chr6 (25-74)||(19862978-19863027)
chr6 (25-74)||(19873120-19873169)
chr6 (25-90)||(21766695-21766759)
chr6 (128-193)||(21939488-21939553)
chr6 (213-266)||(27333161-27333214)
chr6 (213-266)||(27393901-27393954)
[»] chr4 (79 HSPs)
chr4 (25-266)||(8846360-8846617)
chr4 (25-266)||(12774011-12774242)
chr4 (40-266)||(13726-13953)
chr4 (21-252)||(39706179-39706409)
chr4 (36-266)||(43198428-43198661)
chr4 (36-257)||(12288094-12288316)
chr4 (21-266)||(15551817-15552058)
chr4 (59-266)||(16596686-16596890)
chr4 (36-207)||(52243128-52243302)
chr4 (40-258)||(53082035-53082254)
chr4 (40-258)||(46640339-46640558)
chr4 (21-147)||(7798774-7798900)
chr4 (24-199)||(44928866-44929042)
chr4 (24-143)||(16377522-16377639)
chr4 (24-208)||(18215253-18215436)
chr4 (21-140)||(7088877-7088996)
chr4 (24-147)||(14280316-14280438)
chr4 (24-202)||(44615288-44615465)
chr4 (24-147)||(54798749-54798872)
chr4 (21-147)||(6899891-6900016)
chr4 (21-147)||(16270231-16270356)
chr4 (21-146)||(52873363-52873488)
chr4 (24-202)||(15118337-15118514)
chr4 (24-202)||(44773072-44773249)
chr4 (24-202)||(52312510-52312687)
chr4 (21-147)||(12902757-12902883)
chr4 (24-192)||(12301-12469)
chr4 (21-147)||(16239965-16240090)
chr4 (22-143)||(19618216-19618336)
chr4 (18-197)||(19242693-19242872)
chr4 (24-202)||(1837494-1837671)
chr4 (21-147)||(7893703-7893829)
chr4 (21-147)||(44052829-44052955)
chr4 (24-192)||(50222333-50222501)
chr4 (21-98)||(3096293-3096369)
chr4 (23-147)||(22636437-22636561)
chr4 (24-202)||(3515007-3515184)
chr4 (21-93)||(17046487-17046559)
chr4 (24-202)||(18239404-18239581)
chr4 (24-147)||(8574864-8574985)
chr4 (26-143)||(14038653-14038770)
chr4 (24-208)||(51463847-51464030)
chr4 (28-202)||(15355309-15355483)
chr4 (28-147)||(23374354-23374473)
chr4 (24-83)||(7641286-7641344)
chr4 (24-83)||(12610950-12611008)
chr4 (24-83)||(23803369-23803427)
chr4 (24-74)||(44102214-44102264)
chr4 (97-207)||(630710-630819)
chr4 (21-138)||(14053306-14053422)
chr4 (97-207)||(3331961-3332070)
chr4 (40-90)||(6190481-6190531)
chr4 (97-207)||(14953897-14954006)
chr4 (22-143)||(14970751-14970871)
chr4 (97-207)||(25690137-25690246)
chr4 (97-193)||(13812759-13812854)
chr4 (97-207)||(10713083-10713192)
chr4 (97-207)||(10926853-10926962)
chr4 (133-199)||(15099461-15099526)
chr4 (133-199)||(15190428-15190493)
chr4 (97-207)||(15225308-15225417)
chr4 (97-202)||(12487941-12488045)
chr4 (23-90)||(22353835-22353901)
chr4 (97-207)||(15868645-15868754)
chr4 (21-74)||(15367690-15367743)
chr4 (21-74)||(15370018-15370071)
chr4 (21-74)||(15371202-15371255)
chr4 (21-74)||(15373483-15373536)
chr4 (21-74)||(15402703-15402756)
chr4 (103-207)||(15464865-15464970)
chr4 (21-74)||(16223532-16223585)
chr4 (97-192)||(32851450-32851545)
chr4 (204-255)||(14164732-14164783)
chr4 (97-172)||(15225114-15225188)
chr4 (163-207)||(15791916-15791960)
chr4 (121-193)||(20157240-20157312)
chr4 (22-74)||(20157527-20157579)
chr4 (40-72)||(21815699-21815731)
chr4 (121-193)||(22634163-22634235)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (21-264)||(6520368-6520610)
chr8 (21-266)||(5866153-5866395)
chr8 (21-266)||(21490995-21491237)
chr8 (21-260)||(38855134-38855372)
chr8 (25-266)||(26355576-26355815)
chr8 (21-266)||(17140916-17141158)
chr8 (40-264)||(20498581-20498806)
chr8 (25-266)||(21285601-21285842)
chr8 (21-266)||(23760717-23760962)
chr8 (40-258)||(37116366-37116586)
chr8 (21-266)||(21249384-21249626)
chr8 (21-266)||(21255222-21255464)
chr8 (35-266)||(21673718-21673948)
chr8 (36-257)||(983287-983512)
chr8 (40-258)||(17266876-17267096)
chr8 (39-207)||(13508019-13508188)
chr8 (39-207)||(13597551-13597720)
chr8 (40-258)||(24353039-24353261)
chr8 (21-195)||(17612056-17612231)
chr8 (21-147)||(16092337-16092463)
chr8 (21-147)||(22626736-22626861)
chr8 (22-202)||(28648983-28649164)
chr8 (40-209)||(17439438-17439609)
chr8 (21-147)||(22875065-22875190)
chr8 (24-202)||(14409429-14409606)
chr8 (21-147)||(7372778-7372904)
chr8 (21-147)||(20536208-20536334)
chr8 (21-140)||(31971257-31971375)
chr8 (18-131)||(6759255-6759368)
chr8 (24-202)||(1484402-1484579)
chr8 (24-202)||(5853277-5853454)
chr8 (24-202)||(20403227-20403404)
chr8 (24-202)||(22001753-22001930)
chr8 (21-147)||(18818404-18818530)
chr8 (21-147)||(21918995-21919121)
chr8 (21-147)||(21923923-21924049)
chr8 (21-131)||(23406379-23406489)
chr8 (102-256)||(22364744-22364897)
chr8 (21-98)||(18879276-18879352)
chr8 (24-207)||(41598188-41598370)
chr8 (28-202)||(16413301-16413474)
chr8 (24-202)||(20046180-20046357)
chr8 (21-140)||(21395984-21396101)
chr8 (21-140)||(21790477-21790594)
chr8 (21-140)||(16199647-16199765)
chr8 (24-147)||(26219717-26219838)
chr8 (24-202)||(4483281-4483457)
chr8 (24-202)||(15203216-15203393)
chr8 (21-140)||(21389454-21389571)
chr8 (21-140)||(21778780-21778897)
chr8 (24-147)||(26225288-26225409)
chr8 (24-202)||(4542358-4542535)
chr8 (24-83)||(19896265-19896323)
chr8 (21-92)||(45131047-45131117)
chr8 (97-207)||(21383887-21383996)
chr8 (18-74)||(19937118-19937174)
chr8 (28-74)||(45290807-45290853)
chr8 (97-207)||(18862412-18862521)
chr8 (97-207)||(21387307-21387416)
chr8 (97-207)||(21411180-21411289)
chr8 (97-207)||(21805672-21805781)
chr8 (97-207)||(21827781-21827890)
chr8 (24-74)||(25484380-25484430)
chr8 (40-93)||(19154936-19154989)
chr8 (40-207)||(19801362-19801527)
chr8 (22-90)||(23648554-23648621)
chr8 (23-74)||(18678170-18678221)
chr8 (24-192)||(14823774-14823941)
chr8 (22-143)||(26223917-26224037)
chr8 (37-74)||(15070571-15070608)
chr8 (23-74)||(32121734-32121785)
chr8 (102-159)||(40492834-40492891)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (36-266)||(8481-8714)
scaffold0621 (21-266)||(6535-6779)
[»] chr7 (87 HSPs)
chr7 (21-266)||(67745-67989)
chr7 (21-264)||(16219595-16219835)
chr7 (21-266)||(34200786-34201028)
chr7 (21-266)||(15754765-15755008)
chr7 (25-266)||(18005650-18005891)
chr7 (21-264)||(47831807-47832050)
chr7 (25-261)||(811012-811248)
chr7 (21-266)||(11995906-11996148)
chr7 (21-266)||(28505177-28505419)
chr7 (25-265)||(44014182-44014418)
chr7 (36-266)||(16056343-16056572)
chr7 (21-255)||(22072913-22073149)
chr7 (21-202)||(16495402-16495579)
chr7 (40-258)||(20220073-20220290)
chr7 (36-257)||(12901338-12901560)
chr7 (21-207)||(2280053-2280238)
chr7 (106-266)||(15116565-15116725)
chr7 (36-207)||(1867929-1868101)
chr7 (43-203)||(12255729-12255892)
chr7 (36-208)||(14044761-14044935)
chr7 (36-208)||(14354791-14354965)
chr7 (24-147)||(18456408-18456530)
chr7 (21-207)||(19486678-19486865)
chr7 (21-147)||(38227481-38227606)
chr7 (21-208)||(13647325-13647512)
chr7 (106-266)||(15113028-15113188)
chr7 (24-207)||(17061895-17062077)
chr7 (21-202)||(18430709-18430889)
chr7 (21-147)||(12698831-12698958)
chr7 (24-143)||(3564363-3564482)
chr7 (24-143)||(48273392-48273511)
chr7 (21-147)||(9509189-9509315)
chr7 (44-207)||(15008433-15008597)
chr7 (24-202)||(456321-456498)
chr7 (24-202)||(11972496-11972673)
chr7 (24-202)||(14949107-14949284)
chr7 (24-202)||(15376698-15376875)
chr7 (24-202)||(16232520-16232697)
chr7 (24-202)||(20385108-20385285)
chr7 (24-202)||(21189580-21189757)
chr7 (24-202)||(24702238-24702415)
chr7 (24-202)||(32125491-32125668)
chr7 (24-202)||(41522917-41523094)
chr7 (24-202)||(41525379-41525556)
chr7 (25-202)||(11393272-11393448)
chr7 (24-192)||(18640272-18640440)
chr7 (39-207)||(10063757-10063921)
chr7 (24-207)||(44116509-44116691)
chr7 (24-202)||(24704688-24704862)
chr7 (24-202)||(27216860-27217037)
chr7 (21-147)||(16386242-16386369)
chr7 (24-143)||(16410059-16410177)
chr7 (28-143)||(24275175-24275289)
chr7 (24-136)||(16213684-16213795)
chr7 (23-140)||(40443393-40443509)
chr7 (21-147)||(26211995-26212122)
chr7 (24-83)||(3386333-3386391)
chr7 (24-74)||(13869346-13869396)
chr7 (24-74)||(20110556-20110606)
chr7 (21-91)||(27847881-27847951)
chr7 (24-74)||(13831373-13831423)
chr7 (21-98)||(10589039-10589115)
chr7 (36-143)||(15144037-15144143)
chr7 (28-192)||(38898370-38898535)
chr7 (49-149)||(14036282-14036384)
chr7 (49-149)||(14346312-14346414)
chr7 (27-90)||(18154894-18154956)
chr7 (97-207)||(18426070-18426179)
chr7 (97-207)||(39267582-39267691)
chr7 (97-207)||(45169773-45169882)
chr7 (25-74)||(14932802-14932851)
chr7 (25-74)||(15356237-15356286)
chr7 (25-74)||(15360351-15360400)
chr7 (213-266)||(16324197-16324250)
chr7 (106-142)||(16324135-16324171)
chr7 (24-74)||(26356106-26356156)
chr7 (24-74)||(26358558-26358608)
chr7 (47-93)||(48991206-48991252)
chr7 (22-74)||(2832509-2832561)
chr7 (121-193)||(9751500-9751572)
chr7 (97-173)||(18425668-18425743)
chr7 (97-173)||(18425870-18425945)
chr7 (133-190)||(9389649-9389705)
chr7 (25-90)||(12187019-12187083)
chr7 (25-90)||(17138113-17138177)
chr7 (25-74)||(19649557-19649606)
chr7 (42-90)||(9177718-9177766)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (21-266)||(12766-13011)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (21-264)||(6001-6244)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (21-266)||(11292-11534)
scaffold0046 (21-260)||(1997-2233)
scaffold0046 (21-140)||(28414-28533)
scaffold0046 (21-77)||(4552-4608)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (25-266)||(19268-19509)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (36-266)||(10542-10772)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (24-266)||(15664-15903)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (21-260)||(6611-6850)
scaffold0333 (21-260)||(13991-14230)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (25-266)||(100378-100619)
scaffold0023 (25-266)||(40050-40291)
scaffold0023 (21-94)||(119875-119948)
scaffold0023 (24-202)||(94411-94588)
scaffold0023 (24-143)||(44454-44573)
scaffold0023 (28-202)||(17425-17598)
scaffold0023 (25-98)||(101503-101576)
scaffold0023 (25-74)||(38547-38596)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (25-266)||(25175854-25176095)
chr2 (25-187)||(7679589-7679750)
chr2 (26-266)||(28405981-28406222)
chr2 (22-266)||(22134093-22134326)
chr2 (21-229)||(23071865-23072070)
chr2 (40-257)||(7617-7835)
chr2 (36-257)||(18786787-18787009)
chr2 (21-207)||(23708553-23708738)
chr2 (40-258)||(23207296-23207515)
chr2 (21-203)||(19671830-19672011)
chr2 (40-262)||(23791292-23791516)
chr2 (24-202)||(22105412-22105590)
chr2 (106-266)||(22459437-22459598)
chr2 (40-258)||(25108906-25109126)
chr2 (24-147)||(298809-298933)
chr2 (21-147)||(23060513-23060639)
chr2 (40-207)||(20520127-20520295)
chr2 (24-202)||(18808943-18809120)
chr2 (24-202)||(23130862-23131039)
chr2 (24-202)||(23133329-23133506)
chr2 (24-202)||(23709517-23709694)
chr2 (24-202)||(23711998-23712175)
chr2 (24-202)||(26505379-26505556)
chr2 (24-202)||(26507857-26508034)
chr2 (24-202)||(34402507-34402684)
chr2 (24-202)||(39682313-39682490)
chr2 (21-147)||(22337115-22337241)
chr2 (21-147)||(23076442-23076568)
chr2 (21-147)||(23285865-23285987)
chr2 (21-147)||(23654381-23654507)
chr2 (21-119)||(38138-38235)
chr2 (40-207)||(22413070-22413240)
chr2 (24-202)||(571397-571574)
chr2 (24-202)||(6725995-6726172)
chr2 (21-140)||(20309108-20309225)
chr2 (24-202)||(23135590-23135767)
chr2 (24-202)||(24367774-24367951)
chr2 (24-202)||(28577099-28577276)
chr2 (21-147)||(22731229-22731355)
chr2 (21-143)||(23103396-23103516)
chr2 (21-147)||(23660023-23660148)
chr2 (24-208)||(32039477-32039660)
chr2 (22-202)||(32214906-32215085)
chr2 (27-202)||(21155045-21155219)
chr2 (24-202)||(24898180-24898358)
chr2 (24-202)||(24900663-24900841)
chr2 (24-202)||(24903140-24903318)
chr2 (24-202)||(24905617-24905795)
chr2 (24-202)||(24908092-24908270)
chr2 (21-98)||(8946657-8946733)
chr2 (21-85)||(23040247-23040310)
chr2 (40-209)||(24697538-24697709)
chr2 (26-192)||(43137301-43137467)
chr2 (21-147)||(22738175-22738300)
chr2 (24-74)||(38967374-38967424)
chr2 (24-74)||(45029966-45030016)
chr2 (27-83)||(24643054-24643109)
chr2 (24-74)||(24529641-24529691)
chr2 (40-197)||(23004767-23004926)
chr2 (97-207)||(1283657-1283766)
chr2 (97-207)||(30344758-30344867)
chr2 (40-90)||(32451981-32452031)
chr2 (42-92)||(23287384-23287433)
chr2 (28-74)||(25616192-25616238)
chr2 (42-91)||(26392403-26392451)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (25-266)||(32102-32336)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (40-266)||(53424-53651)
scaffold0075 (107-207)||(8230-8330)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (25-266)||(132662-132896)
scaffold0028 (39-266)||(62216-62440)
scaffold0028 (24-202)||(136680-136857)
scaffold0028 (24-202)||(139149-139326)
scaffold0028 (24-202)||(144087-144264)
scaffold0028 (24-202)||(134211-134388)
scaffold0028 (24-202)||(141618-141795)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (21-261)||(916-1155)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (21-260)||(12942-13178)
scaffold0138 (102-258)||(18121-18277)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (21-266)||(34123-34365)
scaffold0175 (21-74)||(273-326)
scaffold0175 (71-147)||(13141-13218)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (25-266)||(2521-2762)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (21-266)||(32538-32780)
scaffold0034 (40-90)||(51936-51985)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (35-266)||(5657-5887)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (40-266)||(12587-12813)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (25-266)||(14573-14814)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (40-258)||(128853-129072)
scaffold0022 (44-255)||(78345-78556)
scaffold0022 (24-147)||(116430-116551)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (21-159)||(15760-15898)
scaffold0020 (25-74)||(178898-178947)
scaffold0020 (213-260)||(15714-15761)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (25-266)||(2680-2923)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (42-266)||(7934-8161)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (36-266)||(7952-8180)
scaffold0218 (68-266)||(29156-29354)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (21-202)||(1013-1190)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (40-258)||(97024-97244)
scaffold0006 (40-258)||(106302-106522)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (24-202)||(38641-38820)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (40-258)||(6166-6386)
scaffold0420 (40-87)||(13793-13840)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (44-258)||(38339-38555)
scaffold0139 (25-74)||(19980-20029)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (79-266)||(2094-2281)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (21-202)||(3090-3271)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (40-258)||(19768-19987)
scaffold0080 (21-147)||(39913-40038)
scaffold0080 (97-207)||(48921-49030)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (40-257)||(136252-136471)
scaffold0021 (40-257)||(144960-145179)
scaffold0021 (22-93)||(174767-174838)
scaffold0021 (21-91)||(121766-121835)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (21-127)||(23898-24001)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (21-207)||(11464-11651)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (21-207)||(17961-18148)
scaffold0247 (24-74)||(2241-2291)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (21-207)||(38190-38377)
scaffold0124 (97-207)||(21828-21937)
scaffold0124 (97-207)||(24587-24699)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (36-207)||(27683-27855)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (40-147)||(1051-1158)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (90-266)||(2321-2494)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (36-190)||(25121-25276)
scaffold0123 (102-209)||(619-725)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (36-207)||(16034-16206)
scaffold0357 (40-207)||(13147-13316)
scaffold0357 (40-92)||(2680-2732)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (178-266)||(28687-28775)
scaffold0211 (25-105)||(28806-28887)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (23-147)||(39479-39602)
scaffold0141 (97-207)||(13854-13963)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (23-147)||(75210-75333)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (36-257)||(103523-103737)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (40-258)||(267679-267898)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (40-258)||(569-787)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (24-147)||(44702-44825)
scaffold0122 (28-143)||(26064-26179)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (71-258)||(54-243)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (22-143)||(3185-3306)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (22-143)||(17214-17337)
scaffold0056 (40-207)||(79264-79430)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (21-147)||(25896-26021)
scaffold0026 (21-147)||(39858-39983)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (40-258)||(1681-1900)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (178-266)||(2179-2267)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (21-147)||(13211-13337)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (21-147)||(1851-1977)
scaffold0016 (121-195)||(207467-207541)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (21-147)||(32942-33067)
scaffold0145 (21-147)||(38761-38886)
scaffold0145 (19-83)||(9744-9807)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (21-147)||(32952-33077)
scaffold0120 (21-147)||(45928-46053)
scaffold0120 (21-143)||(16113-16235)
scaffold0120 (21-83)||(17389-17450)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (21-140)||(4849-4968)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (24-202)||(20747-20924)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (24-202)||(37821-37998)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (21-140)||(1289-1406)
scaffold0106 (21-140)||(7266-7383)
scaffold0106 (24-90)||(15291-15356)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (24-202)||(158435-158612)
scaffold0003 (24-202)||(339889-340065)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (21-147)||(3470-3596)
scaffold0292 (21-147)||(343-468)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (21-147)||(51913-52039)
scaffold0011 (21-147)||(167973-168099)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (23-143)||(10772-10891)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (21-147)||(8528-8650)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (24-202)||(4694-4871)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (24-202)||(13392-13569)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (24-147)||(22886-23008)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (24-202)||(13947-14124)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (21-140)||(51582-51699)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (21-147)||(1043-1169)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (21-140)||(15466-15584)
scaffold0114 (25-90)||(7295-7359)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (21-140)||(32067-32184)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (21-147)||(6116-6245)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (21-138)||(16282-16397)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (24-192)||(16784-16952)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (21-93)||(10472-10544)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (21-140)||(13497-13615)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (21-143)||(16599-16721)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (39-147)||(24297-24406)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (40-193)||(20372-20524)
scaffold0031 (21-75)||(128751-128805)
scaffold0031 (97-207)||(35853-35962)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (24-140)||(5132-5246)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (23-143)||(9241-9360)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (21-98)||(4712-4788)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (21-140)||(8479-8598)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (21-140)||(1053-1170)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (21-159)||(1952-2091)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (76-136)||(9133-9193)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (24-208)||(12064-12241)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (24-202)||(40400-40577)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (21-147)||(4508-4633)
scaffold0228 (21-147)||(12090-12215)
scaffold0228 (21-147)||(22042-22167)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (24-192)||(161083-161252)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (24-208)||(106-289)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (21-91)||(46995-47065)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (22-143)||(11286-11406)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (79-207)||(225465-225593)
scaffold0012 (97-207)||(189144-189253)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (27-83)||(4300-4355)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (24-207)||(4214-4396)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (21-88)||(4888-4954)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (22-143)||(12293-12413)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (40-127)||(2694-2783)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (21-140)||(20910-21030)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (27-74)||(1393-1440)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (21-138)||(11447-11564)
scaffold0235 (97-192)||(13638-13733)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (25-74)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (25-74)||(36454-36503)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (24-83)||(29931-29990)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (97-207)||(627-736)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (107-193)||(6-92)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (97-207)||(11268-11377)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (97-202)||(32432-32536)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (163-251)||(165-252)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (40-83)||(11982-12024)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (42-97)||(4545-4599)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (25-74)||(29558-29607)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (121-193)||(12758-12830)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (121-193)||(9784-9856)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (103-202)||(27912-28012)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (25-75)||(289-339)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (42-92)||(206575-206624)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (25-90)||(1881-1945)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (25-74)||(159-208)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (25-90)||(10575-10639)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (25-74)||(21871-21920)
scaffold0210 (25-74)||(29763-29812)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (25-74)||(69794-69843)


Alignment Details
Target: scaffold0555 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 36 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10417
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10548  T
Q  136 catctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10547 catctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaaca 10448  T
Q  236 gtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10447 acaagataaacaacttagtttctaacctcta 10417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 35 - 266
Target Start/End: Original strand, 129919 - 130150
Alignment:
Q  35 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129919 atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 130018  T
Q  135 acatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaac 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130019 acatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaac 130118  T
Q  235 agtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  130119 agcaagataaacaacttagtttctaacctcta 130150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60649
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaaca 60720  T
Q  138 tctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||||| | ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  60719 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaatcat 60649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 106)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097573
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatcatataacaatatcgaatg 16097431  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097432 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 16097531  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16097532 gaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaatctcta 16097573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16104024
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 16103883  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16103884 caa-tcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcatatggattagtcttactg 16103982  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103983 gaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctcta 16104024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174152
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 12174277  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
    |||   | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12174276 caa---aacaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattgattcatatgcatcagtcttactg 12174180  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaactta 252  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12174179 gaacaacaacagcaagctaaacaactta 12174152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Original strand, 15470927 - 15471166
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470927 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 15471023  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |  ||||||   |||| |||    
T  15471024 aatgcaagtcatcaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcatataattcaggctt 15471122  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctc 264  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15471123 actgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctc 15471166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210205
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 13210349  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaaca-tcaattcatatgcatcagtct 219  Q
    |||||||   ||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||    
T  13210348 aatgcaa---atcaacaacttaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgaattcatatgcatcagcct 13210252  T
Q  220 tactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||||||||    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210251 tactggaatgttaacaacaagataaacaacttagtttctaacctcta 13210205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 266
Target Start/End: Original strand, 32307691 - 32307912
Alignment:
Q  35 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  32307691 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaaca 32307789  T
Q  135 acatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaac 234  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||    
T  32307790 acatctcaattatc-aacataatccatttaatgtatatac--------aacattataaacaacattaattcataagcatcagtcttactagaacaatgac 32307880  T
Q  235 agtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307881 agcaagataaacaacttagtttctaacctcta 32307912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234665
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 14234586  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  14234587 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacat 14234665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9513152
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 9513023  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
    ||    ||||||||||||  |||| |||||||| | | |||||||        |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9513024 ca----atcaacatctcatttatc-aacataatccatttaatgta--------tataaaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 9513110  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9513111 gaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctcta 9513152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9521127
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 9520998  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
    ||    ||||||||||||  |||| |||||||| | | ||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9520999 ca----atcaacatctcatttatc-aacataatccatttaatgtatat--aac------acattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 9521085  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9521086 gaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctcta 9521127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49667961
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 49668094  T
Q  125 caagtcatc-aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 223  Q
    ||| ||| | |||||||||  |||| |||||||| | | ||| ||||||||        | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49668093 caa-tcaacaaacatctcatttatc-aacataatccatttaaagtatatac--------agcattatatacaacatcaactcatatgcatcagtcttact 49668004  T
Q  224 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49668003 ggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctcta 49667961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1644780 - 1644560
Alignment:
Q  35 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 134  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  1644780 atcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatgcaaatcatcattatataacaatatcgaatacaa-tcaaca 1644683  T
Q  135 acatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaac 234  Q
    | ||||||| |||||| |||||| | | |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1644682 atatctcaattatcaa-cataatccatttaatgtatatacaac--------attataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataac 1644592  T
Q  235 agtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644591 aacaagataaacaacttagtttctaacctcta 1644560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251051
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37251171  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||  |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  37251170 tctcaac-atcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcagacttactggaacaacaacagt 37251072  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37251071 aagataaacaacttagtttct 37251051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 133 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 49389639 - 49389506
Alignment:
Q  133 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49389639 caacatctcaactatcaaacataattcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 49389540  T
Q  233 acagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49389539 acaacaagataaacaacttagtttctaacctcta 49389506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165429
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||    
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaacaacatgatataccaatatcaaat 27165349  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||   ||| ||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  27165350 gcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 27165429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523665
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaaca 52523732  T
Q  138 tctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaat 203  Q
    ||||||| | ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  52523731 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaat 52523665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340657
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaacatcatgatataataatatcg 24340745  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    || |||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24340744 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 24340657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301492
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 53301570  T
Q  124 gcaagtca-tcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 199  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||  ||| |   ||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  53301569 gcaagtcattcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattacgtatacaattatatcacaatataaacaacat 53301492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274874
Alignment:
Q  39 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 138  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 23274804  T
Q  139 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    |||||||| ||| | |||||||  |||| | |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||    
T  23274805 ctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaatcat 23274874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110235
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagca 22110355  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||  |||| | | ||||| |||||||  ||||||  ||||| ||||||| |||||| |||| |||||    |||| ||||||| ||||||||||||    
T  22110354 tctcaac-atcatatagaattcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcatacaattcaggcttactgaaacaacaacagt 22110256  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  22110255 aagataagcaacttagtttct 22110235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642199
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 37642287  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
     | | |||| | ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37642286 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 37642199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18438653
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||    
T  18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatc 18438632  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatct 140  Q
     ||||||||||| ||||||||    
T  18438633 aaatgcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399335
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 12399307  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  12399308 aaatgcaattcaacaacatcttaaatat 12399335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14973036
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14972952  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
     ||||||| ||| |||||||||| |||| ||  ||||||||  |||||| |||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  14972953 aaatgcaaatcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 14973036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153204
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggtagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 24153228  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  24153227 gcaagtcaacaacatcttaaatat 24153204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 147
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166719
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 36166695  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  36166696 gcaagtcaacaacatctcaaatat 36166719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12934268 - 12934188
Alignment:
Q  186 attataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12934268 attataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctcta 12934188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442400
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 13442372  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  13442373 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 13442400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424783
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataacaatatc 11424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 175
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926114
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 43926076  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatataca 175  Q
    ||||||| |||| | | ||||| ||||||| |||||||    
T  43926077 tctcaaacatcatatacaattcatgtaatgcatataca 43926114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 147
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386536
Alignment:
Q  39 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaaca 42386526  T
Q  138 tctcaaatat 147  Q
    ||||||||||    
T  42386527 tctcaaatat 42386536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550457
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||| |||| ||||||    
T  43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-tgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatc 43550546  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
     ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  43550545 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 43550457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707592
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 9707672  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    | ||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  9707671 tacaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 9707592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463355
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17463275  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  17463276 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 17463355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698437
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||  ||| ||||||    
T  20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatc 20698458  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatct 140  Q
     | ||||| ||||||||||||    
T  20698457 aattgcaattcatcaacatct 20698437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172587
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29172648  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatat 182  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  29172647 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29172587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159503
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34159423  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  34159424 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 34159503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606892
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 45606972  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  45606971 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 45606892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476668
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55476588  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  55476589 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 55476668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17487982
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17487954  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  17487955 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 17487982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499464
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17499436  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  17499437 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 17499464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147467
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 22147547  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 199  Q
     | | |||| | ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22147546 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23083356
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||  |||| |||| ||||||    
T  23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatc 23083384  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23083383 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 23083356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899277
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8899191  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  8899192 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 8899277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282796
Alignment:
Q  26 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||||| |||||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatg 16282874  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16282873 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 16282796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 86
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 202
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544202
Alignment:
Q  23 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 13544121  T
Q  122 atgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  13544122 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 13544202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469119
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6469199  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | ||||||   |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  6469198 tgcaagtcaacaacgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 6469119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781332
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 7781412  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  7781411 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 7781332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567737
Alignment:
Q  28 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 12567661  T
Q  127 agtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  12567662 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 12567737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454266
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16454346  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16454345 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 16454266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848596
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 28848676  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||    
T  28848675 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtat-aacaacatcaa 28848596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961876
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 38961956  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  38961955 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 38961876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213720
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| || || |||||||| |||| |||||| ||    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacatcaacaca-gcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaa 40213741  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  40213740 tgcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 147
Target Start/End: Original strand, 21618449 - 21618570
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21618449 tcatcttctcaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 21618546  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  21618547 gcaagtcaacaacatctcaaatat 21618570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476384
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaac-aacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 25476408  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
     ||||||||||| |||||||||||    
T  25476407 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687013
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 26686985  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  26686986 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 26687013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151775
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13151856  T
Q  122 atgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  13151855 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 13151775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154240
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13154321  T
Q  122 atgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  13154320 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 13154240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051137
Alignment:
Q  83 ataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaacta 179  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || || | |||||||  |||||| |||||||| ||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaatta 2051161  T
Q  180 tataacattataaacaacatcaat 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  2051160 tatcacattataaacaacatcaat 2051137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247708
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10247788  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  10247787 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 10247708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 147
Target Start/End: Original strand, 14572603 - 14572714
Alignment:
Q  35 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||  ||||| ||    
T  14572603 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaaca 14572701  T
Q  135 acatctcaaatat 147  Q
    |||||| ||||||    
T  14572702 acatcttaaatat 14572714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672744
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17672723  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||||| ||| |||| ||||||    
T  17672724 tgcaaatcaacaacgtctcaa 17672744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 138
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55501039  T
Q  123 tgcaagtcatcaacat 138  Q
    ||||||||| ||||||    
T  55501040 tgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50243005
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 50242919  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  50242920 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 50243005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 202
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124064
Alignment:
Q  26 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 41123986  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  41123987 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 41124064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977633
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 15977612  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  15977613 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446640
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17446720  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | || ||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  17446719 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 17446640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737294
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 17737294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841058
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 43841030  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  43841031 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 43841058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 606428 - 606324
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |   ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  606428 cttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcacataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattcaacaaca 606330  T
Q  138 tctcaa 143  Q
    ||||||    
T  606329 tctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499568
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 8499568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557035
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 10557035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412479
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15412479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577950
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45577950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119768
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12119790  T
Q  123 tgcaagtc-atcaacatctcaa 143  Q
    |||||||| |||||| ||||||    
T  12119789 tgcaagtcaatcaacgtctcaa 12119768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14576939 - 14576828
Alignment:
Q  35 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 134  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | | || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||    
T  14576939 atcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataac-aacagcaacatagacagtataaacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 14576841  T
Q  135 acatctcaaatat 147  Q
    |||||| ||||||    
T  14576840 acatcttaaatat 14576828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494859
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaa 44494859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070633
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||| || || || |||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 53070702  T
Q  139 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||| ||||    
T  53070701 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatct-aacaacatcaaatcat 53070633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 137
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378039
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 12378039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 258
Target Start/End: Original strand, 43927291 - 43927370
Alignment:
Q  179 atataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttct 258  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43927291 atatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttct 43927370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 19775998 - 19776107
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  19775998 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 19776096  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  19776097 catcaaatcat 19776107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37439512 - 37439403
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  37439512 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 37439414  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  37439413 catcaaatcat 37439403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23413271 - 23413186
Alignment:
Q  122 atgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  23413271 atgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatccatctatataacattataaatatcatcaaatcat 23413186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 74
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822318
Alignment:
Q  23 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 46822318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1465419 - 1465354
Alignment:
Q  133 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||    
T  1465419 caacatctcaaatatcaa-cataattcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacat 1465354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4107273 - 4107164
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  4107273 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 4107175  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  4107174 catcaaatcat 4107164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4111125 - 4111016
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  4111125 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 4111027  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  4111026 catcaaatcat 4111016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8489341 - 8489232
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  8489341 aatcatcat-atataacaattacaaatacacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaaatatataacattataaatat 8489243  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  8489242 catcaaatcat 8489232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 15965202 - 15965311
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  15965202 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 15965300  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  15965301 catcaaatcat 15965311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 15969126 - 15969235
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  15969126 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 15969224  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  15969225 catcaaatcat 15969235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 15973050 - 15973159
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  15973050 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 15973148  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  15973149 catcaaatcat 15973159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16749870 - 16749761
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  16749870 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatcttaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 16749772  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  16749771 catcaaatcat 16749761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 74
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511110
Alignment:
Q  23 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaa 12511110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16750464 - 16750390
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 172  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||    
T  16750464 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatgtatat 16750390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 90
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856204
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataac-aatagcaacataggcag 856204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12852413 - 12852300
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatata----caactatataacattataa 192  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||    ||| |||||||||||| ||    
T  12852413 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatatatccaattatataacattaaaa 12852315  T
Q  193 acaacatcaattcat 207  Q
    | | |||||| ||||    
T  12852314 aaatcatcaaatcat 12852300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077530
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataac-aacagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665450
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14665450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668606
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14668606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Original strand, 45797242 - 45797337
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataa-ttcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  45797242 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaactatataacattataa 45797337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16750068 - 16749994
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 172  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  16750068 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 16749994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 92
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 92  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878119
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 15878119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Original strand, 14501198 - 14501293
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataa-ttcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| || ||  ||||| ||| |||||||||||||||    
T  14501198 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaattatataacattataa 14501293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26196548 - 26196500
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 73  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  26196548 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataaca 26196500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Original strand, 30029841 - 30029893
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30029841 catcaacatctcattcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaa 30029893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 64)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 33681010 - 33681252
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681010 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 33681106  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681107 aatgcaagtcgtcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 33681206  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681207 actagaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctcta 33681252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 22237630 - 22237873
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237630 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 22237726  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22237727 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacatcaattcatatgtatcagtctc 22237826  T
Q  221 actggaacaacaa-cagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237827 gctggaacaacaatcagcaagataaacaacttagtttctaacctcta 22237873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52927858
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat------------ 52927989  T
Q  136 catctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52927988 catctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaata 52927889  T
Q  236 gtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52927888 gcaagataaacaacttagtttctaacctcta 52927858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248520
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 20248382  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
    |||   ||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20248383 caa---atcaacaacttaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacatggattcatatgcatcagtcttactg 20248479  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    | |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20248480 g-acaacaacatcaagataaataacttagtttctaacctcta 20248520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921745
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 22921887  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttact 223  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||    
T  22921886 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacaaaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 22921788  T
Q  224 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921787 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctcta 22921745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 265
Target Start/End: Original strand, 21754059 - 21754279
Alignment:
Q  35 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  21754059 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaaca 21754157  T
Q  135 acatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaac 234  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21754158 acatctcaattatc-aacataatccatttaatgtatatac--------aacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaatgac 21754248  T
Q  235 agtaagataaacaacttagtttctaacctct 265  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754249 agcaagataaacaacttagtttctaacctct 21754279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 266
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918846
Alignment:
Q  37 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa---atcaac 20918716  T
Q  137 atctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacag 236  Q
    | ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||     
T  20918717 aactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacatcaattcataagcatgagtcttactggaacattaacaa 20918816  T
Q  237 taagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20918817 caaggtaaacgacttagtttctaacctcta 20918846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861445
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21861573  T
Q  140 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagta 238  Q
    ||||| | ||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||    |||| ||||||| |||||||| || |    
T  21861572 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataatattcaggcttactgaaacaacaatagca 21861473  T
Q  239 agataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21861472 agataaacaacttagtttcttacctcta 21861445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896142
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 139  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21896259  T
Q  140 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagta 238  Q
    ||||| | ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||| ||||||| |||||||||   |    
T  21896258 tcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataatattcaggcttactgaaacaacaac---a 21896162  T
Q  239 agataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21896161 agataaacaacttagtttct 21896142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295495
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 14295573  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14295572 aatgtaa---atcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattat-aacaacatcaa 14295495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368170
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 16368290  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    |||| || |||    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  16368289 tctc-aacatcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 16368191  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  16368190 aagataaacaacttaatttct 16368170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261015
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacatc 35261084  T
Q  140 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||| | ||| |||||||||  |||||| |||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  35261083 tcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaatcat 35261015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 209
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758839
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||  || |    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaac 16758763  T
Q  134 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatat 209  Q
    |||||| |||   ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16758764 aacatcacaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatat 16758839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50613999
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50614120  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||| |||    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||  | ||||||||| ||||||   |||| ||||||| |  |||||| ||    
T  50614119 tctcaaacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacggt 50614020  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  50614019 aagacaaacaacttagtttct 50613999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621827
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50621948  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||| |||    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||  | ||||||||| ||||||   |||| ||||||| |  |||||| ||    
T  50621947 tctcaaacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacggt 50621848  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  50621847 aagacaaacaacttagtttct 50621827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Original strand, 50686630 - 50686850
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    |||  |  ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||    
T  50686630 cttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaatagttcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaaca 50686729  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||   ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  50686730 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcggatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 50686829  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  50686830 aagataagcaacttagtttct 50686850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049933
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||  |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  41050038 tctcaac-atcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 41049940  T
Q  238 aagataa 244  Q
    |||||||    
T  41049939 aagataa 41049933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 207
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433193
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||| ||||  ||||| || |||| |||||| ||    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaa 433107  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  433108 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatcat 433193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50210212
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 50210235  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  50210234 aatgcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22130975 - 22130844
Alignment:
Q  74 aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatata 173  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||| |||||    
T  22130975 aacagcaacataggcagtatccaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgcatata 22130879  T
Q  174 caactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22130878 caattatataacattataagcaacatcaaatcata 22130844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593719
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23593800  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  23593799 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 23593719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 140
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34509899
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaa 34509881  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatct 140  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  34509882 tgcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574836
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||| |    
T  45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacc 45574910  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaa-acataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
     ||||||||||| |||| |||||| ||| || | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  45574909 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 45574836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13989043
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13988963  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  13988964 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 13989043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923276
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21923356  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21923355 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 21923276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 136
Target Start/End: Original strand, 21161720 - 21161830
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21161720 catcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaacaaaa-cagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatg 21161818  T
Q  125 caagtcatcaac 136  Q
    ||| ||||||||    
T  21161819 caattcatcaac 21161830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250724
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 27250752  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  27250751 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 27250724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840885
Alignment:
Q  23 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 21840863  T
Q  122 atgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  21840864 atgcaagtcaacaacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475072
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21475152  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21475151 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 21475072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776865
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaa 29776785  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  29776786 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 29776865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612490
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 31612410  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| ||||||||||  || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  31612411 tgcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 31612490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093826
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc-atcaac 136  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||    
T  16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaac 16093889  T
Q  137 atctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 199  Q
    |||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  16093888 atctcaaacatcataggtaattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacat 16093826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 202
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362095
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||   ||| || ||||| |||| ||||||     
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatca 16362012  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  16362013 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 16362095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298304
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaa 29298233  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  29298234 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 29298304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454606
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847205
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 92  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 20847205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532395
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 22532367  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  22532368 cattgcaattcaacaacatcttaaatat 22532395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212974
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13212974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342146
Alignment:
Q  18 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21342146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123052
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||  |||||| || ||| |  ||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 22123052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801433
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa 97  Q
    ||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21026806
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||  |||  |||||    
T  21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatc 21026778  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  21026779 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 21026806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 202
Target Start/End: Original strand, 51130632 - 51130741
Alignment:
Q  89 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacatt 188  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  51130632 agtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa---atcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 51130728  T
Q  189 ataaacaacatcaa 202  Q
    || |||||||||||    
T  51130729 at-aacaacatcaa 51130741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347011
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21347011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707217
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21707217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711759
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21711759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860121
Alignment:
Q  18 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15860121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 190
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065108
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 139  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   |||  |  |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  26064959 tagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaata-ccaatgcaaatcaacaacatc 26065057  T
Q  140 tcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattat 190  Q
    ||||| |||| | |||||||  |||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  26065058 tcaaagatcatatataattcaagtaatacatatacaaatatatcacattat 26065108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 266
Target Start/End: Original strand, 12271639 - 12271792
Alignment:
Q  106 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattc 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | |   |||| |   ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  12271639 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatatttacgtataactaaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaactc 12271738  T
Q  206 atatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |       ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  12271739 a-------cagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttacctcta 12271792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468749
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcaacataggcag 22468749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1925005 - 1924896
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  1925005 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 1924907  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  1924906 catcaaatcat 1924896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275476
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaa 16275476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20924019 - 20923910
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  20924019 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 20923921  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  20923920 catcaaatcat 20923910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714595
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 21714595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 264
Target Start/End: Original strand, 20636956 - 20637091
Alignment:
Q  128 gtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaa 227  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||   |||    |||| ||||||||||    
T  20636956 gtcaacaacatcccaaata-caaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaatacaattcaggcttactggaa 20637054  T
Q  228 caacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctc 264  Q
      ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20637055 tgacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctc 20637091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41387924 - 41387815
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  41387924 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatcttaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 41387826  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  41387825 catcaaatcat 41387815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135240
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaa 20135240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 35981696 - 35981566
Alignment:
Q  133 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 232  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |    |||     ||| ||||||||||  |||    
T  35981696 caacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaatgaca 35981598  T
Q  233 acagtaagataaacaacttagtttctaacctc 264  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  35981597 acatcaagataaataacttagtttctaacctc 35981566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Original strand, 49261452 - 49261517
Alignment:
Q  133 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  49261452 caacatctcaaatatcaa-cataatttatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacat 49261517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24783212 - 24783160
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24783212 catcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaa 24783160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 74
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389204
Alignment:
Q  27 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaa 40389204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 41388122 - 41388048
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 172  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  41388122 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 41388048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 39244008 - 39243943
Alignment:
Q  107 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 172  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  39244008 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 39243943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 39247563 - 39247498
Alignment:
Q  107 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 172  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  39247563 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 39247498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565787
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatccaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 21565645  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21565646 caagtcatcaacatttcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttacta 21565745  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565746 gaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctcta 21565787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19669142
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcg 19668997  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca--attcatatgcatcagtc 218  Q
    |||||||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19668998 aatgcaa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaatattcatatgcatcagtc 19669094  T
Q  219 ttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19669095 ttactggaacaacaacaacaagataaacgacttagtttctaacctcta 19669142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959411
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatg 22959550  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
    |||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22959549 caa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattttaaccaacattgattcatatgcatcagtcttactg 22959453  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22959452 gaacaaaaacaacaagataaacaacttggtttttaacctcta 22959411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329373
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcg 21329519  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||    
T  21329518 aattcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggctt 21329419  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21329418 actgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttcttacctcta 21329373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21502041
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcagcatgatataacaatatcg 21502178  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtct 219  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||    
T  21502177 aatgcaagtcatcatcatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggct 21502078  T
Q  220 tactggaacaacaacagtaagataaacaacttagttt 256  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21502077 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagttt 21502041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660714
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||    
T  19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcttgatataatgatatcg 19660857  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||  ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  19660856 aatataa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 19660760  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19660759 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctcta 19660714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26011913
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  26012154 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaacatgatataacaatatca 26012057  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    ||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||  | ||||   |||| |||    
T  26012056 aatgtgaatcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattatatagttcaggctt 26011957  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctc 264  Q
    |||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26011956 actgaaacaacaataacaagataaacaacttagtttctaacctc 26011913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026816
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaaca 20026944  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    || |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||   |||| ||||||| |||||| |||      
T  20026943 tcacaac-atcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacatataattcaggcttactgaaacaactacaac 20026845  T
Q  238 aagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20026844 aagataaacaacttagtttcttacctcta 20026816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178103
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 22178224  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||   | ||  |||||| ||||||||||||    
T  22178223 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcatataatttaggtttactgaaacaacaacagt 22178124  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  22178123 aagataagcaacttagtttct 22178103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144236
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacatc 22144167  T
Q  140 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||| | ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22144168 tcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaattcat 22144236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314678
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 36314676  T
Q  121 aa 122  Q
    ||    
T  36314677 aa 36314678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40726040
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaagcatcatgatataataatatcg 40725952  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
     | | |||| | ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40725953 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 40726040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 147
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412309
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-gataacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 22412285  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  22412286 gcaagtcaacaacatctcaaatat 22412309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24493694
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 24493667  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24493668 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 24493694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286829
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc--aaatcatcatgatataacaatat 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| || ||||| |||| |||||    
T  8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatat 8286866  T
Q  119 cgaatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacat 154  Q
    | | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  8286865 caattgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacat 8286829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729059
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21729087  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  21729086 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 21729059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808384
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21808412  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  21808411 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 21808384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390491
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23390519  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23390518 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 23390491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025436
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||   |||||     
T  13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatca 13025409  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13025410 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 13025436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095620
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||   |||||     
T  13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatca 13095593  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13095594 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 13095620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997547
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 21997557  T
Q  120 gaatgcaagt 129  Q
     |||||||||    
T  21997556 aaatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264753
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 264833  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  264832 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 264753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909189
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20909109  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20909110 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 20909189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330111
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 29330031  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  29330032 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 29330111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363561
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39363481  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  39363482 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 39363561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096649
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| | |||| ||||||    
T  1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatc 1096565  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
     ||||||| ||| |||||||||| |||| ||  ||||||||  |||||| |||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  1096566 aaatgcaaatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 1096649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078074
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 9078050  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
     | ||||||||| |||||||||||    
T  9078051 aagtgcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25421658
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25421630  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  25421631 aattgcaagtcaacagcatcttaaatat 25421658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581183
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 11581264  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaat 203  Q
    |||||||||  ||| |||||| || |||   |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  11581263 tgcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaat 11581183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 140
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529339
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaa 24529321  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatct 140  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  24529322 tgcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732944
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10733005  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatat 182  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  10733004 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10732944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245350
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 42245430  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  42245429 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 42245350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154777
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 36154848  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  36154847 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 36154777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346157
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29346077  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  29346078 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 29346157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 209
Target Start/End: Original strand, 29448055 - 29448192
Alignment:
Q  74 aacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtata 171  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| || |||||| ||||||| |||    
T  29448055 aacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgtaattcatgtaatgcata 29448154  T
Q  172 tacaactatataacattataaacaacatcaattcatat 209  Q
    ||||| || || || |||| | ||||||||| ||||||    
T  29448155 tacaaatacatcaccttattatcaacatcaaatcatat 29448192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431518
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25431492  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaat 145  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||    
T  25431493 aattgcaagtcaacaacatcttaaat 25431518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20901988
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 20902075  T
Q  122 atgcaagtcatcaacatctcaa--atatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
     ||||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  20902074 gtgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 20901988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075145
Alignment:
Q  21 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 118  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||| |||||    
T  22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataac-aacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatat 22075116  T
Q  119 cgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    | | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  22075117 caattgcaattcaacaacatcttaaatat 22075145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348630
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29348550  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  29348551 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 29348630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351103
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29351023  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  29351024 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 29351103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 131
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245242
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39245233  T
Q  123 tgcaagtca 131  Q
    |||||||||    
T  39245234 tgcaagtca 39245242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154593
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |     
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 2154679  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaa--atatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2154678 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 2154593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20918052
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 20918052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619484
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38619484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064561
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 23064561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775790
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 10775790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319027
Alignment:
Q  27 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||    
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 18319096  T
Q  126 aagtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
    ||||| |||||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  18319095 aagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 18319027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027570
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32027490  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    | ||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  32027491 tccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 32027570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21293020
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 92  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21871616 - 21871507
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21871616 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacataattcatgcaatatatatcgaattatataacattataaatat 21871518  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||||||||    
T  21871517 catcaattcat 21871507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21875896 - 21875787
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21875896 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacataattcatgcaatatatatcgaattatataacattataaatat 21875798  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||||||||    
T  21875797 catcaattcat 21875787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061118
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 31061118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 93
Target Start/End: Original strand, 37723922 - 37723975
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 93  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37723922 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtat 37723975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 10753594 - 10753703
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  10753594 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 10753692  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  10753693 catcaaatcat 10753703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806854
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaa 20806854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22120240 - 22120131
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  22120240 aatcatcat-atataacaattacaaatgaacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 22120142  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  22120141 catcaaatcat 22120131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704124
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26704124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973857
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26973857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21741541 - 21741486
Alignment:
Q  133 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacatta 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21741541 caacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataacatta 21741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517269
Alignment:
Q  23 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaa 17517269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 74
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067157
Alignment:
Q  27 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaa 24067157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  37 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 91  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Original strand, 18418590 - 18418677
Alignment:
Q  31 cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  18418590 cttaatcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatc 18418677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24767359 - 24767287
Alignment:
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 193  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  24767359 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 24767287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 251
Target Start/End: Original strand, 15796438 - 15796651
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac- 136  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| |   ||| ||  |||||||||| ||||||| ||||  | ||| || |     
T  15796438 cttagaccgactcatgcagctta-atcaataataaacagcaacataggcagcacataaaacagctcatgatatagcaatatcaaatgataatcaacatca 15796536  T
Q  137 atctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacag 236  Q
    |||| ||| |||    ||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||| |  ||||| ||||||| |||| || |||    
T  15796537 atcttaaacatctcttataattcgcatactgtatatacaattatatcacattattagcaacatcaaatcatttatatcaggcttactgaaacagcagcag 15796636  T
Q  237 taagataaacaactt 251  Q
    ||  |||| ||||||    
T  15796637 tagtataagcaactt 15796651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766115
Alignment:
Q  88 cagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20766174 cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 20766115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Original strand, 36314670 - 36314728
Alignment:
Q  143 aatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  36314670 aatatcgaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattat-aacaacatcaa 36314728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 90
Target Start/End: Original strand, 21873254 - 21873318
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21873254 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcagcataggcag 21873318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 90
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032387
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 22032387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45668
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 45810  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45809 taagtcatcaacatctcaattatcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 45710  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  45709 gaacaattacagcaatataaacaacttagtttctaacctcta 45668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 266
Target Start/End: Original strand, 6826 - 7054
Alignment:
Q  35 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||    
T  6826 atcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaa---atca 6922  T
Q  135 acatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaac 234  Q
    ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6923 acaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaac 7022  T
Q  235 agtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7023 agcaagataaacaacttagtttctaacctcta 7054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 266
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8260
Alignment:
Q  103 catgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |     
T  8097 catgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattag 8196  T
Q  203 ttcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
     | ||||   |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||    
T  8197 attatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaacttagttccttacctcta 8260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22550
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 22677  T
Q  136 catctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22676 catctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatca----atatgcatcagtcttactggaacagcaaca 22581  T
Q  236 gtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22580 tcaagacaaacaacttagtttctaacctcta 22550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82255
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 82169  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  82170 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 82255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1327
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaata 1185  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1186 caggtcatcaacatttcaaacatcaaacataattcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcatatacatcagtcttactg 1285  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1286 gaacaacaacaacaagataaaaaacttagtttcttacctcta 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160928
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatg 160787  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  160788 caa-tcaacaacatgtcaaatatcaaacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 160886  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  160887 aaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctcta 160928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501261
Alignment:
Q  28 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 501185  T
Q  127 agtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  501186 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 501261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85692
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 85692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 133 - 373
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 232  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  233 caaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaattcatatgtatcagtctcacta 332  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  333 gaacaacaacagcaagat-aacaactcagtttctaacctcta 373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 86)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652438
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 19652298  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652299 caa-tcaacaacatctcaaacatcaa-cataatccatttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 19652396  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652397 gaacaataacagcaagataaacaacttagtttctaacctcta 19652438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496350
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 28496493  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||| ||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28496492 aatgtaa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtctt 28496396  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28496395 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaaactcta 28496350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808761
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 29808904  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||| ||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29808903 aatgtaa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtctt 29808807  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  29808806 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaaactcta 29808761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561546
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 1561402  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaaca-tcaattcatatgcatcagtct 219  Q
    |||||||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  1561403 aatgcaa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgcatcagtct 1561499  T
Q  220 tactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1561500 tactggaatattaacagcaagataaacaacttagtttctaacctcta 1561546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109386
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||     
T  20109140 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacataatataacaatatca 20109237  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatataca--actatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20109238 aatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattgatatacatcagt 20109337  T
Q  218 cttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20109338 cttactagaaagacatcagcaagataaacaacttagtttcttacctcta 20109386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019649
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  23019408 acatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatca 23019505  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |  | ||||   |||| |||    
T  23019506 aatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattatatagttcaggctt 23019605  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctc 264  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23019606 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctc 23019649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 264
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668615
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaac 19668485  T
Q  134 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 233  Q
    |||||| |||  |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  |||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  19668486 aacatcacaac-atcatacgtaattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcatatacatcagacttactgaaacaacaa 19668584  T
Q  234 cagtaagataaacaacttagtttctaacctc 264  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19668585 cagcaagataaacaacttagtttcttacctc 19668615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333238
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 27333240  T
Q  121 aa 122  Q
    ||    
T  27333239 aa 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27393978
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 27393980  T
Q  121 aa 122  Q
    ||    
T  27393979 aa 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098466
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  ||| |    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaac 9098521  T
Q  134 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacatta 189  Q
    ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9098520 aacttcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatataattatataacatta 9098466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 207
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644508
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  135 acatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    |||||||||| | ||| | |||||||  ||||||  ||||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacatcaaatcat 25644508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227445
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 8227533  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
     | | |||| | ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8227532 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 8227445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4185928 - 4185827
Alignment:
Q  35 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4185928 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatca 4185829  T
Q  135 ac 136  Q
    ||    
T  4185828 ac 4185827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782410
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22782324  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  22782325 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 22782410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076969
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  | ||| |||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaaca 23076848  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
     || ||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23076849 acttaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagt 23076948  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  23076949 aagataagcaaattagtttct 23076969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29060662
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 29060638  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
     ||||||||||| |||||||||||    
T  29060639 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Original strand, 4186381 - 4186482
Alignment:
Q  35 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4186381 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatca 4186480  T
Q  135 ac 136  Q
    ||    
T  4186481 ac 4186482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008387
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  | |||  ||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaaca 35008266  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
     || ||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  35008267 acttaaacatcatatataattcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaataacagt 35008366  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  35008367 aagataagcaacttagtttct 35008387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080615
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagtta-------------aacataggcagtatgcaaaacatcatgatataacaatatcg 22080760  T
Q  121 aatgca-agtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtc 218  Q
    |||||| ||  | |||||||||||| |||   |||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||| |  ||||||  | | || |    
T  22080759 aatgcacag--aacaacatctcaaacatc-gtcataattaatataatgtatatacatttatataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttaggc 22080663  T
Q  219 ttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22080662 ttactgaaacaacaagagcaagataagcaacttagtttctaacctcta 22080615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496370
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 16496342  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  16496343 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 16496370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287791
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  || ||||| |||| ||||||    
T  17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatc 17287819  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  17287818 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 17287791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409826
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatca 18409849  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  18409848 aatgcaagtcaacaacatctcaa 18409826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303540
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacacaggaagtatacaaaacaacatgacataataatatca 19303563  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  19303562 aatgcaagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076805
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||     
T  20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaacagcatgacataataatatca 20076798  T
Q  121 aatgcaa 127  Q
    |||||||    
T  20076799 aatgcaa 20076805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676695
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || |||||||||| ||||||     
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 30676777  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  30676776 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 30676695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291165
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 2291245  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  2291244 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 2291165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742494
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12742414  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  12742415 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 12742494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334577
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18334657  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  18334656 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 18334577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005223
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19005143  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  19005144 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 19005223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858904
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19858984  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  19858983 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 19858904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422724
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24422644  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24422645 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 24422724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861971
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33861891  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  33861892 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 33861971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864455
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33864375  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  33864376 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 33864455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25629354
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattac-aacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatc 25629378  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
     ||||||||||| |||||||||||    
T  25629377 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595726
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 1595646  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  1595647 tgcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 1595726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055206
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-aaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8055126  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  8055127 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 8055206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924625
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 26924705  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  26924704 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 26924625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360955
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatc 20360983  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  20360982 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 20360955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20593895
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 20593871  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
     ||||||||||| |||||||||||    
T  20593872 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 129
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656733
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25656726  T
Q  123 tgcaagt 129  Q
    |||||||    
T  25656727 tgcaagt 25656733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754992
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25754906  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  25754907 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 25754992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556873
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaa 20556957  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  20556956 tgcaagtcaacaacgtctc-aatttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 20556873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920634
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||     
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatacaa--catcatgacataagtatatca 16920654  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    ||| | | ||||||||||||    
T  16920653 aattccattcatcaacatct 16920634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20638285
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 20638306  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatct 140  Q
     | ||||| | ||||||||||    
T  20638305 aattgcaatttatcaacatct 20638285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245703
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| |||| ||||||     
T  35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaa--caacatgacataataatatca 35245683  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    | | ||| ||||||||||||    
T  35245684 atttcaattcatcaacatct 35245703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714478
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 202
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963550
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 34963468  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  34963469 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 34963550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540896
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaa 1540976  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||    
T  1540975 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatat-aacaacatcaa 1540896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4668277 - 4668217
Alignment:
Q  76 cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 136  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4668277 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4668217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4675124 - 4675064
Alignment:
Q  76 cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 136  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4675124 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4675064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31155514 - 31155403
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    ||||||| | |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31155514 catcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaaaacagcaac-taaacagtatgcaagtcatcgtgatataacaatatcgaat 31155416  T
Q  124 gcaagtcatcaac 136  Q
    |||| ||||||||    
T  31155415 gcaattcatcaac 31155403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448520
Alignment:
Q  27 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||    
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 16448589  T
Q  126 aagtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
    ||||| |||||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  16448588 aagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 16448520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831571
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 89  Q
    ||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 22831571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688620
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |     
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 25688599  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  25688600 tgcaagtcaacaacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852121
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataac-aacagcaaca 3852121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22780222
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||| || | ||| |||| ||||||    
T  22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatc 22780250  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  22780249 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 22780222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456901
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18456832  T
Q  139 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18456833 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 18456901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Original strand, 18706356 - 18706493
Alignment:
Q  73 aaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtat 170  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| ||  |||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||| ||| |||| | ||||||| ||||||| ||    
T  18706356 aaacagcaacataggcaatatataaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatcttaaacatcatatataattcatgtaatgcat 18706454  T
Q  171 atacaactatataacattataaacaacatcaattcatat 209  Q
    |||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18706455 atacatttatatgacattattaacaacatcaaatcatat 18706493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 22949375 - 22949484
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  22949375 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 22949473  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  22949474 catcaaatcat 22949484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 22953331 - 22953440
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  22953331 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 22953429  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  22953430 catcaaatcat 22953440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 23871819 - 23871928
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  23871819 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 23871917  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  23871918 catcaaatcat 23871928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 23875775 - 23875884
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  23875775 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 23875873  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  23875874 catcaaatcat 23875884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27325479 - 27325370
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  || ||| |||||| || |||||||||||||||| |     
T  27325479 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattaatgcaatatatatataattatataacattataaatat 27325381  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  27325380 catcaaatcat 27325370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185568
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacat 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18199519 - 18199321
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| || |   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||  | ||| || ||    
T  18199519 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacagcaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18199421  T
Q  138 -tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacag 236  Q
     ||| ||| |||| | |||||||   ||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  18199420 atcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatttatatcagacttactgaaacaacaacag 18199321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 236
Target Start/End: Original strand, 18204096 - 18204294
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||| || |   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||  | ||| || ||    
T  18204096 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacaacaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18204194  T
Q  138 -tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacag 236  Q
     ||| ||| |||| | |||||||   ||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  18204195 atcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatttacatcagacttactgaaacaacaacag 18204294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19848063
Alignment:
Q  23 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 19848063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 16760525 - 16760634
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  16760525 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 16760623  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  16760624 catcaaatcat 16760634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462031
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18461992  T
Q  139 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaa 176  Q
    ||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||||||    
T  18461993 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaa 18462031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28103877 - 28103796
Alignment:
Q  163 taatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataa 244  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28103877 taatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataa 28103796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18177775 - 18177577
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||| || |   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||  | ||| || ||    
T  18177775 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacaacaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18177677  T
Q  138 -tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacag 236  Q
     ||| ||| |||| | |||||||   ||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  18177676 atcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatttatatcagacttactgaaacaacaacag 18177577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Original strand, 18696569 - 18696676
Alignment:
Q  102 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 201  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||| || |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| |    
T  18696569 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T
Q  202 attcatatg 210  Q
    | |||||||    
T  18696668 aatcatatg 18696676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 119
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443146
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagtatataaaacatctcaagatataacaatatc 33443146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821904
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 18821904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 74
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992480
Alignment:
Q  23 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaa 23992480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 207
Target Start/End: Original strand, 16624583 - 16624669
Alignment:
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  16624583 aatgcacgtcatcaacatcttaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 16624669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31477686 - 31477577
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||  || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  31477686 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacaaaatttatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 31477588  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  31477587 catcaaatcat 31477577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Original strand, 19008799 - 19008843
Alignment:
Q  18 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctta 62  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19008799 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccaactcatgcagctta 19008843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 172
Target Start/End: Original strand, 16624371 - 16624436
Alignment:
Q  107 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 172  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  16624371 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 16624436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 18907111 - 18907160
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907111 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcagcttagttaaataacaa 18907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863027
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19863027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873169
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19873169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 90
Target Start/End: Original strand, 21766695 - 21766759
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21766695 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcaacataggcag 21766759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Original strand, 21939488 - 21939553
Alignment:
Q  128 gtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 193  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  21939488 gtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 21939553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27333214 - 27333161
Alignment:
Q  213 tcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27333214 tcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctcta 27333161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27393954 - 27393901
Alignment:
Q  213 tcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27393954 tcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctcta 27393901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 79)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846617
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataac----------- 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||               
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgagataacaatatcgaatg 8846459  T
Q  114 -----aatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8846460 ctaacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata 8846559  T
Q  209 tgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8846560 tgcatcagtcttactggaacaacaactacaagataaacaacttagtttctaatctcta 8846617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774242
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaata 12774110  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774111 caa-tcaacaacatctcaattatc-aacataatccatttaatgtatatac--------aacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 12774200  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774201 gaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctcta 12774242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13726
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 13854  T
Q  140 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagta 238  Q
    ||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||  |    
T  13853 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacataa 13754  T
Q  239 agataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13753 agataaacaacttagtttcttacctcta 13726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706179
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 39706310  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||   |||| |||    
T  39706309 aatgcaagtcatgaacatcataaacatc-aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcatataattcaggctt 39706211  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaactta 252  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39706210 actaaaacaacaacagcaagataaacaactta 39706179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198428
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  134 aacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 232  Q
    || ||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatatgcattagtcttactggaacatca 43198462  T
Q  233 acagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||  ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43198461 acaacaagataaacaacttagttttttacctcta 43198428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288094
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaac 12288217  T
Q  134 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 233  Q
    |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||   |||| ||||||| ||||||||    
T  12288216 aacatcacaac-atcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 12288118  T
Q  234 cagtaagataaacaacttagtttc 257  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  12288117 cagcaagataaacaacttagtttc 12288094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15552058
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgatataataatatcg 15551916  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    || | ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  15551917 aaggtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgattcataagcatcagtctt 15552013  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||||| |||  ||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  15552014 actgggacattaacagcagggt-aacaacttagtttctaacctcta 15552058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 266
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596890
Alignment:
Q  59 cttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataatt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||   |||| |||||||| ||| |    
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaac---tcaattatcaaacttaagt 16596782  T
Q  159 cgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttct 258  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16596783 catgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaatttataagcatcagtcttacttgaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttct 16596882  T
Q  259 aacctcta 266  Q
    ||||||||    
T  16596883 aacctcta 16596890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243128
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||| |    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaac 52243203  T
Q  134 aacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||||||||| | ||| | ||||| |  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  52243202 aacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 52243128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082035
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| || |||| |||  ||||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataaca 53082156  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  53082155 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 53082056  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  53082055 aagataagcaacttagtttct 53082035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640339
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||| || |||  ||||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataaca 46640459  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||  |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||| || ||||||||||| ||||||   ||||  |||||| ||||| ||||||    
T  46640458 tctcaac-atcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcatataattcaggtttactgaaacaataacagt 46640360  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  46640359 aagataagcaacttagtttct 46640339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798900
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7798872  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||    
T  7798873 aattgcaagtcatcaacatcttaaatat 7798900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928866
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||| || ||    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaa 44928944  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 199  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  44928943 tgcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacat 44928866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377522
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaaat 16377542  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  16377541 gcaagtcaacaacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215253
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18215339  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  18215338 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 18215253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7088996
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7088975  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatct 140  Q
     | ||||| ||||||||||||    
T  7088976 aattgcaattcatcaacatct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 147
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280438
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 14280413  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  14280414 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 14280438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615465
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 44615385  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  44615386 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 44615465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798749
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 54798774  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  54798773 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 54798749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900016
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||   |||| ||||||     
T  6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacaacatagcataataatatca 6899989  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6899990 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 6900016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270231
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 16270258  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  16270257 aatgcaagttaacaacatcttaaatat 16270231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873363
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 52873390  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaata 146  Q
     | ||||||||| || ||||| |||||    
T  52873389 aattgcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118337
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15118417  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15118416 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 15118337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773072
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44773152  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  44773151 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 44773072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312687
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 52312607  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  52312608 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 52312687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12902883
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 12902855  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | || || |||||||||||| ||||||    
T  12902856 aattgtaattcatcaacatcttaaatat 12902883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12301
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12372  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  12371 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 12301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239965
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataac-aatagcaaaataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 16239992  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16239991 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 16239965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618216
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||     
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatca 19618239  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  19618238 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 19618216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242872
Alignment:
Q  18 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataat 19242790  T
Q  117 atcgaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaac 197  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  19242791 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaac 19242872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837494
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||| | ||    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaa 1837574  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  1837573 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattat-aacaacatcaa 1837494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7893829
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7893801  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  7893802 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 7893829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44052955
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44052927  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  44052928 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 44052955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222333
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 50222404  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  50222403 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 50222333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 98
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096369
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 98  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 3096369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 147
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636561
Alignment:
Q  23 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 22636535  T
Q  122 atgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||    
T  22636536 ttgcaattcatcaacatcttaaatat 22636561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515184
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || || || |||| |||||| ||    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaa 3515104  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  3515105 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 3515184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046559
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 93  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat 17046559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239404
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18239484  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||    
T  18239483 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtat-aacaacatcaa 18239404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574864
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat 8574888  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    | || ||| |||||||||||||||    
T  8574887 gtaattcaacaacatctcaaatat 8574864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 143
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038770
Alignment:
Q  26 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatg 14038751  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  14038752 caagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463847
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 51463933  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| ||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  51463932 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 51463847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355309
Alignment:
Q  28 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15355386  T
Q  127 agtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||| |||||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15355385 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 15355309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374354
Alignment:
Q  28 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 126  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 23374375  T
Q  127 agtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    | ||| |||||||| ||||||    
T  23374374 attcaacaacatcttaaatat 23374354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641286
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 7641286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611008
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12611008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803369
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 23803369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102264
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 44102264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 630819 - 630710
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | || ||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  630819 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataatgcatgcaatatatatccaattatataacattataaataa 630721  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  630720 catcaaatcat 630710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14053306
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa-cagcatgacataataatatca 14053324  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacat 138  Q
    | | ||| ||||||||||    
T  14053323 atttcaattcatcaacat 14053306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 3331961 - 3332070
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  3331961 aatcatcat-atataacaattacaaatgcatgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 3332059  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  3332060 catcaaatcat 3332070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 90
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190531
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcag 6190531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14954006 - 14953897
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  14954006 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 14953908  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  14953907 catcaaatcat 14953897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970751
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaaca-gcaatatacaaaaacagcatgacataataatatca 14970774  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  14970773 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 14970751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 25690137 - 25690246
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  25690137 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 25690235  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  25690236 catcaaatcat 25690246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13812854 - 13812759
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 193  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  13812854 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 13812759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 10713083 - 10713192
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  10713083 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 10713181  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  10713182 catcaaatcat 10713192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 10926853 - 10926962
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  10926853 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 10926951  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  10926952 catcaaatcat 10926962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Original strand, 15099461 - 15099526
Alignment:
Q  133 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  15099461 caacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacat 15099526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Original strand, 15190428 - 15190493
Alignment:
Q  133 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  15190428 caacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacat 15190493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 15225308 - 15225417
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  15225308 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatcttaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 15225406  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  15225407 catcaaatcat 15225417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Original strand, 12487941 - 12488045
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  12487941 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 12488039  T
Q  197 catcaa 202  Q
    ||||||    
T  12488040 catcaa 12488045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 90
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353901
Alignment:
Q  23 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataac-aacagcagcataggcag 22353901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15868754 - 15868645
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  | | | |||||||| || |||  |||| ||| |||||||||||||||| |     
T  15868754 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcagcgaccataattcatgcaataaatatccaattatataacattataaatat 15868656  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||||||||    
T  15868655 catcaattcat 15868645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367743
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15367743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370071
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15370071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371255
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15371255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373536
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15373536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402756
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15402756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15464970 - 15464865
Alignment:
Q  103 catgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||| | |||||||  ||| || |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||    
T  15464970 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattatatcaaattttaaacgacatca 15464871  T
Q  202 attcat 207  Q
    | ||||    
T  15464870 aatcat 15464865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223585
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 16223585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Original strand, 32851450 - 32851545
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataa-ttcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  32851450 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaactatataacattataa 32851545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Original strand, 14164732 - 14164783
Alignment:
Q  204 tcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtt 255  Q
    |||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14164732 tcatatgattcaggcttactagaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 14164783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 172
Target Start/End: Original strand, 15225114 - 15225188
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 172  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  15225114 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 15225188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 207
Target Start/End: Original strand, 15791916 - 15791960
Alignment:
Q  163 taatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  15791916 taatgcatatacaactatatcacattattaacaacatcaaatcat 15791960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20157312 - 20157240
Alignment:
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 193  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || | | |||||  || ||||||||||||||||    
T  20157312 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcagtatatatctaattatataacattataaa 20157240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20157579 - 20157527
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  20157579 catcatcgtcttaatcaacttatatagactcatgcaaattagttaaataacaa 20157527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815699
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 72  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac 21815699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22634235 - 22634163
Alignment:
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 193  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||  || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  22634235 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataatttatgcaatatatatctaattatataacattataaa 22634163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520610
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 6520467  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||    
T  6520468 aatgcaagtcatcaacatcataaacatc-aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggctt 6520566  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctc 264  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6520567 actgaaacaacaacagcaagataaataacttagtttctaacctc 6520610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866153
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 5866296  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  5866295 aatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 5866199  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5866198 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctcta 5866153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491237
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattg 21491094  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  21491095 aatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataggcatcagtctt 21491191  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21491192 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctcta 21491237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855134
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 38855273  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||    
T  38855272 aatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggctt 38855174  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 260  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  38855173 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagttcctaa 38855134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355576
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcacgatataacaatatcgaatg 26355716  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
    ||| ||| ||||||||||   ||| |||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26355715 caa-tcaacaacatctcagccatc-aacatattccatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttacta 26355618  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355617 gaacaataacaaaaagataaacaacttagtttctaacctcta 26355576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17141158
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||    
T  17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgacataataatatcg 17141015  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||| || |||||||   ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  17141016 aatgtaaatcatcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 17141112  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17141113 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctcta 17141158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 264
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498806
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 139  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 20498680  T
Q  140 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagta 238  Q
    ||||| | ||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |||||  |    
T  20498681 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtcttaccgaaacatcaacatca 20498780  T
Q  239 agataaacaacttagtttctaacctc 264  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  20498781 agataaacaacttagtttcttacctc 20498806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285842
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 21285700  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| || |  | ||||   |||| |||||||    
T  21285701 caaatcaacaacatctcaaacatcaaacatagttcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattatataattcaggcttactg 21285800  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
     ||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  21285801 aaacaacaacaacaagataaagcacttagtttcttacctcta 21285842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23760962 - 23760717
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23760962 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcatcatgatataacaatattg 23760866  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtct 219  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||    
T  23760865 aattcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcaggct 23760767  T
Q  220 tactg---gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23760766 tactgaaacaacaacaacaacaaggtaaacaacttagtttttaacctcta 23760717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116586
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37116465  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  37116466 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaacagt 37116565  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  37116566 aagataagcaacttagtttct 37116586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249626
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaac-agcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatc 21249483  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtct 219  Q
    ||||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  21249484 gaatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtct 21249580  T
Q  220 tactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    || ||  |||  ||||| | | | |||||||||||| ||||||||||    
T  21249581 tagtgagacattaacagcagggt-aacaacttagttcctaacctcta 21249626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255464
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaac-agcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatc 21255321  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtct 219  Q
    ||||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  21255322 gaatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtct 21255418  T
Q  220 tactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    || ||  |||  ||||| | | | |||||||||||| ||||||||||    
T  21255419 tagtgagacattaacagcagggt-aacaacttagttcctaacctcta 21255464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 266
Target Start/End: Original strand, 21673718 - 21673948
Alignment:
Q  35 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21673718 atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaaca 21673817  T
Q  135 acatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaa 233  Q
    |||||||||||||| || ||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||  ||||||| ||||||||    
T  21673818 acatctcaaatatc-aatataatttatttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttactgaaacaacaa 21673916  T
Q  234 cagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21673917 caacaagat-aacaacttagtttttaacctcta 21673948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983287
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| || ||||||| ||| |    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  134 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 233  Q
    |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||   |||| ||||||| ||||||||    
T  983412 aacatcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcatataattcagacttactgaaacaacaa 983314  T
Q  234 cagtaa---gataaacaacttagtttc 257  Q
    ||  ||   ||||||||||||||||||    
T  983313 caacaacatgataaacaacttagtttc 983287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266876
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| |   |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| || |||| ||||||||||||    
T  17266996 tctcaaacatcatatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggctcactgaaacaacaacagt 17266897  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  17266896 aagataagcaacttagtttct 17266876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13508188 - 13508019
Alignment:
Q  39 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  13508188 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 13508089  T
Q  139 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    |||||||| ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13508088 ctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 13508019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13597720 - 13597551
Alignment:
Q  39 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  13597720 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 13597621  T
Q  139 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    | |||||| ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13597620 cccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 13597551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353261
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 24353137  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg---gaacaacaac 234  Q
    ||||||| |||  | | ||||| ||||||| |||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||   |||| |||||||    |||||||||    
T  24353138 tctcaaacatcgtatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaac 24353237  T
Q  235 agtaagataaacaacttagtttct 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  24353238 agtaagataagcaacttagtttct 24353261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17612056
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 17612132  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaaca 195  Q
     | | |||| | ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17612131 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaaca 17612056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16092337
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16092365  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16092364 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 16092337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22626861
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 22626834  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  22626835 aatacaaatcaacaacatcttaaatat 22626861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28648983
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 28649066  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||  ||||||| ||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  28649065 aatgcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 28648983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439438
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17439510  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatat 209  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||| || ||||||    
T  17439509 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatat 17439438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875190
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 22875163  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22875164 aatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22875190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409429
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14409509  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  14409508 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 14409429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7372904
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7372876  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  7372877 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 7372904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536334
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20536306  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  20536307 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 20536334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971375
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 31971355  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    | | ||| ||||||||||||    
T  31971356 attccaattcatcaacatct 31971375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759368
Alignment:
Q  18 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataat 6759353  T
Q  117 atcgaatgcaagtca 131  Q
    ||| |||||||||||    
T  6759354 atcaaatgcaagtca 6759368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484579
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 1484499  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  1484500 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 1484579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853277
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 5853357  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  5853356 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 5853277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403404
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20403324  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20403325 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 20403404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001930
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22001850  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  22001851 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 22001930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818404
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18818432  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | || |||||| || ||||| ||||||    
T  18818431 aattgtaagtcaacatcatcttaaatat 18818404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21918995
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21919023  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  21919022 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 21918995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923923
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| || | ||||||    
T  21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatc 21923951  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  21923950 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 21923923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 131
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406489
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23406477  T
Q  120 gaatgcaagtca 131  Q
     | |||||||||    
T  23406478 aattgcaagtca 23406489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 256
Target Start/End: Original strand, 22364744 - 22364897
Alignment:
Q  102 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 201  Q
    |||||||||||||||||| || | || ||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| || |||| ||||||||||    
T  22364744 tcatgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  202 attcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagttt 256  Q
    | ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22364843 aatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagttt 22364897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18879276
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 18879276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 207
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598370
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41598285  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  41598286 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 41598370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413301
Alignment:
Q  28 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16413377  T
Q  127 agtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16413376 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 16413301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046180
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 20046260  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || | | | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20046259 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 20046180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395984
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatca 21396004  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  21396003 aattcaattcatcaacatct 21395984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790477
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatca 21790497  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  21790496 aattcaattcatcaacatct 21790477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199647
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa-caacatgacataataatatca 16199667  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    | | ||| ||||| ||||||    
T  16199666 atttcaattcatctacatct 16199647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 147
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219838
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||  |  |||| |||| |||||| |||    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaatagtatgacataataatatcaaat 26219814  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  26219815 gcaagtcaacaacatctcaaatat 26219838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483457
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4483377  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  4483378 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 4483457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203216
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15203296  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    || |||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15203295 tgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 15203216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389454
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatca 21389474  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  21389473 aattcaattcatcaacatct 21389454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778780
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatca 21778800  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  21778799 aattcaattcatcaacatct 21778780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225288
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  || ||| |||| ||  |||| |||| |||||| |||    
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acaatatacaaaacagtatgacataataatatcaaat 26225312  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  26225311 acaagtcaacaacatctcaaatat 26225288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542358
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||  || | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4542438  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | ||| |||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  4542437 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 4542358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896323
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 19896323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45131047
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 92  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 45131047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 21383887 - 21383996
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21383887 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21383985  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  21383986 catcaaatcat 21383996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937118
Alignment:
Q  18 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 19937118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290807
Alignment:
Q  28 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45290807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18862521 - 18862412
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  18862521 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 18862423  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  18862422 catcaaatcat 18862412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 21387307 - 21387416
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21387307 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21387405  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  21387406 catcaaatcat 21387416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 21411180 - 21411289
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21411180 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21411278  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  21411279 catcaaatcat 21411289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 21805672 - 21805781
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21805672 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21805770  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  21805771 catcaaatcat 21805781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21827890 - 21827781
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21827890 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21827792  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  21827791 catcaaatcat 21827781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484380
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaa 25484380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154936
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 93  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat 19154936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801362
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| || |||||||| |||| ||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
Q  140 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    |||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatat-aacaacatcaagtcat 19801362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 90
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648621
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaac-aatagcaacataggcag 23648621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678170
Alignment:
Q  23 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 18678170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823941
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14823870  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  14823871 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 14823941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224037
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||| ||| | |||  | ||||| |||| ||||||     
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataac-aacagcaata-aagcaatatacaaaaatagcatgacataataatatca 26224014  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  26224015 aatgcaagtcaacaacatctcaa 26224037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070608
Alignment:
Q  37 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15070608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 74
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121785
Alignment:
Q  23 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaa 32121785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40492891 - 40492834
Alignment:
Q  102 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattc 159  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| | |||||||    
T  40492891 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcataaataattc 40492834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 266
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8714
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 8580  T
Q  136 catctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatataca--actatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 232  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8581 catctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcatatacatcagtcttactggaacaaca 8680  T
Q  233 acagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8681 tcagcaagataaacaacttagtttcttacctcta 8714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6779
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 6634  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtct 219  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||    
T  6635 aatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggct 6733  T
Q  220 tactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6734 tactgaaacaacaacagcaagat-aacaacttagtttttaacctcta 6779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 87)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 67745 - 67989
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 67844  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtct 219  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||    
T  67845 aatgcaaatcaacaacatctc-aatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggct 67942  T
Q  220 tactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  67943 cactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctcta 67989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16219835 - 16219595
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219835 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 16219739  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | ||||   |||| |||    
T  16219738 aatgcaagtcatcaacatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggctt 16219639  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctc 264  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16219638 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctc 16219595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34201028
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 34200885  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  34200886 aatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 34200982  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34200983 actgggacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctcta 34201028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754765
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 15754909  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaaca-tcaattcatatgcatcagtct 219  Q
    |||||||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  15754908 aatgcaa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgcatcagtct 15754812  T
Q  220 tactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15754811 tactggaatattaacagcaagataaacaacttagtttctaacctcta 15754765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005891
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatggaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 18005749  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttact 223  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||    
T  18005750 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 18005848  T
Q  224 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005849 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctcta 18005891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47832050
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatcatcatgatataacaatatcg 47831906  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| |  | |||    |||| |||    
T  47831907 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattatacaattcaggctt 47832006  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctc 264  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  47832007 actgaaacaacaacaacaagataaataacttagtttctaacctc 47832050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811012
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 811149  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 224  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||||    
T  811148 caagtcattaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactg 811049  T
Q  225 gaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaac 261  Q
     ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  811048 aaactacaacagcaagataaataacttagtttctaac 811012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11995906
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattg 11996049  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||| ||   ||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  11996048 aatgtaa---atcaacaactcaaatatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 11995952  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||||| |||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11995951 actgggacattaacagcaaggtaaacaaattagtttctaacctcta 11995906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505177
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 28505320  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
     ||  ||   |||| || ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  28505319 gatataa---atcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 28505223  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||   |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28505222 actggaacattgacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctcta 28505177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 265
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014418
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 44014281  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttact 223  Q
    |||   |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |  ||||||  | |||| ||||||    
T  44014282 caa---atcaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggcttact 44014377  T
Q  224 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctct 265  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44014378 gaaacaacaacagcaagat-aacaacttagtttttaacctct 44014418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 266
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056572
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 135  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 16056441  T
Q  136 catctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaaca 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | ||||   |||| ||||| | ||||||||||    
T  16056442 catctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatatcattcaggcttaccgaaacaacaaca 16056541  T
Q  236 gtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16056542 tcaagataaacaacttagtttcttacctcta 16056572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 255
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073149
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtc 218  Q
     |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| |  | ||||   |||| |    
T  22073013 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggc 22073112  T
Q  219 ttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtt 255  Q
    |||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  22073113 ttactgaaacaacaacatcaagacaaacaacttagtt 22073149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495579
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 16495501  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16495502 aatgtaa---atcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattat-aacaacatcaa 16495579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220073
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaaca 20220194  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20220193 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactggaacaacaacagt 20220094  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  20220093 aagataagcaacttagtttct 20220073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 257
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901560
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 133  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||| |||||||  || |    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagc 12901437  T
Q  134 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 233  Q
    |||||| | || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||   |||  ||||||| ||||||||    
T  12901438 aacatcac-aacatcatacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcatataattcaagcttactgaaacaacaa 12901536  T
Q  234 cagtaagataaacaacttagtttc 257  Q
    ||  ||||||||||||||||||||    
T  12901537 caacaagataaacaacttagtttc 12901560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280053
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||     
T  2280238 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataataatatca 2280141  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||||   ||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2280140 aatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 2280053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 266
Target Start/End: Original strand, 15116565 - 15116725
Alignment:
Q  106 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattc 205  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||| | |||| ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  15116565 gatataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaactc 15116664  T
Q  206 atatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15116665 atatacatcagtcttactgaaacaataacagtaggataaacaacttagtttcttacctcta 15116725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867929
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | | |    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaac 1868003  T
Q  134 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  1868002 aacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat 1867929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255729
Alignment:
Q  43 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  141 caaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaat 203  Q
    |||| | ||| | |||||||  |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12255792 caaacattcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaat 12255729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 208
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044935
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtca-t 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| ||| |    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14044859  T
Q  133 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  14044860 caacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14044935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 208
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354965
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtca-t 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| ||| |    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14354889  T
Q  133 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  14354890 caacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14354965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456408
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat 18456432  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  18456431 gcaagtcaacaacatcttaaatat 18456408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486678
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 19486766  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
     | | |||| | ||||||||||||| |||| | |||||||  || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19486765 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 19486678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227606
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 38227579  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  38227580 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 38227606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647512
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||||    
T  13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatc 13647423  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
     ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  13647424 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 13647512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 266
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113188
Alignment:
Q  106 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattc 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| | |||| ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| ||    
T  15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaactc 15113127  T
Q  206 atatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15113128 atataaatcagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttacctcta 15113188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061895
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||    
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatacaaaatagcatgacataataatatcaaat 17061979  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaa-acataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    |||||||| |||| |||||| ||| || | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17061978 gcaagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 17061895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430889
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||   ||| |||||||| |||| ||||||    
T  18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatc 18430806  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
     ||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  18430807 aaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 18430889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12698958
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatat 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   || ||||| |||| |||||    
T  12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatat 12698929  T
Q  119 cgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    | | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  12698930 caattgcaattcatcaacatcttaaatat 12698958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564363
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 3564384  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    || |||||| |||||||||||    
T  3564383 tgtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273511
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 48273490  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  48273491 tgcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509315
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | || ||||| |||| ||||||    
T  9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatc 9509287  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  9509288 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 9509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008433
Alignment:
Q  44 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacctc 15008499  T
Q  142 aaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  15008498 aaacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat 15008433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456498
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 456418  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  456419 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 456498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972673
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 11972593  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  11972594 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 11972673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949107
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14949187  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  14949186 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 14949107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376698
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15376778  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15376777 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 15376698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232697
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16232617  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16232618 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 16232697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385108
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20385188  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20385187 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 20385108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189580
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21189660  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21189659 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 21189580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702415
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 24702335  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24702336 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 24702415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125668
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32125588  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  32125589 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 32125668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523094
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41523014  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  41523015 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 41523094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525556
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41525476  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  41525477 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 41525556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393272
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11393351  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  11393350 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 11393272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640440
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18640369  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  18640370 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 18640440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10063921 - 10063757
Alignment:
Q  39 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 138  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||    
T  10063921 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaacat 10063822  T
Q  139 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    |||||||| ||| | |||||||     |   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  10063821 ctcaaatattcacatataattc-----aaacatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 10063757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 207
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116691
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 44116606  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  | |||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  44116607 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 44116691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704862
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  | || || |||| |||||| |||    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaa--aacaagacataataatatcaaat 24704783  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24704784 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 24704862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27217037
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 27216957  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  27216958 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 27217037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16386242
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | || |  |||||||||||| ||||||    
T  16386269 aattgtatttcatcaacatcttaaatat 16386242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410177
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16410156  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  16410157 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16410177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 143
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275289
Alignment:
Q  28 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 24275272  T
Q  127 agtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  24275273 agtcaacaacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 136
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213795
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16213781  T
Q  123 tgcaagtcatcaac 136  Q
    | ||||||| ||||    
T  16213782 tccaagtcaacaac 16213795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443509
Alignment:
Q  23 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||| |||| |||||| |     
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa-cagcatgacataataatatcaat 40443491  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatct 140  Q
    | ||| ||||||||||||    
T  40443492 ttcaattcatcaacatct 40443509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212122
Alignment:
Q  21 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 118  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||    
T  26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatat 26212093  T
Q  119 cgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    | | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  26212094 caattgcaattcaacaacatcttaaatat 26212122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386391
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 3386391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869396
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13869396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110606
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20110606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847881
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 91  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831423
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13831423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 98
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589115
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 98  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatatgcagtatacaaa 10589115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15144037
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| | || || ||||| | |||||| |||||||| || ||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaaca 15144046  T
Q  135 acatctcaa 143  Q
    |||||||||    
T  15144045 acatctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898370
Alignment:
Q  28 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||   ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 38898438  T
Q  127 agtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  38898437 agtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacagtataa 38898370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 149
Target Start/End: Original strand, 14036282 - 14036384
Alignment:
Q  49 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc-atcaacatctcaaat 145  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||     
T  14036282 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaac 14036380  T
Q  146 atca 149  Q
    ||||    
T  14036381 atca 14036384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 149
Target Start/End: Original strand, 14346312 - 14346414
Alignment:
Q  49 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc-atcaacatctcaaat 145  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||     
T  14346312 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaac 14346410  T
Q  146 atca 149  Q
    ||||    
T  14346411 atca 14346414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154894
Alignment:
Q  27 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggcag 18154894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 18426070 - 18426179
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  18426070 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatcttaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 18426168  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  18426169 catcaaatcat 18426179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39267691 - 39267582
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||| |||||||| |     
T  39267691 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataaaattataaatat 39267593  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  39267592 catcaaatcat 39267582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 45169882 - 45169773
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  45169882 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 45169784  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  45169783 catcaaatcat 45169773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932802
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 14932802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356237
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15356237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360351
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 16324197 - 16324250
Alignment:
Q  213 tcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16324197 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagatcaacaacttagtttctaacctcta 16324250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 142
Target Start/End: Original strand, 16324135 - 16324171
Alignment:
Q  106 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctca 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324135 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctca 16324171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 26356156 - 26356106
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26356106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 26358608 - 26358558
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26358558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 93
Target Start/End: Original strand, 48991206 - 48991252
Alignment:
Q  47 cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 93  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  48991206 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtat 48991252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832509
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 2832509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9751572 - 9751500
Alignment:
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 193  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  9751572 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 9751500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Original strand, 18425668 - 18425743
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatata 173  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||    
T  18425668 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatata 18425743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Original strand, 18425870 - 18425945
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatata 173  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||    
T  18425870 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatata 18425945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9389705 - 9389649
Alignment:
Q  133 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattat 190  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9389705 caacatctcatatatcaa-cataattcatacaatgtatatacaattatataacattat 9389649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 90
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187083
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 12187083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138113
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 17138113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649557
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19649557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 9177766 - 9177718
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  9177766 tagaccgactcatgcagcttaattcaataataaacaacaacatatgcag 9177718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 12766 - 13011
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 12865  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||   |||| |||    
T  12866 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcatataattcaggctt 12965  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12966 actggaacaacaacagcaagataaaccacttagtttctaacctcta 13011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6001
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 6145  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||    
T  6144 aatgcaagtcattaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggctt 6045  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctc 264  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  6044 actgaaacaataacagcaagataaataacttagtttttaacctc 6001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11534
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 11391  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  11392 aatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatactattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 11488  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||| |||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11489 acttgaacattaacaccaaggtaaacaacttagtttctaacctcta 11534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 260
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2233
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 2096  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||    
T  2097 aatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagactt 2193  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 260  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2194 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaa 2233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28533
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 28512  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatct 140  Q
     | ||||| ||| ||||||||    
T  28513 aattgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4608
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 77  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19509
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 19367  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttact 223  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  |||||  |||||    
T  19368 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggttact 19466  T
Q  224 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19467 gaaacaacaacatcaagataaacaacttagtttctaacctcta 19509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 266
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10772
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10641  T
Q  136 catctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaaca 235  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |  | ||||   |||| ||||||| ||||||||||    
T  10642 catctcaaacatcgaacataattcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaaca 10741  T
Q  236 gtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10742 gcaagataaacaacttagtttcttacctcta 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 266
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15903
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaccatcatgatataataatatcgaat 15763  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 223  Q
    | ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| | ||||||||||||    
T  15764 gtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattatttcataagaatcagtcttact 15860  T
Q  224 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||| ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15861 ggatcattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctcta 15903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 260
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6850
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcg 6710  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    ||||||||| |||| |||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||   |||  |||    
T  6711 aatgcaagttatcatcattataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagctt 6810  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 260  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6811 actaaaacaacaacagcaagataaacaacttagattctaa 6850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 260
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14230
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcg 14090  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    ||||||||| |||| |||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||   |||  |||    
T  14091 aatgcaagttatcatcattataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagctt 14190  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 260  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14191 actaaaacaacaacagcaagataaacaacttagattctaa 14230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100619
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataataatatcgaatg 100477  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttact 223  Q
    ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | | || ||||||    
T  100478 caaatcaacaacatctcaaatat-taacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggcttact 100576  T
Q  224 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  100577 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctcta 100619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40050
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 40192  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttact 223  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||    
T  40191 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggcttact 40093  T
Q  224 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40092 gaaacaacaacatcaaggtaaacaacttagtttctaacctcta 40050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119948
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 94  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94588
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 94508  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  94509 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 94588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44573
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc--aaatcatcatgatataacaatatcga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |  ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaa 44551  T
Q  122 atgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  44552 atgcaagtcaacaacatctcaa 44573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17425
Alignment:
Q  28 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 17501  T
Q  127 agtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  17500 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacagtat-aacaacatcaa 17425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 98
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 98  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38547
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaa 38547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25176095
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 25175953  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttact 223  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||    
T  25175954 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 25176052  T
Q  224 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176053 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctcta 25176095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 187
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679750
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc-aatg 7679687  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacat 187  Q
     ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  7679688 taagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatataattatataacat 7679750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406222
Alignment:
Q  26 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttact 223  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||  |  ||||| |  || || ||||||    
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttact 28406179  T
Q  224 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28406180 aaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctcta 28406222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134093
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcga 121  Q
    |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaa-cagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcga 22134228  T
Q  122 atgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctta 221  Q
    |||||| |||  |||||||||  |||| |||||||| | | ||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22134227 atgcaa-tcaataacatctcatttatc-aacataatccatttaatgtatatac--------aacattataaacaacaccaattcatatgcatcagtctta 22134138  T
Q  222 ctggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134137 ctggaaaaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctcta 22134093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071865
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 23071971  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||  ||   |||| || ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  23071970 aatataa---atcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 23071874  T
Q  221 actggaaca 229  Q
    |||||||||    
T  23071873 actggaaca 23071865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7617
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 139  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 7736  T
Q  140 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagta 238  Q
    ||||| | ||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| || ||||||   |||| ||||||| ||||||||||  |    
T  7735 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaaca 7636  T
Q  239 agataaacaacttagtttc 257  Q
     ||||||||||||||||||    
T  7635 tgataaacaacttagtttc 7617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786787
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||||||| ||| |    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 18786910  T
Q  134 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 233  Q
    ||| || | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||   | || ||||||| ||||||||    
T  18786909 aacgtcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcatataatttaggcttactgaaacaacaa 18786811  T
Q  234 cagtaagataaacaacttagtttc 257  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  18786810 cagcatgataaacaacttagtttc 18786787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708553
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  23708738 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatca 23708641  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    | ||||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23708640 attgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcat 23708553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207515
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgaca 23207395  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||  || | | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| |||||| |||||||||||||    
T  23207396 tctcaac-attataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttacttgaacaacaacagt 23207494  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  23207495 aagataagcaacttagtttct 23207515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19672011
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 19671929  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaat 203  Q
    || |||||| | |||||||||||   ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19671930 aacgcaagtaaacaacatctcaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattat-aacaacatcaat 19672011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 262
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791516
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||   ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaaca 23791391  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||| || | | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||      
T  23791392 tctcaaacattatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaac 23791491  T
Q  238 aagataaacaacttagtttctaacc 262  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  23791492 aagataaacaacttagtttccaacc 23791516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105590
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22105510  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  22105511 tgcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 22105590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459437
Alignment:
Q  106 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaatt 204  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| || | |||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |    
T  22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaact 22459499  T
Q  205 catatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22459498 cgtatacatcagtcttactgaaacaataacagcaagataaacaacttagtttcttacctcta 22459437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25109126
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||  |  |||||||||||||||||| ||   || ||| ||| |    
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaatagttcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaata 25109005  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  25109006 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 25109105  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  25109106 aagataagcaacttagtttct 25109126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298809
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| |     
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatcttaaatat 298809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060639
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23060611  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23060612 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 23060639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520127
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 20520197  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  20520196 tctcaaacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaatcat 20520127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809120
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18809040  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  18809041 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 18809120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23131039
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23130959  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  23130960 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 23131039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133506
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23133426  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  23133427 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 23133506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709517
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23709597  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  23709596 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 23709517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23711998
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23712078  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  23712077 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 23711998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505556
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26505476  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  26505477 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 26505556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26508034
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26507954  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  26507955 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 26508034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402507
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34402587  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  34402586 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 34402507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682490
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39682410  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  39682411 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 39682490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337241
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||   ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatc 22337213  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     |||||||| || |||||||||||||||    
T  22337214 aaatgcaagacaacaacatctcaaatat 22337241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076568
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23076540  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  23076541 aattgcaagtcaacaatatcttaaatat 23076568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23285987
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | || || |||| ||||||     
T  23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa--aaca-gacataataatatca 23285960  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23285961 attgcaattcatcaacatcttaaatat 23285987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654381
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatc 23654409  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23654408 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 23654381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 38138
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413070
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataaca--atatcgaatgcaagtcatcaa 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaa 22413141  T
Q  136 catctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    |||||| || |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22413140 catctc-aacatcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcat 22413070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571574
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 571494  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  571495 tgcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 571574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726172
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6726092  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    || |||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  6726093 tgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 6726172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309225
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatca 20309205  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  20309206 aattcaattcatcaacatct 20309225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135767
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23135687  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||    
T  23135688 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtat-aacaacatcaa 23135767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367951
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24367871  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24367872 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 24367951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577276
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||| | ||| || |||||||||| |||||| ||    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaa 28577196  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||||| || |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  28577197 tgcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 28577276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22731229
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22731257  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||| | ||||||    
T  22731256 aattgcaattcatcaacatattaaatat 22731229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103396
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |  |||||     
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacatgattatatca 23103419  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||| ||| |||||||||||||||    
T  23103418 aattcaattcatcaacatctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660148
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | || ||  |||| |||| ||||||     
T  23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaac-aacagcaacataggcagtatacgaaacaggatgacataataatatca 23660121  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  23660122 aatgcaaatcaacaacatcttaaatat 23660148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039477
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32039563  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  32039562 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 32039477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214906
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 32214988  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  32214987 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 32214906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155045
Alignment:
Q  27 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |||    
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 21155122  T
Q  126 aagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21155121 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 21155045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898180
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24898261  T
Q  122 atgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24898260 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 24898180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900663
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24900744  T
Q  122 atgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24900743 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 24900663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903140
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24903221  T
Q  122 atgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24903220 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 24903140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905617
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24905698  T
Q  122 atgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24905697 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 24905617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908092
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24908173  T
Q  122 atgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24908172 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 24908092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 98
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946733
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataac-aatagcaacataggcagtatacaaa 8946733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040247
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacata 85  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24697709 - 24697538
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||| |||||||||    || ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  24697709 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaacaacaacgtaggcagtacatcaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 24697610  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatat 209  Q
    |||||||  ||| | | ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| || ||||||    
T  24697609 tctcaaacttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataaaatcatat 24697538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 192
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137467
Alignment:
Q  26 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 43137398  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
    ||||||| |||| |||||| |  ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  43137399 caagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 43137467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22738175
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22738203  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  22738202 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 22738175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967424
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38967424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029966
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45029966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643054
Alignment:
Q  27 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529641
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaa 24529641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 197
Target Start/End: Original strand, 23004767 - 23004926
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||   |||  |  ||| ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  23004767 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaaca 23004866  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaac 197  Q
    ||||||| |||| | ||||| |   ||||| |||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  23004867 tctcaaacatcatatataatccacataatgcatatacaaatatttaacatcattaacaac 23004926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 1283657 - 1283766
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  1283657 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 1283755  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  1283756 catcaaatcat 1283766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30344867 - 30344758
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  30344867 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 30344769  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  30344768 catcaaatcat 30344758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451981
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcag 32451981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 92
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 92  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 74
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616238
Alignment:
Q  28 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaa 25616238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 91
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32336
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaat 32201  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 223  Q
    | || |||||||| |||||| |||||| |||||| | | |||||||||||      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32202 gtaa-tcatcaacgtctcaattatcaa-cataatccatttaatgtatata------tacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 32293  T
Q  224 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32294 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 32336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53424
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 139  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 53552  T
Q  140 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagta 238  Q
    ||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||  |    
T  53551 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacataa 53452  T
Q  239 agataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  53451 agataaacaacttagtttcttacctcta 53424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8330 - 8230
Alignment:
Q  107 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattca 206  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  ||| |||||  || |||||||||||||||| | |||||| |||    
T  8330 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataattcatacaatatatatttaattatataacattataaatatcatcaaatca 8231  T
Q  207 t 207  Q
    |    
T  8230 t 8230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132896
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaat 132761  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 223  Q
    | || |||||||| |||||| |||||| |||||| | | |||||||||||      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132762 gtaa-tcatcaacgtctcaattatcaa-cataatccatttaatgtatata------tacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 132853  T
Q  224 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132854 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 132896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 266
Target Start/End: Original strand, 62216 - 62440
Alignment:
Q  39 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||   || ||||||    
T  62216 acttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaacatcatggtataataatatcgaatgca---caacaacat 62312  T
Q  139 ctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| | ||||||   | |||| ||||||| |||||||||||     
T  62313 ctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactgaaacaacaacagc 62411  T
Q  238 aagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  62412 aagataaacaacttagtttctaacctcta 62440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136857
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 136777  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  136778 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 136857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139326
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 139246  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  139247 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 139326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144264
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 144184  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  144185 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 144264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134388
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 134308  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  134309 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 134388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141795
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 141715  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  141716 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 141795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 916
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatcatcatgatataacaacatcg 1056  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca-attcatatgcatcagtct 219  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| | |||  ||    |||| ||    
T  1055 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatt--tacaattcaggct 958  T
Q  220 tactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaac 261  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  957 tactgaaacaacaacaacaagataaataacttagtttctaac 916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 260
Target Start/End: Original strand, 12942 - 13178
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12942 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcagcatgatataacaatatcg 13038  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | ||     |||| |||    
T  13039 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatccaattcaggctt 13138  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 260  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13139 actgaaacaacaacagcaagataaataacttagtttctaa 13178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18277 - 18121
Alignment:
Q  102 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 201  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||  ||||||||||    
T  18277 tcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  202 attcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttct 258  Q
    |  |||||   |||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18177 aaacatataattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagcaacttagtttct 18121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34365
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacccatcatgatataataatatcg 34222  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  34223 aatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcaagtaatatatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 34319  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||||||| |  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34320 actggaaaattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctcta 34365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Original strand, 273 - 326
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaa 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 147
Target Start/End: Original strand, 13141 - 13218
Alignment:
Q  71 acaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  13141 acaaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 13218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2521
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatcatcatgttataacaatattgaatg 2663  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttact 223  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||    
T  2662 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 2564  T
Q  224 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2563 gaaacaacatcagcaagataaacaacttaatttctaacctcta 2521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32780
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  32538 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatca 32635  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 220  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |  | ||||   |||| |||    
T  32636 aatgcaa-tcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattatataattcaggctt 32734  T
Q  221 actggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32735 actgaaacaataacaacaagataaacaacttagtttcttacctcta 32780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51936
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcag 51936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 266
Target Start/End: Original strand, 5657 - 5887
Alignment:
Q  35 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  5657 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatgaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaaca 5756  T
Q  135 acatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaa 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| ||||||||    
T  5757 acatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaa 5855  T
Q  234 cagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||  |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5856 caacaagataaa-aacttagtttttaacctcta 5887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 266
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12813
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 12686  T
Q  140 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagta 238  Q
    ||||||| | | | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||| || ||||||| ||||||||||| |    
T  12687 tcaaatacttatatataattc-agtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacattagacttactgaaacaacaacagca 12785  T
Q  239 agataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||    
T  12786 agataaacaacttagtttattacctcta 12813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14573
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaagaaaatcatcatgatatagtaatatcgaatg 14715  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttact 223  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| | |||||| |||||  || ||||| |  ||||| |  ||||| ||||||    
T  14714 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggcttact 14616  T
Q  224 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14615 gaaacaacaacagcaagatatacaacttagtttctaacctcta 14573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128853
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  128973 tctcaaacatcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaacagt 128874  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  128873 aagataagcaacttagtttct 128853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 255
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78556
Alignment:
Q  44 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctc 78443  T
Q  142 aaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaaga 241  Q
     || |||    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  78444 -aacatcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 78542  T
Q  242 taaacaacttagtt 255  Q
    ||| ||||||||||    
T  78543 taagcaacttagtt 78556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 147
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116551
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| |||| || ||||| ||||  ||||| |||    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataatcatatcaaat 116527  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  116528 gcaagtcaacaacatctcaaatat 116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15760
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcg 15799  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattc 159  Q
    |||||||||||||| ||||  | | ||||||||||||||    
T  15798 aatgcaagtcatcatcatcatatacatcaaacataattc 15760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178947
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 178947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15761 - 15714
Alignment:
Q  213 tcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaa 260  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15761 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaa 15714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2680
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 124  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatg 2824  T
Q  125 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatataca-acta-tataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtctta 221  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| | | |||||| |  |||||||||| | || | |||| |||||  |||||||  |  ||||| |  ||||| ||||    
T  2823 caaatcaacaacatctcaaatatc-agcttaattcataaaatgtatatatatacaattataccattaacaacaacaatagatcatattaaatcaggctta 2725  T
Q  222 ctggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2724 ctgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctcta 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7934
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 139  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatc 8062  T
Q  140 tcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagta 238  Q
    | ||| || || | |||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  8061 ttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtctcactggaacaacatcagca 7962  T
Q  239 agataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||    
T  7961 agataaacaacttagtttcatacctcta 7934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 7952
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaac 8081  T
Q  134 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 233  Q
    |||||| | || |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||   |||| |||||||    |||||    
T  8080 aacatcac-aacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcatataattcaggcttactg---aaacaa 7985  T
Q  234 cagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7984 cagcaagataaacaacttagtttcttacctcta 7952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29156
Alignment:
Q  68 ataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatg 167  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||   |||| |||||||| ||| || |||| ||    
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaactatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtactg 29258  T
Q  168 tatatacaactatataacat---tataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctc 264  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29257 tatatacaattatataacataattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctc 29158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1013
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 1091  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1090 aatgtaa---atcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattat-aacaacatcaa 1013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97244
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 97123  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  97124 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagt 97223  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  97224 aagaaaagcaacttagtttct 97244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106522
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 106401  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  106402 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagt 106501  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  106502 aagaaaagcaacttagtttct 106522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38641
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 38721  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | | |||||||  ||| ||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  38720 gcaagtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 38641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6166
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 6287  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||  ||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  6286 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 6187  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
     |||||| |||||||||||||    
T  6186 gagataagcaacttagtttct 6166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 13840 - 13793
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  13840 cttagaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacaacaacatagg 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38555
Alignment:
Q  44 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctc 38438  T
Q  142 aaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaaga 241  Q
    ||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||    ||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38439 aaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 38538  T
Q  242 taaacaacttagtttct 258  Q
    ||| |||||||||||||    
T  38539 taagcaacttagtttct 38555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20029
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaa 20029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2094
Alignment:
Q  79 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaact 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-agcataattcatataatgtatatacaatt 2183  T
Q  179 atataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||||| |||||  ||||||||    ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2182 atataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttattttctaacctcta 2094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 3090
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 3173  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| |||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  3172 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 3090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19768
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 19888  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    |||| |  |||| | |||| || ||||||| |||||||  ||||| ||||||| || |||||||| ||||||   |||  ||||||||||||||||||||    
T  19887 tctc-agcatcataaataactcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcatataattcatgcttactggaacaacaacagt 19789  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  19788 aagataagcaacttagtttct 19768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40038
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 40011  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  40012 aatgcatgtcaataacatcttaaatat 40038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 49030 - 48921
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  49030 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 48932  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  48931 catcaaatcat 48921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136252
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 136372  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaaca-tcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacag 236  Q
    || ||   |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||   |||| ||||||| |||||||||||    
T  136371 tcacatc-atcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacag 136273  T
Q  237 taagataaacaacttagtttc 257  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  136272 caagataaacaacttagtttc 136252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 144960
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 145080  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaaca-tcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacag 236  Q
    || ||   |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||   |||| ||||||| |||||||||||    
T  145079 tcacatc-atcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacag 144981  T
Q  237 taagataaacaacttagtttc 257  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  144980 caagataaacaacttagtttc 144960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174838
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 93  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 174838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 91  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24001 - 23898
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24001 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 23905  T
Q  121 aatgcaa 127  Q
    |||||||    
T  23904 aatgcaa 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11651
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 11563  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
     | | |||| | ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11564 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 11651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17961
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaacatcatgatataataatatcg 18049  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    || |||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18048 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 17961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2241
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaa 2241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38190
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 38278  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
     | | |||| | ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38277 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 38190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21937 - 21828
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21937 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatctacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21839  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  21838 catcaaatcat 21828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24699 - 24587
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataa-ttcgtgtaatgtatata--caactatataacattataaa 193  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  24699 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataatttcatgcaatatatatatccaattatataacattataaa 24601  T
Q  194 caacatcaattcat 207  Q
     | |||||| ||||    
T  24600 tatcatcaaatcat 24587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27683
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||| |||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 27756  T
Q  136 catctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  27755 catctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcat 27683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 147
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1158
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacatc 1150  T
Q  140 tcaaatat 147  Q
    ||||||||    
T  1151 tcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2494 - 2321
Alignment:
Q  90 gtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacatta 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||   |||| |||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2494 gtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatttaatgtatatacaattatataacatta 2398  T
Q  190 taaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2397 taagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaatagcaaggtaaaaaacttagtttctaacctcta 2321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 190
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25276
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaac 25219  T
Q  134 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattat 190  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25220 aacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattat 25276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Original strand, 619 - 725
Alignment:
Q  102 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 201  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  619 tcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 717  T
Q  202 attcatat 209  Q
    | ||||||    
T  718 aatcatat 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16034
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||| |||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 16107  T
Q  136 catctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||||||| | ||  | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  16106 catctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcat 16034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13316
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatc 13246  T
Q  140 tcaaa--tatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    | |||    ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  13247 tgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcat 13316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 92
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2732
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  2680 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 178 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28775 - 28687
Alignment:
Q  178 tatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775 tatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctcta 28687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28806
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcat 105  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaatcatcat 28806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 147
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39602
Alignment:
Q  23 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaa 39577  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  39578 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 39602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13963 - 13854
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  13963 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacttcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 13865  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  13864 catcaaatcat 13854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 75210
Alignment:
Q  23 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaa 75235  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  75234 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 75210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103523
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  || |    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacaac 103638  T
Q  134 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 233  Q
    ||||||         | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| || ||||||   |||| ||||||| ||||||||    
T  103637 aacatc---------atacataattcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 103547  T
Q  234 cagtaagataaacaacttagtttc 257  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  103546 caggaagataaagaacttagtttc 103523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267898
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |    
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaata 267778  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcat-cagtcttactggaacaacaacag 236  Q
    |||| || |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||    
T  267779 tctc-aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcatat-catccaggcttactgaaacaacagcag 267876  T
Q  237 taagataaacaacttagtttct 258  Q
    |||| ||| |||||||||||||    
T  267877 taagctaagcaacttagtttct 267898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Original strand, 569 - 787
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 667  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    || | || |||| | ||||||| ||||||| |||||||   |||| | |||||  | || ||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  668 tc-ccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 766  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  767 tagataaacaacttagtttct 787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44702
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44727  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  44726 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 44702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26064
Alignment:
Q  28 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| |    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 26081  T
Q  127 agtcatcaacatctcaa 143  Q
    | ||| |||| ||||||    
T  26080 attcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 258
Target Start/End: Original strand, 54 - 243
Alignment:
Q  71 acaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| ||  ||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||     
T  54 acaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgc 153  T
Q  169 atatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttct 258  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |   | || ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  154 atatacatttatataacattattaacaacatcaaatcatttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaagatatgcaacttagtttct 243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3185
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||     
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 3208  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    |||| || ||| |||||||||||    
T  3207 aatgtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 17214
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc---aaatcatcatgatataacaatat 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||| || ||||| |||| |||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatat 17239  T
Q  119 cgaatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  17238 caaatgcaagtcaacaacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79264
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||   ||| || ||||| |||| ||| || ||||||||||| |||| |    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgt 79333  T
Q  139 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  79332 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 79264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26021
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||     
T  25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatca 25994  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    
T  25995 aatgcaagtaaacaacatctcaaatat 26021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 39858 - 39983
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||     
T  39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatca 39956  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    
T  39957 aatgcaagtaaacaacatctcaaatat 39983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1900 - 1681
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||| |||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  1900 cttagaccgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 1801  T
Q  138 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 237  Q
    ||||||  |||| | ||||||  ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||   |||| |||||||||||||||| |||    
T  1800 tctcaac-atcatatataatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactggaacaacaatagt 1702  T
Q  238 aagataaacaacttagtttct 258  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  1701 aagataggcaacttagtttct 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2267 - 2179
Alignment:
Q  178 tatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2267 tatacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactgggataagatcagtaagataaacaacttagtttctaacctcta 2179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13337
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 13309  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  13310 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 13337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 1851 - 1977
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 1949  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  1950 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 207541 - 207467
Alignment:
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaaca 195  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  207541 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatataattatataacattataaaca 207467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33067
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 33040  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  33041 aatgcaagttaacaacatcttaaatat 33067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 38761 - 38886
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 38859  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||| | | |||||||| ||||||    
T  38860 aatgcaaataaacaacatcttaaatat 38886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9807
Alignment:
Q  19 ggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 83  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 9807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32952
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 32979  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  32978 attgcaattcaacaacatcttaaatat 32952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46053
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 46026  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  46027 attgcaattcaacaacatcttaaatat 46053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16235
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || || ||||| | ||||||    
T  16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatc 16211  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
     |||||||| || || ||||||||    
T  16212 aaatgcaagccaacatcatctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17389
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 83  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 4849 - 4968
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 4947  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatct 140  Q
     ||||||| ||| ||||||||    
T  4948 aaatgcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20924
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20844  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20845 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 20924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37998
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 37918  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  37919 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 37998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1406
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||  |||||     
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtacaa--catcatgacataattatatca 1386  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  1387 aattcaattcatcaacatct 1406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7383
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--caacatgaaataattatatca 7363  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  7364 aattcaattcatcaacatct 7383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158435
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 158515  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  158514 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 158435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339889
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat 339968  T
Q  124 gcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
     ||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||  ||||||| ||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  339967 -caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 339889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3596
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 3568  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  3569 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 3596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 343 - 468
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||  | |||||  ||| ||||||     
T  343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacataggcagtatacaaaatagcatgacgtaataatatca 441  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    | || |||||| |||||||| ||||||    
T  442 attggaagtcaacaacatcttaaatat 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52039
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatc 52011  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  52012 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 52039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167973
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||  | ||||| |||| ||||||    
T  168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 168001  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  168000 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 167973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10891
Alignment:
Q  23 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 10869  T
Q  122 atgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  10870 atgcaagtcaacaacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8528
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| ||||||     
T  8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacagcaacataggcagtatcaaaaacagcatgacataataatatca 8555  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  8554 attgcaagtcaacatcatcttaaatat 8528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4871
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 4791  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  4792 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 4871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13569
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13489  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||    
T  13490 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtat-aacaacatcaa 13569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 147
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23008
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-ccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22983  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||    
T  22984 tgcaagtcaacaacatcttaaatat 23008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14124
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14044  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  14045 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 14124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 51582 - 51699
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    |||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  ||| |     
T  51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattataaca 51679  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  51680 aattcaattcatcaacatct 51699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 1043
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||  | ||||| |||| ||||||    
T  1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 1071  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  1070 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 1043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15466
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aagagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 15486  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    | | ||| ||||||||||||    
T  15485 atttcaattcatcaacatct 15466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 90
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7359
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 7359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32184
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||     
T  32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaa-caacatgacataataatatca 32164  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    | | ||| ||||||||||||    
T  32165 atttcaattcatcaacatct 32184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 6116
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--aacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| | ||| || ||||| || | ||||    
T  6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
Q  118 tcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
    || | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  6145 tcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16397
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatca 16379  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacat 138  Q
    ||| ||| ||||||||||    
T  16380 aattcaattcatcaacat 16397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16952
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16881  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
    ||||||||| |||| |||||| || | | | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  16882 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 16952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10472
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 93  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtat 10472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13615
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| || | ||||||     
T  13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacatgataatatca 13595  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    | | | | ||||||||||||    
T  13596 atttcgattcatcaacatct 13615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16599
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 16623  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
     |||| |||||| || ||||||||    
T  16622 aaatggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24297
Alignment:
Q  39 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaac 24308  T
Q  137 atctcaaatat 147  Q
    |||| ||||||    
T  24307 atcttaaatat 24297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20372
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-tcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 20427  T
Q  140 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 193  Q
    |||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20426 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaa 20372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 75
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128805
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa 75  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaa 128805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35962 - 35853
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  35962 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 35864  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  35863 catcaaatcat 35853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 5132
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 123  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||  |||||||| ||||  ||||| |||    
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatacaa--catcatgacataattatatcaaat 5149  T
Q  124 gcaagtcatcaacatct 140  Q
     ||| ||||||||||||    
T  5148 tcaattcatcaacatct 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9360
Alignment:
Q  23 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcga 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||   ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaa 9338  T
Q  122 atgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  9339 atgcaagtcaacaacgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 98
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4788
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 98  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaa 4788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8598
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| ||  |||| |||| ||||||    
T  8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatc 8577  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatct 140  Q
     | ||||||||| ||||||||    
T  8578 aattgcaagtcaacaacatct 8598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 1053
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||     
T  1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattatatca 1073  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatct 140  Q
    | | ||| ||||||||||||    
T  1072 atttcaattcatcaacatct 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 159
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2091
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatc 2050  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattc 159  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  2051 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattc 2091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9193
Alignment:
Q  76 cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 136  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9133 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 9193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12241
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-------aaacagcaacaca-gcagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaa 12155  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  12156 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 12241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40577
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaa 40497  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | | |||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  40498 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 40577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 4508 - 4633
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatc 119  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||  || ||||| |||| ||||||    
T  4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 4605  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4606 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 4633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12215
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatc 119  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||  || ||||| |||| ||||||    
T  12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 12187  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12188 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 12215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22167
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatc 119  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||  || ||||| |||| ||||||    
T  22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 22139  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 147  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22140 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161083
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | ||||||| | ||| ||| |||| |||| |||||| ||    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaa 161155  T
Q  123 tgcaagtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  161154 tgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 161083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Original strand, 106 - 289
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 203  T
Q  123 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 208  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  204 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47065
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 91  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11406
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 11383  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  11384 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 11406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 207
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225593
Alignment:
Q  79 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaac 177  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| || || | |||||||  |||||| ||||||||     
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaat 225563  T
Q  178 tatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  225564 tatatcacattataaacaacatcaaatcat 225593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 189253 - 189144
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  189253 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 189155  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  189154 catcaaatcat 189144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4355
Alignment:
Q  27 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 4355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 207
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4396
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-gacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaa 4311  T
Q  123 tgcaagtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 207  Q
    |||||||| |||||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| |||  ||| |||||||||| ||||    
T  4312 tgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca--atatacaacatcaaatcat 4396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4888
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggc 88  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12293
Alignment:
Q  22 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || | ||| || ||||| | || ||||||     
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatca 12316  T
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaa 143  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  12315 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 12293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 127
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2783
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaa 2783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21030
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    |||||| |||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacatct 140  Q
     | ||||| ||| ||||||||    
T  21010 aattgcaattcaacaacatct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1393
Alignment:
Q  27 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 1393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11447
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 119  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 11466  T
Q  120 gaatgcaagtcatcaacat 138  Q
     | | ||| ||||||||||    
T  11465 aatttcaattcatcaacat 11447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Original strand, 13638 - 13733
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataa-ttcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 192  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  13638 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaactatataacattataa 13733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 23843 - 23892
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36503
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Original strand, 29931 - 29990
Alignment:
Q  24 tcatcatcttaatc-aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 83  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29931 tcatcatcttaattgaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 29990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 627 - 736
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  627 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 725  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  726 catcaaatcat 736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 193
Target Start/End: Original strand, 6 - 92
Alignment:
Q  107 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 193  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  6 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 92  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11377 - 11268
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  11377 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 11279  T
Q  197 catcaattcat 207  Q
    |||||| ||||    
T  11278 catcaaatcat 11268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32536 - 32432
Alignment:
Q  97 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  32536 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 32438  T
Q  197 catcaa 202  Q
    ||||||    
T  32437 catcaa 32432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 251
Target Start/End: Original strand, 165 - 252
Alignment:
Q  163 taatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagtaagataaacaactt 251  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  165 taatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttact-gaacaacaatagtaatataaacaactt 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 83
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 97
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4599
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa 97  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacagcataggcagtatgcaa 4599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29607
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaa 29607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12830 - 12758
Alignment:
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 193  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  12830 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 12758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9856 - 9784
Alignment:
Q  121 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 193  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  9856 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 9784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 202
Target Start/End: Original strand, 27912 - 28012
Alignment:
Q  103 catgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 201  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| |||||  | ||||| |||| |||| ||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 28011  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  28012 a 28012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 75
Target Start/End: Original strand, 289 - 339
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa 75  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  289 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaaa 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 92  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 90
Target Start/End: Original strand, 1881 - 1945
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 159 - 208
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  159 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10575
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 90  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataac-aatagcaacataggcag 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21871
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 21871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29763
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 29763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69843
Alignment:
Q  25 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 69843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5534 times since January 2019
Visitors: 4854