View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0755_low_169 (Length: 240)

Name: NF0755_low_169
Description: NF0755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0755_low_169
NF0755_low_169
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (22-240)||(10429-10647)
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (7-240)||(33681010-33681240)
chr1 (7-240)||(22237630-22237861)
chr1 (22-240)||(52927870-52928076)
chr1 (11-240)||(20248283-20248508)
chr1 (11-240)||(22921757-22921986)
chr1 (23-240)||(20918620-20918834)
chr1 (21-240)||(21754059-21754268)
chr1 (26-240)||(21861457-21861672)
chr1 (26-240)||(21896146-21896358)
chr1 (7-188)||(14295495-14295672)
chr1 (26-193)||(35261015-35261180)
chr1 (22-195)||(16758664-16758839)
chr1 (10-193)||(433012-433193)
chr1 (26-238)||(16368176-16368388)
chr1 (8-129)||(50210212-50210333)
chr1 (10-188)||(23593719-23593897)
chr1 (7-133)||(27250724-27250850)
chr1 (26-230)||(41049933-41050138)
chr1 (62-194)||(22130844-22130973)
chr1 (10-126)||(34509783-34509899)
chr1 (7-178)||(45574836-45575008)
chr1 (26-240)||(50614003-50614219)
chr1 (26-240)||(50621831-50622047)
chr1 (26-240)||(50686630-50686846)
chr1 (10-188)||(13988866-13989043)
chr1 (10-188)||(21923276-21923453)
chr1 (9-129)||(21840766-21840885)
chr1 (10-188)||(21475072-21475249)
chr1 (10-188)||(29776688-29776865)
chr1 (10-188)||(31612313-31612490)
chr1 (11-122)||(21161720-21161830)
chr1 (8-188)||(16361915-16362095)
chr1 (10-178)||(29298137-29298304)
chr1 (8-76)||(20454606-20454673)
chr1 (26-185)||(16093826-16093987)
chr1 (7-78)||(20847205-20847275)
chr1 (7-133)||(22532269-22532395)
chr1 (7-60)||(13212974-13213027)
chr1 (4-60)||(21342090-21342146)
chr1 (7-133)||(21026680-21026806)
chr1 (75-188)||(51130632-51130741)
chr1 (10-60)||(21346961-21347011)
chr1 (10-60)||(21707167-21707217)
chr1 (10-60)||(21711709-21711759)
chr1 (4-60)||(15860121-15860177)
chr1 (10-188)||(22123052-22123230)
chr1 (8-76)||(22468749-22468816)
chr1 (7-83)||(38801433-38801508)
chr1 (11-76)||(21714546-21714610)
chr1 (28-176)||(26064959-26065108)
chr1 (83-193)||(1924896-1925005)
chr1 (10-60)||(16275476-16275526)
chr1 (83-193)||(20923910-20924019)
chr1 (8-76)||(20135188-20135255)
chr1 (92-240)||(12271639-12271780)
chr1 (83-193)||(41387815-41387924)
chr1 (114-185)||(20636956-20637026)
chr1 (119-185)||(35981631-35981696)
chr1 (119-185)||(49261452-49261517)
chr1 (8-61)||(24783159-24783212)
chr1 (13-60)||(40389157-40389204)
chr1 (83-158)||(41388048-41388122)
chr1 (93-158)||(39243943-39244008)
chr1 (93-158)||(39247498-39247563)
chr1 (11-76)||(42865266-42865330)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (11-240)||(160688-160916)
scaffold0001 (14-188)||(501088-501261)
scaffold0001 (10-60)||(85692-85742)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (11-240)||(21565546-21565775)
chr5 (7-240)||(21329385-21329618)
chr5 (11-237)||(22959426-22959649)
chr5 (7-240)||(19668898-19669130)
chr5 (7-240)||(21502043-21502277)
chr5 (7-240)||(19660726-19660956)
chr5 (7-240)||(26011923-26012154)
chr5 (26-240)||(20026828-20027043)
chr5 (26-193)||(22144068-22144236)
chr5 (7-193)||(40725853-40726040)
chr5 (10-133)||(22412187-22412309)
chr5 (7-133)||(24493569-24493694)
chr5 (26-240)||(22178107-22178323)
chr5 (7-108)||(36314577-36314678)
chr5 (7-133)||(13025311-13025436)
chr5 (7-133)||(13095495-13095620)
chr5 (7-140)||(8286829-8286964)
chr5 (7-133)||(21729059-21729185)
chr5 (7-133)||(21808384-21808510)
chr5 (7-133)||(23390491-23390617)
chr5 (7-115)||(21997547-21997655)
chr5 (10-188)||(264753-264930)
chr5 (10-188)||(29329934-29330111)
chr5 (10-188)||(39363384-39363561)
chr5 (7-188)||(1096467-1096649)
chr5 (7-129)||(9077952-9078074)
chr5 (7-133)||(25421532-25421658)
chr5 (10-189)||(11581183-11581361)
chr5 (10-126)||(24529223-24529339)
chr5 (10-168)||(10732944-10733102)
chr5 (10-188)||(20909012-20909189)
chr5 (10-188)||(42245350-42245527)
chr5 (10-178)||(36154777-36154942)
chr5 (10-188)||(29345980-29346157)
chr5 (10-193)||(2154593-2154776)
chr5 (7-131)||(25431395-25431518)
chr5 (10-193)||(20901988-20902172)
chr5 (7-133)||(22075018-22075145)
chr5 (10-188)||(29348453-29348630)
chr5 (10-188)||(29350926-29351103)
chr5 (62-195)||(29448057-29448192)
chr5 (10-117)||(39245136-39245242)
chr5 (10-69)||(20918052-20918110)
chr5 (10-60)||(38619434-38619484)
chr5 (11-60)||(23064512-23064561)
chr5 (10-58)||(10775790-10775838)
chr5 (13-178)||(18319027-18319193)
chr5 (10-188)||(32027393-32027570)
chr5 (7-78)||(21293020-21293090)
chr5 (83-193)||(21871507-21871616)
chr5 (83-193)||(21875787-21875896)
chr5 (10-60)||(31061068-31061118)
chr5 (83-193)||(10753594-10753703)
chr5 (10-60)||(20806854-20806904)
chr5 (11-76)||(26704075-26704139)
chr5 (11-76)||(26973808-26973872)
chr5 (26-79)||(37723922-37723975)
chr5 (9-76)||(17517254-17517320)
chr5 (83-193)||(22120131-22120240)
chr5 (119-175)||(21741486-21741541)
chr5 (13-60)||(24067110-24067157)
chr5 (23-77)||(26732884-26732937)
chr5 (17-105)||(18418590-18418677)
chr5 (11-76)||(22032323-22032387)
chr5 (107-179)||(24767287-24767359)
chr5 (74-133)||(20766115-20766174)
chr5 (26-77)||(26740697-26740747)
chr5 (129-188)||(36314670-36314728)
chr5 (11-76)||(18770054-18770118)
chr5 (11-76)||(20805552-20805616)
chr5 (11-75)||(20766974-20767037)
[»] chr3 (108 HSPs)
chr3 (11-240)||(16097332-16097561)
chr3 (11-240)||(16103784-16104012)
chr3 (11-238)||(12174152-12174376)
chr3 (7-240)||(15470927-15471156)
chr3 (7-185)||(14234487-14234665)
chr3 (7-240)||(13210217-13210448)
chr3 (21-240)||(32307691-32307900)
chr3 (11-240)||(9512924-9513140)
chr3 (11-240)||(9520899-9521115)
chr3 (21-240)||(1644572-1644780)
chr3 (11-240)||(49667973-49668193)
chr3 (119-240)||(49389518-49389639)
chr3 (7-193)||(24340657-24340844)
chr3 (10-188)||(27165250-27165429)
chr3 (26-189)||(52523665-52523831)
chr3 (25-193)||(23274705-23274874)
chr3 (26-240)||(37251055-37251270)
chr3 (10-185)||(53301492-53301669)
chr3 (7-193)||(37642199-37642386)
chr3 (10-133)||(24153204-24153326)
chr3 (7-126)||(18438534-18438653)
chr3 (7-133)||(12399209-12399335)
chr3 (7-188)||(14972854-14973036)
chr3 (10-133)||(36166598-36166719)
chr3 (7-133)||(13442274-13442400)
chr3 (7-185)||(22147467-22147646)
chr3 (7-133)||(23083356-23083482)
chr3 (7-105)||(11424783-11424880)
chr3 (26-240)||(22110239-22110454)
chr3 (25-133)||(42386428-42386536)
chr3 (7-194)||(43550457-43550644)
chr3 (10-188)||(9707592-9707769)
chr3 (10-188)||(17463178-17463355)
chr3 (7-126)||(20698437-20698556)
chr3 (10-168)||(29172587-29172745)
chr3 (10-188)||(34159326-34159503)
chr3 (10-188)||(45606892-45607069)
chr3 (10-188)||(55476491-55476668)
chr3 (7-133)||(17487856-17487982)
chr3 (7-133)||(17499338-17499464)
chr3 (10-194)||(8899094-8899277)
chr3 (12-188)||(16282796-16282971)
chr3 (26-161)||(43925977-43926114)
chr3 (9-188)||(13544024-13544202)
chr3 (10-188)||(6469119-6469296)
chr3 (10-188)||(7781332-7781509)
chr3 (14-188)||(12567564-12567737)
chr3 (10-188)||(16454266-16454443)
chr3 (10-188)||(28848596-28848773)
chr3 (10-188)||(38961876-38962053)
chr3 (10-129)||(40213720-40213838)
chr3 (10-133)||(21618449-21618570)
chr3 (7-129)||(25476384-25476506)
chr3 (7-133)||(26686887-26687013)
chr3 (10-72)||(28194693-28194755)
chr3 (10-188)||(13151775-13151953)
chr3 (10-188)||(13154240-13154418)
chr3 (69-189)||(2051137-2051260)
chr3 (10-188)||(10247708-10247885)
chr3 (21-133)||(14572603-14572714)
chr3 (10-129)||(17672626-17672744)
chr3 (10-124)||(55500942-55501055)
chr3 (10-194)||(50242822-50243005)
chr3 (12-188)||(41123892-41124064)
chr3 (10-129)||(15977515-15977633)
chr3 (10-188)||(17446640-17446816)
chr3 (10-69)||(17737236-17737294)
chr3 (7-133)||(43840932-43841058)
chr3 (10-60)||(8499518-8499568)
chr3 (10-60)||(10556985-10557035)
chr3 (10-60)||(15412429-15412479)
chr3 (10-60)||(45577950-45578000)
chr3 (10-129)||(12119768-12119887)
chr3 (172-240)||(12934200-12934268)
chr3 (21-133)||(14576828-14576939)
chr3 (26-129)||(606324-606428)
chr3 (10-60)||(44494809-44494859)
chr3 (26-193)||(53070633-53070799)
chr3 (9-76)||(46822267-46822333)
chr3 (83-193)||(19775998-19776107)
chr3 (83-193)||(37439403-37439512)
chr3 (108-193)||(23413186-23413271)
chr3 (26-123)||(12377940-12378039)
chr3 (9-76)||(12511059-12511125)
chr3 (119-185)||(1465354-1465419)
chr3 (83-193)||(4107164-4107273)
chr3 (83-193)||(4111016-4111125)
chr3 (83-193)||(8489232-8489341)
chr3 (83-193)||(15965202-15965311)
chr3 (83-193)||(15969126-15969235)
chr3 (83-193)||(15973050-15973159)
chr3 (83-193)||(16749761-16749870)
chr3 (11-76)||(856140-856204)
chr3 (8-71)||(14665398-14665460)
chr3 (83-158)||(16750390-16750464)
chr3 (83-193)||(12852300-12852413)
chr3 (8-61)||(14668554-14668607)
chr3 (11-76)||(15878104-15878168)
chr3 (11-76)||(23077530-23077594)
chr3 (83-178)||(45797242-45797337)
chr3 (83-158)||(16749994-16750068)
chr3 (165-240)||(43927291-43927366)
chr3 (28-78)||(13919350-13919399)
chr3 (11-76)||(11298580-11298644)
chr3 (11-76)||(14878569-14878633)
chr3 (8-61)||(30029841-30029894)
chr3 (83-178)||(14501198-14501293)
chr3 (11-59)||(26196500-26196548)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (21-240)||(129919-130138)
scaffold0010 (26-193)||(60649-60818)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (11-240)||(1086-1315)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (11-240)||(45680-45909)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (22-240)||(22562-22776)
scaffold0037 (10-194)||(82072-82255)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (21-240)||(6826-7042)
scaffold0556 (89-240)||(8097-8248)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (11-230)||(133-352)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (7-240)||(38855140-38855372)
chr8 (7-240)||(6520368-6520600)
chr8 (11-240)||(26355588-26355815)
chr8 (7-240)||(5866165-5866395)
chr8 (7-240)||(21490995-21491225)
chr8 (7-240)||(17140916-17141146)
chr8 (26-240)||(20498581-20498796)
chr8 (11-240)||(21285601-21285830)
chr8 (22-240)||(983290-983512)
chr8 (7-225)||(23760747-23760962)
chr8 (7-207)||(21249384-21249582)
chr8 (7-207)||(21255222-21255420)
chr8 (21-240)||(21673718-21673936)
chr8 (26-240)||(37116366-37116582)
chr8 (25-193)||(13508019-13508188)
chr8 (25-193)||(13597551-13597720)
chr8 (7-181)||(17612056-17612231)
chr8 (26-240)||(17266880-17267096)
chr8 (7-133)||(16092337-16092463)
chr8 (7-133)||(22626736-22626861)
chr8 (26-240)||(24353039-24353257)
chr8 (7-133)||(22875065-22875190)
chr8 (8-188)||(28648983-28649164)
chr8 (10-188)||(14409429-14409606)
chr8 (26-195)||(17439438-17439609)
chr8 (7-133)||(7372778-7372904)
chr8 (7-133)||(20536208-20536334)
chr8 (7-126)||(31971257-31971375)
chr8 (4-117)||(6759255-6759368)
chr8 (10-188)||(1484402-1484579)
chr8 (10-188)||(5853277-5853454)
chr8 (10-188)||(20403227-20403404)
chr8 (10-188)||(22001753-22001930)
chr8 (7-133)||(18818404-18818530)
chr8 (7-133)||(21918995-21919121)
chr8 (7-133)||(21923923-21924049)
chr8 (7-117)||(23406379-23406489)
chr8 (7-84)||(18879276-18879352)
chr8 (10-193)||(41598188-41598370)
chr8 (14-188)||(16413301-16413474)
chr8 (10-188)||(20046180-20046357)
chr8 (10-133)||(26219717-26219838)
chr8 (10-188)||(4483281-4483457)
chr8 (10-188)||(15203216-15203393)
chr8 (7-126)||(21395984-21396101)
chr8 (7-126)||(21790477-21790594)
chr8 (7-126)||(16199647-16199765)
chr8 (10-133)||(26225288-26225409)
chr8 (10-188)||(4542358-4542535)
chr8 (7-126)||(21389454-21389571)
chr8 (7-126)||(21778780-21778897)
chr8 (88-240)||(22364744-22364895)
chr8 (10-69)||(19896265-19896323)
chr8 (7-78)||(45131047-45131117)
chr8 (83-193)||(21383887-21383996)
chr8 (4-60)||(19937118-19937174)
chr8 (14-60)||(45290807-45290853)
chr8 (26-193)||(19801362-19801527)
chr8 (8-76)||(23648554-23648621)
chr8 (9-76)||(18678155-18678221)
chr8 (83-193)||(18862412-18862521)
chr8 (83-193)||(21387307-21387416)
chr8 (83-193)||(21411180-21411289)
chr8 (83-193)||(21805672-21805781)
chr8 (83-193)||(21827781-21827890)
chr8 (10-60)||(25484380-25484430)
chr8 (9-76)||(32121734-32121800)
chr8 (10-178)||(14823774-14823941)
chr8 (8-129)||(26223917-26224037)
chr8 (23-60)||(15070571-15070608)
chr8 (26-79)||(19154936-19154989)
chr8 (88-145)||(40492834-40492891)
chr8 (11-76)||(17353996-17354060)
[»] chr6 (86 HSPs)
chr6 (11-240)||(19652199-19652426)
chr6 (7-240)||(28496362-28496592)
chr6 (7-240)||(29808773-29809003)
chr6 (7-240)||(1561303-1561534)
chr6 (7-240)||(20109140-20109374)
chr6 (7-240)||(23019408-23019639)
chr6 (22-240)||(19668386-19668605)
chr6 (7-108)||(27333238-27333339)
chr6 (7-108)||(27393978-27394079)
chr6 (22-175)||(9098466-9098620)
chr6 (7-193)||(8227445-8227632)
chr6 (22-193)||(25644335-25644508)
chr6 (10-194)||(22782227-22782410)
chr6 (21-122)||(4185827-4185928)
chr6 (7-129)||(29060540-29060662)
chr6 (21-122)||(4186381-4186482)
chr6 (7-133)||(16496244-16496370)
chr6 (7-133)||(17287791-17287917)
chr6 (8-129)||(18409826-18409947)
chr6 (7-129)||(19303540-19303661)
chr6 (7-113)||(20076700-20076805)
chr6 (8-188)||(30676695-30676874)
chr6 (10-188)||(2291165-2291342)
chr6 (10-188)||(12742317-12742494)
chr6 (10-188)||(18334577-18334754)
chr6 (10-188)||(19005046-19005223)
chr6 (10-188)||(19858904-19859081)
chr6 (10-188)||(24422547-24422724)
chr6 (10-188)||(33861794-33861971)
chr6 (10-188)||(33864278-33864455)
chr6 (7-129)||(25629354-25629476)
chr6 (10-188)||(1595549-1595726)
chr6 (10-188)||(8055029-8055206)
chr6 (10-188)||(26924625-26924802)
chr6 (7-133)||(20360955-20361081)
chr6 (10-115)||(25656629-25656733)
chr6 (10-194)||(25754809-25754992)
chr6 (10-194)||(20556873-20557054)
chr6 (26-240)||(23076749-23076965)
chr6 (7-126)||(20638285-20638404)
chr6 (7-240)||(22080627-22080846)
chr6 (7-129)||(20593773-20593895)
chr6 (7-69)||(25714417-25714478)
chr6 (8-188)||(34963371-34963550)
chr6 (26-240)||(35008167-35008383)
chr6 (10-188)||(1540896-1541073)
chr6 (62-122)||(4668217-4668277)
chr6 (62-122)||(4675064-4675124)
chr6 (7-126)||(16920634-16920751)
chr6 (7-126)||(35245586-35245703)
chr6 (13-178)||(16448520-16448686)
chr6 (10-129)||(25688502-25688620)
chr6 (11-122)||(31155403-31155514)
chr6 (10-69)||(3852121-3852179)
chr6 (7-133)||(22780222-22780348)
chr6 (26-193)||(18456735-18456901)
chr6 (7-75)||(22831503-22831571)
chr6 (9-76)||(19848048-19848114)
chr6 (83-193)||(22949375-22949484)
chr6 (83-193)||(22953331-22953440)
chr6 (83-193)||(23871819-23871928)
chr6 (83-193)||(23875775-23875884)
chr6 (83-193)||(27325370-27325479)
chr6 (62-195)||(18706359-18706493)
chr6 (9-76)||(23992429-23992495)
chr6 (83-193)||(16760525-16760634)
chr6 (26-162)||(18461895-18462031)
chr6 (26-70)||(11185524-11185568)
chr6 (88-196)||(18696569-18696676)
chr6 (28-105)||(33443068-33443146)
chr6 (26-221)||(18199322-18199519)
chr6 (26-221)||(18204096-18204293)
chr6 (26-69)||(18821904-18821946)
chr6 (107-193)||(16624583-16624669)
chr6 (83-193)||(31477577-31477686)
chr6 (11-76)||(19873120-19873184)
chr6 (11-76)||(21766695-21766759)
chr6 (4-48)||(19008799-19008843)
chr6 (26-221)||(18177578-18177775)
chr6 (11-61)||(18907111-18907161)
chr6 (11-61)||(19862978-19863028)
chr6 (11-77)||(22432249-22432314)
chr6 (11-77)||(22438799-22438864)
chr6 (93-158)||(16624371-16624436)
chr6 (114-179)||(21939488-21939553)
chr6 (149-230)||(28103796-28103877)
[»] chr4 (80 HSPs)
chr4 (11-240)||(8846360-8846605)
chr4 (7-238)||(39706179-39706409)
chr4 (11-240)||(12774011-12774230)
chr4 (22-240)||(43198440-43198661)
chr4 (22-240)||(12288097-12288316)
chr4 (26-240)||(13738-13953)
chr4 (7-208)||(15551817-15552015)
chr4 (22-193)||(52243128-52243302)
chr4 (45-240)||(16596686-16596878)
chr4 (26-240)||(53082039-53082254)
chr4 (7-133)||(7798774-7798900)
chr4 (10-185)||(44928866-44929042)
chr4 (10-129)||(16377522-16377639)
chr4 (7-133)||(6899891-6900016)
chr4 (7-133)||(16270231-16270356)
chr4 (10-194)||(18215253-18215436)
chr4 (7-126)||(7088877-7088996)
chr4 (10-133)||(14280316-14280438)
chr4 (10-188)||(44615288-44615465)
chr4 (10-133)||(54798749-54798872)
chr4 (7-133)||(16239965-16240090)
chr4 (7-132)||(52873363-52873488)
chr4 (26-240)||(46640343-46640558)
chr4 (10-188)||(15118337-15118514)
chr4 (10-188)||(44773072-44773249)
chr4 (10-188)||(52312510-52312687)
chr4 (7-133)||(7893703-7893829)
chr4 (7-133)||(12902757-12902883)
chr4 (10-178)||(12301-12469)
chr4 (8-129)||(19618216-19618336)
chr4 (4-183)||(19242693-19242872)
chr4 (10-188)||(1837494-1837671)
chr4 (7-133)||(44052829-44052955)
chr4 (10-178)||(50222333-50222501)
chr4 (7-84)||(3096293-3096369)
chr4 (9-133)||(22636437-22636561)
chr4 (10-188)||(3515007-3515184)
chr4 (10-188)||(18239404-18239581)
chr4 (10-133)||(8574864-8574985)
chr4 (12-129)||(14038653-14038770)
chr4 (10-194)||(51463847-51464030)
chr4 (14-188)||(15355309-15355483)
chr4 (7-79)||(17046487-17046559)
chr4 (14-133)||(23374354-23374473)
chr4 (10-69)||(7641286-7641344)
chr4 (10-69)||(12610950-12611008)
chr4 (10-69)||(23803369-23803427)
chr4 (10-60)||(44102214-44102264)
chr4 (83-193)||(630710-630819)
chr4 (83-193)||(3331961-3332070)
chr4 (83-193)||(14953897-14954006)
chr4 (8-129)||(14970751-14970871)
chr4 (83-193)||(25690137-25690246)
chr4 (7-124)||(14053306-14053422)
chr4 (83-179)||(13812759-13812854)
chr4 (26-76)||(6190481-6190531)
chr4 (83-193)||(10713083-10713192)
chr4 (83-193)||(10926853-10926962)
chr4 (119-185)||(15099461-15099526)
chr4 (119-185)||(15190428-15190493)
chr4 (83-193)||(15225308-15225417)
chr4 (83-188)||(12487941-12488045)
chr4 (9-76)||(22353835-22353901)
chr4 (83-193)||(15868645-15868754)
chr4 (7-60)||(15367690-15367743)
chr4 (7-60)||(15370018-15370071)
chr4 (7-60)||(15371202-15371255)
chr4 (7-60)||(15373483-15373536)
chr4 (7-60)||(15402703-15402756)
chr4 (89-193)||(15464865-15464970)
chr4 (7-60)||(16223532-16223585)
chr4 (83-178)||(32851450-32851545)
chr4 (83-158)||(15225114-15225188)
chr4 (11-76)||(16348716-16348780)
chr4 (11-76)||(16357004-16357068)
chr4 (8-61)||(20157526-20157579)
chr4 (149-193)||(15791916-15791960)
chr4 (107-179)||(20157240-20157312)
chr4 (26-58)||(21815699-21815731)
chr4 (107-179)||(22634163-22634235)
[»] chr7 (85 HSPs)
chr7 (7-240)||(16219605-16219835)
chr7 (7-240)||(67745-67977)
chr7 (7-240)||(47831807-47832040)
chr7 (7-240)||(34200786-34201016)
chr7 (11-240)||(18005650-18005879)
chr7 (11-240)||(811019-811248)
chr7 (7-240)||(15754777-15755008)
chr7 (7-240)||(28505189-28505419)
chr7 (11-240)||(44014182-44014407)
chr7 (22-240)||(16056343-16056560)
chr7 (7-208)||(11995950-11996148)
chr7 (7-240)||(22072913-22073148)
chr7 (7-188)||(16495402-16495579)
chr7 (22-240)||(12901338-12901557)
chr7 (7-193)||(2280053-2280238)
chr7 (10-133)||(18456408-18456530)
chr7 (7-193)||(19486678-19486865)
chr7 (26-240)||(20220077-20220290)
chr7 (7-133)||(38227481-38227606)
chr7 (10-193)||(17061895-17062077)
chr7 (22-193)||(1867929-1868101)
chr7 (7-194)||(13647325-13647512)
chr7 (29-189)||(12255729-12255892)
chr7 (22-194)||(14044761-14044935)
chr7 (22-194)||(14354791-14354965)
chr7 (7-188)||(18430709-18430889)
chr7 (7-133)||(12698831-12698958)
chr7 (10-129)||(3564363-3564482)
chr7 (10-129)||(48273392-48273511)
chr7 (7-133)||(9509189-9509315)
chr7 (25-193)||(10063757-10063921)
chr7 (10-188)||(456321-456498)
chr7 (10-188)||(11972496-11972673)
chr7 (10-188)||(14949107-14949284)
chr7 (92-240)||(15113028-15113176)
chr7 (92-240)||(15116565-15116713)
chr7 (10-188)||(15376698-15376875)
chr7 (10-188)||(16232520-16232697)
chr7 (10-188)||(20385108-20385285)
chr7 (10-188)||(21189580-21189757)
chr7 (10-188)||(24702238-24702415)
chr7 (10-188)||(32125491-32125668)
chr7 (10-188)||(41522917-41523094)
chr7 (10-188)||(41525379-41525556)
chr7 (11-188)||(11393272-11393448)
chr7 (30-193)||(15008433-15008597)
chr7 (10-178)||(18640272-18640440)
chr7 (10-193)||(44116509-44116691)
chr7 (10-188)||(24704688-24704862)
chr7 (10-188)||(27216860-27217037)
chr7 (10-129)||(16410059-16410177)
chr7 (14-129)||(24275175-24275289)
chr7 (7-133)||(16386242-16386369)
chr7 (10-122)||(16213684-16213795)
chr7 (7-133)||(26211995-26212122)
chr7 (10-69)||(3386333-3386391)
chr7 (10-60)||(13869346-13869396)
chr7 (10-60)||(20110556-20110606)
chr7 (9-126)||(40443393-40443509)
chr7 (10-60)||(13831373-13831423)
chr7 (7-77)||(27847881-27847951)
chr7 (7-84)||(10589039-10589115)
chr7 (22-129)||(15144037-15144143)
chr7 (13-76)||(18154894-18154956)
chr7 (14-178)||(38898370-38898535)
chr7 (11-61)||(14932801-14932851)
chr7 (11-61)||(15356236-15356286)
chr7 (11-61)||(15360350-15360400)
chr7 (83-193)||(18426070-18426179)
chr7 (83-193)||(39267582-39267691)
chr7 (83-193)||(45169773-45169882)
chr7 (35-135)||(14036282-14036384)
chr7 (35-135)||(14346312-14346414)
chr7 (92-128)||(16324135-16324171)
chr7 (10-60)||(26356106-26356156)
chr7 (10-60)||(26358558-26358608)
chr7 (8-61)||(2832508-2832561)
chr7 (11-76)||(12187019-12187083)
chr7 (11-76)||(17138113-17138177)
chr7 (107-179)||(9751500-9751572)
chr7 (83-159)||(18425668-18425743)
chr7 (83-159)||(18425870-18425945)
chr7 (11-61)||(19649556-19649606)
chr7 (33-79)||(48991206-48991252)
chr7 (119-176)||(9389649-9389705)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (7-240)||(6011-6244)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (22-240)||(8481-8702)
scaffold0621 (7-240)||(6535-6767)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (7-239)||(6611-6843)
scaffold0333 (7-239)||(13991-14223)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (7-240)||(923-1155)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (11-240)||(19268-19497)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (22-240)||(10542-10760)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (11-240)||(100378-100607)
scaffold0023 (11-240)||(40062-40291)
scaffold0023 (10-188)||(94411-94588)
scaffold0023 (7-80)||(119875-119948)
scaffold0023 (14-188)||(17425-17598)
scaffold0023 (10-129)||(44454-44573)
scaffold0023 (11-84)||(101503-101576)
scaffold0023 (11-61)||(38546-38596)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (7-240)||(12766-12999)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (7-240)||(11292-11522)
scaffold0046 (7-240)||(1997-2227)
scaffold0046 (7-126)||(28414-28533)
scaffold0046 (7-60)||(4552-4605)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (7-240)||(32538-32768)
scaffold0034 (26-76)||(51936-51985)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (11-240)||(25175854-25176083)
chr2 (11-173)||(7679589-7679750)
chr2 (26-240)||(7620-7835)
chr2 (7-208)||(23071872-23072070)
chr2 (12-240)||(28405981-28406210)
chr2 (22-240)||(18786790-18787009)
chr2 (7-193)||(23708553-23708738)
chr2 (8-240)||(22134105-22134326)
chr2 (7-189)||(19671830-19672011)
chr2 (26-240)||(23791292-23791508)
chr2 (10-188)||(22105412-22105590)
chr2 (92-240)||(22459449-22459598)
chr2 (26-240)||(23207296-23207511)
chr2 (10-133)||(298809-298933)
chr2 (7-133)||(23060513-23060639)
chr2 (26-193)||(20520127-20520295)
chr2 (10-188)||(18808943-18809120)
chr2 (10-188)||(23130862-23131039)
chr2 (10-188)||(23133329-23133506)
chr2 (10-188)||(23709517-23709694)
chr2 (10-188)||(23711998-23712175)
chr2 (10-188)||(26505379-26505556)
chr2 (10-188)||(26507857-26508034)
chr2 (10-188)||(34402507-34402684)
chr2 (10-188)||(39682313-39682490)
chr2 (7-133)||(22337115-22337241)
chr2 (7-133)||(23076442-23076568)
chr2 (7-133)||(23285865-23285987)
chr2 (7-133)||(23654381-23654507)
chr2 (7-105)||(38138-38235)
chr2 (26-240)||(25108906-25109122)
chr2 (10-188)||(571397-571574)
chr2 (10-188)||(6725995-6726172)
chr2 (10-188)||(23135590-23135767)
chr2 (10-188)||(24367774-24367951)
chr2 (10-188)||(28577099-28577276)
chr2 (7-133)||(22731229-22731355)
chr2 (7-133)||(23660023-23660148)
chr2 (10-194)||(32039477-32039660)
chr2 (8-188)||(32214906-32215085)
chr2 (7-84)||(8946657-8946733)
chr2 (13-188)||(21155045-21155219)
chr2 (26-193)||(22413070-22413240)
chr2 (10-188)||(24898180-24898358)
chr2 (10-188)||(24900663-24900841)
chr2 (10-188)||(24903140-24903318)
chr2 (10-188)||(24905617-24905795)
chr2 (10-188)||(24908092-24908270)
chr2 (7-126)||(20309108-20309225)
chr2 (7-129)||(23103396-23103516)
chr2 (7-71)||(23040247-23040310)
chr2 (12-178)||(43137301-43137467)
chr2 (7-133)||(22738175-22738300)
chr2 (10-60)||(38967374-38967424)
chr2 (10-60)||(45029966-45030016)
chr2 (13-69)||(24643054-24643109)
chr2 (26-195)||(24697538-24697709)
chr2 (10-60)||(24529641-24529691)
chr2 (83-193)||(1283657-1283766)
chr2 (83-193)||(30344758-30344867)
chr2 (26-183)||(23004767-23004926)
chr2 (14-76)||(25616192-25616253)
chr2 (28-78)||(23287384-23287433)
chr2 (26-76)||(32451981-32452031)
chr2 (28-77)||(26392403-26392451)
chr2 (11-76)||(22799179-22799243)
chr2 (11-76)||(40622263-40622327)
chr2 (28-76)||(23038048-23038095)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (21-240)||(5657-5875)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (7-240)||(12942-13172)
scaffold0138 (88-240)||(18125-18277)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (10-240)||(15664-15891)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (26-240)||(53436-53651)
scaffold0075 (93-193)||(8230-8330)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (11-238)||(2535-2762)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (26-240)||(12587-12801)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (7-240)||(34123-34353)
scaffold0175 (7-60)||(273-326)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (11-240)||(32102-32324)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (11-240)||(132662-132884)
scaffold0028 (25-240)||(62216-62428)
scaffold0028 (10-188)||(136680-136857)
scaffold0028 (10-188)||(139149-139326)
scaffold0028 (10-188)||(144087-144264)
scaffold0028 (10-188)||(134211-134388)
scaffold0028 (10-188)||(141618-141795)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (7-145)||(15760-15898)
scaffold0020 (11-75)||(178898-178961)
scaffold0020 (199-240)||(15720-15761)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (11-240)||(14585-14814)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (7-188)||(1013-1190)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (26-240)||(128857-129072)
scaffold0022 (30-240)||(78345-78555)
scaffold0022 (10-133)||(116430-116551)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (22-240)||(7964-8180)
scaffold0218 (54-240)||(29168-29354)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (10-188)||(38641-38820)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (11-135)||(2799-2923)
scaffold0628 (198-240)||(2692-2734)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (28-240)||(7946-8161)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (7-193)||(11464-11651)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (7-193)||(17961-18148)
scaffold0247 (10-60)||(2241-2291)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (7-193)||(38190-38377)
scaffold0124 (83-193)||(21828-21937)
scaffold0124 (83-193)||(24587-24699)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (7-188)||(3090-3271)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (26-240)||(97024-97240)
scaffold0006 (26-240)||(106302-106518)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (7-113)||(23898-24001)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (65-238)||(2108-2281)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (26-240)||(136255-136471)
scaffold0021 (26-240)||(144963-145179)
scaffold0021 (7-77)||(121766-121835)
scaffold0021 (8-79)||(174767-174838)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (26-240)||(6170-6386)
scaffold0420 (26-73)||(13793-13840)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (22-193)||(27683-27855)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (26-133)||(1051-1158)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (30-240)||(38339-38551)
scaffold0139 (11-61)||(19980-20030)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (22-176)||(25121-25276)
scaffold0123 (88-195)||(619-725)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (22-193)||(16034-16206)
scaffold0357 (26-193)||(13147-13316)
scaffold0357 (26-78)||(2680-2732)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (9-133)||(39479-39602)
scaffold0141 (83-193)||(13854-13963)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (9-133)||(75210-75333)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (7-133)||(25896-26021)
scaffold0026 (7-133)||(39858-39983)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (10-133)||(44702-44825)
scaffold0122 (14-129)||(26064-26179)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (8-129)||(3185-3306)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (7-133)||(32942-33067)
scaffold0145 (7-133)||(38761-38886)
scaffold0145 (5-69)||(9744-9807)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (8-129)||(17214-17337)
scaffold0056 (26-193)||(79264-79430)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (7-133)||(13211-13337)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (7-133)||(1851-1977)
scaffold0016 (107-181)||(207467-207541)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (7-133)||(32952-33077)
scaffold0120 (7-133)||(45928-46053)
scaffold0120 (7-129)||(16113-16235)
scaffold0120 (7-69)||(17389-17450)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (7-133)||(39913-40038)
scaffold0080 (26-240)||(19772-19987)
scaffold0080 (83-193)||(48921-49030)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (22-240)||(103526-103737)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (7-126)||(4849-4968)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (10-188)||(20747-20924)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (10-188)||(37821-37998)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (10-188)||(158435-158612)
scaffold0003 (10-188)||(339889-340065)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (7-133)||(51913-52039)
scaffold0011 (7-133)||(167973-168099)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (76-208)||(2365-2494)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (9-129)||(10772-10891)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (7-133)||(8528-8650)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (10-188)||(4694-4871)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (10-188)||(13392-13569)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (10-133)||(22886-23008)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (10-188)||(13947-14124)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (7-126)||(1289-1406)
scaffold0106 (7-126)||(7266-7383)
scaffold0106 (10-76)||(15291-15356)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (7-133)||(1043-1169)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (7-133)||(3470-3596)
scaffold0292 (7-133)||(343-468)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (7-126)||(15466-15584)
scaffold0114 (11-76)||(7295-7359)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (7-126)||(32067-32184)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (10-178)||(16784-16952)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (26-240)||(267679-267894)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (26-240)||(569-783)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (11-91)||(28806-28887)
scaffold0211 (164-240)||(28699-28775)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (7-126)||(8479-8598)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (7-126)||(51582-51699)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (7-126)||(13497-13615)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (7-129)||(16599-16721)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (25-133)||(24297-24406)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (57-240)||(54-239)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (7-133)||(6116-6245)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (7-124)||(16282-16397)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (26-179)||(20372-20524)
scaffold0031 (7-60)||(128751-128804)
scaffold0031 (83-193)||(35853-35962)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (9-129)||(9241-9360)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (7-84)||(4712-4788)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (7-145)||(1952-2091)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (62-122)||(9133-9193)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (7-79)||(10472-10544)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (10-194)||(12064-12241)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (10-188)||(40400-40577)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (7-133)||(4508-4633)
scaffold0228 (7-133)||(12090-12215)
scaffold0228 (7-133)||(22042-22167)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (10-178)||(161083-161252)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (10-194)||(106-289)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (8-129)||(11286-11406)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (10-126)||(5132-5246)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (65-193)||(225465-225593)
scaffold0012 (83-193)||(189144-189253)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (13-69)||(4300-4355)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (7-126)||(1053-1170)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (7-126)||(20910-21030)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (10-193)||(4214-4396)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (7-74)||(4888-4954)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (8-129)||(12293-12413)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (7-77)||(46995-47065)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (26-240)||(1685-1900)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (11-76)||(23843-23907)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (13-60)||(1393-1440)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (7-124)||(11447-11564)
scaffold0235 (83-178)||(13638-13733)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (11-61)||(36454-36504)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (26-113)||(2694-2783)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (164-208)||(2223-2267)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (10-69)||(29931-29990)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (83-193)||(627-736)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (93-179)||(6-92)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (83-193)||(11268-11377)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (83-188)||(32432-32536)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (26-69)||(11982-12024)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (28-83)||(4545-4599)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (11-61)||(29558-29608)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (11-76)||(1881-1945)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (11-76)||(10575-10639)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (11-76)||(21856-21920)
scaffold0210 (11-76)||(29748-29812)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (11-76)||(69794-69858)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (107-179)||(12758-12830)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (107-179)||(9784-9856)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (89-188)||(27912-28012)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (11-61)||(159-209)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (28-78)||(206575-206624)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (11-76)||(6095-6159)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (11-60)||(289-338)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (11-76)||(26828-26892)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (11-76)||(4857-4921)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (11-76)||(44081-44145)


Alignment Details
Target: scaffold0555 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10429
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10548  T
Q  122 catctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaaca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10547 catctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaaca 10448  T
Q  222 acaagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10447 acaagataaacaacttagt 10429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 33681010 - 33681240
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681010 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 33681106  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681107 aatgcaagtcgtcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 33681206  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681207 actagaacaacaacaacaagataaacaacttagt 33681240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 22237630 - 22237861
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237630 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 22237726  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22237727 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacatcaattcatatgtatcagtctc 22237826  T
Q  207 accgaaacaacaa-caacaagataaacaacttagt 240  Q
     | | |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22237827 gctggaacaacaatcagcaagataaacaacttagt 22237861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52927870
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat------------ 52927989  T
Q  122 catctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaaca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  52927988 catctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaata 52927889  T
Q  222 acaagataaacaacttagt 240  Q
     ||||||||||||||||||    
T  52927888 gcaagataaacaacttagt 52927870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248508
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 20248382  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
    |||   ||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  20248383 caa---atcaacaacttaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacatggattcatatgcatcagtcttactg 20248479  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20248480 -gacaacaacatcaagataaataacttagt 20248508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921757
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 22921887  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttacc 209  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||     
T  22921886 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacaaaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 22921788  T
Q  210 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22921787 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagt 22921757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 240
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918834
Alignment:
Q  23 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa---atcaac 20918716  T
Q  123 atctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaa 222  Q
    | ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||  |||||    
T  20918717 aactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacatcaattcataagcatgagtcttactggaacattaacaa 20918816  T
Q  223 caagataaacaacttagt 240  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  20918817 caaggtaaacgacttagt 20918834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 21754059 - 21754268
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  21754059 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaaca 21754157  T
Q  121 acatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaac 220  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||    
T  21754158 acatctcaattatc-aacataatccatttaatgtatatac--------aacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaatgac 21754248  T
Q  221 aacaagataaacaacttagt 240  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  21754249 agcaagataaacaacttagt 21754268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861457
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21861573  T
Q  126 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaaca 224  Q
    ||||| | ||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||    |||| ||||| |||||||||| | ||    
T  21861572 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataatattcaggcttactgaaacaacaatagca 21861473  T
Q  225 agataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||||||||||    
T  21861472 agataaacaacttagt 21861457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896146
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21896259  T
Q  126 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaaca 224  Q
    ||||| | ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||| ||||| ||   ||||||||||    
T  21896258 tcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataatattcaggcttactga---aacaacaaca 21896162  T
Q  225 agataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||||||||||    
T  21896161 agataaacaacttagt 21896146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295495
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 14295573  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14295572 aatgtaa---atcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattat-aacaacatcaa 14295495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261015
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacatc 35261084  T
Q  126 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||| | ||| |||||||||  |||||| |||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  35261083 tcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaatcat 35261015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 195
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758839
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 119  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||  || |    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaac 16758763  T
Q  120 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatat 195  Q
    |||||| |||   ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16758764 aacatcacaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatat 16758839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433193
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||| ||||  ||||| || |||| |||||| ||    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaa 433107  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  433108 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatcat 433193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368176
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 16368290  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    |||| || |||    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||||||||      
T  16368289 tctc-aacatcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 16368191  T
Q  224 aagataaacaactta 238  Q
    |||||||||||||||    
T  16368190 aagataaacaactta 16368176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50210212
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 50210235  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  50210234 aatgcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593719
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23593800  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  23593799 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 23593719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250724
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 27250752  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  27250751 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 27250724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049933
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||  |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||   |||| ||||| ||||||||||||      
T  41050038 tctcaac-atcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 41049940  T
Q  224 aagataa 230  Q
    |||||||    
T  41049939 aagataa 41049933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22130973 - 22130844
Alignment:
Q  62 cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatataca 161  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||| |||||||    
T  22130973 cagcaacataggcagtatccaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgcatataca 22130877  T
Q  162 actatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22130876 attatataacattataagcaacatcaaatcata 22130844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34509899
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaa 34509881  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatct 126  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  34509882 tgcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574836
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||| |    
T  45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacc 45574910  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaa-acataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
     ||||||||||| |||| |||||| ||| || | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  45574909 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 45574836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50614003
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50614120  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||| |||    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||  | ||||||||| ||||||   |||| ||||| |||  ||||||       
T  50614119 tctcaaacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacggt 50614020  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    |||| ||||||||||||    
T  50614019 aagacaaacaacttagt 50614003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621831
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50621948  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||| |||    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||  | ||||||||| ||||||   |||| ||||| |||  ||||||       
T  50621947 tctcaaacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacggt 50621848  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    |||| ||||||||||||    
T  50621847 aagacaaacaacttagt 50621831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 50686630 - 50686846
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||    |||  |  ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||    
T  50686630 cttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaatagttcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaaca 50686729  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||   ||||||   |||| ||||| ||||||||||||      
T  50686730 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcggatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 50686829  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||| |||||||||    
T  50686830 aagataagcaacttagt 50686846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13989043
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13988963  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  13988964 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 13989043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923276
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21923356  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21923355 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 21923276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840885
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 21840863  T
Q  108 atgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  21840864 atgcaagtcaacaacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475072
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21475152  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21475151 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 21475072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776865
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaa 29776785  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  29776786 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 29776865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612490
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 31612410  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| ||||||||||  || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  31612411 tgcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 31612490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 21161720 - 21161830
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21161720 catcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaacaaaa-cagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatg 21161818  T
Q  111 caagtcatcaac 122  Q
    ||| ||||||||    
T  21161819 caattcatcaac 21161830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362095
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |  ||||||   ||| || ||||| |||| ||||||     
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacga-cagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatca 16362012  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  16362013 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 16362095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298304
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaa 29298233  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  29298234 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 29298304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454606
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093826
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat-caac 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||  |||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaac 16093889  T
Q  123 atctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 185  Q
    |||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  16093888 atctcaaacatcataggtaattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacat 16093826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847205
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagta 78  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagta 20847205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532395
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 22532367  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  22532368 cattgcaattcaacaacatcttaaatat 22532395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212974
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13212974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342146
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21342146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21026806
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| |||||  |||  |||||    
T  21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatc 21026778  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  21026779 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 21026806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 188
Target Start/End: Original strand, 51130632 - 51130741
Alignment:
Q  75 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacatt 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  51130632 agtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaa---atcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 51130728  T
Q  175 ataaacaacatcaa 188  Q
    || |||||||||||    
T  51130729 at-aacaacatcaa 51130741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347011
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21347011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707217
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21707217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711759
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21711759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860121
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15860121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123052
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |  |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||  |||||| || ||| |  ||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 22123052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468749
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcaacataggcag 22468749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801433
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaa 83  Q
    ||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714610
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaat-agcagcataggcag 21714610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065108
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||   |||  |  |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  26064959 tagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaatacc-aatgcaaatcaacaacatc 26065057  T
Q  126 tcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattat 176  Q
    ||||| |||| | |||||||  |||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  26065058 tcaaagatcatatataattcaagtaatacatatacaaatatatcacattat 26065108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1925005 - 1924896
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  1925005 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 1924907  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  1924906 catcaaatcat 1924896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275476
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaa 16275476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20924019 - 20923910
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  20924019 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 20923921  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  20923920 catcaaatcat 20923910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135255
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaat-agcagcataggcag 20135255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 240
Target Start/End: Original strand, 12271639 - 12271780
Alignment:
Q  92 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattc 191  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | |   |||| |   ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  12271639 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatatttacgtataactaaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaactc 12271738  T
Q  192 atatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |       ||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  12271739 a-------cagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagt 12271780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41387924 - 41387815
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  41387924 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatcttaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 41387826  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  41387825 catcaaatcat 41387815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 185
Target Start/End: Original strand, 20636956 - 20637026
Alignment:
Q  114 gtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 185  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  20636956 gtcaacaacatcccaaata-caaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacat 20637026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35981696 - 35981631
Alignment:
Q  119 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  35981696 caacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacat 35981631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 185
Target Start/End: Original strand, 49261452 - 49261517
Alignment:
Q  119 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  49261452 caacatctcaaatatcaa-cataatttatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacat 49261517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 24783212 - 24783159
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat 61  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24783212 catcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaat 24783159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389204
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaa 40389204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41388122 - 41388048
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 158  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  41388122 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 41388048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 39244008 - 39243943
Alignment:
Q  93 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 158  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  39244008 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 39243943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 39247563 - 39247498
Alignment:
Q  93 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 158  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  39247563 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 39247498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 42865330 - 42865266
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42865330 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaat-agcaacatatgcag 42865266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160916
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatg 160787  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160788 caa-tcaacaacatgtcaaatatcaaacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 160886  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160887 aaacaacaacaacaagataaacaacttagt 160916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501261
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 501185  T
Q  113 agtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  501186 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 501261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85692
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 85692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565775
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatccaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 21565645  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  21565646 caagtcatcaacatttcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttacta 21565745  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565746 gaacaacaacaacaagataaacaacttagt 21565775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329385
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcg 21329519  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||    
T  21329518 aattcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggctt 21329419  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329418 actgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 21329385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959426
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatg 22959550  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
    |||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  22959549 caa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattttaaccaacattgattcatatgcatcagtcttactg 22959453  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataaacaactt 237  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22959452 gaacaaaaacaacaagataaacaactt 22959426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19669130
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcg 19668997  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca--attcatatgcatcagtc 204  Q
    |||||||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19668998 aatgcaa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaatattcatatgcatcagtc 19669094  T
Q  205 ttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19669095 ttactggaacaacaacaacaagataaacgacttagt 19669130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21502043
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcagcatgatataacaatatcg 21502178  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtct 205  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||    
T  21502177 aatgcaagtcatcatcatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggct 21502078  T
Q  206 taccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21502077 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagt 21502043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660726
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||    
T  19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcttgatataatgatatcg 19660857  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||  ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  19660856 aatataa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 19660760  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || | ||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  19660759 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagt 19660726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26011923
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  26012154 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaacatgatataacaatatca 26012057  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    ||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||  | ||||   |||| |||    
T  26012056 aatgtgaatcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattatatagttcaggctt 26011957  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26011956 actgaaacaacaataacaagataaacaacttagt 26011923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026828
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaaca 20026944  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    || |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||   |||| ||||| |||||||| |||||    
T  20026943 tcacaac-atcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacatataattcaggcttactgaaacaactacaac 20026845  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||||||||    
T  20026844 aagataaacaacttagt 20026828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144236
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacatc 22144167  T
Q  126 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||| | ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22144168 tcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaattcat 22144236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40726040
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaagcatcatgatataataatatcg 40725952  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
     | | |||| | ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40725953 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 40726040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412309
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgat-aacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 22412285  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  22412286 gcaagtcaacaacatctcaaatat 22412309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24493694
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 24493667  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24493668 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 24493694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178107
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 22178224  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||   | ||  |||| ||||||||||||      
T  22178223 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcatataatttaggtttactgaaacaacaacagt 22178124  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||| |||||||||    
T  22178123 aagataagcaacttagt 22178107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314678
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 36314676  T
Q  107 aa 108  Q
    ||    
T  36314677 aa 36314678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025436
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||   |||||     
T  13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatca 13025409  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13025410 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 13025436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095620
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||   |||||     
T  13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatca 13095593  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13095594 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 13095620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286829
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc--aaatcatcatgatataacaatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| || ||||| |||| |||||    
T  8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatat 8286866  T
Q  105 cgaatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacat 140  Q
    | | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  8286865 caattgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacat 8286829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729059
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21729087  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  21729086 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 21729059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808384
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21808412  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  21808411 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 21808384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390491
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23390519  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23390518 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 23390491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997547
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 21997557  T
Q  106 gaatgcaagt 115  Q
     |||||||||    
T  21997556 aaatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264753
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 264833  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  264832 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 264753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330111
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 29330031  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  29330032 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 29330111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363561
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39363481  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  39363482 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 39363561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096649
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| || ||| | |||| ||||||    
T  1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatc 1096565  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
     ||||||| ||| |||||||||| |||| ||  ||||||||  |||||| |||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  1096566 aaatgcaaatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 1096649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078074
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 9078050  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
     | ||||||||| |||||||||||    
T  9078051 aagtgcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25421658
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25421630  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  25421631 aattgcaagtcaacagcatcttaaatat 25421658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581183
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 11581264  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaat 189  Q
    |||||||||  ||| |||||| || |||   |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  11581263 tgcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaat 11581183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529339
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaa 24529321  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatct 126  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  24529322 tgcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732944
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10733005  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatat 168  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  10733004 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10732944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909189
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-aagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20909109  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20909110 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 20909189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245350
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 42245430  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  42245429 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 42245350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154777
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 36154848  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  36154847 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 36154777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346157
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29346077  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  29346078 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 29346157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154593
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |     
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 2154679  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaa--atatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2154678 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 2154593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431518
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25431492  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaat 131  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||    
T  25431493 aattgcaagtcaacaacatcttaaat 25431518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20901988
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 20902075  T
Q  108 atgcaagtcatcaacatctcaa--atatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
     ||||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  20902074 gtgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 20901988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075145
Alignment:
Q  7 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 104  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||| |||||    
T  22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatat 22075116  T
Q  105 cgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    | | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  22075117 caattgcaattcaacaacatcttaaatat 22075145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348630
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaa-cagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29348550  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  29348551 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 29348630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351103
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaa-cagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29351023  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  29351024 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 29351103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 195
Target Start/End: Original strand, 29448057 - 29448192
Alignment:
Q  62 cagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatata 159  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| || |||||| ||||||| |||||    
T  29448057 cagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgtaattcatgtaatgcatata 29448156  T
Q  160 caactatataacattataaacaacatcaattcatat 195  Q
    ||| || || || |||| | ||||||||| ||||||    
T  29448157 caaatacatcaccttattatcaacatcaaatcatat 29448192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 117
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245242
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39245233  T
Q  109 tgcaagtca 117  Q
    |||||||||    
T  39245234 tgcaagtca 39245242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20918052
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca 20918052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619484
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38619484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064561
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 23064561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775790
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 10775790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319027
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||    
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 18319096  T
Q  112 aagtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
    ||||| |||||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  18319095 aagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 18319027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027570
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaa-caacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32027490  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    | ||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  32027491 tccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 32027570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21293020
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagta 78  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21871616 - 21871507
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21871616 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacataattcatgcaatatatatcgaattatataacattataaatat 21871518  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||||||||    
T  21871517 catcaattcat 21871507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21875896 - 21875787
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21875896 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacataattcatgcaatatatatcgaattatataacattataaatat 21875798  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||||||||    
T  21875797 catcaattcat 21875787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061118
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 31061118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 10753594 - 10753703
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  10753594 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 10753692  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  10753693 catcaaatcat 10753703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806854
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaa 20806854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704139
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaat-agcagcataggcag 26704139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973872
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaat-agcagcataggcag 26973872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Original strand, 37723922 - 37723975
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtat 79  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37723922 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtat 37723975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517254
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaat-agcagcataggcag 17517254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22120240 - 22120131
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  22120240 aatcatcat-atataacaattacaaatgaacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 22120142  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  22120141 catcaaatcat 22120131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21741541 - 21741486
Alignment:
Q  119 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacatta 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21741541 caacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataacatta 21741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067157
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaa 24067157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  23 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagt 77  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagttaataaacaa-cagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Original strand, 18418590 - 18418677
Alignment:
Q  17 cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  18418590 cttaatcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaa-catcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatc 18418677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032387
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaat-agcaacataggcag 22032387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24767359 - 24767287
Alignment:
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 179  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  24767359 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 24767287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766115
Alignment:
Q  74 cagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20766174 cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 20766115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagt 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaa-cagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 188
Target Start/End: Original strand, 36314670 - 36314728
Alignment:
Q  129 aatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  36314670 aatatcgaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattat-aacaacatcaa 36314728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18770118 - 18770054
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  18770118 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggtcgaataacaat-agcaacataggcag 18770054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 20805552 - 20805616
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20805552 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcag 20805616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 20766974 - 20767037
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggca 75  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20766974 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggca 20767037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 108)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097561
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatcatataacaatatcgaatg 16097431  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16097432 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 16097531  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16097532 gaacaacaacagcaagataaacaacttagt 16097561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16104012
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 16103883  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  16103884 caa-tcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcatatggattagtcttactg 16103982  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16103983 gaacaacaacagcaagataaacaacttagt 16104012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174152
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 12174277  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
    |||   | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  12174276 caa---aacaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattgattcatatgcatcagtcttactg 12174180  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataaacaactta 238  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||    
T  12174179 gaacaacaacagcaagctaaacaactta 12174152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 15470927 - 15471156
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470927 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 15471023  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |  ||||||   |||| |||    
T  15471024 aatgcaagtcatcaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcatataattcaggctt 15471122  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471123 actgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 15471156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 185
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234665
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 14234586  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 185  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  14234587 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacat 14234665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210217
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 13210349  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaaca-tcaattcatatgcatcagtct 205  Q
    |||||||   ||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||    
T  13210348 aatgcaa---atcaacaacttaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgaattcatatgcatcagcct 13210252  T
Q  206 taccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||| | ||    |||||||||||||||||||||||    
T  13210251 tactggaatgttaacaacaagataaacaacttagt 13210217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 32307691 - 32307900
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  32307691 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaaca 32307789  T
Q  121 acatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaac 220  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||||  ||    
T  32307790 acatctcaattatc-aacataatccatttaatgtatatac--------aacattataaacaacattaattcataagcatcagtcttactagaacaatgac 32307880  T
Q  221 aacaagataaacaacttagt 240  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  32307881 agcaagataaacaacttagt 32307900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9513140
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 9513023  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
    ||    ||||||||||||  |||| |||||||| | | |||||||        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9513024 ca----atcaacatctcatttatc-aacataatccatttaatgta--------tataaaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 9513110  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9513111 gaacaataacaacaaggtaaacaacttagt 9513140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9521115
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 9520998  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
    ||    ||||||||||||  |||| |||||||| | | ||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9520999 ca----atcaacatctcatttatc-aacataatccatttaatgtatat--aac------acattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 9521085  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9521086 gaacaataacaacaaggtaaacaacttagt 9521115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1644780 - 1644572
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 120  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  1644780 atcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatgcaaatcatcattatataacaatatcgaatacaa-tcaaca 1644683  T
Q  121 acatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaac 220  Q
    | ||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  1644682 atatctcaattatc-aacataatccatttaatgtatatac--------aacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataac 1644592  T
Q  221 aacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1644591 aacaagataaacaacttagt 1644572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49667973
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 49668094  T
Q  111 caagtcatc-aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttacc 209  Q
    ||| ||| | |||||||||  |||| |||||||| | | ||| ||||||||        | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  49668093 caa-tcaacaaacatctcatttatc-aacataatccatttaaagtatatac--------agcattatatacaacatcaactcatatgcatcagtcttact 49668004  T
Q  210 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    | |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  49668003 ggaacaatgacagcaagataaacaacttagt 49667973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49389639 - 49389518
Alignment:
Q  119 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  49389639 caacatctcaactatcaaacataattcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 49389540  T
Q  219 acaacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49389539 acaacaagataaacaacttagt 49389518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340657
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaacatcatgatataataatatcg 24340745  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    || |||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24340744 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 24340657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165429
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||    
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaacaacatgatataccaatatcaaat 27165349  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||   ||| ||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  27165350 gcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 27165429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523665
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaaca 52523732  T
Q  124 tctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaat 189  Q
    ||||||| | ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  52523731 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaat 52523665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274874
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 124  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 23274804  T
Q  125 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    |||||||| ||| | |||||||  |||| | |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||    
T  23274805 ctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaatcat 23274874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251055
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37251171  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||  |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||| | ||||||||||      
T  37251170 tctcaac-atcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcagacttactggaacaacaacagt 37251072  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||||||||    
T  37251071 aagataaacaacttagt 37251055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301492
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 53301570  T
Q  110 gcaagtca-tcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 185  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||  ||| |   ||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  53301569 gcaagtcattcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattacgtatacaattatatcacaatataaacaacat 53301492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642199
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 37642287  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
     | | |||| | ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37642286 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 37642199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153204
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgat-agcaacataggtagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 24153228  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  24153227 gcaagtcaacaacatcttaaatat 24153204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18438653
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||    
T  18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatc 18438632  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatct 126  Q
     ||||||||||| ||||||||    
T  18438633 aaatgcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399335
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 12399307  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  12399308 aaatgcaattcaacaacatcttaaatat 12399335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14973036
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14972952  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
     ||||||| ||| |||||||||| |||| ||  ||||||||  |||||| |||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  14972953 aaatgcaaatcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 14973036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166719
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-gcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 36166695  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  36166696 gcaagtcaacaacatctcaaatat 36166719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442400
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 13442372  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  13442373 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 13442400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147467
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 22147547  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 185  Q
     | | |||| | ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22147546 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23083356
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  |||| |||| ||||||    
T  23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatc 23083384  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23083383 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 23083356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424783
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataacaatatc 11424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110239
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagca 22110355  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    |||| || |||| | | ||||| |||||||  ||||||  ||||| ||||||| |||||| |||| |||||    |||| ||||| ||||||||||||      
T  22110354 tctc-aacatcatatagaattcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcatacaattcaggcttactgaaacaacaacagt 22110256  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||| |||||||||    
T  22110255 aagataagcaacttagt 22110239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386536
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaaca 42386526  T
Q  124 tctcaaatat 133  Q
    ||||||||||    
T  42386527 tctcaaatat 42386536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550457
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||| || ||||| |||| ||||||    
T  43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatga-cagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatc 43550546  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
     ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  43550545 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 43550457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707592
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 9707672  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    | ||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  9707671 tacaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 9707592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463355
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17463275  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  17463276 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 17463355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698437
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || |||||  ||| ||||||    
T  20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatc 20698458  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatct 126  Q
     | ||||| ||||||||||||    
T  20698457 aattgcaattcatcaacatct 20698437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172587
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29172648  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatat 168  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  29172647 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29172587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159503
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34159423  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  34159424 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 34159503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606892
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 45606972  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  45606971 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 45606892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476668
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55476588  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  55476589 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 55476668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17487982
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17487954  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  17487955 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 17487982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499464
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17499436  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  17499437 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 17499464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899277
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8899191  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  8899192 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 8899277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282796
Alignment:
Q  12 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||||| |||||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatg 16282874  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16282873 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 16282796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926114
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 43926076  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatataca 161  Q
    ||||||| |||| | | ||||| ||||||| |||||||    
T  43926077 tctcaaacatcatatacaattcatgtaatgcatataca 43926114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 188
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544202
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 13544121  T
Q  108 atgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  13544122 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 13544202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469119
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6469199  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | ||||||   |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  6469198 tgcaagtcaacaacgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 6469119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781332
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 7781412  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  7781411 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 7781332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567737
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 12567661  T
Q  113 agtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  12567662 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 12567737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454266
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16454346  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16454345 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 16454266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848596
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 28848676  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||    
T  28848675 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtat-aacaacatcaa 28848596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961876
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 38961956  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  38961955 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 38961876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213720
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| | ||||||| || || |||||||| |||| |||||| ||    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-catcaacaca-gcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaa 40213741  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  40213740 tgcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 21618449 - 21618570
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21618449 tcatcttctcaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 21618546  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  21618547 gcaagtcaacaacatctcaaatat 21618570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476384
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaa-cagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 25476408  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
     ||||||||||| |||||||||||    
T  25476407 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687013
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 26686985  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  26686986 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 26687013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacatag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151775
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13151856  T
Q  108 atgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  13151855 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 13151775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154240
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13154321  T
Q  108 atgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  13154320 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 13154240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051137
Alignment:
Q  69 ataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaacta 165  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || || | |||||||  |||||| |||||||| ||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaatta 2051161  T
Q  166 tataacattataaacaacatcaat 189  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  2051160 tatcacattataaacaacatcaat 2051137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247708
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10247788  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  10247787 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 10247708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 14572603 - 14572714
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||  ||||| ||    
T  14572603 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacatagacagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaaca 14572701  T
Q  121 acatctcaaatat 133  Q
    |||||| ||||||    
T  14572702 acatcttaaatat 14572714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672744
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17672723  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||||| ||| |||| ||||||    
T  17672724 tgcaaatcaacaacgtctcaa 17672744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55501039  T
Q  109 tgcaagtcatcaacat 124  Q
    ||||||||| ||||||    
T  55501040 tgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50243005
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 50242919  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  50242920 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 50243005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124064
Alignment:
Q  12 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 41123986  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  41123987 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 41124064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977633
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 15977612  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  15977613 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446640
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17446720  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | || ||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  17446719 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 17446640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737294
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca 17737294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841058
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 43841030  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  43841031 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 43841058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499568
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 8499568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557035
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 10557035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412479
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15412479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577950
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45577950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119768
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaa-cagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12119790  T
Q  109 tgcaagtc-atcaacatctcaa 129  Q
    |||||||| |||||| ||||||    
T  12119789 tgcaagtcaatcaacgtctcaa 12119768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12934268 - 12934200
Alignment:
Q  172 attataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  12934268 attataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagt 12934200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14576939 - 14576828
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 120  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | | || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||    
T  14576939 atcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaa-cagcaacatagacagtataaacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 14576841  T
Q  121 acatctcaaatat 133  Q
    |||||| ||||||    
T  14576840 acatcttaaatat 14576828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 606428 - 606324
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |   ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  606428 cttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcacataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattcaacaaca 606330  T
Q  124 tctcaa 129  Q
    ||||||    
T  606329 tctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494859
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaa 44494859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070633
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||| || || || |||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 53070702  T
Q  125 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| | | ||||||||||| ||||    
T  53070701 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatct-aacaacatcaaatcat 53070633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822333
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcag 46822333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 19775998 - 19776107
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  19775998 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 19776096  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  19776097 catcaaatcat 19776107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37439512 - 37439403
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  37439512 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 37439414  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  37439413 catcaaatcat 37439403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23413271 - 23413186
Alignment:
Q  108 atgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  23413271 atgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatccatctatataacattataaatatcatcaaatcat 23413186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 123
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378039
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 12378039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511125
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcag 12511125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1465419 - 1465354
Alignment:
Q  119 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||    
T  1465419 caacatctcaaatatcaa-cataattcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacat 1465354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4107273 - 4107164
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  4107273 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 4107175  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  4107174 catcaaatcat 4107164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4111125 - 4111016
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  4111125 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 4111027  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  4111026 catcaaatcat 4111016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8489341 - 8489232
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  8489341 aatcatcat-atataacaattacaaatacacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaaatatataacattataaatat 8489243  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  8489242 catcaaatcat 8489232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 15965202 - 15965311
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  15965202 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 15965300  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  15965301 catcaaatcat 15965311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 15969126 - 15969235
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  15969126 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 15969224  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  15969225 catcaaatcat 15969235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 15973050 - 15973159
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  15973050 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 15973148  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  15973149 catcaaatcat 15973159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16749870 - 16749761
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  16749870 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatcttaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 16749772  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  16749771 catcaaatcat 16749761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856204
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaat-agcaacataggcag 856204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 71
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665460
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacata 71  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaat-agcaacata 14665460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16750464 - 16750390
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 158  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||    
T  16750464 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatgtatat 16750390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12852413 - 12852300
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatata----caactatataacattataa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||    ||| |||||||||||| ||    
T  12852413 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatatatccaattatataacattaaaa 12852315  T
Q  179 acaacatcaattcat 193  Q
    | | |||||| ||||    
T  12852314 aaatcatcaaatcat 12852300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668607
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat 61  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaat 14668607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878104
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaat-agcagcataggcag 15878104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077530
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaa-cagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 178
Target Start/End: Original strand, 45797242 - 45797337
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataa-ttcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  45797242 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaactatataacattataa 45797337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16750068 - 16749994
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 158  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  16750068 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 16749994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 240
Target Start/End: Original strand, 43927291 - 43927366
Alignment:
Q  165 atataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  43927291 atatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagt 43927366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaa-cagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 11298644 - 11298580
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11298644 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcag 11298580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 14878633 - 14878569
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14878633 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcag 14878569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Original strand, 30029841 - 30029894
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat 61  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30029841 catcaacatctcattcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaat 30029894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 178
Target Start/End: Original strand, 14501198 - 14501293
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataa-ttcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| || ||  ||||| ||| |||||||||||||||    
T  14501198 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaattatataacattataa 14501293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 26196548 - 26196500
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 59  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  26196548 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataaca 26196500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 129919 - 130138
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129919 atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 130018  T
Q  121 acatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  130019 acatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaac 130118  T
Q  221 aacaagataaacaacttagt 240  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  130119 agcaagataaacaacttagt 130138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60649
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaaca 60720  T
Q  124 tctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||||| | ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  60719 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaatcat 60649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1315
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaata 1185  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  1186 caggtcatcaacatttcaaacatcaaacataattcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcatatacatcagtcttactg 1285  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1286 gaacaacaacaacaagataaaaaacttagt 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45680
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 45810  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45809 taagtcatcaacatctcaattatcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 45710  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
     |||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  45709 gaacaattacagcaatataaacaacttagt 45680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22562
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 22677  T
Q  122 catctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaaca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  22676 catctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatca----atatgcatcagtcttactggaacagcaaca 22581  T
Q  222 acaagataaacaacttagt 240  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  22580 tcaagacaaacaacttagt 22562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82255
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 82169  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  82170 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 82255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 6826 - 7042
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||    
T  6826 atcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaa---atca 6922  T
Q  121 acatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaac 220  Q
    ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6923 acaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaac 7022  T
Q  221 aacaagataaacaacttagt 240  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  7023 agcaagataaacaacttagt 7042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 240
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8248
Alignment:
Q  89 catgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |     
T  8097 catgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattag 8196  T
Q  189 ttcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
     | ||||   |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8197 attatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaacttagt 8248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 133 - 352
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 232  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||      
T  233 caaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaattcatatgtatcagtctcacta 332  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataa 230  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  333 gaacaacaacagcaagataa 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855140
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 38855273  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||    
T  38855272 aatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggctt 38855174  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38855173 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagt 38855140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520600
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 6520467  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||    
T  6520468 aatgcaagtcatcaacatcataaacatc-aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggctt 6520566  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6520567 actgaaacaacaacagcaagataaataacttagt 6520600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355588
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcacgatataacaatatcgaatg 26355716  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
    ||| ||| ||||||||||   ||| |||||| | | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26355715 caa-tcaacaacatctcagccatc-aacatattccatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttacta 26355618  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26355617 gaacaataacaaaaagataaacaacttagt 26355588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866165
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 5866296  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  5866295 aatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 5866199  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || | ||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  5866198 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagt 5866165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491225
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattg 21491094  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  21491095 aatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataggcatcagtctt 21491191  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || | ||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  21491192 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagt 21491225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17141146
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||    
T  17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgacataataatatcg 17141015  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||| || |||||||   ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  17141016 aatgtaaatcatcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 17141112  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || | ||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  17141113 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagt 17141146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498796
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 20498680  T
Q  126 tcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaaca 224  Q
    ||||| || || | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20498681 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtcttaccgaaacatcaacatca 20498780  T
Q  225 agataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||||||||||    
T  20498781 agataaacaacttagt 20498796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285830
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 21285700  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| || |  | ||||   |||| ||||| |    
T  21285701 caaatcaacaacatctcaaacatcaaacatagttcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattatataattcaggcttactg 21285800  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21285801 aaacaacaacaacaagataaagcacttagt 21285830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983290
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| || ||||||| ||| |    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  120 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaa 219  Q
    |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  983412 aacatcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcatataattcagacttactgaaacaacaa 983314  T
Q  220 caacaa---gataaacaacttagt 240  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  983313 caacaacatgataaacaacttagt 983290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23760962 - 23760747
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23760962 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcatcatgatataacaatattg 23760866  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtct 205  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||    
T  23760865 aattcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcaggct 23760767  T
Q  206 taccgaaacaacaacaacaa 225  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  23760766 tactgaaacaacaacaacaa 23760747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 207
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249582
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatc-agcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatc 21249483  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtct 205  Q
    ||||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  21249484 gaatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtct 21249580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 207
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255420
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatc-agcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatc 21255321  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtct 205  Q
    ||||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  21255322 gaatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtct 21255418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 21673718 - 21673936
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21673718 atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaaca 21673817  T
Q  121 acatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttaccgaaacaacaa 219  Q
    |||||||||||||| || ||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||  ||||| ||||||||||    
T  21673818 acatctcaaatatc-aatataatttatttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttactgaaacaacaa 21673916  T
Q  220 caacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  21673917 caacaagat-aacaacttagt 21673936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116582
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37116465  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||| ||||||||||||      
T  37116466 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaacagt 37116565  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||| |||||||||    
T  37116566 aagataagcaacttagt 37116582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13508188 - 13508019
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  13508188 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 13508089  T
Q  125 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    |||||||| ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13508088 ctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 13508019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13597720 - 13597551
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  13597720 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 13597621  T
Q  125 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    | |||||| ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13597620 cccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 13597551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17612056
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 17612132  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaaca 181  Q
     | | |||| | ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17612131 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaaca 17612056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266880
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||   ||| |   |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| || || ||||||||||||      
T  17266996 tctcaaacatcatatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggctcactgaaacaacaacagt 17266897  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||| |||||||||    
T  17266896 aagataagcaacttagt 17266880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16092337
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16092365  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16092364 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 16092337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22626861
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 22626834  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  22626835 aatacaaatcaacaacatcttaaatat 22626861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353257
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 24353137  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||| |||  | | ||||| ||||||| |||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||||||||||    
T  24353138 tctcaaacatcgtatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaac 24353237  T
Q  224 ---aagataaacaacttagt 240  Q
       ||||||| |||||||||    
T  24353238 agtaagataagcaacttagt 24353257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875190
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 22875163  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22875164 aatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22875190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28648983
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-aagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 28649066  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||  ||||||| ||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  28649065 aatgcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 28648983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409429
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14409509  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  14409508 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 14409429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439438
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17439510  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatat 195  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||| || ||||||    
T  17439509 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatat 17439438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7372904
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7372876  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  7372877 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 7372904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536334
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20536306  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  20536307 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 20536334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971375
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 31971355  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    | | ||| ||||||||||||    
T  31971356 attccaattcatcaacatct 31971375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 117
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759368
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataat 6759353  T
Q  103 atcgaatgcaagtca 117  Q
    ||| |||||||||||    
T  6759354 atcaaatgcaagtca 6759368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484579
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 1484499  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  1484500 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 1484579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853277
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 5853357  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  5853356 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 5853277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403404
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20403324  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20403325 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 20403404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001930
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22001850  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  22001851 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 22001930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818404
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18818432  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | || |||||| || ||||| ||||||    
T  18818431 aattgtaagtcaacatcatcttaaatat 18818404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21918995
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21919023  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  21919022 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 21918995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923923
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| || ||||| || | ||||||    
T  21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatc 21923951  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  21923950 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 21923923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 117
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406489
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23406477  T
Q  106 gaatgcaagtca 117  Q
     | |||||||||    
T  23406478 aattgcaagtca 23406489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18879276
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa 84  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaa 18879276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598370
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaa-cagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41598285  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  41598286 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 41598370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413301
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16413377  T
Q  113 agtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16413376 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 16413301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046180
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 20046260  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || | | | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20046259 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 20046180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219838
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||  |  |||| |||| |||||| |||    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-gcagtatacaaaatagtatgacataataatatcaaat 26219814  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  26219815 gcaagtcaacaacatctcaaatat 26219838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483457
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4483377  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  4483378 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 4483457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203216
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15203296  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    || |||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15203295 tgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 15203216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395984
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatca 21396004  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  21396003 aattcaattcatcaacatct 21395984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790477
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatca 21790497  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  21790496 aattcaattcatcaacatct 21790477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199647
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa-caacatgacataataatatca 16199667  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    | | ||| ||||| ||||||    
T  16199666 atttcaattcatctacatct 16199647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225288
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  || ||| |||| ||  |||| |||| |||||| |||    
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-acaatatacaaaacagtatgacataataatatcaaat 26225312  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  26225311 acaagtcaacaacatctcaaatat 26225288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542358
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  || | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4542438  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | ||| |||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  4542437 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 4542358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389454
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatca 21389474  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  21389473 aattcaattcatcaacatct 21389454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778780
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatca 21778800  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  21778799 aattcaattcatcaacatct 21778780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 240
Target Start/End: Original strand, 22364744 - 22364895
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 187  Q
    |||||||||||||||||| || | || ||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| || |||| ||||||||||    
T  22364744 tcatgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  188 attcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    | ||||||   |||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  22364843 aatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagt 22364895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896323
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca 19896323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45131047
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagta 78  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagta 45131047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 21383887 - 21383996
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21383887 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21383985  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  21383986 catcaaatcat 21383996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937118
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 19937118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290807
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45290807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801362
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| || |||||||| |||| ||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
Q  126 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    |||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatat-aacaacatcaagtcat 19801362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648621
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaat-agcaacataggcag 23648621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678155
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcag 18678155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18862521 - 18862412
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  18862521 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 18862423  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  18862422 catcaaatcat 18862412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 21387307 - 21387416
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21387307 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21387405  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  21387406 catcaaatcat 21387416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 21411180 - 21411289
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21411180 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21411278  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  21411279 catcaaatcat 21411289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 21805672 - 21805781
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21805672 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21805770  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  21805771 catcaaatcat 21805781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21827890 - 21827781
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21827890 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21827792  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  21827791 catcaaatcat 21827781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484380
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaa 25484380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121800
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcag 32121800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823941
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaa-caacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14823870  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  14823871 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 14823941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224037
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | | ||| ||| | |||  | ||||| |||| ||||||     
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaa-cagcaata-aagcaatatacaaaaatagcatgacataataatatca 26224014  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  26224015 aatgcaagtcaacaacatctcaa 26224037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 60
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070608
Alignment:
Q  23 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15070608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154936
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtat 79  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat 19154936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 40492891 - 40492834
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattc 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| | |||||||    
T  40492891 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcataaataattc 40492834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 17354060 - 17353996
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17354060 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaat-agcagcataggcag 17353996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 86)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652426
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 19652298  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| | | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19652299 caa-tcaacaacatctcaaacatc-aacataatccatttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 19652396  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19652397 gaacaataacagcaagataaacaacttagt 19652426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496362
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 28496493  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||| ||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28496492 aatgtaa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtctt 28496396  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || | ||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  28496395 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagt 28496362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808773
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 29808904  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||| ||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29808903 aatgtaa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtctt 29808807  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || | ||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  29808806 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagt 29808773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561534
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 1561402  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaaca-tcaattcatatgcatcagtct 205  Q
    |||||||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  1561403 aatgcaa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgcatcagtct 1561499  T
Q  206 taccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||| | || |  |||| ||||||||||||||||||    
T  1561500 tactggaatattaacagcaagataaacaacttagt 1561534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109374
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||     
T  20109140 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacataatataacaatatca 20109237  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatataca--actatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20109238 aatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattgatatacatcagt 20109337  T
Q  204 cttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||||   ||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  20109338 cttactagaaagacatcagcaagataaacaacttagt 20109374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019639
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  23019408 acatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatca 23019505  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |  | ||||   |||| |||    
T  23019506 aatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattatatagttcaggctt 23019605  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23019606 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagt 23019639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668605
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaac 19668485  T
Q  120 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaa 219  Q
    |||||| |||  |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  19668486 aacatcacaac-atcatacgtaattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcatatacatcagacttactgaaacaacaa 19668584  T
Q  220 caacaagataaacaacttagt 240  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  19668585 cagcaagataaacaacttagt 19668605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333238
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 27333240  T
Q  107 aa 108  Q
    ||    
T  27333239 aa 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27393978
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 27393980  T
Q  107 aa 108  Q
    ||    
T  27393979 aa 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098466
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  ||| |    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaac 9098521  T
Q  120 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacatta 175  Q
    ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9098520 aacttcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatataattatataacatta 9098466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227445
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 8227533  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
     | | |||| | ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8227532 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 8227445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644508
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  121 acatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    |||||||||| | ||| | |||||||  ||||||  ||||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacatcaaatcat 25644508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782410
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22782324  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  22782325 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 22782410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4185928 - 4185827
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4185928 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatca 4185829  T
Q  121 ac 122  Q
    ||    
T  4185828 ac 4185827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29060662
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 29060638  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
     ||||||||||| |||||||||||    
T  29060639 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Original strand, 4186381 - 4186482
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4186381 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatca 4186480  T
Q  121 ac 122  Q
    ||    
T  4186481 ac 4186482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496370
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 16496342  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  16496343 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 16496370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287791
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  || ||||| |||| ||||||    
T  17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatc 17287819  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  17287818 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 17287791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409826
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatca 18409849  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  18409848 aatgcaagtcaacaacatctcaa 18409826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303540
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacacaggaagtatacaaaacaacatgacataataatatca 19303563  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  19303562 aatgcaagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076805
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||     
T  20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtaaacaaaacagcatgacataataatatca 20076798  T
Q  107 aatgcaa 113  Q
    |||||||    
T  20076799 aatgcaa 20076805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676695
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || |||||||||| ||||||     
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 30676777  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  30676776 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 30676695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291165
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 2291245  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  2291244 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 2291165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742494
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12742414  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  12742415 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 12742494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334577
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18334657  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  18334656 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 18334577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005223
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19005143  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  19005144 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 19005223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858904
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19858984  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  19858983 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 19858904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422724
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24422644  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24422645 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 24422724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861971
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33861891  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  33861892 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 33861971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864455
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33864375  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  33864376 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 33864455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25629354
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaa-caggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatc 25629378  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
     ||||||||||| |||||||||||    
T  25629377 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595726
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 1595646  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  1595647 tgcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 1595726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055206
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-aaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8055126  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  8055127 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 8055206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924625
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 26924705  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  26924704 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 26924625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360955
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatc 20360983  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  20360982 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 20360955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 115
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656733
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25656726  T
Q  109 tgcaagt 115  Q
    |||||||    
T  25656727 tgcaagt 25656733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754992
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25754906  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  25754907 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 25754992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556873
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaa 20556957  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  20556956 tgcaagtcaacaacgtctc-aatttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 20556873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076965
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  | ||| |||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaaca 23076848  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
     || ||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||| ||||||||||||      
T  23076849 acttaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagt 23076948  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  23076949 aagataagcaaattagt 23076965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20638285
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 20638306  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatct 126  Q
     | ||||| | ||||||||||    
T  20638305 aattgcaatttatcaacatct 20638285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080627
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagtta-------------aacataggcagtatgcaaaacatcatgatataacaatatcg 22080760  T
Q  107 aatgca-agtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtc 204  Q
    |||||| ||  | |||||||||||| |||   |||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||| |  ||||||  | | || |    
T  22080759 aatgcacag--aacaacatctcaaacatc-gtcataattaatataatgtatatacatttatataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttaggc 22080663  T
Q  205 ttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  22080662 ttactgaaacaacaagagcaagataagcaacttagt 22080627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20593895
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 20593871  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
     ||||||||||| |||||||||||    
T  20593872 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714478
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963550
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 34963468  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  34963469 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 34963550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008383
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  | |||  ||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaaca 35008266  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
     || ||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||| ||||||| ||||      
T  35008267 acttaaacatcatatataattcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaataacagt 35008366  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||| |||||||||    
T  35008367 aagataagcaacttagt 35008383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540896
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaa 1540976  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||    
T  1540975 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatat-aacaacatcaa 1540896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4668277 - 4668217
Alignment:
Q  62 cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4668277 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4668217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4675124 - 4675064
Alignment:
Q  62 cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4675124 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4675064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920634
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||     
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatacaa--catcatgacataagtatatca 16920654  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    ||| | | ||||||||||||    
T  16920653 aattccattcatcaacatct 16920634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245703
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||  || ||||| |||| ||||||     
T  35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaa--caacatgacataataatatca 35245683  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    | | ||| ||||||||||||    
T  35245684 atttcaattcatcaacatct 35245703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448520
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||    
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 16448589  T
Q  112 aagtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
    ||||| |||||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  16448588 aagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 16448520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688620
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |     
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 25688599  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  25688600 tgcaagtcaacaacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 31155514 - 31155403
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat-cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31155514 catcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaaaacagcaac-taaacagtatgcaagtcatcgtgatataacaatatcgaat 31155416  T
Q  110 gcaagtcatcaac 122  Q
    |||| ||||||||    
T  31155415 gcaattcatcaac 31155403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852121
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaa-cagcaaca 3852121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22780222
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| | ||| || | ||| |||| ||||||    
T  22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-caaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatc 22780250  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  22780249 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 22780222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456901
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18456832  T
Q  125 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18456833 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 18456901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831571
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggca 75  Q
    ||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 22831571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19848048
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcag 19848048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 22949375 - 22949484
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  22949375 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 22949473  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  22949474 catcaaatcat 22949484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 22953331 - 22953440
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  22953331 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 22953429  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  22953430 catcaaatcat 22953440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 23871819 - 23871928
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  23871819 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 23871917  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  23871918 catcaaatcat 23871928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 23875775 - 23875884
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  23875775 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 23875873  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  23875874 catcaaatcat 23875884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27325479 - 27325370
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  || ||| |||||| || |||||||||||||||| |     
T  27325479 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattaatgcaatatatatataattatataacattataaatat 27325381  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  27325380 catcaaatcat 27325370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 195
Target Start/End: Original strand, 18706359 - 18706493
Alignment:
Q  62 cagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatata 159  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||  |||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||| ||| |||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  18706359 cagcaacataggcaatatataaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatcttaaacatcatatataattcatgtaatgcatata 18706457  T
Q  160 caactatataacattataaacaacatcaattcatat 195  Q
    ||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18706458 catttatatgacattattaacaacatcaaatcatat 18706493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992495
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaat-agcagcataggcag 23992495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 16760525 - 16760634
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  16760525 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 16760623  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  16760624 catcaaatcat 16760634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 162
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462031
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18461992  T
Q  125 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaa 162  Q
    ||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||||||    
T  18461993 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaa 18462031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185568
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacat 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 196
Target Start/End: Original strand, 18696569 - 18696676
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 187  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||| || |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| |    
T  18696569 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T
Q  188 attcatatg 196  Q
    | |||||||    
T  18696668 aatcatatg 18696676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 105
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443146
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaa-cagcaacataggcagtatataaaacatctcaagatataacaatatc 33443146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18199519 - 18199322
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| || |   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||  | ||| || ||    
T  18199519 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacagcaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18199421  T
Q  124 -tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaaca 221  Q
     ||| ||| |||| | |||||||   ||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18199420 atcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatttatatcagacttactgaaacaacaaca 18199322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 18204096 - 18204293
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| || || ||||||||| || |   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||  | ||| || ||    
T  18204096 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacaacaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18204194  T
Q  124 -tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaaca 221  Q
     ||| ||| |||| | |||||||   ||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  18204195 atcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatttacatcagacttactgaaacaacaaca 18204293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821904
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca 18821904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 193
Target Start/End: Original strand, 16624583 - 16624669
Alignment:
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  16624583 aatgcacgtcatcaacatcttaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatatcatcaaatcat 16624669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31477686 - 31477577
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||  || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  31477686 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacaaaatttatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 31477588  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  31477587 catcaaatcat 31477577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873184
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaat-agcagcataggcag 19873184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 21766695 - 21766759
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21766695 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcaacataggcag 21766759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Original strand, 19008799 - 19008843
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctta 48  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19008799 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccaactcatgcagctta 19008843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18177775 - 18177578
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| || || ||||||||| || |   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||  | ||| || ||    
T  18177775 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacaacaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18177677  T
Q  124 -tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaaca 221  Q
     ||| ||| |||| | |||||||   ||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18177676 atcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatttatatcagacttactgaaacaacaaca 18177578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Original strand, 18907111 - 18907161
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat 61  Q
    |||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18907111 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcagcttagttaaataacaat 18907161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863028
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat 61  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaat 19863028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Original strand, 22432249 - 22432314
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagt 77  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  22432249 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaat-agcagcataggcagt 22432314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Original strand, 22438799 - 22438864
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagt 77  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  22438799 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaat-agcagcataggcagt 22438864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 158
Target Start/End: Original strand, 16624371 - 16624436
Alignment:
Q  93 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 158  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  16624371 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 16624436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 179
Target Start/End: Original strand, 21939488 - 21939553
Alignment:
Q  114 gtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 179  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  21939488 gtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 21939553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28103877 - 28103796
Alignment:
Q  149 taatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataa 230  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||||||||  |||||||    
T  28103877 taatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataa 28103796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 80)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846605
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataac----------- 99  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||               
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgagataacaatatcgaatg 8846459  T
Q  100 -----aatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8846460 ctaacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata 8846559  T
Q  195 tgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8846560 tgcatcagtcttactggaacaacaactacaagataaacaacttagt 8846605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706179
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 39706310  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||   |||| |||    
T  39706309 aatgcaagtcatgaacatcataaacatc-aacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcatataattcaggctt 39706211  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaactta 238  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39706210 actaaaacaacaacagcaagataaacaactta 39706179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774230
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaata 12774110  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12774111 caa-tcaacaacatctcaattatc-aacataatccatttaatgtatatac--------aacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactg 12774200  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12774201 gaacaacaacagcaagataaacaacttagt 12774230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198440
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  120 aacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaaca 218  Q
    || ||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatatgcattagtcttactggaacatca 43198462  T
Q  219 acaacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43198461 acaacaagataaacaacttagt 43198440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288097
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaac 12288217  T
Q  120 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaa 219  Q
    |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  12288216 aacatcacaac-atcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 12288118  T
Q  220 caacaagataaacaacttagt 240  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  12288117 cagcaagataaacaacttagt 12288097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13738
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 13854  T
Q  126 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaaca 224  Q
    ||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | |||| |||||  |    
T  13853 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacataa 13754  T
Q  225 agataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||||||||||    
T  13753 agataaacaacttagt 13738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15552015
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgatataataatatcg 15551916  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    || | ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  15551917 aaggtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgattcataagcatcagtctt 15552013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243128
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||| |    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaac 52243203  T
Q  120 aacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||||||||| | ||| | ||||| |  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  52243202 aacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 52243128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 240
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596878
Alignment:
Q  45 cttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataatt 144  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||||||| ||| |    
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaa---ctcaattatcaaacttaagt 16596782  T
Q  145 cgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||   ||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  16596783 catgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaatttataagcatcagtcttacttgaacattaacagcaaggtaaacaacttagt 16596878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082039
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| || |||| |||  ||||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataaca 53082156  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||||||||      
T  53082155 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 53082056  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||| |||||||||    
T  53082055 aagataagcaacttagt 53082039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798900
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7798872  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||    
T  7798873 aattgcaagtcatcaacatcttaaatat 7798900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928866
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||| || ||    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaa 44928944  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 185  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  44928943 tgcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacat 44928866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377522
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaaat 16377542  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  16377541 gcaagtcaacaacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900016
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||   |||| ||||||     
T  6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacaacatagcataataatatca 6899989  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6899990 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 6900016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270231
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 16270258  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  16270257 aatgcaagttaacaacatcttaaatat 16270231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215253
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18215339  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  18215338 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 18215253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7088996
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7088975  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatct 126  Q
     | ||||| ||||||||||||    
T  7088976 aattgcaattcatcaacatct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280438
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 14280413  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  14280414 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 14280438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615465
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 44615385  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  44615386 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 44615465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798749
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 54798774  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  54798773 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 54798749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239965
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaat-agcaaaataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 16239992  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16239991 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 16239965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873363
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 52873390  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaata 132  Q
     | ||||||||| || ||||| |||||    
T  52873389 aattgcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640343
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||| || |||  ||||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataaca 46640459  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    |||| || |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||| || ||||||||||| ||||||   ||||  |||| ||||||| ||||      
T  46640458 tctc-aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcatataattcaggtttactgaaacaataacagt 46640360  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||| |||||||||    
T  46640359 aagataagcaacttagt 46640343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118337
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15118417  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15118416 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 15118337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773072
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44773152  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  44773151 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 44773072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312687
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 52312607  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  52312608 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 52312687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7893829
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7893801  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  7893802 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 7893829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12902883
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 12902855  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | || || |||||||||||| ||||||    
T  12902856 aattgtaattcatcaacatcttaaatat 12902883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12301
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12372  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  12371 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 12301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618216
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||     
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatca 19618239  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  19618238 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 19618216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242872
Alignment:
Q  4 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataat 19242790  T
Q  103 atcgaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaac 183  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  19242791 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaac 19242872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837494
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||| | ||    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaa 1837574  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  1837573 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattat-aacaacatcaa 1837494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44052955
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaa-catcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44052927  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  44052928 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 44052955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222333
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 50222404  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  50222403 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 50222333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096369
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa 84  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaa 3096369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636561
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 22636535  T
Q  108 atgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||    
T  22636536 ttgcaattcatcaacatcttaaatat 22636561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515184
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| | ||| || || || |||| |||||| ||    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaa 3515104  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  3515105 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 3515184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239404
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18239484  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||    
T  18239483 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtat-aacaacatcaa 18239404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574864
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-acagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat 8574888  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    | || ||| |||||||||||||||    
T  8574887 gtaattcaacaacatctcaaatat 8574864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038770
Alignment:
Q  12 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatg 14038751  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  14038752 caagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463847
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 51463933  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| ||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  51463932 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 51463847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355309
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15355386  T
Q  113 agtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||| |||||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15355385 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 15355309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046559
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtat 79  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat 17046559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374354
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 23374375  T
Q  113 agtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    | ||| |||||||| ||||||    
T  23374374 attcaacaacatcttaaatat 23374354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641286
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca 7641286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611008
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca 12611008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803369
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca 23803369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102264
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 44102264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 630819 - 630710
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | || ||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  630819 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataatgcatgcaatatatatccaattatataacattataaataa 630721  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  630720 catcaaatcat 630710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 3331961 - 3332070
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  3331961 aatcatcat-atataacaattacaaatgcatgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 3332059  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  3332060 catcaaatcat 3332070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14954006 - 14953897
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  14954006 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 14953908  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  14953907 catcaaatcat 14953897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970751
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaaaca-gcaatatacaaaaacagcatgacataataatatca 14970774  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  14970773 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 14970751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 25690137 - 25690246
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  25690137 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 25690235  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  25690236 catcaaatcat 25690246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14053306
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa-cagcatgacataataatatca 14053324  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacat 124  Q
    | | ||| ||||||||||    
T  14053323 atttcaattcatcaacat 14053306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13812854 - 13812759
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 179  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  13812854 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 13812759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190531
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcag 6190531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 10713083 - 10713192
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  10713083 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 10713181  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  10713182 catcaaatcat 10713192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 10926853 - 10926962
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  10926853 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 10926951  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  10926952 catcaaatcat 10926962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 185
Target Start/End: Original strand, 15099461 - 15099526
Alignment:
Q  119 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  15099461 caacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacat 15099526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 185
Target Start/End: Original strand, 15190428 - 15190493
Alignment:
Q  119 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacat 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  15190428 caacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacat 15190493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 15225308 - 15225417
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  15225308 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatcttaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 15225406  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  15225407 catcaaatcat 15225417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Original strand, 12487941 - 12488045
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  12487941 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 12488039  T
Q  183 catcaa 188  Q
    ||||||    
T  12488040 catcaa 12488045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353901
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaa-cagcagcataggcag 22353901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15868754 - 15868645
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  | | | |||||||| || |||  |||| ||| |||||||||||||||| |     
T  15868754 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcagcgaccataattcatgcaataaatatccaattatataacattataaatat 15868656  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||||||||    
T  15868655 catcaattcat 15868645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367743
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15367743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370071
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15370071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371255
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15371255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373536
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15373536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402756
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15402756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15464970 - 15464865
Alignment:
Q  89 catgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||| | |||||||  ||| || |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||    
T  15464970 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattatatcaaattttaaacgacatca 15464871  T
Q  188 attcat 193  Q
    | ||||    
T  15464870 aatcat 15464865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223585
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 16223585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 178
Target Start/End: Original strand, 32851450 - 32851545
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataa-ttcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  32851450 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaactatataacattataa 32851545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 158
Target Start/End: Original strand, 15225114 - 15225188
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatat 158  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||    
T  15225114 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatat 15225188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 16348780 - 16348716
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16348780 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcag 16348716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 16357068 - 16357004
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16357068 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcag 16357004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 20157579 - 20157526
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat 61  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20157579 catcatcgtcttaatcaacttatatagactcatgcaaattagttaaataacaat 20157526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 193
Target Start/End: Original strand, 15791916 - 15791960
Alignment:
Q  149 taatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  15791916 taatgcatatacaactatatcacattattaacaacatcaaatcat 15791960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20157312 - 20157240
Alignment:
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 179  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || | | |||||  || ||||||||||||||||    
T  20157312 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcagtatatatctaattatataacattataaa 20157240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815699
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 58  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac 21815699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22634235 - 22634163
Alignment:
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 179  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||  || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  22634235 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataatttatgcaatatatatctaattatataacattataaa 22634163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 85)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16219835 - 16219605
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219835 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 16219739  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | ||||   |||| |||    
T  16219738 aatgcaagtcatcaacatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggctt 16219639  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16219638 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagt 16219605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 67745 - 67977
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 67844  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtct 205  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||    
T  67845 aatgcaaatcaacaacatctc-aatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggct 67942  T
Q  206 taccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  67943 cactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagt 67977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47832040
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatcatcatgatataacaatatcg 47831906  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| |  | |||    |||| |||    
T  47831907 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattatacaattcaggctt 47832006  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47832007 actgaaacaacaacaacaagataaataacttagt 47832040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34201016
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 34200885  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  34200886 aatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 34200982  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || |  |||  |||| |||| |||||||||||||    
T  34200983 actgggacattaacagcaaggtaaacaacttagt 34201016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005879
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatggaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 18005749  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttacc 209  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| |||||     
T  18005750 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 18005848  T
Q  210 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18005849 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagt 18005879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811019
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 811149  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccg 210  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||| |    
T  811148 caagtcattaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactg 811049  T
Q  211 aaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  811048 aaactacaacagcaagataaataacttagt 811019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754777
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 15754909  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaaca-tcaattcatatgcatcagtct 205  Q
    |||||||   ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  15754908 aatgcaa---atcaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgcatcagtct 15754812  T
Q  206 taccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||| | || |  |||| ||||||||||||||||||    
T  15754811 tactggaatattaacagcaagataaacaacttagt 15754777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505189
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 28505320  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
     ||  ||   |||| || ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  28505319 gatataa---atcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 28505223  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || | ||||   |||||||| |||||||||||||    
T  28505222 actggaacattgacaacaaggtaaacaacttagt 28505189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014407
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 44014281  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttacc 209  Q
    |||   |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |  ||||||  | |||| |||||     
T  44014282 caa---atcaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggcttact 44014377  T
Q  210 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44014378 gaaacaacaacagcaagat-aacaacttagt 44014407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056560
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 16056441  T
Q  122 catctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaaca 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | ||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  16056442 catctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatatcattcaggcttaccgaaacaacaaca 16056541  T
Q  222 acaagataaacaacttagt 240  Q
     ||||||||||||||||||    
T  16056542 tcaagataaacaacttagt 16056560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11995950
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattg 11996049  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||| ||   ||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  11996048 aatgtaa---atcaacaactcaaatatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 11995952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073148
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtc 204  Q
     |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| |  | ||||   |||| |    
T  22073013 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggc 22073112  T
Q  205 ttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22073113 ttactgaaacaacaacatcaagacaaacaacttagt 22073148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495579
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 16495501  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16495502 aatgtaa---atcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattat-aacaacatcaa 16495579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901557
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||| |||||||  || |    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagc 12901437  T
Q  120 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaa 219  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||   |||  ||||| ||||||||||    
T  12901438 aacatcacaac-atcatacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcatataattcaagcttactgaaacaacaa 12901536  T
Q  220 caacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12901537 caacaagataaacaacttagt 12901557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280053
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||     
T  2280238 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataataatatca 2280141  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||||   ||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2280140 aatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 2280053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456408
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgat-agcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat 18456432  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  18456431 gcaagtcaacaacatcttaaatat 18456408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486678
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 19486766  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
     | | |||| | ||||||||||||| |||| | |||||||  || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19486765 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 19486678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220077
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaaca 20220194  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||| | ||||||||||      
T  20220193 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactggaacaacaacagt 20220094  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||| |||||||||    
T  20220093 aagataagcaacttagt 20220077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227606
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 38227579  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  38227580 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 38227606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061895
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||    
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatacaaaatagcatgacataataatatcaaat 17061979  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaa-acataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    |||||||| |||| |||||| ||| || | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17061978 gcaagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 17061895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867929
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | | |    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaac 1868003  T
Q  120 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  1868002 aacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat 1867929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 194
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647512
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||||    
T  13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatc 13647423  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
     ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  13647424 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 13647512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255729
Alignment:
Q  29 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  127 caaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaat 189  Q
    |||| | ||| | |||||||  |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12255792 caaacattcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaat 12255729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 194
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044935
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtca-t 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| ||| |    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14044859  T
Q  119 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  14044860 caacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14044935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 194
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354965
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtca-t 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| ||| |    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14354889  T
Q  119 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  14354890 caacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14354965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430889
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||   ||| |||||||| |||| ||||||    
T  18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatc 18430806  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
     ||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  18430807 aaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 18430889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12698958
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   || ||||| |||| |||||    
T  12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatat 12698929  T
Q  105 cgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    | | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  12698930 caattgcaattcatcaacatcttaaatat 12698958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564363
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 3564384  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    || |||||| |||||||||||    
T  3564383 tgtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273511
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 48273490  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  48273491 tgcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509315
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | || ||||| |||| ||||||    
T  9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatc 9509287  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  9509288 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 9509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10063921 - 10063757
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 124  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||    
T  10063921 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaacat 10063822  T
Q  125 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    |||||||| ||| | |||||||     |   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  10063821 ctcaaatattcacatataattc-----aaacatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 10063757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456498
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 456418  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  456419 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 456498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972673
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 11972593  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  11972594 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 11972673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949107
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14949187  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  14949186 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 14949107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 240
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113176
Alignment:
Q  92 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattc 191  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| | |||| ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| ||    
T  15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaactc 15113127  T
Q  192 atatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  15113128 atataaatcagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagt 15113176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 240
Target Start/End: Original strand, 15116565 - 15116713
Alignment:
Q  92 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattc 191  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||| | |||| ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  15116565 gatataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaactc 15116664  T
Q  192 atatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  15116665 atatacatcagtcttactgaaacaataacagtaggataaacaacttagt 15116713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376698
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15376778  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15376777 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 15376698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232697
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16232617  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16232618 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 16232697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385108
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20385188  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20385187 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 20385108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189580
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21189660  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21189659 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 21189580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702415
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 24702335  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24702336 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 24702415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125668
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32125588  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  32125589 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 32125668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523094
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41523014  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  41523015 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 41523094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525556
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41525476  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  41525477 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 41525556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393272
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11393351  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  11393350 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 11393272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008433
Alignment:
Q  30 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacctc 15008499  T
Q  128 aaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  15008498 aaacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat 15008433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640440
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18640369  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  18640370 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 18640440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116691
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 44116606  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  | |||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  44116607 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 44116691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704862
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||  | || || |||| |||||| |||    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaa--aacaagacataataatatcaaat 24704783  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24704784 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 24704862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27217037
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 27216957  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  27216958 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 27217037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410177
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16410156  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  16410157 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16410177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275289
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 24275272  T
Q  113 agtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  24275273 agtcaacaacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16386242
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | || |  |||||||||||| ||||||    
T  16386269 aattgtatttcatcaacatcttaaatat 16386242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213795
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16213781  T
Q  109 tgcaagtcatcaac 122  Q
    | ||||||| ||||    
T  16213782 tccaagtcaacaac 16213795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212122
Alignment:
Q  7 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 104  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||    
T  26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatat 26212093  T
Q  105 cgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    | | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  26212094 caattgcaattcaacaacatcttaaatat 26212122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386391
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca 3386391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869396
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13869396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110606
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20110606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 126
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443509
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| || ||||| |||| |||||| |     
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa-cagcatgacataataatatcaat 40443491  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatct 126  Q
    | ||| ||||||||||||    
T  40443492 ttcaattcatcaacatct 40443509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831423
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13831423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847881
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagt 77  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589115
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa 84  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacatatgcagtatacaaa 10589115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15144037
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| | || || ||||| | |||||| |||||||| || ||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaaca 15144046  T
Q  121 acatctcaa 129  Q
    |||||||||    
T  15144045 acatctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154894
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaat-agcaacataggcag 18154894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898370
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| | |||||||   ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacgacaca-gcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 38898438  T
Q  113 agtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  38898437 agtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacagtataa 38898370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932801
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaat 14932801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356236
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaat 15356236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360350
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaat 15360350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 18426070 - 18426179
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  18426070 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatcttaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 18426168  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  18426169 catcaaatcat 18426179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39267691 - 39267582
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||| |||||||| |     
T  39267691 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataaaattataaatat 39267593  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  39267592 catcaaatcat 39267582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45169882 - 45169773
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  45169882 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 45169784  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  45169783 catcaaatcat 45169773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 135
Target Start/End: Original strand, 14036282 - 14036384
Alignment:
Q  35 actcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc-atcaacatctcaaat 131  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||     
T  14036282 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaac 14036380  T
Q  132 atca 135  Q
    ||||    
T  14036381 atca 14036384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 135
Target Start/End: Original strand, 14346312 - 14346414
Alignment:
Q  35 actcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc-atcaacatctcaaat 131  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||     
T  14346312 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaac 14346410  T
Q  132 atca 135  Q
    ||||    
T  14346411 atca 14346414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 128
Target Start/End: Original strand, 16324135 - 16324171
Alignment:
Q  92 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctca 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324135 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctca 16324171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26356156 - 26356106
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26356106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26358608 - 26358558
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26358558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832508
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat 61  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaat 2832508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187083
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaat-agcaacataggcag 12187083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138113
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaat-agcaacataggcag 17138113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9751572 - 9751500
Alignment:
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 179  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  9751572 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 9751500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 159
Target Start/End: Original strand, 18425668 - 18425743
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatata 159  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||    
T  18425668 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatata 18425743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 159
Target Start/End: Original strand, 18425870 - 18425945
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatata 159  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||    
T  18425870 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatata 18425945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649556
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat 61  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaat 19649556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 79
Target Start/End: Original strand, 48991206 - 48991252
Alignment:
Q  33 cgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtat 79  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  48991206 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtat 48991252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9389705 - 9389649
Alignment:
Q  119 caacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattat 176  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9389705 caacatctcatatatcaa-cataattcatacaatgtatatacaattatataacattat 9389649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6011
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 6145  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||    
T  6144 aatgcaagtcattaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggctt 6045  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || ||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  6044 actgaaacaataacagcaagataaataacttagt 6011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8702
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 8580  T
Q  122 catctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatataca--actatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaaca 218  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  8581 catctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcatatacatcagtcttactggaacaaca 8680  T
Q  219 acaacaagataaacaacttagt 240  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  8681 tcagcaagataaacaacttagt 8702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6767
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 6634  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtct 205  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||    
T  6635 aatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggct 6733  T
Q  206 taccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  6734 tactgaaacaacaacagcaagat-aacaacttagt 6767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6843
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcg 6710  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    ||||||||| |||| |||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||   |||  |||    
T  6711 aatgcaagttatcatcattataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagctt 6810  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttag 239  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6811 actaaaacaacaacagcaagataaacaacttag 6843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14223
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcg 14090  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    ||||||||| |||| |||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||   |||  |||    
T  14091 aatgcaagttatcatcattataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagctt 14190  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttag 239  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14191 actaaaacaacaacagcaagataaacaacttag 14223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 923
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatcatcatgatataacaacatcg 1056  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca-attcatatgcatcagtct 205  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| | |||  ||    |||| ||    
T  1055 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatt--tacaattcaggct 958  T
Q  206 taccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  957 tactgaaacaacaacaacaagataaataacttagt 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19497
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 19367  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttacc 209  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  |||||  ||||     
T  19368 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggttact 19466  T
Q  210 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19467 gaaacaacaacatcaagataaacaacttagt 19497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10760
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10641  T
Q  122 catctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaaca 221  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |  | ||||   |||| ||||| ||||||||||||    
T  10642 catctcaaacatcgaacataattcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaaca 10741  T
Q  222 acaagataaacaacttagt 240  Q
     ||||||||||||||||||    
T  10742 gcaagataaacaacttagt 10760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100607
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataataatatcgaatg 100477  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttacc 209  Q
    ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | | || |||||     
T  100478 caaatcaacaacatctcaaatat-taacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggcttact 100576  T
Q  210 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100577 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 100607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40062
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 40192  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttacc 209  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||     
T  40191 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggcttact 40093  T
Q  210 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40092 gaaacaacaacatcaaggtaaacaacttagt 40062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94588
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 94508  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  94509 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 94588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119948
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatg 80  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17425
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 17501  T
Q  113 agtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  17500 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacagtat-aacaacatcaa 17425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44573
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc--aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| |  ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaa 44551  T
Q  108 atgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  44552 atgcaagtcaacaacatctcaa 44573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa 84  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38546
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat 61  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaat 38546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 12766 - 12999
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 12865  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  ||||||   |||| |||    
T  12866 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcatataattcaggctt 12965  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12966 actggaacaacaacagcaagataaaccacttagt 12999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11522
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 11391  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  11392 aatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatactattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 11488  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||   ||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  11489 acttgaacattaacaccaaggtaaacaacttagt 11522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2227
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 2096  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||    
T  2097 aatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagactt 2193  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || | ||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  2194 actggaacattaacagcaaggtaaacaacttagt 2227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28533
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 28512  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatct 126  Q
     | ||||| ||| ||||||||    
T  28513 aattgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4605
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32768
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  32538 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatca 32635  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |  | ||||   |||| |||    
T  32636 aatgcaa-tcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattatataattcaggctt 32734  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32735 actgaaacaataacaacaagataaacaacttagt 32768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51936
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcag 51936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25176083
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 25175953  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttacc 209  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||     
T  25175954 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 25176052  T
Q  210 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25176053 gaaacaacaacagcaagataaacaacttagt 25176083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679750
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc-aatg 7679687  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacat 173  Q
     ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  7679688 taagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatataattatataacat 7679750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7620
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 125  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 7736  T
Q  126 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaaca 224  Q
    ||||| | ||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| || ||||||   |||| ||||| |||||||||||||||    
T  7735 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaaca 7636  T
Q  225 agataaacaacttagt 240  Q
     |||||||||||||||    
T  7635 tgataaacaacttagt 7620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071872
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 23071971  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||  ||   |||| || ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  23071970 aatataa---atcagcaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 23071874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406210
Alignment:
Q  12 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttacc 209  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||  |  ||||| |  || || |||||     
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttact 28406179  T
Q  210 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28406180 aaaacaacaacagcaagataaacaacttagt 28406210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786790
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||||||| ||| |    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 18786910  T
Q  120 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaa 219  Q
    ||| || | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||   | || ||||| ||||||||||    
T  18786909 aacgtcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcatataatttaggcttactgaaacaacaa 18786811  T
Q  220 caacaagataaacaacttagt 240  Q
    || || |||||||||||||||    
T  18786810 cagcatgataaacaacttagt 18786790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708553
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  23708738 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatca 23708641  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    | ||||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23708640 attgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcat 23708553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134105
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaa-cagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcga 22134228  T
Q  108 atgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctta 207  Q
    |||||| |||  |||||||||  |||| |||||||| | | ||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22134227 atgcaa-tcaataacatctcatttatc-aacataatccatttaatgtatatac--------aacattataaacaacaccaattcatatgcatcagtctta 22134138  T
Q  208 ccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    | | || ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  22134137 ctggaaaaatgacagcaagataaacaacttagt 22134105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19672011
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 19671929  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaat 189  Q
    || |||||| | |||||||||||   ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19671930 aacgcaagtaaacaacatctcaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattat-aacaacatcaat 19672011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791508
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | ||| || ||||||||||||||   ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaaca 23791391  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||| || | | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||||||||||    
T  23791392 tctcaaacattatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaac 23791491  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||||||||    
T  23791492 aagataaacaacttagt 23791508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105590
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22105510  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  22105511 tgcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 22105590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459449
Alignment:
Q  92 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaatt 190  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| || | |||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |    
T  22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaact 22459499  T
Q  191 catatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22459498 cgtatacatcagtcttactgaaacaataacagcaagataaacaacttagt 22459449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207511
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgaca 23207395  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    |||| || || | | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| |||||   ||||||||||      
T  23207396 tctc-aacattataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttacttgaacaacaacagt 23207494  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||| |||||||||    
T  23207495 aagataagcaacttagt 23207511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298809
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| |     
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatcttaaatat 298809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060639
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23060611  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23060612 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 23060639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520127
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 20520197  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  20520196 tctcaaacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaatcat 20520127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809120
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18809040  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  18809041 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 18809120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23131039
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23130959  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  23130960 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 23131039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133506
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23133426  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  23133427 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 23133506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709517
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23709597  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  23709596 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 23709517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23711998
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23712078  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  23712077 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 23711998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505556
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | |||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26505476  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  26505477 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 26505556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26508034
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | |||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26507954  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  26507955 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 26508034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402507
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34402587  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  34402586 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 34402507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682490
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39682410  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  39682411 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 39682490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337241
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||   ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatc 22337213  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     |||||||| || |||||||||||||||    
T  22337214 aaatgcaagacaacaacatctcaaatat 22337241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076568
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23076540  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  23076541 aattgcaagtcaacaatatcttaaatat 23076568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23285987
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | || || |||| ||||||     
T  23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaa--aaca-gacataataatatca 23285960  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23285961 attgcaattcatcaacatcttaaatat 23285987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654381
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatc 23654409  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23654408 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 23654381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 38138
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25109122
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||||||||||||||   |||  |  |||||||||||||||||| ||   || ||| ||| |    
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaatagttcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaata 25109005  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||||||||      
T  25109006 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 25109105  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||| |||||||||    
T  25109106 aagataagcaacttagt 25109122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571574
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 571494  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  571495 tgcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 571574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726172
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6726092  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    || |||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  6726093 tgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 6726172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135767
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23135687  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||    
T  23135688 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtat-aacaacatcaa 23135767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367951
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24367871  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24367872 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 24367951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577276
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  |||||| | ||| || |||||||||| |||||| ||    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaa 28577196  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||||| || |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  28577197 tgcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 28577276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22731229
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22731257  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||| | ||||||    
T  22731256 aattgcaattcatcaacatattaaatat 22731229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660148
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || ||  |||| |||| ||||||     
T  23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaa-cagcaacataggcagtatacgaaacaggatgacataataatatca 23660121  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  23660122 aatgcaaatcaacaacatcttaaatat 23660148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039477
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaa-cagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32039563  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  32039562 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 32039477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214906
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 32214988  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  32214987 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 32214906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946733
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa 84  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaat-agcaacataggcagtatacaaa 8946733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155045
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |||    
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 21155122  T
Q  112 aagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21155121 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 21155045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413070
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataaca--atatcgaatgcaagtcatcaa 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaa 22413141  T
Q  122 catctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    |||||| || |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22413140 catctc-aacatcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcat 22413070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898180
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24898261  T
Q  108 atgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24898260 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 24898180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900663
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24900744  T
Q  108 atgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24900743 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 24900663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903140
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24903221  T
Q  108 atgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24903220 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 24903140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905617
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24905698  T
Q  108 atgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24905697 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 24905617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908092
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24908173  T
Q  108 atgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24908172 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 24908092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309225
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatca 20309205  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  20309206 aattcaattcatcaacatct 20309225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103396
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||||| || |  |||||     
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacatgattatatca 23103419  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||| ||| |||||||||||||||    
T  23103418 aattcaattcatcaacatctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040247
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacata 71  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137467
Alignment:
Q  12 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | | ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 43137398  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
    ||||||| |||| |||||| |  ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  43137399 caagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 43137467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22738175
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22738203  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  22738202 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 22738175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967424
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38967424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029966
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45029966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643054
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24697709 - 24697538
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  ||||| || |||| |||||||||    || ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  24697709 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaacaacaacgtaggcagtacatcaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 24697610  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatat 195  Q
    |||||||  ||| | | ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| || ||||||    
T  24697609 tctcaaacttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataaaatcatat 24697538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529641
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaa 24529641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 1283657 - 1283766
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  1283657 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 1283755  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  1283756 catcaaatcat 1283766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30344867 - 30344758
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  30344867 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 30344769  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  30344768 catcaaatcat 30344758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 183
Target Start/End: Original strand, 23004767 - 23004926
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||   |||  |  ||| ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  23004767 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaaca 23004866  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaac 183  Q
    ||||||| |||| | ||||| |   ||||| |||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  23004867 tctcaaacatcatatataatccacataatgcatatacaaatatttaacatcattaacaac 23004926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616253
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaat-agcagcataggcag 25616253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaa-cagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451981
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcag 32451981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 77
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagt 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaa-cagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22799243 - 22799179
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22799243 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcag 22799179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 40622327 - 40622263
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  40622327 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaat-agcagcataggcag 40622263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 76
Target Start/End: Original strand, 23038048 - 23038095
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23038048 tagacggactcatgcagcttggttaaataacaat-agcagcataggcag 23038095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 5657 - 5875
Alignment:
Q  21 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  5657 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatgaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaaca 5756  T
Q  121 acatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttaccgaaacaacaa 219  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||| ||||||||||    
T  5757 acatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaa 5855  T
Q  220 caacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  5856 caacaagataaa-aacttagt 5875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 12942 - 13172
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12942 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcagcatgatataacaatatcg 13038  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |  | ||     |||| |||    
T  13039 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatccaattcaggctt 13138  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13139 actgaaacaacaacagcaagataaataacttagt 13172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18277 - 18125
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 187  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||  ||||||||||    
T  18277 tcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  188 attcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |  |||||   |||| ||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||    
T  18177 aaacatataattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagcaacttagt 18125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15891
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaccatcatgatataataatatcgaat 15763  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttacc 209  Q
    | ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| | |||||||||||     
T  15764 gtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattatttcataagaatcagtcttact 15860  T
Q  210 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    | | ||  |||| |||| |||||||||||||    
T  15861 ggatcattaacagcaaggtaaacaacttagt 15891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53436
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 125  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 53552  T
Q  126 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaaca 224  Q
    ||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | |||| |||||  |    
T  53551 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacataa 53452  T
Q  225 agataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||||||||||    
T  53451 agataaacaacttagt 53436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8330 - 8230
Alignment:
Q  93 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattca 192  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  ||| |||||  || |||||||||||||||| | |||||| |||    
T  8330 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataattcatacaatatatatttaattatataacattataaatatcatcaaatca 8231  T
Q  193 t 193  Q
    |    
T  8230 t 8230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2535
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatcatcatgttataacaatattgaatg 2663  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttacc 209  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||     
T  2662 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttact 2564  T
Q  210 gaaacaacaacaacaagataaacaactta 238  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2563 gaaacaacatcagcaagataaacaactta 2535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12801
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 12686  T
Q  126 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaaca 224  Q
    ||||||| | | | |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||| || ||||| |||||||||||| ||    
T  12687 tcaaatacttatatataattc-agtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacattagacttactgaaacaacaacagca 12785  T
Q  225 agataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||||||||||    
T  12786 agataaacaacttagt 12801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34353
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacccatcatgatataataatatcg 34222  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtctt 206  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  34223 aatgtaa---atcaacaactcaattatcaaacttaagtcaagtaatatatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtctt 34319  T
Q  207 accgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    || | || |  |||| |||| |||||||||||||    
T  34320 actggaaaattaacagcaaggtaaacaacttagt 34353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 273 - 326
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaa 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32324
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaat 32201  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttacc 209  Q
    | || |||||||| |||||| |||| |||||||| | | |||||||||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32202 gtaa-tcatcaacgtctcaattatc-aacataatccatttaatgtata------tatacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 32293  T
Q  210 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32294 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagt 32324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132884
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaat 132761  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttacc 209  Q
    | || |||||||| |||||| |||| |||||||| | | |||||||||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  132762 gtaa-tcatcaacgtctcaattatc-aacataatccatttaatgtata------tatacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttact 132853  T
Q  210 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  132854 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagt 132884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 240
Target Start/End: Original strand, 62216 - 62428
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||   || ||||||    
T  62216 acttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaacatcatggtataataatatcgaatgca---caacaacat 62312  T
Q  125 ctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| | ||||||   | |||| ||||| |||||||||||| |    
T  62313 ctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactgaaacaacaacagc 62411  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||||||||    
T  62412 aagataaacaacttagt 62428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136857
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 136777  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  136778 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 136857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139326
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 139246  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  139247 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 139326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144264
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 144184  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  144185 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 144264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134388
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 134308  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  134309 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 134388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141795
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 141715  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  141716 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 141795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15760
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcg 15799  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattc 145  Q
    |||||||||||||| ||||  | | ||||||||||||||    
T  15798 aatgcaagtcatcatcatcatatacatcaaacataattc 15760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178961
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggca 75  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaat-agcagcataggca 178961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 199 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15761 - 15720
Alignment:
Q  199 tcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15761 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagt 15720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14585
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaagaaaatcatcatgatatagtaatatcgaatg 14715  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttacc 209  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| | |||||| |||||  || ||||| |  ||||| |  ||||| |||||     
T  14714 caaatcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggcttact 14616  T
Q  210 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14615 gaaacaacaacagcaagatatacaacttagt 14585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1013
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 1091  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||| ||   ||||||| ||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1090 aatgtaa---atcaacaactcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattat-aacaacatcaa 1013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128857
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||| ||||||||||||      
T  128973 tctcaaacatcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaacagt 128874  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||| |||||||||    
T  128873 aagataagcaacttagt 128857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 240
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78555
Alignment:
Q  30 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctc 78443  T
Q  128 aaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaaga 227  Q
     || |||    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||||||||  ||||    
T  78444 -aacatcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 78542  T
Q  228 taaacaacttagt 240  Q
    ||| |||||||||    
T  78543 taagcaacttagt 78555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116551
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| |||| || ||||| ||||  ||||| |||    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataatcatatcaaat 116527  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  116528 gcaagtcaacaacatctcaaatat 116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 7964
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaac 8081  T
Q  120 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaa 219  Q
    |||||| | || |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||   |||| ||||| ||   |||||    
T  8080 aacatcac-aacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcatataattcaggcttactga---aacaa 7985  T
Q  220 caacaagataaacaacttagt 240  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  7984 cagcaagataaacaacttagt 7964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29168
Alignment:
Q  54 ataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatg 153  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||   |||| |||||||| ||| || |||| ||    
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaactatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtactg 29258  T
Q  154 tatatacaactatataacat---tataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  29257 tatatacaattatataacataattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagt 29168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38641
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 38721  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | | |||||||  ||| ||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  38720 gcaagtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 38641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2799
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 110  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatg 2824  T
Q  111 caagtcatcaacatctcaaatatca 135  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||    
T  2823 caaatcaacaacatctcaaatatca 2799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2734 - 2692
Alignment:
Q  198 atcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2734 atcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagt 2692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7946
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 125  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatc 8062  T
Q  126 tcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaaca 224  Q
    | ||| || || | |||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||| || ||    
T  8061 ttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtctcactggaacaacatcagca 7962  T
Q  225 agataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||||||||||    
T  7961 agataaacaacttagt 7946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11651
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 11563  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
     | | |||| | ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11564 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 11651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17961
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaacatcatgatataataatatcg 18049  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    || |||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18048 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 17961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2241
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaa 2241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38190
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 38278  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaat-atcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
     | | |||| | ||||||||||||| |||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38277 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcat 38190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21937 - 21828
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  21937 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatctacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 21839  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  21838 catcaaatcat 21828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24699 - 24587
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataa-ttcgtgtaatgtatata--caactatataacattataaa 179  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  24699 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataatttcatgcaatatatatatccaattatataacattataaa 24601  T
Q  180 caacatcaattcat 193  Q
     | |||||| ||||    
T  24600 tatcatcaaatcat 24587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 3090
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 3173  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| |||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  3172 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 3090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97240
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 97123  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||| ||||||||||||      
T  97124 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagt 97223  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    |||| || |||||||||    
T  97224 aagaaaagcaacttagt 97240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106518
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 106401  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||| ||||||||||||      
T  106402 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagt 106501  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    |||| || |||||||||    
T  106502 aagaaaagcaacttagt 106518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 24001 - 23898
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24001 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 23905  T
Q  107 aatgcaa 113  Q
    |||||||    
T  23904 aatgcaa 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2108
Alignment:
Q  65 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaact 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-agcataattcatataatgtatatacaatt 2183  T
Q  165 atataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaactta 238  Q
    ||||| |||||  ||||||||    ||||| |  ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2182 atataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaactta 2108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136255
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 136372  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaaca-tcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaa 222  Q
    || ||   |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||   |||| ||||| ||||||||||||     
T  136371 tcacatc-atcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacag 136273  T
Q  223 caagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||||||||||||    
T  136272 caagataaacaacttagt 136255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 144963
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 145080  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaaca-tcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaa 222  Q
    || ||   |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||   |||| ||||| ||||||||||||     
T  145079 tcacatc-atcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacag 144981  T
Q  223 caagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||||||||||||    
T  144980 caagataaacaacttagt 144963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagt 77  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 79
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174838
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtat 79  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 174838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6170
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 6287  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||  ||||||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||||||||      
T  6286 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 6187  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
     |||||| |||||||||    
T  6186 gagataagcaacttagt 6170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 13840 - 13793
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacatagg 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||    
T  13840 cttagaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacaacaacatagg 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27683
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||| |||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 27756  T
Q  122 catctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  27755 catctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcat 27683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1158
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacatc 1150  T
Q  126 tcaaatat 133  Q
    ||||||||    
T  1151 tcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 240
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38551
Alignment:
Q  30 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctc 38438  T
Q  128 aaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaaga 227  Q
    ||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||    ||||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||||||||  ||||    
T  38439 aaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 38538  T
Q  228 taaacaacttagt 240  Q
    ||| |||||||||    
T  38539 taagcaacttagt 38551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20030
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat 61  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaat 20030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25276
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaac 25219  T
Q  120 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattat 176  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25220 aacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattat 25276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Original strand, 619 - 725
Alignment:
Q  88 tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 187  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  619 tcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 717  T
Q  188 attcatat 195  Q
    | ||||||    
T  718 aatcatat 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16034
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||| |||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 16107  T
Q  122 catctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||||||| | ||  | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  16106 catctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcat 16034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13316
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatc 13246  T
Q  126 tcaaa--tatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    | |||    ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  13247 tgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcat 13316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 78
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2732
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  2680 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39602
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaa 39577  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  39578 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 39602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13963 - 13854
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  13963 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacttcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 13865  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  13864 catcaaatcat 13854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 75210
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaa 75235  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  75234 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 75210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26021
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||     
T  25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatca 25994  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    
T  25995 aatgcaagtaaacaacatctcaaatat 26021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 39858 - 39983
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||     
T  39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatca 39956  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    
T  39957 aatgcaagtaaacaacatctcaaatat 39983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44702
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44727  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  44726 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 44702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26064
Alignment:
Q  14 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| |    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 26081  T
Q  113 agtcatcaacatctcaa 129  Q
    | ||| |||| ||||||    
T  26080 attcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3185
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||     
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 3208  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    |||| || ||| |||||||||||    
T  3207 aatgtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33067
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 33040  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  33041 aatgcaagttaacaacatcttaaatat 33067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 38761 - 38886
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 38859  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||| | | |||||||| ||||||    
T  38860 aatgcaaataaacaacatcttaaatat 38886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 69
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9807
Alignment:
Q  5 ggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 69  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca 9807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 17214
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc---aaatcatcatgatataacaatat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   ||| || ||||| |||| |||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatat 17239  T
Q  105 cgaatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  17238 caaatgcaagtcaacaacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79264
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||   ||| || ||||| |||| ||| || ||||||||||| |||| |    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca-cgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgt 79333  T
Q  125 ctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  79332 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 79264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13337
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 13309  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  13310 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 13337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 1851 - 1977
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 1949  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  1950 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 207541 - 207467
Alignment:
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaaca 181  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  207541 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatataattatataacattataaaca 207467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32952
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 32979  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  32978 attgcaattcaacaacatcttaaatat 32952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46053
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 46026  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  46027 attgcaattcaacaacatcttaaatat 46053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16235
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| || || ||||| | ||||||    
T  16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatc 16211  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
     |||||||| || || ||||||||    
T  16212 aaatgcaagccaacatcatctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17389
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40038
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 40011  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  40012 aatgcatgtcaataacatcttaaatat 40038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19772
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 19888  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    |||| |  |||| | |||| || ||||||| |||||||  ||||| ||||||| || |||||||| ||||||   |||  ||||| | ||||||||||      
T  19887 tctc-agcatcataaataactcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcatataattcatgcttactggaacaacaacagt 19789  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||| |||||||||    
T  19788 aagataagcaacttagt 19772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 49030 - 48921
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  49030 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 48932  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  48931 catcaaatcat 48921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103526
Alignment:
Q  22 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  || || |||||||||||| |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  || |    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacaac 103638  T
Q  120 aacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaa 219  Q
    ||||||         | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| || ||||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  103637 aacatc---------atacataattcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 103547  T
Q  220 caacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||  |||||||| ||||||||    
T  103546 caggaagataaagaacttagt 103526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 4849 - 4968
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 4947  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatct 126  Q
     ||||||| ||| ||||||||    
T  4948 aaatgcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20924
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20844  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20845 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 20924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37998
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 37918  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  37919 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 37998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158435
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 158515  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  158514 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 158435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339889
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--caacaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat 339968  T
Q  110 gcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
     ||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||  ||||||| ||||  | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  339967 -caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 339889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52039
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatc 52011  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  52012 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 52039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167973
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||  | ||||| |||| ||||||    
T  168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 168001  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  168000 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 167973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2494 - 2365
Alignment:
Q  76 gtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacatta 175  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||   |||| |||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2494 gtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatttaatgtatatacaattatataacatta 2398  T
Q  176 taaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 208  Q
    ||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2397 taagcaacattaattcataagcatcagtcttac 2365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10891
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 10869  T
Q  108 atgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  10870 atgcaagtcaacaacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8528
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| ||||||     
T  8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa----cagcaacataggcagtatcaaaaacagcatgacataataatatca 8555  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  8554 attgcaagtcaacatcatcttaaatat 8528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4871
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 4791  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  4792 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 4871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13569
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13489  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||    
T  13490 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtat-aacaacatcaa 13569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23008
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-ccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22983  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||    
T  22984 tgcaagtcaacaacatcttaaatat 23008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14124
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14044  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  14045 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 14124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1406
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||  |||||     
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtacaa--catcatgacataattatatca 1386  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  1387 aattcaattcatcaacatct 1406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7383
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--caacatgaaataattatatca 7363  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  7364 aattcaattcatcaacatct 7383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 1043
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||  | ||||| |||| ||||||    
T  1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 1071  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  1070 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 1043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3596
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacta-aagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 3568  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  3569 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 3596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 343 - 468
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||  | |||||  ||| ||||||     
T  343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caataacataggcagtatacaaaatagcatgacgtaataatatca 441  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    | || |||||| |||||||| ||||||    
T  442 attggaagtcaacaacatcttaaatat 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15466
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-gagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 15486  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    | | ||| ||||||||||||    
T  15485 atttcaattcatcaacatct 15466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7359
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataacaat-agcaacataggcag 7359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32184
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||     
T  32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtaaacaaa-caacatgacataataatatca 32164  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    | | ||| ||||||||||||    
T  32165 atttcaattcatcaacatct 32184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16952
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16881  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
    ||||||||| |||| |||||| || | | | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  16882 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 16952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267894
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||| |||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |    
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaata 267778  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcat-cagtcttaccgaaacaacaacaa 222  Q
    |||| || |||| | ||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||     
T  267779 tctc-aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcatat-catccaggcttactgaaacaacagcag 267876  T
Q  223 caagataaacaacttagt 240  Q
     ||| ||| |||||||||    
T  267877 taagctaagcaacttagt 267894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 569 - 783
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 667  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    || | || |||| | ||||||| ||||||| |||||||   |||| | |||||  | || ||||| ||||||   |||| ||||| ||||||||||||      
T  668 tc-ccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagt 766  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
     ||||||||||||||||    
T  767 tagataaacaacttagt 783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28806
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat-cagcaacataggcagtatgcaaatcatcat 91  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaatcatcat 28806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28775 - 28699
Alignment:
Q  164 tatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  28775 tatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagt 28699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8598
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||  |||| |||| ||||||    
T  8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaat-agcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatc 8577  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatct 126  Q
     | ||||||||| ||||||||    
T  8578 aattgcaagtcaacaacatct 8598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 51582 - 51699
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  ||| |     
T  51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattataaca 51679  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  51680 aattcaattcatcaacatct 51699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13615
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| || | ||||||     
T  13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacatgataatatca 13595  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    | | | | ||||||||||||    
T  13596 atttcgattcatcaacatct 13615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16599
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 16623  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
     |||| |||||| || ||||||||    
T  16622 aaatggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24297
Alignment:
Q  25 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaac 24308  T
Q  123 atctcaaatat 133  Q
    |||| ||||||    
T  24307 atcttaaatat 24297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 240
Target Start/End: Original strand, 54 - 239
Alignment:
Q  57 acaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgt 154  Q
    |||| |||||||||||||||||   ||| ||  ||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||     
T  54 acaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgc 153  T
Q  155 atatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaacttagt 240  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |   | || ||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  154 atatacatttatataacattattaacaacatcaaatcatttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaagatatgcaacttagt 239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 6116
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--atcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||| ||||| | ||| || ||||| || | ||||    
T  6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
Q  104 tcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
    || | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  6145 tcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 124
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16397
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatca 16379  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacat 124  Q
    ||| ||| ||||||||||    
T  16380 aattcaattcatcaacat 16397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20372
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-tcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 20427  T
Q  126 tcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 179  Q
    |||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20426 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaa 20372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128804
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaa 128804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35962 - 35853
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  35962 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 35864  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  35863 catcaaatcat 35853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9360
Alignment:
Q  9 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcga 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||   ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaa 9338  T
Q  108 atgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  9339 atgcaagtcaacaacgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4788
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa 84  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaa 4788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 145
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2091
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaa-cagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatc 2050  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattc 145  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  2051 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattc 2091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 122
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9193
Alignment:
Q  62 cagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9133 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 9193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10472
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtat 79  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtat 10472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12241
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa-------cagcaacaca-gcagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaa 12155  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  12156 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 12241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40577
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaa 40497  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaa 188  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||| | | |||||  |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  40498 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat-aacaacatcaa 40577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 4508 - 4633
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatc 105  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||  || ||||| |||| ||||||    
T  4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 4605  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4606 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 4633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12215
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatc 105  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||  || ||||| |||| ||||||    
T  12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 12187  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12188 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 12215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22167
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatc 105  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||  || ||||| |||| ||||||    
T  22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 22139  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 133  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22140 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161083
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||||||| | ||| ||| |||| |||| |||||| ||    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaa-cagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaa 161155  T
Q  109 tgcaagtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  161154 tgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 161083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 106 - 289
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 203  T
Q  109 tgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcata 194  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  204 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatcata 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11406
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 11383  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  11384 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 11406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 5132
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 109  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||  |||||||| ||||  ||||| |||    
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatacaa--catcatgacataattatatcaaat 5149  T
Q  110 gcaagtcatcaacatct 126  Q
     ||| ||||||||||||    
T  5148 tcaattcatcaacatct 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 193
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225593
Alignment:
Q  65 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaac 163  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| || || | |||||||  |||||| ||||||||     
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaat 225563  T
Q  164 tatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  225564 tatatcacattataaacaacatcaaatcat 225593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 189253 - 189144
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  189253 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 189155  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  189154 catcaaatcat 189144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4355
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca 4355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 1053
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||     
T  1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattatatca 1073  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatct 126  Q
    | | ||| ||||||||||||    
T  1072 atttcaattcatcaacatct 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21030
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    |||||| |||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacatct 126  Q
     | ||||| ||| ||||||||    
T  21010 aattgcaattcaacaacatct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4396
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacga-cagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaa 4311  T
Q  109 tgcaagtc-atcaacatctcaaata-tcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcat 193  Q
    |||||||| |||||| |||||| || ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||| |||  ||| |||||||||| ||||    
T  4312 tgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca--atatacaacatcaaatcat 4396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4888
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggc 74  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12293
Alignment:
Q  8 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || | ||| || ||||| | || ||||||     
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatca 12316  T
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaa 129  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  12315 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 12293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47065
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagt 77  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1900 - 1685
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| | ||  |||||||| |||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  1900 cttagaccgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 1801  T
Q  124 tctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaac 223  Q
    |||| || |||| | ||||||  ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||   |||| ||||| | |||||||| |      
T  1800 tctc-aacatcatatataatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactggaacaacaatagt 1702  T
Q  224 aagataaacaacttagt 240  Q
    ||||||  |||||||||    
T  1701 aagataggcaacttagt 1685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 23843 - 23907
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaat-agcaccataggcag 23907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1393
Alignment:
Q  13 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 1393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11447
Alignment:
Q  7 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 105  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 11466  T
Q  106 gaatgcaagtcatcaacat 124  Q
     | | ||| ||||||||||    
T  11465 aatttcaattcatcaacat 11447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 178
Target Start/End: Original strand, 13638 - 13733
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataa-ttcgtgtaatgtatatacaactatataacattataa 178  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  13638 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaactatataacattataa 13733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36504
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat 61  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaat 36504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 113
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2783
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaa 2783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2267 - 2223
Alignment:
Q  164 tatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2267 tatacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 2223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 29931 - 29990
Alignment:
Q  10 tcatcatcttaatc-aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 69  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29931 tcatcatcttaattgaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca 29990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 627 - 736
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  627 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 725  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  726 catcaaatcat 736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Original strand, 6 - 92
Alignment:
Q  93 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 179  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  6 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 92  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11377 - 11268
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  11377 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 11279  T
Q  183 catcaattcat 193  Q
    |||||| ||||    
T  11278 catcaaatcat 11268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32536 - 32432
Alignment:
Q  83 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaa 182  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |||||  || |||||||||||||||| |     
T  32536 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcattaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaatat 32438  T
Q  183 catcaa 188  Q
    ||||||    
T  32437 catcaa 32432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  26 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 83
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4599
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaa 83  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacagcataggcagtatgcaa 4599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29608
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaat 29608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 1881 - 1945
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaat-agcaacataggcag 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10575
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaat-agcaacataggcag 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21856
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaat-agcagcataggcag 21856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29748
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaat-agcagcataggcag 29748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69858
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaat-agcagcataggcag 69858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12830 - 12758
Alignment:
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 179  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  12830 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 12758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9856 - 9784
Alignment:
Q  107 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaa 179  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  9856 aatgcacgtcatcaacatttcaatcatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacattataaa 9784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 188
Target Start/End: Original strand, 27912 - 28012
Alignment:
Q  89 catgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcgtgtaatgtatatacaactatataacattataaacaacatca 187  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| |||||  | ||||| |||| |||| ||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 28011  T
Q  188 a 188  Q
    |    
T  28012 a 28012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Original strand, 159 - 209
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat 61  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  159 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaat 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  28 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagta 78  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagttaataaacaa-cagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 6095 - 6159
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6095 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttggttaaataacaat-agcagcataggcag 6159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 289 - 338
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 60  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  289 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 26828 - 26892
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||| ||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26828 catcattttaatcatcttatatcgactcatgcatcttggttaaataacaat-agcagcataggcag 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 4921 - 4857
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  4921 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataataat-agcagcataggcag 4857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 44081 - 44145
Alignment:
Q  11 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcag 76  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44081 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcag 44145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5187 times since January 2019
Visitors: 4845