View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0755_low_70 (Length: 330)

Name: NF0755_low_70
Description: NF0755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0755_low_70
NF0755_low_70
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (1-318)||(19886596-19886913)
chr2 (66-318)||(17396665-17396916)
chr2 (66-313)||(462743-462989)
chr2 (69-318)||(19794719-19794967)
chr2 (66-318)||(8891242-8891493)
chr2 (66-318)||(36982453-36982704)
chr2 (66-318)||(7507856-7508107)
chr2 (69-318)||(20627328-20627576)
chr2 (86-318)||(43642989-43643220)
chr2 (85-318)||(24341420-24341652)
chr2 (2-150)||(23777984-23778133)
chr2 (1-150)||(8944014-8944164)
chr2 (1-150)||(12728560-12728710)
chr2 (1-150)||(34824643-34824793)
chr2 (66-318)||(25265402-25265653)
chr2 (1-150)||(3798541-3798691)
chr2 (1-150)||(12635806-12635956)
chr2 (1-150)||(12641580-12641730)
chr2 (1-150)||(16935761-16935911)
chr2 (1-150)||(17006421-17006571)
chr2 (1-150)||(42177907-42178057)
chr2 (1-150)||(11231276-11231426)
chr2 (1-150)||(22513123-22513273)
chr2 (1-150)||(24685719-24685869)
chr2 (1-150)||(28775745-28775895)
chr2 (66-186)||(19689413-19689533)
chr2 (66-186)||(23820202-23820322)
chr2 (17-84)||(5888585-5888652)
chr2 (27-115)||(21142098-21142187)
chr2 (66-186)||(14906452-14906572)
chr2 (17-84)||(23774370-23774437)
chr2 (66-186)||(20015142-20015262)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (1-318)||(12374-12691)
chr5 (1-318)||(25426628-25426945)
chr5 (1-318)||(18777927-18778244)
chr5 (1-318)||(19499899-19500216)
chr5 (1-318)||(22366416-22366733)
chr5 (1-318)||(21073530-21073847)
chr5 (1-318)||(43443332-43443647)
chr5 (1-318)||(4199920-4200237)
chr5 (19-318)||(27009841-27010140)
chr5 (14-266)||(29188232-29188483)
chr5 (66-318)||(23506965-23507216)
chr5 (66-318)||(27182559-27182810)
chr5 (66-318)||(22053845-22054096)
chr5 (66-318)||(18531079-18531330)
chr5 (66-307)||(34939289-34939528)
chr5 (1-150)||(11212003-11212153)
chr5 (1-150)||(7425492-7425642)
chr5 (1-150)||(10777908-10778058)
chr5 (1-150)||(35791036-35791186)
chr5 (2-150)||(23514729-23514878)
chr5 (1-150)||(1219458-1219608)
chr5 (1-150)||(17471526-17471676)
chr5 (1-150)||(21932319-21932469)
chr5 (1-150)||(21938489-21938639)
chr5 (1-150)||(35582204-35582354)
chr5 (1-117)||(22883022-22883139)
chr5 (1-150)||(36989708-36989858)
chr5 (66-186)||(20623100-20623220)
chr5 (66-186)||(21233540-21233660)
chr5 (66-186)||(25900418-25900538)
chr5 (17-84)||(23328791-23328858)
chr5 (17-84)||(24616395-24616462)
chr5 (17-84)||(24712771-24712838)
chr5 (17-84)||(24745789-24745856)
chr5 (66-186)||(16536328-16536448)
chr5 (66-150)||(37052911-37052995)
chr5 (69-150)||(32950862-32950943)
chr5 (274-314)||(29190482-29190522)
chr5 (277-318)||(17471803-17471844)
chr5 (70-154)||(26559815-26559900)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (1-318)||(27653918-27654235)
chr6 (4-318)||(25175563-25175878)
chr6 (1-318)||(16825687-16826006)
chr6 (1-314)||(1650042-1650352)
chr6 (66-314)||(14626130-14626377)
chr6 (68-307)||(23153458-23153696)
chr6 (66-307)||(1657760-1657999)
chr6 (66-318)||(35009451-35009702)
chr6 (68-307)||(15862484-15862720)
chr6 (1-150)||(16232060-16232210)
chr6 (2-150)||(1556173-1556322)
chr6 (2-250)||(29665941-29666191)
chr6 (19-150)||(18086780-18086911)
chr6 (1-150)||(19610186-19610336)
chr6 (1-150)||(23977937-23978087)
chr6 (1-117)||(22251504-22251621)
chr6 (1-150)||(22225676-22225826)
chr6 (3-150)||(13620734-13620882)
chr6 (1-150)||(10488867-10489017)
chr6 (1-150)||(16376311-16376461)
chr6 (1-150)||(16383635-16383785)
chr6 (1-150)||(16556077-16556227)
chr6 (1-150)||(16632633-16632783)
chr6 (1-88)||(19299467-19299555)
chr6 (17-84)||(29869731-29869798)
chr6 (67-139)||(27751603-27751675)
chr6 (70-154)||(19854317-19854402)
chr6 (94-154)||(29605612-29605672)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (14-318)||(47357654-47357958)
chr4 (14-318)||(10644219-10644523)
chr4 (94-310)||(13048261-13048477)
chr4 (66-318)||(54118256-54118507)
chr4 (85-318)||(13246430-13246662)
chr4 (66-318)||(15675101-15675352)
chr4 (85-318)||(31115629-31115861)
chr4 (66-250)||(10104262-10104445)
chr4 (1-150)||(18169138-18169288)
chr4 (2-150)||(19020654-19020803)
chr4 (66-318)||(26680201-26680451)
chr4 (66-218)||(121989-122140)
chr4 (1-150)||(7132003-7132153)
chr4 (1-150)||(15287183-15287333)
chr4 (1-150)||(15294292-15294442)
chr4 (1-150)||(17145595-17145745)
chr4 (1-150)||(20000891-20001041)
chr4 (1-92)||(8378377-8378469)
chr4 (19-115)||(18248421-18248517)
chr4 (19-150)||(22738437-22738568)
chr4 (221-318)||(111395-111492)
chr4 (66-186)||(10488693-10488813)
chr4 (66-186)||(16327938-16328058)
chr4 (17-84)||(22352019-22352086)
chr4 (17-84)||(26339253-26339320)
chr4 (85-250)||(40885585-40885749)
chr4 (66-117)||(33240900-33240951)
chr4 (274-318)||(10104450-10104494)
chr4 (70-154)||(18238157-18238242)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (1-318)||(10989410-10989726)
chr7 (1-318)||(2437457-2437774)
chr7 (1-318)||(13910959-13911277)
chr7 (19-318)||(13572676-13572975)
chr7 (19-318)||(18253800-18254098)
chr7 (16-318)||(16478912-16479213)
chr7 (66-318)||(47481043-47481294)
chr7 (66-312)||(25292350-25292595)
chr7 (66-318)||(13037026-13037277)
chr7 (66-313)||(11580751-11580997)
chr7 (66-316)||(16211768-16212017)
chr7 (66-318)||(3059966-3060217)
chr7 (85-318)||(36052667-36052896)
chr7 (66-318)||(13321014-13321267)
chr7 (1-150)||(15950729-15950879)
chr7 (1-150)||(18979959-18980109)
chr7 (66-318)||(7293017-7293267)
chr7 (2-150)||(15760053-15760202)
chr7 (1-150)||(13758538-13758688)
chr7 (19-152)||(48622623-48622756)
chr7 (1-150)||(15927736-15927886)
chr7 (1-150)||(7822896-7823046)
chr7 (1-150)||(7830207-7830357)
chr7 (1-150)||(27101575-27101725)
chr7 (1-150)||(27108923-27109073)
chr7 (1-150)||(27176601-27176751)
chr7 (1-150)||(38783667-38783817)
chr7 (19-150)||(14250855-14250986)
chr7 (66-186)||(11516358-11516478)
chr7 (66-186)||(15441576-15441696)
chr7 (66-186)||(30262141-30262261)
chr7 (1-63)||(15862174-15862237)
chr7 (17-84)||(16418731-16418798)
chr7 (17-84)||(10000325-10000392)
chr7 (66-175)||(295978-296087)
chr7 (70-154)||(28722272-28722357)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (1-318)||(36093-36410)
scaffold0023 (66-318)||(48598-48849)
scaffold0023 (1-105)||(169847-169951)
scaffold0023 (1-150)||(153945-154095)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (19-318)||(55316219-55316518)
chr3 (19-318)||(41270075-41270374)
chr3 (14-318)||(16821139-16821443)
chr3 (19-318)||(15936592-15936890)
chr3 (1-314)||(15614838-15615148)
chr3 (19-315)||(15938434-15938729)
chr3 (66-318)||(14842573-14842824)
chr3 (66-319)||(51158030-51158282)
chr3 (66-318)||(15859036-15859287)
chr3 (66-318)||(13975734-13975985)
chr3 (66-318)||(45860805-45861056)
chr3 (66-318)||(12030159-12030410)
chr3 (66-318)||(13954902-13955153)
chr3 (66-318)||(2049810-2050061)
chr3 (66-307)||(13838905-13839145)
chr3 (66-318)||(17912495-17912744)
chr3 (1-150)||(12264730-12264880)
chr3 (1-150)||(49232604-49232754)
chr3 (2-150)||(12902029-12902178)
chr3 (19-150)||(25058907-25059038)
chr3 (1-150)||(18911161-18911311)
chr3 (1-150)||(22275377-22275527)
chr3 (2-150)||(54651625-54651774)
chr3 (1-150)||(15468278-15468428)
chr3 (1-117)||(18896982-18897099)
chr3 (1-150)||(1467677-1467827)
chr3 (2-150)||(5228481-5228629)
chr3 (1-117)||(12812042-12812159)
chr3 (69-318)||(16744130-16744377)
chr3 (66-186)||(2449250-2449370)
chr3 (27-150)||(44229153-44229277)
chr3 (69-150)||(11986181-11986262)
chr3 (277-318)||(15468555-15468596)
chr3 (70-154)||(41661727-41661812)
chr3 (205-318)||(47984650-47984763)
chr3 (205-318)||(47993937-47994050)
chr3 (205-318)||(48003224-48003337)
chr3 (205-318)||(48012510-48012623)
chr3 (277-318)||(22275209-22275250)
chr3 (70-154)||(31412333-31412418)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (1-318)||(30120722-30121040)
chr8 (19-318)||(16674345-16674644)
chr8 (19-318)||(21844525-21844824)
chr8 (19-318)||(21851918-21852217)
chr8 (128-318)||(222753-222943)
chr8 (128-318)||(736376-736566)
chr8 (128-318)||(860271-860461)
chr8 (1-314)||(6774195-6774505)
chr8 (1-314)||(24548986-24549296)
chr8 (60-318)||(43373474-43373731)
chr8 (66-319)||(16193728-16193980)
chr8 (66-307)||(24928803-24929043)
chr8 (66-318)||(16404987-16405235)
chr8 (70-307)||(17345581-17345816)
chr8 (1-150)||(22006196-22006346)
chr8 (1-150)||(13720866-13721016)
chr8 (1-150)||(16195399-16195549)
chr8 (66-318)||(22907226-22907476)
chr8 (1-150)||(16872989-16873139)
chr8 (1-150)||(13662203-13662353)
chr8 (1-150)||(271298-271448)
chr8 (1-150)||(644472-644622)
chr8 (1-150)||(830207-830357)
chr8 (1-91)||(15319097-15319188)
chr8 (1-91)||(15499466-15499557)
chr8 (128-190)||(691908-691970)
chr8 (2-150)||(22088733-22088882)
chr8 (66-186)||(5238218-5238338)
chr8 (66-186)||(24661260-24661380)
chr8 (66-186)||(43685677-43685797)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (19-318)||(18601071-18601370)
chr1 (19-318)||(5072341-5072640)
chr1 (1-318)||(22227809-22228126)
chr1 (1-318)||(22232506-22232823)
chr1 (1-314)||(2116258-2116569)
chr1 (1-252)||(45051489-45051737)
chr1 (66-318)||(20931345-20931596)
chr1 (66-318)||(20913037-20913281)
chr1 (66-318)||(20893638-20893889)
chr1 (66-318)||(20445679-20445930)
chr1 (66-318)||(41394222-41394473)
chr1 (66-318)||(20531444-20531695)
chr1 (66-318)||(37844462-37844714)
chr1 (1-150)||(46523557-46523706)
chr1 (1-150)||(18059696-18059846)
chr1 (1-150)||(17148735-17148885)
chr1 (1-150)||(17004806-17004956)
chr1 (1-88)||(19962437-19962525)
chr1 (1-150)||(38055029-38055179)
chr1 (17-84)||(22035681-22035748)
chr1 (66-186)||(51452623-51452743)
chr1 (17-84)||(7640889-7640956)
chr1 (274-314)||(45051446-45051486)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-318)||(31610-31928)
scaffold0008 (66-318)||(128181-128431)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (14-318)||(42997-43302)
scaffold0076 (1-150)||(39271-39421)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-318)||(21051-21367)
scaffold0139 (1-318)||(13997-14312)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (14-318)||(35-338)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (19-318)||(64476-64780)
scaffold0026 (19-318)||(107747-108045)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (1-318)||(3722-4040)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-318)||(5150-5466)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (14-314)||(9297-9596)
scaffold0215 (14-314)||(16195-16494)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (19-212)||(1257-1450)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-314)||(2966-3279)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (66-294)||(5552-5780)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (66-316)||(3594-3843)
scaffold0266 (66-318)||(1124-1375)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (66-318)||(12115-12364)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (66-318)||(6076-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (66-318)||(968-1218)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (66-318)||(48187-48438)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-222)||(13262-13480)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (66-318)||(8878-9129)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (66-318)||(19206-19457)
scaffold0195 (66-318)||(21290-21541)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (85-318)||(148721-148953)
scaffold0025 (66-318)||(8849-9100)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (66-318)||(123176-123427)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (69-318)||(36928-37176)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (66-318)||(5073-5324)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (66-307)||(247454-247694)
scaffold0012 (2-150)||(34097-34246)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (66-318)||(26427-26678)
scaffold0162 (66-201)||(8192-8327)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (66-307)||(171916-172156)
scaffold0001 (66-307)||(177619-177859)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (66-314)||(41733-41980)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (66-318)||(546-797)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (66-318)||(34472-34724)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (85-312)||(272031-272257)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (212-318)||(9-115)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (69-318)||(41648-41896)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (212-318)||(48514-48620)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (3-150)||(10279-10427)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-150)||(1513-1663)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (19-152)||(3579-3712)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (19-152)||(54040-54173)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (1-150)||(2560-2711)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (66-318)||(13506-13757)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (1-150)||(1452-1602)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (66-200)||(51194-51328)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (66-318)||(37078-37328)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-92)||(29388-29480)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (1-92)||(10686-10778)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (1-150)||(31477-31627)
scaffold0107 (29-150)||(39814-39935)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (2-150)||(45198-45348)
scaffold0066 (2-150)||(54584-54734)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (66-200)||(89466-89600)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (221-318)||(9382-9479)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (19-115)||(7413-7509)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (60-147)||(3360-3447)
scaffold0361 (262-316)||(3210-3264)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (17-84)||(6831-6898)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (17-84)||(7443-7510)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (66-186)||(22671-22791)
scaffold0141 (66-186)||(26926-27046)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (66-186)||(1594-1714)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (17-82)||(23704-23769)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (27-84)||(12091-12149)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (69-150)||(56114-56195)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (67-150)||(1-84)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (70-152)||(8174-8257)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (2-55)||(13289-13342)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (70-154)||(14198-14283)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (70-154)||(108171-108256)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 19886596 - 19886913
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886596 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 19886695  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886696 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 19886795  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886796 tctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 19886895  T
Q  301 attcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19886896 attcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 17396665 - 17396916
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| | |||| |    
T  17396665 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaat 17396763  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17396764 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 17396863  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17396864 tattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 66 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 462989 - 462743
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  462989 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 462890  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  462889 gataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 462791  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 313  Q
    | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  462790 tgtcgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 69 - 318
Target Start/End: Original strand, 19794719 - 19794967
Alignment:
Q  69 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgat 168  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||    
T  19794719 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgat 19794818  T
Q  169 aagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 268  Q
    ||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| |    
T  19794819 aagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgt 19794917  T
Q  269 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794918 tatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8891493 - 8891242
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | || |    
T  8891493 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaat 8891394  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||    
T  8891393 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattga 8891295  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8891294 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 36982453 - 36982704
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  36982453 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 36982552  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | | ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  36982553 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattga 36982651  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982652 tgttgttgttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 7507856 - 7508107
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  7507856 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 7507955  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttg 264  Q
     |||||||||||| |||||| | || ||||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||   |||||||||    
T  7507956 aataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-ggctaagttgttgttaa-ttgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 7508053  T
Q  265 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    || || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508054 atgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 318
Target Start/End: Original strand, 20627328 - 20627576
Alignment:
Q  69 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgat 168  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||    
T  20627328 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgat 20627427  T
Q  169 aagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 268  Q
    || || |||| |||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||| | |    
T  20627428 aacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgt 20627526  T
Q  269 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20627527 tgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 318
Target Start/End: Original strand, 43642989 - 43643220
Alignment:
Q  86 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 185  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||||| |||| ||||||    
T  43642989 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtg 43643088  T
Q  186 ctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 285  Q
    || || |||||||||| | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |     
T  43643089 ctcaattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcac 43643187  T
Q  286 tgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43643188 tgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 318
Target Start/End: Original strand, 24341420 - 24341652
Alignment:
Q  85 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgt 184  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||  ||||| |||| |||||    
T  24341420 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgt 24341519  T
Q  185 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 284  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||    ||||||||| |    
T  24341520 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgttgatgaatca 24341618  T
Q  285 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24341619 ttgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 23777984 - 23778133
Alignment:
Q  2 atcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  23777984 atcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 23778083  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
     |||||||||||||||| |  | ||||  |||| | ||||||||||||||    
T  23778084 ttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtt 23778133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8944164 - 8944014
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  8944164 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctatttt 8944065  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8944064 cttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtt 8944014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12728710 - 12728560
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  12728710 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 12728611  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12728610 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12728560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 34824793 - 34824643
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  34824793 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 34824694  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  34824693 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 34824643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 25265402 - 25265653
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  25265402 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 25265501  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |  ||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | |  ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| ||||    
T  25265502 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattga 25265600  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  || |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25265601 tgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 3798541 - 3798691
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  3798541 tatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttatttt 3798640  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  3798641 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 3798691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 12635806 - 12635956
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  12635806 tatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgttgtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctatttt 12635905  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12635906 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12635956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 12641580 - 12641730
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  12641580 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttatttt 12641679  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| | ||||||||||||||    
T  12641680 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtt 12641730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16935911 - 16935761
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  16935911 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctatttt 16935812  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  |||||||||||||||    
T  16935811 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtt 16935761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 17006571 - 17006421
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  17006571 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctatttt 17006472  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  |||||||||||||||    
T  17006471 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtt 17006421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 42177907 - 42178057
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||    
T  42177907 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctatttt 42178006  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  42178007 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtt 42178057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 11231276 - 11231426
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  11231276 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 11231375  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  11231376 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 11231426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 22513123 - 22513273
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22513123 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 22513222  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22513223 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 22513273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 24685719 - 24685869
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  24685719 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 24685818  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  24685819 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 24685869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 28775745 - 28775895
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  28775745 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 28775844  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  28775845 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 28775895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Original strand, 19689413 - 19689533
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  19689413 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 19689512  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  19689513 gaaaagttatgaaaattgtgc 19689533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23820322 - 23820202
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  23820322 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 23820223  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  23820222 gaaaagttatgaaaattgtgc 23820202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 5888585 - 5888652
Alignment:
Q  17 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 84  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5888585 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 5888652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 21142187 - 21142098
Alignment:
Q  27 tttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  21142187 tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 21142098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Original strand, 14906452 - 14906572
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  14906452 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 14906551  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  14906552 gaaaagttatgaaaattgtgc 14906572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 23774437 - 23774370
Alignment:
Q  17 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 84  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23774437 aattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 23774370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20015262 - 20015142
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  20015262 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 20015163  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  20015162 gaaaagttatgaaaattgtgc 20015142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 310; Significance: 1e-175; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12691 - 12374
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12691 tatcataatcatgtgtaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 12592  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12591 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 12492  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12491 tctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 12392  T
Q  301 attcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12391 attcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25426945 - 25426628
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426945 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 25426846  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426845 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 25426746  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426745 tctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 25426646  T
Q  301 attcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25426645 attcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 18777927 - 18778244
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18777927 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 18778026  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18778027 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatt 18778126  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778127 tctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 18778226  T
Q  301 attcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18778227 attcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19500216 - 19499899
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500216 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 19500117  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500116 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 19500017  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19500016 tctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgattaataattgctttggtatgcat 19499917  T
Q  301 attcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19499916 attcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 22366416 - 22366733
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366416 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 22366515  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22366516 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatt 22366615  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366616 tctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 22366715  T
Q  301 attcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22366716 attcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 21073530 - 21073847
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073530 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 21073629  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073630 gtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 21073729  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073730 tcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 21073829  T
Q  301 attcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21073830 attcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 43443332 - 43443647
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443332 tatcataatcatgtgtaatt--gcatattctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 43443429  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  43443430 gtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatt 43443529  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43443530 tcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcat 43443629  T
Q  301 attcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43443630 attcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 4199920 - 4200237
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4199920 tatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgttt 4200019  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  4200020 gtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaatt 4200119  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    |||| || ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4200120 tctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattgcttgggtttgcat 4200219  T
Q  301 attcatggattgatgatg 318  Q
    |||||||| |||||||||    
T  4200220 attcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27010140 - 27009841
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27010140 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatga 27010041  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 218  Q
    |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27010040 tgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgtta 27009941  T
Q  219 atttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27009940 atttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Original strand, 29188232 - 29188483
Alignment:
Q  14 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29188232 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 29188331  T
Q  114 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgt 213  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || ||||| || |||||||||| | ||||||| |    
T  29188332 gatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttat 29188430  T
Q  214 tgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgat 266  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  29188431 tgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 29188483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23507216 - 23506965
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  23507216 tgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 23507117  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  23507116 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 23507018  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23507017 tgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 27182559 - 27182810
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | || |    
T  27182559 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaat 27182658  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  27182659 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 27182757  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27182758 tgttgtggttgatgaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 22053845 - 22054096
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  22053845 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 22053944  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |  ||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  22053945 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattga 22054043  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054044 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 18531079 - 18531330
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  18531079 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 18531178  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |  ||||| |||| |||||| | || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  18531179 gtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattga 18531277  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18531278 tgttgttgttgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34939528 - 34939289
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |    
T  34939528 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 34939429  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |  |||||||||| |||||||| || || || |||| | ||||||  |||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||| ||||    
T  34939428 gtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttattgctgttaattga 34939331  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 307  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34939330 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 11212003 - 11212153
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  11212003 tatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 11212102  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  11212103 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 11212153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7425642 - 7425492
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7425642 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttt 7425543  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||||||||| |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  7425542 cttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 7425492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 10777908 - 10778058
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  10777908 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 10778007  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10778008 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10778058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 35791036 - 35791186
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35791036 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttt 35791135  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  |||||||||||||||    
T  35791136 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtt 35791186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23514878 - 23514729
Alignment:
Q  2 atcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  23514878 atcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 23514779  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
     | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  23514778 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 23514729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 1219458 - 1219608
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  1219458 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 1219557  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||||| |||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  1219558 cttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1219608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 17471526 - 17471676
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17471526 tatcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 17471625  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17471626 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 21932319 - 21932469
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21932319 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 21932418  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  21932419 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 21932469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 21938489 - 21938639
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21938489 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 21938588  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  21938589 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 21938639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35582354 - 35582204
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  35582354 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 35582255  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  35582254 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 35582204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 22883022 - 22883139
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  22883022 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttgctgtgatgctatttt 22883121  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatg 117  Q
      | ||| ||||||||||    
T  22883122 cttgtgcttgaattgatg 22883139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 36989708 - 36989858
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  36989708 tatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgctatttt 36989807  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  36989808 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 36989858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20623220 - 20623100
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  20623220 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 20623121  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  20623120 gaaaagttatgaaaattgtgc 20623100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Original strand, 21233540 - 21233660
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  21233540 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 21233639  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  21233640 gaaaagttatgaaaattgtgc 21233660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Original strand, 25900418 - 25900538
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   |||||  ||| |    
T  25900418 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaaaat 25900517  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  25900518 gaaaagttatgaaaattgtgc 25900538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 23328858 - 23328791
Alignment:
Q  17 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 84  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23328858 aattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 23328791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 24616462 - 24616395
Alignment:
Q  17 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 84  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24616462 aattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 24616395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 24712838 - 24712771
Alignment:
Q  17 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 84  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24712838 aattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 24712771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 24745856 - 24745789
Alignment:
Q  17 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 84  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24745856 aattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 24745789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16536448 - 16536328
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  16536448 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 16536349  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  16536348 gaaaagttatgaaaattgtgc 16536328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37052995 - 37052911
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  37052995 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 37052911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 32950943 - 32950862
Alignment:
Q  69 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || || || |||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  32950943 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 314
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  274 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 318
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471844
Alignment:
Q  277 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatg 17471844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 26559815 - 26559900
Alignment:
Q  70 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  26559815 aaattcgtgctcttgctatgattatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 26559900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 27653918 - 27654235
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27653918 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgctt 27654017  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27654018 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatt 27654117  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654118 tctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 27654217  T
Q  301 attcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  27654218 attcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25175878 - 25175563
Alignment:
Q  4 cataatcatgtgtaattttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgt 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25175878 cataatcatgtataattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgt 25175779  T
Q  103 atgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25175778 atgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttc 25175679  T
Q  203 tcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175678 tcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 25175579  T
Q  303 tcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||    
T  25175578 tcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 16825687 - 16826006
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825687 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 16825786  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16825787 gtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgga 16825886  T
Q  199 tttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgc 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  16825887 tttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatctgatattatgattgatgaataattgctttgttatgc 16825986  T
Q  299 atattcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16825987 atattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 1650042 - 1650352
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1650042 tatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgttt 1650139  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  1650140 gtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 1650239  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    | | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  1650240 t-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcat 1650338  T
Q  301 attcatggattgat 314  Q
    ||||||| ||||||    
T  1650339 attcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 314
Target Start/End: Original strand, 14626130 - 14626377
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  14626130 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 14626229  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    ||||||||||||| ||||||   || ||||||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  14626230 gataagttatgaaaattgtgtgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 14626328  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 314  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626329 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23153696 - 23153458
Alignment:
Q  68 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtga 167  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |||    
T  23153696 ctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatga 23153597  T
Q  168 taagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgata 267  Q
    |||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||     
T  23153596 taagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatg 23153498  T
Q  268 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 307  Q
    || || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23153497 ttgtggttgatgaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 307
Target Start/End: Original strand, 1657760 - 1657999
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |    
T  1657760 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 1657859  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |  |||||||||| |||||||| || || || |||| | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||| ||||    
T  1657860 gtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttattgttgttaattga 1657957  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 307  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1657958 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 35009451 - 35009702
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  35009451 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 35009550  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |  ||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | |  ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| ||||    
T  35009551 gtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattga 35009649  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35009650 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15862720 - 15862484
Alignment:
Q  68 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtga 167  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| | || ||     
T  15862720 ctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgt 15862621  T
Q  168 taagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgata 267  Q
     |||||||||| |||||||| || || || |||| | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| | | |||||||   || || |||||     
T  15862620 gaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttc-atttatgttattgctgataattgatg 15862524  T
Q  268 ttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 307  Q
    || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15862523 ttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16232210 - 16232060
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16232210 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 16232111  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16232110 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16232060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 1556322 - 1556173
Alignment:
Q  2 atcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  1556322 atcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 1556223  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
     | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  1556222 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1556173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29666191 - 29665941
Alignment:
Q  2 atcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  29666191 atcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttatttt 29666092  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt-cata-tatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 197  Q
      |||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| || | |||||| || ||  |||||||||| ||||| || || ||||||    
T  29666091 cttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaa-attgtactcaattggtga 29665993  T
Q  198 atttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgtt 250  Q
    |||| | ||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  29665992 attt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 150
Target Start/End: Original strand, 18086780 - 18086911
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||     
T  18086780 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 18086879  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
    |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18086880 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18086911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19610336 - 19610186
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19610336 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 19610237  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||||||||| |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19610236 cttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 19610186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23978087 - 23977937
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  23978087 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttatttt 23977988  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  23977987 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 23977937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 22251504 - 22251621
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22251504 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 22251603  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatg 117  Q
      | ||||||||||||||    
T  22251604 cttgtgcatgaattgatg 22251621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 22225676 - 22225826
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  22225676 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctttctgtgatgctatttt 22225775  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22225776 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 22225826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Original strand, 13620734 - 13620882
Alignment:
Q  3 tcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttg 101  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||      
T  13620734 tcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttct 13620833  T
Q  102 tatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
    | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  13620834 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtt 13620882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10489017 - 10488867
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  10489017 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 10488918  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  10488917 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 10488867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 16376311 - 16376461
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16376311 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 16376410  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16376411 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16376461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 16383635 - 16383785
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16383635 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 16383734  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16383735 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16383785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 16556077 - 16556227
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  16556077 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctatttt 16556176  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16556177 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16556227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 16632633 - 16632783
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  16632633 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctatttt 16632732  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16632733 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16632783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 19299555 - 19299467
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgt 88  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  19299555 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgt 19299467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 29869731 - 29869798
Alignment:
Q  17 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 84  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29869731 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 29869798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 27751675 - 27751603
Alignment:
Q  67 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 139  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751675 gctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19854402 - 19854317
Alignment:
Q  70 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 154  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  19854402 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 19854317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 29605672 - 29605612
Alignment:
Q  94 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 154  Q
    |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605672 tatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 14 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 47357958 - 47357654
Alignment:
Q  14 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47357958 tgtaattttgcatttcctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggatt 47357859  T
Q  114 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47357858 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 47357759  T
Q  214 tgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  47357758 tgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattga 47357659  T
Q  314 tgatg 318  Q
    |||||    
T  47357658 tgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10644523 - 10644219
Alignment:
Q  14 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644523 tgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 10644424  T
Q  114 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgt 213  Q
    |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10644423 gatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 10644324  T
Q  214 tgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 313  Q
    |||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10644323 tgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattga 10644224  T
Q  314 tgatg 318  Q
    |||||    
T  10644223 tgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 310
Target Start/End: Original strand, 13048261 - 13048477
Alignment:
Q  94 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtg 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  13048261 tatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattg 13048360  T
Q  194 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 293  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13048361 atgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttattagataatatgattaatgaataattgcttggg 13048460  T
Q  294 tatgcatattcatggat 310  Q
    | |||||||||||||||    
T  13048461 tttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 54118256 - 54118507
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  54118256 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaatt 54118355  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  54118356 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattga 54118454  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54118455 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13246662 - 13246430
Alignment:
Q  85 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgt 184  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| |||||    
T  13246662 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 13246563  T
Q  185 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 284  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  13246562 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 13246464  T
Q  285 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13246463 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 15675101 - 15675352
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  15675101 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 15675200  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |  ||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  15675201 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattga 15675299  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15675300 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31115861 - 31115629
Alignment:
Q  85 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgt 184  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||  ||||| |||| ||| |    
T  31115861 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattat 31115762  T
Q  185 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 284  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |    
T  31115761 gctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatca 31115663  T
Q  285 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31115662 ttgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 250
Target Start/End: Original strand, 10104262 - 10104445
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  10104262 tgctaaatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 10104361  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgtt 250  Q
    |  ||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  10104362 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18169288 - 18169138
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18169288 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 18169189  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18169188 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18169138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19020803 - 19020654
Alignment:
Q  2 atcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  19020803 atcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 19020704  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
     | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19020703 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 19020654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26680451 - 26680201
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||| |    
T  26680451 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 26680352  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  26680351 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 26680254  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680253 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 122140 - 121989
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  122140 tgctaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 122041  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 218  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  122040 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 7132003 - 7132153
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  7132003 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctatttt 7132102  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  7132103 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 7132153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 15287183 - 15287333
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15287183 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 15287282  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||||||||| |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15287283 cttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15287333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 15294292 - 15294442
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15294292 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 15294391  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||||||||| |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15294392 cttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15294442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 17145595 - 17145745
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  17145595 tatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttactgtgatgctatttt 17145694  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | | |||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17145695 cttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17145745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20001041 - 20000891
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  20001041 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttatttt 20000942  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  20000941 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtt 20000891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 8378469 - 8378377
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttg-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 92  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8378469 tatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 8378377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 18248517 - 18248421
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  18248517 ttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 18248421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22738568 - 22738437
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||     
T  22738568 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 22738469  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
    |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22738468 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22738437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 111492 - 111395
Alignment:
Q  221 ttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111492 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10488813 - 10488693
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  10488813 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 10488714  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  10488713 gaaaagttatgaaaattgtgc 10488693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Original strand, 16327938 - 16328058
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  16327938 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 16328037  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  16328038 gaaaagttatgaaaattgtgc 16328058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 22352019 - 22352086
Alignment:
Q  17 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 84  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  22352019 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttg 22352086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 26339320 - 26339253
Alignment:
Q  17 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 84  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26339320 aattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 26339253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 250
Target Start/End: Original strand, 40885585 - 40885749
Alignment:
Q  85 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaagtgataagttatgaagattg 183  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||  |||||||||| |||     
T  40885585 ctgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaa-atta 40885683  T
Q  184 tgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgtt 250  Q
    |||| || ||||||| || | ||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  40885684 tgctcaattggtgaactt-tgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 33240951 - 33240900
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 117  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33240951 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 318
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  274 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 18238157 - 18238242
Alignment:
Q  70 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatga-attgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 154  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| |||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  18238157 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 18238242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10989726 - 10989410
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989726 tatcataatcatgtataattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 10989627  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  10989626 gtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatt 10989527  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10989526 tctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcat 10989428  T
Q  301 attcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10989427 attcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2437774 - 2437457
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2437774 tatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgttt 2437675  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  2437674 gtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgttcaattggtgaatt 2437575  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    | |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2437574 tttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgagtttgcat 2437475  T
Q  301 attcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2437474 attcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 13910959 - 13911277
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13910959 tatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgttt 13911058  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||    
T  13911059 gtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattggtgaatt 13911158  T
Q  201 tctcct-aagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgca 299  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13911159 tctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatttcttgggtttgca 13911258  T
Q  300 tattcatggattgatgatg 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13911259 tattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13572975 - 13572676
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13572975 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatga 13572876  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 218  Q
    |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13572875 tgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgtta 13572776  T
Q  219 atttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13572775 atttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Original strand, 18253800 - 18254098
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18253800 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatga 18253899  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 218  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  18253900 taattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 18253998  T
Q  219 atttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18253999 atttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 318
Target Start/End: Original strand, 16478912 - 16479213
Alignment:
Q  16 taattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16478912 taattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattga 16479011  T
Q  116 tgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttg 215  Q
    || || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |  |||||| ||     
T  16479012 tgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttattt 16479110  T
Q  216 ttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 315  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479111 ttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatg 16479210  T
Q  316 atg 318  Q
    |||    
T  16479211 atg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 47481043 - 47481294
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  47481043 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 47481142  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||| | || |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||   | ||| ||||    
T  47481143 gataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcgctcttaattga 47481241  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47481242 tgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 312
Target Start/End: Original strand, 25292350 - 25292595
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||      
T  25292350 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaag 25292449  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||| |||||| |||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25292450 gataagctatgaatattgtgctcaattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25292548  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 312  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25292549 tattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 13037026 - 13037277
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | | || |    
T  13037026 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaat 13037125  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||    
T  13037126 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattga 13037224  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13037225 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 313
Target Start/End: Original strand, 11580751 - 11580997
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  11580751 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 11580850  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  11580851 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 11580949  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 313  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11580950 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16212017 - 16211768
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |    
T  16212017 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaat 16211918  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||    
T  16211917 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattga 16211819  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 316  Q
    | || || ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16211818 tgttgtggttgatgattcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3060217 - 3059966
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  3060217 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 3060118  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    ||||| || |||| ||| |||| || |||||||||| |  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  3060117 gataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattga 3060019  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3060018 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36052896 - 36052667
Alignment:
Q  85 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgt 184  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||    
T  36052896 ctgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 36052797  T
Q  185 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 284  Q
    ||| || |||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  36052796 gctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgatgaataa 36052701  T
Q  285 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36052700 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13321267 - 13321014
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaa 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||| | ||    
T  13321267 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 13321168  T
Q  164 gtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttg-ttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 262  Q
     ||  |||||||||| |||||||| || |||||||||| | |||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||   ||||| |    
T  13321167 atgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaat 13321070  T
Q  263 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    |||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13321069 tgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 15950729 - 15950879
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15950729 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 15950828  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15950829 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15950879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 18979959 - 18980109
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18979959 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 18980058  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18980059 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18980109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7293267 - 7293017
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  7293267 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 7293168  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  7293167 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 7293070  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7293069 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 15760053 - 15760202
Alignment:
Q  2 atcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  15760053 atcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 15760152  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
     | |||||||||||||| |  |  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  15760153 ttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15760202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 13758688 - 13758538
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  13758688 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttatttt 13758589  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  13758588 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 13758538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Original strand, 48622623 - 48622756
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||     
T  48622623 ttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatga 48622722  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 152  Q
    |  | ||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  48622723 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttca 48622756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15927886 - 15927736
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  15927886 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctatttt 15927787  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15927786 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtt 15927736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7823046 - 7822896
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7823046 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 7822947  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  7822946 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 7822896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7830357 - 7830207
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7830357 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 7830258  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  7830257 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 7830207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 27101575 - 27101725
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27101575 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 27101674  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27101675 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27101725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 27108923 - 27109073
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27108923 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 27109022  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27109023 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27109073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27176751 - 27176601
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27176751 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 27176652  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27176651 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27176601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 38783667 - 38783817
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  38783667 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 38783766  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  38783767 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 38783817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 150
Target Start/End: Original strand, 14250855 - 14250986
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||| ||| ||| ||  | ||||||||||||||     
T  14250855 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatga 14250954  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
    |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  14250955 ttatggtatgtttttgggtgaaattacatgtt 14250986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11516478 - 11516358
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  11516478 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 11516379  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  11516378 gaaaagttatgaaaattgtgc 11516358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Original strand, 15441576 - 15441696
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  15441576 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 15441675  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  15441676 gaaaagttatgaaaattgtgc 15441696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Original strand, 30262141 - 30262261
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  30262141 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 30262240  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  30262241 gaaaagttatgaaaattgtgc 30262261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15862237 - 15862174
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 63  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862237 tatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 16418798 - 16418731
Alignment:
Q  17 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 84  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16418798 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 16418731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 10000325 - 10000392
Alignment:
Q  17 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 84  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  10000325 aattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgctcttg 10000392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 175
Target Start/End: Original strand, 295978 - 296087
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||| |||   || | |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||| |||| |    
T  295978 tgctaaattcgtgttctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaat 296077  T
Q  166 gataagttat 175  Q
    || |||||||    
T  296078 gagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28722357 - 28722272
Alignment:
Q  70 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 154  Q
    ||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||||||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  28722357 aaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 28722272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36410 - 36093
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36410 tatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtagtgatgttatgttt 36311  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36310 gtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatt 36211  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36210 tctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattgcttgggtttgcat 36111  T
Q  301 attcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36110 attcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48849 - 48598
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |    
T  48849 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaat 48750  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||    
T  48749 gataagttgtgaaaattgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattga 48651  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48650 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 169847 - 169951
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169847 tatcataatcatgtataattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 169946  T
Q  101 gtatg 105  Q
    |||||    
T  169947 gtatg 169951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 153945 - 154095
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  153945 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 154044  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||||| |||||||||    
T  154045 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtt 154095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 55316518 - 55316219
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316518 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 55316419  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  55316418 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgtta 55316319  T
Q  219 atttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55316318 agttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41270374 - 41270075
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270374 ttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 41270275  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 218  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  41270274 tagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgtta 41270175  T
Q  219 atttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41270174 agttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16821443 - 16821139
Alignment:
Q  14 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16821443 tgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaatt 16821344  T
Q  114 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgt 213  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16821343 gatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgt 16821244  T
Q  214 tgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 313  Q
    |||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16821243 tgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattaa 16821144  T
Q  314 tgatg 318  Q
    |||||    
T  16821143 tgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Original strand, 15936592 - 15936890
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  15936592 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatga 15936691  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 218  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||    
T  15936692 taattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgtta 15936790  T
Q  219 atttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15936791 atttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15615148 - 15614838
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||    
T  15615148 tatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgctcttactgtggtgttatattt 15615051  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || ||||| || |||||||||    
T  15615050 gtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatggtgctcaattggtgaatt 15614951  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    | | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15614950 t-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcat 15614852  T
Q  301 attcatggattgat 314  Q
    ||||||| ||||||    
T  15614851 attcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Original strand, 15938434 - 15938729
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||   |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||     
T  15938434 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatga 15938533  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 218  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||    
T  15938534 taattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgtta 15938632  T
Q  219 atttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 315  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15938633 atttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 14842573 - 14842824
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |||| |    
T  14842573 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaat 14842672  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  14842673 gataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattga 14842771  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842772 tgttatgattgatgaataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 66 - 319
Target Start/End: Original strand, 51158030 - 51158282
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  51158030 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 51158129  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  51158130 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 51158228  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 319  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51158229 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 15859036 - 15859287
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || |    
T  15859036 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaat 15859135  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  15859136 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 15859234  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15859235 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 13975734 - 13975985
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | |||| |    
T  13975734 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 13975832  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13975833 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 13975932  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13975933 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45861056 - 45860805
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | |||| |    
T  45861056 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 45860958  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45860957 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 45860858  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45860857 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 12030159 - 12030410
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12030159 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagt 12030258  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| ||||  ||||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  12030259 gataagttgtgaaagttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattga 12030357  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12030358 tgttatggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 13954902 - 13955153
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | |||| |    
T  13954902 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 13955000  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    ||| ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13955001 gatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 13955100  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13955101 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2050061 - 2049810
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |    
T  2050061 tgctaaattcgtgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacat 2049962  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    ||||| || |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  2049961 gataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattga 2049863  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2049862 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13839145 - 13838905
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  13839145 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 13839046  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  13839045 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 13838947  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 307  Q
    | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13838946 tgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 17912495 - 17912744
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |    
T  17912495 tgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 17912593  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    || |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    || ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||  ||||||||   ||||| ||||    
T  17912594 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttga--tatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaattga 17912691  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17912692 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 12264730 - 12264880
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  12264730 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 12264829  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12264830 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12264880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 49232754 - 49232604
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  49232754 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 49232655  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  49232654 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 49232604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 12902029 - 12902178
Alignment:
Q  2 atcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  12902029 atcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttc 12902128  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
     | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12902129 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12902178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25059038 - 25058907
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||     
T  25059038 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 25058939  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
    |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25058938 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 25058907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18911311 - 18911161
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  18911311 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctatttt 18911212  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18911211 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18911161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22275527 - 22275377
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  22275527 tatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgccatttt 22275428  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22275427 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22275377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 54651774 - 54651625
Alignment:
Q  2 atcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  54651774 atcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 54651675  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
     | |||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  54651674 ttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgtt 54651625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 15468278 - 15468428
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  15468278 tatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctatttt 15468377  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15468378 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15468428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 18896982 - 18897099
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaa-ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18896982 tatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 18897081  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatg 117  Q
      | ||||||||||||||    
T  18897082 cttgtgcatgaattgatg 18897099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 1467677 - 1467827
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  1467677 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 1467776  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  1467777 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 1467827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 5228629 - 5228481
Alignment:
Q  2 atcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  5228629 atcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtgttatgaaaatgggttgatgaac-attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttcc 5228531  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
     | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  5228530 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 5228481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12812159 - 12812042
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  12812159 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctatttt 12812060  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatg 117  Q
      | ||| ||||||||||    
T  12812059 cttgtgcttgaattgatg 12812042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 318
Target Start/End: Original strand, 16744130 - 16744377
Alignment:
Q  69 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgat 168  Q
    |||||||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||| |||     
T  16744130 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaa 16744229  T
Q  169 aagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 268  Q
    |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||| | ||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |  ||| || |  || |    
T  16744230 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgt 16744327  T
Q  269 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | |  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16744328 tgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Original strand, 2449250 - 2449370
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  2449250 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 2449349  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  2449350 gaaaagttatgaaaattgtgc 2449370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 44229277 - 44229153
Alignment:
Q  27 tttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgt 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||    
T  44229277 tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggt 44229178  T
Q  126 ataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
    ||  |||| | ||||||||||||||    
T  44229177 atgtttgtggatgaaattacatgtt 44229153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Original strand, 11986181 - 11986262
Alignment:
Q  69 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||| || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11986181 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 318
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468596
Alignment:
Q  277 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 41661812 - 41661727
Alignment:
Q  70 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcat-gaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  41661812 aaattcgtgctcttgctatgatgatatgtttgaatacatggaaatgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 41661727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984650
Alignment:
Q  205 ctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 304  Q
    |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  305 atggattgatgatg 318  Q
    ||| ||||||||||    
T  47984663 atgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993937
Alignment:
Q  205 ctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 304  Q
    |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  305 atggattgatgatg 318  Q
    ||| ||||||||||    
T  47993950 atgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003224
Alignment:
Q  205 ctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 304  Q
    |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  305 atggattgatgatg 318  Q
    ||| ||||||||||    
T  48003237 atgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012510
Alignment:
Q  205 ctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 304  Q
    |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  305 atggattgatgatg 318  Q
    ||| ||||||||||    
T  48012523 atgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275209
Alignment:
Q  277 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatg 22275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 31412333 - 31412418
Alignment:
Q  70 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 154  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  31412333 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 31412418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30121040 - 30120722
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30121040 tatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 30120941  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaat 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  30120940 tgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaat 30120841  T
Q  200 ttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30120840 ttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgca 30120741  T
Q  300 tattcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  30120740 tattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Original strand, 16674345 - 16674644
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16674345 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgt 16674444  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16674445 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgtta 16674544  T
Q  219 atttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16674545 agttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Original strand, 21844525 - 21844824
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21844525 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatga 21844624  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 218  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21844625 tgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgtta 21844724  T
Q  219 atttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21844725 atttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Original strand, 21851918 - 21852217
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21851918 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatga 21852017  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 218  Q
    |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21852018 tgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgtta 21852117  T
Q  219 atttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21852118 atttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 128 - 318
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222943
Alignment:
Q  128 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  228 atgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 128 - 318
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736566
Alignment:
Q  128 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  228 atgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 128 - 318
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860461
Alignment:
Q  128 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  228 atgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 6774195 - 6774505
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6774195 tatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgttt 6774292  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  6774293 gtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 6774392  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    | | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  6774393 t-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcat 6774491  T
Q  301 attcatggattgat 314  Q
    ||||||| ||||||    
T  6774492 attcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24549296 - 24548986
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24549296 tatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgttt 24549199  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || ||||| || |||||||||    
T  24549198 gtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaatt 24549099  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    | | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24549098 t-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcat 24549000  T
Q  301 attcatggattgat 314  Q
    ||||||| ||||||    
T  24548999 attcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 60 - 318
Target Start/End: Original strand, 43373474 - 43373731
Alignment:
Q  60 aattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgc 159  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43373474 aattaatgctaaattcgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 43373573  T
Q  160 aaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 259  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||    
T  43373574 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgtt 43373672  T
Q  260 atttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43373673 aattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 319
Target Start/End: Original strand, 16193728 - 16193980
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  16193728 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 16193827  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | | || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  16193828 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 16193926  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 319  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16193927 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 307
Target Start/End: Original strand, 24928803 - 24929043
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  24928803 tgctaaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 24928902  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||| |||   ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||    
T  24928903 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattga 24929001  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 307  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24929002 tgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 16404987 - 16405235
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  16404987 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 16405086  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    | |||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||   |||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  16405087 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattga 16405182  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16405183 tgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17345816 - 17345581
Alignment:
Q  70 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgata 169  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||  |    
T  17345816 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtga 17345717  T
Q  170 agttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 269  Q
    ||||||||| |||||||| || || || |||| | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||  |||| ||||   ||||| ||||| ||    
T  17345716 agttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatattattgttgttaattgatgtt 17345619  T
Q  270 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 307  Q
     |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17345618 gttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 22006196 - 22006346
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22006196 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 22006295  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22006296 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22006346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 13720866 - 13721016
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  13720866 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctatttt 13720965  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  13720966 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 13721016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16195549 - 16195399
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  16195549 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgtt 16195450  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16195449 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16195399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 22907226 - 22907476
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  22907226 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 22907325  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  22907326 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 22907423  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907424 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 16872989 - 16873139
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  16872989 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttatttt 16873088  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16873089 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16873139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 13662203 - 13662353
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  13662203 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 13662302  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||  ||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  13662303 cttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 13662353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 271298 - 271448
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  271298 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 271397  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  271398 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 271448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 644622 - 644472
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  644622 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 644523  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  644522 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 644472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 830357 - 830207
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  830357 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 830258  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  830257 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 830207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 15319097 - 15319188
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 91  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  15319097 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgat 15319188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 15499466 - 15499557
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 91  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  15499466 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgat 15499557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 190
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691970
Alignment:
Q  128 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 22088733 - 22088882
Alignment:
Q  2 atcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  22088733 atcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 22088832  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
     | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22088833 ttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtt 22088882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5238338 - 5238218
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  5238338 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 5238239  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  5238238 gaaaagttatgaaaattgtgc 5238218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Original strand, 24661260 - 24661380
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  24661260 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 24661359  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  24661360 gaaaagttatgaaaattgtgc 24661380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43685797 - 43685677
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  43685797 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 43685698  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  43685697 gaaaagttatgaaaattgtgc 43685677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Original strand, 18601071 - 18601370
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601071 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 18601170  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18601171 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgtta 18601270  T
Q  219 atttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601271 agttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Original strand, 5072341 - 5072640
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5072341 ttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgt 5072440  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5072441 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgtta 5072540  T
Q  219 atttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5072541 agttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22228126 - 22227809
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22228126 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttt 22228027  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaat 199  Q
      | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||   || || |||||    
T  22228026 cttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaat 22227927  T
Q  200 ttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgca 299  Q
    || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22227926 tt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgca 22227828  T
Q  300 tattcatggattgatgatg 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22227827 tattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22232823 - 22232506
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22232823 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttt 22232724  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaat 199  Q
      | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||   || || |||||    
T  22232723 cttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaat 22232624  T
Q  200 ttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgca 299  Q
    || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22232623 tt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgca 22232525  T
Q  300 tattcatggattgatgatg 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22232524 tattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2116569 - 2116258
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2116569 tatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgttt 2116472  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || ||||| || |||||||||    
T  2116471 gtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaatt 2116372  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttga-gttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgca 299  Q
    | | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2116371 t-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgca 2116273  T
Q  300 tattcatggattgat 314  Q
    |||||||| ||||||    
T  2116272 tattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 45051737 - 45051489
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  45051737 tatcataatcatgtg--attttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgttcttactgtgatgttacgttt 45051640  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  45051639 gtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 45051540  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttat 252  Q
    | | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051539 t-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20931596 - 20931345
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  20931596 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaat 20931497  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  20931496 gataagttatgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 20931398  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931397 tgttgtggttgatgaataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20913281 - 20913037
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  20913281 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaat 20913182  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | | |||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  20913181 gataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaatt-------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 20913090  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913089 tcttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 20893638 - 20893889
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | || |    
T  20893638 tgctaaattcttgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaat 20893737  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  20893738 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattga 20893836  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20893837 tgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20445930 - 20445679
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | || |    
T  20445930 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaat 20445831  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||  |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  20445830 gataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattga 20445732  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20445731 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41394473 - 41394222
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |    
T  41394473 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaat 41394374  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  41394373 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 41394275  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394274 tgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20531695 - 20531444
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||    ||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | || |    
T  20531695 tgctaaattcgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaat 20531596  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||  |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  20531595 gataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattga 20531497  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20531496 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 37844462 - 37844714
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | || |    
T  37844462 tgctaaattcatgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaat 37844561  T
Q  166 gataagtta-tgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 264  Q
    |||||  || |||| |||||||| || |  ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||    
T  37844562 gataaaatagtgaaaattgtgctcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattg 37844660  T
Q  265 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    || || || ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37844661 atgttgtggttgatgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 46523706 - 46523557
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||     
T  46523706 tatcataatcatgttccattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 46523607  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
     | ||||||||||||||||  |  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  46523606 ttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtt 46523557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 18059696 - 18059846
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18059696 tatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 18059795  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  18059796 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 18059846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 17148885 - 17148735
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  17148885 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttatttt 17148786  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17148785 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17148735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 17004956 - 17004806
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17004956 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 17004857  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  17004856 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 17004806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 19962437 - 19962525
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgt 88  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  19962437 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgt 19962525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 38055029 - 38055179
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  38055029 tatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgcttttactgtgatgttatttt 38055128  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  38055129 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 38055179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 22035748 - 22035681
Alignment:
Q  17 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 84  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22035748 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 22035681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 51452743 - 51452623
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  51452743 tgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 51452644  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  51452643 gaaaagttatgaaaattgtgc 51452623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 7640889 - 7640956
Alignment:
Q  17 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 84  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7640889 aattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 7640956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 45051486 - 45051446
Alignment:
Q  274 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 314  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45051486 ttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 45051446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 31610 - 31928
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31610 tatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtggtgatgttatgttt 31709  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||    
T  31710 gaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattggtgaatt 31809  T
Q  201 tctcct-aagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgca 299  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31810 tctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataattgcttgggtttgca 31909  T
Q  300 tattcatggattgatgatg 318  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  31910 tattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 128181 - 128431
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| || || ||| ||    
T  128181 tgctaaattcgtgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggt 128280  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    | |||||| |||| |||||||| || ||| |||||| |  || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  128281 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgttaatt-gagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatgga 128378  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  128379 tgttgtgattgatgaataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 43302 - 42997
Alignment:
Q  14 tgtaattttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43302 tgtaattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgggatgttatgtttctatgcatgaat 43203  T
Q  113 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttg 212  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43202 tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttg 43103  T
Q  213 ttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 312  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43102 ttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 43003  T
Q  313 atgatg 318  Q
    ||||||    
T  43002 atgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 39421 - 39271
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  39421 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 39322  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  39321 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 39271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 21051 - 21367
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21051 tatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgttt 21150  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    |||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  21151 gtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgagctcaattggtgaatt 21250  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21251 t-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcat 21349  T
Q  301 attcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  21350 attcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 13997 - 14312
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  13997 tatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaat-cgtgctcttgctgtgatgttatgtct 14095  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14096 gtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaattggtgaatt 14195  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcat 300  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14196 t-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcat 14294  T
Q  301 attcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14295 attcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 338 - 35
Alignment:
Q  14 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 113  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  338 tgtaattttgcattg-ctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 240  T
Q  114 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgt 213  Q
    |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  239 gatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 140  T
Q  214 tgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 313  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  139 tgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgt 40  T
Q  314 tgatg 318  Q
    |||||    
T  39 tgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Original strand, 64476 - 64780
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt----- 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         
T  64476 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatatt 64575  T
Q  114 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgt 213  Q
    |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  64576 gatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgt 64675  T
Q  214 tgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 313  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  64676 tgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgt 64775  T
Q  314 tgatg 318  Q
    |||||    
T  64776 tgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 108045 - 107747
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  108045 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatga 107946  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 218  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | || |||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||    
T  107945 taattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgtta 107847  T
Q  219 atttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107846 atttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4040 - 3722
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  4040 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctatttt 3941  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatg-caaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaa 198  Q
      | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| | ||||||   || |||||||    
T  3940 cttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaa 3841  T
Q  199 tttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgc 298  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3840 ttt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgc 3742  T
Q  299 atattcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3741 atattcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 5150 - 5466
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  5150 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 5249  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaat 199  Q
      | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| | || ||||||||    
T  5250 cttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaat 5349  T
Q  200 ttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgca 299  Q
    || | || |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5350 tt-tgctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgca 5447  T
Q  300 tattcatggattgatgatg 318  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5448 tattcatggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 314
Target Start/End: Original strand, 9297 - 9596
Alignment:
Q  14 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9297 tgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 9396  T
Q  114 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgt 213  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || ||||| || |||||||||| | ||||||| |    
T  9397 gatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttat 9495  T
Q  214 tgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 313  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9496 tgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 9595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 314
Target Start/End: Original strand, 16195 - 16494
Alignment:
Q  14 tgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195 tgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 16294  T
Q  114 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgt 213  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || ||||| || |||||||||| | ||||||| |    
T  16295 gatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttat 16393  T
Q  214 tgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 313  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16394 tgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 16493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Original strand, 1257 - 1450
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1257 ttttgcatttactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 1356  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1357 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3279 - 2966
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3279 tatcataattatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 3180  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    |||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  3179 gtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 3080  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgca 299  Q
    | | ||||||||||||| | ||||| |||||||| || || || |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||| |||||||    
T  3079 t-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgca 2981  T
Q  300 tattcatggattgat 314  Q
    |||||||| ||||||    
T  2980 tattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5780 - 5552
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |    
T  5780 tgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 5681  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5680 gataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5581  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggt 294  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5580 taatatgattaatgaataattgcttgggt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 66 - 316
Target Start/End: Original strand, 3594 - 3843
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  3594 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 3693  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  3694 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattga 3792  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 316  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3793 tgttgtgattgaggaataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1375 - 1124
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  1375 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 1276  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  1275 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 1177  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1176 tattgtggttgatgaataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12364 - 12115
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||| |    
T  12364 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaat 12265  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||  | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12264 gataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattga 12168  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12167 tgttatgattcatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6326
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  6076 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6175  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
     ||||||| | || |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||      
T  6176 aataagttgtaaaaattgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttt 6273  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6274 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 968 - 1218
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  968 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 1067  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
     ||||||| |||| |||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  1068 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 1165  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1166 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48438 - 48187
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| |    
T  48438 tgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaat 48339  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  48338 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaattga 48240  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48239 tgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 13262 - 13480
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 100  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13262 tatcataatcatgt--aatttttcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgttt 13359  T
Q  101 gtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || ||||| || |||||||||    
T  13360 gtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaatt 13459  T
Q  201 tctcctaagttgttgttaattt 222  Q
    | | ||||||| ||||||||||    
T  13460 t-tgctaagttattgttaattt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9129 - 8878
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  9129 tgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 9030  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    | |||||| |||| |||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  9029 gttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattga 8931  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8930 tgttgtgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19457 - 19206
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  19457 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 19358  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  19357 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattga 19259  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19258 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21541 - 21290
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  21541 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 21442  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||    
T  21441 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattga 21343  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21342 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 148953 - 148721
Alignment:
Q  85 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgt 184  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||    
T  148953 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 148854  T
Q  185 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 284  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || || ||||||||| |    
T  148853 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatca 148755  T
Q  285 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  148754 ttgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9100 - 8849
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  9100 tgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 9001  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |  ||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||  ||||||| |||||||||   | ||| ||||    
T  9000 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattga 8902  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8901 tgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 123176 - 123427
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  123176 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 123275  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  123276 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattga 123374  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  123375 tgttgtggttgatgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 69 - 318
Target Start/End: Original strand, 36928 - 37176
Alignment:
Q  69 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgat 168  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  36928 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgat 37027  T
Q  169 aagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 268  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| |    
T  37028 aagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgt 37126  T
Q  269 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37127 tgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 5073 - 5324
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||||||| |||   |||||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |    
T  5073 tgctaaattcgtactccaactgtgacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaat 5172  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| | | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  5173 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 5271  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5272 tgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 307
Target Start/End: Original strand, 247454 - 247694
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | | || |    
T  247454 tgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaat 247553  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  247554 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattga 247652  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 307  Q
    | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  247653 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 34097 - 34246
Alignment:
Q  2 atcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  34097 atcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgaagctatttt 34195  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  34196 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 34246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 26427 - 26678
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||| |    
T  26427 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaat 26526  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| ||||| || || |||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  26527 gataagttgtgaaaattgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 26625  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26626 tgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 201
Target Start/End: Original strand, 8192 - 8327
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||| |    
T  8192 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaat 8291  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaattt 201  Q
    |  ||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  8292 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 172156 - 171916
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  172156 tgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 172057  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  172056 gataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 171958  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 307  Q
    | || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  171957 tgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 177859 - 177619
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  177859 tgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 177760  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  177759 gataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 177661  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 307  Q
    | || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  177660 tgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41980 - 41733
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  41980 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaat 41881  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    ||||| || |||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||     
T  41880 gataatttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgt 41782  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 314  Q
    | || |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41781 tgttgtagatgatgaatcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 546 - 797
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  546 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 645  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    ||| |||| |||| ||||| || || |||||||||| | |||||||  |||||  || |||||||||||||||| || ||||||||||  || || ||||    
T  646 gatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggctgctaattga 744  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  745 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 34472 - 34724
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||| |    
T  34472 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaat 34571  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttg 264  Q
       ||||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| || || || |||||||||   |||||||||    
T  34572 atgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 34670  T
Q  265 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    || || |  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34671 atgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 272257 - 272031
Alignment:
Q  85 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgt 184  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| |||||    
T  272257 ctgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 272158  T
Q  185 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 284  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  272157 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 272059  T
Q  285 ttgcttgggtatgcatattcatggattg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  272058 ttgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 212 - 318
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  212 gttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 311  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  312 gatgatg 318  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41896 - 41648
Alignment:
Q  69 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgat 168  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||      
T  41896 taaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtg 41797  T
Q  169 aagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 268  Q
    ||||| |||| |||||| | || |||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | |  ||  | ||||||| ||||||| |   |||||  |||| |    
T  41796 aagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgatgt 41698  T
Q  269 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41697 tgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  212 gttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 311  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  312 gatgatg 318  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Original strand, 10279 - 10427
Alignment:
Q  3 tcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttg 101  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      
T  10279 tcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttct 10378  T
Q  102 tatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
    | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10379 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 1513 - 1663
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||    
T  1513 tatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctatttt 1612  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  1613 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 3712 - 3579
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | ||  | | ||||||||||||     
T  3712 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatga 3613  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 152  Q
    |  | |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3612 ttatggtatgattgtgggtgaaattacatgttca 3579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 54173 - 54040
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | | ||  | ||||||||||||||     
T  54173 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatga 54074  T
Q  119 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 152  Q
    |  | ||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  54073 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttca 54040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 2711 - 2560
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaa--ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgt 98  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  2711 tatcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctcttgccgtgatgctattt 2612  T
Q  99 ttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
    |  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  2611 tcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13757 - 13506
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  13757 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 13658  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    |  ||||| |||| |||||||| || || ||||||| | ||| ||||||||| | ||  | |  ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| ||||    
T  13657 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattga 13559  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13558 tgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 1452 - 1602
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||    
T  1452 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctatttt 1551  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  1552 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 1602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 200
Target Start/End: Original strand, 51194 - 51328
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |    
T  51194 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaat 51293  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  51294 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 318
Target Start/End: Original strand, 37078 - 37328
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  37078 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 37177  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 265  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| |||   ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  37178 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 37275  T
Q  266 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    | || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37276 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 29480 - 29388
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 92  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  29480 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatg 29388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 10686 - 10778
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 92  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10686 tatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31627 - 31477
Alignment:
Q  1 tatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  31627 tatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 31528  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  31527 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 31477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39814
Alignment:
Q  29 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  129 attgttggtgaaattacatgtt 150  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgtt 39814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 45348 - 45198
Alignment:
Q  2 atcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||    
T  45348 atcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgcccttgttgtgatgctatttt 45249  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45248 gatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 54734 - 54584
Alignment:
Q  2 atcataatcatgtgtaatt-ttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 99  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||  |||||||||||| ||| ||    
T  54734 atcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgtccttgctgtgatgctatttt 54635  T
Q  100 tgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
      | |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  54634 cttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtt 54584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 200
Target Start/End: Original strand, 89466 - 89600
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  89466 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 89565  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 200  Q
     ||||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  89566 tataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9479 - 9382
Alignment:
Q  221 ttgagttatgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9479 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 115
Target Start/End: Original strand, 7413 - 7509
Alignment:
Q  19 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  7413 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 7509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3447 - 3360
Alignment:
Q  60 aattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 147  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3447 aattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3264 - 3210
Alignment:
Q  262 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 316  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3264 ttgatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 6898 - 6831
Alignment:
Q  17 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 84  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6898 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 7510 - 7443
Alignment:
Q  17 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 84  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7510 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 7443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22791 - 22671
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  22791 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 22692  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  22691 gaaaagttatgaaaattgtgc 22671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27046 - 26926
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  27046 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 26947  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  26946 gaaaagttatgaaaattgtgc 26926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Original strand, 1594 - 1714
Alignment:
Q  66 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 165  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  1594 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 1693  T
Q  166 gataagttatgaagattgtgc 186  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  1694 gaaaagttatgaaaattgtgc 1714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 23704 - 23769
Alignment:
Q  17 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 82  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  23704 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctct 23769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 84
Target Start/End: Original strand, 12091 - 12149
Alignment:
Q  27 tttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 84  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12091 tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Original strand, 56114 - 56195
Alignment:
Q  69 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  56114 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgtt 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 150
Target Start/End: Original strand, 1 - 84
Alignment:
Q  67 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  1 gctaaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 84  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8174
Alignment:
Q  70 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 152  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||||| || ||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 55
Target Start/End: Original strand, 13289 - 13342
Alignment:
Q  2 atcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 55  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13289 atcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 13342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14283 - 14198
Alignment:
Q  70 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 154  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| ||||| || || ||| || |||| |||||||||| ||||||||||    
T  14283 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattattgctggtgaaattgcatgttcata 14198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 108256 - 108171
Alignment:
Q  70 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 154  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  108256 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 108171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5750 times since January 2019
Visitors: 4859