View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0755_low_18 (Length: 466)

Name: NF0755_low_18
Description: NF0755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0755_low_18
NF0755_low_18
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (12-440)||(19886483-19886913)
chr2 (12-275)||(11231161-11231427)
chr2 (12-275)||(22513008-22513274)
chr2 (12-275)||(28775630-28775896)
chr2 (12-275)||(24685604-24685870)
chr2 (212-440)||(19794738-19794967)
chr2 (100-275)||(3798516-3798692)
chr2 (12-136)||(24826522-24826646)
chr2 (63-275)||(8944013-8944226)
chr2 (63-275)||(12728559-12728772)
chr2 (212-440)||(36982475-36982704)
chr2 (63-275)||(42177845-42178058)
chr2 (212-344)||(19689435-19689567)
chr2 (212-344)||(23820168-23820300)
chr2 (105-275)||(12641560-12641731)
chr2 (105-275)||(23777963-23778134)
chr2 (63-275)||(12635744-12635957)
chr2 (63-275)||(16935760-16935973)
chr2 (63-275)||(17006420-17006633)
chr2 (63-275)||(34824642-34824855)
chr2 (212-344)||(14906474-14906606)
chr2 (212-440)||(24341423-24341652)
chr2 (190-440)||(7507856-7508107)
chr2 (212-435)||(462743-462967)
chr2 (212-344)||(20015108-20015240)
chr2 (190-440)||(25265402-25265653)
chr2 (212-440)||(43642991-43643220)
chr2 (222-440)||(8891242-8891461)
chr2 (63-210)||(23774368-23774516)
chr2 (212-440)||(20627347-20627576)
chr2 (105-210)||(5888548-5888654)
chr2 (151-275)||(21142062-21142187)
chr2 (223-310)||(17396697-17396784)
chr2 (63-136)||(25213372-25213446)
chr2 (362-440)||(19669279-19669358)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (5-440)||(12374-12811)
chr5 (5-440)||(21073410-21073847)
chr5 (12-440)||(4199807-4200237)
chr5 (12-440)||(18777814-18778244)
chr5 (12-440)||(22366302-22366733)
chr5 (12-440)||(19499899-19500328)
chr5 (12-440)||(25426628-25427058)
chr5 (12-440)||(43443220-43443647)
chr5 (12-310)||(29188107-29188404)
chr5 (38-440)||(27009841-27010244)
chr5 (12-275)||(10777793-10778059)
chr5 (12-275)||(21932204-21932470)
chr5 (12-275)||(21938374-21938640)
chr5 (12-275)||(35582203-35582469)
chr5 (38-275)||(7425491-7425729)
chr5 (62-275)||(11211940-11212154)
chr5 (12-275)||(22882907-22883173)
chr5 (12-275)||(36989593-36989859)
chr5 (63-275)||(35790974-35791187)
chr5 (12-275)||(17471411-17471677)
chr5 (63-275)||(23514728-23514941)
chr5 (212-344)||(20623066-20623198)
chr5 (212-344)||(21233562-21233694)
chr5 (190-440)||(23506965-23507216)
chr5 (212-440)||(22053867-22054096)
chr5 (63-275)||(1219396-1219609)
chr5 (212-440)||(18531101-18531330)
chr5 (212-344)||(16536294-16536426)
chr5 (212-341)||(37052844-37052973)
chr5 (212-344)||(25900440-25900571)
chr5 (190-440)||(27182559-27182810)
chr5 (190-429)||(34939289-34939528)
chr5 (12-136)||(11343008-11343134)
chr5 (63-210)||(23328789-23328937)
chr5 (63-210)||(24616393-24616541)
chr5 (63-210)||(24712769-24712917)
chr5 (63-210)||(24745787-24745935)
chr5 (12-136)||(16105967-16106093)
chr5 (392-436)||(29190478-29190522)
chr5 (364-440)||(17471768-17471844)
chr5 (329-440)||(19862207-19862319)
chr5 (329-440)||(23493917-23494029)
chr5 (212-275)||(32950861-32950924)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (12-440)||(13910846-13911277)
chr7 (12-440)||(16478785-16479213)
chr7 (12-440)||(2437457-2437889)
chr7 (12-440)||(10989410-10989841)
chr7 (212-440)||(7293017-7293245)
chr7 (38-440)||(13572676-13573079)
chr7 (12-275)||(7822895-7823161)
chr7 (12-275)||(7830206-7830472)
chr7 (12-275)||(27176600-27176866)
chr7 (105-440)||(18253761-18254098)
chr7 (12-275)||(27101460-27101726)
chr7 (12-275)||(27108808-27109074)
chr7 (12-275)||(38783552-38783818)
chr7 (38-275)||(18979872-18980110)
chr7 (38-275)||(15927735-15927973)
chr7 (12-275)||(15950613-15950880)
chr7 (190-440)||(47481043-47481294)
chr7 (63-275)||(13758537-13758750)
chr7 (212-344)||(11516324-11516456)
chr7 (212-344)||(15441598-15441730)
chr7 (212-344)||(30262163-30262295)
chr7 (63-275)||(15759990-15760203)
chr7 (218-440)||(3059966-3060189)
chr7 (105-187)||(15862174-15862257)
chr7 (222-435)||(11580783-11580997)
chr7 (222-440)||(36052667-36052883)
chr7 (100-275)||(14250811-14250987)
chr7 (212-440)||(13037048-13037277)
chr7 (190-440)||(13321014-13321267)
chr7 (212-438)||(16211768-16211995)
chr7 (105-274)||(48622584-48622754)
chr7 (105-210)||(16418729-16418835)
chr7 (105-272)||(10000288-10000455)
chr7 (212-283)||(25292372-25292443)
chr7 (62-136)||(15516719-15516793)
chr7 (338-437)||(296128-296224)
chr7 (329-422)||(13274804-13274897)
chr7 (329-422)||(49047811-49047904)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (12-440)||(27653805-27654235)
chr6 (38-440)||(25175563-25175968)
chr6 (12-436)||(14625952-14626377)
chr6 (105-436)||(1650022-1650352)
chr6 (116-440)||(16825678-16826006)
chr6 (12-275)||(16376196-16376462)
chr6 (12-275)||(16383520-16383786)
chr6 (12-275)||(10488866-10489132)
chr6 (12-241)||(22251389-22251621)
chr6 (38-275)||(16232059-16232297)
chr6 (12-275)||(22225561-22225827)
chr6 (12-208)||(19299471-19299670)
chr6 (38-275)||(18086674-18086912)
chr6 (23-275)||(16555973-16556228)
chr6 (23-275)||(16632529-16632784)
chr6 (38-210)||(29869627-29869800)
chr6 (63-275)||(1556172-1556385)
chr6 (63-275)||(19610185-19610398)
chr6 (63-275)||(23977936-23978149)
chr6 (190-440)||(35009451-35009702)
chr6 (190-429)||(1657760-1657999)
chr6 (12-121)||(16814820-16814930)
chr6 (105-275)||(13620712-13620883)
chr6 (212-429)||(15862484-15862700)
chr6 (212-429)||(23153458-23153676)
chr6 (109-275)||(29666040-29666208)
chr6 (337-440)||(27740838-27740941)
chr6 (63-136)||(4991396-4991470)
chr6 (191-259)||(27751607-27751675)
chr6 (330-423)||(18381821-18381914)
chr6 (353-440)||(22361926-22362014)
chr6 (329-440)||(25367374-25367486)
chr6 (400-440)||(29665892-29665932)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (12-440)||(36093-36523)
scaffold0023 (16-229)||(169736-169951)
scaffold0023 (63-275)||(153883-154096)
scaffold0023 (212-440)||(48598-48827)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (12-436)||(24548986-24549410)
chr8 (12-440)||(30120722-30121153)
chr8 (12-436)||(6774082-6774505)
chr8 (12-440)||(21851786-21852217)
chr8 (212-440)||(22907248-22907476)
chr8 (12-440)||(21844393-21844824)
chr8 (41-440)||(16674245-16674644)
chr8 (12-275)||(271183-271449)
chr8 (12-275)||(644471-644737)
chr8 (12-275)||(830206-830472)
chr8 (12-208)||(15318982-15319181)
chr8 (12-208)||(15499351-15499550)
chr8 (12-275)||(22088617-22088883)
chr8 (63-275)||(13720804-13721017)
chr8 (63-275)||(22006134-22006347)
chr8 (212-344)||(5238184-5238316)
chr8 (100-275)||(16872964-16873140)
chr8 (212-344)||(24661282-24661414)
chr8 (212-344)||(43685643-43685775)
chr8 (63-275)||(13662141-13662354)
chr8 (212-441)||(16193750-16193980)
chr8 (63-275)||(16195398-16195611)
chr8 (222-440)||(43373512-43373731)
chr8 (212-440)||(16405009-16405235)
chr8 (212-429)||(17345581-17345798)
chr8 (222-429)||(24928835-24929043)
chr8 (253-440)||(222754-222943)
chr8 (253-440)||(736377-736566)
chr8 (253-440)||(860272-860461)
chr8 (329-423)||(23837214-23837308)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (12-440)||(31497-31928)
scaffold0008 (212-440)||(128203-128431)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (12-440)||(10644219-10644648)
chr4 (212-440)||(26680201-26680429)
chr4 (63-440)||(47357654-47358030)
chr4 (38-275)||(15287096-15287334)
chr4 (12-275)||(18169137-18169403)
chr4 (38-275)||(15294205-15294443)
chr4 (38-210)||(22351915-22352088)
chr4 (63-275)||(7131941-7132154)
chr4 (212-440)||(15675123-15675352)
chr4 (63-275)||(20000890-20001103)
chr4 (212-344)||(10488659-10488791)
chr4 (212-344)||(16327960-16328092)
chr4 (212-440)||(31115629-31115858)
chr4 (105-275)||(19020653-19020824)
chr4 (100-275)||(17145570-17145746)
chr4 (105-275)||(18248385-18248556)
chr4 (190-440)||(54118256-54118507)
chr4 (212-440)||(13246430-13246659)
chr4 (63-210)||(26339251-26339399)
chr4 (114-208)||(8378385-8378480)
chr4 (212-376)||(10104284-10104449)
chr4 (342-440)||(111395-111493)
chr4 (143-275)||(22738436-22738568)
chr4 (212-310)||(122020-122118)
chr4 (38-136)||(14952085-14952183)
chr4 (222-432)||(13048265-13048477)
chr4 (105-179)||(9795490-9795564)
chr4 (395-440)||(10104449-10104494)
chr4 (63-137)||(14996444-14996518)
chr4 (329-423)||(41166083-41166177)
chr4 (329-416)||(7185981-7186068)
chr4 (329-416)||(15044851-15044938)
chr4 (105-138)||(8378491-8378524)
chr4 (329-422)||(13809647-13809740)
chr4 (329-441)||(52265645-52265758)
chr4 (222-274)||(40885598-40885650)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (12-440)||(42997-43427)
scaffold0076 (12-275)||(39270-39536)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (34-310)||(13171-13445)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (38-440)||(55316219-55316622)
chr3 (38-440)||(41270075-41270478)
chr3 (212-440)||(16744149-16744377)
chr3 (212-440)||(17912516-17912744)
chr3 (105-436)||(15614838-15615168)
chr3 (62-440)||(16821139-16821517)
chr3 (12-275)||(49232603-49232869)
chr3 (105-440)||(15936553-15936890)
chr3 (12-275)||(12264614-12264881)
chr3 (12-275)||(1467562-1467828)
chr3 (105-437)||(15938395-15938729)
chr3 (12-208)||(12812075-12812274)
chr3 (12-275)||(22275376-22275642)
chr3 (63-440)||(15468216-15468596)
chr3 (63-275)||(18911160-18911373)
chr3 (63-275)||(25058906-25059119)
chr3 (212-440)||(15859058-15859287)
chr3 (212-441)||(51158052-51158282)
chr3 (63-440)||(14842446-14842824)
chr3 (212-344)||(2449272-2449404)
chr3 (105-275)||(12902008-12902179)
chr3 (63-241)||(18896920-18897099)
chr3 (222-440)||(2049810-2050029)
chr3 (212-429)||(13838905-13839123)
chr3 (63-275)||(5228480-5228692)
chr3 (212-440)||(12030181-12030410)
chr3 (105-274)||(54651625-54651795)
chr3 (105-275)||(44229152-44229323)
chr3 (331-440)||(47984650-47984759)
chr3 (331-440)||(48003224-48003333)
chr3 (331-440)||(47993937-47994046)
chr3 (331-440)||(48012510-48012619)
chr3 (223-310)||(13975766-13975853)
chr3 (223-310)||(45860937-45861024)
chr3 (223-440)||(13954934-13955153)
chr3 (364-440)||(22275209-22275285)
chr3 (63-137)||(8268609-8268683)
chr3 (63-137)||(8275709-8275783)
chr3 (212-275)||(11986200-11986263)
chr3 (329-422)||(11329098-11329191)
chr3 (399-440)||(13975944-13975985)
chr3 (329-422)||(17139525-17139618)
chr3 (399-440)||(45860805-45860846)
chr3 (352-439)||(38811168-38811256)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (212-440)||(37100-37328)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (12-440)||(20936-21367)
scaffold0139 (12-440)||(13882-14312)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (38-440)||(5072237-5072640)
chr1 (66-440)||(22227809-22228185)
chr1 (66-440)||(22232506-22232882)
chr1 (12-275)||(17148734-17149001)
chr1 (105-436)||(2116258-2116589)
chr1 (12-275)||(18059581-18059847)
chr1 (143-440)||(18601071-18601370)
chr1 (12-275)||(17004805-17005071)
chr1 (105-310)||(45051554-45051757)
chr1 (12-275)||(38054914-38055180)
chr1 (12-208)||(19962322-19962521)
chr1 (100-275)||(46523556-46523731)
chr1 (212-344)||(51452589-51452721)
chr1 (190-440)||(20445679-20445930)
chr1 (212-440)||(20931345-20931574)
chr1 (63-210)||(22035679-22035827)
chr1 (222-440)||(20531444-20531663)
chr1 (212-440)||(20893660-20893889)
chr1 (190-440)||(37844462-37844714)
chr1 (212-440)||(41394222-41394451)
chr1 (63-210)||(7640810-7640958)
chr1 (212-440)||(20913037-20913259)
chr1 (62-136)||(15861284-15861358)
chr1 (386-436)||(45051446-45051496)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (38-310)||(1153-1424)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (63-440)||(3722-4102)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (63-436)||(2966-3341)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (105-436)||(9266-9596)
scaffold0215 (105-436)||(16164-16494)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (63-440)||(5088-5466)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (38-440)||(64372-64780)
scaffold0026 (105-440)||(107747-108084)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (47-208)||(29396-29558)
scaffold0213 (12-73)||(29565-29627)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (12-275)||(31476-31742)
scaffold0107 (153-275)||(39813-39935)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (63-440)||(35-411)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (12-275)||(7278-7545)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (63-216)||(10624-10778)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (212-440)||(19206-19435)
scaffold0195 (212-440)||(21290-21519)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (63-275)||(1390-1603)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (63-275)||(1451-1664)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (38-210)||(6829-7002)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (12-275)||(2559-2826)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (105-440)||(12115-12449)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (212-440)||(36947-37176)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (212-344)||(22637-22769)
scaffold0141 (212-344)||(26892-27024)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (212-344)||(1616-1748)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (212-440)||(990-1218)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (212-440)||(8849-9078)
scaffold0025 (212-440)||(148721-148950)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (222-440)||(48187-48406)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (190-440)||(8878-9129)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (212-438)||(3616-3843)
scaffold0266 (212-440)||(1124-1353)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (105-440)||(13506-13855)
scaffold0132 (104-136)||(42677-42709)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (212-440)||(6098-6326)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (38-206)||(23600-23769)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (212-440)||(41648-41877)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (105-440)||(34374-34724)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (12-136)||(130880-131006)
scaffold0028 (212-280)||(89488-89556)
scaffold0028 (362-440)||(79537-79616)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (212-429)||(171916-172134)
scaffold0001 (212-429)||(177619-177837)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (105-275)||(45197-45369)
scaffold0066 (105-440)||(54416-54755)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (222-440)||(5105-5324)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (190-440)||(123176-123427)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (222-434)||(272031-272244)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (105-275)||(10257-10428)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (212-436)||(41733-41958)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (342-440)||(9382-9480)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (105-274)||(54042-54212)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (212-440)||(26449-26678)
scaffold0162 (190-440)||(8192-8440)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (143-274)||(3581-3712)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (212-310)||(5660-5758)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (105-210)||(7441-7547)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (212-440)||(568-797)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (105-208)||(12045-12149)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (105-275)||(34076-34247)
scaffold0012 (222-429)||(247486-247694)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (38-129)||(154282-154373)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (212-310)||(51216-51314)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (351-440)||(48514-48603)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (105-179)||(13268-13342)
scaffold0032 (363-440)||(104793-104871)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (12-136)||(17115-17241)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (184-271)||(3360-3447)
scaffold0361 (396-438)||(3210-3252)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (351-440)||(26-115)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (212-275)||(56133-56196)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (362-423)||(2471-2532)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 19886483 - 19886913
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886483 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 19886582  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  19886583 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 19886682  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||  ||  ||| || ||||||| |||||||     
T  19886683 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 19886782  T
Q  312 aaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattg 409  Q
    |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||    
T  19886783 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 19886882  T
Q  410 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886883 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 11231161 - 11231427
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  11231161 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 11231260  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  11231261 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 11231360  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  11231361 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 11231427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 22513008 - 22513274
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  22513008 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 22513107  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  22513108 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22513207  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  22513208 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 22513274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 28775630 - 28775896
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  28775630 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 28775729  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  28775730 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 28775829  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  28775830 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 28775896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 24685604 - 24685870
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  24685604 agagaagaacaaaagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 24685703  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  24685704 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 24685803  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  24685804 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 24685870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 19794738 - 19794967
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | |||| || || ||||||||||||     
T  19794738 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 19794837  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19794838 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgc 19794937  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794938 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 275
Target Start/End: Original strand, 3798516 - 3798692
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  3798516 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 3798615  T
Q  199 catgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    | |||||||||| | ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  3798616 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 3798692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 24826522 - 24826646
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  24826522 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 24826621  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcat 136  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  24826622 aggggttagtcatcatcataatcat 24826646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8944226 - 8944013
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8944226 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 8944127  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| | |    
T  8944126 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggt 8944027  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  8944026 gaaattacatgttt 8944013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12728772 - 12728559
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  12728772 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 12728673  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  12728672 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 12728573  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  12728572 gaaattacatgttt 12728559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 36982475 - 36982704
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||     
T  36982475 tgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 36982574  T
Q  312 aaacggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | ||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | |||||||||||||||     
T  36982575 caattggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgt 36982674  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982675 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 42177845 - 42178058
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  42177845 taggggctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 42177944  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | | |    
T  42177945 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggt 42178044  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  42178045 gaaattacatgttt 42178058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Original strand, 19689435 - 19689567
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19689435 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 19689534  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19689535 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 19689567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23820300 - 23820168
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23820300 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 23820201  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23820200 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 23820168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 12641560 - 12641731
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||    
T  12641560 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 12641659  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||||||| | ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  12641660 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgttt 12641731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 23777963 - 23778134
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  23777963 aaggtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 23778062  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||||| | ||||| ||| ||  |||||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  23778063 tcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgttt 23778134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 12635744 - 12635957
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  12635744 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgtt 12635843  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  12635844 gtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 12635943  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  12635944 gaaattacatgttt 12635957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16935973 - 16935760
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16935973 taggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 16935874  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| ||||   |    
T  16935873 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgt 16935774  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  16935773 gaaattacatgttt 16935760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17006633 - 17006420
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17006633 taggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 17006534  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| ||||   |    
T  17006533 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgt 17006434  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  17006433 gaaattacatgttt 17006420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34824855 - 34824642
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  34824855 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 34824756  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  34824755 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 34824656  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  34824655 gaaattacatgttt 34824642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Original strand, 14906474 - 14906606
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14906474 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 14906573  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14906574 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 14906606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 24341423 - 24341652
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||  || || ||||||||||||     
T  24341423 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 24341522  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  24341523 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgttgatgaatcattgc 24341622  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24341623 ttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 440
Target Start/End: Original strand, 7507856 - 7508107
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 289  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  7507856 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 7507955  T
Q  290 gaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaataga 387  Q
     | || ||||||||||||||   ||  | |||||||| | | ||||| ||| ||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | ||    
T  7507956 aataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaatttggctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttga 7508054  T
Q  388 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508055 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 462967 - 462743
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || |||||||||||      
T  462967 tgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgtt 462868  T
Q  312 aaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||  |  |||||||||||||||    
T  462867 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatgaatcattgc 462768  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattga 435  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  462767 ttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20015240 - 20015108
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  || |||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20015240 tgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 20015141  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20015140 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20015108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 440
Target Start/End: Original strand, 25265402 - 25265653
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 289  Q
    |||||||||| ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  25265402 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 25265501  T
Q  290 gaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 388  Q
    |  || || ||||||||||||  ||  | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  25265502 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgat 25265601  T
Q  389 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25265602 gttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 43642991 - 43643220
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | |||  || || ||||||||||||     
T  43642991 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgct 43643090  T
Q  312 aaacggatgaatttgacat-gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | |||||  || | ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  43643091 caattggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgc 43643190  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43643191 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 222 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8891461 - 8891242
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatga 321  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |   | |||| || || ||||||||||||  ||  | |||    
T  8891461 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 8891362  T
Q  322 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgc 420  Q
    ||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8891361 attttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 8891262  T
Q  421 atattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  8891261 atattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23774516 - 23774368
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||| || |||||||    
T  23774516 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgtt 23774417  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  23774416 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 23774368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 20627347 - 20627576
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||| || || ||||||||||||     
T  20627347 tgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgct 20627446  T
Q  312 aaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| |||||||| || | | || |||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  20627447 caattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgc 20627546  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20627547 ttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Original strand, 5888548 - 5888654
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  5888548 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 5888647  T
Q  204 tcttgtt 210  Q
    |||||||    
T  5888648 tcttgtt 5888654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21142187 - 21142062
Alignment:
Q  151 tttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgt 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||| | |  | ||    
T  21142187 tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggt 21142088  T
Q  250 atgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||    
T  21142087 atgtttgtggatgaaattacatgttt 21142062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 310
Target Start/End: Original strand, 17396697 - 17396784
Alignment:
Q  223 ttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgc 310  Q
    |||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| || ||||||| |||||||    
T  17396697 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 17396784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25213446 - 25213372
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaagga-taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25213446 taggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 440
Target Start/End: Original strand, 19669279 - 19669358
Alignment:
Q  362 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| | ||||||||    
T  19669279 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaactgatgatg 19669358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 5 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12811 - 12374
Alignment:
Q  5 gaggagcagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttca 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12811 gaggagaagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttca 12712  T
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12711 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 12612  T
Q  205 cttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaa 304  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||  ||  ||| || ||||||| |    
T  12611 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 12512  T
Q  305 ttgtgcaaaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 402  Q
    |||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  |||||||    
T  12511 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 12412  T
Q  403 atcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12411 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 5 - 440
Target Start/End: Original strand, 21073410 - 21073847
Alignment:
Q  5 gaggagcagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttca 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073410 gaggagaagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttca 21073509  T
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21073510 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgct 21073609  T
Q  205 cttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaa 304  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| |    
T  21073610 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 21073709  T
Q  305 ttgtgcaaaacggatgaatt--tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 402  Q
    |||||| |||  | ||||||  |   | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  |||||||    
T  21073710 ttgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttgatattatgattgatga 21073809  T
Q  403 atcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073810 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 4199807 - 4200237
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  4199807 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 4199906  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  4199907 gggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttg 4200006  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| ||| |||     
T  4200007 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 4200106  T
Q  312 aaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattg 409  Q
    |||  | |||||||  |  ||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||    
T  4200107 aaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattg 4200206  T
Q  410 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4200207 cttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 18777814 - 18778244
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  18777814 agagaagaacaagagggttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataattaacttcaaaggtaa 18777913  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |     
T  18777914 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctg 18778013  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| |||||||     
T  18778014 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 18778113  T
Q  312 aaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattg 409  Q
    |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||  || | ||| ||||  ||||||||| ||||    
T  18778114 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattg 18778213  T
Q  410 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778214 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 22366302 - 22366733
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  22366302 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttagcaatcaagtggggtgacctaggagttgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 22366401  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22366402 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttgct 22366501  T
Q  211 ctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgc 310  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| |||||||    
T  22366502 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 22366601  T
Q  311 aaaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcatt 408  Q
     |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||    
T  22366602 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 22366701  T
Q  409 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366702 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19500328 - 19499899
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  19500328 agagaagaacaagagagttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 19500230  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |     
T  19500229 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttgctg 19500130  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| |||||||     
T  19500129 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 19500030  T
Q  312 aaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattg 409  Q
    |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||| ||| ||||    
T  19500029 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgattaataattg 19499930  T
Q  410 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19499929 ctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25427058 - 25426628
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaag-gataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||    
T  25427058 agagaagagcaagagggttgaagggaagcttaaagaatcaagtgggtaac-taggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggta 25426960  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25426959 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 25426860  T
Q  211 ctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgc 310  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| |||||||    
T  25426859 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 25426760  T
Q  311 aaaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcatt 408  Q
     |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||    
T  25426759 taaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 25426660  T
Q  409 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426659 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 43443220 - 43443647
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  43443220 agagaagagcatgagggttgaagggaagctt-aggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 43443318  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |     
T  43443319 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaatt--gcatattctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctg 43443416  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| |||||||     
T  43443417 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 43443516  T
Q  312 aaacggatgaatt--tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattg 409  Q
     ||  | ||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | ||| |||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||    
T  43443517 caattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 43443616  T
Q  410 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43443617 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 310
Target Start/End: Original strand, 29188107 - 29188404
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  29188107 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 29188206  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  |    
T  29188207 agggggttagtgattattataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 29188304  T
Q  211 ctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgc 310  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||| ||||    
T  29188305 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 38 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27010244 - 27009841
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27010244 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 27010145  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27010144 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 27010046  T
Q  238 gatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac--atgttgt 335  Q
    |||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||| ||||| |  ||  | |||||||  |  | |||||    
T  27010045 gatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgt 27009946  T
Q  336 agttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattga 435  Q
     ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27009945 tgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgt 27009846  T
Q  436 tgatg 440  Q
    |||||    
T  27009845 tgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 10777793 - 10778059
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10777793 agagaagaacaagagagttgaaggggaagcttgaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaaggataatcatcttcaaaggt 10777892  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  10777893 aaggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 10777992  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  10777993 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 10778059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 21932204 - 21932470
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21932204 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 21932303  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  21932304 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 21932403  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  21932404 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 21932470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 21938374 - 21938640
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21938374 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 21938473  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  21938474 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 21938573  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  21938574 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 21938640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35582469 - 35582203
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  35582469 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 35582370  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  35582369 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 35582270  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  35582269 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 35582203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7425729 - 7425491
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425729 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 7425630  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||||    
T  7425629 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaat 7425530  T
Q  237 tgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     |||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  7425529 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 7425491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 275
Target Start/End: Original strand, 11211940 - 11212154
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgt 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  11211940 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 11212039  T
Q  161 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| |     
T  11212040 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 11212139  T
Q  261 tgaaattacatgttt 275  Q
    |||||||||||||||    
T  11212140 tgaaattacatgttt 11212154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 22882907 - 22883173
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  22882907 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgggaaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaagat 22883006  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||  ||||||||    
T  22883007 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttg 22883106  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  22883107 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatggatgaaattacatgttt 22883173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 36989593 - 36989859
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  36989593 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 36989692  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| |||||| |    
T  36989693 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctctag 36989792  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  36989793 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 36989859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 35790974 - 35791187
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  35790974 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 35791073  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| ||||   |    
T  35791074 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagt 35791173  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  35791174 gaaattacatgttt 35791187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 17471411 - 17471677
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||   | |||||| |||||||||    
T  17471411 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcatcttcaaagg 17471509  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||    
T  17471510 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctctt 17471609  T
Q  208 gttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    | | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  17471610 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 17471677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23514941 - 23514728
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  23514941 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 23514842  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  23514841 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 23514742  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  23514741 gaaattacatgttt 23514728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20623198 - 20623066
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20623198 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 20623099  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20623098 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20623066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Original strand, 21233562 - 21233694
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21233562 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 21233661  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21233662 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 21233694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 190 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23507216 - 23506965
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 289  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  23507216 tgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 23507117  T
Q  290 gaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 388  Q
    || || || ||||||||||||  ||  | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  23507116 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgat 23507017  T
Q  389 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23507016 gttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 22053867 - 22054096
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  || || ||||||||||||     
T  22053867 tgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 22053966  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  22053967 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgc 22054066  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054067 ttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 1219396 - 1219609
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1219396 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 1219495  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | ||||| |||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  1219496 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1219595  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  1219596 gaaattacatgttt 1219609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 18531101 - 18531330
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  || || |||||||||||      
T  18531101 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgtt 18531200  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  18531201 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgc 18531300  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18531301 tcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16536426 - 16536294
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16536426 tgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 16536327  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16536326 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16536294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 212 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37052973 - 37052844
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  37052973 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 37052874  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttga 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  37052873 aaatggatgaatttgacatgttgttgttga 37052844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Original strand, 25900440 - 25900571
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25900440 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 25900539  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25900540 aaatggatgaa-ttgacatgttgttgttgaatt 25900571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 440
Target Start/End: Original strand, 27182559 - 27182810
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 289  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | ||    
T  27182559 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaat 27182658  T
Q  290 gaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 388  Q
    || || || ||||||||||||  ||  | |||||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  27182659 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgat 27182758  T
Q  389 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27182759 gttgtggttgatgaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 190 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 34939528 - 34939289
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 289  Q
    |||||||||| ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| || ||    
T  34939528 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 34939429  T
Q  290 gaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 388  Q
    |  || |||||||||||||||  ||  ||| || ||||  | ||  | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| || |||| |||    
T  34939428 gtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagtcattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgctgttaattgat 34939330  T
Q  389 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 429  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34939329 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11343134 - 11343008
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||| || |||||  ||||||||||    
T  11343134 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcagaggttagggttaatcttcttcaaaggt 11343035  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11343034 aagggggttagtttttatcataatcat 11343008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23328937 - 23328789
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  23328937 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 23328838  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  23328837 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 23328789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24616541 - 24616393
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  24616541 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24616442  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  24616441 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 24616393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24712917 - 24712769
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  24712917 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24712818  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  24712817 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 24712769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24745935 - 24745787
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  24745935 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24745836  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  24745835 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 24745787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16106093 - 16105967
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||  || ||| |||||  |||| |||||    
T  16106093 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggt 16105994  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16105993 aagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 392 - 436
Target Start/End: Original strand, 29190478 - 29190522
Alignment:
Q  392 atagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29190478 atagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 440
Target Start/End: Original strand, 17471768 - 17471844
Alignment:
Q  364 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||  || |||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17471768 attgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatg 17471844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19862319 - 19862207
Alignment:
Q  329 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attca 427  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | ||| |||||    
T  19862319 atgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatgacttgggtgttcataattca 19862220  T
Q  428 tggattgatgatg 440  Q
    ||  |||||||||    
T  19862219 tgatttgatgatg 19862207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23494029 - 23493917
Alignment:
Q  329 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attca 427  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||||| |||| |||||||| | ||| |||||    
T  23494029 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattca 23493930  T
Q  428 tggattgatgatg 440  Q
    ||  |||||||||    
T  23493929 tgatttgatgatg 23493917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 32950924 - 32950861
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||| || || || |||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32950924 tgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttt 32950861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 13910846 - 13911277
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  13910846 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 13910945  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  13910946 gggggttattgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttg 13911045  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| ||| |||     
T  13911046 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 13911145  T
Q  312 aaacggatgaatttgac---atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcatt 408  Q
     ||  | |||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||    
T  13911146 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 13911245  T
Q  409 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13911246 tcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 16478785 - 16479213
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16478785 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggta 16478884  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |    
T  16478885 agggggttagtgattatcataatcattt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctcttact 16478982  T
Q  211 ctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgc 310  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||    
T  16478983 gcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 16479082  T
Q  311 aaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattg 409  Q
      ||  | |||| ||||  | ||| |  || | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||| | |||||||||||| ||    
T  16479083 tcaattggtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactg 16479182  T
Q  410 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479183 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2437889 - 2437457
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  2437889 agagaagaacaggagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 2437790  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2437789 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgt 2437690  T
Q  210 tctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtg 309  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| ||||||    
T  2437689 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 2437590  T
Q  310 caaaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcat 407  Q
       ||  | |||||||  |  | ||||| ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||    
T  2437589 ttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 2437490  T
Q  408 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2437489 tgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10989841 - 10989410
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggtt-gaagggaagctttaggaatcaagtg-ggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10989841 agagaagatcaagagtgttagaaggggagcttgaggaatcaagtgaggtgacataggagcttaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggt 10989742  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgt 209  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  10989741 atgggggttagtgattatcataatcatgtataattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgc 10989642  T
Q  210 tctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtg 309  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| ||||||    
T  10989641 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtg 10989542  T
Q  310 caaaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcat 407  Q
    |  ||  | |||||||  |  | ||||| | | | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||    
T  10989541 ctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 10989443  T
Q  408 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989442 tgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 7293245 - 7293017
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7293245 tgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 7293146  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgct 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7293145 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgct 7293046  T
Q  412 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7293045 tgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 38 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13573079 - 13572676
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13573079 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 13572980  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13572979 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 13572881  T
Q  238 gatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac--atgttgt 335  Q
    |||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||| |||||||  ||  | |||||||  |  | |||||    
T  13572880 gatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 13572781  T
Q  336 agttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattga 435  Q
     ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13572780 tgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgt 13572681  T
Q  436 tgatg 440  Q
    |||||    
T  13572680 tgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7823161 - 7822895
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7823161 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 7823062  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  7823061 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 7822962  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  7822961 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 7822895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7830472 - 7830206
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7830472 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 7830373  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  7830372 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 7830273  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  7830272 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 7830206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27176866 - 27176600
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27176866 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27176767  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  27176766 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27176667  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  27176666 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 27176600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 440
Target Start/End: Original strand, 18253761 - 18254098
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||    
T  18253761 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 18253860  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaa 303  Q
    ||    | | ||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||| || || |||||    
T  18253861 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 18253960  T
Q  304 attgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 402  Q
    |||||||  ||  | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  18253961 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 18254060  T
Q  403 atcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18254061 ataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 27101460 - 27101726
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27101460 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27101559  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  27101560 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27101659  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  27101660 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 27101726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 27108808 - 27109074
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27108808 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27108907  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  27108908 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27109007  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  27109008 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 27109074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 38783552 - 38783818
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  38783552 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 38783651  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  38783652 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 38783751  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  38783752 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 38783818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 275
Target Start/End: Original strand, 18979872 - 18980110
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18979872 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 18979971  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||    
T  18979972 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 18980071  T
Q  237 tgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  18980072 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 18980110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15927973 - 15927735
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927973 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15927874  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15927873 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15927774  T
Q  237 tgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  15927773 tgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgttt 15927735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 15950613 - 15950880
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||||||||    
T  15950613 agagaagaacaagggttttgaaggaaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttcaaagg 15950712  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  15950713 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 15950812  T
Q  208 gttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    | | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  15950813 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 15950880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 190 - 440
Target Start/End: Original strand, 47481043 - 47481294
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 289  Q
    |||||||||| ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  47481043 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 47481142  T
Q  290 gaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 388  Q
    || || || |||||||||||   ||  | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||    
T  47481143 gataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcgctcttaattgat 47481242  T
Q  389 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47481243 gtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13758750 - 13758537
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13758750 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13758651  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  13758650 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 13758551  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  13758550 gaaattacatgttt 13758537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11516456 - 11516324
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11516456 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 11516357  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11516356 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 11516324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Original strand, 15441598 - 15441730
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15441598 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 15441697  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15441698 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 15441730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Original strand, 30262163 - 30262295
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  30262163 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 30262262  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30262263 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 30262295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 15759990 - 15760203
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  15759990 taggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 15760089  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  |  |||| |||| | |    
T  15760090 gtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggt 15760189  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  15760190 gaaattacatgttt 15760203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 218 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3060189 - 3059966
Alignment:
Q  218 tatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacgg 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||| |||||||| |||  ||  |    
T  3060189 tatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatg 3060090  T
Q  318 atgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggt 416  Q
     ||||||| |  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3060089 gtgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 3059990  T
Q  417 atgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  3059989 atgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15862257 - 15862174
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862257 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 222 - 435
Target Start/End: Original strand, 11580783 - 11580997
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatga 321  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | |||| || || ||||||||||||  ||  | |||    
T  11580783 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 11580882  T
Q  322 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgc 420  Q
    ||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  11580883 attttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatac 11580982  T
Q  421 atattcatggattga 435  Q
    ||||||||| |||||    
T  11580983 atattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 222 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 36052883 - 36052667
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatga 321  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||  ||  | |||    
T  36052883 tttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 36052784  T
Q  322 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgc 420  Q
    ||||  | | |||||   | | ||||| | |||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  36052783 attttgctaagttgt---taatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgc 36052687  T
Q  421 atattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  36052686 atattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 275
Target Start/End: Original strand, 14250811 - 14250987
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  14250811 cttctaaggtaagggggttagttatcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaatt 14250910  T
Q  199 catgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    | |||||||||| | ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  14250911 cgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgttt 14250987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 13037048 - 13037277
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |   | |||| || || ||||||||||||     
T  13037048 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 13037147  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||  |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  13037148 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 13037247  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13037248 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13321267 - 13321014
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt--aaatatgtgaag 287  Q
    |||||||||| ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||  |     
T  13321267 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 13321168  T
Q  288 atgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 385  Q
    |||  || ||||| |||||||||  ||  | |||| ||||  | |||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||     
T  13321167 atgtcaagttatg-aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaatt 13321069  T
Q  386 gatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||| | |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13321068 gatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 212 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16211995 - 16211768
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||     
T  16211995 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 16211896  T
Q  312 aaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||||||||  |||||||||| | | || |||| |||||| | |||||||| |||||||    
T  16211895 caattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgattcattgc 16211796  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatga 438  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16211795 ttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 48622584 - 48622754
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  48622584 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgc 48622683  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtt 274  Q
    ||||  | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  48622684 tcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 48622754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16418835 - 16418729
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  16418835 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 16418736  T
Q  204 tcttgtt 210  Q
    |||||||    
T  16418735 tcttgtt 16418729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 272
Target Start/End: Original strand, 10000288 - 10000455
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||    
T  10000288 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaaattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgc 10000387  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatg 272  Q
    ||||||| || |||| | ||  ||| |||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||||||||||    
T  10000388 tcttgttatgttgttgt-ttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatg 10000455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 283
Target Start/End: Original strand, 25292372 - 25292443
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgt 283  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25292372 tgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgt 25292443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 15516719 - 15516793
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15516719 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaatgtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 437
Target Start/End: Original strand, 296128 - 296224
Alignment:
Q  338 ttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 437  Q
    |||||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||   |||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  296128 ttgaattgtgttgtgattcatgttcaattgatgttgttgctattaattgatgtt---gttgatgaattactgattgggtatgcttattcatggattgatg 296224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13274897 - 13274804
Alignment:
Q  329 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat 422  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||||| |||| |||| |||||||||    
T  13274897 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggctttggtatgcat 13274804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 422
Target Start/End: Original strand, 49047811 - 49047904
Alignment:
Q  329 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat 422  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||| | |||| ||||||||||||||    
T  49047811 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgataattcatggcttgggtatgcat 49047904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 27653805 - 27654235
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| |    
T  27653805 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtga 27653904  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |     
T  27653905 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctg 27654004  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| |||||||     
T  27654005 tgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 27654104  T
Q  312 aaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattg 409  Q
    |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| | | ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||    
T  27654105 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 27654204  T
Q  410 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27654205 cttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 38 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25175968 - 25175563
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaag-gataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25175968 agctttcggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattaccataatcat 25175870  T
Q  137 gtgtaattttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaa 235  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  25175869 gtataattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaa 25175770  T
Q  236 ttgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac--atgtt 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | |||    
T  25175769 ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagtt 25175670  T
Q  334 gtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggatt 433  Q
    || ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175669 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 25175570  T
Q  434 gatgatg 440  Q
    |||||||    
T  25175569 gatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 436
Target Start/End: Original strand, 14625952 - 14626377
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  14625952 agagaagaacaagagggttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 14626051  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctc--atgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgt 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | | | ||| ||  |||||  ||||||| || || || | | ||| | ||||  |||||||||| ||||||||     
T  14626052 gggggttagttattatcacaatcatct-tcactttacaaattctcaaatgttgtttg-aattgtgattatggataattattgctaaattcgtgctcttgc 14626149  T
Q  210 tctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtg 309  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||||    
T  14626150 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 14626249  T
Q  310 caaaacggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcatt 408  Q
       ||  | |||||| ||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14626250 tgcaattggtgaattatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcatt 14626349  T
Q  409 gcttgggtatgcatattcatggattgat 436  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626350 gcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 105 - 436
Target Start/End: Original strand, 1650022 - 1650352
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgct 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1650022 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgct 1650119  T
Q  205 cttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaa 304  Q
    |||  | ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||| || || ||||||    
T  1650120 cttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaa 1650219  T
Q  305 ttgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaa 403  Q
    ||||||  ||  | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||| | |||||||||    
T  1650220 ttgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaa 1650319  T
Q  404 tcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 436  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1650320 tcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 116 - 440
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16826006
Alignment:
Q  116 gttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgat 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  16825678 gttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 16825777  T
Q  216 gttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgta--tgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaa 313  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| ||||||| ||    
T  16825778 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaa 16825877  T
Q  314 acggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgct 411  Q
    |  | || ||||  |  |  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| ||   ||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  16825878 attggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatctgatattatgattgatgaataattgct 16825977  T
Q  412 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  16825978 ttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 16376196 - 16376462
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16376196 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 16376295  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  16376296 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 16376395  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  16376396 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 16376462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 16383520 - 16383786
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16383520 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 16383619  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  16383620 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 16383719  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  16383720 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 16383786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10489132 - 10488866
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  10489132 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 10489033  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  10489032 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 10488933  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  10488932 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 10488866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 22251389 - 22251621
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  22251389 agagaagaacaagagtgttgaatggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 22251488  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  22251489 atgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22251588  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatg 241  Q
     | ||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  22251589 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 22251621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16232297 - 16232059
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232297 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 16232198  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||    
T  16232197 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 16232098  T
Q  237 tgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  16232097 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 16232059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 22225561 - 22225827
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  22225561 agagaagaacaagagtgttgaatggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 22225660  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||     
T  22225661 atgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttt 22225760  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  22225761 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 22225827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19299670 - 19299471
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19299670 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggattcaatttgggcgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 19299571  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||    
T  19299570 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 19299471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 275
Target Start/End: Original strand, 18086674 - 18086912
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18086674 agctttagaaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattagtataatcatg 18086773  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||    
T  18086774 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaat 18086873  T
Q  237 tgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  18086874 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 18086912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 16555973 - 16556228
Alignment:
Q  23 agagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttag 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555973 agagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttag 16556072  T
Q  121 ttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgtta 219  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||| || | ||||| ||    
T  16556073 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgcta 16556172  T
Q  220 tatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    | ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  16556173 ttttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 16556228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 16632529 - 16632784
Alignment:
Q  23 agagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttag 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632529 agagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttag 16632628  T
Q  121 ttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgtta 219  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||| || | ||||| ||    
T  16632629 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgcta 16632728  T
Q  220 tatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    | ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  16632729 ttttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 16632784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Original strand, 29869627 - 29869800
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29869627 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttgatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 29869726  T
Q  137 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
     |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  29869727 ttaaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 29869800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1556385 - 1556172
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1556385 taggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 1556286  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  1556285 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1556186  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  1556185 gaaattacatgttt 1556172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19610398 - 19610185
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  19610398 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgtt 19610299  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||| |||| | |    
T  19610298 gtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggt 19610199  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  19610198 gaaattacatgttt 19610185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23978149 - 23977936
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  23978149 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 23978050  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  23978049 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 23977950  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  23977949 gaaattacatgttt 23977936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 190 - 440
Target Start/End: Original strand, 35009451 - 35009702
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 289  Q
    |||||||||| ||||||   | ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  35009451 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 35009550  T
Q  290 gaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 388  Q
    |  || || ||||||||||||  ||  | |||||||  | ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  35009551 gtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgat 35009650  T
Q  389 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35009651 gttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 190 - 429
Target Start/End: Original strand, 1657760 - 1657999
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 289  Q
    |||||||||| ||||||   | ||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| || ||    
T  1657760 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 1657859  T
Q  290 gaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 388  Q
    |  || |||||||||||||||  ||  |||| ||||  | | ||| | || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| || |||| |||    
T  1657860 gtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattgt-gaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgttgttaattgat 1657958  T
Q  389 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 429  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1657959 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 16814820 - 16814930
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  16814820 agagaagagcaagaggtttgaagggaagctttagcaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 16814919  T
Q  111 agggggttagt 121  Q
    || ||||||||    
T  16814920 agagggttagt 16814930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 13620712 - 13620883
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  13620712 aaggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 13620811  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||||||| | ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  13620812 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgttt 13620883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15862700 - 15862484
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||  | |||  || |||||||||||||||     
T  15862700 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgct 15862601  T
Q  312 aaacggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||| || |||| |||||| | |||||||||||| |||    
T  15862600 caattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattgctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgc 15862503  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatg 429  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15862502 ttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23153676 - 23153458
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | |||| || || ||||||||||||     
T  23153676 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 23153577  T
Q  312 aaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||| || | | || |||| |||||| | |||||||||||||| |    
T  23153576 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattac 23153477  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatg 429  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  23153476 ttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29666208 - 29666040
Alignment:
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctct 206  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||  || ||||||| ||||||    
T  29666208 taagtgggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctct 29666109  T
Q  207 tgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | | ||||||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29666108 agctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgttt 29666040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27740941 - 27740838
Alignment:
Q  337 gttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 436  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |  ||   |||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27740941 gttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgat 27740842  T
Q  437 gatg 440  Q
    ||||    
T  27740841 gatg 27740838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4991470 - 4991396
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaagga-taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4991470 taggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27751675 - 27751607
Alignment:
Q  191 gctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttg 259  Q
    ||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  27751675 gctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttg 27751607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 330 - 423
Target Start/End: Original strand, 18381821 - 18381914
Alignment:
Q  330 tgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcata 423  Q
    |||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  18381821 tgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 18381914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 440
Target Start/End: Original strand, 22361926 - 22362014
Alignment:
Q  353 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attcatggattgatgatg 440  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||    
T  22361926 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatg 22362014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 440
Target Start/End: Original strand, 25367374 - 25367486
Alignment:
Q  329 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attca 427  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |  | ||| | |||| |||||||| ||||| |||||    
T  25367374 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttatcgataattcatggcttgggtgtgcatgattca 25367473  T
Q  428 tggattgatgatg 440  Q
    || |||| |||||    
T  25367474 tgaattgttgatg 25367486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29665932 - 29665892
Alignment:
Q  400 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29665932 tgaatcatgacttgggtatgcatattcatggattggtgatg 29665892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 36523 - 36093
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  36523 agagaagagcaagagggttgaaggaaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggtaa 36424  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  36423 gggggttaatgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtag 36324  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||  || |||| || ||||||| |||||||     
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 36224  T
Q  312 aaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattg 409  Q
    |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| |||| |||||| |  ||| || | |||  |||  ||||||||| ||||    
T  36223 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattg 36124  T
Q  410 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36123 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 169736 - 169951
Alignment:
Q  16 aagaacaagagggttgaagg-gaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagg 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  169736 aagaacaagagagttgaaggcgaagcttgaggaatcaagtggggtgacataagagctgaattgaagcaagggttagtgataatcatcttcaaaagtaagg 169835  T
Q  114 gggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctg 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  169836 gggttagtgattatcataatcatgtataattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 169935  T
Q  214 atgttatatttgtatg 229  Q
    ||||||| ||||||||    
T  169936 atgttatgtttgtatg 169951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 153883 - 154096
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  153883 taggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 153982  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  153983 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 154082  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||| ||||||||||    
T  154083 gaagttacatgttt 154096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48827 - 48598
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  || |||| || || ||||||||||||     
T  48827 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 48728  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     |   | |||||||  | | ||||| | |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  48727 cagttggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 48628  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48627 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 24549410 - 24548986
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24549410 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttctaaggta 24549311  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |    
T  24549310 agggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 24549213  T
Q  211 ctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgc 310  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||| ||||    
T  24549212 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 24549113  T
Q  311 aaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattg 409  Q
      ||  | |||| ||||  | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24549112 tcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattg 24549013  T
Q  410 cttgggtatgcatattcatggattgat 436  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24549012 cttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 30121153 - 30120722
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  30121153 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagtaagggttagagataatcatcttcaaaggtaa 30121054  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  30121053 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 30120954  T
Q  211 ctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgc 310  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| |||||||    
T  30120953 gtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 30120854  T
Q  311 aaaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcatt 408  Q
      ||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||    
T  30120853 tcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 30120754  T
Q  409 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30120753 gcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 436
Target Start/End: Original strand, 6774082 - 6774505
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  6774082 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 6774180  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |    
T  6774181 agggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 6774278  T
Q  211 ctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgc 310  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||    
T  6774279 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 6774378  T
Q  311 aaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattg 409  Q
      ||  | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||| | |||||||||||| ||    
T  6774379 tcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactg 6774478  T
Q  410 cttgggtatgcatattcatggattgat 436  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6774479 cttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 21851786 - 21852217
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg--aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21851786 agagaagaacaagagtgttggagggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctagaagctgaagtggagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 21851885  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgt 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||     
T  21851886 aagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 21851984  T
Q  210 tctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtg 309  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| || ||||||| ||||||    
T  21851985 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtg 21852084  T
Q  310 caaaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcat 407  Q
    |  ||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||    
T  21852085 ctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 21852184  T
Q  408 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21852185 tgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 22907248 - 22907476
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22907248 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 22907347  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgct 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22907348 aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgct 22907447  T
Q  412 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907448 tgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 21844393 - 21844824
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg--aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21844393 agagaagaacaagagtgttggagggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctagaagctgaagtggagctaggattaaggataatcaacttcaacggt 21844492  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgt 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||     
T  21844493 aagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 21844591  T
Q  210 tctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtg 309  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||| ||||||    
T  21844592 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtg 21844691  T
Q  310 caaaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcat 407  Q
    |  ||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||    
T  21844692 ctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 21844791  T
Q  408 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21844792 tgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 440
Target Start/End: Original strand, 16674245 - 16674644
Alignment:
Q  41 tttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  || ||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  16674245 tttaggaatcaagtgggtgacttatgagctgaattgaagcaagagttgagt-taatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta- 16674342  T
Q  141 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgat 240  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  16674343 atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttat 16674442  T
Q  241 gttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac--atgttgtagt 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| |||||||  ||  | |||||||  |  | ||||| ||    
T  16674443 gttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgt 16674542  T
Q  339 tgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 438  Q
    | | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | |||  |||  || |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16674543 taagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatga 16674642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 271183 - 271449
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  271183 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 271282  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  271283 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 271382  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  271383 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 271449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 644737 - 644471
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  644737 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 644638  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  644637 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 644538  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  644537 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 644471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 830472 - 830206
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  830472 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 830373  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  830372 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 830273  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  830272 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 830206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Original strand, 15318982 - 15319181
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15318982 agagaagaacaagagtgttgaaggaaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 15319081  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  15319082 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 15319181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Original strand, 15499351 - 15499550
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15499351 agagaagaacaagagtgttgaaggaaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 15499450  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  15499451 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 15499550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 22088617 - 22088883
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  22088617 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 22088716  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  22088717 aagggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22088816  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  22088817 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgttt 22088883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 13720804 - 13721017
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13720804 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13720903  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  13720904 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 13721003  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  13721004 gaaattacatgttt 13721017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 22006134 - 22006347
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22006134 taggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 22006233  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  22006234 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 22006333  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  22006334 gaaattacatgttt 22006347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5238316 - 5238184
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5238316 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 5238217  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5238216 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 5238184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 275
Target Start/End: Original strand, 16872964 - 16873140
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  16872964 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 16873063  T
Q  199 catgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    | |||||||||| | ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  16873064 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 16873140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Original strand, 24661282 - 24661414
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24661282 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 24661381  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24661382 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 24661414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 43685775 - 43685643
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  43685775 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 43685676  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43685675 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 43685643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 13662141 - 13662354
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13662141 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13662240  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||  ||| |  | ||||| |||| | |    
T  13662241 gtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggt 13662340  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  13662341 gaaattacatgttt 13662354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 212 - 441
Target Start/End: Original strand, 16193750 - 16193980
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||     
T  16193750 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 16193849  T
Q  312 aaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||| |||| ||  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  16193850 caattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 16193949  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 441  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16193950 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16195611 - 16195398
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||  || |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16195611 taggagttgaattgaagcaagagtttgggttaatcatcttctaaggtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 16195512  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| || | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  16195511 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 16195412  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  16195411 gaaattacatgttt 16195398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 222 - 440
Target Start/End: Original strand, 43373512 - 43373731
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatga 321  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||  ||  | |||    
T  43373512 tttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 43373611  T
Q  322 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgc 420  Q
    | ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  43373612 attttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgc 43373711  T
Q  421 atattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  43373712 atattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 16405009 - 16405235
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | |||  || || ||||||||||||     
T  16405009 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgct 16405108  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | |||||   | ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  16405109 caattggtgaattttgctaagttgt---taaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgc 16405205  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16405206 ttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17345798 - 17345581
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| || |||  || |||||||||||||||     
T  17345798 tgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgct 17345699  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  |||| ||||  | | ||| | || |||||||| |||||||||||| || ||||| || ||| || |||| |||||| | |||||||||||| |||    
T  17345698 caattgatggattttgctaagttattgt-gaattgagttatgattcttgttcagttgatattattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgc 17345600  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatg 429  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17345599 ttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 222 - 429
Target Start/End: Original strand, 24928835 - 24929043
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatga 321  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | |||| || || ||||||||||||  ||  | |||    
T  24928835 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 24928934  T
Q  322 attt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgc 420  Q
    |||| |  | ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||| ||| | | || |||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  24928935 atttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgc 24929034  T
Q  421 atattcatg 429  Q
    |||||||||    
T  24929035 atattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 440
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222943
Alignment:
Q  253 attgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 350  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| ||||||| |||  | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  351 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 440
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736566
Alignment:
Q  253 attgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 350  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| ||||||| |||  | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  351 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 440
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860461
Alignment:
Q  253 attgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 350  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| ||||||| |||  | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  351 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 23837308 - 23837214
Alignment:
Q  329 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcata 423  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  23837308 atgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 23837214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 31497 - 31928
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  31497 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaatgtaa 31596  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  31597 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtgg 31696  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||  || |||| || ||||||| ||| |||     
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 31796  T
Q  312 aaacggatgaatttgac---atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcatt 408  Q
     ||  | |||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || |  || ||||  ||||||||| |||    
T  31797 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataatt 31896  T
Q  409 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31897 gcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 128203 - 128431
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||  || || ||||||||||||     
T  128203 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaattgtgct 128302  T
Q  312 aaacggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  |  |||||| |  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  ||||||||| ||||     
T  128303 caattggcgaattttgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatgaataattga 128401  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  128402 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10644648 - 10644219
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644648 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgatctaggagctgaagtgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggta 10644549  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |    
T  10644548 agggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 10644451  T
Q  211 ctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgc 310  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||  || ||||||  |||||||    
T  10644450 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 10644351  T
Q  311 aaaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcatt 408  Q
     |||  | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||    
T  10644350 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 10644251  T
Q  409 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10644250 gcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26680429 - 26680201
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  26680429 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 26680330  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgct 411  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26680329 aaatagatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgct 26680230  T
Q  412 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680229 tgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 63 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 47358030 - 47357654
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttg 162  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  47358030 taggagctgaattgaagcaagagttg-ggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttcctcatgttg 47357934  T
Q  163 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  47357933 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtg 47357834  T
Q  263 aaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgt 360  Q
    |||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | ||||||||||    
T  47357833 aaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgt 47357734  T
Q  361 gcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
     ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47357733 tcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 275
Target Start/End: Original strand, 15287096 - 15287334
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15287096 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15287195  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15287196 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15287295  T
Q  237 tgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     |||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  15287296 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 15287334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18169403 - 18169137
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||| || |||||  |||||| ||    
T  18169403 agagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaa-gg 18169305  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  18169304 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 18169205  T
Q  208 gttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    | | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  18169204 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 18169137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 275
Target Start/End: Original strand, 15294205 - 15294443
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294205 agctttaggaatgaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15294304  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15294305 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15294404  T
Q  237 tgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     |||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  15294405 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 15294443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Original strand, 22351915 - 22352088
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22351915 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 22352014  T
Q  137 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
     |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22352015 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttgtt 22352088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 7131941 - 7132154
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  |  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  7131941 taggagctgaattgaagcaagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 7132040  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  7132041 atatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 7132140  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  7132141 gaaattacatgttt 7132154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 15675123 - 15675352
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  || || ||||||||||||     
T  15675123 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 15675222  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  15675223 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgc 15675322  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15675323 ttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20001103 - 20000890
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  20001103 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 20001004  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | | |    
T  20001003 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggt 20000904  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  20000903 gaaattacatgttt 20000890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10488791 - 10488659
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  10488791 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 10488692  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10488691 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 10488659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Original strand, 16327960 - 16328092
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16327960 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 16328059  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16328060 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16328092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31115858 - 31115629
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| || |||  || || |||||||| |||     
T  31115858 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattatgct 31115759  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  31115758 caattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgc 31115659  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31115658 ttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19020824 - 19020653
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19020824 aaggtaagggggttagttaccatcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 19020725  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  19020724 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 19020653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 275
Target Start/End: Original strand, 17145570 - 17145746
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  17145570 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaatt 17145669  T
Q  199 catgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    | |||||||  | ||||| ||| ||  | | |||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  17145670 cgtgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 17145746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18248556 - 18248385
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttg-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  18248556 aaggtaagggggttagttattatcataatcttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgc 18248457  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||| | |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  18248456 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgttt 18248385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 440
Target Start/End: Original strand, 54118256 - 54118507
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 289  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   |  |    
T  54118256 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaatt 54118355  T
Q  290 gaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 388  Q
    || || || ||||||||||||  ||  | |||||||  | | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  54118356 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattgat 54118455  T
Q  389 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54118456 gttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13246659 - 13246430
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | |||| || || ||||||||||||     
T  13246659 tgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 13246560  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  13246559 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 13246460  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13246459 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26339399 - 26339251
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  26339399 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 26339300  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  26339299 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 26339251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8378480 - 8378385
Alignment:
Q  114 gggttagttattatcataatcatgtgtaattttg-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  8378480 gggttagttattatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 8378385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 376
Target Start/End: Original strand, 10104284 - 10104449
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  || || ||||||||||||     
T  10104284 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 10104383  T
Q  312 aaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 376  Q
     ||  | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10104384 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 10104449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111395
Alignment:
Q  342 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22738568 - 22738436
Alignment:
Q  143 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| || ||||| | ||||| ||| ||  | ||||||||||||||     
T  22738568 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 22738469  T
Q  243 tagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  22738468 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 22738436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 122118 - 122020
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||    
T  122118 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 122020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14952183 - 14952085
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14952183 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 432
Target Start/End: Original strand, 13048265 - 13048477
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatga 321  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || || ||||||| |||||||  ||  |||||    
T  13048265 tttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatga 13048364  T
Q  322 atttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatg 419  Q
    ||||  |  | ||||| |||   ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || |||||  |||  || |||||| ||||||||||| ||    
T  13048365 atttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgggtttg 13048464  T
Q  420 catattcatggat 432  Q
    |||||||||||||    
T  13048465 catattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9795564 - 9795490
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9795564 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaattttttcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 9795490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 440
Target Start/End: Original strand, 10104449 - 10104494
Alignment:
Q  395 gttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10104449 gttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14996518 - 14996444
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996518 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttttaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 14996444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 423
Target Start/End: Original strand, 41166083 - 41166177
Alignment:
Q  329 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcata 423  Q
    ||||||| ||||||||| |  | || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  41166083 atgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcata 41166177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 416
Target Start/End: Original strand, 7185981 - 7186068
Alignment:
Q  329 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggt 416  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| |||  |||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  7185981 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattattgttgatgattcatggcttgggt 7186068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 15044938 - 15044851
Alignment:
Q  329 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggt 416  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||||| |||| ||||||||    
T  15044938 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggt 15044851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8378524 - 8378491
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgt 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8378524 aaggtaaggggattagttattatcataatcatgt 8378491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 422
Target Start/End: Original strand, 13809647 - 13809740
Alignment:
Q  329 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat 422  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||| | | |||| | |||| |||||| |||||||    
T  13809647 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgataattcatggcttggatatgcat 13809740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 441
Target Start/End: Original strand, 52265645 - 52265758
Alignment:
Q  329 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attca 427  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||   |||||||| |||| |||||||| | ||| |||||    
T  52265645 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggcttgggtgttcataattca 52265744  T
Q  428 tggattgatgatgt 441  Q
    ||  ||||||||||    
T  52265745 tgatttgatgatgt 52265758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 222 - 274
Target Start/End: Original strand, 40885598 - 40885650
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  40885598 tttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgtt 40885650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 183; Significance: 8e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 43427 - 42997
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43427 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgatctaggagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 43328  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgt 209  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||     
T  43327 agggggttagttactatcacaaacatgt--aattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 43230  T
Q  210 tctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtg 309  Q
    |  |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||  || ||||||| ||||||    
T  43229 tgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtg 43130  T
Q  310 caaaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcat 407  Q
    | |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||    
T  43129 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 43030  T
Q  408 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43029 tgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39536 - 39270
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  39536 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 39437  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  39436 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 39337  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  39336 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 39270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Original strand, 13171 - 13445
Alignment:
Q  34 gggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataat 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13171 gggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggaactgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataat 13270  T
Q  134 catgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatg 233  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||| ||||||||||||    
T  13271 catgt--aatttttcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatg 13368  T
Q  234 aattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgc 310  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||| ||||    
T  13369 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 38 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 55316622 - 55316219
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  55316622 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaaaggggttagttattatcacaatcatg 55316523  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  55316522 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 55316424  T
Q  238 gatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac--atgttgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| |||||||  ||  | |||||||  |  | |||||    
T  55316423 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 55316324  T
Q  336 agttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattga 435  Q
     ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | |||  |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55316323 tgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattga 55316224  T
Q  436 tgatg 440  Q
    |||||    
T  55316223 tgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 38 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41270478 - 41270075
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41270478 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 41270379  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41270378 ta-atttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 41270280  T
Q  238 gatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac--atgttgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| |||||||  ||  | |||||||  |  | |||||    
T  41270279 gatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 41270180  T
Q  336 agttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattga 435  Q
     ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | |||  |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41270179 tgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattga 41270080  T
Q  436 tgatg 440  Q
    |||||    
T  41270079 tgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 16744149 - 16744377
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  16744149 tgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 16744248  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgct 411  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16744249 aaatggatgaatttgacatgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgct 16744348  T
Q  412 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16744349 tgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 17912516 - 17912744
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  17912516 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 17912615  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgct 411  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||| || |||| |||||| | |||||||||||| ||||    
T  17912616 aaattgatgaatttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgct 17912715  T
Q  412 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17912716 tgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 105 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15615168 - 15614838
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgct 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  15615168 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgct 15615071  T
Q  205 cttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaa 304  Q
    |||  | || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || |||| |    
T  15615070 cttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaata 15614971  T
Q  305 ttgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaa 403  Q
    | ||||  ||  | |||| ||||  | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||| |||||||||||    
T  15614970 tggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaa 15614871  T
Q  404 tcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15614870 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16821517 - 16821139
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  16821517 ctaggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgtt 16821420  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |    
T  16821419 gtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggt 16821320  T
Q  262 gaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttg 359  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||  ||  |||||  ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||    
T  16821319 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatg 16821220  T
Q  360 tgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | ||||||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16821219 ttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 49232869 - 49232603
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  49232869 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctatgagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 49232770  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  49232769 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 49232670  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  49232669 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 49232603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 440
Target Start/End: Original strand, 15936553 - 15936890
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||    
T  15936553 aaggtatgggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 15936652  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaa 303  Q
    ||    | | ||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||| || || |||||    
T  15936653 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 15936752  T
Q  304 attgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 402  Q
    |||||||  ||  | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  15936753 attgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 15936852  T
Q  403 atcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15936853 ataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 12264614 - 12264881
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt--gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| | | ||  |  |||||| |||||||||    
T  12264614 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttggggtgacctaggagctgaattgaagcaaaggttgggattaatcatcttcaaagg 12264713  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  12264714 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 12264813  T
Q  208 gttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    | | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  12264814 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 12264881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 1467562 - 1467828
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  1467562 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 1467661  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  1467662 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 1467761  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  1467762 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 1467828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 105 - 437
Target Start/End: Original strand, 15938395 - 15938729
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | |||    
T  15938395 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgc 15938494  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaa 303  Q
    ||    | | ||| ||| ||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||| || || |||||    
T  15938495 tccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 15938594  T
Q  304 attgtgcaaaacggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 402  Q
    |||||||  ||  | ||||||| || | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  15938595 attgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 15938694  T
Q  403 atcattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 437  Q
    || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15938695 ataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12812274 - 12812075
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  12812274 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaactttaaaggt 12812175  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||    
T  12812174 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 12812075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22275642 - 22275376
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||||||    
T  22275642 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaaaagttaaggttaatcatcttcaaagg 22275544  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  22275543 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 22275444  T
Q  208 gttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    | | |||||  || ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  22275443 gctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 22275376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 440
Target Start/End: Original strand, 15468216 - 15468596
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| || |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  15468216 taggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgtt 15468315  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  15468316 gtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 15468415  T
Q  262 gaaattacatgttt--aaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatg-aatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattctt 358  Q
    ||||||||||||||  || |||||  | |||  || | ||| ||||| | |  ||  |||| ||||||| ||||| |  ||||| |||| | | |||| |    
T  15468416 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatg-aaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcat 15468514  T
Q  359 gtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
     | | ||||||||||||  || |||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15468515 attccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18911373 - 18911160
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  18911373 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 18911274  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  18911273 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 18911174  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  18911173 gaaattacatgttt 18911160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25059119 - 25058906
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  25059119 taggagctgaattgaagcaaaaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgtt 25059020  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  25059019 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 25058920  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  25058919 gaaattacatgttt 25058906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 15859058 - 15859287
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   | |||| || || ||||||||||||     
T  15859058 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 15859157  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  15859158 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 15859257  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15859258 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 212 - 441
Target Start/End: Original strand, 51158052 - 51158282
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||     
T  51158052 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 51158151  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  51158152 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 51158251  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 441  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51158252 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 440
Target Start/End: Original strand, 14842446 - 14842824
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctca--tgt 160  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | | | ||||||  ||||||  |||    
T  14842446 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatct-tcactttgcaaattctcaaatgt 14842544  T
Q  161 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgt 260  Q
    ||||||||  || | | ||| | ||||  |||||||||| |||||    | ||||| ||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||     
T  14842545 tgtatgaat-tgtgattatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttgg 14842643  T
Q  261 tgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttg 359  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| || |||| || |||||||||||||||  ||  | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| | |||||||||    
T  14842644 tgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttg 14842743  T
Q  360 tgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842744 ttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Original strand, 2449272 - 2449404
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2449272 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 2449371  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2449372 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 2449404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 12902008 - 12902179
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||    
T  12902008 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgc 12902107  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||||| | ||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  12902108 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 12902179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Original strand, 18896920 - 18897099
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||    
T  18896920 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttccaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgtt 18897019  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  18897020 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 18897099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 222 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2050029 - 2049810
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatga 321  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||  ||  | |||    
T  2050029 tttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtga 2049930  T
Q  322 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgc 420  Q
    ||||  | | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||| | | | || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2049929 attttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 2049830  T
Q  421 atattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  2049829 atattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 13839123 - 13838905
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |   | |||| || || ||||||||||||     
T  13839123 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 13839024  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||||||||||||     
T  13839023 caattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgt 13838924  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatg 429  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13838923 ttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5228692 - 5228480
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||     
T  5228692 taggagctgaattgaaacaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtg 5228593  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
     ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| | ||||||||| |   | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  5228592 ttatgaaaatgggttgatgaac-attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 5228494  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  5228493 gaaattacatgttt 5228480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 12030181 - 12030410
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||| || || ||||| ||||||     
T  12030181 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaagttgtgct 12030280  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||| | ||| | ||||  | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12030281 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatgaatcattgc 12030380  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12030381 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 54651795 - 54651625
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||    
T  54651795 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 54651696  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  54651695 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgtt 54651625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44229323 - 44229152
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  ||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||    
T  44229323 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaattttttcatttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgc 44229224  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  44229223 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgttt 44229152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 331 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 47984759 - 47984650
Alignment:
Q  331 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgg 430  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  47984759 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47984660  T
Q  431 attgatgatg 440  Q
    ||||||||||    
T  47984659 attgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 331 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48003333 - 48003224
Alignment:
Q  331 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgg 430  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  48003333 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48003234  T
Q  431 attgatgatg 440  Q
    ||||||||||    
T  48003233 attgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 331 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 47994046 - 47993937
Alignment:
Q  331 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgg 430  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  47994046 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47993947  T
Q  431 attgatgatg 440  Q
    ||||||||||    
T  47993946 attgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 331 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48012619 - 48012510
Alignment:
Q  331 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgg 430  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  48012619 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48012520  T
Q  431 attgatgatg 440  Q
    ||||||||||    
T  48012519 attgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 310
Target Start/End: Original strand, 13975766 - 13975853
Alignment:
Q  223 ttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgc 310  Q
    |||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||| || ||||||| |||||||    
T  13975766 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45861024 - 45860937
Alignment:
Q  223 ttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgc 310  Q
    |||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||| || ||||||| |||||||    
T  45861024 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 45860937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 440
Target Start/End: Original strand, 13954934 - 13955153
Alignment:
Q  223 ttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaa 322  Q
    |||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||  | ||||||| |||||||  ||  ||||||    
T  13954934 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaa 13955033  T
Q  323 tttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgc 420  Q
    |||  |  | |||||  || | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | |||  |||  || |||||| ||||||||||| |||    
T  13955034 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgc 13955133  T
Q  421 atattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  13955134 atattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22275285 - 22275209
Alignment:
Q  364 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||  || |||  |||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275285 attgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatg 22275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 8268609 - 8268683
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268609 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8268683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 8275709 - 8275783
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8275709 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8275783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 275
Target Start/End: Original strand, 11986200 - 11986263
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||| || || ||||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11986200 tgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttt 11986263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 422
Target Start/End: Original strand, 11329098 - 11329191
Alignment:
Q  329 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat 422  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||| | |||| ||||||||||||||    
T  11329098 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcat 11329191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 440
Target Start/End: Original strand, 13975944 - 13975985
Alignment:
Q  399 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13975944 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17139618 - 17139525
Alignment:
Q  329 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat 422  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||| | |||| ||||||||||||||    
T  17139618 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcat 17139525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 45860846 - 45860805
Alignment:
Q  399 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45860846 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 439
Target Start/End: Original strand, 38811168 - 38811256
Alignment:
Q  352 gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attcatggattgatgat 439  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||    
T  38811168 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtgcataattcatgttttgatgat 38811256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 173; Significance: 8e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 37100 - 37328
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37100 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 37199  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgct 411  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37200 aaatggatgaatttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgct 37299  T
Q  412 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37300 tgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 20936 - 21367
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||| ||||||||||    
T  20936 agagaagaacaagagttttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggt 21035  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21036 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgt 21135  T
Q  210 tctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtg 309  Q
    | ||||||||| ||||||| ||| |||||||| || || ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||| |||| |    
T  21136 tgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgag 21235  T
Q  310 caaaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcatt 408  Q
    |  ||  | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| |  ||||||||| ||||||||||| |  ||| || | ||||||||  ||||||||| |||    
T  21236 ctcaattggtgaattttcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaataatt 21335  T
Q  409 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  21336 gcttgagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 13882 - 14312
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||| ||||||||||    
T  13882 agagaagaacaagagttttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggt 13981  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||     
T  13982 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaa-tcgtgctcttgc 14080  T
Q  210 tctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtg 309  Q
    | ||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||| ||||||    
T  14081 tgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtg 14180  T
Q  310 caaaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcatt 408  Q
    |  ||  | |||||||  | | ||||| | | | ||||| |  ||||||||| ||||| ||||| |  ||| |  | ||||||||  ||||||||| |||    
T  14181 ctcaattggtgaattttcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataatt 14280  T
Q  409 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14281 gcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 38 - 440
Target Start/End: Original strand, 5072237 - 5072640
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5072237 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaagattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 5072336  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5072337 ta-atttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaatt 5072435  T
Q  238 gatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac--atgttgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| |||||||  ||  | |||||||  |  | |||||    
T  5072436 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 5072535  T
Q  336 agttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattga 435  Q
     ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | |||  |||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5072536 tgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattga 5072635  T
Q  436 tgatg 440  Q
    |||||    
T  5072636 tgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 66 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22228185 - 22227809
Alignment:
Q  66 gagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgta 164  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22228185 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22228086  T
Q  165 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||    
T  22228085 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22227986  T
Q  265 attacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 363  Q
    |||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||||   ||  | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||    
T  22227985 attacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttca 22227886  T
Q  364 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| |  ||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22227885 attgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 66 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22232882 - 22232506
Alignment:
Q  66 gagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgta 164  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22232882 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22232783  T
Q  165 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||    
T  22232782 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22232683  T
Q  265 attacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 363  Q
    |||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||||   ||  | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||    
T  22232682 attacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttca 22232583  T
Q  364 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| |  ||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22232582 attgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17149001 - 17148734
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  17149001 agagaagaacaagagggttgaagggaaagcttgaggaatcaagtggggtgacataggagctgaattgaagcaagggttggggataatcaacttcaaaggt 17148902  T
Q  110 aaggggg-ttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctctt 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  17148901 aaggggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctctt 17148802  T
Q  208 gttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||| | ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  17148801 gttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 17148734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 2116589 - 2116258
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgct 204  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2116589 aaggtaaaggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgct 2116492  T
Q  205 cttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaa 304  Q
     ||  | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||    
T  2116491 tttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 2116392  T
Q  305 ttgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattga-gctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 402  Q
    | ||||  ||  | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||   | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||| ||||||||||    
T  2116391 tggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 2116292  T
Q  403 atcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2116291 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 18059581 - 18059847
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  18059581 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 18059680  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  18059681 aagggggttagttattatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 18059780  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  18059781 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 18059847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 440
Target Start/End: Original strand, 18601071 - 18601370
Alignment:
Q  143 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgt 242  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18601071 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 18601170  T
Q  243 tagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac--atgttgtagttg 340  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| |||||||  ||  | |||||||  |  | ||||| |||     
T  18601171 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgtta 18601270  T
Q  341 aattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | |||  |||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601271 agttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17005071 - 17004805
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  17005071 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 17004972  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  17004971 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 17004872  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  17004871 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 17004805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 105 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45051757 - 45051554
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgct 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  45051757 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtg--attttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgtt 45051660  T
Q  205 cttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaa 304  Q
    |||  | ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||    
T  45051659 cttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 45051560  T
Q  305 ttgtgc 310  Q
    ||||||    
T  45051559 ttgtgc 45051554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 38054914 - 38055180
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  38054914 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 38055013  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| |||| ||     
T  38055014 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctttta 38055113  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||||||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  38055114 ctgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 38055180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Original strand, 19962322 - 19962521
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19962322 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggattcaatttgggcgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 19962421  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||    
T  19962422 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 19962521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 46523731 - 46523556
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattc 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  46523731 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattc 46523632  T
Q  200 atgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     |||||||||| ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||  |  |||| |||| | |||||||||||||||    
T  46523631 gtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgttt 46523556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 51452721 - 51452589
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  51452721 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 51452622  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51452621 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 51452589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20445930 - 20445679
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 289  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |   | ||    
T  20445930 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaat 20445831  T
Q  290 gaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 388  Q
    || || |  ||||||||||||  ||  | |||||||  | | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  20445830 gataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgat 20445731  T
Q  389 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20445730 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20931574 - 20931345
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| || |||| || |||||||||||||||     
T  20931574 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgct 20931475  T
Q  312 aaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
    |||  | |||| ||||  |  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||||||| ||| |    
T  20931474 aaattggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataatttc 20931375  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931374 ttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22035827 - 22035679
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||    
T  22035827 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgtt 22035728  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  22035727 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 22035679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 222 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20531663 - 20531444
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatga 321  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |   | |||| || |  ||||||||||||  ||  | |||    
T  20531663 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtga 20531564  T
Q  322 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgc 420  Q
    ||||  | | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531563 attttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgc 20531464  T
Q  421 atattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  20531463 atattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 20893660 - 20893889
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   | |||| || || ||||||||||||     
T  20893660 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 20893759  T
Q  312 aaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||| ||||  | ||||| |||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||| | |||||||||||||||     
T  20893760 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgt 20893859  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20893860 ttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 440
Target Start/End: Original strand, 37844462 - 37844714
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 289  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |   | ||    
T  37844462 tgctaaattcatgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaat 37844561  T
Q  290 gaaaaatta-tgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 387  Q
    || ||| || ||||||||||||  ||   ||||||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||    
T  37844562 gataaaatagtgaaaattgtgctcaattaatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 37844661  T
Q  388 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37844662 tgttgtggttgatgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41394451 - 41394222
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||     
T  41394451 tgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 41394352  T
Q  312 aaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||| ||||  | ||| | |||   ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||| | |||||||||||| ||     
T  41394351 caattggtgaattttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactga 41394252  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394251 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Original strand, 7640810 - 7640958
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  7640810 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 7640909  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  7640910 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 7640958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20913259 - 20913037
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| || |||| || |||||||||||||||     
T  20913259 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgct 20913160  T
Q  312 aaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||| ||||  | ||||| ||| ||||      |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  20913159 caattggtgaattttgcaaagttgttgtt-aatt------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatgaataattgc 20913067  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913066 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 15861284 - 15861358
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15861284 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 386 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 45051496 - 45051446
Alignment:
Q  386 gatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 436  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45051496 gatgttattgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 45051446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 38 - 310
Target Start/End: Original strand, 1153 - 1424
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1153 agctttaggaatcaagttggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaggggggttagttattatcacaatcatg 1252  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1253 ta-atttttgcatttactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 1351  T
Q  238 gatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgc 310  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  || |||| || ||||||| |||||||    
T  1352 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 63 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4102 - 3722
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  4102 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttctaaggtaaggggtttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 4003  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  4002 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 3903  T
Q  262 gaaattacatgtttaaatatgt-gaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || |||| || ||||| ||||||||   ||  | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||    
T  3902 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttg 3803  T
Q  360 tgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3802 ttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatattcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 63 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 3341 - 2966
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttg 162  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3341 taggagctgaattgaagcaagagtttcggttaatcttcttctaaggtaagggggttaattattatcataattatgtacaattttgcattttctcatgttg 3242  T
Q  163 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  3241 tatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtg 3142  T
Q  263 aaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-t 360  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||  || || ||||||||||||  ||  | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |    
T  3141 aaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgtt 3042  T
Q  361 gcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 436  Q
      |||||||||| ||| || || | |||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3041 ttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 105 - 436
Target Start/End: Original strand, 9266 - 9596
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  9266 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 9363  T
Q  205 cttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaa 304  Q
     ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||    
T  9364 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 9463  T
Q  305 ttgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaa 403  Q
    | ||||  ||  | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||| |||||||||||    
T  9464 tggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaa 9563  T
Q  404 tcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9564 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 105 - 436
Target Start/End: Original strand, 16164 - 16494
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  16164 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 16261  T
Q  205 cttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaa 304  Q
     ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||    
T  16262 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16361  T
Q  305 ttgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaa 403  Q
    | ||||  ||  | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||| |||||||||||    
T  16362 tggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaa 16461  T
Q  404 tcattgcttgggtatgcatattcatggattgat 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16462 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 63 - 440
Target Start/End: Original strand, 5088 - 5466
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||    
T  5088 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggagttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgtt 5187  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  5188 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 5287  T
Q  262 gaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgt 360  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||||   ||  | |||| ||||    ||||| ||| | ||||| | ||||||||||    
T  5288 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgt 5387  T
Q  361 gcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
     ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5388 tcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatattcatggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 440
Target Start/End: Original strand, 64372 - 64780
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  64372 agcttaaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 64471  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatga--- 234  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||       
T  64472 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaatt 64570  T
Q  235 --attgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac--at 330  Q
      ||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||| |||||||  ||  | |||||||  |  |     
T  64571 atattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaa 64670  T
Q  331 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgg 430  Q
    ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  64671 gttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgg 64770  T
Q  431 attgatgatg 440  Q
    |||| |||||    
T  64771 attgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 108084 - 107747
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||    
T  108084 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 107985  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaa 303  Q
    ||    | | ||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  || |||| || || | |||    
T  107984 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaa 107885  T
Q  304 attgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 402  Q
    |||||||  ||  | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  107884 attgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 107785  T
Q  403 atcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107784 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29558 - 29396
Alignment:
Q  47 aatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  29558 aatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctt 29459  T
Q  146 tgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  29458 tgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 29396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 29627 - 29565
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaa 73  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29627 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaa 29565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31742 - 31476
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  31742 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 31643  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  31642 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 31543  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | | |||||||||||||||    
T  31542 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 31476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39813
Alignment:
Q  153 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatg 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||  ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  253 attgttgttgaaattacatgttt 275  Q
     |||| | |||||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgttt 39813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 411 - 35
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttg 162  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  |  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||||     
T  411 taggagctgaattgaagcgagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcaaaatcatgt--aattttgcattg-ctcatgtta 315  T
Q  163 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||    
T  314 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtg 215  T
Q  263 aaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| | |||||||  ||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| |||||    
T  214 aaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgt 115  T
Q  361 gcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
     ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  114 tcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 7278 - 7545
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||| || |||||  |||||||||    
T  7278 agagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaagg 7377  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||    
T  7378 taagggggttagttattatcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctctt 7477  T
Q  208 gttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||| ||||| ||| ||  | |||||||||||| | |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  7478 gttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatgaaattacatgttt 7545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 216
Target Start/End: Original strand, 10624 - 10778
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10624 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 10723  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||    
T  10724 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19435 - 19206
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||     
T  19435 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 19336  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  19335 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgc 19236  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19235 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21519 - 21290
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||     
T  21519 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 21420  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  21419 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgc 21320  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21319 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 1390 - 1603
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  || ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1390 taggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 1489  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| || | | |    
T  1490 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggt 1589  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  1590 gaaattacatgttt 1603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 1451 - 1664
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1451 taggagctgaattgaagcaagggtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 1550  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |    
T  1551 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1650  T
Q  262 gaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||||||||    
T  1651 gaaattacatgttt 1664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7002 - 6829
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7002 agctttacgaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 6903  T
Q  137 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
     |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  6902 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 6829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2826 - 2559
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||    
T  2826 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagg 2728  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaa--ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  2727 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctct 2628  T
Q  207 tgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||   ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  2627 tgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 2559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12449 - 12115
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcat-tttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |  ||||  ||| ||||||||| |  | | ||| | ||||  |||||||||| |||    
T  12449 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatct-taattttgtaactttcaaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtgc 12351  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaa 303  Q
    |||   | ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || |||| || || |||||    
T  12350 tctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 12251  T
Q  304 attgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 402  Q
    ||||||| |||  | |||| ||||  | ||||| ||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||  || ||||    
T  12250 attgtgctaaattggtgaattttgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatga 12153  T
Q  403 atcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12152 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 36947 - 37176
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||     
T  36947 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 37046  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
    |||  | |||||||  | | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | | || |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  37047 aaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 37146  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37147 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22769 - 22637
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22769 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 22670  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22669 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 22637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27024 - 26892
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27024 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 26925  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26924 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Original strand, 1616 - 1748
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1616 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 1715  T
Q  312 aaacggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1716 aaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 990 - 1218
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || | || || ||||||||||||     
T  990 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgct 1089  T
Q  312 aaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  |||||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||| | |||| ||||  |||||||  ||||||||| |||||    
T  1090 caattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgc 1188  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 9078 - 8849
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  || || ||||||||||||     
T  9078 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 8979  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| |  |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  8978 caattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgttgatgaatcattgc 8879  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8878 ttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 148950 - 148721
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||     
T  148950 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 148851  T
Q  312 aaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  148850 caattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgc 148751  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  148750 ttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 222 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48406 - 48187
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatga 321  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||| || || ||||||||||||  ||  | |||    
T  48406 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 48307  T
Q  322 attt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgc 420  Q
    |||| |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  48306 attttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgc 48207  T
Q  421 atattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48206 atattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 9129 - 8878
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 289  Q
    |||||||||| |||||   || ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  9129 tgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 9030  T
Q  290 gaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 388  Q
    |  || || ||||||||||||  ||  | ||||||| |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||    
T  9029 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgat 8930  T
Q  389 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8929 gttgtgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 438
Target Start/End: Original strand, 3616 - 3843
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||     
T  3616 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 3715  T
Q  312 aaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | | || ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||| |||| |||||    
T  3716 caattggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgaggaataattgc 3815  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatga 438  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3816 ttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1353 - 1124
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||     
T  1353 tgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 1254  T
Q  312 aaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  1253 caattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatgaataattgc 1154  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1153 ttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13855 - 13506
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttg----------atgaacaattcatg 191  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| || || ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||          ||| | ||||  ||    
T  13855 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgtttatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttg 13756  T
Q  192 ctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatga 291  Q
    |||||||| ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||     
T  13755 ctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgt 13656  T
Q  292 aaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgt 390  Q
     || || ||||||||||||  ||  |||||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||| |||||    
T  13655 gaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgt 13556  T
Q  391 tatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13555 tgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 42709 - 42677
Alignment:
Q  104 aaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42709 aaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 6098 - 6326
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || | || || | ||||||||||     
T  6098 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaaattgtgct 6197  T
Q  312 aaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||   ||||||  ||||||||| |||||    
T  6198 gaattggtgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatgaataattgc 6296  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6297 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 23600 - 23769
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23600 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggaactgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagttaagggggttagttattatcatattcaat 23699  T
Q  137 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctct 206  Q
     |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  23700 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctct 23769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41877 - 41648
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  || || |||||||||||      
T  41877 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgtt 41778  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  41777 caattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgc 41678  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41677 ttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 440
Target Start/End: Original strand, 34374 - 34724
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattcatg 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | ||||  ||    
T  34374 aaggtaagagggttagttattatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaatgaatggataattattg 34473  T
Q  192 ctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatga 291  Q
    |||||||| ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| || ||      
T  34474 ctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaatat 34573  T
Q  292 aaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatagatg 389  Q
     || || |||||||||| |  ||  | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | ||||    
T  34574 gaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatg 34673  T
Q  390 ttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    || | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34674 ttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 131006 - 130880
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  131006 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggcataatcatcttcaaaggt 130907  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||    
T  130906 aagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 280
Target Start/End: Original strand, 89488 - 89556
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaata 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  89488 tgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaata 89556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 79616 - 79537
Alignment:
Q  362 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||    
T  79616 caattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatg 79537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 172134 - 171916
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |   | |||| || || ||||||||||||     
T  172134 tgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 172035  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
    |||  | |||||||  | | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  172034 aaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 171935  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatg 429  Q
    || ||||||||||||||||    
T  171934 ttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 177837 - 177619
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |   | |||| || || ||||||||||||     
T  177837 tgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 177738  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
    |||  | |||||||  | | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  177737 aaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 177638  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatg 429  Q
    || ||||||||||||||||    
T  177637 ttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 45369 - 45197
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatg 202  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||    
T  45369 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 45270  T
Q  203 ctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    | |||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45269 cccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgttt 45197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 54755 - 54416
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatg 202  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||    
T  54755 aaggtaaggtggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 54656  T
Q  203 ctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt--aaatatgtgaagatgaaaaattatg 300  Q
      |||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||| |||||||  || |||||  | |||  || |||||    
T  54655 tccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg 54556  T
Q  301 aaaattgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttga 399  Q
     ||||||| |  ||  | |||| ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||| | || |     
T  54555 -aaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtggg 54457  T
Q  400 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  54456 tgaatcatgagttgggtatacatatttatggattgatgatg 54416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 222 - 440
Target Start/End: Original strand, 5105 - 5324
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatga 321  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||| || || ||||||||||||  ||  | |||    
T  5105 tttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 5204  T
Q  322 atttgacat-gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgc 420  Q
    ||||  ||  ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  5205 attttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgc 5304  T
Q  421 atattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  5305 atattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 190 - 440
Target Start/End: Original strand, 123176 - 123427
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 289  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | ||    
T  123176 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 123275  T
Q  290 gaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 388  Q
    || || || ||||||||||||  ||  | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||    
T  123276 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgat 123375  T
Q  389 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  123376 gttgtggttgatgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 222 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 272244 - 272031
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatga 321  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| |   | |||| || || |||||||||||| |||  | |||    
T  272244 tttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtga 272145  T
Q  322 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgc 420  Q
    ||||  | | ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| | | || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  272144 attttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 272045  T
Q  421 atattcatggattg 434  Q
    ||||||||| ||||    
T  272044 atattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 10257 - 10428
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||    
T  10257 aaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 10356  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  10357 tcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 10428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 41958 - 41733
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||| || |||| || || ||||||||||||     
T  41958 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaaattgtgct 41859  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||| | | | || |||| | |||| ||| |||||||||||||     
T  41858 caattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatgaatcattgg 41759  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgat 436  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41758 ttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9382
Alignment:
Q  342 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 54212 - 54042
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  54212 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgc 54113  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtt 274  Q
    ||||  | ||||| | | ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  54112 tcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 54042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 26449 - 26678
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||| || |||| || || |||||||||| |     
T  26449 tgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgttct 26548  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| |  |||||||||||||||    
T  26549 caattggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgc 26648  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26649 ttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 440
Target Start/End: Original strand, 8192 - 8440
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagat 289  Q
    |||||||||| ||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| || ||    
T  8192 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaat 8291  T
Q  290 gaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 388  Q
    |  || || ||||||||||||  ||  | |||| ||||  |||||   ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  8292 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt---gttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgat 8388  T
Q  389 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8389 gttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatatacatgaattgatgatg 8440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3712 - 3581
Alignment:
Q  143 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgt 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  | ||||||| | ||  | | ||||||||||||     
T  3712 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatga 3613  T
Q  243 tagttgtatgattgttgttgaaattacatgtt 274  Q
    |  | |||||||||| | ||||||||||||||    
T  3612 ttatggtatgattgtgggtgaaattacatgtt 3581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5758 - 5660
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgc 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| || | ||||| |||||||    
T  5758 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagtcatgaatattgtgc 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7547 - 7441
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  7547 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 7448  T
Q  204 tcttgtt 210  Q
    |||||||    
T  7447 tcttgtt 7441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 568 - 797
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgca 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   | ||||  | || |||||||||| |     
T  568 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtact 667  T
Q  312 aaacggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 410  Q
     ||  | |||||||  | | |||   |||  ||| || ||||||||||||  |||||||||| | | ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  668 caattggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgc 767  T
Q  411 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  768 ttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 12045 - 12149
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  12045 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaatttttcattt-ctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtg 12143  T
Q  203 ctcttg 208  Q
    ||||||    
T  12144 ctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 34076 - 34247
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatg 202  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||    
T  34076 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtg 34174  T
Q  203 ctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    |||||| | ||| | ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  34175 ctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 34247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 222 - 429
Target Start/End: Original strand, 247486 - 247694
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgcaaaacggatga 321  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |   | |||| || || ||||||||||||  ||  | | |    
T  247486 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaa 247585  T
Q  322 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgc 420  Q
    ||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  247586 attttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 247685  T
Q  421 atattcatg 429  Q
    |||||||||    
T  247686 atattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Original strand, 154282 - 154373
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  154282 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatca 154373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 51216 - 51314
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgtttaaatatgtgaagatgaaaaattatgaaaattgtgc 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| || || ||||||||||||    
T  51216 tgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 351 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48603 - 48514
Alignment:
Q  351 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||| || |||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48603 tgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Original strand, 13268 - 13342
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13268 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 13342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 440
Target Start/End: Original strand, 104793 - 104871
Alignment:
Q  363 aattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  104793 aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatg 104871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 17115 - 17241
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| | |||| |||||    
T  17115 agagaagcacaggagtgttgaaaggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataataatcttctaaggt 17214  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||    
T  17215 aagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3447 - 3360
Alignment:
Q  184 aattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacat 271  Q
    |||| ||||||||||| |||||| | | ||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  3447 aattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 3252 - 3210
Alignment:
Q  396 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 438  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3252 ttgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 440
Target Start/End: Original strand, 26 - 115
Alignment:
Q  351 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||| ||| |||| || |  ||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26 tgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 275
Target Start/End: Original strand, 56133 - 56196
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttgttgaaattacatgttt 275  Q
    ||||||||| || || ||||||| |||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  56133 tgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttt 56196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2471
Alignment:
Q  362 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcata 423  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  2532 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5760 times since January 2019
Visitors: 4859