View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0755_low_20 (Length: 461)

Name: NF0755_low_20
Description: NF0755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0755_low_20
NF0755_low_20
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (12-440)||(10644219-10644648)
chr4 (63-440)||(47357654-47358030)
chr4 (216-432)||(13048261-13048477)
chr4 (188-440)||(15675101-15675352)
chr4 (207-440)||(13246430-13246662)
chr4 (188-440)||(54118256-54118507)
chr4 (12-299)||(18169109-18169403)
chr4 (38-299)||(15287096-15287362)
chr4 (207-440)||(31115629-31115861)
chr4 (38-299)||(15294205-15294471)
chr4 (188-372)||(10104262-10104445)
chr4 (63-299)||(7131941-7132182)
chr4 (105-299)||(19020625-19020824)
chr4 (63-299)||(20000862-20001103)
chr4 (188-340)||(121989-122140)
chr4 (100-295)||(17145570-17145770)
chr4 (188-440)||(26680201-26680451)
chr4 (105-299)||(18248357-18248556)
chr4 (38-270)||(22351915-22352149)
chr4 (141-295)||(22738412-22738568)
chr4 (188-323)||(10488678-10488813)
chr4 (188-323)||(16327938-16328073)
chr4 (207-372)||(40885585-40885749)
chr4 (114-214)||(8378377-8378480)
chr4 (63-206)||(26339253-26339399)
chr4 (343-440)||(111395-111492)
chr4 (38-136)||(14952085-14952183)
chr4 (188-249)||(33240890-33240951)
chr4 (226-299)||(8374647-8374722)
chr4 (211-309)||(7850130-7850228)
chr4 (210-276)||(15044990-15045057)
chr4 (210-276)||(15109367-15109434)
chr4 (192-274)||(18238157-18238240)
chr4 (105-177)||(9795490-9795564)
chr4 (192-291)||(13442676-13442777)
chr4 (192-274)||(40904934-40905017)
chr4 (210-291)||(7964730-7964812)
chr4 (63-137)||(14996444-14996518)
chr4 (193-274)||(47468349-47468431)
chr4 (192-276)||(18276596-18276681)
chr4 (216-291)||(38764855-38764932)
chr4 (192-276)||(47535065-47535150)
chr4 (396-440)||(10104450-10104494)
chr4 (191-274)||(15013282-15013365)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (12-440)||(19886483-19886913)
chr2 (188-440)||(17396665-17396916)
chr2 (12-299)||(11231161-11231455)
chr2 (12-299)||(22513008-22513302)
chr2 (12-299)||(28775630-28775924)
chr2 (188-435)||(462743-462989)
chr2 (12-299)||(24685604-24685898)
chr2 (191-440)||(19794719-19794967)
chr2 (188-440)||(8891242-8891493)
chr2 (188-440)||(36982453-36982704)
chr2 (191-440)||(20627328-20627576)
chr2 (208-440)||(43642989-43643220)
chr2 (188-440)||(7507856-7508107)
chr2 (207-440)||(24341420-24341652)
chr2 (63-299)||(12728531-12728772)
chr2 (63-299)||(34824614-34824855)
chr2 (105-299)||(23777963-23778162)
chr2 (188-440)||(25265402-25265653)
chr2 (63-299)||(8943985-8944226)
chr2 (63-299)||(12635744-12635985)
chr2 (63-299)||(42177845-42178086)
chr2 (100-299)||(3798516-3798720)
chr2 (63-299)||(16935732-16935973)
chr2 (63-299)||(17006392-17006633)
chr2 (105-299)||(12641560-12641759)
chr2 (12-136)||(24826522-24826646)
chr2 (188-323)||(19689413-19689548)
chr2 (188-323)||(23820187-23820322)
chr2 (188-323)||(14906452-14906587)
chr2 (188-323)||(20015127-20015262)
chr2 (157-299)||(21142034-21142178)
chr2 (63-206)||(23774370-23774516)
chr2 (139-206)||(5888585-5888652)
chr2 (210-276)||(68154-68221)
chr2 (63-136)||(25213372-25213446)
chr2 (192-276)||(24884848-24884933)
chr2 (192-274)||(24277925-24278008)
chr2 (216-273)||(19669133-19669191)
chr2 (210-274)||(19660044-19660109)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (5-440)||(12374-12811)
chr5 (5-440)||(21073410-21073847)
chr5 (12-440)||(18777814-18778244)
chr5 (12-440)||(22366302-22366733)
chr5 (12-440)||(19499899-19500328)
chr5 (12-440)||(25426628-25427058)
chr5 (12-440)||(43443220-43443647)
chr5 (12-440)||(4199807-4200237)
chr5 (38-440)||(27009841-27010244)
chr5 (12-388)||(29188107-29188483)
chr5 (12-299)||(10777793-10778087)
chr5 (188-440)||(23506965-23507216)
chr5 (12-299)||(21932204-21932498)
chr5 (12-299)||(21938374-21938668)
chr5 (12-299)||(35582175-35582469)
chr5 (38-299)||(7425463-7425729)
chr5 (12-299)||(36989593-36989887)
chr5 (62-299)||(11211940-11212182)
chr5 (12-299)||(22882907-22883201)
chr5 (188-440)||(27182559-27182810)
chr5 (188-440)||(18531079-18531330)
chr5 (188-440)||(22053845-22054096)
chr5 (63-300)||(35790974-35791216)
chr5 (12-299)||(17471411-17471705)
chr5 (188-429)||(34939289-34939528)
chr5 (63-299)||(23514700-23514941)
chr5 (63-299)||(1219396-1219637)
chr5 (188-323)||(20623085-20623220)
chr5 (188-323)||(21233540-21233675)
chr5 (188-322)||(25900418-25900552)
chr5 (188-323)||(16536313-16536448)
chr5 (188-323)||(37052860-37052995)
chr5 (12-136)||(11343008-11343134)
chr5 (63-206)||(23328791-23328937)
chr5 (63-206)||(24616395-24616541)
chr5 (63-206)||(24712771-24712917)
chr5 (63-206)||(24745789-24745935)
chr5 (12-136)||(16105967-16106093)
chr5 (191-272)||(32950862-32950943)
chr5 (192-299)||(23981516-23981625)
chr5 (192-276)||(21310709-21310794)
chr5 (210-276)||(5450861-5450928)
chr5 (192-274)||(26559815-26559898)
chr5 (192-276)||(19862371-19862456)
chr5 (210-291)||(22885788-22885871)
chr5 (192-276)||(21297175-21297260)
chr5 (210-274)||(29918129-29918194)
chr5 (193-276)||(21222609-21222693)
chr5 (396-436)||(29190482-29190522)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (12-440)||(42997-43427)
scaffold0076 (12-299)||(39242-39536)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (12-440)||(21851786-21852217)
chr8 (12-440)||(21844393-21844824)
chr8 (12-440)||(30120722-30121153)
chr8 (41-440)||(16674245-16674644)
chr8 (12-436)||(24548986-24549410)
chr8 (12-436)||(6774082-6774505)
chr8 (251-440)||(222754-222943)
chr8 (251-440)||(736377-736566)
chr8 (251-440)||(860272-860461)
chr8 (188-440)||(43373480-43373731)
chr8 (12-299)||(271183-271477)
chr8 (12-299)||(644443-644737)
chr8 (12-299)||(830178-830472)
chr8 (188-441)||(16193728-16193980)
chr8 (12-299)||(22088617-22088911)
chr8 (12-299)||(15318982-15319276)
chr8 (12-299)||(15499351-15499645)
chr8 (63-299)||(22006134-22006375)
chr8 (188-429)||(24928803-24929043)
chr8 (63-299)||(13720804-13721045)
chr8 (188-440)||(16404987-16405235)
chr8 (63-300)||(16195369-16195611)
chr8 (192-429)||(17345581-17345816)
chr8 (63-299)||(13662141-13662382)
chr8 (100-299)||(16872964-16873168)
chr8 (188-440)||(22907226-22907476)
chr8 (188-323)||(5238203-5238338)
chr8 (188-323)||(24661260-24661395)
chr8 (188-323)||(43685662-43685797)
chr8 (251-312)||(691909-691970)
chr8 (192-276)||(26011656-26011741)
chr8 (192-291)||(45465126-45465227)
chr8 (210-292)||(15933443-15933527)
chr8 (192-274)||(24552570-24552653)
chr8 (192-276)||(21198152-21198237)
chr8 (192-299)||(23226076-23226185)
chr8 (192-276)||(25296320-25296405)
chr8 (192-276)||(25758340-25758425)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (12-440)||(27653805-27654235)
chr6 (38-440)||(25175563-25175968)
chr6 (116-440)||(16825678-16826006)
chr6 (12-436)||(14625952-14626377)
chr6 (105-436)||(1650022-1650352)
chr6 (12-299)||(16376196-16376490)
chr6 (12-299)||(16383520-16383814)
chr6 (12-299)||(10488838-10489132)
chr6 (38-299)||(16232031-16232297)
chr6 (12-299)||(22225561-22225855)
chr6 (23-299)||(16555973-16556256)
chr6 (23-299)||(16632529-16632812)
chr6 (12-266)||(22251389-22251648)
chr6 (38-299)||(18086674-18086940)
chr6 (12-299)||(19299376-19299670)
chr6 (190-429)||(23153458-23153696)
chr6 (188-429)||(1657760-1657999)
chr6 (188-440)||(35009451-35009702)
chr6 (63-299)||(1556144-1556385)
chr6 (63-297)||(19610159-19610398)
chr6 (190-429)||(15862484-15862720)
chr6 (63-299)||(23977908-23978149)
chr6 (156-372)||(29665941-29666157)
chr6 (105-299)||(13620712-13620911)
chr6 (38-270)||(29869627-29869861)
chr6 (12-121)||(16814820-16814930)
chr6 (189-261)||(27751603-27751675)
chr6 (192-274)||(19854319-19854402)
chr6 (192-276)||(18629608-18629693)
chr6 (63-136)||(4991396-4991470)
chr6 (257-440)||(27740838-27741021)
chr6 (216-274)||(29605614-29605672)
chr6 (192-276)||(16887792-16887877)
chr6 (194-274)||(17083200-17083280)
chr6 (191-276)||(17557017-17557102)
chr6 (216-276)||(25651399-25651460)
chr6 (192-276)||(35136013-35136097)
[»] chr3 (52 HSPs)
chr3 (38-440)||(55316219-55316622)
chr3 (38-440)||(41270075-41270478)
chr3 (62-440)||(16821139-16821517)
chr3 (105-436)||(15614838-15615168)
chr3 (105-440)||(15936553-15936890)
chr3 (105-437)||(15938395-15938729)
chr3 (63-440)||(14842446-14842824)
chr3 (188-440)||(13975734-13975985)
chr3 (188-440)||(45860805-45861056)
chr3 (188-440)||(13954902-13955153)
chr3 (12-299)||(49232575-49232869)
chr3 (188-441)||(51158030-51158282)
chr3 (188-440)||(15859036-15859287)
chr3 (12-300)||(12264614-12264910)
chr3 (12-299)||(1467562-1467856)
chr3 (188-440)||(12030159-12030410)
chr3 (188-440)||(2049810-2050061)
chr3 (12-299)||(22275348-22275642)
chr3 (12-299)||(12811980-12812274)
chr3 (63-299)||(15468216-15468457)
chr3 (63-299)||(25058878-25059119)
chr3 (188-429)||(13838905-13839145)
chr3 (63-299)||(18911132-18911373)
chr3 (105-299)||(12902008-12902207)
chr3 (188-440)||(17912495-17912744)
chr3 (63-300)||(5228451-5228692)
chr3 (63-270)||(18896920-18897130)
chr3 (105-299)||(54651596-54651795)
chr3 (188-323)||(2449250-2449385)
chr3 (191-440)||(16744130-16744377)
chr3 (157-299)||(44229124-44229268)
chr3 (191-339)||(11986181-11986329)
chr3 (192-274)||(41661729-41661812)
chr3 (192-274)||(31412333-31412416)
chr3 (327-440)||(47984650-47984763)
chr3 (327-440)||(47993937-47994050)
chr3 (327-440)||(48003224-48003337)
chr3 (327-440)||(48012510-48012623)
chr3 (193-276)||(47784767-47784851)
chr3 (210-276)||(30207378-30207445)
chr3 (210-275)||(3576456-3576522)
chr3 (216-274)||(4145838-4145896)
chr3 (63-137)||(8268609-8268683)
chr3 (63-137)||(8275709-8275783)
chr3 (210-274)||(13301487-13301552)
chr3 (210-274)||(13312143-13312208)
chr3 (192-276)||(14080671-14080756)
chr3 (399-440)||(15468555-15468596)
chr3 (192-276)||(17191703-17191788)
chr3 (192-276)||(17204843-17204928)
chr3 (188-241)||(19231979-19232032)
chr3 (216-276)||(34560061-34560122)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (12-440)||(13910846-13911277)
chr7 (12-440)||(10989410-10989841)
chr7 (38-440)||(13572676-13573079)
chr7 (12-440)||(2437457-2437889)
chr7 (12-440)||(16478785-16479213)
chr7 (105-440)||(18253761-18254098)
chr7 (188-434)||(25292350-25292595)
chr7 (12-299)||(7822867-7823161)
chr7 (12-299)||(7830178-7830472)
chr7 (12-299)||(27176572-27176866)
chr7 (188-440)||(47481043-47481294)
chr7 (12-299)||(27101460-27101754)
chr7 (12-299)||(27108808-27109102)
chr7 (12-299)||(38783552-38783846)
chr7 (38-299)||(18979872-18980138)
chr7 (188-438)||(16211768-16212017)
chr7 (188-440)||(13037026-13037277)
chr7 (188-435)||(11580751-11580997)
chr7 (38-299)||(15927707-15927973)
chr7 (207-440)||(36052667-36052896)
chr7 (12-299)||(15950613-15950908)
chr7 (188-440)||(3059966-3060217)
chr7 (188-440)||(13321014-13321267)
chr7 (63-299)||(13758509-13758750)
chr7 (63-299)||(15759990-15760231)
chr7 (188-440)||(7293017-7293267)
chr7 (100-299)||(14250811-14251015)
chr7 (141-276)||(48622623-48622758)
chr7 (188-323)||(11516343-11516478)
chr7 (188-323)||(15441576-15441711)
chr7 (188-323)||(30262141-30262276)
chr7 (105-185)||(15862174-15862257)
chr7 (188-297)||(295978-296087)
chr7 (139-270)||(10000325-10000455)
chr7 (139-206)||(16418731-16418798)
chr7 (192-276)||(16914928-16915013)
chr7 (210-276)||(13377691-13377758)
chr7 (192-274)||(28722274-28722357)
chr7 (62-136)||(15516719-15516793)
chr7 (192-276)||(9611470-9611555)
chr7 (192-276)||(9839041-9839126)
chr7 (192-274)||(13448827-13448910)
chr7 (192-274)||(14935524-14935607)
chr7 (192-274)||(15363117-15363200)
chr7 (192-274)||(28390476-28390559)
chr7 (210-272)||(34241225-34241288)
chr7 (210-276)||(48356806-48356873)
chr7 (217-276)||(49047699-49047759)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (12-440)||(36093-36523)
scaffold0023 (188-440)||(48598-48849)
scaffold0023 (16-227)||(169736-169951)
scaffold0023 (63-299)||(153883-154124)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (38-440)||(5072237-5072640)
chr1 (123-440)||(18601052-18601370)
chr1 (66-440)||(22227809-22228185)
chr1 (66-440)||(22232506-22232882)
chr1 (105-436)||(2116258-2116589)
chr1 (105-374)||(45051489-45051757)
chr1 (12-299)||(17148706-17149001)
chr1 (188-440)||(20931345-20931596)
chr1 (12-299)||(18059581-18059875)
chr1 (12-299)||(17004777-17005071)
chr1 (188-440)||(20913037-20913281)
chr1 (12-299)||(38054914-38055208)
chr1 (188-440)||(20893638-20893889)
chr1 (188-440)||(41394222-41394473)
chr1 (12-299)||(19962322-19962616)
chr1 (188-440)||(20445679-20445930)
chr1 (188-440)||(20531444-20531695)
chr1 (188-440)||(37844462-37844714)
chr1 (100-299)||(46523528-46523731)
chr1 (188-323)||(51452608-51452743)
chr1 (63-206)||(22035681-22035827)
chr1 (63-206)||(7640810-7640956)
chr1 (62-136)||(15861284-15861358)
chr1 (192-299)||(22143361-22143470)
chr1 (192-288)||(40436269-40436367)
chr1 (193-265)||(38033675-38033748)
chr1 (193-276)||(17609090-17609174)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (12-440)||(31497-31928)
scaffold0008 (188-440)||(128181-128431)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (38-440)||(64372-64780)
scaffold0026 (105-440)||(107747-108084)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (12-440)||(20936-21367)
scaffold0139 (12-440)||(13882-14312)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (63-440)||(35-411)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (63-440)||(3722-4102)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (105-436)||(9266-9596)
scaffold0215 (105-436)||(16164-16494)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (34-344)||(13171-13480)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (63-440)||(5088-5466)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (38-334)||(1153-1450)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (63-436)||(2966-3341)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (188-417)||(5551-5780)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (188-438)||(3594-3843)
scaffold0266 (188-440)||(1124-1375)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (188-440)||(8878-9129)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (188-440)||(12115-12364)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (188-440)||(6076-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (188-440)||(968-1218)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (188-440)||(48187-48438)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (12-299)||(31448-31742)
scaffold0107 (152-299)||(39785-39934)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (47-299)||(29301-29558)
scaffold0213 (12-73)||(29565-29627)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (207-440)||(148721-148953)
scaffold0025 (188-440)||(8849-9100)
scaffold0025 (210-276)||(53508-53575)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (188-440)||(19206-19457)
scaffold0195 (188-440)||(21290-21541)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (191-440)||(36928-37176)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (188-440)||(123176-123427)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (188-440)||(5073-5324)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (188-440)||(26427-26678)
scaffold0162 (188-323)||(8192-8327)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (188-429)||(247454-247694)
scaffold0012 (105-299)||(34076-34275)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (188-440)||(34472-34724)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (188-429)||(171916-172156)
scaffold0001 (188-429)||(177619-177859)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (63-299)||(1451-1692)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (188-436)||(41733-41980)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (63-299)||(1390-1631)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (12-299)||(7278-7573)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (191-440)||(41648-41896)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (188-440)||(546-797)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (12-299)||(2531-2826)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (207-434)||(272031-272257)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (188-440)||(13506-13757)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (63-214)||(10624-10778)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (188-322)||(51194-51328)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (141-299)||(10296-10456)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (334-440)||(9-115)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (38-270)||(6768-7002)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (334-440)||(48514-48620)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (105-372)||(45098-45369)
scaffold0066 (156-372)||(54484-54700)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (188-322)||(89466-89600)
scaffold0028 (12-136)||(130880-131006)
scaffold0028 (192-273)||(79704-79786)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (188-440)||(37078-37328)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (141-276)||(3577-3712)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (141-276)||(54038-54173)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (188-372)||(3257-3441)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (188-323)||(22656-22791)
scaffold0141 (188-323)||(26911-27046)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (188-323)||(1594-1729)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (38-270)||(23600-23834)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (191-339)||(56114-56262)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (343-440)||(9382-9479)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (38-129)||(154282-154373)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (189-299)||(1-113)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (105-206)||(12045-12149)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (12-121)||(17115-17226)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (139-206)||(7443-7510)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (192-276)||(8172-8257)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (192-299)||(22422-22531)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (105-177)||(13268-13342)
scaffold0032 (192-299)||(104623-104732)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (210-276)||(456-523)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (192-274)||(14200-14283)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (210-276)||(2334-2401)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (192-274)||(22163-22246)
scaffold0165 (192-274)||(30128-30211)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (192-274)||(108173-108256)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (192-288)||(1348-1446)
scaffold0409 (192-288)||(9603-9701)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (192-276)||(2687-2772)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (216-276)||(22453-22514)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (192-274)||(3415-3498)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (210-276)||(6823-6890)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (192-274)||(8654-8737)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (210-276)||(43816-43883)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (210-276)||(76865-76932)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (192-274)||(27661-27744)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (193-246)||(10854-10908)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (192-299)||(1546-1655)
scaffold0456 (192-299)||(8691-8800)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10644648 - 10644219
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644648 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgatctaggagctgaagtgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggta 10644549  T
Q  111 agggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  10644548 agggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgt 10644449  T
Q  211 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644448 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 10644349  T
Q  311 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644348 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 10644249  T
Q  411 ttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644248 ttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 63 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 47358030 - 47357654
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgta 162  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47358030 taggagctgaattgaagcaagagttg-ggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttcctcatgttgta 47357932  T
Q  163 tgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  47357931 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaa 47357832  T
Q  263 attacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttc 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357831 attacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttc 47357732  T
Q  363 aaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  47357731 aaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 216 - 432
Target Start/End: Original strand, 13048261 - 13048477
Alignment:
Q  216 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattg 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  13048261 tatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattg 13048360  T
Q  316 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 415  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13048361 atgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttattagataatatgattaatgaataattgcttggg 13048460  T
Q  416 tttgcatattcatggat 432  Q
    |||||||||||||||||    
T  13048461 tttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 15675101 - 15675352
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15675101 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 15675200  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    || ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  15675201 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattga 15675299  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  15675300 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 207 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13246662 - 13246430
Alignment:
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||    
T  13246662 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 13246563  T
Q  307 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 406  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  13246562 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 13246464  T
Q  407 ttgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  13246463 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 54118256 - 54118507
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |    
T  54118256 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaatt 54118355  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  54118356 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattga 54118454  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  54118455 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18169403 - 18169109
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||| || |||||  |||||| ||    
T  18169403 agagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaa-gg 18169305  T
Q  109 taagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctctt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18169304 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 18169205  T
Q  206 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18169204 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18169109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 299
Target Start/End: Original strand, 15287096 - 15287362
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15287096 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15287195  T
Q  138 taa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 234  Q
    ||    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15287196 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15287295  T
Q  235 tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
     |||| | || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15287296 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 15287362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 207 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31115861 - 31115629
Alignment:
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||  ||| |    
T  31115861 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattat 31115762  T
Q  307 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 406  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |    
T  31115761 gctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatca 31115663  T
Q  407 ttgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  31115662 ttgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 299
Target Start/End: Original strand, 15294205 - 15294471
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15294205 agctttaggaatgaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15294304  T
Q  138 taa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 234  Q
    ||    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15294305 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15294404  T
Q  235 tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
     |||| | || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  15294405 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatatataaatgttaagttatga 15294471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 188 - 372
Target Start/End: Original strand, 10104262 - 10104445
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10104262 tgctaaatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 10104361  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 372  Q
    || ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  10104362 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 7131941 - 7132182
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  |  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  7131941 taggagctgaattgaagcaagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 7132040  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  7132041 atatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 7132140  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7132141 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 7132182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19020824 - 19020625
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgc 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||   | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19020824 aaggtaagggggttagttaccatcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 19020725  T
Q  202 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19020724 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 19020625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20001103 - 20000862
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  20001103 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 20001004  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| || | |||    
T  20001003 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggt 20000904  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20000903 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 20000862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 188 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 122140 - 121989
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122140 tgctaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 122041  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgtta 340  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  122040 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 295
Target Start/End: Original strand, 17145570 - 17145770
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaatt 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||    
T  17145570 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaatt 17145669  T
Q  197 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagt 294  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||  | | |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  17145670 cgtgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagt 17145769  T
Q  295 t 295  Q
    |    
T  17145770 t 17145770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26680451 - 26680201
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26680451 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 26680352  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  26680351 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 26680254  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26680253 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18248556 - 18248357
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  18248556 aaggtaagggggttagttattatcataatcttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgc 18248457  T
Q  202 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| ||| || ||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  18248456 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagatatga 18248357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 270
Target Start/End: Original strand, 22351915 - 22352149
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatca-- 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  22351915 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 22352014  T
Q  136 -tgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 234  Q
     |  |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| | || || | | ||  ||| |||||||    
T  22352015 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttgttatgttgctgt-ttcttatacatgaat 22352113  T
Q  235 tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg 270  Q
    ||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||    
T  22352114 tgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatg 22352149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 141 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22738568 - 22738412
Alignment:
Q  141 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  || |||||||||| ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||    
T  22738568 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 22738469  T
Q  241 taattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagtt 295  Q
    | || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  22738468 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtt 22738412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10488813 - 10488678
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  10488813 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 10488714  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  10488713 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 10488678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Original strand, 16327938 - 16328073
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  16327938 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 16328037  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  16328038 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 372
Target Start/End: Original strand, 40885585 - 40885749
Alignment:
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattg 305  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  |||     
T  40885585 ctgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatga-aatta 40885683  T
Q  306 tgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 372  Q
    |||| |||||||||| || | ||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  40885684 tgctcaattggtgaactt-tgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8378480 - 8378377
Alignment:
Q  114 gggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8378480 gggttagttattatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 8378381  T
Q  211 gatg 214  Q
    ||||    
T  8378380 gatg 8378377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26339399 - 26339253
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| |  |||||||    
T  26339399 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 26339300  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  26339299 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 26339253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 343 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 111492 - 111395
Alignment:
Q  343 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  111492 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14952183 - 14952085
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  14952183 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33240951 - 33240890
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtat 249  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33240951 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtat 33240890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8374722 - 8374647
Alignment:
Q  226 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8374722 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 8374647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 7850228 - 7850130
Alignment:
Q  211 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 309  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||| || ||| |||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  7850228 gatgttatgtttgaatgaatgtattgatgaaaactgtgtgattgttggtggaattgtatgtccaattatgtgaaaatgtgaagttatgaaaattgtgct 7850130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15045057 - 15044990
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  15045057 tgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 15044990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 276
Target Start/End: Original strand, 15109367 - 15109434
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  15109367 tgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 15109434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Original strand, 18238157 - 18238240
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18238157 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 18238240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9795564 - 9795490
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgat 177  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9795564 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaattttttcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 9795490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Original strand, 13442676 - 13442777
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgt 289  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  13442676 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgtttgtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgt 13442775  T
Q  290 ta 291  Q
    ||    
T  13442776 ta 13442777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Original strand, 40904934 - 40905017
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||| | | ||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  40904934 aaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatacatgaaattgctgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 40905017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 291
Target Start/End: Original strand, 7964730 - 7964812
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 291  Q
    ||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  7964730 tgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaagtatgtgaaagtgtta 7964812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14996518 - 14996444
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14996518 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttttaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 14996444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 274
Target Start/End: Original strand, 47468349 - 47468431
Alignment:
Q  193 aattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||    
T  47468349 aattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttca 47468431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18276681 - 18276596
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  18276681 aaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 18276596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38764932 - 38764855
Alignment:
Q  216 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgtta 291  Q
    |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  38764932 tatgtttgaatgaatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgtta 38764855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Original strand, 47535065 - 47535150
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| || |||||||    
T  47535065 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcaagttcaaa 47535150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 396 - 440
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  396 ttgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 274
Target Start/End: Original strand, 15013282 - 15013365
Alignment:
Q  191 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||||   | ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15013282 taaattcgtgctctaattatgatgatatgtt-gaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 15013365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 19886483 - 19886913
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886483 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 19886582  T
Q  112 gggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctg 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19886583 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 19886682  T
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||  ||||||||    
T  19886683 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 19886782  T
Q  310 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 409  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886783 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 19886882  T
Q  410 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19886883 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 17396665 - 17396916
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17396665 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaat 17396763  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17396764 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 17396863  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17396864 tattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 11231161 - 11231455
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  11231161 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 11231260  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  11231261 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 11231360  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11231361 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 11231455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 22513008 - 22513302
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  22513008 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 22513107  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  22513108 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22513207  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22513208 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22513302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 28775630 - 28775924
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  28775630 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 28775729  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  28775730 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 28775829  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28775830 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 28775924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 188 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 462989 - 462743
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  462989 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 462890  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  462889 gataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 462791  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattga 435  Q
    | |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  462790 tgtcgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 24685604 - 24685898
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  24685604 agagaagaacaaaagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 24685703  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  24685704 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 24685803  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24685804 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 24685898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 191 - 440
Target Start/End: Original strand, 19794719 - 19794967
Alignment:
Q  191 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtt 290  Q
    |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |    
T  19794719 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgat 19794818  T
Q  291 aagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 390  Q
    ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| |    
T  19794819 aagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgt 19794917  T
Q  391 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19794918 tatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8891493 - 8891242
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||    
T  8891493 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaat 8891394  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||    
T  8891393 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattga 8891295  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  8891294 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 36982453 - 36982704
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982453 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 36982552  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  36982553 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattga 36982651  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36982652 tgttgttgttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 440
Target Start/End: Original strand, 20627328 - 20627576
Alignment:
Q  191 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtt 290  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  20627328 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgat 20627427  T
Q  291 aagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 390  Q
    || || |||  |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||| | |    
T  20627428 aacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgt 20627526  T
Q  391 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||    
T  20627527 tgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 208 - 440
Target Start/End: Original strand, 43642989 - 43643220
Alignment:
Q  208 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtg 307  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||  ||||||    
T  43642989 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtg 43643088  T
Q  308 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 407  Q
    || ||||||||||||| | || ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |     
T  43643089 ctcaattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcac 43643187  T
Q  408 tgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43643188 tgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 7507856 - 7508107
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507856 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 7507955  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttg 386  Q
      ||||||||||  |||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| | |||||| || || || |||||||||   |||||||||    
T  7507956 aataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-ggctaagttgttgttaa-ttgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 7508053  T
Q  387 atattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    || || |  ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7508054 atgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 207 - 440
Target Start/End: Original strand, 24341420 - 24341652
Alignment:
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||    
T  24341420 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgt 24341519  T
Q  307 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 406  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||    ||||||||| |    
T  24341520 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgttgatgaatca 24341618  T
Q  407 ttgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  24341619 ttgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12728772 - 12728531
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  12728772 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 12728673  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  12728672 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 12728573  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12728572 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12728531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34824855 - 34824614
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  34824855 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 34824756  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  34824755 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 34824656  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34824655 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 34824614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 299
Target Start/End: Original strand, 23777963 - 23778162
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgc 201  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23777963 aaggtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 23778062  T
Q  202 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23778063 tcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 23778162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 25265402 - 25265653
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25265402 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 25265501  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    || ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| ||||    
T  25265502 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattga 25265600  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  || |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25265601 tgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8944226 - 8943985
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  8944226 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 8944127  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||  |||| |||    
T  8944126 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggt 8944027  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8944026 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 8943985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 12635744 - 12635985
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  12635744 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgtt 12635843  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  12635844 gtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 12635943  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12635944 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12635985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 42177845 - 42178086
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  42177845 taggggctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 42177944  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| || | |||    
T  42177945 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggt 42178044  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  42178045 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 42178086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 3798516 - 3798720
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaatt 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  3798516 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 3798615  T
Q  197 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagt 294  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  3798616 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagt 3798715  T
Q  295 tatga 299  Q
    |||||    
T  3798716 tatga 3798720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16935973 - 16935732
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  16935973 taggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 16935874  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||    
T  16935873 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgt 16935774  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16935773 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16935732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17006633 - 17006392
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  17006633 taggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 17006534  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||    
T  17006533 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgt 17006434  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17006433 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 17006392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 299
Target Start/End: Original strand, 12641560 - 12641759
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  12641560 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 12641659  T
Q  202 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12641660 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12641759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 24826522 - 24826646
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  24826522 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 24826621  T
Q  112 gggggttagttattatcacaatcat 136  Q
     ||||||||| || |||| ||||||    
T  24826622 aggggttagtcatcatcataatcat 24826646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Original strand, 19689413 - 19689548
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  19689413 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 19689512  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  19689513 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 19689548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 23820322 - 23820187
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  23820322 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 23820223  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  23820222 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 23820187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Original strand, 14906452 - 14906587
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  14906452 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 14906551  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  14906552 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 14906587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20015262 - 20015127
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  20015262 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 20015163  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  20015162 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20015127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21142178 - 21142034
Alignment:
Q  157 gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||| ||| || ||||| ||||     
T  21142178 gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtg 21142079  T
Q  257 ggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  21142078 gatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatga 21142034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23774516 - 23774370
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| ||| |  |||||||    
T  23774516 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgtt 23774417  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  23774416 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 23774370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 206
Target Start/End: Original strand, 5888585 - 5888652
Alignment:
Q  139 aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  5888585 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 5888652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 68221 - 68154
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  68221 tgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 68154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25213446 - 25213372
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaagga-taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 136  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  25213446 taggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24884933 - 24884848
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    ||||| |||||||  || ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  24884933 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatggaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 24884848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24278008 - 24277925
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  24278008 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgatattggtgacaattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 24277925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 273
Target Start/End: Original strand, 19669133 - 19669191
Alignment:
Q  216 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 273  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||    
T  19669133 tatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaaattgcatgttc 19669191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19660109 - 19660044
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||| |||||| |||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  19660109 tgatgatatgttcgtatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttca 19660044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12811 - 12374
Alignment:
Q  5 gaggagcagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttca 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12811 gaggagaagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttca 12712  T
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12711 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 12612  T
Q  203 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||  |    
T  12611 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 12512  T
Q  303 ttgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12511 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 12412  T
Q  403 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12411 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 440
Target Start/End: Original strand, 21073410 - 21073847
Alignment:
Q  5 gaggagcagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttca 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073410 gaggagaagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttca 21073509  T
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21073510 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgct 21073609  T
Q  203 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |    
T  21073610 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 21073709  T
Q  303 ttgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 402  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21073710 ttgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttgatattatgattgatga 21073809  T
Q  403 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21073810 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 18777814 - 18778244
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  18777814 agagaagaacaagagggttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataattaacttcaaaggtaa 18777913  T
Q  112 gggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctg 209  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18777914 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctg 18778013  T
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  18778014 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 18778113  T
Q  310 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778114 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattg 18778213  T
Q  410 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18778214 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 22366302 - 22366733
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  22366302 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttagcaatcaagtggggtgacctaggagttgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 22366401  T
Q  111 agggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgct 208  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22366402 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttgct 22366501  T
Q  209 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||    
T  22366502 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 22366601  T
Q  309 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366602 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 22366701  T
Q  409 gcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22366702 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19500328 - 19499899
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  19500328 agagaagaacaagagagttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 19500230  T
Q  112 gggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctg 209  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19500229 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttgctg 19500130  T
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  19500129 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 19500030  T
Q  310 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 409  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19500029 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgattaataattg 19499930  T
Q  410 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19499929 ctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25427058 - 25426628
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaag-gataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||    
T  25427058 agagaagagcaagagggttgaagggaagcttaaagaatcaagtgggtaac-taggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggta 25426960  T
Q  111 agggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgct 208  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25426959 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 25426860  T
Q  209 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||    
T  25426859 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 25426760  T
Q  309 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426759 taaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 25426660  T
Q  409 gcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25426659 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 43443220 - 43443647
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  43443220 agagaagagcatgagggttgaagggaagctt-aggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 43443318  T
Q  112 gggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtg 211  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||    |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  43443319 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattgcatattctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgtg 43443418  T
Q  212 atgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  43443419 atgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctca 43443518  T
Q  312 attggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 411  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443519 attggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 43443618  T
Q  412 tgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443619 tgggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 4199807 - 4200237
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  4199807 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 4199906  T
Q  112 gggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctg 209  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  4199907 gggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttg 4200006  T
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  4200007 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 4200106  T
Q  310 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 409  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4200107 aaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattg 4200206  T
Q  410 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4200207 cttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 38 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27010244 - 27009841
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27010244 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 27010145  T
Q  138 taatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattg 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27010144 taatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattg 27010045  T
Q  237 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgtt 336  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27010044 atgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgtt 27009945  T
Q  337 gttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgat 436  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27009944 gttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgtt 27009845  T
Q  437 gatg 440  Q
    ||||    
T  27009844 gatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 12 - 388
Target Start/End: Original strand, 29188107 - 29188483
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  29188107 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 29188206  T
Q  111 agggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgt 210  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  29188207 agggggttagtgattattataatcatgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgt 29188306  T
Q  211 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||     
T  29188307 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctc 29188406  T
Q  311 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgat 388  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  29188407 aattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 29188483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 10777793 - 10778087
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10777793 agagaagaacaagagagttgaaggggaagcttgaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaaggataatcatcttcaaaggt 10777892  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10777893 aaggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 10777992  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10777993 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 10778087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23507216 - 23506965
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507216 tgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 23507117  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  23507116 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 23507018  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23507017 tgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 21932204 - 21932498
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21932204 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 21932303  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  21932304 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 21932403  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21932404 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 21932498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 21938374 - 21938668
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21938374 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 21938473  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  21938474 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 21938573  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21938574 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 21938668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 35582469 - 35582175
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  35582469 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 35582370  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  35582369 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 35582270  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35582269 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 35582175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 38 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7425729 - 7425463
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7425729 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 7425630  T
Q  138 taa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 234  Q
    ||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  7425629 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaat 7425530  T
Q  235 tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
     |||| | || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7425529 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 7425463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 36989593 - 36989887
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  36989593 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 36989692  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgt--aat-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||| |    
T  36989693 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctctag 36989792  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36989793 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 36989887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 62 - 299
Target Start/End: Original strand, 11211940 - 11212182
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgt 158  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||||| |||||||    
T  11211940 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 11212039  T
Q  159 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgg 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||    
T  11212040 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 11212139  T
Q  259 tgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  11212140 tgaaattacatgtttcaaagtgtgtataaatgttaagttatga 11212182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 22882907 - 22883201
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  22882907 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgggaaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaagat 22883006  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgt--aat-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  22883007 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttg 22883106  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | | |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22883107 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22883201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 27182559 - 27182810
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||    
T  27182559 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaat 27182658  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  27182659 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 27182757  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || || ||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  27182758 tgttgtggttgatgaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 18531079 - 18531330
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18531079 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 18531178  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    || ||||| |||  |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  18531179 gtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattga 18531277  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| |||||| |||| | |||||||||| ||||||||||    
T  18531278 tgttgttgttgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 22053845 - 22054096
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22053845 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 22053944  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    || ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  22053945 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattga 22054043  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054044 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 63 - 300
Target Start/End: Original strand, 35790974 - 35791216
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  35790974 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 35791073  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||    
T  35791074 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagt 35791173  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgag 300  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  35791174 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgag 35791216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 17471411 - 17471705
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||   | |||||| |||||||||    
T  17471411 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcatcttcaaagg 17471509  T
Q  109 taagggggttagttattatcacaatcatgta---attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctctt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  17471510 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctctt 17471609  T
Q  206 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  17471610 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtaatga 17471705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 188 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 34939528 - 34939289
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  34939528 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 34939429  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    || |||||||||  |||||||| ||||| || |||| | ||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||| ||||    
T  34939428 gtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttattgctgttaattga 34939331  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 429  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  34939330 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23514941 - 23514700
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| ||||||||    
T  23514941 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 23514842  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  23514841 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 23514742  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23514741 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 23514700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 1219396 - 1219637
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  1219396 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 1219495  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||| |||||||||| || ||||| |||| |||    
T  1219496 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1219595  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1219596 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1219637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20623220 - 20623085
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  20623220 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 20623121  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  20623120 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Original strand, 21233540 - 21233675
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  21233540 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 21233639  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  21233640 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 322
Target Start/End: Original strand, 25900418 - 25900552
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||    
T  25900418 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaaaat 25900517  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatt 322  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | ||||||    
T  25900518 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt 25900552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16536448 - 16536313
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  16536448 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 16536349  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  16536348 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16536313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 37052995 - 37052860
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||    
T  37052995 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtggaaat 37052896  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  37052895 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 37052860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11343134 - 11343008
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||| || |||||  ||||||||||    
T  11343134 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcagaggttagggttaatcttcttcaaaggt 11343035  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcat 136  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  11343034 aagggggttagtttttatcataatcat 11343008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23328937 - 23328791
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| |  |||||||    
T  23328937 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 23328838  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  23328837 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 23328791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24616541 - 24616395
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| |  |||||||    
T  24616541 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24616442  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  24616441 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 24616395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24712917 - 24712771
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| |  |||||||    
T  24712917 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24712818  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  24712817 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 24712771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24745935 - 24745789
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| |  |||||||    
T  24745935 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24745836  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  24745835 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 24745789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16106093 - 16105967
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||  || ||| |||||  |||| |||||    
T  16106093 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggt 16105994  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcat 136  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||    
T  16105993 aagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 32950943 - 32950862
Alignment:
Q  191 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 272  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  32950943 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Original strand, 23981516 - 23981625
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgt 289  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||    
T  23981516 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatgt 23981615  T
Q  290 taagttatga 299  Q
    ||| ||||||    
T  23981616 taacttatga 23981625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310794
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 21310794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 276
Target Start/End: Original strand, 5450861 - 5450928
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  5450861 tgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 5450928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Original strand, 26559815 - 26559898
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  26559815 aaattcgtgctcttgctatgattatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 26559898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19862456 - 19862371
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  19862456 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 19862371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22885871 - 22885788
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgtta 291  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  22885871 tgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgtta 22885788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Original strand, 21297175 - 21297260
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||| ||||  || ||||| |||||||| | ||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21297175 aaattcgtcctctaactatgatgatatgtttgaacgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 21297260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29918194 - 29918129
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  29918194 tgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 29918129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Original strand, 21222609 - 21222693
Alignment:
Q  193 aattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    ||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21222609 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 21222693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 396 - 436
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  396 ttgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgat 436  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 43427 - 42997
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43427 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgatctaggagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 43328  T
Q  111 agggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttg-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctg 209  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  43327 agggggttagttactatcacaaacatgtaattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttgctg 43228  T
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 309  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43227 ggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgct 43128  T
Q  310 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43127 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 43028  T
Q  410 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43027 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39536 - 39242
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  39536 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 39437  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  39436 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 39337  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39336 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 39242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 21851786 - 21852217
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg--aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21851786 agagaagaacaagagtgttggagggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctagaagctgaagtggagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 21851885  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgtaatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  21851886 aagggggttagttattatcacaatcatgtaatttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 21851985  T
Q  209 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21851986 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 21852085  T
Q  309 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 408  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852086 tcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 21852185  T
Q  409 gcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21852186 gcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 21844393 - 21844824
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg--aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21844393 agagaagaacaagagtgttggagggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctagaagctgaagtggagctaggattaaggataatcaacttcaacggt 21844492  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgtaatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  21844493 aagggggttagttattatcacaatcatgtaatttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 21844592  T
Q  209 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21844593 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 21844692  T
Q  309 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 408  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844693 tcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 21844792  T
Q  409 gcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21844793 gcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 30121153 - 30120722
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  30121153 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagtaagggttagagataatcatcttcaaaggtaa 30121054  T
Q  112 gggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgct 208  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||   | ||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30121053 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 30120954  T
Q  209 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30120953 gtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 30120854  T
Q  309 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 408  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120853 tcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 30120754  T
Q  409 gcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30120753 gcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 41 - 440
Target Start/End: Original strand, 16674245 - 16674644
Alignment:
Q  41 tttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  || ||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674245 tttaggaatcaagtgggtgacttatgagctgaattgaagcaagagttgagt-taatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa 16674343  T
Q  141 tttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16674344 tttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatg 16674443  T
Q  240 ataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgtt 339  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674444 ttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgtt 16674543  T
Q  340 aatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgat 439  Q
    || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16674544 aagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgat 16674643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 24549410 - 24548986
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24549410 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttctaaggta 24549311  T
Q  111 agggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgt 210  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  24549310 agggggttagtgattatcataatcatgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgt 24549211  T
Q  211 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||     
T  24549210 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctc 24549111  T
Q  311 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 410  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||    
T  24549110 aattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 24549012  T
Q  411 ttgggtttgcatattcatggattgat 436  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24549011 ttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 436
Target Start/End: Original strand, 6774082 - 6774505
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  6774082 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 6774180  T
Q  111 agggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgt 210  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  6774181 agggggttagtgattatcataatcatgtaattttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgt 6774280  T
Q  211 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||     
T  6774281 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 6774380  T
Q  311 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 410  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||    
T  6774381 aattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgc 6774479  T
Q  411 ttgggtttgcatattcatggattgat 436  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  6774480 ttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 251 - 440
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222943
Alignment:
Q  251 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  351 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 251 - 440
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736566
Alignment:
Q  251 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  351 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 251 - 440
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860461
Alignment:
Q  251 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  351 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 43373480 - 43373731
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43373480 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 43373579  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  43373580 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattga 43373678  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43373679 tgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 271183 - 271477
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  271183 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 271282  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  271283 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 271382  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  271383 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 271477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 644737 - 644443
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  644737 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 644638  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  644637 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 644538  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  644537 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 644443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 830472 - 830178
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  830472 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 830373  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  830372 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 830273  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  830272 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 830178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 188 - 441
Target Start/End: Original strand, 16193728 - 16193980
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193728 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 16193827  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | | || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  16193828 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 16193926  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgt 441  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  16193927 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 22088617 - 22088911
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  22088617 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 22088716  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  22088717 aagggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22088816  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22088817 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 15318982 - 15319276
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15318982 agagaagaacaagagtgttgaaggaaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 15319081  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgt--aat-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  15319082 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 15319181  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caaatatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||  ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||||    
T  15319182 ctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatga 15319276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 15499351 - 15499645
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15499351 agagaagaacaagagtgttgaaggaaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 15499450  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgt--aat-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  15499451 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 15499550  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caaatatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||  ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||||    
T  15499551 ctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatga 15499645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 22006134 - 22006375
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  22006134 taggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 22006233  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  22006234 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 22006333  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22006334 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22006375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 188 - 429
Target Start/End: Original strand, 24928803 - 24929043
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  24928803 tgctaaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 24928902  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||   ||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||    
T  24928903 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattga 24929001  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 429  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24929002 tgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 13720804 - 13721045
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  13720804 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13720903  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  13720904 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 13721003  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13721004 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 13721045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 16404987 - 16405235
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  16404987 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 16405086  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    |||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  16405087 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattga 16405182  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  16405183 tgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16195611 - 16195369
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||  || |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  16195611 taggagttgaattgaagcaagagtttgggttaatcatcttctaaggtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 16195512  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  16195511 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 16195412  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgag 300  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16195411 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgag 16195369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17345816 - 17345581
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 291  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  17345816 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtga 17345717  T
Q  292 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 391  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||| ||||   ||||| ||||| ||    
T  17345716 agttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatattattgttgttaattgatgtt 17345619  T
Q  392 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 429  Q
     |  ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  17345618 gttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 13662141 - 13662382
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  13662141 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13662240  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||  ||||| || ||||| |||| |||    
T  13662241 gtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggt 13662340  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13662341 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 13662382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 16872964 - 16873168
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaatt 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  16872964 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 16873063  T
Q  197 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagt 294  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  16873064 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagt 16873163  T
Q  295 tatga 299  Q
    |||||    
T  16873164 tatga 16873168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 22907226 - 22907476
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  22907226 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 22907325  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  22907326 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 22907423  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22907424 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5238338 - 5238203
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  5238338 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 5238239  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  5238238 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Original strand, 24661260 - 24661395
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  24661260 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 24661359  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  24661360 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43685797 - 43685662
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  43685797 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 43685698  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  43685697 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 312
Target Start/End: Original strand, 691909 - 691970
Alignment:
Q  251 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  691909 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26011741 - 26011656
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26011741 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaa 26011656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Original strand, 45465126 - 45465227
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgt 289  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  45465126 aaattcgtgctcctgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgt 45465225  T
Q  290 ta 291  Q
    ||    
T  45465226 ta 45465227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15933527 - 15933443
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgttaa 292  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  15933527 tgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttaa 15933443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Original strand, 24552570 - 24552653
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  24552570 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 24552653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Original strand, 21198152 - 21198237
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| |||  |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21198152 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgtagataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 21198237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Original strand, 23226076 - 23226185
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgt 289  Q
    ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||| || |||||  ||| |||||| || |||    
T  23226076 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaatttgcatgtcaaaagtatgtataagtgt 23226175  T
Q  290 taagttatga 299  Q
    ||| ||||||    
T  23226176 taacttatga 23226185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25296405 - 25296320
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||| ||  || ||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  25296405 aaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcatgttcaaa 25296320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25758425 - 25758340
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||| ||  || ||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  25758425 aaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcatgttcaaa 25758340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 27653805 - 27654235
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| |    
T  27653805 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtga 27653904  T
Q  112 gggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctg 209  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27653905 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctg 27654004  T
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  27654005 tgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 27654104  T
Q  310 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654105 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 27654204  T
Q  410 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27654205 cttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 38 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25175968 - 25175563
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaag-gataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  25175968 agctttcggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattaccataatcat 25175870  T
Q  137 gta--attttgcatttg-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa 233  Q
    |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25175869 gtataattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaa 25175770  T
Q  234 ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagtt 333  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175769 ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagtt 25175670  T
Q  334 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25175669 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 25175570  T
Q  434 gatgatg 440  Q
    |||||||    
T  25175569 gatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 116 - 440
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16826006
Alignment:
Q  116 gttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgat 213  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16825678 gttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 16825777  T
Q  214 gttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgta--tgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  16825778 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaa 16825877  T
Q  312 attggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 411  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16825878 attggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatctgatattatgattgatgaataattgct 16825977  T
Q  412 tgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||    
T  16825978 ttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 436
Target Start/End: Original strand, 14625952 - 14626377
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  14625952 agagaagaacaagagggttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 14626051  T
Q  112 gggggttagttattatcacaatcatgta-attttgcatttgctca--tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | ||| ||  | ||||  |||||| ||||  || | | ||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  14626052 gggggttagttattatcacaatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtttgaat-tgtgattatggataattattgctaaattcgtgctcttgct 14626150  T
Q  209 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||     
T  14626151 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgt 14626250  T
Q  309 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 408  Q
      |||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||    
T  14626251 gcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcatt 14626349  T
Q  409 gcttgggtttgcatattcatggattgat 436  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14626350 gcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 105 - 436
Target Start/End: Original strand, 1650022 - 1650352
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctct 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1650022 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctct 1650121  T
Q  205 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 304  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |||    
T  1650122 tactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaatt 1650221  T
Q  305 gtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 404  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  |||||||||    
T  1650222 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaat 1650320  T
Q  405 aattgcttgggtttgcatattcatggattgat 436  Q
     | ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1650321 cactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 16376196 - 16376490
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16376196 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 16376295  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  16376296 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 16376395  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16376396 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16376490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 16383520 - 16383814
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16383520 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 16383619  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  16383620 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 16383719  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16383720 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16383814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10489132 - 10488838
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  10489132 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 10489033  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  10489032 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 10488933  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10488932 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 10488838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16232297 - 16232031
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16232297 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 16232198  T
Q  138 taa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 234  Q
    ||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  16232197 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 16232098  T
Q  235 tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16232097 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16232031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 22225561 - 22225855
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  22225561 agagaagaacaagagtgttgaatggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 22225660  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||     
T  22225661 atgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttt 22225760  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22225761 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22225855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 299
Target Start/End: Original strand, 16555973 - 16556256
Alignment:
Q  23 agagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttag 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555973 agagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttag 16556072  T
Q  121 ttattatcacaatcatgt--aat-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgtta 217  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  16556073 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgcta 16556172  T
Q  218 tgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    | ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16556173 ttttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16556256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 299
Target Start/End: Original strand, 16632529 - 16632812
Alignment:
Q  23 agagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttag 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632529 agagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttag 16632628  T
Q  121 ttattatcacaatcatgt--aat-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgtta 217  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  16632629 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgcta 16632728  T
Q  218 tgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    | ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16632729 ttttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16632812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 266
Target Start/End: Original strand, 22251389 - 22251648
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  22251389 agagaagaacaagagtgttgaatggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 22251488  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  22251489 atgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22251588  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatta 266  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  22251589 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaatta 22251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 299
Target Start/End: Original strand, 18086674 - 18086940
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  18086674 agctttagaaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattagtataatcatg 18086773  T
Q  138 taa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 234  Q
    ||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  18086774 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaat 18086873  T
Q  235 tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18086874 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18086940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19299670 - 19299376
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19299670 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggattcaatttgggcgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 19299571  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgt--aat-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  19299570 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 19299471  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||| ||| ||| ||  | ||  |||||||||||| || ||||| || | |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19299470 ctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 19299376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 190 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23153696 - 23153458
Alignment:
Q  190 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgt 289  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||     
T  23153696 ctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatga 23153597  T
Q  290 taagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgata 389  Q
    |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||     
T  23153596 taagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatg 23153498  T
Q  390 ttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 429  Q
    || || ||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||    
T  23153497 ttgtggttgatgaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 188 - 429
Target Start/End: Original strand, 1657760 - 1657999
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1657760 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 1657859  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    || |||||||||  |||||||| ||||| || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||| ||||    
T  1657860 gtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttattgttgttaattga 1657957  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 429  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  1657958 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 35009451 - 35009702
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35009451 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 35009550  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    || ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| ||||    
T  35009551 gtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattga 35009649  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35009650 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1556385 - 1556144
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| ||||||||    
T  1556385 taggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 1556286  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  1556285 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1556186  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1556185 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1556144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19610398 - 19610159
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| || |||||    
T  19610398 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgtt 19610299  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| | || ||||| |||| |||    
T  19610298 gtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggt 19610199  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttat 297  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19610198 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 19610159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 190 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15862720 - 15862484
Alignment:
Q  190 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgt 289  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  15862720 ctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgt 15862621  T
Q  290 taagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgata 389  Q
     |||||||||  |||||||| ||||| || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| | | |||||||   || || |||||     
T  15862620 gaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttc-atttatgttattgctgataattgatg 15862524  T
Q  390 ttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 429  Q
    || |  ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  15862523 ttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23978149 - 23977908
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  23978149 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 23978050  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  23978049 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 23977950  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23977949 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 23977908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 29666157 - 29665941
Alignment:
Q  156 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgt 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29666157 tgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgt 29666058  T
Q  256 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtga 353  Q
     |||||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||    
T  29666057 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatga-aattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatga 29665960  T
Q  354 ttcttgttcaaatgatgtt 372  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  29665959 ttcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 299
Target Start/End: Original strand, 13620712 - 13620911
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgc 201  Q
    |||||||||||||||||  |  ||| |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13620712 aaggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 13620811  T
Q  202 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13620812 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 13620911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 270
Target Start/End: Original strand, 29869627 - 29869861
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  29869627 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttgatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 29869726  T
Q  138 t---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 234  Q
    |   |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | || || | | ||  ||| |||||||    
T  29869727 ttaaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgt-ttcttatacatgaat 29869825  T
Q  235 tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg 270  Q
    ||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||    
T  29869826 tgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatg 29869861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 16814820 - 16814930
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  16814820 agagaagagcaagaggtttgaagggaagctttagcaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 16814919  T
Q  111 agggggttagt 121  Q
    || ||||||||    
T  16814920 agagggttagt 16814930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27751675 - 27751603
Alignment:
Q  189 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 261  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27751675 gctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19854402 - 19854319
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  19854402 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 19854319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Original strand, 18629608 - 18629693
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  18629608 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 18629693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4991470 - 4991396
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaagga-taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 136  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  4991470 taggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740838
Alignment:
Q  257 ggtgaaattacatgttc--aaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgat 354  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagtcgttgttgaattgagatatgat 27740924  T
Q  355 tcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    || ||||||| ||||||  |   | |||| |||| || |  | ||||||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27740923 tcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 27740838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29605672 - 29605614
Alignment:
Q  216 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  29605672 tatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttca 29605614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Original strand, 16887792 - 16887877
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| || ||||||||||    
T  16887792 aaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaactgttgttggtgaatttgcatgttcaaa 16887877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 274
Target Start/End: Original strand, 17083200 - 17083280
Alignment:
Q  194 attcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    |||||||||||   | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||    
T  17083200 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttca 17083280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 276
Target Start/End: Original strand, 17557017 - 17557102
Alignment:
Q  191 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    ||||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17557017 taaattcgtgctctaattatgatgatatgtttg-atgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 17557102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25651460 - 25651399
Alignment:
Q  216 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  25651460 tatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 25651399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Original strand, 35136013 - 35136097
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||  ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||||| || ||||||||||    
T  35136013 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgtt-gtgaatttgcatgttcaaa 35136097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 52)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 38 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 55316622 - 55316219
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55316622 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaaaggggttagttattatcacaatcatg 55316523  T
Q  138 taatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattg 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316522 taatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattg 55316423  T
Q  237 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgtt 336  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55316422 atgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtt 55316323  T
Q  337 gttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgat 436  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316322 gttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgat 55316223  T
Q  437 gatg 440  Q
    ||||    
T  55316222 gatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 38 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41270478 - 41270075
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270478 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 41270379  T
Q  138 taatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattg 236  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270378 taatttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattg 41270279  T
Q  237 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgtt 336  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41270278 atgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtt 41270179  T
Q  337 gttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgat 436  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270178 gttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgat 41270079  T
Q  437 gatg 440  Q
    ||||    
T  41270078 gatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 62 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16821517 - 16821139
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgt 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821517 ctaggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgt 16821418  T
Q  162 atgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821417 atgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtga 16821318  T
Q  262 aattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgtt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  16821317 aattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgtt 16821218  T
Q  362 caaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16821217 caattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 105 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15615168 - 15614838
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctct 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15615168 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgctct 15615069  T
Q  205 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 304  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||     
T  15615068 tactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatg 15614969  T
Q  305 gtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 404  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||||    
T  15614968 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaat 15614870  T
Q  405 aattgcttgggtttgcatattcatggattgat 436  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15614869 cattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 105 - 440
Target Start/End: Original strand, 15936553 - 15936890
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgc 201  Q
    |||||| ||||||||||||| || | ||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15936553 aaggtatgggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 15936652  T
Q  202 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 301  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||      
T  15936653 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 15936752  T
Q  302 attgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 401  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  15936753 attgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 15936851  T
Q  402 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  15936852 aataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 105 - 437
Target Start/End: Original strand, 15938395 - 15938729
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgc 201  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  15938395 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgc 15938494  T
Q  202 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 301  Q
    ||   |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||      
T  15938495 tccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 15938594  T
Q  302 attgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 401  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  15938595 attgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 15938693  T
Q  402 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatg 437  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  15938694 aataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 63 - 440
Target Start/End: Original strand, 14842446 - 14842824
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta-attttgcatttgctca--tgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||| |  | ||||||  | ||||  ||||    
T  14842446 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgtt 14842545  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    |||||||  || | | ||| | ||||  ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14842546 gtatgaat-tgtgattatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggt 14842644  T
Q  260 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg 359  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14842645 gaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttg 14842743  T
Q  360 ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842744 ttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 13975734 - 13975985
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13975734 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 13975832  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13975833 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 13975932  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13975933 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 45861056 - 45860805
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  45861056 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 45860958  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45860957 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 45860858  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45860857 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 13954902 - 13955153
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13954902 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 13955000  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | | |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13955001 gatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 13955100  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13955101 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 49232869 - 49232575
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  49232869 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctatgagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 49232770  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  49232769 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 49232670  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  49232669 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 49232575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 188 - 441
Target Start/End: Original strand, 51158030 - 51158282
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51158030 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 51158129  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  51158130 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 51158228  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgt 441  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  51158229 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 15859036 - 15859287
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  15859036 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaat 15859135  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  15859136 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 15859234  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15859235 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 12264614 - 12264910
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt--gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| | | ||  |  |||||| |||||||||    
T  12264614 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttggggtgacctaggagctgaattgaagcaaaggttgggattaatcatcttcaaagg 12264713  T
Q  109 taagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctctt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12264714 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 12264813  T
Q  206 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgag 300  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12264814 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgag 12264910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 1467562 - 1467856
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  1467562 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 1467661  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  1467662 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 1467761  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1467762 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1467856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 12030159 - 12030410
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12030159 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagt 12030258  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||   ||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  12030259 gataagttgtgaaagttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattga 12030357  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12030358 tgttatggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2050061 - 2049810
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2050061 tgctaaattcgtgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacat 2049962  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | ||| || |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  2049961 gataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattga 2049863  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2049862 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22275642 - 22275348
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||||||    
T  22275642 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaaaagttaaggttaatcatcttcaaagg 22275544  T
Q  109 taagggggttagttattatcacaatcatgta---attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctctt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22275543 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 22275444  T
Q  206 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||||  || ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  22275443 gctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatga 22275348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12812274 - 12811980
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  12812274 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaactttaaaggt 12812175  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgt--aat-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  12812174 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 12812075  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||| ||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12812074 ctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12811980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 15468216 - 15468457
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta---attttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| || |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  15468216 taggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgtt 15468315  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  15468316 gtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 15468415  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  15468416 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatga 15468457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25059119 - 25058878
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg---taattttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    | |||||||||| ||||||||    
T  25059119 taggagctgaattgaagcaaaaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgtt 25059020  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  25059019 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 25058920  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25058919 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 25058878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 188 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 13839145 - 13838905
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  13839145 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 13839046  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  13839045 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 13838947  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 429  Q
    | || || ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  13838946 tgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18911373 - 18911132
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  18911373 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 18911274  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  18911273 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 18911174  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18911173 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18911132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 299
Target Start/End: Original strand, 12902008 - 12902207
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgc 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  12902008 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgc 12902107  T
Q  202 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12902108 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12902207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 17912495 - 17912744
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17912495 tgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 17912593  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||||| |||||||    || ||||| ||| | ||||| | |||||| |||||||  ||||||||   ||||| ||||    
T  17912594 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttga--tatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaattga 17912691  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17912692 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5228692 - 5228451
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| |||||||     
T  5228692 taggagctgaattgaaacaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtg 5228593  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
     |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  5228592 ttatgaaaatgggttgatgaaca-ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 5228494  T
Q  260 gaaattacatgtt--caaatatgtaaaaatgttaagttatgag 300  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5228493 gaaattacatgtttcaaaatatgtataaatgttaagttatgag 5228451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 18896920 - 18897130
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||| |||| ||||||||    
T  18896920 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttccaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgtt 18897019  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  18897020 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 18897119  T
Q  260 gaaattacatg 270  Q
    | |||||||||    
T  18897120 ggaattacatg 18897130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 54651795 - 54651596
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgc 201  Q
    |||||||||||||| ||  | |||| ||||||||   | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  54651795 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 54651696  T
Q  202 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  54651695 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatga 54651596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Original strand, 2449250 - 2449385
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  2449250 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 2449349  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  2449350 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 2449385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 191 - 440
Target Start/End: Original strand, 16744130 - 16744377
Alignment:
Q  191 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtt 290  Q
    |||||||||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||      
T  16744130 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaa 16744229  T
Q  291 aagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 390  Q
    |||||||||  ||||||| |||| | |||||||  |  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || |  || |    
T  16744230 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgt 16744327  T
Q  391 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | |  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  16744328 tgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44229268 - 44229124
Alignment:
Q  157 gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||     
T  44229268 gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtg 44229169  T
Q  257 ggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  44229168 gatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatga 44229124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 339
Target Start/End: Original strand, 11986181 - 11986329
Alignment:
Q  191 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg--ttcaaatatgtaaaaatg 288  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || || ||||||  ||||    
T  11986181 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtatgtattaatg 11986280  T
Q  289 ttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgtt 339  Q
    | |||||||||  |||||||| || | |||||||| | |||||||||||||    
T  11986281 tcaagttatga-aattgtgctcaaatagtgaattt-tgctaagttgttgtt 11986329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41661812 - 41661729
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| || |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  41661812 aaattcgtgctcttgctatgatgatatgtttgaatacatggaaatgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 41661729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Original strand, 31412333 - 31412416
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  31412333 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 31412416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984650
Alignment:
Q  327 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 426  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  427 atggattgatgatg 440  Q
    ||| ||||||||||    
T  47984663 atgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993937
Alignment:
Q  327 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 426  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  427 atggattgatgatg 440  Q
    ||| ||||||||||    
T  47993950 atgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003224
Alignment:
Q  327 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 426  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  427 atggattgatgatg 440  Q
    ||| ||||||||||    
T  48003237 atgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012510
Alignment:
Q  327 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 426  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  427 atggattgatgatg 440  Q
    ||| ||||||||||    
T  48012523 atgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Original strand, 47784767 - 47784851
Alignment:
Q  193 aattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    ||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  47784767 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 47784851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30207445 - 30207378
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  30207445 tgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaa 30207378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 275
Target Start/End: Original strand, 3576456 - 3576522
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 275  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  3576456 tgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 3576522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 4145838 - 4145896
Alignment:
Q  216 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  4145838 tatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttca 4145896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 8268609 - 8268683
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8268609 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8268683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 8275709 - 8275783
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8275709 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8275783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 274
Target Start/End: Original strand, 13301487 - 13301552
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  13301487 tgatggtatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttca 13301552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 274
Target Start/End: Original strand, 13312143 - 13312208
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  13312143 tgatggtatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttca 13312208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080671
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | ||| ||||| || ||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgtggttagtgaatttgcatgttcaaa 14080671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 440
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468596
Alignment:
Q  399 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17191788 - 17191703
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17191788 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 17191703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17204928 - 17204843
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17204928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 17204843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19232032 - 19231979
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgat 241  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19232032 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgatgat 19231979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 34560122 - 34560061
Alignment:
Q  216 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  34560122 tatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 34560061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 13910846 - 13911277
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  13910846 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 13910945  T
Q  112 gggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctg 209  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  13910946 gggggttattgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttg 13911045  T
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  13911046 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 13911145  T
Q  310 aaattggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 408  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911146 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 13911245  T
Q  409 gcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911246 tcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10989841 - 10989410
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggtt-gaagggaagctttaggaatcaagtg-ggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10989841 agagaagatcaagagtgttagaaggggagcttgaggaatcaagtgaggtgacataggagcttaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggt 10989742  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgc 207  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10989741 atgggggttagtgattatcataatcatgtataattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgc 10989642  T
Q  208 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  10989641 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtg 10989542  T
Q  308 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 407  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989541 ctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 10989443  T
Q  408 tgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989442 tgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 38 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13573079 - 13572676
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13573079 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 13572980  T
Q  138 taatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattg 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13572979 taatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattg 13572880  T
Q  237 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgtt 336  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13572879 atgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtt 13572780  T
Q  337 gttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgat 436  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13572779 gttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgtt 13572680  T
Q  437 gatg 440  Q
    ||||    
T  13572679 gatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2437889 - 2437457
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  2437889 agagaagaacaggagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 2437790  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgc 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  2437789 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgt 2437690  T
Q  208 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  2437689 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 2437590  T
Q  308 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 407  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437589 ttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 2437490  T
Q  408 tgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2437489 tgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 16478785 - 16479213
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16478785 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggta 16478884  T
Q  111 agggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgt 210  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||     
T  16478885 agggggttagtgattatcataatcatttaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctcttactgc 16478984  T
Q  211 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgcta 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||     
T  16478985 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 16479084  T
Q  311 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 410  Q
    ||||||||||||| |  |||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||    
T  16479085 aattggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgc 16479183  T
Q  411 ttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16479184 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 105 - 440
Target Start/End: Original strand, 18253761 - 18254098
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgc 201  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  18253761 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 18253860  T
Q  202 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 301  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||      
T  18253861 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 18253960  T
Q  302 attgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 401  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  18253961 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 18254059  T
Q  402 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  18254060 aataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 188 - 434
Target Start/End: Original strand, 25292350 - 25292595
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  25292350 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaag 25292449  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25292450 gataagctatgaatattgtgctcaattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25292548  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 434  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25292549 tattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7823161 - 7822867
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7823161 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 7823062  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  7823061 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 7822962  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7822961 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 7822867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7830472 - 7830178
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7830472 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 7830373  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  7830372 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 7830273  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7830272 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 7830178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27176866 - 27176572
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27176866 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27176767  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  27176766 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27176667  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27176666 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 27176572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 47481043 - 47481294
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47481043 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 47481142  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||   | ||| ||||    
T  47481143 gataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcgctcttaattga 47481241  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  47481242 tgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 27101460 - 27101754
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27101460 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27101559  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  27101560 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27101659  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27101660 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 27101754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 27108808 - 27109102
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27108808 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27108907  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  27108908 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27109007  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27109008 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 27109102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 38783552 - 38783846
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  38783552 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 38783651  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  38783652 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 38783751  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38783752 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 38783846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 299
Target Start/End: Original strand, 18979872 - 18980138
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18979872 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 18979971  T
Q  138 taa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 234  Q
    ||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  18979972 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 18980071  T
Q  235 tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18980072 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18980138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 188 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16212017 - 16211768
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16212017 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaat 16211918  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||    
T  16211917 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattga 16211819  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatga 438  Q
    | || || ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  16211818 tgttgtggttgatgattcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 13037026 - 13037277
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | | ||||    
T  13037026 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaat 13037125  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||    
T  13037126 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattga 13037224  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  13037225 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 188 - 435
Target Start/End: Original strand, 11580751 - 11580997
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  11580751 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 11580850  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  11580851 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 11580949  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattga 435  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  11580950 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15927973 - 15927707
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15927973 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15927874  T
Q  138 taa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 234  Q
    ||    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15927873 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15927774  T
Q  235 tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15927773 tgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 15927707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 207 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 36052896 - 36052667
Alignment:
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 306  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||    
T  36052896 ctgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 36052797  T
Q  307 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 406  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  36052796 gctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgatgaataa 36052701  T
Q  407 ttgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36052700 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 15950613 - 15950908
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||||||||    
T  15950613 agagaagaacaagggttttgaaggaaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttcaaagg 15950712  T
Q  109 taagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctctt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15950713 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 15950812  T
Q  206 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15950813 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 15950908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3060217 - 3059966
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3060217 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 3060118  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | ||| || |||  ||| |||| || |||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  3060117 gataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattga 3060019  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  3060018 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13321267 - 13321014
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaa 285  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  13321267 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 13321168  T
Q  286 atgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttg-ttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 384  Q
    |||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| |    
T  13321167 atgtcaagttatga-aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaat 13321070  T
Q  385 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13321069 tgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13758750 - 13758509
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  13758750 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13758651  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  13758650 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 13758551  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13758550 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 13758509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 15759990 - 15760231
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| ||||||||    
T  15759990 taggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 15760089  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| ||  |||| |||| |||    
T  15760090 gtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggt 15760189  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15760190 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 15760231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 7293267 - 7293017
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  7293267 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 7293168  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||||||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  7293167 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 7293070  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7293069 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 14250811 - 14251015
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaatt 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  14250811 cttctaaggtaagggggttagttatcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaatt 14250910  T
Q  197 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagt 294  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  14250911 cgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagt 14251010  T
Q  295 tatga 299  Q
    |||||    
T  14251011 tatga 14251015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 276
Target Start/End: Original strand, 48622623 - 48622758
Alignment:
Q  141 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatga 240  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||    
T  48622623 ttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatga 48622722  T
Q  241 taattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    | || ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  48622723 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaa 48622758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 11516478 - 11516343
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  11516478 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 11516379  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  11516378 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 11516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Original strand, 15441576 - 15441711
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  15441576 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 15441675  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  15441676 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Original strand, 30262141 - 30262276
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  30262141 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 30262240  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  30262241 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15862257 - 15862174
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862257 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 297
Target Start/End: Original strand, 295978 - 296087
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||| |||   || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  295978 tgctaaattcgtgttctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaat 296077  T
Q  288 gttaagttat 297  Q
    |  |||||||    
T  296078 gagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 270
Target Start/End: Original strand, 10000325 - 10000455
Alignment:
Q  139 aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgat 238  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || |||| | ||  ||| |||||||||||    
T  10000325 aattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgt-ttcttatacatgaattgat 10000423  T
Q  239 gataattgtatgattgttggtgaaattacatg 270  Q
    ||| || ||||| |||| | ||||||||||||    
T  10000424 gattatggtatgtttgtggatgaaattacatg 10000455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16418798 - 16418731
Alignment:
Q  139 aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  16418798 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 16418731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Original strand, 16914928 - 16915013
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  16914928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 16915013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13377758 - 13377691
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  13377758 tgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 13377691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28722357 - 28722274
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  28722357 aaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 28722274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 15516719 - 15516793
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  15516719 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaatgtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9611555 - 9611470
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  9611555 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 9611470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9839126 - 9839041
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  9839126 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 9839041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Original strand, 13448827 - 13448910
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    |||||| |||||||| | | ||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  13448827 aaattcatgctcttgttatcatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttca 13448910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14935607 - 14935524
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||| | | || || |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  14935607 aaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 14935524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15363200 - 15363117
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||| | | || || |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15363200 aaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 15363117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28390559 - 28390476
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  28390559 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttca 28390476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 272
Target Start/End: Original strand, 34241225 - 34241288
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  34241225 tgatgttatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 34241288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 48356873 - 48356806
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  48356873 tgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 48356806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 276
Target Start/End: Original strand, 49047699 - 49047759
Alignment:
Q  217 atgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  49047699 atgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 49047759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 36523 - 36093
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  36523 agagaagagcaagagggttgaaggaaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggtaa 36424  T
Q  112 gggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctg 209  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  36423 gggggttaatgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtag 36324  T
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 309  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 36224  T
Q  310 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36223 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattg 36124  T
Q  410 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36123 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48849 - 48598
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  48849 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaat 48750  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||    
T  48749 gataagttgtgaaaattgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattga 48651  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  48650 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 227
Target Start/End: Original strand, 169736 - 169951
Alignment:
Q  16 aagaacaagagggttgaagg-gaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagg 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  169736 aagaacaagagagttgaaggcgaagcttgaggaatcaagtggggtgacataagagctgaattgaagcaagggttagtgataatcatcttcaaaagtaagg 169835  T
Q  114 gggttagttattatcacaatcatgta--attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtg 211  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  169836 gggttagtgattatcataatcatgtataattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 169935  T
Q  212 atgttatgtttgtatg 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  169936 atgttatgtttgtatg 169951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 153883 - 154124
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  153883 taggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 153982  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  153983 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 154082  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  154083 gaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 154124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 38 - 440
Target Start/End: Original strand, 5072237 - 5072640
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072237 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaagattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 5072336  T
Q  138 taatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattg 236  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5072337 taatttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattg 5072436  T
Q  237 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgtt 336  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5072437 atgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtt 5072536  T
Q  337 gttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgat 436  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072537 gttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgat 5072636  T
Q  437 gatg 440  Q
    ||||    
T  5072637 gatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 123 - 440
Target Start/End: Original strand, 18601052 - 18601370
Alignment:
Q  123 attatcacaatcatgtaatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601052 attatcacaatcatgtaatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtt 18601151  T
Q  222 tgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaat 321  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18601152 tgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaat 18601251  T
Q  322 ttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgca 421  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601252 ttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgca 18601351  T
Q  422 tattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18601352 tattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 66 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22228185 - 22227809
Alignment:
Q  66 gagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgta 162  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||    
T  22228185 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22228086  T
Q  163 tgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22228085 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22227986  T
Q  263 attacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||   ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22227985 attacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttc 22227887  T
Q  363 aaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22227886 aattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 66 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22232882 - 22232506
Alignment:
Q  66 gagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgta 162  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||    
T  22232882 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22232783  T
Q  163 tgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22232782 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22232683  T
Q  263 attacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||   ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22232682 attacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttc 22232584  T
Q  363 aaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22232583 aattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 105 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 2116589 - 2116258
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctct 204  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  2116589 aaggtaaaggggttagtgattatcataatcatgtaattttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgcttt 2116490  T
Q  205 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 304  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||     
T  2116489 tactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatg 2116390  T
Q  305 gtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttga-gttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 403  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||    
T  2116389 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaa 2116291  T
Q  404 taattgcttgggtttgcatattcatggattgat 436  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2116290 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 105 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45051757 - 45051489
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctct 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  45051757 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtgattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgttct 45051658  T
Q  205 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 304  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||    
T  45051657 tactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 45051558  T
Q  305 gtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 374  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051557 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17149001 - 17148706
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  17149001 agagaagaacaagagggttgaagggaaagcttgaggaatcaagtggggtgacataggagctgaattgaagcaagggttggggataatcaacttcaaaggt 17148902  T
Q  110 aaggggg-ttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctctt 205  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  17148901 aaggggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctctt 17148802  T
Q  206 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    | ||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17148801 gttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 17148706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20931596 - 20931345
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20931596 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaat 20931497  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  20931496 gataagttatgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 20931398  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  20931397 tgttgtggttgatgaataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 18059581 - 18059875
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  18059581 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 18059680  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  18059681 aagggggttagttattatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 18059780  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18059781 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18059875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17005071 - 17004777
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  17005071 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 17004972  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  17004971 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 17004872  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17004871 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 17004777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20913281 - 20913037
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20913281 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaat 20913182  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  20913181 gataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaatt-------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 20913090  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20913089 tcttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 38054914 - 38055208
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  38054914 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 38055013  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgt--aat-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||     
T  38055014 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctttta 38055113  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||||||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38055114 ctgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 38055208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 20893638 - 20893889
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||    
T  20893638 tgctaaattcttgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaat 20893737  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  20893738 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattga 20893836  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || || ||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  20893837 tgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41394473 - 41394222
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41394473 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaat 41394374  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  41394373 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 41394275  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41394274 tgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 19962322 - 19962616
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19962322 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggattcaatttgggcgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 19962421  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgt--aat-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  19962422 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 19962521  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||| ||| ||| ||  | ||  |||||||||||| || ||||| || | |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19962522 ctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 19962616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20445930 - 20445679
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||    
T  20445930 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaat 20445831  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||  |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  20445830 gataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattga 20445732  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  20445731 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20531695 - 20531444
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||    
T  20531695 tgctaaattcgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaat 20531596  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||  |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  20531595 gataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattga 20531497  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  20531496 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 37844462 - 37844714
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||    
T  37844462 tgctaaattcatgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaat 37844561  T
Q  288 gttaagtta-tgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 386  Q
    | |||  || |||  |||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||    
T  37844562 gataaaatagtgaaaattgtgctcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattg 37844660  T
Q  387 atattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    || || || ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  37844661 atgttgtggttgatgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 46523731 - 46523528
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattc 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  46523731 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattc 46523632  T
Q  198 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagtt 295  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| | ||  |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  46523631 gtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtt 46523532  T
Q  296 atga 299  Q
    ||||    
T  46523531 atga 46523528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 51452743 - 51452608
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||||||||||    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  51452743 tgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 51452644  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  51452643 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22035827 - 22035681
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| | ||||||||    
T  22035827 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgtt 22035728  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  22035727 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 22035681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 206
Target Start/End: Original strand, 7640810 - 7640956
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| |  |||||||    
T  7640810 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 7640909  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  7640910 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 7640956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 15861284 - 15861358
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  15861284 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Original strand, 22143361 - 22143470
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgt 289  Q
    |||||||||||||  || ||||| | |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||    
T  22143361 aaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaaatttgtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatgt 22143460  T
Q  290 taagttatga 299  Q
    ||| ||||||    
T  22143461 taacttatga 22143470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Original strand, 40436269 - 40436367
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatg 288  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||  ||| ||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  40436269 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatatatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatg 40436367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 265
Target Start/End: Original strand, 38033675 - 38033748
Alignment:
Q  193 aattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 265  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  38033675 aattcgtgctcctattatgatgttatgtttgtatgtaagaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaatt 38033748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17609174 - 17609090
Alignment:
Q  193 aattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    ||||||||||||   | ||||| ||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17609174 aattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 17609090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 31497 - 31928
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  31497 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaatgtaa 31596  T
Q  112 gggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctg 209  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  31597 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtgg 31696  T
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 31796  T
Q  310 aaattggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 408  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31797 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataatt 31896  T
Q  409 gcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31897 gcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 128181 - 128431
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  128181 tgctaaattcgtgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggt 128280  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    |||||||| |||  |||||||| |||||| |||||| |  || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  128281 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatgga 128378  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  128379 tgttgtgattgatgaataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 38 - 440
Target Start/End: Original strand, 64372 - 64780
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64372 agcttaaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 64471  T
Q  138 taatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt- 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  64472 taatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaatta 64571  T
Q  236 ----gatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaag 331  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  64572 tattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaag 64671  T
Q  332 ttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatgga 431  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64672 ttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgga 64771  T
Q  432 ttgatgatg 440  Q
    ||| |||||    
T  64772 ttgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 105 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 108084 - 107747
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgc 201  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  108084 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 107985  T
Q  202 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 301  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |      
T  107984 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaa 107885  T
Q  302 attgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 401  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  107884 attgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 107786  T
Q  402 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107785 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 20936 - 21367
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||| ||||||||||    
T  20936 agagaagaacaagagttttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggt 21035  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgc 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21036 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgt 21135  T
Q  208 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtg 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |    
T  21136 tgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgag 21235  T
Q  308 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 407  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21236 ctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaataat 21334  T
Q  408 tgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21335 tgcttgagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 13882 - 14312
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||| ||||||||||    
T  13882 agagaagaacaagagttttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggt 13981  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgc 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13982 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaat-cgtgctcttgc 14080  T
Q  208 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtg 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  14081 tgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtg 14180  T
Q  308 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 407  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14181 ctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataat 14279  T
Q  408 tgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14280 tgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 63 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 411 - 35
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgta 162  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  |  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  411 taggagctgaattgaagcgagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcaaaatcatgtaattttgcatt-gctcatgttata 313  T
Q  163 tgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  312 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaa 213  T
Q  263 attacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttc 362  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  212 attacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttc 113  T
Q  363 aaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  112 aaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 63 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4102 - 3722
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  4102 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttctaaggtaaggggtttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 4003  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4002 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 3903  T
Q  260 gaaattacatgttcaaatatgta-aaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattctt 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3902 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattctt 3804  T
Q  359 gttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3803 gttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatattcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 105 - 436
Target Start/End: Original strand, 9266 - 9596
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  9266 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttt 9365  T
Q  205 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||     
T  9366 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatg 9465  T
Q  305 gtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 404  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||||    
T  9466 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaat 9564  T
Q  405 aattgcttgggtttgcatattcatggattgat 436  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9565 cattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 105 - 436
Target Start/End: Original strand, 16164 - 16494
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  16164 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttt 16263  T
Q  205 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||     
T  16264 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatg 16363  T
Q  305 gtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 404  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||||    
T  16364 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaat 16462  T
Q  405 aattgcttgggtttgcatattcatggattgat 436  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16463 cattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 34 - 344
Target Start/End: Original strand, 13171 - 13480
Alignment:
Q  34 gggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaat 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13171 gggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggaactgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataat 13270  T
Q  134 catgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa 233  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13271 catgtaatttttcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaa 13370  T
Q  234 ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagtt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13371 ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagtt 13469  T
Q  334 gttgttaattt 344  Q
     ||||||||||    
T  13470 attgttaattt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 63 - 440
Target Start/End: Original strand, 5088 - 5466
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||| |||    
T  5088 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggagttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgtt 5187  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5188 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 5287  T
Q  260 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5288 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctgagttgttgttaatttgagatttgattcttg 5386  T
Q  360 ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5387 ttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttggg-ttgcatattcatggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 38 - 334
Target Start/End: Original strand, 1153 - 1450
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1153 agctttaggaatcaagttggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaggggggttagttattatcacaatcatg 1252  T
Q  138 taatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattg 236  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1253 taatttttgcatttactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattg 1352  T
Q  237 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttg 334  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1353 atgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 63 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 3341 - 2966
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--attttgcatttgctcatgttg 160  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||||||||    
T  3341 taggagctgaattgaagcaagagtttcggttaatcttcttctaaggtaagggggttaattattatcataattatgtacaattttgcattttctcatgttg 3242  T
Q  161 tatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3241 tatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtg 3142  T
Q  261 aaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg- 359  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||     
T  3141 aaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgt 3043  T
Q  360 ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgat 436  Q
    || || |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||| || |||||||||||| ||||||    
T  3042 tttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 188 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 5780 - 5551
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5780 tgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 5681  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5680 gataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5581  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtt 417  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5580 taatatgattaatgaataattgcttgggtt 5551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 188 - 438
Target Start/End: Original strand, 3594 - 3843
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3594 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 3693  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  3694 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattga 3792  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatga 438  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3793 tgttgtgattgaggaataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1375 - 1124
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1375 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 1276  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  1275 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 1177  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1176 tattgtggttgatgaataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 9129 - 8878
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9129 tgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 9030  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    |||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  9029 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattga 8931  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8930 tgttgtgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12364 - 12115
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12364 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaat 12265  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12264 gataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattga 12168  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12167 tgttatgattcatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6326
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6076 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6175  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
      |||||| | |  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||      
T  6176 aataagttgtaaaaattgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttt 6273  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6274 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 968 - 1218
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  968 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 1067  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
      |||||| |||  |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  1068 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 1165  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1166 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48438 - 48187
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48438 tgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaat 48339  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  48338 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaattga 48240  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48239 tgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31742 - 31448
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  31742 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 31643  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  31642 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 31543  T
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31542 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 31448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39934 - 39785
Alignment:
Q  152 ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatga 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||      
T  39934 ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtattt 39835  T
Q  252 ttgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39834 ttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 39785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29558 - 29301
Alignment:
Q  47 aatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aat-tt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||    
T  29558 aatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctt 29459  T
Q  144 tgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataa 243  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||| |||| |    
T  29458 tgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgttgatta 29359  T
Q  244 ttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    |  |||| || | |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  29358 tgttatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatgttaagttatga 29301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 29627 - 29565
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaa 73  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29627 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaa 29565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 207 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 148953 - 148721
Alignment:
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||    
T  148953 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 148854  T
Q  307 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 406  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || || ||||||||| |    
T  148853 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatca 148755  T
Q  407 ttgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  148754 ttgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 9100 - 8849
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9100 tgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 9001  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    || ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||  ||||||| |||||||||   | ||| ||||    
T  9000 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattga 8902  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  8901 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 53575 - 53508
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  53575 tgatgatatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 53508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19457 - 19206
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19457 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 19358  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  19357 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattga 19259  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19258 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21541 - 21290
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21541 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 21442  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  21441 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattga 21343  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21342 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 191 - 440
Target Start/End: Original strand, 36928 - 37176
Alignment:
Q  191 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtt 290  Q
    |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36928 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgat 37027  T
Q  291 aagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 390  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| |    
T  37028 aagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgt 37126  T
Q  391 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37127 tgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 123176 - 123427
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  123176 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 123275  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  123276 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 123374  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  123375 tgttgtggttgatgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 5073 - 5324
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||||||| |||   |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5073 tgctaaattcgtactccaactgtgacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaat 5172  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  5173 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 5271  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  5272 tgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 26427 - 26678
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26427 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaat 26526  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  26527 gataagttgtgaaaattgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 26625  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  26626 tgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Original strand, 8192 - 8327
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8192 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaat 8291  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    || ||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  8292 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 188 - 429
Target Start/End: Original strand, 247454 - 247694
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | | ||||    
T  247454 tgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaat 247553  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  247554 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattga 247652  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 429  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  247653 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 299
Target Start/End: Original strand, 34076 - 34275
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtg 200  Q
    |||||||||||||||||  | |||| ||||||||   | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  34076 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtg 34174  T
Q  201 ctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatg 298  Q
    |||||||||||| | ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34175 ctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 34274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 34472 - 34724
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34472 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaat 34571  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttg 386  Q
     | ||||| |||  ||||| || ||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||   |||||||||    
T  34572 atgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 34670  T
Q  387 atattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    || || |  ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34671 atgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 188 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 172156 - 171916
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  172156 tgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 172057  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  172056 gataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 171958  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 429  Q
    | || || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  171957 tgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 188 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 177859 - 177619
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  177859 tgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 177760  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  177759 gataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 177661  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 429  Q
    | || || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  177660 tgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 1451 - 1692
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||||| ||||||||    
T  1451 taggagctgaattgaagcaagggtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 1550  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  1551 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1650  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1651 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 188 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 41980 - 41733
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41980 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaat 41881  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | ||| || |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||     
T  41880 gataatttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgt 41782  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgat 436  Q
    | || |   |||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  41781 tgttgtagatgatgaatcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 299
Target Start/End: Original strand, 1390 - 1631
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  || ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  1390 taggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 1489  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| || | |||    
T  1490 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggt 1589  T
Q  260 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1590 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 7278 - 7573
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||| || |||||  |||||||||    
T  7278 agagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaagg 7377  T
Q  109 taagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctctt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  7378 taagggggttagttattatcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctctt 7477  T
Q  206 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    | ||||||| ||| ||  | |||||||||||| ||| || ||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  7478 gttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatga 7573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 191 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41896 - 41648
Alignment:
Q  191 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtt 290  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  41896 taaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtg 41797  T
Q  291 aagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 390  Q
    ||||| |||  |||||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   |||||  |||| |    
T  41796 aagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgatgt 41698  T
Q  391 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41697 tgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 546 - 797
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  546 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 645  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    | | |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | |||||||  |||||  || |||| ||||||||||| || ||||||||||  || || ||||    
T  646 gatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggctgctaattga 744  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||    
T  745 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2826 - 2531
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||    
T  2826 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagg 2728  T
Q  109 taagggggttagttattatcacaatcatgtaa----ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctct 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  2727 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctct 2628  T
Q  205 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    ||| |||||| ||| ||  | |||||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  2627 tgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatga 2531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 207 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 272257 - 272031
Alignment:
Q  207 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 306  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||    
T  272257 ctgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 272158  T
Q  307 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 406  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  272157 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 272059  T
Q  407 ttgcttgggtttgcatattcatggattg 434  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  272058 ttgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13757 - 13506
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13757 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 13658  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    || ||||| |||  |||||||| ||||| ||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| ||||    
T  13657 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattga 13559  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  13558 tgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 214
Target Start/End: Original strand, 10624 - 10778
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgtt 159  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  10624 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 10723  T
Q  160 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10724 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 188 - 322
Target Start/End: Original strand, 51194 - 51328
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51194 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaat 51293  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatt 322  Q
    | |||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  51294 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 10296 - 10456
Alignment:
Q  141 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||    
T  10296 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatga 10395  T
Q  241 taattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 299  Q
    | || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  10396 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatga 10456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 440
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  334 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 433  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  434 gatgatg 440  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7002 - 6768
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatca-- 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  7002 agctttacgaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 6903  T
Q  136 -tgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 234  Q
     |  |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | || || | | ||  ||| |||||||    
T  6902 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgt-ttcttatacatgaat 6804  T
Q  235 tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg 270  Q
    ||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||    
T  6803 tgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatg 6768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  334 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 433  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  434 gatgatg 440  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 45369 - 45098
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aatt-ttgcatttgctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtg 200  Q
    |||||||||||||||||  | |||| ||||||||  |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  45369 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 45270  T
Q  201 ctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatg 298  Q
    | |||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||    
T  45269 cccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttg 45170  T
Q  299 agtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 372  Q
    |  ||||| || ||||||||||||| |  || ||||||||| |  |||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  45169 a-aattgtactcaattggtgaattt-tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 45098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 54700 - 54484
Alignment:
Q  156 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||  |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54700 tgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgtccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgt 54601  T
Q  256 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtga 353  Q
     ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||| |  || ||||||||| |  |||| |||||    
T  54600 gggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatga-aattgtactcaattggtgaattt-tgatatgttgttgttgaaatgagatgtga 54503  T
Q  354 ttcttgttcaaatgatgtt 372  Q
    ||| ||||| | |||||||    
T  54502 ttcatgttccattgatgtt 54484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 188 - 322
Target Start/End: Original strand, 89466 - 89600
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  89466 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 89565  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatt 322  Q
      |||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  89566 tataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 131006 - 130880
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  131006 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggcataatcatcttcaaaggt 130907  T
Q  110 aagggggttagttattatcacaatcat 136  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||    
T  130906 aagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 79786 - 79704
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 273  Q
    |||||||||| ||  || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||| |||||||||| |||||||    
T  79786 aaattcgtgcactaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttggtggtgaaattgcatgttc 79704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 37078 - 37328
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  37078 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 37177  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 387  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| |||   ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  37178 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 37275  T
Q  388 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  37276 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3712 - 3577
Alignment:
Q  141 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatga 240  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||| | ||  | | |||||||||||||    
T  3712 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatga 3613  T
Q  241 taattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    | || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3612 ttatggtatgattgtgggtgaaattacatgttcaaa 3577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 54173 - 54038
Alignment:
Q  141 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatga 240  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | | ||  | |||||||||||||||    
T  54173 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatga 54074  T
Q  241 taattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    | || ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  54073 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaa 54038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3441 - 3257
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacat-gttcaaa-tatgtaaaa 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||    
T  3441 tgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttcaaagtatgtataa 3342  T
Q  286 atgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 372  Q
    || | |||||||||  ||||| || || |||||||||| | ||||||||||||| |   ||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  3341 atatcaagttatga-aattgtactcaaatggtgaattt-tgctaagttgttgttgagaggatatgtgattattgttcaattgatgtt 3257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22791 - 22656
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  22791 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 22692  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  22691 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 22656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 27046 - 26911
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  27046 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 26947  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  26946 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Original strand, 1594 - 1729
Alignment:
Q  188 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 287  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  1594 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 1693  T
Q  288 gttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaattt 323  Q
    |  |||||||||  ||||||| |||| | |||||||    
T  1694 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 270
Target Start/End: Original strand, 23600 - 23834
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatca-- 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||      
T  23600 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggaactgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagttaagggggttagttattatcatattcaat 23699  T
Q  136 -tgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 234  Q
     |  |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| | | || |||| | ||  ||| |||| ||    
T  23700 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctctggttatgttgttgt-ttcttatacatggat 23798  T
Q  235 tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg 270  Q
    ||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||    
T  23799 tgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatg 23834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 191 - 339
Target Start/End: Original strand, 56114 - 56262
Alignment:
Q  191 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg--ttcaaatatgtaaaaatg 288  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || || |||||| |||||    
T  56114 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatgtataaatg 56213  T
Q  289 ttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgtt 339  Q
    | |||||||||  |||||||| || |||||||||| | |||||||||||||    
T  56214 tcaagttatga-aattgtgctcaaatggtgaattt-tgctaagttgttgtt 56262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 343 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 9479 - 9382
Alignment:
Q  343 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 440  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9479 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Original strand, 154282 - 154373
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  154282 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatca 154373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 299
Target Start/End: Original strand, 1 - 113
Alignment:
Q  189 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||  |||    
T  1 gctaaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaa 100  T
Q  287 tgttaagttatga 299  Q
    |||||||||||||    
T  101 tgttaagttatga 113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Original strand, 12045 - 12149
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  12045 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaatttttcattt-ctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtg 12143  T
Q  201 ctcttg 206  Q
    ||||||    
T  12144 ctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 17115 - 17226
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| | |||| |||||    
T  17115 agagaagcacaggagtgttgaaaggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataataatcttctaaggt 17214  T
Q  110 aagggggttagt 121  Q
    ||||||||||||    
T  17215 aagggggttagt 17226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7510 - 7443
Alignment:
Q  139 aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcgtgctaaattcgtgctcttg 206  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  7510 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 7443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8172
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaa 8172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Original strand, 22422 - 22531
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc-aaatatgtaaaaatgt 289  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||     
T  22422 aaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataatttaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaaatatgtataaatgc 22521  T
Q  290 taagttatga 299  Q
    ||| ||||||    
T  22522 taacttatga 22531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 177
Target Start/End: Original strand, 13268 - 13342
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgat 177  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13268 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 13342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Original strand, 104623 - 104732
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgt 289  Q
    |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||||||||||| || || ||||||| |||||| |||||     
T  104623 aaattcatgctctaactatgatgatatgtttgtatgcattaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcaggttcaaagtatgtataaatgc 104722  T
Q  290 taagttatga 299  Q
    ||| ||||||    
T  104723 taacttatga 104732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 523 - 456
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  523 tgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattatattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14283 - 14200
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||    
T  14283 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattattgctggtgaaattgcatgttca 14200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 276
Target Start/End: Original strand, 2334 - 2401
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  2334 tgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 2401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22246 - 22163
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  22246 aaattcgtgctcttgctatgatgttatgtttgagtatatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 22163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30211 - 30128
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||    
T  30211 aaattcgtgctcttactatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgttca 30128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 108256 - 108173
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  108256 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Original strand, 1348 - 1446
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcat-gaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg 288  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  1348 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaatg 1446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Original strand, 9603 - 9701
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcat-gaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg 288  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  9603 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaatg 9701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2772 - 2687
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  2772 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 2687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Original strand, 22453 - 22514
Alignment:
Q  216 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  22453 tatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaa 22514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3498 - 3415
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    |||||||||| |||| | ||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  3498 aaattcgtgcgcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 3415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 6890 - 6823
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  6890 tgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 6823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8737 - 8654
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||| ||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  8737 aaattcgtgctcttgttgtgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 8654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 276
Target Start/End: Original strand, 43816 - 43883
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  43816 tgatgctatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 43883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 276
Target Start/End: Original strand, 76865 - 76932
Alignment:
Q  210 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 276  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  76865 tgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 76932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27744 - 27661
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 274  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  27744 aaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 27661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10908 - 10854
Alignment:
Q  193 aattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattg 246  Q
    ||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10908 aattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 10854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1655
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgt 289  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||  ||||||||||| || | |||| ||| |||||| |||||     
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaatttgcttgttaaaagtatgtataaatgc 1645  T
Q  290 taagttatga 299  Q
    ||| ||||||    
T  1646 taatttatga 1655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8800
Alignment:
Q  192 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgt 289  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||  ||||||||||| || | |||| ||| |||||| |||||     
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaatttgcttgttaaaagtatgtataaatgc 8790  T
Q  290 taagttatga 299  Q
    ||| ||||||    
T  8791 taatttatga 8800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5549 times since January 2019
Visitors: 4857