View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0755_low_30 (Length: 425)

Name: NF0755_low_30
Description: NF0755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0755_low_30
NF0755_low_30
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (12-425)||(19886483-19886896)
chr2 (223-425)||(17396697-17396899)
chr2 (12-274)||(11231161-11231426)
chr2 (12-274)||(22513008-22513273)
chr2 (12-274)||(28775630-28775895)
chr2 (12-274)||(24685604-24685869)
chr2 (212-425)||(462755-462967)
chr2 (63-274)||(8944014-8944226)
chr2 (222-425)||(8891259-8891461)
chr2 (212-425)||(19794738-19794950)
chr2 (12-136)||(24826522-24826646)
chr2 (100-274)||(3798516-3798691)
chr2 (63-274)||(12728560-12728772)
chr2 (63-274)||(42177845-42178057)
chr2 (63-274)||(12635744-12635956)
chr2 (63-274)||(16935761-16935973)
chr2 (63-274)||(17006421-17006633)
chr2 (63-274)||(34824643-34824855)
chr2 (105-274)||(12641560-12641730)
chr2 (105-274)||(23777963-23778133)
chr2 (212-421)||(20627347-20627555)
chr2 (212-425)||(36982475-36982687)
chr2 (212-425)||(43642991-43643203)
chr2 (190-425)||(7507856-7508090)
chr2 (212-425)||(24341423-24341635)
chr2 (63-210)||(23774368-23774516)
chr2 (190-325)||(25265402-25265537)
chr2 (105-210)||(5888548-5888654)
chr2 (151-239)||(21142098-21142187)
chr2 (212-310)||(19689435-19689533)
chr2 (212-310)||(23820202-23820300)
chr2 (212-310)||(14906474-14906572)
chr2 (63-136)||(25213372-25213446)
chr2 (212-310)||(20015142-20015240)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (5-425)||(12391-12811)
chr5 (5-425)||(21073410-21073830)
chr5 (12-425)||(18777814-18778227)
chr5 (12-425)||(19499916-19500328)
chr5 (12-425)||(22366302-22366716)
chr5 (12-425)||(25426645-25427058)
chr5 (12-425)||(4199807-4200220)
chr5 (12-425)||(43443220-43443630)
chr5 (38-425)||(27009858-27010244)
chr5 (12-390)||(29188107-29188483)
chr5 (12-274)||(10777793-10778058)
chr5 (12-274)||(21932204-21932469)
chr5 (12-274)||(21938374-21938639)
chr5 (190-425)||(23506982-23507216)
chr5 (12-274)||(35582204-35582469)
chr5 (38-274)||(7425492-7425729)
chr5 (62-274)||(11211940-11212153)
chr5 (12-206)||(36989593-36989790)
chr5 (12-241)||(22882907-22883139)
chr5 (190-425)||(27182559-27182793)
chr5 (63-274)||(35790974-35791186)
chr5 (12-274)||(17471411-17471676)
chr5 (63-274)||(23514729-23514941)
chr5 (63-274)||(1219396-1219608)
chr5 (212-418)||(22053867-22054072)
chr5 (212-425)||(18531101-18531313)
chr5 (190-425)||(34939295-34939528)
chr5 (12-136)||(11343008-11343134)
chr5 (63-210)||(23328789-23328937)
chr5 (63-210)||(24616393-24616541)
chr5 (63-210)||(24712769-24712917)
chr5 (63-210)||(24745787-24745935)
chr5 (12-136)||(16105967-16106093)
chr5 (212-310)||(20623100-20623198)
chr5 (212-310)||(21233562-21233660)
chr5 (212-310)||(25900440-25900538)
chr5 (212-310)||(16536328-16536426)
chr5 (212-274)||(37052911-37052973)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (12-425)||(27653805-27654218)
chr6 (38-425)||(25175580-25175968)
chr6 (116-425)||(16825678-16825989)
chr6 (12-425)||(14625952-14626364)
chr6 (105-425)||(1650022-1650339)
chr6 (12-274)||(16376196-16376461)
chr6 (12-274)||(16383520-16383785)
chr6 (12-274)||(10488867-10489132)
chr6 (12-241)||(22251389-22251621)
chr6 (38-274)||(16232060-16232297)
chr6 (12-274)||(22225561-22225826)
chr6 (12-208)||(19299471-19299670)
chr6 (38-274)||(18086674-18086911)
chr6 (23-274)||(16555973-16556227)
chr6 (23-274)||(16632529-16632783)
chr6 (212-425)||(23153464-23153676)
chr6 (38-210)||(29869627-29869800)
chr6 (63-274)||(1556173-1556385)
chr6 (63-274)||(19610186-19610398)
chr6 (63-274)||(23977937-23978149)
chr6 (190-425)||(1657760-1657993)
chr6 (12-121)||(16814820-16814930)
chr6 (105-274)||(13620712-13620882)
chr6 (109-374)||(29665941-29666208)
chr6 (212-365)||(15862549-15862700)
chr6 (190-325)||(35009451-35009586)
chr6 (63-136)||(4991396-4991470)
chr6 (191-263)||(27751603-27751675)
chr6 (194-278)||(19854317-19854402)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (12-425)||(36110-36523)
scaffold0023 (16-229)||(169736-169951)
scaffold0023 (212-425)||(48615-48827)
scaffold0023 (63-274)||(153883-154095)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (12-425)||(13910846-13911260)
chr7 (12-425)||(10989427-10989841)
chr7 (12-425)||(2437474-2437889)
chr7 (38-425)||(13572693-13573079)
chr7 (12-425)||(16478785-16479196)
chr7 (105-425)||(18253761-18254081)
chr7 (12-274)||(7822896-7823161)
chr7 (12-274)||(7830207-7830472)
chr7 (12-274)||(27176601-27176866)
chr7 (12-274)||(27101460-27101725)
chr7 (12-274)||(27108808-27109073)
chr7 (12-274)||(38783552-38783817)
chr7 (38-274)||(18979872-18980109)
chr7 (38-274)||(15927736-15927973)
chr7 (212-425)||(25292372-25292584)
chr7 (222-425)||(11580783-11580985)
chr7 (12-274)||(15950613-15950879)
chr7 (190-425)||(47481043-47481277)
chr7 (212-425)||(13037048-13037260)
chr7 (218-425)||(3059983-3060189)
chr7 (212-425)||(16211783-16211995)
chr7 (222-425)||(36052684-36052883)
chr7 (63-274)||(13758538-13758750)
chr7 (63-274)||(15759990-15760202)
chr7 (105-187)||(15862174-15862257)
chr7 (100-274)||(14250811-14250986)
chr7 (105-276)||(48622584-48622756)
chr7 (190-376)||(13321080-13321267)
chr7 (105-210)||(16418729-16418835)
chr7 (212-425)||(7293034-7293245)
chr7 (105-210)||(10000288-10000394)
chr7 (212-310)||(11516358-11516456)
chr7 (212-310)||(15441598-15441696)
chr7 (212-310)||(30262163-30262261)
chr7 (62-136)||(15516719-15516793)
chr7 (194-278)||(13448827-13448912)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (12-425)||(30120739-30121153)
chr8 (12-425)||(21851786-21852200)
chr8 (12-425)||(21844393-21844807)
chr8 (12-425)||(24548999-24549410)
chr8 (41-425)||(16674245-16674627)
chr8 (12-425)||(6774082-6774492)
chr8 (252-425)||(222753-222926)
chr8 (252-425)||(736376-736549)
chr8 (252-425)||(860271-860444)
chr8 (12-274)||(271183-271448)
chr8 (12-274)||(644472-644737)
chr8 (12-274)||(830207-830472)
chr8 (12-208)||(15318982-15319181)
chr8 (12-208)||(15499351-15499550)
chr8 (12-274)||(22088617-22088882)
chr8 (222-425)||(43373512-43373714)
chr8 (212-425)||(16193750-16193962)
chr8 (63-274)||(13720804-13721016)
chr8 (63-274)||(22006134-22006346)
chr8 (100-274)||(16872964-16873139)
chr8 (222-425)||(24928835-24929037)
chr8 (63-274)||(13662141-13662353)
chr8 (63-274)||(16195399-16195611)
chr8 (212-423)||(16405009-16405216)
chr8 (212-425)||(17345587-17345798)
chr8 (252-314)||(691908-691970)
chr8 (212-425)||(22907248-22907459)
chr8 (212-310)||(5238218-5238316)
chr8 (212-310)||(24661282-24661380)
chr8 (212-310)||(43685677-43685775)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (12-425)||(31497-31911)
scaffold0008 (212-425)||(128203-128414)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (12-425)||(10644236-10644648)
chr4 (63-421)||(47357675-47358030)
chr4 (222-425)||(13048265-13048468)
chr4 (212-425)||(13246447-13246659)
chr4 (38-274)||(15287096-15287333)
chr4 (12-274)||(18169138-18169403)
chr4 (190-425)||(54118256-54118490)
chr4 (38-274)||(15294205-15294442)
chr4 (38-210)||(22351915-22352088)
chr4 (63-274)||(7131941-7132153)
chr4 (63-274)||(20000891-20001103)
chr4 (212-425)||(15675123-15675335)
chr4 (105-274)||(19020654-19020824)
chr4 (212-425)||(31115646-31115858)
chr4 (100-274)||(17145570-17145745)
chr4 (105-239)||(18248421-18248556)
chr4 (212-374)||(10104284-10104445)
chr4 (212-342)||(121989-122118)
chr4 (63-210)||(26339251-26339399)
chr4 (114-208)||(8378385-8378480)
chr4 (143-274)||(22738437-22738568)
chr4 (38-136)||(14952085-14952183)
chr4 (212-425)||(26680218-26680429)
chr4 (345-425)||(111412-111492)
chr4 (105-179)||(9795490-9795564)
chr4 (212-310)||(10488693-10488791)
chr4 (212-310)||(16327960-16328058)
chr4 (222-374)||(40885598-40885749)
chr4 (63-137)||(14996444-14996518)
chr4 (105-138)||(8378491-8378524)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (38-425)||(55316236-55316622)
chr3 (38-425)||(41270092-41270478)
chr3 (62-425)||(16821156-16821517)
chr3 (105-425)||(15614851-15615168)
chr3 (105-425)||(15936553-15936873)
chr3 (105-425)||(15938395-15938715)
chr3 (12-274)||(49232604-49232869)
chr3 (63-425)||(14842446-14842807)
chr3 (12-274)||(12264614-12264880)
chr3 (12-274)||(1467562-1467827)
chr3 (223-425)||(13975766-13975968)
chr3 (223-425)||(45860822-45861024)
chr3 (212-425)||(51158052-51158264)
chr3 (212-425)||(15859058-15859270)
chr3 (12-208)||(12812075-12812274)
chr3 (223-425)||(13954934-13955136)
chr3 (12-274)||(22275377-22275642)
chr3 (212-425)||(12030181-12030393)
chr3 (63-274)||(15468216-15468428)
chr3 (63-274)||(18911161-18911373)
chr3 (63-274)||(25058907-25059119)
chr3 (212-425)||(13838911-13839123)
chr3 (222-425)||(2049827-2050029)
chr3 (105-274)||(12902008-12902178)
chr3 (63-241)||(18896920-18897099)
chr3 (63-274)||(5228481-5228692)
chr3 (212-425)||(17912516-17912727)
chr3 (105-274)||(54651625-54651795)
chr3 (105-274)||(44229153-44229323)
chr3 (212-310)||(2449272-2449370)
chr3 (63-137)||(8268609-8268683)
chr3 (63-137)||(8275709-8275783)
chr3 (212-310)||(16744149-16744247)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (12-425)||(43014-43427)
scaffold0076 (12-274)||(39271-39536)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (38-425)||(5072237-5072623)
chr1 (143-425)||(18601071-18601353)
chr1 (66-425)||(22227826-22228185)
chr1 (66-425)||(22232523-22232882)
chr1 (105-425)||(2116271-2116589)
chr1 (105-376)||(45051489-45051757)
chr1 (12-274)||(17148735-17149001)
chr1 (12-274)||(18059581-18059846)
chr1 (12-274)||(17004806-17005071)
chr1 (212-425)||(20931362-20931574)
chr1 (12-274)||(38054914-38055179)
chr1 (12-208)||(19962322-19962521)
chr1 (212-425)||(20913054-20913259)
chr1 (212-425)||(20893660-20893872)
chr1 (100-274)||(46523557-46523731)
chr1 (190-425)||(20445696-20445930)
chr1 (222-425)||(20531461-20531663)
chr1 (190-425)||(37844462-37844697)
chr1 (212-425)||(41394239-41394451)
chr1 (63-210)||(22035679-22035827)
chr1 (63-210)||(7640810-7640958)
chr1 (62-136)||(15861284-15861358)
chr1 (212-310)||(51452623-51452721)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (12-425)||(20936-21350)
scaffold0139 (12-425)||(13882-14295)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (38-425)||(64372-64763)
scaffold0026 (105-425)||(107764-108084)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (38-336)||(1153-1450)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (63-425)||(52-411)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (34-346)||(13171-13480)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (63-425)||(3739-4102)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (63-418)||(5088-5443)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (105-425)||(9266-9583)
scaffold0215 (105-425)||(16164-16481)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (63-425)||(2979-3341)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (212-418)||(5552-5758)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (47-208)||(29396-29558)
scaffold0213 (12-73)||(29565-29627)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (212-425)||(3616-3828)
scaffold0266 (212-425)||(1141-1353)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (12-274)||(31477-31742)
scaffold0107 (153-274)||(39814-39935)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (190-425)||(8895-9129)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (222-425)||(48204-48406)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (105-425)||(12132-12449)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (212-425)||(6098-6309)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (212-425)||(990-1201)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (190-425)||(123176-123410)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (212-421)||(148742-148950)
scaffold0025 (212-425)||(8866-9078)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (63-216)||(10624-10778)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (212-425)||(19223-19435)
scaffold0195 (212-425)||(21307-21519)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (12-239)||(7278-7509)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (222-425)||(5105-5307)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (212-425)||(26449-26661)
scaffold0162 (190-325)||(8192-8327)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (212-425)||(36947-37159)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (63-274)||(1390-1602)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (222-425)||(247486-247688)
scaffold0012 (105-274)||(34076-34246)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (38-210)||(6829-7002)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (212-425)||(171922-172134)
scaffold0001 (212-425)||(177625-177837)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (63-274)||(1451-1663)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (12-274)||(2560-2826)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (222-425)||(272042-272244)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (212-425)||(568-780)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (212-425)||(41746-41958)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (38-206)||(23600-23769)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (12-136)||(130880-131006)
scaffold0028 (212-324)||(89488-89600)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (105-274)||(45198-45369)
scaffold0066 (105-274)||(54584-54755)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (105-425)||(34374-34707)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (105-274)||(10257-10427)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (336-425)||(9-98)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (212-324)||(51216-51328)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (105-276)||(54040-54212)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (143-276)||(3579-3712)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (336-425)||(48531-48620)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (105-325)||(13622-13855)
scaffold0132 (104-136)||(42677-42709)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (105-210)||(7441-7547)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (105-208)||(12045-12149)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (212-325)||(41764-41877)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (38-129)||(154282-154373)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (345-425)||(9399-9479)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (105-179)||(13268-13342)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (12-136)||(17115-17241)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (184-271)||(3360-3447)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (212-310)||(22671-22769)
scaffold0141 (212-310)||(26926-27024)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (212-310)||(1616-1714)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (212-310)||(37100-37198)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Original strand, 19886483 - 19886896
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886483 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 19886582  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  19886583 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 19886682  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886683 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 19886782  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886783 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 19886882  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  19886883 cttgggtatgcata 19886896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 223 - 425
Target Start/End: Original strand, 17396697 - 17396899
Alignment:
Q  223 ttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaa 322  Q
    |||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  17396697 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaa 17396796  T
Q  323 tttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgc 422  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  17396797 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgc 17396896  T
Q  423 ata 425  Q
    |||    
T  17396897 ata 17396899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 11231161 - 11231426
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  11231161 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 11231260  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  11231261 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 11231360  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  11231361 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 11231426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 22513008 - 22513273
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  22513008 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 22513107  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  22513108 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22513207  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22513208 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 22513273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 28775630 - 28775895
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  28775630 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 28775729  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  28775730 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 28775829  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  28775830 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 28775895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 24685604 - 24685869
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  24685604 agagaagaacaaaagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 24685703  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  24685704 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 24685803  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  24685804 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 24685869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 462967 - 462755
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |    
T  462967 tgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgtt 462868  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||||| ||||    
T  462867 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatgaatcattg 462769  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  462768 cttgggtatgcata 462755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8944226 - 8944014
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8944226 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 8944127  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||    
T  8944126 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggt 8944027  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  8944026 gaaattacatgtt 8944014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 222 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 8891461 - 8891259
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 321  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  8891461 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 8891362  T
Q  322 atttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 421  Q
    |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||    
T  8891361 attt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatg 8891263  T
Q  422 cata 425  Q
    ||||    
T  8891262 cata 8891259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 19794738 - 19794950
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| ||||||||    
T  19794738 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 19794837  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  19794838 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattg 19794936  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  19794937 cttgggtatgcata 19794950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 24826522 - 24826646
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  24826522 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 24826621  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcat 136  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  24826622 aggggttagtcatcatcataatcat 24826646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 3798516 - 3798691
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  3798516 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 3798615  T
Q  199 catgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | |||||||||| | ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  3798616 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 3798691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12728772 - 12728560
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  12728772 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 12728673  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  12728672 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 12728573  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  12728572 gaaattacatgtt 12728560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 42177845 - 42178057
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  42177845 taggggctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 42177944  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  42177945 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggt 42178044  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  42178045 gaaattacatgtt 42178057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 12635744 - 12635956
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  12635744 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgtt 12635843  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  12635844 gtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 12635943  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  12635944 gaaattacatgtt 12635956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16935973 - 16935761
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16935973 taggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 16935874  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  ||    
T  16935873 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgt 16935774  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  16935773 gaaattacatgtt 16935761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17006633 - 17006421
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17006633 taggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 17006534  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  ||    
T  17006533 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgt 17006434  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  17006433 gaaattacatgtt 17006421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34824855 - 34824643
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  34824855 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 34824756  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  34824755 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 34824656  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  34824655 gaaattacatgtt 34824643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 12641560 - 12641730
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||    
T  12641560 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 12641659  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||| | ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| | ||||||||||||||    
T  12641660 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtt 12641730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 23777963 - 23778133
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  23777963 aaggtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 23778062  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| | ||||| ||| ||  |||||||||||||||| |  | ||||  |||| | ||||||||||||||    
T  23778063 tcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtt 23778133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 421
Target Start/End: Original strand, 20627347 - 20627555
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| || |||| ||||||||    
T  20627347 tgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgct 20627446  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||| | || || ||||||||| ||||    
T  20627447 caattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattg 20627545  T
Q  412 cttgggtatg 421  Q
    ||||||||||    
T  20627546 cttgggtatg 20627555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 36982475 - 36982687
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  36982475 tgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 36982574  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | | ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||    
T  36982575 caattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattg 36982673  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
     |||||||||||||    
T  36982674 tttgggtatgcata 36982687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 43642991 - 43643203
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||||| |||| ||||||||    
T  43642991 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgct 43643090  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||    
T  43643091 caattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactg 43643189  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  43643190 cttgggtatgcata 43643203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 425
Target Start/End: Original strand, 7507856 - 7508090
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  7507856 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 7507955  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttg 388  Q
     |||||||||||| |||||| | || ||||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||   |||||||||    
T  7507956 aataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-ggctaagttgttgttaa-ttgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 7508053  T
Q  389 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    || || |  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7508054 atgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcata 7508090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 24341423 - 24341635
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||  ||||| |||| ||||||||    
T  24341423 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 24341522  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||    ||||||||| ||||    
T  24341523 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgttgatgaatcattg 24341621  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||| ||||    
T  24341622 cttgggtatacata 24341635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23774516 - 23774368
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||| || |||||||    
T  23774516 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgtt 23774417  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  23774416 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 23774368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 25265402 - 25265537
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||| ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  25265402 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 25265501  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaattt 325  Q
    |  ||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  25265502 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 25265537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Original strand, 5888548 - 5888654
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  5888548 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 5888647  T
Q  204 tcttgtt 210  Q
    |||||||    
T  5888648 tcttgtt 5888654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21142187 - 21142098
Alignment:
Q  151 tttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattga 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  21142187 tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 21142098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 19689435 - 19689533
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  19689435 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 19689533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23820300 - 23820202
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  23820300 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 23820202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 14906474 - 14906572
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  14906474 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 14906572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25213446 - 25213372
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaagga-taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25213446 taggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20015240 - 20015142
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  20015240 tgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 20015142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12811 - 12391
Alignment:
Q  5 gaggagcagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttca 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12811 gaggagaagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttca 12712  T
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12711 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 12612  T
Q  205 cttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 12512  T
Q  305 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12511 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 12412  T
Q  405 ataattgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12411 ataattgcttgggtatgcata 12391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 425
Target Start/End: Original strand, 21073410 - 21073830
Alignment:
Q  5 gaggagcagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttca 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073410 gaggagaagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttca 21073509  T
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21073510 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgct 21073609  T
Q  205 cttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21073610 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 21073709  T
Q  305 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21073710 ttgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttgatattatgattgatga 21073809  T
Q  405 ataattgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21073810 ataattgcttgggtatgcata 21073830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Original strand, 18777814 - 18778227
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  18777814 agagaagaacaagagggttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataattaacttcaaaggtaa 18777913  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |     
T  18777914 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctg 18778013  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18778014 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 18778113  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778114 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattg 18778213  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  18778214 cttgggtatgcata 18778227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19500328 - 19499916
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  19500328 agagaagaacaagagagttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 19500230  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |     
T  19500229 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttgctg 19500130  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19500129 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 19500030  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19500029 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgattaataattg 19499930  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||| ||||||||||    
T  19499929 ctttggtatgcata 19499916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Original strand, 22366302 - 22366716
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  22366302 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttagcaatcaagtggggtgacctaggagttgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 22366401  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22366402 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttgct 22366501  T
Q  211 ctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22366502 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 22366601  T
Q  311 taaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366602 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 22366701  T
Q  411 gcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||||||||||    
T  22366702 gcttgggtatgcata 22366716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 25427058 - 25426645
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaag-gataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||    
T  25427058 agagaagagcaagagggttgaagggaagcttaaagaatcaagtgggtaac-taggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggta 25426960  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25426959 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 25426860  T
Q  211 ctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25426859 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 25426760  T
Q  311 taaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426759 taaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 25426660  T
Q  411 gcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||||||||||    
T  25426659 gcttgggtatgcata 25426645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Original strand, 4199807 - 4200220
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  4199807 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 4199906  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  4199907 gggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttg 4200006  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  4200007 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 4200106  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4200107 aaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattg 4200206  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||| ||||||    
T  4200207 cttgggtttgcata 4200220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Original strand, 43443220 - 43443630
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  43443220 agagaagagcatgagggttgaagggaagctt-aggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 43443318  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |     
T  43443319 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaatt--gcatattctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctg 43443416  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43443417 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 43443516  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443517 caattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 43443616  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||| ||||||    
T  43443617 cttgggtttgcata 43443630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 38 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27010244 - 27009858
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27010244 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 27010145  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27010144 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 27010046  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgt 337  Q
    |||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  27010045 gatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgt 27009946  T
Q  338 tgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  27009945 tgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcata 27009858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 390
Target Start/End: Original strand, 29188107 - 29188483
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  29188107 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 29188206  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  |    
T  29188207 agggggttagtgattattataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 29188304  T
Q  211 ctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || ||||    
T  29188305 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T
Q  311 taaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgat 390  Q
    | || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  29188405 tcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 29188483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 10777793 - 10778058
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10777793 agagaagaacaagagagttgaaggggaagcttgaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaaggataatcatcttcaaaggt 10777892  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  10777893 aaggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 10777992  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10777993 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10778058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 21932204 - 21932469
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21932204 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 21932303  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  21932304 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 21932403  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  21932404 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 21932469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 21938374 - 21938639
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21938374 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 21938473  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  21938474 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 21938573  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  21938574 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 21938639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 190 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 23507216 - 23506982
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  23507216 tgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 23507117  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  23507116 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 23507018  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507017 tgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcata 23506982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35582469 - 35582204
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  35582469 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 35582370  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  35582369 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 35582270  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  35582269 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 35582204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7425729 - 7425492
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425729 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 7425630  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||||    
T  7425629 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaat 7425530  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  7425529 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 7425492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 274
Target Start/End: Original strand, 11211940 - 11212153
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgt 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  11211940 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 11212039  T
Q  161 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttgg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||    
T  11212040 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 11212139  T
Q  261 tgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||    
T  11212140 tgaaattacatgtt 11212153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 206
Target Start/End: Original strand, 36989593 - 36989790
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  36989593 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 36989692  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||    
T  36989693 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctct 36989790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 22882907 - 22883139
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  22882907 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgggaaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaagat 22883006  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||  ||||||||    
T  22883007 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttg 22883106  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatg 241  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| ||||||||||    
T  22883107 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatg 22883139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 190 - 425
Target Start/End: Original strand, 27182559 - 27182793
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | || |    
T  27182559 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaat 27182658  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  27182659 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 27182757  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    | || || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27182758 tgttgtggttgatgaatcattgcttgagtatgcata 27182793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 35790974 - 35791186
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  35790974 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 35791073  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  ||    
T  35791074 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagt 35791173  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  35791174 gaaattacatgtt 35791186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 17471411 - 17471676
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||   | |||||| |||||||||    
T  17471411 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcatcttcaaagg 17471509  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||    
T  17471510 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctctt 17471609  T
Q  208 gttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17471610 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23514941 - 23514729
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  23514941 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 23514842  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  23514841 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 23514742  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  23514741 gaaattacatgtt 23514729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 1219396 - 1219608
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1219396 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 1219495  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | ||||| |||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  1219496 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1219595  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  1219596 gaaattacatgtt 1219608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 212 - 418
Target Start/End: Original strand, 22053867 - 22054072
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||| |||| ||||||||    
T  22053867 tgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 22053966  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||    
T  22053967 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattg 22054065  T
Q  412 cttgggt 418  Q
    |||||||    
T  22054066 cttgggt 22054072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 18531101 - 18531313
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||| |||| |||||| |    
T  18531101 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgtt 18531200  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||    
T  18531201 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattg 18531299  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    || |||||| ||||    
T  18531300 ctcgggtatacata 18531313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 34939528 - 34939295
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||| ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |    
T  34939528 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 34939429  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |  |||||||||| |||||||| || || || |||| | ||||||  |||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||| ||||    
T  34939428 gtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttattgctgttaattga 34939331  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34939330 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcata 34939295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11343134 - 11343008
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||| || |||||  ||||||||||    
T  11343134 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcagaggttagggttaatcttcttcaaaggt 11343035  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11343034 aagggggttagtttttatcataatcat 11343008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23328937 - 23328789
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  23328937 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 23328838  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  23328837 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 23328789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24616541 - 24616393
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  24616541 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24616442  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  24616441 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 24616393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24712917 - 24712769
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  24712917 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24712818  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  24712817 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 24712769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24745935 - 24745787
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  24745935 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24745836  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  24745835 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 24745787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16106093 - 16105967
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||  || ||| |||||  |||| |||||    
T  16106093 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggt 16105994  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16105993 aagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20623198 - 20623100
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  20623198 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 20623100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 21233562 - 21233660
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  21233562 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 21233660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 25900440 - 25900538
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  25900440 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 25900538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16536426 - 16536328
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  16536426 tgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16536328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37052973 - 37052911
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  37052973 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 37052911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Original strand, 27653805 - 27654218
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| |    
T  27653805 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtga 27653904  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |     
T  27653905 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctg 27654004  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27654005 tgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 27654104  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654105 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 27654204  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  27654205 cttgggtatgcata 27654218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 38 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 25175968 - 25175580
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaag-gataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25175968 agctttcggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattaccataatcat 25175870  T
Q  137 gtgtaattttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaa 235  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  25175869 gtataattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaa 25175770  T
Q  236 ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagtt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25175769 ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagtt 25175670  T
Q  336 gttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175669 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 25175580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 116 - 425
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16825989
Alignment:
Q  116 gttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgat 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  16825678 gttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 16825777  T
Q  216 gttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaa 313  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16825778 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaa 16825877  T
Q  314 agtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 413  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16825878 attggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatctgatattatgattgatgaataattgct 16825977  T
Q  414 tgggtatgcata 425  Q
    | | ||||||||    
T  16825978 ttgttatgcata 16825989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Original strand, 14625952 - 14626364
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  14625952 agagaagaacaagagggttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 14626051  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgt 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | | | ||| ||  ||||||  |||||| ||||  || | | ||| | ||||  |||||||||| ||||||||     
T  14626052 gggggttagttattatcacaatcatct-tcactttacaaattctcaaatgttgtttgaat-tgtgattatggataattattgctaaattcgtgctcttgc 14626149  T
Q  210 tctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  14626150 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 14626249  T
Q  310 ctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
       || ||||||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||    
T  14626250 tgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcat 14626348  T
Q  410 tgcttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||||    
T  14626349 tgcttgggtatgcata 14626364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 105 - 425
Target Start/End: Original strand, 1650022 - 1650339
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgct 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1650022 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgct 1650119  T
Q  205 cttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
    |||  | ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||| |    
T  1650120 cttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaa 1650219  T
Q  305 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 404  Q
    ||||||| || |||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  |||||||    
T  1650220 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatga 1650318  T
Q  405 ataattgcttgggtatgcata 425  Q
    || | ||||||||||||||||    
T  1650319 atcactgcttgggtatgcata 1650339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 16376196 - 16376461
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16376196 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 16376295  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  16376296 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 16376395  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16376396 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16376461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 16383520 - 16383785
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16383520 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 16383619  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  16383620 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 16383719  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16383720 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16383785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10489132 - 10488867
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  10489132 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 10489033  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  10489032 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 10488933  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  10488932 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 10488867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 22251389 - 22251621
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  22251389 agagaagaacaagagtgttgaatggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 22251488  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  22251489 atgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22251588  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatg 241  Q
     | ||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  22251589 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 22251621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16232297 - 16232060
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232297 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 16232198  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||    
T  16232197 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 16232098  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16232097 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16232060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 22225561 - 22225826
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  22225561 agagaagaacaagagtgttgaatggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 22225660  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||     
T  22225661 atgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttt 22225760  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22225761 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 22225826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19299670 - 19299471
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19299670 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggattcaatttgggcgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 19299571  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||    
T  19299570 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 19299471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 18086674 - 18086911
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18086674 agctttagaaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattagtataatcatg 18086773  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||    
T  18086774 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaat 18086873  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18086874 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18086911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 274
Target Start/End: Original strand, 16555973 - 16556227
Alignment:
Q  23 agagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttag 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555973 agagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttag 16556072  T
Q  121 ttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgtta 219  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||| || | ||||| ||    
T  16556073 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgcta 16556172  T
Q  220 tatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16556173 ttttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16556227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 274
Target Start/End: Original strand, 16632529 - 16632783
Alignment:
Q  23 agagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttag 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632529 agagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttag 16632628  T
Q  121 ttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgtta 219  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||| || | ||||| ||    
T  16632629 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgcta 16632728  T
Q  220 tatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16632729 ttttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16632783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 23153676 - 23153464
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| ||||||||    
T  23153676 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 23153577  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||     
T  23153576 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcatta 23153478  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||| ||||    
T  23153477 cttgggtatacata 23153464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Original strand, 29869627 - 29869800
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29869627 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttgatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 29869726  T
Q  137 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
     |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  29869727 ttaaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 29869800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1556385 - 1556173
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1556385 taggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 1556286  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  1556285 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1556186  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  1556185 gaaattacatgtt 1556173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19610398 - 19610186
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  19610398 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgtt 19610299  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||  |||| |||    
T  19610298 gtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggt 19610199  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  19610198 gaaattacatgtt 19610186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23978149 - 23977937
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  23978149 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 23978050  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  23978049 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 23977950  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  23977949 gaaattacatgtt 23977937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 425
Target Start/End: Original strand, 1657760 - 1657993
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||| ||||||   | ||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |    
T  1657760 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 1657859  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |  |||||||||| |||||||| || || || |||| | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||| ||||    
T  1657860 gtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttattgttgttaattga 1657957  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1657958 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcata 1657993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 16814820 - 16814930
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  16814820 agagaagagcaagaggtttgaagggaagctttagcaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 16814919  T
Q  111 agggggttagt 121  Q
    || ||||||||    
T  16814920 agagggttagt 16814930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 13620712 - 13620882
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  13620712 aaggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 13620811  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||| | ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  13620812 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtt 13620882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 29666208 - 29665941
Alignment:
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctct 206  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||  || ||||||| ||||||    
T  29666208 taagtgggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctct 29666109  T
Q  207 tgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt-cata-tatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
     | | ||||||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||  |||||||||| |    
T  29666108 agctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaa-a 29666010  T
Q  305 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgtt 374  Q
    |||| || || |||||||||| | ||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  29666009 ttgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15862700 - 15862549
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| | || ||  |||||||||| ||||||||    
T  15862700 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgct 15862601  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttca 365  Q
     || || || |||| | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  15862600 caattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttca 15862549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 35009451 - 35009586
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||| ||||||   | ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  35009451 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 35009550  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaattt 325  Q
    |  ||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  35009551 gtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt 35009586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4991470 - 4991396
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaagga-taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4991470 taggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27751675 - 27751603
Alignment:
Q  191 gctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 263  Q
    ||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751675 gctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19854402 - 19854317
Alignment:
Q  194 aaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 278  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||  | |||||| |||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  19854402 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 19854317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36523 - 36110
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  36523 agagaagagcaagagggttgaaggaaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggtaa 36424  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  36423 gggggttaatgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtag 36324  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 36224  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36223 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattg 36124  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||| ||||||    
T  36123 cttgggtttgcata 36110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 169736 - 169951
Alignment:
Q  16 aagaacaagagggttgaagg-gaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagg 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  169736 aagaacaagagagttgaaggcgaagcttgaggaatcaagtggggtgacataagagctgaattgaagcaagggttagtgataatcatcttcaaaagtaagg 169835  T
Q  114 gggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctg 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  169836 gggttagtgattatcataatcatgtataattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 169935  T
Q  214 atgttatatttgtatg 229  Q
    ||||||| ||||||||    
T  169936 atgttatgtttgtatg 169951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 48827 - 48615
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  48827 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 48728  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     |  |||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  48727 cagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcattg 48629  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  48628 cttgggtatgcata 48615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 153883 - 154095
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  153883 taggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 153982  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  153983 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 154082  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    ||| |||||||||    
T  154083 gaagttacatgtt 154095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Original strand, 13910846 - 13911260
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  13910846 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 13910945  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  13910946 gggggttattgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttg 13911045  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  13911046 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 13911145  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911146 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 13911245  T
Q  411 gcttgggtatgcata 425  Q
     ||||||| ||||||    
T  13911246 tcttgggtttgcata 13911260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 10989841 - 10989427
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggtt-gaagggaagctttaggaatcaagtg-ggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10989841 agagaagatcaagagtgttagaaggggagcttgaggaatcaagtgaggtgacataggagcttaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggt 10989742  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgt 209  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  10989741 atgggggttagtgattatcataatcatgtataattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgc 10989642  T
Q  210 tctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10989641 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtg 10989542  T
Q  310 ctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989541 ctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 10989443  T
Q  410 tgcttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||| ||||||    
T  10989442 tgcttgggtttgcata 10989427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2437889 - 2437474
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  2437889 agagaagaacaggagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 2437790  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2437789 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgt 2437690  T
Q  210 tctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2437689 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 2437590  T
Q  310 ctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
     | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437589 ttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 2437490  T
Q  410 tgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||| || ||||||    
T  2437489 tgcttgagtttgcata 2437474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 38 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13573079 - 13572693
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13573079 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 13572980  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13572979 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 13572881  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgt 337  Q
    |||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13572880 gatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 13572781  T
Q  338 tgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13572780 tgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcata 13572693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Original strand, 16478785 - 16479196
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16478785 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggta 16478884  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |    
T  16478885 agggggttagtgattatcataatcattt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctcttact 16478982  T
Q  211 ctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||    
T  16478983 gcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 16479082  T
Q  311 taaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
    | || |||||||||| |  |||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |    
T  16479083 tcaattggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcact 16479181  T
Q  411 gcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||||||||||    
T  16479182 gcttgggtatgcata 16479196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 105 - 425
Target Start/End: Original strand, 18253761 - 18254081
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||    
T  18253761 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 18253860  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaag 303  Q
    ||    | | ||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||     
T  18253861 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 18253960  T
Q  304 attgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 403  Q
    |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  18253961 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 18254059  T
Q  404 aataattgcttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||| || |||||||||    
T  18254060 aataattgcctgagtatgcata 18254081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7823161 - 7822896
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7823161 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 7823062  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  7823061 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 7822962  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  7822961 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 7822896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7830472 - 7830207
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7830472 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 7830373  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  7830372 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 7830273  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  7830272 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 7830207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27176866 - 27176601
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27176866 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27176767  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  27176766 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27176667  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27176666 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27176601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 27101460 - 27101725
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27101460 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27101559  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  27101560 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27101659  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27101660 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27101725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 27108808 - 27109073
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27108808 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27108907  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  27108908 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27109007  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27109008 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27109073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 38783552 - 38783817
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  38783552 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 38783651  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  38783652 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 38783751  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  38783752 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 38783817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 18979872 - 18980109
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18979872 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 18979971  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||    
T  18979972 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 18980071  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18980072 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18980109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15927973 - 15927736
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927973 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15927874  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15927873 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15927774  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15927773 tgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtt 15927736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 25292372 - 25292584
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  25292372 tgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgct 25292471  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25292472 caattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgactaatgaataattg 25292570  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||| ||||||    
T  25292571 cttgggtttgcata 25292584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 222 - 425
Target Start/End: Original strand, 11580783 - 11580985
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 321  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  11580783 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 11580882  T
Q  322 atttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 421  Q
    |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||     
T  11580883 attt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtata 11580981  T
Q  422 cata 425  Q
    ||||    
T  11580982 cata 11580985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 15950613 - 15950879
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||||||||    
T  15950613 agagaagaacaagggttttgaaggaaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttcaaagg 15950712  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  15950713 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 15950812  T
Q  208 gttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15950813 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15950879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 190 - 425
Target Start/End: Original strand, 47481043 - 47481277
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||| ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  47481043 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 47481142  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||| | || |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||   | ||| ||||    
T  47481143 gataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcgctcttaattga 47481241  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47481242 tgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcata 47481277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 13037048 - 13037260
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | | || ||||||||| |||| ||||||||    
T  13037048 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 13037147  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  13037148 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgatgaatcattg 13037246  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  13037247 cttgggtatgcata 13037260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 218 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3060189 - 3059983
Alignment:
Q  218 tatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtg 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| |||| || ||    
T  3060189 tatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatg 3060090  T
Q  318 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 417  Q
    |||||||| |  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  3060089 gtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttggg 3059991  T
Q  418 tatgcata 425  Q
    ||||||||    
T  3059990 tatgcata 3059983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16211995 - 16211783
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  16211995 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 16211896  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||| | ||||    
T  16211895 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgattcattg 16211797  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  16211796 cttgggtatgcata 16211783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 222 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36052883 - 36052684
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 321  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  36052883 tttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 36052784  T
Q  322 atttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 421  Q
    |||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  36052783 attt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatg 36052688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13758750 - 13758538
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13758750 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13758651  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  13758650 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 13758551  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  13758550 gaaattacatgtt 13758538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 15759990 - 15760202
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  15759990 taggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 15760089  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  |  |||  |||| |||    
T  15760090 gtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggt 15760189  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  15760190 gaaattacatgtt 15760202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15862257 - 15862174
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862257 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 14250811 - 14250986
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  14250811 cttctaaggtaagggggttagttatcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaatt 14250910  T
Q  199 catgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | |||||||||| | ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  14250911 cgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtt 14250986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 276
Target Start/End: Original strand, 48622584 - 48622756
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  48622584 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgc 48622683  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 276  Q
    ||||  | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  48622684 tcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttca 48622756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13321267 - 13321080
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaa 287  Q
    |||||||||| ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||| | ||    
T  13321267 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 13321168  T
Q  288 gtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttg-ttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttat 376  Q
     ||  |||||||||| |||||||| || |||||||||| | |||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  13321167 atgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 13321080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16418835 - 16418729
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  16418835 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 16418736  T
Q  204 tcttgtt 210  Q
    |||||||    
T  16418735 tcttgtt 16418729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 7293245 - 7293034
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||     
T  7293245 tgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 7293146  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    |||  | |||||||  |  | ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||    
T  7293145 aaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattg 7293048  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||| ||||    
T  7293047 cttgggtatacata 7293034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Original strand, 10000288 - 10000394
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||    
T  10000288 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaaattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgc 10000387  T
Q  204 tcttgtt 210  Q
    |||||||    
T  10000388 tcttgtt 10000394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11516456 - 11516358
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  11516456 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 11516358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 15441598 - 15441696
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  15441598 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 15441696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 30262163 - 30262261
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  30262163 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 30262261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 15516719 - 15516793
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15516719 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaatgtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Original strand, 13448827 - 13448912
Alignment:
Q  194 aaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 278  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||  | |||||| ||| || || ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13448827 aaattcatgctcttgttatcatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcata 13448912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30121153 - 30120739
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  30121153 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagtaagggttagagataatcatcttcaaaggtaa 30121054  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  30121053 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 30120954  T
Q  211 ctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30120953 gtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 30120854  T
Q  311 taaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120853 tcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 30120754  T
Q  411 gcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||| ||||||    
T  30120753 gcttgggtttgcata 30120739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Original strand, 21851786 - 21852200
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg--aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21851786 agagaagaacaagagtgttggagggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctagaagctgaagtggagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 21851885  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgt 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||     
T  21851886 aagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 21851984  T
Q  210 tctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  21851985 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtg 21852084  T
Q  310 ctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852085 ctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 21852184  T
Q  410 tgcttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||| ||||||    
T  21852185 tgcttgggtttgcata 21852200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Original strand, 21844393 - 21844807
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg--aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21844393 agagaagaacaagagtgttggagggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctagaagctgaagtggagctaggattaaggataatcaacttcaacggt 21844492  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgt 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||     
T  21844493 aagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 21844591  T
Q  210 tctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  21844592 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtg 21844691  T
Q  310 ctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844692 ctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 21844791  T
Q  410 tgcttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||| ||||||    
T  21844792 tgcttgggtttgcata 21844807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24549410 - 24548999
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24549410 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttctaaggta 24549311  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |    
T  24549310 agggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 24549213  T
Q  211 ctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || ||||    
T  24549212 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 24549113  T
Q  311 taaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
    | || |||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||    
T  24549112 tcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcatt 24549014  T
Q  411 gcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||||||||||    
T  24549013 gcttgggtatgcata 24548999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 41 - 425
Target Start/End: Original strand, 16674245 - 16674627
Alignment:
Q  41 tttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  || ||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  16674245 tttaggaatcaagtgggtgacttatgagctgaattgaagcaagagttgagt-taatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta- 16674342  T
Q  141 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgat 240  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  16674343 atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttat 16674442  T
Q  241 gttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgt 340  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16674443 gttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgt 16674542  T
Q  341 taatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    ||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  16674543 taagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgagtttgcata 16674627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Original strand, 6774082 - 6774492
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  6774082 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 6774180  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |    
T  6774181 agggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 6774278  T
Q  211 ctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||    
T  6774279 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 6774378  T
Q  311 taaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
    | || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |    
T  6774379 tcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcact 6774477  T
Q  411 gcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||||||||||    
T  6774478 gcttgggtatgcata 6774492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 252 - 425
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222926
Alignment:
Q  252 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  352 atgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 222926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 252 - 425
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736549
Alignment:
Q  252 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  352 atgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 736549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 252 - 425
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860444
Alignment:
Q  252 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  352 atgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 860444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 271183 - 271448
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  271183 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 271282  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  271283 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 271382  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  271383 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 271448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 644737 - 644472
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  644737 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 644638  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  644637 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 644538  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  644537 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 644472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 830472 - 830207
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  830472 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 830373  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  830372 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 830273  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  830272 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 830207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Original strand, 15318982 - 15319181
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15318982 agagaagaacaagagtgttgaaggaaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 15319081  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  15319082 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 15319181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Original strand, 15499351 - 15499550
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15499351 agagaagaacaagagtgttgaaggaaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 15499450  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  15499451 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 15499550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 22088617 - 22088882
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  22088617 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 22088716  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  22088717 aagggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22088816  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22088817 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtt 22088882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 222 - 425
Target Start/End: Original strand, 43373512 - 43373714
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 321  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  43373512 tttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 43373611  T
Q  322 atttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 421  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  43373612 attt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatg 43373710  T
Q  422 cata 425  Q
    ||||    
T  43373711 cata 43373714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 16193750 - 16193962
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  16193750 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 16193849  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | | || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  16193850 caattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 16193948  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  16193949 cttgggtatgcata 16193962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 13720804 - 13721016
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13720804 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13720903  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  13720904 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 13721003  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  13721004 gaaattacatgtt 13721016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 22006134 - 22006346
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22006134 taggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 22006233  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  22006234 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 22006333  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  22006334 gaaattacatgtt 22006346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 16872964 - 16873139
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  16872964 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 16873063  T
Q  199 catgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | |||||||||| | ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16873064 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16873139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 222 - 425
Target Start/End: Original strand, 24928835 - 24929037
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 321  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  24928835 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 24928934  T
Q  322 atttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 421  Q
    |||||  ||||||||| |||   ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24928935 atttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatg 24929033  T
Q  422 cata 425  Q
    ||||    
T  24929034 cata 24929037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 13662141 - 13662353
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13662141 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13662240  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||  ||| |  | ||||  |||| |||    
T  13662241 gtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggt 13662340  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  13662341 gaaattacatgtt 13662353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16195611 - 16195399
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||  || |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16195611 taggagttgaattgaagcaagagtttgggttaatcatcttctaaggtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 16195512  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| || | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  16195511 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 16195412  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  16195411 gaaattacatgtt 16195399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 423
Target Start/End: Original strand, 16405009 - 16405216
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||||| |||| ||||||||    
T  16405009 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgct 16405108  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||   |||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||    
T  16405109 caattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactg 16405204  T
Q  412 cttgggtatgca 423  Q
    ||||||||||||    
T  16405205 cttgggtatgca 16405216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17345798 - 17345587
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  17345798 tgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgct 17345699  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || || || |||| | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||  |||| ||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||    
T  17345698 caattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatattattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactg 17345601  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  17345600 cttgggtatgcata 17345587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 314
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691970
Alignment:
Q  252 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 22907248 - 22907459
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||     
T  22907248 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 22907347  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||    
T  22907348 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattg 22907445  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||| ||||    
T  22907446 cttgggtatacata 22907459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5238316 - 5238218
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  5238316 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 5238218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 24661282 - 24661380
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  24661282 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 24661380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43685775 - 43685677
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  43685775 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 43685677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Original strand, 31497 - 31911
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  31497 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaatgtaa 31596  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttc 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  31597 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtgg 31696  T
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 31796  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31797 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataatt 31896  T
Q  411 gcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||| ||||||    
T  31897 gcttgggtttgcata 31911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 128203 - 128414
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| |||||| |||| ||||||||    
T  128203 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaattgtgct 128302  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || ||| |||||| |  || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || |||||||||||||||||    
T  128303 caattggcgaattt-tgttaggttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatgaataattg 128400  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
     |||||||||||||    
T  128401 attgggtatgcata 128414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 10644648 - 10644236
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644648 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgatctaggagctgaagtgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggta 10644549  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |    
T  10644548 agggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 10644451  T
Q  211 ctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||  |||||||    
T  10644450 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 10644351  T
Q  311 taaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644350 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 10644251  T
Q  411 gcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||| ||||||    
T  10644250 gcttgggtttgcata 10644236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 63 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 47358030 - 47357675
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttg 162  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  47358030 taggagctgaattgaagcaagagttg-ggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttcctcatgttg 47357934  T
Q  163 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357933 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtg 47357834  T
Q  263 aaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47357833 aaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgt 47357734  T
Q  363 tcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47357733 tcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgattgggtatg 47357675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 222 - 425
Target Start/End: Original strand, 13048265 - 13048468
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 321  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| || || |||    
T  13048265 tttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatga 13048364  T
Q  322 atttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 421  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  13048365 atttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgggtttg 13048464  T
Q  422 cata 425  Q
    ||||    
T  13048465 cata 13048468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13246659 - 13246447
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| ||||||||    
T  13246659 tgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 13246560  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  13246559 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 13246461  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  13246460 cttgggtatgcata 13246447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 15287096 - 15287333
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15287096 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15287195  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15287196 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15287295  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15287296 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15287333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18169403 - 18169138
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||| || |||||  |||||| ||    
T  18169403 agagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaa-gg 18169305  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  18169304 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 18169205  T
Q  208 gttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18169204 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18169138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 190 - 425
Target Start/End: Original strand, 54118256 - 54118490
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  54118256 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaatt 54118355  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  54118356 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattga 54118454  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54118455 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcata 54118490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 15294205 - 15294442
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294205 agctttaggaatgaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15294304  T
Q  138 tgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15294305 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15294404  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15294405 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15294442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Original strand, 22351915 - 22352088
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22351915 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 22352014  T
Q  137 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
     |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22352015 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttgtt 22352088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 7131941 - 7132153
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  |  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  7131941 taggagctgaattgaagcaagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 7132040  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  7132041 atatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 7132140  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  7132141 gaaattacatgtt 7132153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20001103 - 20000891
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  20001103 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 20001004  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  20001003 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggt 20000904  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  20000903 gaaattacatgtt 20000891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 15675123 - 15675335
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||| |||| ||||||||    
T  15675123 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 15675222  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||    
T  15675223 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattg 15675321  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||| ||||    
T  15675322 cttgggtatacata 15675335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19020824 - 19020654
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19020824 aaggtaagggggttagttaccatcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 19020725  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19020724 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 19020654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31115858 - 31115646
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||  ||||| |||| ||| ||||    
T  31115858 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattatgct 31115759  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||    
T  31115758 caattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattg 31115660  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||| ||||    
T  31115659 cttgggtatacata 31115646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 17145570 - 17145745
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  17145570 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaatt 17145669  T
Q  199 catgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | |||||||  | ||||| ||| ||  | | |||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17145670 cgtgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17145745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18248556 - 18248421
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttg-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  18248556 aaggtaagggggttagttattatcataatcttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgc 18248457  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattga 239  Q
    ||||| | ||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  18248456 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 18248421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 374
Target Start/End: Original strand, 10104284 - 10104445
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||| |||| ||||||||    
T  10104284 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 10104383  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgtt 374  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  10104384 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 122118 - 121989
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  122118 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 122019  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 342  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  122018 caattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26339399 - 26339251
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  26339399 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 26339300  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  26339299 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 26339251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8378480 - 8378385
Alignment:
Q  114 gggttagttattatcataatcatgtgtaattttg-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  8378480 gggttagttattatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 8378385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22738568 - 22738437
Alignment:
Q  143 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| || ||||| | ||||| ||| ||  | ||||||||||||||     
T  22738568 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 22738469  T
Q  243 tagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22738468 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22738437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14952183 - 14952085
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14952183 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26680429 - 26680218
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||     
T  26680429 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 26680330  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||    
T  26680329 aaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattg 26680232  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||| ||||    
T  26680231 cttgggtatacata 26680218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 111492 - 111412
Alignment:
Q  345 ttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  111492 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcata 111412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9795564 - 9795490
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9795564 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaattttttcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 9795490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10488791 - 10488693
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  10488791 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 10488693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 16327960 - 16328058
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  16327960 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16328058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 374
Target Start/End: Original strand, 40885598 - 40885749
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtg 320  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||  |||||||||| ||| |||| || |||||    
T  40885598 tttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaa-attatgctcaattggtg 40885696  T
Q  321 aatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgtt 374  Q
    || || | ||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  40885697 aactt-tgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14996518 - 14996444
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996518 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttttaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 14996444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8378524 - 8378491
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgt 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8378524 aaggtaaggggattagttattatcataatcatgt 8378491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 38 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 55316622 - 55316236
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  55316622 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaaaggggttagttattatcacaatcatg 55316523  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  55316522 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 55316424  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgt 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  55316423 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 55316324  T
Q  338 tgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  55316323 tgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcata 55316236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 38 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 41270478 - 41270092
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41270478 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 41270379  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41270378 ta-atttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 41270280  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgt 337  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41270279 gatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 41270180  T
Q  338 tgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  41270179 tgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcata 41270092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 62 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16821517 - 16821156
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||   | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  16821517 ctaggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgtt 16821420  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||    
T  16821419 gtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggt 16821320  T
Q  262 gaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttg 361  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||    
T  16821319 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatg 16821220  T
Q  362 ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16821219 ttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcata 16821156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 105 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15615168 - 15614851
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgct 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  15615168 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgct 15615071  T
Q  205 cttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
    |||  | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  15615070 cttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaata 15614971  T
Q  305 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 404  Q
    | ||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||    
T  15614970 tggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 15614872  T
Q  405 ataattgcttgggtatgcata 425  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  15614871 atcattgcttgggtatgcata 15614851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 105 - 425
Target Start/End: Original strand, 15936553 - 15936873
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||    
T  15936553 aaggtatgggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 15936652  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaag 303  Q
    ||    | | ||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||     
T  15936653 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 15936752  T
Q  304 attgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 403  Q
    |||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  15936753 attgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 15936851  T
Q  404 aataattgcttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||| || |||||||||    
T  15936852 aataattgcctgagtatgcata 15936873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 105 - 425
Target Start/End: Original strand, 15938395 - 15938715
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | |||    
T  15938395 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgc 15938494  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaag 303  Q
    ||    | | ||| ||| ||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||     
T  15938495 tccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 15938594  T
Q  304 attgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 403  Q
    |||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  15938595 attgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 15938693  T
Q  404 aataattgcttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||| || |||||||||    
T  15938694 aataattgcctgagtatgcata 15938715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49232869 - 49232604
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  49232869 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctatgagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 49232770  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  49232769 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 49232670  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  49232669 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 49232604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 425
Target Start/End: Original strand, 14842446 - 14842807
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctca--tgt 160  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | | | ||||||  ||||||  |||    
T  14842446 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatct-tcactttgcaaattctcaaatgt 14842544  T
Q  161 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttgg 260  Q
    ||||||||  || | | ||| | ||||  |||||||||| |||||    | ||||| ||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  14842545 tgtatgaat-tgtgattatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttgg 14842643  T
Q  261 tgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattctt 360  Q
    ||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14842644 tgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattctt 14842742  T
Q  361 gttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14842743 gttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgattgggtttgcata 14842807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 12264614 - 12264880
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt--gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| | | ||  |  |||||| |||||||||    
T  12264614 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttggggtgacctaggagctgaattgaagcaaaggttgggattaatcatcttcaaagg 12264713  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  12264714 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 12264813  T
Q  208 gttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12264814 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12264880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 1467562 - 1467827
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  1467562 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 1467661  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  1467662 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 1467761  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  1467762 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 1467827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 223 - 425
Target Start/End: Original strand, 13975766 - 13975968
Alignment:
Q  223 ttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaa 322  Q
    |||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  13975766 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaa 13975865  T
Q  323 tttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgc 422  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  13975866 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgc 13975965  T
Q  423 ata 425  Q
    |||    
T  13975966 ata 13975968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 223 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 45861024 - 45860822
Alignment:
Q  223 ttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaa 322  Q
    |||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  45861024 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaa 45860925  T
Q  323 tttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgc 422  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  45860924 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgc 45860825  T
Q  423 ata 425  Q
    |||    
T  45860824 ata 45860822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 51158052 - 51158264
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  51158052 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 51158151  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  51158152 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 51158250  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  51158251 cttgggtatgcata 51158264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 15859058 - 15859270
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| |||| ||||||||    
T  15859058 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 15859157  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  15859158 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 15859256  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  15859257 cttgggtatgcata 15859270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12812274 - 12812075
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  12812274 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaactttaaaggt 12812175  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||    
T  12812174 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 12812075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 223 - 425
Target Start/End: Original strand, 13954934 - 13955136
Alignment:
Q  223 ttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaa 322  Q
    |||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | |||| |||| ||||||||| |||||||| || || ||||    
T  13954934 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaa 13955033  T
Q  323 tttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgc 422  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  13955034 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgc 13955133  T
Q  423 ata 425  Q
    |||    
T  13955134 ata 13955136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22275642 - 22275377
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |   |||||| |||||| |||||||||    
T  22275642 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaaaagttaaggttaatcatcttcaaagg 22275544  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  22275543 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 22275444  T
Q  208 gttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | | |||||  || ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22275443 gctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22275377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 12030181 - 12030393
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||    
T  12030181 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaagttgtgct 12030280  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  12030281 caattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatgaatcattg 12030379  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  12030380 cttgggtatgcata 12030393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 15468216 - 15468428
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| || |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  15468216 taggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgtt 15468315  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  15468316 gtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 15468415  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  15468416 gaaattacatgtt 15468428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18911373 - 18911161
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  18911373 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 18911274  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  18911273 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 18911174  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  18911173 gaaattacatgtt 18911161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25059119 - 25058907
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  25059119 taggagctgaattgaagcaaaaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgtt 25059020  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  25059019 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 25058920  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  25058919 gaaattacatgtt 25058907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13839123 - 13838911
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| ||||||||    
T  13839123 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 13839024  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  13839023 caattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 13838925  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
     |||||||||||||    
T  13838924 tttgggtatgcata 13838911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 222 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2050029 - 2049827
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 321  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| || |||| |||||||| || ||||||    
T  2050029 tttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtga 2049930  T
Q  322 atttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 421  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||    
T  2049929 attt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatg 2049831  T
Q  422 cata 425  Q
    ||||    
T  2049830 cata 2049827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 12902008 - 12902178
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||    
T  12902008 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgc 12902107  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| | ||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12902108 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12902178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Original strand, 18896920 - 18897099
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||    
T  18896920 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttccaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgtt 18897019  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  18897020 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 18897099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5228692 - 5228481
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||     
T  5228692 taggagctgaattgaaacaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtg 5228593  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
     ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| | ||||||||| |   | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  5228592 ttatgaaaatgggttgatgaac-attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 5228494  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  5228493 gaaattacatgtt 5228481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 17912516 - 17912727
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||     
T  17912516 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 17912615  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    ||| || |||||||    || ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||  ||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||    
T  17912616 aaattgatgaatttga--tatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactg 17912713  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  17912714 cttgggtatgcata 17912727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 54651795 - 54651625
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||    
T  54651795 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 54651696  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  54651695 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgtt 54651625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44229323 - 44229153
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  ||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||    
T  44229323 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaattttttcatttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgc 44229224  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| | ||||||||||||||    
T  44229223 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtt 44229153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 2449272 - 2449370
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  2449272 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 2449370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 8268609 - 8268683
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268609 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8268683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 8275709 - 8275783
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8275709 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8275783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 16744149 - 16744247
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||    
T  16744149 tgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16744247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 43427 - 43014
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43427 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgatctaggagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 43328  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgt 209  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||     
T  43327 agggggttagttactatcacaaacatgt--aattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 43230  T
Q  210 tctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    |  |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  43229 tgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtg 43130  T
Q  310 ctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43129 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 43030  T
Q  410 tgcttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||| ||||||    
T  43029 tgcttgggtttgcata 43014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39536 - 39271
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  39536 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 39437  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  39436 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 39337  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  39336 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 39271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 38 - 425
Target Start/End: Original strand, 5072237 - 5072623
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5072237 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaagattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 5072336  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5072337 ta-atttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaatt 5072435  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgt 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5072436 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 5072535  T
Q  338 tgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  5072536 tgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcata 5072623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 143 - 425
Target Start/End: Original strand, 18601071 - 18601353
Alignment:
Q  143 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgt 242  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18601071 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 18601170  T
Q  243 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18601171 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgtta 18601270  T
Q  343 atttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18601271 agttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcata 18601353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 66 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22228185 - 22227826
Alignment:
Q  66 gagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgta 164  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22228185 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22228086  T
Q  165 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  22228085 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22227986  T
Q  265 attacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttc 364  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||   || || ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22227985 attacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttc 22227887  T
Q  365 aaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22227886 aattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcata 22227826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 66 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22232882 - 22232523
Alignment:
Q  66 gagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgta 164  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22232882 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22232783  T
Q  165 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  22232782 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22232683  T
Q  265 attacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttc 364  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||   || || ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22232682 attacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttc 22232584  T
Q  365 aaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22232583 aattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcata 22232523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 105 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2116589 - 2116271
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgct 204  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2116589 aaggtaaaggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgct 2116492  T
Q  205 cttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
     ||  | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  2116491 tttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 2116392  T
Q  305 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttga-gttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 403  Q
    | ||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||    
T  2116391 tggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatg 2116293  T
Q  404 aataattgcttgggtatgcata 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  2116292 aatcattgcttgggtatgcata 2116271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 105 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45051757 - 45051489
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgct 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  45051757 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtg--attttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgtt 45051660  T
Q  205 cttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
    |||  | ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  45051659 cttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 45051560  T
Q  305 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttat 376  Q
    ||||||| || |||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051559 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17149001 - 17148735
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  17149001 agagaagaacaagagggttgaagggaaagcttgaggaatcaagtggggtgacataggagctgaattgaagcaagggttggggataatcaacttcaaaggt 17148902  T
Q  110 aaggggg-ttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctctt 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  17148901 aaggggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctctt 17148802  T
Q  208 gttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||| | ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17148801 gttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17148735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 18059581 - 18059846
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  18059581 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 18059680  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  18059681 aagggggttagttattatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 18059780  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  18059781 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 18059846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17005071 - 17004806
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  17005071 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 17004972  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  17004971 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 17004872  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  17004871 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 17004806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20931574 - 20931362
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20931574 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgct 20931475  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    ||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||||||||     
T  20931474 aaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattt 20931376  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  20931375 cttgggtatgcata 20931362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 38054914 - 38055179
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  38054914 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 38055013  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| |||| ||     
T  38055014 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctttta 38055113  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||||||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  38055114 ctgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 38055179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Original strand, 19962322 - 19962521
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19962322 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggattcaatttgggcgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 19962421  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||    
T  19962422 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 19962521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20913259 - 20913054
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20913259 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgct 20913160  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | | |||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  20913159 caattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaatt-------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatgaataattg 20913068  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  20913067 cttgggtatgcata 20913054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 20893660 - 20893872
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| ||||||||    
T  20893660 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 20893759  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  20893760 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 20893858  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
     |||||||||||||    
T  20893859 tttgggtatgcata 20893872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 46523731 - 46523557
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattc 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  46523731 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattc 46523632  T
Q  200 atgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||||||||| ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||  |  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  46523631 gtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtt 46523557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 190 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20445930 - 20445696
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | || |    
T  20445930 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaat 20445831  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||  |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  20445830 gataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattga 20445732  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20445731 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcata 20445696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 222 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20531663 - 20531461
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 321  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | || ||||||||  |||| |||||||| || ||||||    
T  20531663 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtga 20531564  T
Q  322 atttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 421  Q
    |||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  20531563 attt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatg 20531465  T
Q  422 cata 425  Q
    ||||    
T  20531464 cata 20531461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 425
Target Start/End: Original strand, 37844462 - 37844697
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | || |    
T  37844462 tgctaaattcatgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaat 37844561  T
Q  290 gataagtta-tgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 388  Q
    |||||  || |||| |||||||| || |  ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||    
T  37844562 gataaaatagtgaaaattgtgctcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattg 37844660  T
Q  389 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    || || || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37844661 atgttgtggttgatgagtcattgcttgggtatgcata 37844697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 41394451 - 41394239
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  41394451 tgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 41394352  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | ||    
T  41394351 caattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactg 41394253  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
     |||||||||||||    
T  41394252 attgggtatgcata 41394239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22035827 - 22035679
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||    
T  22035827 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgtt 22035728  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  22035727 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 22035679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 210
Target Start/End: Original strand, 7640810 - 7640958
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||    
T  7640810 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 7640909  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  7640910 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 7640958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 15861284 - 15861358
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15861284 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 51452721 - 51452623
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  51452721 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 51452623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Original strand, 20936 - 21350
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||| ||||||||||    
T  20936 agagaagaacaagagttttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggt 21035  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21036 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgt 21135  T
Q  210 tctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    | ||||||||| ||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  21136 tgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgag 21235  T
Q  310 ctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21236 ctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaataat 21334  T
Q  410 tgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||| || ||||||    
T  21335 tgcttgagtttgcata 21350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 425
Target Start/End: Original strand, 13882 - 14295
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||| ||||||||||    
T  13882 agagaagaacaagagttttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggt 13981  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||     
T  13982 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaa-tcgtgctcttgc 14080  T
Q  210 tctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    | ||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14081 tgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtg 14180  T
Q  310 ctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 409  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14181 ctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataat 14279  T
Q  410 tgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||| || ||||||    
T  14280 tgcttgagtttgcata 14295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 38 - 425
Target Start/End: Original strand, 64372 - 64763
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  64372 agcttaaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 64471  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  64472 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaatt 64570  T
Q  238 -----gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaa 332  Q
         |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  64571 atattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaa 64670  T
Q  333 gttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  64671 gttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcata 64763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 105 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 108084 - 107764
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||    
T  108084 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 107985  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaag 303  Q
    ||    | | ||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | ||     
T  107984 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaa 107885  T
Q  304 attgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 403  Q
    |||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  107884 attgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 107786  T
Q  404 aataattgcttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  107785 aataattgcttgggtttgcata 107764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 38 - 336
Target Start/End: Original strand, 1153 - 1450
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1153 agctttaggaatcaagttggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaggggggttagttattatcacaatcatg 1252  T
Q  138 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1253 ta-atttttgcatttactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 1351  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttg 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1352 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 63 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 411 - 52
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttg 162  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  |  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||||     
T  411 taggagctgaattgaagcgagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcaaaatcatgt--aattttgcattg-ctcatgtta 315  T
Q  163 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||    
T  314 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtg 215  T
Q  263 aaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgt 362  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  214 aaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgt 115  T
Q  363 tcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  114 tcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcata 52  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 346
Target Start/End: Original strand, 13171 - 13480
Alignment:
Q  34 gggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataat 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13171 gggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggaactgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataat 13270  T
Q  134 catgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatg 233  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||| ||||||||||||    
T  13271 catgt--aatttttcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatg 13368  T
Q  234 aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaag 333  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || ||||| || |||||||||| | |||||    
T  13369 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaag 13467  T
Q  334 ttgttgttaattt 346  Q
    || ||||||||||    
T  13468 ttattgttaattt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 63 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4102 - 3739
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  4102 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttctaaggtaaggggtttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 4003  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  4002 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 3903  T
Q  262 gaaattacatgttcatatatg-caaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattctt 360  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| | ||||||   || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3902 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattctt 3804  T
Q  361 gttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3803 gttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcata 3739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 63 - 418
Target Start/End: Original strand, 5088 - 5443
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||    
T  5088 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggagttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgtt 5187  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  5188 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 5287  T
Q  262 gaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttg 361  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| | || |||||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5288 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctgagttgttgttaatttgagatttgattcttg 5386  T
Q  362 ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggt 418  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  5387 ttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt 5443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 105 - 425
Target Start/End: Original strand, 9266 - 9583
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  9266 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 9363  T
Q  205 cttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
     ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  9364 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 9463  T
Q  305 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 404  Q
    | ||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||    
T  9464 tggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 9562  T
Q  405 ataattgcttgggtatgcata 425  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  9563 atcattgcttgggtatgcata 9583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 105 - 425
Target Start/End: Original strand, 16164 - 16481
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  16164 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 16261  T
Q  205 cttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
     ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  16262 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16361  T
Q  305 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 404  Q
    | ||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||    
T  16362 tggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 16460  T
Q  405 ataattgcttgggtatgcata 425  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  16461 atcattgcttgggtatgcata 16481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 63 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3341 - 2979
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttg 162  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3341 taggagctgaattgaagcaagagtttcggttaatcttcttctaaggtaagggggttaattattatcataattatgtacaattttgcattttctcatgttg 3242  T
Q  163 tatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  3241 tatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtg 3142  T
Q  263 aaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttg- 361  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||     
T  3141 aaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgt 3043  T
Q  362 ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    || || |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||| |||||||||    
T  3042 tttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcata 2979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 212 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 5758 - 5552
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  5758 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagtcatgaatattgtgct 5659  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5658 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattg 5559  T
Q  412 cttgggt 418  Q
    |||||||    
T  5558 cttgggt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29558 - 29396
Alignment:
Q  47 aatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  29558 aatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctt 29459  T
Q  146 tgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  29458 tgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 29396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 29627 - 29565
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaa 73  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29627 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaa 29565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 3616 - 3828
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  3616 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 3715  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| |||||||||    
T  3716 caattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgaggaataattg 3814  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  3815 cttgggtatgcata 3828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1353 - 1141
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  1353 tgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 1254  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  1253 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatgaataattg 1155  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||| ||||||    
T  1154 cttgggtgtgcata 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31742 - 31477
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  31742 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 31643  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  31642 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 31543  T
Q  209 ttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     | ||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  31542 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 31477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39814
Alignment:
Q  153 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtata 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||  ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  253 attgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgtt 39814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 190 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9129 - 8895
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||| |||||   || ||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  9129 tgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 9030  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    | |||||| |||| |||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  9029 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattga 8931  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8930 tgttgtgattgatgaataattgcttgggtatgcata 8895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 222 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 48406 - 48204
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 321  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  48406 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 48307  T
Q  322 atttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 421  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  48306 attt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatg 48208  T
Q  422 cata 425  Q
    ||||    
T  48207 cata 48204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12449 - 12132
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcat-tttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |  ||||  ||| ||||||||| |  | | ||| | ||||  |||||||||| |||    
T  12449 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatct-taattttgtaactttcaaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtgc 12351  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaag 303  Q
    |||   | ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||| ||||||||| ||||     
T  12350 tctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 12251  T
Q  304 attgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 403  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||  | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  12250 attgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatg 12154  T
Q  404 aataattgcttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12153 aataattgcttgggtatgcata 12132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 6098 - 6309
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| | || ||||||||    
T  6098 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaaattgtgct 6197  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  6198 gaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatgaataattg 6295  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  6296 cttgggtatgcata 6309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 990 - 1201
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||| ||||||||    
T  990 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgct 1089  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || || ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  1090 caattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattg 1187  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  1188 cttgggtatgcata 1201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 190 - 425
Target Start/End: Original strand, 123176 - 123410
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  123176 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 123275  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  123276 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 123374  T
Q  390 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    | || || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  123375 tgttgtggttgatgaataatggcttgggtatgcata 123410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 212 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 148950 - 148742
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  148950 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 148851  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || || ||||||||| ||||    
T  148850 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattg 148752  T
Q  412 cttgggtatg 421  Q
    ||||||||||    
T  148751 cttgggtatg 148742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9078 - 8866
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||| |||| ||||||||    
T  9078 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 8979  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||  ||||||| |||||||||   | ||| ||||| || |  ||||||||| ||||    
T  8978 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgttgatgaatcattg 8880  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||| ||||    
T  8879 cttgggtatacata 8866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 216
Target Start/End: Original strand, 10624 - 10778
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10624 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 10723  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||    
T  10724 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19435 - 19223
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  19435 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 19336  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||    
T  19335 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattg 19237  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  19236 cttgggtatgcata 19223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 21519 - 21307
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  21519 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 21420  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||    
T  21419 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattg 21321  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  21320 cttgggtatgcata 21307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Original strand, 7278 - 7509
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||| || |||||  |||||||||    
T  7278 agagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaagg 7377  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||    
T  7378 taagggggttagttattatcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctctt 7477  T
Q  208 gttctgatgttatatttgtatgcatgaattga 239  Q
    ||| ||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  7478 gttgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 7509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 222 - 425
Target Start/End: Original strand, 5105 - 5307
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 321  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  5105 tttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 5204  T
Q  322 atttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 421  Q
    |||| | | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5205 attt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatg 5303  T
Q  422 cata 425  Q
    ||||    
T  5304 cata 5307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 26449 - 26661
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||    
T  26449 tgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgttct 26548  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||    
T  26549 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattg 26647  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  26648 cttgggtatgcata 26661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 8192 - 8327
Alignment:
Q  190 tgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||| ||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||| |    
T  8192 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaat 8291  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaattt 325  Q
    |  ||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  8292 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 36947 - 37159
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  36947 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 37046  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  37047 aaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 37145  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  37146 cttgggtatgcata 37159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 1390 - 1602
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  || ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1390 taggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 1489  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  1490 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggt 1589  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  1590 gaaattacatgtt 1602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 222 - 425
Target Start/End: Original strand, 247486 - 247688
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 321  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | | || ||||||||| |||| |||||||| || |||| |    
T  247486 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaa 247585  T
Q  322 atttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 421  Q
    |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||    
T  247586 attt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatg 247684  T
Q  422 cata 425  Q
    ||||    
T  247685 cata 247688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 34076 - 34246
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatg 202  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||    
T  34076 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtg 34174  T
Q  203 ctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||| | ||| | ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  34175 ctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 34246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7002 - 6829
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7002 agctttacgaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 6903  T
Q  137 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgtt 210  Q
     |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  6902 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 6829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 172134 - 171922
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| ||||||||    
T  172134 tgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 172035  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  172034 aaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 171936  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||| ||||||||||    
T  171935 cttaggtatgcata 171922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 177837 - 177625
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| ||||||||    
T  177837 tgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 177738  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  177737 aaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 177639  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||| ||||||||||    
T  177638 cttaggtatgcata 177625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 1451 - 1663
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1451 taggagctgaattgaagcaagggtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 1550  T
Q  162 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  1551 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1650  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  1651 gaaattacatgtt 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2826 - 2560
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||||    
T  2826 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagg 2728  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaa--ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  2727 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctct 2628  T
Q  207 tgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||   ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  2627 tgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 222 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 272244 - 272042
Alignment:
Q  222 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 321  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  272244 tttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtga 272145  T
Q  322 atttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 421  Q
    |||| | ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||    
T  272144 attt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatg 272046  T
Q  422 cata 425  Q
    ||||    
T  272045 cata 272042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Original strand, 568 - 780
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |||| |||| |||| ||||| ||    
T  568 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtact 667  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | |||||||  |||||  || |||||||||||||||| || ||||||||||  || || ||||| || || ||||||||| ||||    
T  668 caattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattg 766  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
    ||||||||||||||    
T  767 cttgggtatgcata 780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 212 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 41958 - 41746
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||||||||    
T  41958 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaaattgtgct 41859  T
Q  312 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 411  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| | || |   |||||||| ||||    
T  41858 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatgaatcattg 41760  T
Q  412 cttgggtatgcata 425  Q
     |||||||||||||    
T  41759 gttgggtatgcata 41746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 23600 - 23769
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23600 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggaactgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagttaagggggttagttattatcatattcaat 23699  T
Q  137 gtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctct 206  Q
     |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  23700 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctct 23769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 131006 - 130880
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  131006 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggcataatcatcttcaaaggt 130907  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||    
T  130906 aagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Original strand, 89488 - 89600
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || | ||||||| |||| ||||||||    
T  89488 tgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtgaaaattgtgct 89587  T
Q  312 aaagtggtgaatt 324  Q
     || |||||||||    
T  89588 caattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 45369 - 45198
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatg 202  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||    
T  45369 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 45270  T
Q  203 ctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | |||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45269 cccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 54755 - 54584
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatg 202  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||    
T  54755 aaggtaaggtggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 54656  T
Q  203 ctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
      |||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  54655 tccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtt 54584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 425
Target Start/End: Original strand, 34374 - 34707
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattcatg 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | ||||  ||    
T  34374 aaggtaagagggttagttattatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaatgaatggataattattg 34473  T
Q  192 ctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtga 291  Q
    |||||||| ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||| |      
T  34474 ctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaatat 34573  T
Q  292 taagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgat 390  Q
     ||||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| || || || |||||||||   |||||||||||    
T  34574 gaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgat 34672  T
Q  391 attatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
     || |  ||||||||| | | ||||||||||||||    
T  34673 gttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcata 34707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 10257 - 10427
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||    
T  10257 aaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 10356  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| | ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10357 tcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 336 - 425
Target Start/End: Original strand, 9 - 98
Alignment:
Q  336 gttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcata 98  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Original strand, 51216 - 51328
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  51216 tgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 51315  T
Q  312 aaagtggtgaatt 324  Q
     || |||||||||    
T  51316 caattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 54212 - 54040
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  54212 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgc 54113  T
Q  204 tcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 276  Q
    ||||  | ||||| | | ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  54112 tcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttca 54040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3712 - 3579
Alignment:
Q  143 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgt 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  | ||||||| | ||  | | ||||||||||||     
T  3712 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatga 3613  T
Q  243 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 276  Q
    |  | |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3612 ttatggtatgattgtgggtgaaattacatgttca 3579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 336 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48531
Alignment:
Q  336 gttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcata 48531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13855 - 13622
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttg----------atgaacaattcatg 191  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| || || ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||          ||| | ||||  ||    
T  13855 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgtttatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttg 13756  T
Q  192 ctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtga 291  Q
    |||||||| ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||     
T  13755 ctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgt 13656  T
Q  292 taagttatgaagattgtgctaaagtggtgaattt 325  Q
     ||||| |||| |||||||| || || |||||||    
T  13655 gaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 13622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 42709 - 42677
Alignment:
Q  104 aaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42709 aaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7547 - 7441
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  7547 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 7448  T
Q  204 tcttgtt 210  Q
    |||||||    
T  7447 tcttgtt 7441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 12045 - 12149
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  12045 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaatttttcattt-ctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtg 12143  T
Q  203 ctcttg 208  Q
    ||||||    
T  12144 ctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41877 - 41764
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||| |||| |||||| |    
T  41877 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgtt 41778  T
Q  312 aaagtggtgaattt 325  Q
     || ||||||||||    
T  41777 caattggtgaattt 41764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Original strand, 154282 - 154373
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  154282 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatca 154373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9479 - 9399
Alignment:
Q  345 ttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcata 425  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9479 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcata 9399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Original strand, 13268 - 13342
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13268 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 13342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 17115 - 17241
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| | |||| |||||    
T  17115 agagaagcacaggagtgttgaaaggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataataatcttctaaggt 17214  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||    
T  17215 aagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3447 - 3360
Alignment:
Q  184 aattcatgctaaattcatgctcttgttctgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 271  Q
    |||| ||||||||||| |||||| | | ||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3447 aattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22769 - 22671
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  22769 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 22671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27024 - 26926
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  27024 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 26926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 1616 - 1714
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  1616 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 1714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 37100 - 37198
Alignment:
Q  212 tgatgttatatttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||    
T  37100 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 37198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5882 times since January 2019
Visitors: 4860