View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0755_low_2 (Length: 593)

Name: NF0755_low_2
Description: NF0755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0755_low_2
NF0755_low_2
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (84-573)||(10055-10544)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (84-573)||(681-1170)
[»] chr2 (125 HSPs)
chr2 (84-573)||(20309108-20309597)
chr2 (84-573)||(37745-38235)
chr2 (85-573)||(23285865-23286352)
chr2 (84-570)||(298433-298933)
chr2 (84-573)||(23654028-23654507)
chr2 (85-573)||(22737799-22738300)
chr2 (85-573)||(22730852-22731355)
chr2 (87-573)||(23076442-23076940)
chr2 (84-573)||(23660023-23660525)
chr2 (85-573)||(22337115-22337617)
chr2 (84-423)||(27753728-27754078)
chr2 (99-556)||(32451562-32452033)
chr2 (272-573)||(23060513-23060815)
chr2 (84-191)||(28291920-28292027)
chr2 (456-573)||(23103399-23103516)
chr2 (97-197)||(22133848-22133948)
chr2 (117-262)||(23071614-23071768)
chr2 (98-202)||(25176227-25176331)
chr2 (221-554)||(23708383-23708721)
chr2 (456-557)||(7735-7838)
chr2 (477-573)||(19671830-19671928)
chr2 (424-570)||(22105412-22105560)
chr2 (477-573)||(23071972-23072070)
chr2 (369-569)||(40622123-40622327)
chr2 (500-557)||(23207293-23207350)
chr2 (130-198)||(28406368-28406436)
chr2 (457-569)||(7679589-7679702)
chr2 (497-573)||(8946657-8946732)
chr2 (502-557)||(20520243-20520298)
chr2 (84-151)||(23100849-23100916)
chr2 (424-570)||(26505379-26505526)
chr2 (424-570)||(26507857-26508004)
chr2 (501-568)||(28405981-28406048)
chr2 (500-557)||(22413186-22413243)
chr2 (424-567)||(21155075-21155219)
chr2 (509-573)||(23040247-23040310)
chr2 (501-569)||(25175854-25175922)
chr2 (410-572)||(32214921-32215085)
chr2 (424-570)||(18808943-18809090)
chr2 (501-572)||(22134256-22134326)
chr2 (502-557)||(23004764-23004819)
chr2 (424-570)||(23130862-23131009)
chr2 (424-570)||(23133329-23133476)
chr2 (424-570)||(23135590-23135737)
chr2 (424-570)||(23709547-23709694)
chr2 (424-570)||(23712028-23712175)
chr2 (502-557)||(25108903-25108958)
chr2 (424-570)||(34402537-34402684)
chr2 (424-570)||(39682313-39682460)
chr2 (83-197)||(24503473-24503587)
chr2 (108-262)||(22460844-22460999)
chr2 (108-169)||(24658055-24658116)
chr2 (475-570)||(571397-571493)
chr2 (475-570)||(6725995-6726091)
chr2 (502-558)||(23287378-23287433)
chr2 (107-199)||(25963359-25963451)
chr2 (502-557)||(23791289-23791344)
chr2 (424-554)||(24367790-24367921)
chr2 (503-558)||(26392397-26392451)
chr2 (424-570)||(45029869-45030016)
chr2 (84-170)||(22811553-22811639)
chr2 (475-568)||(43137301-43137395)
chr2 (501-554)||(18786952-18787005)
chr2 (84-169)||(22740579-22740664)
chr2 (84-169)||(22758334-22758419)
chr2 (108-201)||(27263610-27263703)
chr2 (108-262)||(19928156-19928311)
chr2 (99-175)||(23708252-23708328)
chr2 (424-570)||(24898210-24898358)
chr2 (424-570)||(24900693-24900841)
chr2 (424-570)||(24903170-24903318)
chr2 (424-570)||(24905647-24905795)
chr2 (424-570)||(24908122-24908270)
chr2 (85-196)||(12829434-12829545)
chr2 (107-170)||(21917958-21918021)
chr2 (218-261)||(22133977-22134020)
chr2 (211-262)||(22740717-22740768)
chr2 (502-557)||(24697657-24697712)
chr2 (424-570)||(32039513-32039660)
chr2 (107-170)||(37525078-37525141)
chr2 (86-196)||(21138903-21139013)
chr2 (108-170)||(22798769-22798831)
chr2 (520-570)||(28577099-28577149)
chr2 (520-570)||(38967374-38967424)
chr2 (129-175)||(39827602-39827648)
chr2 (129-197)||(23207744-23207812)
chr2 (475-570)||(24529595-24529691)
chr2 (511-567)||(24643054-24643109)
chr2 (112-148)||(24654996-24655032)
chr2 (100-144)||(40428892-40428936)
chr2 (108-148)||(45677798-45677838)
chr2 (227-262)||(12901286-12901321)
chr2 (138-185)||(23171413-23171460)
chr2 (138-185)||(23582670-23582717)
chr2 (227-262)||(24628252-24628287)
chr2 (227-262)||(24649654-24649689)
chr2 (227-262)||(27379206-27379241)
chr2 (227-262)||(27383252-27383287)
chr2 (227-262)||(27602094-27602129)
chr2 (227-262)||(41530783-41530818)
chr2 (84-151)||(44369918-44369985)
chr2 (504-558)||(9241941-9241994)
chr2 (129-199)||(22412722-22412792)
chr2 (129-171)||(23005221-23005263)
chr2 (454-500)||(23019706-23019752)
chr2 (101-151)||(23038468-23038518)
chr2 (108-201)||(26125562-26125655)
chr2 (143-197)||(27197248-27197302)
chr2 (221-259)||(28406297-28406335)
chr2 (129-171)||(34137412-34137454)
chr2 (83-196)||(21146918-21147031)
chr2 (220-261)||(25176158-25176199)
chr2 (83-184)||(30970608-30970709)
chr2 (108-145)||(40621851-40621888)
chr2 (120-168)||(7330-7378)
chr2 (108-144)||(23187491-23187527)
chr2 (108-144)||(23598754-23598790)
chr2 (112-144)||(24175227-24175259)
chr2 (108-148)||(24674012-24674052)
chr2 (112-144)||(24870307-24870339)
chr2 (97-185)||(29233904-29233992)
chr2 (97-185)||(29347203-29347291)
chr2 (226-262)||(31756232-31756268)
chr2 (135-183)||(37318652-37318700)
chr2 (108-144)||(41667365-41667401)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (87-573)||(32067-32553)
[»] chr7 (176 HSPs)
chr7 (84-571)||(40443393-40443880)
chr7 (84-573)||(27847462-27847951)
chr7 (84-573)||(16385876-16386369)
chr7 (84-573)||(9509189-9509692)
chr7 (84-573)||(12698831-12699335)
chr7 (84-573)||(26211995-26212488)
chr7 (85-573)||(38227481-38227982)
chr7 (84-570)||(3563982-3564482)
chr7 (228-573)||(10589039-10589386)
chr7 (84-554)||(15143654-15144139)
chr7 (99-570)||(17061593-17062077)
chr7 (84-262)||(2831924-2832110)
chr7 (84-201)||(9751168-9751285)
chr7 (361-570)||(18456319-18456530)
chr7 (84-262)||(28504919-28505106)
chr7 (84-258)||(39267264-39267447)
chr7 (99-266)||(44116816-44116992)
chr7 (99-263)||(12756350-12756523)
chr7 (84-201)||(15754505-15754622)
chr7 (84-201)||(18302564-18302681)
chr7 (84-198)||(34201172-34201286)
chr7 (97-201)||(44014560-44014664)
chr7 (97-201)||(810760-810864)
chr7 (84-176)||(11995676-11995768)
chr7 (97-202)||(68131-68236)
chr7 (477-573)||(16495402-16495500)
chr7 (97-176)||(18006052-18006131)
chr7 (477-573)||(28505321-28505419)
chr7 (477-573)||(34200786-34200884)
chr7 (424-573)||(13647325-13647476)
chr7 (478-573)||(11996051-11996148)
chr7 (404-570)||(16213684-16213852)
chr7 (98-202)||(47832193-47832297)
chr7 (369-569)||(17137978-17138177)
chr7 (501-573)||(67745-67817)
chr7 (98-202)||(16324391-16324495)
chr7 (456-554)||(2280121-2280221)
chr7 (369-473)||(12187115-12187218)
chr7 (454-573)||(16219717-16219835)
chr7 (84-151)||(19649103-19649170)
chr7 (456-570)||(48273392-48273508)
chr7 (84-202)||(21064780-21064898)
chr7 (424-570)||(24704688-24704832)
chr7 (501-569)||(811180-811248)
chr7 (98-202)||(16219348-16219452)
chr7 (501-569)||(18005650-18005718)
chr7 (501-569)||(44014182-44014250)
chr7 (501-573)||(47831807-47831879)
chr7 (99-170)||(2760542-2760613)
chr7 (99-170)||(3272202-3272273)
chr7 (477-573)||(10063841-10063939)
chr7 (477-573)||(15754910-15755008)
chr7 (424-570)||(24702238-24702385)
chr7 (455-520)||(2530139-2530205)
chr7 (108-202)||(9389337-9389431)
chr7 (424-573)||(18430709-18430859)
chr7 (83-197)||(44407988-44408102)
chr7 (129-202)||(12255454-12255527)
chr7 (497-554)||(12901342-12901399)
chr7 (84-169)||(24054884-24054969)
chr7 (502-554)||(14044765-14044817)
chr7 (502-554)||(14354795-14354847)
chr7 (475-570)||(44116509-44116605)
chr7 (424-570)||(456321-456468)
chr7 (424-570)||(11972496-11972643)
chr7 (424-570)||(14949137-14949284)
chr7 (424-570)||(15376728-15376875)
chr7 (456-554)||(16056347-16056446)
chr7 (424-570)||(16232520-16232667)
chr7 (424-570)||(18640272-18640419)
chr7 (477-573)||(19486767-19486865)
chr7 (502-557)||(20220238-20220293)
chr7 (424-570)||(20385138-20385285)
chr7 (424-570)||(21189610-21189757)
chr7 (127-202)||(22073301-22073376)
chr7 (424-554)||(24275187-24275318)
chr7 (424-570)||(32125491-32125638)
chr7 (424-570)||(41522917-41523064)
chr7 (424-570)||(41525379-41525526)
chr7 (500-554)||(1868043-1868097)
chr7 (120-198)||(2279772-2279850)
chr7 (424-569)||(11393302-11393448)
chr7 (83-197)||(14953560-14953674)
chr7 (83-197)||(26420340-26420454)
chr7 (500-557)||(15008547-15008604)
chr7 (98-151)||(18154469-18154522)
chr7 (500-557)||(48991196-48991253)
chr7 (475-570)||(16410059-16410155)
chr7 (505-573)||(22072913-22072981)
chr7 (502-545)||(14036282-14036325)
chr7 (502-545)||(14346312-14346355)
chr7 (424-570)||(27216860-27217007)
chr7 (83-197)||(14959526-14959640)
chr7 (108-170)||(17137706-17137768)
chr7 (108-169)||(10508725-10508786)
chr7 (108-169)||(11880668-11880729)
chr7 (108-169)||(12187429-12187490)
chr7 (108-262)||(13149451-13149606)
chr7 (475-570)||(13869346-13869442)
chr7 (221-289)||(16056616-16056684)
chr7 (120-171)||(2529631-2529682)
chr7 (511-570)||(3386333-3386391)
chr7 (110-169)||(15211844-15211903)
chr7 (223-262)||(18302494-18302533)
chr7 (221-263)||(810894-810936)
chr7 (501-551)||(12255842-12255892)
chr7 (83-197)||(14148932-14149046)
chr7 (120-202)||(16056713-16056795)
chr7 (492-554)||(18154882-18154943)
chr7 (520-570)||(20110556-20110606)
chr7 (114-196)||(20702651-20702733)
chr7 (114-196)||(32768038-32768120)
chr7 (83-196)||(4318174-4318287)
chr7 (108-262)||(6801509-6801664)
chr7 (84-197)||(11262691-11262804)
chr7 (140-197)||(11547953-11548010)
chr7 (140-197)||(11554549-11554606)
chr7 (478-570)||(13831373-13831466)
chr7 (130-199)||(14045212-14045281)
chr7 (130-199)||(14355242-14355311)
chr7 (107-148)||(14430315-14430356)
chr7 (221-270)||(22073223-22073272)
chr7 (108-262)||(26292692-26292847)
chr7 (107-144)||(42205530-42205567)
chr7 (84-156)||(4993917-4993989)
chr7 (108-144)||(8917842-8917878)
chr7 (108-148)||(9703703-9703743)
chr7 (108-144)||(13462177-13462213)
chr7 (108-144)||(15581108-15581144)
chr7 (108-144)||(15604926-15604962)
chr7 (223-262)||(9389462-9389501)
chr7 (223-262)||(9751316-9751355)
chr7 (138-185)||(11238655-11238702)
chr7 (223-262)||(11995796-11995835)
chr7 (138-197)||(12692858-12692917)
chr7 (227-262)||(12718966-12719001)
chr7 (227-262)||(12723877-12723912)
chr7 (140-199)||(12901793-12901852)
chr7 (320-546)||(15211484-15211703)
chr7 (211-262)||(16438792-16438843)
chr7 (227-262)||(16906974-16907009)
chr7 (211-262)||(17137820-17137871)
chr7 (502-557)||(18203828-18203882)
chr7 (227-262)||(18279701-18279736)
chr7 (227-262)||(18283664-18283699)
chr7 (223-262)||(34201099-34201138)
chr7 (224-262)||(68061-68099)
chr7 (129-195)||(9177252-9177318)
chr7 (129-171)||(11768526-11768568)
chr7 (221-263)||(12255556-12255598)
chr7 (108-170)||(12321385-12321447)
chr7 (108-201)||(16275850-16275943)
chr7 (139-197)||(25038895-25038953)
chr7 (84-202)||(35366609-35366727)
chr7 (127-196)||(70438-70507)
chr7 (127-196)||(74546-74615)
chr7 (130-199)||(1867650-1867719)
chr7 (83-184)||(6016800-6016901)
chr7 (108-201)||(9593704-9593797)
chr7 (108-201)||(9644667-9644760)
chr7 (98-135)||(14194729-14194766)
chr7 (120-185)||(14655082-14655147)
chr7 (129-170)||(15008107-15008148)
chr7 (139-196)||(18531608-18531665)
chr7 (221-262)||(44014489-44014530)
chr7 (108-144)||(11044-11080)
chr7 (108-144)||(18712-18748)
chr7 (108-144)||(11313064-11313100)
chr7 (108-144)||(11987628-11987664)
chr7 (108-144)||(12318543-12318579)
chr7 (108-144)||(13635123-13635159)
chr7 (108-144)||(15728740-15728776)
chr7 (108-144)||(16583650-16583686)
chr7 (108-144)||(16724285-16724321)
chr7 (108-144)||(17701299-17701335)
chr7 (108-144)||(35152021-35152057)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (84-573)||(15094-15584)
scaffold0114 (84-158)||(32894-32968)
scaffold0114 (405-569)||(7295-7459)
scaffold0114 (108-169)||(7705-7766)
[»] chr8 (144 HSPs)
chr8 (84-573)||(31971257-31971747)
chr8 (84-573)||(16199276-16199765)
chr8 (84-573)||(21918628-21919121)
chr8 (84-573)||(45130649-45131117)
chr8 (84-573)||(18878855-18879352)
chr8 (84-573)||(20536208-20536711)
chr8 (84-573)||(18818028-18818530)
chr8 (84-573)||(22626736-22627238)
chr8 (84-573)||(21923546-21924049)
chr8 (84-573)||(23406379-23406884)
chr8 (85-572)||(28648663-28649164)
chr8 (85-576)||(6759255-6759759)
chr8 (85-572)||(23648554-23649055)
chr8 (108-437)||(25362793-25363123)
chr8 (84-573)||(16091959-16092463)
chr8 (84-573)||(22875065-22875568)
chr8 (99-573)||(7372778-7373237)
chr8 (360-573)||(21389358-21389571)
chr8 (360-573)||(21395888-21396101)
chr8 (360-573)||(21790381-21790594)
chr8 (373-573)||(21778697-21778897)
chr8 (84-267)||(41598494-41598687)
chr8 (84-262)||(5865895-5866082)
chr8 (84-201)||(21255605-21255722)
chr8 (84-197)||(21491382-21491495)
chr8 (84-198)||(17141302-17141416)
chr8 (84-202)||(19801045-19801163)
chr8 (84-201)||(21249767-21249884)
chr8 (97-201)||(21674091-21674195)
chr8 (97-201)||(26355329-26355433)
chr8 (477-573)||(5866297-5866395)
chr8 (477-573)||(17140916-17141014)
chr8 (478-573)||(21490995-21491092)
chr8 (98-202)||(38854883-38854987)
chr8 (457-573)||(6520368-6520486)
chr8 (84-169)||(21389071-21389156)
chr8 (501-573)||(38855300-38855372)
chr8 (501-573)||(23760893-23760962)
chr8 (477-566)||(13508108-13508199)
chr8 (456-557)||(20498578-20498681)
chr8 (477-573)||(17612133-17612231)
chr8 (107-202)||(23760481-23760576)
chr8 (502-557)||(24353036-24353091)
chr8 (502-557)||(37116363-37116418)
chr8 (98-176)||(6520779-6520857)
chr8 (500-557)||(19154935-19154992)
chr8 (456-554)||(21285616-21285716)
chr8 (477-573)||(21249384-21249483)
chr8 (477-573)||(21255222-21255321)
chr8 (424-570)||(14409459-14409606)
chr8 (502-557)||(17267044-17267099)
chr8 (410-554)||(16413316-16413462)
chr8 (108-202)||(39834217-39834311)
chr8 (501-554)||(983455-983508)
chr8 (477-566)||(13597640-13597731)
chr8 (99-199)||(16409889-16409989)
chr8 (475-570)||(20046261-20046357)
chr8 (501-569)||(26355747-26355815)
chr8 (424-570)||(1484402-1484549)
chr8 (424-570)||(5853307-5853454)
chr8 (99-170)||(16860971-16861042)
chr8 (502-557)||(17439557-17439612)
chr8 (424-570)||(20403227-20403374)
chr8 (96-195)||(21414857-21414956)
chr8 (424-570)||(22001753-22001900)
chr8 (108-198)||(20499049-20499139)
chr8 (83-197)||(20527812-20527926)
chr8 (99-148)||(20856059-20856108)
chr8 (424-570)||(4483281-4483427)
chr8 (107-170)||(15602659-15602722)
chr8 (107-170)||(15611111-15611174)
chr8 (424-570)||(41598188-41598335)
chr8 (108-170)||(22010322-22010384)
chr8 (108-169)||(19899510-19899571)
chr8 (108-148)||(377714-377754)
chr8 (475-570)||(15203297-15203393)
chr8 (108-148)||(20465682-20465722)
chr8 (113-169)||(21395630-21395686)
chr8 (113-169)||(21790123-21790179)
chr8 (511-570)||(4542477-4542535)
chr8 (511-570)||(19896265-19896323)
chr8 (120-170)||(13507663-13507713)
chr8 (120-170)||(13597195-13597245)
chr8 (107-197)||(16411911-16412001)
chr8 (138-196)||(18865695-18865753)
chr8 (520-570)||(26225359-26225409)
chr8 (114-196)||(29123449-29123531)
chr8 (108-170)||(30642934-30642996)
chr8 (225-262)||(17141229-17141266)
chr8 (108-169)||(17353580-17353641)
chr8 (113-170)||(17926355-17926412)
chr8 (475-557)||(19801448-19801530)
chr8 (108-169)||(19976860-19976921)
chr8 (108-169)||(19983508-19983569)
chr8 (225-262)||(21249697-21249734)
chr8 (505-554)||(21673723-21673772)
chr8 (108-201)||(23834532-23834625)
chr8 (108-262)||(24433891-24434046)
chr8 (456-554)||(26219733-26219831)
chr8 (129-198)||(37116813-37116882)
chr8 (221-262)||(39834147-39834188)
chr8 (475-554)||(15070574-15070654)
chr8 (129-197)||(17266579-17266647)
chr8 (108-144)||(18619894-18619930)
chr8 (520-576)||(19937118-19937174)
chr8 (108-144)||(22028973-22029009)
chr8 (502-558)||(22525573-22525628)
chr8 (100-144)||(39094587-39094631)
chr8 (475-554)||(45290761-45290841)
chr8 (211-262)||(15538745-15538796)
chr8 (108-199)||(21168364-21168455)
chr8 (227-262)||(43252110-43252145)
chr8 (120-198)||(982980-983058)
chr8 (84-170)||(10829072-10829158)
chr8 (137-171)||(17085770-17085804)
chr8 (138-196)||(18855300-18855358)
chr8 (107-169)||(19259244-19259305)
chr8 (504-558)||(20502154-20502207)
chr8 (108-170)||(21161758-21161820)
chr8 (137-199)||(24353488-24353550)
chr8 (108-169)||(16185143-16185204)
chr8 (225-262)||(21255535-21255572)
chr8 (108-262)||(22113382-22113537)
chr8 (108-262)||(22134885-22135040)
chr8 (83-184)||(26934805-26934906)
chr8 (108-144)||(15532304-15532340)
chr8 (108-148)||(15538860-15538900)
chr8 (133-185)||(19111601-19111653)
chr8 (133-185)||(19117892-19117944)
chr8 (221-261)||(21674021-21674061)
chr8 (222-262)||(21972353-21972393)
chr8 (222-262)||(21976438-21976478)
chr8 (108-140)||(22057768-22057800)
chr8 (108-144)||(22166035-22166071)
chr8 (108-144)||(23252416-23252452)
chr8 (83-183)||(23845412-23845512)
chr8 (84-148)||(24756157-24756221)
chr8 (505-557)||(28397566-28397617)
chr8 (108-144)||(30308408-30308444)
chr8 (108-144)||(32599094-32599130)
chr8 (108-144)||(32605626-32605662)
chr8 (222-262)||(37116664-37116704)
chr8 (221-261)||(38855015-38855055)
chr8 (129-197)||(40492438-40492506)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (84-573)||(13497-13987)
[»] chr4 (155 HSPs)
chr4 (84-573)||(14052932-14053422)
chr4 (84-573)||(12902757-12903248)
chr4 (87-573)||(7088877-7089366)
chr4 (84-573)||(44052829-44053332)
chr4 (84-447)||(3096772-3097135)
chr4 (84-571)||(22636437-22636937)
chr4 (84-570)||(16377140-16377639)
chr4 (85-568)||(14038653-14039151)
chr4 (108-437)||(17047726-17048055)
chr4 (336-573)||(17046487-17046724)
chr4 (221-566)||(23374125-23374473)
chr4 (204-573)||(7893703-7894073)
chr4 (84-306)||(7798967-7799200)
chr4 (84-379)||(15091093-15091400)
chr4 (250-573)||(16239764-16240090)
chr4 (85-570)||(44928542-44929042)
chr4 (84-201)||(20156908-20157025)
chr4 (84-262)||(24029057-24029244)
chr4 (84-201)||(16239610-16239728)
chr4 (84-262)||(13812427-13812614)
chr4 (84-201)||(15552199-15552316)
chr4 (84-201)||(22633831-22633948)
chr4 (99-267)||(44102520-44102697)
chr4 (364-573)||(16270145-16270356)
chr4 (99-201)||(6190819-6190921)
chr4 (84-201)||(16597031-16597148)
chr4 (392-573)||(7798774-7798958)
chr4 (99-263)||(21814936-21815109)
chr4 (99-263)||(21815265-21815438)
chr4 (99-263)||(21818358-21818531)
chr4 (97-200)||(12774385-12774488)
chr4 (97-201)||(8846761-8846865)
chr4 (256-556)||(6190479-6190782)
chr4 (404-573)||(6899891-6900062)
chr4 (454-573)||(52873367-52873488)
chr4 (477-573)||(15551817-15551915)
chr4 (404-557)||(13800-13956)
chr4 (98-202)||(39705920-39706024)
chr4 (492-573)||(3096293-3096373)
chr4 (424-571)||(22353835-22353984)
chr4 (401-487)||(15121749-15121834)
chr4 (401-520)||(43256106-43256227)
chr4 (501-569)||(12774011-12774079)
chr4 (501-573)||(39706337-39706409)
chr4 (456-570)||(14280316-14280431)
chr4 (129-554)||(52242856-52243298)
chr4 (98-176)||(13844950-13845028)
chr4 (501-554)||(12288259-12288312)
chr4 (500-557)||(46640504-46640561)
chr4 (98-202)||(43198220-43198324)
chr4 (138-185)||(17046718-17046765)
chr4 (424-570)||(18215289-18215436)
chr4 (502-557)||(53082202-53082257)
chr4 (456-570)||(54798756-54798872)
chr4 (83-197)||(14679325-14679439)
chr4 (108-202)||(15099735-15099829)
chr4 (410-570)||(23803265-23803427)
chr4 (501-569)||(8846360-8846428)
chr4 (85-197)||(14685534-14685646)
chr4 (410-576)||(19242693-19242861)
chr4 (410-572)||(19618172-19618336)
chr4 (424-570)||(12322-12469)
chr4 (424-570)||(15118367-15118514)
chr4 (99-198)||(15464562-15464661)
chr4 (120-199)||(15868289-15868368)
chr4 (110-262)||(19757257-19757410)
chr4 (110-262)||(19782396-19782549)
chr4 (424-570)||(44615288-44615435)
chr4 (424-570)||(52312510-52312657)
chr4 (410-570)||(3515007-3515169)
chr4 (83-262)||(9556827-9557007)
chr4 (83-197)||(23838796-23838910)
chr4 (508-554)||(43198611-43198657)
chr4 (410-570)||(51463868-51464030)
chr4 (83-196)||(7900800-7900913)
chr4 (456-554)||(8574871-8574969)
chr4 (109-202)||(15190702-15190795)
chr4 (404-570)||(1837503-1837671)
chr4 (475-570)||(44773153-44773249)
chr4 (85-136)||(17053482-17053533)
chr4 (424-570)||(18239434-18239581)
chr4 (424-570)||(50222354-50222501)
chr4 (221-263)||(12774313-12774355)
chr4 (108-170)||(16356596-16356658)
chr4 (84-121)||(3332284-3332321)
chr4 (83-196)||(15321723-15321836)
chr4 (108-262)||(16243054-16243209)
chr4 (107-148)||(16348334-16348375)
chr4 (108-169)||(44676047-44676108)
chr4 (83-196)||(51493447-51493560)
chr4 (410-570)||(12610950-12611105)
chr4 (475-554)||(15355391-15355471)
chr4 (83-183)||(16956279-16956379)
chr4 (120-199)||(13427-13506)
chr4 (223-262)||(3332201-3332240)
chr4 (511-570)||(7641286-7641344)
chr4 (475-573)||(15367690-15367789)
chr4 (475-573)||(15370018-15370117)
chr4 (475-573)||(15371202-15371301)
chr4 (475-573)||(15373483-15373582)
chr4 (475-573)||(15402703-15402802)
chr4 (108-259)||(26243319-26243471)
chr4 (114-197)||(40471837-40471920)
chr4 (138-196)||(386038-386096)
chr4 (108-170)||(15094187-15094249)
chr4 (108-170)||(15121446-15121508)
chr4 (224-262)||(22633980-22634018)
chr4 (83-201)||(27534384-27534502)
chr4 (120-170)||(32851868-32851918)
chr4 (114-196)||(40478511-40478593)
chr4 (520-570)||(44102214-44102264)
chr4 (108-262)||(2015075-2015230)
chr4 (221-262)||(15099665-15099706)
chr4 (225-262)||(15552129-15552166)
chr4 (520-573)||(16223532-16223585)
chr4 (108-262)||(18222032-18222187)
chr4 (108-169)||(23843894-23843955)
chr4 (108-144)||(3413212-3413248)
chr4 (108-148)||(13569948-13569988)
chr4 (221-330)||(15464694-15464805)
chr4 (502-558)||(17333292-17333347)
chr4 (108-144)||(18602399-18602435)
chr4 (108-144)||(18608993-18609029)
chr4 (108-262)||(1951415-1951570)
chr4 (227-262)||(4561107-4561142)
chr4 (227-262)||(5756711-5756746)
chr4 (223-262)||(20157056-20157095)
chr4 (141-196)||(26284595-26284650)
chr4 (227-262)||(33742675-33742710)
chr4 (211-262)||(45938444-45938495)
chr4 (138-196)||(6873060-6873118)
chr4 (139-197)||(12522447-12522505)
chr4 (410-554)||(14970707-14970853)
chr4 (129-171)||(32306582-32306624)
chr4 (143-197)||(35170991-35171045)
chr4 (83-197)||(35614301-35614415)
chr4 (139-197)||(41385430-41385488)
chr4 (221-262)||(8846689-8846730)
chr4 (83-184)||(9271733-9271834)
chr4 (477-535)||(16596686-16596746)
chr4 (83-184)||(53433753-53433854)
chr4 (112-144)||(11250219-11250251)
chr4 (127-199)||(12287794-12287866)
chr4 (108-148)||(12570457-12570497)
chr4 (97-185)||(14268101-14268189)
chr4 (108-144)||(14708288-14708324)
chr4 (112-144)||(16351506-16351538)
chr4 (108-144)||(18237308-18237344)
chr4 (108-144)||(23139686-23139722)
chr4 (108-144)||(28569098-28569134)
chr4 (108-144)||(36133616-36133652)
chr4 (221-261)||(39706052-39706092)
chr4 (108-144)||(43255814-43255850)
chr4 (108-144)||(45938563-45938599)
chr4 (129-201)||(53081760-53081832)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (84-573)||(16282-16771)
[»] chr5 (164 HSPs)
chr5 (96-573)||(21292611-21293090)
chr5 (84-573)||(8286471-8286964)
chr5 (84-573)||(22075018-22075511)
chr5 (85-573)||(23390115-23390617)
chr5 (84-573)||(24493569-24494071)
chr5 (84-573)||(25421532-25422035)
chr5 (85-573)||(13095495-13095996)
chr5 (84-570)||(24529223-24529724)
chr5 (85-573)||(13025311-13025812)
chr5 (84-573)||(9077952-9078455)
chr5 (84-553)||(25431414-25431897)
chr5 (84-438)||(22107002-22107357)
chr5 (84-573)||(1096467-1096970)
chr5 (84-437)||(21985765-21986130)
chr5 (99-269)||(11580878-11581058)
chr5 (84-262)||(22119811-22119998)
chr5 (85-201)||(21871190-21871306)
chr5 (85-201)||(21875470-21875586)
chr5 (99-267)||(36154461-36154639)
chr5 (409-573)||(21808343-21808510)
chr5 (84-201)||(19660455-19660572)
chr5 (423-573)||(21729033-21729185)
chr5 (84-262)||(24766955-24767142)
chr5 (97-201)||(21565930-21566034)
chr5 (99-200)||(22959166-22959267)
chr5 (456-566)||(37723910-37724020)
chr5 (97-201)||(19669286-19669390)
chr5 (475-573)||(21997555-21997655)
chr5 (477-573)||(36314577-36314675)
chr5 (501-573)||(19660884-19660956)
chr5 (457-573)||(21329500-21329618)
chr5 (129-557)||(22144065-22144508)
chr5 (98-202)||(21329127-21329231)
chr5 (501-573)||(21502205-21502277)
chr5 (457-557)||(20026942-20027046)
chr5 (369-569)||(22032323-22032520)
chr5 (369-569)||(18769919-18770118)
chr5 (475-554)||(26012056-26012137)
chr5 (401-520)||(18356367-18356488)
chr5 (98-202)||(21498649-21498753)
chr5 (501-569)||(22959581-22959649)
chr5 (401-473)||(23572180-23572252)
chr5 (84-262)||(20910430-20910609)
chr5 (458-569)||(21565546-21565659)
chr5 (361-570)||(22412187-22412388)
chr5 (424-570)||(29329934-29330081)
chr5 (401-520)||(20910745-20910866)
chr5 (500-557)||(22178269-22178326)
chr5 (475-570)||(11581265-11581361)
chr5 (85-169)||(37724319-37724403)
chr5 (424-570)||(264783-264930)
chr5 (424-570)||(10732955-10733102)
chr5 (424-570)||(20909012-20909159)
chr5 (424-570)||(39363384-39363531)
chr5 (83-197)||(21294892-21295006)
chr5 (83-196)||(15441583-15441696)
chr5 (361-554)||(18418599-18418793)
chr5 (108-262)||(21340421-21340576)
chr5 (108-262)||(26665785-26665940)
chr5 (108-262)||(26937382-26937537)
chr5 (501-573)||(19668898-19668970)
chr5 (475-554)||(20902075-20902155)
chr5 (475-570)||(39245136-39245232)
chr5 (107-170)||(21366308-21366371)
chr5 (477-573)||(40725853-40725951)
chr5 (424-570)||(42245380-42245527)
chr5 (128-202)||(5888837-5888911)
chr5 (83-197)||(24554896-24555010)
chr5 (503-557)||(26740697-26740750)
chr5 (424-570)||(36154798-36154942)
chr5 (108-262)||(16674449-16674604)
chr5 (107-148)||(17918804-17918845)
chr5 (108-262)||(18356624-18356779)
chr5 (108-169)||(22032731-22032792)
chr5 (108-169)||(23201784-23201845)
chr5 (108-262)||(23535243-23535398)
chr5 (108-262)||(24532702-24532857)
chr5 (83-196)||(25406789-25406902)
chr5 (503-552)||(26732884-26732932)
chr5 (475-570)||(2154680-2154776)
chr5 (99-135)||(29916580-29916616)
chr5 (108-148)||(31342539-31342579)
chr5 (132-196)||(41294112-41294176)
chr5 (124-195)||(20026521-20026592)
chr5 (107-170)||(20805961-20806024)
chr5 (511-570)||(20918052-20918110)
chr5 (424-570)||(29345980-29346127)
chr5 (504-558)||(15796434-15796487)
chr5 (114-196)||(17284430-17284512)
chr5 (108-202)||(21741185-21741279)
chr5 (504-558)||(23469818-23469871)
chr5 (139-197)||(25535351-25535409)
chr5 (520-570)||(38619434-38619484)
chr5 (99-144)||(1858621-1858666)
chr5 (221-262)||(5888940-5888981)
chr5 (475-567)||(18319100-18319193)
chr5 (108-169)||(18769647-18769708)
chr5 (225-262)||(19660606-19660643)
chr5 (221-270)||(21501919-21501968)
chr5 (221-258)||(21565863-21565900)
chr5 (108-169)||(21887239-21887300)
chr5 (83-196)||(22133362-22133475)
chr5 (83-196)||(22140054-22140167)
chr5 (138-195)||(22588459-22588516)
chr5 (221-262)||(22959298-22959339)
chr5 (520-569)||(23064512-23064561)
chr5 (139-196)||(23336973-23337030)
chr5 (520-557)||(27988997-27989034)
chr5 (108-201)||(33409565-33409658)
chr5 (522-570)||(10775790-10775838)
chr5 (223-263)||(20026706-20026746)
chr5 (475-570)||(31061068-31061164)
chr5 (227-262)||(19472493-19472528)
chr5 (138-185)||(19992258-19992305)
chr5 (227-262)||(20296145-20296180)
chr5 (120-171)||(22177797-22177848)
chr5 (138-185)||(22334501-22334548)
chr5 (211-262)||(23201680-23201731)
chr5 (223-262)||(31342414-31342453)
chr5 (424-570)||(32027393-32027540)
chr5 (138-197)||(37286464-37286523)
chr5 (138-197)||(37293167-37293226)
chr5 (112-170)||(12028223-12028281)
chr5 (139-197)||(14359504-14359562)
chr5 (114-196)||(15236440-15236522)
chr5 (113-151)||(23500993-23501031)
chr5 (112-170)||(23512521-23512579)
chr5 (224-262)||(25744036-25744074)
chr5 (120-202)||(26011688-26011770)
chr5 (112-170)||(26680980-26681038)
chr5 (492-554)||(26704090-26704151)
chr5 (129-171)||(26732421-26732463)
chr5 (129-171)||(26740234-26740276)
chr5 (112-170)||(26952587-26952645)
chr5 (492-554)||(26973823-26973884)
chr5 (127-185)||(27517126-27517184)
chr5 (127-185)||(27523763-27523821)
chr5 (114-196)||(29471019-29471101)
chr5 (114-196)||(29477614-29477696)
chr5 (108-262)||(17718093-17718248)
chr5 (213-262)||(20232847-20232896)
chr5 (504-557)||(21328268-21328320)
chr5 (221-258)||(21741308-21741345)
chr5 (108-262)||(21884843-21884998)
chr5 (129-170)||(25574056-25574097)
chr5 (129-170)||(25575249-25575290)
chr5 (129-170)||(25576442-25576483)
chr5 (98-151)||(26704499-26704552)
chr5 (98-151)||(26974232-26974285)
chr5 (222-262)||(123074-123114)
chr5 (108-144)||(4036636-4036672)
chr5 (108-148)||(14079584-14079624)
chr5 (108-144)||(18784463-18784499)
chr5 (108-144)||(21482894-21482930)
chr5 (206-262)||(21871321-21871377)
chr5 (206-262)||(21875601-21875657)
chr5 (112-144)||(22760081-22760113)
chr5 (112-144)||(24222304-24222336)
chr5 (108-144)||(25229060-25229096)
chr5 (108-144)||(25293216-25293252)
chr5 (83-183)||(25808115-25808215)
chr5 (108-144)||(26172880-26172916)
chr5 (84-144)||(26742376-26742436)
chr5 (108-144)||(42805836-42805872)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (84-573)||(46995-47478)
scaffold0064 (108-169)||(64306-64367)
[»] chr3 (216 HSPs)
chr3 (84-573)||(20698065-20698556)
chr3 (85-573)||(17487856-17488359)
chr3 (85-573)||(17499338-17499841)
chr3 (136-573)||(13442274-13442725)
chr3 (84-573)||(26686887-26687390)
chr3 (84-573)||(12399209-12399698)
chr3 (84-573)||(18438534-18439037)
chr3 (84-573)||(14972854-14973357)
chr3 (84-554)||(14576451-14576934)
chr3 (84-570)||(40213339-40213838)
chr3 (84-573)||(11424381-11424880)
chr3 (84-573)||(25476003-25476506)
chr3 (87-554)||(14572608-14573088)
chr3 (84-573)||(23082979-23083482)
chr3 (84-554)||(30029859-30030331)
chr3 (199-573)||(43840932-43841309)
chr3 (84-270)||(17247904-17248100)
chr3 (88-263)||(53070321-53070505)
chr3 (85-252)||(16809724-16809887)
chr3 (84-201)||(12340138-12340255)
chr3 (84-201)||(14179708-14179825)
chr3 (84-193)||(43842572-43842681)
chr3 (248-437)||(16796685-16796875)
chr3 (84-201)||(14669146-14669263)
chr3 (86-262)||(12851984-12852169)
chr3 (84-201)||(13209946-13210062)
chr3 (84-201)||(14665991-14666108)
chr3 (84-201)||(14735504-14735621)
chr3 (361-570)||(24153115-24153326)
chr3 (97-200)||(49389275-49389378)
chr3 (88-182)||(17247142-17247236)
chr3 (97-197)||(32308058-32308158)
chr3 (108-554)||(42386429-42386890)
chr3 (108-198)||(4588457-4588547)
chr3 (97-201)||(12933941-12934045)
chr3 (97-198)||(9513299-9513400)
chr3 (97-198)||(9521274-9521375)
chr3 (99-199)||(16104168-16104268)
chr3 (97-198)||(1644314-1644415)
chr3 (97-198)||(16097719-16097820)
chr3 (97-201)||(49667715-49667818)
chr3 (99-176)||(12171750-12171827)
chr3 (477-573)||(13210350-13210448)
chr3 (98-202)||(15471309-15471413)
chr3 (501-569)||(49668125-49668193)
chr3 (477-573)||(24340746-24340844)
chr3 (475-573)||(43550544-43550644)
chr3 (360-437)||(14179570-14179648)
chr3 (456-573)||(15470927-15471043)
chr3 (84-169)||(15877447-15877532)
chr3 (501-569)||(9512924-9512992)
chr3 (501-569)||(9520899-9520967)
chr3 (501-569)||(12174308-12174376)
chr3 (502-557)||(22110402-22110457)
chr3 (502-557)||(43925974-43926029)
chr3 (405-569)||(856140-856304)
chr3 (500-569)||(37251216-37251283)
chr3 (456-570)||(27165250-27165366)
chr3 (501-554)||(32307696-32307749)
chr3 (501-557)||(52523778-52523834)
chr3 (120-195)||(324627-324702)
chr3 (424-570)||(9707622-9707769)
chr3 (457-573)||(14234487-14234605)
chr3 (424-570)||(29172598-29172745)
chr3 (98-196)||(14234881-14234979)
chr3 (410-570)||(17672626-17672788)
chr3 (508-570)||(28194693-28194755)
chr3 (410-554)||(50242838-50242984)
chr3 (424-557)||(53070668-53070802)
chr3 (475-570)||(53301572-53301669)
chr3 (504-557)||(606378-606431)
chr3 (456-570)||(36166598-36166712)
chr3 (108-262)||(38814681-38814836)
chr3 (120-196)||(2050855-2050931)
chr3 (500-556)||(12377938-12377994)
chr3 (505-569)||(16097332-16097396)
chr3 (501-569)||(16103784-16103852)
chr3 (477-554)||(23274706-23274785)
chr3 (424-570)||(7781362-7781509)
chr3 (410-571)||(13544024-13544187)
chr3 (424-570)||(17463178-17463325)
chr3 (424-570)||(28848626-28848773)
chr3 (424-570)||(34159326-34159473)
chr3 (477-573)||(37642288-37642386)
chr3 (424-570)||(45606922-45607069)
chr3 (424-570)||(55476491-55476638)
chr3 (83-197)||(839609-839723)
chr3 (108-202)||(1465051-1465145)
chr3 (410-554)||(12567576-12567722)
chr3 (83-197)||(24188140-24188254)
chr3 (83-197)||(55149341-55149455)
chr3 (108-262)||(17242269-17242424)
chr3 (99-148)||(17674209-17674258)
chr3 (458-570)||(55500942-55501055)
chr3 (475-570)||(6469200-6469296)
chr3 (475-570)||(8499518-8499614)
chr3 (475-570)||(15977515-15977611)
chr3 (107-199)||(18383559-18383651)
chr3 (129-201)||(52523390-52523462)
chr3 (424-570)||(8899094-8899241)
chr3 (107-170)||(12496668-12496731)
chr3 (424-570)||(16454296-16454443)
chr3 (424-554)||(38961906-38962037)
chr3 (221-263)||(1644447-1644489)
chr3 (107-169)||(15060706-15060768)
chr3 (120-198)||(22109929-22110007)
chr3 (87-169)||(23408847-23408928)
chr3 (221-263)||(32307983-32308025)
chr3 (221-263)||(49667848-49667890)
chr3 (107-148)||(3402608-3402649)
chr3 (108-262)||(3833971-3834126)
chr3 (456-554)||(21618465-21618563)
chr3 (108-148)||(3389600-3389640)
chr3 (83-183)||(4291149-4291249)
chr3 (108-148)||(11298172-11298212)
chr3 (475-570)||(12119791-12119887)
chr3 (424-570)||(13151805-13151953)
chr3 (424-570)||(13154270-13154418)
chr3 (502-558)||(13919344-13919399)
chr3 (475-570)||(15412429-15412525)
chr3 (83-262)||(20723298-20723478)
chr3 (108-148)||(26190652-26190692)
chr3 (107-146)||(323026-323065)
chr3 (424-570)||(10247738-10247885)
chr3 (84-151)||(12037572-12037639)
chr3 (223-262)||(12340068-12340107)
chr3 (120-171)||(14501615-14501666)
chr3 (478-568)||(16282880-16282971)
chr3 (424-570)||(17446670-17446816)
chr3 (511-570)||(17737236-17737294)
chr3 (99-170)||(19725546-19725617)
chr3 (211-262)||(19725669-19725720)
chr3 (120-195)||(23275133-23275208)
chr3 (520-570)||(10556985-10557035)
chr3 (108-170)||(12173199-12173261)
chr3 (221-263)||(12934075-12934117)
chr3 (107-169)||(15051930-15051992)
chr3 (108-170)||(23077121-23077183)
chr3 (114-196)||(23704428-23704510)
chr3 (114-196)||(23722884-23722966)
chr3 (114-196)||(23741340-23741422)
chr3 (114-196)||(41201457-41201539)
chr3 (520-570)||(45577950-45578000)
chr3 (120-201)||(605945-606026)
chr3 (108-169)||(856550-856611)
chr3 (108-262)||(1598134-1598289)
chr3 (99-148)||(11852006-11852055)
chr3 (127-196)||(15691950-15692019)
chr3 (108-262)||(15849739-15849894)
chr3 (83-184)||(16333548-16333649)
chr3 (129-170)||(43927597-43927638)
chr3 (108-148)||(321657-321697)
chr3 (108-148)||(17524817-17524857)
chr3 (520-568)||(41123892-41123940)
chr3 (475-570)||(44494809-44494905)
chr3 (84-171)||(603258-603345)
chr3 (227-262)||(7109999-7110034)
chr3 (227-262)||(7113934-7113969)
chr3 (114-185)||(13251095-13251166)
chr3 (114-185)||(13257741-13257812)
chr3 (223-262)||(14665921-14665960)
chr3 (223-262)||(14669076-14669115)
chr3 (223-262)||(14735434-14735473)
chr3 (108-262)||(15941558-15941713)
chr3 (107-146)||(16369845-16369884)
chr3 (477-573)||(22147548-22147646)
chr3 (227-262)||(22321965-22322000)
chr3 (227-262)||(22337020-22337055)
chr3 (99-150)||(23052711-23052762)
chr3 (120-171)||(23412827-23412878)
chr3 (227-262)||(27409417-27409452)
chr3 (120-171)||(45797659-45797710)
chr3 (129-171)||(316612-316654)
chr3 (221-263)||(324549-324591)
chr3 (114-196)||(11070435-11070517)
chr3 (114-196)||(11165189-11165271)
chr3 (114-196)||(14499692-14499774)
chr3 (108-170)||(14878148-14878210)
chr3 (114-196)||(15726591-15726673)
chr3 (220-262)||(16097645-16097687)
chr3 (114-196)||(30066313-30066395)
chr3 (138-184)||(41092030-41092076)
chr3 (221-259)||(49389408-49389446)
chr3 (114-196)||(55023212-55023294)
chr3 (108-262)||(326818-326973)
chr3 (221-262)||(1465174-1465215)
chr3 (83-196)||(5149596-5149709)
chr3 (221-258)||(9513228-9513265)
chr3 (221-258)||(9521203-9521240)
chr3 (83-184)||(12891782-12891883)
chr3 (225-262)||(13210096-13210133)
chr3 (504-557)||(15246034-15246086)
chr3 (108-262)||(15482959-15483114)
chr3 (492-569)||(15878092-15878168)
chr3 (108-201)||(16862834-16862927)
chr3 (83-184)||(17252685-17252786)
chr3 (138-183)||(17710275-17710320)
chr3 (492-569)||(23408428-23408504)
chr3 (139-196)||(28350846-28350903)
chr3 (222-263)||(37250932-37250973)
chr3 (83-183)||(4710675-4710775)
chr3 (108-144)||(7793000-7793036)
chr3 (112-144)||(11557043-11557075)
chr3 (112-144)||(11594797-11594829)
chr3 (221-261)||(12171869-12171909)
chr3 (127-171)||(12378412-12378456)
chr3 (83-171)||(15617766-15617854)
chr3 (108-144)||(16690635-16690671)
chr3 (108-144)||(16697208-16697244)
chr3 (108-144)||(16797708-16797744)
chr3 (108-144)||(20461154-20461190)
chr3 (222-262)||(22110116-22110156)
chr3 (108-144)||(31097208-31097244)
chr3 (100-144)||(42326360-42326404)
chr3 (133-185)||(53380030-53380082)
chr3 (133-185)||(53386682-53386734)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (84-573)||(678-1169)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (84-570)||(4760-5246)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (84-573)||(167608-168099)
scaffold0011 (84-573)||(51913-52415)
scaffold0011 (504-557)||(38204-38256)
[»] chr6 (142 HSPs)
chr6 (85-573)||(16920263-16920751)
chr6 (84-573)||(22831503-22831994)
chr6 (96-573)||(20360601-20361081)
chr6 (87-573)||(20637915-20638404)
chr6 (84-561)||(11185517-11185994)
chr6 (84-573)||(22779845-22780348)
chr6 (84-573)||(19303159-19303661)
chr6 (102-573)||(29060540-29061025)
chr6 (84-573)||(17287414-17287917)
chr6 (84-572)||(18409445-18409947)
chr6 (84-573)||(20593773-20594276)
chr6 (99-350)||(18821463-18821714)
chr6 (94-573)||(25628983-25629476)
chr6 (401-573)||(35245586-35245758)
chr6 (84-263)||(28496091-28496280)
chr6 (84-263)||(29808501-29808691)
chr6 (84-201)||(1561689-1561806)
chr6 (84-262)||(21939699-21939886)
chr6 (99-263)||(18457029-18457202)
chr6 (423-573)||(16496244-16496396)
chr6 (90-262)||(25611347-25611530)
chr6 (85-262)||(15894049-15894237)
chr6 (84-201)||(22334500-22334617)
chr6 (97-201)||(19652581-19652685)
chr6 (84-201)||(4667831-4667948)
chr6 (84-201)||(4674678-4674795)
chr6 (84-546)||(25603003-25603478)
chr6 (84-201)||(4185441-4185558)
chr6 (84-201)||(4189342-4189459)
chr6 (84-201)||(31155016-31155133)
chr6 (409-573)||(20076700-20076863)
chr6 (81-197)||(31164473-31164589)
chr6 (428-554)||(20109157-20109285)
chr6 (98-202)||(23019792-23019896)
chr6 (501-573)||(27333267-27333339)
chr6 (501-573)||(27394007-27394079)
chr6 (98-201)||(27332916-27333019)
chr6 (98-201)||(27393656-27393759)
chr6 (477-573)||(28496494-28496592)
chr6 (477-573)||(29808905-29809003)
chr6 (456-573)||(23019408-23019525)
chr6 (84-156)||(22439230-22439302)
chr6 (401-520)||(27415887-27416008)
chr6 (84-169)||(19863395-19863480)
chr6 (475-570)||(25656629-25656725)
chr6 (84-144)||(27415572-27415632)
chr6 (477-573)||(1561303-1561401)
chr6 (428-570)||(1595549-1595692)
chr6 (424-570)||(2291195-2291342)
chr6 (456-554)||(25644339-25644440)
chr6 (508-554)||(19668390-19668436)
chr6 (410-570)||(25754809-25754971)
chr6 (501-554)||(9098563-9098616)
chr6 (84-169)||(22432667-22432752)
chr6 (502-555)||(23076748-23076801)
chr6 (502-555)||(35008166-35008219)
chr6 (501-569)||(19652199-19652267)
chr6 (120-262)||(22080391-22080543)
chr6 (475-570)||(22782227-22782323)
chr6 (98-202)||(25956253-25956357)
chr6 (410-572)||(30676710-30676874)
chr6 (477-573)||(8227534-8227632)
chr6 (424-570)||(12742317-12742464)
chr6 (99-170)||(18180903-18180974)
chr6 (424-570)||(18334607-18334754)
chr6 (424-570)||(19005046-19005193)
chr6 (424-570)||(19858934-19859081)
chr6 (424-570)||(24422547-24422694)
chr6 (424-570)||(33861794-33861941)
chr6 (424-570)||(33864278-33864425)
chr6 (83-197)||(22331803-22331917)
chr6 (500-558)||(33443062-33443119)
chr6 (84-169)||(25641802-25641887)
chr6 (98-198)||(25644711-25644811)
chr6 (410-572)||(34963371-34963535)
chr6 (424-570)||(1540926-1541073)
chr6 (424-570)||(8055029-8055176)
chr6 (108-262)||(19663065-19663220)
chr6 (424-570)||(26924655-26924802)
chr6 (108-262)||(12496605-12496760)
chr6 (424-557)||(18456732-18456866)
chr6 (424-557)||(18461892-18462026)
chr6 (108-170)||(21834533-21834595)
chr6 (527-573)||(22080800-22080846)
chr6 (511-573)||(25714417-25714478)
chr6 (460-550)||(4185827-4185919)
chr6 (492-569)||(22432249-22432325)
chr6 (492-569)||(22438799-22438875)
chr6 (83-183)||(14099004-14099104)
chr6 (475-554)||(25688518-25688598)
chr6 (107-170)||(16523045-16523108)
chr6 (211-262)||(22334648-22334699)
chr6 (211-262)||(25641940-25641991)
chr6 (138-196)||(1538628-1538686)
chr6 (138-196)||(1544727-1544785)
chr6 (511-557)||(18821904-18821949)
chr6 (108-170)||(21739665-21739727)
chr6 (83-197)||(34295696-34295810)
chr6 (221-262)||(4185588-4185629)
chr6 (221-262)||(4667978-4668019)
chr6 (107-200)||(15041192-15041285)
chr6 (139-196)||(16372223-16372280)
chr6 (475-567)||(16448593-16448686)
chr6 (120-197)||(20109605-20109682)
chr6 (108-262)||(22429684-22429839)
chr6 (83-184)||(34833031-34833132)
chr6 (475-570)||(20556958-20557054)
chr6 (221-261)||(27333049-27333089)
chr6 (221-261)||(27393789-27393829)
chr6 (511-570)||(3852121-3852179)
chr6 (227-262)||(8244158-8244193)
chr6 (227-262)||(11567160-11567195)
chr6 (507-558)||(18199473-18199523)
chr6 (221-260)||(19652512-19652551)
chr6 (227-262)||(19870888-19870923)
chr6 (84-151)||(22059362-22059429)
chr6 (109-148)||(22405709-22405748)
chr6 (227-262)||(22863243-22863278)
chr6 (227-262)||(23395366-23395401)
chr6 (504-558)||(18453197-18453250)
chr6 (139-185)||(30694738-30694784)
chr6 (108-201)||(2684995-2685088)
chr6 (460-550)||(4186390-4186482)
chr6 (138-183)||(14472647-14472692)
chr6 (217-262)||(16924642-16924687)
chr6 (217-262)||(16929357-16929402)
chr6 (108-262)||(17804494-17804649)
chr6 (492-569)||(19873120-19873196)
chr6 (83-192)||(25594981-25595090)
chr6 (221-262)||(31155163-31155204)
chr6 (139-196)||(34369658-34369715)
chr6 (108-144)||(1587385-1587421)
chr6 (108-144)||(5616468-5616504)
chr6 (108-144)||(12707104-12707140)
chr6 (108-144)||(16741623-16741659)
chr6 (222-262)||(19668688-19668728)
chr6 (108-144)||(20803206-20803242)
chr6 (108-144)||(21702703-21702739)
chr6 (222-262)||(23657189-23657229)
chr6 (108-144)||(25766822-25766858)
chr6 (133-185)||(27327735-27327787)
chr6 (133-185)||(27388475-27388527)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (84-573)||(4712-5204)
scaffold0358 (84-498)||(13-428)
[»] chr1 (131 HSPs)
chr1 (84-573)||(38801020-38801508)
chr1 (84-573)||(27250358-27250850)
chr1 (84-573)||(21026680-21027172)
chr1 (84-572)||(50209832-50210333)
chr1 (84-498)||(22354190-22354616)
chr1 (84-570)||(34509783-34510283)
chr1 (84-573)||(22532269-22532772)
chr1 (84-464)||(22355803-22356185)
chr1 (84-464)||(22357489-22357871)
chr1 (84-383)||(20846848-20847147)
chr1 (84-572)||(20135188-20135690)
chr1 (85-570)||(433012-433509)
chr1 (84-262)||(20918917-20919104)
chr1 (85-173)||(21301157-21301245)
chr1 (97-285)||(33681301-33681499)
chr1 (97-201)||(52927612-52927716)
chr1 (97-199)||(21754423-21754525)
chr1 (84-198)||(21162117-21162231)
chr1 (99-201)||(22238015-22238117)
chr1 (107-200)||(20248664-20248757)
chr1 (98-202)||(22921499-22921603)
chr1 (84-262)||(20091092-20091281)
chr1 (362-572)||(22468604-22468816)
chr1 (477-573)||(14295574-14295672)
chr1 (456-557)||(21896258-21896361)
chr1 (479-573)||(45574912-45575008)
chr1 (497-573)||(20847200-20847275)
chr1 (456-557)||(21861572-21861675)
chr1 (98-202)||(43697745-43697849)
chr1 (401-520)||(33797573-33797694)
chr1 (360-437)||(48603652-48603730)
chr1 (475-557)||(35261099-35261183)
chr1 (501-569)||(22921918-22921986)
chr1 (502-557)||(50614167-50614222)
chr1 (502-557)||(50621995-50622050)
chr1 (501-573)||(33681010-33681079)
chr1 (504-557)||(16368338-16368391)
chr1 (84-169)||(22468315-22468400)
chr1 (477-554)||(20918623-20918702)
chr1 (475-554)||(21754064-21754145)
chr1 (456-573)||(22237630-22237746)
chr1 (410-570)||(23593735-23593897)
chr1 (501-554)||(16758668-16758721)
chr1 (500-557)||(41050084-41050141)
chr1 (424-570)||(13988866-13989013)
chr1 (410-571)||(21840766-21840929)
chr1 (424-570)||(21923306-21923453)
chr1 (424-570)||(29776688-29776835)
chr1 (424-570)||(31612313-31612460)
chr1 (108-170)||(18181764-18181826)
chr1 (83-197)||(23763574-23763688)
chr1 (503-557)||(50686627-50686681)
chr1 (501-573)||(52928019-52928088)
chr1 (98-151)||(21714983-21715036)
chr1 (84-148)||(8761252-8761316)
chr1 (501-569)||(20248283-20248351)
chr1 (504-572)||(20454606-20454673)
chr1 (475-554)||(22123133-22123214)
chr1 (99-146)||(3472560-3472607)
chr1 (475-573)||(13212928-13213027)
chr1 (478-576)||(15860078-15860177)
chr1 (500-555)||(16093933-16093988)
chr1 (424-570)||(21475102-21475249)
chr1 (120-199)||(21895886-21895965)
chr1 (107-170)||(22432425-22432488)
chr1 (502-557)||(26064954-26065009)
chr1 (475-576)||(21342090-21342192)
chr1 (221-263)||(21754350-21754392)
chr1 (108-198)||(28194090-28194180)
chr1 (99-144)||(3704731-3704776)
chr1 (410-572)||(16361915-16362079)
chr1 (475-570)||(21346961-21347057)
chr1 (138-197)||(20524899-20524958)
chr1 (138-197)||(21438157-21438216)
chr1 (120-199)||(21861148-21861227)
chr1 (511-570)||(29298137-29298195)
chr1 (132-199)||(35981352-35981419)
chr1 (473-570)||(16275428-16275526)
chr1 (138-196)||(19063884-19063942)
chr1 (138-196)||(19111774-19111832)
chr1 (520-570)||(21707167-21707217)
chr1 (520-570)||(21711709-21711759)
chr1 (108-170)||(22831021-22831083)
chr1 (108-262)||(12647166-12647321)
chr1 (108-262)||(18882664-18882819)
chr1 (221-262)||(20637165-20637206)
chr1 (221-262)||(21162080-21162121)
chr1 (492-569)||(21714546-21714622)
chr1 (108-169)||(21787685-21787746)
chr1 (83-196)||(21829078-21829191)
chr1 (83-196)||(21844591-21844704)
chr1 (129-198)||(35260718-35260787)
chr1 (108-169)||(42864854-42864915)
chr1 (129-201)||(16367873-16367945)
chr1 (99-202)||(20637235-20637339)
chr1 (107-147)||(21023075-21023115)
chr1 (502-558)||(21533923-21533978)
chr1 (108-144)||(23818953-23818989)
chr1 (127-199)||(41049629-41049701)
chr1 (84-156)||(45307721-45307793)
chr1 (108-144)||(45489397-45489433)
chr1 (227-262)||(16375231-16375266)
chr1 (127-198)||(16759115-16759186)
chr1 (120-171)||(21342564-21342615)
chr1 (120-171)||(21347429-21347480)
chr1 (227-262)||(21407653-21407688)
chr1 (84-171)||(24087831-24087918)
chr1 (140-199)||(26065382-26065441)
chr1 (227-262)||(52639839-52639874)
chr1 (114-196)||(1011087-1011169)
chr1 (129-175)||(16381652-16381698)
chr1 (138-196)||(19105117-19105175)
chr1 (108-201)||(19212226-19212319)
chr1 (108-201)||(21615796-21615889)
chr1 (108-170)||(24782754-24782816)
chr1 (129-171)||(52940464-52940506)
chr1 (108-169)||(6152270-6152331)
chr1 (107-144)||(17678240-17678277)
chr1 (108-262)||(20138380-20138535)
chr1 (221-262)||(20248592-20248633)
chr1 (220-261)||(22921631-22921672)
chr1 (222-263)||(26065254-26065295)
chr1 (221-262)||(28194213-28194254)
chr1 (221-262)||(35981451-35981492)
chr1 (108-262)||(46975764-46975919)
chr1 (83-184)||(50887381-50887482)
chr1 (220-261)||(52927745-52927786)
chr1 (129-201)||(16093479-16093551)
chr1 (108-144)||(21305730-21305766)
chr1 (108-144)||(33797949-33797985)
chr1 (222-262)||(45310135-45310175)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (84-573)||(1952-2444)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (88-573)||(51582-52067)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (84-573)||(13211-13703)
scaffold0193 (108-262)||(9717-9872)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (84-573)||(1289-1778)
scaffold0106 (84-573)||(7266-7755)
scaffold0106 (84-151)||(16083-16150)
scaffold0106 (504-570)||(15291-15356)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (84-573)||(3470-3973)
scaffold0292 (96-573)||(343-833)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (85-573)||(1851-2353)
scaffold0016 (108-262)||(207161-207324)
scaffold0016 (120-170)||(119205-119255)
[»] scaffold0042 (5 HSPs)
scaffold0042 (85-554)||(23921-24405)
scaffold0042 (108-262)||(64150-64305)
scaffold0042 (108-262)||(76034-76189)
scaffold0042 (108-148)||(34553-34593)
scaffold0042 (108-148)||(41196-41236)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (84-513)||(6669-7102)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (85-573)||(4849-5339)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (84-573)||(5739-6245)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (84-573)||(38761-39262)
scaffold0145 (364-573)||(32942-33153)
scaffold0145 (475-575)||(9744-9845)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (85-573)||(20910-21392)
[»] scaffold0021 (9 HSPs)
scaffold0021 (84-485)||(124675-125085)
scaffold0021 (456-572)||(174767-174883)
scaffold0021 (97-201)||(62947-63051)
scaffold0021 (84-149)||(175202-175267)
scaffold0021 (503-573)||(121766-121835)
scaffold0021 (497-557)||(136414-136474)
scaffold0021 (497-557)||(145122-145182)
scaffold0021 (222-263)||(136132-136173)
scaffold0021 (222-263)||(144840-144881)
[»] scaffold0175 (4 HSPs)
scaffold0175 (85-523)||(13141-13594)
scaffold0175 (84-261)||(34437-34623)
scaffold0175 (477-573)||(34123-34221)
scaffold0175 (520-573)||(273-326)
[»] scaffold0056 (4 HSPs)
scaffold0056 (84-572)||(16833-17337)
scaffold0056 (84-200)||(78980-79096)
scaffold0056 (511-557)||(79388-79433)
scaffold0056 (84-148)||(13696-13760)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (84-573)||(8479-8978)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (87-573)||(8154-8650)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (84-573)||(39913-40414)
scaffold0080 (500-557)||(19933-19990)
scaffold0080 (211-262)||(18413-18464)
scaffold0080 (108-169)||(18299-18360)
[»] scaffold0003 (5 HSPs)
scaffold0003 (84-570)||(339569-340065)
scaffold0003 (401-520)||(71353-71474)
scaffold0003 (84-144)||(71729-71789)
scaffold0003 (424-570)||(158465-158612)
scaffold0003 (108-144)||(140126-140162)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (85-566)||(25684-26179)
scaffold0122 (84-421)||(33112-33461)
scaffold0122 (456-570)||(44709-44825)
[»] scaffold0026 (7 HSPs)
scaffold0026 (84-573)||(39858-40359)
scaffold0026 (259-573)||(25896-26213)
scaffold0026 (84-201)||(39549-39666)
scaffold0026 (142-198)||(59179-59235)
scaffold0026 (150-201)||(26611-26662)
scaffold0026 (225-262)||(59271-59308)
scaffold0026 (213-247)||(26555-26589)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (108-437)||(1052-1382)
[»] scaffold0165 (4 HSPs)
scaffold0165 (108-417)||(3640-3949)
scaffold0165 (108-417)||(7704-8013)
scaffold0165 (475-554)||(27770-27851)
scaffold0165 (120-199)||(27296-27375)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (84-383)||(20596-20906)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (112-382)||(11170-11440)
scaffold0235 (458-573)||(11447-11564)
scaffold0235 (120-171)||(14055-14106)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (99-570)||(22886-23370)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (94-573)||(16227-16721)
[»] scaffold0228 (4 HSPs)
scaffold0228 (85-573)||(4508-5010)
scaffold0228 (85-573)||(12090-12592)
scaffold0228 (85-573)||(22042-22544)
scaffold0228 (108-262)||(18286-18441)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (99-556)||(51517-51987)
scaffold0034 (475-554)||(32555-32636)
scaffold0034 (120-202)||(32921-33003)
scaffold0034 (221-287)||(32826-32892)
[»] scaffold0395 (3 HSPs)
scaffold0395 (84-513)||(580-1021)
scaffold0395 (84-202)||(8110-8228)
scaffold0395 (506-573)||(4888-4954)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (217-571)||(39479-39836)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (217-571)||(74976-75333)
[»] scaffold0120 (6 HSPs)
scaffold0120 (84-573)||(32577-33077)
scaffold0120 (84-573)||(45928-46428)
scaffold0120 (85-330)||(16333-16588)
scaffold0120 (365-573)||(16113-16323)
scaffold0120 (511-573)||(17389-17450)
scaffold0120 (108-144)||(19671-19707)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (84-317)||(163-407)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (84-396)||(17626-17928)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (84-416)||(10323-10661)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (291-573)||(2987-3271)
scaffold0540 (84-280)||(631-837)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (84-241)||(13226-13383)
[»] scaffold0070 (2 HSPs)
scaffold0070 (84-552)||(4545-5026)
scaffold0070 (108-262)||(10200-10355)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (215-493)||(27912-28192)
scaffold0130 (84-199)||(28924-29039)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (84-263)||(20426-20615)
scaffold0100 (501-573)||(23932-24001)
[»] scaffold0413 (3 HSPs)
scaffold0413 (84-267)||(15233-15426)
scaffold0413 (456-557)||(12584-12687)
scaffold0413 (98-198)||(13033-13133)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (84-201)||(2703-2820)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (84-201)||(18576-18693)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (84-270)||(1696-1891)
[»] scaffold0142 (4 HSPs)
scaffold0142 (99-267)||(17090-17268)
scaffold0142 (475-570)||(16784-16880)
scaffold0142 (166-201)||(7471-7506)
scaffold0142 (223-262)||(7537-7576)
[»] scaffold0031 (5 HSPs)
scaffold0031 (84-259)||(20044-20228)
scaffold0031 (424-557)||(20394-20527)
scaffold0031 (84-151)||(65412-65479)
scaffold0031 (409-498)||(128827-128917)
scaffold0031 (108-262)||(53862-54017)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (84-259)||(12427-12611)
[»] scaffold0075 (4 HSPs)
scaffold0075 (85-201)||(7913-8029)
scaffold0075 (404-557)||(53498-53654)
scaffold0075 (120-199)||(53125-53204)
scaffold0075 (225-262)||(8062-8099)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (84-262)||(344-530)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (85-262)||(2064-2250)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (84-191)||(10540-10647)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (84-198)||(16047-16161)
scaffold0261 (477-570)||(15664-15759)
scaffold0261 (79-169)||(1755-1845)
scaffold0261 (225-262)||(15974-16011)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (84-262)||(79950-80137)
scaffold0037 (456-573)||(22672-22788)
scaffold0037 (410-570)||(82072-82234)
scaffold0037 (108-199)||(21212-21303)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (85-197)||(28899-29011)
scaffold0218 (497-554)||(8119-8176)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (85-262)||(10226-10412)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (99-263)||(12243-12416)
scaffold0503 (511-557)||(11979-12024)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (84-262)||(9452-9639)
[»] scaffold0556 (4 HSPs)
scaffold0556 (97-201)||(7197-7301)
scaffold0556 (501-557)||(6828-6884)
scaffold0556 (98-202)||(8401-8505)
scaffold0556 (221-262)||(7126-7167)
[»] scaffold0247 (4 HSPs)
scaffold0247 (87-195)||(6449-6557)
scaffold0247 (222-286)||(6561-6625)
scaffold0247 (477-573)||(18050-18148)
scaffold0247 (475-554)||(2195-2275)
[»] scaffold0028 (12 HSPs)
scaffold0028 (97-201)||(133039-133143)
scaffold0028 (509-569)||(132662-132722)
scaffold0028 (424-570)||(136680-136827)
scaffold0028 (424-570)||(139149-139296)
scaffold0028 (424-570)||(144087-144234)
scaffold0028 (501-554)||(62217-62270)
scaffold0028 (424-570)||(134211-134358)
scaffold0028 (424-570)||(141618-141765)
scaffold0028 (221-263)||(132967-133009)
scaffold0028 (227-262)||(58492-58527)
scaffold0028 (138-196)||(41901-41959)
scaffold0028 (138-196)||(57408-57466)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (372-572)||(3103-3306)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (84-262)||(24268-24456)
scaffold0124 (477-573)||(38279-38377)
[»] scaffold0046 (5 HSPs)
scaffold0046 (437-573)||(28414-28552)
scaffold0046 (477-573)||(11292-11390)
scaffold0046 (477-573)||(1997-2095)
scaffold0046 (84-150)||(14914-14980)
scaffold0046 (517-573)||(4552-4608)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (99-200)||(161072-161173)
scaffold0001 (475-569)||(160688-160784)
scaffold0001 (410-554)||(501100-501246)
scaffold0001 (475-570)||(85646-85742)
scaffold0001 (129-171)||(446965-447007)
scaffold0001 (129-171)||(497896-497938)
[»] scaffold0211 (3 HSPs)
scaffold0211 (97-197)||(28440-28540)
scaffold0211 (221-263)||(28574-28616)
scaffold0211 (501-569)||(28818-28887)
[»] scaffold0150 (3 HSPs)
scaffold0150 (97-201)||(32469-32573)
scaffold0150 (509-569)||(32102-32162)
scaffold0150 (221-263)||(32397-32439)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (99-202)||(3317-3420)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (84-201)||(9462-9579)
scaffold0475 (221-262)||(9391-9432)
[»] scaffold0023 (10 HSPs)
scaffold0023 (97-200)||(101781-101884)
scaffold0023 (501-573)||(119875-119947)
scaffold0023 (456-569)||(100378-100493)
scaffold0023 (424-570)||(44454-44602)
scaffold0023 (502-569)||(40224-40291)
scaffold0023 (424-570)||(94411-94558)
scaffold0023 (410-554)||(17440-17586)
scaffold0023 (97-159)||(39640-39702)
scaffold0023 (501-569)||(101503-101571)
scaffold0023 (219-263)||(101709-101753)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (99-200)||(2277-2378)
scaffold0207 (501-569)||(2694-2762)
[»] scaffold0102 (4 HSPs)
scaffold0102 (97-201)||(19652-19756)
scaffold0102 (501-569)||(19268-19336)
scaffold0102 (221-270)||(19573-19622)
scaffold0102 (97-169)||(48092-48164)
[»] scaffold1984 (2 HSPs)
scaffold1984 (97-270)||(437-620)
scaffold1984 (501-569)||(133-201)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (369-557)||(26840-27027)
scaffold0215 (108-151)||(27256-27299)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (97-202)||(5978-6083)
scaffold0278 (501-554)||(5662-5715)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (84-164)||(10890-10970)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (477-573)||(1092-1190)
scaffold0184 (222-262)||(3993-4033)
[»] scaffold0125 (3 HSPs)
scaffold0125 (97-199)||(45420-45522)
scaffold0125 (501-569)||(45841-45909)
scaffold0125 (221-262)||(45555-45596)
[»] scaffold0628 (3 HSPs)
scaffold0628 (97-198)||(2434-2535)
scaffold0628 (456-569)||(2808-2923)
scaffold0628 (221-263)||(2567-2609)
[»] scaffold0621 (4 HSPs)
scaffold0621 (97-202)||(6922-7026)
scaffold0621 (501-573)||(6535-6607)
scaffold0621 (428-554)||(8485-8613)
scaffold0621 (120-171)||(8961-9012)
[»] scaffold0555 (5 HSPs)
scaffold0555 (84-201)||(965-1082)
scaffold0555 (98-176)||(10200-10278)
scaffold0555 (456-573)||(10543-10659)
scaffold0555 (211-258)||(897-944)
scaffold0555 (221-263)||(10305-10347)
[»] scaffold0010 (9 HSPs)
scaffold0010 (97-202)||(130292-130397)
scaffold0010 (497-557)||(60761-60821)
scaffold0010 (456-554)||(129924-130024)
scaffold0010 (83-197)||(242420-242534)
scaffold0010 (108-262)||(23513-23668)
scaffold0010 (221-262)||(130222-130263)
scaffold0010 (129-195)||(60301-60367)
scaffold0010 (505-558)||(662-714)
scaffold0010 (222-263)||(60479-60520)
[»] scaffold1137 (2 HSPs)
scaffold1137 (99-195)||(1934-2030)
scaffold1137 (221-263)||(2066-2108)
[»] scaffold0138 (5 HSPs)
scaffold0138 (98-202)||(13325-13429)
scaffold0138 (83-197)||(29836-29950)
scaffold0138 (83-197)||(41832-41946)
scaffold0138 (457-573)||(12942-13057)
scaffold0138 (221-262)||(13255-13296)
[»] scaffold2044 (1 HSPs)
scaffold2044 (85-144)||(1075-1134)
[»] scaffold1124 (2 HSPs)
scaffold1124 (405-569)||(1881-2045)
scaffold1124 (108-169)||(2291-2352)
[»] scaffold0210 (6 HSPs)
scaffold0210 (369-569)||(21721-21920)
scaffold0210 (369-569)||(29613-29812)
scaffold0210 (108-151)||(21449-21492)
scaffold0210 (108-151)||(29341-29384)
scaffold0210 (211-262)||(21563-21614)
scaffold0210 (211-262)||(29455-29506)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (456-557)||(1048-1151)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (98-202)||(15462-15566)
scaffold0020 (501-573)||(15826-15898)
scaffold0020 (98-151)||(179085-179138)
[»] scaffold0357 (6 HSPs)
scaffold0357 (456-557)||(13144-13247)
scaffold0357 (475-554)||(16121-16202)
scaffold0357 (502-557)||(2677-2732)
scaffold0357 (129-199)||(13595-13665)
scaffold0357 (224-339)||(15866-15983)
scaffold0357 (127-195)||(3162-3230)
[»] scaffold0333 (4 HSPs)
scaffold0333 (501-573)||(6611-6683)
scaffold0333 (98-202)||(6998-7102)
scaffold0333 (501-573)||(13991-14063)
scaffold0333 (98-202)||(14378-14482)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (501-573)||(6172-6244)
scaffold0243 (109-196)||(5765-5852)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (118-202)||(43436-43520)
scaffold0116 (118-202)||(47356-47440)
[»] scaffold0029 (7 HSPs)
scaffold0029 (401-473)||(12859-12931)
scaffold0029 (410-553)||(11305-11450)
scaffold0029 (108-169)||(13173-13234)
scaffold0029 (138-196)||(125797-125855)
scaffold0029 (227-262)||(61386-61421)
scaffold0029 (229-262)||(65304-65337)
scaffold0029 (139-196)||(105563-105620)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (477-573)||(11464-11562)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (502-569)||(14747-14814)
scaffold0008 (99-170)||(30379-30450)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (410-554)||(4710-4856)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (500-554)||(25125-25179)
scaffold0123 (129-201)||(25568-25640)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (401-520)||(15362-15483)
scaffold0107 (85-144)||(15049-15108)
scaffold0107 (504-558)||(36195-36248)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (504-557)||(566-619)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (500-557)||(6332-6389)
scaffold0420 (507-557)||(13793-13843)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (456-570)||(38704-38820)
[»] scaffold0530 (2 HSPs)
scaffold0530 (109-193)||(671-755)
scaffold0530 (501-573)||(1083-1155)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (410-567)||(4300-4459)
scaffold0761 (99-151)||(5943-5995)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (85-144)||(17343-17402)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (502-557)||(129021-129075)
scaffold0022 (504-557)||(78338-78391)
scaffold0022 (129-199)||(80726-80796)
scaffold0022 (456-570)||(116430-116544)
scaffold0022 (222-262)||(128735-128775)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (120-202)||(12380-12462)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (500-550)||(38339-38389)
scaffold0139 (84-149)||(20418-20483)
scaffold0139 (127-199)||(38761-38833)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (128-202)||(10913-10987)
scaffold0078 (456-554)||(10546-10646)
scaffold0078 (221-263)||(10842-10884)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (501-554)||(1101-1154)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (500-557)||(2691-2748)
[»] scaffold0004 (6 HSPs)
scaffold0004 (84-169)||(70211-70296)
scaffold0004 (138-197)||(58102-58161)
scaffold0004 (120-195)||(332784-332859)
scaffold0004 (108-262)||(10238-10393)
scaffold0004 (492-569)||(69794-69870)
scaffold0004 (369-438)||(69930-70000)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (360-498)||(3434-3574)
scaffold0327 (108-262)||(587-742)
[»] scaffold0476 (3 HSPs)
scaffold0476 (457-573)||(12766-12884)
scaffold0476 (108-170)||(5996-6058)
scaffold0476 (108-170)||(7191-7253)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (410-571)||(10772-10935)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (424-570)||(13392-13539)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (107-170)||(1307-1370)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (424-570)||(20747-20894)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (424-570)||(37821-37968)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (502-557)||(97021-97076)
scaffold0006 (502-557)||(106299-106354)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (410-570)||(106-268)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (120-202)||(7711-7793)
scaffold0507 (454-557)||(8059-8166)
scaffold0507 (221-263)||(7822-7864)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (83-196)||(3505-3618)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (83-196)||(14169-14282)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (83-196)||(8506-8619)
scaffold0216 (84-148)||(16740-16804)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (98-151)||(26834-26887)
scaffold0198 (492-569)||(23843-23919)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (98-151)||(36024-36077)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (98-151)||(36891-36944)
scaffold0131 (520-569)||(36454-36503)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (137-202)||(227877-227942)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (500-557)||(267676-267733)
scaffold0005 (127-196)||(307460-307529)
scaffold0005 (120-199)||(268116-268195)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (104-148)||(18941-18985)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (96-195)||(2245-2344)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (107-170)||(1904-1967)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (424-570)||(13947-14094)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (500-554)||(103679-103733)
scaffold0040 (127-199)||(103244-103316)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (108-170)||(46370-46432)
[»] scaffold1992 (1 HSPs)
scaffold1992 (99-140)||(239-280)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (108-169)||(891-952)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (108-262)||(18651-18806)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (108-169)||(3254-3315)
scaffold0158 (108-169)||(6920-6981)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (107-148)||(44486-44527)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (83-196)||(37071-37184)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (108-148)||(6059-6099)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (84-196)||(10541-10653)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (475-554)||(29948-30028)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (110-170)||(2240-2300)
scaffold0104 (110-170)||(9922-9982)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (475-570)||(40400-40496)
scaffold0044 (127-196)||(8423-8492)
scaffold0044 (227-263)||(62556-62592)
[»] scaffold0017 (6 HSPs)
scaffold0017 (89-169)||(190905-190985)
scaffold0017 (89-169)||(192608-192688)
scaffold0017 (476-546)||(192997-193070)
scaffold0017 (112-144)||(14971-15003)
scaffold0017 (112-144)||(19493-19525)
scaffold0017 (227-263)||(192757-192793)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (475-570)||(161156-161252)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (107-170)||(4841-4904)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (107-170)||(1726-1789)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (410-571)||(9241-9404)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (107-170)||(35163-35226)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (85-196)||(9704-9815)
scaffold0013 (505-557)||(30347-30398)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (83-197)||(5427-5541)
[»] scaffold0109 (5 HSPs)
scaffold0109 (138-196)||(27006-27064)
scaffold0109 (99-144)||(45534-45579)
scaffold0109 (120-171)||(35524-35575)
scaffold0109 (108-201)||(10956-11049)
scaffold0109 (108-144)||(38473-38509)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (128-202)||(24182-24256)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (502-552)||(206575-206624)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (107-144)||(830-867)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (99-144)||(2217-2262)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (83-196)||(478-591)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (500-557)||(1846-1903)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (99-144)||(747-792)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (424-570)||(12064-12205)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (108-169)||(10464-10525)
scaffold0297 (108-169)||(15322-15383)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (84-197)||(19762-19875)
scaffold0256 (139-202)||(24660-24723)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (108-169)||(18655-18716)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (108-144)||(769-805)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (475-570)||(4214-4310)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (410-572)||(12249-12413)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (108-148)||(15837-15877)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (108-148)||(6721-6761)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (227-262)||(4875-4910)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (114-197)||(12785-12868)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (120-171)||(589-640)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (120-171)||(29177-29228)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (129-199)||(7118-7188)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (108-201)||(2258-2351)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (108-146)||(595-633)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (108-170)||(9346-9408)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (143-197)||(17421-17475)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (106-144)||(36721-36759)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (129-171)||(55271-55313)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (108-262)||(226-381)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (107-144)||(2088-2125)
scaffold0439 (107-144)||(9948-9985)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (107-144)||(6923-6960)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (108-201)||(18014-18107)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (108-201)||(12112-12205)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (107-148)||(18095-18136)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (139-184)||(3148-3193)
[»] scaffold0111 (3 HSPs)
scaffold0111 (504-557)||(7447-7499)
scaffold0111 (504-557)||(14566-14618)
scaffold0111 (117-169)||(32849-32901)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (505-558)||(3272-3324)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (84-169)||(8576-8661)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (108-169)||(15992-16053)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (108-262)||(66069-66224)
scaffold0036 (108-144)||(71210-71246)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (108-148)||(1143-1183)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (108-144)||(6543-6579)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (108-144)||(15759-15795)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (502-558)||(17517-17572)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (140-196)||(3073-3129)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (454-569)||(4804-4921)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (108-148)||(15107-15147)


Alignment Details
Target: scaffold0456 (Bit Score: 430; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 10055 - 10544
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10055 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 10154  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10155 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggggagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 10254  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10255 tgttagattttgcgaccattgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 10354  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10355 ataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatatta 10454  T
Q  484 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10455 ttatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 681 - 1170
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  681 cagagagcattcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 780  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  781 atgagattgaacctggaattaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaacccagaaacagagtgact 880  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  881 tgttagattttgcaacctttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgt 980  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  981 ataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataa 1080  T
Q  484 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1081 ttatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 125)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 20309597 - 20309108
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309597 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctggatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 20309498  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20309497 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgact 20309398  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  20309397 tgttagattttgcgacccttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctga 20309298  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20309297 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 20309198  T
Q  484 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309197 ttatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 37745 - 38235
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37745 cagaaagcatgcaaaatttcgtatttttgacttttgagtggaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaagatgtagg 37844  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  37845 atgagattgaacctggaattaaacttgtgagattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacatagtgact 37944  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37945 tgttagactttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgt 38044  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38045 ataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatatta 38144  T
Q  484 ttatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38145 ttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 23286352 - 23285865
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286352 agagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 23286253  T
Q  185 tgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgactt 284  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23286252 tgagattgaacatggaatgaaaattgtgagattatgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgactt 23286153  T
Q  285 gttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgta 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||     
T  23286152 gttagattttgcgacctttgttgcatgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtt 23286053  T
Q  385 taagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23286052 taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 23285953  T
Q  484 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23285952 ttatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 84 - 570
Target Start/End: Original strand, 298433 - 298933
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  298433 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatatagg 298532  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298533 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 298632  T
Q  274 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||| |    
T  298633 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatat 298732  T
Q  374 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 472  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| |||||||     
T  298733 gtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgc 298832  T
Q  473 aattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    |||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  298833 aattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 298932  T
Q  570 a 570  Q
    |    
T  298933 a 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 23654028 - 23654507
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654028 cagagagcatgcaagatttcataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgactgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 23654127  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||    
T  23654128 atgagattgaacctggaattaaactgttgggattctgacttgaactcgccacggcgagca-------------cgcgagtgacccagaaacagagtgact 23654214  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23654215 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgt 23654314  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 482  Q
     |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23654315 ttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 23654414  T
Q  483 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||   |||||| ||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23654415 attatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Original strand, 22737799 - 22738300
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22737799 agagatcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtagga 22737898  T
Q  185 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||| |||           | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22737899 tgagattgaacctagaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgaactgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaa 22737998  T
Q  274 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 373  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  22737999 cagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatct 22738098  T
Q  374 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 472  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  22738099 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 22738198  T
Q  473 aattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||| ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  22738199 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 22738296  T
Q  570 atgt 573  Q
    ||||    
T  22738297 atgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Original strand, 22730852 - 22731355
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22730852 agagagcatgcaatatttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 22730951  T
Q  185 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22730952 tgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggggagcaaaggctctcgcctcacgagtcacccagaaa 22731051  T
Q  274 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaaccct-tgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || ||| || | ||||||| |  |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  22731052 cagagtgccttgttaggttttgcgatctttgttgcacgagctgttgataattgaaccttgggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 22731151  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  22731152 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattg 22731251  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  22731252 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgat 22731350  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  22731351 gatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 87 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 23076940 - 23076442
Alignment:
Q  87 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23076940 agagcatgcaagatttcgtgattttgactattaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatg 23076841  T
Q  187 agattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 276  Q
    |||||| ||||||||          | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23076840 agattggacctggaaagatttagaatgaaactt-tggaattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacag 23076742  T
Q  277 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtg 376  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| |||  || || || || | |||||||||||||||||    
T  23076741 agtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggattttatgatgatgttaattataatctgtg 23076642  T
Q  377 aagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaat 475  Q
    ||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| ||| ||| ||| |||    
T  23076641 aagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaat 23076542  T
Q  476 tgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 572  Q
    ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  23076541 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatg 23076443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 23660525 - 23660023
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23660525 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 23660426  T
Q  184 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23660425 atgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactt-ttggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccagaa 23660327  T
Q  273 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 371  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||| | |||| | |||||||||||| | |||||| ||| ||||||| | || | ||||||||||||    
T  23660326 acagagtgccttgttaggtttttgtgacctttattgcacgagttattgagagttgaaccttggggtagtattgagacttattgatgatgttaattataat 23660227  T
Q  372 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 470  Q
     ||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||  ||| |||  |||||||||| ||| ||    
T  23660226 ttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgattt 23660127  T
Q  471 gaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
    | | ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23660126 gcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23660028  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  23660027 gatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22337617 - 22337115
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337617 agagagcatgcaagatttcgtgattctgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 22337518  T
Q  185 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 274  Q
    |||||||||||||||||          | |||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337517 tgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgagttctgacctgaattcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 22337418  T
Q  275 agagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 373  Q
    |||| | |||||||| |||| | |||||||||||| | |||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  22337417 agagagtcttgttaggtttttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattataattt 22337318  T
Q  374 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 472  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||  |||     
T  22337317 gtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgc 22337218  T
Q  473 aattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    | |||||||||||||||||   |||| || ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22337217 atttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 22337119  T
Q  570 atgt 573  Q
    ||||    
T  22337118 atgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 84 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 27754078 - 27753728
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27754078 cagatagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctcaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 27753979  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27753978 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaa 27753879  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | | || ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||     
T  27753878 acagagtgccttgttagattttgcgaccttcgttgcacgagttgtcgagagttgaagcttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataata 27753779  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat 423  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27753778 tgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgat 27753728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 99 - 556
Target Start/End: Original strand, 32451562 - 32452033
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  32451562 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacatg 32451661  T
Q  199 gaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 287  Q
    |||           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32451662 gaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 32451761  T
Q  288 agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataa 387  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |  || |  ||||||| ||| ||||||||||| ||     
T  32451762 agattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctgt-tat 32451860  T
Q  388 gatatgttgttgatga-ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg-ttgatgaattgaaattgatattatt 485  Q
    |  |||||  || ||| |||||||||||||| |||  || |||||||||||||  ||  || |||  | ||||| ||| ||  |||  ||||||||| ||    
T  32451861 gggatgttaatgttgatttatgatgtgatattatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttg-cattgatattgtt 32451959  T
Q  486 atgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 556  Q
    ||||||||   || ||| || ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32451960 atgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 272 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 23060815 - 23060513
Alignment:
Q  272 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 371  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||||  | |||||| |||  |||||||| || | ||||||||||||    
T  23060815 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgtt-cacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 23060717  T
Q  372 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 470  Q
     ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||||||| ||| ||    
T  23060716 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 23060618  T
Q  471 gaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23060617 gcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 23060519  T
Q  568 tgatgt 573  Q
    ||||||    
T  23060518 tgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 191
Target Start/End: Original strand, 28291920 - 28292027
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  28291920 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaagaatgattaggaaagaatgtaga 28292019  T
Q  184 atgagatt 191  Q
    ||||||||    
T  28292020 atgagatt 28292027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 456 - 573
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23103497  T
Q  555 atgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23103498 atgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 197
Target Start/End: Original strand, 22133848 - 22133948
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  22133848 agatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 22133947  T
Q  197 t 197  Q
    |    
T  22133948 t 22133948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 117 - 262
Target Start/End: Original strand, 23071614 - 23071768
Alignment:
Q  117 ttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg----------gaattaaa 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          |||| |||    
T  23071614 ttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaa 23071713  T
Q  207 cttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
     ||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23071714 atttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 23071768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25176331 - 25176227
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||  |||||||||||||    
T  25176331 gatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaaggttggagattgagattgaacct 25176232  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  25176231 ggaat 25176227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 554
Target Start/End: Original strand, 23708383 - 23708721
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgctcaagttgtc 318  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| || | ||||||     
T  23708383 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttacccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgtt 23708481  T
Q  319 gagagttgaacccttgggtaggatt-aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt-ataagatatgttgttgatgattatgatgtgata 416  Q
    || ||||||||| | |||| | | | |||| ||  | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| || || |||| ||||||||    
T  23708482 gatagttgaaccttggggtcgtaatgaaga-ttgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgata 23708580  T
Q  417 taatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgt 513  Q
    ||||  | |||||||||||||||  ||||||| ||   | |||||| ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||    
T  23708581 taattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgt 23708680  T
Q  514 tgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708681 tgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaag 23708721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 456 - 557
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7838
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  554 gatg 557  Q
    ||||    
T  7835 gatg 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 19671928 - 19671830
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19671928 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 22105560 - 22105412
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  22105560 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 22105461  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22105460 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072070
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 369 - 569
Target Start/End: Original strand, 40622123 - 40622327
Alignment:
Q  369 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatt-----tgtatacataagatgttg 463  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  40622123 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacataagatgttg 40622221  T
Q  464 atgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 561  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |    
T  40622222 atgaattg-aattgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatta 40622319  T
Q  562 agatgatg 569  Q
    ||||||||    
T  40622320 agatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 500 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207293
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 23207293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28406436 - 28406368
Alignment:
Q  130 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  28406436 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagattggagaatgagattgaacctg 28406368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 457 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 7679702 - 7679589
Alignment:
Q  457 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  7679702 gatgttgatgactt-acattgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 7679604  T
Q  555 atgttgaagatgatg 569  Q
     || | |||||||||    
T  7679603 ttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 497 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946657
Alignment:
Q  497 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520298
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20520298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 151
Target Start/End: Original strand, 23100849 - 23100916
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  23100849 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaacctcagatgtttttaagtgcctgaa 23100916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 26505526 - 26505379
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||    
T  26505526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26505428  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26505427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 26508004 - 26507857
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||    
T  26508004 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26507906  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26507905 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 501 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405981
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 500 - 557
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413243
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22413243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 567
Target Start/End: Original strand, 21155075 - 21155219
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21155075 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21155173  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  21155174 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 509 - 573
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  509 tatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175854
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 572
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 572  Q
    || | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  32215021 gc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 18809090 - 18808943
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18809090 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18808992  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18808991 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 501 - 572
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134326
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 572  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004764
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 23004764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 23131009 - 23130862
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23131009 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23130911  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23130910 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 23133476 - 23133329
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23133476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23133378  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23133377 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 23135737 - 23135590
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23135737 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23135639  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23135638 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 23709547 - 23709694
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23709547 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23709645  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23709646 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 23712028 - 23712175
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23712028 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23712126  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23712127 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108903
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 25108903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 34402537 - 34402684
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34402537 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34402635  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34402636 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 39682460 - 39682313
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  39682460 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39682362  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39682361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24503587 - 24503473
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24503587 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 24503488  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  24503487 gacaagattgaacct 24503473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 22460844 - 22460999
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  22460844 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 22460942  T
Q  208 ttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22460943 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22460999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24658116 - 24658055
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  24658116 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 24658055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 571493 - 571397
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  571493 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 6726091 - 6725995
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6726091 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 502 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287378
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 23287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 199
Target Start/End: Original strand, 25963359 - 25963451
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  || ||| ||||||||||||||||    
T  25963359 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacctgg 25963451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791289
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 23791289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 24367921 - 24367790
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24367921 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24367823  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367822 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24367790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 503 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392397
Alignment:
Q  503 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 26392397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 45029869 - 45030016
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||  | ||||| ||||    
T  45029869 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgttgtt 45029967  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45029968 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 170
Target Start/End: Original strand, 22811553 - 22811639
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22811553 cagagagcatgttaaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttaggtgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 22811639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 475 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 43137395 - 43137301
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| | | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43137395 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 554
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18787005
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Original strand, 22740579 - 22740664
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||||| ||||||  ||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  22740579 cagagagcatgtaagattatgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 22740664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Original strand, 22758334 - 22758419
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||||| ||||||  ||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  22758334 cagagagcatgtaagattatgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 22758419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27263703 - 27263610
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |  |||||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  27263703 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa 27263610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 19928156 - 19928311
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  19928156 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacc 19928254  T
Q  208 tt-gt-gggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    || || |||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19928255 ttagtcgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19928311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 175
Target Start/End: Original strand, 23708252 - 23708328
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag 175  Q
    |||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||    
T  23708252 atttcgtagttttgacccttgagttgatctttagatgtttttgagtgtctgaacatatgtattaatgattaggaaag 23708328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 24898210 - 24898358
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24898210 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24898308  T
Q  521 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24898309 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 24900693 - 24900841
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24900693 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24900791  T
Q  521 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24900792 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 24903170 - 24903318
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24903170 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24903268  T
Q  521 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24903269 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 24905647 - 24905795
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24905647 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24905745  T
Q  521 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24905746 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 24908122 - 24908270
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24908122 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24908220  T
Q  521 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24908221 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12829545 - 12829434
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  12829545 agagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 12829446  T
Q  185 tgagattgaacc 196  Q
    | ||||||||||    
T  12829445 tcagattgaacc 12829434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Original strand, 21917958 - 21918021
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21917958 attttgacttttgagtttaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 21918021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 261
Target Start/End: Original strand, 22133977 - 22134020
Alignment:
Q  218 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 261  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22133977 ctgaactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 22134020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 262
Target Start/End: Original strand, 22740717 - 22740768
Alignment:
Q  211 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22740717 tgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22740768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697712
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatg 24697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 32039513 - 32039660
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||| |||||    
T  32039513 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt 32039611  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  32039612 -gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 37525141 - 37525078
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  37525141 attttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 37525078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 196
Target Start/End: Original strand, 21138903 - 21139013
Alignment:
Q  86 gagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||     
T  21138903 gagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtatgac 21139002  T
Q  186 gagattgaacc 196  Q
     ||||||||||    
T  21139003 aagattgaacc 21139013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 22798769 - 22798831
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22798769 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 22798831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 175
Target Start/End: Original strand, 39827602 - 39827648
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag 175  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39827602 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaag 39827648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23207812 - 23207744
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  23207812 ttagatgattatgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 23207744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Original strand, 24529595 - 24529691
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24529595 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 567
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643109
Alignment:
Q  511 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 148
Target Start/End: Original strand, 24654996 - 24655032
Alignment:
Q  112 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24654996 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 24655032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40428936 - 40428892
Alignment:
Q  100 tttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40428936 tttcgtgttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 40428892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Original strand, 45677798 - 45677838
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  45677798 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 45677838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Original strand, 12901286 - 12901321
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12901286 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12901321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23171460 - 23171413
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  23171460 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 23171413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23582717 - 23582670
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  23582717 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 23582670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Original strand, 24628252 - 24628287
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24628252 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24628287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24649689 - 24649654
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24649689 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24649654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Original strand, 27379206 - 27379241
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27379206 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27379241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Original strand, 27383252 - 27383287
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27383252 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27383287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27602129 - 27602094
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27602129 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27602094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Original strand, 41530783 - 41530818
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41530783 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 41530818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 151
Target Start/End: Original strand, 44369918 - 44369985
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  44369918 cagagagcatgttggatttcgtgattttaagctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 44369985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 504 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 9241994 - 9241941
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9241994 ctgcctatgttgctgtt-gtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 9241941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 199
Target Start/End: Original strand, 22412722 - 22412792
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  22412722 ttagatgattctgagtgcctgaacatgtatgataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 22412792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23005263 - 23005221
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23005263 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 23005221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 454 - 500
Target Start/End: Original strand, 23019706 - 23019752
Alignment:
Q  454 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 500  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23019706 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgttgttgt 23019752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23038518 - 23038468
Alignment:
Q  101 ttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  23038518 ttcgtaattttgacttttgagatgaaccttagatgttgttgagtgcctgaa 23038468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26125655 - 26125562
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |  ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  26125655 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactaatgattagggaacgaatg-agaatgagattgaacctggaa 26125562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27197302 - 27197248
Alignment:
Q  143 gtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  27197302 gtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 27197248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28406335 - 28406297
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 259  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28406335 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 28406297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 34137454 - 34137412
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34137454 ttagatggttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 34137412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Original strand, 21146918 - 21147031
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||| ||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  21146918 gcagagagcttgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctggacatacctagtaatgattatgaatgaatgtag 21147017  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    ||  ||||||||||    
T  21147018 gacaagattgaacc 21147031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25176199 - 25176158
Alignment:
Q  220 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 261  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  25176199 gacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 25176158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 184
Target Start/End: Original strand, 30970608 - 30970709
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  30970608 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 30970707  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  30970708 ga 30970709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 145
Target Start/End: Original strand, 40621851 - 40621888
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtg 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  40621851 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 40621888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Original strand, 7330 - 7378
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatt 168  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  7330 agttgatctttagatgattctgagtgcctgaacaagtataataatgatt 7378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23187527 - 23187491
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23187527 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23187491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23598790 - 23598754
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23598790 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23598754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24175259 - 24175227
Alignment:
Q  112 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24175259 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 24175227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24674052 - 24674012
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  24674052 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttaagtgcct 24674012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24870339 - 24870307
Alignment:
Q  112 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24870339 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 24870307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29233992 - 29233904
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  29233992 agattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 29233904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29347291 - 29347203
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  29347291 agattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 29347203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31756268 - 31756232
Alignment:
Q  226 aactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31756268 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 31756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37318700 - 37318652
Alignment:
Q  135 gcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37318700 gcttatgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 37318652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41667401 - 41667365
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41667401 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 41667365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 32553 - 32067
Alignment:
Q  87 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 186  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  32553 agagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgactaggaaagaatgtgggatg 32454  T
Q  187 agattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  32453 agattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacttgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagttactttt 32354  T
Q  287 tagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtata 386  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32353 ttgattttgcgacctttgttgctctagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtata 32254  T
Q  387 agatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattatta 486  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32253 agatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattatta 32154  T
Q  487 tgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32153 tgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 176)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 40443880 - 40443393
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40443880 cagaaagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagg 40443781  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443780 atgagattgaacctggaattaa-cttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 40443682  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    | || |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40443681 tattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgt 40443582  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443581 ataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatatta 40443482  T
Q  484 ttatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443481 ttatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 27847462 - 27847951
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27847462 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatttagg 27847561  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27847562 atgagattgaacctggaattaaacttatgggattttgacctgaactcgccacggcaagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgact 27847661  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||     
T  27847662 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctga 27847761  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27847762 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 27847861  T
Q  484 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847862 ttatgtcatactgttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 16385876 - 16386369
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385876 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 16385975  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385976 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagtggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 16386075  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16386076 tgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtccagagttgaacctttgggtaacattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgt 16386175  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 482  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  | | |||| |||  ||||||||||||||| |  |||||||||     
T  16386176 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatata 16386275  T
Q  483 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
     |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16386276 tttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 9509692 - 9509189
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509692 cagagagcatgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 9509593  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509592 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgaggagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 9509493  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  9509492 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatc 9509393  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  9509392 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 9509293  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9509292 caattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 9509194  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  9509193 gatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 12699335 - 12698831
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12699335 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 12699236  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    |||| |||||||||||||           | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12699235 atgaaattgaacctggaaagattgttgaatgaaactcgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcacctcgtgagtgacccagaa 12699136  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |  | |||||||||||||    
T  12699135 acaaagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgatagttgaaccttggggtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatc 12699036  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  12699035 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 12698936  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
     ||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12698935 caattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 12698837  T
Q  568 tgatgt 573  Q
    ||||||    
T  12698836 tgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 26212488 - 26211995
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  26212488 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggtaagaatgtagg 26212389  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag-aaacagagtgac 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  26212388 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgat 26212289  T
Q  283 ttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 382  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  26212288 ttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctg 26212190  T
Q  383 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatat 481  Q
    | |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26212189 tttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatat 26212090  T
Q  482 tattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag-atgatgatgt 573  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26212089 tattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 38227982 - 38227481
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38227982 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaa 38227883  T
Q  185 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 274  Q
    |||||||||||||||||          | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38227882 tgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccataaac 38227783  T
Q  275 agagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 373  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  38227782 agagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatat 38227683  T
Q  374 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 472  Q
    |||||| | | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||     
T  38227682 gtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgc 38227583  T
Q  473 aattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  38227582 atttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatga 38227484  T
Q  571 tgt 573  Q
    |||    
T  38227483 tgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 84 - 570
Target Start/End: Original strand, 3563982 - 3564482
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3563982 cagagagcttgcaagatttcgttattttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 3564081  T
Q  184 atgagattgaacctgga----------attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||||||||||||||||          | | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3564082 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacagcgagcaaatgctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 3564181  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| |    
T  3564182 cagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacc 3564281  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    | ||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||     
T  3564282 tatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgactta 3564381  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3564382 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3564480  T
Q  569 ga 570  Q
    ||    
T  3564481 ga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 228 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 10589386 - 10589039
Alignment:
Q  228 ctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttga 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||     
T  10589386 ctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttttttgcacgagttgtctagagttgg 10589287  T
Q  328 acccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg 427  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10589286 acctttgggtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatg 10589187  T
Q  428 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 524  Q
    |||| ||||||||||||||| | |   ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10589186 cattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctg-ttgtt 10589088  T
Q  525 aattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  10589087 atttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 84 - 554
Target Start/End: Original strand, 15143654 - 15144139
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgactttt-gagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15143654 cagagaacttgcgagatttcgtgattttgactttttgagttgtaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattttag 15143753  T
Q  183 gatgagattgaacctggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
     ||||||||||||||||||     |||     ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15143754 aatgagattgaacctggaaagattttagaatgaacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaa 15143853  T
Q  273 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 371  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||   |||||| | ||||||||||| || | ||| | ||||||    
T  15143854 acagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagttgaacctcggggtagtactaagacttaatgatgatgtttaatataat 15143953  T
Q  372 ctgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaat 469  Q
    |||| |||||| | |||||| | |||    ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| ||  ||   ||||||| | |||||||| ||  |    
T  15143954 ctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggct 15144053  T
Q  470 tgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    || | |||||||||| || ||    |||| ||| ||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144054 tgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactg-agatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15144139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 570
Target Start/End: Original strand, 17061593 - 17062077
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17061593 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 17061692  T
Q  199 -----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 287  Q
               |||| |||||| || || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||| || ||||||    
T  17061693 gatagattttagaataaaactt-tgagaatctgacctgaactcgcgatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatg-cttgtt 17061790  T
Q  288 --agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtag-gattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg-t 383  Q
       |||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||| | ||||||  || || | |||   ||||  ||||| || ||||||||||||| |    
T  17061791 taggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccatggggtagttatgaata-ttacatataatattaataatgatctgtgaagctgat 17061889  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 482  Q
     || |||   ||| || || ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| |  |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||    
T  17061890 ttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatatt 17061988  T
Q  483 attatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||||||   | |||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17061989 attatgtcatgctattttgtatactg-ctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Original strand, 2831924 - 2832110
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2831924 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 2832023  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| |||    |||     |||||  | || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2832024 atgagattgaacctagaaagacttagaatgaactttggagaatctga-ctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 2832110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 9751168 - 9751285
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9751168 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 9751267  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  9751268 atgaggttgaacctggaa 9751285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 361 - 570
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  361 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 459  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  460 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  558 ttgaagatgatga 570  Q
     | ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Original strand, 28504919 - 28505106
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28504919 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 28505018  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||||          |||| ||| ||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28505019 atgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 28505106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 258
Target Start/End: Original strand, 39267264 - 39267447
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39267264 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 39267363  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 258  Q
    ||||||||||||||||||          | ||||||  | || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39267364 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 39267447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 99 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 44116992 - 44116816
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc-- 196  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  44116992 atttcgtaattttgactcttgagttgatccttatatgcctttgagtccctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacccg 44116893  T
Q  197 --------tggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgac 266  Q
            | |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116892 gaaagatttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgac 44116816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Original strand, 12756350 - 12756523
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12756350 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 12756449  T
Q  199 ga---------attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    ||         | | ||||| | |||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12756450 gattatttaagaatgaactttttggaagctgacctgaactcaccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 12756523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 15754505 - 15754622
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15754505 cagagagcatgcaagatttcgaatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtaga 15754604  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15754605 atgagattgaacctggaa 15754622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18302681 - 18302564
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18302681 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggaaagaatgtagg 18302582  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18302581 atgagattgaacctggaa 18302564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34201286 - 34201172
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||     
T  34201286 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgatcaagaaagaatttaga 34201187  T
Q  184 atgagattgaacctg 198  Q
    |||||||||||||||    
T  34201186 atgagattgaacctg 34201172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44014664 - 44014560
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  44014664 agatttcgtaattttgacttttgagttgatacttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 44014565  T
Q  197 tggaa 201  Q
    |||||    
T  44014564 tggaa 44014560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 810760 - 810864
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  810760 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaataagattgaacc 810859  T
Q  197 tggaa 201  Q
    |||||    
T  810860 tggaa 810864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 176
Target Start/End: Original strand, 11995676 - 11995768
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 176  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995676 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 11995768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 68236 - 68131
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  68236 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgttttcgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacc 68137  T
Q  197 tggaat 202  Q
    ||||||    
T  68136 tggaat 68131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 16495500 - 16495402
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495500 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18006131 - 18006052
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18006131 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaaga 18006052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505419
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 34200884 - 34200786
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200884 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 424 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 13647476 - 13647325
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  13647476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 13647377  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13647376 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 478 - 573
Target Start/End: Original strand, 11996051 - 11996148
Alignment:
Q  478 atattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11996051 atattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 404 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  404 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---g 499  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  ||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16213752 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 47832297 - 47832193
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||    
T  47832297 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattaagattgaatct 47832198  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  47832197 ggaat 47832193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 369 - 569
Target Start/End: Original strand, 17137978 - 17138177
Alignment:
Q  369 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 468  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17137978 aatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 17138076  T
Q  469 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 566  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  |||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  17138077 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 17138174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67745
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16324495 - 16324391
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  16324495 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttgaatgtttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagtttgagattgaacct 16324396  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  16324395 ggaat 16324391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 456 - 554
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280221
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 2280220  T
Q  554 g 554  Q
    |    
T  2280221 g 2280221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 369 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 12187218 - 12187115
Alignment:
Q  369 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 468  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||   | ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12187218 aatctgtgaagctg-ataagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 12187120  T
Q  469 ttgaa 473  Q
    |||||    
T  12187119 ttgaa 12187115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 454 - 573
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219835
Alignment:
Q  454 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 551  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  552 aagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  16219817 aa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 151
Target Start/End: Original strand, 19649103 - 19649170
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19649103 cagagagcatgcaagatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 19649170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 456 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 552  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T
Q  553 agatgttgaagatgatga 570  Q
    || || | ||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 202
Target Start/End: Original strand, 21064780 - 21064898
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||  | |||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||     
T  21064780 cagagagcttgcaagattttgtgattttgagctgtgagtttaaccttagatgtttatgagggcctgaacatgtacaataatgattaggaaatattttaga 21064879  T
Q  184 atgagattgaacctggaat 202  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  21064880 atgagattgaacttggaat 21064898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 24704832 - 24704688
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 523  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||||||||| ||    
T  24704832 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gt 24704735  T
Q  524 taattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24704734 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811248
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Original strand, 16219348 - 16219452
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  16219348 gatttcataattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctaaacttgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacct 16219447  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  16219448 ggaat 16219452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014182
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2760613 - 2760542
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  2760613 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattag 2760542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3272273 - 3272202
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  3272273 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattag 3272202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 10063841 - 10063939
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||    
T  10063841 gatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 15754910 - 15755008
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15754910 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 24702385 - 24702238
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24702385 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24702287  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24702286 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 455 - 520
Target Start/End: Original strand, 2530139 - 2530205
Alignment:
Q  455 aagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  2530139 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgttgcctatgttgctgtt 2530205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 202
Target Start/End: Original strand, 9389337 - 9389431
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  9389337 ttttgacttttaagttgaaccttggatgtttttgagtgtctggacttgtataatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaat 9389431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 424 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 18430859 - 18430709
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||  | ||||||||||    
T  18430859 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt 18430761  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18430760 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 44407988 - 44408102
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||| ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44407988 gcagagagcatgtaagattttgaaatttcgactttttagttgaaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 44408087  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  44408088 gacaagattgaacct 44408102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 202
Target Start/End: Original strand, 12255454 - 12255527
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  12255454 ttagatgattttgagtgcttgaacatgtataataatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaat 12255527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 497 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901342
Alignment:
Q  497 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 12901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24054969 - 24054884
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  24054969 cagagtgcatgcaagattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 24054884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 502 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044765
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14044765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 502 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354795
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14354795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 44116605 - 44116509
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44116605 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 456468 - 456321
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  456468 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 456370  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  456369 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 11972643 - 11972496
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  11972643 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11972545  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11972544 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 14949137 - 14949284
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  14949137 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 14949235  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14949236 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 15376728 - 15376875
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15376728 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15376826  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15376827 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 456 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056347
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 16232667 - 16232520
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  16232667 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16232569  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16232568 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 18640419 - 18640272
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18640419 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18640321  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18640320 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 19486767 - 19486865
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  19486767 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220293
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatg 20220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 20385138 - 20385285
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20385138 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20385236  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20385237 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 21189610 - 21189757
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21189610 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21189708  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21189709 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22073376 - 22073301
Alignment:
Q  127 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||    
T  22073376 ccttagaggtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctagaat 22073301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 24275318 - 24275187
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  24275318 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 24275220  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275219 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 32125638 - 32125491
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  32125638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 32125540  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32125539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 41523064 - 41522917
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  41523064 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41522966  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41522965 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 41525526 - 41525379
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  41525526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41525428  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41525427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 500 - 554
Target Start/End: Original strand, 1868043 - 1868097
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868043 tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 2279772 - 2279850
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  2279772 agttgatatttagatgattttgagtgcctgaacatgcataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctg 2279850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 424 - 569
Target Start/End: Original strand, 11393302 - 11393448
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  11393302 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11393400  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  11393401 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14953674 - 14953560
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14953674 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14953575  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  14953574 gacaagattgaacct 14953560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26420454 - 26420340
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26420454 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 26420355  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  26420354 gacaagattgaacct 26420340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 557
Target Start/End: Original strand, 15008547 - 15008604
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15008547 tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 15008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 151
Target Start/End: Original strand, 18154469 - 18154522
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18154469 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 18154522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991196
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgatccaagatg 48991196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 16410155 - 16410059
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16410155 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 505 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22072981 - 22072913
Alignment:
Q  505 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  22072981 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 502 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 502 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 27217007 - 27216860
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  27217007 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 27216909  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  27216908 -gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14959640 - 14959526
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| |||||||    |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14959640 gcagagagcatgtaagatttttcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14959541  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  14959540 gacaagattgaacct 14959526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 17137706 - 17137768
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  17137706 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 17137768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 10508725 - 10508786
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  10508725 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 10508786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11880729 - 11880668
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  11880729 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 11880668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12187490 - 12187429
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  12187490 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 12187429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13149606 - 13149451
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  13149606 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacc 13149508  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13149507 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 13149451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 13869442 - 13869346
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13869442 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16056684 - 16056616
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag 289  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||    
T  16056684 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgccttgttag 16056616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Original strand, 2529631 - 2529682
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2529631 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 2529682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386333
Alignment:
Q  511 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15211903 - 15211844
Alignment:
Q  110 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  15211903 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttataaatgatta 15211844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18302533 - 18302494
Alignment:
Q  223 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18302533 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 18302494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Original strand, 810894 - 810936
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  810894 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 810936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 551
Target Start/End: Original strand, 12255842 - 12255892
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 551  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14149046 - 14148932
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| |||||||    |||| ||||||| |||||  ||||   ||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14149046 gcagagagcatgtaagatttttcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14148947  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  14148946 gacaagattgaacct 14148932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16056795 - 16056713
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    |||||| | |||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  16056795 agttgagctttaggtgattttgtgtacctgaacatgtataataatgaataggaaagattttagattgagattgaacctggaat 16056713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 554
Target Start/End: Original strand, 18154882 - 18154943
Alignment:
Q  492 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18154882 tgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 18154943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Original strand, 20702651 - 20702733
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20702651 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 20702733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32768120 - 32768038
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32768120 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 32768038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Original strand, 4318174 - 4318287
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||  ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  4318174 gcagagagcatgttagattttgtattttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatggatgtag 4318273  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    ||  ||||||||||    
T  4318274 gacaagattgaacc 4318287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6801664 - 6801509
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| |  |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  6801664 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctacttttgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacc 6801566  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6801565 ttagttgggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 6801509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11262804 - 11262691
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   |||  |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11262804 cagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgccattgaatgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 11262705  T
Q  184 atgagattgaacct 197  Q
    |  |||||||||||    
T  11262704 acaagattgaacct 11262691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 197
Target Start/End: Original strand, 11547953 - 11548010
Alignment:
Q  140 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  11547953 tgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaaaagattgaacct 11548010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 197
Target Start/End: Original strand, 11554549 - 11554606
Alignment:
Q  140 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  11554549 tgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaaaagattgaacct 11554606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 478 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 13831466 - 13831373
Alignment:
Q  478 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| ||  ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  13831466 atattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14045281 - 14045212
Alignment:
Q  130 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  14045281 tagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 14045212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14355311 - 14355242
Alignment:
Q  130 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  14355311 tagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 14355242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14430356 - 14430315
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14430356 attttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgcct 14430315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22073272 - 22073223
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 270  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22073272 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttacccag 22073223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26292847 - 26292692
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  || |    
T  26292847 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caacc 26292749  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  26292748 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgag 26292692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 42205567 - 42205530
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42205567 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 42205530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4993989 - 4993917
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 156  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  4993989 cagagagcttgcaagatctcgtgattttgagctgtgagtttaaccttagatgtttatgagggcctgaacatgt 4993917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8917878 - 8917842
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8917878 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 8917842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 9703743 - 9703703
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9703743 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 9703703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13462213 - 13462177
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13462213 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 13462177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15581144 - 15581108
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15581144 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15581108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 15604926 - 15604962
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15604926 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15604962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 262
Target Start/End: Original strand, 9389462 - 9389501
Alignment:
Q  223 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9389462 ctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 9389501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 262
Target Start/End: Original strand, 9751316 - 9751355
Alignment:
Q  223 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9751316 ctgaactcgccatggtgagcagaggctctcgcctcgcgag 9751355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 185
Target Start/End: Original strand, 11238655 - 11238702
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  11238655 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 11238702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 262
Target Start/End: Original strand, 11995796 - 11995835
Alignment:
Q  223 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11995796 ctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgag 11995835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12692917 - 12692858
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  12692917 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtcggacaagattgaacct 12692858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12719001 - 12718966
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12719001 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12718966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12723912 - 12723877
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12723912 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12723877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12901852 - 12901793
Alignment:
Q  140 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  12901852 tgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 12901793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 15211703 - 15211484
Alignment:
Q  320 agagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataa 419  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||| |  || || ||||||||||| ||||||          |||||||||||||||||||    
T  15211703 agagttgaacctttgggtagctttaagacttaataatgacgtttaagatgatatgtgaagctgtttaagat----------tgattatgatgtgatataa 15211614  T
Q  420 tgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt----atactgcctatgtt 514  Q
    || | ||| |||  |||||||  |  ||| |||  | |||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||| ||||||    || ||||||||| |    
T  15211613 tgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgct 15211515  T
Q  515 gctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 546  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15211514 gctgtt-gttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 262
Target Start/End: Original strand, 16438792 - 16438843
Alignment:
Q  211 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16438792 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16438843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Original strand, 16906974 - 16907009
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16906974 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16907009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 262
Target Start/End: Original strand, 17137820 - 17137871
Alignment:
Q  211 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17137820 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17137871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203828
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcgatctaagatg 18203828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18279736 - 18279701
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18279736 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18279701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18283699 - 18283664
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18283699 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18283664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34201138 - 34201099
Alignment:
Q  223 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34201138 ctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 34201099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 68099 - 68061
Alignment:
Q  224 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  68099 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 68061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 195
Target Start/End: Original strand, 9177252 - 9177318
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  9177252 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattaggtaagtttttagattgagattgaac 9177318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 171
Target Start/End: Original strand, 11768526 - 11768568
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11768526 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 11768568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Original strand, 12255556 - 12255598
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12255556 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 12255598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 12321385 - 12321447
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12321385 ttttgacttttgagttgaaccttagacgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 12321447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16275943 - 16275850
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||||||    
T  16275943 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagggaacgaatg-gggatgatattgaacctggaa 16275850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 197
Target Start/End: Original strand, 25038895 - 25038953
Alignment:
Q  139 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  25038895 ttgagtgcctgaacatacctagaaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 25038953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35366727 - 35366609
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |  | |||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||||   | |||||||||| ||   | |||     
T  35366727 cagagagcttgcaagatttcgtgtttttaagctgtgagtttaaccttggatgtttttgagggcctgaacatgtactacaatgattaggcaaagttttaga 35366628  T
Q  184 atgagattgaacctggaat 202  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  35366627 atgagattgaacttggaat 35366609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 196
Target Start/End: Original strand, 70438 - 70507
Alignment:
Q  127 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  70438 ccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 70507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 196
Target Start/End: Original strand, 74546 - 74615
Alignment:
Q  127 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  74546 ccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 74615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 199
Target Start/End: Original strand, 1867650 - 1867719
Alignment:
Q  130 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  1867650 tagatgttttttagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 1867719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 184
Target Start/End: Original strand, 6016800 - 6016901
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  6016800 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 6016899  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  6016900 ga 6016901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9593797 - 9593704
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  9593797 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaa 9593704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9644760 - 9644667
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  9644760 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaa 9644667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 14194766 - 14194729
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatg 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14194766 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatg 14194729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 185
Target Start/End: Original strand, 14655082 - 14655147
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||||| ||||  |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  14655082 agttgaaccttgcatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 14655147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 170
Target Start/End: Original strand, 15008107 - 15008148
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15008107 ttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattag 15008148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18531665 - 18531608
Alignment:
Q  139 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  18531665 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacc 18531608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 44014530 - 44014489
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  44014530 acctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 44014489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 11044 - 11080
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11044 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 18712 - 18748
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18712 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11313100 - 11313064
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11313100 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11313064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11987664 - 11987628
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11987664 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11987628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12318579 - 12318543
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12318579 ttttgacttttgagttgaacattagatgcttttgagt 12318543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 13635123 - 13635159
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13635123 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 13635159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15728776 - 15728740
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15728776 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15728740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16583686 - 16583650
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16583686 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16583650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 16724285 - 16724321
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16724285 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16724321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 17701299 - 17701335
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17701299 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 17701335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35152057 - 35152021
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35152057 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 35152021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 15094 - 15584
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15094 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttaagttgaaccgtagatgcttttgagtgccttaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 15193  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15194 atgagattgaacctggaataaaacttgtaggattctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 15293  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgactcgttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 15393  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15394 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 15493  T
Q  484 ttatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15494 ttatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 158
Target Start/End: Original strand, 32894 - 32968
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtct 158  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32894 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgaatgcctgaacatgtct 32968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 405 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 7459 - 7295
Alignment:
Q  405 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattg-at-attattatgtcatgttgttgtat 502  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||   ||||||||||     
T  7459 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttgtataattatcatg-attgttgttgtaa 7361  T
Q  503 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
     ||||||||||||||  |||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  7360 tctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7766 - 7705
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  7766 ttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 7705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 144)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 31971747 - 31971257
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31971747 cagagagcatgcaagatttcgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgtgtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtagg 31971648  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31971647 atgagattgaacctggaattaaacttgtgagattctgacctgaactcgccccggcgagcagaggctgtcacctcgcgagcgacccagaaatagagtgact 31971548  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  31971547 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagctgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgt 31971448  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31971447 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatatta 31971348  T
Q  484 ttatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31971347 ttatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 16199276 - 16199765
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16199276 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaacatgtcttataatgattaggaaagaatgtagg 16199375  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16199376 atgagattgaacctagaattaaact-gtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagacgctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgact 16199474  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16199475 tattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgt 16199574  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16199575 ataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatatta 16199674  T
Q  484 ttatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199675 ttatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 21918628 - 21919121
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21918628 cagacagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgctttggagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagg 21918727  T
Q  184 atgagattgaacctggaatt-aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac 282  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21918728 aagagattgaacctggaaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgac 21918827  T
Q  283 ttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||    
T  21918828 ttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacccttgggtaagattaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctg 21918927  T
Q  383 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaa-tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatat 481  Q
    | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21918928 tttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatat 21919027  T
Q  482 tattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21919028 tattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 45130649 - 45131117
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130649 cagagaccatgcaagatttcgtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 45130748  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130749 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaac----------------------tcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 45130826  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45130827 tattagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgt 45130926  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa-ttgaaattgatatt 482  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45130927 ataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatatt 45131026  T
Q  483 attatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131027 attatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 18878855 - 18879352
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18878855 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 18878954  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18878955 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccaagacgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 18879054  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| || |||||||||| || | ||||| |||||||    
T  18879055 acagagtgccttgttagattttgcggcctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcatcaagacttaatgatgatgttaactataatc 18879154  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat--gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 470  Q
    |||||||||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  18879155 tgtgaagctg-ataagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 18879252  T
Q  471 gaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    | |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18879253 gcaattgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 18879349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 20536711 - 20536208
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20536711 cagagagcatgcaagattttgtgattttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctgataatgattaggaaagaatgtagg 20536612  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536611 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttatgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 20536512  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  20536511 acagagtgacttattaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagtgttgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 20536412  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  20536411 tgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 20536312  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20536311 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 20536213  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  20536212 gatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 18818028 - 18818530
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18818028 cagagagcatgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtagg 18818127  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818128 atgagattgaacctggaaagattgtaaaatgaaacttttggt-ttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 18818226  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||   | |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  18818227 acagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaatttagggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 18818326  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||     
T  18818327 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactta 18818426  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18818427 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 18818525  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  18818526 gatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22627238 - 22626736
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22627238 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22627139  T
Q  184 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||||||||||||| |||  |          ||| | ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22627138 atgagattgaacctcgaaagattgtagaatgaacctttggaaatctgacccgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgatctagaaa 22627039  T
Q  274 cagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | |||||||||||||    
T  22627038 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatc 22626939  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  22626938 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttg 22626839  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
     | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22626838 tatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 22626740  T
Q  570 atgt 573  Q
    ||||    
T  22626739 atgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 21923546 - 21924049
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21923546 cagagagcatgtgagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggacagaatgtagg 21923645  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacc-tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    |||||||||||||||          |||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923646 atgagattgaacctgaaaagatttagaatgaaactttttggattctgaccctgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 21923745  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21923746 acagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcccgagtagttgagagttgaaccttgaggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatc 21923845  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  | |||| | | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  21923846 tgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 21923945  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     |||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21923946 caattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 21924044  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  21924045 gatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 23406884 - 23406379
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406884 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 23406785  T
Q  184 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||| |||||           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406784 atgagattggacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 23406685  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||||  | || ||  |||  |||||||| |  | ||||||||||||     
T  23406684 acagagtgccttgttaggttttgtgacctttgttgcacgagttattgagagttgaactttgggataatattgggacttaatgaggatgttaattataata 23406585  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg--ttgatgaat 469  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||   || ||| |    
T  23406584 tgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgact 23406485  T
Q  470 tgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 566  Q
    || ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23406484 tgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23406386  T
Q  567 atgatgt 573  Q
    |||||||    
T  23406385 atgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 85 - 572
Target Start/End: Original strand, 28648663 - 28649164
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28648663 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagga 28648762  T
Q  185 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 274  Q
    ||||||||||| |||||          | |||| | | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  28648763 tgagattgaacatggaaagatttagaatgaaaccttttgaattttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgccttgcgcatgacccagaaac 28648862  T
Q  275 agagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 373  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||| |    
T  28648863 agagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatat 28648962  T
Q  374 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 472  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||   ||||||  |||||||||| ||| |||     
T  28648963 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgc 28649062  T
Q  473 aattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28649063 atttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 28649161  T
Q  570 atg 572  Q
    |||    
T  28649162 atg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 85 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 6759759 - 6759255
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6759759 agagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaa 6759660  T
Q  185 tgagattgaacctggaatta-----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||| ||||| ||           ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759659 tgagattgaacttggaaatattttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 6759560  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | || ||| || |||||||   ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  6759559 cagagtgtcttgttaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 6759460  T
Q  373 tgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 470  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||  ||   ||||||  | ||||||   ||| ||    
T  6759459 tgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgt---tgactt 6759363  T
Q  471 gaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
    | | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6759362 gcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 6759264  T
Q  568 tgatgtcca 576  Q
    |||||||||    
T  6759263 tgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 85 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 23649055 - 23648554
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23649055 agagagcatgcaagatttcatgtttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgactgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 23648956  T
Q  185 tgagattgaacctg----------gaattaaac-ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||||||| |||||          |||| |||| || ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23648955 tgagattggacctgaaaagacttagaatgaaacattttggaattctgacc-gaactcgccatggcgatcagaggctctcgcctcgtgagtaacccagaaa 23648857  T
Q  274 cagagtgacttgttagattt-tgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||| || | |||||||||||||    
T  23648856 cagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatc 23648757  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  ||| |||  |||||||||| || ||||    
T  23648756 tgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattg 23648657  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     || |||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |    
T  23648656 caaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgtt 23648558  T
Q  569 gatg 572  Q
    ||||    
T  23648557 gatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 108 - 437
Target Start/End: Original strand, 25362793 - 25363123
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25362793 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgactgaacatgactaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaac 25362892  T
Q  208 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||    
T  25362893 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgagagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttcttg 25362992  T
Q  308 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 407  Q
    | | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  25362993 cacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattat 25363092  T
Q  408 gatgtgatataatg-attatgcattacttga 437  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  25363093 gatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 16091959 - 16092463
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16091959 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 16092058  T
Q  184 atgagattgaacctgga---att-------aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||||||| |||||| |   |||       |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16092059 atgagattaaacctgaaaagatttaaaaaaaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcccgagtgacccagaaa 16092158  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||| || |||  | ||||||||  ||||||||||| | |||||  ||| ||||||||  || | ||||||||||||     
T  16092159 cagagtgccctgttaggattttgcgatctgtgtcacacaagttgttaagagttgaaccttggggtaatattgagacttaaggatgatgttaattataata 16092258  T
Q  373 tgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 470  Q
    || |||| || | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  16092259 tgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 16092358  T
Q  471 gaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
    | | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16092359 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 16092457  T
Q  568 tgatgt 573  Q
    ||||||    
T  16092458 tgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22875568 - 22875065
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  22875568 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacctttgagttaatccttagatgcttttgagcgtctaaacatgtttaataatgattaggaaagattgtaga 22875469  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    | ||| ||||||||||||           | |||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22875468 acgaggttgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatgacgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 22875370  T
Q  273 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 371  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| || ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| |||  ||||  | | ||||||||||||    
T  22875369 acagagtgacttgttagggctttgcgatctatgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagatgtaatggtgatgttaattataat 22875270  T
Q  372 ctgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaat 469  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| |    
T  22875269 ctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgact 22875170  T
Q  470 tgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
    || | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  22875169 tgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctg-ctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatga 22875071  T
Q  568 tgatgt 573  Q
    ||||||    
T  22875070 tgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 99 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 7373237 - 7372778
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7373237 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgaaattgaacctg 7373138  T
Q  199 -----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 287  Q
               |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7373137 gaaagattgtagaatgaaacttgtgaaattctgacctgaactcgccacggc---------------------gagtgacccagaaacagagtgtcttgtt 7373059  T
Q  288 agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataa 387  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||| | | | ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  7373058 aggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtggtagtgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaa 7372959  T
Q  388 gatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat 487  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||||||||       ||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||    
T  7372958 gatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattat 7372866  T
Q  488 gtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7372865 gtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 360 - 573
Target Start/End: Original strand, 21389358 - 21389571
Alignment:
Q  360 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 459  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21389358 gttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21389457  T
Q  460 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 559  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21389557  T
Q  560 gaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||    
T  21389558 gaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 360 - 573
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396101
Alignment:
Q  360 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 459  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21395987  T
Q  460 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 559  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21396087  T
Q  560 gaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||    
T  21396088 gaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 360 - 573
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790594
Alignment:
Q  360 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 459  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21790480  T
Q  460 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 559  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21790580  T
Q  560 gaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||    
T  21790581 gaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 373 - 573
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 472  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  473 aattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 572  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21778896  T
Q  573 t 573  Q
    |    
T  21778897 t 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 84 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41598687 - 41598494
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  41598687 cagagagcttgcaggattccgtgattttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtaga 41598588  T
Q  184 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 267  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598587 atgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 41598494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Original strand, 5865895 - 5866082
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5865895 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 5865994  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||||          |||| ||| ||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5865995 atgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 5866082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21255722 - 21255605
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255722 cagagagcatgcaagatttcgcatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 21255623  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21255622 atgagattgaacctggaa 21255605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21491495 - 21491382
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21491495 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 21491396  T
Q  184 atgagattgaacct 197  Q
    ||||||||||||||    
T  21491395 atgagattgaacct 21491382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 84 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17141416 - 17141302
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17141416 cagagagcatgcaagattttgtattttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 17141317  T
Q  184 atgagattgaacctg 198  Q
    |||||||||||||||    
T  17141316 atgagattgaacctg 17141302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 84 - 202
Target Start/End: Original strand, 19801045 - 19801163
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||     
T  19801045 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcatatgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagactagaga 19801144  T
Q  184 atgagattgaacctggaat 202  Q
    || ||||||||||||||||    
T  19801145 ataagattgaacctggaat 19801163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21249884 - 21249767
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249884 cagagagcatgcaagatttcgcatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 21249785  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||| |||||||||||    
T  21249784 atgagactgaacctggaa 21249767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21674195 - 21674091
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21674195 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttggacgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 21674096  T
Q  197 tggaa 201  Q
    |||||    
T  21674095 tggaa 21674091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 26355329 - 26355433
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||    
T  26355329 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagagattgaagattgagattgaacc 26355428  T
Q  197 tggaa 201  Q
    |||||    
T  26355429 tggaa 26355433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 5866297 - 5866395
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866297 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 17141014 - 17140916
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17141014 gatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 478 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 21491092 - 21490995
Alignment:
Q  478 atattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491092 atattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Original strand, 38854883 - 38854987
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| |||||    
T  38854883 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattaagatttaacct 38854982  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  38854983 ggaat 38854987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 457 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520368
Alignment:
Q  457 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6520387  T
Q  555 atgttgaagatgatgatgt 573  Q
     || | |||||||||||||    
T  6520386 ttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Original strand, 21389071 - 21389156
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21389071 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 21389156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855372
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760962
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 477 - 566
Target Start/End: Original strand, 13508108 - 13508199
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 566  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13508108 gatattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 456 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 20498681 - 20498578
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20498681 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 20498582  T
Q  554 gatg 557  Q
    ||||    
T  20498581 gatg 20498578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 17612133 - 17612231
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  17612133 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 202
Target Start/End: Original strand, 23760481 - 23760576
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |   ||||||||||||||||||    
T  23760481 attttgacttttgagttgatccctgaatgtttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaatattggatattgagattgaacctggaat 23760576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353036
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 24353036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116363
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 37116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6520857 - 6520779
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 176  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6520857 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataataattaggaaaga 6520779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 500 - 557
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154992
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 19154992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 456 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285616
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaa 21285617  T
Q  554 g 554  Q
    |    
T  21285616 g 21285616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 21249483 - 21249384
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249483 gatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 21255321 - 21255222
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21255321 gatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 14409459 - 14409606
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  14409459 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 14409557  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14409558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267099
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17267099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 410 - 554
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413462
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413416 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16413462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39834311 - 39834217
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    ||||||| ||| ||| || ||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  39834311 ttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacttgtatgataatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaat 39834217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 501 - 554
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983508
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 477 - 566
Target Start/End: Original strand, 13597640 - 13597731
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 566  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13597640 gatattattatatcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Original strand, 16409889 - 16409989
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  || ||| |||||||||||||||    
T  16409889 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacctg 16409988  T
Q  199 g 199  Q
    |    
T  16409989 g 16409989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Original strand, 20046261 - 20046357
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20046261 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355815
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 1484549 - 1484402
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  1484549 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1484451  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1484450 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 5853307 - 5853454
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  5853307 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 5853405  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  5853406 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 170
Target Start/End: Original strand, 16860971 - 16861042
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  16860971 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 16861042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439612
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatg 17439612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 20403374 - 20403227
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20403374 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20403276  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20403275 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 195
Target Start/End: Original strand, 21414857 - 21414956
Alignment:
Q  96 aagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 195  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21414857 aagatttcggaatttttactttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcacactaatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 21414956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 22001900 - 22001753
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  22001900 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 22001802  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22001801 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20499139 - 20499049
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    |||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  20499139 ttttgacccttgagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggtaagtttttagattgagattgaacctg 20499049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20527926 - 20527812
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20527926 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 20527827  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  20527826 gacaagattgaacct 20527812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 148
Target Start/End: Original strand, 20856059 - 20856108
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20856059 atttcgtgattttgaattttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 20856108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 4483427 - 4483281
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  4483427 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 4483329  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4483328 -gtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Original strand, 15602659 - 15602722
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15602659 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 15602722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Original strand, 15611111 - 15611174
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15611111 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 15611174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 41598335 - 41598188
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||||||||||    
T  41598335 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 41598237  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41598236 -gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 22010322 - 22010384
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  22010322 ttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattag 22010384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19899571 - 19899510
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  19899571 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19899510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 377754 - 377714
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  377754 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 377714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Original strand, 15203297 - 15203393
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  15203297 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Original strand, 20465682 - 20465722
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20465682 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 20465722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 169
Target Start/End: Original strand, 21395630 - 21395686
Alignment:
Q  113 acttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21395630 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 21395686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 169
Target Start/End: Original strand, 21790123 - 21790179
Alignment:
Q  113 acttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21790123 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 21790179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542535
Alignment:
Q  511 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896265
Alignment:
Q  511 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Original strand, 13507663 - 13507713
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13507663 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 13507713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Original strand, 13597195 - 13597245
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13597195 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 13597245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 197
Target Start/End: Original strand, 16411911 - 16412001
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    | |||||||||| |||||||||||    
T  16411911 attttgacttttgagttgaaccttaaatgtttttgagtgccttaagatgtgtattaaagattaaatgataatgtaggatcagattgaacct 16412001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18865753 - 18865695
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18865753 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 18865695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 570
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225409
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29123531 - 29123449
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| |||| |||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29123531 ctttttagttggaccttggatgctttagagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 29123449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 30642934 - 30642996
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  30642934 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 30642996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17141266 - 17141229
Alignment:
Q  225 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17141266 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17141229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 17353580 - 17353641
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||| |||||    
T  17353580 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaagatgcctattaaagatta 17353641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 170
Target Start/End: Original strand, 17926355 - 17926412
Alignment:
Q  113 acttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  17926355 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 17926412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 475 - 557
Target Start/End: Original strand, 19801448 - 19801530
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | ||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19801448 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagatg 19801530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19976921 - 19976860
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  19976921 tttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19976860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19983569 - 19983508
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  19983569 tttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21249734 - 21249697
Alignment:
Q  225 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21249734 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21249697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 505 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673723
Alignment:
Q  505 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaag 21673723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23834625 - 23834532
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  23834625 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa 23834532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 24433891 - 24434046
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| |  ||||||||||| |||  || |    
T  24433891 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagtgaatgatttagaacaagattgaacctagaac-aacc 24433989  T
Q  208 ttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24433990 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 456 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 26219831 - 26219733
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  | ||  ||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26219831 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26219734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37116882 - 37116813
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  37116882 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 37116813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39834188 - 39834147
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39834188 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 39834147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 15070654 - 15070574
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070654 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15070574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 197
Target Start/End: Original strand, 17266579 - 17266647
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  17266579 ttagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 17266647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18619930 - 18619894
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18619930 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18619894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 520 - 576
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 576  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22029009 - 22028973
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22029009 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 22028973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 502 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525573
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22525573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 144
Target Start/End: Original strand, 39094587 - 39094631
Alignment:
Q  100 tttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39094587 tttcgtgttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 39094631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 554
Target Start/End: Original strand, 45290761 - 45290841
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290761 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45290841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15538796 - 15538745
Alignment:
Q  211 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15538796 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15538745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 199
Target Start/End: Original strand, 21168364 - 21168455
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||| || ||| ||||||   | ||  ||| ||||||||||||||||    
T  21168364 ttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttagaatgagattgaacctgg 21168455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43252145 - 43252110
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43252145 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 43252110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 982980 - 983058
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||  | |||  ||||||||||||||    
T  982980 agttgaactttagatgattttgagtgtctgaacatgtatattagtgattaggaaagtttttagattgagattgaacctg 983058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 170
Target Start/End: Original strand, 10829072 - 10829158
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| | || | |||| || |||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  10829072 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgagctgtgagtttaaccctggatgtttatgagagcctgaacatgtactataatgattag 10829158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 171
Target Start/End: Original strand, 17085770 - 17085804
Alignment:
Q  137 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17085770 ttttgagtgcctgaacatgtataataatgattagg 17085804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18855358 - 18855300
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||||||||||   || || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18855358 tttgagtgcctgaacatacgtagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 18855300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 169
Target Start/End: Original strand, 19259244 - 19259305
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  19259244 attttgacttttgagttgaaccttagatgc-tttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 19259305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 504 - 558
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502207
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgtt-gtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 20502207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 21161758 - 21161820
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21161758 ttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 21161820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24353550 - 24353488
Alignment:
Q  137 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  24353550 ttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 24353488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16185204 - 16185143
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  16185204 ttttgacttttgagttgaaccatagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 16185143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21255572 - 21255535
Alignment:
Q  225 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21255572 gaactcgccatggcgagcagcggctctcgcctcgcgag 21255535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 22113382 - 22113537
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || | | ||||||||||||||||||  || |    
T  22113382 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctggaa-caacc 22113480  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||  ||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22113481 ttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22113537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 22134885 - 22135040
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || | | ||||||||||||||||||  || |    
T  22134885 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctggaa-caacc 22134983  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||  ||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22134984 ttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22135040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 184
Target Start/End: Original strand, 26934805 - 26934906
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  26934805 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 26934904  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  26934905 ga 26934906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15532340 - 15532304
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15532340 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15532304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15538900 - 15538860
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  15538900 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 15538860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19111653 - 19111601
Alignment:
Q  133 atgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  19111653 atgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 19111601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19117944 - 19117892
Alignment:
Q  133 atgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  19117944 atgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 19117892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21674061 - 21674021
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 261  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  21674061 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 21674021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 262
Target Start/End: Original strand, 21972353 - 21972393
Alignment:
Q  222 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21972353 cctgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgcgag 21972393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 262
Target Start/End: Original strand, 21976438 - 21976478
Alignment:
Q  222 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21976438 cctgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgcgag 21976478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22057800 - 22057768
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgctttt 140  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22057800 ttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 22057768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 22166035 - 22166071
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22166035 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22166071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 23252416 - 23252452
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23252416 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23252452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Original strand, 23845412 - 23845512
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  ||||||  |  ||| ||||||| |||||  ||||  |||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23845412 gcagagagcatgttagattttttattttcgactttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 23845511  T
Q  183 g 183  Q
    |    
T  23845512 g 23845512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24756221 - 24756157
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||||||| | ||||  ||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24756221 cagagagcatgtaggattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 24756157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397566
Alignment:
Q  505 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgtt-gtctattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 28397566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 30308408 - 30308444
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30308408 ttttgatttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 30308444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32599130 - 32599094
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  32599130 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 32599094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32605662 - 32605626
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  32605662 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 32605626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37116704 - 37116664
Alignment:
Q  222 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37116704 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 37116664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Original strand, 38855015 - 38855055
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 261  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  38855015 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 38855055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 197
Target Start/End: Original strand, 40492438 - 40492506
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  40492438 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataagaatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 40492506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 13987 - 13497
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  13987 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtagc 13888  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13887 atgagattgaacctggaattaaacttgtgagattctgagctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgact 13788  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13787 tgttagattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttcggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgt 13688  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13687 ataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatatta 13588  T
Q  484 ttatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13587 tcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 155)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 14052932 - 14053422
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14052932 cagagagcatgcaagatt-cgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 14053030  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14053031 atgagattgaacttggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccagaaacagagtgact 14053130  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14053131 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgt 14053230  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag-atgttgatgaattgaaattgatatt 482  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14053231 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatatt 14053330  T
Q  483 attatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14053331 attatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 12903248 - 12902757
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12903248 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttt-gagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 12903150  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12903149 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctcccgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgcct 12903050  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12903049 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgt 12902950  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 482  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12902949 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatatt 12902850  T
Q  483 attatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12902849 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 7089366 - 7088877
Alignment:
Q  87 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 186  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089366 agagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcctatgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 7089267  T
Q  187 agattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgt 286  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7089266 agattgaacctggaatgaaacttatgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgtcttgt 7089167  T
Q  287 tagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtata 386  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7089166 tagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaacctttgagtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgttta 7089067  T
Q  387 agatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattatt 485  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7089066 agatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattatt 7088967  T
Q  486 atgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7088966 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 44053332 - 44052829
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44053332 cagagagcatgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattgggaaagaatgtagg 44053233  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||||||||| ||           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44053232 atgagattgaacctgtaaagattataggatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagagactctcgcctcgcgagtgacccagaa 44053133  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  44053132 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatc 44053033  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat--gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 470  Q
    ||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  44053032 tgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 44052934  T
Q  471 gaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
    | |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  44052933 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatga 44052835  T
Q  568 tgatgt 573  Q
    ||||||    
T  44052834 tgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 84 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 3097135 - 3096772
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097135 cagagagcatgcaagatttcataattttgacttttgagttaaaccttagatgttttcgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 3097036  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097035 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccaaggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 3096936  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  3096935 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggataaatacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgt 3096836  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttg 447  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3096835 ttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 84 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 22636937 - 22636437
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636937 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaagatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22636838  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22636837 atgagattgaacctggaaaaattgtagaatgaaacttgtgggattctgacttgacctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaa 22636738  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||    
T  22636737 acagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatc 22636638  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  22636637 tgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 22636539  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22636538 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 22636440  T
Q  569 gat 571  Q
    |||    
T  22636439 gat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 84 - 570
Target Start/End: Original strand, 16377140 - 16377639
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16377140 cagatagcttgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagcgtctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtagg 16377239  T
Q  184 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||| |          ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16377240 atgagattgaacctggaatgatcgtagaatgaacttttgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaa 16377339  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgt-cgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 371  Q
    || |||| ||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| |  |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  16377340 catagtgccttgttaggattttgctacctttgttgcacgagttttatgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataat 16377439  T
Q  372 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 470  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  16377440 ctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgactt 16377539  T
Q  471 gaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  16377540 gcatttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatg 16377638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 85 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 14039151 - 14038653
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  14039151 agagagcttgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatttggaaagaatgtagaa 14039052  T
Q  185 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||| |||           | |||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14039051 tgagattgaacctagaaagattttagaatgaaacttttggaaatctgaccagaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 14038952  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || |||||||   ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || |  ||||||||||||    
T  14038951 cagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatc 14038852  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| |||    
T  14038851 tgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttg 14038752  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     | |||||||||||||| |||||||   ||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  14038751 catttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 108 - 437
Target Start/End: Original strand, 17047726 - 17048055
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17047726 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgactaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaac-tggaatgaaac 17047824  T
Q  208 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17047825 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttg 17047924  T
Q  308 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 407  Q
    | | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||  |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  17047925 cacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattat 17048024  T
Q  408 gatgtgatataatg-attatgcattacttga 437  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17048025 gatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 336 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 17046724 - 17046487
Alignment:
Q  336 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattactt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  17046724 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattactt 17046625  T
Q  436 gaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaag 535  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17046624 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 17046525  T
Q  536 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046524 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 221 - 566
Target Start/End: Original strand, 23374125 - 23374473
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||    
T  23374125 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgggtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgagttgttga 23374224  T
Q  321 gagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat 420  Q
    |  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23374225 ggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataat 23374324  T
Q  421 g-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgc 516  Q
    |  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  23374325 gttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgc 23374424  T
Q  517 tgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 566  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23374425 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 204 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 7894073 - 7893703
Alignment:
Q  204 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||    
T  7894073 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctt 7893974  T
Q  303 tgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatg 402  Q
    ||||||   ||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||| ||    
T  7893973 tgttgcatgagttgccgagagttgaaccttggggtaatattaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagat---gtgttgctg 7893877  T
Q  403 attatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgtt 498  Q
    |||||||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| ||    
T  7893876 attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttttt 7893777  T
Q  499 gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  7893776 gtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 84 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7799200 - 7798967
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  7799200 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgactaataatgattaggacataatgtagg 7799101  T
Q  184 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799100 atgagattgaacctggaaagtttgtagaatgaaacttgtagtattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 7799001  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgtt 306  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7799000 acaaagtgtcttgttaggttttgcgacctttgtt 7798967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 84 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15091400 - 15091093
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15091400 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagtttctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaga 15091301  T
Q  184 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15091300 atgagattgaacctggaaggattttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 15091201  T
Q  273 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 371  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || ||||||    ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||||    
T  15091200 acagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtttctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaagatgttaattataat 15091101  T
Q  372 ctgtgaag 379  Q
    ||||||||    
T  15091100 ctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 250 - 573
Target Start/End: Original strand, 16239764 - 16240090
Alignment:
Q  250 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||    
T  16239764 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattaagac 16239863  T
Q  349 ttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttg 447  Q
    ||||| || | ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| ||| ||| |||    
T  16239864 ttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattg 16239963  T
Q  448 tatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagt 545  Q
     |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||| |||||||||    
T  16239964 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgct-attgttatttaattaagttgcatgagt 16240062  T
Q  546 cggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
     |||||||| || |||||||||||||||    
T  16240063 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 570
Target Start/End: Original strand, 44928542 - 44929042
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44928542 agagagcttgcaagattccgtgattttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtagaa 44928641  T
Q  185 tgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||           |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  44928642 tgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagtta 44928740  T
Q  274 cagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagact-taata-ataaggttaattata 369  Q
    |||| || ||||||   |||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||| |  |||||  ||| || | | ||| ||||  ||||| ||     
T  44928741 cagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttgtggtag--ttatgaatattatatataatattaatgatg 44928837  T
Q  370 atctgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 467  Q
    ||||||||||||| | || |||   ||  || || ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||  |||    
T  44928838 atctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattga 44928937  T
Q  468 attgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 564  Q
     ||| | |||| ||||||||||||   |||| ||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  44928938 cttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 44929036  T
Q  565 tgatga 570  Q
    ||||||    
T  44929037 tgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 20156908 - 20157025
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20156908 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttaatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 20157007  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20157008 atgagattgaacctggaa 20157025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24029244 - 24029057
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24029244 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattatgaaagaatgtagg 24029145  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24029144 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24029057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 16239610 - 16239728
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag-aatgtag 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16239610 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgctccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaatgtag 16239709  T
Q  183 gatgagattgaacctggaa 201  Q
     ||||||||||||||||||    
T  16239710 aatgagattgaacctggaa 16239728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Original strand, 13812427 - 13812614
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13812427 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaacatgtctaatattgattaggaaataatgtagg 13812526  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||          | ||||||  | || |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13812527 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctgac-taaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 13812614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15552316 - 15552199
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552316 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 15552217  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  15552216 atgagattggacctggaa 15552199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 22633831 - 22633948
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22633831 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 22633930  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22633931 atgagattgaacctggaa 22633948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 44102697 - 44102520
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44102697 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgagcatgtttaataatgattatg-aagaatgtaggatgagattgaacctg 44102599  T
Q  199 -----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 267  Q
               |||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102598 gatagattttagaataaaactt-tgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 44102520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 573
Target Start/End: Original strand, 16270145 - 16270356
Alignment:
Q  364 attataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt 462  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  16270145 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 16270244  T
Q  463 gatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 560  Q
    | | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  16270245 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 16270343  T
Q  561 aagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||||||    
T  16270344 aagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6190921 - 6190819
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6190921 atttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctg 6190822  T
Q  199 gaa 201  Q
    |||    
T  6190821 gaa 6190819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16597148 - 16597031
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16597148 cagagagcatgcaagattctgtaattttgatttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 16597049  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16597048 atgagattgaacctggaa 16597031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 392 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  392 tgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc 490  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  491 atgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Original strand, 21814936 - 21815109
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||    
T  21814936 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctg 21815035  T
Q  199 g---aatta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |   |||||      ||||| | |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815036 gattaattaagaatgaactttttggaagctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21815109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Original strand, 21815265 - 21815438
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||    
T  21815265 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaataatttagaatgataatgaacctg 21815364  T
Q  199 g---aatta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |   |||||      ||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815365 gattaattaagaatgaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21815438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Original strand, 21818358 - 21818531
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||    
T  21818358 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctg 21818457  T
Q  199 g---aatta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |   |||||      ||||| | |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21818458 gattaattaagaatgaactttttggaagctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21818531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12774488 - 12774385
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  12774488 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagattggagaatgagattgaacc 12774389  T
Q  197 tgga 200  Q
    ||||    
T  12774388 tgga 12774385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8846865 - 8846761
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  8846865 agatttcgtaattttgacttttgagttgattcttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 8846766  T
Q  197 tggaa 201  Q
    |||||    
T  8846765 tggaa 8846761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 256 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 6190782 - 6190479
Alignment:
Q  256 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataa 355  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |  |    
T  6190782 tcgcgagtgacccaaaaatagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgtcgagagttgaaccttggcgtagcattaagacttgaata 6190683  T
Q  356 taaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgat-tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacat 454  Q
    | |  ||||||| |||  |||||||||| || || |||||  || |||| ||||||||||| |||||  || |||||||||||||  ||  || |||  |    
T  6190682 tgatattaattacaattcgtgaagctgt-tatgagatgttaatgttgatgtatgatgtgatctaatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataatt 6190584  T
Q  455 aagatg-ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 550  Q
     ||||| ||| |   || | ||||||||| ||||||||||   || ||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  6190583 gagatgattgttcgctt-acattgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtc 6190485  T
Q  551 taagat 556  Q
    ||||||    
T  6190484 taagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 404 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  404 ttatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--g 499  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||  |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatg-ttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttg 6899964  T
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 454 - 573
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873488
Alignment:
Q  454 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 550  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52873465  T
Q  551 taagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  52873466 taagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 15551915 - 15551817
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15551915 gatattattatatcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 404 - 557
Target Start/End: Original strand, 13800 - 13956
Alignment:
Q  404 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt-- 500  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |      
T  13800 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 13899  T
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13900 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Original strand, 39705920 - 39706024
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  39705920 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagattaagattgaacct 39706019  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  39706020 ggaat 39706024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 492 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 3096373 - 3096293
Alignment:
Q  492 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3096373 tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 424 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 22353984 - 22353835
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg-tata--ctgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  22353984 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctgtt 22353885  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22353884 -gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 401 - 487
Target Start/End: Original strand, 15121749 - 15121834
Alignment:
Q  401 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat 487  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15121749 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataattat 15121834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 401 - 520
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256227
Alignment:
Q  401 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 498  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 43256204  T
Q  499 -gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  43256205 ggtatgctgcctatgttgctgtt 43256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774011
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706409
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 456 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280316
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 552  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T
Q  553 agatgttgaagatgatga 570  Q
    || || | ||||||||||    
T  14280333 agttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 554
Target Start/End: Original strand, 52242856 - 52243298
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat----taaacttg------tgggattc 218  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    |||   ||      ||||| |     
T  52242856 ttagatgatttcgagtgcctgaacatgtataataatgatcaggaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgcattgttgggagtt 52242955  T
Q  219 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgctcaagttg 316  Q
      ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| || | ||| |    
T  52242956 acacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcg 52243054  T
Q  317 tcgagagttgaacccttgggtaggatt-aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt-ataagatatgttgttgatgattatgatgtga 414  Q
    |  ||||||||||  | |||||| | | |||| |  |||| |   ||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| || || |||| ||||||    
T  52243055 taaagagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataagata-ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtga 52243153  T
Q  415 tataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt--tg--ttgtatactgcct 509  Q
    ||||||  | ||||||||||||| |  |||| || ||   | |||||||| ||||||  | |||||||| |||| |||||   ||  ||| |||||||||    
T  52243154 tataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcct 52243253  T
Q  510 atgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243254 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13845028 - 13844950
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 176  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13845028 gatttcgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaattatgattagaaaaga 13844950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 501 - 554
Target Start/End: Original strand, 12288259 - 12288312
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288259 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 500 - 557
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640561
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 46640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Original strand, 43198220 - 43198324
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||||||  |||||||  || |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| |    
T  43198220 gatttcgtagttttgacccttaagttaaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagattttagattgagattgaacat 43198319  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  43198320 ggaat 43198324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17046765 - 17046718
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046765 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 17046718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 18215289 - 18215436
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  18215289 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 18215387  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18215388 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082257
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 456 - 570
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798872
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 552  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T
Q  553 agatgttgaagatgatga 570  Q
    || || | ||||||||||    
T  54798855 agttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14679439 - 14679325
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||  |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14679439 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgaatgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14679340  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  14679339 gacaagattgaacct 14679325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15099829 - 15099735
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    ||||||| ||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  15099829 ttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaat 15099735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 410 - 570
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23803365 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846360
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14685646 - 14685534
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14685646 agagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 14685547  T
Q  185 tgagattgaacct 197  Q
    | |||||||||||    
T  14685546 taagattgaacct 14685534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 576  Q
    |  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  19242761 gt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 572
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||  || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 572  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  19618272 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 12322 - 12469
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  12322 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12420  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12421 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 15118367 - 15118514
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15118367 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15118465  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15118466 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 15464562 - 15464661
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    |||||||  |||||||  || |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  15464562 atttcgtagttttgacccttaagttgatatttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctg 15464661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Original strand, 15868289 - 15868368
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||    
T  15868289 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacctgg 15868368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 262
Target Start/End: Original strand, 19757257 - 19757410
Alignment:
Q  110 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaactt 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |||    
T  19757257 ttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacctt 19757355  T
Q  210 --gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
       |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19757356 agttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19757410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19782549 - 19782396
Alignment:
Q  110 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaactt 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |||    
T  19782549 ttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacctt 19782451  T
Q  210 g--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
       |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19782450 agttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19782396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 44615435 - 44615288
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  44615435 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 44615337  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44615336 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 52312657 - 52312510
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  52312657 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 52312559  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  52312558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| || ||||   |||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    || | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3515069 gc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9557007 - 9556827
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  9557007 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 9556908  T
Q  183 gatgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |   ||||||||||| |||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9556907 ggcaagattgaacctagaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 9556827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23838910 - 23838796
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23838910 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 23838811  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  23838810 gacaagattgaacct 23838796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 508 - 554
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198657
Alignment:
Q  508 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 570
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  51463968 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Original strand, 7900800 - 7900913
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  |||| | ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  7900800 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgggtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 7900899  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    ||| ||||||||||    
T  7900900 gatcagattgaacc 7900913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 554
Target Start/End: Original strand, 8574871 - 8574969
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8574871 agatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8574968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15190795 - 15190702
Alignment:
Q  109 tttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    |||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||  ||||||| ||||||||||    
T  15190795 tttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaaggttctagattgagatttaacctggaat 15190702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 404 - 570
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  404 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---g 499  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||   |    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1837603 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Original strand, 44773153 - 44773249
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44773153 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17053533 - 17053482
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgc 136  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17053533 agagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgc 17053482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 18239434 - 18239581
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  18239434 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 18239532  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18239533 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 50222354 - 50222501
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||  | ||||||||||    
T  50222354 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt 50222452  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  50222453 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12774355 - 12774313
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774355 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 12774313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 16356596 - 16356658
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  16356596 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 16356658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 3332321 - 3332284
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgag 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3332321 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgag 3332284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Original strand, 15321723 - 15321836
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  15321723 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 15321822  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    ||| ||||||||||    
T  15321823 gatcagattgaacc 15321836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 16243054 - 16243209
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || |||||| |||||||  ||  || ||| |||||||||||||| |||  || |    
T  16243054 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctaatattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctagaa-caacc 16243152  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16243153 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16243209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 148
Target Start/End: Original strand, 16348334 - 16348375
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16348334 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 16348375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 44676108 - 44676047
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  44676108 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 44676047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Original strand, 51493447 - 51493560
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  51493447 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 51493546  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    ||| ||||||||||    
T  51493547 gatcagattgaacc 51493560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcc 508  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |    ||      
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt----tgt- 12611011  T
Q  509 tatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12611010 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 554
Target Start/End: Original strand, 15355391 - 15355471
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355391 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15355471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Original strand, 16956279 - 16956379
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16956279 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 16956378  T
Q  183 g 183  Q
    |    
T  16956379 g 16956379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Original strand, 13427 - 13506
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  13427 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3332240 - 3332201
Alignment:
Q  223 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3332240 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 3332201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641344
Alignment:
Q  511 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 15367789 - 15367690
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15367789 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15367692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 15370117 - 15370018
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15370117 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15370020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 15371301 - 15371202
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15371301 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15371204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 15373582 - 15373483
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15373582 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15373485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 15402802 - 15402703
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15402802 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15402705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 259
Target Start/End: Original strand, 26243319 - 26243471
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  26243319 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgaat-tagaacgagattgaacctggaa-caac 26243416  T
Q  207 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 259  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26243417 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 26243471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40471920 - 40471837
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40471920 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacct 40471837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Original strand, 386038 - 386096
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  386038 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 386096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15094249 - 15094187
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15094249 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 15094187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 15121446 - 15121508
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15121446 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 15121508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 262
Target Start/End: Original strand, 22633980 - 22634018
Alignment:
Q  224 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22633980 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22634018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27534502 - 27534384
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||  |  |  ||| ||||||||||||||  ||  ||    
T  27534502 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtacctactaatgattaggaaacgattgag 27534403  T
Q  183 gatgagattgaacctggaa 201  Q
     ||||||||||||||||||    
T  27534402 aatgagattgaacctggaa 27534384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32851918 - 32851868
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32851918 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 32851868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40478593 - 40478511
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40478593 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 40478511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 2015230 - 2015075
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  || |    
T  2015230 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caacc 2015132  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||| |||| | || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  2015131 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggtgagcagacgctctcgcctcgcgag 2015075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15099706 - 15099665
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15099706 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 15099665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15552166 - 15552129
Alignment:
Q  225 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15552166 gaactcgccacggcgagcagaggctcgcgcctcgcgag 15552129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 520 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 18222032 - 18222187
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  18222032 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacc 18222130  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||| |||| | || |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  18222131 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 18222187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23843955 - 23843894
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||  | |||||||||    
T  23843955 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttcattaatgatta 23843894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3413248 - 3413212
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3413248 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 3413212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13569988 - 13569948
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13569988 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 13569948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Original strand, 15464694 - 15464805
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgctcaagttgtc 318  Q
    |||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||   |||||||| | |||||| || ||||||||     
T  15464694 acctgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgacttgtttaggattttgcaatctttgtcgcacaagttgtt 15464793  T
Q  319 gagagttgaacc 330  Q
      ||||||||||    
T  15464794 atgagttgaacc 15464805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 502 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333292
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcagtctatgatgt 17333292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 18602399 - 18602435
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18602399 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18602435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 18608993 - 18609029
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18608993 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18609029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 1951415 - 1951570
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||  |       
T  1951415 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaacgacct 1951514  T
Q  208 ttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    | | ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  1951515 tagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcttcgcgag 1951570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Original strand, 4561107 - 4561142
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4561107 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4561142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Original strand, 5756711 - 5756746
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5756711 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 5756746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 262
Target Start/End: Original strand, 20157056 - 20157095
Alignment:
Q  223 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20157056 ctgaactcgccatggcgtgcagaggctctcgcctcgcgag 20157095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 196
Target Start/End: Original strand, 26284595 - 26284650
Alignment:
Q  141 gagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26284595 gagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 26284650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33742710 - 33742675
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33742710 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 33742675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 45938495 - 45938444
Alignment:
Q  211 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45938495 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 45938444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Original strand, 6873060 - 6873118
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6873060 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattatgaatgaatgtaggatcagattgaacc 6873118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12522505 - 12522447
Alignment:
Q  139 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  12522505 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagatggaacct 12522447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 554
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970853
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    || | | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970807 gc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 14970853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 171
Target Start/End: Original strand, 32306582 - 32306624
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32306582 ttagatggttttgagtgcctaaacatgtataataatgattagg 32306624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35171045 - 35170991
Alignment:
Q  143 gtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  35171045 gtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 35170991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35614415 - 35614301
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||  ||| ||||||| |||||  ||||   ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||    
T  35614415 gcagagagcatgttagattttgtattttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatatctagtaatgataagggatgaatgtag 35614316  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  ||||| |||||    
T  35614315 gactagattaaacct 35614301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 197
Target Start/End: Original strand, 41385430 - 41385488
Alignment:
Q  139 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||    
T  41385430 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggagtgaatgtaggacaagattgaacct 41385488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8846730 - 8846689
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8846730 accttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 8846689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 184
Target Start/End: Original strand, 9271733 - 9271834
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| | ||||||||    
T  9271733 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtag 9271832  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  9271833 ga 9271834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 16596746 - 16596686
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaag 535  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16596746 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 53433854 - 53433753
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  53433854 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 53433755  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  53433754 ga 53433753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 144
Target Start/End: Original strand, 11250219 - 11250251
Alignment:
Q  112 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11250219 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 11250251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Original strand, 12287794 - 12287866
Alignment:
Q  127 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    ||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  12287794 ccttagatgtttctaagtgtctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 12287866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 12570497 - 12570457
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12570497 ttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 12570457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 185
Target Start/End: Original strand, 14268101 - 14268189
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  14268101 agattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 14268189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 14708288 - 14708324
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14708288 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 14708324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 144
Target Start/End: Original strand, 16351506 - 16351538
Alignment:
Q  112 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16351506 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 16351538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18237344 - 18237308
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18237344 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18237308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23139722 - 23139686
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23139722 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23139686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 28569098 - 28569134
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28569098 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 28569134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 36133616 - 36133652
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36133616 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 36133652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Original strand, 39706052 - 39706092
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 261  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  39706052 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 39706092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 43255814 - 43255850
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  43255814 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 43255850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 45938599 - 45938563
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45938599 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 45938563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 201
Target Start/End: Original strand, 53081760 - 53081832
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  53081760 ttagatgattctgagtgcctaaacatgtataataatgattaagcaagtttttagattgagattgaacctggaa 53081832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 16771 - 16282
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16771 cagagagcatgcaagatttcgtacttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 16672  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16671 acgagattgaacctgaaattaaacttatgggattttgaccagaactcggcacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgact 16572  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  16571 tgttggattttgtgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacgcttgggtaggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctga 16472  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  16471 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataa 16372  T
Q  484 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371 ttatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 164)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 96 - 573
Target Start/End: Original strand, 21292611 - 21293090
Alignment:
Q  96 aagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 195  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292611 aagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 21292710  T
Q  196 ctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttg 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21292711 ctggaattaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaatagagtgactttttagattttg 21292810  T
Q  296 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 395  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21292811 cgacctttgttgcacgagttgtcgggagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtt 21292910  T
Q  396 gttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa-ttgaa-attgatattattatgtcatg 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  21292911 gttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcata 21293010  T
Q  494 ttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
     || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21293011 ctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 8286471 - 8286964
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8286471 cagagagcatgcaagatttcgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtgccggaacatgtctaataatgattaagaaagaatgtagg 8286570  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286571 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctaaactagccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 8286670  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||| | |||||||||||    
T  8286671 tgttagattttgcgacctttgttgcttgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgt 8286770  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 482  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8286771 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 8286870  T
Q  483 attatgtcatg----ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||||    || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8286871 attatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22075511 - 22075018
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22075511 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtagg 22075412  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag-aaacagagtgac 282  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22075411 atgaaaatgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgac 22075312  T
Q  283 ttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 382  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  22075311 ttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctg 22075213  T
Q  383 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatat 481  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22075212 tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatat 22075113  T
Q  482 tattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag-atgatgatgt 573  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22075112 tattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Original strand, 23390115 - 23390617
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390115 agagagcatccaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 23390214  T
Q  185 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||    
T  23390215 tgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccctaaaa 23390314  T
Q  274 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 373  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  23390315 cagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatct 23390414  T
Q  374 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 472  Q
    |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  23390415 gtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 23390514  T
Q  473 aattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23390515 aattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23390613  T
Q  570 atgt 573  Q
    ||||    
T  23390614 atgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 24494071 - 24493569
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24494071 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgaacgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 24493972  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||    
T  24493971 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctttcgcctcgtgagtaacccataaa 24493872  T
Q  274 cagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24493871 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaataatgatgttaattataatc 24493772  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  24493771 tgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 24493672  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
     | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24493671 catttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 24493573  T
Q  570 atgt 573  Q
    ||||    
T  24493572 atgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 25422035 - 25421532
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  25422035 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctattaatgattaggaaagaacttagg 25421936  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||| ||||||||          | ||||||  || | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25421935 atgagattggacctggaaagatttagaatgaaactttcggaaatctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaa 25421836  T
Q  274 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  25421835 ccgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatc 25421736  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| |||    
T  25421735 tgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttg 25421636  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25421635 caattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 25421537  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  25421536 gatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 13095996 - 13095495
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095996 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgaaagcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 13095897  T
Q  185 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 274  Q
    |||||||| ||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13095896 tgagattggacctggaaagatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaac 13095797  T
Q  275 agagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 373  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  13095796 agagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatat 13095697  T
Q  374 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  13095696 gtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatg-ttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 13095598  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
     | ||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13095597 catttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 13095499  T
Q  570 atgt 573  Q
    ||||    
T  13095498 atgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 84 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 24529724 - 24529223
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529724 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttcagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 24529625  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529624 atgagattgaacctggaaaggttgtagaatgaaacttttggaattctgatctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 24529525  T
Q  273 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 371  Q
    |||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| | |||||| ||| | ||||||| || | ||||| ||||||    
T  24529524 acagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcactagtagttgagagttgaaccttggggtagtattgaaacttaatgatgatgttaactataat 24529425  T
Q  372 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 470  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||   ||||||  |||||||||| ||| ||    
T  24529424 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgactt 24529325  T
Q  471 gaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24529324 gcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 24529226  T
Q  568 tga 570  Q
    |||    
T  24529225 tga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 13025812 - 13025311
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025812 agagagcatgcaagatttcgtgattttgaattttgagttgatccttagatacttttgaaagcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 13025713  T
Q  185 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 274  Q
    |||||||| ||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13025712 tgagattggacctggaaagatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaac 13025613  T
Q  275 agagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 373  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  13025612 agagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatat 13025513  T
Q  374 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  13025512 gtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatg-ttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 13025414  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
     | ||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13025413 catttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 13025315  T
Q  570 atgt 573  Q
    ||||    
T  13025314 atgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 9078455 - 9077952
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  9078455 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatctttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaga 9078356  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||          | |||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078355 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaaccttttgaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 9078256  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||  || |||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  9078255 cagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 9078156  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||   ||||||  | |||||||| ||| |||    
T  9078155 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttg 9078056  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||    
T  9078055 cacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgat 9077957  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  9077956 gatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 84 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 25431897 - 25431414
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  25431897 cagagagcgtgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagaatttagg 25431798  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||| ||||||||          | |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25431797 atgagattggacctggaaagatttagaatgaaacttttggaaatctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcacctcgcgagtgacccagaaa 25431698  T
Q  274 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
      ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  25431697 tcgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttacacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatc 25431598  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| | |  |||||||||| ||| |||    
T  25431597 tgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttg 25431498  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
     ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431497 caattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 84 - 438
Target Start/End: Original strand, 22107002 - 22107357
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22107002 cagagagcatgcaaaatttcgtatttttgacttttgagttgaactttagatgcgtttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 22107101  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  22107102 acgagattgaacctgaaattaaacttgtgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaatagagtgcct 22107201  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||| | | ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22107202 tgtgatactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagatgaacctttgagtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgt 22107301  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat-gattatgcattacttgaa 438  Q
     |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22107302 ttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 1096970 - 1096467
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096970 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 1096871  T
Q  184 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||| ||||||  |          ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096870 atgagattgaatctggaaagattgcagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 1096771  T
Q  274 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||| || ||| |||| ||||||||| || ||| || ||||||||  | ||||| ||| | |||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||| |    
T  1096770 cagaatgcctttttagaattttgcgatctctgtcgcacaagttgttaaaagttggaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacc 1096671  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    | ||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| |||    
T  1096670 tatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttg 1096571  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     | ||||||||||||||| ||||||   ||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  1096570 catttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgtt 1096472  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  1096471 gatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 84 - 437
Target Start/End: Original strand, 21985765 - 21986130
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21985765 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 21985864  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||||||||||||||          |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21985865 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcaagcagaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaa 21985964  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| |||||| || || | ||||| ||||||     
T  21985965 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattcagacttgatgatgatgttaactataatt 21986064  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttga 437  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| || ||| ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||    
T  21986065 tgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 269
Target Start/End: Original strand, 11580878 - 11581058
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11580878 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagaagcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 11580977  T
Q  199 -----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccca 269  Q
               |||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11580978 gatagattttagaataaaactt-tgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccca 11581058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Original strand, 22119811 - 22119998
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22119811 cagagagcatgcaaaattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 22119910  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22119911 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22119998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 201
Target Start/End: Original strand, 21871190 - 21871306
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  21871190 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtagga 21871289  T
Q  185 tgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||    
T  21871290 tgagattgaacctggaa 21871306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 201
Target Start/End: Original strand, 21875470 - 21875586
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  21875470 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtagga 21875569  T
Q  185 tgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||    
T  21875570 tgagattgaacctggaa 21875586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 267
Target Start/End: Original strand, 36154461 - 36154639
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36154461 atttcatgattttgacttttaagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagagtgagattgaacctg 36154560  T
Q  199 -----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 267  Q
               |||| |||||| || || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36154561 gatagattttagaataaaactt-tgagaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacc 36154639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  409 atgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatac 504  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  505 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 19660455 - 19660572
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  19660455 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtgga 19660554  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||| |||||||||    
T  19660555 atgagattaaacctggaa 19660572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 423 - 573
Target Start/End: Original strand, 21729033 - 21729185
Alignment:
Q  423 ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgt 519  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  21729033 ttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgt 21729132  T
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21729133 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Original strand, 24766955 - 24767142
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24766955 cagatagcatgcaagatttcatgatttcgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattacgaaagaatgtagg 24767054  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||| ||||||          | ||||||  | || |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24767055 atgagattgaatctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctgac-tgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24767142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21566034 - 21565930
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21566034 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 21565935  T
Q  197 tggaa 201  Q
    |||||    
T  21565934 tggaa 21565930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Original strand, 22959166 - 22959267
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  22959166 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctg 22959265  T
Q  199 ga 200  Q
    ||    
T  22959266 ga 22959267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 456 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 37724020 - 37723910
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 555  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37724020 agatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaaga 37723921  T
Q  556 tgttgaagatg 566  Q
    |||||||||||    
T  37723920 tgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19669390 - 19669286
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  19669390 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacg 19669291  T
Q  197 tggaa 201  Q
    |||||    
T  19669290 tggaa 19669286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 475 - 573
Target Start/End: Original strand, 21997555 - 21997655
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21997555 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 21997653  T
Q  572 gt 573  Q
    ||    
T  21997654 gt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314577
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660956
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 457 - 573
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329618
Alignment:
Q  457 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21329599  T
Q  555 atgttgaagatgatgatgt 573  Q
     || | |||||||||||||    
T  21329600 ttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 22144508 - 22144065
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat----taa------acttgtgggattc 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    |||      | || ||||| |     
T  22144508 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtgtaacaatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaataatttaagaatggatttttgggagtt 22144409  T
Q  219 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgctcaagttg 316  Q
      ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| || | |||||    
T  22144408 acacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttg 22144310  T
Q  317 tcgagagttgaacccttgggtaggatt-aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt-ataagatatgttgttgatgattatgatgtga 414  Q
    | |||||||||||| | | || | | | |||| ||  | || |  ||||| || | |||||||| ||| |||||||   ||| || || |||  ||||||    
T  22144309 ttgagagttgaaccttggagtcgtaatgaaga-ttgtttatgatattaatgatgacctgtgaagttgttataagatgaattgatgttgtttacaatgtga 22144211  T
Q  415 tataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctat 511  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||| || ||   | |||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||| |||||    
T  22144210 tataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctat 22144111  T
Q  512 gttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144110 gttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22144065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Original strand, 21329127 - 21329231
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||  |||||||||||||    
T  21329127 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacct 21329226  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  21329227 ggaat 21329231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Original strand, 21502205 - 21502277
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21502205 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 457 - 557
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027046
Alignment:
Q  457 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt----tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 552  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||     | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  553 agatg 557  Q
    |||||    
T  20027042 agatg 20027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 369 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 22032520 - 22032323
Alignment:
Q  369 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 468  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22032520 aatctgtgaagctg-atacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 22032422  T
Q  469 ttgaaattgatattattatgtcatg-ttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 566  Q
    ||| ||||| ||| ||||  ||||| ||| |||||  ||||||||||||||  |||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  22032421 ttg-aattggtataatta--tcatgattgtttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 22032326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 369 - 569
Target Start/End: Original strand, 18769919 - 18770118
Alignment:
Q  369 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 468  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18769919 aatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 18770017  T
Q  469 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 566  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |  || ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  18770018 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 18770115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 475 - 554
Target Start/End: Original strand, 26012056 - 26012137
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012056 ttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 401 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356367
Alignment:
Q  401 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tt 498  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T
Q  499 gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18356388 gtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Original strand, 21498649 - 21498753
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||| ||| |||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  21498649 gattgcgtaattttgacctttaagttgaaccttggatgtttttgagtgcctgaacatgtataataattattaggagagattgtagattgagattgaacct 21498748  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  21498749 ggaat 21498753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959649
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 401 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 23572252 - 23572180
Alignment:
Q  401 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 473  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572252 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 23572180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Original strand, 20910430 - 20910609
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag-gaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||  |  |||||| ||| |||||| | | |||| |||    
T  20910430 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgaat-tag 20910528  T
Q  183 gatgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
     |  |||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20910529 aacaagattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20910609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 458 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 21565659 - 21565546
Alignment:
Q  458 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 555  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21565659 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21565560  T
Q  556 tgttgaagatgatg 569  Q
    || ||| |||||||    
T  21565559 tgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 361 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  361 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||      ||||    ||||||||  ||   ||||||  | |||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac-----ttat----tacttgaattatgaatgtatatttgagatg 22412298  T
Q  461 ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  22412297 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 22412199  T
Q  559 tgaagatgatga 570  Q
    | ||||||||||    
T  22412198 ttaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 29330081 - 29329934
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  29330081 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29329983  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29329982 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 401 - 520
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910866
Alignment:
Q  401 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 497  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 20910843  T
Q  498 tgtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  20910844 tgtatgctgtctatgttgctgtt 20910866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 500 - 557
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178326
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22178326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Original strand, 11581265 - 11581361
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11581265 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 37724403 - 37724319
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  37724403 agagagcatgtaagattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 37724319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 264783 - 264930
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  264783 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 264881  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  264882 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 10732955 - 10733102
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  10732955 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 10733053  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10733054 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 20909159 - 20909012
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||| ||    
T  20909159 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tt 20909062  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20909061 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 39363531 - 39363384
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  39363531 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39363433  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39363432 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 21294892 - 21295006
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21294892 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 21294991  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  21294992 gacaagattgaacct 21295006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Original strand, 15441583 - 15441696
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15441583 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 15441682  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    ||  ||||||||||    
T  15441683 gacaagattgaacc 15441696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418599
Alignment:
Q  361 ttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 458  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| | |||    ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||  |  ||| |||  |||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatat-taaga 18418695  T
Q  459 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta-attaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaag 18418599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 21340421 - 21340576
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  21340421 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 21340519  T
Q  208 ttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21340520 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21340576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 26665785 - 26665940
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  26665785 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 26665883  T
Q  208 ttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26665884 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 26665940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 26937382 - 26937537
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  26937382 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 26937480  T
Q  208 ttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26937481 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 26937537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 19668970 - 19668898
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  19668970 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 554
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902155
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20902155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 39245232 - 39245136
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39245232 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Original strand, 21366308 - 21366371
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21366308 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 21366371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 40725951 - 40725853
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  40725951 gatattattatatcatgatgctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 42245380 - 42245527
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  42245380 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 42245478  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  42245479 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 202
Target Start/End: Original strand, 5888837 - 5888911
Alignment:
Q  128 cttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||    
T  5888837 cttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacatggaat 5888911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24555010 - 24554896
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24555010 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaatatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 24554911  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  24554910 gacaagattgaacct 24554896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 503 - 557
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740750
Alignment:
Q  503 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 26740750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 36154798 - 36154942
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||    |    
T  36154798 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttg----t 36154892  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  36154893 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16674604 - 16674449
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  16674604 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacc 16674506  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||||||  | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16674505 ttagttgggattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16674449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 148
Target Start/End: Original strand, 17918804 - 17918845
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17918804 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17918845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18356779 - 18356624
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| ||||||||| ||||||||  || |    
T  18356779 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaagtgcctactattgattagggaatgatttagaatgagattgcacctggaa-caacc 18356681  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18356680 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18356624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22032792 - 22032731
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  22032792 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 22032731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23201845 - 23201784
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  23201845 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 23201784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 23535243 - 23535398
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  23535243 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 23535341  T
Q  208 ttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||| |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23535342 ttagttgggaatctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23535398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 24532702 - 24532857
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  24532702 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 24532800  T
Q  208 ttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24532801 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24532857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25406902 - 25406789
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  25406902 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 25406803  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    ||| ||||||||||    
T  25406802 gatcagattgaacc 25406789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 503 - 552
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  503 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 552  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Original strand, 2154680 - 2154776
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2154680 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 29916616 - 29916580
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29916616 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatg 29916580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31342579 - 31342539
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31342579 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 31342539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 196
Target Start/End: Original strand, 41294112 - 41294176
Alignment:
Q  132 gatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41294112 gatgccttagagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 41294176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Original strand, 20026521 - 20026592
Alignment:
Q  124 gatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 195  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  20026521 gatctttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 20026592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20806024 - 20805961
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  20806024 attttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 20805961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918110
Alignment:
Q  511 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 29346127 - 29345980
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  29346127 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29346029  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29346028 -gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796434
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttatta-ttgattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 15796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17284512 - 17284430
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17284512 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 17284430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 202
Target Start/End: Original strand, 21741185 - 21741279
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    ||||||| ||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  21741185 ttttgacctttaagtcgaaccttagatatttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgaataggaaagattatagattgagattgaacctggaat 21741279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469818
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 23469818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25535409 - 25535351
Alignment:
Q  139 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  25535409 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 25535351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 144
Target Start/End: Original strand, 1858621 - 1858666
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1858621 atttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 1858666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Original strand, 5888940 - 5888981
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5888940 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 5888981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 475 - 567
Target Start/End: Original strand, 18319100 - 18319193
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  18319100 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 18769647 - 18769708
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  18769647 ttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 18769708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Original strand, 19660606 - 19660643
Alignment:
Q  225 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19660606 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 19660643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 270
Target Start/End: Original strand, 21501919 - 21501968
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 270  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21501919 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccag 21501968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21565900 - 21565863
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21565900 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 21565863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21887300 - 21887239
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  21887300 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 21887239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22133475 - 22133362
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||     
T  22133475 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtat 22133376  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    ||| ||||||||||    
T  22133375 gatcagattgaacc 22133362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22140167 - 22140054
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||     
T  22140167 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtat 22140068  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    ||| ||||||||||    
T  22140067 gatcagattgaacc 22140054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22588516 - 22588459
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 195  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22588516 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaac 22588459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Original strand, 22959298 - 22959339
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22959298 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22959339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 520 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Original strand, 23336973 - 23337030
Alignment:
Q  139 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  23336973 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 23337030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 520 - 557
Target Start/End: Original strand, 27988997 - 27989034
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27988997 ttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 27989034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33409658 - 33409565
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  33409658 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaaggatttagaacgagattgaacctggaa 33409565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 522 - 570
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775838
Alignment:
Q  522 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 263
Target Start/End: Original strand, 20026706 - 20026746
Alignment:
Q  223 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20026706 ctgaactcgccacagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 20026746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 31061164 - 31061068
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | | |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31061164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Original strand, 19472493 - 19472528
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19472493 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19472528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19992305 - 19992258
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  19992305 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 19992258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20296180 - 20296145
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20296180 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20296145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Original strand, 22177797 - 22177848
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22177797 agttgaaccctagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 22177848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 185
Target Start/End: Original strand, 22334501 - 22334548
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  22334501 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 22334548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23201731 - 23201680
Alignment:
Q  211 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23201731 tgggaatctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23201680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31342453 - 31342414
Alignment:
Q  223 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31342453 ctgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 31342414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 32027540 - 32027393
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  32027540 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt 32027442  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| ||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32027441 -gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 197
Target Start/End: Original strand, 37286464 - 37286523
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  37286464 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacct 37286523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 197
Target Start/End: Original strand, 37293167 - 37293226
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  37293167 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacct 37293226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 170
Target Start/End: Original strand, 12028223 - 12028281
Alignment:
Q  112 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  12028223 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctattaaagattag 12028281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 197
Target Start/End: Original strand, 14359504 - 14359562
Alignment:
Q  139 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  14359504 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacatgattgaacct 14359562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Original strand, 15236440 - 15236522
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  15236440 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 15236522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 151
Target Start/End: Original strand, 23500993 - 23501031
Alignment:
Q  113 acttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  23500993 acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 23501031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23512579 - 23512521
Alignment:
Q  112 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  23512579 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 23512521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25744074 - 25744036
Alignment:
Q  224 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25744074 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 25744036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 202
Target Start/End: Original strand, 26011688 - 26011770
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    |||||| | ||||||| || |||||| || ||||||| |||||||||||| |||||| | ||   ||||||||||||||||||    
T  26011688 agttgaactttagatgattatgagtgtctaaacatgtgtaataatgattaagaaagattctaaattgagattgaacctggaat 26011770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26681038 - 26680980
Alignment:
Q  112 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  26681038 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattag 26680980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 26704151 - 26704090
Alignment:
Q  492 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26704151 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26704090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 171
Target Start/End: Original strand, 26732421 - 26732463
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26732421 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 26732463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 171
Target Start/End: Original strand, 26740234 - 26740276
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26740234 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 26740276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26952645 - 26952587
Alignment:
Q  112 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  26952645 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattag 26952587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 26973884 - 26973823
Alignment:
Q  492 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26973884 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26973823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27517184 - 27517126
Alignment:
Q  127 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27517184 ccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 27517126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27523821 - 27523763
Alignment:
Q  127 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27523821 ccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 27523763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Original strand, 29471019 - 29471101
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29471019 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagttttgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 29471101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Original strand, 29477614 - 29477696
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29477614 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagttttgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 29477696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 17718093 - 17718248
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | |||||||||| | |||  || |    
T  17718093 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacatagaa-caacc 17718191  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||||||| | || |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  17718192 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 17718248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20232896 - 20232847
Alignment:
Q  213 ggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20232896 ggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20232847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 557
Target Start/End: Original strand, 21328268 - 21328320
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21328268 ctgcctatgttgctgct-gtctattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 21328320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 258
Target Start/End: Original strand, 21741308 - 21741345
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 258  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21741308 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcg 21741345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 21884843 - 21884998
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || | | ||||||||||||||||||  || |    
T  21884843 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctggaa-caacc 21884941  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||  ||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21884942 ttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21884998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 170
Target Start/End: Original strand, 25574056 - 25574097
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25574056 ttagatggttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattag 25574097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 170
Target Start/End: Original strand, 25575249 - 25575290
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25575249 ttagatggttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattag 25575290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 170
Target Start/End: Original strand, 25576442 - 25576483
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25576442 ttagatggttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattag 25576483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26704552 - 26704499
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||    
T  26704552 gatttcgaaattttgacttttgagttgaaccctagatatttttgagtgcctgaa 26704499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26974285 - 26974232
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||    
T  26974285 gatttcgaaattttgacttttgagttgaaccctagatatttttgagtgcctgaa 26974232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 262
Target Start/End: Original strand, 123074 - 123114
Alignment:
Q  222 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  123074 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 123114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4036672 - 4036636
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4036672 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 4036636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14079624 - 14079584
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  14079624 ttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcct 14079584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18784499 - 18784463
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18784499 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18784463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21482930 - 21482894
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21482930 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21482894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 262
Target Start/End: Original strand, 21871321 - 21871377
Alignment:
Q  206 acttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||| || |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  21871321 acttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgag 21871377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 262
Target Start/End: Original strand, 21875601 - 21875657
Alignment:
Q  206 acttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||| || |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  21875601 acttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgag 21875657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22760113 - 22760081
Alignment:
Q  112 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22760113 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 22760081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24222336 - 24222304
Alignment:
Q  112 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24222336 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 24222304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 25229060 - 25229096
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25229060 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25229096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 25293216 - 25293252
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25293216 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25293252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Original strand, 25808115 - 25808215
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||  ||| ||||||| |||||  ||||  |||| || || |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25808115 gcagagagcatgttagattttgtattttcgactttttagttggaccttgaatgccttagaatgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 25808214  T
Q  183 g 183  Q
    |    
T  25808215 g 25808215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 26172916 - 26172880
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26172916 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26172880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 144
Target Start/End: Original strand, 26742376 - 26742436
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    ||||||||||| || |||  | | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26742376 cagagagcatgtaaaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26742436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 42805872 - 42805836
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42805872 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 42805836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 47478 - 46995
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47478 cagagagcatgcaagatttcgtattgttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtctaataatgattaggaatgaatgtagg 47379  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47378 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgagctcgccacggagcgcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaccagagtgact 47279  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    |||||||  | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||||||||||||||||||    
T  47278 tgttagaaatggcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgag------tataatctgtgaagctgt 47185  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47184 ataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 47085  T
Q  484 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47084 ttatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 64306 - 64367
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  64306 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 64367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 216)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 20698065 - 20698556
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698065 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 20698164  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698165 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 20698264  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  20698265 tgttagattttgcgacctttgtggcacgagttgtcgagagttgaacctttggatagaattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 20698364  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
      ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20698365 tcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatatta 20698464  T
Q  484 ttatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20698465 ttacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 17488359 - 17487856
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488359 agagagcatgcaagatttcgtgaatttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 17488260  T
Q  185 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||||||||||||||||           | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17488259 tgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtaggattctgacctgaaatcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaa 17488160  T
Q  274 -cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17488159 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatc 17488060  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  17488059 tgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 17487960  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17487959 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 17487861  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  17487860 gatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 17499841 - 17499338
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499841 agagagaatgcaagatttcatgattttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 17499742  T
Q  185 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||||||||||||||||           | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  17499741 tgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgttggattctgacctgaattcgccacggtgagcagaggctctcgcctctctagtgacctagaaa 17499642  T
Q  274 -cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||     
T  17499641 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatt 17499542  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  17499541 tgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 17499442  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17499441 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 17499343  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  17499342 gatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 136 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 13442725 - 13442274
Alignment:
Q  136 cttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacct 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||    
T  13442725 cttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacct 13442626  T
Q  225 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagt 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13442625 gaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagt 13442526  T
Q  325 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 423  Q
    |||||| | || |   ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  13442525 tgaaccttgggatgacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 13442426  T
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |    
T  13442425 tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccg-t 13442327  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13442326 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 26687390 - 26686887
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687390 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 26687291  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687290 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 26687191  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| | | | || |||||||||||  | |||||| |||  |||||||| |  | |||||||||||||    
T  26687190 acagagtgtcttgttaggttttacgacctttgttgcacgaatcgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatc 26687091  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||  ||||||| || ||| |||    
T  26687090 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttg 26686991  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  26686990 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgat 26686892  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  26686891 gatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 12399698 - 12399209
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12399698 cagagagcatgctagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatatagg 12399599  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  12399598 atgggtttgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtaaaggctctcgcctcacgagtgacccagaaac--agtgact 12399501  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| | |||||| | |  || | || |||||||| |||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  12399500 tgttag-ttttccgacctttgttgcacgagttgttggggattaagcctttgggtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctat 12399402  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 482  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  12399401 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatatt 12399302  T
Q  483 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12399301 attatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 18439037 - 18438534
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18439037 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaaa 18438938  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438937 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaagttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 18438838  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||| |||||||    
T  18438837 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagtgttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatc 18438738  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||   |||||| | ||||||||| ||| |||    
T  18438737 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttg 18438638  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     | ||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18438637 catttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 18438539  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  18438538 gatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 14973357 - 14972854
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14973357 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 14973258  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||||||| |||| | ||     |||     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14973257 atgagattaaaccagaaaagattttagaaagaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaa 14973158  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  | ||| || |||||||   ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  14973157 cagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 14973058  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    | ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   |||||| || |||||||| ||| |||    
T  14973057 tatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttg 14972958  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14972957 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 14972859  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  14972858 gatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 84 - 554
Target Start/End: Original strand, 14576451 - 14576934
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  14576451 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagaatgtaga 14576550  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||| |||||||||||||          | |||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14576551 atgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaa 14576650  T
Q  274 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| || | |||||||||||||    
T  14576651 caaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatc 14576750  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  14576751 tgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 14576850  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttgttg--tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  14576851 caattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaag 14576934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 84 - 570
Target Start/End: Original strand, 40213339 - 40213838
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213339 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatcattagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 40213438  T
Q  184 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||  |          ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213439 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttgggaatctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 40213538  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  40213539 cagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 40213638  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |  ||   ||||||  | |||||||| ||| |||    
T  40213639 tgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttg 40213738  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     | ||||||||||||||||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||    
T  40213739 catttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgat 40213836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 11424381 - 11424880
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  11424381 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtaga 11424480  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||||||||||||||          |||| |||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11424481 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgaactctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcgacctagaaa 11424580  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| ||| |||||||||  | | ||||||| |||||    
T  11424581 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatc 11424680  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   || |||  | ||||||||||   |||    
T  11424681 tgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttg 11424777  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
      ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  11424778 ctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 11424876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 25476003 - 25476506
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  25476003 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtaga 25476102  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||| ||||||||||           | |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476103 atgagatcgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaat-ctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 25476201  T
Q  273 acagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 371  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| |  | |||||||| |||    
T  25476202 acagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaat 25476301  T
Q  372 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat--gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaat 469  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| |    
T  25476302 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatg-ttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgact 25476400  T
Q  470 tgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 566  Q
    || | |||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  25476401 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctg-ttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 25476499  T
Q  567 atgatgt 573  Q
    |||||||    
T  25476500 atgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 87 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 14573088 - 14572608
Alignment:
Q  87 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 186  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14573088 agagcatgcaagattttgtgtttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatg 14572989  T
Q  187 agattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 276  Q
    |||||||||||||||          | |||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14572988 agattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacag 14572889  T
Q  277 agtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgt 375  Q
    |||  |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||    
T  14572888 agtaccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgt 14572789  T
Q  376 gaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaa 474  Q
    |||| ||| |||||| ||||  || || ||||||||||||||||||  || | ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |   ||    
T  14572788 gaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaa 14572689  T
Q  475 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572688 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 14572608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 23082979 - 23083482
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  23082979 cagagagcatgtcagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctggatatgtctaatagtgattaggacaaaatgtagg 23083078  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacc-tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||| ||||||||          | |||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23083079 atgagattggacctggaaagatttagaatgaaactttttggattctgacccttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaa 23083178  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| | || | |||||||| ||||    
T  23083179 acatagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttcagagttgaaccttgaggtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatc 23083278  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| | | ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  23083279 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttg 23083378  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23083379 caattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23083477  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  23083478 gatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 84 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 30030331 - 30029859
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  30030331 cagagagcatgcaagatttcgtaaatttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaacatgtctaataatgattacgaaagaatgtggg 30030232  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaac-ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtga-cccagaaacagagtga 281  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||     
T  30030231 atgagattgaacctggaatgaaacagtttggaattctgacct-aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaatcccag-aacagaatgc 30030134  T
Q  282 cttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagct 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || | ||| | |||||| |||||||||    
T  30030133 cttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagct 30030034  T
Q  382 gtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgata 480  Q
    || |||||| | |||    ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||  |  ||| |||  ||||| |||| ||||||| || |||||    
T  30030033 gtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgata 30029935  T
Q  481 ttattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    || ||||||||   ||||||||||  ||| ||||| ||||  |||||| | ||||||| |||||||||| |||||||    
T  30029934 ttcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgct-attgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaag 30029859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 199 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 43841309 - 43840932
Alignment:
Q  199 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 298  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43841309 gaatgaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcga 43841210  T
Q  299 cctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgtt 398  Q
    |||||||| | | |||||| |||||||  ||  | |||||| |||  |||||||  |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  43841209 cctttgttacacgagttgttgagagtttgactttggggtagtattgggacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 43841110  T
Q  399 gatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgt 494  Q
    | |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||    
T  43841109 gttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 43841010  T
Q  495 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    | |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||    
T  43841009 ttttgtatactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 84 - 270
Target Start/End: Original strand, 17247904 - 17248100
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17247904 cagagaggttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 17248003  T
Q  184 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 270  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17248004 atgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 17248100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 88 - 263
Target Start/End: Original strand, 53070321 - 53070505
Alignment:
Q  88 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 187  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53070321 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatga 53070420  T
Q  188 gattgaacctgg---aatta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    ||||||||||||   |||||      ||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  53070421 gattgaacctggattaattaagaatgaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 53070505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 85 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16809887 - 16809724
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16809887 agagagcatgctagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcttgaacat----aataatgattaggaaagaatgtagga 16809792  T
Q  185 tgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctc 252  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16809791 tgagattgatcctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgctctc 16809724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12340255 - 12340138
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12340255 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 12340156  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12340155 atgagattgaacctggaa 12340138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14179825 - 14179708
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14179825 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 14179726  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||| |||||    
T  14179725 atgagattgaacttggaa 14179708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43842681 - 43842572
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43842681 cagagagcatgcaagatttcatgattttgactttttagttgatccttagatgcttttgagtgcctgagcatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 43842582  T
Q  184 atgagattga 193  Q
    ||||||||||    
T  43842581 atgagattga 43842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 248 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16796875 - 16796685
Alignment:
Q  248 ctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaaga 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16796875 ctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgaattgttaagagttgaacctttgggtagcattaaga 16796776  T
Q  348 cttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 437  Q
    |||||| |  ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16796775 cttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14669263 - 14669146
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14669263 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatgtctaatattgaataggaaagaatgtagg 14669164  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14669163 atgagattgaacctggaa 14669146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 262
Target Start/End: Original strand, 12851984 - 12852169
Alignment:
Q  86 gagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12851984 gagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagtttaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 12852083  T
Q  186 gagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||| ||||||          | |||||| ||  | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12852084 gagattgaatctggaaagacttagaatgaaacttttgataatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 12852169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 13209946 - 13210062
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  13209946 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaat-atgattaggaaagaaagtaga 13210044  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13210045 atgagattgaacctggaa 13210062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14666108 - 14665991
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14666108 cagagagcatgcaagattttatgattttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtagg 14666009  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14666008 atgagattgaacctggaa 14665991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14735621 - 14735504
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14735621 cagagagcatgcaagattttatgattttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtagg 14735522  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14735521 atgagattgaacctggaa 14735504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 570
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  361 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 459  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  460 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  558 ttgaagatgatga 570  Q
     | ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 200
Target Start/End: Original strand, 49389275 - 49389378
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  49389275 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 49389374  T
Q  197 tgga 200  Q
    ||||    
T  49389375 tgga 49389378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 182
Target Start/End: Original strand, 17247142 - 17247236
Alignment:
Q  88 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17247142 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgccggaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 17247236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32308158 - 32308058
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  32308158 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 32308059  T
Q  197 t 197  Q
    |    
T  32308058 t 32308058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 42386890 - 42386429
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 198  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| || || ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| | |||  || |||||||||||             
T  42386890 ttttgacctttaagttgaaccttagttgtttatgagtgcatgaacatgcataataatgattaggcaagactttagactgtgattgaacctgaaatagtta 42386791  T
Q  199 -gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttg 295  Q
     |||| |||||| ||||| |   |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||   |||||  | ||||||   |||||||    
T  42386790 agaatgaaacttttgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggattttg 42386692  T
Q  296 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgt 394  Q
    ||| |||||| || | |||||| | |||||||||| | |||||| |||  |||||  | || | |||||| ||||||||||||||||| | ||||| | |    
T  42386691 cgaactttgtcgcacgagttgttgtgagttgaaccttggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttt 42386592  T
Q  395 tgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 493  Q
    || || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||   || |||  | |||||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||||    
T  42386591 tgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatg 42386492  T
Q  494 ttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
     ||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386491 ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaag 42386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 198
Target Start/End: Original strand, 4588457 - 4588547
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588457 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 4588547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 12933941 - 12934045
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  12933941 agatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 12934040  T
Q  197 tggaa 201  Q
    |||||    
T  12934041 tggaa 12934045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9513400 - 9513299
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  9513400 agatttcgtactattgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 9513301  T
Q  197 tg 198  Q
    ||    
T  9513300 tg 9513299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9521375 - 9521274
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  9521375 agatttcgtactattgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 9521276  T
Q  197 tg 198  Q
    ||    
T  9521275 tg 9521274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16104268 - 16104168
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  16104268 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgaggttgaacctg 16104169  T
Q  199 g 199  Q
    |    
T  16104168 g 16104168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 198
Target Start/End: Original strand, 1644314 - 1644415
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  1644314 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttggatgtttttgagtgcctgaacatgtctgataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 1644413  T
Q  197 tg 198  Q
    ||    
T  1644414 tg 1644415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16097820 - 16097719
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  16097820 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataattattaggaaagattggagaatgagattgaacc 16097721  T
Q  197 tg 198  Q
    ||    
T  16097720 tg 16097719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 49667715 - 49667818
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  49667715 agatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatg-ttttgagcgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 49667813  T
Q  197 tggaa 201  Q
    |||||    
T  49667814 tggaa 49667818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 176
Target Start/End: Original strand, 12171750 - 12171827
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 176  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171750 atttcgtaattttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 12171827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 13210350 - 13210448
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13210350 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15471413 - 15471309
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  15471413 gatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaacatgtataatgatgattaggaaagattggagattaagattgaacct 15471314  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  15471313 ggaat 15471309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668193
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 24340746 - 24340844
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  24340746 gatattattatatcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 475 - 573
Target Start/End: Original strand, 43550544 - 43550644
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43550544 ttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 43550642  T
Q  572 gt 573  Q
    ||    
T  43550643 gt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 360 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  360 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 437  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 456 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470927
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15470944  T
Q  554 gatgttgaagatgatgatgt 573  Q
       |||||||||||||||||    
T  15470943 ---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Original strand, 15877447 - 15877532
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  15877447 cagagagcatgcaagatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 15877532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512924
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520899
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174376
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110457
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925974
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 43925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856140
Alignment:
Q  405 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtat 502  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||     
T  856304 tatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaa 856206  T
Q  503 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
     ||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  856205 tctgcctatgttgct-attgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 500 - 569
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251283
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg--gaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 456 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 27165366 - 27165250
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||| ||||||| ||| | ||||||||  ||| |||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27165366 agatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 27165267  T
Q  554 gatgttgaagatgatga 570  Q
    | || | ||||||||||    
T  27165266 gttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 501 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307696
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32307696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 501 - 557
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523834
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 52523834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 324702 - 324627
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 195  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  324702 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 324627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 9707622 - 9707769
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  9707622 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 9707720  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  9707721 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 457 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234487
Alignment:
Q  457 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaag 14234506  T
Q  555 atgttgaagatgatgatgt 573  Q
     || | |||||||||||||    
T  14234505 ttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 29172598 - 29172745
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  29172598 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 29172696  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29172697 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14234979 - 14234881
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  14234979 gatttcataattttgacctttaagttgaaccttagatttttttgagtgcctgaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattgagattgaacc 14234881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 410 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    || ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17672688 gc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 508 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  508 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 410 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242838
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
     | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242884 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 50242838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 424 - 557
Target Start/End: Original strand, 53070668 - 53070802
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||   ||||||||  ||||||||||||    
T  53070668 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt 53070766  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070767 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53070802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Original strand, 53301572 - 53301669
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53301572 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 504 - 557
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606431
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatg 606431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 456 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166598
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  554 gatgttgaagatgatga 570  Q
    | || | ||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38814836 - 38814681
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  38814836 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaaggatttagaacgagattgaacctggaa-caacc 38814738  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38814737 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 38814681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 196
Target Start/End: Original strand, 2050855 - 2050931
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  2050855 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctcaacatgtgtaataatgattaggaaagattctagattgagattgaacc 2050931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 500 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377938
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagat 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 505 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  505 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103784
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 477 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 23274785 - 23274706
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23274785 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 7781362 - 7781509
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  7781362 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 7781460  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7781461 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  13544087 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 17463325 - 17463178
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  17463325 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17463227  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17463226 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 28848626 - 28848773
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  28848626 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 28848724  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28848725 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 34159473 - 34159326
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34159473 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34159375  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34159374 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 37642288 - 37642386
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  37642288 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 45606922 - 45607069
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  45606922 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 45607020  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45607021 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 55476638 - 55476491
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  55476638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 55476540  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  55476539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 839723 - 839609
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  839723 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgacttttaagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 839624  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  839623 gacaagattgaacct 839609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 202
Target Start/End: Original strand, 1465051 - 1465145
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    ||||||| ||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||| | || ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  1465051 ttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattatgaaagattgtagattgagattgaacctggaat 1465145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567576
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567622 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12567576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24188254 - 24188140
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24188254 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 24188155  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  24188154 gacaagattgaacct 24188140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 55149455 - 55149341
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  55149455 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 55149356  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  55149355 gacaagattgaacct 55149341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17242424 - 17242269
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  17242424 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 17242326  T
Q  208 ttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17242325 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17242269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 148
Target Start/End: Original strand, 17674209 - 17674258
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17674209 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17674258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  458 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  555 atgttgaagatgatga 570  Q
     || | ||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Original strand, 6469200 - 6469296
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6469200 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 8499614 - 8499518
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8499614 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 15977611 - 15977515
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15977611 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 199
Target Start/End: Original strand, 18383559 - 18383651
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  || ||| ||||||||||||||||    
T  18383559 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacctgg 18383651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 201
Target Start/End: Original strand, 52523390 - 52523462
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||    
T  52523390 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtgtaataattattaggaaagattctagtttgatattgaacctggaa 52523462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 8899241 - 8899094
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  8899241 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 8899143  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  8899142 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12496731 - 12496668
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12496731 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 12496668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 16454296 - 16454443
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  16454296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16454394  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16454395 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 554
Target Start/End: Original strand, 38961906 - 38962037
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  38961906 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 38962004  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962005 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 38962037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Original strand, 1644447 - 1644489
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644447 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 1644489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15060768 - 15060706
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  15060768 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 15060706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 22109929 - 22110007
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  22109929 agttgaactttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagtttgagattgaacctg 22110007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23408928 - 23408847
Alignment:
Q  87 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  23408928 agagcatgcaagaattcgtaattttgacttttgagttgaaccttagat-attatgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 23408847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32308025 - 32307983
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32308025 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 32307983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Original strand, 49667848 - 49667890
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49667848 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 49667890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 148
Target Start/End: Original strand, 3402608 - 3402649
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3402608 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 3402649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3834126 - 3833971
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | |||||||||||| |||  || |    
T  3834126 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctagaac-aacc 3834028  T
Q  208 ttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||  |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3834027 ttggttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 3833971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618465
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21618466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Original strand, 3389600 - 3389640
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3389600 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 3389640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4291249 - 4291149
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4291249 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 4291150  T
Q  183 g 183  Q
    |    
T  4291149 g 4291149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Original strand, 11298172 - 11298212
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11298172 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 11298212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Original strand, 12119791 - 12119887
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12119791 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 13151805 - 13151953
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13151805 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13151903  T
Q  521 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13151904 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 13154270 - 13154418
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13154270 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13154368  T
Q  521 tgttaattaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13154369 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 502 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919344
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 13919344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 15412525 - 15412429
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15412525 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20723478 - 20723298
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   |||  |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20723478 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgccattgagtgcttgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 20723379  T
Q  183 gatgagattgaacctggaattaaacttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||  ||||||||||| |||  | | | | |||||  ||| | || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20723378 gacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 20723298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Original strand, 26190652 - 26190692
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26190652 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 26190692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 323065 - 323026
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgc 146  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  323065 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 323026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 10247738 - 10247885
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  10247738 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 10247836  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10247837 -gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 151
Target Start/End: Original strand, 12037572 - 12037639
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  12037572 cagagagcatgttggatttcgtgattttgacatgtgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 12037639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12340107 - 12340068
Alignment:
Q  223 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12340107 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 12340068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14501666 - 14501615
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14501666 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 14501615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 478 - 568
Target Start/End: Original strand, 16282880 - 16282971
Alignment:
Q  478 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16282880 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 17446670 - 17446816
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  17446670 tatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17446768  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  17446769 -gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737236
Alignment:
Q  511 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 170
Target Start/End: Original strand, 19725546 - 19725617
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||  ||||| ||||||    
T  19725546 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgtgtgccttaagatgttgaataaagattag 19725617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 262
Target Start/End: Original strand, 19725669 - 19725720
Alignment:
Q  211 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19725669 tgggattctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19725720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23275208 - 23275133
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 195  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  23275208 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 23275133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12173261 - 12173199
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12173261 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 12173199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Original strand, 12934075 - 12934117
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12934075 acctgaactcgccatggcgagcagagactctcgcctcgcgagt 12934117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15051992 - 15051930
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  15051992 attttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 15051930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 23077121 - 23077183
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  23077121 ttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 23077183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Original strand, 23704428 - 23704510
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23704428 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 23704510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Original strand, 23722884 - 23722966
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23722884 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 23722966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Original strand, 23741340 - 23741422
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23741340 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 23741422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Original strand, 41201457 - 41201539
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41201457 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 41201539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 570
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 201
Target Start/End: Original strand, 605945 - 606026
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   | |||  |||||||||||||||||    
T  605945 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatgtgtataataatgattaggcaattttctagattgagattgaacctggaa 606026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 856611 - 856550
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  856611 ttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 856550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 1598134 - 1598289
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| | |||||||||||| |||  || |    
T  1598134 ttttgacttttgagttgaaccttagatacttttgagtacctttaggtgcctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacctagaac-aacc 1598232  T
Q  208 ttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1598233 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 1598289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11852055 - 11852006
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11852055 atttcgtaattttaacttttcagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 11852006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 196
Target Start/End: Original strand, 15691950 - 15692019
Alignment:
Q  127 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15691950 ccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 15692019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 15849739 - 15849894
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  15849739 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaa-caacc 15849837  T
Q  208 ttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||  ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15849838 ttggttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15849894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16333649 - 16333548
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| || | || ||||||| |||||  |||||  ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  16333649 gcagagagcatgttagattttgtaacttcgactttttagttggaccttaagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 16333550  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  16333549 ga 16333548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 43927638 - 43927597
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43927638 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattag 43927597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Original strand, 321657 - 321697
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  321657 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 321697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Original strand, 17524817 - 17524857
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17524817 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 17524857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 520 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 171
Target Start/End: Original strand, 603258 - 603345
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| | || | |||| || |||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  603258 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgagctgtgagtttaaccctggatgtttatgagagcctgaacatgtactataatgattagg 603345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7110034 - 7109999
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7110034 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 7109999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7113969 - 7113934
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7113969 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 7113934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13251166 - 13251095
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  13251166 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 13251095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13257812 - 13257741
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  13257812 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 13257741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14665960 - 14665921
Alignment:
Q  223 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14665960 ctgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 14665921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14669115 - 14669076
Alignment:
Q  223 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14669115 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgag 14669076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14735473 - 14735434
Alignment:
Q  223 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14735473 ctgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 14735434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 15941558 - 15941713
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | |||||||||||| |||  |       
T  15941558 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacctagaacaaccg 15941657  T
Q  208 ttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    | | ||| |||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15941658 tagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15941713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16369884 - 16369845
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgc 146  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16369884 attttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 16369845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 22147548 - 22147646
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||| ||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  22147548 gatattattatatcatgatgttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22322000 - 22321965
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22322000 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22321965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22337055 - 22337020
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22337055 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22337020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 150
Target Start/End: Original strand, 23052711 - 23052762
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctga 150  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23052711 attttgtgattttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctga 23052762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Original strand, 23412827 - 23412878
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  23412827 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataaaaatgattagg 23412878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Original strand, 27409417 - 27409452
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27409417 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 45797710 - 45797659
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45797710 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 45797659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 316654 - 316612
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  316654 ttagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 316612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 324591 - 324549
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  324591 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 324549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11070517 - 11070435
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  11070517 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 11070435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Original strand, 11165189 - 11165271
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  11165189 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 11165271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14499774 - 14499692
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  14499774 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 14499692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 14878148 - 14878210
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  14878148 ttttgacttttgagttgaaccttatatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 14878210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Original strand, 15726591 - 15726673
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  15726591 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgaaggatcagattgaacc 15726673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16097687 - 16097645
Alignment:
Q  220 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  16097687 gacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 16097645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30066395 - 30066313
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  30066395 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 30066313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 184
Target Start/End: Original strand, 41092030 - 41092076
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  41092030 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtagga 41092076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 259
Target Start/End: Original strand, 49389408 - 49389446
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 259  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  49389408 acctgaactcgccatggcgagcagaggttctcgcctcgc 49389446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 55023294 - 55023212
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  55023294 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 55023212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 326818 - 326973
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  326818 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaa-caacc 326916  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  326917 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 326973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Original strand, 1465174 - 1465215
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1465174 acctgaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 1465215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Original strand, 5149596 - 5149709
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||| | |    
T  5149596 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttgg 5149695  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    ||| ||||||||||    
T  5149696 gatcagattgaacc 5149709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9513265 - 9513228
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 258  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9513265 acctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcg 9513228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9521240 - 9521203
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 258  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9521240 acctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcg 9521203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12891883 - 12891782
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  12891883 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 12891784  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  12891783 ga 12891782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Original strand, 13210096 - 13210133
Alignment:
Q  225 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13210096 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 13210133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 15246086 - 15246034
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15246086 ctgcctatgttgctgtt-gtctattaattaaactgcatgagtcggtctaagatg 15246034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15483114 - 15482959
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||  ||  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  15483114 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctggaa-caacc 15483016  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   | ||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15483015 ttagtttggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15482959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 569
Target Start/End: Original strand, 15878092 - 15878168
Alignment:
Q  492 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15878092 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Original strand, 16862834 - 16862927
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  16862834 ttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgactactaatgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa 16862927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 184
Target Start/End: Original strand, 17252685 - 17252786
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  17252685 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 17252784  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  17252785 ga 17252786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 183
Target Start/End: Original strand, 17710275 - 17710320
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17710275 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 17710320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 23408504 - 23408428
Alignment:
Q  492 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| | |||||||||    
T  23408504 tgttgttgtaatctgtctatgttgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaagatgatg 23408428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Original strand, 28350846 - 28350903
Alignment:
Q  139 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  28350846 ttgagtgcctgaacatacctagtgatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 28350903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 263
Target Start/End: Original strand, 37250932 - 37250973
Alignment:
Q  222 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37250932 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 37250973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4710775 - 4710675
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||   ||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||    
T  4710775 gcagagagcatgttggattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaacaaatgtag 4710676  T
Q  183 g 183  Q
    |    
T  4710675 g 4710675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 7793000 - 7793036
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7793000 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 7793036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 144
Target Start/End: Original strand, 11557043 - 11557075
Alignment:
Q  112 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11557043 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 11557075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 144
Target Start/End: Original strand, 11594797 - 11594829
Alignment:
Q  112 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11594797 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 11594829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Original strand, 12171869 - 12171909
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 261  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12171869 acctgaactggccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 12171909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 12378456 - 12378412
Alignment:
Q  127 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12378456 ccttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattagg 12378412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15617854 - 15617766
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||||||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  15617854 gcagagagcatgttggattttgtaattttgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 15617766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16690671 - 16690635
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16690671 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16690635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16697244 - 16697208
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16697244 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16697208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 16797708 - 16797744
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16797708 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16797744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 20461154 - 20461190
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20461154 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 20461190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 262
Target Start/End: Original strand, 22110116 - 22110156
Alignment:
Q  222 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22110116 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22110156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 31097208 - 31097244
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31097208 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 31097244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 42326404 - 42326360
Alignment:
Q  100 tttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42326404 tttcgtgttttggacttttgagttgaaccttagaagcttttgagt 42326360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Original strand, 53380030 - 53380082
Alignment:
Q  133 atgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  53380030 atgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 53380082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Original strand, 53386682 - 53386734
Alignment:
Q  133 atgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  53386682 atgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 53386734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 678 - 1169
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  678 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagg 777  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  778 atgagattgaacctagattgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 877  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||    
T  878 tgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgt 977  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
     |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  978 ttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 1077  T
Q  484 ttatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||   || ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1078 ttatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 570
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5246
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 4859  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4860 atgagattgaacctggaattgaacttatgggattctgacctgaactcgccaaagagagcagaggatctcgcctcgcgagtgacacagaaacagagtgact 4959  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    | || ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  4960 tattggattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactga 5059  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5060 ataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 5159  T
Q  484 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5160 ttatgtcatgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 167608 - 168099
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  167608 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagg 167707  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167708 atgagattgaacctagattgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 167807  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||    
T  167808 tgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgt 167907  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
     |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  167908 ttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 168007  T
Q  484 ttatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||   || ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  168008 ttatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 52415 - 51913
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52415 cagagagcatgcaagattttttgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 52316  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52315 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 52216  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  52215 actgagtgtcttgttaggttttgcgacc-ttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatc 52117  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| |||    
T  52116 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttg 52017  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  52016 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 51918  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  51917 gatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 557
Target Start/End: Original strand, 38204 - 38256
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38204 ctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatg 38256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 142)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Original strand, 16920263 - 16920751
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16920263 agagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattagaaaagaatgtagga 16920362  T
Q  185 tgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgactt 284  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16920363 taagattgtacctggaattaaacttatggaattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccagaaacaaagtgactt 16920462  T
Q  285 gttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgta 384  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |    
T  16920463 gttggattttgcgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaa 16920562  T
Q  385 taagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattat 484  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |    
T  16920563 taagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatact 16920662  T
Q  485 tatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16920663 tatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22831994 - 22831503
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  22831994 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtttgaacatgtctaatattgattagtgaagaatatagg 22831895  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22831894 acgagattgaacctggaattaaactgatgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccgagaaacagagtgact 22831795  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    |||| ||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  22831794 tgttggattttgcgacctttgtcgcacgattcgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctga 22831695  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtataca--taagatgttgatgaattgaaattgatat 481  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22831694 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatat 22831595  T
Q  482 tattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
     |||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22831594 gattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 96 - 573
Target Start/End: Original strand, 20360601 - 20361081
Alignment:
Q  96 aagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20360601 aagatttcgtgtttttgacttttcagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 20360700  T
Q  196 ctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttg 295  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20360701 ctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagctgaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttg 20360800  T
Q  296 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 395  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  20360801 cgacctttgttgcacgagttgttgaggattgaacctttgggtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgtt 20360900  T
Q  396 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca--- 491  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  20360901 gttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgc 20361000  T
Q  492 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  20361001 tgtttttgtatgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 573
Target Start/End: Original strand, 20637915 - 20638404
Alignment:
Q  87 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 186  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20637915 agagcatccaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 20638014  T
Q  187 agattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgt 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20638015 agattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcacctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgt 20638114  T
Q  287 tagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtata 386  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||  ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  20638115 tagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggataacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttta 20638214  T
Q  387 agatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattatt 485  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20638215 agatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattatt 20638314  T
Q  486 atgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  20638315 atgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 84 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 11185994 - 11185517
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||    
T  11185994 cagagagcatgtaagatttcgtatatttgatttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtcgaatattgattagtgaagagtgtagg 11185895  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11185894 acgagattgaacctggaattaaacttatgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggccctcgcctcgtgagtgacccagaaacatagtgact 11185795  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||| ||     
T  11185794 tgttagattttgcgacctttgttgcatgggttgtcgaggatcggacccttgggtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatga 11185695  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  11185694 ataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataa 11185595  T
Q  484 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 561  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185594 ttatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 22779845 - 22780348
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22779845 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22779944  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22779945 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctaaactcgccacggcaagcaaaggctctcgcctcgcgagtaacctagaa 22780044  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||| || | |||||| ||||||    
T  22780045 acagagtgtcctgttaggttttgtgacctttgttgcacaagttgccgagagttgaaccttggggtagtataaagacttaatgatgatgttaatcataatc 22780144  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| |||    
T  22780145 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttg 22780244  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  22780245 caattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 22780343  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  22780344 gatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 19303159 - 19303661
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19303159 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 19303258  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||||||||||||||          |||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19303259 atgagattgaacctgaaaagatttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgagagtgacccagaaa 19303358  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || |||||||   ||||||||||| | |||||| | | ||| ||||| || | |||||||||||||    
T  19303359 cagagtgccttgttaggattttgcgatctatgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagcactgagaattaatgatgatgttaattataatc 19303458  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 470  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  19303459 tgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgactt 19303557  T
Q  471 gaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
    | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19303558 gcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgat 19303656  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  19303657 gatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 102 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 29061025 - 29060540
Alignment:
Q  102 tcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29061025 tcgtgatttcgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtccaataatgattaggaaggaatgtaggatgagattgaacctggaa 29060926  T
Q  202 tta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-ga 290  Q
      |          ||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29060925 agattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagga 29060826  T
Q  291 ttttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagat 390  Q
    |||||||||||||||||| | |||||   |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29060825 ttttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagat 29060726  T
Q  391 atgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgt 489  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  29060725 gtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 29060626  T
Q  490 catgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29060625 catgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 17287414 - 17287917
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287414 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 17287513  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||| ||||| ||||||||           | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  17287514 atgtgattgtacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctaaactcgccacggcgattagaggctcttgtctcgtgagtgacccagaa 17287613  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||| |    
T  17287614 acagagtgtcttgttagggtttgctatctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacc 17287713  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  | |||||||| | ||| |||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| |||    
T  17287714 tgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttg 17287813  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  17287814 caattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 17287912  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  17287913 gatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 84 - 572
Target Start/End: Original strand, 18409445 - 18409947
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18409445 cagagagcatgcaggatttcgtgattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtaga 18409544  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18409545 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctctctagtgacccagaaa 18409644  T
Q  274 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||     
T  18409645 cagagtgccttgttaggattttacgacctttgttgcacgagttattgagagttgaaccttagggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataata 18409744  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||  ||   || ||   | |||||||| ||| |||    
T  18409745 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttg 18409844  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18409845 catttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 18409943  T
Q  569 gatg 572  Q
    ||||    
T  18409944 gatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 20594276 - 20593773
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  20594276 cagagagcttgcaagatttcgtgatttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtctaaatatgattagggaagaatgtagg 20594177  T
Q  184 atgagattgaacctggaat----------taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||           ||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20594176 atgagattgaacctggaaagattgtagaataaacttttggaaatctgacctgaactcgctacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaa 20594077  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||  || |||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  20594076 cagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgataatgataattataatc 20593977  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || | || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||||| ||| |||    
T  20593976 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttg 20593877  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  20593876 catttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgat 20593778  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  20593777 gatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 99 - 350
Target Start/End: Original strand, 18821463 - 18821714
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18821463 atttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctg 18821562  T
Q  199 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821563 gaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 18821662  T
Q  299 cctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagactt 350  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  18821663 cctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagactt 18821714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 94 - 573
Target Start/End: Original strand, 25628983 - 25629476
Alignment:
Q  94 gcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattga 193  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | || || |||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  25628983 gcaagatttcatgattttgactttttagttgaaccttagatgttgttaagcgcctaaacatctctattaatgattaggaaatattgtagaatgagattga 25629082  T
Q  194 acctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    |||||||| ||          ||||| || |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25629083 acctggaaatattttagaataaacttttgtgattatgacctgtactcgccgtggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgcct 25629182  T
Q  284 tgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 382  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  25629183 tgttaggattttgcgacttttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctg 25629282  T
Q  383 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatat 481  Q
    | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||    
T  25629283 tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatat 25629382  T
Q  482 tattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    | |||||||||| ||||   ||||||||| | |||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25629383 tgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctg-ttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 401 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  401 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 84 - 263
Target Start/End: Original strand, 28496091 - 28496280
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  28496091 cagagagcatgtaagatttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtaga 28496190  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||||          |||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496191 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaacttttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 28496280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 84 - 263
Target Start/End: Original strand, 29808501 - 29808691
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  29808501 cagagagcatgtaagatttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtaga 29808600  T
Q  184 atgagattgaacctg------------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||||            |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808601 atgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 29808691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1561806 - 1561689
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1561806 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtaga 1561707  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1561706 atgagattgaacctggaa 1561689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21939886 - 21939699
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21939886 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtgtaatattgattaggaaagaatgtagg 21939787  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| ||||          |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21939786 atgagattgagcctggaaagacttagaataaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21939699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18457202 - 18457029
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18457202 atttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 18457103  T
Q  199 g---aatta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |   |||||      ||||| | |||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18457102 gattaattaagaatgaactttttggaagctgacctgaactagccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 18457029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 423 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 16496396 - 16496244
Alignment:
Q  423 ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgt 519  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  16496396 ttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgt 16496297  T
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16496296 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 90 - 262
Target Start/End: Original strand, 25611347 - 25611530
Alignment:
Q  90 gcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgaga 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||    
T  25611347 gcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagtgaatgcagcatgaga 25611446  T
Q  190 ttgaacctggaa----tta---------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||| ||||||||    |||         ||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25611447 ttggacctggaaagacttagaatgaaacaact--taggattctgacctgaactcgccatggagagcagaggctctcgcctcgcgag 25611530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 262
Target Start/End: Original strand, 15894049 - 15894237
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||    
T  15894049 agagagcatgcaagatttcgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaaga 15894148  T
Q  185 tgagattgaacctggaa----tta---------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||| ||||||||    |||         ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15894149 tgagattggacctggaaagacttagaatgaaagaact--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagagtctctcacctcgcgag 15894237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 22334500 - 22334617
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  22334500 cagagagcatgcaagatttcgtaaatttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaag 22334599  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  22334600 atgagattggacctggaa 22334617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19652685 - 19652581
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19652685 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagaatgagattgaacc 19652586  T
Q  197 tggaa 201  Q
    |||||    
T  19652585 tggaa 19652581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 4667831 - 4667948
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  4667831 cagagagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtaga 4667930  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
     |||||||| ||||||||    
T  4667931 gtgagattggacctggaa 4667948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 4674678 - 4674795
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  4674678 cagagagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtaga 4674777  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
     |||||||| ||||||||    
T  4674778 gtgagattggacctggaa 4674795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 546
Target Start/End: Original strand, 25603003 - 25603478
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |    
T  25603003 cagagagcatgcaagatttcgtgattttaacttttgagttgaacctgaaacgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagtgaatgcatg 25603102  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----tta---------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 270  Q
    ||||||||| ||||||||    |||         ||||  | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |  |      
T  25603103 atgagattggacctggaaagacttagaatgaaacaact--taggattctgacttgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagctagtcta 25603200  T
Q  271 aaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataa 370  Q
     |||||||||  |||| ||   |||||| || ||| ||   |||||   ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |  | ||| | || ||    
T  25603201 gaacagagtgcattgtgaggacttgcgatctgtgtcgcatgagttgcttagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaa 25603300  T
Q  371 tctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaat 469  Q
    ||||||||||||| |||||| | | ||   ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||  |  ||| |||  | |||||| | |||||    
T  25603301 tctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaat 25603399  T
Q  470 tgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 546  Q
    |  || ||||||| |||||||   |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  25603400 tataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctg-ttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 4185441 - 4185558
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  4185441 cagagagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcatgaacaagtctaataacgattatgaaagaatgtaga 4185540  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
     |||||||||||||||||    
T  4185541 gtgagattgaacctggaa 4185558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4189459 - 4189342
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  4189459 cagagagcatgcaagattctgtgttttttacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtaga 4189360  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
     |||||||| ||||||||    
T  4189359 gtgagattggacctggaa 4189342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 31155016 - 31155133
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||     
T  31155016 cagagagcatgcaagattctgtttttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaataagtctaataacgattgggaaagaatgtaga 31155115  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31155116 atgagattgaacctggaa 31155133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  409 atgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatact 505  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||| ||   ||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||| ||||  || ||||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttact 20076767  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20076766 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 197
Target Start/End: Original strand, 31164473 - 31164589
Alignment:
Q  81 gagcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgt 180  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  31164473 gagcagagagcatgcaagattttgcaattttgacatttgagttgatacttggatgtccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgt 31164572  T
Q  181 aggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||||||| ||||    
T  31164573 aggatgagattggacct 31164589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 428 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 20109285 - 20109157
Alignment:
Q  428 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 525  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttt 20109186  T
Q  526 attaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109185 attaactaagctgcatgagtcggtctaag 20109157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23019896 - 23019792
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||||||  |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  23019896 gatttcgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtgtgataatgattaggaaagattttagattgagattgaacct 23019797  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  23019796 ggaat 23019792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333339
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394079
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 201
Target Start/End: Original strand, 27332916 - 27333019
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  27332916 gatttcataattttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacct 27333015  T
Q  198 ggaa 201  Q
    ||||    
T  27333016 ggaa 27333019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 201
Target Start/End: Original strand, 27393656 - 27393759
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  27393656 gatttcataattttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacct 27393755  T
Q  198 ggaa 201  Q
    ||||    
T  27393756 ggaa 27393759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 28496494 - 28496592
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28496494 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 29808905 - 29809003
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29808905 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 456 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019408
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaa 23019426  T
Q  554 gatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  23019425 gatg--aaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22439302 - 22439230
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 156  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22439302 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgt 22439230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 401 - 520
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416008
Alignment:
Q  401 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 497  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 27415985  T
Q  498 tgtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27415986 tgtatgctgcctatgttgctgtt 27416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19863480 - 19863395
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  19863480 cagagagcatgtaagatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 19863395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 25656725 - 25656629
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25656725 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 144
Target Start/End: Original strand, 27415572 - 27415632
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  27415572 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 27415632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 1561401 - 1561303
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1561401 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 428 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 1595692 - 1595549
Alignment:
Q  428 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 524  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  1595692 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttatgttgctg-ttgtt 1595595  T
Q  525 aattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  1595594 atttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 2291195 - 2291342
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  2291195 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 2291293  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2291294 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 456 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 25644440 - 25644339
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 552  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |||| |||   |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25644440 agatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25644341  T
Q  553 ag 554  Q
    ||    
T  25644340 ag 25644339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 508 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668390
Alignment:
Q  508 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 410 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25754871 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 501 - 554
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098616
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22432752 - 22432667
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||| |||||    
T  22432752 cagagagcatgcaagattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcatgaagatgtatattaaagatta 22432667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 502 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076748
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 555  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23076748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 502 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008166
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 555  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 35008166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652199
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 262
Target Start/End: Original strand, 22080391 - 22080543
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----tta------aactt 209  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||  | |||||||||||||||    |||      |||||    
T  22080391 agttgaaccttagatgtttttgagtgactgaacatgtctaataatgattagaaaagattagagattaagattgaacctggaatagtttaagaacgaactt 22080490  T
Q  210 gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
     ||||| |   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22080491 atgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22080543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 22782323 - 22782227
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22782323 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Original strand, 25956253 - 25956357
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| | |||  ||||||| |||||    
T  25956253 gatttcgtaattttgacttttaagttgaatcttagatatttttgagtgcctgaacatgtctaattacgattggaaaagattctagattgagatttaacct 25956352  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  25956353 ggaat 25956357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 572
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 572  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  30676810 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 8227534 - 8227632
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8227534 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 12742464 - 12742317
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  12742464 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12742366  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12742365 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18180974 - 18180903
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  18180974 atttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 18180903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 18334607 - 18334754
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18334607 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18334705  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18334706 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 19005193 - 19005046
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  19005193 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19005095  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19005094 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 19858934 - 19859081
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  19858934 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19859032  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19859033 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 24422694 - 24422547
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24422694 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24422596  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24422595 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 33861941 - 33861794
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  33861941 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33861843  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33861842 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 33864425 - 33864278
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  33864425 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33864327  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33864326 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22331917 - 22331803
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22331917 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 22331818  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  22331817 gacaagattgaacct 22331803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 500 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443062
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 33443062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Original strand, 25641802 - 25641887
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  25641802 cagagagcatgtaagattttgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 25641887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25644811 - 25644711
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||   ||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  25644811 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgttcatgtataacgttgattaggaaagattttagattgagattgaacct 25644712  T
Q  198 g 198  Q
    |    
T  25644711 g 25644711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 410 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 572  Q
    |  | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  34963435 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 1540926 - 1541073
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  1540926 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1541024  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  1541025 -gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 8055176 - 8055029
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  8055176 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt 8055078  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8055077 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19663220 - 19663065
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  |       
T  19663220 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaacaacct 19663121  T
Q  208 ttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||| |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19663120 ttgttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctatcgcctcgcgag 19663065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 26924655 - 26924802
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  26924655 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 26924753  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26924754 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12496760 - 12496605
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaa-gaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  12496760 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtacctttaggtgcctattattgattagggaatgaat-tagaacgagattgaacctggaac-aac 12496663  T
Q  207 cttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12496662 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12496605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 424 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 18456866 - 18456732
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  18456866 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18456768  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456767 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18456732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 424 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 18462026 - 18461892
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  18462026 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18461928  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461927 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18461892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 21834533 - 21834595
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21834533 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaaaatgtttattaaagattag 21834595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 527 - 573
Target Start/End: Original strand, 22080800 - 22080846
Alignment:
Q  527 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22080800 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 511 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  511 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 460 - 550
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185919
Alignment:
Q  460 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 550  Q
    |||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 492 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 22432325 - 22432249
Alignment:
Q  492 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22432325 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 492 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 22438875 - 22438799
Alignment:
Q  492 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22438875 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14099104 - 14099004
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14099104 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14099005  T
Q  183 g 183  Q
    |    
T  14099004 g 14099004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688518
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 25688518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Original strand, 16523045 - 16523108
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||| || ||| ||||||    
T  16523045 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagcgccttaagatgtttattaaagattag 16523108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 262
Target Start/End: Original strand, 22334648 - 22334699
Alignment:
Q  211 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  22334648 tgggattctgacctaaactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgag 22334699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 262
Target Start/End: Original strand, 25641940 - 25641991
Alignment:
Q  211 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25641940 tgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 25641991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Original strand, 1538628 - 1538686
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1538628 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 1538686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Original strand, 1544727 - 1544785
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1544727 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 1544785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 557
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821949
Alignment:
Q  511 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18821949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 21739665 - 21739727
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21739665 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttactaaagattag 21739727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 34295696 - 34295810
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| || |||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  34295696 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgaatttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtgatgattaggaatgaatgtag 34295795  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  34295796 gacaagattgaacct 34295810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Original strand, 4185588 - 4185629
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4185588 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4185629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Original strand, 4667978 - 4668019
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4667978 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4668019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 200
Target Start/End: Original strand, 15041192 - 15041285
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga 200  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||   | ||  ||| |||||||||||||||||    
T  15041192 attttgacttttgagttataccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttaataaaggttagatgataacttagaatgagattgaacctgga 15041285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16372280 - 16372223
Alignment:
Q  139 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  16372280 ttgagtgcctgaacatatctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacc 16372223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 475 - 567
Target Start/End: Original strand, 16448593 - 16448686
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  16448593 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20109682 - 20109605
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  20109682 agttgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 20109605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 22429684 - 22429839
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  22429684 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttctgagtgcctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaa-caacc 22429782  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22429783 ttagctgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22429839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34833132 - 34833031
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  34833132 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 34833033  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  34833032 ga 34833031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Original strand, 20556958 - 20557054
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  20556958 ttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Original strand, 27333049 - 27333089
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 261  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27333049 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 27333089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Original strand, 27393789 - 27393829
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 261  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27393789 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 27393829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852179
Alignment:
Q  511 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8244193 - 8244158
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8244193 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 8244158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11567195 - 11567160
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11567195 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 11567160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 558
Target Start/End: Original strand, 18199473 - 18199523
Alignment:
Q  507 cctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    ||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18199473 cctatgttgctgtttatta-ttgattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 18199523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19652551 - 19652512
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcg 260  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19652551 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcg 19652512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19870923 - 19870888
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19870923 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19870888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 151
Target Start/End: Original strand, 22059362 - 22059429
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22059362 cagagagcatgttggatttcgtgattttaagctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 22059429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Original strand, 22405709 - 22405748
Alignment:
Q  109 tttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22405709 tttgacttttgagttgaaccttagatgctttagagtgcct 22405748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22863278 - 22863243
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22863278 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22863243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23395401 - 23395366
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23395401 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23395366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 504 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 18453250 - 18453197
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18453250 ctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcataagtcggtctaagatgt 18453197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30694784 - 30694738
Alignment:
Q  139 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  30694784 ttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 30694738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Original strand, 2684995 - 2685088
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  2684995 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa 2685088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186390
Alignment:
Q  460 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 550  Q
    |||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4186390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14472692 - 14472647
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14472692 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 14472647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 262
Target Start/End: Original strand, 16924642 - 16924687
Alignment:
Q  217 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16924642 tctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16924687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 262
Target Start/End: Original strand, 16929357 - 16929402
Alignment:
Q  217 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16929357 tctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16929402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17804649 - 17804494
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  17804649 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaa-caacc 17804551  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17804550 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17804494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 19873196 - 19873120
Alignment:
Q  492 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19873196 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 192
Target Start/End: Original strand, 25594981 - 25595090
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||   |||  |||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | | ||||||    
T  25594981 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttgaaccttgagtgcccttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggatggatgtag 25595080  T
Q  183 gatgagattg 192  Q
    || |||||||    
T  25595081 gacgagattg 25595090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Original strand, 31155163 - 31155204
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31155163 acctgtactctccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 31155204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Original strand, 34369658 - 34369715
Alignment:
Q  139 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  34369658 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacc 34369715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 1587385 - 1587421
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1587385 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 1587421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 5616468 - 5616504
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5616468 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 5616504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12707140 - 12707104
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12707140 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 12707104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16741659 - 16741623
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16741659 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16741623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19668728 - 19668688
Alignment:
Q  222 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19668728 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 19668688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 20803206 - 20803242
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20803206 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 20803242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21702739 - 21702703
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21702739 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21702703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 262
Target Start/End: Original strand, 23657189 - 23657229
Alignment:
Q  222 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23657189 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23657229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 25766822 - 25766858
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25766822 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25766858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Original strand, 27327735 - 27327787
Alignment:
Q  133 atgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27327735 atgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 27327787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Original strand, 27388475 - 27388527
Alignment:
Q  133 atgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 185  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27388475 atgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 27388527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5204 - 4712
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5204 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 5105  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  5104 atgagattgaatctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccataataagagtgact 5005  T
Q  284 tgttaga-ttttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 382  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  5004 tgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttg 4905  T
Q  383 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 482  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |     
T  4904 tataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgta 4805  T
Q  483 attatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
     ||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4804 tttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 84 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 428 - 13
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  428 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 329  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  328 atgagattgaatctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccataataagagtgact 229  T
Q  284 tgttaga-ttttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 382  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  228 tgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttg 129  T
Q  383 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 482  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |     
T  128 tataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgta 29  T
Q  483 attatgtcatgttgtt 498  Q
     |||||||||| ||||    
T  28 tttatgtcatgctgtt 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 131)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 38801020 - 38801508
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801020 cagagagcatgcaagatttcatatttttgacttttgagttgaactttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 38801119  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38801120 atgtgattgaacctggaattgaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgact 38801219  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||     
T  38801220 tgttagattttgcgacctttgttgtacgagttgtcggaagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctga 38801319  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  38801320 ataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataa 38801419  T
Q  484 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38801420 ttatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 27250358 - 27250850
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250358 cagagagcatgcaagatttcgtaatattgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 27250457  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  27250458 atgggattgaacctggaatgaaacctgtgggattctgacctgaactcgccacgtcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacacagaaacagagtccct 27250557  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27250558 tgttatattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgt 27250657  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 482  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27250658 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 27250757  T
Q  483 attatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27250758 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 21027172 - 21026680
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21027172 cagagagcatgcaagaatttgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtagg 21027073  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21027072 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctaaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgact 21026973  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21026972 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgt 21026873  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 482  Q
     |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||     
T  21026872 ttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatata 21026773  T
Q  483 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
     ||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21026772 tttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 84 - 572
Target Start/End: Original strand, 50209832 - 50210333
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50209832 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgatc-ttatatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 50209930  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50209931 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 50210030  T
Q  274 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  50210031 cagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 50210130  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| |||    
T  50210131 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg 50210230  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  50210231 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 50210329  T
Q  569 gatg 572  Q
    ||||    
T  50210330 gatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 84 - 498
Target Start/End: Original strand, 22354190 - 22354616
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  22354190 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcttgaacatgtcttataatgattaggaaataacgtagg 22354289  T
Q  184 atgagattgaacctgga-----------attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    |||||||||||||||||           || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22354290 atgagattgaacctggatagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaa 22354389  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  22354390 acagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttaggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 22354489  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  22354490 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 22354589  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttgtt 498  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||    
T  22354590 caattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 84 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 34510283 - 34509783
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34510283 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 34510184  T
Q  184 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||  |          ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34510183 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaa 34510084  T
Q  274 cagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  34510083 cagagtgtcatgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 34509984  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    | ||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||   ||||||  |||||||||| ||| |||    
T  34509983 tttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttg 34509884  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     | ||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34509883 catttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 34509785  T
Q  569 ga 570  Q
    ||    
T  34509784 ga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22532772 - 22532269
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532772 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgatttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22532673  T
Q  184 atgagattgaacctgga----------attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||||||||||||||||          | | ||||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22532672 atgagattgaacctggaaggattgtagaatgaacttttggaaatctgacttgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaa 22532573  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| || | |||| |||| | |    
T  22532572 cagagtgacttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaac 22532473  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   || |||  |||||||||| |||||||    
T  22532472 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattg 22532373  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     ||| |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  22532372 caatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgat 22532274  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  22532273 gatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 84 - 464
Target Start/End: Original strand, 22355803 - 22356185
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22355803 cagagaacatgcaagatttcataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22355902  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac- 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  22355903 atgagattgaacctggaatgaaatttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtgaca 22356001  T
Q  283 ttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 382  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||     
T  22356002 ttgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagcta 22356101  T
Q  383 tataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttga 464  Q
    | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||  || ||||||||    
T  22356102 tttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 84 - 464
Target Start/End: Original strand, 22357489 - 22357871
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22357489 cagagaacatgcaagatttcataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22357588  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac- 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  22357589 atgagattgaacctggaatgaaatttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtgaca 22357687  T
Q  283 ttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 382  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||     
T  22357688 ttgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagcta 22357787  T
Q  383 tataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttga 464  Q
    | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||  || ||||||||    
T  22357788 tttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 84 - 383
Target Start/End: Original strand, 20846848 - 20847147
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20846848 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtagg 20846947  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20846948 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgaggttttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 20847047  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||  ||||||| |||||||||    
T  20847048 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaaccataatctatgaagctgt 20847147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 84 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 20135690 - 20135188
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20135690 cagagagcatgcaatattttgtaattttgacttttgagtttatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 20135591  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaac-ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||| ||||||||          | |||| || ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  20135590 atgagattggacctggaaagacttagaatgaaacattttggaattctgacc-gaactcgccatggcgagcagaagctctcacctcgcgagtaacccagaa 20135492  T
Q  273 acagagtgacttgttagattt-tgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 371  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| | |||||| | |||||| |||| ||   ||||||||||||    
T  20135491 acagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgtacgagttgttgagagttgaaccttagggtagtagtaagacctaatgatgttgttaattataat 20135392  T
Q  372 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 470  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || | |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  |  ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  20135391 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttgaatt 20135292  T
Q  471 gaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
    | |  |||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||| ||||  |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| || | ||||||     
T  20135291 gcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgt 20135193  T
Q  568 tgatg 572  Q
    |||||    
T  20135192 tgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 433509 - 433012
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  433509 agagagcttgcaagattccgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaa 433410  T
Q  185 tgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||           |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  433409 tgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttg 433311  T
Q  274 cagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtag-gattaagacttaataataaggttaattataa 370  Q
    || | || ||||||   |||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||| | ||||||  || || | |||  |||||  ||||| || |    
T  433310 caaaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagctatgaata-ttataaataatattaatgatga 433213  T
Q  371 tctgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 468  Q
    ||||| |||||| | || |||   ||| || || ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| |||     
T  433212 tctgtaaagctgatttatgatgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgac 433113  T
Q  469 ttgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 565  Q
    ||| | ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  433112 ttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 433017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20919104 - 20918917
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20919104 cagagagcatgcaagattttataattttgacctttgagttgatccttacatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 20919005  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||||          ||||| || ||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20919004 atgagattgaacctgaaaagacttagaatttaaatttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 20918917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 173
Target Start/End: Original strand, 21301157 - 21301245
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21301157 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaa 21301245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33681499 - 33681301
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  33681499 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagttcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 33681400  T
Q  197 tggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttg 285  Q
    |||||     |||     || || || || |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||    
T  33681399 tggaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaattacccagttacagagtgccttg 33681301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 52927612 - 52927716
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  52927612 agatttcgtaattttgacttttgagttgacccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagattggagaatgagattgaacc 52927711  T
Q  197 tggaa 201  Q
    |||||    
T  52927712 tggaa 52927716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21754525 - 21754423
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  21754525 agatttcgtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaaagagattgaacc 21754426  T
Q  197 tgg 199  Q
    |||    
T  21754425 tgg 21754423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 84 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21162231 - 21162117
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||     
T  21162231 cagagagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttaaatgcttttgagtgcctgaataagtctaataacgattgggaaagaatgtaga 21162132  T
Q  184 atgagattgaacctg 198  Q
    |||||||||||||||    
T  21162131 atgagattgaacctg 21162117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22238117 - 22238015
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||||    
T  22238117 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatatttttgagtgcctgaacatgtctaataatggttaggaaagattggagaatgagattaaacctg 22238018  T
Q  199 gaa 201  Q
    |||    
T  22238017 gaa 22238015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20248757 - 20248664
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  20248757 attttgacttttgagttgatccatagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagatcggagaatgagattgaacctgga 20248664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Original strand, 22921499 - 22921603
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||     
T  22921499 gatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacca 22921598  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  22921599 ggaat 22921603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Original strand, 20091092 - 20091281
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  20091092 cagagagcatgcaagatttcttatttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgattgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaag 20091191  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgt-gggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||| |||||          |||| ||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  20091192 atgagattggacctgaaaagacttagaatgaaacaacttgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgttctcacctcgcgag 20091281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 362 - 572
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468816
Alignment:
Q  362 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 460  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || || || | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||   ||  ||| |||  |||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatg-taattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  461 ttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 22468801  T
Q  558 ttgaagatgatgatg 572  Q
     | |||||| |||||    
T  22468802 attaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 14295574 - 14295672
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14295574 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 456 - 557
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896361
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  554 gatg 557  Q
    ||||    
T  21896358 gatg 21896361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 479 - 573
Target Start/End: Original strand, 45574912 - 45575008
Alignment:
Q  479 tattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 497 - 573
Target Start/End: Original strand, 20847200 - 20847275
Alignment:
Q  497 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20847200 ttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 456 - 557
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861675
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaa 21861671  T
Q  554 gatg 557  Q
    ||||    
T  21861672 gatg 21861675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43697849 - 43697745
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||  ||||||| |||||    
T  43697849 gatttcgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctatttatgattagaaaagattctagattgagatttaacct 43697750  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  43697749 ggaat 43697745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 401 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797573
Alignment:
Q  401 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 497  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 33797596  T
Q  498 tgtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  33797595 tgtatgctgcatatgttgctgtt 33797573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 360 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  360 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 437  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 475 - 557
Target Start/End: Original strand, 35261099 - 35261183
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261099 ttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 35261183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921986
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614222
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622050
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50622050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681010
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 504 - 557
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368391
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Original strand, 22468315 - 22468400
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  22468315 cagagagcatgtaagatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 22468400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 477 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 20918702 - 20918623
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918702 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 475 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 21754145 - 21754064
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754145 ttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21754064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 456 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22237746 - 22237630
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22237746 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa 22237647  T
Q  554 gatgttgaagatgatgatgt 573  Q
       |||||||||||||||||    
T  22237646 ---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 410 - 570
Target Start/End: Original strand, 23593735 - 23593897
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  23593735 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23593834  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23593835 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 501 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758668
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 16758668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 500 - 557
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050141
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 41050141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 13989013 - 13988866
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13989013 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13988915  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13988914 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  21840829 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 21923306 - 21923453
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21923306 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21923404  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21923405 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 29776835 - 29776688
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||||||||    
T  29776835 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29776737  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29776736 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 31612460 - 31612313
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  31612460 tatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 31612362  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31612361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 18181764 - 18181826
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||    
T  18181764 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattag 18181826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23763688 - 23763574
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23763688 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 23763589  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  23763588 gacaagattgaacct 23763574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 503 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686627
Alignment:
Q  503 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatg 50686627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928088
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21715036 - 21714983
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21715036 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 21714983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Original strand, 8761252 - 8761316
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||   |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8761252 cagagagcatgttggatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 8761316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248283
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 504 - 572
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 572  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 554
Target Start/End: Original strand, 22123133 - 22123214
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||||  | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123133 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 146
Target Start/End: Original strand, 3472560 - 3472607
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgc 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3472560 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 3472607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 573
Target Start/End: Original strand, 13212928 - 13213027
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  |  || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  13212928 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 13213025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 478 - 576
Target Start/End: Original strand, 15860078 - 15860177
Alignment:
Q  478 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtc 574  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||    
T  15860078 atattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtc 15860175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 555
Target Start/End: Original strand, 16093933 - 16093988
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 555  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaaga 16093988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 21475102 - 21475249
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21475102 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21475200  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  21475201 -gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Original strand, 21895886 - 21895965
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||    
T  21895886 agttgatctttagatgattatgagtgcctgaacaagtataataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacctgg 21895965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Original strand, 22432425 - 22432488
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22432425 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 22432488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064954
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatg 26064954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 475 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 21342192 - 21342090
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  21342192 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 21342095  T
Q  572 gtcca 576  Q
    |||||    
T  21342094 gtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21754392 - 21754350
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754392 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 21754350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 198
Target Start/End: Original strand, 28194090 - 28194180
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||| ||| ||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  28194090 ttttgacctttaagtcgaaccttggatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctg 28194180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 144
Target Start/End: Original strand, 3704731 - 3704776
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3704731 atttcgtgttttggacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 3704776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 16362079 - 16361915
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  || | || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  16362079 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatact 16361980  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 572  Q
    |  | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16361979 gt-tgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 21347057 - 21346961
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21347057 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 197
Target Start/End: Original strand, 20524899 - 20524958
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  20524899 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 20524958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21438216 - 21438157
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  21438216 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 21438157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Original strand, 21861148 - 21861227
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  21861148 agttgatctttagatgattctgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 21861227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 29298195 - 29298137
Alignment:
Q  511 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29298195 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 199
Target Start/End: Original strand, 35981352 - 35981419
Alignment:
Q  132 gatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35981352 gatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctgg 35981419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 570
Target Start/End: Original strand, 16275428 - 16275526
Alignment:
Q  473 aattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||| || | |||||||||    
T  16275428 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16275525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19063942 - 19063884
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  19063942 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 19063884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19111832 - 19111774
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  19111832 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 19111774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707167
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711709
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 22831021 - 22831083
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22831021 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 22831083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12647321 - 12647166
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || ||| | |||||||||| |||||  || |    
T  12647321 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttagaacgagattgaacttggaac-aacc 12647223  T
Q  208 ttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12647222 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12647166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18882819 - 18882664
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  18882819 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacc 18882721  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||||| || | || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18882720 ttagttgggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgag 18882664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20637206 - 20637165
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20637206 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 20637165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21162121 - 21162080
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21162121 acctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21162080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 492 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 21714622 - 21714546
Alignment:
Q  492 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21714622 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 21787685 - 21787746
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  21787685 ttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttaataaagatta 21787746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21829191 - 21829078
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  21829191 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtatggattaggaatgaatgtag 21829092  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    ||| ||||||||||    
T  21829091 gatcagattgaacc 21829078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21844704 - 21844591
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  21844704 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtatggattaggaatgaatgtag 21844605  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    ||| ||||||||||    
T  21844604 gatcagattgaacc 21844591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 198
Target Start/End: Original strand, 35260718 - 35260787
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  35260718 ttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 35260787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 42864854 - 42864915
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  ||| || |||||||||    
T  42864854 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagttgtttattaatgatta 42864915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 201
Target Start/End: Original strand, 16367873 - 16367945
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||| |||||||||||    
T  16367873 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagaatgaacctggaa 16367945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20637339 - 20637235
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgctttt-gagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| |||| |||| |||| ||||||||  || ||| |||| |||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  20637339 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttggatgttttttgagtgcctagacttgtataatgatgattaggaaagattggagattaagattgaacct 20637240  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  20637239 ggaat 20637235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21023115 - 21023075
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcc 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21023115 attttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcc 21023075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 502 - 558
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533978
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgtt-gtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21533978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 23818953 - 23818989
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23818953 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 23818989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Original strand, 41049629 - 41049701
Alignment:
Q  127 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  41049629 ccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtataataatggttaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 41049701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45307793 - 45307721
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 156  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  45307793 cagagagcttgcaagatctcgtgattttgagctgtgagtttaaccttagatgtttatgagggcctgaacatgt 45307721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 45489397 - 45489433
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45489397 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 45489433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Original strand, 16375231 - 16375266
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16375231 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16375266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16759186 - 16759115
Alignment:
Q  127 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  16759186 ccttagatgtttttgagtgcctaaacacgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 16759115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21342615 - 21342564
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21342615 agttgaaccttagatgattttgagtgtctgaatatgtataataatgattagg 21342564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21347480 - 21347429
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21347480 agttgaaccttagatgattttgagtgtctgaatatgtataataatgattagg 21347429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21407688 - 21407653
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21407688 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 24087918 - 24087831
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| | || | |||| || |||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  24087918 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgagctgtgagtttaaccctggatgtttatgagagcctgaacatgtactataatgattagg 24087831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26065441 - 26065382
Alignment:
Q  140 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  26065441 tgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 26065382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 52639874 - 52639839
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52639874 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 52639839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1011169 - 1011087
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1011169 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 1011087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16381698 - 16381652
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag 175  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  16381698 ttagatggttttgagtgcctggacatgtataagaatgattaggaaag 16381652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19105175 - 19105117
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  19105175 tttgagtgcctaaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 19105117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19212319 - 19212226
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag-gaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || ||||||| ||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  19212319 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgaat-tagaacgagattgaacctggaa 19212226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21615889 - 21615796
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |  ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  21615889 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactaatgattagggaacgaatg-agaatgagattgaacctggaa 21615796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 24782754 - 24782816
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | |||| || ||||||||||    
T  24782754 ttttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaatgattag 24782816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 171
Target Start/End: Original strand, 52940464 - 52940506
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  52940464 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataataattagg 52940506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6152331 - 6152270
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  6152331 ttttgacctttgagttgaaccttagttgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 6152270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 144
Target Start/End: Original strand, 17678240 - 17678277
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17678240 atttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 17678277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20138535 - 20138380
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||   |  || ||| |||||||||||||  |||  || |    
T  20138535 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagaggatgatttagaatgagattgaacccagaa-caacc 20138437  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20138436 ttagttgggaatctgacttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20138380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20248633 - 20248592
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20248633 acctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcgcgag 20248592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 261
Target Start/End: Original strand, 22921631 - 22921672
Alignment:
Q  220 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 261  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22921631 gacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 22921672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26065295 - 26065254
Alignment:
Q  222 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26065295 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 26065254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Original strand, 28194213 - 28194254
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  28194213 acctgaactcgccatggcaagtagaggctctcgcctcgcgag 28194254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Original strand, 35981451 - 35981492
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  35981451 acctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 35981492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 46975919 - 46975764
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  46975919 tttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacttttaggtgcctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacc 46975821  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||||||  | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  46975820 ttagttgggattctttcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 46975764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 184
Target Start/End: Original strand, 50887381 - 50887482
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  50887381 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 50887480  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  50887481 ga 50887482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 261
Target Start/End: Original strand, 52927745 - 52927786
Alignment:
Q  220 gacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 261  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  52927745 gacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 52927786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 201
Target Start/End: Original strand, 16093479 - 16093551
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  16093479 ttagatggttttgagtgcctggatatgtataataatgatttggcaagtttttagattgagattgaacctggaa 16093551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21305766 - 21305730
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21305766 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21305730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 33797985 - 33797949
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33797985 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 33797949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 262
Target Start/End: Original strand, 45310135 - 45310175
Alignment:
Q  222 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45310135 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 45310175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 2444 - 1952
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2444 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacgtgtctaataataattaggaaggaatgtagg 2345  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  2344 atgagattgaacctggaattaaacttgagggatgctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgaca 2245  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  2244 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgt 2145  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 482  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||     
T  2144 atatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatc 2045  T
Q  483 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2044 attatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctg-ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 88 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 52067 - 51582
Alignment:
Q  88 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 187  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52067 gagcttgcaagatttcgtattttttacttttgagttaaacctttgatgcctttgagtgcctgaacaagtctaataatgattaggaaagaatgtaggacga 51968  T
Q  188 gattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51967 gattgaacctggaatgaaacttacgggattctaacctgagctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 51868  T
Q  288 agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataa 387  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51867 agattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagaattggacccttgggtaggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataa 51768  T
Q  388 gatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat 487  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  51767 gatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattat 51668  T
Q  488 gtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51667 gtcatgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 13703 - 13211
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13703 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaaaatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 13604  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  13603 atgagactgaacctggaatgaaacttgtggcattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaatcagagtgcct 13504  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||    
T  13503 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgt 13404  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 482  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13403 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 13304  T
Q  483 attatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  13303 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9872 - 9717
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | |   || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  9872 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattatggatttatttagaacgagattgaacctggaa-caacc 9774  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9773 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgag 9717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 1778 - 1289
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |  |||||    
T  1778 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttaaattgaacgttagatgcttttgcgtgcctgaacatgtctaatattgattagtgaatagggtagg 1679  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    | | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1678 acgtgattgaacctggaattaaacttatggaattctaaactgaactcgcgacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgact 1579  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||     
T  1578 tgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctga 1479  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1478 ataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 1379  T
Q  484 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1378 ttatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 7755 - 7266
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |  |||||    
T  7755 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttaaattgaacgttagatgcttttgcgtgcctgaacatgtctaatattgattagtgaatagggtagg 7656  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    | | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7655 acgtgattgaacctggaattaaacttatggaattctaaactgaactcgcgacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgact 7556  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||     
T  7555 tgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctga 7456  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  7455 ataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 7356  T
Q  484 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7355 ttatttcatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 16150 - 16083
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16150 cagagagcatccaagatttcgtatttttgacttttgaattgaaccatagatgcttttgagtgcctgaa 16083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 570
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 3973 - 3470
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3973 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 3874  T
Q  184 atgagattgaacctggaatta-----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||||||||||||| |           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3873 atgagattgaacctggaatgattgtagaatcaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaa 3774  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||  | |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  3773 acagagtgagttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 3674  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    | ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  3673 tatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 3574  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3573 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3475  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  3474 gatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 96 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 833 - 343
Alignment:
Q  96 aagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  833 aagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaac 734  T
Q  196 ctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgactt 284  Q
    || |||           | |||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  733 ctagaaagaatttagaatgaaacttttggaat-ctgaactgaactcgccgcggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtctt 635  T
Q  285 gtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    |||| | |||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | |||||||||||| | |||||||||    
T  634 gttaggtttttgcaacctttgttgcatgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgt 535  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 482  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||  |||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  534 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatatt 435  T
Q  483 attatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||| ||||||   | ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  434 attacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 2353 - 1851
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2353 agagagcatccaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 2254  T
Q  185 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||    
T  2253 tgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccctaaaa 2154  T
Q  274 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 373  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  2153 cagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatct 2054  T
Q  374 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 472  Q
    |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  2053 gtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 1954  T
Q  473 aattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1953 aattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 1855  T
Q  570 atgt 573  Q
    ||||    
T  1854 atgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 207161 - 207324
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||             
T  207161 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaaagactt 207260  T
Q  199 -gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
     |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  207261 agaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 207324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Original strand, 119205 - 119255
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  119205 agttgaacattagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 119255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 5)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 85 - 554
Target Start/End: Original strand, 23921 - 24405
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23921 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtagga 24020  T
Q  185 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 274  Q
    |||||||||||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24021 tgagattgaacctggaaaattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaac 24120  T
Q  275 agagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctg 374  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | || ||| ||||||||||| | |  | |||||||||||||||    
T  24121 aaagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaactttgggatagtattaagacttattgaggatgttaattataatctg 24220  T
Q  375 tgaagctgtataagatatgttgttgatg-attatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 472  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  24221 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 24320  T
Q  473 aattgatattattatgtcatgttg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||||| |||||||||| ||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24321 aattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 64305 - 64150
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  ||  || || |||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||||  || |    
T  64305 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcgtactattgattagggaaggatttagaacgagattgaaactggaac-aacc 64207  T
Q  208 ttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  64206 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 64150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 76189 - 76034
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||  |  || ||| || |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  76189 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtaactttaggtgcctactattgattagggaaggatttagaacgagattgaacctggaa-caacc 76091  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   | ||||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  76090 ttagttaggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 76034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Original strand, 34553 - 34593
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34553 ttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 34593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Original strand, 41196 - 41236
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  41196 ttttgacttgtgagttgaaccttagatgattttgagtgcct 41236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 84 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 7102 - 6669
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7102 cagagagcacgcaagatttcatatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacgtgtctaataattattaggaaggaatgtagg 7003  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  7002 atgagattgaacctggaattaaacttgagggatgctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccataaacagagtgaca 6903  T
Q  284 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6902 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgt 6803  T
Q  384 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 482  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||| |||||||  ||||||||     
T  6802 atatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatc 6703  T
Q  483 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgt 513  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  6702 attatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5339 - 4849
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5339 agagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaagatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 5240  T
Q  185 tgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgactt 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5239 tgagattgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctcttgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgactt 5140  T
Q  285 gttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgta 384  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||| ||| | ||||||||||| |   |||||  ||||||||||||||||||     
T  5139 gttag-ttttgccacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggctagcaataagacttaatgaaggggttagctataatctgtgaagctgtt 5041  T
Q  385 taagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  5040 taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatatta 4941  T
Q  484 ttatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4940 ttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 5739 - 6245
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5739 cagagagcatgcaagatttcgtgttttttacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtagg 5838  T
Q  184 atgagattgaacctgg-----------aattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||||||||||           ||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5839 atgagattgaacctgggaagattattgaatgaaatttgcgggattctgacctgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgttagtgacccagaa 5938  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||      
T  5939 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttatcgagagtggaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaa 6038  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  6039 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 6138  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgt--ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 566  Q
     |||||||||||| ||||||   |||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6139 caattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 6238  T
Q  567 atgatgt 573  Q
    |||||||    
T  6239 atgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 39262 - 38761
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39262 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgactttgaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 39163  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39162 atgagattgaacctggaaagattttgaatgaaacttgtgg-attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 39064  T
Q  274 cagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39063 catagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatc 38964  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| | | |||    
T  38963 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttg 38864  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
     | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  38863 catttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatg 38765  T
Q  570 atgt 573  Q
    ||||    
T  38764 atgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 33153 - 32942
Alignment:
Q  364 attataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt 462  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  33153 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 33054  T
Q  463 gatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 560  Q
    | | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  33053 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 32955  T
Q  561 aagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||||||    
T  32954 aagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 9845 - 9744
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  9845 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 9748  T
Q  572 gtcc 575  Q
    ||||    
T  9747 gtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 21392 - 20910
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21392 agagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgttttttagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagga 21293  T
Q  185 tgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgactt 284  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21292 tgagattgtacctggaatgaaacttgt----------cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccaaaaacagagtgactt 21203  T
Q  285 gttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgta 384  Q
    |||   |||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||||     
T  21202 gttgagttttgcgacctttgttgcacgagttgatcagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtt 21103  T
Q  385 taagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 483  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21102 taagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatatta 21003  T
Q  484 ttatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21002 ttatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 9)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 84 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 125085 - 124675
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  125085 cagagagcatgcaagatttggtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 124986  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    |||||   ||||||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124985 atgag---gaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 124889  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  124888 aaagagtgtcttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatc 124789  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||    
T  124788 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattg 124689  T
Q  472 aaattgatattatt 485  Q
     |||||||||||||    
T  124688 caattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 174883 - 174767
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 555  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  174883 agatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 174784  T
Q  556 tgttgaagatgatgatg 572  Q
    |||||||| ||||||||    
T  174783 tgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 63051 - 62947
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  63051 agatttcgtaaatttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 62952  T
Q  197 tggaa 201  Q
    |||||    
T  62951 tggaa 62947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 175267 - 175202
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctg 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  175267 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctg 175202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 503 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  503 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 497 - 557
Target Start/End: Original strand, 136414 - 136474
Alignment:
Q  497 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136414 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 497 - 557
Target Start/End: Original strand, 145122 - 145182
Alignment:
Q  497 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145122 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 145182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 263
Target Start/End: Original strand, 136132 - 136173
Alignment:
Q  222 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  136132 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 136173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 263
Target Start/End: Original strand, 144840 - 144881
Alignment:
Q  222 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  144840 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 144881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 4)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 85 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 13594 - 13141
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13594 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagga 13495  T
Q  185 tgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||||||||| |||           |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13494 tgagattgaatctgaaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 13395  T
Q  274 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 373  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| |||  |||||||| |  | ||||||||||||||    
T  13394 ctgagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaagatgttaattataatct 13295  T
Q  374 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 472  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| |||     
T  13294 gtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgc 13195  T
Q  473 aattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 523  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13194 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34623 - 34437
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34623 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 34524  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 261  Q
    |||||||||||||||          |||| ||| ||  | || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34523 atgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttggagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 34437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 34221 - 34123
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34221 gatattattatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 520 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 4)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 84 - 572
Target Start/End: Original strand, 16833 - 17337
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16833 cagagagcatgcaagatttcttgtttttgactttcgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 16932  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 17032  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  17033 cagagtaccttattaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttaaaccttggggtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatc 17132  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||| ||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| |||    
T  17133 tgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg 17232  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatg-----ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 566  Q
     | |||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17233 catttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17331  T
Q  567 atgatg 572  Q
    ||||||    
T  17332 atgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 200
Target Start/End: Original strand, 78980 - 79096
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  78980 cagagagcatgcaagattttgtaattctgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtttaataatgattaggaaggaatgtaga 79079  T
Q  184 atgagattgaacctgga 200  Q
    |||||||||||||||||    
T  79080 atgagattgaacctgga 79096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 557
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79433
Alignment:
Q  511 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 79433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Original strand, 13696 - 13760
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||||||| |  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  13696 cagagagcatgtagaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagaggtttttgagtgcct 13760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 8978 - 8479
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8978 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaatagtgattaggaaagaatgtagg 8879  T
Q  184 atgagattgaacctggaatta-----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    |||||||||||||| |||  |           |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8878 atgagattgaacctagaaagattgtaaaatggaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggccagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaa 8779  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||||| || | |||||||| ||||    
T  8778 acagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatc 8679  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||    ||||| | | |||||||||||||| | | ||| ||   |||||||||| ||| |||    
T  8678 tgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttg 8583  T
Q  472 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8582 caattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgct-attgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 8484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 87 - 573
Target Start/End: Original strand, 8154 - 8650
Alignment:
Q  87 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8154 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatcctt-gatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 8252  T
Q  187 agattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaca 275  Q
    ||||||||||||           |||| |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8253 agattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttttggaattctggcctaaactcgccacggtgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaca 8352  T
Q  276 gagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaaccct-tgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctg 374  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||  |  |||||| |||  |||||||| |  | |||||||||||||||    
T  8353 gagtgtcttgttaggttttgcgaccttcgttgcacgagttgttgagagttgaacgttgggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctg 8452  T
Q  375 tgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 473  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |    
T  8453 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgca 8552  T
Q  474 attgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8553 attgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgc----tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 8648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 40414 - 39913
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  40414 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaggaatgtagg 40315  T
Q  184 atgagattgaacctg---gaat------taaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 274  Q
    |||||||||||||||   || |      | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40314 atgagattgaacctgacagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 40215  T
Q  275 agagtgacttgttagat-tttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 373  Q
    |||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||    
T  40214 agagtaccttgttaggtgtttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatct 40115  T
Q  374 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 472  Q
    |||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| |   |||  |||||||||  |||  ||     
T  40114 gtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgc 40015  T
Q  473 aattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  40014 atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 39916  T
Q  571 tgt 573  Q
    |||    
T  39915 tgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 500 - 557
Target Start/End: Original strand, 19933 - 19990
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19933 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 262
Target Start/End: Original strand, 18413 - 18464
Alignment:
Q  211 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18413 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 18299 - 18360
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  18299 tttttacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 18360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 5)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 84 - 570
Target Start/End: Original strand, 339569 - 340065
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  339569 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgagtgcctgaatttgtctaataatgattaggaatgaatgtagg 339668  T
Q  184 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||||||  |          ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339669 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttgggaatctgacatgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 339768  T
Q  274 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 373  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||  || |||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||    
T  339769 tagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagtcgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatct 339868  T
Q  374 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 472  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| |||     
T  339869 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg- 339967  T
Q  473 aattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  339968 atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttg--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 401 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71353
Alignment:
Q  401 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 497  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 71376  T
Q  498 tgtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  71375 tgtatgctgcctatgttgctgtt 71353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 71789 - 71729
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  71789 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 71729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 158465 - 158612
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  158465 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 158563  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  158564 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 140162 - 140126
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  140162 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 140126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 85 - 566
Target Start/End: Original strand, 25684 - 26179
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25684 agagagcttgcaagatttcatgtttttgacttttgagttgatccttagatggttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 25783  T
Q  185 tgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 274  Q
    |||||||||||||| ||  |          || || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25784 tgagattgaacctgaaaagattgtagaatgaatttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 25883  T
Q  275 agagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 373  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||   |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||    
T  25884 agagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatct 25983  T
Q  374 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 472  Q
     ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||   ||||||| | ||| |||| ||||||      
T  25984 atgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattac 26083  T
Q  473 aattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 566  Q
    | |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26084 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 84 - 421
Target Start/End: Original strand, 33112 - 33461
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33112 cagagagcttgcaagatttcgtgattttcacttttgagttgatccttagatgcttctgagtgcctggacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 33211  T
Q  184 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33212 atgagattgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaagtcttacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcgcctcgcgtgtgacccagaa 33311  T
Q  273 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 371  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||| || |||    ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||     
T  33312 acagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcatacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataac 33411  T
Q  372 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg 421  Q
    || ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||||||    
T  33412 ctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatg 33461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 456 - 570
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44825
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 552  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T
Q  553 agatgttgaagatgatga 570  Q
    || || | ||||||||||    
T  44808 agttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 7)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 40359 - 39858
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40359 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccgtagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatggagg 40260  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||| |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40259 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttttggt-ttctaacctgtactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgggtgacctagaa 40161  T
Q  273 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 371  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||||    
T  40160 accgagtgccttgttatgattttgcgacctttgttgcacaatttgttgagagttgaa-ccttgggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataat 40062  T
Q  372 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 470  Q
     ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||| | | ||    
T  40061 ttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttactt 39962  T
Q  471 gaaattgatattattatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 568  Q
    | | |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  39961 gcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgat 39863  T
Q  569 gatgt 573  Q
    |||||    
T  39862 gatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 259 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 26213 - 25896
Alignment:
Q  259 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataata 357  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |      
T  26213 cgagtgacccagaaaccaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgagg 26114  T
Q  358 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataa 456  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||| |||  | |    
T  26113 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttga 26014  T
Q  457 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26013 gatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaag 25915  T
Q  555 atgttgaagatgatgatgt 573  Q
     || ||||||| |||||||    
T  25914 ttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 39549 - 39666
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  39549 cagagagcatgccagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtaga 39648  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39649 atgagattgaacctggaa 39666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Original strand, 59179 - 59235
Alignment:
Q  142 agtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  59179 agtgcctgaacatgtctaataatgattaggacagaatgtagaatgagattgaacctg 59235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26662 - 26611
Alignment:
Q  150 aacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26662 aacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattaaacctggaa 26611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Original strand, 59271 - 59308
Alignment:
Q  225 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  59271 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 59308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26589 - 26555
Alignment:
Q  213 ggattctgacctgaactcgccacggcgagcagagg 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26589 ggattctgacctgaagtcgccacggcgagcagagg 26555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 108 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 1382 - 1052
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1382 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacattactaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaac 1283  T
Q  208 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 307  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1282 ttgtgggattctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccggaaacaaagtgccttgtgagactttgcgacctttgttg 1183  T
Q  308 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 407  Q
    | | |||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||    
T  1182 cacgagttgttgagagttgaacttttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattat 1083  T
Q  408 gatgtgatataatg-attatgcattacttga 437  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1082 gatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 4)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 108 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 3949 - 3640
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3949 ttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaacatgactagtaatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaac 3850  T
Q  208 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||    
T  3849 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgtgacctttgttg 3750  T
Q  308 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 407  Q
    | | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  3749 cacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattat 3650  T
Q  408 gatgtgatat 417  Q
    ||||||||||    
T  3649 gatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 108 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 8013 - 7704
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8013 ttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaacatgactagtaatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaac 7914  T
Q  208 ttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||    
T  7913 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgtgacctttgttg 7814  T
Q  308 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 407  Q
    | | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  7813 cacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattat 7714  T
Q  408 gatgtgatat 417  Q
    ||||||||||    
T  7713 gatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 475 - 554
Target Start/End: Original strand, 27770 - 27851
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27770 ttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 27851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Original strand, 27296 - 27375
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  27296 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagtttgagattgaacctgg 27375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 84 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 20906 - 20596
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20906 cagagagcatgtaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 20807  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20806 atgagattgaacctggaaagattatagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacctagaa 20707  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||| || | ||||| |||||||    
T  20706 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggaatagcattaagacttaatgatgatgttaactataatc 20607  T
Q  373 tgtgaagctgt 383  Q
    |||||||||||    
T  20606 tgtgaagctgt 20596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 112 - 382
Target Start/End: Original strand, 11170 - 11440
Alignment:
Q  112 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgt 211  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11170 gacttttgagttgaaccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgt 11269  T
Q  212 gggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctca 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  11270 gggatactgacctgaactcgccaaggcgagaagaggctctcacctcgcgagtgacacagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacg 11369  T
Q  312 agttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 382  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11370 agttgtagagagttgaacctttgggtagaattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctg 11440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 458 - 573
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  458 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  555 atgttgaagatgatgatgt 573  Q
     |||||||||||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14106 - 14055
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14106 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 14055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 99 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 23370 - 22886
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  23370 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggatctg 23271  T
Q  199 gaat-----taaacttg-----tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta 288  Q
    |||      || | |||     ||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23270 gaaagattgtagaattgaattttggaattctgaactgagctcgccacagcgagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgtcttgtta 23171  T
Q  289 gatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataa 387  Q
    | |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23170 ggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaa 23071  T
Q  388 gatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattatta 486  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  23070 gatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattatta 22971  T
Q  487 tgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |||||   |||| ||||||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22970 tgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 94 - 573
Target Start/End: Original strand, 16227 - 16721
Alignment:
Q  94 gcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattga 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16227 gcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagaatgagattga 16326  T
Q  194 acctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac 282  Q
    |||||           |||| |||| | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  16327 acctggaaagattttcgaatgaaacgtttggaaatctaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgcc 16426  T
Q  283 ttgtt-agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagct 381  Q
    |||||  |||||||||| || ||| || ||||||||   |||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||||||    
T  16427 ttgttgggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaggagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagct 16526  T
Q  382 gtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgata 480  Q
    || |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||| | ||||| || ||| ||  | ||||||    
T  16527 gtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgata 16626  T
Q  481 ttattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  16627 ttattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 4)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5010 - 4508
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5010 agagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaa 4911  T
Q  185 tgagattgaacctggaa------------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    |||||||||||||||||            | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4910 tgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaa 4812  T
Q  273 acagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 371  Q
    |||| ||  || ||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  4811 acagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataat 4712  T
Q  372 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 470  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  4711 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 4612  T
Q  471 gaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
    | | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  4611 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatga 4514  T
Q  568 tgatgt 573  Q
    | ||||    
T  4513 ttatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 12592 - 12090
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12592 agagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaa 12493  T
Q  185 tgagattgaacctggaa------------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    |||||||||||||||||            | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12492 tgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaa 12394  T
Q  273 acagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 371  Q
    |||| ||  || ||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  12393 acagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataat 12294  T
Q  372 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 470  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  12293 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 12194  T
Q  471 gaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
    | | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  12193 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatga 12096  T
Q  568 tgatgt 573  Q
    | ||||    
T  12095 ttatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 85 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22544 - 22042
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22544 agagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaa 22445  T
Q  185 tgagattgaacctggaa------------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    |||||||||||||||||            | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22444 tgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaa 22346  T
Q  273 acagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 371  Q
    |||| ||  || ||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  22345 acagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataat 22246  T
Q  372 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 470  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  22245 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 22146  T
Q  471 gaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
    | | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  22145 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatga 22048  T
Q  568 tgatgt 573  Q
    | ||||    
T  22047 ttatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 18286 - 18441
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  |||||| ||| ||||||  ||  || ||| |  ||||||||||| |||  || |    
T  18286 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctttaggtgtctattaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctagaa-caacc 18384  T
Q  208 t--tgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |  | ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18385 ttatttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 99 - 556
Target Start/End: Original strand, 51517 - 51987
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51517 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctg 51616  T
Q  199 gaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 287  Q
    |||           | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51617 gaaagattgtcgaatgaaacttgtgggattttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcacctcgctagtgacccagaaacagagtgacttgtt 51716  T
Q  288 agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg-tata 386  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |  || |  ||||||| ||| |||||||||| |||     
T  51717 agattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctgttatg 51816  T
Q  387 agata-tgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg-ttgatgaattgaaattgatattat 484  Q
    ||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||  || |||  | ||||| ||| ||  |||  |||||||||||    
T  51817 agatattaatgttgat--ttatgatgtgatataatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttg-cattgatattat 51913  T
Q  485 tatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagat 556  Q
    |||||| ||   || ||| || ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51914 tatgtcttgctatttttgaatgctgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 475 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 32636 - 32555
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32636 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 32555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33003 - 32921
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    |||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| ||||||    
T  33003 agttgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagattctagattgagattgaacttggaat 32921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 32892 - 32826
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 287  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||    
T  32892 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctacccagttacagaatgccttgtt 32826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 84 - 513
Target Start/End: Original strand, 580 - 1021
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  580 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtaga 679  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    | |||||||||||||          |||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  680 acgagattgaacctggtttagtagagaatgaaacttgttggaaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggttcccgcctcgtgagtgacctagaa 779  T
Q  273 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 371  Q
    |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||  | | | || |||| ||    
T  780 acagagagtcttgttaggatttttcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgat 879  T
Q  372 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 470  Q
     ||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||  ||  ||| |||  | |||| ||| ||| ||    
T  880 atgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgactt 979  T
Q  471 gaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgt 513  Q
    |  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  980 g-cattgatattattatgccatgctgttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 202
Target Start/End: Original strand, 8110 - 8228
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| | |||| |||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||  | |||     
T  8110 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgagttgtgagtttaaccttggatgtttatgagggcctgaacatgtacaataatgattaggcaaggttttaga 8209  T
Q  184 atgagattgaacctggaat 202  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  8210 atgagattgaacttggaat 8228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 573
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 217 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 39836 - 39479
Alignment:
Q  217 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagtt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || ||| || ||||||    
T  39836 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtt 39737  T
Q  316 gtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgat 415  Q
    ||  || |||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  39736 gttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 39637  T
Q  416 ataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatg 512  Q
    |||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  39636 ataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatg 39537  T
Q  513 ttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  39536 ttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 217 - 571
Target Start/End: Original strand, 74976 - 75333
Alignment:
Q  217 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagtt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || ||| || ||||||    
T  74976 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtt 75075  T
Q  316 gtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgat 415  Q
    ||  || |||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  75076 gttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 75175  T
Q  416 ataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatg 512  Q
    |||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  75176 ataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatg 75275  T
Q  513 ttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  75276 ttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 6)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Original strand, 32577 - 33077
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||     
T  32577 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggaga 32676  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||| ||     |||     || || || || |   |||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  32677 atgagattgaacctgtaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcaccctaactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgacccataaa 32776  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||| || ||||||| |||||||||| || ||| || | | ||||  ||||||||||| | |||||| ||| | ||||| | |    |||| ||||||||    
T  32777 cagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatc 32876  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||| | | |   ||| || || |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| |||  || |||  |||||||||| |||||||    
T  32877 tgtgaagctatttta-tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtata-atgaatatttaagatgttgttgaattg 32974  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
     ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32975 caattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 33073  T
Q  570 atgt 573  Q
    ||||    
T  33074 atgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 84 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 46428 - 45928
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||     
T  46428 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggaga 46329  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||| ||     |||     || || || || |   |||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  46328 atgagattgaacctgtaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcaccctaactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgacccataaa 46229  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||| || ||||||| |||||||||| || ||| || | | ||||  ||||||||||| | |||||| ||| | ||||| | |    |||| ||||||||    
T  46228 cagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatc 46129  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||||||| | | |   ||| || || |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| |||  || |||  |||||||||| |||||||    
T  46128 tgtgaagctatttta-tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtata-atgaatatttaagatgttgttgaattg 46031  T
Q  472 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
     ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  46030 caattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 45932  T
Q  570 atgt 573  Q
    ||||    
T  45931 atgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16588 - 16333
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16588 agagagcatgcaagatttcaagattttgacttttgagttgatccttagg-gcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 16490  T
Q  185 tgagattgaacctggaa-----ttaaacttg-----tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 274  Q
     ||||||||||||||||      || | |||     ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  16489 cgagattgaacctggaaagattgtagaattgaattttggaattctgaactgagctcgccacggcgatcagaggccctcacctcgcaagtgacccagaaac 16390  T
Q  275 agagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacc 330  Q
    |||| | ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  16389 agagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacc 16333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 365 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  365 ttataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttg 463  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||||| || |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||   ||   ||||||| | ||||| ||    
T  16323 ttataatctgtgaagctgtttta-agatgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatg 16225  T
Q  464 atgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 560  Q
     ||  ||| | |||||||||| || || || ||||   ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16224 ttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  561 aagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||||||    
T  16125 aagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 511 - 573
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  511 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 19671 - 19707
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19671 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 19707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 84 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 407 - 163
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  407 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 308  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    |||||||||||||||          |||| |||||| | |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  307 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgagttctgacctgaactcgccacagcgagtagaggctctcgccacgcgagtgacccagaaa 208  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgt 317  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||    
T  207 cagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgt 163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 84 - 396
Target Start/End: Original strand, 17626 - 17928
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17626 cagagagcatgcaagatttcatgattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 17725  T
Q  184 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 272  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||| ||||||||    
T  17726 atgagattgaacctggatagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggc---------------------gagtcacccagaa 17804  T
Q  273 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  17805 atagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 17904  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttg 396  Q
    ||||||||||| |||||| |||||    
T  17905 tgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 84 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 10661 - 10323
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||        
T  10661 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgcctagtagtgattaggaaagaatg---- 10566  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----tta-------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaga 271  Q
       |||||||||||||||     |||       || || |   ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||    
T  10565 ---agattgaacctggaaagattttagaatgaaaaattttcaaattctgacctgaactcgccacggcgagcagagcttcccgcctcgcgagtgacctaga 10469  T
Q  272 aacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataa 370  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||| || ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||    
T  10468 aacaaagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaataataa 10369  T
Q  371 tctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgata 416  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  10368 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 291 - 573
Target Start/End: Original strand, 2987 - 3271
Alignment:
Q  291 ttttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagat 390  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2987 ttttgcgacctgtgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagat 3086  T
Q  391 atgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgt 489  Q
      |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  3087 gcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 3186  T
Q  490 catgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3187 catgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 84 - 280
Target Start/End: Original strand, 631 - 837
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  631 cagagagcttgtaagattttgtgattttgaccttcgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 730  T
Q  184 atgagattgaacctgga----------attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||| ||| |          | | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  731 atgagattgaatctgaaaagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggtgagcggaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 830  T
Q  274 cagagtg 280  Q
    |||||||    
T  831 cagagtg 837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 84 - 241
Target Start/End: Original strand, 13226 - 13383
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13226 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 13325  T
Q  184 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgag 241  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  13326 atgagattgagcctgaaatgaaacttgtgggatcctgacctgaacttgccccggcgag 13383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 84 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 5026 - 4545
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| |||||     
T  5026 cagagagcttgcaagatttcgtgactttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctattaatgactagggaagattgtaga 4927  T
Q  184 atgagattgaacctggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 273  Q
    ||||||||||||||| ||     |||     ||||| ||    || ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  4926 atgagattgaacctgaaaagattttagaatgaacttttgtcgatcagacctgtcctcgccatggcgagcaaaggctctcgcctcgcaagctacccagaaa 4827  T
Q  274 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 372  Q
    |||| || | ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||| | |  | ||||||||||||     
T  4826 cagaatgccatgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttgaggtagtattgagacttattgaagatgttaattataatt 4727  T
Q  373 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 471  Q
    ||||| ||||| | | | |||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || |||  |||||||||| ||||||     
T  4726 tgtgaggctgtttta-agatgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaatta 4628  T
Q  472 aaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 552  Q
     | |||||||||| || ||    || ||||| |||||||||||| || || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4627 tatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10355 - 10200
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  10355 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 10257  T
Q  208 ttg--tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10256 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 10200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 215 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 28192 - 27912
Alignment:
Q  215 attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaag 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || ||| || ||||    
T  28192 attctgacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcaatctgtgtcgcacaag 28093  T
Q  314 ttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtg 413  Q
    ||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  28092 ttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtg 27993  T
Q  414 atataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 493  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  27992 atataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 84 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29039 - 28924
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29039 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagtagatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 28940  T
Q  184 atgagattgaacctgg 199  Q
    ||||||||||||||||    
T  28939 atgagattgaacctgg 28924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 84 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20615 - 20426
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20615 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 20516  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    || ||||||||||||          |||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20515 ataagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggagttctgacctgagctcgccacgacgagcagaggctctcgcctcgcgagt 20426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Original strand, 23932 - 24001
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 84 - 267
Target Start/End: Original strand, 15233 - 15426
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  15233 cagagagcatgcaagatatcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtaga 15332  T
Q  184 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 267  Q
    ||||||||||| |||           |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15333 atgagattgaatctggatagattttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatagcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 15426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 456 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12584
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  554 gatg 557  Q
    ||||    
T  12587 gatg 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13133 - 13033
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||| ||| |||||||  || |||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  13133 gattttgtggttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaccatgtatattaatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 13034  T
Q  198 g 198  Q
    |    
T  13033 g 13033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 2703 - 2820
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2703 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 2802  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2803 atgagattgaacctggaa 2820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 18576 - 18693
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18576 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagatgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 18675  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18676 atgagattgaacctggaa 18693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 84 - 270
Target Start/End: Original strand, 1696 - 1891
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1696 cagagagcttgcaagattctgtgattttgacttttgagttgatccttagatg-ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 1794  T
Q  184 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 270  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1795 atgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tggaaatctgacctgaattcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 1891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 106; Significance: 9e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17268 - 17090
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17268 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 17169  T
Q  199 -----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 267  Q
               |||| |||||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17168 gatagattttagaataaaactt-tgagaatatgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 17090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 16880 - 16784
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16880 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 201
Target Start/End: Original strand, 7471 - 7506
Alignment:
Q  166 attaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7471 attaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 7506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 262
Target Start/End: Original strand, 7537 - 7576
Alignment:
Q  223 ctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7537 ctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgag 7576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 5)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 84 - 259
Target Start/End: Original strand, 20044 - 20228
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  20044 cagagagcatgcaagatttcgtgaatttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtttaataatgagtaggaaagaatgtaga 20143  T
Q  184 atgagattgaacctgg---aatta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 259  Q
    ||||||||||||||||   |||||      ||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20144 atgagattgaacctggattaattaagaatgaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 20228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 424 - 557
Target Start/End: Original strand, 20394 - 20527
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgttt 521  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||     
T  20394 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt- 20491  T
Q  522 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20492 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 151
Target Start/End: Original strand, 65412 - 65479
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  65412 cagagagcatgtaagattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 65479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 409 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128827
Alignment:
Q  409 atgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 498  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  128917 atgtgatataatg-ttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 128827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 54017 - 53862
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  54017 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaa-caacc 53919  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  53918 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 53862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 84 - 259
Target Start/End: Original strand, 12427 - 12611
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12427 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 12526  T
Q  184 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 259  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12527 atgagattgaacctggaaagacatagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 12611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 201
Target Start/End: Original strand, 7913 - 8029
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7913 agagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagga 8012  T
Q  185 tgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||    
T  8013 tgagattgaacctggaa 8029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 404 - 557
Target Start/End: Original strand, 53498 - 53654
Alignment:
Q  404 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt-- 500  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |      
T  53498 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 53597  T
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53598 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaagatg 53654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Original strand, 53125 - 53204
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  53125 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 53204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Original strand, 8062 - 8099
Alignment:
Q  225 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8062 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 8099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 530 - 344
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  530 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgaattgaaccttagatgcctt-gagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 432  T
Q  184 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||||||| ||          |||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  431 atgagattgaacctggaaatacttagaatggaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 262
Target Start/End: Original strand, 2064 - 2250
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2064 agagagcatgcaagattttgtaattttgactgttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaa 2163  T
Q  185 tgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||          |||| ||| ||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2164 tgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 2250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10540
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10647 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 10548  T
Q  184 atgagatt 191  Q
    ||||||||    
T  10547 atgagatt 10540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16161 - 16047
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16161 cagagagcatgcaagattttgtaattttgactttagagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 16062  T
Q  184 atgagattgaacctg 198  Q
    |||||||||||||||    
T  16061 atgagattgaacctg 16047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 477 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 15759 - 15664
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15759 gatattattatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1845 - 1755
Alignment:
Q  79 aggagcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  1845 aggaccagagagcatgtaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttattaaagatta 1755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16011 - 15974
Alignment:
Q  225 gaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16011 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 15974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Original strand, 79950 - 80137
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  79950 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaacattaaatgccattgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 80049  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||          | ||||||  | || |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  80050 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctgac-tgaactcgacatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 80137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 456 - 573
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22788
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22672 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22771  T
Q  554 gatgttgaagatgatgatgt 573  Q
       ||||||| |||||||||    
T  22772 ---gttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     | | |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  82134 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 199
Target Start/End: Original strand, 21212 - 21303
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| || |||| || ||| |||||    | ||||||||||||||||||||||||    
T  21212 tttttacttttgagttgaaccttagatgttttttagtaccttaagatgtgtattaaggattaaatgataatgtaggatgagattgaacctgg 21303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 197
Target Start/End: Original strand, 28899 - 29011
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28899 agagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgggttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaa 28998  T
Q  185 tgagattgaacct 197  Q
    |||||||||||||    
T  28999 tgagattgaacct 29011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 497 - 554
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8176
Alignment:
Q  497 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10412 - 10226
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10412 agagagcatgtaagattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaacatgtctattattgattaggaaagaatgtagga 10313  T
Q  185 tgagattgaacctggaa----tt------aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||||||    ||      ||||||  | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10312 tgagattgaacctggaaagacttagaaggaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 10226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12416 - 12243
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12416 atttcgtgattttgacttttgaattgatccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 12317  T
Q  199 g---aatta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |   |||||      ||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12316 gattaattaagaatgaactttttggaaactgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagt 12243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11979
Alignment:
Q  511 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Original strand, 9452 - 9639
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9452 cagatagcatgcaagatttcatgatttcgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattacgaaagaatgtagg 9551  T
Q  184 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||| ||||||          | ||||||  | || |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9552 atgagattgaatctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctgac-tgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 9639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7301 - 7197
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  7301 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 7202  T
Q  197 tggaa 201  Q
    |||||    
T  7201 tggaa 7197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 501 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6828
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8505 - 8401
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||||||  |||||||  || |||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||    
T  8505 gatttcgtagttttgacccttaagttgaaccttaaatgtttttgggtgtctgaatatgtgtaataatgattagaaaagattctagattgagattgaacct 8406  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  8405 ggaat 8401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7167 - 7126
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  7167 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgccttgcgag 7126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 195
Target Start/End: Original strand, 6449 - 6557
Alignment:
Q  87 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 186  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6449 agagaatgcaagatttcatgattttgacttttgagatgatccttagatgccttttagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatg 6548  T
Q  187 agattgaac 195  Q
    |||||||||    
T  6549 agattgaac 6557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 222 - 286
Target Start/End: Original strand, 6561 - 6625
Alignment:
Q  222 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  6561 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaatagagtgccttgt 6625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18148
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18050 gatattattatatcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 554
Target Start/End: Original strand, 2195 - 2275
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2195 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcaagagtcggtctaag 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 12)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 133143 - 133039
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  133143 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 133044  T
Q  197 tggaa 201  Q
    |||||    
T  133043 tggaa 133039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 509 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  509 tatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 136827 - 136680
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  136827 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 136729  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  136728 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 139296 - 139149
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  139296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 139198  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  139197 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 144234 - 144087
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  144234 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 144136  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  144135 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62217
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaag 62217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 134358 - 134211
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  134358 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 134260  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  134259 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 141765 - 141618
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  141765 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 141667  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  141666 -gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 133009 - 132967
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  133009 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 132967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Original strand, 58492 - 58527
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  58492 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 58527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 41959 - 41901
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  41959 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcatattgaacc 41901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 57466 - 57408
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  57466 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagaatcagattgaacc 57408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 372 - 572
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  372 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat-gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 470  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  471 gaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
      | ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  568 tgatg 572  Q
    |||||    
T  3302 tgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 262
Target Start/End: Original strand, 24268 - 24456
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgatttt-gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  24268 cagagagcatgcaagatttcgtgatttttgacttttgagtttaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatttag 24367  T
Q  183 gatgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||| |||          | ||||||  |  | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24368 gatgagattgaacctagaaagacttagaatgaaactttggataatctgac-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 38279 - 38377
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  38279 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 5)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 437 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28414
Alignment:
Q  437 aagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaacta 533  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaacta 28454  T
Q  534 agctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28453 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 11390 - 11292
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11390 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 2095 - 1997
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2095 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14980 - 14914
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctga 150  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14980 cagagagcatgcaagattttgtaattttgactttagagttgatccttagatgctttggagtgcctga 14914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 517 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  517 tgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 161173 - 161072
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  161173 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctg 161074  T
Q  199 ga 200  Q
    ||    
T  161073 ga 161072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 475 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 160784 - 160688
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  160784 ttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 410 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501100
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  501146 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 501100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Original strand, 85646 - 85742
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  85646 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 447007 - 446965
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  447007 ttagatgattttgggtgcctgaacatgtataataatgattagg 446965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 497938 - 497896
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  497938 ttagatgattttgtgtgcctgaacatgtataataatgattagg 497896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 197
Target Start/End: Original strand, 28440 - 28540
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  28440 agatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 28539  T
Q  197 t 197  Q
    |    
T  28540 t 28540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Original strand, 28574 - 28616
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28574 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 28616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtt-tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32573 - 32469
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  32573 agattttgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 32474  T
Q  197 tggaa 201  Q
    |||||    
T  32473 tggaa 32469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 509 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32102
Alignment:
Q  509 tatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32439 - 32397
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32439 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagt 32397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 3420 - 3317
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  3420 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 3321  T
Q  199 gaat 202  Q
    ||||    
T  3320 gaat 3317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9579 - 9462
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  9579 cagagagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtaga 9480  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
     |||||||| ||||||||    
T  9479 gtgagattggacctggaa 9462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9432 - 9391
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9432 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 9391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 10)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 101884 - 101781
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  101884 agatttcgtaatttttacttttgagttgatccttagaagtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 101785  T
Q  197 tgga 200  Q
    ||||    
T  101784 tgga 101781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 456 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 100493 - 100378
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||| ||| ||| | | ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  100493 agatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 100394  T
Q  554 gatgttgaagatgatg 569  Q
    | || ||| |||||||    
T  100393 gttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 44602 - 44454
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt----gtatactgcctatgttgctgt 519  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    ||||||||  | |||||||||    
T  44602 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgt 44504  T
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44503 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 502 - 569
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 94558 - 94411
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  94558 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 94460  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  94459 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 554
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17586
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    || | ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540 gc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 159
Target Start/End: Original strand, 39640 - 39702
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtcta 159  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  39640 agatttcataattttgacttttgagttgatccttagatgttttcgagtgcctgaacaggtcta 39702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101503
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 101753 - 101709
Alignment:
Q  219 tgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  101753 tgacctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgggagt 101709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Original strand, 2277 - 2378
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  2277 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 2376  T
Q  199 ga 200  Q
    ||    
T  2377 ga 2378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19756 - 19652
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  19756 agattttgtaattttgacttctgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaggattggagaatgagattgaacc 19657  T
Q  197 tggaa 201  Q
    |||||    
T  19656 tggaa 19652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19268
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19622 - 19573
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 270  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19622 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatgacccag 19573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Original strand, 48092 - 48164
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| || ||| |||||    
T  48092 agattttgtgattttgacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgtctgaagatgtatattaaagatta 48164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 620 - 437
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||     
T  620 agatttcgtaattttgacttttgaattgatccttagacttttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaact 521  T
Q  197 tggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 270  Q
    |||||     |||     || || || || |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520 tggaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 133
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 369 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 27027 - 26840
Alignment:
Q  369 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 468  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27027 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 26929  T
Q  469 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||| ||||||||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  26928 ttg-aattgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatg 26840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27299 - 27256
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27299 tttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 27256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6083 - 5978
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||     
T  6083 agatttcgtaattttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacaggtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaact 5984  T
Q  197 tggaat 202  Q
    ||||||    
T  5983 tggaat 5978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 501 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5662
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaag 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 164
Target Start/End: Original strand, 10890 - 10970
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10890 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataat 10970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 1092 - 1190
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1092 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 262
Target Start/End: Original strand, 3993 - 4033
Alignment:
Q  222 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3993 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 199
Target Start/End: Original strand, 45420 - 45522
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  45420 agattttgtaatttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacc 45519  T
Q  197 tgg 199  Q
    |||    
T  45520 tgg 45522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45909
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Original strand, 45555 - 45596
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45555 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 45596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 198
Target Start/End: Original strand, 2434 - 2535
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  2434 agatttcataattttgacttttgggatgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagtttgaacc 2533  T
Q  197 tg 198  Q
    ||    
T  2534 tg 2535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 456 - 569
Target Start/End: Original strand, 2808 - 2923
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2808 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 2907  T
Q  554 gatgttgaagatgatg 569  Q
    |||| ||| |||||||    
T  2908 gatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Original strand, 2567 - 2609
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2567 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 2609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7026 - 6922
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  7026 agatttcgtaattttgacttttgagttgatcctttgatg-ttttgagtgcctggacatgtctaataataattaggaaagattggagattgagattgaacc 6928  T
Q  197 tggaat 202  Q
    ||||||    
T  6927 tggaat 6922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6535
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8485
Alignment:
Q  428 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 525  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtta 8514  T
Q  526 attaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 9012 - 8961
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9012 agttgatctttagaagattttgagtgcctgaacatgtataataatgactagg 8961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 5)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1082 - 965
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  1082 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgctagaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaag 983  T
Q  184 atgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  982 atgagataggacctggaa 965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 176
Target Start/End: Original strand, 10200 - 10278
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 176  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10200 gatttcgtaattttgacctttgagatgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagtaaaga 10278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 456 - 573
Target Start/End: Original strand, 10543 - 10659
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10543 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 10642  T
Q  554 gatgttgaagatgatgatgt 573  Q
       |||||||||| ||||||    
T  10643 ---gttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 944 - 897
Alignment:
Q  211 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  944 tgggattctgccctgaactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcg 897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Original strand, 10305 - 10347
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10305 acctgaactcgccaaagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 10347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 9)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 130397 - 130292
Alignment:
Q  97 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||  ||||||||||||    
T  130397 agatttcgtaattttgacttttgagttgatcctttgatgtttttgagtgcctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacc 130298  T
Q  197 tggaat 202  Q
    ||||||    
T  130297 tggaat 130292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 497 - 557
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60821
Alignment:
Q  497 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 60821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 456 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 130024 - 129924
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  130024 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 129925  T
Q  554 g 554  Q
    |    
T  129924 g 129924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 242534 - 242420
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  242534 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 242435  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    |   |||||||||||    
T  242434 ggcaagattgaacct 242420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23668 - 23513
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  || |    
T  23668 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactactgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caacc 23570  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   || || |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23569 ttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 130263 - 130222
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  130263 acctaaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 130222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 195
Target Start/End: Original strand, 60301 - 60367
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 195  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  60301 ttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 60367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 662
Alignment:
Q  505 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  714 tgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 263
Target Start/End: Original strand, 60479 - 60520
Alignment:
Q  222 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  60479 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 60520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 195
Target Start/End: Original strand, 1934 - 2030
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 195  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  1934 atttcgtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtcactgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaac 2030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Original strand, 2066 - 2108
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2066 acctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagt 2108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 5)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13429 - 13325
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  13429 gatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagattggagattaagattgaacct 13330  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  13329 ggaat 13325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 29836 - 29950
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||  ||||   |||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29836 gcagagagcatgtaagattttgtaattttgactttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 29935  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  29936 gacaagattgaacct 29950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 41832 - 41946
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||  ||||   |||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41832 gcagagagcatgtaagattttgtaattttgactttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 41931  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||  |||||||||||    
T  41932 gacaagattgaacct 41946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 457 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12942
Alignment:
Q  457 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||     
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa- 12959  T
Q  555 atgttgaagatgatgatgt 573  Q
      |||||||||||||||||    
T  12958 --gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13296 - 13255
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  13296 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgag 13255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2044 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold2044
Description:

Target: scaffold2044; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 1075 - 1134
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1075 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 1134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 405 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  405 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtat 502  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||     
T  2045 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaa 1947  T
Q  503 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
     ||||||||||||||  |||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  1946 tctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2352 - 2291
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  2352 ttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 6)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 369 - 569
Target Start/End: Original strand, 21721 - 21920
Alignment:
Q  369 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 468  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21721 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 21819  T
Q  469 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 566  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  21820 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 21917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 369 - 569
Target Start/End: Original strand, 29613 - 29812
Alignment:
Q  369 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 468  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29613 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 29711  T
Q  469 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 566  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  29712 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 29809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 151
Target Start/End: Original strand, 21449 - 21492
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21449 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 21492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 151
Target Start/End: Original strand, 29341 - 29384
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  29341 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 29384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 262
Target Start/End: Original strand, 21563 - 21614
Alignment:
Q  211 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21563 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 262
Target Start/End: Original strand, 29455 - 29506
Alignment:
Q  211 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29455 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 29506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 456 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1048
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||||||| | | | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1052  T
Q  554 gatg 557  Q
    ||||    
T  1051 gatg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Original strand, 15462 - 15566
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  15462 gatttcgtaattttaacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattgagattgaacct 15561  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  15562 ggaat 15566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15898
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 179138 - 179085
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  179138 gatttcataattttgacttttgagttggaccttagatgtttttcagtgcctgaa 179085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 6)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 456 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13144
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  554 gatg 557  Q
    ||||    
T  13147 gatg 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 475 - 554
Target Start/End: Original strand, 16121 - 16202
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16121 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2677
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13665 - 13595
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  13665 ttagatgattctaagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 13595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 339
Target Start/End: Original strand, 15866 - 15983
Alignment:
Q  224 tgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgag 321  Q
    |||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| || ||||||||   |    
T  15866 tgaactcgccatagcgagtataggccctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacaagttgttatg 15965  T
Q  322 agttgaacccttgggtag 339  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  15966 agttgaacctttgggtag 15983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3230 - 3162
Alignment:
Q  127 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  3230 ccttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 3162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6611
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7102 - 6998
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  7102 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattaagattgaacct 7003  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  7002 ggaat 6998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 13991
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14482 - 14378
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  14482 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattaagattgaacct 14383  T
Q  198 ggaat 202  Q
    |||||    
T  14382 ggaat 14378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6244
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 196
Target Start/End: Original strand, 5765 - 5852
Alignment:
Q  109 tttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||    
T  5765 tttgacctttaagttgaatcttagatgtttttgagtacctgaacatgtataataatgattaggaaaaattgtagattgagattgaacc 5852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Original strand, 43436 - 43520
Alignment:
Q  118 tgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  43436 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaat 43520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Original strand, 47356 - 47440
Alignment:
Q  118 tgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  47356 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaat 47440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 7)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 401 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 12931 - 12859
Alignment:
Q  401 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 473  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12931 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 12859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11305
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11350 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13234 - 13173
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  13234 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 13173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Original strand, 125797 - 125855
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  125797 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 125855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Original strand, 61386 - 61421
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  61386 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 61421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 262
Target Start/End: Original strand, 65304 - 65337
Alignment:
Q  229 tcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  65304 tcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 65337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Original strand, 105563 - 105620
Alignment:
Q  139 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  105563 ttgagtgcctaaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 105620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 11562 - 11464
Alignment:
Q  477 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  11562 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 502 - 569
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14814
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 170
Target Start/End: Original strand, 30379 - 30450
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||    
T  30379 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatctttaataaagattag 30450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 410 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4710
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4756 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 500 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25125
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25640 - 25568
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||| |||||    
T  25640 ttagatgattttgagtgcctgaaaatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacttggaa 25568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 401 - 520
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15483
Alignment:
Q  401 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 497  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 15460  T
Q  498 tgtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  15461 tgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 15049 - 15108
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15049 agagagcatgcaagatttcgtgattttcacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 504 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36195
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgtt-gtatattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 36195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 504 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 566
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 500 - 557
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6389
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 507 - 557
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13843
Alignment:
Q  507 cctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 456 - 570
Target Start/End: Original strand, 38704 - 38820
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38704 agatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaa 38803  T
Q  554 gatgttgaagatgatga 570  Q
    | || | ||||||||||    
T  38804 gttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Original strand, 671 - 755
Alignment:
Q  109 tttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattga 193  Q
    |||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  671 tttgacctttaagttgaatcttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggaaagattgtagattgagattga 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 573  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 410 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||  ||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 567  Q
     | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 151
Target Start/End: Original strand, 5943 - 5995
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5943 atttcatgattttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 5995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 17343 - 17402
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17343 agagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 17402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129075
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 504 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78338
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 78338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 80796 - 80726
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  80796 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 80726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116430
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 116447  T
Q  554 gatgttgaagatgatga 570  Q
    | || | ||||||||||    
T  116446 gttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 262
Target Start/End: Original strand, 128735 - 128775
Alignment:
Q  222 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  128735 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 128775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12462 - 12380
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  12462 agttgatatttagatgattttgagtgtctgaacatgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaat 12380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 500 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38339
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20483 - 20418
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctg 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20483 cagagagcatgcaagattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctg 20418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38833 - 38761
Alignment:
Q  127 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  38833 ccttagatgattctgagtgcgtgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10987 - 10913
Alignment:
Q  128 cttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||    
T  10987 cttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagatcctagactgagattgaacctggaat 10913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10546
Alignment:
Q  456 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 553  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaa 10547  T
Q  554 g 554  Q
    |    
T  10546 g 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10842
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10884 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 10842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 501 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1101
Alignment:
Q  501 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 500 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2691
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 6)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 70296 - 70211
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  70296 cagagagcatgcaagattttatagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 70211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 197
Target Start/End: Original strand, 58102 - 58161
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  58102 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 58161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 332859 - 332784
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 195  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  | |||  |||||||||||    
T  332859 agttgagctttagatgattttgagtgcctgaatatgtataagaatgattaggaaagtttttagattgagattgaac 332784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 10238 - 10393
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  10238 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaa-caacc 10336  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10337 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 10393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 69870 - 69794
Alignment:
Q  492 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  69870 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 369 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 70000 - 69930
Alignment:
Q  369 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatta--tgcattacttgaa 438  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  70000 aatctgtgaagctgt-tatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 69930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 360 - 498
Target Start/End: Original strand, 3434 - 3574
Alignment:
Q  360 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  3434 gttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgag 3533  T
Q  458 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 498  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  3534 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 742 - 587
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||   |  |  ||| |  |||||||||||||||| |       
T  742 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgacttagaacaagattgaacctggaataacca 643  T
Q  208 ttg-tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||| ||| |||||  | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  642 ttgttggaattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 457 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12766
Alignment:
Q  457 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaag 12785  T
Q  555 atgttgaagatgatgatgt 573  Q
     || |||  ||||||||||    
T  12784 ttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 6058 - 5996
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  6058 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 5996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 7253 - 7191
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  7253 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 7191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  10835 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 13539 - 13392
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13539 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13441  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13440 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1370 - 1307
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  1370 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtctattaaagattag 1307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 20894 - 20747
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20894 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20796  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20795 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37821
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  37968 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 37870  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  37869 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97021
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 97021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106299
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 106299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
       | |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  168 at-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 202
Target Start/End: Original strand, 7711 - 7793
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||    
T  7711 agttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtgtaataatgattaggaaagatcctagactgagattgaacctagaat 7793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 454 - 557
Target Start/End: Original strand, 8059 - 8166
Alignment:
Q  454 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt--tg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 549  Q
    |||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||   ||  ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  8059 taagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggt 8158  T
Q  550 ctaagatg 557  Q
    ||| ||||    
T  8159 ctatgatg 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Original strand, 7822 - 7864
Alignment:
Q  221 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7822 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 7864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Original strand, 3505 - 3618
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  3505 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 3604  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    ||| ||||||||||    
T  3605 gatcagattgaacc 3618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Original strand, 14169 - 14282
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14169 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14268  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    ||  ||||||||||    
T  14269 gacaagattgaacc 14282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Original strand, 8506 - 8619
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||| ||||||| |||||  |||||  ||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  8506 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttaagtgcctttgagtgcgtgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 8605  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    ||| ||||||||||    
T  8606 gataagattgaacc 8619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Original strand, 16740 - 16804
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||||||| |  |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16740 cagagagcatgtagaattctgtgtttttgacttttgagttgaagcttagatgcttttgagtgcct 16804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26887 - 26834
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  26887 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 26834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 492 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 23919 - 23843
Alignment:
Q  492 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23919 tgttgttgtaatctgcctatggtgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 151
Target Start/End: Original strand, 36024 - 36077
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  36024 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 36077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 36944 - 36891
Alignment:
Q  98 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  36944 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 36891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  520 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 569  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 227942 - 227877
Alignment:
Q  137 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  227942 ttttgagtgcctaaacatgtataataatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaat 227877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 267733 - 267676
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  267733 tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 267676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 307529 - 307460
Alignment:
Q  127 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  307529 ccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 307460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 268195 - 268116
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    |||||| | ||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  268195 agttgaactttagatgattctaagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 268116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 148
Target Start/End: Original strand, 18941 - 18985
Alignment:
Q  104 gtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18941 gtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 18985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2344 - 2245
Alignment:
Q  96 aagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 195  Q
    |||||||||  ||| | |||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2344 aagatttcggaattataactttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcacactaatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 2245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1967 - 1904
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  1967 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 1904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 14094 - 13947
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  14094 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13996  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13995 -gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 500 - 554
Target Start/End: Original strand, 103679 - 103733
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  103679 tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaag 103733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Original strand, 103244 - 103316
Alignment:
Q  127 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  103244 ccttagaggattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 103316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 46370 - 46432
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  46370 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 46432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1992 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1992
Description:

Target: scaffold1992; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 280 - 239
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgctttt 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  280 atttcgtgatttagacttttgagttgatccttagatgctttt 239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 891 - 952
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  891 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18806 - 18651
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  || |    
T  18806 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caacc 18708  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||| |||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18707 ttagttgggaatctggcttgaactcgctaaggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3315 - 3254
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  3315 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 3254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6981 - 6920
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  6981 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 6920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 44527 - 44486
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44527 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 44486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 37184 - 37071
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  37184 gcagagagcatgtaagattttgcgatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 37085  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    |   ||||||||||    
T  37084 ggcaagattgaacc 37071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Original strand, 6059 - 6099
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6059 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 6099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10653 - 10541
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| || ||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10653 cagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagatggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 10554  T
Q  184 atgagattgaacc 196  Q
    |  ||||||||||    
T  10553 acaagattgaacc 10541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 30028 - 29948
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2300 - 2240
Alignment:
Q  110 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  2300 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattag 2240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9982 - 9922
Alignment:
Q  110 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  9982 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattag 9922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 40496 - 40400
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40496 ttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 8492 - 8423
Alignment:
Q  127 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||| ||||| || |||| |||||||||  || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8492 ccttggatgccttagagtccctgaacatacctgatattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 8423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 62592 - 62556
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  62592 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagt 62556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 6)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 169
Target Start/End: Original strand, 190905 - 190985
Alignment:
Q  89 agcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  190905 agcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttagaaatgatta 190985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 169
Target Start/End: Original strand, 192608 - 192688
Alignment:
Q  89 agcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  192608 agcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttagaaatgatta 192688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 546
Target Start/End: Original strand, 192997 - 193070
Alignment:
Q  476 tgatattattatgtcatgttgttgt----atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 546  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||    || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  192997 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgtt-gttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 144
Target Start/End: Original strand, 14971 - 15003
Alignment:
Q  112 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14971 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 144
Target Start/End: Original strand, 19493 - 19525
Alignment:
Q  112 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19493 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 19525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 263
Target Start/End: Original strand, 192757 - 192793
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 263  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  192757 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagt 192793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Original strand, 161156 - 161252
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| | ||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  161156 ttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4904 - 4841
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  4904 attttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 4841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Original strand, 1726 - 1789
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  1726 attttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtgtattaaagattag 1789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 410 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   |||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 571  Q
    |  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Original strand, 35163 - 35226
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | |||| |||||| ||||||    
T  35163 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtataataaagattag 35226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9815 - 9704
Alignment:
Q  85 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| ||||   ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9815 agagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttttaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 9716  T
Q  185 tgagattgaacc 196  Q
      ||||||||||    
T  9715 caagattgaacc 9704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 30398 - 30347
Alignment:
Q  505 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30398 tgcctatgttgctgtt-gtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatg 30347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 5427 - 5541
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||| || |||| |||||  ||||   ||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  5427 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgattttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 5526  T
Q  183 gatgagattgaacct 197  Q
    ||| |||||||||||    
T  5527 gataagattgaacct 5541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 5)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27064 - 27006
Alignment:
Q  138 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27064 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 27006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 45579 - 45534
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45579 atttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 45534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Original strand, 35524 - 35575
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35524 agttgaaccttaaatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 35575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Original strand, 10956 - 11049
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  10956 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagggaacgaatg-ggaatgagattgaacctggaa 11049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 38473 - 38509
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  38473 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 38509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 202
Target Start/End: Original strand, 24182 - 24256
Alignment:
Q  128 cttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||||||    
T  24182 cttagatgattttgagtgcctgaatatatataataatgattaggcaagcttttagattgagattgaacctggaat 24256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 502 - 552
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 552  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 867 - 830
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  867 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2262 - 2217
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2262 atttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 2217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 591 - 478
Alignment:
Q  83 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 182  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  591 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggtatgaatgtag 492  T
Q  183 gatgagattgaacc 196  Q
    ||| ||||| ||||    
T  491 gattagattaaacc 478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 500 - 557
Target Start/End: Original strand, 1846 - 1903
Alignment:
Q  500 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    |||||| ||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1846 tatactacctatgttaatgttagtttaataactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 792 - 747
Alignment:
Q  99 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  792 atttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 12205 - 12064
Alignment:
Q  424 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 520  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  12205 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgtt 12107  T
Q  521 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12106 t-------aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 10464 - 10525
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||    
T  10464 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttgaagatgcctattaaagatta 10525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 15322 - 15383
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | || ||||||| ||| |||||    
T  15322 tttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttaaagatgtctattaaagatta 15383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 197
Target Start/End: Original strand, 19762 - 19875
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 183  Q
    ||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   |||  ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  19762 cagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattgggaatgaatgtagg 19861  T
Q  184 atgagattgaacct 197  Q
    |  |||||||||||    
T  19862 acaagattgaacct 19875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 202
Target Start/End: Original strand, 24660 - 24723
Alignment:
Q  139 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 202  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  24660 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattgggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaat 24723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18716 - 18655
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  18716 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 18655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 805 - 769
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  805 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 4310 - 4214
Alignment:
Q  475 ttgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | ||| |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4310 ttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 572
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  410 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 505  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | || || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||   |||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  506 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 572  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||    
T  12349 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15877 - 15837
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15877 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Original strand, 6721 - 6761
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6721 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 6761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Original strand, 4875 - 4910
Alignment:
Q  227 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4875 actcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12868 - 12785
Alignment:
Q  114 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  12868 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacct 12785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Original strand, 589 - 640
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  589 agttgatccttaaatgattttgagtgcatgaatatgtataataatgattagg 640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 29228 - 29177
Alignment:
Q  120 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  29228 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatatataataatgattagg 29177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7188 - 7118
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 199  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  7188 ttagatgattttgagtgactgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 7118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2351 - 2258
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  2351 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagggaacgaatg-ggaatgagattgaacctggaa 2258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 633 - 595
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgc 146  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  633 ttttgacttttgagttgaaccctagatgcttttgagtgc 595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 9346 - 9408
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||||||||||    
T  9346 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctataggtgtctactaatgattag 9408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Original strand, 17421 - 17475
Alignment:
Q  143 gtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 197  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  17421 gtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 17475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36759 - 36721
Alignment:
Q  106 gattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36759 gattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 36721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 171
Target Start/End: Original strand, 55271 - 55313
Alignment:
Q  129 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  55271 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 55313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 381 - 226
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||   | ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  381 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgttttagaacaagattgaacctggaa-caacc 283  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  282 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 144
Target Start/End: Original strand, 2088 - 2125
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2088 attttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagt 2125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 144
Target Start/End: Original strand, 9948 - 9985
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9948 attttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagt 9985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 144
Target Start/End: Original strand, 6923 - 6960
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6923 attttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagt 6960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Original strand, 18014 - 18107
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  18014 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa 18107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12205 - 12112
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  12205 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaa 12112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 148
Target Start/End: Original strand, 18095 - 18136
Alignment:
Q  107 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18095 attttgactttagagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 18136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3193 - 3148
Alignment:
Q  139 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 184  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3193 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 3148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 7499 - 7447
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7499 ctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatg 7447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 14618 - 14566
Alignment:
Q  504 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 557  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14618 ctgcctatgttgctgtt-gtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatg 14566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 32901 - 32849
Alignment:
Q  117 ttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  32901 ttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 32849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 3324 - 3272
Alignment:
Q  505 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3324 tgcctatgttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 3272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Original strand, 8576 - 8661
Alignment:
Q  84 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    ||||||||||| || |||  ||  ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||| |||||    
T  8576 cagagagcatgtaaaattcggtatttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaagatgcctattaaagatta 8661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 15992 - 16053
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 169  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  15992 tttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 16053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 66069 - 66224
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||||||  ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  66069 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctaatatagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaa-caacc 66167  T
Q  208 tt--gtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 262  Q
    ||   ||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  66168 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 66224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Original strand, 71210 - 71246
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  71210 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 71246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Original strand, 1143 - 1183
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1143 ttttgacttgtgagttgaactttagatgcttttgagtgcct 1183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6579 - 6543
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6579 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 6543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15795 - 15759
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15795 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 502 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 17572 - 17517
Alignment:
Q  502 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 558  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17572 tactgcctaagttgctgtt-gtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 17517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3129 - 3073
Alignment:
Q  140 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 196  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  3129 tgagtgcctgatcatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 3073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 569
Target Start/End: Original strand, 4804 - 4921
Alignment:
Q  454 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 550  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||   |||||||||   ||||||||| ||||  || ||| ||||||||| ||||||||||  |     
T  4804 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgct-attattatttaactaagttgcatgagtcaata 4902  T
Q  551 taagatgttgaagatgatg 569  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  4903 taagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15147 - 15107
Alignment:
Q  108 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 148  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15147 tttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 4950 times since January 2019
Visitors: 4844