View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0755_low_14 (Length: 481)

Name: NF0755_low_14
Description: NF0755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0755_low_14
NF0755_low_14
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (19-460)||(17201747-17202188)
chr3 (7-460)||(13963931-13964384)
chr3 (7-460)||(30150468-30150921)
chr3 (7-460)||(8270975-8271428)
chr3 (13-457)||(17321176-17321620)
chr3 (19-362)||(25768424-25768767)
chr3 (7-461)||(6149429-6149883)
chr3 (6-460)||(22149321-22149775)
chr3 (10-460)||(15943174-15943624)
chr3 (307-371)||(22259971-22260035)
chr3 (307-371)||(22268464-22268528)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (13-460)||(22364852-22365299)
chr6 (7-460)||(16378855-16379308)
chr6 (7-460)||(16646451-16646904)
chr6 (7-460)||(21412008-21412461)
chr6 (64-458)||(14149746-14150139)
chr6 (7-460)||(1660325-1660778)
chr6 (19-460)||(16103651-16104092)
chr6 (7-226)||(18421144-18421363)
chr6 (289-458)||(19982365-19982534)
chr6 (7-313)||(17786689-17786996)
chr6 (7-75)||(15007241-15007309)
[»] chr8 (5 HSPs)
chr8 (19-460)||(21193344-21193785)
chr8 (7-460)||(20649135-20649588)
chr8 (7-460)||(21847117-21847570)
chr8 (175-460)||(16415634-16415918)
chr8 (13-68)||(22553265-22553320)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (7-461)||(25041-25494)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (7-460)||(22128847-22129301)
chr1 (7-460)||(20827801-20828254)
chr1 (7-458)||(41214270-41214721)
chr1 (10-460)||(20928551-20929001)
chr1 (64-460)||(20528550-20528946)
chr1 (350-460)||(23312571-23312681)
chr1 (32-445)||(20172643-20173056)
chr1 (6-81)||(20959744-20959819)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (33-458)||(20242-20667)
scaffold0021 (33-458)||(29818-30243)
scaffold0021 (7-461)||(8667-9121)
scaffold0021 (163-460)||(91013-91310)
[»] chr7 (7 HSPs)
chr7 (7-460)||(27104120-27104573)
chr7 (7-460)||(7827371-7827824)
chr7 (7-460)||(27173752-27174205)
chr7 (7-462)||(4443392-4443847)
chr7 (7-458)||(13459484-13459943)
chr7 (7-107)||(16575119-16575219)
chr7 (7-107)||(16590443-16590543)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (7-460)||(24584596-24585049)
chr5 (7-461)||(21828202-21828655)
chr5 (7-460)||(23509071-23509524)
chr5 (98-328)||(33313828-33314075)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (7-460)||(15289495-15289948)
chr4 (52-372)||(18272656-18272976)
chr4 (7-460)||(15000128-15000588)
chr4 (70-460)||(12339274-12339664)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (7-458)||(25131574-25132026)
chr2 (10-461)||(22281217-22281668)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (7-458)||(35513-35963)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (7-460)||(4147-4599)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (28-460)||(5374-5806)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (7-460)||(97038-97489)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (7-460)||(3266-3719)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (7-460)||(12671-13124)
scaffold0467 (64-460)||(18-414)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (7-461)||(25689-26142)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (7-462)||(3999-4454)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (7-460)||(26907-27360)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (7-459)||(3215-3675)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (7-460)||(27287-27740)
scaffold0008 (163-460)||(130982-131282)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (7-461)||(101-555)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (186-458)||(32394-32665)
scaffold0151 (7-140)||(32257-32391)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (117-367)||(2180-2430)
scaffold0193 (7-85)||(2427-2505)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (64-460)||(4768-5163)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (10-460)||(6200-6653)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (118-460)||(402-744)
[»] scaffold0465 (2 HSPs)
scaffold0465 (169-460)||(12127-12418)
scaffold0465 (7-89)||(11999-12081)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (288-460)||(24474-24646)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (10-461)||(8732-9175)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (262-460)||(16412-16610)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (7-434)||(7776-8203)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (323-460)||(73290-73427)
scaffold0011 (323-460)||(77671-77808)
scaffold0011 (349-461)||(182500-182612)
scaffold0011 (7-182)||(73065-73240)
scaffold0011 (7-182)||(77446-77621)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (356-460)||(35587-35691)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (289-458)||(77934-78103)
scaffold0058 (67-209)||(78183-78325)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (7-203)||(3178-3374)
scaffold0302 (412-460)||(1722-1770)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (289-460)||(49170-49341)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 17202188 - 17201747
Alignment:
Q  19 tgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatatt 118  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17202188 tgggtgcagggcatggagaggatatttcgtgctatggtgacgagtgatgaacagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtatt 17202089  T
Q  119 ggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagattt 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17202088 agtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcaaagttcaaagctgagttcttgaggaagtattttcctgaagattt 17201989  T
Q  219 aaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcg 318  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17201988 gaggaccaggaaggaagtggagttcctgaacttgaagcaagggagcatgtccatagctgtgtatgtggcgaagtttgaggagcttttgaggttttgtccg 17201889  T
Q  319 tacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgag 418  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  17201888 tacatcaatgctgaggatgcgatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgtttaggagatcctag 17201789  T
Q  419 attttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17201788 attttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 17201747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 13963931 - 13964384
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||||||| || | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||| |||||    
T  13963931 ggagctcagacatggttgcaaggcatggaaaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgttgagg 13964030  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13964031 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattgatggagaggttgtgacttggacaaggttcaaagctgagtttttgaggaagtactt 13964130  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||| |     
T  13964131 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 13964230  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  13964231 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 13964330  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13964331 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 13964384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 30150921 - 30150468
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| || |||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  30150921 ggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 30150822  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30150821 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 30150722  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| || || ||| ||| || |||||||||||||||| |     
T  30150721 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 30150622  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  30150621 aggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 30150522  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30150521 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 30150468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 8270975 - 8271428
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || | ||||||||||||||    
T  8270975 ggagctcagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcaaaaggtgaggttggctactcgcatgcttgctgagg 8271074  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8271075 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 8271174  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||| |     
T  8271175 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 8271274  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  8271275 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcaaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 8271374  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8271375 aggagatccgagactttgatactttggtgaataagtgtcgtatgtttgatgatg 8271428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 457
Target Start/End: Original strand, 17321176 - 17321620
Alignment:
Q  13 cagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccg 112  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| |    
T  17321176 cagacatgggtgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctaaccacatgcttgctaaggaggctg 17321275  T
Q  113 aatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctga 212  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17321276 agtattggtggacgaatgctaaggggagactcgagataggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggttgagtttttgaggaagtactttccaga 17321375  T
Q  213 agatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttt 312  Q
     ||||| || || || ||||||||||| ||| |||||||  || || ||||||||||||| |||||| |||  |  |||||||| |||||||||||||||    
T  17321376 ggatttgagaactagaaaggaagtggagttcttgaacttgcagtaagggagcatgtccgtggctgagtatgcagcaaagtttgaagagctttcgaggttt 17321475  T
Q  313 tgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggaga 412  Q
    |  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17321476 ttctcgtacattaatgttgaggatgcgatggtgtccaagtgtgtgaaatttgaaagtggacttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggaga 17321575  T
Q  413 tccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatg 457  Q
    | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17321576 ttcgagagtttgataccttggtgcataagtgtcgtatgtttgatg 17321620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25768767 - 25768424
Alignment:
Q  19 tgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatatt 118  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  25768767 tgggtgcagggcatagagaggatattccgtgctatggtgacgagtgatgaccaaaaggtcagattggcgactcatatgcttgctgaggaggccgaacatt 25768668  T
Q  119 ggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagattt 218  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25768667 ggtggactaatgccaaaggaagacttgagttgggaggagaagttgtgacctgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtatttccctgaagattt 25768568  T
Q  219 aaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcg 318  Q
     |||||||||||||| || || || |||||||| || ||| | ||||| || ||||||  | |||  |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  25768567 gaggaccaggaaggaggttgagtttctgaacttgaaacaaggaagcatatctgtagctacgtatgcagaaaagtttgaggagctttcaaggttttgtccg 25768468  T
Q  319 tacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagtt 362  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25768467 tacatcaatgctgaagatgctatggtttcaaagtgtgtgaagtt 25768424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 461
Target Start/End: Original strand, 6149429 - 6149883
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||||| || |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||||||  | | |||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||    
T  6149429 ggagcacaaacttgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggtgacaggaggtgaccagaaggtcaggctagcgactcatatgcttgctgagg 6149528  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||    
T  6149529 aagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggcgaagtttaaggttgaattcttgaggaagtattt 6149628  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     |||||||| || ||||||| ||||||  | || || |||||  | || ||| | |||||||| || || ||| ||| || |||||||||||| ||||||    
T  6149629 ccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggaactttcg 6149728  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  6149729 aggttttgcccctacatcaatgctgaggatgctatggttttgaagtatgtgaagtttgagagtgggcttaggccgaatatctatcagtacatgtgtgttc 6149828  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6149829 aggagatccgagactttgatactttggtgcattagtgttgtatgtttgatgatgt 6149883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 460
Target Start/End: Original strand, 22149321 - 22149775
Alignment:
Q  6 aggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgag 105  Q
    |||||| ||||  |||||| ||||||| ||||||||||| | |||  |||||||| | |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  22149321 aggagctcagatttgggtgtagggcatagagaggatctttcatgcggtggtgactggcgatgaccagaaggttaggttggctactcatatgcttgctgag 22149420  T
Q  106 gaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtact 205  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||||||||| |  || || || ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |    
T  22149421 gaggcagagtattagtggactaatgccaaaggaagacttgagatggagggggaggtggtgacttgggcaaggttcaaggccgagttcttgaggaagtatt 22149520  T
Q  206 ttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttc 305  Q
    || | |||||||| ||||| |||||||  || || ||| | ||||| |||||| | || ||||| || || ||| ||| || ||||||||| ||| || |    
T  22149521 tttcggaagatttgaggacaaggaaggtggtagaattcttaaacttgaagcaaggaagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaagagtttgc 22149620  T
Q  306 gaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgtt 405  Q
     |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || |||  ||| |||||||||| || |||||     
T  22149621 aaggttttgtctgtacatcaatgtcgagaatgcaatggtgtccaagtgtgtgaagtttgagagtgggctttggctagatgtctatcagtacatgtgtgtg 22149720  T
Q  406 caggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  22149721 caagagatccgtgattttgacactttggtgcacaagtgtcatatgtttgatgatg 22149775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 460
Target Start/End: Original strand, 15943174 - 15943624
Alignment:
Q  10 gcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggagg 109  Q
    |||||||| |||||| | || ||||||  ||| ||||| || ||||| ||  | |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||| |  ||||||| |    
T  15943174 gcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaag 15943273  T
Q  110 ccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcc 209  Q
    | ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||| | |  || || || ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| || ||    
T  15943274 cggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttaaggaagtatttccc 15943373  T
Q  210 tgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgagg 309  Q
     ||||| || ||||||| ||| ||  | || || |||||  |||||||| | | | |||| || || ||| ||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  15943374 ggaagacttgaggaccaagaatgagattgagtttctgaatctaaagcaaggaatcttgtcagtggccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgagg 15943473  T
Q  310 ttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcagg 409  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15943474 ttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgcgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcagg 15943573  T
Q  410 agatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15943574 agatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 15943624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22260035 - 22259971
Alignment:
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgg 371  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  22260035 aggttttgtccttatatcaatgttgaagatgctatggtgtccaagtgtgttaagtttgagagtgg 22259971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 371
Target Start/End: Original strand, 22268464 - 22268528
Alignment:
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgg 371  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  22268464 aggttttgtccttatatcaatgttgaagatgctatggtgtccaagtgtgttaagtttgagagtgg 22268528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 460
Target Start/End: Original strand, 22364852 - 22365299
Alignment:
Q  13 cagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccg 112  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  22364852 cagacttgggtgcagggcatagagaggatattccgtgctatggtgacaagtgatgactagaaggtcaggttggttactcacatgcttgctgaggaggccg 22364951  T
Q  113 aatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctga 212  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  22364952 agtattggtggactaattctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcaaagttcaaagttgagttcttgaggaagtatttccctga 22365051  T
Q  213 agatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttt 312  Q
    || ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||| ||||||||||| |||    
T  22365052 aggtttgaggaccaggaaggaagtagagttcttgaacttgtagcaagggagcatgtctgtagctgagtatacggcgaagtttgaagagctttcgagattt 22365151  T
Q  313 tgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggaga 412  Q
    | | | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22365152 tttccatacatcaatgttgaagatgcaatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgagcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggaga 22365251  T
Q  413 tccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22365252 tccgagattttgatactttggtgtataagtgtcgtatgtttgatgatg 22365299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 16378855 - 16379308
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| || |||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  16378855 ggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 16378954  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16378955 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 16379054  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| || || ||| ||| || |||||||||||||||| |     
T  16379055 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 16379154  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  16379155 aggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 16379254  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16379255 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 16379308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 16646451 - 16646904
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  16646451 ggagctcagacatggttgcaaggcatggagagaatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 16646550  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | | ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16646551 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattgatggaggggttgtgacttggacaacgttcaagactgagtttttgaggaagtactt 16646650  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||| |     
T  16646651 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 16646750  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  16646751 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgtta 16646850  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16646851 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 16646904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 21412008 - 21412461
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| || ||||| ||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  21412008 ggagctcagacttgggtgcagggcatggagcggatatttcgtgctatggtgacgggagatgaccaaaaggccagattggcgactcatatgcttgctgagg 21412107  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    |||| || || |||||||||||||  || |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  21412108 aggctgagtactggtggactaatgtcaaaggaagatttgagatgggaggagaagttgtgacctgggcgaagttcaaagcagaattcttaaggaagtattt 21412207  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     ||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||| | |||||  | |||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21412208 ccctgaagatttgagaactaggaaggaggtggaatttctgaacctgaagcagggaagcatgtctgtagccgagtatgaggcgaagtttgaggagctttcg 21412307  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21412308 aagttttgtccgtacatcaatgctgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttc 21412407  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||    
T  21412408 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgttgcatgtttgttgatg 21412461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 64 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 14150139 - 14149746
Alignment:
Q  64 gatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttg 163  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14150139 gatgatcagaaggtcaggttggctactcacatgtttgttgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaaaacttgagattggtggagaggttg 14150040  T
Q  164 tgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggag 263  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  14150039 tgacttgggctaagttcaagaccgagtttttgaggaagtactttctagaggatttgaggactaggaaggaggtggagttcttgaacttgaagcaagggag 14149940  T
Q  264 catgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttc 363  Q
     |||||||| |||||| ||| || || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  14149939 tatgtccgtggctgagtatgcggcgatgtttgaggagctgtcgaggttttgtccgtacatcaatgctgaggatgcgatggtgtccaagtgtgtgaaattt 14149840  T
Q  364 gaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  14149839 gaaagtgggcttaggctggatttctatctgtatatgtgtgttcaagagatccgagattttgatacctt-gtgcatcagtgtcgtatgtttgatga 14149746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 1660325 - 1660778
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||||||    
T  1660325 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgtttgctgagg 1660424  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || || || |||||||  ||||| ||||| || |||||| | || || || || ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  1660425 aagcagagtactggtggatcaatgccaagggcaggcttgagttgggcggtgatgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 1660524  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     || ||||| || ||||||| |||||| || || || |||||  | || ||| ||| |||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||| ||||||    
T  1660525 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtttgaggaactttcg 1660624  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||||||| || |||||||    
T  1660625 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggtcatctatcagtacatgtgtgttc 1660724  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1660725 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 1660778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 16104092 - 16103651
Alignment:
Q  19 tgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatatt 118  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||  || ||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| || ||  | |    
T  16104092 tgggtgcagggtatggagcggattttccaagctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatgtgcttgctgaggaagcggagcact 16103993  T
Q  119 ggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagattt 218  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  16103992 ggtggactaatgccaaaggaagacttgaaatgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaagctgaattcttgaggaagtatttccctgaagactt 16103893  T
Q  219 aaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcg 318  Q
     ||||| | |||||| || || || ||||| || || ||| | |||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  16103892 gaggactaagaaggaggttgagtttctgaatttgaatcaaggaagcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttccaggttttttccc 16103793  T
Q  319 tacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgag 418  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||    
T  16103792 tacatcaatgctgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgcgtctaggagatccgag 16103693  T
Q  419 attttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16103692 actttcatactttggtgcaaaagtgtcgtatgtttgatgatg 16103651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18421363 - 18421144
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||  | |||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| |||    
T  18421363 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgatctatggtgacgagggatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgctaagg 18421264  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | | ||| |||||||||||||| ||    
T  18421263 aagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgttgtgacctgggctaagttccaggttgaattcttgaggaagtattt 18421164  T
Q  207 tcctgaagatttaaggacca 226  Q
     |||||||| || |||||||    
T  18421163 ccctgaagacttgaggacca 18421144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 289 - 458
Target Start/End: Original strand, 19982365 - 19982534
Alignment:
Q  289 aagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatct 388  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || ||| | || ||||| || || |    
T  19982365 aagtttaaggagctatcaaggttttgttcgtatattaatgttgaggatgctatggtttcaaaatgtgagaagtttgagagtcgtttgaggcccgagattt 19982464  T
Q  389 atcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19982465 atcagtacatacgttttcatgagatccgagatttttatactttggtacacaagtatcgtatgtttgatga 19982534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17786996 - 17786689
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaagg-tcagattggcgacccacatgcttgctgag 105  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||  |||| ||||| || ||||| ||  |  |||||||||||| ||||| | ||||| || ||||| ||||||    
T  17786996 ggagcacagacttgggtgcagggtatggaacggattttccgagctatggttacgggaaatgaccagaaggctcagactagcgactcatatgctagctgag 17786897  T
Q  106 gaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtact 205  Q
    || |  |   | |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || ||||| | ||| |||||||| |  || ||||||||||| || |    
T  17786896 gaagaagggcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctaggctaagttcaaggtcgaattcttgaggaaatatt 17786797  T
Q  206 ttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttc 305  Q
    | |||||||| || ||||||| ||||||  | || || |||||  | || ||| | |||||||| ||||| ||  ||| || |||||| ||||| |||||    
T  17786796 tccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgaatatgcggcgaagttcgaggaactttc 17786697  T
Q  306 gaggtttt 313  Q
    ||||||||    
T  17786696 gaggtttt 17786689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Original strand, 15007241 - 15007309
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaag 75  Q
    ||||| ||||||||||   | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15007241 ggagcgcagacatggggtcaaggcatggaaaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaag 15007309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 21193344 - 21193785
Alignment:
Q  19 tgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatatt 118  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21193344 tgggtgcagggcatggagaggatattttgtgctatggtgacgagtgatgaccagaaggtcagattgacgactcatatgcttgctgaggaggccgaatatt 21193443  T
Q  119 ggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagattt 218  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21193444 ggtggaccaatgccaagggaagacttgagattgttggggaagtcgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtatttccctgaagattt 21193543  T
Q  219 aaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcg 318  Q
     |||||||||||||| || |  || |||||||| ||| || ||||||| || ||||| ||| ||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  21193544 gaggaccaggaaggaggtagcgtttctgaacttgaagtaagggagcatctctgtagccgagtatgcggcgaagttcgagaagctttcgaggttttgtccg 21193643  T
Q  319 tacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgag 418  Q
    ||||||| || ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21193644 tacatcattgctgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgag 21193743  T
Q  419 attttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21193744 attttgatactttggtgcataagtgtcgtaagtttgatgatg 21193785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 20649135 - 20649588
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| || | || || || ||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  20649135 ggagcacagacttgggtgcagggcatggagcgggtttttcgagctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgcttgctgagg 20649234  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | | |||||||||||| || |||||||||||| | || || || |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||    
T  20649235 aagcagagcacttgtggactaatgccaaaggaagacttgagttgggaggtgatgttgtgacctgggcgaagttcaaagttgaattcttgaggaagtgttt 20649334  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     |||||||| || ||||||| |||||| || || || ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  20649335 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatttaaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 20649434  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || | ||| |    
T  20649435 aggttttgtccctacatcaatgttgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtaaatgtatgtac 20649534  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20649535 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttaatgatg 20649588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 21847117 - 21847570
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||  || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  21847117 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccaagctatggttactggtgatgaccagaaggtcagattggcgactcatatgctagctgagg 21847216  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |  || |  |||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  21847217 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcagacttgagttggaaggtggtgttgtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 21847316  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     || ||||| || ||||||| |||||| || || || |||||  | || ||| ||| |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21847317 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggtgaagtttgaggagctttcg 21847416  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  21847417 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 21847516  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21847517 aggagattcgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 21847570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 16415918 - 16415634
Alignment:
Q  175 aagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtag 274  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||| ||||||  | || || |||||  | || ||| ||| |||||| ||||    
T  16415918 aagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccccgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaatggatcatgtctgtag 16415819  T
Q  275 ctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtt 374  Q
    | ||  ||| || |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |    
T  16415818 ccgaatatgcggcgaagtttgaggaactttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggct 16415719  T
Q  375 taggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  16415718 taggccggatatctatcagtacatgtgtgtccaggggatccgagactttgatactttggtgcataactgttg-atgtttgatgatg 16415634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 22553320 - 22553265
Alignment:
Q  13 cagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatga 68  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  22553320 cagacatgggtgcaagacatggagaggatcttccgtgctatgatgactaatgatga 22553265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 461
Target Start/End: Original strand, 25041 - 25494
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| || |  |||||||| ||||    
T  25041 ggagctcagacatgggtgcaaggcatggggtggatcttccgtgctatgatgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactctaatgcttgccgagg 25140  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25141 aggccgagtattggtggaccaatgctaatggaagacttgagattggtggagaagtt-tgacttgggctaagttcaaagctgagtttttgaggaagtactt 25239  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| || ||| ||| || |||||||||||||||| ||    
T  25240 tccagaggatttaaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgttcgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttccg 25339  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25340 aggttttgtccgtacatcaatgctgaggatgcgatggtttccaagtgcgcgaagtttgaaagtgggattaggccggatgtctatcagtatatgtgtgttc 25439  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25440 aagagattcaagattttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 25494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 22128847 - 22129301
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||| |||||||||    
T  22128847 ggagctcagacgtgggtgcaaggcatggagaggatctttcgaactatggtgactagtgatgatcaaaaggtcaggttggctactcatatgattgctgagg 22128946  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaaga-cttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtact 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22128947 aggccgagtattggtggactaatgctaaggcaaaagcttgagattggtgaagaggttgtgacttgggctaagttcaaagctgagtttttgaggaagtact 22129046  T
Q  206 ttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttc 305  Q
    |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||||| |    
T  22129047 ttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggttgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgc 22129146  T
Q  306 gaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgtt 405  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22129147 aaggttttgttcgtacatcaatgctgaggatgcgatggtttcgaagtgtgtgaaatttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgtt 22129246  T
Q  406 caggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22129247 taggagatcctagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 22129301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 20827801 - 20828254
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| || |||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  20827801 ggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 20827900  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20827901 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 20828000  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| || || ||| ||| || |||||||||||||||| |     
T  20828001 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 20828100  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  20828101 aggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 20828200  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20828201 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 20828254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 7 - 458
Target Start/End: Original strand, 41214270 - 41214721
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41214270 ggagctcagacataggtgcaaggaatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgctgagg 41214369  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    |||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||| |||||||||| |||    
T  41214370 aggctgagtattggtagacgaatgctaaggggagactcgagatcggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaagactgagtttttgaggaagtcctt 41214469  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||| |||  | || |||||| ||||||| |    
T  41214470 tcctgaggatttgaggactagaaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtctgtggctgagtatgctgcgatgtttgaagagcttttg 41214569  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| |||| || |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  41214570 aggttttgtccgtatattaatgctgaagatgggatggtttcgaagtgtgtgaagttcgaaagtgggctcaggctggatatctatcagtatatgtgtgttc 41214669  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41214670 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgcatgtttgatga 41214721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 20929001 - 20928551
Alignment:
Q  10 gcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggagg 109  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||  |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||| || | | |  ||||||| |    
T  20929001 gcacagacttgggtgtagggaatggaacggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcataagttgactgaggaag 20928902  T
Q  110 ccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcc 209  Q
    | ||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |  || || ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| || ||    
T  20928901 cagagcattggtggaccaatgccaagggaaggcttgagatgggagatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttaaggaagtatttccc 20928802  T
Q  210 tgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgagg 309  Q
     ||||| || ||||||| ||||||  | || || |||||  | ||| || | | |||||| ||||| ||| ||| || |||||| ||||| ||||| |||    
T  20928801 cgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaagaaaggaatcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcaagg 20928702  T
Q  310 ttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcagg 409  Q
    |||||| | |||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20928701 ttttgtccctacatcaatgctcaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcagg 20928602  T
Q  410 agatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20928601 agatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 20928551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 20528946 - 20528550
Alignment:
Q  64 gatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttg 163  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || ||| |  ||||||| || ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |  || || |    
T  20528946 gatgaccagaaggttagactagcgactcatatgttgactgaggaagcagagcactggtggactaatgccaaaggaaggcttgagatgggagatgatgtgg 20528847  T
Q  164 tgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggag 263  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||| ||||||  | || || |||||  | ||| || | |     
T  20528846 tgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccccgaagacttgaggaccaagaaggacattgagtttctgaatctgaagtaaggaat 20528747  T
Q  264 catgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttc 363  Q
    ||||||  |||| ||| ||| || |||||| ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||     
T  20528746 catgtctatagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttttccctacatcaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagttt 20528647  T
Q  364 gaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    || |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  20528646 gagagtgggcttaggccggagatctaccagtacatatgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgaataagtatcgtatgtttgatgatg 20528550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 350 - 460
Target Start/End: Original strand, 23312571 - 23312681
Alignment:
Q  350 agtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtat 449  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23312571 agtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcatgagatccgagattttgatactttggtgcataagtgtcgtat 23312670  T
Q  450 gtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||    
T  23312671 gtttgatgatg 23312681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 20173056 - 20172643
Alignment:
Q  32 tggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgc 131  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||   ||| ||| |||| || |||||||| |  |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||  ||    
T  20173056 tggagaggatctttcgtgctatggttaccgatgaggactagaaagttagattggctattcacatgcttgcacaggaggctgagtattggtggactagagc 20172957  T
Q  132 taagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaag 231  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||   ||||||  ||| ||||| |||| |  |||| || ||||  | |||     
T  20172956 taagagaagacttgaggccggtggagaagtggtgtcttgggagaaattcaagagtgagtttctgaagaagtgcttttcgaaagacttgaggaataagaaa 20172857  T
Q  232 gaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttg 331  Q
    || ||||| ||| || | || |||||   || |||||| || || ||| |||  |  |||||||||||| | ||  |||||||| | | ||||||| |||    
T  20172856 gaggtggagttcttgcagttgaagcaggagaacatgtctgttgcggagtatgccgccaagtttgaggagatatcctggttttgtcccttcatcaatattg 20172757  T
Q  332 aggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatacttt 431  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||| | || |||||  | || || || ||  ||||||| || ||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20172756 aggatgctatggtgtctaagtgtgtgaaggttgagagtggtctgagtcccgagattcatcagtacatctgctttcatgagatctgagattttgatacttt 20172657  T
Q  432 ggtacataagtgtc 445  Q
    | | || |||||||    
T  20172656 gatgcacaagtgtc 20172643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 81
Target Start/End: Original strand, 20959744 - 20959819
Alignment:
Q  6 aggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcaga 81  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20959744 aggagctcagacttgggtgcagggcatgaagaggatattttgtgttatggtgacaagtgatgaccagaaggtcaga 20959819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 33 - 458
Target Start/End: Original strand, 20242 - 20667
Alignment:
Q  33 ggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgct 132  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20242 ggagaggatcttctgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggttaggttggctacccacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgct 20341  T
Q  133 aagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaagg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  20342 aagggaagacttgagattggtggataggtggtgccttgggctaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaagg 20441  T
Q  233 aagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttga 332  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| | |    
T  20442 aagtggagttcttgaacttgaagcaagggagtatgtccgtggctgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgtgaggttttgtccgtacattaatgctaa 20541  T
Q  333 ggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttg 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20542 ggatgcgatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctaccagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttg 20641  T
Q  433 gtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||    
T  20642 gtgcataggtgtcatatgtttgatga 20667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 33 - 458
Target Start/End: Original strand, 29818 - 30243
Alignment:
Q  33 ggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgct 132  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29818 ggagaggatcttctgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggttaggttggctacccacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgct 29917  T
Q  133 aagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaagg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  29918 aagggaagacttgagattggtggataggtggtgccttgggctaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaagg 30017  T
Q  233 aagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttga 332  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| | |    
T  30018 aagtggagttcttgaacttgaagcaagggagtatgtccgtggctgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgtgaggttttgtccgtacattaatgctaa 30117  T
Q  333 ggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttg 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30118 ggatgcgatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctaccagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttg 30217  T
Q  433 gtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||    
T  30218 gtgcataggtgtcatatgtttgatga 30243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 9121 - 8667
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||||| || |||||| |||||| |||| |||| ||| |||| ||||||||  | | ||| |||||||||| | ||||||| |  ||||||| |||||    
T  9121 ggagcacaaacgtgggtgcagggcacggagcggatattcggtgctatggtgacgggaggtgatcagaaggtcaaactggcgactcgtatgcttgttgagg 9022  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | |  ||||||||||| || |||||| ||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  9021 aagctgagcactattggactaatgccaaaggaagaattgagatgggaggtaaagttgtgacctgggcgaagttcaaagctgaattcttgatgaagtattt 8922  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     |||||||| || ||||||| |||||| || || || |||||  | || ||| | |||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  8921 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 8822  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||| | |||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||| |    
T  8821 aggttttatccgtacatcaatgctaaagatgctatggtttcgaagtgtgtaaagtttgaaagtgggcttaggccgaatatttatcagtatttgtgtgtcc 8722  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8721 aggagatccgagactttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 8667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 163 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 91310 - 91013
Alignment:
Q  163 gtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacgga 262  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||  | || || |||||  | || ||  |||    
T  91310 gtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacatggga 91211  T
Q  263 gcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagtt 362  Q
     |||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | | |||| |||| |||||||||    
T  91210 tcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctaagatttcgaagtatgtgaagtt 91111  T
Q  363 cgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
     || |||||| ||||| || | |||||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  91110 tgagagtgggcttaggacgaaaatctatcaataaatgtgtgttcaggagatcagagactttgaaactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 91013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 27104120 - 27104573
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| || |||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  27104120 ggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 27104219  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27104220 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 27104319  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| || || ||| ||| || |||||||||||||||| |     
T  27104320 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 27104419  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  27104420 aggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 27104519  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27104520 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 27104573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 7827824 - 7827371
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| || |||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  7827824 ggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 7827725  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7827724 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 7827625  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| || || ||| ||| || |||||||||||||||| |     
T  7827624 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 7827525  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||  | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  7827524 aggttttgcccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 7827425  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7827424 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 7827371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27174205 - 27173752
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| || |||||| || | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  27174205 ggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatcgtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 27174106  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27174105 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 27174006  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| || || ||| ||| || |||||||||||||||| |     
T  27174005 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 27173906  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  27173905 aggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 27173806  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27173805 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 27173752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 4443847 - 4443392
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  4443847 ggagctcagacatgggtgcagggcatggagaggatcttctatgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacctacatgcttgctgagg 4443748  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||| | ||||||  || |||| ||||||||||||||    
T  4443747 aggccgagtattggtggacgaatgctaagggaagacttgagatcggcagagaggttgggacttgggcaaggttcaagactaagtttttgaggaagtactt 4443648  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    ||| || ||||| ||||  || ||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||| || |||||| ||| || |||||||||||||||| ||    
T  4443647 tccagaggatttgaggaatagaaaggaagtggagttcttaaacttgaagcaagggagcatgtctgtggctgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcg 4443548  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  4443547 aggttttatgcgtacattaatgttgaggatgcaatggtgtccaagtgtgtgaaatttgaaagtggacataggccggatatctatcagtatatgtgtgtta 4443448  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgtc 462  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4443447 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgtc 4443392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 13459943 - 13459484
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtg--------actagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgct 98  Q
    ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||        ||| |||||||  |||||||||  || || |||||||||||    
T  13459943 ggagctcagacattggtgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgctatggtgactggtgatgattagaaggtcaagttagctacccacatgct 13459844  T
Q  99 tgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgagg 198  Q
    || ||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||  | ||||||  ||||||| ||||||    
T  13459843 tgttgaggaggctgagcattggttgacgaatgctaagggaagacttgagatcagtggagaggtagtgacttaggttaggttcaagactgagtttttgagg 13459744  T
Q  199 aagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgagg 298  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||  || || |||  |  ||||||||||    
T  13459743 aagtattttccagaggatttgaggagcaggaaggaagtggaattcttgaacttgaagcaagggagcttgtctgtcactaagtatgctgcaaagtttgagg 13459644  T
Q  299 agctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatat 398  Q
    | ||| ||||||||| | | ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||||| |    
T  13459643 aacttccgaggttttatccctacattaatgtcgaagatgcaatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaacgtgggcttaagctggatatctatcagtatgt 13459544  T
Q  399 atgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
     |||||| |||| ||  |||| || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  13459543 gtgtgtttaggatattagagacttcgatactttggtgcacaagtgtcgtatattcgatga 13459484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 107
Target Start/End: Original strand, 16575119 - 16575219
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||   | |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||    
T  16575119 ggagcacagacttaggtgcagggcatggagcggatattccatgccatggtgatgggagatgaccagaaggtcagactggcaactcatatgcttgctgagg 16575218  T
Q  107 a 107  Q
    |    
T  16575219 a 16575219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16590543 - 16590443
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||   | |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||    
T  16590543 ggagcacagacttaggtgcagggcatggagcggatattccatgccatggtgatgggagatgaccagaaggtcagactggcaactcatatgcttgctgagg 16590444  T
Q  107 a 107  Q
    |    
T  16590443 a 16590443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 24585049 - 24584596
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  24585049 ggagctcagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcagatgcttgctgagg 24584950  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24584949 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattgatggagaggttgtgacttggacaatgttcaaaactgagtttttgaggaagtactt 24584850  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||| || ||| ||| || ||||||| |||||||| |     
T  24584849 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttaaggagcttgca 24584750  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  24584749 aggttttgtccctacatcaatgttgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagttggagagtgggcttaggtcggatatctatcagtacatgtgtgttc 24584650  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24584649 aggagatccgagagtttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 24584596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 21828655 - 21828202
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21828655 ggagctcagacatggctgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgctgagg 21828556  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||  | ||||| |||| ||| |||||    
T  21828555 aagctgagttttggtggactaatgctaaggggagacttgaggtcggtggagaggttgtgacttgggctaggttcaagaccgagtttttgatgaaatactt 21828456  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||| ||||| || |||||| |||  |  ||||||||||||||||||    
T  21828455 tcctgaggatttgaggactagaaaggaagtggagttcttgaacttgaagtaagggagtatgtctgtcgctgagtatgcagcaaagtttgaggagctttcg 21828356  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21828355 aggttttgtacgtacattaatgctgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagttcgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttc 21828256  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21828255 aggagattagagatttcgat-ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 21828202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 23509524 - 23509071
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||    
T  23509524 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgttgactgagg 23509425  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | |||||||| ||||| || ||||| ||| || | || || || || ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  23509424 aagcagagcactggtggaccaatgccaaaggaaggcttaagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 23509325  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     || ||||| || ||||||| |||||   | || || |||||  | |||||| | | |||||| |||||  |||||| ||||||||| ||||| |||| |    
T  23509324 ccccgaagacttgaggaccaagaaggcgattgagtttctgaatctgaagcaaggaatcatgtctgtagccaagcatgtggtgaagttcgaggaacttttg 23509225  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23509224 aggttttgtccatacatcaatgctaaggatgctatgatttcgaagtgtgcgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttc 23509125  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23509124 aggagatccgagactttgatactttgatgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 23509071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 98 - 328
Target Start/End: Original strand, 33313828 - 33314075
Alignment:
Q  98 ttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagac-----ttgagatt----ggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctga 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33313828 ttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacaagacttgagattgattggtggagaggttgtgacttgggctaagttcaaagctga 33313927  T
Q  189 gttcttgaggaagtactttcctga---agatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaa-----cggagcatgtccgtagctgagc 280  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||    ||| | ||||| || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||     ||||||||||| |||||||||     
T  33313928 gtttttgaggaagtactttccagagggggatctgaggactagaaaggaagcggagttcttgaacttgaagcaagggatcggagcatgtcagtagctgagt 33314027  T
Q  281 atgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatg 328  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33314028 atgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccgtacattaatg 33314075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 15289495 - 15289948
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  15289495 ggagctcagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 15289594  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    |||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15289595 aggctgagtattggcggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 15289694  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||| || |||| |||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||| |     
T  15289695 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaatttgaagtaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 15289794  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15289795 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagaatgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 15289894  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15289895 aggagatctgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 15289948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 52 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18272976 - 18272656
Alignment:
Q  52 atggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattg 151  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18272976 atggtgactagtgacgatcagaaggtcaggtttgctacccacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattg 18272877  T
Q  152 gtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaactt 251  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  18272876 gtggagaggttgtgacttgggcaaagttcaaagctgagtttttgaggaagtattttccagaagatttaaggactaggaagaaagtggagttcttgaactt 18272777  T
Q  252 aaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaag 351  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||| ||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||    
T  18272776 gaagcaagggagcatgtccatagctgagtatgcggcgacgtttgaggagctatcgaggttttgttcgtacattaatgctgaggatgcaatggtgcccaag 18272677  T
Q  352 tgtgtgaagttcgaaagtggg 372  Q
    ||||||||||| ||| |||||    
T  18272676 tgtgtgaagtttgaaggtggg 18272656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 15000588 - 15000128
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||| ||||||||||| | ||||| || ||| | |||||||    
T  15000588 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgactagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 15000489  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || || || |||||||| ||||| ||||| || |||||| | || || || || ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  15000488 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggggggtgatgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagta-tt 15000390  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     || ||||| || ||||||| |||||| || || || |||||  | || ||| ||| |||||| ||||| ||| ||  || |||||||||||| ||||||    
T  15000389 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatacggcgaagtttgaggaactttcg 15000290  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15000289 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 15000190  T
Q  407 aggagatccgagattttgatac--------tttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| ||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15000189 aggagatccgagactttgatactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 15000128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 460
Target Start/End: Original strand, 12339274 - 12339664
Alignment:
Q  70 cagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgactt 169  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| || || ||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||   |||||||| ||| ||||||    
T  12339274 cagaaggtcaggttggctacctacatgcttgttgaggaagctgagtaccggtggacgaatgctaaggggagacttaaggcaggtggagaggttatgactt 12339373  T
Q  170 gggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtc 269  Q
    |||| | | ||||   ||||||  | |||||||| ||||| ||  |||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||  | |||||   || | ||||    
T  12339374 gggctaggctcaagagtgagtttgtaaggaagtattttccagagaatttgaggaccaagaaggaagtgaagttcttgaatctgaagcaggagaacttgtc 12339473  T
Q  270 cgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagt 369  Q
     || |  ||  |||  |  ||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||    
T  12339474 tgttgtggaatatgcagctaagttcgagaaactttcgaggttttgtccttacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaaatgtgtgaagtttgagagt 12339573  T
Q  370 gggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    || || ||||| || ||  |  ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  12339574 ggtttgaggccagagattcactagtatatgtgtgttcaggagatcagggatttcgataccttggtgcctaagtttcgtatgtttgatgatg 12339664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 25132026 - 25131574
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  25132026 ggagctcagacatgggtgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttagctacccacatgcttgctgagg 25131927  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  25131926 aggccgagtattggtggacaaatgctaaggggagactcgagatcggcggagaggttgtgacttgggcaaggttcaagactgagttttttaggaagtactt 25131827  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgag-gtgaagtttgaggagctttc 305  Q
    ||  || ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||||| |||||| |||| |||||||| |||||| ||| |    |||||||||||||||||    
T  25131826 tcaagaggatttgaggactagaaaggaagtagagttcttaaacttgaagcaagggagtatgtccgtggctgagtatgcgacaaaagtttgaggagctttc 25131727  T
Q  306 gaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgtt 405  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25131726 gaggttttgtccgtacattaatgttgaggatgcgatggtgtcacagtgtgtgaaatttgaaagtggacttaggccggatatttatcagtatatgtgtgtt 25131627  T
Q  406 caggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25131626 caggagattcgagattttgataccttggtgcaaaagtgtcgtatgtttgatga 25131574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 22281668 - 22281217
Alignment:
Q  10 gcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggagg 109  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||| |    
T  22281668 gcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgttgactgaggaag 22281569  T
Q  110 ccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcc 209  Q
    | ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || || || ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || ||    
T  22281568 cagagcactggtggaccaatgccaaaggaaggcttgagatgggaggtgatgtggtaacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 22281469  T
Q  210 tgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgagg 309  Q
      |||| || ||||||| ||||||  | || ||  ||||  | ||| || | | |||||| ||||  ||| |||  | |||||| ||||| ||||||| |    
T  22281468 gaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttttgaatctgaagtaaggaatcatgtctgtagtcgagtatgcagcgaagttcgaggaactttcgaag 22281369  T
Q  310 ttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcagg 409  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||    
T  22281368 ttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatttatcagtacatgtttgttcagg 22281269  T
Q  410 agatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22281268 agatccgagacttttatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 22281217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 458
Target Start/End: Original strand, 35513 - 35963
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35513 ggagctcagacatgggtgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgctgagg 35612  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||  | ||||| |||| ||| |||||    
T  35613 aagctgagttttggtggactaatgctaaggggagacttgaggtcggtggagaggttgtgacttgggctaggttcaagaccgagtttttgacgaaatactt 35712  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||| |||| || |||||| |||| ||||| || |||||| |||  |  ||||||||||||||||||    
T  35713 tcctgaggatttgagtactagaaaggaagtggagttcttgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggctgagtatgcagcaaagtttgaggagctttcg 35812  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  35813 aggttttgtccatacattaatgctgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttagcccggatatctatcagtatatgtgtgttc 35912  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35913 aggagattagagatttcgat-ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatga 35963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 4147 - 4599
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| |||| |||| || | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||| | ||| |||    
T  4147 ggagctcagatatggttgcaaggcatggagaggatctttcatgctatggtgactagtgatgatcagaaggtaaggttgg-gactcacatggtagctaagg 4245  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4246 aagcagagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggggaggttgtgacttggataaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 4345  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    ||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| || || ||| ||| || |||||||||||||||| |     
T  4346 tccagaggatttgagaactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 4445  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  4446 aggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 4545  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4546 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 4599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 460
Target Start/End: Original strand, 5374 - 5806
Alignment:
Q  28 ggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggacta 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  5374 ggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggacga 5473  T
Q  128 atgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccag 227  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||| || ||||||||||| | |||||| | |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  5474 atgctaaggggagacttgaagtcggtggagaggtcgtgacttgggcaaggttcaaggttgagtttttgaggaaatactttccagaggatttgagaactag 5573  T
Q  228 gaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaat 327  Q
     ||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||| ||| |   |||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |||    
T  5574 aaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtcagtggctgagtatgcgccaaagtttgaagagctttcgtggttttgtccgtatattaat 5673  T
Q  328 gttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgata 427  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5674 gttgaagatgcaatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggagatttgagattttgata 5773  T
Q  428 ctttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
      ||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  5774 tcttggtgcataagcgtcgtatgtttgaagatg 5806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 97489 - 97038
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||| |||||  || |||||||| |||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  97489 ggagcccagacttgggtacagagcatggagcggatattccgtgctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagattggcgactcatatgcttgctgagg 97390  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  97389 aagctgagcagtggtggactaatgccaaaagaagacttgagtttggtgaagaagttgtgacctggacaaagttcaaagctgaattcttgaggaaatattt 97290  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     |||||||| || ||||||| |||||| || || ||  ||||  | || ||| | |||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  97289 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttttgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgaggcgaagtttgaggagctttcg 97190  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  97189 aggttttgtccgtacatcaatgttgaagatgttatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagt--atatgtgttc 97092  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  97091 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 97038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 3266 - 3719
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  3266 ggagcacagacttgggtgcagggcatggagcggatattccatgctatggtgacgggagatgaccagaaggttagattggcgactcatatgcttactgagg 3365  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  3366 aagcggagcactggtggactaatgccaagggaagacttgatatgggaggtgaagttgtgacctgggaaaagttcaaagctgaattcttgaggaagtattt 3465  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     |||||||| || ||||||| |||||| || || ||  ||||  | || ||| | ||||||||  |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  3466 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttttgaatctgaaacaaggaagcatgtctatagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 3565  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  3566 aggttttgtccctacatcaatgctgaagatgttatggtttcgaagtgtgtgaagtttgatagtgggcttaggccagatatctatcagtacatgtgtgtcc 3665  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3666 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 3719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 12671 - 13124
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||    
T  12671 ggagcacagacttgggtctaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgctagctgagg 12770  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || || || ||||  ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  12771 aagcagagcactggtgggctaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgaactgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 12870  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     |||||||| || ||||||| ||||||| | || || |||||  | || ||| | | |||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  12871 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaaattgagtttctgaatctgaaacaaggaaacatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 12970  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||     
T  12971 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaaatgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatcaatcagtacatgtgtgttt 13070  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13071 aggagatccgagattttgatactttggttcataagtgtcgtatgtttgatgatg 13124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 460
Target Start/End: Original strand, 18 - 414
Alignment:
Q  64 gatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttg 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| || ||  | |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || || || |    
T  18 gatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgctagctgaggaagcagagcactggtgggctaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtgg 117  T
Q  164 tgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggag 263  Q
    |||  ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||| | || || |||||  | || ||| | |     
T  118 tgaactgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggaaattgagtttctgaatctgaaacaaggaaa 217  T
Q  264 catgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttc 363  Q
    |||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||     
T  218 catgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaaatgtgtgaagttt 317  T
Q  364 gaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  318 gagagtgggcttaggccggatatcaatcagtacatgtgtgtttaggagatccgagattttgatactttggttcataagtgtcgtatgtttgatgatg 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 26142 - 25689
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||| | |||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||||    
T  26142 ggagcacagacttgggtgcagggtatggggtggattttccgagctatggtgacaggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgttgagg 26043  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||  | || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  26042 aagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtaatgtggtgacttgggctaagttcaaagttgaattcttg-ggaagtattt 25944  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     |||||||| || || || | |||||| || || || |||||  | || ||| | |||||||  ||||| ||| ||| || ||||||| || ||||||||    
T  25943 ccctgaagacttgagaactaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtttgtagccgagtatgcggcgaagtttaagaagctttcg 25844  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  25843 aggttttgtccttacatcaatgctgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttg 25744  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25743 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 25689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 4454 - 3999
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| |||||||||||| | | |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  4454 ggagctcagacatgggtgcaagccatggagagggtcttccgtgttatggttactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgttgagg 4355  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||| | || ||||||||||| | ||||||  | ||||| ||||||||||| ||    
T  4354 aggctgagtattggtggactaatgctaaggtgagacttgaggctagtggaaaggtcgtgacttgggctaggttcaagacagagtttttgaggaagtattt 4255  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||   ||    ||| || || ||| ||   |   ||||||  | ||||||     
T  4254 tccggaggatttgaggaccaggaaggaagtagagttcttgaacttcaagcatgagaatcggtcagtggcagagtatactgcatagtttgtagtgctttcc 4155  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |    
T  4154 aggttttgcccgtacatcaatgcggaggatgttatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtaggcttaggctggatatgtatcagtatatttgtgtcc 4055  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgtc 462  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4054 aggagatcgaagattttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgtc 3999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27360 - 26907
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||| |||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  27360 ggaggacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagattagcgactcatatgctagctgagg 27261  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||||||   ||| ||||||||||| || ||    
T  27260 aagcagagtactggtggaccaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaagtttgaattcttgaggaattattt 27161  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     ||  |||| || ||||||| ||||||  | || || |||||  | || ||| ||| |||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||| |||||     
T  27160 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtttgaggaactttct 27061  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  27060 aggttttgtccctacatcaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 26961  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26960 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgttgatg 26907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 3675 - 3215
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||||| || |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||    
T  3675 ggagcacaaacttgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgctgagg 3576  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | | |||||||||||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||    
T  3575 aagcagagaactagtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaagcttaattattgaggaagtattt 3476  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     |||||||| || ||||||| |||||| || || || |||||  | || ||| | |||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  3475 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 3376  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  3375 aggttttgtccctacatcaatgctgaagatgatatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtatcc 3276  T
Q  407 aggagatcc--------gagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgat 459  Q
    | |||||||        |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3275 aagagatccgagactttgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgttgat 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27740 - 27287
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||||| || |||||| |||| |||||| |||| ||||| || | ||| || || |||||||||||||||||| | |||||  | |||||||||||||    
T  27740 ggagcacaaacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctacggtcacgagagatgaccagaaggtcagactagcgacttatatgcttgctgagg 27641  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | ||  |  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || | ||| ||||| ||||||||||   | |||||||||||||| ||    
T  27640 aagcaaagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggggacctgggctaagttcaaagtcaaattcttgaggaagtattt 27541  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     |||||||| || ||||||| |||||| || || || |||||  | || ||| | |||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  27540 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 27441  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | || ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  27440 aggttttgtccctatatcaatgctgaggatgctgtggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtggacttaggccggatatctatcaatacatgtgtgttc 27341  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    || |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27340 agtagatcctagacttttatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 27287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 163 - 460
Target Start/End: Original strand, 130982 - 131282
Alignment:
Q  163 gtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacgga 262  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| || || || |||||  | |||||| | |    
T  130982 gtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaagcaaggaa 131081  T
Q  263 gcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggag---ctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaa 359  Q
     |||||| || || ||| ||| || |||||| |||||    ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  131082 tcatgtctgtggccgagtatgcggcgaagttcgaggaattactttcgaggttctgtccctacattaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaa 131181  T
Q  360 gttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgat 459  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  131182 gtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaagagatccgagactttgatactttagtgcataagtgtcgtatgtttgatgat 131281  T
Q  460 g 460  Q
    |    
T  131282 g 131282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 555 - 101
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||||| || |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  555 ggagcacatacttgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 456  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | || ||||||||||| || ||||| |||||| | || ||  | || ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  455 aagcagagcactgatggactaatgccaaaggaaggcttgagttgggaggttatgtggtgacgtgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 356  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     ||  |||| || ||||||| ||||||  | || || |||||  | || ||| ||| |||||| ||||| ||| ||| || |||||| ||||| ||||||    
T  355 cccgtaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 256  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| | || |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  255 aggttttgtccctacatcaatgttgaggatggtatgatctcgaagtgtttgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctattagtacatgtgtgttc 156  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  155 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 186 - 458
Target Start/End: Original strand, 32394 - 32665
Alignment:
Q  186 tgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgag 285  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||   ||| |||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| ||| |    
T  32394 tgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactcagaaagaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgttcgtggctgagtatgcg 32493  T
Q  286 gtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggata 385  Q
    |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  32494 gcaaaatttgaggagcttgcgaggttttgttcgtacattaatgttgaggatgtgatg-tgtccaagtgtgtgaattttgaaagtgggcttaggccggata 32592  T
Q  386 tctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32593 tctatcagtatatgtgtgtttaggagatccaagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatga 32665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 32257 - 32391
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgc-ttgctgag 105  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| | || ||||| || ||||||| ||||||||    
T  32257 ggagctcagacatgggtgcaaggcatgtagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatgagaagattaggttggctactcacatgcattgctgag 32356  T
Q  106 gaggccgaatattggtggactaatgctaagggaag 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32357 gaggccgagtattggtggactaatgctaagggaag 32391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 117 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2430 - 2180
Alignment:
Q  117 ttggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||   |||||||  ||||||| ||||||||||||||||  || |||    
T  2430 ttggtggactaatgctaagggaagacttgagaatggtggagaggttatgacttgggatcagttcaagactgagtttttgaggaagtactttctagaggat 2331  T
Q  217 ttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgtt 316  Q
    || ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||     
T  2330 ttgaggactaggaagcaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggatttgtc 2231  T
Q  317 cgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaa 367  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2230 cgtacattaatgttgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaa 2180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2505 - 2427
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattgg 85  Q
    ||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2505 ggagctcagatatgggtgcaaggcatggagaggatctcccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttgg 2427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 460
Target Start/End: Original strand, 4768 - 5163
Alignment:
Q  64 gatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttg 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||  | | || ||||||||  || |||||  ||||||| || || || || |    
T  4768 gatgaccagaaggtcagactggcgactcaaatgcttgctgaggaagcagagcactagttgactaatgtcaaaggaagg-ttgagatgggaggtgatgtgg 4866  T
Q  164 tgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggag 263  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||  | || || |||||  | || ||| |||     
T  4867 tgacctgggctaagttcaaggttgaattctagaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggat 4966  T
Q  264 catgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttc 363  Q
    ||||||  | || ||| ||| || |||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  4967 catgtctttcgccgagtatgcggcgaagtttgaggaaccttcgaggttttgcccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagttt 5066  T
Q  364 gaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    || |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5067 gagagtgggcttagaccggatatctatcagtacatgtgtgtccaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 5163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 460
Target Start/End: Original strand, 6200 - 6653
Alignment:
Q  10 gcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggagg 109  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |  ||||||| |    
T  6200 gcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttgactgaggaag 6299  T
Q  110 ccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcc 209  Q
    | ||  | | |||||| ||||| |||||||| |||||| | ||    || || ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || ||    
T  6300 cagagcactagtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaaatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 6399  T
Q  210 tgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggag---ctttcg 306  Q
    |||||| || ||||||| |||||| || || || |||||  | |||||| | | |||||| || || ||| ||| || |||||| |||||    ||||||    
T  6400 tgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaagcaaggaatcatgtctgtggccgagtatgcggcgaagttcgaggaattactttcg 6499  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6500 aggttctgtccctacattaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttc 6599  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6600 aagagatccgagactttgatactttagtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 6653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 118 - 460
Target Start/End: Original strand, 402 - 744
Alignment:
Q  118 tggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatt 217  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||| | || || || || ||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||||||||| || || ||||| |    
T  402 tggtggacaaacgccaaaggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctacgttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagact 501  T
Q  218 taaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttc 317  Q
    | ||||||| ||||||  | || || || ||  | |||||| | | |||||| ||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||      
T  502 tgaggaccaagaaggagattgagtttctaaatctgaagcaaggaatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgtct 601  T
Q  318 gtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccga 417  Q
     ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  602 ctacatcaatgcggaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccga 701  T
Q  418 gattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  702 gactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 169 - 460
Target Start/End: Original strand, 12127 - 12418
Alignment:
Q  169 tgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgt 268  Q
    ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||| || || ||||| || ||||||| ||||||  | || || |||||  | || ||| | | |||||    
T  12127 tgggctaagttcaaggttgaattattgaggaagtatttccccgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaaggaatcatgt 12226  T
Q  269 ccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaag 368  Q
    | ||||| ||| ||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||    
T  12227 ctgtagccgagtatgcggcgaagttcgagcaactttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagag 12326  T
Q  369 tgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12327 tgggcttaggccagatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 89
Target Start/End: Original strand, 11999 - 12081
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgac 89  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  11999 ggagcacggacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgac 12081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 288 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 24646 - 24474
Alignment:
Q  288 gaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatc 387  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  24646 gaagtttgaggagcttgcaaggttttgcccctacatcaatgcggaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatc 24547  T
Q  388 tatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24546 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 24474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 461
Target Start/End: Original strand, 8732 - 9175
Alignment:
Q  10 gcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggagg 109  Q
    |||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||    |||||||||||||||||  | ||||| || ||| |  |||||||||    
T  8732 gcacagacttggatgcagggtatggagcggattttccgagctatggttacggaagatgaccagaaggtcaggctagcgactcatatgttgactgaggagg 8831  T
Q  110 ccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcc 209  Q
    | ||  | ||||||||||  || || ||||||| |||| | || || || || ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || ||    
T  8832 cagagcactggtggactagcgccaaaggaagacatgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 8931  T
Q  210 tgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgagg 309  Q
    |||||| || |||||||  ||||| || || || |||||  | || ||| | |||||||| ||||| ||| ||| || ||||||||||||||| || |||    
T  8932 tgaagacttgaggaccaataaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctgtctagg 9031  T
Q  310 ttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcagg 409  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| || || |||||| |||    
T  9032 ttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtggacttaggccggatatctatcaatacatgtgtgttaagg 9131  T
Q  410 agatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    |||||        ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9132 agatc--------tgagactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 9175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 16610 - 16412
Alignment:
Q  262 agcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagt 361  Q
    |||||||| ||||| ||| ||| || ||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  16610 agcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttcaggagctgtctaggttttgtccctacatcaatcttgaggatgctatggtttcgaagcgtgtgaagt 16511  T
Q  362 tcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    | || |||||  || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16510 ttgagagtggacttgggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaagagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 16412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 434
Target Start/End: Original strand, 7776 - 8203
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||| | | ||||| || ||||| |||||||    
T  7776 ggagcacagacttgggtgtaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcaaactagcgactcatatgctagctgagg 7875  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | ||  |  | | |||||| ||||| || || || |||||| | || || || |  ||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  7876 aagcatagcactagtggaccaatgccaaaggcaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctatgttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 7975  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     || ||||| || ||| ||| ||||||  || | || |||||  | || ||| ||| |||||| ||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||| |    
T  7976 cccggaagacttgagggccaagaaggagatgaagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgtggcgaagttcgaggaacttttg 8075  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||| | |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  8076 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgcgcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 8175  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggt 434  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  8176 aggagatcccagactttgatattttggt 8203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 323 - 460
Target Start/End: Original strand, 73290 - 73427
Alignment:
Q  323 tcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattt 422  Q
    ||||||||||||| || ||| | || ||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  73290 tcaatgttgaggacgctatgatctcgaagtgtgtgaattttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactt 73389  T
Q  423 tgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  73390 tgatactttggtgcaaaaatgtcgtatgtttgatgatg 73427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 323 - 460
Target Start/End: Original strand, 77671 - 77808
Alignment:
Q  323 tcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattt 422  Q
    ||||||||||||| || ||| | || ||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  77671 tcaatgttgaggacgctatgatctcgaagtgtgtgaattttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactt 77770  T
Q  423 tgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  77771 tgatactttggtgcacaaatgtcgtatgtttgatgatg 77808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 349 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 182612 - 182500
Alignment:
Q  349 aagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgta 448  Q
    |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  182612 aagtgtttgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctattagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgta 182513  T
Q  449 tgtttgatgatgt 461  Q
    |||||||||||||    
T  182512 tgtttgatgatgt 182500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Original strand, 73065 - 73240
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || | | |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| || ||||    
T  73065 ggagcacagacttgggtgcagggtatagcgcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgctagccgagg 73164  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaa 182  Q
    | || ||  | ||||||||||| || || ||||| |||||| | || || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  73165 aagcagagcactggtggactaacgccaaaggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaa 73240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Original strand, 77446 - 77621
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || | | |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| || ||||    
T  77446 ggagcacagacttgggtgcagggtatagcgcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgctagccgagg 77545  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaa 182  Q
    | || ||  | ||||||||||| || || ||||| |||||| | || || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  77546 aagcagagcactggtggactaacgccaaaggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaa 77621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 356 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 35691 - 35587
Alignment:
Q  356 tgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttga 455  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35691 tgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttga 35592  T
Q  456 tgatg 460  Q
    |||||    
T  35591 tgatg 35587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 289 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 78103 - 77934
Alignment:
Q  289 aagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatct 388  Q
    |||||||||||||| || |||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  78103 aagtttgaggagctatcaaggttttgtcgctacattaatgttgaggatgctatggtgtcgaaatgtgtgaagtttgagagtggattgaggcccgagattt 78004  T
Q  389 atcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    |||||||||| ||  |||| |||||  | || |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  78003 atcagtatatctgctttcatgagatttgtgactttgatactttggtgcacaagtgtcgcctgtttgatga 77934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 78325 - 78183
Alignment:
Q  67 gaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtga 166  Q
    |||||||| || |||||||| |  || |||||||| |||||||  || ||||||||| |||  | |||| |||||||||||  |||||||||||| |||     
T  78325 gaccagaaagttagattggctattcatatgcttgcagaggaggatgagtattggtgggctagagttaagagaagacttgaggctggtggagaagtggtgt 78226  T
Q  167 cttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcc 209  Q
    ||| |||||| |||||   ||||||  ||||||||||||||||    
T  78225 cttaggcgaaattcaagagtgagtttctgaggaagtactttcc 78183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3374 - 3178
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||| ||| ||||||| || ||| |  ||||||    
T  3374 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggttagactggcgactcatatgttgactgagg 3275  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagta 203  Q
    | || ||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||| | || || || || ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  3274 aagcagagcattggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagta 3178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 1770 - 1722
Alignment:
Q  412 atccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1770 atccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 1722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 49341 - 49170
Alignment:
Q  289 aagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatct 388  Q
    ||||| |||||| | |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| | || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  49341 aagttcgaggagttgtcgatgttttgcccgtacattaatgttgaggatgctatgatatctaaatgtgtgaagtttgagagtggtttgaggcctgagattt 49242  T
Q  389 atcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||| || || ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| ||||||    
T  49241 atcaatacatctgttttcatgagatcagagattttgatactttggtgcacaagtgtcacatgtttaatgatg 49170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5631 times since January 2019
Visitors: 4857