View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0755_low_6 (Length: 541)

Name: NF0755_low_6
Description: NF0755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0755_low_6
NF0755_low_6
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (32-521)||(10055-10544)
[»] chr2 (146 HSPs)
chr2 (32-521)||(20309108-20309597)
chr2 (32-521)||(37745-38235)
chr2 (33-521)||(23285865-23286352)
chr2 (32-518)||(298433-298933)
chr2 (32-521)||(23654028-23654507)
chr2 (33-521)||(22737799-22738300)
chr2 (33-521)||(22730852-22731355)
chr2 (35-521)||(23076442-23076940)
chr2 (32-521)||(23660023-23660525)
chr2 (33-521)||(22337115-22337617)
chr2 (32-371)||(27753728-27754078)
chr2 (47-504)||(32451562-32452033)
chr2 (220-521)||(23060513-23060815)
chr2 (32-139)||(28291920-28292027)
chr2 (404-521)||(23103399-23103516)
chr2 (45-145)||(22133848-22133948)
chr2 (65-210)||(23071614-23071768)
chr2 (169-502)||(23708383-23708721)
chr2 (46-150)||(25176227-25176331)
chr2 (372-518)||(22105412-22105560)
chr2 (425-521)||(23071972-23072070)
chr2 (317-517)||(40622123-40622327)
chr2 (405-517)||(7679589-7679702)
chr2 (404-505)||(7735-7838)
chr2 (445-521)||(8946657-8946732)
chr2 (78-146)||(28406368-28406436)
chr2 (425-521)||(19671830-19671928)
chr2 (372-518)||(26505379-26505526)
chr2 (372-518)||(26507857-26508004)
chr2 (449-516)||(28405981-28406048)
chr2 (448-505)||(23207293-23207350)
chr2 (372-515)||(21155075-21155219)
chr2 (457-521)||(23040247-23040310)
chr2 (449-517)||(25175854-25175922)
chr2 (358-520)||(32214921-32215085)
chr2 (372-518)||(18808943-18809090)
chr2 (449-520)||(22134256-22134326)
chr2 (32-99)||(23100849-23100916)
chr2 (372-518)||(23130862-23131009)
chr2 (372-518)||(23133329-23133476)
chr2 (372-518)||(23135590-23135737)
chr2 (372-518)||(23709547-23709694)
chr2 (372-518)||(23712028-23712175)
chr2 (372-518)||(34402537-34402684)
chr2 (372-518)||(39682313-39682460)
chr2 (56-210)||(22460844-22460999)
chr2 (423-518)||(571397-571493)
chr2 (423-518)||(6725995-6726091)
chr2 (450-505)||(20520243-20520298)
chr2 (372-502)||(24367790-24367921)
chr2 (372-518)||(45029869-45030016)
chr2 (31-145)||(24503473-24503587)
chr2 (423-516)||(43137301-43137395)
chr2 (449-502)||(18786952-18787005)
chr2 (448-505)||(22413186-22413243)
chr2 (56-117)||(24658055-24658116)
chr2 (56-210)||(19928156-19928311)
chr2 (372-518)||(24898210-24898358)
chr2 (372-518)||(24900693-24900841)
chr2 (372-518)||(24903170-24903318)
chr2 (372-518)||(24905647-24905795)
chr2 (372-518)||(24908122-24908270)
chr2 (55-147)||(25963359-25963451)
chr2 (166-209)||(22133977-22134020)
chr2 (450-505)||(23004764-23004819)
chr2 (450-505)||(25108903-25108958)
chr2 (372-518)||(32039513-32039660)
chr2 (32-118)||(22811553-22811639)
chr2 (468-518)||(28577099-28577149)
chr2 (468-518)||(38967374-38967424)
chr2 (32-117)||(22740579-22740664)
chr2 (32-117)||(22758334-22758419)
chr2 (56-149)||(27263610-27263703)
chr2 (450-506)||(23287378-23287433)
chr2 (47-123)||(23708252-23708328)
chr2 (423-518)||(24529595-24529691)
chr2 (459-515)||(24643054-24643109)
chr2 (33-144)||(12829434-12829545)
chr2 (55-118)||(21917958-21918021)
chr2 (450-505)||(23791289-23791344)
chr2 (451-506)||(26392397-26392451)
chr2 (55-118)||(37525078-37525141)
chr2 (31-210)||(15477901-15478081)
chr2 (34-144)||(21138903-21139013)
chr2 (56-118)||(22798769-22798831)
chr2 (169-207)||(28406297-28406335)
chr2 (77-123)||(39827602-39827648)
chr2 (402-494)||(22799126-22799220)
chr2 (47-210)||(24716175-24716339)
chr2 (168-209)||(25176158-25176199)
chr2 (402-502)||(25616204-25616306)
chr2 (77-145)||(23207744-23207812)
chr2 (60-96)||(24654996-24655032)
chr2 (174-210)||(31756232-31756268)
chr2 (48-92)||(40428892-40428936)
chr2 (56-96)||(45677798-45677838)
chr2 (175-210)||(21918089-21918124)
chr2 (159-210)||(22740717-22740768)
chr2 (175-210)||(22798899-22798934)
chr2 (86-133)||(23171413-23171460)
chr2 (86-133)||(23582670-23582717)
chr2 (175-210)||(24175108-24175143)
chr2 (175-210)||(24655112-24655147)
chr2 (450-505)||(24697657-24697712)
chr2 (175-210)||(25961308-25961343)
chr2 (159-210)||(25963474-25963525)
chr2 (175-210)||(37524975-37525010)
chr2 (175-210)||(40621981-40622016)
chr2 (32-99)||(44369918-44369985)
chr2 (77-147)||(22412722-22412792)
chr2 (77-119)||(23005221-23005263)
chr2 (402-448)||(23019706-23019752)
chr2 (49-99)||(23038468-23038518)
chr2 (172-210)||(23791591-23791629)
chr2 (56-149)||(26125562-26125655)
chr2 (91-145)||(27197248-27197302)
chr2 (77-119)||(34137412-34137454)
chr2 (31-144)||(21146918-21147031)
chr2 (174-211)||(21238877-21238914)
chr2 (174-211)||(21241427-21241464)
chr2 (170-211)||(22412900-22412941)
chr2 (177-210)||(23101005-23101038)
chr2 (56-210)||(23187372-23187527)
chr2 (170-211)||(23207593-23207634)
chr2 (56-210)||(23598635-23598790)
chr2 (174-211)||(24505015-24505052)
chr2 (177-210)||(24673887-24673920)
chr2 (31-132)||(30970608-30970709)
chr2 (174-211)||(31503912-31503949)
chr2 (174-211)||(31506478-31506515)
chr2 (56-93)||(40621851-40621888)
chr2 (68-116)||(7330-7378)
chr2 (170-210)||(18786667-18786707)
chr2 (171-211)||(22459327-22459367)
chr2 (440-500)||(23038048-23038107)
chr2 (60-92)||(24175227-24175259)
chr2 (56-96)||(24674012-24674052)
chr2 (60-92)||(24870307-24870339)
chr2 (175-207)||(26125503-26125535)
chr2 (45-133)||(29233904-29233992)
chr2 (45-133)||(29347203-29347291)
chr2 (83-131)||(37318652-37318700)
chr2 (175-207)||(41667249-41667281)
chr2 (56-92)||(41667365-41667401)
chr2 (174-210)||(41684531-41684567)
chr2 (174-210)||(44621242-44621278)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (35-521)||(32067-32553)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (32-521)||(681-1170)
[»] chr7 (196 HSPs)
chr7 (32-519)||(40443393-40443880)
chr7 (32-521)||(27847462-27847951)
chr7 (32-521)||(16385876-16386369)
chr7 (32-521)||(9509189-9509692)
chr7 (32-521)||(12698831-12699335)
chr7 (32-521)||(26211995-26212488)
chr7 (33-521)||(38227481-38227982)
chr7 (32-518)||(3563982-3564482)
chr7 (176-521)||(10589039-10589386)
chr7 (32-502)||(15143654-15144139)
chr7 (47-518)||(17061593-17062077)
chr7 (32-210)||(2831924-2832110)
chr7 (309-518)||(18456319-18456530)
chr7 (32-210)||(9751168-9751355)
chr7 (32-210)||(28504919-28505106)
chr7 (32-206)||(39267264-39267447)
chr7 (47-214)||(44116816-44116992)
chr7 (47-211)||(12756350-12756523)
chr7 (32-210)||(18302494-18302681)
chr7 (32-149)||(15754505-15754622)
chr7 (32-210)||(34201099-34201286)
chr7 (45-149)||(44014560-44014664)
chr7 (45-149)||(810760-810864)
chr7 (32-124)||(11995676-11995768)
chr7 (45-210)||(68061-68236)
chr7 (425-521)||(16495402-16495500)
chr7 (425-521)||(28505321-28505419)
chr7 (425-521)||(34200786-34200884)
chr7 (372-521)||(13647325-13647476)
chr7 (45-124)||(18006052-18006131)
chr7 (352-518)||(16213684-16213852)
chr7 (317-517)||(17137978-17138177)
chr7 (449-521)||(67745-67817)
chr7 (46-150)||(47832193-47832297)
chr7 (426-521)||(11996051-11996148)
chr7 (402-521)||(16219717-16219835)
chr7 (46-150)||(16324391-16324495)
chr7 (317-517)||(12187019-12187218)
chr7 (404-518)||(48273392-48273508)
chr7 (372-518)||(24704688-24704832)
chr7 (449-517)||(811180-811248)
chr7 (449-517)||(18005650-18005718)
chr7 (449-517)||(44014182-44014250)
chr7 (449-521)||(47831807-47831879)
chr7 (425-521)||(15754910-15755008)
chr7 (32-99)||(19649103-19649170)
chr7 (372-518)||(24702238-24702385)
chr7 (372-521)||(18430709-18430859)
chr7 (32-150)||(21064780-21064898)
chr7 (404-502)||(2280121-2280221)
chr7 (46-150)||(16219348-16219452)
chr7 (423-518)||(44116509-44116605)
chr7 (372-518)||(456321-456468)
chr7 (47-118)||(2760542-2760613)
chr7 (47-118)||(3272202-3272273)
chr7 (372-518)||(11972496-11972643)
chr7 (372-518)||(14949137-14949284)
chr7 (372-518)||(15376728-15376875)
chr7 (404-502)||(16056347-16056446)
chr7 (372-518)||(16232520-16232667)
chr7 (372-518)||(18640272-18640419)
chr7 (372-518)||(20385138-20385285)
chr7 (372-518)||(21189610-21189757)
chr7 (372-502)||(24275187-24275318)
chr7 (372-518)||(32125491-32125638)
chr7 (372-518)||(41522917-41523064)
chr7 (372-518)||(41525379-41525526)
chr7 (403-468)||(2530139-2530205)
chr7 (56-150)||(9389337-9389431)
chr7 (372-517)||(11393302-11393448)
chr7 (31-145)||(44407988-44408102)
chr7 (77-211)||(12255454-12255598)
chr7 (75-218)||(22073223-22073376)
chr7 (32-117)||(24054884-24054969)
chr7 (423-518)||(16410059-16410155)
chr7 (453-521)||(22072913-22072981)
chr7 (425-521)||(10063841-10063939)
chr7 (372-518)||(27216860-27217007)
chr7 (68-146)||(2279772-2279850)
chr7 (31-145)||(14953560-14953674)
chr7 (31-145)||(26420340-26420454)
chr7 (445-502)||(12901342-12901399)
chr7 (56-210)||(13149451-13149606)
chr7 (46-99)||(18154469-18154522)
chr7 (423-518)||(13869346-13869442)
chr7 (450-502)||(14044765-14044817)
chr7 (450-502)||(14354795-14354847)
chr7 (169-237)||(16056616-16056684)
chr7 (459-518)||(3386333-3386391)
chr7 (425-521)||(19486767-19486865)
chr7 (450-505)||(20220238-20220293)
chr7 (169-211)||(810894-810936)
chr7 (448-502)||(1868043-1868097)
chr7 (445-499)||(12255838-12255892)
chr7 (31-145)||(14959526-14959640)
chr7 (56-118)||(17137706-17137768)
chr7 (440-502)||(18154882-18154943)
chr7 (468-518)||(20110556-20110606)
chr7 (56-210)||(6801509-6801664)
chr7 (56-117)||(10508725-10508786)
chr7 (56-117)||(11880668-11880729)
chr7 (56-117)||(12187429-12187490)
chr7 (426-518)||(13831373-13831466)
chr7 (448-505)||(15008547-15008604)
chr7 (56-210)||(26292692-26292847)
chr7 (448-505)||(48991196-48991253)
chr7 (68-119)||(2529631-2529682)
chr7 (171-210)||(9389462-9389501)
chr7 (171-210)||(11995796-11995835)
chr7 (450-493)||(14036282-14036325)
chr7 (450-493)||(14346312-14346355)
chr7 (58-117)||(15211844-15211903)
chr7 (159-210)||(16438792-16438843)
chr7 (159-210)||(17137820-17137871)
chr7 (31-145)||(14148932-14149046)
chr7 (68-150)||(16056713-16056795)
chr7 (62-144)||(20702651-20702733)
chr7 (62-144)||(32768038-32768120)
chr7 (31-144)||(4318174-4318287)
chr7 (32-145)||(11262691-11262804)
chr7 (88-145)||(11547953-11548010)
chr7 (88-145)||(11554549-11554606)
chr7 (78-147)||(14045212-14045281)
chr7 (78-147)||(14355242-14355311)
chr7 (55-96)||(14430315-14430356)
chr7 (55-92)||(42205530-42205567)
chr7 (169-210)||(44014489-44014530)
chr7 (32-104)||(4993917-4993989)
chr7 (56-92)||(8917842-8917878)
chr7 (56-96)||(9703703-9703743)
chr7 (56-92)||(13462177-13462213)
chr7 (56-92)||(15581108-15581144)
chr7 (56-92)||(15604926-15604962)
chr7 (175-210)||(9445932-9445967)
chr7 (56-210)||(9593642-9593797)
chr7 (56-210)||(9644605-9644760)
chr7 (175-210)||(9703578-9703613)
chr7 (175-210)||(10508855-10508890)
chr7 (86-133)||(11238655-11238702)
chr7 (159-210)||(12187325-12187376)
chr7 (175-210)||(12321515-12321550)
chr7 (86-145)||(12692858-12692917)
chr7 (88-147)||(12901793-12901852)
chr7 (175-210)||(14430190-14430225)
chr7 (415-517)||(14932747-14932851)
chr7 (415-517)||(15356182-15356286)
chr7 (415-517)||(15360296-15360400)
chr7 (175-210)||(15580988-15581023)
chr7 (172-211)||(16219484-16219523)
chr7 (163-210)||(16724393-16724440)
chr7 (163-210)||(17701407-17701454)
chr7 (175-210)||(18154609-18154644)
chr7 (175-210)||(18557268-18557303)
chr7 (175-210)||(20569370-20569405)
chr7 (175-210)||(48593230-48593265)
chr7 (77-143)||(9177252-9177318)
chr7 (452-506)||(9177718-9177772)
chr7 (77-119)||(11768526-11768568)
chr7 (56-118)||(12321385-12321447)
chr7 (173-211)||(15113258-15113296)
chr7 (56-149)||(16275850-16275943)
chr7 (169-211)||(21064927-21064969)
chr7 (87-145)||(25038895-25038953)
chr7 (32-150)||(35366609-35366727)
chr7 (468-502)||(38898489-38898523)
chr7 (56-210)||(18712-18867)
chr7 (75-144)||(70438-70507)
chr7 (75-144)||(74546-74615)
chr7 (78-147)||(1867650-1867719)
chr7 (31-132)||(6016800-6016901)
chr7 (46-83)||(14194729-14194766)
chr7 (68-133)||(14655082-14655147)
chr7 (77-118)||(15008107-15008148)
chr7 (170-211)||(15008263-15008304)
chr7 (174-211)||(16006731-16006768)
chr7 (87-144)||(18531608-18531665)
chr7 (468-517)||(19649557-19649606)
chr7 (174-211)||(21743056-21743093)
chr7 (172-209)||(47832125-47832162)
chr7 (56-92)||(11044-11080)
chr7 (174-210)||(123961-123997)
chr7 (468-520)||(2832509-2832561)
chr7 (174-210)||(4993801-4993837)
chr7 (56-92)||(11313064-11313100)
chr7 (56-92)||(11987628-11987664)
chr7 (56-92)||(12318543-12318579)
chr7 (174-210)||(13395233-13395269)
chr7 (56-92)||(13635123-13635159)
chr7 (171-211)||(15116795-15116835)
chr7 (56-92)||(15728740-15728776)
chr7 (56-92)||(16583650-16583686)
chr7 (56-92)||(16724285-16724321)
chr7 (56-92)||(17701299-17701335)
chr7 (169-209)||(18005963-18006003)
chr7 (56-92)||(35152021-35152057)
chr7 (174-210)||(48785628-48785664)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (32-521)||(15094-15584)
scaffold0114 (353-517)||(7295-7459)
scaffold0114 (32-106)||(32894-32968)
scaffold0114 (56-117)||(7705-7766)
[»] chr8 (170 HSPs)
chr8 (32-521)||(31971257-31971747)
chr8 (32-521)||(16199276-16199765)
chr8 (32-521)||(21918628-21919121)
chr8 (32-521)||(45130649-45131117)
chr8 (32-521)||(18878855-18879352)
chr8 (32-521)||(20536208-20536711)
chr8 (32-521)||(18818028-18818530)
chr8 (32-521)||(22626736-22627238)
chr8 (32-521)||(21923546-21924049)
chr8 (32-521)||(23406379-23406884)
chr8 (33-520)||(28648663-28649164)
chr8 (33-524)||(6759255-6759759)
chr8 (56-385)||(25362793-25363123)
chr8 (33-520)||(23648554-23649055)
chr8 (32-521)||(16091959-16092463)
chr8 (32-521)||(22875065-22875568)
chr8 (47-521)||(7372778-7373237)
chr8 (308-521)||(21389358-21389571)
chr8 (308-521)||(21395888-21396101)
chr8 (308-521)||(21790381-21790594)
chr8 (321-521)||(21778697-21778897)
chr8 (32-518)||(41598188-41598687)
chr8 (32-210)||(5865895-5866082)
chr8 (32-210)||(17141229-17141416)
chr8 (32-211)||(19801045-19801234)
chr8 (32-210)||(21249697-21249884)
chr8 (32-149)||(21255605-21255722)
chr8 (32-145)||(21491382-21491495)
chr8 (45-149)||(21674091-21674195)
chr8 (425-521)||(5866297-5866395)
chr8 (425-521)||(17140916-17141014)
chr8 (45-149)||(26355329-26355433)
chr8 (426-521)||(21490995-21491092)
chr8 (405-521)||(6520368-6520486)
chr8 (46-150)||(38854883-38854987)
chr8 (449-521)||(38855300-38855372)
chr8 (449-521)||(23760893-23760962)
chr8 (32-117)||(21389071-21389156)
chr8 (404-502)||(21285616-21285716)
chr8 (425-521)||(21249384-21249483)
chr8 (425-521)||(21255222-21255321)
chr8 (372-518)||(14409459-14409606)
chr8 (55-150)||(23760481-23760576)
chr8 (46-124)||(6520779-6520857)
chr8 (358-502)||(16413316-16413462)
chr8 (449-502)||(983455-983508)
chr8 (425-514)||(13508108-13508199)
chr8 (423-518)||(20046261-20046357)
chr8 (404-505)||(20498578-20498681)
chr8 (449-517)||(26355747-26355815)
chr8 (372-518)||(1484402-1484549)
chr8 (372-518)||(5853307-5853454)
chr8 (425-521)||(17612133-17612231)
chr8 (372-518)||(20403227-20403374)
chr8 (372-518)||(22001753-22001900)
chr8 (450-505)||(24353036-24353091)
chr8 (450-505)||(37116363-37116418)
chr8 (56-150)||(39834217-39834311)
chr8 (448-505)||(19154935-19154992)
chr8 (47-147)||(16409889-16409989)
chr8 (47-210)||(16860971-16861135)
chr8 (450-505)||(17267044-17267099)
chr8 (44-143)||(21414857-21414956)
chr8 (56-146)||(20499049-20499139)
chr8 (31-145)||(20527812-20527926)
chr8 (47-96)||(20856059-20856108)
chr8 (425-514)||(13597640-13597731)
chr8 (423-518)||(15203297-15203393)
chr8 (372-518)||(4483281-4483427)
chr8 (459-518)||(4542477-4542535)
chr8 (55-118)||(15602659-15602722)
chr8 (55-118)||(15611111-15611174)
chr8 (450-505)||(17439557-17439612)
chr8 (459-518)||(19896265-19896323)
chr8 (402-519)||(18678102-18678221)
chr8 (56-118)||(22010322-22010384)
chr8 (468-518)||(26225359-26225409)
chr8 (423-505)||(19801448-19801530)
chr8 (56-117)||(19899510-19899571)
chr8 (453-502)||(21673723-21673772)
chr8 (56-210)||(23834470-23834625)
chr8 (56-210)||(24433891-24434046)
chr8 (404-502)||(26219733-26219831)
chr8 (169-210)||(39834147-39834188)
chr8 (56-96)||(377714-377754)
chr8 (423-502)||(15070574-15070654)
chr8 (468-524)||(19937118-19937174)
chr8 (56-96)||(20465682-20465722)
chr8 (61-117)||(21395630-21395686)
chr8 (61-117)||(21790123-21790179)
chr8 (423-502)||(45290761-45290841)
chr8 (159-210)||(15538745-15538796)
chr8 (68-118)||(13507663-13507713)
chr8 (68-118)||(13597195-13597245)
chr8 (55-145)||(16411911-16412001)
chr8 (86-144)||(18865695-18865753)
chr8 (62-144)||(29123449-29123531)
chr8 (56-118)||(30642934-30642996)
chr8 (402-519)||(32121734-32121853)
chr8 (56-117)||(17353580-17353641)
chr8 (61-118)||(17926355-17926412)
chr8 (56-117)||(19976860-19976921)
chr8 (56-117)||(19983508-19983569)
chr8 (173-210)||(21255535-21255572)
chr8 (56-210)||(22113382-22113537)
chr8 (56-210)||(22134885-22135040)
chr8 (77-146)||(37116813-37116882)
chr8 (77-145)||(17266579-17266647)
chr8 (56-92)||(18619894-18619930)
chr8 (169-209)||(21674021-21674061)
chr8 (56-92)||(22028973-22029009)
chr8 (170-210)||(37116664-37116704)
chr8 (169-209)||(38855015-38855055)
chr8 (48-92)||(39094587-39094631)
chr8 (159-210)||(15532185-15532236)
chr8 (175-210)||(15602790-15602825)
chr8 (175-210)||(15611242-15611277)
chr8 (175-210)||(16185039-16185074)
chr8 (175-210)||(17353710-17353745)
chr8 (175-210)||(17828357-17828392)
chr8 (175-210)||(17926480-17926515)
chr8 (175-210)||(19899406-19899441)
chr8 (159-210)||(20465796-20465847)
chr8 (175-210)||(20856198-20856233)
chr8 (56-147)||(21168364-21168455)
chr8 (175-210)||(22010452-22010487)
chr8 (175-210)||(23846789-23846824)
chr8 (175-210)||(24756032-24756067)
chr8 (175-210)||(39094715-39094750)
chr8 (68-146)||(982980-983058)
chr8 (32-118)||(10829072-10829158)
chr8 (85-119)||(17085770-17085804)
chr8 (439-517)||(17353983-17354060)
chr8 (86-144)||(18855300-18855358)
chr8 (55-117)||(19259244-19259305)
chr8 (452-506)||(20502154-20502207)
chr8 (56-118)||(21161758-21161820)
chr8 (56-207)||(22166035-22166187)
chr8 (85-147)||(24353488-24353550)
chr8 (468-518)||(25484380-25484430)
chr8 (172-209)||(2418642-2418679)
chr8 (174-211)||(6608025-6608062)
chr8 (174-211)||(7300833-7300870)
chr8 (56-117)||(16185143-16185204)
chr8 (177-210)||(17055165-17055198)
chr8 (177-210)||(19259376-19259409)
chr8 (174-211)||(21414997-21415034)
chr8 (169-210)||(26355463-26355504)
chr8 (31-132)||(26934805-26934906)
chr8 (56-210)||(30308408-30308563)
chr8 (174-211)||(45134676-45134713)
chr8 (56-96)||(15532300-15532340)
chr8 (56-96)||(15538860-15538900)
chr8 (170-210)||(17266757-17266797)
chr8 (174-210)||(17615232-17615268)
chr8 (81-133)||(19111601-19111653)
chr8 (81-133)||(19117892-19117944)
chr8 (174-210)||(20498879-20498915)
chr8 (175-207)||(21168494-21168526)
chr8 (56-88)||(22057768-22057800)
chr8 (174-210)||(22059159-22059195)
chr8 (174-210)||(22145156-22145192)
chr8 (450-506)||(22525573-22525628)
chr8 (56-92)||(23252416-23252452)
chr8 (31-131)||(23845412-23845512)
chr8 (174-210)||(24707577-24707613)
chr8 (32-96)||(24756157-24756221)
chr8 (56-92)||(32599094-32599130)
chr8 (56-92)||(32605626-32605662)
chr8 (77-145)||(40492438-40492506)
[»] chr4 (178 HSPs)
chr4 (32-521)||(14052932-14053422)
chr4 (32-521)||(12902757-12903248)
chr4 (35-521)||(7088877-7089366)
chr4 (32-521)||(44052829-44053332)
chr4 (32-395)||(3096772-3097135)
chr4 (32-519)||(22636437-22636937)
chr4 (32-518)||(16377140-16377639)
chr4 (33-516)||(14038653-14039151)
chr4 (56-385)||(17047726-17048055)
chr4 (284-521)||(17046487-17046724)
chr4 (169-514)||(23374125-23374473)
chr4 (152-521)||(7893703-7894073)
chr4 (32-254)||(7798967-7799200)
chr4 (32-327)||(15091093-15091400)
chr4 (198-521)||(16239764-16240090)
chr4 (33-518)||(44928542-44929042)
chr4 (32-149)||(20156908-20157025)
chr4 (32-210)||(24029057-24029244)
chr4 (32-210)||(13812427-13812614)
chr4 (47-215)||(44102520-44102697)
chr4 (32-149)||(16239610-16239728)
chr4 (32-149)||(15552199-15552316)
chr4 (312-521)||(16270145-16270356)
chr4 (32-149)||(22633831-22633948)
chr4 (340-521)||(7798774-7798958)
chr4 (47-149)||(6190819-6190921)
chr4 (32-149)||(16597031-16597148)
chr4 (47-211)||(21814936-21815109)
chr4 (47-211)||(21815265-21815438)
chr4 (47-211)||(21818358-21818531)
chr4 (45-148)||(12774385-12774488)
chr4 (45-149)||(8846761-8846865)
chr4 (204-504)||(6190479-6190782)
chr4 (352-521)||(6899891-6900062)
chr4 (402-521)||(52873367-52873488)
chr4 (425-521)||(15551817-15551915)
chr4 (440-521)||(3096293-3096373)
chr4 (46-150)||(39705920-39706024)
chr4 (372-519)||(22353835-22353984)
chr4 (352-505)||(13800-13956)
chr4 (77-502)||(52242856-52243298)
chr4 (449-517)||(12774011-12774079)
chr4 (349-517)||(15121749-15121917)
chr4 (449-521)||(39706337-39706409)
chr4 (404-518)||(14280316-14280431)
chr4 (349-468)||(43256106-43256227)
chr4 (449-502)||(12288259-12288312)
chr4 (372-518)||(18215289-18215436)
chr4 (404-518)||(54798756-54798872)
chr4 (46-124)||(13844950-13845028)
chr4 (358-518)||(23803265-23803427)
chr4 (449-517)||(8846360-8846428)
chr4 (358-524)||(19242693-19242861)
chr4 (358-520)||(19618172-19618336)
chr4 (46-150)||(43198220-43198324)
chr4 (372-518)||(12322-12469)
chr4 (372-518)||(15118367-15118514)
chr4 (86-133)||(17046718-17046765)
chr4 (58-210)||(19757257-19757410)
chr4 (58-210)||(19782396-19782549)
chr4 (372-518)||(44615288-44615435)
chr4 (372-518)||(52312510-52312657)
chr4 (358-518)||(3515007-3515169)
chr4 (31-210)||(9556827-9557007)
chr4 (31-145)||(14679325-14679439)
chr4 (56-150)||(15099735-15099829)
chr4 (456-502)||(43198611-43198657)
chr4 (358-518)||(51463868-51464030)
chr4 (404-502)||(8574871-8574969)
chr4 (448-505)||(46640504-46640561)
chr4 (352-518)||(1837503-1837671)
chr4 (33-145)||(14685534-14685646)
chr4 (423-518)||(44773153-44773249)
chr4 (47-146)||(15464562-15464661)
chr4 (68-147)||(15868289-15868368)
chr4 (372-518)||(18239434-18239581)
chr4 (372-518)||(50222354-50222501)
chr4 (450-505)||(53082202-53082257)
chr4 (169-211)||(12774313-12774355)
chr4 (31-145)||(23838796-23838910)
chr4 (31-144)||(7900800-7900913)
chr4 (57-150)||(15190702-15190795)
chr4 (56-210)||(16243054-16243209)
chr4 (358-518)||(12610950-12611105)
chr4 (423-502)||(15355391-15355471)
chr4 (171-210)||(3332201-3332240)
chr4 (459-518)||(7641286-7641344)
chr4 (423-521)||(15367690-15367789)
chr4 (423-521)||(15370018-15370117)
chr4 (423-521)||(15371202-15371301)
chr4 (423-521)||(15373483-15373582)
chr4 (423-521)||(15402703-15402802)
chr4 (33-84)||(17053482-17053533)
chr4 (56-207)||(26243319-26243471)
chr4 (56-118)||(16356596-16356658)
chr4 (172-210)||(22633980-22634018)
chr4 (468-518)||(44102214-44102264)
chr4 (56-210)||(2015075-2015230)
chr4 (32-69)||(3332284-3332321)
chr4 (169-210)||(15099665-15099706)
chr4 (31-144)||(15321723-15321836)
chr4 (468-521)||(16223532-16223585)
chr4 (55-96)||(16348334-16348375)
chr4 (56-210)||(18222032-18222187)
chr4 (56-117)||(44676047-44676108)
chr4 (31-144)||(51493447-51493560)
chr4 (169-278)||(15464694-15464805)
chr4 (31-131)||(16956279-16956379)
chr4 (68-147)||(13427-13506)
chr4 (56-210)||(1951415-1951570)
chr4 (171-210)||(20157056-20157095)
chr4 (62-145)||(40471837-40471920)
chr4 (159-210)||(45938444-45938495)
chr4 (86-144)||(386038-386096)
chr4 (358-502)||(14970707-14970853)
chr4 (56-118)||(15094187-15094249)
chr4 (56-118)||(15121446-15121508)
chr4 (31-210)||(27534322-27534502)
chr4 (68-118)||(32851868-32851918)
chr4 (62-144)||(40478511-40478593)
chr4 (169-210)||(8846689-8846730)
chr4 (425-483)||(16596686-16596746)
chr4 (56-210)||(17152141-17152296)
chr4 (56-117)||(23843894-23843955)
chr4 (56-92)||(3413212-3413248)
chr4 (56-96)||(13569948-13569988)
chr4 (56-92)||(18602399-18602435)
chr4 (56-92)||(18608993-18609029)
chr4 (169-209)||(39706052-39706092)
chr4 (175-210)||(11250335-11250370)
chr4 (175-210)||(12570332-12570367)
chr4 (175-210)||(13569823-13569858)
chr4 (175-210)||(14708408-14708443)
chr4 (175-210)||(15190632-15190667)
chr4 (175-210)||(15353080-15353115)
chr4 (175-210)||(16351622-16351657)
chr4 (175-210)||(16356726-16356761)
chr4 (175-210)||(16487851-16487886)
chr4 (175-210)||(16678363-16678398)
chr4 (470-505)||(21815699-21815734)
chr4 (159-210)||(23139567-23139618)
chr4 (175-210)||(23843789-23843824)
chr4 (89-144)||(26284595-26284650)
chr4 (175-210)||(36133736-36133771)
chr4 (175-210)||(43255935-43255970)
chr4 (86-144)||(6873060-6873118)
chr4 (87-145)||(12522447-12522505)
chr4 (77-119)||(32306582-32306624)
chr4 (91-145)||(35170991-35171045)
chr4 (31-145)||(35614301-35614415)
chr4 (87-145)||(41385430-41385488)
chr4 (174-211)||(4171337-4171374)
chr4 (31-132)||(9271733-9271834)
chr4 (169-210)||(13844854-13844895)
chr4 (174-211)||(14699029-14699066)
chr4 (173-210)||(15552129-15552166)
chr4 (56-210)||(18237189-18237344)
chr4 (31-132)||(53433753-53433854)
chr4 (171-211)||(13616-13656)
chr4 (174-210)||(287405-287441)
chr4 (60-92)||(11250219-11250251)
chr4 (75-147)||(12287794-12287866)
chr4 (170-210)||(12287974-12288014)
chr4 (56-96)||(12570457-12570497)
chr4 (45-133)||(14268101-14268189)
chr4 (56-92)||(14708288-14708324)
chr4 (60-92)||(16351506-16351538)
chr4 (174-210)||(16359818-16359854)
chr4 (450-506)||(17333292-17333347)
chr4 (56-96)||(23139682-23139722)
chr4 (56-92)||(28569098-28569134)
chr4 (174-210)||(31116822-31116858)
chr4 (56-92)||(36133616-36133652)
chr4 (56-92)||(43255814-43255850)
chr4 (56-92)||(45938563-45938599)
chr4 (77-149)||(53081760-53081832)
chr4 (170-210)||(53081915-53081955)
chr4 (174-210)||(55502517-55502553)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (32-521)||(13497-13987)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (32-521)||(16282-16771)
[»] chr5 (197 HSPs)
chr5 (44-521)||(21292611-21293090)
chr5 (32-521)||(8286471-8286964)
chr5 (33-521)||(23390115-23390617)
chr5 (32-521)||(22075018-22075511)
chr5 (32-521)||(24493569-24494071)
chr5 (32-521)||(25421532-25422035)
chr5 (33-521)||(13095495-13095996)
chr5 (32-518)||(24529223-24529724)
chr5 (33-521)||(13025311-13025812)
chr5 (32-521)||(9077952-9078455)
chr5 (32-501)||(25431414-25431897)
chr5 (32-386)||(22107002-22107357)
chr5 (32-521)||(1096467-1096970)
chr5 (32-385)||(21985765-21986130)
chr5 (47-217)||(11580878-11581058)
chr5 (32-210)||(22119811-22119998)
chr5 (33-210)||(21871190-21871377)
chr5 (33-210)||(21875470-21875657)
chr5 (47-518)||(36154461-36154942)
chr5 (357-521)||(21808343-21808510)
chr5 (371-521)||(21729033-21729185)
chr5 (32-210)||(19660455-19660643)
chr5 (32-210)||(24766955-24767142)
chr5 (45-149)||(21565930-21566034)
chr5 (404-514)||(37723910-37724020)
chr5 (47-148)||(22959166-22959267)
chr5 (45-149)||(19669286-19669390)
chr5 (423-521)||(21997555-21997655)
chr5 (425-521)||(36314577-36314675)
chr5 (449-521)||(19660884-19660956)
chr5 (77-505)||(22144065-22144508)
chr5 (405-521)||(21329500-21329618)
chr5 (405-505)||(20026942-20027046)
chr5 (317-517)||(22032323-22032520)
chr5 (317-517)||(18769919-18770118)
chr5 (46-150)||(21329127-21329231)
chr5 (449-517)||(22959581-22959649)
chr5 (32-210)||(20910430-20910609)
chr5 (406-517)||(21565546-21565659)
chr5 (349-468)||(18356367-18356488)
chr5 (46-150)||(21498649-21498753)
chr5 (449-521)||(21502205-21502277)
chr5 (349-421)||(23572180-23572252)
chr5 (309-518)||(22412187-22412388)
chr5 (372-518)||(29329934-29330081)
chr5 (423-502)||(26012056-26012137)
chr5 (423-518)||(11581265-11581361)
chr5 (372-518)||(264783-264930)
chr5 (372-518)||(10732955-10733102)
chr5 (372-518)||(20909012-20909159)
chr5 (372-518)||(39363384-39363531)
chr5 (349-468)||(20910745-20910866)
chr5 (309-502)||(18418599-18418793)
chr5 (56-210)||(21340421-21340576)
chr5 (56-210)||(26665785-26665940)
chr5 (56-210)||(26937382-26937537)
chr5 (449-521)||(19668898-19668970)
chr5 (423-502)||(20902075-20902155)
chr5 (33-117)||(37724319-37724403)
chr5 (423-518)||(39245136-39245232)
chr5 (372-518)||(42245380-42245527)
chr5 (31-145)||(21294892-21295006)
chr5 (31-144)||(15441583-15441696)
chr5 (56-210)||(16674449-16674604)
chr5 (56-210)||(18356624-18356779)
chr5 (448-505)||(22178269-22178326)
chr5 (56-210)||(23535243-23535398)
chr5 (56-210)||(24532702-24532857)
chr5 (423-518)||(2154680-2154776)
chr5 (459-518)||(20918052-20918110)
chr5 (55-118)||(21366308-21366371)
chr5 (372-518)||(29345980-29346127)
chr5 (76-150)||(5888837-5888911)
chr5 (31-145)||(24554896-24555010)
chr5 (468-518)||(38619434-38619484)
chr5 (169-210)||(5888940-5888981)
chr5 (55-96)||(17918804-17918845)
chr5 (423-515)||(18319100-18319193)
chr5 (169-218)||(21501919-21501968)
chr5 (169-206)||(21565863-21565900)
chr5 (56-117)||(22032731-22032792)
chr5 (169-210)||(22959298-22959339)
chr5 (468-517)||(23064512-23064561)
chr5 (56-117)||(23201784-23201845)
chr5 (31-144)||(25406789-25406902)
chr5 (470-518)||(10775790-10775838)
chr5 (47-83)||(29916580-29916616)
chr5 (423-518)||(31061068-31061164)
chr5 (56-96)||(31342539-31342579)
chr5 (80-144)||(41294112-41294176)
chr5 (72-143)||(20026521-20026592)
chr5 (55-118)||(20805961-20806024)
chr5 (159-210)||(23201680-23201731)
chr5 (372-518)||(29348453-29348600)
chr5 (372-518)||(29350926-29351073)
chr5 (171-210)||(31342414-31342453)
chr5 (372-518)||(32027393-32027540)
chr5 (425-521)||(40725853-40725951)
chr5 (452-506)||(15796434-15796487)
chr5 (62-144)||(17284430-17284512)
chr5 (56-150)||(21741185-21741279)
chr5 (87-145)||(25535351-25535409)
chr5 (172-210)||(25744036-25744074)
chr5 (440-502)||(26704090-26704151)
chr5 (451-505)||(26740697-26740750)
chr5 (440-502)||(26973823-26973884)
chr5 (47-92)||(1858621-1858666)
chr5 (56-210)||(17718093-17718248)
chr5 (56-117)||(18769647-18769708)
chr5 (161-210)||(20232847-20232896)
chr5 (169-206)||(21741308-21741345)
chr5 (56-210)||(21884843-21884998)
chr5 (56-117)||(21887239-21887300)
chr5 (31-144)||(22133362-22133475)
chr5 (31-144)||(22140054-22140167)
chr5 (86-143)||(22588459-22588516)
chr5 (87-144)||(23336973-23337030)
chr5 (451-500)||(26732884-26732932)
chr5 (56-149)||(33409565-33409658)
chr5 (170-210)||(123074-123114)
chr5 (56-210)||(26172761-26172916)
chr5 (175-210)||(12028339-12028374)
chr5 (175-210)||(17410744-17410779)
chr5 (175-210)||(17918925-17918960)
chr5 (159-210)||(18774501-18774552)
chr5 (159-210)||(18784344-18784395)
chr5 (86-133)||(19992258-19992305)
chr5 (175-210)||(20805858-20805893)
chr5 (175-210)||(21366439-21366474)
chr5 (443-494)||(21873277-21873327)
chr5 (175-210)||(21873560-21873595)
chr5 (175-210)||(21887135-21887170)
chr5 (159-210)||(22032627-22032678)
chr5 (68-119)||(22177797-22177848)
chr5 (86-133)||(22334501-22334548)
chr5 (175-210)||(23512418-23512453)
chr5 (175-210)||(24222185-24222220)
chr5 (175-210)||(26680887-26680922)
chr5 (175-210)||(26952494-26952529)
chr5 (86-145)||(37286464-37286523)
chr5 (86-145)||(37293167-37293226)
chr5 (175-210)||(37724215-37724250)
chr5 (60-118)||(12028223-12028281)
chr5 (87-145)||(14359504-14359562)
chr5 (62-144)||(15236440-15236522)
chr5 (468-518)||(20806854-20806904)
chr5 (452-506)||(23469818-23469871)
chr5 (61-99)||(23500993-23501031)
chr5 (60-118)||(23512521-23512579)
chr5 (68-150)||(26011688-26011770)
chr5 (169-211)||(26011799-26011841)
chr5 (60-118)||(26680980-26681038)
chr5 (77-119)||(26732421-26732463)
chr5 (77-119)||(26740234-26740276)
chr5 (60-118)||(26952587-26952645)
chr5 (75-133)||(27517126-27517184)
chr5 (75-133)||(27523763-27523821)
chr5 (475-505)||(27989004-27989034)
chr5 (62-144)||(29471019-29471101)
chr5 (62-144)||(29477614-29477696)
chr5 (172-209)||(21329263-21329300)
chr5 (135-207)||(23451657-23451730)
chr5 (135-207)||(23458901-23458974)
chr5 (135-207)||(23463162-23463235)
chr5 (159-208)||(23572392-23572441)
chr5 (77-118)||(25574056-25574097)
chr5 (77-118)||(25575249-25575290)
chr5 (77-118)||(25576442-25576483)
chr5 (174-211)||(26496198-26496235)
chr5 (46-99)||(26704499-26704552)
chr5 (46-99)||(26974232-26974285)
chr5 (174-211)||(29324991-29325028)
chr5 (56-92)||(4036636-4036672)
chr5 (174-210)||(4398022-4398058)
chr5 (56-96)||(14079584-14079624)
chr5 (174-210)||(16255704-16255740)
chr5 (174-210)||(16259337-16259373)
chr5 (56-96)||(18784459-18784499)
chr5 (169-205)||(19669219-19669255)
chr5 (171-211)||(20026706-20026746)
chr5 (56-92)||(21482894-21482930)
chr5 (170-210)||(22177984-22178024)
chr5 (174-210)||(22589501-22589537)
chr5 (174-210)||(22593056-22593092)
chr5 (174-210)||(22596611-22596647)
chr5 (60-92)||(22760081-22760113)
chr5 (174-210)||(22880522-22880558)
chr5 (174-210)||(23693772-23693808)
chr5 (60-92)||(24222304-24222336)
chr5 (56-92)||(25229060-25229096)
chr5 (56-92)||(25293216-25293252)
chr5 (31-131)||(25808115-25808215)
chr5 (174-210)||(26360854-26360890)
chr5 (32-92)||(26742376-26742436)
chr5 (56-92)||(42805836-42805872)
chr5 (174-210)||(43121477-43121513)
chr5 (174-210)||(43125010-43125046)
[»] chr6 (164 HSPs)
chr6 (33-521)||(16920263-16920751)
chr6 (44-521)||(20360601-20361081)
chr6 (32-521)||(22831503-22831994)
chr6 (35-521)||(20637915-20638404)
chr6 (32-509)||(11185517-11185994)
chr6 (32-521)||(22779845-22780348)
chr6 (32-521)||(19303159-19303661)
chr6 (50-521)||(29060540-29061025)
chr6 (32-521)||(17287414-17287917)
chr6 (32-520)||(18409445-18409947)
chr6 (47-298)||(18821463-18821714)
chr6 (32-521)||(20593773-20594276)
chr6 (42-521)||(25628983-25629476)
chr6 (349-521)||(35245586-35245758)
chr6 (32-211)||(28496091-28496280)
chr6 (32-211)||(29808501-29808691)
chr6 (32-210)||(21939699-21939886)
chr6 (47-211)||(18457029-18457202)
chr6 (32-149)||(1561689-1561806)
chr6 (371-521)||(16496244-16496396)
chr6 (38-210)||(25611347-25611530)
chr6 (33-210)||(15894049-15894237)
chr6 (32-149)||(22334500-22334617)
chr6 (45-149)||(19652581-19652685)
chr6 (32-149)||(4667831-4667948)
chr6 (32-149)||(4674678-4674795)
chr6 (32-494)||(25603003-25603478)
chr6 (32-149)||(4185441-4185558)
chr6 (32-149)||(4189342-4189459)
chr6 (32-149)||(31155016-31155133)
chr6 (357-521)||(20076700-20076863)
chr6 (449-521)||(27333267-27333339)
chr6 (449-521)||(27394007-27394079)
chr6 (29-145)||(31164473-31164589)
chr6 (425-521)||(28496494-28496592)
chr6 (425-521)||(29808905-29809003)
chr6 (46-150)||(23019792-23019896)
chr6 (46-149)||(27332916-27333019)
chr6 (46-149)||(27393656-27393759)
chr6 (376-502)||(20109157-20109285)
chr6 (32-104)||(22439230-22439302)
chr6 (423-518)||(25656629-25656725)
chr6 (425-521)||(1561303-1561401)
chr6 (376-518)||(1595549-1595692)
chr6 (372-518)||(2291195-2291342)
chr6 (404-502)||(25644339-25644440)
chr6 (358-518)||(25754809-25754971)
chr6 (349-468)||(27415887-27416008)
chr6 (449-502)||(9098563-9098616)
chr6 (32-117)||(19863395-19863480)
chr6 (404-521)||(23019408-23019525)
chr6 (449-517)||(19652199-19652267)
chr6 (68-210)||(22080391-22080543)
chr6 (423-518)||(22782227-22782323)
chr6 (32-92)||(27415572-27415632)
chr6 (358-520)||(30676710-30676874)
chr6 (372-518)||(12742317-12742464)
chr6 (372-518)||(18334607-18334754)
chr6 (372-518)||(19005046-19005193)
chr6 (372-518)||(19858934-19859081)
chr6 (372-518)||(24422547-24422694)
chr6 (372-518)||(33861794-33861941)
chr6 (372-518)||(33864278-33864425)
chr6 (32-117)||(22432667-22432752)
chr6 (46-150)||(25956253-25956357)
chr6 (358-520)||(34963371-34963535)
chr6 (372-518)||(1540926-1541073)
chr6 (372-518)||(8055029-8055176)
chr6 (47-118)||(18180903-18180974)
chr6 (56-210)||(19663065-19663220)
chr6 (372-518)||(26924655-26924802)
chr6 (56-210)||(12496605-12496760)
chr6 (372-505)||(18456732-18456866)
chr6 (372-505)||(18461892-18462026)
chr6 (456-502)||(19668390-19668436)
chr6 (31-145)||(22331803-22331917)
chr6 (459-521)||(25714417-25714478)
chr6 (408-498)||(4185827-4185919)
chr6 (450-503)||(23076748-23076801)
chr6 (32-117)||(25641802-25641887)
chr6 (450-503)||(35008166-35008219)
chr6 (46-146)||(25644711-25644811)
chr6 (423-502)||(25688518-25688598)
chr6 (425-521)||(8227534-8227632)
chr6 (474-521)||(22080799-22080846)
chr6 (159-210)||(22334648-22334699)
chr6 (459-505)||(18821904-18821949)
chr6 (56-118)||(21834533-21834595)
chr6 (448-506)||(33443062-33443119)
chr6 (169-210)||(4185588-4185629)
chr6 (169-210)||(4667978-4668019)
chr6 (423-515)||(16448593-16448686)
chr6 (56-210)||(22429684-22429839)
chr6 (31-131)||(14099004-14099104)
chr6 (423-518)||(20556958-20557054)
chr6 (169-209)||(27333049-27333089)
chr6 (169-209)||(27393789-27393829)
chr6 (459-518)||(3852121-3852179)
chr6 (55-118)||(16523045-16523108)
chr6 (169-208)||(19652512-19652551)
chr6 (86-144)||(1538628-1538686)
chr6 (86-144)||(1544727-1544785)
chr6 (56-118)||(21739665-21739727)
chr6 (31-145)||(34295696-34295810)
chr6 (408-498)||(4186390-4186482)
chr6 (55-148)||(15041192-15041285)
chr6 (87-144)||(16372223-16372280)
chr6 (165-210)||(16924642-16924687)
chr6 (165-210)||(16929357-16929402)
chr6 (56-210)||(17804494-17804649)
chr6 (440-517)||(19873120-19873196)
chr6 (68-145)||(20109605-20109682)
chr6 (440-517)||(22432249-22432325)
chr6 (440-517)||(22438799-22438875)
chr6 (169-210)||(31155163-31155204)
chr6 (31-132)||(34833031-34833132)
chr6 (170-210)||(19668688-19668728)
chr6 (170-210)||(23657189-23657229)
chr6 (317-494)||(15041465-15041644)
chr6 (175-210)||(16523176-16523211)
chr6 (56-210)||(16741503-16741659)
chr6 (455-506)||(18199473-18199523)
chr6 (175-210)||(19863291-19863326)
chr6 (175-210)||(19873433-19873468)
chr6 (175-210)||(21702584-21702619)
chr6 (32-99)||(22059362-22059429)
chr6 (57-96)||(22405709-22405748)
chr6 (175-210)||(22432563-22432598)
chr6 (175-210)||(22592578-22592613)
chr6 (175-210)||(25135446-25135481)
chr6 (159-210)||(25641940-25641991)
chr6 (175-210)||(27567383-27567418)
chr6 (56-210)||(20803206-20803362)
chr6 (169-211)||(23019721-23019763)
chr6 (87-133)||(30694738-30694784)
chr6 (172-210)||(35008465-35008503)
chr6 (174-211)||(2287677-2287714)
chr6 (56-149)||(2684995-2685088)
chr6 (169-210)||(4674825-4674866)
chr6 (56-210)||(5616468-5616623)
chr6 (174-211)||(8523245-8523282)
chr6 (56-210)||(12706985-12707140)
chr6 (86-131)||(14472647-14472692)
chr6 (174-211)||(15539592-15539629)
chr6 (174-211)||(15685871-15685908)
chr6 (169-210)||(16830111-16830152)
chr6 (177-210)||(18907419-18907452)
chr6 (468-517)||(19862978-19863027)
chr6 (175-212)||(22405838-22405875)
chr6 (31-140)||(25594981-25595090)
chr6 (87-144)||(34369658-34369715)
chr6 (56-92)||(1587385-1587421)
chr6 (174-210)||(4189271-4189307)
chr6 (170-210)||(9098290-9098330)
chr6 (174-210)||(12596272-12596308)
chr6 (159-207)||(15041307-15041355)
chr6 (174-210)||(16102658-16102694)
chr6 (174-210)||(16813091-16813127)
chr6 (170-210)||(20109456-20109496)
chr6 (56-96)||(21702699-21702739)
chr6 (56-92)||(25766822-25766858)
chr6 (81-133)||(27327735-27327787)
chr6 (81-133)||(27388475-27388527)
chr6 (174-210)||(29493068-29493104)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (32-521)||(4712-5204)
scaffold0358 (32-446)||(13-428)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (32-518)||(4760-5246)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (32-521)||(46995-47478)
scaffold0064 (56-117)||(64306-64367)
[»] chr3 (241 HSPs)
chr3 (32-521)||(20698065-20698556)
chr3 (33-521)||(17487856-17488359)
chr3 (33-521)||(17499338-17499841)
chr3 (84-521)||(13442274-13442725)
chr3 (32-521)||(26686887-26687390)
chr3 (32-521)||(12399209-12399698)
chr3 (32-521)||(18438534-18439037)
chr3 (32-521)||(14972854-14973357)
chr3 (32-502)||(14576451-14576934)
chr3 (32-518)||(40213339-40213838)
chr3 (35-502)||(14572608-14573088)
chr3 (32-521)||(23082979-23083482)
chr3 (32-521)||(11424381-11424880)
chr3 (32-521)||(25476003-25476506)
chr3 (32-502)||(30029859-30030331)
chr3 (147-521)||(43840932-43841309)
chr3 (32-218)||(17247904-17248100)
chr3 (36-505)||(53070321-53070802)
chr3 (33-200)||(16809724-16809887)
chr3 (32-210)||(12340068-12340255)
chr3 (32-149)||(14179708-14179825)
chr3 (32-210)||(14669076-14669263)
chr3 (32-141)||(43842572-43842681)
chr3 (196-385)||(16796685-16796875)
chr3 (34-210)||(12851984-12852169)
chr3 (32-210)||(14665921-14666108)
chr3 (32-210)||(14735434-14735621)
chr3 (309-518)||(24153115-24153326)
chr3 (56-502)||(42386429-42386890)
chr3 (32-149)||(13209946-13210062)
chr3 (45-148)||(49389275-49389378)
chr3 (36-130)||(17247142-17247236)
chr3 (45-211)||(32307983-32308158)
chr3 (56-146)||(4588457-4588547)
chr3 (45-149)||(12933941-12934045)
chr3 (45-146)||(9513299-9513400)
chr3 (45-146)||(9521274-9521375)
chr3 (47-147)||(16104168-16104268)
chr3 (45-146)||(1644314-1644415)
chr3 (45-146)||(16097719-16097820)
chr3 (45-149)||(49667715-49667818)
chr3 (425-521)||(13210350-13210448)
chr3 (47-124)||(12171750-12171827)
chr3 (449-517)||(49668125-49668193)
chr3 (423-521)||(43550544-43550644)
chr3 (404-521)||(15470927-15471043)
chr3 (449-517)||(9512924-9512992)
chr3 (449-517)||(9520899-9520967)
chr3 (449-517)||(12174308-12174376)
chr3 (46-150)||(15471309-15471413)
chr3 (353-517)||(856140-856304)
chr3 (308-385)||(14179570-14179648)
chr3 (32-117)||(15877447-15877532)
chr3 (404-518)||(27165250-27165366)
chr3 (449-502)||(32307696-32307749)
chr3 (449-505)||(52523778-52523834)
chr3 (372-518)||(9707622-9707769)
chr3 (405-521)||(14234487-14234605)
chr3 (425-521)||(24340746-24340844)
chr3 (372-518)||(29172598-29172745)
chr3 (358-518)||(17672626-17672788)
chr3 (456-518)||(28194693-28194755)
chr3 (358-502)||(50242838-50242984)
chr3 (423-518)||(53301572-53301669)
chr3 (404-518)||(36166598-36166712)
chr3 (56-210)||(38814681-38814836)
chr3 (453-517)||(16097332-16097396)
chr3 (449-517)||(16103784-16103852)
chr3 (68-143)||(324627-324702)
chr3 (372-518)||(7781362-7781509)
chr3 (358-519)||(13544024-13544187)
chr3 (372-518)||(17463178-17463325)
chr3 (450-505)||(22110402-22110457)
chr3 (372-518)||(28848626-28848773)
chr3 (372-518)||(34159326-34159473)
chr3 (450-505)||(43925974-43926029)
chr3 (372-518)||(45606922-45607069)
chr3 (372-518)||(55476491-55476638)
chr3 (31-210)||(839543-839723)
chr3 (358-502)||(12567576-12567722)
chr3 (46-144)||(14234881-14234979)
chr3 (448-517)||(37251216-37251283)
chr3 (56-210)||(17242269-17242424)
chr3 (406-518)||(55500942-55501055)
chr3 (68-144)||(2050855-2050931)
chr3 (423-518)||(6469200-6469296)
chr3 (423-518)||(8499518-8499614)
chr3 (423-518)||(15977515-15977611)
chr3 (372-518)||(8899094-8899241)
chr3 (372-518)||(16454296-16454443)
chr3 (372-502)||(38961906-38962037)
chr3 (56-150)||(1465051-1465145)
chr3 (169-211)||(1644447-1644489)
chr3 (31-145)||(24188140-24188254)
chr3 (402-519)||(46822267-46822386)
chr3 (169-211)||(49667848-49667890)
chr3 (31-145)||(55149341-55149455)
chr3 (452-505)||(606378-606431)
chr3 (56-210)||(3833971-3834126)
chr3 (47-96)||(17674209-17674258)
chr3 (404-502)||(21618465-21618563)
chr3 (423-518)||(12119791-12119887)
chr3 (448-504)||(12377938-12377994)
chr3 (372-518)||(13151805-13151953)
chr3 (372-518)||(13154270-13154418)
chr3 (423-518)||(15412429-15412525)
chr3 (55-147)||(18383559-18383651)
chr3 (31-210)||(20723298-20723478)
chr3 (425-502)||(23274706-23274785)
chr3 (77-149)||(52523390-52523462)
chr3 (372-518)||(10247738-10247885)
chr3 (55-118)||(12496668-12496731)
chr3 (426-516)||(16282880-16282971)
chr3 (372-518)||(17446670-17446816)
chr3 (459-518)||(17737236-17737294)
chr3 (159-210)||(19725669-19725720)
chr3 (425-521)||(37642288-37642386)
chr3 (468-518)||(10556985-10557035)
chr3 (169-211)||(12934075-12934117)
chr3 (55-117)||(15060706-15060768)
chr3 (68-146)||(22109929-22110007)
chr3 (35-117)||(23408847-23408928)
chr3 (468-518)||(45577950-45578000)
chr3 (56-210)||(1598134-1598289)
chr3 (55-96)||(3402608-3402649)
chr3 (56-210)||(11300165-11300320)
chr3 (403-519)||(12511059-12511177)
chr3 (56-210)||(15849739-15849894)
chr3 (56-96)||(3389600-3389640)
chr3 (31-131)||(4291149-4291249)
chr3 (56-96)||(11298172-11298212)
chr3 (56-96)||(26190652-26190692)
chr3 (468-516)||(41123892-41123940)
chr3 (423-518)||(44494809-44494905)
chr3 (55-94)||(323026-323065)
chr3 (32-99)||(12037572-12037639)
chr3 (68-119)||(14501615-14501666)
chr3 (56-210)||(15941558-15941713)
chr3 (47-118)||(19725546-19725617)
chr3 (68-143)||(23275133-23275208)
chr3 (169-211)||(324549-324591)
chr3 (56-118)||(12173199-12173261)
chr3 (55-117)||(15051930-15051992)
chr3 (168-210)||(16097645-16097687)
chr3 (56-118)||(23077121-23077183)
chr3 (62-144)||(23704428-23704510)
chr3 (62-144)||(23722884-23722966)
chr3 (62-144)||(23741340-23741422)
chr3 (62-144)||(41201457-41201539)
chr3 (169-207)||(49389408-49389446)
chr3 (56-210)||(326818-326973)
chr3 (68-149)||(605945-606026)
chr3 (56-117)||(856550-856611)
chr3 (169-210)||(1465174-1465215)
chr3 (169-206)||(9513228-9513265)
chr3 (169-206)||(9521203-9521240)
chr3 (47-96)||(11852006-11852055)
chr3 (173-210)||(13210096-13210133)
chr3 (56-210)||(15482959-15483114)
chr3 (75-144)||(15691950-15692019)
chr3 (440-517)||(15878092-15878168)
chr3 (31-132)||(16333548-16333649)
chr3 (170-211)||(37250932-37250973)
chr3 (77-118)||(43927597-43927638)
chr3 (56-96)||(321657-321697)
chr3 (169-209)||(12171869-12171909)
chr3 (450-506)||(13919344-13919399)
chr3 (56-96)||(17524817-17524857)
chr3 (170-210)||(22110116-22110156)
chr3 (32-119)||(603258-603345)
chr3 (175-210)||(3402729-3402764)
chr3 (175-210)||(11594913-11594948)
chr3 (163-206)||(11863105-11863148)
chr3 (175-210)||(12173096-12173131)
chr3 (175-210)||(12496565-12496600)
chr3 (62-133)||(13251095-13251166)
chr3 (62-133)||(13257741-13257812)
chr3 (175-210)||(15051826-15051861)
chr3 (175-210)||(15060602-15060637)
chr3 (175-210)||(15877601-15877636)
chr3 (159-210)||(16369718-16369769)
chr3 (55-94)||(16369845-16369884)
chr3 (175-210)||(16690516-16690551)
chr3 (175-210)||(16697089-16697124)
chr3 (175-210)||(16797828-16797863)
chr3 (175-210)||(16808655-16808690)
chr3 (175-210)||(16910060-16910095)
chr3 (175-210)||(18383690-18383725)
chr3 (175-210)||(20461274-20461309)
chr3 (47-98)||(23052711-23052762)
chr3 (175-210)||(23052850-23052885)
chr3 (175-210)||(23077251-23077286)
chr3 (175-210)||(23408743-23408778)
chr3 (68-119)||(23412827-23412878)
chr3 (175-210)||(26190782-26190817)
chr3 (175-210)||(42326241-42326276)
chr3 (68-119)||(45797659-45797710)
chr3 (77-119)||(316612-316654)
chr3 (62-144)||(11070435-11070517)
chr3 (62-144)||(11165189-11165271)
chr3 (169-207)||(14234809-14234847)
chr3 (62-144)||(14499692-14499774)
chr3 (56-118)||(14878148-14878210)
chr3 (62-144)||(15726591-15726673)
chr3 (439-517)||(23077517-23077594)
chr3 (62-144)||(30066313-30066395)
chr3 (86-132)||(41092030-41092076)
chr3 (62-144)||(55023212-55023294)
chr3 (31-144)||(5149596-5149709)
chr3 (56-210)||(7793000-7793155)
chr3 (31-132)||(12891782-12891883)
chr3 (169-206)||(15471244-15471281)
chr3 (56-149)||(16862834-16862927)
chr3 (31-132)||(17252685-17252786)
chr3 (86-131)||(17710275-17710320)
chr3 (87-144)||(28350846-28350903)
chr3 (174-211)||(54973699-54973736)
chr3 (174-211)||(54976309-54976346)
chr3 (174-211)||(54978919-54978956)
chr3 (174-210)||(2034752-2034788)
chr3 (174-210)||(2038259-2038295)
chr3 (174-210)||(2042000-2042036)
chr3 (31-131)||(4710675-4710775)
chr3 (60-92)||(11557043-11557075)
chr3 (60-92)||(11594797-11594829)
chr3 (75-119)||(12378412-12378456)
chr3 (174-210)||(14038492-14038528)
chr3 (174-210)||(14041960-14041996)
chr3 (468-520)||(14665398-14665450)
chr3 (468-520)||(14668554-14668606)
chr3 (31-119)||(15617766-15617854)
chr3 (56-92)||(16690635-16690671)
chr3 (56-92)||(16697208-16697244)
chr3 (56-92)||(16797708-16797744)
chr3 (174-210)||(18959209-18959245)
chr3 (56-92)||(20461154-20461190)
chr3 (56-92)||(31097208-31097244)
chr3 (174-210)||(39231039-39231075)
chr3 (48-92)||(42326360-42326404)
chr3 (81-133)||(53380030-53380082)
chr3 (81-133)||(53386682-53386734)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (32-521)||(678-1169)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (32-521)||(167608-168099)
scaffold0011 (32-521)||(51913-52415)
[»] chr1 (158 HSPs)
chr1 (32-521)||(38801020-38801508)
chr1 (32-521)||(27250358-27250850)
chr1 (32-521)||(21026680-21027172)
chr1 (32-520)||(50209832-50210333)
chr1 (32-446)||(22354190-22354616)
chr1 (32-518)||(34509783-34510283)
chr1 (32-521)||(22532269-22532772)
chr1 (32-412)||(22355803-22356185)
chr1 (32-412)||(22357489-22357871)
chr1 (32-331)||(20846848-20847147)
chr1 (32-520)||(20135188-20135690)
chr1 (33-518)||(433012-433509)
chr1 (32-210)||(20918917-20919104)
chr1 (33-121)||(21301157-21301245)
chr1 (45-233)||(33681301-33681499)
chr1 (45-149)||(52927612-52927716)
chr1 (45-147)||(21754423-21754525)
chr1 (32-210)||(20091092-20091281)
chr1 (32-146)||(21162117-21162231)
chr1 (47-149)||(22238015-22238117)
chr1 (55-148)||(20248664-20248757)
chr1 (310-520)||(22468604-22468816)
chr1 (46-150)||(22921499-22921603)
chr1 (425-521)||(14295574-14295672)
chr1 (427-521)||(45574912-45575008)
chr1 (445-521)||(20847200-20847275)
chr1 (404-505)||(21896258-21896361)
chr1 (449-517)||(22921918-22921986)
chr1 (46-150)||(43697745-43697849)
chr1 (449-521)||(33681010-33681079)
chr1 (349-468)||(33797573-33797694)
chr1 (308-385)||(48603652-48603730)
chr1 (425-502)||(20918623-20918702)
chr1 (404-505)||(21861572-21861675)
chr1 (423-502)||(21754064-21754145)
chr1 (404-521)||(22237630-22237746)
chr1 (358-518)||(23593735-23593897)
chr1 (449-502)||(16758668-16758721)
chr1 (32-117)||(22468315-22468400)
chr1 (423-505)||(35261099-35261183)
chr1 (372-518)||(13988866-13989013)
chr1 (358-519)||(21840766-21840929)
chr1 (372-518)||(21923306-21923453)
chr1 (372-518)||(29776688-29776835)
chr1 (372-518)||(31612313-31612460)
chr1 (450-505)||(50614167-50614222)
chr1 (450-505)||(50621995-50622050)
chr1 (449-521)||(52928019-52928088)
chr1 (452-505)||(16368338-16368391)
chr1 (449-517)||(20248283-20248351)
chr1 (452-520)||(20454606-20454673)
chr1 (423-502)||(22123133-22123214)
chr1 (423-521)||(13212928-13213027)
chr1 (426-524)||(15860078-15860177)
chr1 (372-518)||(21475102-21475249)
chr1 (56-118)||(18181764-18181826)
chr1 (423-524)||(21342090-21342192)
chr1 (169-211)||(21754350-21754392)
chr1 (31-145)||(23763574-23763688)
chr1 (46-99)||(21714983-21715036)
chr1 (448-505)||(41050084-41050141)
chr1 (32-96)||(8761252-8761316)
chr1 (358-520)||(16361915-16362079)
chr1 (423-518)||(21346961-21347057)
chr1 (47-94)||(3472560-3472607)
chr1 (68-147)||(21895886-21895965)
chr1 (55-118)||(22432425-22432488)
chr1 (459-518)||(29298137-29298195)
chr1 (421-518)||(16275428-16275526)
chr1 (468-518)||(21707167-21707217)
chr1 (468-518)||(21711709-21711759)
chr1 (56-146)||(28194090-28194180)
chr1 (451-505)||(50686627-50686681)
chr1 (47-92)||(3704731-3704776)
chr1 (56-210)||(12647166-12647321)
chr1 (56-210)||(18882664-18882819)
chr1 (169-210)||(20637165-20637206)
chr1 (169-210)||(21162080-21162121)
chr1 (440-517)||(21714546-21714622)
chr1 (448-503)||(16093933-16093988)
chr1 (86-145)||(20524899-20524958)
chr1 (86-145)||(21438157-21438216)
chr1 (68-147)||(21861148-21861227)
chr1 (56-210)||(23818953-23819108)
chr1 (450-505)||(26064954-26065009)
chr1 (80-147)||(35981352-35981419)
chr1 (86-144)||(19063884-19063942)
chr1 (86-144)||(19111774-19111832)
chr1 (56-210)||(19212164-19212319)
chr1 (56-118)||(22831021-22831083)
chr1 (56-210)||(20138380-20138535)
chr1 (169-210)||(20248592-20248633)
chr1 (56-117)||(21787685-21787746)
chr1 (31-144)||(21829078-21829191)
chr1 (31-144)||(21844591-21844704)
chr1 (168-209)||(22921631-22921672)
chr1 (170-211)||(26065254-26065295)
chr1 (169-210)||(28194213-28194254)
chr1 (77-146)||(35260718-35260787)
chr1 (169-210)||(35981451-35981492)
chr1 (56-117)||(42864854-42864915)
chr1 (56-210)||(46975764-46975919)
chr1 (168-209)||(52927745-52927786)
chr1 (77-149)||(16367873-16367945)
chr1 (55-210)||(17678240-17678396)
chr1 (47-150)||(20637235-20637339)
chr1 (55-95)||(21023075-21023115)
chr1 (75-147)||(41049629-41049701)
chr1 (32-104)||(45307721-45307793)
chr1 (170-210)||(45310135-45310175)
chr1 (56-92)||(45489397-45489433)
chr1 (175-210)||(3472699-3472734)
chr1 (159-210)||(6152166-6152217)
chr1 (175-210)||(16080218-16080253)
chr1 (75-146)||(16759115-16759186)
chr1 (175-210)||(21022949-21022984)
chr1 (68-119)||(21342564-21342615)
chr1 (68-119)||(21347429-21347480)
chr1 (175-210)||(21615734-21615769)
chr1 (175-210)||(21714861-21714896)
chr1 (175-210)||(21787815-21787850)
chr1 (159-210)||(22432540-22432591)
chr1 (175-210)||(22449039-22449074)
chr1 (175-210)||(22831151-22831186)
chr1 (32-119)||(24087831-24087918)
chr1 (175-210)||(24782874-24782909)
chr1 (88-147)||(26065382-26065441)
chr1 (175-210)||(33797830-33797865)
chr1 (175-210)||(36819082-36819117)
chr1 (175-210)||(42864984-42865019)
chr1 (175-210)||(45489517-45489552)
chr1 (62-144)||(1011087-1011169)
chr1 (175-209)||(8761406-8761440)
chr1 (77-123)||(16381652-16381698)
chr1 (86-144)||(19105117-19105175)
chr1 (459-517)||(21161720-21161778)
chr1 (476-506)||(21533948-21533978)
chr1 (56-149)||(21615796-21615889)
chr1 (56-118)||(24782754-24782816)
chr1 (77-119)||(52940464-52940506)
chr1 (56-117)||(6152270-6152331)
chr1 (174-211)||(20579778-20579815)
chr1 (172-209)||(22237946-22237983)
chr1 (31-132)||(50887381-50887482)
chr1 (171-211)||(12271862-12271902)
chr1 (174-210)||(14432123-14432159)
chr1 (77-149)||(16093479-16093551)
chr1 (170-210)||(16368051-16368091)
chr1 (170-210)||(18393732-18393772)
chr1 (174-210)||(20631631-20631667)
chr1 (56-92)||(21305730-21305766)
chr1 (174-210)||(22900022-22900058)
chr1 (174-210)||(24087730-24087766)
chr1 (468-520)||(24783160-24783212)
chr1 (56-96)||(33797945-33797985)
chr1 (174-210)||(36181890-36181926)
chr1 (174-210)||(37358783-37358819)
chr1 (174-210)||(45307605-45307641)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (36-521)||(51582-52067)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (32-521)||(13211-13703)
scaffold0193 (56-210)||(9717-9872)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (32-521)||(1952-2444)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (32-521)||(1289-1778)
scaffold0106 (32-521)||(7266-7755)
scaffold0106 (32-99)||(16083-16150)
scaffold0106 (452-518)||(15291-15356)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (33-521)||(1851-2353)
scaffold0016 (56-210)||(207161-207324)
scaffold0016 (68-118)||(119205-119255)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (32-521)||(3470-3973)
scaffold0292 (44-521)||(343-833)
[»] scaffold0042 (6 HSPs)
scaffold0042 (33-502)||(23921-24405)
scaffold0042 (56-210)||(64150-64305)
scaffold0042 (56-210)||(76034-76189)
scaffold0042 (175-210)||(34683-34718)
scaffold0042 (56-96)||(34553-34593)
scaffold0042 (56-96)||(41196-41236)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (33-521)||(4849-5339)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (32-521)||(5739-6245)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (32-461)||(6669-7102)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (32-521)||(38761-39262)
scaffold0145 (312-521)||(32942-33153)
scaffold0145 (423-523)||(9744-9845)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (33-521)||(20910-21392)
[»] scaffold0021 (10 HSPs)
scaffold0021 (32-433)||(124675-125085)
scaffold0021 (404-520)||(174767-174883)
scaffold0021 (45-149)||(62947-63051)
scaffold0021 (32-97)||(175202-175267)
scaffold0021 (451-521)||(121766-121835)
scaffold0021 (445-505)||(136414-136474)
scaffold0021 (445-505)||(145122-145182)
scaffold0021 (170-211)||(136132-136173)
scaffold0021 (170-211)||(144840-144881)
scaffold0021 (174-210)||(133740-133776)
[»] scaffold0056 (5 HSPs)
scaffold0056 (32-520)||(16833-17337)
scaffold0056 (32-148)||(78980-79096)
scaffold0056 (459-505)||(79388-79433)
scaffold0056 (175-210)||(13850-13885)
scaffold0056 (32-96)||(13696-13760)
[»] scaffold0175 (4 HSPs)
scaffold0175 (33-471)||(13141-13594)
scaffold0175 (32-209)||(34437-34623)
scaffold0175 (425-521)||(34123-34221)
scaffold0175 (468-521)||(273-326)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (32-521)||(8479-8978)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (35-521)||(8154-8650)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (32-521)||(39913-40414)
scaffold0080 (448-505)||(19933-19990)
scaffold0080 (159-210)||(18413-18464)
scaffold0080 (56-117)||(18299-18360)
[»] scaffold0003 (7 HSPs)
scaffold0003 (32-518)||(339569-340065)
scaffold0003 (349-468)||(71353-71474)
scaffold0003 (32-92)||(71729-71789)
scaffold0003 (372-518)||(158465-158612)
scaffold0003 (175-210)||(96903-96938)
scaffold0003 (175-210)||(413824-413859)
scaffold0003 (56-210)||(140007-140162)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (33-514)||(25684-26179)
scaffold0122 (32-369)||(33112-33461)
scaffold0122 (404-518)||(44709-44825)
[»] scaffold0026 (5 HSPs)
scaffold0026 (32-521)||(39858-40359)
scaffold0026 (207-521)||(25896-26213)
scaffold0026 (32-149)||(39549-39666)
scaffold0026 (90-210)||(59179-59308)
scaffold0026 (98-149)||(26611-26662)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (56-385)||(1052-1382)
[»] scaffold0165 (5 HSPs)
scaffold0165 (56-365)||(3640-3949)
scaffold0165 (56-365)||(7704-8013)
scaffold0165 (68-147)||(27296-27375)
scaffold0165 (423-502)||(27770-27851)
scaffold0165 (171-211)||(27485-27525)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (42-521)||(16227-16721)
[»] scaffold0228 (4 HSPs)
scaffold0228 (33-521)||(4508-5010)
scaffold0228 (33-521)||(12090-12592)
scaffold0228 (33-521)||(22042-22544)
scaffold0228 (56-210)||(18286-18441)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (60-330)||(11170-11440)
scaffold0235 (406-521)||(11447-11564)
scaffold0235 (68-119)||(14055-14106)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (32-331)||(20596-20906)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (47-518)||(22886-23370)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (47-504)||(51517-51987)
scaffold0034 (423-502)||(32555-32636)
scaffold0034 (68-150)||(32921-33003)
scaffold0034 (169-235)||(32826-32892)
[»] scaffold0395 (3 HSPs)
scaffold0395 (32-461)||(580-1021)
scaffold0395 (32-150)||(8110-8228)
scaffold0395 (454-521)||(4888-4954)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (165-519)||(39479-39836)
scaffold0141 (174-210)||(33461-33497)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (165-519)||(74976-75333)
scaffold0049 (174-210)||(81315-81351)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (32-265)||(163-407)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (32-344)||(17626-17928)
[»] scaffold0120 (6 HSPs)
scaffold0120 (32-521)||(32577-33077)
scaffold0120 (32-521)||(45928-46428)
scaffold0120 (33-278)||(16333-16588)
scaffold0120 (313-521)||(16113-16323)
scaffold0120 (459-521)||(17389-17450)
scaffold0120 (56-210)||(19671-19826)
[»] scaffold0070 (2 HSPs)
scaffold0070 (32-500)||(4545-5026)
scaffold0070 (56-210)||(10200-10355)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (239-521)||(2987-3271)
scaffold0540 (32-228)||(631-837)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (32-364)||(10323-10661)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (32-177)||(13226-13371)
[»] scaffold0413 (4 HSPs)
scaffold0413 (32-215)||(15233-15426)
scaffold0413 (404-505)||(12584-12687)
scaffold0413 (46-146)||(13033-13133)
scaffold0413 (170-210)||(12884-12924)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (163-441)||(27912-28192)
scaffold0130 (32-147)||(28924-29039)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (32-211)||(20426-20615)
scaffold0100 (449-521)||(23932-24001)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (32-218)||(1696-1891)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (32-149)||(2703-2820)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (32-149)||(18576-18693)
[»] scaffold0142 (4 HSPs)
scaffold0142 (47-215)||(17090-17268)
scaffold0142 (423-518)||(16784-16880)
scaffold0142 (114-149)||(7471-7506)
scaffold0142 (171-210)||(7537-7576)
[»] scaffold0031 (5 HSPs)
scaffold0031 (32-207)||(20044-20228)
scaffold0031 (372-505)||(20394-20527)
scaffold0031 (32-99)||(65412-65479)
scaffold0031 (357-521)||(128751-128917)
scaffold0031 (56-210)||(53862-54017)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (32-207)||(12427-12611)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (32-210)||(344-530)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (33-210)||(2064-2250)
[»] scaffold0075 (4 HSPs)
scaffold0075 (33-210)||(7913-8099)
scaffold0075 (352-505)||(53498-53654)
scaffold0075 (68-147)||(53125-53204)
scaffold0075 (171-211)||(53314-53354)
[»] scaffold0261 (3 HSPs)
scaffold0261 (32-210)||(15974-16161)
scaffold0261 (425-518)||(15664-15759)
scaffold0261 (27-117)||(1755-1845)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (32-210)||(79950-80137)
scaffold0037 (404-521)||(22672-22788)
scaffold0037 (358-518)||(82072-82234)
scaffold0037 (56-147)||(21212-21303)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (33-210)||(10226-10412)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (32-139)||(10540-10647)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (47-211)||(12243-12416)
scaffold0503 (459-505)||(11979-12024)
[»] scaffold0218 (4 HSPs)
scaffold0218 (33-145)||(28899-29011)
scaffold0218 (445-502)||(8119-8176)
scaffold0218 (170-211)||(7841-7882)
scaffold0218 (165-206)||(29041-29081)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (32-210)||(9452-9639)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (320-520)||(3103-3306)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (32-210)||(24268-24456)
scaffold0124 (425-521)||(38279-38377)
[»] scaffold0046 (5 HSPs)
scaffold0046 (385-521)||(28414-28552)
scaffold0046 (425-521)||(11292-11390)
scaffold0046 (425-521)||(1997-2095)
scaffold0046 (465-521)||(4552-4608)
scaffold0046 (32-98)||(14914-14980)
[»] scaffold0028 (10 HSPs)
scaffold0028 (45-211)||(132967-133143)
scaffold0028 (457-517)||(132662-132722)
scaffold0028 (372-518)||(136680-136827)
scaffold0028 (372-518)||(139149-139296)
scaffold0028 (372-518)||(144087-144234)
scaffold0028 (449-502)||(62217-62270)
scaffold0028 (372-518)||(134211-134358)
scaffold0028 (372-518)||(141618-141765)
scaffold0028 (86-144)||(41901-41959)
scaffold0028 (86-144)||(57408-57466)
[»] scaffold0556 (5 HSPs)
scaffold0556 (45-149)||(7197-7301)
scaffold0556 (449-505)||(6828-6884)
scaffold0556 (46-150)||(8401-8505)
scaffold0556 (169-210)||(7126-7167)
scaffold0556 (169-211)||(8330-8372)
[»] scaffold0247 (4 HSPs)
scaffold0247 (35-143)||(6449-6557)
scaffold0247 (170-234)||(6561-6625)
scaffold0247 (425-521)||(18050-18148)
scaffold0247 (423-502)||(2195-2275)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (47-206)||(3251-3420)
[»] scaffold0001 (7 HSPs)
scaffold0001 (47-148)||(161072-161173)
scaffold0001 (423-517)||(160688-160784)
scaffold0001 (358-502)||(501100-501246)
scaffold0001 (423-518)||(85646-85742)
scaffold0001 (56-210)||(173587-173742)
scaffold0001 (77-119)||(446965-447007)
scaffold0001 (77-119)||(497896-497938)
[»] scaffold0211 (3 HSPs)
scaffold0211 (45-145)||(28440-28540)
scaffold0211 (169-211)||(28574-28616)
scaffold0211 (449-517)||(28818-28887)
[»] scaffold0150 (3 HSPs)
scaffold0150 (45-149)||(32469-32573)
scaffold0150 (457-517)||(32102-32162)
scaffold0150 (169-211)||(32397-32439)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (32-149)||(9462-9579)
scaffold0475 (169-210)||(9391-9432)
[»] scaffold1984 (2 HSPs)
scaffold1984 (45-218)||(437-620)
scaffold1984 (449-517)||(133-201)
[»] scaffold0023 (12 HSPs)
scaffold0023 (45-148)||(101781-101884)
scaffold0023 (449-521)||(119875-119947)
scaffold0023 (404-517)||(100378-100493)
scaffold0023 (372-518)||(44454-44602)
scaffold0023 (450-517)||(40224-40291)
scaffold0023 (372-518)||(94411-94558)
scaffold0023 (358-502)||(17440-17586)
scaffold0023 (449-517)||(101503-101571)
scaffold0023 (45-107)||(39640-39702)
scaffold0023 (167-211)||(101709-101753)
scaffold0023 (176-210)||(23441-23475)
scaffold0023 (153-210)||(39921-39978)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (317-505)||(26840-27027)
scaffold0215 (56-99)||(27256-27299)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (47-148)||(2277-2378)
scaffold0207 (449-517)||(2694-2762)
[»] scaffold0102 (5 HSPs)
scaffold0102 (45-149)||(19652-19756)
scaffold0102 (449-517)||(19268-19336)
scaffold0102 (169-218)||(19573-19622)
scaffold0102 (45-117)||(48092-48164)
scaffold0102 (175-210)||(48233-48268)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (425-521)||(1092-1190)
scaffold0184 (170-210)||(3993-4033)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (45-150)||(5978-6083)
scaffold0278 (449-502)||(5662-5715)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (32-112)||(10890-10970)
[»] scaffold0010 (7 HSPs)
scaffold0010 (45-210)||(130222-130397)
scaffold0010 (404-502)||(129924-130024)
scaffold0010 (445-505)||(60761-60821)
scaffold0010 (56-210)||(23513-23668)
scaffold0010 (31-145)||(242420-242534)
scaffold0010 (170-211)||(60479-60520)
scaffold0010 (77-143)||(60301-60367)
[»] scaffold0125 (3 HSPs)
scaffold0125 (45-147)||(45420-45522)
scaffold0125 (449-517)||(45841-45909)
scaffold0125 (169-210)||(45555-45596)
[»] scaffold0628 (3 HSPs)
scaffold0628 (45-146)||(2434-2535)
scaffold0628 (404-517)||(2808-2923)
scaffold0628 (169-211)||(2567-2609)
[»] scaffold0621 (5 HSPs)
scaffold0621 (45-150)||(6922-7026)
scaffold0621 (449-521)||(6535-6607)
scaffold0621 (376-502)||(8485-8613)
scaffold0621 (68-119)||(8961-9012)
scaffold0621 (171-211)||(8784-8824)
[»] scaffold0555 (5 HSPs)
scaffold0555 (32-149)||(965-1082)
scaffold0555 (46-124)||(10200-10278)
scaffold0555 (404-521)||(10543-10659)
scaffold0555 (159-206)||(897-944)
scaffold0555 (169-211)||(10305-10347)
[»] scaffold1137 (2 HSPs)
scaffold1137 (47-143)||(1934-2030)
scaffold1137 (169-211)||(2066-2108)
[»] scaffold0138 (6 HSPs)
scaffold0138 (46-150)||(13325-13429)
scaffold0138 (405-521)||(12942-13057)
scaffold0138 (31-145)||(29836-29950)
scaffold0138 (31-145)||(41832-41946)
scaffold0138 (169-210)||(13255-13296)
scaffold0138 (170-210)||(18002-18042)
[»] scaffold1124 (3 HSPs)
scaffold1124 (353-517)||(1881-2045)
scaffold1124 (56-117)||(2291-2352)
scaffold1124 (159-210)||(2187-2238)
[»] scaffold0210 (6 HSPs)
scaffold0210 (317-517)||(21721-21920)
scaffold0210 (317-517)||(29613-29812)
scaffold0210 (56-99)||(21449-21492)
scaffold0210 (159-210)||(21563-21614)
scaffold0210 (56-99)||(29341-29384)
scaffold0210 (159-210)||(29455-29506)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (404-505)||(1048-1151)
[»] scaffold2044 (1 HSPs)
scaffold2044 (33-92)||(1075-1134)
[»] scaffold0333 (6 HSPs)
scaffold0333 (449-521)||(6611-6683)
scaffold0333 (449-521)||(13991-14063)
scaffold0333 (46-150)||(6998-7102)
scaffold0333 (46-150)||(14378-14482)
scaffold0333 (169-207)||(6931-6969)
scaffold0333 (169-207)||(14311-14349)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (449-521)||(6172-6244)
scaffold0243 (57-144)||(5765-5852)
[»] scaffold0020 (5 HSPs)
scaffold0020 (46-150)||(15462-15566)
scaffold0020 (449-521)||(15826-15898)
scaffold0020 (172-210)||(15598-15636)
scaffold0020 (468-502)||(178913-178947)
scaffold0020 (46-99)||(179085-179138)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (358-502)||(4710-4856)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (404-518)||(38704-38820)
[»] scaffold0530 (2 HSPs)
scaffold0530 (449-521)||(1083-1155)
scaffold0530 (57-141)||(671-755)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (66-150)||(43436-43520)
scaffold0116 (66-150)||(47356-47440)
scaffold0116 (169-210)||(43549-43590)
[»] scaffold0029 (6 HSPs)
scaffold0029 (349-421)||(12859-12931)
scaffold0029 (358-501)||(11305-11450)
scaffold0029 (56-117)||(13173-13234)
scaffold0029 (86-144)||(125797-125855)
scaffold0029 (175-210)||(13069-13104)
scaffold0029 (87-144)||(105563-105620)
[»] scaffold0761 (3 HSPs)
scaffold0761 (358-515)||(4300-4459)
scaffold0761 (47-99)||(5943-5995)
scaffold0761 (175-210)||(6082-6117)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (450-517)||(14747-14814)
scaffold0008 (47-118)||(30379-30450)
scaffold0008 (175-210)||(2173-2208)
scaffold0008 (175-210)||(30518-30553)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (349-468)||(15362-15483)
scaffold0107 (33-210)||(15049-15227)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (449-502)||(1101-1154)
[»] scaffold0357 (6 HSPs)
scaffold0357 (404-505)||(13144-13247)
scaffold0357 (423-502)||(16121-16202)
scaffold0357 (450-505)||(2677-2732)
scaffold0357 (172-287)||(15866-15983)
scaffold0357 (77-147)||(13595-13665)
scaffold0357 (75-143)||(3162-3230)
[»] scaffold0476 (5 HSPs)
scaffold0476 (405-521)||(12766-12884)
scaffold0476 (56-118)||(5996-6058)
scaffold0476 (56-118)||(7191-7253)
scaffold0476 (175-210)||(5893-5928)
scaffold0476 (175-210)||(7088-7123)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (425-521)||(11464-11562)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (358-519)||(10772-10935)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (372-518)||(13392-13539)
[»] scaffold0346 (2 HSPs)
scaffold0346 (33-92)||(17343-17402)
scaffold0346 (175-210)||(15394-15429)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (56-210)||(587-742)
scaffold0327 (308-446)||(3434-3574)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (372-518)||(20747-20894)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (372-518)||(37821-37968)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (450-505)||(129021-129075)
scaffold0022 (452-505)||(78338-78391)
scaffold0022 (404-518)||(116430-116544)
scaffold0022 (77-147)||(80726-80796)
scaffold0022 (170-210)||(128735-128775)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (358-518)||(106-268)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (68-150)||(12380-12462)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (448-502)||(25125-25179)
scaffold0123 (77-149)||(25568-25640)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (76-150)||(10913-10987)
scaffold0078 (404-502)||(10546-10646)
scaffold0078 (169-211)||(10842-10884)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (452-505)||(566-619)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (448-505)||(6332-6389)
scaffold0420 (455-505)||(13793-13843)
[»] scaffold0139 (5 HSPs)
scaffold0139 (32-97)||(20418-20483)
scaffold0139 (448-498)||(38339-38389)
scaffold0139 (172-210)||(38634-38672)
scaffold0139 (468-517)||(19980-20029)
scaffold0139 (75-147)||(38761-38833)
[»] scaffold0004 (7 HSPs)
scaffold0004 (32-117)||(70211-70296)
scaffold0004 (86-145)||(58102-58161)
scaffold0004 (56-210)||(10238-10393)
scaffold0004 (440-517)||(69794-69870)
scaffold0004 (175-210)||(70107-70142)
scaffold0004 (68-143)||(332784-332859)
scaffold0004 (317-386)||(69930-70000)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (55-118)||(1307-1370)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (372-518)||(13947-14094)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (68-150)||(7711-7793)
scaffold0507 (402-505)||(8059-8166)
scaffold0507 (169-211)||(7822-7864)
[»] scaffold0525 (3 HSPs)
scaffold0525 (31-144)||(3505-3618)
scaffold0525 (174-211)||(9484-9521)
scaffold0525 (174-210)||(10643-10679)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (31-144)||(14169-14282)
[»] scaffold0216 (3 HSPs)
scaffold0216 (31-144)||(8506-8619)
scaffold0216 (32-96)||(16740-16804)
scaffold0216 (175-210)||(16894-16929)
[»] scaffold0198 (3 HSPs)
scaffold0198 (46-99)||(26834-26887)
scaffold0198 (440-517)||(23843-23919)
scaffold0198 (175-210)||(26712-26747)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (46-99)||(36024-36077)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (46-99)||(36891-36944)
scaffold0131 (468-517)||(36454-36503)
scaffold0131 (175-210)||(36769-36804)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (448-505)||(2691-2748)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (85-150)||(227877-227942)
scaffold0012 (56-210)||(24622-24777)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (52-96)||(18941-18985)
scaffold0280 (135-210)||(19024-19100)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (423-502)||(29948-30028)
[»] scaffold0044 (5 HSPs)
scaffold0044 (423-518)||(40400-40496)
scaffold0044 (56-210)||(19485-19640)
scaffold0044 (175-211)||(62556-62592)
scaffold0044 (175-210)||(13201-13236)
scaffold0044 (75-144)||(8423-8492)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (423-518)||(161156-161252)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (44-143)||(2245-2344)
[»] scaffold0393 (2 HSPs)
scaffold0393 (55-118)||(1904-1967)
scaffold0393 (175-210)||(1801-1836)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (358-519)||(9241-9404)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (450-505)||(97021-97076)
scaffold0006 (450-505)||(106299-106354)
scaffold0006 (172-210)||(97321-97359)
scaffold0006 (172-210)||(106599-106637)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (56-118)||(46370-46432)
[»] scaffold1992 (1 HSPs)
scaffold1992 (47-88)||(239-280)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (56-117)||(891-952)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (56-210)||(18651-18806)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (56-117)||(3254-3315)
scaffold0158 (56-117)||(6920-6981)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (55-96)||(44486-44527)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (31-144)||(37071-37184)
[»] scaffold0017 (7 HSPs)
scaffold0017 (56-210)||(56394-56549)
scaffold0017 (37-117)||(190905-190985)
scaffold0017 (37-117)||(192608-192688)
scaffold0017 (175-211)||(192757-192793)
scaffold0017 (175-210)||(191054-191089)
scaffold0017 (60-92)||(14971-15003)
scaffold0017 (60-92)||(19493-19525)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (448-505)||(267676-267733)
scaffold0005 (75-144)||(307460-307529)
scaffold0005 (68-147)||(268116-268195)
scaffold0005 (170-211)||(267966-268007)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (47-210)||(2099-2262)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (423-518)||(4214-4310)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (358-520)||(12249-12413)
[»] scaffold0412 (2 HSPs)
scaffold0412 (56-96)||(6059-6099)
scaffold0412 (175-210)||(6189-6224)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (32-144)||(10541-10653)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (58-118)||(2240-2300)
scaffold0104 (58-118)||(9922-9982)
scaffold0104 (165-210)||(2137-2182)
scaffold0104 (165-210)||(9819-9864)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (55-118)||(4841-4904)
scaffold0676 (175-210)||(4738-4773)
[»] scaffold0615 (2 HSPs)
scaffold0615 (55-118)||(1726-1789)
scaffold0615 (175-210)||(1857-1892)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (55-118)||(35163-35226)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (33-144)||(9704-9815)
scaffold0013 (175-210)||(2447-2482)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (31-145)||(5427-5541)
[»] scaffold0109 (6 HSPs)
scaffold0109 (86-144)||(27006-27064)
scaffold0109 (47-92)||(45534-45579)
scaffold0109 (68-119)||(35524-35575)
scaffold0109 (175-210)||(45415-45450)
scaffold0109 (56-149)||(10956-11049)
scaffold0109 (56-92)||(38473-38509)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (76-150)||(24182-24256)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (448-502)||(103679-103733)
scaffold0040 (75-147)||(103244-103316)
scaffold0040 (170-211)||(103403-103444)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (56-210)||(226-381)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (55-92)||(830-867)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (31-144)||(478-591)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (47-92)||(747-792)
scaffold0483 (175-210)||(628-663)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (372-518)||(12064-12205)
[»] scaffold0297 (3 HSPs)
scaffold0297 (56-117)||(10464-10525)
scaffold0297 (56-209)||(15322-15476)
scaffold0297 (452-517)||(10575-10639)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (32-145)||(19762-19875)
scaffold0256 (87-150)||(24660-24723)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (56-117)||(18655-18716)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (56-210)||(66069-66224)
scaffold0036 (56-92)||(71210-71246)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (56-92)||(769-805)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (56-96)||(15837-15877)
scaffold0324 (175-210)||(15712-15747)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (56-96)||(6721-6761)
scaffold0311 (175-210)||(6851-6886)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (402-517)||(4804-4921)
[»] scaffold0439 (4 HSPs)
scaffold0439 (175-210)||(2209-2244)
scaffold0439 (175-210)||(10069-10104)
scaffold0439 (55-92)||(2088-2125)
scaffold0439 (55-92)||(9948-9985)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (175-210)||(11677-11712)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (62-145)||(12785-12868)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (68-119)||(589-640)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (175-210)||(18226-18261)
scaffold0174 (55-96)||(18095-18136)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (175-210)||(3304-3339)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (175-210)||(36602-36637)
scaffold0132 (54-92)||(36721-36759)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (175-210)||(8796-8831)
scaffold0111 (65-117)||(32849-32901)
[»] scaffold0101 (3 HSPs)
scaffold0101 (468-515)||(1393-1440)
scaffold0101 (175-210)||(8730-8765)
scaffold0101 (32-117)||(8576-8661)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (68-119)||(29177-29228)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (175-210)||(14983-15018)
scaffold0081 (56-96)||(15107-15147)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (175-210)||(228147-228182)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (77-147)||(7118-7188)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (56-149)||(2258-2351)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (56-94)||(595-633)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (56-118)||(9346-9408)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (91-145)||(17421-17475)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (77-119)||(55271-55313)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (450-500)||(206575-206624)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (476-505)||(1874-1903)
scaffold0737 (170-206)||(1562-1598)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (55-92)||(6923-6960)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (56-149)||(18014-18107)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (56-149)||(12112-12205)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (87-132)||(3148-3193)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (56-117)||(15992-16053)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (174-210)||(338-374)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (170-206)||(326-362)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (56-96)||(1143-1183)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (56-92)||(6543-6579)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (56-92)||(15759-15795)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (88-144)||(3073-3129)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (415-494)||(29117-29198)


Alignment Details
Target: scaffold0456 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 10055 - 10544
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10055 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 10154  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10155 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggggagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 10254  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10255 tgttagattttgcgaccattgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 10354  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10355 ataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatatta 10454  T
Q  432 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10455 ttatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 146)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 20309597 - 20309108
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309597 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctggatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 20309498  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20309497 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgact 20309398  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  20309397 tgttagattttgcgacccttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctga 20309298  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20309297 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 20309198  T
Q  432 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309197 ttatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 37745 - 38235
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37745 cagaaagcatgcaaaatttcgtatttttgacttttgagtggaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaagatgtagg 37844  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  37845 atgagattgaacctggaattaaacttgtgagattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacatagtgact 37944  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37945 tgttagactttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgt 38044  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38045 ataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatatta 38144  T
Q  432 ttatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38145 ttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 23286352 - 23285865
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286352 agagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 23286253  T
Q  133 tgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgactt 232  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23286252 tgagattgaacatggaatgaaaattgtgagattatgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgactt 23286153  T
Q  233 gttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgta 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||     
T  23286152 gttagattttgcgacctttgttgcatgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtt 23286053  T
Q  333 taagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23286052 taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 23285953  T
Q  432 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23285952 ttatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 32 - 518
Target Start/End: Original strand, 298433 - 298933
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  298433 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatatagg 298532  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||          | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298533 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 298632  T
Q  222 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||| |    
T  298633 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatat 298732  T
Q  322 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 420  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| |||||||     
T  298733 gtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgc 298832  T
Q  421 aattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  298833 aattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 298932  T
Q  518 a 518  Q
    |    
T  298933 a 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 23654028 - 23654507
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654028 cagagagcatgcaagatttcataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgactgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 23654127  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||             |||||||||||||||||||||||||||    
T  23654128 atgagattgaacctggaattaaactgttgggattctgacttgaactcgccacggcgagca-------------cgcgagtgacccagaaacagagtgact 23654214  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23654215 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgt 23654314  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 430  Q
     |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23654315 ttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 23654414  T
Q  431 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||   |||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23654415 attatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Original strand, 22737799 - 22738300
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22737799 agagatcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtagga 22737898  T
Q  133 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||| |||           | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22737899 tgagattgaacctagaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgaactgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaa 22737998  T
Q  222 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 321  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  22737999 cagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatct 22738098  T
Q  322 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 420  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  22738099 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 22738198  T
Q  421 aattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  22738199 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 22738296  T
Q  518 atgt 521  Q
    ||||    
T  22738297 atgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Original strand, 22730852 - 22731355
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22730852 agagagcatgcaatatttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 22730951  T
Q  133 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22730952 tgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggggagcaaaggctctcgcctcacgagtcacccagaaa 22731051  T
Q  222 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaaccct-tgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || ||| || | ||||||| |  |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  22731052 cagagtgccttgttaggttttgcgatctttgttgcacgagctgttgataattgaaccttgggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 22731151  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  22731152 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattg 22731251  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  22731252 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgat 22731350  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  22731351 gatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 35 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 23076940 - 23076442
Alignment:
Q  35 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23076940 agagcatgcaagatttcgtgattttgactattaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatg 23076841  T
Q  135 agattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 224  Q
    |||||| ||||||||          | |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23076840 agattggacctggaaagatttagaatgaaactt-tggaattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacag 23076742  T
Q  225 agtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtg 324  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| |||  || || || || | |||||||||||||||||    
T  23076741 agtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggattttatgatgatgttaattataatctgtg 23076642  T
Q  325 aagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaat 423  Q
    ||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| ||| ||| ||| |||    
T  23076641 aagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaat 23076542  T
Q  424 tgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 520  Q
    ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  23076541 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatg 23076443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 23660525 - 23660023
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23660525 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 23660426  T
Q  132 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23660425 atgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactt-ttggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccagaa 23660327  T
Q  221 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 319  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||| | |||| | |||||||||||| | |||||| ||| ||||||| | || | ||||||||||||    
T  23660326 acagagtgccttgttaggtttttgtgacctttattgcacgagttattgagagttgaaccttggggtagtattgagacttattgatgatgttaattataat 23660227  T
Q  320 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 418  Q
     ||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||  ||| |||  |||||||||| ||| ||    
T  23660226 ttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgattt 23660127  T
Q  419 gaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
    | | ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23660126 gcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23660028  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  23660027 gatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 22337617 - 22337115
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337617 agagagcatgcaagatttcgtgattctgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 22337518  T
Q  133 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 222  Q
    |||||||||||||||||          | |||||| | |  |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337517 tgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgagttctgacctgaattcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 22337418  T
Q  223 agagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 321  Q
    |||| | |||||||| |||| | |||||||||||| | |||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  22337417 agagagtcttgttaggtttttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattataattt 22337318  T
Q  322 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 420  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||  |||     
T  22337317 gtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgc 22337218  T
Q  421 aattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    | |||||||||||||||||   |||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22337217 atttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 22337119  T
Q  518 atgt 521  Q
    ||||    
T  22337118 atgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 32 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27754078 - 27753728
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27754078 cagatagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctcaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 27753979  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27753978 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaa 27753879  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | | || ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||     
T  27753878 acagagtgccttgttagattttgcgaccttcgttgcacgagttgtcgagagttgaagcttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataata 27753779  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat 371  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27753778 tgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgat 27753728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 504
Target Start/End: Original strand, 32451562 - 32452033
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  32451562 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacatg 32451661  T
Q  147 gaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 235  Q
    |||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32451662 gaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 32451761  T
Q  236 agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataa 335  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |  || |  ||||||| ||| ||||||||||| ||     
T  32451762 agattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctgt-tat 32451860  T
Q  336 gatatgttgttgatga-ttatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg-ttgatgaattgaaattgatattatt 433  Q
    |  |||||  || ||| |||||||||||||| |||  || |||||||||||||  ||  || |||  | ||||| ||| ||  |||  ||||||||| ||    
T  32451861 gggatgttaatgttgatttatgatgtgatattatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttg-cattgatattgtt 32451959  T
Q  434 atgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 504  Q
    ||||||||   || ||| || ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32451960 atgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 220 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 23060815 - 23060513
Alignment:
Q  220 aacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 319  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||||  | |||||| |||  |||||||| || | ||||||||||||    
T  23060815 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgtt-cacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 23060717  T
Q  320 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 418  Q
     ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||||||| ||| ||    
T  23060716 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgactt 23060618  T
Q  419 gaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23060617 gcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 23060519  T
Q  516 tgatgt 521  Q
    ||||||    
T  23060518 tgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 139
Target Start/End: Original strand, 28291920 - 28292027
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  28291920 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaagaatgattaggaaagaatgtaga 28292019  T
Q  132 atgagatt 139  Q
    ||||||||    
T  28292020 atgagatt 28292027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 404 - 521
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23103497  T
Q  503 atgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23103498 atgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 145
Target Start/End: Original strand, 22133848 - 22133948
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  22133848 agatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 22133947  T
Q  145 t 145  Q
    |    
T  22133948 t 22133948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 210
Target Start/End: Original strand, 23071614 - 23071768
Alignment:
Q  65 ttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg----------gaattaaa 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          |||| |||    
T  23071614 ttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaa 23071713  T
Q  155 cttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
     ||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23071714 atttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 23071768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 502
Target Start/End: Original strand, 23708383 - 23708721
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgctcaagttgtc 266  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| || | ||||||     
T  23708383 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttacccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgtt 23708481  T
Q  267 gagagttgaacccttgggtaggatt-aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt-ataagatatgttgttgatgattatgatgtgata 364  Q
    || ||||||||| | |||| | | | |||| ||  | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| || || |||| ||||||||    
T  23708482 gatagttgaaccttggggtcgtaatgaaga-ttgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgata 23708580  T
Q  365 taatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgt 461  Q
    ||||  | |||||||||||||||  ||||||| ||   | |||||| ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||    
T  23708581 taattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgt 23708680  T
Q  462 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708681 tgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaag 23708721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25176331 - 25176227
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||  |||||||||||||    
T  25176331 gatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaaggttggagattgagattgaacct 25176232  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  25176231 ggaat 25176227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22105560 - 22105412
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  22105560 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 22105461  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22105460 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072070
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 317 - 517
Target Start/End: Original strand, 40622123 - 40622327
Alignment:
Q  317 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatt-----tgtatacataagatgttg 411  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  40622123 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacataagatgttg 40622221  T
Q  412 atgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 509  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |    
T  40622222 atgaattg-aattgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatta 40622319  T
Q  510 agatgatg 517  Q
    ||||||||    
T  40622320 agatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 405 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 7679702 - 7679589
Alignment:
Q  405 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7679702 gatgttgatgactt-acattgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 7679604  T
Q  503 atgttgaagatgatg 517  Q
     || | |||||||||    
T  7679603 ttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 404 - 505
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7838
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  502 gatg 505  Q
    ||||    
T  7835 gatg 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 445 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946657
Alignment:
Q  445 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28406436 - 28406368
Alignment:
Q  78 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  28406436 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagattggagaatgagattgaacctg 28406368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 19671928 - 19671830
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19671928 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 26505526 - 26505379
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||    
T  26505526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26505428  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26505427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 26508004 - 26507857
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||    
T  26508004 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26507906  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26507905 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 449 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405981
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207293
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 23207293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 372 - 515
Target Start/End: Original strand, 21155075 - 21155219
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21155075 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21155173  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  21155174 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 457 - 521
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  457 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175854
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 520
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 520  Q
    || | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  32215021 gc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 18809090 - 18808943
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18809090 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18808992  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18808991 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 449 - 520
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134326
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 520  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Original strand, 23100849 - 23100916
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  23100849 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaacctcagatgtttttaagtgcctgaa 23100916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 23131009 - 23130862
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23131009 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23130911  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23130910 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 23133476 - 23133329
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23133476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23133378  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23133377 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 23135737 - 23135590
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23135737 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23135639  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23135638 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 23709547 - 23709694
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23709547 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23709645  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23709646 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 23712028 - 23712175
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23712028 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23712126  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23712127 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 34402537 - 34402684
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34402537 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34402635  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34402636 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 39682460 - 39682313
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  39682460 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39682362  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39682361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 22460844 - 22460999
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  22460844 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 22460942  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22460943 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22460999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 571493 - 571397
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  571493 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 6726091 - 6725995
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6726091 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520298
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20520298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 24367921 - 24367790
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24367921 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24367823  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367822 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24367790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 45029869 - 45030016
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||  | ||||| ||||    
T  45029869 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgttgtt 45029967  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45029968 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24503587 - 24503473
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24503587 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 24503488  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  24503487 gacaagattgaacct 24503473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 43137395 - 43137301
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43137395 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 502
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18787005
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 505
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413243
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22413243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 24658116 - 24658055
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  24658116 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 24658055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 19928156 - 19928311
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  19928156 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 19928254  T
Q  156 tt-gt-gggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    || || |||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19928255 ttagtcgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19928311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 24898210 - 24898358
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24898210 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24898308  T
Q  469 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24898309 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 24900693 - 24900841
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24900693 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24900791  T
Q  469 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24900792 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 24903170 - 24903318
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24903170 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24903268  T
Q  469 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24903269 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 24905647 - 24905795
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24905647 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24905745  T
Q  469 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24905746 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 24908122 - 24908270
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24908122 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24908220  T
Q  469 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24908221 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 147
Target Start/End: Original strand, 25963359 - 25963451
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  || ||| ||||||||||||||||    
T  25963359 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacctgg 25963451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 209
Target Start/End: Original strand, 22133977 - 22134020
Alignment:
Q  166 ctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133977 ctgaactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 22134020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004764
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 23004764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108903
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 25108903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 32039513 - 32039660
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||| |||||    
T  32039513 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt 32039611  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  32039612 -gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 22811553 - 22811639
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22811553 cagagagcatgttaaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttaggtgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 22811639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 117
Target Start/End: Original strand, 22740579 - 22740664
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||||| ||||||  ||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  22740579 cagagagcatgtaagattatgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 22740664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 117
Target Start/End: Original strand, 22758334 - 22758419
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||||| ||||||  ||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  22758334 cagagagcatgtaagattatgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 22758419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 27263703 - 27263610
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |  |||||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  27263703 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa 27263610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287378
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 23287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 23708252 - 23708328
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag 123  Q
    |||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||    
T  23708252 atttcgtagttttgacccttgagttgatctttagatgtttttgagtgtctgaacatatgtattaatgattaggaaag 23708328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Original strand, 24529595 - 24529691
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24529595 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 459 - 515
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643109
Alignment:
Q  459 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12829545 - 12829434
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  12829545 agagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 12829446  T
Q  133 tgagattgaacc 144  Q
    | ||||||||||    
T  12829445 tcagattgaacc 12829434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Original strand, 21917958 - 21918021
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21917958 attttgacttttgagtttaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 21918021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791289
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 23791289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 451 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392397
Alignment:
Q  451 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 26392397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 37525141 - 37525078
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  37525141 attttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 37525078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15478081 - 15477901
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||| ||||||||  ||| | ||||||||| | ||||||||    
T  15478081 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgtctgaacatacctagttatgattagggatgaatgtag 15477982  T
Q  131 gatgagattgaacctggaattaaacttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |   ||||||||||| |||  || |||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15477981 ggcaagattgaacctagaac-aatcttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15477901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 144
Target Start/End: Original strand, 21138903 - 21139013
Alignment:
Q  34 gagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||     
T  21138903 gagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtatgac 21139002  T
Q  134 gagattgaacc 144  Q
     ||||||||||    
T  21139003 aagattgaacc 21139013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 22798769 - 22798831
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22798769 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 22798831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28406335 - 28406297
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28406335 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 28406297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 123
Target Start/End: Original strand, 39827602 - 39827648
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39827602 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaag 39827648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 402 - 494
Target Start/End: Original strand, 22799126 - 22799220
Alignment:
Q  402 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 494  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||   |||||||   ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  22799126 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 24716175 - 24716339
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag-gaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||| | | || | ||  | ||||||||||||    
T  24716175 atttcgtaatctggacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagaggatgact-taaaacgagattgaacct 24716273  T
Q  146 ggaattaaacttgtggga-ttctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||| |    ||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24716274 ggaataaccaatgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24716339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25176199 - 25176158
Alignment:
Q  168 gacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25176199 gacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 25176158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 402 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 25616306 - 25616204
Alignment:
Q  402 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 498  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  25616306 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gtaatttaactaagttgcatgagtcagtc 25616208  T
Q  499 taag 502  Q
    ||||    
T  25616207 taag 25616204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23207812 - 23207744
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  23207812 ttagatgattatgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 23207744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 96
Target Start/End: Original strand, 24654996 - 24655032
Alignment:
Q  60 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24654996 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 24655032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31756268 - 31756232
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31756268 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 31756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 40428936 - 40428892
Alignment:
Q  48 tttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40428936 tttcgtgttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 40428892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Original strand, 45677798 - 45677838
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  45677798 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 45677838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 21918089 - 21918124
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21918089 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21918124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Original strand, 22740717 - 22740768
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22740717 tgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22740768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 22798899 - 22798934
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22798899 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22798934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23171460 - 23171413
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  23171460 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 23171413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23582717 - 23582670
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  23582717 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 23582670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24175143 - 24175108
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24175143 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24175108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 24655112 - 24655147
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24655112 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24655147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697712
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatg 24697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 25961308 - 25961343
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25961308 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 25961343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Original strand, 25963474 - 25963525
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25963474 tggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 25963525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37525010 - 37524975
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37525010 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 37524975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 40621981 - 40622016
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40621981 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 40622016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Original strand, 44369918 - 44369985
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  44369918 cagagagcatgttggatttcgtgattttaagctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 44369985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Original strand, 22412722 - 22412792
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  22412722 ttagatgattctgagtgcctgaacatgtatgataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 22412792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23005263 - 23005221
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23005263 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 23005221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 448
Target Start/End: Original strand, 23019706 - 23019752
Alignment:
Q  402 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 448  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23019706 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgttgttgt 23019752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23038518 - 23038468
Alignment:
Q  49 ttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  23038518 ttcgtaattttgacttttgagatgaaccttagatgttgttgagtgcctgaa 23038468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23791629 - 23791591
Alignment:
Q  172 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23791629 tgaactcgccatcgcgagtagaggctctcgcctcgcgag 23791591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26125655 - 26125562
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |  ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  26125655 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactaatgattagggaacgaatg-agaatgagattgaacctggaa 26125562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27197302 - 27197248
Alignment:
Q  91 gtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  27197302 gtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 27197248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 34137454 - 34137412
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34137454 ttagatggttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 34137412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 21146918 - 21147031
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||| ||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  21146918 gcagagagcttgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctggacatacctagtaatgattatgaatgaatgtag 21147017  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    ||  ||||||||||    
T  21147018 gacaagattgaacc 21147031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Original strand, 21238877 - 21238914
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21238877 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 21238914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Original strand, 21241427 - 21241464
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21241427 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 21241464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 211
Target Start/End: Original strand, 22412900 - 22412941
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22412900 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagt 22412941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 23101005 - 23101038
Alignment:
Q  177 tcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23101005 tcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23101038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23187527 - 23187372
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || ||||||| |||  || ||| | |||||||||||| |||  || |    
T  23187527 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagtaaatgatttagaacgagattgaacctagaa-caacc 23187429  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||| |||||| | |  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23187428 ttagttggaattctggcttatactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 23187372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23207634 - 23207593
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23207634 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagt 23207593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23598790 - 23598635
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || ||||||| |||  || ||| | |||||||||||| |||  || |    
T  23598790 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagaaaatgatttagaacgagattgaacctagaa-caacc 23598692  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||| |||||| | |  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23598691 ttagttggaattctggcttatactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 23598635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24505052 - 24505015
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24505052 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 24505015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24673920 - 24673887
Alignment:
Q  177 tcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24673920 tcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24673887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Original strand, 30970608 - 30970709
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  30970608 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 30970707  T
Q  131 ga 132  Q
    ||    
T  30970708 ga 30970709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31503949 - 31503912
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31503949 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 31503912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31506515 - 31506478
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31506515 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 31506478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 93
Target Start/End: Original strand, 40621851 - 40621888
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtg 93  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  40621851 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 40621888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 116
Target Start/End: Original strand, 7330 - 7378
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatt 116  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  7330 agttgatctttagatgattctgagtgcctgaacaagtataataatgatt 7378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 18786667 - 18786707
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18786667 cctgaacttgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 18786707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 211
Target Start/End: Original strand, 22459327 - 22459367
Alignment:
Q  171 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22459327 ctgaactcgccatagcgagtagaggctcttgcctcgcgagt 22459367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23038107 - 23038048
Alignment:
Q  440 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 500  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23038107 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 24175259 - 24175227
Alignment:
Q  60 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24175259 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 24175227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24674052 - 24674012
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  24674052 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttaagtgcct 24674012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 24870339 - 24870307
Alignment:
Q  60 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24870339 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 24870307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26125535 - 26125503
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26125535 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 26125503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 29233992 - 29233904
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  29233992 agattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 29233904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 29347291 - 29347203
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  29347291 agattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 29347203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37318700 - 37318652
Alignment:
Q  83 gcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37318700 gcttatgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 37318652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41667281 - 41667249
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41667281 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 41667249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 41667401 - 41667365
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41667401 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 41667365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 41684531 - 41684567
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41684531 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 41684567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44621278 - 44621242
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44621278 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 44621242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 32553 - 32067
Alignment:
Q  35 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 134  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  32553 agagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgactaggaaagaatgtgggatg 32454  T
Q  135 agattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  32453 agattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacttgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagttactttt 32354  T
Q  235 tagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtata 334  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32353 ttgattttgcgacctttgttgctctagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtata 32254  T
Q  335 agatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattatta 434  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32253 agatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattatta 32154  T
Q  435 tgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32153 tgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 681 - 1170
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  681 cagagagcattcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 780  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  781 atgagattgaacctggaattaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaacccagaaacagagtgact 880  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  881 tgttagattttgcaacctttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgt 980  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  981 ataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataa 1080  T
Q  432 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1081 ttatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 196)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 40443880 - 40443393
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40443880 cagaaagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagg 40443781  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443780 atgagattgaacctggaattaa-cttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 40443682  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    | || |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40443681 tattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgt 40443582  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443581 ataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatatta 40443482  T
Q  432 ttatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    |||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443481 ttatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 27847462 - 27847951
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27847462 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatttagg 27847561  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27847562 atgagattgaacctggaattaaacttatgggattttgacctgaactcgccacggcaagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgact 27847661  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||     
T  27847662 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctga 27847761  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27847762 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 27847861  T
Q  432 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847862 ttatgtcatactgttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 16385876 - 16386369
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385876 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 16385975  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385976 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagtggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 16386075  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16386076 tgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtccagagttgaacctttgggtaacattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgt 16386175  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 430  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  | | |||| |||  ||||||||||||||| |  |||||||||     
T  16386176 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatata 16386275  T
Q  431 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
     |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16386276 tttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 9509692 - 9509189
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509692 cagagagcatgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 9509593  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509592 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgaggagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 9509493  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  9509492 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatc 9509393  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  9509392 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 9509293  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9509292 caattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 9509194  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  9509193 gatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 12699335 - 12698831
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12699335 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 12699236  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    |||| |||||||||||||           | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12699235 atgaaattgaacctggaaagattgttgaatgaaactcgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcacctcgtgagtgacccagaa 12699136  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |  | |||||||||||||    
T  12699135 acaaagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgatagttgaaccttggggtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatc 12699036  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  12699035 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 12698936  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
     ||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12698935 caattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 12698837  T
Q  516 tgatgt 521  Q
    ||||||    
T  12698836 tgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 26212488 - 26211995
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  26212488 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggtaagaatgtagg 26212389  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag-aaacagagtgac 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  26212388 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgat 26212289  T
Q  231 ttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 330  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  26212288 ttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctg 26212190  T
Q  331 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatat 429  Q
    | |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26212189 tttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatat 26212090  T
Q  430 tattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag-atgatgatgt 521  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26212089 tattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 38227982 - 38227481
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38227982 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaa 38227883  T
Q  133 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 222  Q
    |||||||||||||||||          | |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38227882 tgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccataaac 38227783  T
Q  223 agagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 321  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  38227782 agagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatat 38227683  T
Q  322 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 420  Q
    |||||| | | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||     
T  38227682 gtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgc 38227583  T
Q  421 aattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  38227582 atttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatga 38227484  T
Q  519 tgt 521  Q
    |||    
T  38227483 tgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 32 - 518
Target Start/End: Original strand, 3563982 - 3564482
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3563982 cagagagcttgcaagatttcgttattttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 3564081  T
Q  132 atgagattgaacctgga----------attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||||||||||||||||          | | ||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3564082 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacagcgagcaaatgctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 3564181  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| |    
T  3564182 cagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacc 3564281  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    | ||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||     
T  3564282 tatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgactta 3564381  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3564382 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3564480  T
Q  517 ga 518  Q
    ||    
T  3564481 ga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 176 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 10589386 - 10589039
Alignment:
Q  176 ctcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttga 275  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||     
T  10589386 ctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttttttgcacgagttgtctagagttgg 10589287  T
Q  276 acccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg 375  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10589286 acctttgggtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatg 10589187  T
Q  376 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 472  Q
    |||| ||||||||||||||| | |   ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10589186 cattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctg-ttgtt 10589088  T
Q  473 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  10589087 atttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 502
Target Start/End: Original strand, 15143654 - 15144139
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgactttt-gagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15143654 cagagaacttgcgagatttcgtgattttgactttttgagttgtaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattttag 15143753  T
Q  131 gatgagattgaacctggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
     ||||||||||||||||||     |||     ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15143754 aatgagattgaacctggaaagattttagaatgaacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaa 15143853  T
Q  221 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 319  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||   |||||| | ||||||||||| || | ||| | ||||||    
T  15143854 acagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagttgaacctcggggtagtactaagacttaatgatgatgtttaatataat 15143953  T
Q  320 ctgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaat 417  Q
    |||| |||||| | |||||| | |||    ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| ||  ||   ||||||| | |||||||| ||  |    
T  15143954 ctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggct 15144053  T
Q  418 tgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    || | |||||||||| || ||    |||| ||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144054 tgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactg-agatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15144139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 518
Target Start/End: Original strand, 17061593 - 17062077
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17061593 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 17061692  T
Q  147 -----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 235  Q
               |||| |||||| || || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||| || ||||||    
T  17061693 gatagattttagaataaaactt-tgagaatctgacctgaactcgcgatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatg-cttgtt 17061790  T
Q  236 --agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtag-gattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg-t 331  Q
       |||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||| | ||||||  || || | |||   ||||  ||||| || ||||||||||||| |    
T  17061791 taggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccatggggtagttatgaata-ttacatataatattaataatgatctgtgaagctgat 17061889  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 430  Q
     || |||   ||| || || ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| |  |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||    
T  17061890 ttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatatt 17061988  T
Q  431 attatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||||||   | |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17061989 attatgtcatgctattttgtatactg-ctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Original strand, 2831924 - 2832110
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2831924 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 2832023  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||| |||    |||     |||||  | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2832024 atgagattgaacctagaaagacttagaatgaactttggagaatctga-ctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 2832110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 309 - 518
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  309 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  408 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  506 ttgaagatgatga 518  Q
     | ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Original strand, 9751168 - 9751355
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9751168 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 9751267  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||| ||||||||||||          | ||||||  | || | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9751268 atgaggttgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatttgac-tgaactcgccatggtgagcagaggctctcgcctcgcgag 9751355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Original strand, 28504919 - 28505106
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28504919 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 28505018  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||          |||| ||| ||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505019 atgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 28505106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 206
Target Start/End: Original strand, 39267264 - 39267447
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39267264 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 39267363  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 206  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39267364 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 39267447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44116992 - 44116816
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc-- 144  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  44116992 atttcgtaattttgactcttgagttgatccttatatgcctttgagtccctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacccg 44116893  T
Q  145 --------tggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgac 214  Q
            | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116892 gaaagatttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgac 44116816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 12756350 - 12756523
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12756350 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 12756449  T
Q  147 ga---------attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||         | | ||||| | |||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12756450 gattatttaagaatgaactttttggaagctgacctgaactcaccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 12756523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18302681 - 18302494
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18302681 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggaaagaatgtagg 18302582  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18302581 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggataatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 18302494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Original strand, 15754505 - 15754622
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15754505 cagagagcatgcaagatttcgaatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtaga 15754604  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15754605 atgagattgaacctggaa 15754622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34201286 - 34201099
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||     
T  34201286 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgatcaagaaagaatttaga 34201187  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||          |||| ||| ||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34201186 atgagattgaacctgtaaagacttagaatgaaaatttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 34201099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 44014664 - 44014560
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  44014664 agatttcgtaattttgacttttgagttgatacttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 44014565  T
Q  145 tggaa 149  Q
    |||||    
T  44014564 tggaa 44014560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Original strand, 810760 - 810864
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  810760 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaataagattgaacc 810859  T
Q  145 tggaa 149  Q
    |||||    
T  810860 tggaa 810864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 124
Target Start/End: Original strand, 11995676 - 11995768
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995676 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 11995768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 68236 - 68061
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  68236 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgttttcgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacc 68137  T
Q  145 tggaat----------taaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||           |||||||||||| |   |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  68136 tggaataatttaagaacaaacttgtgggagttacagatgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 68061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 16495500 - 16495402
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495500 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505419
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 34200884 - 34200786
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200884 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 372 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 13647476 - 13647325
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  13647476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 13647377  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13647376 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18006131 - 18006052
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18006131 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaaga 18006052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 352 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  352 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---g 447  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  ||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16213752 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 317 - 517
Target Start/End: Original strand, 17137978 - 17138177
Alignment:
Q  317 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 416  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17137978 aatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 17138076  T
Q  417 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 514  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  17138077 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 17138174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67745
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 47832297 - 47832193
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||    
T  47832297 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattaagattgaatct 47832198  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  47832197 ggaat 47832193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 426 - 521
Target Start/End: Original strand, 11996051 - 11996148
Alignment:
Q  426 atattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11996051 atattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 402 - 521
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219835
Alignment:
Q  402 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 499  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  500 aagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  16219817 aa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16324495 - 16324391
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  16324495 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttgaatgtttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagtttgagattgaacct 16324396  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  16324395 ggaat 16324391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 317 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 12187218 - 12187019
Alignment:
Q  317 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 416  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||   | ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12187218 aatctgtgaagctg-ataagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 12187120  T
Q  417 ttgaaattgatattattatgtcatg-ttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 512  Q
    ||| ||||| ||| ||||  ||||| |||   |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||    
T  12187119 ttg-aattggtataatta--tcatgattgtaattgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaaga 12187024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 404 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 500  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T
Q  501 agatgttgaagatgatga 518  Q
    || || | ||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 24704832 - 24704688
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 471  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||||||||| ||    
T  24704832 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gt 24704735  T
Q  472 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24704734 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811248
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014182
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 15754910 - 15755008
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15754910 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Original strand, 19649103 - 19649170
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19649103 cagagagcatgcaagatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 19649170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 24702385 - 24702238
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24702385 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24702287  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24702286 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 18430859 - 18430709
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||  | ||||||||||    
T  18430859 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt 18430761  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18430760 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 150
Target Start/End: Original strand, 21064780 - 21064898
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||  | |||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||     
T  21064780 cagagagcttgcaagattttgtgattttgagctgtgagtttaaccttagatgtttatgagggcctgaacatgtacaataatgattaggaaatattttaga 21064879  T
Q  132 atgagattgaacctggaat 150  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  21064880 atgagattgaacttggaat 21064898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 502
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280221
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 2280220  T
Q  502 g 502  Q
    |    
T  2280221 g 2280221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Original strand, 16219348 - 16219452
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  16219348 gatttcataattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctaaacttgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacct 16219447  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  16219448 ggaat 16219452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 44116605 - 44116509
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44116605 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 456468 - 456321
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  456468 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 456370  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  456369 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 2760613 - 2760542
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  2760613 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattag 2760542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 3272273 - 3272202
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  3272273 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattag 3272202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 11972643 - 11972496
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  11972643 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11972545  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11972544 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 14949137 - 14949284
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  14949137 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 14949235  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14949236 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 15376728 - 15376875
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15376728 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15376826  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15376827 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056347
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16232667 - 16232520
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  16232667 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16232569  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16232568 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 18640419 - 18640272
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18640419 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18640321  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18640320 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 20385138 - 20385285
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20385138 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20385236  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20385237 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 21189610 - 21189757
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21189610 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21189708  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21189709 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 24275318 - 24275187
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  24275318 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 24275220  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275219 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 32125638 - 32125491
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  32125638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 32125540  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32125539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 41523064 - 41522917
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  41523064 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41522966  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41522965 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 41525526 - 41525379
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  41525526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41525428  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41525427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 403 - 468
Target Start/End: Original strand, 2530139 - 2530205
Alignment:
Q  403 aagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  2530139 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgttgcctatgttgctgtt 2530205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 150
Target Start/End: Original strand, 9389337 - 9389431
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  9389337 ttttgacttttaagttgaaccttggatgtttttgagtgtctggacttgtataatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaat 9389431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 372 - 517
Target Start/End: Original strand, 11393302 - 11393448
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  11393302 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11393400  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  11393401 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Original strand, 44407988 - 44408102
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||| ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44407988 gcagagagcatgtaagattttgaaatttcgactttttagttgaaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 44408087  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  44408088 gacaagattgaacct 44408102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 211
Target Start/End: Original strand, 12255454 - 12255598
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat----------taaacttgtgggattc 166  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||          | || || ||||| |     
T  12255454 ttagatgattttgagtgcttgaacatgtataataatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatgaatttttgggagtt 12255553  T
Q  167 tgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
      ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12255554 acacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 12255598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22073376 - 22073223
Alignment:
Q  75 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----ttaa------acttgtgggat 164  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||    ||||      | || |||||     
T  22073376 ccttagaggtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctagaatagtttaagaatggatttttgggag 22073277  T
Q  165 tctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 218  Q
    |   ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22073276 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttacccag 22073223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 24054969 - 24054884
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  24054969 cagagtgcatgcaagattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 24054884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16410155 - 16410059
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16410155 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 453 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 22072981 - 22072913
Alignment:
Q  453 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  22072981 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 10063841 - 10063939
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||    
T  10063841 gatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27217007 - 27216860
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  27217007 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 27216909  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  27216908 -gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 146
Target Start/End: Original strand, 2279772 - 2279850
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  2279772 agttgatatttagatgattttgagtgcctgaacatgcataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctg 2279850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14953674 - 14953560
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14953674 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14953575  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  14953574 gacaagattgaacct 14953560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26420454 - 26420340
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26420454 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 26420355  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  26420354 gacaagattgaacct 26420340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901342
Alignment:
Q  445 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 12901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13149606 - 13149451
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  13149606 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 13149508  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13149507 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 13149451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 99
Target Start/End: Original strand, 18154469 - 18154522
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18154469 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 18154522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 13869442 - 13869346
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13869442 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044765
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14044765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354795
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14354795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16056684 - 16056616
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag 237  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||    
T  16056684 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgccttgttag 16056616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386333
Alignment:
Q  459 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 19486767 - 19486865
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  19486767 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220293
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatg 20220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Original strand, 810894 - 810936
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  810894 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 810936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 448 - 502
Target Start/End: Original strand, 1868043 - 1868097
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868043 tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 445 - 499
Target Start/End: Original strand, 12255838 - 12255892
Alignment:
Q  445 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 499  Q
    ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255838 ttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14959640 - 14959526
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| |||||||    |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14959640 gcagagagcatgtaagatttttcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14959541  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  14959540 gacaagattgaacct 14959526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 17137706 - 17137768
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  17137706 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 17137768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 502
Target Start/End: Original strand, 18154882 - 18154943
Alignment:
Q  440 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18154882 tgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 18154943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6801664 - 6801509
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| |  |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  6801664 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctacttttgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 6801566  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||||| || | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6801565 ttagttgggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 6801509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Original strand, 10508725 - 10508786
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  10508725 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 10508786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 11880729 - 11880668
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  11880729 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 11880668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12187490 - 12187429
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  12187490 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 12187429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 426 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 13831466 - 13831373
Alignment:
Q  426 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  13831466 atattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 505
Target Start/End: Original strand, 15008547 - 15008604
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15008547 tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 15008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26292847 - 26292692
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  || |    
T  26292847 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caacc 26292749  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26292748 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgag 26292692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991196
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgatccaagatg 48991196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 119
Target Start/End: Original strand, 2529631 - 2529682
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2529631 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 2529682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 210
Target Start/End: Original strand, 9389462 - 9389501
Alignment:
Q  171 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9389462 ctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 9389501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 210
Target Start/End: Original strand, 11995796 - 11995835
Alignment:
Q  171 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11995796 ctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgag 11995835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15211903 - 15211844
Alignment:
Q  58 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  15211903 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttataaatgatta 15211844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Original strand, 16438792 - 16438843
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16438792 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16438843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Original strand, 17137820 - 17137871
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17137820 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17137871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14149046 - 14148932
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| |||||||    |||| ||||||| |||||  ||||   ||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14149046 gcagagagcatgtaagatttttcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14148947  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  14148946 gacaagattgaacct 14148932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16056795 - 16056713
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    |||||| | |||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  16056795 agttgagctttaggtgattttgtgtacctgaacatgtataataatgaataggaaagattttagattgagattgaacctggaat 16056713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Original strand, 20702651 - 20702733
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20702651 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 20702733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32768120 - 32768038
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32768120 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 32768038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 4318174 - 4318287
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||  ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  4318174 gcagagagcatgttagattttgtattttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatggatgtag 4318273  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    ||  ||||||||||    
T  4318274 gacaagattgaacc 4318287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11262804 - 11262691
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   |||  |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11262804 cagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgccattgaatgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 11262705  T
Q  132 atgagattgaacct 145  Q
    |  |||||||||||    
T  11262704 acaagattgaacct 11262691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 11547953 - 11548010
Alignment:
Q  88 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  11547953 tgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaaaagattgaacct 11548010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 11554549 - 11554606
Alignment:
Q  88 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  11554549 tgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaaaagattgaacct 11554606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14045281 - 14045212
Alignment:
Q  78 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  14045281 tagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 14045212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14355311 - 14355242
Alignment:
Q  78 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  14355311 tagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 14355242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 14430356 - 14430315
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14430356 attttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgcct 14430315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 42205567 - 42205530
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42205567 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 42205530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44014530 - 44014489
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  44014530 acctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 44014489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 4993989 - 4993917
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 104  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  4993989 cagagagcttgcaagatctcgtgattttgagctgtgagtttaaccttagatgtttatgagggcctgaacatgt 4993917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 8917878 - 8917842
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8917878 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 8917842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 9703743 - 9703703
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9703743 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 9703703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 13462213 - 13462177
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13462213 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 13462177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15581144 - 15581108
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15581144 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15581108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 15604926 - 15604962
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15604926 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15604962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 9445932 - 9445967
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9445932 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 9445967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9593797 - 9593642
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||  |       
T  9593797 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaacgacct 9593698  T
Q  156 ttg-tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    | | ||| | |||| | || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9593697 tagttggaaatctggcttgtactcgccatagcgagcagatgctctcgcctcgcgag 9593642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9644760 - 9644605
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||  |       
T  9644760 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaacgacct 9644661  T
Q  156 ttg-tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    | | ||| | |||| | || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9644660 tagttggaaatctggcttgtactcgccatagcgagcagatgctctcgcctcgcgag 9644605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9703613 - 9703578
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9703613 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 9703578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 10508855 - 10508890
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10508855 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 10508890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 133
Target Start/End: Original strand, 11238655 - 11238702
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  11238655 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 11238702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12187376 - 12187325
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12187376 tgggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12187325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 12321515 - 12321550
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12321515 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12321550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12692917 - 12692858
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  12692917 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtcggacaagattgaacct 12692858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 12901852 - 12901793
Alignment:
Q  88 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  12901852 tgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 12901793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14430225 - 14430190
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14430225 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 14430190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 517
Target Start/End: Original strand, 14932747 - 14932851
Alignment:
Q  415 aattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 511  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||  || |||||| | ||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || | |||    
T  14932747 aattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctact-attgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaag 14932845  T
Q  512 atgatg 517  Q
    ||||||    
T  14932846 atgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 517
Target Start/End: Original strand, 15356182 - 15356286
Alignment:
Q  415 aattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 511  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||  || |||||| | ||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || | |||    
T  15356182 aattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctact-attgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaag 15356280  T
Q  512 atgatg 517  Q
    ||||||    
T  15356281 atgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 517
Target Start/End: Original strand, 15360296 - 15360400
Alignment:
Q  415 aattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 511  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||  || |||||| | ||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || | |||    
T  15360296 aattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctact-attgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaag 15360394  T
Q  512 atgatg 517  Q
    ||||||    
T  15360395 atgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15581023 - 15580988
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15581023 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15580988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 211
Target Start/End: Original strand, 16219484 - 16219523
Alignment:
Q  172 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16219484 tgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagt 16219523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Original strand, 16724393 - 16724440
Alignment:
Q  163 attctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16724393 attctggcttgaactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 16724440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Original strand, 17701407 - 17701454
Alignment:
Q  163 attctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17701407 attctggcttgaactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 17701454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 18154609 - 18154644
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18154609 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18154644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18557303 - 18557268
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18557303 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18557268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 20569370 - 20569405
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20569370 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20569405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 48593230 - 48593265
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48593230 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 48593265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 143
Target Start/End: Original strand, 9177252 - 9177318
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  9177252 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattaggtaagtttttagattgagattgaac 9177318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 452 - 506
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177772
Alignment:
Q  452 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 506  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatgt 9177772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 119
Target Start/End: Original strand, 11768526 - 11768568
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11768526 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 11768568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 12321385 - 12321447
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12321385 ttttgacttttgagttgaaccttagacgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 12321447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15113296 - 15113258
Alignment:
Q  173 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15113296 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 15113258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16275943 - 16275850
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||||||    
T  16275943 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagggaacgaatg-gggatgatattgaacctggaa 16275850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Original strand, 21064927 - 21064969
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21064927 accttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgtgagt 21064969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 145
Target Start/End: Original strand, 25038895 - 25038953
Alignment:
Q  87 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  25038895 ttgagtgcctgaacatacctagaaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 25038953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35366727 - 35366609
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |  | |||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||||   | |||||||||| ||   | |||     
T  35366727 cagagagcttgcaagatttcgtgtttttaagctgtgagtttaaccttggatgtttttgagggcctgaacatgtactacaatgattaggcaaagttttaga 35366628  T
Q  132 atgagattgaacctggaat 150  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  35366627 atgagattgaacttggaat 35366609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 468 - 502
Target Start/End: Original strand, 38898489 - 38898523
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38898489 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 38898523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 18712 - 18867
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | |||||||||  |||||  || |    
T  18712 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaaattggaa-caacc 18810  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18811 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgag 18867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 144
Target Start/End: Original strand, 70438 - 70507
Alignment:
Q  75 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  70438 ccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 70507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 144
Target Start/End: Original strand, 74546 - 74615
Alignment:
Q  75 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  74546 ccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 74615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 1867650 - 1867719
Alignment:
Q  78 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  1867650 tagatgttttttagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 1867719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Original strand, 6016800 - 6016901
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  6016800 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 6016899  T
Q  131 ga 132  Q
    ||    
T  6016900 ga 6016901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 14194766 - 14194729
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatg 83  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14194766 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatg 14194729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 133
Target Start/End: Original strand, 14655082 - 14655147
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||||| ||||  |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  14655082 agttgaaccttgcatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 14655147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 118
Target Start/End: Original strand, 15008107 - 15008148
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15008107 ttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattag 15008148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 211
Target Start/End: Original strand, 15008263 - 15008304
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15008263 cctgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 15008304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16006768 - 16006731
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16006768 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 16006731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18531665 - 18531608
Alignment:
Q  87 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  18531665 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacc 18531608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 517
Target Start/End: Original strand, 19649557 - 19649606
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19649557 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Original strand, 21743056 - 21743093
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21743056 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 21743093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47832162 - 47832125
Alignment:
Q  172 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  47832162 tgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 47832125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 11044 - 11080
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11044 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 123961 - 123997
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  123961 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 123997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 520
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 520  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4993837 - 4993801
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4993837 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4993801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 11313100 - 11313064
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11313100 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11313064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 11987664 - 11987628
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11987664 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11987628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 12318579 - 12318543
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12318579 ttttgacttttgagttgaacattagatgcttttgagt 12318543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 13395233 - 13395269
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13395233 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 13395269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 13635123 - 13635159
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13635123 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 13635159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15116835 - 15116795
Alignment:
Q  171 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15116835 ctgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 15116795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15728776 - 15728740
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15728776 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15728740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 16583686 - 16583650
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16583686 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16583650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 16724285 - 16724321
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16724285 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16724321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 17701299 - 17701335
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17701299 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 17701335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18006003 - 18005963
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  18006003 acctgaactcgccatggcgactagaggccctcgcctcgcga 18005963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 35152057 - 35152021
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35152057 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 35152021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 48785664 - 48785628
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48785664 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 48785628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 15094 - 15584
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15094 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttaagttgaaccgtagatgcttttgagtgccttaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 15193  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15194 atgagattgaacctggaataaaacttgtaggattctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 15293  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgactcgttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 15393  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15394 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 15493  T
Q  432 ttatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15494 ttatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 353 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 7459 - 7295
Alignment:
Q  353 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattg-at-attattatgtcatgttgttgtat 450  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||   ||||||||||     
T  7459 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttgtataattatcatg-attgttgttgtaa 7361  T
Q  451 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
     ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  7360 tctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 106
Target Start/End: Original strand, 32894 - 32968
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32894 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgaatgcctgaacatgtct 32968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 7766 - 7705
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  7766 ttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 7705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 170)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 31971747 - 31971257
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31971747 cagagagcatgcaagatttcgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgtgtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtagg 31971648  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31971647 atgagattgaacctggaattaaacttgtgagattctgacctgaactcgccccggcgagcagaggctgtcacctcgcgagcgacccagaaatagagtgact 31971548  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  31971547 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagctgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgt 31971448  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31971447 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatatta 31971348  T
Q  432 ttatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31971347 ttatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 16199276 - 16199765
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16199276 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaacatgtcttataatgattaggaaagaatgtagg 16199375  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16199376 atgagattgaacctagaattaaact-gtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagacgctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgact 16199474  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16199475 tattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgt 16199574  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16199575 ataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatatta 16199674  T
Q  432 ttatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199675 ttatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 21918628 - 21919121
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21918628 cagacagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgctttggagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagg 21918727  T
Q  132 atgagattgaacctggaatt-aaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac 230  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21918728 aagagattgaacctggaaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgac 21918827  T
Q  231 ttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||    
T  21918828 ttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacccttgggtaagattaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctg 21918927  T
Q  331 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaa-tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatat 429  Q
    | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21918928 tttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatat 21919027  T
Q  430 tattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21919028 tattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 45130649 - 45131117
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130649 cagagaccatgcaagatttcgtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 45130748  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130749 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaac----------------------tcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 45130826  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45130827 tattagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgt 45130926  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa-ttgaaattgatatt 430  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45130927 ataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatatt 45131026  T
Q  431 attatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131027 attatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 18878855 - 18879352
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18878855 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 18878954  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18878955 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccaagacgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 18879054  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| || |||||||||| || | ||||| |||||||    
T  18879055 acagagtgccttgttagattttgcggcctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcatcaagacttaatgatgatgttaactataatc 18879154  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat--gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 418  Q
    |||||||||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  18879155 tgtgaagctg-ataagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 18879252  T
Q  419 gaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    | |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18879253 gcaattgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 18879349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 20536711 - 20536208
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20536711 cagagagcatgcaagattttgtgattttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctgataatgattaggaaagaatgtagg 20536612  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536611 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttatgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 20536512  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  20536511 acagagtgacttattaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagtgttgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 20536412  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  20536411 tgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 20536312  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20536311 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 20536213  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  20536212 gatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 18818028 - 18818530
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18818028 cagagagcatgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtagg 18818127  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818128 atgagattgaacctggaaagattgtaaaatgaaacttttggt-ttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 18818226  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||   | |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  18818227 acagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaatttagggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 18818326  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||     
T  18818327 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactta 18818426  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18818427 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 18818525  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  18818526 gatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 22627238 - 22626736
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22627238 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22627139  T
Q  132 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||||||||||||| |||  |          ||| | ||| | ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22627138 atgagattgaacctcgaaagattgtagaatgaacctttggaaatctgacccgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgatctagaaa 22627039  T
Q  222 cagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | |||||||||||||    
T  22627038 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatc 22626939  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  22626938 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttg 22626839  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
     | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22626838 tatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 22626740  T
Q  518 atgt 521  Q
    ||||    
T  22626739 atgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 21923546 - 21924049
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21923546 cagagagcatgtgagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggacagaatgtagg 21923645  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacc-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    |||||||||||||||          |||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923646 atgagattgaacctgaaaagatttagaatgaaactttttggattctgaccctgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 21923745  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21923746 acagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcccgagtagttgagagttgaaccttgaggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatc 21923845  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  | |||| | | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  21923846 tgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 21923945  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     |||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21923946 caattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 21924044  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  21924045 gatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 23406884 - 23406379
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406884 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 23406785  T
Q  132 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||| |||||           |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406784 atgagattggacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 23406685  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||||  | || ||  |||  |||||||| |  | ||||||||||||     
T  23406684 acagagtgccttgttaggttttgtgacctttgttgcacgagttattgagagttgaactttgggataatattgggacttaatgaggatgttaattataata 23406585  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg--ttgatgaat 417  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||   || ||| |    
T  23406584 tgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgact 23406485  T
Q  418 tgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 514  Q
    || ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23406484 tgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23406386  T
Q  515 atgatgt 521  Q
    |||||||    
T  23406385 atgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 33 - 520
Target Start/End: Original strand, 28648663 - 28649164
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28648663 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagga 28648762  T
Q  133 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 222  Q
    ||||||||||| |||||          | |||| | | | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  28648763 tgagattgaacatggaaagatttagaatgaaaccttttgaattttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgccttgcgcatgacccagaaac 28648862  T
Q  223 agagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 321  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||| |    
T  28648863 agagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatat 28648962  T
Q  322 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 420  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||   ||||||  |||||||||| ||| |||     
T  28648963 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgc 28649062  T
Q  421 aattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28649063 atttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 28649161  T
Q  518 atg 520  Q
    |||    
T  28649162 atg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 33 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 6759759 - 6759255
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6759759 agagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaa 6759660  T
Q  133 tgagattgaacctggaatta-----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||| ||||| ||           ||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759659 tgagattgaacttggaaatattttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 6759560  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | || ||| || |||||||   ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  6759559 cagagtgtcttgttaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 6759460  T
Q  321 tgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 418  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||  ||   ||||||  | ||||||   ||| ||    
T  6759459 tgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgt---tgactt 6759363  T
Q  419 gaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
    | | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6759362 gcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 6759264  T
Q  516 tgatgtcca 524  Q
    |||||||||    
T  6759263 tgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 56 - 385
Target Start/End: Original strand, 25362793 - 25363123
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25362793 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgactgaacatgactaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaac 25362892  T
Q  156 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||    
T  25362893 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgagagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttcttg 25362992  T
Q  256 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 355  Q
    | | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  25362993 cacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattat 25363092  T
Q  356 gatgtgatataatg-attatgcattacttga 385  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  25363093 gatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 33 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23649055 - 23648554
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23649055 agagagcatgcaagatttcatgtttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgactgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 23648956  T
Q  133 tgagattgaacctg----------gaattaaac-ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||||||| |||||          |||| |||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23648955 tgagattggacctgaaaagacttagaatgaaacattttggaattctgacc-gaactcgccatggcgatcagaggctctcgcctcgtgagtaacccagaaa 23648857  T
Q  222 cagagtgacttgttagattt-tgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||| || | |||||||||||||    
T  23648856 cagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatc 23648757  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  ||| |||  |||||||||| || ||||    
T  23648756 tgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattg 23648657  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     || |||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |    
T  23648656 caaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgtt 23648558  T
Q  517 gatg 520  Q
    ||||    
T  23648557 gatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 16091959 - 16092463
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16091959 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 16092058  T
Q  132 atgagattgaacctgga---att-------aaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||||||| |||||| |   |||       |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16092059 atgagattaaacctgaaaagatttaaaaaaaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcccgagtgacccagaaa 16092158  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||| || |||  | ||||||||  ||||||||||| | |||||  ||| ||||||||  || | ||||||||||||     
T  16092159 cagagtgccctgttaggattttgcgatctgtgtcacacaagttgttaagagttgaaccttggggtaatattgagacttaaggatgatgttaattataata 16092258  T
Q  321 tgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 418  Q
    || |||| || | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  16092259 tgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 16092358  T
Q  419 gaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
    | | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16092359 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 16092457  T
Q  516 tgatgt 521  Q
    ||||||    
T  16092458 tgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 22875568 - 22875065
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  22875568 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacctttgagttaatccttagatgcttttgagcgtctaaacatgtttaataatgattaggaaagattgtaga 22875469  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    | ||| ||||||||||||           | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22875468 acgaggttgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatgacgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 22875370  T
Q  221 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 319  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| || ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| |||  ||||  | | ||||||||||||    
T  22875369 acagagtgacttgttagggctttgcgatctatgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagatgtaatggtgatgttaattataat 22875270  T
Q  320 ctgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaat 417  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| |    
T  22875269 ctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgact 22875170  T
Q  418 tgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
    || | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  22875169 tgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctg-ctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatga 22875071  T
Q  516 tgatgt 521  Q
    ||||||    
T  22875070 tgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 47 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 7373237 - 7372778
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7373237 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgaaattgaacctg 7373138  T
Q  147 -----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 235  Q
               |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||                     |||||||||||||||||| ||||||    
T  7373137 gaaagattgtagaatgaaacttgtgaaattctgacctgaactcgccacggcgag---------------------tgacccagaaacagagtgtcttgtt 7373059  T
Q  236 agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataa 335  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||| | | | ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  7373058 aggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtggtagtgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaa 7372959  T
Q  336 gatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat 435  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||||||||       ||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||    
T  7372958 gatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattat 7372866  T
Q  436 gtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7372865 gtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 308 - 521
Target Start/End: Original strand, 21389358 - 21389571
Alignment:
Q  308 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 407  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21389358 gttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21389457  T
Q  408 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 507  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21389557  T
Q  508 gaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||    
T  21389558 gaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 308 - 521
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396101
Alignment:
Q  308 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 407  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21395987  T
Q  408 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 507  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21396087  T
Q  508 gaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||    
T  21396088 gaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 308 - 521
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790594
Alignment:
Q  308 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 407  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21790480  T
Q  408 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 507  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21790580  T
Q  508 gaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||    
T  21790581 gaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 321 - 521
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 420  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  421 aattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 520  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21778896  T
Q  521 t 521  Q
    |    
T  21778897 t 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 41598687 - 41598188
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  41598687 cagagagcttgcaggattccgtgattttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtaga 41598588  T
Q  132 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  41598587 atgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagtt 41598489  T
Q  221 acagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagact-taata-ataaggttaattat 316  Q
    ||||| || ||||||   |||||||||| |||||  || | ||| || |||||||||||| | ||||||  ||| || | | ||| ||||  ||||| ||    
T  41598488 acagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgccgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtag--ttatgaatattatatataatattaatgat 41598392  T
Q  317 aatctgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatg 414  Q
     ||||||||| ||| | || |||   ||| || || ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||    
T  41598391 gatctgtgaaactgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttg 41598293  T
Q  415 aattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 511  Q
    | ||| | |||||||||||||||||   |||| |||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  41598292 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctg-ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 41598195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Original strand, 5865895 - 5866082
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5865895 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 5865994  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||          |||| ||| ||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5865995 atgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 5866082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17141416 - 17141229
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17141416 cagagagcatgcaagattttgtattttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 17141317  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||          |||| ||| ||  | || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17141316 atgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaatcagacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17141229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 211
Target Start/End: Original strand, 19801045 - 19801234
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||     
T  19801045 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcatatgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagactagaga 19801144  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----tta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    || |||||||||||||||    |||      ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  19801145 ataagattgaacctggaatagtttaagaacgaacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggtcctcgcctcgcgagt 19801234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21249884 - 21249697
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249884 cagagagcatgcaagatttcgcatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 21249785  T
Q  132 atgagattgaacct----------ggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||| |||||||          ||||| ||| ||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249784 atgagactgaacctggaaagacttggaatgaaaatttggagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21249697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21255722 - 21255605
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255722 cagagagcatgcaagatttcgcatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 21255623  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21255622 atgagattgaacctggaa 21255605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21491495 - 21491382
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21491495 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 21491396  T
Q  132 atgagattgaacct 145  Q
    ||||||||||||||    
T  21491395 atgagattgaacct 21491382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21674195 - 21674091
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21674195 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttggacgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 21674096  T
Q  145 tggaa 149  Q
    |||||    
T  21674095 tggaa 21674091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 5866297 - 5866395
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866297 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 17141014 - 17140916
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17141014 gatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Original strand, 26355329 - 26355433
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||    
T  26355329 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagagattgaagattgagattgaacc 26355428  T
Q  145 tggaa 149  Q
    |||||    
T  26355429 tggaa 26355433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 426 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 21491092 - 21490995
Alignment:
Q  426 atattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491092 atattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 405 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520368
Alignment:
Q  405 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6520387  T
Q  503 atgttgaagatgatgatgt 521  Q
     || | |||||||||||||    
T  6520386 ttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Original strand, 38854883 - 38854987
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| |||||    
T  38854883 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattaagatttaacct 38854982  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  38854983 ggaat 38854987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855372
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760962
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 117
Target Start/End: Original strand, 21389071 - 21389156
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21389071 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 21389156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 404 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285616
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaa 21285617  T
Q  502 g 502  Q
    |    
T  21285616 g 21285616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 21249483 - 21249384
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249483 gatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 21255321 - 21255222
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21255321 gatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 14409459 - 14409606
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  14409459 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 14409557  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14409558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 150
Target Start/End: Original strand, 23760481 - 23760576
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |   ||||||||||||||||||    
T  23760481 attttgacttttgagttgatccctgaatgtttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaatattggatattgagattgaacctggaat 23760576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 6520857 - 6520779
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6520857 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataataattaggaaaga 6520779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 502
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413462
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413416 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16413462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 449 - 502
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983508
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 425 - 514
Target Start/End: Original strand, 13508108 - 13508199
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 514  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13508108 gatattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Original strand, 20046261 - 20046357
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20046261 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 20498681 - 20498578
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| | || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20498681 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 20498582  T
Q  502 gatg 505  Q
    ||||    
T  20498581 gatg 20498578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355815
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 1484549 - 1484402
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  1484549 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1484451  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1484450 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 5853307 - 5853454
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  5853307 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 5853405  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  5853406 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 17612133 - 17612231
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  17612133 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20403374 - 20403227
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20403374 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20403276  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20403275 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22001900 - 22001753
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  22001900 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 22001802  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22001801 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353036
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 24353036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116363
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 37116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 39834311 - 39834217
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    ||||||| ||| ||| || ||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  39834311 ttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacttgtatgataatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaat 39834217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 505
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154992
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 19154992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Original strand, 16409889 - 16409989
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  || ||| |||||||||||||||    
T  16409889 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacctg 16409988  T
Q  147 g 147  Q
    |    
T  16409989 g 16409989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 16860971 - 16861135
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  |  ||| |  ||||||||||||    
T  16860971 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaacaagattgaacctg 16861070  T
Q  147 gaatta-aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||| |  | || ||| |||||  | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16861071 gaataaccatttttggaattcttgcttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 16861135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267099
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17267099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Original strand, 21414857 - 21414956
Alignment:
Q  44 aagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 143  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21414857 aagatttcggaatttttactttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcacactaatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 21414956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20499139 - 20499049
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    |||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  20499139 ttttgacccttgagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggtaagtttttagattgagattgaacctg 20499049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20527926 - 20527812
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20527926 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 20527827  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  20527826 gacaagattgaacct 20527812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 96
Target Start/End: Original strand, 20856059 - 20856108
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20856059 atttcgtgattttgaattttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 20856108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 425 - 514
Target Start/End: Original strand, 13597640 - 13597731
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 514  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13597640 gatattattatatcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Original strand, 15203297 - 15203393
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  15203297 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 4483427 - 4483281
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  4483427 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 4483329  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4483328 -gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 518
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542535
Alignment:
Q  459 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Original strand, 15602659 - 15602722
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15602659 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 15602722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Original strand, 15611111 - 15611174
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15611111 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 15611174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439612
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatg 17439612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896265
Alignment:
Q  459 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 402 - 519
Target Start/End: Original strand, 18678102 - 18678221
Alignment:
Q  402 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 498  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18678102 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 18678200  T
Q  499 taagatgttgaagatgatgat 519  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  18678201 taagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 22010322 - 22010384
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  22010322 ttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattag 22010384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 518
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225409
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 505
Target Start/End: Original strand, 19801448 - 19801530
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19801448 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagatg 19801530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 19899571 - 19899510
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  19899571 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19899510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673723
Alignment:
Q  453 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaag 21673723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23834625 - 23834470
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  || |    
T  23834625 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caacc 23834527  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   || || |||| | || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23834526 ttagttgagaatctggcttgtactcgcgatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23834470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 24433891 - 24434046
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| |  ||||||||||| |||  || |    
T  24433891 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagtgaatgatttagaacaagattgaacctagaac-aacc 24433989  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24433990 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 26219831 - 26219733
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  | ||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219831 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26219734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39834188 - 39834147
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39834188 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 39834147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 377754 - 377714
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  377754 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 377714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 423 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 15070654 - 15070574
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070654 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15070574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 524
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Original strand, 20465682 - 20465722
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20465682 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 20465722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 117
Target Start/End: Original strand, 21395630 - 21395686
Alignment:
Q  61 acttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21395630 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 21395686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 117
Target Start/End: Original strand, 21790123 - 21790179
Alignment:
Q  61 acttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  21790123 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagatta 21790179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 423 - 502
Target Start/End: Original strand, 45290761 - 45290841
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290761 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45290841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15538796 - 15538745
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15538796 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15538745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Original strand, 13507663 - 13507713
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13507663 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 13507713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Original strand, 13597195 - 13597245
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13597195 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 13597245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 145
Target Start/End: Original strand, 16411911 - 16412001
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    | |||||||||| |||||||||||    
T  16411911 attttgacttttgagttgaaccttaaatgtttttgagtgccttaagatgtgtattaaagattaaatgataatgtaggatcagattgaacct 16412001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18865753 - 18865695
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18865753 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 18865695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29123531 - 29123449
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| |||| |||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29123531 ctttttagttggaccttggatgctttagagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 29123449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 30642934 - 30642996
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  30642934 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 30642996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 32121853 - 32121734
Alignment:
Q  402 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 498  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  32121853 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattc 32121755  T
Q  499 taagatgttgaagatgatgat 519  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  32121754 taagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Original strand, 17353580 - 17353641
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||| |||||    
T  17353580 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaagatgcctattaaagatta 17353641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 118
Target Start/End: Original strand, 17926355 - 17926412
Alignment:
Q  61 acttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  17926355 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 17926412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 19976921 - 19976860
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  19976921 tttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19976860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 19983569 - 19983508
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  19983569 tttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21255572 - 21255535
Alignment:
Q  173 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21255572 gaactcgccatggcgagcagcggctctcgcctcgcgag 21255535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 22113382 - 22113537
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || | | ||||||||||||||||||  || |    
T  22113382 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctggaac-aacc 22113480  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||  ||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22113481 ttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22113537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 22134885 - 22135040
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || | | ||||||||||||||||||  || |    
T  22134885 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctggaac-aacc 22134983  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||  ||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22134984 ttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22135040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 37116882 - 37116813
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  37116882 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 37116813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 145
Target Start/End: Original strand, 17266579 - 17266647
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  17266579 ttagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 17266647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 18619930 - 18619894
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18619930 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18619894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21674061 - 21674021
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21674061 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 21674021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 22029009 - 22028973
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22029009 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 22028973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37116704 - 37116664
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37116704 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 37116664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 209
Target Start/End: Original strand, 38855015 - 38855055
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  38855015 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 38855055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 92
Target Start/End: Original strand, 39094587 - 39094631
Alignment:
Q  48 tttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39094587 tttcgtgttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 39094631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15532236 - 15532185
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15532236 tgggattctggcttgtactcgccatgccgagcagatgctctcgcctcgcgag 15532185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 15602790 - 15602825
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15602790 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15602825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 15611242 - 15611277
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15611242 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15611277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16185074 - 16185039
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16185074 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16185039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 17353710 - 17353745
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17353710 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17353745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 17828357 - 17828392
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17828357 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17828392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 17926480 - 17926515
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17926480 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17926515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19899441 - 19899406
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19899441 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19899406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Original strand, 20465796 - 20465847
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20465796 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcggatgctctcgcctcgcgag 20465847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 20856198 - 20856233
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20856198 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20856233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 147
Target Start/End: Original strand, 21168364 - 21168455
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||| || ||| ||||||   | ||  ||| ||||||||||||||||    
T  21168364 ttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttagaatgagattgaacctgg 21168455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 22010452 - 22010487
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22010452 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22010487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 23846789 - 23846824
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23846789 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23846824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24756067 - 24756032
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24756067 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24756032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 39094715 - 39094750
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39094715 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 39094750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 146
Target Start/End: Original strand, 982980 - 983058
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||  | |||  ||||||||||||||    
T  982980 agttgaactttagatgattttgagtgtctgaacatgtatattagtgattaggaaagtttttagattgagattgaacctg 983058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 10829072 - 10829158
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| | || | |||| || |||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  10829072 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgagctgtgagtttaaccctggatgtttatgagagcctgaacatgtactataatgattag 10829158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 119
Target Start/End: Original strand, 17085770 - 17085804
Alignment:
Q  85 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17085770 ttttgagtgcctgaacatgtataataatgattagg 17085804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 439 - 517
Target Start/End: Original strand, 17353983 - 17354060
Alignment:
Q  439 atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  17353983 atgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18855358 - 18855300
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||||||||||   || || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18855358 tttgagtgcctgaacatacgtagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 18855300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 117
Target Start/End: Original strand, 19259244 - 19259305
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  19259244 attttgacttttgagttgaaccttagatgc-tttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 19259305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 452 - 506
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502207
Alignment:
Q  452 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 506  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgtt-gtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 20502207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 21161758 - 21161820
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21161758 ttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 21161820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Original strand, 22166035 - 22166187
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || | | ||||||||||||||||||  || |    
T  22166035 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctggaa-caacc 22166133  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 207  Q
    ||   |||||  ||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22166134 ttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 22166187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24353550 - 24353488
Alignment:
Q  85 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  24353550 ttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 24353488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 468 - 518
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484430
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 209
Target Start/End: Original strand, 2418642 - 2418679
Alignment:
Q  172 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2418642 tgaactcgccatagcgagcagaggccctcgcctcgcga 2418679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Original strand, 6608025 - 6608062
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6608025 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 6608062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Original strand, 7300833 - 7300870
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7300833 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 7300870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16185204 - 16185143
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  16185204 ttttgacttttgagttgaaccatagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 16185143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 17055165 - 17055198
Alignment:
Q  177 tcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17055165 tcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17055198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 19259376 - 19259409
Alignment:
Q  177 tcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19259376 tcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19259409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Original strand, 21414997 - 21415034
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21414997 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 21415034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Original strand, 26355463 - 26355504
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26355463 acctgaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcacgag 26355504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Original strand, 26934805 - 26934906
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  26934805 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 26934904  T
Q  131 ga 132  Q
    ||    
T  26934905 ga 26934906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 30308408 - 30308563
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  30308408 ttttgatttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacc 30308506  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||| |||||| | || ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  30308507 ttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctaatgctctcgcctcgcgag 30308563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Original strand, 45134676 - 45134713
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  45134676 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 45134713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15532340 - 15532300
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  15532340 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 15532300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15538900 - 15538860
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  15538900 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 15538860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 17266757 - 17266797
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  17266757 cctgaactcgccatagcaagtagaggctctcgcctcgcgag 17266797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17615268 - 17615232
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17615268 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 17615232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19111653 - 19111601
Alignment:
Q  81 atgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  19111653 atgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 19111601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19117944 - 19117892
Alignment:
Q  81 atgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  19117944 atgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 19117892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20498915 - 20498879
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20498915 aactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 20498879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 207
Target Start/End: Original strand, 21168494 - 21168526
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21168494 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 21168526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 22057800 - 22057768
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgctttt 88  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22057800 ttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 22057768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 22059159 - 22059195
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22059159 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22059195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 22145156 - 22145192
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22145156 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22145192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525573
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 506  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22525573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 23252416 - 23252452
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23252416 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23252452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Original strand, 23845412 - 23845512
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  ||||||  |  ||| ||||||| |||||  ||||  |||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23845412 gcagagagcatgttagattttttattttcgactttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 23845511  T
Q  131 g 131  Q
    |    
T  23845512 g 23845512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 24707577 - 24707613
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24707577 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 24707613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24756221 - 24756157
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||||||| | ||||  ||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24756221 cagagagcatgtaggattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 24756157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 32599130 - 32599094
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  32599130 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 32599094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 32605662 - 32605626
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  32605662 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 32605626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 145
Target Start/End: Original strand, 40492438 - 40492506
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  40492438 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataagaatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 40492506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 178)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 14052932 - 14053422
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14052932 cagagagcatgcaagatt-cgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 14053030  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14053031 atgagattgaacttggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccagaaacagagtgact 14053130  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14053131 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgt 14053230  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag-atgttgatgaattgaaattgatatt 430  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14053231 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatatt 14053330  T
Q  431 attatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14053331 attatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 12903248 - 12902757
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12903248 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttt-gagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 12903150  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12903149 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctcccgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgcct 12903050  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12903049 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgt 12902950  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 430  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12902949 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatatt 12902850  T
Q  431 attatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12902849 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 7089366 - 7088877
Alignment:
Q  35 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089366 agagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcctatgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 7089267  T
Q  135 agattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgt 234  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7089266 agattgaacctggaatgaaacttatgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgtcttgt 7089167  T
Q  235 tagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtata 334  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7089166 tagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaacctttgagtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgttta 7089067  T
Q  335 agatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattatt 433  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7089066 agatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattatt 7088967  T
Q  434 atgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7088966 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 44053332 - 44052829
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44053332 cagagagcatgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattgggaaagaatgtagg 44053233  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||||||||| ||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44053232 atgagattgaacctgtaaagattataggatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagagactctcgcctcgcgagtgacccagaa 44053133  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  44053132 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatc 44053033  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat--gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 418  Q
    ||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  44053032 tgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 44052934  T
Q  419 gaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
    | |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  44052933 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatga 44052835  T
Q  516 tgatgt 521  Q
    ||||||    
T  44052834 tgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 32 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 3097135 - 3096772
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097135 cagagagcatgcaagatttcataattttgacttttgagttaaaccttagatgttttcgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 3097036  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097035 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccaaggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 3096936  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  3096935 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggataaatacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgt 3096836  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttg 395  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3096835 ttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 32 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 22636937 - 22636437
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636937 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaagatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22636838  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22636837 atgagattgaacctggaaaaattgtagaatgaaacttgtgggattctgacttgacctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaa 22636738  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||    
T  22636737 acagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatc 22636638  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  22636637 tgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 22636539  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22636538 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 22636440  T
Q  517 gat 519  Q
    |||    
T  22636439 gat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 32 - 518
Target Start/End: Original strand, 16377140 - 16377639
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16377140 cagatagcttgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagcgtctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtagg 16377239  T
Q  132 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||| |          ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16377240 atgagattgaacctggaatgatcgtagaatgaacttttgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaa 16377339  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgt-cgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 319  Q
    || |||| ||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| |  |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  16377340 catagtgccttgttaggattttgctacctttgttgcacgagttttatgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataat 16377439  T
Q  320 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 418  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  16377440 ctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgactt 16377539  T
Q  419 gaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  16377540 gcatttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatg 16377638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 33 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 14039151 - 14038653
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  14039151 agagagcttgcaagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatttggaaagaatgtagaa 14039052  T
Q  133 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||| |||           | |||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14039051 tgagattgaacctagaaagattttagaatgaaacttttggaaatctgaccagaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 14038952  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || |||||||   ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || |  ||||||||||||    
T  14038951 cagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatc 14038852  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| |||    
T  14038851 tgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttg 14038752  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     | |||||||||||||| |||||||   ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  14038751 catttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 56 - 385
Target Start/End: Original strand, 17047726 - 17048055
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17047726 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgactaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaac-tggaatgaaac 17047824  T
Q  156 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17047825 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttg 17047924  T
Q  256 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 355  Q
    | | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||  |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  17047925 cacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattat 17048024  T
Q  356 gatgtgatataatg-attatgcattacttga 385  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17048025 gatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 284 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 17046724 - 17046487
Alignment:
Q  284 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattactt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  17046724 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattactt 17046625  T
Q  384 gaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 483  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046624 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 17046525  T
Q  484 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046524 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 169 - 514
Target Start/End: Original strand, 23374125 - 23374473
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcga 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||    
T  23374125 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgggtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgagttgttga 23374224  T
Q  269 gagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat 368  Q
    |  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23374225 ggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataat 23374324  T
Q  369 g-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgc 464  Q
    |  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  23374325 gttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgc 23374424  T
Q  465 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 514  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23374425 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 152 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 7894073 - 7893703
Alignment:
Q  152 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||    
T  7894073 aaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctt 7893974  T
Q  251 tgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatg 350  Q
    ||||||   ||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||| ||    
T  7893973 tgttgcatgagttgccgagagttgaaccttggggtaatattaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagat---gtgttgctg 7893877  T
Q  351 attatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgtt 446  Q
    |||||||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| ||    
T  7893876 attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttttt 7893777  T
Q  447 gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  7893776 gtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7799200 - 7798967
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  7799200 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgactaataatgattaggacataatgtagg 7799101  T
Q  132 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799100 atgagattgaacctggaaagtttgtagaatgaaacttgtagtattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 7799001  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgtt 254  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7799000 acaaagtgtcttgttaggttttgcgacctttgtt 7798967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15091400 - 15091093
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15091400 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagtttctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaga 15091301  T
Q  132 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15091300 atgagattgaacctggaaggattttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 15091201  T
Q  221 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 319  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || ||||||    ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||||    
T  15091200 acagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtttctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaagatgttaattataat 15091101  T
Q  320 ctgtgaag 327  Q
    ||||||||    
T  15091100 ctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 198 - 521
Target Start/End: Original strand, 16239764 - 16240090
Alignment:
Q  198 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||    
T  16239764 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattaagac 16239863  T
Q  297 ttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttg 395  Q
    ||||| || | ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| ||| ||| |||    
T  16239864 ttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattg 16239963  T
Q  396 tatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 493  Q
     |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  16239964 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgct-attgttatttaattaagttgcatgagt 16240062  T
Q  494 cggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
     |||||||| || |||||||||||||||    
T  16240063 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 33 - 518
Target Start/End: Original strand, 44928542 - 44929042
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44928542 agagagcttgcaagattccgtgattttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtagaa 44928641  T
Q  133 tgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||           |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  44928642 tgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagtta 44928740  T
Q  222 cagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagact-taata-ataaggttaattata 317  Q
    |||| || ||||||   |||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||| |  |||||  ||| || | | ||| ||||  ||||| ||     
T  44928741 cagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttgtggtag--ttatgaatattatatataatattaatgatg 44928837  T
Q  318 atctgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 415  Q
    ||||||||||||| | || |||   ||  || || ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||  |||    
T  44928838 atctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattga 44928937  T
Q  416 attgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 512  Q
     ||| | |||| ||||||||||||   |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  44928938 cttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 44929036  T
Q  513 tgatga 518  Q
    ||||||    
T  44929037 tgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Original strand, 20156908 - 20157025
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20156908 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttaatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 20157007  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20157008 atgagattgaacctggaa 20157025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24029244 - 24029057
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24029244 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattatgaaagaatgtagg 24029145  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24029144 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24029057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Original strand, 13812427 - 13812614
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13812427 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaacatgtctaatattgattaggaaataatgtagg 13812526  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13812527 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctga-ctaaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 13812614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44102697 - 44102520
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44102697 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgagcatgtttaataatgattatg-aagaatgtaggatgagattgaacctg 44102599  T
Q  147 -----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 215  Q
               |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102598 gatagattttagaataaaactt-tgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 44102520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Original strand, 16239610 - 16239728
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag-aatgtag 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16239610 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgctccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaatgtag 16239709  T
Q  131 gatgagattgaacctggaa 149  Q
     ||||||||||||||||||    
T  16239710 aatgagattgaacctggaa 16239728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15552316 - 15552199
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552316 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 15552217  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  15552216 atgagattggacctggaa 15552199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 312 - 521
Target Start/End: Original strand, 16270145 - 16270356
Alignment:
Q  312 attataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt 410  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  16270145 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 16270244  T
Q  411 gatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 508  Q
    | | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  16270245 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 16270343  T
Q  509 aagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||    
T  16270344 aagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Original strand, 22633831 - 22633948
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22633831 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 22633930  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22633931 atgagattgaacctggaa 22633948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 340 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  340 tgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc 438  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  439 atgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 6190921 - 6190819
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6190921 atttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctg 6190822  T
Q  147 gaa 149  Q
    |||    
T  6190821 gaa 6190819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16597148 - 16597031
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16597148 cagagagcatgcaagattctgtaattttgatttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 16597049  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16597048 atgagattgaacctggaa 16597031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 21814936 - 21815109
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||    
T  21814936 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctg 21815035  T
Q  147 g---aatta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |   |||||      ||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815036 gattaattaagaatgaactttttggaagctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21815109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 21815265 - 21815438
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||    
T  21815265 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaataatttagaatgataatgaacctg 21815364  T
Q  147 g---aatta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |   |||||      ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815365 gattaattaagaatgaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21815438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Original strand, 21818358 - 21818531
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||    
T  21818358 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctg 21818457  T
Q  147 g---aatta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |   |||||      ||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21818458 gattaattaagaatgaactttttggaagctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 21818531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 12774488 - 12774385
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  12774488 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagattggagaatgagattgaacc 12774389  T
Q  145 tgga 148  Q
    ||||    
T  12774388 tgga 12774385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8846865 - 8846761
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  8846865 agatttcgtaattttgacttttgagttgattcttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 8846766  T
Q  145 tggaa 149  Q
    |||||    
T  8846765 tggaa 8846761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 204 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 6190782 - 6190479
Alignment:
Q  204 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataa 303  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |  |    
T  6190782 tcgcgagtgacccaaaaatagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgtcgagagttgaaccttggcgtagcattaagacttgaata 6190683  T
Q  304 taaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgat-tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacat 402  Q
    | |  ||||||| |||  |||||||||| || || |||||  || |||| ||||||||||| |||||  || |||||||||||||  ||  || |||  |    
T  6190682 tgatattaattacaattcgtgaagctgt-tatgagatgttaatgttgatgtatgatgtgatctaatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataatt 6190584  T
Q  403 aagatg-ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 498  Q
     ||||| ||| |   || | ||||||||| ||||||||||   || ||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6190583 gagatgattgttcgctt-acattgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtc 6190485  T
Q  499 taagat 504  Q
    ||||||    
T  6190484 taagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 352 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  352 ttatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--g 447  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||  |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatg-ttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttg 6899964  T
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 402 - 521
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873488
Alignment:
Q  402 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 498  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52873465  T
Q  499 taagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  52873466 taagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 15551915 - 15551817
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15551915 gatattattatatcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 440 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 3096373 - 3096293
Alignment:
Q  440 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3096373 tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Original strand, 39705920 - 39706024
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  39705920 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagattaagattgaacct 39706019  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  39706020 ggaat 39706024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 372 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 22353984 - 22353835
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg-tata--ctgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  22353984 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctgtt 22353885  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22353884 -gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 352 - 505
Target Start/End: Original strand, 13800 - 13956
Alignment:
Q  352 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt-- 448  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |      
T  13800 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 13899  T
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13900 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 502
Target Start/End: Original strand, 52242856 - 52243298
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat----taaacttg------tgggattc 166  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    |||   ||      ||||| |     
T  52242856 ttagatgatttcgagtgcctgaacatgtataataatgatcaggaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgcattgttgggagtt 52242955  T
Q  167 tgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgctcaagttg 264  Q
      ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| || | ||| |    
T  52242956 acacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcg 52243054  T
Q  265 tcgagagttgaacccttgggtaggatt-aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt-ataagatatgttgttgatgattatgatgtga 362  Q
    |  ||||||||||  | |||||| | | |||| |  |||| |   ||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| || || |||| ||||||    
T  52243055 taaagagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataagata-ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtga 52243153  T
Q  363 tataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt--tg--ttgtatactgcct 457  Q
    ||||||  | ||||||||||||| |  |||| || ||   | |||||||| ||||||  | |||||||| |||| |||||   ||  ||| |||||||||    
T  52243154 tataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcct 52243253  T
Q  458 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243254 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774011
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 349 - 517
Target Start/End: Original strand, 15121749 - 15121917
Alignment:
Q  349 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg----ttg 444  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||    |||    
T  15121749 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgattattg 15121845  T
Q  445 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||  ||||||||| || |  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  15121846 ttgtaatctgcctatgctgat-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 15121917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706409
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 404 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280316
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 500  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T
Q  501 agatgttgaagatgatga 518  Q
    || || | ||||||||||    
T  14280333 agttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 349 - 468
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256227
Alignment:
Q  349 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 446  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 43256204  T
Q  447 -gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  43256205 ggtatgctgcctatgttgctgtt 43256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 449 - 502
Target Start/End: Original strand, 12288259 - 12288312
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288259 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 18215289 - 18215436
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  18215289 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 18215387  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18215388 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 518
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798872
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 500  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T
Q  501 agatgttgaagatgatga 518  Q
    || || | ||||||||||    
T  54798855 agttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13845028 - 13844950
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 124  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13845028 gatttcgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaattatgattagaaaaga 13844950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 518
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23803365 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846360
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 524  Q
    |  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  19242761 gt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 520
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||  || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 520  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  19618272 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Original strand, 43198220 - 43198324
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||||  |||||||  || |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| |    
T  43198220 gatttcgtagttttgacccttaagttaaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagattttagattgagattgaacat 43198319  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  43198320 ggaat 43198324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 12322 - 12469
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  12322 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12420  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12421 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 15118367 - 15118514
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15118367 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15118465  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15118466 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17046765 - 17046718
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046765 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 17046718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 210
Target Start/End: Original strand, 19757257 - 19757410
Alignment:
Q  58 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaactt 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |||    
T  19757257 ttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacctt 19757355  T
Q  158 g--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
       |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19757356 agttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19757410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19782549 - 19782396
Alignment:
Q  58 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaactt 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |||    
T  19782549 ttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacctt 19782451  T
Q  158 g--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
       |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19782450 agttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19782396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 44615435 - 44615288
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  44615435 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 44615337  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44615336 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 52312657 - 52312510
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  52312657 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 52312559  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  52312558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| || ||||   |||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    || | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3515069 gc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9557007 - 9556827
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  9557007 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 9556908  T
Q  131 gatgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |   ||||||||||| |||  || |||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9556907 ggcaagattgaacctagaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 9556827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14679439 - 14679325
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||  |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14679439 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgaatgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14679340  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  14679339 gacaagattgaacct 14679325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15099829 - 15099735
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    ||||||| ||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  15099829 ttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaat 15099735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 456 - 502
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198657
Alignment:
Q  456 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 518
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  51463968 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 404 - 502
Target Start/End: Original strand, 8574871 - 8574969
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574871 agatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8574968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 505
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640561
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 46640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 518
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  352 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---g 447  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||   |    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1837603 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14685646 - 14685534
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14685646 agagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 14685547  T
Q  133 tgagattgaacct 145  Q
    | |||||||||||    
T  14685546 taagattgaacct 14685534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Original strand, 44773153 - 44773249
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44773153 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 146
Target Start/End: Original strand, 15464562 - 15464661
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    |||||||  |||||||  || |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  15464562 atttcgtagttttgacccttaagttgatatttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctg 15464661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 15868289 - 15868368
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||    
T  15868289 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacctgg 15868368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 18239434 - 18239581
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  18239434 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 18239532  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18239533 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 50222354 - 50222501
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||  | ||||||||||    
T  50222354 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt 50222452  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  50222453 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082257
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12774355 - 12774313
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774355 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 12774313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23838910 - 23838796
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23838910 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 23838811  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  23838810 gacaagattgaacct 23838796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 7900800 - 7900913
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  |||| | ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  7900800 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgggtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 7900899  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    ||| ||||||||||    
T  7900900 gatcagattgaacc 7900913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15190795 - 15190702
Alignment:
Q  57 tttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    |||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||  ||||||| ||||||||||    
T  15190795 tttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaaggttctagattgagatttaacctggaat 15190702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 16243054 - 16243209
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || |||||| |||||||  ||  || ||| |||||||||||||| |||  || |    
T  16243054 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctaatattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctagaac-aacc 16243152  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16243153 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16243209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 358 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcc 456  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |    ||      
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt----tgt- 12611011  T
Q  457 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12611010 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 502
Target Start/End: Original strand, 15355391 - 15355471
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355391 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15355471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3332240 - 3332201
Alignment:
Q  171 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3332240 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 3332201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 518
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641344
Alignment:
Q  459 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 15367789 - 15367690
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15367789 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15367692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 15370117 - 15370018
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15370117 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15370020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 15371301 - 15371202
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15371301 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15371204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 15373582 - 15373483
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15373582 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15373485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 15402802 - 15402703
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15402802 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgat 15402705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 17053533 - 17053482
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgc 84  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17053533 agagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgc 17053482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Original strand, 26243319 - 26243471
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaa-gaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 154  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  26243319 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgaat-tagaacgagattgaacctggaac-aac 26243416  T
Q  155 cttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 207  Q
    |||   |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26243417 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 26243471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 16356596 - 16356658
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  16356596 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 16356658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 210
Target Start/End: Original strand, 22633980 - 22634018
Alignment:
Q  172 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22633980 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22634018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2015230 - 2015075
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  || |    
T  2015230 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caacc 2015132  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2015131 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggtgagcagacgctctcgcctcgcgag 2015075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 3332321 - 3332284
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgag 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3332321 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgag 3332284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15099706 - 15099665
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15099706 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 15099665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 15321723 - 15321836
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  15321723 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 15321822  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    ||| ||||||||||    
T  15321823 gatcagattgaacc 15321836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 96
Target Start/End: Original strand, 16348334 - 16348375
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16348334 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 16348375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 18222032 - 18222187
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  18222032 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacc 18222130  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18222131 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 18222187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 44676108 - 44676047
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  44676108 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 44676047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 51493447 - 51493560
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  51493447 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 51493546  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    ||| ||||||||||    
T  51493547 gatcagattgaacc 51493560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 278
Target Start/End: Original strand, 15464694 - 15464805
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgctcaagttgtc 266  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||   |||||||| | |||||| || ||||||||     
T  15464694 acctgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgacttgtttaggattttgcaatctttgtcgcacaagttgtt 15464793  T
Q  267 gagagttgaacc 278  Q
      ||||||||||    
T  15464794 atgagttgaacc 15464805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Original strand, 16956279 - 16956379
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16956279 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 16956378  T
Q  131 g 131  Q
    |    
T  16956379 g 16956379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 13427 - 13506
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  13427 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 1951415 - 1951570
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||  |       
T  1951415 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaacgacct 1951514  T
Q  156 ttg-tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    | | ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1951515 tagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcttcgcgag 1951570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 210
Target Start/End: Original strand, 20157056 - 20157095
Alignment:
Q  171 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20157056 ctgaactcgccatggcgtgcagaggctctcgcctcgcgag 20157095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 40471920 - 40471837
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40471920 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacct 40471837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 45938495 - 45938444
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45938495 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 45938444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Original strand, 386038 - 386096
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  386038 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 386096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 502
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970853
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    || | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970807 gc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 14970853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15094249 - 15094187
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15094249 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 15094187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 15121446 - 15121508
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15121446 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 15121508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27534502 - 27534322
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||  |  |  ||| ||||||||||||||  ||  ||    
T  27534502 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtacctactaatgattaggaaacgattgag 27534403  T
Q  131 gatgagattgaacctggaattaaacttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
     ||||||||||||||||||  || |||   ||| |   || | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27534402 aatgagattgaacctggaac-aaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27534322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 32851918 - 32851868
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32851918 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 32851868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40478593 - 40478511
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40478593 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 40478511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8846730 - 8846689
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8846730 accttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 8846689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 425 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 16596746 - 16596686
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 483  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596746 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 17152141 - 17152296
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||  |  || ||| || |||||||| ||   | ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  17152141 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgactacctttaggtgcctattattgattagggaatgttttagaacgagattgaacctggaac-aacc 17152239  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17152240 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcgcgag 17152296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23843955 - 23843894
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||  | |||||||||    
T  23843955 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttcattaatgatta 23843894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3413248 - 3413212
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3413248 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 3413212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13569988 - 13569948
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13569988 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 13569948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 18602399 - 18602435
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18602399 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18602435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 18608993 - 18609029
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18608993 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18609029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 209
Target Start/End: Original strand, 39706052 - 39706092
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  39706052 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 39706092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 11250335 - 11250370
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11250335 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 11250370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12570367 - 12570332
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12570367 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12570332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13569858 - 13569823
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13569858 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 13569823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 14708408 - 14708443
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14708408 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 14708443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15190667 - 15190632
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15190667 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 15190632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 15353080 - 15353115
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15353080 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15353115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 16351622 - 16351657
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16351622 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16351657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 16356726 - 16356761
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16356726 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16356761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 16487851 - 16487886
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16487851 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16487886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 16678363 - 16678398
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16678363 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16678398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 505
Target Start/End: Original strand, 21815699 - 21815734
Alignment:
Q  470 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatg 21815734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23139618 - 23139567
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23139618 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcggatgctctcgcctcgcgag 23139567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23843824 - 23843789
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23843824 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23843789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 144
Target Start/End: Original strand, 26284595 - 26284650
Alignment:
Q  89 gagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26284595 gagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 26284650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 36133736 - 36133771
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36133736 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 36133771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 43255935 - 43255970
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43255935 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 43255970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Original strand, 6873060 - 6873118
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6873060 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattatgaatgaatgtaggatcagattgaacc 6873118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12522505 - 12522447
Alignment:
Q  87 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  12522505 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagatggaacct 12522447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 119
Target Start/End: Original strand, 32306582 - 32306624
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32306582 ttagatggttttgagtgcctaaacatgtataataatgattagg 32306624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 35171045 - 35170991
Alignment:
Q  91 gtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  35171045 gtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 35170991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 35614415 - 35614301
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||  ||| ||||||| |||||  ||||   ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||    
T  35614415 gcagagagcatgttagattttgtattttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatatctagtaatgataagggatgaatgtag 35614316  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  ||||| |||||    
T  35614315 gactagattaaacct 35614301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 145
Target Start/End: Original strand, 41385430 - 41385488
Alignment:
Q  87 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||    
T  41385430 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggagtgaatgtaggacaagattgaacct 41385488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4171374 - 4171337
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4171374 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 4171337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Original strand, 9271733 - 9271834
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| | ||||||||    
T  9271733 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtag 9271832  T
Q  131 ga 132  Q
    ||    
T  9271833 ga 9271834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13844895 - 13844854
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13844895 acctgtacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 13844854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14699066 - 14699029
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14699066 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 14699029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15552166 - 15552129
Alignment:
Q  173 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15552166 gaactcgccacggcgagcagaggctcgcgcctcgcgag 15552129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18237344 - 18237189
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || ||||||   ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  18237344 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattatagaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacc 18237246  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||| |||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18237245 ttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 18237189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 53433854 - 53433753
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  53433854 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 53433755  T
Q  131 ga 132  Q
    ||    
T  53433754 ga 53433753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 211
Target Start/End: Original strand, 13616 - 13656
Alignment:
Q  171 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13616 ctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagt 13656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 287441 - 287405
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  287441 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 287405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 92
Target Start/End: Original strand, 11250219 - 11250251
Alignment:
Q  60 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11250219 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 11250251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 147
Target Start/End: Original strand, 12287794 - 12287866
Alignment:
Q  75 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    ||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  12287794 ccttagatgtttctaagtgtctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 12287866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 12287974 - 12288014
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12287974 cctgaactcgccatagcgagtagaagctctcgcctcgcgag 12288014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 12570497 - 12570457
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12570497 ttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 12570457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Original strand, 14268101 - 14268189
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  14268101 agattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 14268189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 14708288 - 14708324
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14708288 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 14708324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 92
Target Start/End: Original strand, 16351506 - 16351538
Alignment:
Q  60 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16351506 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 16351538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16359854 - 16359818
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16359854 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 16359818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333292
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 506  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcagtctatgatgt 17333292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 23139722 - 23139682
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  23139722 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 23139682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 28569098 - 28569134
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28569098 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 28569134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 31116822 - 31116858
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31116822 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 31116858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 36133616 - 36133652
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36133616 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 36133652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 43255814 - 43255850
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  43255814 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 43255850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 45938599 - 45938563
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45938599 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 45938563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 149
Target Start/End: Original strand, 53081760 - 53081832
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  53081760 ttagatgattctgagtgcctaaacatgtataataatgattaagcaagtttttagattgagattgaacctggaa 53081832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 53081915 - 53081955
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  53081915 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcgtcgcgag 53081955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 55502517 - 55502553
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55502517 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 55502553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 13987 - 13497
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  13987 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtagc 13888  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13887 atgagattgaacctggaattaaacttgtgagattctgagctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgact 13788  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13787 tgttagattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttcggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgt 13688  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13687 ataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatatta 13588  T
Q  432 ttatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13587 tcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 16771 - 16282
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16771 cagagagcatgcaagatttcgtacttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 16672  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16671 acgagattgaacctgaaattaaacttatgggattttgaccagaactcggcacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgact 16572  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  16571 tgttggattttgtgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacgcttgggtaggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctga 16472  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  16471 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataa 16372  T
Q  432 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371 ttatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 197)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 521
Target Start/End: Original strand, 21292611 - 21293090
Alignment:
Q  44 aagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 143  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292611 aagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 21292710  T
Q  144 ctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttg 243  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21292711 ctggaattaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaatagagtgactttttagattttg 21292810  T
Q  244 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 343  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21292811 cgacctttgttgcacgagttgtcgggagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtt 21292910  T
Q  344 gttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa-ttgaa-attgatattattatgtcatg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  21292911 gttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcata 21293010  T
Q  442 ttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
     || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21293011 ctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 8286471 - 8286964
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8286471 cagagagcatgcaagatttcgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtgccggaacatgtctaataatgattaagaaagaatgtagg 8286570  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286571 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctaaactagccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 8286670  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||| | |||||||||||    
T  8286671 tgttagattttgcgacctttgttgcttgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgt 8286770  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 430  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8286771 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 8286870  T
Q  431 attatgtcatg----ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8286871 attatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Original strand, 23390115 - 23390617
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390115 agagagcatccaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 23390214  T
Q  133 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||    
T  23390215 tgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccctaaaa 23390314  T
Q  222 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 321  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  23390315 cagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatct 23390414  T
Q  322 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 420  Q
    |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  23390415 gtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 23390514  T
Q  421 aattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23390515 aattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23390613  T
Q  518 atgt 521  Q
    ||||    
T  23390614 atgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 22075511 - 22075018
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22075511 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtagg 22075412  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag-aaacagagtgac 230  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22075411 atgaaaatgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgac 22075312  T
Q  231 ttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 330  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  22075311 ttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctg 22075213  T
Q  331 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatat 429  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22075212 tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatat 22075113  T
Q  430 tattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag-atgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22075112 tattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 24494071 - 24493569
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24494071 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgaacgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 24493972  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||    
T  24493971 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctttcgcctcgtgagtaacccataaa 24493872  T
Q  222 cagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24493871 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaataatgatgttaattataatc 24493772  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  24493771 tgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 24493672  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
     | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24493671 catttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 24493573  T
Q  518 atgt 521  Q
    ||||    
T  24493572 atgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 25422035 - 25421532
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  25422035 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctattaatgattaggaaagaacttagg 25421936  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||| ||||||||          | ||||||  || | |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25421935 atgagattggacctggaaagatttagaatgaaactttcggaaatctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaa 25421836  T
Q  222 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  25421835 ccgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatc 25421736  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| |||    
T  25421735 tgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttg 25421636  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25421635 caattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 25421537  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  25421536 gatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 13095996 - 13095495
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095996 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgaaagcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 13095897  T
Q  133 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 222  Q
    |||||||| ||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13095896 tgagattggacctggaaagatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaac 13095797  T
Q  223 agagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 321  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  13095796 agagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatat 13095697  T
Q  322 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  13095696 gtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatg-ttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 13095598  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
     | ||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13095597 catttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 13095499  T
Q  518 atgt 521  Q
    ||||    
T  13095498 atgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 32 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 24529724 - 24529223
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529724 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttcagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 24529625  T
Q  132 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529624 atgagattgaacctggaaaggttgtagaatgaaacttttggaattctgatctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 24529525  T
Q  221 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 319  Q
    |||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| | |||||| ||| | ||||||| || | ||||| ||||||    
T  24529524 acagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcactagtagttgagagttgaaccttggggtagtattgaaacttaatgatgatgttaactataat 24529425  T
Q  320 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 418  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||   ||||||  |||||||||| ||| ||    
T  24529424 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgactt 24529325  T
Q  419 gaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24529324 gcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 24529226  T
Q  516 tga 518  Q
    |||    
T  24529225 tga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 13025812 - 13025311
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025812 agagagcatgcaagatttcgtgattttgaattttgagttgatccttagatacttttgaaagcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 13025713  T
Q  133 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 222  Q
    |||||||| ||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13025712 tgagattggacctggaaagatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaac 13025613  T
Q  223 agagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 321  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  13025612 agagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatat 13025513  T
Q  322 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  13025512 gtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatg-ttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 13025414  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
     | ||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13025413 catttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 13025315  T
Q  518 atgt 521  Q
    ||||    
T  13025314 atgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 9078455 - 9077952
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  9078455 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatctttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaga 9078356  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||          | |||| | | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078355 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaaccttttgaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 9078256  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||  || |||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  9078255 cagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 9078156  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||   ||||||  | |||||||| ||| |||    
T  9078155 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttg 9078056  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||    
T  9078055 cacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgat 9077957  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  9077956 gatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 32 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 25431897 - 25431414
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  25431897 cagagagcgtgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagaatttagg 25431798  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||| ||||||||          | |||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25431797 atgagattggacctggaaagatttagaatgaaacttttggaaatctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcacctcgcgagtgacccagaaa 25431698  T
Q  222 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
      ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  25431697 tcgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttacacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatc 25431598  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| | |  |||||||||| ||| |||    
T  25431597 tgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttg 25431498  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431497 caattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 32 - 386
Target Start/End: Original strand, 22107002 - 22107357
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22107002 cagagagcatgcaaaatttcgtatttttgacttttgagttgaactttagatgcgtttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 22107101  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  22107102 acgagattgaacctgaaattaaacttgtgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaatagagtgcct 22107201  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||| | | ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22107202 tgtgatactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagatgaacctttgagtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgt 22107301  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat-gattatgcattacttgaa 386  Q
     |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22107302 ttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 1096970 - 1096467
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096970 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 1096871  T
Q  132 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||| ||||||  |          ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096870 atgagattgaatctggaaagattgcagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 1096771  T
Q  222 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||| || ||| |||| ||||||||| || ||| || ||||||||  | ||||| ||| | |||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||| |    
T  1096770 cagaatgcctttttagaattttgcgatctctgtcgcacaagttgttaaaagttggaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacc 1096671  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    | ||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| |||    
T  1096670 tatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttg 1096571  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     | ||||||||||||||| ||||||   ||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  1096570 catttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgtt 1096472  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  1096471 gatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 385
Target Start/End: Original strand, 21985765 - 21986130
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21985765 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 21985864  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||||||||||||||          |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21985865 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcaagcagaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaa 21985964  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| |||||| || || | ||||| ||||||     
T  21985965 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattcagacttgatgatgatgttaactataatt 21986064  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttga 385  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| || ||| ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||    
T  21986065 tgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Original strand, 11580878 - 11581058
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11580878 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagaagcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 11580977  T
Q  147 -----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccca 217  Q
               |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11580978 gatagattttagaataaaactt-tgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccca 11581058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Original strand, 22119811 - 22119998
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22119811 cagagagcatgcaaaattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 22119910  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22119911 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22119998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Original strand, 21871190 - 21871377
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  21871190 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtagga 21871289  T
Q  133 tgagattgaacctgga---atta-------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||   ||||        |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  21871290 tgagattgaacctggaaagattatggaatggacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgag 21871377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Original strand, 21875470 - 21875657
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  21875470 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtagga 21875569  T
Q  133 tgagattgaacctgga---atta-------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||   ||||        |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  21875570 tgagattgaacctggaaagattatggaatggacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgag 21875657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 518
Target Start/End: Original strand, 36154461 - 36154942
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36154461 atttcatgattttgacttttaagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagagtgagattgaacctg 36154560  T
Q  147 -----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 235  Q
               |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||| || ||||||    
T  36154561 gatagattttagaataaaactt-tgagaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatg-cttgtt 36154658  T
Q  236 --agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagact-taata-ataaggttaattataatctgtgaagctg- 330  Q
       |||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||| | ||||||  ||| || | | ||| |||   ||||| || || ||||||||||     
T  36154659 taggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtag--ttatgaatattatatatattattaatgatgatatgtgaagctga 36154756  T
Q  331 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatat 429  Q
    | || |||   ||| ||||| ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||    
T  36154757 tttatgatgatttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatat 36154855  T
Q  430 tattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||| || |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  36154856 tattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 357 - 521
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  357 atgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatac 452  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  453 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 371 - 521
Target Start/End: Original strand, 21729033 - 21729185
Alignment:
Q  371 ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgt 467  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  21729033 ttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgt 21729132  T
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21729133 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Original strand, 19660455 - 19660643
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  19660455 cagagagcatgcaagattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtgga 19660554  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----tt-------aaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| |||||||||    ||       ||||||  | || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660555 atgagattaaacctggaaagacttagaatgaaaactttggagaatctaacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 19660643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Original strand, 24766955 - 24767142
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24766955 cagatagcatgcaagatttcatgatttcgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattacgaaagaatgtagg 24767054  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||| |||          |||| ||||||  | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24767055 atgagattgaatctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24767142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21566034 - 21565930
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21566034 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 21565935  T
Q  145 tggaa 149  Q
    |||||    
T  21565934 tggaa 21565930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 404 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 37724020 - 37723910
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 503  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37724020 agatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaaga 37723921  T
Q  504 tgttgaagatg 514  Q
    |||||||||||    
T  37723920 tgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Original strand, 22959166 - 22959267
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  22959166 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctg 22959265  T
Q  147 ga 148  Q
    ||    
T  22959266 ga 22959267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19669390 - 19669286
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  19669390 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacg 19669291  T
Q  145 tggaa 149  Q
    |||||    
T  19669290 tggaa 19669286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 423 - 521
Target Start/End: Original strand, 21997555 - 21997655
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21997555 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 21997653  T
Q  520 gt 521  Q
    ||    
T  21997654 gt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314577
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660956
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 22144508 - 22144065
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat----taa------acttgtgggattc 166  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    |||      | || ||||| |     
T  22144508 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtgtaacaatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaataatttaagaatggatttttgggagtt 22144409  T
Q  167 tgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttgcgacctttgttgctcaagttg 264  Q
      ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| || | |||||    
T  22144408 acacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttg 22144310  T
Q  265 tcgagagttgaacccttgggtaggatt-aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt-ataagatatgttgttgatgattatgatgtga 362  Q
    | |||||||||||| | | || | | | |||| ||  | || |  ||||| || | |||||||| ||| |||||||   ||| || || |||  ||||||    
T  22144309 ttgagagttgaaccttggagtcgtaatgaaga-ttgtttatgatattaatgatgacctgtgaagttgttataagatgaattgatgttgtttacaatgtga 22144211  T
Q  363 tataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctat 459  Q
    ||||||  | |||||||||||||||  |||| || ||   | |||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||| |||||    
T  22144210 tataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctat 22144111  T
Q  460 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144110 gttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22144065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 405 - 521
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329618
Alignment:
Q  405 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21329599  T
Q  503 atgttgaagatgatgatgt 521  Q
     || | |||||||||||||    
T  21329600 ttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 405 - 505
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027046
Alignment:
Q  405 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt----tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 500  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  501 agatg 505  Q
    |||||    
T  20027042 agatg 20027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 317 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 22032520 - 22032323
Alignment:
Q  317 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 416  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22032520 aatctgtgaagctg-atacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 22032422  T
Q  417 ttgaaattgatattattatgtcatg-ttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 514  Q
    ||| ||||| ||| ||||  ||||| ||| |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  22032421 ttg-aattggtataatta--tcatgattgtttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 22032326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 317 - 517
Target Start/End: Original strand, 18769919 - 18770118
Alignment:
Q  317 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 416  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18769919 aatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 18770017  T
Q  417 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 514  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||  || ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  18770018 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 18770115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Original strand, 21329127 - 21329231
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||  |||||||||||||    
T  21329127 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacct 21329226  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  21329227 ggaat 21329231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959649
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Original strand, 20910430 - 20910609
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag-gaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||  |  |||||| ||| |||||| | | |||| |||    
T  20910430 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgaat-tag 20910528  T
Q  131 gatgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
     |  |||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20910529 aacaagattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20910609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 406 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 21565659 - 21565546
Alignment:
Q  406 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 503  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21565659 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21565560  T
Q  504 tgttgaagatgatg 517  Q
    || ||| |||||||    
T  21565559 tgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 349 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356367
Alignment:
Q  349 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tt 446  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T
Q  447 gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18356388 gtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Original strand, 21498649 - 21498753
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||| ||| |||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  21498649 gattgcgtaattttgacctttaagttgaaccttggatgtttttgagtgcctgaacatgtataataattattaggagagattgtagattgagattgaacct 21498748  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  21498749 ggaat 21498753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Original strand, 21502205 - 21502277
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21502205 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 349 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23572252 - 23572180
Alignment:
Q  349 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 421  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572252 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 23572180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  309 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||      ||||    ||||||||  ||   ||||||  | |||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac-----ttat----tacttgaattatgaatgtatatttgagatg 22412298  T
Q  409 ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 506  Q
    ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  22412297 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 22412199  T
Q  507 tgaagatgatga 518  Q
    | ||||||||||    
T  22412198 ttaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 29330081 - 29329934
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  29330081 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29329983  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29329982 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 423 - 502
Target Start/End: Original strand, 26012056 - 26012137
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012056 ttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Original strand, 11581265 - 11581361
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11581265 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 264783 - 264930
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  264783 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 264881  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  264882 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 10732955 - 10733102
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  10732955 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 10733053  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10733054 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20909159 - 20909012
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||| ||    
T  20909159 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tt 20909062  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20909061 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 39363531 - 39363384
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  39363531 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39363433  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39363432 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 349 - 468
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910866
Alignment:
Q  349 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 445  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 20910843  T
Q  446 tgtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  20910844 tgtatgctgtctatgttgctgtt 20910866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 309 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418599
Alignment:
Q  309 ttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 406  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| | |||    ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||  |  ||| |||  |||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatat-taaga 18418695  T
Q  407 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaag 18418599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 21340421 - 21340576
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  21340421 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 21340519  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21340520 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21340576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 26665785 - 26665940
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  26665785 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 26665883  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26665884 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 26665940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 26937382 - 26937537
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  26937382 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 26937480  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26937481 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 26937537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 19668970 - 19668898
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  19668970 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 502
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902155
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20902155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 37724403 - 37724319
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  37724403 agagagcatgtaagattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 37724319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 39245232 - 39245136
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39245232 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 42245380 - 42245527
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  42245380 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 42245478  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  42245479 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Original strand, 21294892 - 21295006
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21294892 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 21294991  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  21294992 gacaagattgaacct 21295006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 15441583 - 15441696
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15441583 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 15441682  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    ||  ||||||||||    
T  15441683 gacaagattgaacc 15441696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16674604 - 16674449
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  16674604 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 16674506  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||  | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16674505 ttagttgggattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16674449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18356779 - 18356624
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| ||||||||| ||||||||  || |    
T  18356779 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaagtgcctactattgattagggaatgatttagaatgagattgcacctggaac-aacc 18356681  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18356680 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18356624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 505
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178326
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22178326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 23535243 - 23535398
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  23535243 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 23535341  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23535342 ttagttgggaatctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23535398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 24532702 - 24532857
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  24532702 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 24532800  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24532801 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24532857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Original strand, 2154680 - 2154776
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2154680 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 518
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918110
Alignment:
Q  459 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Original strand, 21366308 - 21366371
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21366308 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 21366371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 29346127 - 29345980
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  29346127 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29346029  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29346028 -gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 150
Target Start/End: Original strand, 5888837 - 5888911
Alignment:
Q  76 cttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||    
T  5888837 cttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacatggaat 5888911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24555010 - 24554896
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24555010 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaatatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 24554911  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  24554910 gacaagattgaacct 24554896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Original strand, 5888940 - 5888981
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5888940 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 5888981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 96
Target Start/End: Original strand, 17918804 - 17918845
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17918804 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17918845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 515
Target Start/End: Original strand, 18319100 - 18319193
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  18319100 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 218
Target Start/End: Original strand, 21501919 - 21501968
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 218  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21501919 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccag 21501968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21565900 - 21565863
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565900 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 21565863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 22032792 - 22032731
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  22032792 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 22032731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Original strand, 22959298 - 22959339
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22959298 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22959339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23201845 - 23201784
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  23201845 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 23201784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 25406902 - 25406789
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  25406902 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtag 25406803  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    ||| ||||||||||    
T  25406802 gatcagattgaacc 25406789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775838
Alignment:
Q  470 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 29916616 - 29916580
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatg 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29916616 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatg 29916580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 31061164 - 31061068
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31061164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 31342579 - 31342539
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31342579 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 31342539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 144
Target Start/End: Original strand, 41294112 - 41294176
Alignment:
Q  80 gatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41294112 gatgccttagagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 41294176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 143
Target Start/End: Original strand, 20026521 - 20026592
Alignment:
Q  72 gatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 143  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  20026521 gatctttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 20026592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 20806024 - 20805961
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  20806024 attttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 20805961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23201731 - 23201680
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23201731 tgggaatctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23201680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 29348600 - 29348453
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  29348600 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29348502  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29348501 c-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 29351073 - 29350926
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  29351073 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29350975  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29350974 c-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31342453 - 31342414
Alignment:
Q  171 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31342453 ctgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 31342414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 32027540 - 32027393
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  32027540 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt 32027442  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32027441 -gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 40725951 - 40725853
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  40725951 gatattattatatcatgatgctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796434
Alignment:
Q  452 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 506  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 15796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17284512 - 17284430
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17284512 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 17284430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 150
Target Start/End: Original strand, 21741185 - 21741279
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    ||||||| ||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  21741185 ttttgacctttaagtcgaaccttagatatttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgaataggaaagattatagattgagattgaacctggaat 21741279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 25535409 - 25535351
Alignment:
Q  87 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  25535409 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 25535351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25744074 - 25744036
Alignment:
Q  172 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25744074 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 25744036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 26704151 - 26704090
Alignment:
Q  440 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26704151 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26704090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 505
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740750
Alignment:
Q  451 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 26740750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 26973884 - 26973823
Alignment:
Q  440 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26973884 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26973823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 92
Target Start/End: Original strand, 1858621 - 1858666
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1858621 atttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 1858666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 17718093 - 17718248
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | |||||||||| | |||  || |    
T  17718093 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacatagaac-aacc 17718191  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17718192 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 17718248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Original strand, 18769647 - 18769708
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  18769647 ttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 18769708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20232896 - 20232847
Alignment:
Q  161 ggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20232896 ggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20232847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 206
Target Start/End: Original strand, 21741308 - 21741345
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21741308 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcg 21741345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 21884843 - 21884998
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || | | ||||||||||||||||||  || |    
T  21884843 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctggaac-aacc 21884941  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||  ||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21884942 ttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21884998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 21887300 - 21887239
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  21887300 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 21887239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22133475 - 22133362
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||     
T  22133475 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtat 22133376  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    ||| ||||||||||    
T  22133375 gatcagattgaacc 22133362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22140167 - 22140054
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||     
T  22140167 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtat 22140068  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    ||| ||||||||||    
T  22140067 gatcagattgaacc 22140054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22588516 - 22588459
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 143  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22588516 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaac 22588459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 144
Target Start/End: Original strand, 23336973 - 23337030
Alignment:
Q  87 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  23336973 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 23337030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 451 - 500
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  451 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 500  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33409658 - 33409565
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  33409658 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaaggatttagaacgagattgaacctggaa 33409565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 123074 - 123114
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  123074 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 123114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26172916 - 26172761
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || | | ||||||||||||||||||  || |    
T  26172916 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctggaac-aacc 26172818  T
Q  156 tt-gt-gggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    || || ||||  ||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26172817 ttagtagggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 26172761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 12028339 - 12028374
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12028339 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12028374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17410779 - 17410744
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17410779 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17410744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 17918925 - 17918960
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17918925 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17918960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18774552 - 18774501
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18774552 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 18774501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18784395 - 18784344
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18784395 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 18784344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19992305 - 19992258
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  19992305 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 19992258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20805893 - 20805858
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20805893 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20805858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 21366439 - 21366474
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21366439 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21366474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 21873327 - 21873277
Alignment:
Q  443 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 494  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873327 tgttgtatcctgcctatgctgct-tttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21873595 - 21873560
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21873595 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21873560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21887170 - 21887135
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21887170 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21887135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22032678 - 22032627
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22032678 tgggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22032627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 119
Target Start/End: Original strand, 22177797 - 22177848
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22177797 agttgaaccctagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 22177848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 133
Target Start/End: Original strand, 22334501 - 22334548
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  22334501 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 22334548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23512453 - 23512418
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23512453 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23512418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24222220 - 24222185
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24222220 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24222185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26680922 - 26680887
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26680922 actcgccatggcgagcagacgctctcgcctcgcgag 26680887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26952529 - 26952494
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26952529 actcgccatggcgagcagacgctctcgcctcgcgag 26952494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 37286464 - 37286523
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  37286464 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacct 37286523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 37293167 - 37293226
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  37293167 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacct 37293226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37724250 - 37724215
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37724250 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 37724215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 118
Target Start/End: Original strand, 12028223 - 12028281
Alignment:
Q  60 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  12028223 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctattaaagattag 12028281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 145
Target Start/End: Original strand, 14359504 - 14359562
Alignment:
Q  87 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  14359504 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacatgattgaacct 14359562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Original strand, 15236440 - 15236522
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  15236440 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 15236522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 468 - 518
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 452 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469818
Alignment:
Q  452 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 506  Q
    |||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatatt-aattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 23469818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 99
Target Start/End: Original strand, 23500993 - 23501031
Alignment:
Q  61 acttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  23500993 acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 23501031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23512579 - 23512521
Alignment:
Q  60 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  23512579 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 23512521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 150
Target Start/End: Original strand, 26011688 - 26011770
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    |||||| | ||||||| || |||||| || ||||||| |||||||||||| |||||| | ||   ||||||||||||||||||    
T  26011688 agttgaactttagatgattatgagtgtctaaacatgtgtaataatgattaagaaagattctaaattgagattgaacctggaat 26011770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Original strand, 26011799 - 26011841
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  26011799 acctgaactcgccatggcgagtagaggccttcgcctcgcgagt 26011841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 26681038 - 26680980
Alignment:
Q  60 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  26681038 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattag 26680980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 119
Target Start/End: Original strand, 26732421 - 26732463
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26732421 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 26732463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 119
Target Start/End: Original strand, 26740234 - 26740276
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26740234 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 26740276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 26952645 - 26952587
Alignment:
Q  60 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| ||||||    
T  26952645 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattag 26952587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27517184 - 27517126
Alignment:
Q  75 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27517184 ccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 27517126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27523821 - 27523763
Alignment:
Q  75 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27523821 ccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 27523763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 475 - 505
Target Start/End: Original strand, 27989004 - 27989034
Alignment:
Q  475 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989004 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 27989034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Original strand, 29471019 - 29471101
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29471019 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagttttgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 29471101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Original strand, 29477614 - 29477696
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29477614 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagttttgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 29477696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 209
Target Start/End: Original strand, 21329263 - 21329300
Alignment:
Q  172 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21329263 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcga 21329300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23451730 - 23451657
Alignment:
Q  135 agattgaacctggaattaaacttgtggga-ttctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 207  Q
    |||||||||||||||| |   |||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23451730 agattgaacctggaataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 23451657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23458974 - 23458901
Alignment:
Q  135 agattgaacctggaattaaacttgtggga-ttctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 207  Q
    |||||||||||||||| |   |||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23458974 agattgaacctggaataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 23458901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23463235 - 23463162
Alignment:
Q  135 agattgaacctggaattaaacttgtggga-ttctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 207  Q
    |||||||||||||||| |   |||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23463235 agattgaacctggaataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 23463162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23572441 - 23572392
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcg 208  Q
    |||||||||| | || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23572441 tgggattctggcttgtactccccatggcgagcagatgctctcgcctcgcg 23572392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 118
Target Start/End: Original strand, 25574056 - 25574097
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25574056 ttagatggttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattag 25574097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 118
Target Start/End: Original strand, 25575249 - 25575290
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25575249 ttagatggttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattag 25575290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 118
Target Start/End: Original strand, 25576442 - 25576483
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25576442 ttagatggttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattag 25576483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26496235 - 26496198
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26496235 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 26496198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26704552 - 26704499
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||    
T  26704552 gatttcgaaattttgacttttgagttgaaccctagatatttttgagtgcctgaa 26704499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26974285 - 26974232
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||    
T  26974285 gatttcgaaattttgacttttgagttgaaccctagatatttttgagtgcctgaa 26974232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Original strand, 29324991 - 29325028
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29324991 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 29325028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 4036672 - 4036636
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4036672 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 4036636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4398058 - 4398022
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4398058 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4398022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 14079624 - 14079584
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  14079624 ttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcct 14079584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 16255704 - 16255740
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16255704 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 16255740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 16259337 - 16259373
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16259337 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 16259373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 18784499 - 18784459
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  18784499 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 18784459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19669255 - 19669219
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctc 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19669255 acctgaactcgccatggcgtgtagaggctctcgcctc 19669219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 211
Target Start/End: Original strand, 20026706 - 20026746
Alignment:
Q  171 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20026706 ctgaactcgccacagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 20026746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 21482930 - 21482894
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21482930 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21482894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 22177984 - 22178024
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22177984 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccccgcgag 22178024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 22589501 - 22589537
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22589501 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22589537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 22593056 - 22593092
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22593056 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22593092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 22596611 - 22596647
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22596611 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22596647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 22760113 - 22760081
Alignment:
Q  60 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22760113 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 22760081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22880558 - 22880522
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22880558 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22880522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23693808 - 23693772
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23693808 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 23693772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 24222336 - 24222304
Alignment:
Q  60 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24222336 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 24222304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 25229060 - 25229096
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25229060 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25229096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 25293216 - 25293252
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25293216 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25293252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Original strand, 25808115 - 25808215
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||  ||| ||||||| |||||  ||||  |||| || || |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25808115 gcagagagcatgttagattttgtattttcgactttttagttggaccttgaatgccttagaatgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 25808214  T
Q  131 g 131  Q
    |    
T  25808215 g 25808215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 26360854 - 26360890
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26360854 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 26360890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Original strand, 26742376 - 26742436
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    ||||||||||| || |||  | | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26742376 cagagagcatgtaaaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26742436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 42805872 - 42805836
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42805872 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 42805836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43121513 - 43121477
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43121513 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 43121477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43125046 - 43125010
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43125046 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 43125010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 164)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Original strand, 16920263 - 16920751
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16920263 agagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattagaaaagaatgtagga 16920362  T
Q  133 tgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgactt 232  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16920363 taagattgtacctggaattaaacttatggaattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccagaaacaaagtgactt 16920462  T
Q  233 gttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgta 332  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |    
T  16920463 gttggattttgcgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaa 16920562  T
Q  333 taagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattat 432  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |    
T  16920563 taagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatact 16920662  T
Q  433 tatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16920663 tatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 521
Target Start/End: Original strand, 20360601 - 20361081
Alignment:
Q  44 aagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20360601 aagatttcgtgtttttgacttttcagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 20360700  T
Q  144 ctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttg 243  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20360701 ctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagctgaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttg 20360800  T
Q  244 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtt 343  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  20360801 cgacctttgttgcacgagttgttgaggattgaacctttgggtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgtt 20360900  T
Q  344 gttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca--- 439  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  20360901 gttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgc 20361000  T
Q  440 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  20361001 tgtttttgtatgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 22831994 - 22831503
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  22831994 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtttgaacatgtctaatattgattagtgaagaatatagg 22831895  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22831894 acgagattgaacctggaattaaactgatgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccgagaaacagagtgact 22831795  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    |||| ||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  22831794 tgttggattttgcgacctttgtcgcacgattcgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctga 22831695  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtataca--taagatgttgatgaattgaaattgatat 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22831694 ataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatat 22831595  T
Q  430 tattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
     |||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22831594 gattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 521
Target Start/End: Original strand, 20637915 - 20638404
Alignment:
Q  35 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 134  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20637915 agagcatccaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 20638014  T
Q  135 agattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgt 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20638015 agattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcacctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgt 20638114  T
Q  235 tagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtata 334  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||  ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  20638115 tagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggataacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttta 20638214  T
Q  335 agatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattatt 433  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20638215 agatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattatt 20638314  T
Q  434 atgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  20638315 atgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 32 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11185994 - 11185517
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||    
T  11185994 cagagagcatgtaagatttcgtatatttgatttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtcgaatattgattagtgaagagtgtagg 11185895  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11185894 acgagattgaacctggaattaaacttatgggattctaacctgaactcgccacggcgagcagaggccctcgcctcgtgagtgacccagaaacatagtgact 11185795  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||| ||     
T  11185794 tgttagattttgcgacctttgttgcatgggttgtcgaggatcggacccttgggtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatga 11185695  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  11185694 ataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataa 11185595  T
Q  432 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 509  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185594 ttatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 22779845 - 22780348
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22779845 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22779944  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22779945 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctaaactcgccacggcaagcaaaggctctcgcctcgcgagtaacctagaa 22780044  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||| || | |||||| ||||||    
T  22780045 acagagtgtcctgttaggttttgtgacctttgttgcacaagttgccgagagttgaaccttggggtagtataaagacttaatgatgatgttaatcataatc 22780144  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| |||    
T  22780145 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttg 22780244  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  22780245 caattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 22780343  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  22780344 gatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 19303159 - 19303661
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19303159 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 19303258  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||||||||||||||          |||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19303259 atgagattgaacctgaaaagatttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgagagtgacccagaaa 19303358  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || |||||||   ||||||||||| | |||||| | | ||| ||||| || | |||||||||||||    
T  19303359 cagagtgccttgttaggattttgcgatctatgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagcactgagaattaatgatgatgttaattataatc 19303458  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 418  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  19303459 tgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgactt 19303557  T
Q  419 gaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
    | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19303558 gcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgat 19303656  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  19303657 gatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 50 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 29061025 - 29060540
Alignment:
Q  50 tcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29061025 tcgtgatttcgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtccaataatgattaggaaggaatgtaggatgagattgaacctggaa 29060926  T
Q  150 tta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-a 238  Q
      |          ||||| ||| | |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  29060925 agattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagga 29060826  T
Q  239 ttttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagat 338  Q
    |||||||||||||||||| | |||||   |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29060825 ttttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagat 29060726  T
Q  339 atgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgt 437  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  29060725 gtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 29060626  T
Q  438 catgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29060625 catgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 17287414 - 17287917
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287414 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 17287513  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||| ||||| ||||||||           | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  17287514 atgtgattgtacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctaaactcgccacggcgattagaggctcttgtctcgtgagtgacccagaa 17287613  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||| |    
T  17287614 acagagtgtcttgttagggtttgctatctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacc 17287713  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  | |||||||| | ||| |||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| |||    
T  17287714 tgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttg 17287813  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  17287814 caattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 17287912  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  17287913 gatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 32 - 520
Target Start/End: Original strand, 18409445 - 18409947
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18409445 cagagagcatgcaggatttcgtgattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtaga 18409544  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18409545 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctctctagtgacccagaaa 18409644  T
Q  222 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||     
T  18409645 cagagtgccttgttaggattttacgacctttgttgcacgagttattgagagttgaaccttagggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataata 18409744  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||  ||   || ||   | |||||||| ||| |||    
T  18409745 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttg 18409844  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18409845 catttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 18409943  T
Q  517 gatg 520  Q
    ||||    
T  18409944 gatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 298
Target Start/End: Original strand, 18821463 - 18821714
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18821463 atttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctg 18821562  T
Q  147 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 246  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821563 gaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 18821662  T
Q  247 cctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagactt 298  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  18821663 cctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagactt 18821714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 20594276 - 20593773
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  20594276 cagagagcttgcaagatttcgtgatttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtctaaatatgattagggaagaatgtagg 20594177  T
Q  132 atgagattgaacctggaat----------taaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||           ||||||| ||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20594176 atgagattgaacctggaaagattgtagaataaacttttggaaatctgacctgaactcgctacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaa 20594077  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||  || |||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  20594076 cagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgataatgataattataatc 20593977  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || | || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||||| ||| |||    
T  20593976 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttg 20593877  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  20593876 catttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgat 20593778  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  20593777 gatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 521
Target Start/End: Original strand, 25628983 - 25629476
Alignment:
Q  42 gcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattga 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | || || |||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  25628983 gcaagatttcatgattttgactttttagttgaaccttagatgttgttaagcgcctaaacatctctattaatgattaggaaatattgtagaatgagattga 25629082  T
Q  142 acctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    |||||||| ||          ||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25629083 acctggaaatattttagaataaacttttgtgattatgacctgtactcgccgtggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgcct 25629182  T
Q  232 tgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 330  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  25629183 tgttaggattttgcgacttttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctg 25629282  T
Q  331 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatat 429  Q
    | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||    
T  25629283 tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatat 25629382  T
Q  430 tattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    | |||||||||| ||||   ||||||||| | |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25629383 tgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctg-ttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 349 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  349 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 211
Target Start/End: Original strand, 28496091 - 28496280
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  28496091 cagagagcatgtaagatttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtaga 28496190  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||          |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496191 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaacttttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 28496280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 211
Target Start/End: Original strand, 29808501 - 29808691
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  29808501 cagagagcatgtaagatttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtaga 29808600  T
Q  132 atgagattgaacctg------------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||            |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808601 atgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 29808691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21939886 - 21939699
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21939886 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtgtaatattgattaggaaagaatgtagg 21939787  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| ||||          |||| ||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21939786 atgagattgagcctggaaagacttagaataaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21939699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18457202 - 18457029
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18457202 atttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 18457103  T
Q  147 g---aatta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |   |||||      ||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18457102 gattaattaagaatgaactttttggaagctgacctgaactagccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 18457029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 1561806 - 1561689
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1561806 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtaga 1561707  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1561706 atgagattgaacctggaa 1561689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 371 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 16496396 - 16496244
Alignment:
Q  371 ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgt 467  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  16496396 ttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgt 16496297  T
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16496296 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Original strand, 25611347 - 25611530
Alignment:
Q  38 gcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgaga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||    
T  25611347 gcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagtgaatgcagcatgaga 25611446  T
Q  138 ttgaacctggaa----tta---------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||| ||||||||    |||         ||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25611447 ttggacctggaaagacttagaatgaaacaact--taggattctgacctgaactcgccatggagagcagaggctctcgcctcgcgag 25611530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Original strand, 15894049 - 15894237
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||    
T  15894049 agagagcatgcaagatttcgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaaga 15894148  T
Q  133 tgagattgaacctggaa----tta---------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||||    |||         ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15894149 tgagattggacctggaaagacttagaatgaaagaact--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagagtctctcacctcgcgag 15894237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Original strand, 22334500 - 22334617
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  22334500 cagagagcatgcaagatttcgtaaatttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaag 22334599  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  22334600 atgagattggacctggaa 22334617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19652685 - 19652581
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19652685 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagaatgagattgaacc 19652586  T
Q  145 tggaa 149  Q
    |||||    
T  19652585 tggaa 19652581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Original strand, 4667831 - 4667948
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  4667831 cagagagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtaga 4667930  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
     |||||||| ||||||||    
T  4667931 gtgagattggacctggaa 4667948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Original strand, 4674678 - 4674795
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  4674678 cagagagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtaga 4674777  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
     |||||||| ||||||||    
T  4674778 gtgagattggacctggaa 4674795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 494
Target Start/End: Original strand, 25603003 - 25603478
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |    
T  25603003 cagagagcatgcaagatttcgtgattttaacttttgagttgaacctgaaacgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagtgaatgcatg 25603102  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----tta---------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 218  Q
    ||||||||| ||||||||    |||         ||||  | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |      
T  25603103 atgagattggacctggaaagacttagaatgaaacaact--taggattctgacttgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagctagtcta 25603200  T
Q  219 aaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataa 318  Q
     |||||||||  |||| ||   |||||| || ||| ||   |||||   ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |  | ||| | || ||    
T  25603201 gaacagagtgcattgtgaggacttgcgatctgtgtcgcatgagttgcttagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaa 25603300  T
Q  319 tctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaat 417  Q
    ||||||||||||| |||||| | | ||   ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||  |  ||| |||  | |||||| | |||||    
T  25603301 tctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaat 25603399  T
Q  418 tgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 494  Q
    |  || ||||||| |||||||   |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  25603400 tataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctg-ttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Original strand, 4185441 - 4185558
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  4185441 cagagagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcatgaacaagtctaataacgattatgaaagaatgtaga 4185540  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
     |||||||||||||||||    
T  4185541 gtgagattgaacctggaa 4185558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 4189459 - 4189342
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  4189459 cagagagcatgcaagattctgtgttttttacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtaga 4189360  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
     |||||||| ||||||||    
T  4189359 gtgagattggacctggaa 4189342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Original strand, 31155016 - 31155133
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||     
T  31155016 cagagagcatgcaagattctgtttttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaataagtctaataacgattgggaaagaatgtaga 31155115  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31155116 atgagattgaacctggaa 31155133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 357 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  357 atgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatact 453  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||| ||   ||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||| ||||  || ||||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttact 20076767  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20076766 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333339
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394079
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 145
Target Start/End: Original strand, 31164473 - 31164589
Alignment:
Q  29 gagcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  31164473 gagcagagagcatgcaagattttgcaattttgacatttgagttgatacttggatgtccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgt 31164572  T
Q  129 aggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||||||| ||||    
T  31164573 aggatgagattggacct 31164589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 28496494 - 28496592
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28496494 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 29808905 - 29809003
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29808905 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23019896 - 23019792
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||||  |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  23019896 gatttcgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtgtgataatgattaggaaagattttagattgagattgaacct 23019797  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  23019796 ggaat 23019792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 149
Target Start/End: Original strand, 27332916 - 27333019
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  27332916 gatttcataattttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacct 27333015  T
Q  146 ggaa 149  Q
    ||||    
T  27333016 ggaa 27333019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 149
Target Start/End: Original strand, 27393656 - 27393759
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  27393656 gatttcataattttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacct 27393755  T
Q  146 ggaa 149  Q
    ||||    
T  27393756 ggaa 27393759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 376 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 20109285 - 20109157
Alignment:
Q  376 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 473  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttt 20109186  T
Q  474 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109185 attaactaagctgcatgagtcggtctaag 20109157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22439302 - 22439230
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 104  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22439302 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgt 22439230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 25656725 - 25656629
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25656725 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 1561401 - 1561303
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1561401 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 1595692 - 1595549
Alignment:
Q  376 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 472  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  1595692 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttatgttgctg-ttgtt 1595595  T
Q  473 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  1595594 atttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 2291195 - 2291342
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  2291195 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 2291293  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2291294 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 25644440 - 25644339
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 500  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |||| |||   |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644440 agatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25644341  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  25644340 ag 25644339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25754871 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 349 - 468
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416008
Alignment:
Q  349 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 445  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 27415985  T
Q  446 tgtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27415986 tgtatgctgcctatgttgctgtt 27416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 449 - 502
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098616
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 19863480 - 19863395
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  19863480 cagagagcatgtaagatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 19863395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019408
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaa 23019426  T
Q  502 gatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  23019425 gatg--aaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652199
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 210
Target Start/End: Original strand, 22080391 - 22080543
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa----tta------aactt 157  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||  | |||||||||||||||    |||      |||||    
T  22080391 agttgaaccttagatgtttttgagtgactgaacatgtctaataatgattagaaaagattagagattaagattgaacctggaatagtttaagaacgaactt 22080490  T
Q  158 gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
     ||||| |   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22080491 atgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22080543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22782323 - 22782227
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22782323 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Original strand, 27415572 - 27415632
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  27415572 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 27415632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 520
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 520  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  30676810 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 12742464 - 12742317
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  12742464 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12742366  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12742365 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 18334607 - 18334754
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18334607 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18334705  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18334706 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 19005193 - 19005046
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  19005193 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19005095  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19005094 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 19858934 - 19859081
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  19858934 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19859032  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19859033 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 24422694 - 24422547
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24422694 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24422596  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24422595 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 33861941 - 33861794
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  33861941 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33861843  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33861842 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 33864425 - 33864278
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  33864425 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33864327  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33864326 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 22432752 - 22432667
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||| |||||    
T  22432752 cagagagcatgcaagattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcatgaagatgtatattaaagatta 22432667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Original strand, 25956253 - 25956357
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| | |||  ||||||| |||||    
T  25956253 gatttcgtaattttgacttttaagttgaatcttagatatttttgagtgcctgaacatgtctaattacgattggaaaagattctagattgagatttaacct 25956352  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  25956353 ggaat 25956357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 520  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  34963435 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 1540926 - 1541073
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  1540926 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1541024  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  1541025 -gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 8055176 - 8055029
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  8055176 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt 8055078  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8055077 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18180974 - 18180903
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  18180974 atttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 18180903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19663220 - 19663065
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  |       
T  19663220 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaacaacct 19663121  T
Q  156 ttgt-gggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19663120 ttgttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctatcgcctcgcgag 19663065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 26924655 - 26924802
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  26924655 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 26924753  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26924754 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12496760 - 12496605
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaa-gaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 154  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  12496760 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtacctttaggtgcctattattgattagggaatgaat-tagaacgagattgaacctggaac-aac 12496663  T
Q  155 cttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||   |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12496662 cttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12496605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 372 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 18456866 - 18456732
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  18456866 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18456768  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456767 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18456732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 372 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 18462026 - 18461892
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  18462026 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18461928  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461927 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18461892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668390
Alignment:
Q  456 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22331917 - 22331803
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22331917 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 22331818  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  22331817 gacaagattgaacct 22331803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 459 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  459 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 408 - 498
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185919
Alignment:
Q  408 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 498  Q
    |||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076748
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 503  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23076748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 117
Target Start/End: Original strand, 25641802 - 25641887
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  25641802 cagagagcatgtaagattttgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 25641887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008166
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 503  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 35008166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25644811 - 25644711
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||   ||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  25644811 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgttcatgtataacgttgattaggaaagattttagattgagattgaacct 25644712  T
Q  146 g 146  Q
    |    
T  25644711 g 25644711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688518
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 25688518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 8227534 - 8227632
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8227534 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 474 - 521
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  474 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Original strand, 22334648 - 22334699
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22334648 tgggattctgacctaaactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgag 22334699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 459 - 505
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821949
Alignment:
Q  459 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18821949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 21834533 - 21834595
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21834533 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaaaatgtttattaaagattag 21834595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 448 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443062
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 33443062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Original strand, 4185588 - 4185629
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4185588 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4185629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Original strand, 4667978 - 4668019
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4667978 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4668019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 515
Target Start/End: Original strand, 16448593 - 16448686
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  16448593 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 22429684 - 22429839
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  22429684 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttctgagtgcctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaa-caacc 22429782  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22429783 ttagctgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22429839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14099104 - 14099004
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14099104 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14099005  T
Q  131 g 131  Q
    |    
T  14099004 g 14099004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Original strand, 20556958 - 20557054
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  20556958 ttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 209
Target Start/End: Original strand, 27333049 - 27333089
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27333049 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 27333089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 209
Target Start/End: Original strand, 27393789 - 27393829
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27393789 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 27393829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 459 - 518
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852179
Alignment:
Q  459 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Original strand, 16523045 - 16523108
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||| || ||| ||||||    
T  16523045 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagcgccttaagatgtttattaaagattag 16523108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19652551 - 19652512
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19652551 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcg 19652512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Original strand, 1538628 - 1538686
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1538628 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 1538686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Original strand, 1544727 - 1544785
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1544727 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 1544785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 21739665 - 21739727
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21739665 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttactaaagattag 21739727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Original strand, 34295696 - 34295810
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| || |||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  34295696 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgaatttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtgatgattaggaatgaatgtag 34295795  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  34295796 gacaagattgaacct 34295810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 408 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186390
Alignment:
Q  408 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 498  Q
    |||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4186390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Original strand, 15041192 - 15041285
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga 148  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||   | ||  ||| |||||||||||||||||    
T  15041192 attttgacttttgagttataccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttaataaaggttagatgataacttagaatgagattgaacctgga 15041285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16372280 - 16372223
Alignment:
Q  87 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  16372280 ttgagtgcctgaacatatctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacc 16372223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 210
Target Start/End: Original strand, 16924642 - 16924687
Alignment:
Q  165 tctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16924642 tctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16924687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 210
Target Start/End: Original strand, 16929357 - 16929402
Alignment:
Q  165 tctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16929357 tctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16929402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17804649 - 17804494
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  17804649 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaac-aacc 17804551  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17804550 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17804494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 19873196 - 19873120
Alignment:
Q  440 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19873196 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20109682 - 20109605
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  20109682 agttgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 20109605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 22432325 - 22432249
Alignment:
Q  440 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22432325 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 22438875 - 22438799
Alignment:
Q  440 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22438875 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Original strand, 31155163 - 31155204
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31155163 acctgtactctccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 31155204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 34833132 - 34833031
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  34833132 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 34833033  T
Q  131 ga 132  Q
    ||    
T  34833032 ga 34833031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19668728 - 19668688
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19668728 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 19668688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 23657189 - 23657229
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23657189 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23657229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 494
Target Start/End: Original strand, 15041465 - 15041644
Alignment:
Q  317 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatat-ttgtatacataagatgttgatga 415  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||| || | |||||  | |||||||||||| || | | ||| |||| |||||||||  |||    
T  15041465 aatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgtatgtgcattacttga-gattttattgaatacttaagatgttattga 15041563  T
Q  416 attgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 494  Q
    |||| | |||||||||| ||||||||   |||||||   ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  15041564 attgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactatt-gttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 16523176 - 16523211
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16523176 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16523211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16741659 - 16741503
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  | |||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  16741659 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtatctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacc 16741561  T
Q  156 tt---gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||    ||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16741560 ttaggttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16741503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 506
Target Start/End: Original strand, 18199473 - 18199523
Alignment:
Q  455 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 506  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18199473 cctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 18199523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19863326 - 19863291
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19863326 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19863291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19873468 - 19873433
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19873468 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19873433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21702619 - 21702584
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21702619 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21702584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Original strand, 22059362 - 22059429
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22059362 cagagagcatgttggatttcgtgattttaagctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 22059429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 96
Target Start/End: Original strand, 22405709 - 22405748
Alignment:
Q  57 tttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22405709 tttgacttttgagttgaaccttagatgctttagagtgcct 22405748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22432598 - 22432563
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22432598 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22432563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 22592578 - 22592613
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22592578 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22592613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 25135446 - 25135481
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25135446 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 25135481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Original strand, 25641940 - 25641991
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25641940 tgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 25641991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 27567383 - 27567418
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27567383 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 27567418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 20803206 - 20803362
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 154  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |  ||| || |||||| |||| || | ||| |  |||||||||||||||  |||    
T  20803206 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtaactactattgattagggaatgattttagaacaagattgaacctggaa-aaaa 20803304  T
Q  155 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||   ||| |||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20803305 cttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 20803362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23019763 - 23019721
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  23019763 acctgaactcgccatggcgagtagaggcccttgcctcgcgagt 23019721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 30694784 - 30694738
Alignment:
Q  87 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  30694784 ttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 30694738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35008503 - 35008465
Alignment:
Q  172 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35008503 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 35008465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Original strand, 2287677 - 2287714
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2287677 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 2287714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Original strand, 2684995 - 2685088
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  2684995 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa 2685088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Original strand, 4674825 - 4674866
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4674825 accttaactcgtcatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4674866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 5616468 - 5616623
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || ||||||   ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  5616468 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattatagaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacc 5616566  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||| |||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5616567 ttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 5616623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8523282 - 8523245
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8523282 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 8523245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12707140 - 12706985
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||   | ||| | || |||||||||||||  || |    
T  12707140 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgttttagaacgaaattgaacctggaa-caacc 12707042  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12707041 ttagttgggaatctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12706985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14472692 - 14472647
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14472692 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 14472647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15539629 - 15539592
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15539629 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 15539592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Original strand, 15685871 - 15685908
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15685871 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 15685908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16830152 - 16830111
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16830152 accttaactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 16830111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18907452 - 18907419
Alignment:
Q  177 tcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18907452 tcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18907419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 19863027 - 19862978
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19863027 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 212
Target Start/End: Original strand, 22405838 - 22405875
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtg 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22405838 actcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgagtg 22405875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 140
Target Start/End: Original strand, 25594981 - 25595090
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||   |||  |||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | | ||||||    
T  25594981 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttgaaccttgagtgcccttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggatggatgtag 25595080  T
Q  131 gatgagattg 140  Q
    || |||||||    
T  25595081 gacgagattg 25595090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 144
Target Start/End: Original strand, 34369658 - 34369715
Alignment:
Q  87 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  34369658 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacc 34369715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 1587385 - 1587421
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1587385 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 1587421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4189307 - 4189271
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4189307 aactcgtcatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 4189271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 9098290 - 9098330
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9098290 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgag 9098330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12596308 - 12596272
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12596308 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 12596272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 207
Target Start/End: Original strand, 15041307 - 15041355
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 207  Q
    ||||| |||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15041307 tgggaatctgacttgtactcgccatgacgagcagatgctctcgcctcgc 15041355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16102694 - 16102658
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16102694 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 16102658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16813127 - 16813091
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16813127 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 16813091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20109496 - 20109456
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20109496 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgag 20109456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 21702739 - 21702699
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  21702739 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 21702699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 25766822 - 25766858
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25766822 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25766858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 133
Target Start/End: Original strand, 27327735 - 27327787
Alignment:
Q  81 atgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27327735 atgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 27327787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 133
Target Start/End: Original strand, 27388475 - 27388527
Alignment:
Q  81 atgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27388475 atgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 27388527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29493104 - 29493068
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29493104 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 29493068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 5204 - 4712
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5204 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 5105  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  5104 atgagattgaatctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccataataagagtgact 5005  T
Q  232 tgttaga-ttttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 330  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  5004 tgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttg 4905  T
Q  331 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 430  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |     
T  4904 tataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgta 4805  T
Q  431 attatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
     ||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4804 tttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 32 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 428 - 13
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  428 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 329  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  328 atgagattgaatctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccataataagagtgact 229  T
Q  232 tgttaga-ttttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 330  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  228 tgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttg 129  T
Q  331 tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 430  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |     
T  128 tataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgta 29  T
Q  431 attatgtcatgttgtt 446  Q
     |||||||||| ||||    
T  28 tttatgtcatgctgtt 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 518
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5246
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 4859  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4860 atgagattgaacctggaattgaacttatgggattctgacctgaactcgccaaagagagcagaggatctcgcctcgcgagtgacacagaaacagagtgact 4959  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    | || ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  4960 tattggattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactga 5059  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5060 ataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 5159  T
Q  432 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5160 ttatgtcatgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 47478 - 46995
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47478 cagagagcatgcaagatttcgtattgttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtctaataatgattaggaatgaatgtagg 47379  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47378 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgagctcgccacggagcgcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaccagagtgact 47279  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    |||||||  | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||||||||||||||||||    
T  47278 tgttagaaatggcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgag------tataatctgtgaagctgt 47185  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47184 ataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 47085  T
Q  432 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47084 ttatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Original strand, 64306 - 64367
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  64306 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 64367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 241)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 20698065 - 20698556
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698065 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 20698164  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698165 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 20698264  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  20698265 tgttagattttgcgacctttgtggcacgagttgtcgagagttgaacctttggatagaattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 20698364  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
      ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20698365 tcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatatta 20698464  T
Q  432 ttatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20698465 ttacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 17488359 - 17487856
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488359 agagagcatgcaagatttcgtgaatttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 17488260  T
Q  133 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||||||||||||||||           | |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17488259 tgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtaggattctgacctgaaatcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaa 17488160  T
Q  222 -cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17488159 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatc 17488060  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  17488059 tgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 17487960  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17487959 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 17487861  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  17487860 gatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 17499841 - 17499338
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499841 agagagaatgcaagatttcatgattttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 17499742  T
Q  133 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||||||||||||||||           | |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  17499741 tgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgttggattctgacctgaattcgccacggtgagcagaggctctcgcctctctagtgacctagaaa 17499642  T
Q  222 -cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||     
T  17499641 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatt 17499542  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  17499541 tgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 17499442  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17499441 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 17499343  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  17499342 gatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 84 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 13442725 - 13442274
Alignment:
Q  84 cttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacct 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||    
T  13442725 cttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacct 13442626  T
Q  173 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagt 272  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13442625 gaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagt 13442526  T
Q  273 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 371  Q
    |||||| | || |   ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  13442525 tgaaccttgggatgacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 13442426  T
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |    
T  13442425 tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccg-t 13442327  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13442326 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 26687390 - 26686887
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687390 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 26687291  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687290 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 26687191  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| | | | || |||||||||||  | |||||| |||  |||||||| |  | |||||||||||||    
T  26687190 acagagtgtcttgttaggttttacgacctttgttgcacgaatcgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatc 26687091  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||  ||||||| || ||| |||    
T  26687090 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttg 26686991  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  26686990 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgat 26686892  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  26686891 gatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 12399698 - 12399209
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12399698 cagagagcatgctagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatatagg 12399599  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  12399598 atgggtttgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtaaaggctctcgcctcacgagtgacccagaaac--agtgact 12399501  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| | |||||| | |  || | || |||||||| |||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  12399500 tgttag-ttttccgacctttgttgcacgagttgttggggattaagcctttgggtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctat 12399402  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 430  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  12399401 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatatt 12399302  T
Q  431 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12399301 attatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 18439037 - 18438534
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18439037 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaaa 18438938  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438937 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaagttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 18438838  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||| |||||||    
T  18438837 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagtgttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatc 18438738  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||   |||||| | ||||||||| ||| |||    
T  18438737 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttg 18438638  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     | ||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18438637 catttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 18438539  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  18438538 gatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 14973357 - 14972854
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14973357 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 14973258  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||||||| |||| | ||     |||     ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14973257 atgagattaaaccagaaaagattttagaaagaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaa 14973158  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  | ||| || |||||||   ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  14973157 cagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 14973058  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    | ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   |||||| || |||||||| ||| |||    
T  14973057 tatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttg 14972958  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14972957 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 14972859  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  14972858 gatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 32 - 502
Target Start/End: Original strand, 14576451 - 14576934
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  14576451 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagaatgtaga 14576550  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||| |||||||||||||          | |||| | ||| | |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14576551 atgacattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaa 14576650  T
Q  222 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| || | |||||||||||||    
T  14576651 caaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatc 14576750  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  14576751 tgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 14576850  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttgttg--tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14576851 caattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaag 14576934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 32 - 518
Target Start/End: Original strand, 40213339 - 40213838
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213339 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatcattagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 40213438  T
Q  132 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||  |          ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213439 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttgggaatctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 40213538  T
Q  222 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  40213539 cagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 40213638  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |  ||   ||||||  | |||||||| ||| |||    
T  40213639 tgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttg 40213738  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     | ||||||||||||||||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||    
T  40213739 catttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgat 40213836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 35 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 14573088 - 14572608
Alignment:
Q  35 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 134  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14573088 agagcatgcaagattttgtgtttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatg 14572989  T
Q  135 agattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacag 224  Q
    |||||||||||||||          | |||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14572988 agattgaacctggaaagacttagaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacag 14572889  T
Q  225 agtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgt 323  Q
    |||  |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||    
T  14572888 agtaccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgt 14572789  T
Q  324 gaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaa 422  Q
    |||| ||| |||||| ||||  || || ||||||||||||||||||  || | ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |   ||    
T  14572788 gaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaa 14572689  T
Q  423 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572688 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 14572608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 23082979 - 23083482
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  23082979 cagagagcatgtcagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctggatatgtctaatagtgattaggacaaaatgtagg 23083078  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacc-tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||| ||||||||          | |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23083079 atgagattggacctggaaagatttagaatgaaactttttggattctgacccttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaa 23083178  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| | || | |||||||| ||||    
T  23083179 acatagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttcagagttgaaccttgaggtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatc 23083278  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| | | ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  23083279 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttg 23083378  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23083379 caattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23083477  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  23083478 gatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 11424381 - 11424880
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  11424381 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtaga 11424480  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||||||||||||||          |||| |||||| | | | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11424481 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgaactctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcgacctagaaa 11424580  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| ||| |||||||||  | | ||||||| |||||    
T  11424581 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatc 11424680  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   || |||  | ||||||||||   |||    
T  11424681 tgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttg 11424777  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
      ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  11424778 ctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 11424876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 25476003 - 25476506
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  25476003 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtaga 25476102  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||| ||||||||||           | |||||| ||| || ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476103 atgagatcgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaat-ctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 25476201  T
Q  221 acagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| |  | |||||||| |||    
T  25476202 acagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaat 25476301  T
Q  320 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat--gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaat 417  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| |    
T  25476302 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatg-ttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgact 25476400  T
Q  418 tgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 514  Q
    || | |||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  25476401 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctg-ttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 25476499  T
Q  515 atgatgt 521  Q
    |||||||    
T  25476500 atgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 30030331 - 30029859
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  30030331 cagagagcatgcaagatttcgtaaatttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaacatgtctaataatgattacgaaagaatgtggg 30030232  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaac-ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtga-cccagaaacagagtga 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||     
T  30030231 atgagattgaacctggaatgaaacagtttggaattctgacct-aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaatcccag-aacagaatgc 30030134  T
Q  230 cttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagct 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || | ||| | |||||| |||||||||    
T  30030133 cttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagct 30030034  T
Q  330 gtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgata 428  Q
    || |||||| | |||    ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||  |  ||| |||  ||||| |||| ||||||| || |||||    
T  30030033 gtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgata 30029935  T
Q  429 ttattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    || ||||||||   ||||||||||  ||| ||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  30029934 ttcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgct-attgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaag 30029859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 147 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 43841309 - 43840932
Alignment:
Q  147 gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcga 246  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43841309 gaatgaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcga 43841210  T
Q  247 cctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgtt 346  Q
    |||||||| | | |||||| |||||||  ||  | |||||| |||  |||||||  |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  43841209 cctttgttacacgagttgttgagagtttgactttggggtagtattgggacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgat 43841110  T
Q  347 gatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgt 442  Q
    | |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||    
T  43841109 gttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 43841010  T
Q  443 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    | |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||    
T  43841009 ttttgtatactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 32 - 218
Target Start/End: Original strand, 17247904 - 17248100
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17247904 cagagaggttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 17248003  T
Q  132 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 218  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17248004 atgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 17248100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 505
Target Start/End: Original strand, 53070321 - 53070802
Alignment:
Q  36 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 135  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53070321 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatga 53070420  T
Q  136 gattgaacctgg---aatta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagag 226  Q
    ||||||||||||   |||||      ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||   |||||     
T  53070421 gattgaacctggattaattaagaatgaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacaga- 53070519  T
Q  227 tgacttgtt--agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtag-gattaagacttaataataaggttaattataatctgt 323  Q
     | ||||||   |||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||| | ||||||  || || | |  || ||||  ||||| || || |||    
T  53070520 agccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattgtat-ataatattaatgatgatttgt 53070618  T
Q  324 gaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 421  Q
    ||||||| | || |||   ||| || || |||   |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| |    
T  53070619 gaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgca 53070717  T
Q  422 attgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
     |||||||||||||||| |||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070718 tttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactg-ttatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53070802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 33 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16809887 - 16809724
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16809887 agagagcatgctagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcttgaacat----aataatgattaggaaagaatgtagga 16809792  T
Q  133 tgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctc 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16809791 tgagattgatcctggaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgctctc 16809724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12340255 - 12340068
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12340255 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 12340156  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12340155 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatct-aactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 12340068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 14179825 - 14179708
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14179825 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 14179726  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
    |||||||||||| |||||    
T  14179725 atgagattgaacttggaa 14179708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14669263 - 14669076
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14669263 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatgtctaatattgaataggaaagaatgtagg 14669164  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14669163 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgag 14669076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 43842681 - 43842572
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43842681 cagagagcatgcaagatttcatgattttgactttttagttgatccttagatgcttttgagtgcctgagcatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 43842582  T
Q  132 atgagattga 141  Q
    ||||||||||    
T  43842581 atgagattga 43842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16796875 - 16796685
Alignment:
Q  196 ctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaaga 295  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16796875 ctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgaattgttaagagttgaacctttgggtagcattaaga 16796776  T
Q  296 cttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 385  Q
    |||||| |  ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16796775 cttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 210
Target Start/End: Original strand, 12851984 - 12852169
Alignment:
Q  34 gagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12851984 gagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagtttaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 12852083  T
Q  134 gagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||| |||          |||| |||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12852084 gagattgaatctggaaagacttagaatgaaacttttgataatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgag 12852169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14666108 - 14665921
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14666108 cagagagcatgcaagattttatgattttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtagg 14666009  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14666008 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 14665921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14735621 - 14735434
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14735621 cagagagcatgcaagattttatgattttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtagg 14735522  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14735521 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 14735434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 309 - 518
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  309 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  408 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  506 ttgaagatgatga 518  Q
     | ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 42386890 - 42386429
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 146  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| || || ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| | |||  || |||||||||||             
T  42386890 ttttgacctttaagttgaaccttagttgtttatgagtgcatgaacatgcataataatgattaggcaagactttagactgtgattgaacctgaaatagtta 42386791  T
Q  147 -gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta--gattttg 243  Q
     |||| |||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||   |||||  | ||||||   |||||||    
T  42386790 agaatgaaacttttgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggattttg 42386692  T
Q  244 cgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgt 342  Q
    ||| |||||| || | |||||| | |||||||||| | |||||| |||  |||||  | || | |||||| ||||||||||||||||| | ||||| | |    
T  42386691 cgaactttgtcgcacgagttgttgtgagttgaaccttggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttt 42386592  T
Q  343 tgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 441  Q
    || || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||   || |||  | |||||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||||    
T  42386591 tgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatg 42386492  T
Q  442 ttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
     ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386491 ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaag 42386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Original strand, 13209946 - 13210062
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  13209946 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaat-atgattaggaaagaaagtaga 13210044  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13210045 atgagattgaacctggaa 13210062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 148
Target Start/End: Original strand, 49389275 - 49389378
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  49389275 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 49389374  T
Q  145 tgga 148  Q
    ||||    
T  49389375 tgga 49389378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Original strand, 17247142 - 17247236
Alignment:
Q  36 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17247142 gagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgccggaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 17247236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32308158 - 32307983
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  32308158 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 32308059  T
Q  145 t-ggaa----tta----aacttgtgggattctg-acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    | ||||    |||     | || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32308058 taggaagactttagaatgaattttggga-actgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 32307983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 146
Target Start/End: Original strand, 4588457 - 4588547
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588457 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 4588547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Original strand, 12933941 - 12934045
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  12933941 agatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 12934040  T
Q  145 tggaa 149  Q
    |||||    
T  12934041 tggaa 12934045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9513400 - 9513299
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  9513400 agatttcgtactattgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 9513301  T
Q  145 tg 146  Q
    ||    
T  9513300 tg 9513299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9521375 - 9521274
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  9521375 agatttcgtactattgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 9521276  T
Q  145 tg 146  Q
    ||    
T  9521275 tg 9521274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16104268 - 16104168
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  16104268 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgaggttgaacctg 16104169  T
Q  147 g 147  Q
    |    
T  16104168 g 16104168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Original strand, 1644314 - 1644415
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  1644314 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttggatgtttttgagtgcctgaacatgtctgataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 1644413  T
Q  145 tg 146  Q
    ||    
T  1644414 tg 1644415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16097820 - 16097719
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  16097820 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataattattaggaaagattggagaatgagattgaacc 16097721  T
Q  145 tg 146  Q
    ||    
T  16097720 tg 16097719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Original strand, 49667715 - 49667818
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  49667715 agatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatg-ttttgagcgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacc 49667813  T
Q  145 tggaa 149  Q
    |||||    
T  49667814 tggaa 49667818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 13210350 - 13210448
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13210350 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 124
Target Start/End: Original strand, 12171750 - 12171827
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 124  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171750 atttcgtaattttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 12171827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668193
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 423 - 521
Target Start/End: Original strand, 43550544 - 43550644
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43550544 ttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 43550642  T
Q  520 gt 521  Q
    ||    
T  43550643 gt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470927
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15470944  T
Q  502 gatgttgaagatgatgatgt 521  Q
       |||||||||||||||||    
T  15470943 ---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512924
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520899
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174376
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15471413 - 15471309
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  15471413 gatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaacatgtataatgatgattaggaaagattggagattaagattgaacct 15471314  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  15471313 ggaat 15471309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 353 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856140
Alignment:
Q  353 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtat 450  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||     
T  856304 tatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaa 856206  T
Q  451 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
     ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  856205 tctgcctatgttgct-attgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 308 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  308 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 385  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 117
Target Start/End: Original strand, 15877447 - 15877532
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  15877447 cagagagcatgcaagatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 15877532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 404 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27165366 - 27165250
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||| ||||||| ||| | ||||||||  ||| |||||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165366 agatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 27165267  T
Q  502 gatgttgaagatgatga 518  Q
    | || | ||||||||||    
T  27165266 gttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 449 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307696
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32307696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 449 - 505
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523834
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 52523834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 9707622 - 9707769
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  9707622 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 9707720  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  9707721 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234487
Alignment:
Q  405 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaag 14234506  T
Q  503 atgttgaagatgatgatgt 521  Q
     || | |||||||||||||    
T  14234505 ttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 24340746 - 24340844
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  24340746 gatattattatatcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 29172598 - 29172745
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  29172598 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 29172696  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29172697 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17672688 gc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 456 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  456 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242838
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
     | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242884 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 50242838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Original strand, 53301572 - 53301669
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53301572 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166598
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  502 gatgttgaagatgatga 518  Q
    | || | ||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38814836 - 38814681
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  38814836 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaaggatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 38814738  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38814737 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 38814681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 453 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  453 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103784
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 324702 - 324627
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 143  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  324702 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 324627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 7781362 - 7781509
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  7781362 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 7781460  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7781461 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  13544087 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 17463325 - 17463178
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  17463325 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17463227  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17463226 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110457
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 28848626 - 28848773
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  28848626 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 28848724  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28848725 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 34159473 - 34159326
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34159473 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34159375  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34159374 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925974
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 43925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 45606922 - 45607069
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  45606922 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 45607020  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45607021 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 55476638 - 55476491
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  55476638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 55476540  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  55476539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 839723 - 839543
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  839723 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgacttttaagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 839624  T
Q  131 gatgagattgaacctggaattaaacttgt--gggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||  ||||||||||| |||  | | | ||  |||| | |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  839623 gacaagattgaacctagaacaacattagttggggagt-tgacttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgag 839543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567576
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567622 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12567576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14234979 - 14234881
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  14234979 gatttcataattttgacctttaagttgaaccttagatttttttgagtgcctgaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattgagattgaacc 14234881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 517
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251283
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg--gaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17242424 - 17242269
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  17242424 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 17242326  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17242325 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17242269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 406 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  406 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  503 atgttgaagatgatga 518  Q
     || | ||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 144
Target Start/End: Original strand, 2050855 - 2050931
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  2050855 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctcaacatgtgtaataatgattaggaaagattctagattgagattgaacc 2050931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Original strand, 6469200 - 6469296
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6469200 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 8499614 - 8499518
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8499614 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15977611 - 15977515
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15977611 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 8899241 - 8899094
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  8899241 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 8899143  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  8899142 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 16454296 - 16454443
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  16454296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16454394  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16454395 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 502
Target Start/End: Original strand, 38961906 - 38962037
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  38961906 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 38962004  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962005 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 38962037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 150
Target Start/End: Original strand, 1465051 - 1465145
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    ||||||| ||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||| | || ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  1465051 ttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattatgaaagattgtagattgagattgaacctggaat 1465145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Original strand, 1644447 - 1644489
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644447 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 1644489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24188254 - 24188140
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24188254 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 24188155  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  24188154 gacaagattgaacct 24188140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 46822386 - 46822267
Alignment:
Q  402 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 498  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  46822386 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 46822288  T
Q  499 taagatgttgaagatgatgat 519  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  46822287 taagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Original strand, 49667848 - 49667890
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49667848 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 49667890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 55149455 - 55149341
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  55149455 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 55149356  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  55149355 gacaagattgaacct 55149341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 505
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606431
Alignment:
Q  452 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatg 606431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3834126 - 3833971
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | |||||||||||| |||  || |    
T  3834126 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctagaac-aacc 3834028  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3834027 ttggttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 3833971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 96
Target Start/End: Original strand, 17674209 - 17674258
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17674209 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17674258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618465
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21618466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Original strand, 12119791 - 12119887
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12119791 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 448 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377938
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagat 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 13151805 - 13151953
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13151805 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13151903  T
Q  469 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13151904 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 13154270 - 13154418
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13154270 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13154368  T
Q  469 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13154369 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15412525 - 15412429
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15412525 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 147
Target Start/End: Original strand, 18383559 - 18383651
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  || ||| ||||||||||||||||    
T  18383559 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacctgg 18383651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20723478 - 20723298
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   |||  |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20723478 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgccattgagtgcttgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 20723379  T
Q  131 gatgagattgaacctggaattaaacttg-tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||  ||||||||||| |||  | | | | |||||  ||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20723378 gacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 20723298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 425 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 23274785 - 23274706
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23274785 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 149
Target Start/End: Original strand, 52523390 - 52523462
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||    
T  52523390 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtgtaataattattaggaaagattctagtttgatattgaacctggaa 52523462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 10247738 - 10247885
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  10247738 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 10247836  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10247837 -gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 12496731 - 12496668
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12496731 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 12496668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 516
Target Start/End: Original strand, 16282880 - 16282971
Alignment:
Q  426 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16282880 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 17446670 - 17446816
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  17446670 tatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17446768  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  17446769 -gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737236
Alignment:
Q  459 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Original strand, 19725669 - 19725720
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19725669 tgggattctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19725720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 37642288 - 37642386
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  37642288 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Original strand, 12934075 - 12934117
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12934075 acctgaactcgccatggcgagcagagactctcgcctcgcgagt 12934117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15060768 - 15060706
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  15060768 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 15060706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 146
Target Start/End: Original strand, 22109929 - 22110007
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  22109929 agttgaactttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagtttgagattgaacctg 22110007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23408928 - 23408847
Alignment:
Q  35 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  23408928 agagcatgcaagaattcgtaattttgacttttgagttgaaccttagat-attatgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 23408847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 518
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 1598134 - 1598289
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| | |||||||||||| |||  || |    
T  1598134 ttttgacttttgagttgaaccttagatacttttgagtacctttaggtgcctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacctagaac-aacc 1598232  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1598233 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 1598289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 96
Target Start/End: Original strand, 3402608 - 3402649
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3402608 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 3402649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 11300165 - 11300320
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  || |    
T  11300165 ttttgacttttgaattgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaac-aacc 11300263  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11300264 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 11300320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 12511177 - 12511059
Alignment:
Q  403 aagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 499  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  12511177 aagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattct 12511079  T
Q  500 aagatgttgaagatgatgat 519  Q
    ||| || | |||||| ||||    
T  12511078 aagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 15849739 - 15849894
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  15849739 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaac-aacc 15849837  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||  ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15849838 ttggttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15849894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Original strand, 3389600 - 3389640
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3389600 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 3389640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4291249 - 4291149
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4291249 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 4291150  T
Q  131 g 131  Q
    |    
T  4291149 g 4291149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Original strand, 11298172 - 11298212
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11298172 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 11298212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Original strand, 26190652 - 26190692
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26190652 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 26190692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 323065 - 323026
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgc 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  323065 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 323026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Original strand, 12037572 - 12037639
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  12037572 cagagagcatgttggatttcgtgattttgacatgtgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 12037639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 14501666 - 14501615
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14501666 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 14501615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 15941558 - 15941713
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | |||||||||||| |||  |       
T  15941558 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacctagaacaaccg 15941657  T
Q  156 ttgtggga-ttctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    | || ||| ||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15941658 tagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15941713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Original strand, 19725546 - 19725617
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||  ||||| ||||||    
T  19725546 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgtgtgccttaagatgttgaataaagattag 19725617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23275208 - 23275133
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 143  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  23275208 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 23275133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 324591 - 324549
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  324591 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 324549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 12173261 - 12173199
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12173261 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 12173199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15051992 - 15051930
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  15051992 attttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 15051930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16097687 - 16097645
Alignment:
Q  168 gacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16097687 gacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 16097645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 23077121 - 23077183
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  23077121 ttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 23077183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Original strand, 23704428 - 23704510
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23704428 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 23704510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Original strand, 23722884 - 23722966
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23722884 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 23722966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Original strand, 23741340 - 23741422
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23741340 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 23741422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Original strand, 41201457 - 41201539
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41201457 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 41201539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 207
Target Start/End: Original strand, 49389408 - 49389446
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49389408 acctgaactcgccatggcgagcagaggttctcgcctcgc 49389446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 326818 - 326973
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  326818 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaac-aacc 326916  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  326917 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 326973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 149
Target Start/End: Original strand, 605945 - 606026
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   | |||  |||||||||||||||||    
T  605945 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatgtgtataataatgattaggcaattttctagattgagattgaacctggaa 606026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 856611 - 856550
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  856611 ttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 856550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Original strand, 1465174 - 1465215
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1465174 acctgaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 1465215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9513265 - 9513228
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9513265 acctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcg 9513228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9521240 - 9521203
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9521240 acctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcg 9521203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 11852055 - 11852006
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11852055 atttcgtaattttaacttttcagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 11852006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 210
Target Start/End: Original strand, 13210096 - 13210133
Alignment:
Q  173 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13210096 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 13210133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15483114 - 15482959
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||  ||  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  15483114 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctggaac-aacc 15483016  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   | ||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15483015 ttagtttggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15482959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 144
Target Start/End: Original strand, 15691950 - 15692019
Alignment:
Q  75 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15691950 ccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 15692019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 517
Target Start/End: Original strand, 15878092 - 15878168
Alignment:
Q  440 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15878092 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16333649 - 16333548
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| || | || ||||||| |||||  |||||  ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  16333649 gcagagagcatgttagattttgtaacttcgactttttagttggaccttaagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 16333550  T
Q  131 ga 132  Q
    ||    
T  16333549 ga 16333548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 211
Target Start/End: Original strand, 37250932 - 37250973
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37250932 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 37250973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 43927638 - 43927597
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43927638 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattag 43927597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Original strand, 321657 - 321697
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  321657 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 321697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 209
Target Start/End: Original strand, 12171869 - 12171909
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12171869 acctgaactggccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 12171909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919344
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 506  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 13919344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Original strand, 17524817 - 17524857
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17524817 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 17524857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 22110116 - 22110156
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22110116 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22110156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 119
Target Start/End: Original strand, 603258 - 603345
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| | || | |||| || |||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  603258 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgagctgtgagtttaaccctggatgtttatgagagcctgaacatgtactataatgattagg 603345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 3402729 - 3402764
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3402729 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 3402764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 11594913 - 11594948
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11594913 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 11594948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11863148 - 11863105
Alignment:
Q  163 attctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 206  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11863148 attctggcttgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcg 11863105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12173131 - 12173096
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12173131 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12173096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12496600 - 12496565
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12496600 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12496565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13251166 - 13251095
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  13251166 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 13251095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13257812 - 13257741
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  13257812 ctttttagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggat 13257741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15051861 - 15051826
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15051861 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15051826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15060637 - 15060602
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15060637 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15060602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 15877601 - 15877636
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15877601 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15877636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16369769 - 16369718
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16369769 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgag 16369718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16369884 - 16369845
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgc 94  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16369884 attttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 16369845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16690551 - 16690516
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16690551 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16690516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16697124 - 16697089
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16697124 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16697089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 16797828 - 16797863
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16797828 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16797863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 16808655 - 16808690
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16808655 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16808690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16910095 - 16910060
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16910095 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16910060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 18383690 - 18383725
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18383690 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18383725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 20461274 - 20461309
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20461274 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20461309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Original strand, 23052711 - 23052762
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctga 98  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23052711 attttgtgattttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctga 23052762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 23052850 - 23052885
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23052850 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23052885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 23077251 - 23077286
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23077251 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23077286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23408778 - 23408743
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23408778 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23408743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 119
Target Start/End: Original strand, 23412827 - 23412878
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  23412827 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataaaaatgattagg 23412878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 26190782 - 26190817
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26190782 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 26190817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42326276 - 42326241
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42326276 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 42326241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 45797710 - 45797659
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45797710 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 45797659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 316654 - 316612
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  316654 ttagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 316612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11070517 - 11070435
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  11070517 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 11070435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Original strand, 11165189 - 11165271
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  11165189 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 11165271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14234847 - 14234809
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14234847 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgc 14234809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14499774 - 14499692
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  14499774 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 14499692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 14878148 - 14878210
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  14878148 ttttgacttttgagttgaaccttatatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 14878210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Original strand, 15726591 - 15726673
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  15726591 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgaaggatcagattgaacc 15726673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 439 - 517
Target Start/End: Original strand, 23077517 - 23077594
Alignment:
Q  439 atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||| | |||||||||    
T  23077517 atgttgttgtgatctgcctatgttgctgtt-gttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 30066395 - 30066313
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  30066395 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 30066313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 132
Target Start/End: Original strand, 41092030 - 41092076
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  41092030 tttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtagga 41092076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 55023294 - 55023212
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  55023294 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 55023212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 5149596 - 5149709
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||| | |    
T  5149596 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttgg 5149695  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    ||| ||||||||||    
T  5149696 gatcagattgaacc 5149709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 7793000 - 7793155
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  7793000 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaa-caacc 7793098  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7793099 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgag 7793155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12891883 - 12891782
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  12891883 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 12891784  T
Q  131 ga 132  Q
    ||    
T  12891783 ga 12891782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15471281 - 15471244
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15471281 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcg 15471244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Original strand, 16862834 - 16862927
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  16862834 ttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgactactaatgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa 16862927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Original strand, 17252685 - 17252786
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  17252685 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 17252784  T
Q  131 ga 132  Q
    ||    
T  17252785 ga 17252786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 131
Target Start/End: Original strand, 17710275 - 17710320
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17710275 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 17710320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 144
Target Start/End: Original strand, 28350846 - 28350903
Alignment:
Q  87 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  28350846 ttgagtgcctgaacatacctagtgatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 28350903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 54973736 - 54973699
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  54973736 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 54973699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 54976346 - 54976309
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  54976346 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 54976309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 54978956 - 54978919
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  54978956 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 54978919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 2034752 - 2034788
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2034752 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 2034788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 2038259 - 2038295
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2038259 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 2038295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 2042000 - 2042036
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2042000 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 2042036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4710775 - 4710675
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||   ||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||    
T  4710775 gcagagagcatgttggattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaacaaatgtag 4710676  T
Q  131 g 131  Q
    |    
T  4710675 g 4710675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 92
Target Start/End: Original strand, 11557043 - 11557075
Alignment:
Q  60 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11557043 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 11557075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 92
Target Start/End: Original strand, 11594797 - 11594829
Alignment:
Q  60 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11594797 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 11594829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12378456 - 12378412
Alignment:
Q  75 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12378456 ccttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattagg 12378412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14038528 - 14038492
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14038528 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 14038492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14041996 - 14041960
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14041996 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 14041960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 520  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 520  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15617854 - 15617766
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||||||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  15617854 gcagagagcatgttggattttgtaattttgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 15617766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 16690671 - 16690635
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16690671 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16690635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 16697244 - 16697208
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16697244 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16697208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 16797708 - 16797744
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16797708 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16797744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18959245 - 18959209
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18959245 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 18959209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 20461154 - 20461190
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20461154 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 20461190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 31097208 - 31097244
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31097208 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 31097244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39231075 - 39231039
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39231075 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 39231039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 42326404 - 42326360
Alignment:
Q  48 tttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42326404 tttcgtgttttggacttttgagttgaaccttagaagcttttgagt 42326360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 133
Target Start/End: Original strand, 53380030 - 53380082
Alignment:
Q  81 atgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  53380030 atgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 53380082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 133
Target Start/End: Original strand, 53386682 - 53386734
Alignment:
Q  81 atgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggat 133  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  53386682 atgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 53386734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 678 - 1169
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  678 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagg 777  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  778 atgagattgaacctagattgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 877  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||    
T  878 tgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgt 977  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
     |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  978 ttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 1077  T
Q  432 ttatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||   || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1078 ttatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 167608 - 168099
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  167608 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagg 167707  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167708 atgagattgaacctagattgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 167807  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||    
T  167808 tgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgt 167907  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
     |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  167908 ttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatta 168007  T
Q  432 ttatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||   || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  168008 ttatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 52415 - 51913
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52415 cagagagcatgcaagattttttgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 52316  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52315 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 52216  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  52215 actgagtgtcttgttaggttttgcgacc-ttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatc 52117  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| |||    
T  52116 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttg 52017  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  52016 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 51918  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  51917 gatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 158)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 38801020 - 38801508
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801020 cagagagcatgcaagatttcatatttttgacttttgagttgaactttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 38801119  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38801120 atgtgattgaacctggaattgaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgact 38801219  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||     
T  38801220 tgttagattttgcgacctttgttgtacgagttgtcggaagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctga 38801319  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  38801320 ataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataa 38801419  T
Q  432 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38801420 ttatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 27250358 - 27250850
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250358 cagagagcatgcaagatttcgtaatattgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 27250457  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  27250458 atgggattgaacctggaatgaaacctgtgggattctgacctgaactcgccacgtcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacacagaaacagagtccct 27250557  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27250558 tgttatattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgt 27250657  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 430  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27250658 ttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 27250757  T
Q  431 attatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27250758 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 21027172 - 21026680
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21027172 cagagagcatgcaagaatttgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtagg 21027073  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21027072 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctaaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgact 21026973  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21026972 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgt 21026873  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 430  Q
     |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||     
T  21026872 ttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatata 21026773  T
Q  431 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
     ||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21026772 tttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 32 - 520
Target Start/End: Original strand, 50209832 - 50210333
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50209832 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgatc-ttatatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 50209930  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50209931 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 50210030  T
Q  222 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  50210031 cagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 50210130  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| |||    
T  50210131 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg 50210230  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  50210231 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 50210329  T
Q  517 gatg 520  Q
    ||||    
T  50210330 gatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 32 - 446
Target Start/End: Original strand, 22354190 - 22354616
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  22354190 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcttgaacatgtcttataatgattaggaaataacgtagg 22354289  T
Q  132 atgagattgaacctgga-----------attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    |||||||||||||||||           || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22354290 atgagattgaacctggatagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaa 22354389  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  22354390 acagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttaggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 22354489  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  22354490 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 22354589  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttgtt 446  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||    
T  22354590 caattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 32 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 34510283 - 34509783
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34510283 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 34510184  T
Q  132 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||  |          ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34510183 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaa 34510084  T
Q  222 cagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  34510083 cagagtgtcatgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 34509984  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    | ||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||   ||||||  |||||||||| ||| |||    
T  34509983 tttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttg 34509884  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     | ||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34509883 catttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 34509785  T
Q  517 ga 518  Q
    ||    
T  34509784 ga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 22532772 - 22532269
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532772 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgatttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22532673  T
Q  132 atgagattgaacctgga----------attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||||||||||||||||          | | ||||| ||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22532672 atgagattgaacctggaaggattgtagaatgaacttttggaaatctgacttgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaa 22532573  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| || | |||| |||| | |    
T  22532572 cagagtgacttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaac 22532473  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   || |||  |||||||||| |||||||    
T  22532472 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattg 22532373  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     ||| |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  22532372 caatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgat 22532274  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  22532273 gatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 32 - 412
Target Start/End: Original strand, 22355803 - 22356185
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22355803 cagagaacatgcaagatttcataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22355902  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac- 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  22355903 atgagattgaacctggaatgaaatttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtgaca 22356001  T
Q  231 ttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||     
T  22356002 ttgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagcta 22356101  T
Q  331 tataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttga 412  Q
    | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||  || ||||||||    
T  22356102 tttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 32 - 412
Target Start/End: Original strand, 22357489 - 22357871
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22357489 cagagaacatgcaagatttcataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 22357588  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac- 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  22357589 atgagattgaacctggaatgaaatttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtgaca 22357687  T
Q  231 ttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||     
T  22357688 ttgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagcta 22357787  T
Q  331 tataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttga 412  Q
    | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||  || ||||||||    
T  22357788 tttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 331
Target Start/End: Original strand, 20846848 - 20847147
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20846848 cagagagcatgcaagattttgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtagg 20846947  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20846948 atgagattgaacctggaatgaaacttgtgaggttttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 20847047  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||  ||||||| |||||||||    
T  20847048 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaaccataatctatgaagctgt 20847147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 32 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 20135690 - 20135188
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20135690 cagagagcatgcaatattttgtaattttgacttttgagtttatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 20135591  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----------ttaaac-ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||| ||||||||          | |||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  20135590 atgagattggacctggaaagacttagaatgaaacattttggaattctgacc-gaactcgccatggcgagcagaagctctcacctcgcgagtaacccagaa 20135492  T
Q  221 acagagtgacttgttagattt-tgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 319  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| | |||||| | |||||| |||| ||   ||||||||||||    
T  20135491 acagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgtacgagttgttgagagttgaaccttagggtagtagtaagacctaatgatgttgttaattataat 20135392  T
Q  320 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 418  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || | |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  |  ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  20135391 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttgaatt 20135292  T
Q  419 gaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
    | |  |||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || | ||||||     
T  20135291 gcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgt 20135193  T
Q  516 tgatg 520  Q
    |||||    
T  20135192 tgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 33 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 433509 - 433012
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  433509 agagagcttgcaagattccgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaa 433410  T
Q  133 tgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||           |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  433409 tgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttg 433311  T
Q  222 cagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtag-gattaagacttaataataaggttaattataa 318  Q
    || | || ||||||   |||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||| | ||||||  || || | |||  |||||  ||||| || |    
T  433310 caaaatg-cttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagctatgaata-ttataaataatattaatgatga 433213  T
Q  319 tctgtgaagctg-tataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataa-tgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 416  Q
    ||||| |||||| | || |||   ||| || || ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| |||     
T  433212 tctgtaaagctgatttatgatgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgac 433113  T
Q  417 ttgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 513  Q
    ||| | ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  433112 ttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 433017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20919104 - 20918917
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20919104 cagagagcatgcaagattttataattttgacctttgagttgatccttacatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 20919005  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||          ||||| || ||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20919004 atgagattgaacctgaaaagacttagaatttaaatttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 20918917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Original strand, 21301157 - 21301245
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21301157 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaa 21301245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33681499 - 33681301
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  33681499 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagttcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 33681400  T
Q  145 tggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttg 233  Q
    |||||     |||     || || || || |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||    
T  33681399 tggaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaattacccagttacagagtgccttg 33681301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Original strand, 52927612 - 52927716
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  52927612 agatttcgtaattttgacttttgagttgacccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagattggagaatgagattgaacc 52927711  T
Q  145 tggaa 149  Q
    |||||    
T  52927712 tggaa 52927716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21754525 - 21754423
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  21754525 agatttcgtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaaagagattgaacc 21754426  T
Q  145 tgg 147  Q
    |||    
T  21754425 tgg 21754423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Original strand, 20091092 - 20091281
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  20091092 cagagagcatgcaagatttcttatttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgattgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaag 20091191  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaac-ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||| |||||          |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  20091192 atgagattggacctgaaaagacttagaatgaaacaacttgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgttctcacctcgcgag 20091281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21162231 - 21162117
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||     
T  21162231 cagagagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttaaatgcttttgagtgcctgaataagtctaataacgattgggaaagaatgtaga 21162132  T
Q  132 atgagattgaacctg 146  Q
    |||||||||||||||    
T  21162131 atgagattgaacctg 21162117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22238117 - 22238015
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||||    
T  22238117 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatatttttgagtgcctgaacatgtctaataatggttaggaaagattggagaatgagattaaacctg 22238018  T
Q  147 gaa 149  Q
    |||    
T  22238017 gaa 22238015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20248757 - 20248664
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  20248757 attttgacttttgagttgatccatagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagatcggagaatgagattgaacctgga 20248664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 310 - 520
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468816
Alignment:
Q  310 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 408  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || || || | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||   ||  ||| |||  |||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatg-taattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  409 ttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 22468801  T
Q  506 ttgaagatgatgatg 520  Q
     | |||||| |||||    
T  22468802 attaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Original strand, 22921499 - 22921603
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||     
T  22921499 gatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacca 22921598  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  22921599 ggaat 22921603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 14295574 - 14295672
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14295574 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 427 - 521
Target Start/End: Original strand, 45574912 - 45575008
Alignment:
Q  427 tattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 445 - 521
Target Start/End: Original strand, 20847200 - 20847275
Alignment:
Q  445 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20847200 ttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 404 - 505
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896361
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  502 gatg 505  Q
    ||||    
T  21896358 gatg 21896361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921986
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 43697849 - 43697745
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||  ||||||| |||||    
T  43697849 gatttcgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctatttatgattagaaaagattctagattgagatttaacct 43697750  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  43697749 ggaat 43697745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681010
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 349 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797573
Alignment:
Q  349 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 445  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 33797596  T
Q  446 tgtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  33797595 tgtatgctgcatatgttgctgtt 33797573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 308 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  308 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 385  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 425 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 20918702 - 20918623
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918702 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 404 - 505
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861675
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaa 21861671  T
Q  502 gatg 505  Q
    ||||    
T  21861672 gatg 21861675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 423 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21754145 - 21754064
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754145 ttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21754064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 22237746 - 22237630
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22237746 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa 22237647  T
Q  502 gatgttgaagatgatgatgt 521  Q
       |||||||||||||||||    
T  22237646 ---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 518
Target Start/End: Original strand, 23593735 - 23593897
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  23593735 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23593834  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23593835 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 449 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758668
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 16758668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 117
Target Start/End: Original strand, 22468315 - 22468400
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  22468315 cagagagcatgtaagatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 22468400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 423 - 505
Target Start/End: Original strand, 35261099 - 35261183
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261099 ttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 35261183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 13989013 - 13988866
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13989013 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13988915  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13988914 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  21840829 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 21923306 - 21923453
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21923306 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21923404  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21923405 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 29776835 - 29776688
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||||||||    
T  29776835 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29776737  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29776736 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 31612460 - 31612313
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||   | ||||||||||    
T  31612460 tatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 31612362  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31612361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614222
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622050
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50622050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928088
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 452 - 505
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368391
Alignment:
Q  452 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248283
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 452 - 520
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  452 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 520  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 502
Target Start/End: Original strand, 22123133 - 22123214
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123133 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 521
Target Start/End: Original strand, 13212928 - 13213027
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  |  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  13212928 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 13213025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 426 - 524
Target Start/End: Original strand, 15860078 - 15860177
Alignment:
Q  426 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtc 522  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||    
T  15860078 atattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtc 15860175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 21475102 - 21475249
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21475102 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21475200  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  21475201 -gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 18181764 - 18181826
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||    
T  18181764 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattag 18181826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 21342192 - 21342090
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  21342192 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 21342095  T
Q  520 gtcca 524  Q
    |||||    
T  21342094 gtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21754392 - 21754350
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754392 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 21754350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23763688 - 23763574
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23763688 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 23763589  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  23763588 gacaagattgaacct 23763574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21715036 - 21714983
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21715036 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 21714983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 505
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050141
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 41050141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 96
Target Start/End: Original strand, 8761252 - 8761316
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||   |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8761252 cagagagcatgttggatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 8761316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 358 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16362079 - 16361915
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  || | || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  16362079 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatact 16361980  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 520  Q
    |  | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16361979 gt-tgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 21347057 - 21346961
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21347057 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 94
Target Start/End: Original strand, 3472560 - 3472607
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgc 94  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3472560 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 3472607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 21895886 - 21895965
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||    
T  21895886 agttgatctttagatgattatgagtgcctgaacaagtataataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacctgg 21895965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Original strand, 22432425 - 22432488
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22432425 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 22432488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 29298195 - 29298137
Alignment:
Q  459 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29298195 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 421 - 518
Target Start/End: Original strand, 16275428 - 16275526
Alignment:
Q  421 aattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | |||||||||    
T  16275428 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16275525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707167
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711709
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 146
Target Start/End: Original strand, 28194090 - 28194180
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||| ||| ||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  28194090 ttttgacctttaagtcgaaccttggatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctg 28194180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 451 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686627
Alignment:
Q  451 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatg 50686627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 92
Target Start/End: Original strand, 3704731 - 3704776
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3704731 atttcgtgttttggacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 3704776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12647321 - 12647166
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | ||  || ||| | |||||||||| |||||  || |    
T  12647321 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttagaacgagattgaacttggaac-aacc 12647223  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12647222 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 12647166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18882819 - 18882664
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  18882819 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa-caacc 18882721  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||||| || | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18882720 ttagttgggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgag 18882664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20637206 - 20637165
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20637206 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 20637165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21162121 - 21162080
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21162121 acctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21162080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 21714622 - 21714546
Alignment:
Q  440 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21714622 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 448 - 503
Target Start/End: Original strand, 16093933 - 16093988
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 503  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaaga 16093988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 20524899 - 20524958
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  20524899 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 20524958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21438216 - 21438157
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  21438216 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 21438157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 21861148 - 21861227
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  21861148 agttgatctttagatgattctgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 21861227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 23818953 - 23819108
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||  |       
T  23818953 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaacgacct 23819052  T
Q  156 ttgt-gggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    | || || |||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23819053 tagtaggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgag 23819108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064954
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatg 26064954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 147
Target Start/End: Original strand, 35981352 - 35981419
Alignment:
Q  80 gatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35981352 gatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctgg 35981419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19063942 - 19063884
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  19063942 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 19063884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19111832 - 19111774
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  19111832 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 19111774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19212319 - 19212164
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag-gaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 154  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || ||||||| ||| |||| ||| | ||||||||||||||||  ||     
T  19212319 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgaat-tagaacgagattgaacctggaa-caac 19212222  T
Q  155 ctt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||   || || |||| | || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19212221 cttagttgagaatctggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19212164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 22831021 - 22831083
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22831021 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 22831083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20138535 - 20138380
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||   |  || ||| |||||||||||||  |||  || |    
T  20138535 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagaggatgatttagaatgagattgaacccagaac-aacc 20138437  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20138436 ttagttgggaatctgacttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 20138380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20248633 - 20248592
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20248633 acctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcgcgag 20248592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Original strand, 21787685 - 21787746
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  21787685 ttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttaataaagatta 21787746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21829191 - 21829078
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  21829191 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtatggattaggaatgaatgtag 21829092  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    ||| ||||||||||    
T  21829091 gatcagattgaacc 21829078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21844704 - 21844591
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||   ||  |||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  21844704 gcagagagcatgttagattttgtgttttcgactttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtatggattaggaatgaatgtag 21844605  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    ||| ||||||||||    
T  21844604 gatcagattgaacc 21844591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Original strand, 22921631 - 22921672
Alignment:
Q  168 gacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22921631 gacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 22921672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26065295 - 26065254
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26065295 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 26065254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Original strand, 28194213 - 28194254
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28194213 acctgaactcgccatggcaagtagaggctctcgcctcgcgag 28194254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Original strand, 35260718 - 35260787
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  35260718 ttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 35260787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Original strand, 35981451 - 35981492
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  35981451 acctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgag 35981492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Original strand, 42864854 - 42864915
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  ||| || |||||||||    
T  42864854 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagttgtttattaatgatta 42864915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 46975919 - 46975764
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  46975919 tttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacttttaggtgcctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 46975821  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||  | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46975820 ttagttgggattctttcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 46975764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Original strand, 52927745 - 52927786
Alignment:
Q  168 gacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  52927745 gacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 52927786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 149
Target Start/End: Original strand, 16367873 - 16367945
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||| |||||||||||    
T  16367873 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagaatgaacctggaa 16367945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 210
Target Start/End: Original strand, 17678240 - 17678396
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaa 154  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||  | ||| ||||||   |  || ||| |  |||| ||||||||||| |      
T  17678240 atttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagatgatgatttagaacaagatggaacctggaataacc 17678339  T
Q  155 cttgtggga-ttctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
     |||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17678340 attgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 17678396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20637339 - 20637235
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgctttt-gagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| |||| |||| |||| ||||||||  || ||| |||| |||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  20637339 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttggatgttttttgagtgcctagacttgtataatgatgattaggaaagattggagattaagattgaacct 20637240  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  20637239 ggaat 20637235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 21023115 - 21023075
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcc 95  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21023115 attttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcc 21023075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 147
Target Start/End: Original strand, 41049629 - 41049701
Alignment:
Q  75 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  41049629 ccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtataataatggttaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 41049701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 45307793 - 45307721
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgt 104  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  45307793 cagagagcttgcaagatctcgtgattttgagctgtgagtttaaccttagatgtttatgagggcctgaacatgt 45307721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 45310135 - 45310175
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45310135 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 45310175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 45489397 - 45489433
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45489397 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 45489433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 3472699 - 3472734
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3472699 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 3472734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6152217 - 6152166
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6152217 tgggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 6152166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 16080218 - 16080253
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16080218 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16080253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16759186 - 16759115
Alignment:
Q  75 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||    
T  16759186 ccttagatgtttttgagtgcctaaacacgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 16759115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21022984 - 21022949
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21022984 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21022949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 21342615 - 21342564
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21342615 agttgaaccttagatgattttgagtgtctgaatatgtataataatgattagg 21342564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 21347480 - 21347429
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21347480 agttgaaccttagatgattttgagtgtctgaatatgtataataatgattagg 21347429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21615769 - 21615734
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21615769 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21615734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21714896 - 21714861
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21714896 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21714861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 21787815 - 21787850
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21787815 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21787850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Original strand, 22432540 - 22432591
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22432540 tgggattctggcctgtcctcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgag 22432591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 22449039 - 22449074
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22449039 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22449074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 22831151 - 22831186
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22831151 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 22831186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 24087918 - 24087831
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| | || | |||| || |||| ||||||||||||   ||||||||||||    
T  24087918 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgagctgtgagtttaaccctggatgtttatgagagcctgaacatgtactataatgattagg 24087831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 24782874 - 24782909
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24782874 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 24782909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26065441 - 26065382
Alignment:
Q  88 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  26065441 tgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 26065382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33797865 - 33797830
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33797865 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 33797830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 36819082 - 36819117
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36819082 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 36819117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 42864984 - 42865019
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42864984 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 42865019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 45489517 - 45489552
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45489517 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 45489552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1011169 - 1011087
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1011169 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacc 1011087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 209
Target Start/End: Original strand, 8761406 - 8761440
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8761406 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcga 8761440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16381698 - 16381652
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaag 123  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  16381698 ttagatggttttgagtgcctggacatgtataagaatgattaggaaag 16381652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19105175 - 19105117
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  19105175 tttgagtgcctaaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 19105117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 459 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 21161778 - 21161720
Alignment:
Q  459 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| || ||| |||||||    
T  21161778 tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 476 - 506
Target Start/End: Original strand, 21533948 - 21533978
Alignment:
Q  476 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533948 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21533978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21615889 - 21615796
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |  ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  21615889 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactaatgattagggaacgaatg-agaatgagattgaacctggaa 21615796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 24782754 - 24782816
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | |||| || ||||||||||    
T  24782754 ttttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaatgattag 24782816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 119
Target Start/End: Original strand, 52940464 - 52940506
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  52940464 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataataattagg 52940506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 6152331 - 6152270
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  6152331 ttttgacctttgagttgaaccttagttgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 6152270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20579815 - 20579778
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20579815 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 20579778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22237983 - 22237946
Alignment:
Q  172 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22237983 tgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 22237946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Original strand, 50887381 - 50887482
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  50887381 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 50887480  T
Q  131 ga 132  Q
    ||    
T  50887481 ga 50887482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12271902 - 12271862
Alignment:
Q  171 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12271902 ctgaactctccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 12271862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 14432123 - 14432159
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14432123 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 14432159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 149
Target Start/End: Original strand, 16093479 - 16093551
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
T  16093479 ttagatggttttgagtgcctggatatgtataataatgatttggcaagtttttagattgagattgaacctggaa 16093551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 16368051 - 16368091
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  16368051 cctgaactcgccatagcgagtaaaggctctcgcctcgcgag 16368091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 18393732 - 18393772
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18393732 cctgtactcgccatggcgagcagttgctctcgcctcgcgag 18393772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20631667 - 20631631
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20631667 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 20631631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 21305766 - 21305730
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21305766 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21305730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 22900022 - 22900058
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22900022 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22900058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24087766 - 24087730
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24087766 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 24087730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 520
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783212
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 520  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 33797985 - 33797945
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  33797985 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 33797945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36181926 - 36181890
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36181926 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 36181890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37358819 - 37358783
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37358819 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 37358783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 45307641 - 45307605
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45307641 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 45307605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 52067 - 51582
Alignment:
Q  36 gagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatga 135  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52067 gagcttgcaagatttcgtattttttacttttgagttaaacctttgatgcctttgagtgcctgaacaagtctaataatgattaggaaagaatgtaggacga 51968  T
Q  136 gattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51967 gattgaacctggaatgaaacttacgggattctaacctgagctcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 51868  T
Q  236 agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataa 335  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51867 agattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagaattggacccttgggtaggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataa 51768  T
Q  336 gatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat 435  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  51767 gatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattat 51668  T
Q  436 gtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51667 gtcatgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 13703 - 13211
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13703 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaaaatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 13604  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  13603 atgagactgaacctggaatgaaacttgtggcattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaatcagagtgcct 13504  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||    
T  13503 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgt 13404  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 430  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13403 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatt 13304  T
Q  431 attatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  13303 attatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9872 - 9717
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||| | |   || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  9872 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattatggatttatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 9774  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9773 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgag 9717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 2444 - 1952
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2444 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacgtgtctaataataattaggaaggaatgtagg 2345  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  2344 atgagattgaacctggaattaaacttgagggatgctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgaca 2245  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  2244 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgt 2145  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 430  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||     
T  2144 atatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatc 2045  T
Q  431 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2044 attatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctg-ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 1778 - 1289
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |  |||||    
T  1778 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttaaattgaacgttagatgcttttgcgtgcctgaacatgtctaatattgattagtgaatagggtagg 1679  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    | | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1678 acgtgattgaacctggaattaaacttatggaattctaaactgaactcgcgacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgact 1579  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||     
T  1578 tgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctga 1479  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1478 ataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 1379  T
Q  432 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1378 ttatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 7755 - 7266
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |  |||||    
T  7755 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttaaattgaacgttagatgcttttgcgtgcctgaacatgtctaatattgattagtgaatagggtagg 7656  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    | | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7655 acgtgattgaacctggaattaaacttatggaattctaaactgaactcgcgacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgact 7556  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||     
T  7555 tgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctga 7456  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  7455 ataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 7356  T
Q  432 ttatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7355 ttatttcatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16150 - 16083
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16150 cagagagcatccaagatttcgtatttttgacttttgaattgaaccatagatgcttttgagtgcctgaa 16083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 452 - 518
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  452 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 2353 - 1851
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2353 agagagcatccaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 2254  T
Q  133 tgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||    
T  2253 tgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccctaaaa 2154  T
Q  222 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 321  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  2153 cagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatct 2054  T
Q  322 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 420  Q
    |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  2053 gtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 1954  T
Q  421 aattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1953 aattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 1855  T
Q  518 atgt 521  Q
    ||||    
T  1854 atgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 207161 - 207324
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg--------- 146  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||             
T  207161 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaaagactt 207260  T
Q  147 -gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
     |||| ||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  207261 agaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 207324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Original strand, 119205 - 119255
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  119205 agttgaacattagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattag 119255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 3973 - 3470
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3973 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 3874  T
Q  132 atgagattgaacctggaatta-----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||||||||||||| |           |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3873 atgagattgaacctggaatgattgtagaatcaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaa 3774  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||  | |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  3773 acagagtgagttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 3674  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    | ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  3673 tatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 3574  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3573 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3475  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  3474 gatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 44 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 833 - 343
Alignment:
Q  44 aagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  833 aagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaac 734  T
Q  144 ctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgactt 232  Q
    || |||           | |||||| ||| || |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  733 ctagaaagaatttagaatgaaacttttggaat-ctgaactgaactcgccgcggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtctt 635  T
Q  233 gttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||| |||| || |||||||||||   |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | |||||||||||| | |||||||||    
T  634 gttaggtttttgcaacctttgttgcatgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgt 535  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 430  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||  |||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  534 ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatatt 435  T
Q  431 attatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||| ||||||   | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  434 attacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 6)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 33 - 502
Target Start/End: Original strand, 23921 - 24405
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23921 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtagga 24020  T
Q  133 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 222  Q
    |||||||||||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24021 tgagattgaacctggaaaattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaac 24120  T
Q  223 agagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctg 322  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | || ||| ||||||||||| | |  | |||||||||||||||    
T  24121 aaagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaactttgggatagtattaagacttattgaggatgttaattataatctg 24220  T
Q  323 tgaagctgtataagatatgttgttgatg-attatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 420  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  24221 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgc 24320  T
Q  421 aattgatattattatgtcatgttg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||| |||||||||| ||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24321 aattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 64305 - 64150
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  ||  || || |||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||||  || |    
T  64305 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcgtactattgattagggaaggatttagaacgagattgaaactggaac-aacc 64207  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  64206 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 64150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 76189 - 76034
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||  |  || ||| || |||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  76189 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtaactttaggtgcctactattgattagggaaggatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 76091  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   | ||||| || | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  76090 ttagttaggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 76034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 34683 - 34718
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34683 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 34718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Original strand, 34553 - 34593
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34553 ttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 34593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Original strand, 41196 - 41236
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  41196 ttttgacttgtgagttgaaccttagatgattttgagtgcct 41236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 5339 - 4849
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5339 agagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaagatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 5240  T
Q  133 tgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgactt 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5239 tgagattgaacctggaatgaaacttgtgaggttctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctcttgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgactt 5140  T
Q  233 gttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgta 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| | |||||| |||  || |||| |||| ||| | ||||||||||| |   |||||  ||||||||||||||||||     
T  5139 gttag-ttttgccacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggctagcaataagacttaatgaaggggttagctataatctgtgaagctgtt 5041  T
Q  333 taagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  5040 taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatatta 4941  T
Q  432 ttatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4940 ttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 5739 - 6245
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5739 cagagagcatgcaagatttcgtgttttttacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtagg 5838  T
Q  132 atgagattgaacctgg-----------aattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||||||||||           ||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5839 atgagattgaacctgggaagattattgaatgaaatttgcgggattctgacctgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgttagtgacccagaa 5938  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||| || | |||||||||||      
T  5939 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttatcgagagtggaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaa 6038  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  6039 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 6138  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgt--ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 514  Q
     |||||||||||| ||||||   |||| ||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6139 caattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 6238  T
Q  515 atgatgt 521  Q
    |||||||    
T  6239 atgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 32 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 7102 - 6669
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7102 cagagagcacgcaagatttcatatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacgtgtctaataattattaggaaggaatgtagg 7003  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgact 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  7002 atgagattgaacctggaattaaacttgagggatgctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccataaacagagtgaca 6903  T
Q  232 tgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6902 tgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgt 6803  T
Q  332 ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatt 430  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||| |||||||  ||||||||     
T  6802 atatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatc 6703  T
Q  431 attatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgt 461  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  6702 attatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 39262 - 38761
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39262 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgactttgaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 39163  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39162 atgagattgaacctggaaagattttgaatgaaacttgtgg-attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 39064  T
Q  222 cagagtgacttgttagatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39063 catagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatc 38964  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| | | |||    
T  38963 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttg 38864  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
     | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  38863 catttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatg 38765  T
Q  518 atgt 521  Q
    ||||    
T  38764 atgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 312 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 33153 - 32942
Alignment:
Q  312 attataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt 410  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  33153 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 33054  T
Q  411 gatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 508  Q
    | | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  33053 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 32955  T
Q  509 aagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||    
T  32954 aagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 423 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 9845 - 9744
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  9845 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 9748  T
Q  520 gtcc 523  Q
    ||||    
T  9747 gtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 21392 - 20910
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21392 agagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgttttttagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagga 21293  T
Q  133 tgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgactt 232  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21292 tgagattgtacctggaatgaaacttgt----------cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccaaaaacagagtgactt 21203  T
Q  233 gttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgta 332  Q
    |||   |||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||||     
T  21202 gttgagttttgcgacctttgttgcacgagttgatcagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtt 21103  T
Q  333 taagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatatta 431  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21102 taagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatatta 21003  T
Q  432 ttatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21002 ttatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 10)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 32 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 125085 - 124675
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  125085 cagagagcatgcaagatttggtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 124986  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    |||||   ||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124985 atgag---gaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 124889  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  124888 aaagagtgtcttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatc 124789  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||    
T  124788 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattg 124689  T
Q  420 aaattgatattatt 433  Q
     |||||||||||||    
T  124688 caattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 404 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 174883 - 174767
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 503  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174883 agatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 174784  T
Q  504 tgttgaagatgatgatg 520  Q
    |||||||| ||||||||    
T  174783 tgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 63051 - 62947
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  63051 agatttcgtaaatttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 62952  T
Q  145 tggaa 149  Q
    |||||    
T  62951 tggaa 62947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 175267 - 175202
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctg 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  175267 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctg 175202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 451 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  451 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 505
Target Start/End: Original strand, 136414 - 136474
Alignment:
Q  445 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136414 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 505
Target Start/End: Original strand, 145122 - 145182
Alignment:
Q  445 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145122 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 145182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 211
Target Start/End: Original strand, 136132 - 136173
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  136132 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 136173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 211
Target Start/End: Original strand, 144840 - 144881
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  144840 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 144881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 133740 - 133776
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  133740 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 133776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 5)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 32 - 520
Target Start/End: Original strand, 16833 - 17337
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16833 cagagagcatgcaagatttcttgtttttgactttcgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 16932  T
Q  132 atgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||          | |||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 17032  T
Q  222 cagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  17033 cagagtaccttattaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttaaaccttggggtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatc 17132  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||| ||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| |||    
T  17133 tgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg 17232  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatg-----ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 514  Q
     | |||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17233 catttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17331  T
Q  515 atgatg 520  Q
    ||||||    
T  17332 atgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 148
Target Start/End: Original strand, 78980 - 79096
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  78980 cagagagcatgcaagattttgtaattctgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtttaataatgattaggaaggaatgtaga 79079  T
Q  132 atgagattgaacctgga 148  Q
    |||||||||||||||||    
T  79080 atgagattgaacctgga 79096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 459 - 505
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79433
Alignment:
Q  459 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 79433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 13850 - 13885
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13850 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 13885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 96
Target Start/End: Original strand, 13696 - 13760
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||||||| |  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  13696 cagagagcatgtagaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagaggtttttgagtgcct 13760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 4)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 33 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 13594 - 13141
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13594 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtagga 13495  T
Q  133 tgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||||||||| |||           |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13494 tgagattgaatctgaaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 13395  T
Q  222 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 321  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | |||||| |||  |||||||| |  | ||||||||||||||    
T  13394 ctgagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaagatgttaattataatct 13295  T
Q  322 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 420  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| |||     
T  13294 gtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgc 13195  T
Q  421 aattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 471  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13194 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34623 - 34437
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34623 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 34524  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    |||||||||||||||          |||| ||| ||  | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34523 atgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttggagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 34437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 34221 - 34123
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34221 gatattattatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 8978 - 8479
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8978 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaatagtgattaggaaagaatgtagg 8879  T
Q  132 atgagattgaacctggaatta-----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    |||||||||||||| |||  |           |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8878 atgagattgaacctagaaagattgtaaaatggaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggccagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaa 8779  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||||| || | |||||||| ||||    
T  8778 acagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatc 8679  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||    ||||| | | |||||||||||||| | | ||| ||   |||||||||| ||| |||    
T  8678 tgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttg 8583  T
Q  420 aaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
     |||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8582 caattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgct-attgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 8484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 35 - 521
Target Start/End: Original strand, 8154 - 8650
Alignment:
Q  35 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8154 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatcctt-gatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 8252  T
Q  135 agattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaca 223  Q
    ||||||||||||           |||| |||||| ||| |||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8253 agattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttttggaattctggcctaaactcgccacggtgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaca 8352  T
Q  224 gagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaaccct-tgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctg 322  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||  |  |||||| |||  |||||||| |  | |||||||||||||||    
T  8353 gagtgtcttgttaggttttgcgaccttcgttgcacgagttgttgagagttgaacgttgggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctg 8452  T
Q  323 tgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 421  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |    
T  8453 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgca 8552  T
Q  422 attgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8553 attgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgc----tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 8648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 40414 - 39913
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  40414 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaggaatgtagg 40315  T
Q  132 atgagattgaacctg---gaat------taaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 222  Q
    |||||||||||||||   || |      | ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40314 atgagattgaacctgacagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 40215  T
Q  223 agagtgacttgttagat-tttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 321  Q
    |||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||    
T  40214 agagtaccttgttaggtgtttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatct 40115  T
Q  322 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 420  Q
    |||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| |   |||  |||||||||  |||  ||     
T  40114 gtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgc 40015  T
Q  421 aattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  40014 atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 39916  T
Q  519 tgt 521  Q
    |||    
T  39915 tgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 505
Target Start/End: Original strand, 19933 - 19990
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19933 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Original strand, 18413 - 18464
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18413 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Original strand, 18299 - 18360
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  18299 tttttacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 18360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 7)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 32 - 518
Target Start/End: Original strand, 339569 - 340065
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  339569 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgagtgcctgaatttgtctaataatgattaggaatgaatgtagg 339668  T
Q  132 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||  |          ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339669 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttgggaatctgacatgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 339768  T
Q  222 cagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 321  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||  || |||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||    
T  339769 tagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagtcgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatct 339868  T
Q  322 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 420  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| |||     
T  339869 gtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg- 339967  T
Q  421 aattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  339968 atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttg--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 349 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71353
Alignment:
Q  349 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 445  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 71376  T
Q  446 tgtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  71375 tgtatgctgcctatgttgctgtt 71353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 71789 - 71729
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  71789 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 71729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Original strand, 158465 - 158612
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  158465 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 158563  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  158564 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 96938 - 96903
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  96938 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 96903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 413824 - 413859
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  413824 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 413859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 140162 - 140007
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| | |||||||||||| |||  || |    
T  140162 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctagaa-caacc 140064  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||| |||||| | || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  140063 ttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgcgag 140007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 33 - 514
Target Start/End: Original strand, 25684 - 26179
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25684 agagagcttgcaagatttcatgtttttgacttttgagttgatccttagatggttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 25783  T
Q  133 tgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 222  Q
    |||||||||||||| ||  |          || || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25784 tgagattgaacctgaaaagattgtagaatgaatttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 25883  T
Q  223 agagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatct 321  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||   |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||    
T  25884 agagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatct 25983  T
Q  322 gtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 420  Q
     ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||   ||||||| | ||| |||| ||||||      
T  25984 atgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattac 26083  T
Q  421 aattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 514  Q
    | |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26084 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 369
Target Start/End: Original strand, 33112 - 33461
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33112 cagagagcttgcaagatttcgtgattttcacttttgagttgatccttagatgcttctgagtgcctggacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 33211  T
Q  132 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33212 atgagattgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaagtcttacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcgcctcgcgtgtgacccagaa 33311  T
Q  221 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 319  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||| || |||    ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||     
T  33312 acagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcatacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataac 33411  T
Q  320 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg 369  Q
    || ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||||||    
T  33412 ctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatg 33461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 404 - 518
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44825
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 500  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T
Q  501 agatgttgaagatgatga 518  Q
    || || | ||||||||||    
T  44808 agttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 5)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 40359 - 39858
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40359 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccgtagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatggagg 40260  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||| |||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40259 atgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttttggt-ttctaacctgtactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgggtgacctagaa 40161  T
Q  221 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 319  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||||    
T  40160 accgagtgccttgttatgattttgcgacctttgttgcacaatttgttgagagttgaa-ccttgggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataat 40062  T
Q  320 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 418  Q
     ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||| | | ||    
T  40061 ttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttactt 39962  T
Q  419 gaaattgatattattatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 516  Q
    | | |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  39961 gcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgat 39863  T
Q  517 gatgt 521  Q
    |||||    
T  39862 gatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 207 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 26213 - 25896
Alignment:
Q  207 cgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataata 305  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |      
T  26213 cgagtgacccagaaaccaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgagg 26114  T
Q  306 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataa 404  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||| |||  | |    
T  26113 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttga 26014  T
Q  405 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26013 gatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaag 25915  T
Q  503 atgttgaagatgatgatgt 521  Q
     || ||||||| |||||||    
T  25914 ttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Original strand, 39549 - 39666
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  39549 cagagagcatgccagatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtaga 39648  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39649 atgagattgaacctggaa 39666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 210
Target Start/End: Original strand, 59179 - 59308
Alignment:
Q  90 agtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||          |||| ||| ||  | ||  |||||| |||||||    
T  59179 agtgcctgaacatgtctaataatgattaggacagaatgtagaatgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaacctgacc-gaactcg 59277  T
Q  180 ccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59278 ccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 59308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26662 - 26611
Alignment:
Q  98 aacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26662 aacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattaaacctggaa 26611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 56 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 1382 - 1052
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1382 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacattactaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaac 1283  T
Q  156 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1282 ttgtgggattctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccggaaacaaagtgccttgtgagactttgcgacctttgttg 1183  T
Q  256 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 355  Q
    | | |||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||    
T  1182 cacgagttgttgagagttgaacttttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattat 1083  T
Q  356 gatgtgatataatg-attatgcattacttga 385  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1082 gatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 5)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 56 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3949 - 3640
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3949 ttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaacatgactagtaatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaac 3850  T
Q  156 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||    
T  3849 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgtgacctttgttg 3750  T
Q  256 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 355  Q
    | | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  3749 cacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattat 3650  T
Q  356 gatgtgatat 365  Q
    ||||||||||    
T  3649 gatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 56 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8013 - 7704
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8013 ttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaacatgactagtaatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaac 7914  T
Q  156 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||    
T  7913 ttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgtgacctttgttg 7814  T
Q  256 ctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattat 355  Q
    | | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  7813 cacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattat 7714  T
Q  356 gatgtgatat 365  Q
    ||||||||||    
T  7713 gatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 27296 - 27375
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  27296 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagtttgagattgaacctgg 27375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 423 - 502
Target Start/End: Original strand, 27770 - 27851
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27770 ttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 27851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 211
Target Start/End: Original strand, 27485 - 27525
Alignment:
Q  171 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27485 ctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagt 27525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 42 - 521
Target Start/End: Original strand, 16227 - 16721
Alignment:
Q  42 gcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16227 gcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagaatgagattga 16326  T
Q  142 acctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgac 230  Q
    ||||||||           | |||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  16327 acctggaaagattttcgaatgaaacgtttggaaatctaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgcc 16426  T
Q  231 ttgtt-agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagct 329  Q
    |||||  |||||||||| || ||| || ||||||||   |||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||||||    
T  16427 ttgttgggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaggagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagct 16526  T
Q  330 gtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgata 428  Q
    || |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||| | ||||| || ||| ||  | ||||||    
T  16527 gtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgata 16626  T
Q  429 ttattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  16627 ttattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 4)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 5010 - 4508
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5010 agagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaa 4911  T
Q  133 tgagattgaacctggaa------------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    |||||||||||||||||            | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4910 tgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaa 4812  T
Q  221 acagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 319  Q
    |||| ||  || ||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  4811 acagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataat 4712  T
Q  320 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 418  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  4711 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 4612  T
Q  419 gaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
    | | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  4611 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatga 4514  T
Q  516 tgatgt 521  Q
    | ||||    
T  4513 ttatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 12592 - 12090
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12592 agagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaa 12493  T
Q  133 tgagattgaacctggaa------------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    |||||||||||||||||            | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12492 tgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaa 12394  T
Q  221 acagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 319  Q
    |||| ||  || ||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  12393 acagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataat 12294  T
Q  320 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 418  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  12293 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 12194  T
Q  419 gaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
    | | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  12193 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatga 12096  T
Q  516 tgatgt 521  Q
    | ||||    
T  12095 ttatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 33 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 22544 - 22042
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22544 agagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaa 22445  T
Q  133 tgagattgaacctggaa------------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    |||||||||||||||||            | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22444 tgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaa 22346  T
Q  221 acagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 319  Q
    |||| ||  || ||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  22345 acagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataat 22246  T
Q  320 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 418  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  22245 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 22146  T
Q  419 gaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
    | | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  22145 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatga 22048  T
Q  516 tgatgt 521  Q
    | ||||    
T  22047 ttatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 18286 - 18441
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  |||||| ||| ||||||  ||  || ||| |  ||||||||||| |||  || |    
T  18286 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctttaggtgtctattaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctagaa-caacc 18384  T
Q  156 t--tgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |  | ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18385 ttatttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 60 - 330
Target Start/End: Original strand, 11170 - 11440
Alignment:
Q  60 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaacttgt 159  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11170 gacttttgagttgaaccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgaaacttgt 11269  T
Q  160 gggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctca 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  11270 gggatactgacctgaactcgccaaggcgagaagaggctctcacctcgcgagtgacacagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacg 11369  T
Q  260 agttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 330  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11370 agttgtagagagttgaacctttgggtagaattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctg 11440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 406 - 521
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  406 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  503 atgttgaagatgatgatgt 521  Q
     |||||||||||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 14106 - 14055
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14106 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 14055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 32 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20906 - 20596
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20906 cagagagcatgtaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 20807  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    ||||||||||||||||||           | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20806 atgagattgaacctggaaagattatagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacctagaa 20707  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||| || | ||||| |||||||    
T  20706 acagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggaatagcattaagacttaatgatgatgttaactataatc 20607  T
Q  321 tgtgaagctgt 331  Q
    |||||||||||    
T  20606 tgtgaagctgt 20596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 23370 - 22886
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  23370 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggatctg 23271  T
Q  147 gaat-----taaacttg-----tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta 236  Q
    |||      || | |||     ||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23270 gaaagattgtagaattgaattttggaattctgaactgagctcgccacagcgagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgtcttgtta 23171  T
Q  237 gatttt-gcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataa 335  Q
    | |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23170 ggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaa 23071  T
Q  336 gatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattatta 434  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  23070 gatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattatta 22971  T
Q  435 tgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |||||   |||| ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22970 tgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 504
Target Start/End: Original strand, 51517 - 51987
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51517 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctg 51616  T
Q  147 gaa-----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 235  Q
    |||           | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51617 gaaagattgtcgaatgaaacttgtgggattttgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcacctcgctagtgacccagaaacagagtgacttgtt 51716  T
Q  236 agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg-tata 334  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |  || |  ||||||| ||| |||||||||| |||     
T  51717 agattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctgttatg 51816  T
Q  335 agata-tgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg-ttgatgaattgaaattgatattat 432  Q
    ||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||  || |||  | ||||| ||| ||  |||  |||||||||||    
T  51817 agatattaatgttgat--ttatgatgtgatataatgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttg-cattgatattat 51913  T
Q  433 tatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 504  Q
    |||||| ||   || ||| || ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51914 tatgtcttgctatttttgaatgctgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 423 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 32636 - 32555
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32636 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 32555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33003 - 32921
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    |||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| ||||||    
T  33003 agttgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagattctagattgagattgaacttggaat 32921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32892 - 32826
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||    
T  32892 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctacccagttacagaatgccttgtt 32826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 168; Significance: 9e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 461
Target Start/End: Original strand, 580 - 1021
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  580 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtaga 679  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttg-tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    | |||||||||||||          |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  680 acgagattgaacctggtttagtagagaatgaaacttgttggaaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggttcccgcctcgtgagtgacctagaa 779  T
Q  221 acagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataat 319  Q
    |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||  | | | || |||| ||    
T  780 acagagagtcttgttaggatttttcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgat 879  T
Q  320 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 418  Q
     ||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||  ||  ||| |||  | |||| ||| ||| ||    
T  880 atgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgactt 979  T
Q  419 gaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgt 461  Q
    |  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  980 g-cattgatattattatgccatgctgttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 150
Target Start/End: Original strand, 8110 - 8228
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| | |||| |||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||  | |||     
T  8110 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgagttgtgagtttaaccttggatgtttatgagggcctgaacatgtacaataatgattaggcaaggttttaga 8209  T
Q  132 atgagattgaacctggaat 150  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  8210 atgagattgaacttggaat 8228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 454 - 521
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 165 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 39836 - 39479
Alignment:
Q  165 tctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagtt 263  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || ||| || ||||||    
T  39836 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtt 39737  T
Q  264 gtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgat 363  Q
    ||  || |||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  39736 gttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 39637  T
Q  364 ataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatg 460  Q
    |||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  39636 ataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatg 39537  T
Q  461 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  39536 ttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33497 - 33461
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33497 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 33461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 165 - 519
Target Start/End: Original strand, 74976 - 75333
Alignment:
Q  165 tctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagtt 263  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || ||| || ||||||    
T  74976 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtt 75075  T
Q  264 gtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgat 363  Q
    ||  || |||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  75076 gttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgat 75175  T
Q  364 ataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatg 460  Q
    |||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  75176 ataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatg 75275  T
Q  461 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  75276 ttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 81315 - 81351
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  81315 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 81351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 407 - 163
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  407 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 308  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    |||||||||||||||          |||| |||||| | |  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  307 atgagattgaacctggaaagatttagaatgaaactttttgagttctgacctgaactcgccacagcgagtagaggctctcgccacgcgagtgacccagaaa 208  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgt 265  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||    
T  207 cagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgt 163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 344
Target Start/End: Original strand, 17626 - 17928
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17626 cagagagcatgcaagatttcatgattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 17725  T
Q  132 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaa 220  Q
    |||||||||||||||           |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||                     |||| ||||||||    
T  17726 atgagattgaacctggatagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggc---------------------gagtcacccagaa 17804  T
Q  221 acagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  17805 atagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 17904  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttg 344  Q
    ||||||||||| |||||| |||||    
T  17905 tgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 6)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Original strand, 32577 - 33077
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||     
T  32577 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggaga 32676  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||| ||     |||     || || || || |   |||  |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  32677 atgagattgaacctgtaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcaccctaactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgacccataaa 32776  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||| || ||||||| |||||||||| || ||| || | | ||||  ||||||||||| | |||||| ||| | ||||| | |    |||| ||||||||    
T  32777 cagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatc 32876  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||| | | |   ||| || || |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| |||  || |||  |||||||||| |||||||    
T  32877 tgtgaagctatttta-tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtata-atgaatatttaagatgttgttgaattg 32974  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
     ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32975 caattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 33073  T
Q  518 atgt 521  Q
    ||||    
T  33074 atgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 46428 - 45928
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||     
T  46428 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggaga 46329  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||| ||     |||     || || || || |   |||  |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  46328 atgagattgaacctgtaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcaccctaactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgacccataaa 46229  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||| || ||||||| |||||||||| || ||| || | | ||||  ||||||||||| | |||||| ||| | ||||| | |    |||| ||||||||    
T  46228 cagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatc 46129  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||||||| | | |   ||| || || |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| |||  || |||  |||||||||| |||||||    
T  46128 tgtgaagctatttta-tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtata-atgaatatttaagatgttgttgaattg 46031  T
Q  420 aaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
     ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  46030 caattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 45932  T
Q  518 atgt 521  Q
    ||||    
T  45931 atgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16588 - 16333
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16588 agagagcatgcaagatttcaagattttgacttttgagttgatccttagg-gcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 16490  T
Q  133 tgagattgaacctggaa-----ttaaacttg-----tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaac 222  Q
     ||||||||||||||||      || | |||     ||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  16489 cgagattgaacctggaaagattgtagaattgaattttggaattctgaactgagctcgccacggcgatcagaggccctcacctcgcaagtgacccagaaac 16390  T
Q  223 agagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacc 278  Q
    |||| | ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  16389 agagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacc 16333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 313 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  313 ttataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttg 411  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||||| || |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||   ||   ||||||| | ||||| ||    
T  16323 ttataatctgtgaagctgtttta-agatgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatg 16225  T
Q  412 atgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 508  Q
     ||  ||| | |||||||||| || || || ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16224 ttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  509 aagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||    
T  16125 aagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 459 - 521
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  459 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 19671 - 19826
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |  |  |||||| ||| ||||||  ||  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  19671 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacatttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctggaa-caacc 19769  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19770 ttagttgggaatctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5026 - 4545
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| |||||     
T  5026 cagagagcttgcaagatttcgtgactttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctattaatgactagggaagattgtaga 4927  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||||||| ||     |||     ||||| ||    || ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  4926 atgagattgaacctgaaaagattttagaatgaacttttgtcgatcagacctgtcctcgccatggcgagcaaaggctctcgcctcgcaagctacccagaaa 4827  T
Q  222 cagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatc 320  Q
    |||| || | ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||| | |  | ||||||||||||     
T  4826 cagaatgccatgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttgaggtagtattgagacttattgaagatgttaattataatt 4727  T
Q  321 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 419  Q
    ||||| ||||| | | | |||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || |||  |||||||||| ||||||     
T  4726 tgtgaggctgtttta-agatgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaatta 4628  T
Q  420 aaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 500  Q
     | |||||||||| || ||    || ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4627 tatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10355 - 10200
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  10355 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 10257  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10256 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 10200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 239 - 521
Target Start/End: Original strand, 2987 - 3271
Alignment:
Q  239 ttttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagat 338  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2987 ttttgcgacctgtgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagat 3086  T
Q  339 atgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgt 437  Q
      |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  3087 gcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 3186  T
Q  438 catgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3187 catgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 228
Target Start/End: Original strand, 631 - 837
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  631 cagagagcttgtaagattttgtgattttgaccttcgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 730  T
Q  132 atgagattgaacctgga----------attaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 221  Q
    ||||||||||| ||| |          | | ||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  731 atgagattgaatctgaaaagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggtgagcggaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaa 830  T
Q  222 cagagtg 228  Q
    |||||||    
T  831 cagagtg 837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10661 - 10323
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||        
T  10661 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgcctagtagtgattaggaaagaatg---- 10566  T
Q  132 atgagattgaacctggaa-----tta-------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaga 219  Q
       |||||||||||||||     |||       || || |   |||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||| |||    
T  10565 ---agattgaacctggaaagattttagaatgaaaaattttcaaattctgacctgaactcgccacggcgagcagagcttcccgcctcgcgagtgacctaga 10469  T
Q  220 aacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgctcaagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataa 318  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||| || ||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||    
T  10468 aacaaagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaataataa 10369  T
Q  319 tctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgata 364  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  10368 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 177
Target Start/End: Original strand, 13226 - 13371
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13226 cagagagcatgcaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 13325  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaacttgtgggattctgacctgaact 177  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13326 atgagattgagcctgaaatgaaacttgtgggatcctgacctgaact 13371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 32 - 215
Target Start/End: Original strand, 15233 - 15426
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  15233 cagagagcatgcaagatatcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtaga 15332  T
Q  132 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 215  Q
    ||||||||||| |||           |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15333 atgagattgaatctggatagattttagaatgaaactt-tgggaatctgacctgaactcgccatagcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 15426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 404 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12584
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  502 gatg 505  Q
    ||||    
T  12587 gatg 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13133 - 13033
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||| ||| |||||||  || |||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||    
T  13133 gattttgtggttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaccatgtatattaatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 13034  T
Q  146 g 146  Q
    |    
T  13033 g 13033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12924 - 12884
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  12924 cctgaactcgccatagggagtagaggctctcgcctcgcgag 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 163 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 28192 - 27912
Alignment:
Q  163 attctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgctcaag 261  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || ||| || ||||    
T  28192 attctgacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcaatctgtgtcgcacaag 28093  T
Q  262 ttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtg 361  Q
    ||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  28092 ttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtg 27993  T
Q  362 atataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 441  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  27992 atataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29039 - 28924
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29039 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagtagatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 28940  T
Q  132 atgagattgaacctgg 147  Q
    ||||||||||||||||    
T  28939 atgagattgaacctgg 28924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20615 - 20426
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20615 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 20516  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    || ||||||||||||          |||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20515 ataagattgaacctggaaagatttagaatgaaacttttggagttctgacctgagctcgccacgacgagcagaggctctcgcctcgcgagt 20426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Original strand, 23932 - 24001
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 218
Target Start/End: Original strand, 1696 - 1891
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1696 cagagagcttgcaagattctgtgattttgacttttgagttgatccttagatg-ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 1794  T
Q  132 atgagattgaacctg-----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 218  Q
    |||||||||||||||           |||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1795 atgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactt-tggaaatctgacctgaattcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 1891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Original strand, 2703 - 2820
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2703 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 2802  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2803 atgagattgaacctggaa 2820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Original strand, 18576 - 18693
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18576 cagagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagatgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 18675  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18676 atgagattgaacctggaa 18693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 47 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17268 - 17090
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17268 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 17169  T
Q  147 -----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 215  Q
               |||| |||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17168 gatagattttagaataaaactt-tgagaatatgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacc 17090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16880 - 16784
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16880 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 149
Target Start/End: Original strand, 7471 - 7506
Alignment:
Q  114 attaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7471 attaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 7506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 210
Target Start/End: Original strand, 7537 - 7576
Alignment:
Q  171 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7537 ctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgag 7576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 5)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 207
Target Start/End: Original strand, 20044 - 20228
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  20044 cagagagcatgcaagatttcgtgaatttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtttaataatgagtaggaaagaatgtaga 20143  T
Q  132 atgagattgaacctgg---aatta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 207  Q
    ||||||||||||||||   |||||      ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20144 atgagattgaacctggattaattaagaatgaactttttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 20228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 372 - 505
Target Start/End: Original strand, 20394 - 20527
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgttt 469  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||     
T  20394 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt- 20491  T
Q  470 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20492 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Original strand, 65412 - 65479
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  65412 cagagagcatgtaagattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 65479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  357 atgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatac 452  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  || | |      
T  128917 atgtgatataatg-ttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttt 128819  T
Q  453 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |   | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || | |||||||||||||    
T  128818 tttttttgttgct-tttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 54017 - 53862
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  54017 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaac-aacc 53919  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53918 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 53862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 207
Target Start/End: Original strand, 12427 - 12611
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12427 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 12526  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 207  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12527 atgagattgaacctggaaagacatagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 12611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 530 - 344
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  530 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgaattgaaccttagatgcctt-gagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 432  T
Q  132 atgagattgaacctggaatta----------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||||| ||          |||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  431 atgagattgaacctggaaatacttagaatggaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Original strand, 2064 - 2250
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2064 agagagcatgcaagattttgtaattttgactgttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaa 2163  T
Q  133 tgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||          |||| ||| ||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2164 tgagattgaacctgaaaagacttagaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 2250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Original strand, 7913 - 8099
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7913 agagagcatgcaagattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagga 8012  T
Q  133 tgagattgaacctggaa----------ttaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||||          | ||||||  | || ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8013 tgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctaaca-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 8099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 352 - 505
Target Start/End: Original strand, 53498 - 53654
Alignment:
Q  352 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt-- 448  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |      
T  53498 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 53597  T
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53598 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaagatg 53654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 53125 - 53204
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  53125 agttgaactttagatgattttgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 53204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 211
Target Start/End: Original strand, 53314 - 53354
Alignment:
Q  171 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  53314 ctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagt 53354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16161 - 15974
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16161 cagagagcatgcaagattttgtaattttgactttagagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaga 16062  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||           ||| ||| ||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16061 atgagattgaacctgaaaagactcaaaatgaaaatttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 15974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 425 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15759 - 15664
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15759 gatattattatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 1845 - 1755
Alignment:
Q  27 aggagcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  1845 aggaccagagagcatgtaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttattaaagatta 1755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Original strand, 79950 - 80137
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  79950 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgaacattaaatgccattgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagg 80049  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||          |||| ||||||  | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80050 atgagattgaacctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgacatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 80137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 521
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22788
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22672 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22771  T
Q  502 gatgttgaagatgatgatgt 521  Q
       ||||||| |||||||||    
T  22772 ---gttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  82134 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 147
Target Start/End: Original strand, 21212 - 21303
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| || |||| || ||| |||||    | ||||||||||||||||||||||||    
T  21212 tttttacttttgagttgaaccttagatgttttttagtaccttaagatgtgtattaaggattaaatgataatgtaggatgagattgaacctgg 21303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10412 - 10226
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10412 agagagcatgtaagattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaacatgtctattattgattaggaaagaatgtagga 10313  T
Q  133 tgagattgaacctggaa----tt------aaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||||    ||      ||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10312 tgagattgaacctggaaagacttagaaggaaactttggagaatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 10226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10540
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10647 cagagagcttgcaagatttcgtgattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 10548  T
Q  132 atgagatt 139  Q
    ||||||||    
T  10547 atgagatt 10540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12416 - 12243
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12416 atttcgtgattttgacttttgaattgatccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 12317  T
Q  147 g---aatta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |   |||||      ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12316 gattaattaagaatgaactttttggaaactgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagt 12243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 459 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11979
Alignment:
Q  459 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 145
Target Start/End: Original strand, 28899 - 29011
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28899 agagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgggttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaa 28998  T
Q  133 tgagattgaacct 145  Q
    |||||||||||||    
T  28999 tgagattgaacct 29011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 445 - 502
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8176
Alignment:
Q  445 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 211
Target Start/End: Original strand, 7841 - 7882
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  7841 cctgaactcgccatagcgagtaaaggctctcgcctcgcgagt 7882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 206
Target Start/End: Original strand, 29041 - 29081
Alignment:
Q  165 tctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 206  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29041 tctgacc-gaactagccatggcgagcagaggctctcgcctcg 29081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Original strand, 9452 - 9639
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9452 cagatagcatgcaagatttcatgatttcgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattacgaaagaatgtagg 9551  T
Q  132 atgagattgaacctg----------gaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||| |||          |||| ||||||  | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9552 atgagattgaatctggaaagacttagaatgaaactttggagaatctga-ctgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 9639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 520
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  320 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat-gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 418  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  419 gaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
      | ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  516 tgatg 520  Q
    |||||    
T  3302 tgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Original strand, 24268 - 24456
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgatttt-gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  24268 cagagagcatgcaagatttcgtgatttttgacttttgagtttaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatttag 24367  T
Q  131 gatgagattgaacc----------tggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||          | |||| ||||||  |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368 gatgagattgaacctagaaagacttagaatgaaactttggataatctga-ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 24456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 38279 - 38377
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  38279 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 5)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 385 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28414
Alignment:
Q  385 aagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 481  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaacta 28454  T
Q  482 agctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28453 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 11390 - 11292
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11390 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 2095 - 1997
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2095 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 465 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  465 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 14980 - 14914
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctga 98  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14980 cagagagcatgcaagattttgtaattttgactttagagttgatccttagatgctttggagtgcctga 14914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 10)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 133143 - 132967
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  133143 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 133044  T
Q  145 tggaa-----tta-----aacttgtgggattctg-acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||     |||     || || || ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133043 tggaaagactttagaatgaaattttgtga-actgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 132967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 457 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  457 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 136827 - 136680
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  136827 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 136729  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  136728 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 139296 - 139149
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  139296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 139198  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  139197 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 144234 - 144087
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  144234 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 144136  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  144135 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 449 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62217
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaag 62217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 134358 - 134211
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  134358 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 134260  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  134259 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 141765 - 141618
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  141765 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 141667  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  141666 -gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41959 - 41901
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  41959 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcatattgaacc 41901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 57466 - 57408
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  57466 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagaatcagattgaacc 57408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 5)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 7301 - 7197
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  7301 agatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 7202  T
Q  145 tggaa 149  Q
    |||||    
T  7201 tggaa 7197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 449 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6828
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8505 - 8401
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||||  |||||||  || |||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||    
T  8505 gatttcgtagttttgacccttaagttgaaccttaaatgtttttgggtgtctgaatatgtgtaataatgattagaaaagattctagattgagattgaacct 8406  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  8405 ggaat 8401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7167 - 7126
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7167 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgccttgcgag 7126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8372 - 8330
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8372 acctgaactcgccatggcgagtggaggccctcgcctcgcgagt 8330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 143
Target Start/End: Original strand, 6449 - 6557
Alignment:
Q  35 agagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatg 134  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6449 agagaatgcaagatttcatgattttgacttttgagatgatccttagatgccttttagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatg 6548  T
Q  135 agattgaac 143  Q
    |||||||||    
T  6549 agattgaac 6557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 234
Target Start/End: Original strand, 6561 - 6625
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgt 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  6561 cctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaatagagtgccttgt 6625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18148
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18050 gatattattatatcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 423 - 502
Target Start/End: Original strand, 2195 - 2275
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2195 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcaagagtcggtctaag 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3420 - 3251
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  3420 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 3321  T
Q  147 gaa----tta------aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 206  Q
    |||    |||      ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3320 gaatagtttaagaacgaacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcg 3251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 7)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 161173 - 161072
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  161173 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctg 161074  T
Q  147 ga 148  Q
    ||    
T  161073 ga 161072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 423 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 160784 - 160688
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  160784 ttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501100
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501146 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 501100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Original strand, 85646 - 85742
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  85646 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 173742 - 173587
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| |||  |  |||||| ||||||||||   |  || ||  ||||||||||||||||||  || |    
T  173742 ttttgactttttagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactaatgattagaggatgatttataatgagattgaacctggaac-aacc 173644  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  173643 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 173587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 447007 - 446965
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  447007 ttagatgattttgggtgcctgaacatgtataataatgattagg 446965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 497938 - 497896
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  497938 ttagatgattttgtgtgcctgaacatgtataataatgattagg 497896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 145
Target Start/End: Original strand, 28440 - 28540
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  28440 agatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 28539  T
Q  145 t 145  Q
    |    
T  28540 t 28540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Original strand, 28574 - 28616
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28574 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 28616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 32573 - 32469
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  32573 agattttgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 32474  T
Q  145 tggaa 149  Q
    |||||    
T  32473 tggaa 32469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 457 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32102
Alignment:
Q  457 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32439 - 32397
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32439 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagt 32397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 9579 - 9462
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  9579 cagagagcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtaga 9480  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
     |||||||| ||||||||    
T  9479 gtgagattggacctggaa 9462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9432 - 9391
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9432 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 9391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 620 - 437
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||     
T  620 agatttcgtaattttgacttttgaattgatccttagacttttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaact 521  T
Q  145 tggaa-----tta-----aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 218  Q
    |||||     |||     || || || || |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520 tggaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 133
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 12)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 101884 - 101781
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  101884 agatttcgtaatttttacttttgagttgatccttagaagtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacc 101785  T
Q  145 tgga 148  Q
    ||||    
T  101784 tgga 101781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 404 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 100493 - 100378
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||| ||| ||| | | ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100493 agatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 100394  T
Q  502 gatgttgaagatgatg 517  Q
    | || ||| |||||||    
T  100393 gttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 44602 - 44454
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt----gtatactgcctatgttgctgt 467  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    ||||||||  | |||||||||    
T  44602 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgt 44504  T
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44503 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 450 - 517
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 94558 - 94411
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  94558 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 94460  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  94459 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 502
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17586
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    || | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540 gc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101503
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 107
Target Start/End: Original strand, 39640 - 39702
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtcta 107  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  39640 agatttcataattttgacttttgagttgatccttagatgttttcgagtgcctgaacaggtcta 39702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 101753 - 101709
Alignment:
Q  167 tgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  101753 tgacctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgggagt 101709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 23441 - 23475
Alignment:
Q  176 ctcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23441 ctcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Original strand, 39921 - 39978
Alignment:
Q  153 aacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||| |   ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39921 aacttgtgggagttatacctgaacttgccatggcaagtagaggctctcgcctcgcgag 39978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 317 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27027 - 26840
Alignment:
Q  317 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 416  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27027 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 26929  T
Q  417 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    ||| ||||||||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  26928 ttg-aattgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatg 26840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27299 - 27256
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27299 tttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 27256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Original strand, 2277 - 2378
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  2277 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 2376  T
Q  147 ga 148  Q
    ||    
T  2377 ga 2378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 5)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19756 - 19652
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  19756 agattttgtaattttgacttctgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaggattggagaatgagattgaacc 19657  T
Q  145 tggaa 149  Q
    |||||    
T  19656 tggaa 19652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19268
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19622 - 19573
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19622 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatgacccag 19573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 117
Target Start/End: Original strand, 48092 - 48164
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| || ||| |||||    
T  48092 agattttgtgattttgacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgtctgaagatgtatattaaagatta 48164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 48233 - 48268
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48233 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 48268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Original strand, 1092 - 1190
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1092 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 3993 - 4033
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3993 cctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 6083 - 5978
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||     
T  6083 agatttcgtaattttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacaggtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaact 5984  T
Q  145 tggaat 150  Q
    ||||||    
T  5983 tggaat 5978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 449 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5662
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaag 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 112
Target Start/End: Original strand, 10890 - 10970
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10890 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataat 10970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 7)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 130397 - 130222
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||  ||||||||||||    
T  130397 agatttcgtaattttgacttttgagttgatcctttgatgtttttgagtgcctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacc 130298  T
Q  145 tggaa----ttaa------acttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||    ||||      | || ||||| |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130297 tggaatagtttaagaatggatttttgggaattacacctaaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 130222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 130024 - 129924
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  130024 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 129925  T
Q  502 g 502  Q
    |    
T  129924 g 129924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 445 - 505
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60821
Alignment:
Q  445 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 60821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23668 - 23513
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  || |    
T  23668 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactactgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caacc 23570  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   || || |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23569 ttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 23513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 242534 - 242420
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  242534 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 242435  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    |   |||||||||||    
T  242434 ggcaagattgaacct 242420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 211
Target Start/End: Original strand, 60479 - 60520
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  60479 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 60520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 143
Target Start/End: Original strand, 60301 - 60367
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 143  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  60301 ttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 60367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Original strand, 45420 - 45522
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  45420 agattttgtaatttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacc 45519  T
Q  145 tgg 147  Q
    |||    
T  45520 tgg 45522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 449 - 517
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45909
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Original strand, 45555 - 45596
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45555 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 45596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Original strand, 2434 - 2535
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  2434 agatttcataattttgacttttgggatgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagtttgaacc 2533  T
Q  145 tg 146  Q
    ||    
T  2534 tg 2535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 404 - 517
Target Start/End: Original strand, 2808 - 2923
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2808 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 2907  T
Q  502 gatgttgaagatgatg 517  Q
    |||| ||| |||||||    
T  2908 gatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Original strand, 2567 - 2609
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2567 acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 2609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 5)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7026 - 6922
Alignment:
Q  45 agatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  7026 agatttcgtaattttgacttttgagttgatcctttgatg-ttttgagtgcctggacatgtctaataataattaggaaagattggagattgagattgaacc 6928  T
Q  145 tggaat 150  Q
    ||||||    
T  6927 tggaat 6922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6535
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 376 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8485
Alignment:
Q  376 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 473  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtta 8514  T
Q  474 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 9012 - 8961
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9012 agttgatctttagaagattttgagtgcctgaacatgtataataatgactagg 8961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8824 - 8784
Alignment:
Q  171 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8824 ctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagt 8784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 5)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 1082 - 965
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  1082 cagagagcatgcaagatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgctagaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaag 983  T
Q  132 atgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  982 atgagataggacctggaa 965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 124
Target Start/End: Original strand, 10200 - 10278
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10200 gatttcgtaattttgacctttgagatgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagtaaaga 10278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 404 - 521
Target Start/End: Original strand, 10543 - 10659
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10543 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 10642  T
Q  502 gatgttgaagatgatgatgt 521  Q
       |||||||||| ||||||    
T  10643 ---gttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 944 - 897
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  944 tgggattctgccctgaactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcg 897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Original strand, 10305 - 10347
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10305 acctgaactcgccaaagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 10347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 143
Target Start/End: Original strand, 1934 - 2030
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 143  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  1934 atttcgtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtcactgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaac 2030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Original strand, 2066 - 2108
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2066 acctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagt 2108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 6)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 13429 - 13325
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  13429 gatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagattggagattaagattgaacct 13330  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  13329 ggaat 13325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 405 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12942
Alignment:
Q  405 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa- 12959  T
Q  503 atgttgaagatgatgatgt 521  Q
      |||||||||||||||||    
T  12958 --gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Original strand, 29836 - 29950
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||  ||||   |||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29836 gcagagagcatgtaagattttgtaattttgactttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 29935  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  29936 gacaagattgaacct 29950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Original strand, 41832 - 41946
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||  ||||   |||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41832 gcagagagcatgtaagattttgtaattttgactttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 41931  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||  |||||||||||    
T  41932 gacaagattgaacct 41946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13296 - 13255
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13296 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgag 13255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 18002 - 18042
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  18002 cctgaactcgccatagcgagtggaggctctcgcctcgcgag 18042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 353 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  353 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtat 450  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||     
T  2045 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaa 1947  T
Q  451 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
     ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  1946 tctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 2352 - 2291
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  2352 ttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2238 - 2187
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2238 tgggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 2187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 6)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 317 - 517
Target Start/End: Original strand, 21721 - 21920
Alignment:
Q  317 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 416  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21721 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 21819  T
Q  417 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 514  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  21820 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 21917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 317 - 517
Target Start/End: Original strand, 29613 - 29812
Alignment:
Q  317 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 416  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29613 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 29711  T
Q  417 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 514  Q
    ||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  29712 ttg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 29809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 99
Target Start/End: Original strand, 21449 - 21492
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21449 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 21492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Original strand, 21563 - 21614
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21563 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 21614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 99
Target Start/End: Original strand, 29341 - 29384
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  29341 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 29384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Original strand, 29455 - 29506
Alignment:
Q  159 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29455 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 29506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 404 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1048
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||||||| | | | |||||||| |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1052  T
Q  502 gatg 505  Q
    ||||    
T  1051 gatg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2044 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold2044
Description:

Target: scaffold2044; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 92
Target Start/End: Original strand, 1075 - 1134
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1075 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 1134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 6)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6611
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 13991
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7102 - 6998
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  7102 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattaagattgaacct 7003  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  7002 ggaat 6998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14482 - 14378
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  14482 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattaagattgaacct 14383  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  14382 ggaat 14378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6969 - 6931
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  6969 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgc 6931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14349 - 14311
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14349 acctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgc 14311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6244
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 144
Target Start/End: Original strand, 5765 - 5852
Alignment:
Q  57 tttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||    
T  5765 tttgacctttaagttgaatcttagatgtttttgagtacctgaacatgtataataatgattaggaaaaattgtagattgagattgaacc 5852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 5)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Original strand, 15462 - 15566
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  15462 gatttcgtaattttaacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattgagattgaacct 15561  T
Q  146 ggaat 150  Q
    |||||    
T  15562 ggaat 15566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15898
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 210
Target Start/End: Original strand, 15598 - 15636
Alignment:
Q  172 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15598 tgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgag 15636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 468 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178913
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 178913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 179138 - 179085
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  179138 gatttcataattttgacttttgagttggaccttagatgtttttcagtgcctgaa 179085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4710
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4756 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 404 - 518
Target Start/End: Original strand, 38704 - 38820
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38704 agatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaa 38803  T
Q  502 gatgttgaagatgatga 518  Q
    | || | ||||||||||    
T  38804 gttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 449 - 521
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 141
Target Start/End: Original strand, 671 - 755
Alignment:
Q  57 tttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattga 141  Q
    |||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  671 tttgacctttaagttgaatcttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggaaagattgtagattgagattga 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 150
Target Start/End: Original strand, 43436 - 43520
Alignment:
Q  66 tgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  43436 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaat 43520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 150
Target Start/End: Original strand, 47356 - 47440
Alignment:
Q  66 tgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  47356 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaat 47440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Original strand, 43549 - 43590
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43549 acctgtactcgccatgacgagtagaggctctcgcctcgcgag 43590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 6)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 349 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 12931 - 12859
Alignment:
Q  349 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 421  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12931 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 12859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11305
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11350 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 13234 - 13173
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  13234 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 13173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Original strand, 125797 - 125855
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  125797 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 125855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13104 - 13069
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13104 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 13069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 144
Target Start/End: Original strand, 105563 - 105620
Alignment:
Q  87 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||| |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  105563 ttgagtgcctaaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 105620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||  ||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
     | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Original strand, 5943 - 5995
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5943 atttcatgattttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 5995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 6082 - 6117
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6082 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 6117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 450 - 517
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14814
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Original strand, 30379 - 30450
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||    
T  30379 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatctttaataaagattag 30450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2208 - 2173
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2208 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 2173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 30518 - 30553
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30518 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 30553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 349 - 468
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15483
Alignment:
Q  349 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 445  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 15460  T
Q  446 tgtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  15461 tgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Original strand, 15049 - 15227
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag-gaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| |||||| | | |||| |||     
T  15049 agagagcatgcaagatttcgtgattttcacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgaat-taga 15147  T
Q  132 atgagattgaacctggaattaaactt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |  |||||||||||||||  || |||   ||||| |||| | || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15148 acaagattgaacctggaa-caaccttagttgggaatctggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 449 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1101
Alignment:
Q  449 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 6)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13144
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  502 gatg 505  Q
    ||||    
T  13147 gatg 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 502
Target Start/End: Original strand, 16121 - 16202
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16121 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2677
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Original strand, 15866 - 15983
Alignment:
Q  172 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtt--agattttgcgacctttgttgctcaagttgtcgag 269  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||   |||||||||| |||||| || ||||||||   |    
T  15866 tgaactcgccatagcgagtataggccctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacaagttgttatg 15965  T
Q  270 agttgaacccttgggtag 287  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  15966 agttgaacctttgggtag 15983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13665 - 13595
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  13665 ttagatgattctaagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 13595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3230 - 3162
Alignment:
Q  75 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 143  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||    
T  3230 ccttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 3162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 5)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 405 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12766
Alignment:
Q  405 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaag 12785  T
Q  503 atgttgaagatgatgatgt 521  Q
     || |||  ||||||||||    
T  12784 ttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 6058 - 5996
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  6058 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 5996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 7253 - 7191
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  7253 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 7191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5928 - 5893
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5928 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 5893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7123 - 7088
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7123 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 7088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 425 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 11562 - 11464
Alignment:
Q  425 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 521  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  11562 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  10835 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 13539 - 13392
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13539 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13441  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13440 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 92
Target Start/End: Original strand, 17343 - 17402
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17343 agagagcatgcaagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 17402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15429 - 15394
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15429 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 742 - 587
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||   |  |  ||| |  |||||||||||||||| |       
T  742 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgacttagaacaagattgaacctggaataacca 643  T
Q  156 ttg-tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||| ||| |||||  | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  642 ttgttggaattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 308 - 446
Target Start/End: Original strand, 3434 - 3574
Alignment:
Q  308 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 405  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  3434 gttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgag 3533  T
Q  406 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 446  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  3534 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20894 - 20747
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20894 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20796  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20795 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37821
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  37968 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 37870  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  37869 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129075
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78338
Alignment:
Q  452 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 78338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116430
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 116447  T
Q  502 gatgttgaagatgatga 518  Q
    | || | ||||||||||    
T  116446 gttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 80796 - 80726
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  80796 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 80726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 128735 - 128775
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  128735 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 128775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
       | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  168 at-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12462 - 12380
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  12462 agttgatatttagatgattttgagtgtctgaacatgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaat 12380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25125
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25640 - 25568
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||| |||||    
T  25640 ttagatgattttgagtgcctgaaaatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacttggaa 25568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10987 - 10913
Alignment:
Q  76 cttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||    
T  10987 cttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagatcctagactgagattgaacctggaat 10913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 404 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10546
Alignment:
Q  404 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 501  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaa 10547  T
Q  502 g 502  Q
    |    
T  10546 g 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10842
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10884 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 10842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 452 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 566
Alignment:
Q  452 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 505
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6389
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 455 - 505
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13843
Alignment:
Q  455 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 5)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 20483 - 20418
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctg 97  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20483 cagagagcatgcaagattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctg 20418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38339
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38672 - 38634
Alignment:
Q  172 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38672 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 38634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38833 - 38761
Alignment:
Q  75 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  38833 ccttagatgattctgagtgcgtgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 7)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 70296 - 70211
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  70296 cagagagcatgcaagattttatagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 70211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 58102 - 58161
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  58102 tttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 58161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 10238 - 10393
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  10238 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaac-aacc 10336  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10337 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 10393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 69870 - 69794
Alignment:
Q  440 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  69870 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 70142 - 70107
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  70142 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 70107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 332859 - 332784
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 143  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  | |||  |||||||||||    
T  332859 agttgagctttagatgattttgagtgcctgaatatgtataagaatgattaggaaagtttttagattgagattgaac 332784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 317 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 70000 - 69930
Alignment:
Q  317 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatta--tgcattacttgaa 386  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  70000 aatctgtgaagctgt-tatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 69930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 1370 - 1307
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  1370 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtctattaaagattag 1307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 14094 - 13947
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  14094 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13996  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13995 -gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 150
Target Start/End: Original strand, 7711 - 7793
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||    
T  7711 agttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtgtaataatgattaggaaagatcctagactgagattgaacctagaat 7793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 505
Target Start/End: Original strand, 8059 - 8166
Alignment:
Q  402 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt--tg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 497  Q
    |||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||   ||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8059 taagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggt 8158  T
Q  498 ctaagatg 505  Q
    ||| ||||    
T  8159 ctatgatg 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Original strand, 7822 - 7864
Alignment:
Q  169 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7822 acctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 7864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 3505 - 3618
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  3505 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 3604  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    ||| ||||||||||    
T  3605 gatcagattgaacc 3618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9521 - 9484
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9521 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagt 9484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 10643 - 10679
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10643 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 10679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 14169 - 14282
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14169 gcagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtag 14268  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    ||  ||||||||||    
T  14269 gacaagattgaacc 14282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 8506 - 8619
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||| ||||||| |||||  |||||  ||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  8506 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgactttttagttggaccttaagtgcctttgagtgcgtgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 8605  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    ||| ||||||||||    
T  8606 gataagattgaacc 8619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 96
Target Start/End: Original strand, 16740 - 16804
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||||||| |  |||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16740 cagagagcatgtagaattctgtgtttttgacttttgagttgaagcttagatgcttttgagtgcct 16804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 16894 - 16929
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16894 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 16929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26887 - 26834
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  26887 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 26834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 23919 - 23843
Alignment:
Q  440 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23919 tgttgttgtaatctgcctatggtgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26747 - 26712
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26747 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 26712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 99
Target Start/End: Original strand, 36024 - 36077
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  36024 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 36077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 36944 - 36891
Alignment:
Q  46 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaa 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  36944 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 36891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36804 - 36769
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36804 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 36769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2691
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 227942 - 227877
Alignment:
Q  85 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  227942 ttttgagtgcctaaacatgtataataatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaat 227877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 24622 - 24777
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||  || |    
T  24622 ttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaactatttagaacgagattgaacctggaac-aacc 24720  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24721 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagacgctctcgcctcgcgag 24777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 96
Target Start/End: Original strand, 18941 - 18985
Alignment:
Q  52 gtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18941 gtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 18985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Original strand, 19024 - 19100
Alignment:
Q  135 agattgaacctggaattaaacttgtggga-ttctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||| |   |||| ||| ||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19024 agattgaacctggaataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagaagatgctctcgcctcgcgag 19100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 30028 - 29948
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 5)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 40496 - 40400
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40496 ttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19640 - 19485
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||  |  |||||| ||| ||||||  ||  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  19640 ttttgacttttgagttgaaccttagatacctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctggaac-aacc 19542  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19541 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 19485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 62592 - 62556
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  62592 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagt 62556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13236 - 13201
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13236 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 13201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8492 - 8423
Alignment:
Q  75 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||| ||||| || |||| |||||||||  || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8492 ccttggatgccttagagtccctgaacatacctgatattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 8423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Original strand, 161156 - 161252
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  161156 ttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2344 - 2245
Alignment:
Q  44 aagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaac 143  Q
    |||||||||  ||| | |||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2344 aagatttcggaattataactttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcacactaatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 2245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 1967 - 1904
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  1967 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 1904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1836 - 1801
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1836 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 1801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   |||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 519  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97021
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 97021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106299
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 106299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 97359 - 97321
Alignment:
Q  172 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  97359 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 97321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 106637 - 106599
Alignment:
Q  172 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  106637 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 106599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 46370 - 46432
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  46370 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 46432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1992 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1992
Description:

Target: scaffold1992; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 280 - 239
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgctttt 88  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  280 atttcgtgatttagacttttgagttgatccttagatgctttt 239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Original strand, 891 - 952
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  891 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18806 - 18651
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||  || |    
T  18806 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctggaa-caacc 18708  T
Q  156 tt--gtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18707 ttagttgggaatctggcttgaactcgctaaggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 3315 - 3254
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  3315 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 3254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 6981 - 6920
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  6981 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 6920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 44527 - 44486
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44527 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 44486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 37184 - 37071
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  37184 gcagagagcatgtaagattttgcgatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 37085  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    |   ||||||||||    
T  37084 ggcaagattgaacc 37071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 7)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 56549 - 56394
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||   |  || ||| ||||||||||||||||||  || |    
T  56549 ttttgacttttaagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagaggatgatttagaatgagattgaacctggaac-aacc 56451  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56450 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 56394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 117
Target Start/End: Original strand, 190905 - 190985
Alignment:
Q  37 agcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  190905 agcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttagaaatgatta 190985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 117
Target Start/End: Original strand, 192608 - 192688
Alignment:
Q  37 agcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  192608 agcatgcaagattctgtgtttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttagaaatgatta 192688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 211
Target Start/End: Original strand, 192757 - 192793
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  192757 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagt 192793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 191054 - 191089
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  191054 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 191089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 92
Target Start/End: Original strand, 14971 - 15003
Alignment:
Q  60 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14971 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 92
Target Start/End: Original strand, 19493 - 19525
Alignment:
Q  60 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19493 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 19525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 267733 - 267676
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  267733 tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 267676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 307529 - 307460
Alignment:
Q  75 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  307529 ccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 307460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 268195 - 268116
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    |||||| | ||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  268195 agttgaactttagatgattctaagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 268116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 268007 - 267966
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  268007 cctgaactcggcatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 267966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2262 - 2099
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag-gaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||  | ||| |||||| | | || | ||| |  ||||||||||     
T  2262 atttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcattaaagattagaggatgact-tagaacaagattgaaccc 2164  T
Q  146 ggaattaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||| |   |||| ||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2163 ggaataaccattgttggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 2099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 423 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 4310 - 4214
Alignment:
Q  423 ttgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4310 ttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 520
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  358 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 453  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | || || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||   |||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  454 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 520  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||    
T  12349 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Original strand, 6059 - 6099
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6059 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 6099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 6189 - 6224
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6189 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 6224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10653 - 10541
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| || ||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10653 cagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagatggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 10554  T
Q  132 atgagattgaacc 144  Q
    |  ||||||||||    
T  10553 acaagattgaacc 10541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 2300 - 2240
Alignment:
Q  58 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  2300 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattag 2240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 9982 - 9922
Alignment:
Q  58 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  9982 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattag 9922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2182 - 2137
Alignment:
Q  165 tctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2182 tctgacttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 2137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9864 - 9819
Alignment:
Q  165 tctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9864 tctgacttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgag 9819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4904 - 4841
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  4904 attttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattag 4841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4773 - 4738
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4773 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 4738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Original strand, 1726 - 1789
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  1726 attttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtgtattaaagattag 1789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 1857 - 1892
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1857 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 1892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Original strand, 35163 - 35226
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | |||| |||||| ||||||    
T  35163 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtataataaagattag 35226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9815 - 9704
Alignment:
Q  33 agagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| ||||   ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9815 agagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttttaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 9716  T
Q  133 tgagattgaacc 144  Q
      ||||||||||    
T  9715 caagattgaacc 9704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 2447 - 2482
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2447 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 2482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Original strand, 5427 - 5541
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||| || |||| |||||  ||||   ||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  5427 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgattttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggatgaatgtag 5526  T
Q  131 gatgagattgaacct 145  Q
    ||| |||||||||||    
T  5527 gataagattgaacct 5541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 6)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27064 - 27006
Alignment:
Q  86 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27064 tttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacc 27006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 45579 - 45534
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45579 atttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 45534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 119
Target Start/End: Original strand, 35524 - 35575
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35524 agttgaaccttaaatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagg 35575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 45450 - 45415
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45450 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 45415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Original strand, 10956 - 11049
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  10956 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagggaacgaatg-ggaatgagattgaacctggaa 11049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 38473 - 38509
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  38473 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 38509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 150
Target Start/End: Original strand, 24182 - 24256
Alignment:
Q  76 cttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||||||    
T  24182 cttagatgattttgagtgcctgaatatatataataatgattaggcaagcttttagattgagattgaacctggaat 24256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 502
Target Start/End: Original strand, 103679 - 103733
Alignment:
Q  448 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 502  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  103679 tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaag 103733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 147
Target Start/End: Original strand, 103244 - 103316
Alignment:
Q  75 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  103244 ccttagaggattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 103316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 211
Target Start/End: Original strand, 103403 - 103444
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  103403 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagt 103444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 381 - 226
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||   | ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  381 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgttttagaacaagattgaacctggaac-aacc 283  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  282 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 867 - 830
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  867 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 591 - 478
Alignment:
Q  31 gcagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtag 130  Q
    ||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |||||  ||||   ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  591 gcagagagcatgttggattttgtaatttcgactttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggtatgaatgtag 492  T
Q  131 gatgagattgaacc 144  Q
    ||| ||||| ||||    
T  491 gattagattaaacc 478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 792 - 747
Alignment:
Q  47 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  792 atttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 663 - 628
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  663 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 372 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 12205 - 12064
Alignment:
Q  372 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 468  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  12205 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgtt 12107  T
Q  469 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 518  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12106 t-------aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Original strand, 10464 - 10525
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||    
T  10464 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttgaagatgcctattaaagatta 10525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 15322 - 15476
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | || ||||||| ||| |||||    | ||  ||| | |||||||||||| |||  |       
T  15322 tttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttaaagatgtctattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctagaacaactt 15421  T
Q  156 ttg-tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 209  Q
    ||| ||||| |||| | || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15422 ttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcaagcagatgctctcgcctcgcga 15476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 517
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  452 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 517  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 145
Target Start/End: Original strand, 19762 - 19875
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagg 131  Q
    ||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||  ||||   |||  ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  19762 cagagagcatgtaagattttgcaatttcgactttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattgggaatgaatgtagg 19861  T
Q  132 atgagattgaacct 145  Q
    |  |||||||||||    
T  19862 acaagattgaacct 19875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 150
Target Start/End: Original strand, 24660 - 24723
Alignment:
Q  87 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 150  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  24660 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattgggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaat 24723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 18716 - 18655
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  18716 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 18655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 66069 - 66224
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaattaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||||||  ||||||   |  || ||| |  |||||||||||||||  || |    
T  66069 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctaatatagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggaac-aacc 66167  T
Q  156 ttg--tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||   ||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  66168 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 66224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 71210 - 71246
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  71210 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 71246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 805 - 769
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  805 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15877 - 15837
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15877 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15747 - 15712
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15747 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Original strand, 6721 - 6761
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6721 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 6761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 6851 - 6886
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6851 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 6886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 517
Target Start/End: Original strand, 4804 - 4921
Alignment:
Q  402 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 498  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||   |||||||||   ||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||||  |     
T  4804 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgct-attattatttaactaagttgcatgagtcaata 4902  T
Q  499 taagatgttgaagatgatg 517  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  4903 taagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 2209 - 2244
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2209 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 2244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 10069 - 10104
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10069 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 10104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 92
Target Start/End: Original strand, 2088 - 2125
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2088 attttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagt 2125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 92
Target Start/End: Original strand, 9948 - 9985
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9948 attttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagt 9985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11712 - 11677
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11712 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 11677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12868 - 12785
Alignment:
Q  62 cttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  12868 ctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacct 12785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 119
Target Start/End: Original strand, 589 - 640
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  589 agttgatccttaaatgattttgagtgcatgaatatgtataataatgattagg 640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 18226 - 18261
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18226 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 18261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 96
Target Start/End: Original strand, 18095 - 18136
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18095 attttgactttagagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 18136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 3304 - 3339
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3304 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 3339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36637 - 36602
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36637 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 36602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 36759 - 36721
Alignment:
Q  54 gattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36759 gattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 36721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8831 - 8796
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8831 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 8796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 32901 - 32849
Alignment:
Q  65 ttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  32901 ttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 32849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 515
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  468 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 515  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 8730 - 8765
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8730 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 8765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 117
Target Start/End: Original strand, 8576 - 8661
Alignment:
Q  32 cagagagcatgcaagatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    ||||||||||| || |||  ||  ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||| |||||    
T  8576 cagagagcatgtaaaattcggtatttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaagatgcctattaaagatta 8661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 29228 - 29177
Alignment:
Q  68 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  29228 agttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatatataataatgattagg 29177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15018 - 14983
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15018 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 14983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15147 - 15107
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15147 tttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 228147 - 228182
Alignment:
Q  175 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  228147 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 228182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7188 - 7118
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgg 147  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||    
T  7188 ttagatgattttgagtgactgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 7118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 2351 - 2258
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta-ggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| ||||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  2351 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagggaacgaatg-ggaatgagattgaacctggaa 2258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 633 - 595
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgc 94  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  633 ttttgacttttgagttgaaccctagatgcttttgagtgc 595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 9346 - 9408
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| ||||||||||    
T  9346 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctataggtgtctactaatgattag 9408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 145
Target Start/End: Original strand, 17421 - 17475
Alignment:
Q  91 gtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 145  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  17421 gtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacct 17475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 119
Target Start/End: Original strand, 55271 - 55313
Alignment:
Q  77 ttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  55271 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattagg 55313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 500
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  450 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 500  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 505
Target Start/End: Original strand, 1874 - 1903
Alignment:
Q  476 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1874 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 206
Target Start/End: Original strand, 1562 - 1598
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1562 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcg 1598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 92
Target Start/End: Original strand, 6923 - 6960
Alignment:
Q  55 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6923 attttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagt 6960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Original strand, 18014 - 18107
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  || ||| || |||||||| ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  18014 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctggaa 18107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12205 - 12112
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |  |||||| || |||||||  ||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  12205 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctggaa 12112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3193 - 3148
Alignment:
Q  87 ttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagga 132  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3193 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 3148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Original strand, 15992 - 16053
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 117  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  15992 tttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 16053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 374 - 338
Alignment:
Q  174 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 210  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  374 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgag 338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 362 - 326
Alignment:
Q  170 cctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  362 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcg 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Original strand, 1143 - 1183
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 96  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1143 ttttgacttgtgagttgaactttagatgcttttgagtgcct 1183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 6579 - 6543
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6579 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 6543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15795 - 15759
Alignment:
Q  56 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15795 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3129 - 3073
Alignment:
Q  88 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacc 144  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  3129 tgagtgcctgatcatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacc 3073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 415 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 29198 - 29117
Alignment:
Q  415 aattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||  || |||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29198 aattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctact-attgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5154 times since January 2019
Visitors: 4845